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基因筛选

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基因筛选相关的资讯

  • 药物基因和蛋白筛选国家实验室落户东北师大
    我国新组建的十个生物领域国家工程实验室之一——“药物基因和蛋白筛选国家工程实验室”,日前落户东北师范大学。6月21日,在湖南长沙举行的第二届中国生物产业大会开幕式上,国家发展和改革委员会予以正式授牌,这标志着东北师范大学在生物医药研究领域的科研水平和研究成果已得到了国家的充分肯定和高度评价,并且在自主创新、产学研结合的方向上迈出了新的步伐。   为落实国家中长期科技发展规划,促进产业技术进步,国家发展和改革委员会启动了国家工程实验室建设工作。国家工程实验室是国家工程技术领域最高级别的实验室,是国家科技创新体系的重要组成部分,是整合产业创新资源、强化产业技术供给的重要保障,是衔接基础研究和产业开发的桥梁,是凝聚和培养工程技术创新人才的重要基地。   东北师范大学生物学科是国家理科人才培养和科学研究基地。其中细胞生物学科是国家细胞生物学重点学科,国家教育部农业与医药基因工程研究中心设在该学科。作为国家重点学科单位,近年来承担完成了国家多项重要科研和科技开发项目,在基因工程药物和现代中药的研制和开发方面,取得了一系列令人瞩目的科研成果。“药物基因和蛋白筛选国家工程实验室”的建立,必将进一步提升东北师范大学作为综合性研究型师范大学的整体科技实力和社会影响力,有力促进相关领域研究工作和相关学科的发展与进步。   “药物基因和蛋白筛选国家工程实验室”,在东北师范大学已有药物筛选技术体系基础上,通过建设功能完备、技术体系完善的成药基因、蛋白和中药成分筛选技术平台,开展围绕药物基因和蛋白筛选技术体系的优化,及以对疾病发生、发展和转归具有重要影响作用的基因和蛋白为靶标的药物筛选技术等核心技术攻关。工程实验室总面积6200平方米,包括药物基因和蛋白的筛选技术平台、鉴定技术平台、验证技术平台和中试规模制备技术平台等4个技术平台。将为制药企业提供新药开发的候选药物,满足药物开发的源头创新需要,为创新性生物医药成果的转化和产业化提供技术保障。从而形成我国生物医药产业的技术辐射中心,有力推动生物医药产业的长足发展。
  • 一文知晓CRISPER基因编辑早期脱靶克隆快速筛选的多重naica® 数字PCR方法
    使用序列特异性的CAS内切酶进行精确性敲除,敲入,替换等已成为一种常用的分子生物学手段。但是,为了识别所需的基因修饰,排除脱靶克隆,仍然需要筛选几百个单克隆细胞系。而大量克隆的维护和筛选是一个费力、耗时、容易出错的过程。欧洲分子生物学实验室(EMBL)研究人员Moritz Kueblbeck, Andrea Callegari等分享了一种快速验证基因编辑效果的实验方案。该方案使用naica® 微滴芯片数字PCR系统(Crystal Digital PCR™ )实现了一次三色分析就可完成目标拷贝数的评估和脱靶事件的检测。且基于数字PCR (dPCR)的高敏感性,无需大量的样品,因此,在早期就可以完成筛选试验。Crystal Digital PCR™ 一次实验3个小时内就可完成,对于编辑错误的克隆当天就可终止培养。那么这个实验具体是怎么设计的?就让我们一起来看看吧。应用亮点:▶ naica® 微滴芯片数字PCR系统一次三色分析同时完成目标拷贝数的评估和脱靶事件的检测,是非常强大的绝对定量工具。▶ naica® 微滴芯片数字PCR系统对长插入片段(如mEGFP)拷贝数提供稳健的检测方法。▶ naica® 微滴芯片数字PCR系统只需少量生物样本,可以在早期完成检测,快速完成CRISPR筛选,节省时间。Single-step 3-color Crystal Digital PCR™ 实验设计:该实验共设计了三个探针:1.“total tag”(HEX基团标记)检测mEGFP转基因;2.“on-target tag”(FAM基团标记)检测内源NUP93编辑位点的最后一个外显子与整合的mEGFP转基因(标签)的5' 序列之间的连接;3.reference(CY5基团标记)作为内参,对“total tag”和“on-target tag”进行归一化。“total tag”归一化获得整合的mEGFP拷贝数和“on-target tag”获得靶标上整合的mEGFP拷贝数。实验使用U-2 OS细胞作为基因编辑对象,其具有3个NUP93等位基因。结果分析:如图B所示,对多个U-2 OS细胞系的基因编辑效果进行分析,naica® 微滴芯片式数字PCR系统结果显示克隆35,52和247的U-2 OS细胞mEGFP总拷贝数和靶标拷贝数都为3,这表明这三个细胞系的所有3个NUP93等位基因都成功编辑,没有脱靶,这个结果与检测金标准的Southern blot的结果一致(图C),而克隆5虽然mEGFP总拷贝数和靶标拷贝数一致,但与NUP93位点的预期数量不匹配。这表明其可能发生基因组的重排,而Southern blot结果也验证了这一现象,其出现了一个小于正常NUP93的拷贝条带。对于克隆25和246,虽然其靶标拷贝数符合预期,但是其总拷贝数大于3,这表明其可能存在脱靶整合或者不完全HDR(homology-directed repair)现象,而Southern blot结果显示其存在一个过大的整合条带,表示其可能存在基因重排。上述这些结果表明基于naica® 微滴芯片式数字PCR系统(3-color Crystal Digital PCR™ )的基因编辑脱靶检测的三色数字PCR检测方法,是一种快速简便的一步检测方法,其结果与耗时更长的Southern blot技术完全一致,可以用来快速评估基因编辑效果,筛选适合的基因编辑细胞株系。
  • 高通量筛选技术加速新药研发
    对分子目标的高通量筛选虽早已成为生物制药产业早期药物发现的首选模式,但近年来才被用于抗寄生虫病新药的筛选。随着越来越多的寄生虫基因序列的破译,研究人员使用高通量筛选和化合物库的机会增多,预计这一方法将更显其重要性。  典型的高通量筛选方法可在成百上千大量化合物的筛查中确定分子目标,尤其是在以寄生虫为目标的筛查中。寄生虫整体性分析筛查的数量只有原生动物的十分之一,因此确定和验证寄生虫分子目标,对防治寄生虫病新药的发现,具有非常重要的价值。  疟原虫基因组包含约5000个基因,其中适合作为药物靶点的基因编码估计约有200个(占4%),利用计算算法确定能够催化“阻塞点”反应的酶(即消耗特定基质或产生某种物质的酶),这些酶中大约有30种与任何人类体内的酶都没有显著相似之处。根据一些标准,人类基因组中3万个基因中不到1500个基因(占5%)可作为合适的药物靶点。  在基因组研究的基础上发现新的抗菌药物的经验也表明,虽然这一方法令人兴奋,但也要建立在正视现实局限性的基础上。目前正在临床试验中的18种新抗菌药物,没有一例是通过基因组学项目计划发现的。许多潜在的靶点目标已确定并进行探研,但开发新抗菌药物的限制因素显然不是对新靶点反应活跃化合物的特性,而是能够转化为药物候选者的化合物。不仅在活性上,同时在制药和物化特性上都必须是最优化的,这些才是真正的限制因素。  理想的情况下,筛选目标应在基因上和/或化学上得到验证,具有某些生物化学和结构上的特征,不会让疟原虫产生抗药性,并适合于大量化合物筛选技术。寄生虫与在实验中通常用于验证和寻找线索的人类体内的病原体不同,需要考虑不同的寄生物种的相应靶点目标。  另外,寄生虫对新化学药物可能会产生的抗药性在药物开发初期就应该考虑到,影响靶向目标适宜性的动态因素也要考虑到。例如,针对锥虫鸟氨酸脱羧酶的抑制剂有可能成功,是因为这种寄生虫的酶产生的速率不够快,无法在抑制剂的作用下生存下来。这个例子强调了在靶向目标选择中对寄生生物化学知识深入了解的重要性。【原标题:新技术加速新药发现】
  • 设备更新选型指南丨功能微生物筛选解决方案推荐
    在微生物学研究中,研究人员常常需从复杂多变的生态环境如泥土、沉积物、粪便等中取样。不同于动物细胞,微生物细胞具有微小尺寸、形态各异、易受杂质干扰且目标微生物丰度低等特点。因此,传统针对动物细胞设计的分选技术和设备在应对这些微生物样本时,常常束手无策。从这样的复杂样本中分离出目标微生物菌株,不仅耗时耗力,效果也常不尽如人意。为了解决这一问题,长光辰英公司凭借其卓越的科研实力,结合微生物单细胞可视化精准分选技术,并融合单细胞拉曼光谱、高分辨荧光成像、智能形态学识别以及人工智能算法等核心技术,成功推出了一系列功能强大的微生物筛选产品。此外,长光辰英还建立了微生物多维表型检测与可视化精准分选平台,该平台采用“先鉴定,再扩培”的策略,确保研究人员能够“所见即所得”地从复杂样本中高效筛选出目标功能菌株,从而为微生物筛选提供了新的高效解决方案。推荐产品 PRECI SCS单细胞分选仪PRECI SCS 微生物单细胞分选仪 (qq.com) PRECI SCS-R300拉曼单细胞分选仪PRECI SCS-R300 拉曼单细胞分选仪 (qq.com) RAColony菌落原位多表型检测与挑取工作站RAcolony 菌落原位多表型检测与挑取工作站 (qq.com) SC-catcher单细胞光镊操纵与分选系统SC-catcher单细胞光镊操纵与分选系统 (qq.com)推荐服务功能菌筛选技术方案(一)丨微生物多维表型检测与可视化精准分选平台下的微生物单细胞筛选培养功能菌筛选技术方案(二)丨微生物多维表型检测与可视化精准分选平台下的表型靶向MiNi宏基因测序功能菌筛选技术方案(三)丨微生物多维表型检测与可视化精准分选平台的基因转移可视化研究如果您对我们的产品和服务感兴趣,请随时联系我们
  • 国内外大型药企追捧斑马鱼新药筛选平台
    可别小看这几厘米长的小不点,斑马鱼基因与人类基因同源性高达85%,信号传导通路基本相似。这意味着在其身上做药物实验所得到的结果在多数情况下也适用于人体。“比如癫痫、关节炎、脂肪肝、癌症等常见人类疾病模型,都可以通过斑马鱼进行新药筛选。”据环特生物科技有限公司负责人介绍,目前斑马鱼可以承接的新药筛选人类疾病模型达30多种。   在杭州环特生物科技公司的一间显微注射室里,记者目睹了药物筛选的大致过程。玻璃器皿中放着几条出生一天多的斑马鱼幼鱼,在显微镜的放大下,这些幼鱼的器官活动、血液流动在旁边连接的电脑上清晰可见。根据委托方的要求,这位工作人员分别往它的肾脏和肝里注册一种新药剂。因为斑马鱼的胚胎和幼鱼是透明的,实验时很容易观察到各种环境有毒物质、药物对其体内器官的影响。几秒钟后,两个器官起了点反应。“还要观察一段时间,整个过程会照相或者摄影记录,等到反应明显后,通过特殊仪器分析然后提交研究报告,最后挑选出最安全、有效的候选药物。”这位工作人员表示。   和老鼠等其他实验动物相比,斑马鱼筛选实验周期非常短,能够在1天到一周内完成,而老鼠实验通常要1个月以上时间。此外,实验费用也非常低,斑马鱼筛选实验每条每天耗费小于0.01美元 因为个体小,实验所需化合物用量仅为鼠类实验的1/100到1/1000。   综合各种优势,让环特生物科技有限公司的斑马鱼新药筛选平台名声鹊起,成立不到一年,目前委托的国内外大型药企就有20多家,包括先声制药、格兰素史克等,国内的很多医药类学术院校、科研机构也纷至沓来。这个平台的服务范围还在扩大,环保产业,农业、食品、营养保健品、美容护肤品等各个领域纷纷冲着斑马鱼而来,签订各种高科技服务外包协议和意向。
  • 珀金埃尔默与国家新药筛选中心合作建立“转化医学合作中心”
    2013年4月9日,珀金埃尔默宣布与中国国家新药筛选中心合作,共同推进个性化的医学和药物研究。通过分享知识、专业技能和创新能力,双方将建立一个个性化的药物研究和开发平台,旨在开拓药物基因组学的临床应用,服务于中国的医院和病人。   中国科学院上海药物研究所书记成建军、张江高科技园区管委会副主任宋卫华、珀金埃尔默董事长兼首席执行官Robert Friel、国家新药筛选中心主任王明伟等出席了合作平台的揭幕仪式。   “珀金埃尔默非常荣幸与王博士合作,王博士是个性化医疗领域的先锋,Friel说,“我们期待着与王博士及国家药物筛选中心的科学家们一起建立一个个性化药物研发技术平台,使病人得到更准确、安全、高效的治疗。”   该项目将通过对病人样品进行基因组测序来建立基于基因水平的药物疗效信息,包括对个性化疾病治疗的药物疗效标志物的验证和相关生物信息学解决方案。作为这个项目的一部分,珀金埃尔默和国家新药筛选中心将首先进行一个针对中国人群的研究,该研究利用新一代测序技术对代谢性疾病进行药效评估。一旦研发成功,该技术将在整个中国的测试实验室和医院中应用。 编译:刘丰秋
  • 使用Ghost cytometry进行高通量细胞表型的池式CRISPR筛选
    CRISPR基因编辑池式筛选是一种使用CRISPR基因编辑技术进行高通量基因筛选的方法。该方法灵活且高效,能够在单次实验中同时对成千上万的基因进行编辑,为研究者在生物医学研究领域提供了强大的工具。 CRISPR(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats),是细菌或古菌的一种免疫机制,能够帮助它们抵抗病毒等外源遗传物质的入侵。在2012年,科学家发现了其在基因编辑上的潜力,他们利用CRISPR关联蛋白(Cas)能够被引导至任何DNA序列并精确剪切,实现了目标基因的定向编辑。 池式筛选,即在一个大的“池子”里,每个细胞携带一个不同的基因编辑工具-指导RNA(gRNA)。这种编辑工具可以引导Cas蛋白至特定的基因进行编辑。在CRISPR池式筛选中,研究者可以使用含有数以千计不同gRNA的质粒库对大量细胞进行转染,使每个细胞内接收到一个随机的gRNA。 传统的基因筛选方法通常会对单个基因或一小组基因进行逐个测试,这种做法比较耗时且效率较低。某些筛选方法,例如通过微生物菌落挑选或表达差异分析等,虽然可以同时处理多个样品,但是每个基因通常都需要单独处理和分析。而“池式筛选”方法则是一种高通量筛选技术。在一个“池子”中,每个细胞被赋予一个特定的基因编辑工具,比如CRISPR的gRNA,就形成了一个大规模基因编辑池。然后,通过对整个细胞池进行外部压力处理,可以一次性筛选出许多对生存或生长有影响的基因。这样就可以在单个实验中对全基因组进行筛选,大大提高了筛选效率。文章的介绍部分详述了基于CRISPR的池式筛选方法的几个优势,包括提高通量,降低成本,减少了不同筛选中出现的批次效应。在池式的表型筛选中,细胞和细胞内分子被标记为荧光染料、报告基因或荧光免疫抗体。因为需要量化明确定义的特征,所以基于荧光的标记由于其对目标分子的高特异性和高灵敏度具有明显的优势。例如,在荧光激活细胞分类(FACS)中,从时间信号中测量的代表性值,如总荧光,或从光学显微图像中评估的更详细的特性,如分子定位和形态参数。 然而,当适用的生物标志物或染色方法不可用,能否在用识别特征的图像分析评估细胞表型变得具有挑战性。为了解决这个挑战,基于机器学习的无标记高内容细胞表型分析成为一个有希望的替代方案。 在这项研究中,作者展示了一种用于大规模池化CRISPR筛选的多功能方法,包括荧光和无标记高内容细胞表型,利用基于荧光和无标签Ghost Cytometry(GC)技术的细胞分类器。 首先,细胞表达Cas9蛋白被用池化CRISPR逆转录病毒库转导以实现功能丧失基因集,并选出稳定病毒整合。随后,经化合物或试剂处理的池化敲除细胞库显示出多种表型。如有必要,可以进行额外的试验,例如免疫染色。在GC-based的细胞分选中,预训练的机器学习模型可以选择性地丰富显示目标高内容表型的细胞。最后,可以将筛选的细胞进行各种生物学试验,包括基因分析如基因组测序,蛋白质试验以及基于细胞的功能性分析。在标准CRISPR扰动筛选中,从筛选细胞中提取基因组DNA,并由PCR扩增sgRNA区域,然后利用商业上可得的下一代测序平台阅读,以确定导致目标表型的基因。当筛选活细胞时,单细胞RNA测序的转录组学分析和基于细胞的功能试验是广泛适用的。 所以,整体来看,这种方法结合了CRISPR基因编辑技术,无标签高内容筛选和机器学习,进一步提高了我们对基因功能和表型的理解,以及我们在生物医学研究中的筛选能力。
  • VisionSort用于药物发现:突破性药物筛选技术
    视频链接:https://www.bilibili.com/video/BV1btvke7EwP/?spm_id_from=333.999.0.0概述在本次网络研讨会上,介绍了用于药物发现的VisionSort平台。药物筛选方法主要有两种:靶向筛选和表型筛选。尽管两者互为补充,表型筛选因其广泛评估药物作用机制和对细胞表型影响的能力而重新受到重视,且识别了最多的首创药物。传统表型筛选的挑战存在孔间信号差异,需要复杂的细胞标记,图像存储和处理资源密集依赖自动化显微镜平台生成大量高内容数据需要大量的多孔板,通常受限于固定或贴壁细胞VisionSort 平台的优势采用更灵活、高通量的方法进行表型筛选同时捕获高内容的无标记形态信息和荧光信号不需要传统的计算图像处理和分析,速度快,能处理每小时1000万个细胞,适用于活细胞和固定细胞Ghost Cytometry 技术高级光学、机器学习和微流体技术相结合使用结构化照明捕获单细胞形态信息嵌入式机器学习模型快速分析数据使用温和的流体压力分选细胞,保持细胞活性数据生成与分析生成反映光强度随时间变化的波形数据,每秒超过1200万个数据点荧光波形不仅能检测细胞总荧光强度,还能捕捉荧光信号的详细空间分布使用监督和非监督机器学习进行细胞表型分类应用示例HEK 293细胞表型分类VisionSort能够无标记分离这两种表型,分类准确率为0.97使用荧光模式,将细胞标记为溶酶体或线粒体 2. T细胞表型分类无标记分离浆细胞与其B细胞前体激活的人初级T细胞,标记表面细胞标记CD25和CD69VisionSort能够仅通过形态学(无标记)分离这些T细胞表型,分类准确率为0.99无标记分离疲劳和非疲劳T细胞 药物筛选案例研究CRISPR筛选用于NFkB核转位模型,使用机器学习模型筛选目标基因,验证了TLR4信号通路的成员基因富集 2. 巨噬细胞极化使用无标记模式,识别可能调节M1极化的基因,如BRD2基因总结VisionSort平台通过高内容的形态信息、高速筛选能力、兼容多种CRISPR库和NGS平台,为药物筛选和目标识别提供了新的可能性,增强了药物发现流程。重点VisionSort平台的灵活性和高通量筛选能力Ghost Cytometry技术的先进性机器学习在实时数据分析中的应用实际应用中的高分类准确率和新颖基因调控发现对药物筛选流程的显著提升和加速通过这些优势,VisionSort平台在药物发现中展现了巨大的潜力和广泛的应用前景
  • 【解决方案】马尔文帕纳科为药物筛选按下快进键!
    Hot马尔文帕纳科为药物筛选按下快进键!利用生物物理片段筛选“甜蜜点”发现抑制BRPF1 的新化学型马尔文帕纳科为药物筛选按下快进键!基于化合物库的有效采样是片段筛选命中 (fragment screening hit) 识别范式的核心。通常片段分子越小,采样效率越高。对于小分子和靶蛋白之间弱结合力的检测能力决定了片段分子可以设计的大小。 CLS独特的片段筛选平台马尔文帕纳科旗下 Concept Life Sciences 和 Creoptix 联手开发了一个独特的片段筛选平台。该平台将专门构建的片段分子库与尖端的光栅耦合干涉 (GCI) 技术相结合,通过在生物物理“甜蜜点” (Sweet Spot) 进行筛选操作,可在几天内确定最有效的片段命中 (fragment hits),从而为片段命中优化提供理想的起点,并为候选药物提名提供了更快的途径。本文报告了使用该平台进行片段分子筛选,并识别了能有效结合 BRPF1 溴结构域的新片段。BRPF1Bromodomains 溴结构域是进化上保守的蛋白质-蛋白质相互作用模块,可识别组蛋白乙酰化赖氨酸。溴结构域和 PHD 指蛋白 1 (BRPF1) 是单核细胞白血病锌指 (MOZ) 组蛋白乙酰转移酶的亚基。它通过多个表观遗传阅读器结构域调节基因转录,包括独特的双 PHD 和锌指组装、溴结构域和 C 末端 PWWP 结构域(如图 1所示)。BRPF1 被认为是肝细胞癌[1]和急性髓细胞白血病[2]的治疗靶点,目前这种侵袭性癌症的成人 5 年生存率不到 30%[3]。图 1. MOZ/MORF 组蛋白乙酰转移酶复合物介导 H3K9、H3K14 和 H3K23 乙酰化以激活基因。BRPF1 包含两个植物同源域 (PHD) 手指的乙酰阅读器结构域,它们由一个锌指节 (PZP 结构域)、一个溴结构域和一个脯氨酸-色氨酸-色氨酸-脯氨酸 (PWWP) 结构域隔开。近年来报道了一系列 BRPF1 抑制剂,包括 GSK6853[4]和 NI-57 [5](图 2)。高通量片段对接 [6] 和基于配体的筛选 [7] 也被用于鉴定其他化学型 ,并在 X 射线结构的辅助下对其进行优化(图 2)。但是目前尚未有选择性的 BRPF1 抑制剂进入临床研究,所以能抑制这一靶点的新化学型仍是研究热点。图 2. 左:选择性 BRPF1 抑制剂的化学结构。右图:BRPF1与片段分子结合的 X 射线结构 (pdb = 5EQ1)。BRPF1 以绿色带状表示,其表面由位于酰基结合域的残基侧链构成碳原子为绿色,氧原子为红色,氮原子为蓝色。片段分子以棒状表示。生物物理“甜蜜点” Sweet Spot据最新文献估计,化学宇宙已经由多达 11 个重原子、1420 万个化合物增长到了多达 17 个重原子、超过 1660 亿个化合物[8]。这种指数增长体现了片段分子大小的增加对化学领域的影响,而片段库的过分庞杂并不利于基于片段的药物设计 (FBDD) (图 3)。伴随着FBDD的发展,涌现出了多种生物物理技术能够检测到片段分子与靶点之间微弱的结合。因此,一个有效的筛选活动应能在筛选化合物时,可以最大限度的在生物物理技术可以检测到的极限范围内进行采样,即片段分子的生物物理“甜蜜点”(图 3)。图 3. 化学宇宙的演变(橙色)、找到筛选命中的机会(灰色)和典型的亲和力(蓝色)与重原子数量的关系。虽然典型的商业片段库(紫色)倾向于集合较大的化合物,但通过高灵敏的生物物理技术,在生物物理“甜蜜点”(绿色)范围内,可以对更小的片段分子进行更有效的筛选。生物物理片段库构建图 4. 片段库构建流程:从 55,000 个 CLS 化合物集合到最终 1,133 个选定片段。该过程包括一个生物物理 MPO 对匹配生物物理“甜蜜点”的片段进行分类,以最大限度地提高多样性,并基于溶解度和纯度对化合物质量进行严格过滤和筛选。最大化的化合物多样性图 5.(A)CLS化合物库的主要成分分析。散点之间间隔越远,相应片段的结构越多样化(颜色对应于簇 #),(B)惯性矩阵图表示 CLS 片段分子的杆状、片状和球形形状(颜色对应于簇 #),(C ) 结构多样性由在不同 Tanimoto 指数下属于 1 到 5 个簇的化合物数量表示,(D) 1,133 个 CLS 片段的每个主要chemical handles的百分比。片段命中类库Fragment Hit-LikeLibrary在过去 20 年的 FBDD 研究中,已报告的片段命中 [9] 和商业片段集合的物理化学特征之间出现了明显的二分法,这通常由 3 规则 (Ro3) [10] (图 6) 支持 。通过瞄准生物物理“甜蜜点”,CLS 生物物理片段集合(图 6)不仅可以有效地对可用的化合物库进行采样,而且还显示了与报告的片段命中非常匹配的物理化学特征。图 6. Giordanetto 等人报道的 486 个片段命中的物理化学特征[9](绿色)、典型的商业片段集合(橙色,从 11 家供应商的 120,000 多个片段中收集)和Concept Life Sciences构建的生物物理片段集合(蓝色)。生物物理筛选图 7. SPR 和 GCI 筛选工作流程。GCI 技术使用Creoptix WAVE delta 系统(图片),该系统可实现简单且省时的片段筛选。使用 waveRAPID® 进行动力学筛选
  • 微生物所开发出新型微滴反应筛选技术及单细胞分析应用
    p style=" text-indent: 2em " 微生物所 strong 微生物资源前期开发国家重点实验室 /strong 杜文斌研究组和黄力研究组共同开发了一种新型的 strong 微流控界面纳升注射技术 /strong (Interfacial Nanoinjection, INJ),该技术可以将传统的生化反应体系微缩在一个纳升体积的油包水微液滴体系中完成。 /p p    strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 界面纳升注射(INJ)具有诸多显著优势 /span /strong /p p   针对这一技术创新,团队申请了多项中国发明专利和美国专利,并研制了基于INJ技术的小型桌面系统。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201910/uepic/fe470173-c411-4a4f-857f-952adad6e8d5.jpg" title=" 界面纳升注射(INJ)系统.jpg" alt=" 界面纳升注射(INJ)系统.jpg" / /p p style=" text-align: center " 界面纳升注射(INJ)系统 /p p   该系统和国外同类产品如美国Labcyte公司的Echo超声纳升移液系统、以及美国TTP Labtech公司的mosquito HTS微量筛选系统相比, strong 在仪器成本、耗材成本、最小液滴体积、流式细胞仪兼容性、操作的灵活性、以及污染控制等方面,均具有显著优势, /strong 适用于各类单细胞微体积反应分析,也可应用于其他微体积反应分析,在微生物培养筛选、合成生物学、药物筛选、蛋白结晶条件筛选等方面均具有应用潜力。 /p p   在性能方面,INJ系统通过高精密度的微体积控制实现不同试剂组分的纳升体积分步添加,兼容96和384孔板,可以在预先填装矿物油的孔板上,按照程序设定加入纳升样品或试剂液滴,用于实现高通量筛选。利用低成本探针可以精确加注的最小体积达到1 nL,当加样体积为5 nL时,体积标准偏差小于11 %。加注的液滴通过离心可以沉降到孔板底部并融合,液滴的融合效率最高,达到99%以上。利用多次加注样品、试剂的方法,可以实现多步反应和浓度梯度配置。系统加注的体积精确性、线性和重现性良好。 /p p   strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) "  FACS-INJ单细胞分析流程和应用 /span /strong /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 281px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201910/uepic/7cc806a5-55aa-475f-a110-69b3c5038b70.jpg" title=" 杜文斌-流式细胞分选+界面纳升注射技术图示.jpg" alt=" 杜文斌-流式细胞分选+界面纳升注射技术图示.jpg" width=" 600" height=" 281" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center " span style=" text-align: center " FACS-INJ单细胞分选分析流程 /span /p p    strong 单细胞分析是一项变革性技术 /strong ,在单细胞基因组异质性研究及复杂微生物群落中稀有微生物种群多样性研究等领域应用广泛。然而,如何进一步降低单细胞分析的成本,提高可靠性和效率,仍然面临重大挑战。流式细胞荧光激活细胞分选(FACS)是目前最高效的单细胞分选技术,可实现病毒、细菌、真菌和动物细胞的多参数检测和分选 利用荧光标记,可对不同类型的细胞进行有效的区分,分选成功率高。研究团队将INJ与FACS平台相结合,建立了FACS-INJ单细胞分选分析流程,应用覆盖了单细胞表型分析、基因型分析、基因表达分析以及全基因组扩增测序。 /p p   研究团队首先利用FACS-INJ系统实现了 strong 病原菌微生物单细胞耐药基因的PCR筛查和单细胞药敏表型筛查 /strong 。经优化,多孔板可预先装载纳升体积的PCR引物或不同浓度的抗生素液滴。PCR筛查体积缩小到500 nL,试剂消耗和成本和常规体系相比降低至原先的1/40,耐药检测的体积控制在200 nL,试剂消耗和成本和常规体系相比降低至原先的1/1000,时间从& gt 12小时缩短至5小时,这对于大幅降低临床病原检测的成本,实现脑脊液、房水等难获取微量样品的耐药基因和表型筛查具有重要意义。 /p p   其次,FACS-INJ系统还可用于 strong 动物细胞的单细胞基因表达分析 /strong 。以小鼠巨噬细胞RAW264.7在细菌胞外多糖处理前后的炎症反应为例,通过荧光激活流单细胞式分选处理前后的小鼠巨噬细胞,基于一步法反转录实时荧光PCR扩增,在单细胞水平解析了次黄嘌呤鸟嘌呤转磷酸核糖基酶(HPRT)基因(看家基因)和白介素1β(IL-1β)基因(炎症反应)表达水平的变化。 /p p   最后,团队与北京大学黄岩谊课题组合作,建立了 strong 基于FACS-INJ的微生物全基因组扩增测序流程 /strong ,以获得未培养微生物的全基因组信息。流程包括流式分选微生物单细胞、单细胞裂解、酸碱中和、MDA扩增和建库测序。以热泉来源的古菌硫化叶菌(Sulfolobus sp. A20)菌株为模型,将单细胞扩增的体积优化至360nL,硫化叶菌全基因组覆盖度达到80%以上。在纳升级微液滴中实现西南印度洋未培养单细胞微生物全基因组DNA的MDA扩增与测序,拼接后获得15个单细胞基因组,大小在0.1~3.7Mb大小。该方法获得的微生物基因组污染度较传统的MDA扩增方法显著降低(& lt 5%),显著提高了微生物单细胞基因组数据质量。平台也适用于肿瘤、胚胎等动物细胞的全基因组扩增测序,对肿瘤细胞的单细胞测序的覆盖度达到60-80%。 /p p   上述研究工作近期作为特邀论文在线发表在Small上。微生物研究所助理研究员贠娟莉博士、郑小伟博士、徐鹏博士为论文共同第一作者,杜文斌研究员、黄力研究员和北京大学黄岩谊教授为论文共同通讯作者。该研究该研究得到了中国大洋协会大洋十三五重点项目、中科院战略性先导科技专项(B类),中国科学院重点部署项目、中国科学院前沿科学重点研究项目、国家自然科学基金面上项目和优青项目等支持。 /p p   论文出处: /p p   Yun, J.L. sup # /sup Zheng, X.W. sup # /sup Xu. P. sup # /sup Zheng, X. Xu, J.Y. Cao, C. Fu, Y.S. Xu, B.X. Dai, X. Wang, Y. Liu, H.T. Yi, Q.L. Zhu, Y.X. Wang, J. Wang, L. Dong, Z.Y. Huang, L.* Huang, Y.Y.* Du, W.B.* Interfacial Nanoinjection-based Nanoliter Single-cell Analysis, Small, 2019, doi:10.1002/smll.201903739. /p p    a href=" https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/smll.201903739" target=" _self" style=" text-decoration: underline font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai color: rgb(255, 0, 0) " strong span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai color: rgb(255, 0, 0) " 查看原文戳这里 /span /strong /a /p p    strong span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " 杜文斌 /span /strong span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " ,男,中科院微生物研究所研究员。2007年于浙江大学化学系,获博士学位。2007-2011年于美国芝加哥大学化学系从事博士后研究工作。2013年11月加入中科院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室。主要从事微流控芯片技术及新型分析微生物技术与应用研究。已发表论文60余篇,申请中国和美国专利30余项,授权20多项。主持国家优秀青年科学基金项目,国家重点研发计划 “数字诊疗装备研发”项目,中国科学院前沿科学重点研究项目等。 /span /p
  • “小贝开讲”之遗传文库筛选技术在药物靶点发现中的作用
    时间:2018年12月25日 14:00 - 15:00内容简介:1. 肿瘤精准化用药和靶向药物的研究进展。目前全球已经批准了数十种靶向治疗药物,靶向药物已经被广泛用于多种恶性肿瘤疾病的治疗。截至2015年靶向药物市场已经超过430亿美元,其市场的大幅增长也吸引了更多的制药企业投身于靶向药物的研发。但肿瘤的异质性是其重要的特点,即使是同一个部位的肿瘤,不同患者的肿瘤突变情况也千差万别。如果不进行检测和针对性用药,肿瘤药物的有效率仅为20%。因此目前已经公认肿瘤精准化用药是发展趋势。但是癌症精准化用药还存在以下难点:⑴ 拥有明确治疗靶点的肿瘤只占少数比例。⑵ 大部分肿瘤患者检测不到有价值的药物治疗靶点。⑶ 靶向药物容易产生耐药性等。2. 高通量大规模遗传筛选技术是以上难题的解决方案之一。目前高通量筛选是发现药物作用靶点或寻找有效治疗药物的有效手段。高通量筛选,可以在同一时间对数以千万的样品进行检测,幅度地缩短了新药和药物新靶点发现的时间。SiRNA和CRISPR技术是现代生命科学领域最伟大的发现。siRNA可以对特定基因产生敲低(knockdown)效果。而CRISPR/Cas9更是可以在基因组水平上对特定基因进行敲除、基因编辑和激活。我们这个讲座主要介绍遗传筛选文库技术的原理。同时介绍其结合大规模细胞筛选和高通量深度测序技术,在筛选和揭示复杂信号网络调控、寻找药物靶点和制定联合用药方案中的应用。主讲人简介:陈红波副教授,博士生导师 中山大学陈红波,中山大学 副教授 博士生导师 PI,中山大学“百人计划”引进人才,深圳市海外高层次人才(孔雀计划)。近年来在包括Nat Commun, PNAS, Biomaterials,Hum Mol Genet, Acta Biomater等国际著名医学生物学期刊发表SCI论文30多篇,影响因子加和约200点,被引用次数约1000次。目前是多个期刊的编辑和特约审稿人。主持了包括国家自然科学基金面上项目、广东省自然科学基金自由申请项目、教育部博士点基金、深圳市科技创新项目(学科布局和自由探索等)、清华大学深圳研究生院青年项目、中山大学人才启动基金和教育部高校基本科研业务费“重点和交叉培育项目”等在内的多个科研项目。此外曾主持的一个国家一类新药正在准备申报一期临床。 曾获得过北京昭衍新药研究中心“创新奖”,清华大学校级综合优秀一等奖,清华大学深圳研究生院 “科研优秀二等奖”,清华大学深圳研究生院第五届“学术新秀”和2014年深圳市科学技术奖(自然科学奖二等奖)等荣誉和称号。2016年一项成果在“深圳市科技创新委员会”网上登记。陈红波副教授的研究方向为1.基于基因工程技术的皮肤及神经营养因子类药物的研发2.核仁功能与疾病的发生3.利用高通量高内涵细胞筛选技术或CRISPR遗传文库筛选技术鉴定药物作用靶点及开发新型药物分子。
  • 美谷分子微生物筛选系统 QPix亮相央视晚间新闻 ,助力创新中国
    2024 年 7 月 9 日,中国中央电视台新闻联播 CCTV-13 《新思想引领新时代改革开放丨“创新中国”筑梦新征程》重点报道了我国一系列科技创新及促进科研创新的密集落地举措,助力中国式现代化。高通量微生物克隆筛选系统 QPix XE 作为加速科研创新的工具亮相在新闻联播中。中国式现代化要靠科技现代化做支撑,实现高质量发展要靠科技创新培育新动能。科学技术推动经济发展,科学技术的发展离不开科研团队软硬件的配套支持。国家的全社会研发经费在 2012 年的 1.03 万亿元增涨到 2023 年的 3.3 万亿元。在国家大力投入科研创新的举措之下,传统行业转型发展,新兴产业蓬勃发展,未来产业布局建设。其中,生命科学的蓬勃发展,为科研创新注入新动力。创新是科技发展的核心动力,QPix 系列作为经典的微生物克隆筛选系统,客观的成像筛选、高达 3000 克隆/小时通量的自动化挑选、可定制和整合的扩展性、多种功能集成等特性,使其不论是在生物药开发、工业菌株筛选、基因合成还是合成生物学等领域都能发挥重要的作用,促进创新加速。一睹它的风采⬇ ️ ⬇ ️ ⬇ ️ 美谷分子仪器,赞27QPix 高通量微生物克隆筛选系统在生物制造中的应用:随着基因编辑技术的发展,研究人员可以通过基因操纵,让微生物或者其他底盘细胞高效生产之前靠化学合成的产品,用生物合成代替化学合成,提高效率的同时降低污染和风险,也可以让底盘细胞高效生产自然界难以提取的物质,降低低剂量产品提取成本,还可以通过基因改造令微生物具有将有害物质转化为产品的能力等。以“DBTL”循环(Design-Build-Test-Learn)为指导的合成生物学流程,增加了对底盘细胞高通量筛选的需求。传统的微生物挑选为手工铺板、手工挑菌,在挑选的流程中遵循 5 个动作的循环过程:拿吸头、观察、挑菌落、接种至孔板、扔吸头。这种手工挑选有很多局限性:动作重复且技术含量低,挑选的准确性依赖操作人员的熟练程度;挑选速度受限;挑选的标准为肉眼判断,并且菌挑至哪个孔没有数据追溯等。高通量克隆筛选系统 QPix 可以实现克隆挑取的高效化、标准化,替代手工挑选,助力高效生物制造。QPix 400 系列微生物克隆筛选系统QPix 系统全球装机量已经超过 600 套,广泛用于世界各地的研究机构、测序服务单位、生物科技和制药公司。在人类基因组项目中,QPix 系统的稳定性和准确性获得了测序中心的赞誉。2023 年,QPix 400 系列增添新成员,新品 QPix XE 专为空间紧凑型、中高通量需求的实验室而设计。体积和通量上的更新并不影响 QPix XE 强大的功能和高质量的结果,依旧能够轻松实现高效、精准的克隆识别和挑取!基于菌落形态特征和荧光强度的克隆识别和筛选,尽早发现阳性克隆,减少下游工作量轨道运行实现高位置精度,确保准确挑取克隆多种类型挑针可选,匹配不同形态菌落,实现更高效的挑取复制、重排、抑菌圈/水解圈等多种功能可选,一机实现多种用途自动数据存储和样本跟踪功能确保数据完整性QPix 系列广泛的应用场景仍然适用 QPix XE,例如合成生物学、生物技术、生物燃料、农业、微生物组学、环境科学、食品和饮料等广泛的科研活动。同时,QPix 系列与 Molecular Devices 其他高通量产品结合,可以提供完善的高通量应用解决方案,为您的研究提供更多可能!细胞株开发解决方案合成生物学解决方案抗体药物开发-噬菌体展示解决方案结语QPix 高通量微生物克隆筛选系统以其稳定的性能、多样的功能、广泛的应用领域提高了科研人员的生产力,加速科技创新步伐,助力科技现代化。Molecular Devices 与科研人员一起,不断探索,践行创新使命。
  • 网络研讨会:离子通道为靶点的高通量药物筛选
    演讲嘉宾:于海波 Ph.D. 研究员北京协和医学院中国医学科学院药物研究所嘉宾介绍:2005年 中国协和医科大学博士学位2008年-2013年 美国约翰霍普金斯大学医学院神经科学系、离子通道中心进行博士后研究2014年-至今 北京协和医学院药物研究所担任课题组长,研究员。承担国家自然科学基金青年项目和面上项目,目前主要从事以离子通道为靶点的高通量药物筛选、药物发现和分子调控机制研究。讲座时间:2016年12月20日周二 10:00报名参加,好礼相送http://go.moleculardevices.com/l/83942/2016-11-15/6hylg2?cmp=70170000000vAjo讲座介绍:离子通道是一类非常重要的跨膜蛋白,400多个离子通道基因被克隆鉴定。大约90多种离子通道基因突变可导致离子通道疾病的发生。离子通道已经跃居为仅次于GPCR的第二大药物靶点。长期以来,由于其结构和功能的多样性,导致了离子通道药物评价方法的高挑战性,而手动膜片钳技术要求高、通量低,限制了药物发展的速度。过去10年来,离子通道HTS仪器和多种离子通道检测方法的发明问世,已经显著促进了离子通道药物研究的发展。本讲堂将主要介绍离子通道为靶点的高通量筛选的建立以及应用。
  • 天木生物DREM cell设备成功助力高产谷氨酰胺酶突变株超高通量筛选
    工业微生物常用于重要的生物和化学制品的生产,优良菌株的选育是生物产业的核心工作之一。近年来合成生物技术的快速发展使得高性能工业菌株基因型的理性构建性显著增加,但如何从海量候选菌株库中高通量筛选到规模生产用的工业菌株仍面临挑战。多孔板(MTP)筛选系统和流式细胞术(FACS)是研究者常用的筛选手段,但MTP通量较低,而FACS难以用于检测胞外分泌的代谢物。液滴微流控技术在微生物育种领域的应用,成功实现了大容量突变库的全面评价以及高效筛选,不仅在筛选通量方面实现了大幅度提升,有效提高了菌株选育工作效率,而且在筛选成本方面也展现出巨大优势,可显著降低筛选过程中试剂耗材的用量,将单克隆的筛选成本降低至十分之一或百分之一,实现高通量、低消耗的优良工业菌株选育。天木生物基于液滴微流控技术开发了皮升级单细胞分选平台--DREM cell(Droplet entrapping microfluidic cell-sorter)具有体积小、通量高、体系封闭、无交叉污染等特点,越来越成为科学研究和企业生产的重要技术手段。近日,清华大学张翀、安徽工程大学薛正莲研究团队应用DREM cell将液滴微流控技术与基因编码荧光生物传感器相结合,成功实现了高产谷氨酰胺酶突变株的超高通量筛选,相关研究成果以“Combining genetically encoded biosensors with droplet microfluidic system for enhanced glutaminase production by Bacillus amyloliquefaciens”为题,发表在生物化工领域专业期刊《Biochemical Engineering Journal》上。研究团队开发了一种利用谷氨酸拟荧光蛋白传感器 iGluSnFR 的谷氨酰胺酶荧光检测方法,相较于传统的高效液相色谱法,速度提高了700倍。基于iGlusnFR传感器,结合DREM cell单细胞分选平台实现谷氨酰胺酶生产菌株的高通量筛选,单次实验可筛选10万克隆,效率远远超过传统孔板筛选技术。最终项目团队对常压室温等离子体(ARTP)诱变的解淀粉芽孢杆菌全基因组突变文库进行超高通量筛选,成功获得了一株谷氨酰胺酶产量提高47%以上的突变株。该筛选平台,与微孔板筛选系统相比,筛选率提高500倍,试剂用量减少2万倍,并且可以节省大量的多孔板、培养皿、枪头等耗材。▲图丨液滴微流控高通量筛选平台流程图背景信息研究团队所使用的液滴微流控细胞分选仪(DREM cell)是天木生物基于液滴微流控技术开发的皮升级液滴微流控单细胞分选平台,可将待筛选细胞进行包被形成单细胞微液滴,结合荧光筛选模型,可以在细胞水平完成微生物的高通量分离、培养、检测、分选等。▲图丨液滴微流控细胞分选仪(来源:天木生物)高通量皮升级液滴单细胞分选系统(DREM cell)相比于传统筛选方法,筛选效率可提升1万倍,试剂消耗量可下降至百万分之一,在筛选通量显著提升的同时,单克隆筛选成本大幅度降低。该仪器不仅可广泛应用于细菌、酵母、动物细胞等的高通量筛选,还可以应用于蛋白、核酸、抗体等生物大分子筛选等相关研究领域。项目技术参数液滴体积1-1000pL荧光激发与检测可选波段:(1)激发波长488nm,检测波长525±15nm,灵敏度1μM荧光素/单液滴(2)激发波长532nm,检测波长578±11nm,灵敏度100nM试卤灵/单液滴液滴生产频率0-10000个/s液滴分选频率0-1000个/s微注入速度0-1000个/s样品低温控制系统4℃恒温控制,±0.5℃工作环境常压状态下,室温,30%≤湿度≤80%,洁净暗室整机功率600W应用范围细胞、酵母、细菌、蛋白、核酸等
  • 大连华微推出新产品:无极通量“阵列式单细胞超高通量柔性筛选系统”
    —“HW—TORNADO龙卷风”系列大连华微生命科技有限公司(Dalian Life Huawei Technology Co., Ltd.)(以下简称大连华微),是一家拥有自主知识产权,集研发、生产、销售及服务为一体的微流控系统一站式解决方案供应商。大连华微推出“HW—TORNADO龙卷风”系列单细胞液滴制备、混匀、检测、柔性操控与分选综合控制系统,引起业内客户高度关注。“HW—TORNADO龙卷风”系列产品,全球业内具有特色的“N×”阵列式并行模块单元结构,可积木式定制扩展,针对细胞、细菌、酶、病毒、蛋白、线虫等尺寸在0.1微米至2000微米范围的活性生物颗粒,实现高通量筛选:5亿×N个液滴/日(N=1,2,4,8,16…选用阵列数,理论上速度可任意增加);对尺寸在100纳米至2毫米米范围的生物颗粒进行液滴包裹、检测、分析及筛选,可删除空液滴,实现单个液滴只包含一个细胞、菌、酶(或其它生物颗粒);多频激光(405/488/532/561/638等)可根据用户需求配置,共聚焦实时协同作业,并可实现灵活的更换和快速升级;触摸屏软件,智能识别,实现自动化的操作处理;系统可根据客户需求定制生物芯片,实现液滴检测、混匀,以及无损操控与筛选。 大连华微成立伊始,就定位于世界前沿科技的研发与生产,其自主研发的“细胞、菌、酶液滴高通量制备、检测及柔性筛选系统”秉持民族品牌,已经发展5个系列数十种型号,成为业内知名、拥有完全自主知识产权的单细胞液滴自动化控制产品。公司本次重磅推出的:阵列式100%单细胞-巨高通量柔性筛选系统“HW—TORNADO龙卷风”系列,支持全面广泛的应用及科研需求,涵盖单细胞基因测序、基因编辑、细菌分选、药物筛选、疾病诊断、酶活筛选、基因文库构建等多个重要领域。 近一两年,国内出现很多仿制的实验室DIY型“分选系统”——依靠国外成型的功能组件、电源、信号控制部件搭接而成,智能程度低、可靠性差、误差不可控,分选过程对生物颗粒活性影响不可逆,且操作繁琐。最重要的:如果采购这种DIY型“产品”,一旦其进口电源、主控功率部件出现故障或损坏,DIY供应者无法修复,只有更换,且更换成本极高(至少需要RMB十万元以上,维修周期超过两个月,如西方限制进口则无法继续使用)。华微产品源于元器件级别的自主研发,客户众多,质量经过中科院、三甲医院、985高校等高端客户应用及检验,产品可靠性、柔性控制的性能远优于上述DIY型“产品”。华微产品除保修一年外,部件还终身享受成本价格换修(最贵的单个元件更换,不高于前述DIY供应者换修价格的三分之一),维修周期一般不超过一周,自主研发产品不存在受西方限制的核心组件,可大幅节省客户后续使用成本,这是拥有自主核心技术的底气。大连华微生命科技有限公司,依靠自有专利技术,立足独立研发民族品牌,致力于国际前沿领域的微流体控制科技产品的研发与生产,历经十年的探索磨砺,为中国乃至世界的业内客户带来全新的选择。未来公司将一如既往地重视创新科研,与广大华微客户一起携手进步,共同推动着中国生命科学的发展,做世界细分领域有话语权的中国高科技民族企业。关于华微生命科技:大连华微生命科技有限公司,坐落于素有中国“浪漫之都”之称的海滨城市大连高新区火炬路,是大连市第六批“海创工程”企业;成立伊始,就定位于世界最前沿科技的研发与生产,提供生物技术、生命科学、医疗健康、环境保护等领域的专业设备、耗材、服务,以及相关完整解决方案。
  • NanoTemper助力药企研究STING抑制剂片段筛选
    STING抑制剂片段筛选案例干扰素基因刺激因子(Stimulator of interferon genes, STING)在天然免疫中发挥重要作用,当细胞被病原体(如病毒)感染时,STING可以诱导I型干扰素和促炎性细胞因子的产生,是靶向治疗自身免疫疾病和癌症的潜在靶标蛋白。近年STING相关研究火爆,管线数量激增。目前全球范围内在研的STING靶向药物超过50种。今天给大家介绍的STING抑制剂片段筛选案例是由NanoTemper和药明康德旗下的Crelux公司合作完成的。研究人员生产纯化了带有His-tag的STING蛋白,随后使用Prometheus蛋白稳定性分析仪进行缓冲液优化并使用环二核苷酸cGAMP作为阳性对照进行Thermal shift assay,快速验证了蛋白的结合活性。案例回顾:差示扫描荧光法表征蛋白配体互作,不加染料的那种接下来研究人员使用Dianthus完成了片段化合物库单点筛选及亲和力排序。在使用Dianthus进行筛选时,其中一个分子需要带有荧光。本实验中, 研究人员使用His-tag荧光标记试剂盒对STING蛋白进行了特异性标记,片段终浓度为500μM,结合缓冲液为50 mM HEPES, pH 7.4, 150 mM NaCl, 3 mM DTT, 0.005% TWEEN® 20, 4% DMSO。 STING片段筛选流程下图为单点筛选结果,2213个片段加上阳性及DMSO对照(均重复一次)总共采集了5376个数据点,即14块384孔板。消耗590μg STING蛋白,上机检测时间约8h(Dianthus 33分钟即可完成一块384孔板检测,↓ 文末查看Dianthus上机演示)。紫色线框中的黄色数据点为阳性对照cGAMP,213个阳性化合物响应值CV仅0.25%,检测重复性非常好。最后将单点筛选结果中的162个hits(上图蓝色数据点)进行12个浓度点的梯度稀释检测亲和力。消耗STING蛋白190μg,上机检测时间约3小时。苗头化合物验证基于片段的药物发现 (FBDD) 是药物研发的主流方法之一。但片段分子量低,且与蛋白靶标亲和力低,通常在μM-mM范围,因此对筛选技术的灵敏度有较高的要求。Dianthus基于光谱位移技术(Spectral shift)检测,不依赖于分子量,可检测pM-mM的亲和力。此外,Dianthus检测一个kd仅需1min,单孔上样体积20μl,是您亲和力筛选项目的强大工具!Dianthus产品介绍:全新Dianthus携光谱位移技术横空出世,1分钟击破亲和力筛选难点!wx搜索NanoTemper视频号,查看Dianthus上机操作演示吧!
  • 火热报名ing|“创新高通量药物筛选技术与应用”网络研讨会日程公布
    高通量药物筛选技术是一种为寻找新药先导物而对大量样品进行药理活性评价分析的技术手段,巧妙地融合了药理学技术、分子生物学技术、细胞生物学技术、计算机技术以及自动化技术等多种技术,实现了药物筛选的快速、高效、微量化、自动化和规模化。经过几十年的实践和发展,高通量筛选技术已成为新药研究和开发的重要技术方法。为帮助广大实验室用户及时了解高通量药物筛选创新技术以及在药物研发中的应用进展,仪器信息网将于2023年6月20日举办“创新高通量药物筛选技术与应用”网络主题研讨会,欢迎大家踊跃报名!报名链接:https://insevent.instrument.com.cn/t/Pts (点击报名) 精彩报告预告: 兰姝珏 高通量筛选主管/高级工程师中国科学院分子细胞科学卓越创新中心《高通量药物筛选技术体系的建立与运用》【报告摘要】 高通量筛选是药物研发不可或缺的重要环节。学术界高通量筛选技术平台可以帮助科研团队快速启动基础研究前沿成果的转化,为创新型药物研发奠定坚实的基础。本报告将详细介绍中科院分子细胞科学卓越创新中心化学生物学技术平台,分享平台在药物筛选方面的各高通量筛选技术体系建立策略及其前沿运用。报名占位》》》韩帅 高级工程师中科院分子细胞科学卓越创新中心《功能基因组筛选与药物新靶标发现》【报告摘要】 高通量测序技术及功能基因组筛选可以帮助我们更加快速有效地研究疾病发生发展的机制,发现新的药物靶标。本报告将与大家分享我们建立的多种高通量、高内涵筛选体系,以及这些体系如何帮助研究人员成功地鉴定有潜力的靶标。报名占位》》》潘建章 分子智造平台总架构师/副研究员浙江大学化学系/浙江大学杭州国际科创中心《iChemFoundry — 自动化分子智造平台的构建与应用》【报告摘要】 分子智造平台iChemFoundry是国际先进的化学材料智能高通量合成与筛选平台。平台基于机器人技术、微流控技术、自动化合成技术和高通量表征等前沿技术构建,通过深度融合AI人工智能技术,实现了“高通量合成 - 高效表征 - AI实验参数迭代 - 高通量合成”全自动闭环的新物质智能创制。报名占位》》》陈云雨 副教授皖南医学院《新冠病毒主蛋白酶抑制剂三明治样荧光偏振高通量筛选模型的建立与应用》【报告摘要】 进化保守的新冠病毒主蛋白酶(main protease, Mpro)在调控病毒RNA复制与免疫逃逸中具有重要的生物学功能,已成为新型广谱抗冠状病毒药物开发的理想靶标之一。本研究以新冠病毒Mpro为靶标,首次提出并建立以三明治样荧光偏振高通量筛选模型为核心的Mpro抑制剂高效筛选关键技术平台,快速发现天然药物来源的新型Mpro抑制剂,为广谱抗冠状病毒药物的高效筛选与发现奠定了基础。报名占位》》》王静 副主任技师/副高北京大学药学院天然药物及仿生药物国家重点实验室《分子互作与拉曼光谱技术在高通量药物筛选中的应用》【报告摘要】 高通量药物筛选是发现先导化合物最有效的方法之一。本报告将重点介绍分子相互作用技术(如表面等离激元体共振成像、生物膜干涉、光谱位移技术等)和拉曼光谱技术(如表面增强拉曼散射、显微共聚焦拉曼光谱等)在高通量药物筛选中的应用。报名占位》》》方根 应用工程师上海闪谱生物科技有限公司《酶标仪与高通量筛选系统》【报告摘要】 介绍高通量筛选技术、酶标仪与微孔板系统、酶标仪在高通量筛选中的应用与实例。报名占位》》》陈奕奕 应用工程师贝克曼库尔特生命科学《自动化时代下如何加速高通量筛选进程》【报告摘要】 现代小分子药物研发中最重要的基础手段是筛选,这之中需要大量的移液操作,工作量大且耗费时间,易于出错,移液步骤是造成新药开发失败的重要原因之一。随着科技发展,自动化技术在生物医学领域应用广泛,可以帮助我们有效改善工作流程,提高数据质量。贝克曼库尔特生命科学专注于自动化的移液方法,从纳升级到微升级水平,灵活整合多种设备,帮助您加速药物筛选工作流。报名占位》》》王慧 产品应用经理安捷伦科技有限公司《微孔板检测与成像技术在高通量药物筛选中的应用》【报告摘要】 1,药物筛选中高通量筛选技术概览 2,活细胞成像技术在高通量筛选技术中的应用 3,成像技术与酶标检测结合如何实现药物筛选的弯道超车。报名占位》》》 会议日程 (持续更新)创新高通量药物筛选技术与应用( 2023年6月20日)报告时间报告主题专家信息09:30-10:00高通量药物筛选技术体系的建立与运用中国科学院分子细胞科学卓越创新中心兰姝珏 高通量筛选主管/高级工程师10:00-10:30酶标仪与高通量筛选系统上海闪谱生物科技有限公司方根 应用工程师10:30-11:00自动化时代下如何加速高通量筛选进程贝克曼库尔特生命科学陈奕奕 应用工程师11:00-11:30iChemFoundry — 自动化分子智造平台的构建与应用浙江大学化学系/浙江大学杭州国际科创中心潘建章 分子智造平台总架构师/副研究员11:30-13:30午休 13:30-14:00分子互作与拉曼光谱技术在高通量药物筛选中的应用北京大学药学院天然药物及仿生药物国家重点实验室王静 副主任技师/副高14:00-14:30微孔板检测与成像技术在高通量药物筛选中的应用安捷伦科技有限公司王慧 产品应用经理14:30-15:00功能基因组筛选与药物新靶标发现中科院分子细胞科学卓越创新中心韩帅 高级工程师15:30-16:00新冠病毒主蛋白酶抑制剂三明治样荧光偏振高通量筛选模型的建立与应用皖南医学院陈云雨 副教授扫码加入高通量药物筛选技术交流群(发送备注姓名+单位+职位)扫码直达报名页面温馨提示:1) 报名后,直播前一天助教会统一审核,审核通过后,会发送参会链接给报名手机号。填写不完整或填写内容敷衍将不予审核。2) 通过审核后,会议当天您将收到短信提醒。点击短信链接,输入报名手机号,即可参会。会议内容及报告赞助:仪器信息网 赵编辑:13331136682,zhaoyw@instrument.com.cn
  • 英国谢菲尔德大学神经转化研究所(SITraN)高内涵筛选成像大赛投票结果揭晓
    11月9日,由英国谢菲尔德大学神经转化研究所(SiTraN)组织的高内涵筛选成像大赛结果火热出炉。来自Mohammed Karami的Transformers从一系列优秀的参选图片中脱颖而出。获奖图片据悉,在多个研究小组及个人的捐赠与支持下,SiTraN中心一年多前引进了PerkinElmer Opera PhenixTM高内涵成像系统,并使用该成像系统上进行了大量聚焦神经科学及转化方向的科研项目,通过此次成像大赛SiTraN各研究组展示多项相关工作成果。据SiTraN中心介绍,这台自动化的成像设备一天可以完成普通共聚焦显微镜需要耗费100天才能完成的工作,这极大的提高了药物筛选的实验效率。此次高内涵成像大赛吸引了该研究中心7个研究小组及个人的参与,其中两个小组在这台系统上进行了多方向的研究项目。SiTraN中心在Opera Phenix高内涵成像系统上运行了各种细胞及动物实验模型,从简单的单细胞培养成像观察,如标记线粒体到更复杂的两种或多种类型的亚细胞结构的检测,通过成像以及设备高内涵数据分析软件,对混合培养的细胞进行计数或者进行类神经结构的定量分析。值得注意的是,该中心还使用Opera Phenix成像系统进行了针对治疗运动神经元病以及帕金森病的新型药物筛选等多个研究项目。从患者身上进行很小的皮肤成纤维细胞样本采样,从这些皮肤细胞可以进一步研究这些患者特异的基因突变或者可以通过干细胞技术将这些细胞重编程为神经细胞或其他的神经支持细胞,研究神经性疾病中神经系统病变。这些研究中研发的技术可以更广泛的用于阿尔茨海默症、神经硬化症以及相应的药物筛选从而帮助学界加深对这些疾病过程的了解或探索新的治疗靶点。还有一些课题组使用该成像系统进行斑马鱼成像。这些实验中,想保证每一条斑马鱼样本的成像方向一致是件非常有挑战性的工作,通过使用Opera Phenix 成像系统配置的特殊成像功能,研究者们在自动寻找目标神经细胞群这块取得了很大的进展。斑马鱼是可以进行基因编辑的很好的疾病模型,为在体药物筛选提供了理想的方案。比如,在运动神经元疾病中起神经保护作用药物以及在多发性硬化症促进髓鞘形成药物。这些患者来源的细胞和斑马鱼可以帮助科学家们探索运动神经元疾病、帕金森病,多发性硬化症以及其他神经系统疾病:这正是nihr 谢菲尔德大学医学研究中心的使命。于此同时,Opera Phenix 高内涵成像筛选系统也凭借其优越的性能已成为该药筛平台最受欢迎的筛选设备。参赛作品除了以上几个选项,这次竞赛还收集到一些非常有意思的Opera Phenix的参选图像,一并列出供大家欣赏。图片作者信息: aurelie schwarzentruber, ruby macdonald, mohammed karami, chris hastings and camilla boschian are all part of dr heather mortiboy’s team. noemi gatto, chloe allen and monika myszczynska are part of dr laura ferraiuolo’s team. dr alex mcgown is a member of dr tennore ramesh’s team.如您想了解更多微信搜索关注珀金埃尔默生命科学
  • PKI荣获2007生命科学行业高通量筛选奖
    来自美麻省Waltham5月30日的消息,全球领先的健康科学与光电子科学技术公司PerkinElmer公司获得了2007年第三届生命科学行业奖(Life Sciences Industry Awards)高通量筛选奖项(High Throughput Screening,HTS)。 此次生命科学行业奖是由《科学人》(The Scientist)杂志与咨询公司BioInformatics LLC合作主办,对The Science Advisory Board(世界上最大的科学家消费者市场研究小组)的注册成员和《The Scientist》杂志的读者进行调查,并将反馈结果与实际因素如对产品特征的满意度、再次购买的可能性、推荐供应商的可能性以及性价比等相结合,给各生命科学厂家打分,最终选出了11名在20个领域中出类拔萃的,市场份额高、用户满意的佼佼者(见第三届生命科学产业奖落幕,11家公司榜上有名)。 PerkinElmer公司生命科学与分析科学部总裁Robert F. Friel表示,“获得这些科学团体和我们的顾客承认是我们无上的光荣,我们的产品能帮助这些从事着重要研究的工作人员,这让我们感到十分欣慰”,“无论是我们的生物化学筛选,细胞成像仪器,还是这些高灵敏性试剂及分析平台,这一奖励表明生命科学团体对于PerkinElmer作为可以为高级细胞研究和药物研发提供领先技术的供应商的肯定。” BioInformatics LLC公司市场部总监Robin Rothrock评价道,“PerkinElmer获得了这一奖项主要是因为他们重新定义了药物研发:从多孔板发展成了整体考虑,强大的筛选平台。” PKI现有许多强有力的HTS技术的产品,包括自动化,流式操作,检测仪器,以及可以用于最大多功能化,高灵敏度,及高速实验筛选的生化及细胞分析平台。并且随着新获得一些专利权,比如从Axxam’s Photina® 获得的发光 GPCR及离子通道平台专利,以及Evotec Technologies的高含量分析系统,PKI将继续发展强大的筛选分析技术。 PerkinElmer股份有限公司 PerkinElmer是一家全球性的业界著名技术领先公司,其业务集中在三个领域——生命科学、光电子学和分析仪器。 珀金.理查德和埃尔默.查理斯于1937年4月19日创立PerkinElmer公司,1944年,PerkinElmer公司进入分析仪器的全新领域,并成功推出世界上第一台商用红外分光光度计-12型。这项新技术就是现代化学分析手段的鼻祖。并使PerkinElmer公司占据了世界化学分析仪器供应商的领先地位。1955年5月,在英国人A.J.马丁研究开发的技术基础上,PerkinElmer公司推出世界上第一台商用气相色谱仪-154型。1957年匹兹堡会议上,公司又推出世界首台双光束红外光谱仪137型,新产品的推出标志着以低成本进行红外分析的开端,对当时分析仪器行业具有极为重大的意义。50年代后期和60年代,公司先后研究开发出先进的气相色谱技术和原子吸收分析技术。在这一时期,PerkinElmer公司以其创制出的第一台原子吸收分析仪-AA303型占据了世界分析仪器行业领先地位。1972年,公司进入液相色谱市场,成功推出最早的带梯度泵的液相色谱仪-1220型。1975年,公司将微机技术引入460型原子吸收光谱仪,使原子吸收分析的进行更轻松更有效。自80年代起,PerkinElmer公司开始涉足电感耦合等离子体光谱仪(ICP)和电感耦合等离子体质谱仪(ICP-MS)领域,发展至今已成功地在这一领域占据世界领先地位。领先的技术,精湛的工艺,全面的客户服务,让PerkinElmer成为分析仪器界新技术和完善产品的代名词,并赢得了分析仪器客户的衷心信赖和支持,成为在原子光谱(原子吸收、电感耦合等离子体发射光谱仪、电感耦合等离子体质谱仪)、分子光谱(傅里叶变换红外/近红外、紫外/可见近红外光谱仪、荧光、旋光)、气相色谱和气相色谱-质谱联用仪、液相色谱仪以及热分析系统(差热分析、热重、动态/静态热机械分析仪、同步热分析仪)等化学分析仪器领域最著名的供应商之一。 PerkinElmer同时也是生化领域占全球第三位的领先供应商,特别是在药物高通量筛选、全自动液体处理和样品制备以及遗传疾病筛查方面是世界第一位的供应商。最初生命科学部由Wallac跨国集团(1950年在芬兰作为Wallac Oy创立)和NEN Life Science Products(1956年作为New England Nuclear创立)所组成。2001年,公司完全整合了NEN Life Sciences并且完成了对Packard BioScience的收购。生命科学部通过重新定位它的业务到高增长市场进行扩张,从1999年以来,PerkinElmer投资了超过十亿美圆到生命科学业务中,在2001年, 生命科学部研发并投放到市场的新产品和新技术达到了一个创纪录的数字,迅速提升自己成为蛋白组学、基因组学、药品开发和遗传疾病筛查领域的技术领先者。我们的强项在于我们具备在液体处理、样品制备、化学、检测和信息管理等各方面全面的知识和经验。我们的客户还涉及到大量与疾病医疗相关的研究计划,这些计划的范围从发现特殊的基因和弄清它们的功能到为新药认证生物学目标以及筛选候选的新药。临床筛查计划则有助于鉴别高危人群以便在他们今后的生存期内缓解或预防疾病。 随着PerkinElmer在中国业务的迅速增长,PerkinElmer总部加大了对中国的投资力度。2006年2月PerkinElmer在上海张江高科技园区正式成立了中国技术中心。新的技术中心大楼集中了公司的销售、物流、维修、技术支持、客户服务等各个部门。同时还将进一步发展成为全球物流和研发的基地。在技术中心里建立了亚太区最大的示范实验室,并且专门投资装备了将服务于全球半导体行业分析应用的1000级超净实验室。在示范实验室里可以看到PerkinElmer公司生命科学与化学分析仪器几乎所有最新型号的仪器,每个月都会举办多期用户培训班,并为客户提供方法开发、优化等多项增值服务。中国技术中心的建成将成为珀金埃尔默公司提高对整个中国地区,乃至整个亚太区域的客户的服务水平打下坚实的基础。
  • 天津工生所等在基于小分子传感器的放线菌高通量筛选方面获进展
    放线菌能生产种类繁多的次级代谢产物,而微生物发酵是人们获取这些天然产物的重要手段。对于某一目标产品,野生菌株的产量一般难以满足工业生产的要求,需要经过长期的菌株驯化以提升产量。小分子生物传感器与液滴微流控的组合已被证明是放线菌菌株改造和高通量筛选的有效手段。然而,在菌株驯化过程中,目标产物的产量往往是阶段上升的,而多数生物传感器仅能在一定的操作范围内响应目标化合物,难以支持从野生菌株到工业菌株多阶段的长期驯化。因此,在不同的菌株改造阶段,需要不同性能参数的生物传感器相适配以实现高通量筛选。近日,中国科学院天津工业生物技术研究所高通量编辑与筛选平台实验室研究员王猛带领的科研团队,通过对红霉素生物传感器的多轮迭代诱导和筛选,获得了一系列不同灵敏度和操作范围的生物传感器。通过表征实验,该团队证明了转录调控因子(TF)的表达水平与生物传感器灵敏性之间的关联,展示了调控TF蛋白表达水平是改变TF生物传感器性能参数的一种快速而便捷的方法。为了模拟工业菌株驯化过程,该团队从两株产量不同的红霉素生产菌株出发进行液滴共培养实验,证明了生物传感器性能参数与生产菌株产量范围的适配性是成功筛选的前提条件,并从两个不同初始产量红霉素生产菌株文库中筛选到产量提升6.8倍的突变株。基于基因组学的生物信息学分析使该团队在高产突变株中挖掘到多个有益位点,以指导未来的理性代谢工程改造。相关研究成果发表在ACS Synthetic Biology上。研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金、合成生物学海河实验室重大攻关类项目、中国科学院青年创新促进会及天津市合成生物技术创新能力提升行动的支持。小分子生物传感器的改造和高通量筛选过程
  • 加速抗病毒药物高通量筛选,我们提供的不仅仅是实验方案
    当前,COVID-19疫情已在全世界范围蔓延,国内形势逐渐转好但也绝不能松懈,全民复工复产推动经济运转是自救也是对其他国家的支持。特别是医疗和制药行业,在疫情开始阶段就投入研发和生产,加速药物筛选、临床诊断和疫苗研发仍然是药企复工后的重中之重,也是今后长期持久的工作。从各地治疗方案的报道来看,不仅仅考虑对新冠肺炎的治疗效果,更考虑到患者治愈后的生活质量,用药较SARS时期更为谨慎。这也提示,经过此次“战疫”,对于药效、作用机制和副作用的研究要求更为明确,国家可能对新药审批和监管更为严格。疫情之下,珀金埃尔默积极行动,基于在药物研发领域积累的经验和对法规的理解,我们从药物高通量筛选(HTS)的层面出发,为药企提供设备、软件和服务全流程方案。利器加速研发成果转化01利用类病毒颗粒报告基因系统进行药物筛选EBOV trVLP类病毒颗粒报告基因系统可以很好的模拟病毒生命周期,可用于高通量非靶点(target-free)药物筛选,通过EnVision检测报告基因荧光素酶和底物结合释放的化学发光信号来评价化合物的抗病毒活性;同时研究化合物是如何影响病毒进入细胞、复制以及分泌。[1] p1细胞检测药物对病毒进入、复制和转录的抑制作用。p1细胞给药后的细胞上清被转移至p2细胞,用以检测病毒组装和分泌。02病毒空斑检测病毒空斑检测是临床前和临床研究中评价抗病毒药物和疫苗效果的一种通用方法。利用荧光免疫染色和EnSight多功能微孔板检测对96孔板中的RSV(呼吸道合胞病毒)侵染HEp-2细胞产生的空斑成像,通过Kaleido分析软件自动识别病毒空斑并计数,检测RSV滴度,以及抗RSV中和抗体滴度。[2][3]病毒空斑自动计数。A. 细胞明场成像和免疫荧光成像识别到的病毒空斑。B. 软件自动识别的空斑,紫色表示溶斑空洞中心,相应的噬斑显示为红色;非裂解空斑以蓝绿色表示。算法可同时识别裂解(lytic)和非裂解(non-lytic)两种病毒空斑并自动计数。03细胞活力和细胞毒性检测细胞活力或毒性检测是临床前评价药物安全性的重要方法。 ATPlite 1step检测系统将ATP代谢活性作为细胞活力的检测指标,通过Victor Nivo化学发光检测模式对ATP水平定量,当细胞的ATP浓度下降,表示细胞处于凋亡或坏死状态。这种快速灵敏的方法也用于检测化合物诱导的细胞毒效应。[4]04细胞因子风暴监测在新冠肺炎治疗过程中发现,有些急重症病人在免疫系统被激发后,过量细胞因子释放会导致细胞因子风暴,危机病人生命。通过多色AlphaPlex技术可以同时检测细胞因子IL6和IL8的含量,从而开发提升疗效或抑制细胞因子风暴产生的方案,帮助患者度过危险期。检测细胞因子释放也是评价治疗效果及安全性的重要指标。[5]扫平合规之路将一种新药或治疗方法推向市场,是一个繁琐而复杂的过程——必须遵守FDA 21 CFR Part 11或EU Annex 11指南。使用我们针对珀金埃尔默多模式读板仪的增强安全软件,遵守法规就简单多了。该软件提供了所有兼容的工具,包括:高级用户管理审计追踪电子签名导出文件认证全流程验证和确认在多模式微孔板检测系统的使用寿命周期中,会执行多次确认测试。这些测试可以确保仪器达到最佳性能。珀金埃尔默执行这些确认测试,并为您提供证书,作为GxP合规的证明。制药和生物技术公司,包括临床研究机构,需要定义明确的SOPs、可靠的仪器、兼容的软件、经过验证的检测方法等,以确保一切都处于高水平运行。将我们的产品和服务与您的SOPs结合起来,成为一个完整的合规性解决方案。因此您可以专注于真正重要的事情——您的科学研究。扫描下方二维码,即可下载珀金埃尔默“应对复杂的合规需求”电子书《“应对复杂的合规需求”电子书》参考文献 1. Lee N, Shum D, K?nig A, et al. High-throughput drug screening using the Ebola virus transcription-and replication-competent virus-like particle system[J]. Antiviral research, 2018, 158: 226-237.2. Wen Z, CitronM, Bett A J, et al. Development and application of a higher throughput RSV plaque assay by immunofluorescent imaging[J]. Journal of virological methods, 2019, 263: 88-95.3. 快速高效判断病毒活性,何惧“疫”军突起https://mp.weixin.qq.com/s/vEPswHUqS1juaRgmXS4HBQ4. Kuzikov M, Kanke R, ScreeningPort F I M E. Measuring Cell Proliferation and Cytotoxicity using the ATPlite 1step System and the VICTOR Nivo Multimode Plate Reader[J].5. Ruby P, Groves K. Simultaneous Detection of IL-6 and IL-8 Secretion by Cell Lines using AlphaPlex Technology.
  • 评新而论Vol.01 达普Cytospark CSP高通量细胞筛选系统
    听用户真实评价,晓新品技术进展!【评新而论】第1期,本期主角是达普Cytospark CSP高通量功能性细胞筛选系统,分享3位来自高校及生物企业用户的真实评价。 仪器新品区 产品名称:Cytospark CSP 高通量功能性细胞筛选系统点击查看展位详情仪器特点:独特性:基于细胞表型的筛选,整合流式分选与ELISPOT 检测为一体,可依据细胞分泌产物(蛋白),并兼顾细胞表面及胞内标志物的单参数或多参数分选;高通量:单次实现106 B细胞的功能筛选;高效率:筛选速度相对传统 96 孔板法,提高 3-4 个数量级;低成本:减少试剂用量,试剂消耗降至传统方法的百万分之一;产品介绍:CSP高通量筛选系统改变了常规以微孔板为筛选体系的思路,利用液滴微流控技术,可实现单次百万级细胞包裹检测和分离。突破了常规高通量筛选的通量上限,为功能性细胞或困难靶点提供更多可能。在抗体发现工作流程中,使用 CSP 高通量筛选系统可将之前数周的筛选工作压缩到 1~ 2 天内完成, 精准且高效地完成对百万级单 B 细胞的筛选。为抗体药物的发现提供了更高效的解决方案。单 B 细胞抗体制备技术是最近十几年发展起来的一种可直接用原代 B 细胞制备全天然性抗体的技术,其原理是从免疫动物或患者的组织或外周血中分离抗原特异性 B 细胞,并筛选出分泌目标抗体分子的 B 细胞,结合单细胞 PCR 技术,扩增出 IgG 重链和轻链可变区基因,构建表达载体,之后进行表达、纯化、筛选和鉴定,以获取有效功能性抗体。该技术具有开发周期短,抗体保持重轻链天然配对,多样性丰富且亲和力高等优势。 用户评论区 用户1:“PL级反应体系,甚至可以实现基于稀少的原代细胞药物筛选”单位:上海某高校药学院评论:我们采购的达普基于微液滴高通量筛选系统,系统操作简单,且仪器免维护,系统使用PL级反应体系的功能性细胞筛选方式,不但节省了试剂用量,还可用稀少的原代细胞进行药物的筛选,以能更接近体内环境的方式筛选出有效的药物,系统不但能研究药物作用机制,在前期药物开发的过程中,还可用进行高通量化合物DEL库的筛选,是药物开发过程一个非常有用的先进工具!用户2:“一机多用!为我们节省大量试剂和时间,单B抗体筛选利器” 单位:上海抗体开发公司评论:我们因为抗体开发过程中高通量筛选的需求,采购了达普生物基于液滴微流控技术开发的CSP高通量功能性细胞筛选系统,该系统操作比较简单,并且通量很高,单次可以实现106B细胞的筛选,以帮助从大量的原代B细胞中筛出分泌高性能抗体的细胞,相比基于流式分选,培养,ELISA检测的方式,PL级的微液滴体系和1-2h的孵育时间,基于细胞外分泌抗体直接筛选高性能浆细胞,节省了大量的试剂和时间消耗。另外该系统可以根据不同的需求,基于磁珠法,报告细胞法等分别对可溶性抗原抗体或跨膜蛋白抗原抗体进行筛选, 一机多用,是单B抗体筛选不可缺少的先进工具。用户3:“解决了我们之前膜蛋白抗原获得难,跨膜蛋白抗体筛选难或无法进行的问题”单位:广州抗体开发公司评论:我们因为膜蛋白抗体筛选的需求购买了达普生物CSP高通量功能性细胞筛选系统;该系统基于微液滴技术,可将报告细胞与抗体表达细胞共包裹,基于报告细胞将阳性B细胞进行分选富集打印到96孔板,直接基于天然抗原筛选高性能抗体,解决了我们之前获得膜蛋白抗原难,跨膜蛋白抗体筛选难或无法进行的问题,目前我们已经基于该系统在跨膜蛋白抗体筛选上取得一些不错的进展,期待改系统未来在更多膜蛋白抗体筛选项目及我们真在规划的双特异性抗体筛选项目给我们带来更多惊喜!你还想看到哪款仪器新品的真实用户评价,请留言给我们。新品首发,尽在仪器信息网!相关服务欢迎垂询010-51654077-8215
  • 220万!华南理工大学全自动微生物克隆筛选系统采购项目
    项目编号:GZZJ-ZFG-2023074项目名称:华南理工大学全自动微生物克隆筛选系统采购项目预算金额:220.0000000 万元(人民币)最高限价(如有):220.0000000 万元(人民币)采购需求:包组号序号标的名称数量(单位)简要技术需求或服务要求(具体详见采购需求)最高限价万元(人民币)11全自动微生物克隆筛选系统1套用于获取克隆形态学参数和克隆定位。系统可以根据克隆形态学参数(克隆大小、圆度、纵横比,克隆之间的距离等)对目的克隆的筛选,挑选符合要求的克隆。在工业微生物研究、酶定向进化,蛋白表达,生物燃料,宏基因组学,噬菌体展示技术,肠道微生物,文库筛选管理等方面具有广泛应用。人民币220万元经政府采购管理部门同意,本项目允许采购本国产品或不属于国家法律法规政策明确规定限制的进口产品,具体详见采购需求。本项目采购标的所属行业为:工业合同履行期限:国内供货:在合同签订后(30)天内完成供货、安装和调试并交付用户单位使用。境外货物:办理免税证明后(90)天内。本项目( 不接受 )联合体投标。对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名称:华南理工大学地址:广州市天河区五山路381号联系方式:文老师020-871129622.采购代理机构信息名称:广州中经招标有限公司地址:广州市越秀区寺右一马路18号泰恒大厦14楼1409室联系方式:陈小姐、庄小姐 020-87385151、020-37639369、020-87371812、020-873722963.项目联系方式项目联系人:陈小姐、庄小姐电话:020-87385151
  • 英国BIBBY的多管反应工作站,傲步天下! -- 成份筛选,视频直击
    实验室中通过哪种仪器,可以达到成分筛选的目的? 英国BIBBY 向您骄傲地推荐其全球独一无二的STEM Integrity 多管反应工作站。这是BIBBY与剑桥大学,GSK携手共同研制的反应工作站,一经推出,风迷制药,石化等行业,为成份筛选或溶解/结晶测量提供了完美方案。有INTERGRITY多管反应工作站的最新视频(在优酷网www.youku.com 和腾讯视频网 v.qq.com 都可找到)链接:http://v.youku.com/v_show/id_XODEwNDM3MjMy.html 大家常见的平行反应工作站,每个反应池的反应条件都是一样的,也就是说其温度与搅拌速度都相同; 这里介绍的STEM integrity 10 多管反应工作站,在同一系统中同时管理10个不同反应;每个反应在独立反应池中,各自有独立的温度控制和搅拌速度,这就是其全球独一无二之处了!温度范围-30℃至150℃。变温速率也可以调整,为0.1°C/min - 5°C/min.。这是一个适合大多数实验室的优秀的筛选工具,并可以用来建立一个理想的反应条件。选用浸入或者非浸入的IR浊度探针附件,可以用来精确地测定晶体转变点,以提供更进一步的溶解度过程检测作用。总结产品特点:1)一个模块中有10个独立的反应池 2)每个池具有独立温度和搅拌速度控制 3)温度范围-30℃至150℃ 4)搅拌速度 350 rpm - 1200 rpm 5)池工作体积 2ml - 25ml 6)可选附属装置用于回流,和在真空及惰性气体下工作 7)可选多重红外探头用于溶解/结晶研究 Intergrity 10 是10个反应池的多管反应工作站; 还有6个反应池的多管反应工作站,即Intergrity 6,工作池体积为10ml - 50ml。Electrothermal 子品牌最新加入英国BIBBY SCIENTIFIC 比比科技大家庭,拥有70多年的加热、制冷和搅拌设备的制造经验。Electrothermal一直以品质优良称誉,引领电热套与平行反应市场。 关于语特 和 英国Bibby / 德国ART / 德国CAT ( http://bibbyyt.instrument.com.cn. 电话/传真: 020 2802 3589 电邮: GZ_YT8@163.com)广州语特仪器科技有限公司专注于搅拌器/分散乳化机等实验室样品制备等通用仪器, 熔点仪/光度计等分析仪器,以及PCR等生命科学仪器。 作为英国比比(Bibby )在中国南方的首代,广东,广西,四川,重庆,云南,海南,贵州和西藏是我司的服务范围。语特公司也是德国ART, 德国CAT 在中国的首代。英国BIBBY 成立于上个世纪50年代,作为英国最大的实验室科学仪器仪器生产商,世界上拥有最广泛产品系列的实验室仪器制造商之一, 其向全球提供的品牌产品以高品质和高操作性能而著称. 旗下有4个子品牌:Stuart,Techne,Jenway,Electrothermal.l Stuart: 专注于样品前处理等通用实验室仪器,包括: 熔点仪, 菌落计数器, 搅拌器, 混匀器,摇床, 纯水蒸馏器系列;l Techne: 专注于分子生物学研究设备(基因扩增仪和杂交箱), 以及温度控制产品系列(包括水浴和干浴) ;l Jenway: 是紫外/分光光度计, 火焰光度计,色度计等分析仪器的专家;l Electrothermal: 作为有70多年历史的BIBBY的新成员,全球领先的科学仪器提供者,提供电加热套,平行反应设备, 凯氏定氮设备, 电子本生灯系列。其平行反应设备是全球市场领导者。 德国ART 成立于上个世纪,是德国乃至全球最专业的分散乳化专家。 其顶级分散乳化产品从实验室仪器,中试产品到工业设备, 分散头种类极多,可满足客户各类需求;应用领域覆盖了化工,化妆品,制药,食品,环保等各大领域。德国CAT 成立于上个世纪50年代,是德国样品制备仪器方面的专家之一。其搅拌器,从手持式,教学用,到科研通用型,高粘度型,应有尽有,是CAT的代表产品线; 而今又由普通电子马达走向无刷马达, 引领着搅拌器的研发潮流。
  • 科技部部长万钢“点赞”这个微生物高通量筛选平台
    p   6月29日,全国政协副主席、科技部部长万钢在参加首届世界智能大会期间,到中国科学院天津工业生物技术研究所调研指导。实地考察了研究所科技创新及产业化工作,调研合成生物技术创新中心的建设情况,亲切慰问了一线科研人员,对研究所的定位布局及工作进展给予了肯定。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201707/insimg/574724c7-3cf4-417b-b190-a368d5b5b661.jpg" title=" 1_副本.jpg" / /p p style=" text-align: center " 万钢参观科技展厅 /p p   万钢参观了天津工业生物所科技展厅并听取了马延和所长关于研究所战略任务、学科体系、领域方向、发展愿景等方面的介绍,观看了正在组建的合成生物技术创新平台的介绍。万钢指出,生物研究领域十分广阔奥妙,希望天津工业生物所能够把大方向和微创新相结合,广泛集聚人才,协同创新,取得更大的进步。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201707/insimg/d326ad18-510a-438c-9bda-cb41fe80901e.jpg" title=" 2_副本.jpg" / /p p style=" text-align: center " 万钢参观微生物高通量筛选平台 /p p   随后, strong 万钢走进微生物高通量筛选平台以及总体研究部实验室,认真观摩了高通量液体处理及分析检测系统和DNA合成系统,深入了解了高能糖电池、细胞工具计算设计、天然珍稀产物微生物合成、类丝蛋白、生物传感器等成果的技术细节以及研究所以三维科研组织模式为代表的体制机制创新探索,并与一线科研人员进行了亲切交谈。 /strong 万钢表示,天津工业生物所有一支年轻活跃的人才队伍,为工业生物技术研究提供了新鲜血液 正在开展的二氧化碳转化、糖电池等研究项目前瞻性强,希望研究所认真规划,科学布局,率先取得新突破。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201707/insimg/55defb78-79bd-4c65-80a6-c5ba2073aa7c.jpg" title=" 3_副本.jpg" / /p p style=" text-align: center " 万钢了解高能糖-氢电池成果并给予指导 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201707/insimg/22c902c1-61e0-4352-9dfe-6660a28b522b.jpg" title=" 4_副本.jpg" / /p p style=" text-align: center " 万钢观看研究所的科研成果 /p p   科研成果展台前,万钢系统了解了天津工业生物所在绿色生物合成、生物质转化与生物制造、植物产物重组细胞合成等方面取得的创新成果,并详细询问了研究所“BioInn”众创空间的建设情况。万钢对天津工业生物所科技创新与产业应用工作给予了充分肯定,对研究所科技成果带来的节能减排、清洁高效的社会经济效益表示赞赏,并对研究所提出的“工业原料路线转变”、“化工基础工艺转变”、“传统种植模式转变”三大颠覆性发展模式寄予了殷切期望。 /p p   最后,万钢还听取了合成生物技术创新中心从功能定位、建设布局、运行机制、规划布局等方面的汇报,对研究所未来发展与中心建设提出了三点要求:一是要从基因编辑入手将基础工作做牢做实,为应用研究奠定坚实基础 二是要高度重视生物安全,将生物安全作为单独工程来抓,注重制造过程与生物应用的安全 三是要将产业作为产品的目标,形成新的生物产业体系。 /p p   天津市副市长曹小红,天津市政协秘书长李金亮,天津市科委主任戴永康,天津港保税区管委会主任杨兵等参加调研。 /p
  • 金艾顺教授与日本研究团队合作发现T细胞活化新机制并研发快速筛选功能性TCR新技术
    4月8日,重庆医科大学基础医学院金艾顺教授与日本富山大学医学部免疫学研究室Kishi Hiroyuki/Atsushi Muraguchi/Kobayashi Eiji等合作的研究成果在生物医学工程TOP期刊《Nature Biomedical Engineering》杂志在线发表。该成果发现了T细胞识别抗原新机制,并研发了将其应用于肿瘤特异性T细胞受体(TCR)快速筛选和TCR-T细胞免疫治疗的新技术。机体免疫系统的免疫细胞能识别和清除体内的肿瘤细胞或被病毒感染的细胞。T淋巴细胞(T细胞)介导的细胞免疫应答反应在识别和清除病变细胞中发挥重要作用。T细胞杀伤靶细胞(肿瘤细胞或被病毒感染的细胞等)的作用机制是通过T细胞表面表达的TCR识别并结合靶细胞表面MHC分子提呈的抗原肽(MHC-抗原肽复合物),对其进行攻击和杀伤进而清除靶细胞。至今,T细胞上的TCR与靶细胞上的MHC-抗原肽相互作用而活化T细胞,我们叫做trans-activation(图1b),这种T细胞的活化机制是被发现几十年以来被公认的公理。图1 TCR与同一T细胞表达的pMHC复合物结合模拟图(a)。TCR与同一T细胞上的pMHC的cis相互作用(b)。传统的TCR与pMHC-I的trans活化机制(传统的)(c)。通常,T细胞也通过自身表达的MHC分子提呈抗原肽。该合作团队研究发现同一个T细胞上的TCR能与这个T细胞上的MHC-抗原肽结合并被活化,并将这个新发现的活化机制叫做cis-activation(图1ab)。至今国际上尚未见有相关报道,是对T细胞活化机制的补充。合作团队利用这个T细胞活化的新机制研发了特异性T细胞快速分析和TCR基因快速筛选技术,比此前报道的TCR-T细胞技术(Nat Med. 2013 Nov 19(11):1542-6)更加快速有效,为TCR-T细胞抗肿瘤免疫治疗提供了崭新的技术平台。通过该技术筛选的TCR制备的TCR-T细胞展现出比以往方法用于临床试验的TCR- T细胞具有更强的肿瘤杀伤作用。该研究成果的重大意义在于:一是发现T细胞活化新机制,将为详细阐明T细胞发生发育机制提供重要科学理论依据。二是研发的TCR基因筛选技术能更有效从患者血液筛选具有杀伤性的TCR,为TCR- T细胞抗肿瘤或抗感染的免疫治疗提供技术平台。基础医学院免疫研究中心主任金艾顺教授是本研究主要作者之一。金艾顺教授长期致力于肿瘤免疫治疗研究,早期主要从事抗体药物研究,在全人源单克隆抗体快速筛选技术研发和抗体药物研究等方面取得突破性研究成果(Nat Med. 2009 Sep 15(9):1088-92.)。近年来,金艾顺主要聚焦于T细胞活化机制和TCR-T细胞免疫治疗方面。在T细胞活性机制研究时,受抗体技术研发的启发,金艾顺团队将T细胞用于单细胞分离独立培养,发现在添加抗原肽刺激没有靶细胞提呈MHC分子时T细胞也能被活化分泌效应因子,在经历长达10年研究和求证后提出T细胞活化新机制和新理论,该理论如果通过更先进技术得到更多更深的研究和应用,将有望为阐明自身免疫性疾病等更多疾病的发病机制提供新思路。原文链接:https://rdcu.be/cKSAh
  • 小型台式无掩膜光刻机助力开发新型晶体管实现新冠肺炎快速筛选
    【引言】在新冠疫情大流行的背景下,从大量人群中快速筛查出受感染个体对于流行病学研究有着十分重要的意义。目前,新冠病毒诊断方法包括血清学和病毒核酸测试,主要是以分析逆转录聚合酶链反应作为金标准,此方法在检测中核酸提取和扩增程序耗时较长,很难满足对广泛人群进行筛查的要求,因此,亟需发展一种快速的监测方法应对新冠疫情。 【成果简介】近期,复旦大学魏大程教授课题组利用MicroWriter ML3小型台式无掩膜光刻机制备出基于石墨烯场效应晶体管(g-FET)的生物传感器。该传感器上拥有Y形DNA双探针(Y-双探针),可灵敏且快速的实现新冠病毒的核酸检测分析。该传感器中的双探针设计,可以同时靶向新冠病毒核酸的两个目标基因区域:ORF1ab和N基因,从而实现更高的识别率和更低的检出限(0.03份μL−1)。这一检出限比现有的核酸分析低1-2个数量,可避免混检过程中样本病毒载量较低而产生漏网之鱼,实现的混合测试。该传感器也具有快的检测速度,快的核酸检测速度约为1分钟。由于快速、超灵敏、易于操作等特点以及混合检测的能力,这一传感器在大规模范围内筛查新冠病毒和其他流行病感染者方面具有巨大的应用前景。 【图文导读】图1. 基于g-FET的Y形双探针生物传感器的制备和表征。(a)Y形双探针生物传感器进行SARS-CoV-2核酸检测的流程图。(b)选定的病毒序列和探针在检测SARS-CoV-2时所靶向的核酸。ORF1ab: 非结构多蛋白基因 S: 棘突糖蛋白基因 E: 包膜蛋白基因 M: 膜蛋白基因 N: 核衣壳蛋白基因。图中数字表示SARS-CoV-2 NC_045512在GenBank中基因组的位置。(c)封装好的器件。图中的比例尺为1 cm。(d)石墨烯通道的光学照片。(e)在石墨烯上的Cy3共轭Y型双探针。图中的比例尺为250 μm。图2. Y形双探针g-FET生物传感器进行SARS-CoV-2核酸测试的性能表现。(a)SARS-CoV-2核酸样本准备流程。(b)和(c)ΔIds/Ids0随着SARS-CoV-2 IVT-RNA增加的实时改变。(d)ΔIds/Ids0随着SARS-CoV-2 IVT-RNA或cDNA浓度的变化曲线图。(e)ΔIds/Ids0在检测到人类,SARS-CoV和SARS-CoV-2的cDNA和IVT-RNA时的反应。所有数据源自三个不同的传感器。图3. Y形DNA探针和ss-DNA探针的g-FETs生物传感器的测试表现对比。(a, b)在石墨烯上的ss-DNA探针和Y形DNA探针的AFM表征结果。(c, d)分别为ss-DNA和Y形DNA探针在g-FETs生物传感器上的示意图。(e)不同探针下ΔVDirac在SARS-CoV-2 cDNA浓度为0.03到500份/100μL的人工唾液中的变化。(f)利用Y-A探针和Y形探针的传感器的ΔVDirac随着SARS-CoV-2 cDNA浓度的变化。(g)sy-DNA浓度在1x10-15至1x10-12M的条件下,Y-A探针和A探针在0.01xPBS条件下的ΔVDirac变换。(h)暴露在浓度为1μM下的目标DNA生物传感器的ΔVDirac变化。所有数据源自三个不同的传感器。图4. 测试临床SARS-CoV-2样本结果。(a)在添加人体H1和临床P1的样本后ΔIds/Ids0随时间的变化曲线。插图中所示的是诊断P1所用的时间。(b)ΔIds/Ids0在添加P1-P7和H1-H7后的变换。图中偏上的插图为P1-P7诊断时间的箱型图,图中偏下的插图为H1-H7的ΔIds/Ids0值。(c)g-FET传感器中的的ΔIds/Ids0随着P1浓变化的实时反馈结果。(d)五合一SARS-CoV-2核酸集体检测示意图。(e)在添加阳性样本B1-B6和阴性样本A1-A6后,Y形双探针g-FETs生物传感器的ΔIds/Ids0事实变化结果。插图为在添加集体样本A6和B6后ΔIds/Ids0随时间的变换。(f)Y形双探针g-FETs生物传感器的测试速度与其他检测SARS-CoV-2核酸方法速度的对比。【结论】魏大程教授课题组所研发的Y形双探针g-FETs生物传感器,是一种适用于大规模流行病筛选的新手段,突破了传统筛选手段诊断时间长和不能混合检测的瓶颈,在流行病筛选方面有巨大的应用前景。同时,从文中也可以看到随着流行病检测领域的需求逐渐增多,如何快速开发出符合需求的生物传感器显得十分重要。由于实验过程中需要及时修改相应的参数,得到优化的实验结果,十分依赖灵活多变的光刻手段。MicroWirter ML3小型台式无掩膜光刻机可以任意调整光刻图形,帮助用户快速实现原型芯片的开发,助力流行病检测领域的研究。【参考文献】[1]. Direct SARS-CoV-2 Nucleic Acid Detection by Y-Shaped DNA Dual-Probe Transistor Assay,J. Am. Chem. Soc. 2021, 143, 41, 17004–17014
  • 嘉宾公布|看高通量筛选技术如何加速药物研发进程
    药物筛选是新药研发的关键步骤,而随着基因组学、蛋白质组学、代谢组学、组合化学等学科的发展,药物分子库在不断扩大,药物作用靶点也越来越多,这使得药物发现的范围逐渐扩大,药物筛选的工作量急剧增加。因此,高通量筛选(High-throughput screening,HTS)技术应运而生。为帮助用户及时了解高通量药物筛选创新技术以及在药物研发中的应用进展,仪器信息网将于2024年6月21日举办“第二届创新高通量药物筛选技术与应用”网络主题研讨会,特邀10位专家围绕高通量药物筛选模型建立、候选药物发现,以及FRET、AlphaScreen、高内涵成像、全自动膜片钳、表面增强拉曼光谱(SERScreen)等创新技术分享和前沿应用展开探讨交流,欢迎大家踊跃报名!报名链接:https://insevent.instrument.com.cn/t/XXo (点击报名)点击图片报名 会议日程 “第二届创新高通量药物筛选技术与应用”网络主题研讨会日程(更新中)2024年6月21日报告时间报告主题专家单位09:30-10:00高通量靶向药物筛选及“以药寻靶”空间转录组技术的应用梁重阳吉林大学药学院 教授10:00-10:30安捷伦自动化高通量质谱平台及其在新药研发中的应用孙秀红安捷伦科技(中国)有限公司 液质产品工程师10:30-11:00新冠病毒主蛋白酶抑制剂高通量筛选技术平台的建立与应用陈云雨皖南医学院 副教授11:00-11:30YAP出入核调控因子及靶向小分子的高通量筛选汤扬同济大学附属第十人民医院 研究员11:30-12:00降尿酸药物筛选方法进展与候选药物的发现展鹏山东大学药学院 教授12:00-13:30午休时间13:30-14:00高通量全自动膜片钳技术在离子通道药物筛选中的应用胡吉英深圳湾实验室 药物发现平台主管/工程师14:00-14:30离子通道研究技术及其在药物研发中的应用段桂芳北京大学药学院 助理研究员14:30-15:00基于AI辅助高内涵筛选的心肌保护天然化合物发现及机制研究赵璐浙江大学药学院 副教授15:00-15:30高内涵3D成像技术对类器官的分析及应用王娅中国科学院生物物理研究所 高级技术主管/高级工程师15:30-16:00待定李翔山东大学 副教授报告嘉宾报告人:梁重阳 吉林大学教授报告题目:《高通量靶向药物筛选及“以药寻靶”空间转录组技术的应用》 个人简介:1.工作经历及兼职:吉林大学 药学院 | 教授 博士生导师长春百克生物科技股份公司科学顾问2.研发领域:&bull 抗感染、抗肿瘤药研发、肿瘤诊断技术及试剂的研究研发生物一类创新药制剂——吉芝元注射液,完成向美国FDA和中国NMPA的Pre-IND和IND申报,并获批中美临床试验;致力于将电化学、SERS等生物芯片细胞生物学研究和POCT伴随诊断的应用,已完成可用于淋巴瘤单碱基突变诊断的CRISPR-PAA芯片,已受到国内外多家企业关注,并发表多篇学术论文。&bull 光谱学在生物学方面的应用研究致力于将表面增强拉曼光谱技术(SERS)应用于生物学领域,尤其是药物高通量筛选领域。近年来利用SERS研究细胞器功能、分析细胞表面糖链和检测肿瘤标志物等,同时应用SERS技术对PARP1抑制剂、KRAS 4B抑制剂等进行药物活性筛选,发表相关学术论文20余篇,获得包括国家自然科学基金项目等多项支持,并完成成果转化。&bull 单细胞测序和空间转录组新技术平台的研究致力于超微量打印和图案印刷技术在空间转录组技术发展中的应用,研究工作目前已获得国内单细胞测序龙头企业和自然基金的支持。报告人:陈云雨 皖南医学院副教授报告题目:《新冠病毒主蛋白酶抑制剂高通量筛选技术平台的建立与应用》个人简介:陈云雨,皖南医学院副教授、硕士生导师、安徽省优秀青年研究生导师获得者、皖南医学院第四批学术和技术带头人后备人选。2015年7月毕业于北京协和医学院(清华大学医学部)微生物与生化药学系,获医学博士学位,主要从事抗病毒药物药理学研究。自新冠疫情暴发以来,研究团队针对新冠病毒主蛋白酶抑制剂高效筛选中的关键技术问题,首次建立了以荧光偏振高通量筛选模型为核心的系统性筛选与评价方法,并发现了若干天然产物来源的新型先导化合物。以通信作者在PNAS、Antimicrobial Agents and Chemotherapy、Journal of Medical Virology、International Journal of Antimicrobial Agents、Cell & Bioscience、Phytotherapy Research、STAR Protocols和Virology等杂志发表40余篇研究论文,已指导4位硕士研究生荣获国家奖学金。现任中国药理学会化疗药理专业委员会第十届青年委员和《中国现代应用药学》第九届编委会青年编委。报告人:汤扬 同济大学附属第十人民医院研究员报告题目:《YAP出入核调控因子及靶向小分子的高通量筛选》个人简介:汤扬,同济大学高等研究院研究员。2019年毕业于中国科学院大学上海生物化学与细胞生物学研究所,获得博士学位;博士后加入同济大学附属第十人民医院;现为同济大学高等研究院研究员。研究方向为胃肠道癌症发生机制及精准靶向治疗策略研发,聚焦胃肠道肿瘤发生及Hippo信号通路的分子机制研究,长期基于Hippo信号通路发现新的胃癌诊疗靶标,主要从细胞信号转导、细胞间通讯角度揭示胃肠道癌症发生的病理机制,发现新靶点,针对性研发胃肠道癌症靶向干预策略,设计、评估并优化靶向药物的抗肿瘤效果。前期在Cancer Cell、EMBO J、Journal of Experimental Medicine、Cell Discovery等国际高水平SCI期刊上发表研究成果18篇,获批药物发明专利3项;主持包括国家基金委青年基金及面上项目、上海市科委自然科学面上项目等各类科研项目共计7项,入选上海市青年科技启明星;受邀参与编写《高通量筛选技术实验手册》。报告人:展鹏 山东大学药学院教授报告题目:《降尿酸药物筛选方法进展与候选药物的发现》个人简介:展鹏,山东大学教授,博导。教育部青年长江学者、山东省杰青、山东大学杰出中青年学者、基金委创新群体项目骨干;主持科技部重点研发计划、NSFC面上项目、国际(地区)合作、山东省重大科技创新工程等10余项课题。长期从事抗痛风及抗病毒药物研发,共同研发的四类候选药物已转化(两项获临床试验批件)。成果在Chem Soc Rev、J Med Chem、J Med Virol、Elife、Signal Transduct Target Ther、Acta Pharm Sin B等重要期刊发表文章100余篇,多篇为ESI高被引或封面论文,H指数为49;授权专利20余项;主编中英文专著2部,参编专著及教材8部。担任药物化学国际顶尖期刊J Med Chem编委,Acta Pharm Sin B等10余个期刊的(青年)编委;客座主持专刊10余次。获中国药学会青年药物化学奖。入选全球前2%科学家榜单及“全球顶尖前10万科学家”榜单;入选全国药学专家学术影响力百强。报告人:胡吉英 深圳湾实验室药物发现平台主管/工程师报告题目:《高通量全自动膜片钳技术在离子通道药物筛选中的应用》个人简介:胡吉英,博士,深圳湾实验室生物医学实验技术中心药物发现平台主管,负责受体靶向药物筛选、高通量筛选、亲和力筛选等技术体系建设和实验方案开发,为相关科研与转化项目提供技术支持服务。报告人:段桂芳 北京大学药学院助理研究员报告题目:《离子通道研究技术及其在药物研发中的应用》个人简介:段桂芳,博士,2019年于南京大学获得生物学博士学位。2019年8月起在天然药物及仿生药物全国重点实验室药理学平台工作。目前主要负责药理学平台的建设管理、技术服务和新方法新应用开发。擅长利用膜片钳技术、钙成像技术、离子流技术、高内涵成像分析等分子细胞生物学技术进行药物的高通量筛选、药效评价及机制研究。利用上述经验,为校内外多家科研单位及企业提供技术支持,辅助课题组发表多篇论文在Nat. Commun. 、J. Med. Chem. 等国际一流期刊上。近五年内以第一/共一作者在Nat. Commun.、J. Biol. Chem.等国际著名期刊发表文章多篇。参与多项国家自然科学基金项目,主持国家自然科学基金青年项目1项,主持国重技术类攻关开放课题1项。报告人:赵璐 浙江大学药学院副教授报告题目:《基于AI辅助高内涵筛选的心肌保护天然化合物发现及机制研究》个人简介:赵璐博士,浙江大学药学院药物信息学研究所副教授、博士生导师、浙江大学“求是青年学者”,博士毕业于美国耶鲁大学医学院,现为浙江大学中药科学与工程学系模式生物平台负责人,研究方向为使用斑马鱼、细胞等疾病模型进行中药药效物质研究。获浙江省杰出青年科学基金支持,主持国家自然科学基金项目2 项,浙江省自然科学基金项目2 项,研究成果获省科技进步奖一等奖1项,教育部自然科学二等奖1 项。以第一或通讯作者发表PNAS, Engineering等学术论文21篇,被Nature、Lancet等期刊引用1300 余次。报告人:王娅 中国科学院生物物理研究所高级技术主管/高级工程师报告题目:《高内涵3D成像技术对类器官的分析及应用》个人简介:本人自2006年毕业于天津大学精密仪器与光电子工程学院,获得生物医学工程专业硕士学位后,一直从事高通量筛选大型仪器设备的技术支持工作,在科研支撑和测试服务方面受到广大用户的好评。作为结构与功能分析技术实验室的高级技术主管,主要负责两个方向的技术支撑服务:(1) 高通量蛋白晶体筛选,包括2台蛋白结晶点样工作站(Mosquito)、1台全自动晶体培养及观察系统(Rock Imager 1000)和1台紫外荧光晶体成像分析系统(UVEX);(2)高通量高内涵成像与分析平台的技术支撑和测试服务,包括1台高内涵激光共聚焦成像分析系统(Opera Phenix)、2台微孔板多功能光谱检测仪(VF和EnVision)、1台液体处理工作站(Fxp)以及化合物库、siRNA文库两个库的日常管理。科研用户们基于本人负责的设备的支撑服务取得了诸多重要的研究成果并给予致谢,这些成果发表在: Nature Cell Biology、Cell Research、PNAS、Cell Calcium、Immunity等国际一流学术期刊上,其中SCI收录文章30余篇,累计影响因子超过200。获2021年度生物物理研究所风采女性岗位“四季花开”;获中国科学院2022年院所两级公共技术服务优秀个人荣誉称号;2019-2022连续四年年获得生物物理研究所优秀党员称号。获中关村国基条件科技资源共享服务创新联盟2023年度突出贡献个人奖。报告人:李翔 山东大学药学院副教授报告题目:《待定》个人简介:待定报告人:孙秀红 安捷伦科技(中国)有限公司液质产品工程师报告题目:《安捷伦自动化高通量质谱平台及其在新药研发中的应用》个人简介:孙秀红,安捷伦质谱产品工程师,毕业于中国药科大学,熟悉液质联用技术在组学、药物研发、中药分析等领域的分析应用。会议赞助会议内容及报告赞助:仪器信息网 赵编辑:13331136682,zhaoyw@instrument.com.cn 扫码加入HTS技术交流群(发送备注姓名+单位+职位)扫码直达报名页面温馨提示:1) 报名后,直播前一天助教会统一审核,审核通过后,会发送参会链接给报名手机号。填写不完整或填写内容敷衍将不予审核。2) 通过审核后,会议当天您将收到短信提醒。点击短信链接,输入报名手机号,即可参会。附上届会议页面:2023年“第一届创新高通量药物筛选技术与应用”网络主题研讨会(点击查看)
  • 贝克曼库尔特 | 高通量筛选大肠杆菌重组蛋白生产用酵母营养素
    随着重组DNA技术的迅猛发展,外源基因在不同宿主中的表达使得各种重组蛋白的工业生物生产成为可能。选择合适的宿主是生物工艺设计中的关键步骤之一,具体取决于:1.上游培养效率2.易于基因编辑和分子工具的可用性3.翻译后修饰的能力,如糖基化4.蛋白质(用于下游加工和作为生物制药成分等)的分泌能力目前,多种生物已被应用于重组蛋白的生产,尤其是大肠杆菌,易于基因改造,具有在酵母水解物等多种基质上快速生长并产生高蛋白滴度的优势。已成为迄今为止业界追捧的主力军。典型的生物工艺优化通常需要进行一些初步试验,以发现适用于宿主菌株并提高目的重组蛋白表达的培养基成分(特别是氮基营养素)。对于此类应用需求,能够提高实验效率和参数准确度的高通量筛选平台成为热门工具。贝克曼库尔特BioLector通过在线测量关键培养参数提供可放大的高通量分析。本案例为通过BioLector对多种酵母营养素就生物量生长和重组蛋白的形成进行评估和比较,筛选出了适合大肠杆菌重组蛋白生产和诱导时间的理想培养基。方法培养菌株:大肠杆菌BL21(DE3)pET-28a(+)EcFbFP。培养基:以标准TB培养基(Carl Roth)为参照物,对多个TB 样(Terrific 液)培养基进行比较。不同的TB 样培养基使用不同的酵母提取物。BioLector培养条件:在接种至微孔板之前,先在250 mL摇瓶中进行预培养, 37°C培养6小时。然后使用48孔梅花板(MTP-BOH2)在 BioLector中进行培养。温度 37°C ,振摇速度:1400 rpm。分别在每个培养孔中填充800μL培养液用于非诱导实验,填充790μL用于诱导实验。诱导实验中,在诱导时间点上添加 10μL 50μM 的 IPTG。环境氧气浓度保持在35%,避免培养物缺氧。BioLector在线测量:培养过程中对生物量、EcFbFP(黄素荧光蛋白)、pH以及 DO进行在线测量。结果不同TB样培养基的生物量生长情况:培养实验中,不同酵母营养素的培养基中生物量的生长情况如上图所示:培养基不同,最终的光密度和生长速率也会不同。ProCel 6 中的大肠杆菌OD最高,培养基 ProCel 3 中的大肠杆菌的OD低。ProCel 6为本特定工艺的最高生长速率。上图为培养过程的DO值。培养基 ProCel 3 和 ProCel 4 中的培养物未达到0%的氧饱和度,这表明由于耗氧量有限,该培养基中的菌株代谢活性较低。相反,其他培养物包括TB标准培养基,均在短时间内达到0%的氧饱和度,表明菌株代谢活性高。不同酵母营养素TB样培养基的产物生成:通过将IPTG 添加到培养物中来诱导 T7 聚合酶的表达促进黄素荧光蛋白的生成。BioLector使用梅花板为48个培养物提供了独立的培养空间,因此可测试不同的诱导时间点。使用自动化工作站整合BioLector后的 RoboLector 系统还可以自动进行培养诱导。首先选择一个固定的诱导时间点。分别为培养启动后的3小时、3.75小时和4.5小时。下图所示为每种TB样培养基在诱导时间下所测荧光的平均值。荧光动力学清晰地表明不同培养基有不同的EcFbFP(黄素荧光蛋白)表达水平。表现出最强荧光信号的两个样本为:ProCel 2,诱导点为3.75小时;ProCel 5,诱导点为 3 小时。经过 7.7 小时的培养,ProCel 5 的荧光值达到102.94a.u.,而ProCel 2 的荧光值达到 101.82 a.u.。本方法的不足之处在于未比较不同样本的生物量对蛋白质产量的影响。经过3小时的培养,一些培养物的OD已达到6,而其他培养物仅达到3。当诱导具有不同光密度的培养物时,可能会对在每种酵母营养素上生长的实验大肠杆菌的蛋白质生产性能造成误解。鉴于此,我们采用了一种新方法,将诱导点与生物量信号耦合。使用BioLector的信号驱动RoboLector,依赖于特定生物量的诱导对于每个单独的孔都是可行的。为自动化工作站设置3、6或8的OD目标值,以根据孔内培养物的生长动力学自动添加IPTG以诱导蛋白质生产。如下图所示,ProCel 2表现最佳,最终值为 146.23 a.u.,培养时间是 12.3 小时;ProCel 5表现次之,最终值为138.1 a.u.。与之前进行的一系列实验相比,本实验中的排名与在特定时间点进行诱导的实验不同。这一观察证明了最佳工艺条件的重要性,并使这些条件具有可比性。此处数据表明:与之前的实验相比,本实验中的荧光值更高。正如该领域诸多论文中所强调的那样,诱导时间确实是一个关键参数。同样,在优化大肠杆菌重组蛋白生产的过程中,也必须评估诱导剂的浓度。另外,与对照TB培养基相比,这里测试的一些酵母氮源产生了更高的重组蛋白产量。这些结果凸显了选择培养基成分的重要性,这些成分能够在特定的生物工艺中实现高而稳定的产量。结论通过BioLector系统,贝克曼库尔特可为用户提供适用于各种应用领域的高通量筛选平台。其独特的梅花形微孔板尤其适用于好氧培养,如同实验室生物反应器,BioLector系统通过非侵入式传感器使客户能够获取更多的在线测量参数。正如本应用,通过BioLector系统可轻松实现培养基的筛选,整合自动化工作站的RoboLector,还可实现更多功能。补料、pH调控以及文中所述的诱导功能,所有这些均可在小规模实验中实现,帮助客户同时兼顾成本和效率。RoboLector高通量自动化微型生物培养平台欲了解该应用详情,请扫描下方二维码下载应用指南《利用BioLector进行大肠杆菌重组蛋白生产用酵母营养素的筛选》
  • 看点揭秘!明日召开“第二届创新高通量药物筛选”网络主题研讨会
    在新药研发过程中,如何从海量的化合物中找出具有治疗潜力的候选物是一个巨大的挑战。为此,科学家们发展出了一种名为高通量药物筛选(High-throughput screening,HTS)的技术,通过将自动化设备和生物化学检测方法相结合,可以在短时间内筛选数以万计的化合物,极大地提高了新药研发效率。适逢夏至,仪器信息网将于6月21日举办“第二届创新高通量药物筛选技术与应用”网络主题研讨会,特邀9位专家围绕筛选模型建立、创新方法与技术分享,以及候选药物发现等研究方向展开探讨交流,欢迎大家踊跃报名!报名链接:https://insevent.ins t rument.com.cn/t/XXo (点击报名)会议看点1.技术前沿多元:囊括SERScreen技术、FRET技术、AlphaScreen技术、全自动膜片钳技术、基于AI辅助高内涵筛选技术等创新技术2.报告主题火热:涵盖PPI抑制剂筛选、新冠病毒Mpro抑制剂筛选、抗癌靶向小分子筛选、降尿酸药物筛选、离子通道药物筛选、基于斑马鱼行为表型组学药物筛选等研究进展3.嘉宾阵容强大:力邀北大、浙大、吉大、山大、同济大学附属第十人民医院、皖南医学院、深圳湾实验室以及安捷伦9位业内专家会议嘉宾&报告预览报告人:汤扬 同济大学附属第十人民医院研究员报告题目:《YAP出入核调控因子及靶向小分子的高通量筛选》主要介绍通过靶向磷酸酶文库的siRNA筛选,研究人员发现PP2A磷酸酶的调节亚基STRN3的缺失可导致MST1/2激酶活性显著升高以及YAP入核活化显著降低,暗示以STRN3为调节亚基的PP2A磷酸酶可能通过抑制MST1/2激酶的活性而增强YAP活性;随后研究人员阐释了胃癌中MST1/2激酶活性丧失的分子与结构机制;最后通过AlphaScreen体系筛选特异性靶向小分子抑制胃癌生长。「报名观看」报告人:陈云雨皖南医学院副教授报告题目:《新冠病毒主蛋白酶抑制剂高通量筛选技术平台的建立与应用》传统的荧光共振能量转移筛选法具有筛选成本高、稳定性差和假阳性率高等缺点,积极开发稳定、经济、灵敏的新冠病毒主蛋白酶(main protease, Mpro)抑制剂高通量筛选模型具有重要意义。本研究以新冠病毒Mpro为靶标,基于二聚化红色荧光蛋白生物传感器建立Mpro抑制剂高通量筛选技术平台,为抗新冠病毒药物的高效筛选与评价奠定了基础。「报名观看」报告人:梁重阳 吉林大学教授报告题目:《高通量靶向药物筛选及“以药寻靶”空间转录组技术的应用》越来越多的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)靶点被鉴定为药物发现创造了机会。然而,目前的药物筛选策略成本高,试剂消耗大,阻碍了药物发现的进展,并且现有技术无法实现分子垂钓。在此,我们提出了一种基于磁场放大表面增强拉曼光谱(SERS)的新型高通量、均相靶向药物筛选方法,称为“SERScreen”,用于PPI抑制剂的发现。将两种高亲和蛋白分别固定在磁珠(MB)和SERS标签上,PPI诱导两种纳米探针交联,产生强SERS信号。候选调节剂对一种蛋白质的更高亲和力干扰PPI,导致SERS强度在MB以上显著降低。我们建立了一个PD-1/PD-L1药物筛选验证技术模型,并证明了其可行性,不仅与已知的抑制剂(Durvalumab和BMS-202),而且与组合化合物库文库联合,通过SERScreen的分子垂钓成功鉴定了两个新的候选抑制剂。作为一种超灵敏、低试剂消耗(2µ L样品溶液)、高通量的筛选技术,SERScreen为复杂样品的分子垂钓提供了有效的解决方案,并且与自动测量设备具有很高的兼容性。「报名观看」报告人:展鹏 山东大学药学院教授报告题目:《降尿酸药物筛选方法进展与候选药物的发现》本讲座分析了降尿酸药物筛选方法的最新进展,包括体外和体内两种主要评价手段。体外筛选聚焦于黄嘌呤氧化酶、尿酸转运蛋白和嘌呤核苷磷酸化酶等关键靶点,而体内筛选则通过动物模型来模拟高尿酸血症。此外,介绍了本课题组在该领域的研究进展,包括新发现的候选药物及其作用机制,旨在为高尿酸血症和痛风的治疗提供新的策略和药物发现路径。「报名观看」报告人:胡吉英 深圳湾实验室药物发现平台主管/工程师报告题目:《高通量全自动膜片钳技术在离子通道药物筛选中的应用》化合物筛选通量较低是离子通道药物发现的瓶颈。全自动膜片钳整合自动化液体处理和平面芯片电极技术,可以实现找细胞、封接、破膜等整个过程的自动化,快速高通量的测量特定离子通道的电流变化,评估药物对这些通道的影响,从而在短时间内对大量药物候选分子进行筛选,显著提高筛选的效率和准确性,减少人为操作的变异性。「报名观看」报告人:段桂芳 北京大学药学院助理研究员报告题目《离子通道研究技术及其在药物研发中的应用》离子通道是多次跨膜的蛋白质多聚体,是一类重要的药物靶点。然而,已上市药物中针对离子通道靶点的不到10%,离子通道药物没有得到充分开发,主要原因是缺乏高质量和高通量的研究技术。为解决离子通道靶点研究的技术难题,我们建立了3种研究方法,分别是基于全自动膜片钳技术的方法、基于离子流的方法和基于荧光的方法。「报名观看」报告人:赵璐 浙江大学药学院副教授报告题目:《基于AI辅助高内涵筛选的心肌保护天然化合物发现及机制研究》心力衰竭是多种心脏疾病发生发展的终末病变,致死率高且缺乏有效治疗手段。常规心力衰竭动物模型成本高、周期长,不适用于药物高通量筛选。本团队开发了一种可自动定位斑马鱼胚胎心室并进行心功能多参数分析的深度学习算法,首次实现了AI辅助斑马鱼心衰模型中的中药药效物质高内涵筛选,发现桑葚等药材来源活性成分CyCl抗阿霉素诱导心衰活性并探讨其作用机制。「报名观看」报告人:李翔 山东大学药学院副教授报告题目:《斑马鱼行为表型组学辅助药物筛选和毒性效应研究》斑马鱼因其明确的胚胎发育过程、高人类基因同源性及与哺乳动物相似的系统,成为药物发现的理想模型。利用商业化斑马鱼幼鱼行为追踪系统,通过关注幼鱼神经行为特征的变化进行基于表型的药物筛选。通过数据挖掘提取特征码,结合细胞和分子生物学技术,预测药物的发育毒性和神经毒性。基于斑马鱼表型组学的高通量筛选方法有效,可应用于药物筛选及环境污染物的毒性效应研究。此方法结合其他组学技术,未来有望用于加速药物发现和药物毒性研究。「报名观看」报告人:孙秀红 安捷伦科技(中国)有限公司液质产品工程师报告题目:《安捷伦自动化高通量质谱平台及其在新药研发中的应用》高通量筛选是药物研发中重要环节之一,安捷伦自动化前处理平台具有优异的灵活性和整合性,在基因、蛋白及小分子药物前处理中都具有完整的工作流。安捷伦Rapidfire-MS平台具有3~8秒/样品的超高检测通量,且集成在线净化技术,支持96/386等多种孔板,目前在小分子药物、生物大分子及核酸药等多管线研发中都有广泛应用。「报名观看」扫码加入高通量药物筛选技术交流群(发送备注姓名+单位+职位)扫码直达报名页面温馨提示:1) 报名后,直播前一天助教会统一审核,审核通过后,会发送参会链接给报名手机号。填写不完整或填写内容敷衍将不予审核。2) 通过审核后,会议当天您将收到短信提醒。点击短信链接,输入报名手机号,即可参会。
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