农业基因组

昨日下午，由农业部与深圳合作共建的农业部基因组学重点开放实验室正式揭牌，该实验室将依托于深圳华大基因研究院，开展包括中华农业基因组计划、绘制农业生物基因组图谱、培养转基因新品种等重大项目。 　　据悉，该实验室计划于2010-2015年期间，利用我国资源优势，实施中华农业基因组行动计划，绘制重要农业生物的标准基因组图谱，在此基础上对国家种质资源库和丰富的微生物资源进行基因普查，并大规模克隆、鉴定经济性状基因，建立大型基因型和表现型综合数据库。

一、项目基本情况1.项目编号：OITC-G230290223项目名称：中国农业科学院农业基因组研究所全自动多位点基因分型系统等一批仪器采购项目预算金额：881.500000 万元（人民币）最高限价（如有）：881.500000 万元（人民币）采购需求：包号品目采购内容数量（套）是否允许采购进口产品预算金额（万元）最高限价（万元）11超灵敏度多功能成像仪1是50502荧光倒置显微镜1是49.549.53双色红外激光成像系统1是60604细胞成像微孔检测系统1是1371375全自动多位点基因分型系统1是1551556有机元素分析仪1是65657全自动细菌鉴定及药敏分析系统1是85858多功能酶标仪1是45459微流控芯片基因分析系统1是235235 合同履行期限：详见需求书。本项目( 不接受 )联合体投标。2.项目编号：OITC-G230291684项目名称：中国农业科学院农业基因组研究所圆二色光谱仪等一批仪器采购项目预算金额：607.000000 万元（人民币）最高限价（如有）：607.000000 万元（人民币）采购需求：包号品目采购内容数量（台/套）是否允许采购进口产品预算金额（万元）最高限价（万元）11全自动细胞成像仪1套是97972多功能激光扫描成像系统1套是1201203脂双层工作站1套是1001004圆二色光谱仪 (CD)1套是90905傅里叶变换近红外光谱仪1套是50506全自动蛋白免疫印迹定量分析仪1套是150150 合同履行期限：详见需求书。本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间：2023年11月29日 至 2023年12月06日，每天上午9:00至12:00，下午14:00至17:00。（北京时间，法定节假日除外）地点：http://www.oitccas.com/ 招标在线频道方式：登录http://www.oitccas.com注册并购买售价：￥600.0 元，本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问，请按以下方式联系。1.采购人信息名 称：中国农业科学院农业基因组研究所　　　　　地址：深圳市龙岗区大鹏新区布新路97号　　　　　　　　联系方式：李老师0755-28398801　　　　　　2.采购代理机构信息名 称：东方国际招标有限责任公司　　　　　　　　　　　　地　址：北京市海淀区丹棱街1号互联网金融中心20层　　　　　　　　　　　　联系方式：迟兆洋、张君仙0769-26627023、020-87001523　　　　　　　　　　　　3.项目联系方式项目联系人：迟兆洋、张君仙电　话：　　0769-26627023、020-87001523 / mye@oitc.com.cn、bxu@oitc.com.cn

近日，记者从中国农业科学院特产研究所获悉，该所和深圳农业基因组研究所，联合发布了梅花鹿高质量全基因组组装序列，并在梅花鹿耐受毒性食物的分子机制方面取得了重大进展。梅花鹿基因组序列的公布，开启了我省梅花鹿分子育种新时代，也为梅花鹿108个药用部位的物质基础解析，奠定坚实的基础。 据了解，中国梅花鹿全基因组测序计划于2010年启动，中国农业科学院特产研究所建设有全国唯一的梅花鹿种源基因库，特产所经过12年的不懈努力，终于成功组装了梅花鹿高质量基因组序列。基因组序列框架图谱的绘制，将大大加速中国梅花鹿的育种过程，对于寻找与鹿生产性能有关的SNP标记和功能基因，特别是寻找控制鹿茸再生的相关基因具有重大的意义。 我省是我国梅花鹿养殖的发源地和主产区，养殖梅花鹿历史悠久，文化底蕴深厚，产业发展基础好，特色优势明显。2021年，全省梅花鹿饲养量60万只，占全国总量的一半以上。梅花鹿作为我省农业十大产业集群之一，是我省重要的特色农业资源，梅花鹿产业凭借资源优势不断成长为我省畜牧业经济的新兴增长点，成为农民持续增收的重要支撑。 特产研究所此次破解梅花鹿高质量全基因组序列，不但奠定了中国梅花鹿功能基因组学、蛋白组学和分子遗传育种的研究基础，还大大促进了我省梅花鹿基因库、梅花鹿遗传资源保种场和核心育种场建设，对于提高吉林梅花鹿良种纯度及种用和生产性能，刺激我省梅花鹿养殖业、药理功效科技研发、加工业快速发展有着巨大促进作用。

2016年11月6日-8日，第三届国际农业基因组学大会在上海青浦夏阳湖皇冠假日酒店隆重举行，上海泽泉科技股份有限公司应邀参会。本次会议由《自然-遗传学》（Nature Genetics）、中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所共同主办，为Nature Conference系列会议。大会主席由中国农业部副部长、中国农业科学院院长李家洋院士、中科院上海生科院植物生理生态研究所所长韩斌院士及Nature Genetics杂志主编Myles Axton担任。来自中国、美国、英国等国的40位专家应邀出席并作大会报告。 会议开幕 本次会议旨在展示农业生物遗传学与基因组学领域的最新研究进展，促进现代绿色农业发展，搭建国际知名科学家在农业基因组学领域广泛交流的平台。350多位国内外具有重要学术影响的专家学者以及优秀青年科学家，围绕作物基因组学与基因组演化、植物发育学、逆境生物学等多个专题进行了交流和研讨，会议现场气氛热烈。 大会报告 会议期间，泽泉科技与参会人员进行了热烈的技术交流，介绍了WALZ、CID等植物生理生态的仪器、解决方案，以及AgriPheno™ 表型平台的科研服务。老师和同学们对此表示很感兴趣。通过与专家面对面地交流，泽泉科技对客户的需求有了更深入的了解，直接促进了与客户之间的有效沟通。我们期待与更多的专家学者合作，共同为中国的农业发展作出贡献！ 泽泉科技展台 & 交流 本次会议得到了主办方与各方与会人员的大力支持，泽泉科技再次表示诚挚的感谢！

一、项目基本情况项目编号：OITC-G230290224项目名称：中国农业科学院农业基因组研究所高效热解析气相色谱等一批设备采购项目预算金额：791.500000 万元（人民币）最高限价（如有）：791.500000 万元（人民币）采购需求：包号品目采购内容数量（台/套）是否允许采购进口产品预算金额（万元）最高限价（万元）11全自动核酸蛋白分析系统1套是42422全自动高通量等温滴定量热仪1套是1271273高效热解析气相色谱1套是1601604分选型流式细胞仪（4激光）1套是3483485厌氧工作站1套是65656超速离心机1套是49.549.5 合同履行期限：详见需求书。本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间：2023年11月29日 至 2023年12月06日，每天上午9:00至12:00，下午14:00至17:00。（北京时间，法定节假日除外）地点：http://www.oitccas.com/ 招标在线频道方式：登录http://www.oitccas.com/注册并购买售价：￥600.0 元，本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问，请按以下方式联系。1.采购人信息名 称：中国农业科学院农业基因组研究所　　　　　地址：深圳市龙岗区大鹏新区布新路97号　　　　　　　　联系方式：李老师0755-28398801　　　　　　2.采购代理机构信息名 称：东方国际招标有限责任公司　　　　　　　　　　　　地　址：北京市海淀区丹棱街1号互联网金融中心20层　　　　　　　　　　　　联系方式：迟兆洋、张君仙0769-26627023、020-87001523/ mye@oitc.com.cn、bxu@oitc.com.cn　　　　　　　　　　　　3.项目联系方式项目联系人：迟兆洋、张君仙电　话：　　0769-26627023、020-87001523 / mye@oitc.com.cn、bxu@oitc.com.cn

项目编号：0868-2246ZD1204H项目名称：中国农业科学院农业基因组研究所液相-超分辨质谱仪、高分辨气质联用仪采购项目预算金额：1060.0000000 万元（人民币）采购需求：液相-超分辨质谱仪、高分辨气质联用仪设备一批采购，具体如下：序号采购设备标的明细数量（台/套）1液相-超分辨质谱仪12高分辨气质联用分析仪1合同履行期限：签订合同之日起90天内交货本项目( 不接受 )联合体投标。

据中国农业科学院深圳农业基因组研究所讯，该单位委托东方国际招标有限责任公司对高分辨液质联用仪采购项目进行招标采购，预算350万元。请潜在投标人于2022年02月22日 15点00分(北京时间)前递交投标文件。采购人名 称：中国农业科学院深圳农业基因组研究所地址：广东省深圳市龙岗区鹏飞路7号联系方式：0755-28398810项目编号：OITC-G220290051项目名称：中国农业科学院深圳农业基因组研究所高分辨液质联用仪采购项目预算金额：350.0000000 万元(人民币)采购需求：提交投标文件截止时间、开标时间和地点：2022年02月22日 15点00分(北京时间)深圳市南山区粤海街道百度国际大厦西塔1005室采购代理机构名 称：东方国际招标有限责任公司地　址：北京市海淀区西三环北路甲2号院科技园6号楼13层

仪器信息网讯 7月12日，仪器信息网主办的“第六届基因测序网络大会”拉开序幕。会议为期三天，包括“新仪器新技术”、“单细胞和空间组学”、“临床分子诊断”、“病原微生物宏基因组&靶向测序”。“海关检疫”、“遗传育种”六大主题会场，各领域30余位代表专家倾情分享，第一天报名参会人数就突破千人！现在会议已经超过半程，接下来还有2个主题会场，请大家持续关注。日期上午下午7月12日新仪器新技术单细胞和空间组学7月13日病原微生物宏基因组&靶向测序临床分子诊断7月14日海关检疫遗传育种点击观看会议7月14日，大会迎来最后一天，聚焦基因测序仪在海关系统和农业遗传和育种方向的应用。日程如下报告嘉宾王艺凯，硕士研究生，高级工程师。主要从事海关实验室及口岸现场领域的检测仪器设备、监管装备研制工作；检测试剂研发工作。参与国家标准4项；参与国家标准样品3项；申请国家专利7项；发表SCI、核心期刊等论文10余篇。理学博士，香港大学博士后，珠海国际旅行卫生保健中心（拱北海关口岸门诊部）主任技师。目前担任国际旅行医学会（ISTM）研究与奖励委员会委员，全国卫生检疫标准化技术委员会（TC582）秘书，海关总署病原体基因测序平台应用业务专家组成员、科技评估专家组成员、实验室防护安全管理专家组成员、新型冠状病毒实验室检测专家组成员，广东省预防医学会医学病毒学专业委员会委员，珠海市预防医学会理事、新冠病毒检测能力建设和质量控制专家组成员、病原微生物实验室生物安全质量控制中心专家委员会成员、临床检验质量控制中心专家组成员，珠海市劳模和工匠人才创新工作室“拱北海关卫生检疫创新工作室”领衔人。主要从事卫生检疫及传染病防控工作。主持省部级科研项目9项，发表SCI 论文34篇，国际会议摘要10篇，获得授权专利15项，制订行业标准5项，担任Journal of Travel Medicine、Diagnostic Microbiology and Infectious Disease编委以及多本SCI杂志审稿人。曾获得国际艾滋病疫苗大会的“Conference scholar”奖，国际艾滋病协会的“International conference scholarship”奖，国家质检总局“科技兴检奖”三等奖等，曾获得中华全国总工会“阅读学习成才职工”、“全国海关系统抗击新冠肺炎疫情先进个人”、珠海好青年“爱岗敬业好青年”、“珠海市直机关优秀共产党员”、拱北海关“先进工作者”、“卫生检疫业务标兵”等称号，当选南方都市报“致敬劳动者”封面人物。唐泰山，博士，研究员，现于南京海关动植物与食品检测中心从事进出境动物检疫和物种鉴定工作。江苏省“333高层次人才”，目前担任江苏省食品安全委员会专家委员会委员、江苏省卫生健康标准委员会寄生虫病专业委员会委员、江苏省微生物学会理事、海关总署进出境濒危物种鉴定实验室联盟专家等。在动物疫病前沿检测技术、濒危物种鉴定等方面开展了广泛研究，曾主持或参与完成各类科研项目28项，获得科技奖项16项、国家发明专利6项，主持或参与编制国家或行业标准18项、发表论文50余篇。杜智欣，博士，高级农艺师。主要从事植物和植物产品的检验检疫及相关研究工作。现为植物检疫专业委专家、农业转基因生物安全专家、合格评定委员会技术评审专家、进出境濒危物种鉴定实验室联盟专家组成员、广西外来入侵物种专家。主持完成省部级以上科研项目15项。获省部级科技奖励4项，发布标准14项、授权专利20项，发表国内外论文论著20篇。浙江大学“求是特聘”教授、博士生导师，浙江大学农学系主任。1986年毕业于浙江农业大学遗传育种专业并获得学士学位，1996-2001年先后获得德国哥廷根大学硕士、博士学位。2001-2005年任新加坡国立大学农业分子生物研究院（IMA）、分子与细胞生物研究院（IMCB）任博士后、研究员等职。2005年后任浙江大学教授。要从事油料植物基因组学与分子生理学研究，研究主题包括：（1）种子含油量和脂肪酸形成的分子生物学机制；（2）油菜种质资源基因组研究；（3）基于基因组重测序基础上GWAS分析和杂种优势预测；（4）（油菜）异源四倍体基因组进化的分子机制。涉及物种包括：甘蓝型油菜（Brassica napus）、白菜型油菜（Brassica rapa)、甘蓝（Brassica oleracea）、十字花科拟南芥（Arabidopsis thaliana）等。学术兼职：国际油菜发展咨询委员会成员（Member of Global Council for Innovation in Rapeseed and Canola，简称GCIRC ）、国际芸薹属基因组研究指导委员会成员（Member of Multinational Brassica Genome Project, MBGP）、欧盟-中国 Horizon 2020, Food Agriculture and Biotechnology (FAB)专家组成员、Theoretical and Applied Genetics (TAG) 编委 、GEGE、Plants等杂志编辑。刘贵明，生物信息学博士，北京市农林科学院研究员。研究方向为围绕高通量测序平台和分子育种共性技术开发、组学大数据挖掘、复杂作物基因组的组装策略和方法以及作物表观遗传调控等方面的研究。搭建了北京市农林科学院高性能计算平台和高通量测序平台，开发了基于CRISPR和微流控的快速核酸检测以及基于高通量测序的超多重PCR和液相捕获分子设计育种检测平台。建立了de novo、重测序、转录组、甲基化、lncRNA 和miRNA建库平台以及ATAC-seq、RNA m6A修饰、dCAS9捕获、Hi-C、ChIP-seq和等基于高通量测序的表观调控技术。主持国家自然科学基金2项，主持国家科技基础性工作专项子课题1项。在Nature Genetics等杂志发表文章20多篇。赵汀，博士，浙江大学现代种业研究所特聘研究员和浙江大学海南研究院研究人员。博士毕业于南京农业大学，作物遗传育种专业。主要研究方向是基于基因组大数据，利用群体遗传学、机器学习等手段对控制异源多倍体棉花产量、品质等关键农艺性状的遗传基础进行解析。从基因组非编码区转录、陆地棉和海岛棉种间渗透解析和利用和进化丢失基因得鉴定，挖掘农学可利用“非典型”基因资源。以第一作者、通讯作者和共同第一作者在Genome Biology (2018)，Plant Biotechnology Journal (2021, 2022)，Plant Methods（2023） 等期刊发表研究论文9篇。潘磊，男，博士，江汉大学教授/硕士生导师，美国乔治华盛顿大学访问学者。中国园艺学会豆类蔬菜分会秘书长，湖北省遗传学会理事，湖北省植物生理学会理事。主要从事食用豆类植物遗传资源与分子育种研究。在Plant Biotechnology Journal、Journal of Experimental Botany等国际刊物上发表论文20余篇；获批授权国家发明专利6项；参与选育豆类蔬菜植物新品种4个；获“十一五”湖北省高校科技成果转化提名奖1项、武汉市科技进步二等奖2项。成都瀚辰光翼科技有限责任公司产品总监，资深产品应用工程师。研究生期间从事玉米分子育种相关工作，在基于二代测序及高通量基因分型分子育种工作中积累十余年经验。在瀚辰光翼参与开发了高通量自动化核酸提取系统、高通量自动化基因分型系统、全自动核酸提取及建库一体机以及自动化智能化全流程分子育种实验室整体解决方案等一系列产品，目前在全国育种企业、高校科研院所等得到了广泛使用。报名页面：https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/geneseq2023/

p style=" text-indent: 2em " strong 基因测序技术 /strong 是基础生物学研究的重要工具，是临床分子诊断的重要手段，是探索生命奥秘的科学技术。 /p p 　　仪器信息网第二届“基因测序技术发展及前沿”专题网络研讨会于5月28日成功召开。 “ strong 农业基因组 /strong ”专场报告精彩纷呈、亮点多多，小编也是第一时间送出精彩视频回放。错过直播的小伙伴们，赶快观看学习吧~ /p p style=" text-align: center " strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 报告题目：《基因组的组装和基于高通量测序的表观遗传学应用》 /span /strong /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 513px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/e36ec2c6-3eb9-4eeb-bb21-2353562660b8.jpg" title=" 刘贵明.jpg" alt=" 刘贵明.jpg" width=" 400" height=" 513" border=" 0" vspace=" 0" / /p p 　　 span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " 刘贵明，博士，北京市农林科学院研究员。 /span /p p 　　北京市农林科学院刘贵明研究员主要从事高通量测序和表观遗传研究。刘老师介绍了做参考基因测序的5个不同基因测序平台，分别对这些平台的优缺点进行了比较，以及对测序的思路进行对比。在基因组组装方面，针对细菌、作物参考基因组的组装方法和策略、SV变异的分析、捕获测序、SMRT-Cappable-seq等展开了探讨 在表观遗传学方面，建立了4个基础的表观遗传技术——DAP-seq、ATAC-seq、m6A-seq、CrY2H-seq，并探讨该技术在表观遗传学方面的应用。 a href=" https://www.instrument.com.cn/webinar/Video/play/105202" target=" _self" strong span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 报告视频精彩回放 /span /strong /a /p p style=" text-align: center " 　　 strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 报告题目：《基于高通量测序的分子育种平台开发和应用》 /span /strong /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 350px height: 494px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/7c6bcd43-c462-46ca-97e2-119fa3b9fbf6.jpg" title=" 肖世俊.jpg" alt=" 肖世俊.jpg" width=" 350" height=" 494" border=" 0" vspace=" 0" / /p p 　　 span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " 肖世俊，武汉理工大学计算机学院副教授，西藏自治区农牧科学院高层次柔性引进人才。 /span /p p 　　世界十大种子公司，中国企业无一上榜。洋种子占领中国市场，国内种业公司多而不强，我们国家的育种还处于传统育种水平，与发达国家还有一定差距。基因测序技术的进步和基因组学的发展，为我国的育种工作提供了更多的技术和方法。鉴于此，武汉理工大学肖世俊研究员分享了其实验室基于高通量测序的分子育种平台的开发和应用，分析了基于高通量测序技术的分子育种技术难点，并提供了整套一体化的分子育种解决方案。 a href=" https://www.instrument.com.cn/webinar/Video/play/105203" target=" _self" strong span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 报告视频精彩回放 /span /strong /a /p p style=" text-align: center " strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 报告题目：《Illumina农业基因组学研究解决方案》 /span /strong /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 400px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/63bdfd2f-0dd2-4e93-a5e8-fe0595bfc26b.jpg" title=" 曹友培.jpg" alt=" 曹友培.jpg" width=" 400" height=" 400" border=" 0" vspace=" 0" / /p p 　　 span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " 曹友培，Illumina资深测序行业经理 /span /p p 　　农业基因组学已经并将继续推动现代农业的可持续发展，为全世界人口增长所带来的挑战提供解决方案。测序和芯片的联合使用能大大够推进农业基因组学的研究。全球十大创新公司Illumina资深测序行业经理曹友培介绍了Illumina农业研究整体解决策略，重点介绍了Illumina的芯片技术和新一代测序(NGS)技术在农业基因组学研究中应用，以及如何帮助研究人员和育种家培育出更加健康并且高产的作物和牲畜。 a href=" https://www.instrument.com.cn/webinar/Video/play/105200" target=" _self" strong span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 报告视频精彩回放 /span /strong /a /p p style=" text-align: center " strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 报告题目：《聚焦三维基因组学及基因组学研究进展》 /span /strong /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 494px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/5c28e829-f7f7-4069-9c80-d85217aa698d.jpg" title=" 张玉波.jpg" alt=" 张玉波.jpg" width=" 400" height=" 494" border=" 0" vspace=" 0" / /p p 　　 span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " 张玉波，博士，国家千人计划青年项目专家，中国农业科学院农业基因组研究所研究员，博士生导师，动物功能基因组学创新团队首席科学家。 /span /p p 　　三维基因组学是后基因组学时代的一个新的研究领域，其主要研究内容为真核生物染色质空间构象，及其生物学效应。通过该项技术，人们能对染色质的折叠和三维结构、转录调控机制、复杂性状、信号传导通路和基因组的运行机制等一系列重要问题进行更深入的研究，为系统解读生命百科全书和精准生物学的实施奠定坚实基础。 /p p style=" text-align: center " strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 报告题目：《高质量基因组的构建与应用》 /span /strong /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 439px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/41af5e03-d347-424c-9acb-6d2a8ef6fee0.jpg" title=" 梁承志.jpg" alt=" 梁承志.jpg" width=" 400" height=" 439" border=" 0" vspace=" 0" / /p p 　 span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " 　梁承志，博士，中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员，2012年入选中科院引进杰出技术人才项目，担任中科院遗传发育所基因组分析平台首席科学家。 /span /p p 　　目前，单分子长片段测序技术已成为构建高质量基因组的主流技术。中国科学院遗传与发育生物学研究所梁承志研究员利用单分子测序数据构建了多个高质量的参考基因组，并对这些基因组的进化进行了初步研究。此外，梁老师团队开发了一个利用单分子测序长片段进行基因组复杂区域组装的新方法HERA。HERA大大提高了基因组的质量，为功能基因组研究奠定了一个坚实的基础。 a href=" https://www.instrument.com.cn/webinar/Video/play/105201" target=" _self" strong span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 报告视频精彩回放 /span /strong /a /p p 　　 span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " 虽然会议已经结束，但是精彩仍在继续，仪器信息网已经将部分报告老师的现场讲座视频上传到仪器信息网网络讲堂，想要重复学习或者错过参与会议直播的网友，可以点击报告视频精彩回放进行学习与分享。 /span /p p 　　 strong 附： /strong a href=" https://www.instrument.com.cn/news/20190529/486095.shtml" target=" _self" strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 【精彩视频回放】第二届“基因测序技术发展及前沿”专题网络研讨会· 医疗健康 /span /strong strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 篇 /span /strong /a /p

p 　　记者从青岛农业大学了解到，青岛农业大学海洋科学与工程学院科研团队日前完成了紫扇贝基因组的测序和分析，这是继虾夷扇贝和栉孔扇贝之后人类完成的第三个扇贝基因组测序。 /p p 　　青岛农业大学海洋科学与工程学院教授王春德带领的科研团队结合第二代和第三代基因测序方法，对紫扇贝进行了全基因组测序分析，共获得４６３．１９Ｇ测序数据。科研团队通过测序并分析发现，紫扇贝共有２６２５６个基因，并含有４０．６３％的重复序列。 /p p 　　科研团队通过基因组测序还发现，紫扇贝与虾夷扇贝先聚为一支，再与其他双壳类聚为一支，然后再与腹足纲物种聚类，同时紫扇贝与虾夷扇贝的分歧时间为１１３．６百万年前。 /p p 　　王春德介绍，对紫扇贝基因组的成功测序，为从分子水平解析紫扇贝及其杂交扇贝的生长、抗逆性、育性和寿命等重要性状的决定机制及分子育种打下了基础。 /p p 　　扇贝属于双壳贝类，作为５亿年前就已出现的古老动物类群，虽历经多次生物大灭绝事件，至今仍昌盛并繁衍不息，其非凡的环境适应能力使之成为研究动物适应性进化的良好模型。紫扇贝是原产于南美智利和秘鲁的中型扇贝，个体大，壳色优美艳丽，是当地重要的养殖扇贝品种。 /p p 　　２００７年，青岛农业大学从秘鲁引进紫扇贝，并将其与我国大规模养殖的美国海湾扇贝成功进行种间杂交，培育出在生长、抗逆和寿命等方面优势显著的杂交一代扇贝。杂交一代扇贝体重比普通海湾扇贝提高约１００％，最大个体达２０６克。 /p p 　　青岛农业大学从杂交一代扇贝入手，通过多代选育，历经十年时间，先后培育出“渤海红”和“青农２号”等杂交扇贝新品种，大幅提升了海湾扇贝养殖的良种覆盖率。据不完全统计，目前“渤海红”在山东、河北和辽宁等传统海湾扇贝主产区的养殖面积已占据半壁江山。 /p p br/ /p

一、项目基本情况1.项目编号：0868-2346ZD1262H项目名称：中国农业科学院农业基因组研究所基因分析仪等一批仪器采购项目预算金额：669.000000 万元（人民币）采购需求：基因分析仪等设备一批采购，具体如下：序号采购设备标的明细数量（台/套）是否允许进口产品投标1基因分析仪1否2细胞/微生物双用型生物反应器2否3高通量全自动基因克隆工作站1否4生物反应器1否5微生物中试发酵罐1否6单细胞自动制备系统1否7DNA合成仪1否8全自动生化分析仪1否9超纯水仪1否合同履行期限：（交货期）：合同签订后6个月交货本项目( 不接受 )联合体投标。2.项目编号：0868-2346ZD1263H项目名称：中国农业科学院农业基因组研究所步入式植物生长室等仪器设备一批采购项目预算金额：805.000000 万元（人民币）采购需求：步入式植物生长室等设备一批采购，具体如下：序号采购设备标的明细数量（台/套）是否允许进口产品投标1步入式植物生长室3否2植物幼苗高通量动态表型组学分析系统1否3人工气候室智能控制系统2否合同履行期限：（交货期）：详见招标文件。本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间：2023年11月02日 至 2023年11月08日，每天上午9:30至11:30，下午14:00至17:30。（北京时间，法定节假日除外）地点：深圳市罗湖区桂园街道老围社区红宝路139号蔡屋围金龙大厦10楼1003室方式：在线获取售价：￥800.0 元，本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问，请按以下方式联系。1.采购人信息名 称：中国农业科学院农业基因组研究所　　　　　地址：深圳市大鹏新区布新路97号　　　　　　　　联系方式：李老师 0755-28398801　　　　　　2.采购代理机构信息名 称：深圳市振东招标代理有限公司　　　　　　　　　　　　地　址：深圳市罗湖区红宝路京基金融中心D座（蔡屋围金龙大厦）10楼03号-06号　　　　　　　　　　　　联系方式：张先生 0755-82786018/82786038-808　　　　　　　　　　　　3.项目联系方式项目联系人：张先生电　话：　　0755-82786018/82786038-808

html, body { -webkit-user-select: text } * { padding: 0 margin: 0 } .web-box { width: 100% text-align: center } .wenshang { margin: 0 auto width: 80% text-align: center padding: 20px 10px 0 10px } .wenshang h2 { display: block color: #900 text-align: center padding-bottom: 10px border-bottom: 1px dashed #ccc font-size: 16px } .site a { text-decoration: none } .content-box { text-align: left margin: 0 auto width: 80% margin-top: 25px text-indent: 2em font-size: 14px line-height: 25px } .biaoge { margin: 0 auto /* width: 643px */ width: 100% margin-top: 25px } .table_content { border-top: 1px solid #e0e0e0 border-left: 1px solid #e0e0e0 font-family: Arial /* width: 643px */ width: 100% margin-top: 10px margin-left: 15px } .table_content tr td { line-height: 29px } .table_content .bg { background-color: #f6f6f6 } .table_content tr td { border-right: 1px solid #e0e0e0 border-bottom: 1px solid #e0e0e0 } .table-left { text-align: left padding-left: 20px } 详细信息 [公开招标]中国农业科学院深圳农业基因组研究所多功能微孔板检测仪等一批设备采购项目采购公告广东省-深圳市-龙岗区 状态：公告 更新时间： 2023-09-22 [公开招标]中国农业科学院深圳农业基因组研究所多功能微孔板检测仪等一批设备采购项目采购公告 中国农业科学院深圳农业基因组研究所多功能微孔板检测仪等一批设备采购项目招标项目的潜在投标人应在http://www.oitccas.com/招标在线频道获取招标文件，并于2023年10月9日15点00分（北京时间）前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号：OITC-G230291659 项目名称：中国农业科学院深圳农业基因组研究所多功能微孔板检测仪等一批设备采购项目 预算金额：286万元 最高限价：286万元 采购需求： 包号 品目 项目名称 数量 是否允许采购进口货物 预算金额（万元人民币） 最高限价（万元人民币） 1 1 多功能微孔板检测仪 1 是 33.5 33.5 2 化学发光成像系统 1 是 29.5 29.53 实时荧光定量PCR仪 1 是 26 26 4 高压灭菌锅 1 是 7 7 5 高速大容量落地离心机 1 是 32.5 32.5 6 倒置荧光显微镜 1 是 32.9 32.9 7 电穿孔系统 1 是 13.9 13.9 8 大容量台式离心机 1 是 14.5 14.5 9 万分之一天平 1 否 2 2 10 生物安全柜（双人） 2 否 10.6 10.6 11 倒置显微镜 2 否 11.2 11.2 12 二氧化碳培养箱 2 否10.2 10.2 13 全自动样品快速研磨仪 1 否 4 4 14 烘箱 2 否 6 6 15 超净工作平台 10 否 12 12 16 天平 1 否 1.2 1.2 17 体式显微镜 1 是 6 6 18 微生物自动富集系统 1 是 33 33 合同履行期限：详见项目需求书。 本项目( 不接受 )联合体投标。 二、申请人的资格要求： 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定； 2.落实政府采购政策需满足的资格要求：本项目不属于专门面向中小微企业、监狱企业、残疾人福利性单位采购的项目。 3.本项目的特定资格要求： 1）在中华人民共和国境内依法注册的，具有独立承担民事责任能力，遵守国家法律法规，具有良好信誉，具有履行合同能力和良好的履行合同的记录，具有良好资金、财务状况的企事业法人、其他组织或者自然人；2）为本项目提供整体设计、规范编制或者项目管理、监理、检测等服务的供应商，不得参加本项目投标；3）投标单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商，不得参加同一合同项下的政府采购活动；4）按本投标邀请的规定获取招标文件；5）本项目不接受联合体投标，不得分包、转包；6）参与本项目投标前三年内，在经营活动中没有重大违法记录（由供应商在《投标人具备投标资格的证明文件》中作出声明）；7）参与本项目政府采购活动时不存在被有关部门禁止参与政府采购活动且在有效期内的情况（由供应商在《投标人具备投标资格的证明文件》中作出声明）；8）投标人不得为列入失信被执行人、重大税收违法案件当事人名单、政府采购严重违法失信行为记录名单的供应商（由供应商在《投标人具备投标资格的证明文件》中作出声明）。 注1： 1）信用信息查询渠道：“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）、中国政府采购网（www.ccgp.gov.cn）、深圳市政府采购监管网（http://zfcg.sz.gov.cn/）等。“信用中国”中“信用服务”栏的“重大税收违法案件当事人名单”“失信被执行人”“中国政府采购网”中的“政府采购严重违法失信行为记录名单”以及“深圳市政府采购监管网”为供应商信用信息的查询渠道。 2）信用信息查询截止时点：同投标截止期（即开标当日），即查询投标人截止到投标截止期的信用信息记录。 3）信用信息查询记录和证据留存的具体方式：信用信息查询记录将以网站截图打印稿形式与其他采购文件一并保存。 4）信用信息的使用规则：如投标人为“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）中列入失信被执行人或重大税收违法案件当事人名单的供应商，或为中国政府采购网（www.ccgp.gov.cn）、深圳市政府采购监管网（http://zfcg.sz.gov.cn/）政府采购严重违法失信行为记录名单中被财政部门禁止参加政府采购活动的供应商，则其投标将被拒绝。 三、获取招标文件 时间：2023年9月22日 至 2023年10月7日（提供期限自本公告发布之日起不得少于5个工作日），每天上午9:00至12:00，下午14:00至17:00。（北京时间，法定节假日除外） 地点：http://www.oitccas.com/ 招标在线频道 方式：登录http://www.oitccas.com/注册并购买 售价：￥600.0 元，本公告包含的招标文件售价总和 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 2023年10月9日15点00分（北京时间） 地点：深圳市南山区粤海街道粤兴五道9号北理工创新大厦1505室。 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 1、投标文件递交地点：深圳市南山区粤海街道粤兴五道9号北理工创新大厦1505室。 2、招标文件采用网上电子发售购买方式： 1）登陆“东方招标”平台（http://www.oitccas.com/），点击“获取采购文件”链接图标，或直接输入访问地址（http://www.oitccas.com/pages/sign_in.html?page=mine）完成投标人注册手续（免费），然后登陆系统寻找有意向参与的项目，已注册的投标人无需重新注册。招标文件售价：每包人民币600 元，售后不退。如决定购买招标文件，请完成标书款缴费及标书下载手续。 2）投标人可以电汇的形式支付标书款（应以公司名义汇款至下述指定账号）。 开户名称：东方国际招标有限责任公司 开户行：招商银行北京西三环支行 账 号：862081657710001 3）投标人应在平台上填写开票信息。在投标人足额缴纳标书款后，标书款电子发票将发送至投标人在平台上登记的电子邮箱，投标人自行下载打印。 3、以电汇方式购买招标文件的，须在电汇凭据附言栏中写明招标编号、包号及用途，例如：OITC-G230291659标书款（如未标明招标编号，有可能导致投标无效）。 4、采购项目需要落实的政府采购政策： （1）政府采购促进中小企业发展 （2）政府采购支持监狱企业发展 （3）政府采购促进残疾人就业 （4）政府采购鼓励采购节能环保产品 七、对本次招标提出询问，请按以下方式联系。 1.采购人信息 名 称：中国农业科学院深圳农业基因组研究所 地 址：深圳市龙岗区布新路97号 联系方式：李老师0755-28398801 2.采购代理机构信息 名 称：东方国际招标有限责任公司 地 址：北京市海淀区丹棱街1号互联网金融中心20层 联系方式：0769-26627023、020-87001523 3.项目联系方式 项目联系人：迟兆洋、张君仙 电 话：0769-26627023、020-87001523 邮 箱：mye@oitc.com.cn、bxu@oitc.com.cn 东方国际招标有限责任公司 2023年9月22日 DPDL2023000045-A中国农业科学院深圳农业基因组研究所多功能微孔板检测仪等一批设备采购项目采购公告.pdf × 扫码打开掌上仪信通App 查看联系方式 $('.clickModel').click(function () { $('.modelDiv').show() }) $('.closeModel').click(function () { $('.modelDiv').hide() }) 基本信息 关键内容：高压灭菌器,天平,过氧化氢灭菌,生物安全柜,离心机,酶标仪,荧光显微镜,培养箱,PCR 开标时间：2023-10-09 15:00 预算金额：286.00万元 采购单位：中国农业科学院深圳农业基因组研究所 采购联系人：点击查看 采购联系方式：点击查看 招标代理机构：东方国际招标有限责任公司 代理联系人：点击查看 代理联系方式：点击查看 详细信息 [公开招标]中国农业科学院深圳农业基因组研究所多功能微孔板检测仪等一批设备采购项目采购公告 广东省-深圳市-龙岗区 状态：公告 更新时间： 2023-09-22 [公开招标]中国农业科学院深圳农业基因组研究所多功能微孔板检测仪等一批设备采购项目采购公告 中国农业科学院深圳农业基因组研究所多功能微孔板检测仪等一批设备采购项目招标项目的潜在投标人应在http://www.oitccas.com/招标在线频道获取招标文件，并于2023年10月9日15点00分（北京时间）前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号：OITC-G230291659 项目名称：中国农业科学院深圳农业基因组研究所多功能微孔板检测仪等一批设备采购项目 预算金额：286万元 最高限价：286万元 采购需求： 包号 品目 项目名称 数量 是否允许采购进口货物 预算金额（万元人民币） 最高限价（万元人民币） 1 1 多功能微孔板检测仪 1 是 33.5 33.5 2 化学发光成像系统 1 是 29.5 29.5 3 实时荧光定量PCR仪 1 是 26 26 4 高压灭菌锅 1 是 7 7 5 高速大容量落地离心机 1 是 32.5 32.5 6 倒置荧光显微镜 1 是 32.9 32.9 7 电穿孔系统 1 是 13.9 13.9 8 大容量台式离心机 1 是 14.5 14.5 9 万分之一天平 1 否 2 2 10 生物安全柜（双人） 2 否 10.6 10.6 11 倒置显微镜 2 否 11.2 11.2 12 二氧化碳培养箱 2 否 10.2 10.2 13 全自动样品快速研磨仪 1 否 4 4 14 烘箱 2 否 6 6 15 超净工作平台 10 否 12 12 16 天平 1 否 1.2 1.2 17 体式显微镜 1 是 6 6 18 微生物自动富集系统 1 是 33 33 合同履行期限：详见项目需求书。本项目( 不接受 )联合体投标。 二、申请人的资格要求： 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定； 2.落实政府采购政策需满足的资格要求：本项目不属于专门面向中小微企业、监狱企业、残疾人福利性单位采购的项目。 3.本项目的特定资格要求： 1）在中华人民共和国境内依法注册的，具有独立承担民事责任能力，遵守国家法律法规，具有良好信誉，具有履行合同能力和良好的履行合同的记录，具有良好资金、财务状况的企事业法人、其他组织或者自然人；2）为本项目提供整体设计、规范编制或者项目管理、监理、检测等服务的供应商，不得参加本项目投标；3）投标单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商，不得参加同一合同项下的政府采购活动；4）按本投标邀请的规定获取招标文件；5）本项目不接受联合体投标，不得分包、转包；6）参与本项目投标前三年内，在经营活动中没有重大违法记录（由供应商在《投标人具备投标资格的证明文件》中作出声明）；7）参与本项目政府采购活动时不存在被有关部门禁止参与政府采购活动且在有效期内的情况（由供应商在《投标人具备投标资格的证明文件》中作出声明）；8）投标人不得为列入失信被执行人、重大税收违法案件当事人名单、政府采购严重违法失信行为记录名单的供应商（由供应商在《投标人具备投标资格的证明文件》中作出声明）。 注1： 1）信用信息查询渠道：“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）、中国政府采购网（www.ccgp.gov.cn）、深圳市政府采购监管网（http://zfcg.sz.gov.cn/）等。“信用中国”中“信用服务”栏的“重大税收违法案件当事人名单”“失信被执行人”“中国政府采购网”中的“政府采购严重违法失信行为记录名单”以及“深圳市政府采购监管网”为供应商信用信息的查询渠道。 2）信用信息查询截止时点：同投标截止期（即开标当日），即查询投标人截止到投标截止期的信用信息记录。 3）信用信息查询记录和证据留存的具体方式：信用信息查询记录将以网站截图打印稿形式与其他采购文件一并保存。 4）信用信息的使用规则：如投标人为“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）中列入失信被执行人或重大税收违法案件当事人名单的供应商，或为中国政府采购网（www.ccgp.gov.cn）、深圳市政府采购监管网（http://zfcg.sz.gov.cn/）政府采购严重违法失信行为记录名单中被财政部门禁止参加政府采购活动的供应商，则其投标将被拒绝。 三、获取招标文件 时间：2023年9月22日 至 2023年10月7日（提供期限自本公告发布之日起不得少于5个工作日），每天上午9:00至12:00，下午14:00至17:00。（北京时间，法定节假日除外） 地点：http://www.oitccas.com/ 招标在线频道 方式：登录http://www.oitccas.com/注册并购买 售价：￥600.0 元，本公告包含的招标文件售价总和 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 2023年10月9日15点00分（北京时间） 地点：深圳市南山区粤海街道粤兴五道9号北理工创新大厦1505室。 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 1、投标文件递交地点：深圳市南山区粤海街道粤兴五道9号北理工创新大厦1505室。 2、招标文件采用网上电子发售购买方式： 1）登陆“东方招标”平台（http://www.oitccas.com/），点击“获取采购文件”链接图标，或直接输入访问地址（http://www.oitccas.com/pages/sign_in.html?page=mine）完成投标人注册手续（免费），然后登陆系统寻找有意向参与的项目，已注册的投标人无需重新注册。招标文件售价：每包人民币600 元，售后不退。如决定购买招标文件，请完成标书款缴费及标书下载手续。 2）投标人可以电汇的形式支付标书款（应以公司名义汇款至下述指定账号）。 开户名称：东方国际招标有限责任公司 开户行：招商银行北京西三环支行 账 号：862081657710001 3）投标人应在平台上填写开票信息。在投标人足额缴纳标书款后，标书款电子发票将发送至投标人在平台上登记的电子邮箱，投标人自行下载打印。 3、以电汇方式购买招标文件的，须在电汇凭据附言栏中写明招标编号、包号及用途，例如：OITC-G230291659标书款（如未标明招标编号，有可能导致投标无效）。 4、采购项目需要落实的政府采购政策： （1）政府采购促进中小企业发展 （2）政府采购支持监狱企业发展 （3）政府采购促进残疾人就业 （4）政府采购鼓励采购节能环保产品 七、对本次招标提出询问，请按以下方式联系。 1.采购人信息 名 称：中国农业科学院深圳农业基因组研究所 地 址：深圳市龙岗区布新路97号 联系方式：李老师0755-28398801 2.采购代理机构信息 名 称：东方国际招标有限责任公司 地 址：北京市海淀区丹棱街1号互联网金融中心20层 联系方式：0769-26627023、020-87001523 3.项目联系方式 项目联系人：迟兆洋、张君仙 电 话：0769-26627023、020-87001523 邮 箱：mye@oitc.com.cn、bxu@oitc.com.cn 东方国际招标有限责任公司 2023年9月22日 DPDL2023000045-A中国农业科学院深圳农业基因组研究所多功能微孔板检测仪等一批设备采购项目采购公告.pdf

一、项目基本情况项目编号：0868-2346ZD1426H项目名称：中国农业科学院农业基因组研究所透射电子显微镜等一批仪器采购项目预算金额：864.000000 万元（人民币）采购需求：透射电子显微镜等设备一批采购，具体如下：序号采购设备标的明细数量（台/套）是否允许进口产品投标1超薄切片机1是2透射电子显微镜1是3高压冷冻仪1是4冷冻替代仪1是备注：以上设备非分包招标，投标人须同时提供以上全部设备进行投标，不允许投标人选择其中一项或几项设备进行拆分投标。合同履行期限：合同签订后7个月交货本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间：2023年11月29日 至 2023年12月06日，每天上午9:30至11:30，下午14:00至17:30。（北京时间，法定节假日除外）地点：深圳市罗湖区桂园街道老围社区红宝路139号蔡屋围金龙大厦10楼1003室方式：在线获取售价：￥800.0 元，本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问，请按以下方式联系。1.采购人信息名 称：中国农业科学院农业基因组研究所　　　　　地址：深圳市大鹏新区布新路97号　　　　　　　　联系方式：李老师 0755-28398801　　　　　　2.采购代理机构信息名 称：深圳市振东招标代理有限公司　　　　　　　　　　　　地　址：深圳市罗湖区红宝路京基金融中心D座（蔡屋围金龙大厦）10楼03号-06号　　　　　　　　　　　　联系方式：张先生 0755-82786018/82786038-808　　　　　　　　　　　　3.项目联系方式项目联系人：张先生电　话：　　0755-82786018/82786038-808

巡讲简介　 　　博奥生物针对目前科研人员的实际研究需求，精心准备了针对多个领域的交流内容，涵盖当前医学、农业、转化医学等多个热点，由生物芯片北京国家工程研究中心生命科学研究科学家主讲，为大家奉献精彩的讲座。同时，讲座现场会将举办多层次的互动活动，有精美礼品赠送。 　　博奥生物致力于为生命科学领域提供创新、完善的整体解决方案，提供的生命科学服务覆盖了核酸、 蛋白、细胞及活体等各个研究领域；涵盖了基因组学、转录组学、蛋白组学、 细胞生物学、生物信息学等各个组学学科；服务平台也覆盖了生物芯片、荧光定量PCR、测序、质谱、流式细胞仪等各个技术平台，并经严格的资质认证，多个平台通过了ISO 9001/IEC17025服务质量认证；从业人员均是经过专业培训的技术人员，可以为客户提供相应的高质量生命科学服务及后续检测、数据分析等服务。 　 　同时，博奥生物也是Affymetrix公司、Roche公司的战略合作伙伴，并且是Affymetrix、Roche NimbleGen、ABI 7900HT、RayBiotech的认证服务商。 巡讲概况 博奥巡讲清华站 博奥巡讲农科院站

一、项目编号：0868-2246ZD1204H（招标文件编号：0868-2246ZD1204H）二、项目名称：中国农业科学院农业基因组研究所液相-超分辨质谱仪、高分辨气质联用仪采购项目三、中标（成交）信息供应商名称：广州市诚屹进出口有限公司供应商地址：广州高新技术产业开发区科研路2号自编4栋306中标（成交）金额：1059.1000000（万元）四、主要标的信息序号 供应商名称 货物名称 货物品牌 货物型号 货物数量 货物单价(元) 1 广州市诚屹进出口有限公司 高分辨气质联用分析仪液相-超分辨质谱仪 Waters赛默飞世尔 Acquity Premier/DESI XS/Synapt XSOrbitrap Exploris GC 240 1 1 5298000 5293000

p style=" TEXT-ALIGN: center" img style=" WIDTH: 450px HEIGHT: 308px" title=" u=2084952100,4214805908& amp fm=21& amp gp=0.jpg" border=" 0" hspace=" 0" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201508/uepic/4a7be024-3508-421f-812f-92cde5f0bfdf.jpg" width=" 450" height=" 308" / /p p 　　美国农业部国家食品与卫生研究所(NIFA)上周二宣布，将投入2760万美元来通过改善动物生产和健康来支持食品安全的研究。其中包括投入250万美元用于专门开发动物遗传和基因组学的工具和资源。NIFA主任Sonny Ramaswamy在一份声明中说道，我们在农业生产上面临的主要挑战包括极端天气、干旱、水资源的短缺、气候的变化、害虫和全球竞争等，生产商正在寻找可行的解决方案。这些资金可使美国农业部通过提供不仅有营养而且安全和丰富的食物来保持一定的竞争力。 /p p 　　奥本大学获得48.5万美元用于开发鲶鱼全基因组SNP阵列，加利福尼亚大学Davis获得将近50万美元来生成鸡、牛以及猪基因组的全面监管元件，爱荷华州立大学获得35万美元来创建利用不完整基因型数据预测动物基因的计算方法。同时，NIFA将超过45万美元的资金用来支持康涅狄格大学利用合成基因组来研发家禽细菌疫苗的研究，另外Recombinetics生物技术公司获得43万美元的资助，用于评估不同基因编辑技术在无角牛新品种饲养领域的实用性。 /p p 　　该资助属于美国国家食品与卫生研究所的一项食品研究计划，主要是为了支持研究，解决所面临的粮食和农业的问题。根据美国农业部，该项目将推进食品的丰富且安全，“基因组学通过提高动物的生长、繁殖效率以及动物的健康状况来推进精准育种和提高动物的产量。”此外，他们将通过新的疫苗研发、早发现早预防等策略来提高动物的安全卫生性。 /p

从人类基因组草图到完全图谱——论基因组重复片段研究作者：李东卫，张玉波（中国农业科学院农业基因组研究所，“岭南现代农业”广东省实验室，深圳 518120）2001年发表的人类基因组草图并没有包含全部的基因组序列，直到二十年后，科学家们才正式宣布完成了人类全序列基因组图谱，这其中主要的技术障碍就是重复片段的测序工作。重复片段（segmental duplications，SDs）是指广泛存在于基因组中的大于1 kb且序列相似性超过90%以上的大片段。它们可以通过基因组重排及拷贝数变异产生新基因和驱动进化，其大量存在于子端粒中，并与哺乳动物细胞复制性衰老以及癌症等重要生物学过程密切相关，一直以来备受科学家关注。但是其序列特点使得常规的测序技术难以完全准确测出全部序列，是基因组组装工作的一个难点。人类基因组全图谱的完成将重复片段在生物体进化、延缓衰老、疾病治疗等方面的研究提供基础。本文将就重复片段的重要性，研究的技术难点，研究现状以及未来展望等方面展开论述。重复片段的重要性重复片段是基因组中序列高度相同的大片段，具有广泛的结构多样性。它们占人类参考基因组（T2T-CHM13）中的7.0%，长度为218 Mbp[2 ]，在中心体及子端粒区域富集高达10倍。中心体所包含的5个典型重复为：α卫星，β卫星，CER卫星，γ卫星，CAGGG重复，以及重复子4。子端粒所包含的典型重复为：端粒相关重复（TAR）以及传统的（TTAGGG）n重复[4 ]。重复片段可以介导染色体重排，使常染色体和异染色体之间通过同源重组产生镶嵌类型的重复的染色质[5 ]。在最近新鉴定的人类重复片段中，Mitchell R等预测了182个新的候选蛋白编码基因，并使用T2T-CHM13基因组重构了重复基因（TBC1D3，SRGAP2C，ARHGAP11B），这些基因在人额皮质增生中具有重要作用，揭示了重复片段结构在人和他们近亲物种之间的巨大进化差异[6 ]。大量的染色体子端粒区含有重复片段[8 ]。复制性衰老被认为是一种抗癌机制，限制细胞增殖。长寿的有机体经历更多的细胞分裂，因此具有更高的产生肿瘤的风险。端粒酶能够增加端粒的长度，促进癌细胞不断增殖，因此长寿动物体细胞倾向于抑制端粒酶的活性，从而抑制肿瘤发生的风险[10 ]研究难点：大片段长度、多拷贝数、序列高度相似 重复片段的大的片段长度，多拷贝数以及序列的高度相似是长期以来其研究的难点。各种测序技术的发展致力于解决这个问题。重复片段长度范围是1到400 kb [12 ]。而且，标准的长读段校正工具，例如MUMmer 或Minimap2不能够有效的捕捉低相似的重复片段，也经常将重复片段与其它调控元件混淆[14 ]，为重复片段的研究带来机遇。尤其是PacBio的HiFi读段，具有长读段的同时还具有较高的准确度。但是，很多重复片段的长度要比HiFi读段的平均长度要长，因此很难完全准确的进行组装[3 ]。染色体重排，尤其是染色质断裂常发生在高GC区域[16 ]。同时，在T2T-CHM13基因组基础上，Mitchell R等首次进行了全基因组重复片段的研究。与当前人类参考基因组（GRCh38）鉴定的167 Mbp复制片段相比，鉴定了更多的（218 Mbp）非冗余重复片段（图2 a, b）。新发现91%的重复片段能更好地代表人的拷贝数，通过与非人灵长类基因组相比，前所未有的揭示了人类和其它近亲在重复片段结构中的杂合性以及广泛的进化差异[17 ]。图2 T2T-CHM13中新鉴定的染色体内（a）与染色间（b）的重复片段[1 ]。利用重复片段解析衰老机制未来可期新组装的T2T-CHM13的拷贝数比GRCh38高9倍，因此它能更好的呈现人类拷贝数变异。通过鉴定新基因的拷贝数变异，可筛选相应的药物治疗靶点。例如，CHM13鉴定到LPA、MUC3A、FCGR2基因的拷贝数变异与疾病相关[1]。此外，对于尚具争议的疾病标志基因，例如乳腺癌中ESR1 基因[18]，可以通过CHM13对其进行分子进化分析，进而鉴定其突变和扩增，确定其在乳腺癌中的作用。尽管端粒作为抗衰老靶标已研究多年，但是端粒长短变化与复制性衰老的关系仍不清楚。细胞减数分裂过程中端粒变短的机制是什么？重复片段拷贝数变异与端粒变短有无相关性？很多研究已证明端粒酶具有延长端粒长度的作用，具体的机制是什么？这些问题因此前端粒不能被准确测序而长期未解决。现在，人类基因组完全图谱已基本实现，相信这些谜团会很快解开。未来可以根据人类年龄增长过程中端粒重复片段的拷贝数变异，解析其抗衰老的机制。通过人为干预其拷贝数，可能用于探索生命的极限。1. Vollger MR, Guitart X, Dishuck PC, Mercuri L, Harvey WT, Gershman A, Diekhans M, Sulovari A, Munson KM, Lewis AM et al.Segmental duplications and their variation in a complete human genome. bioRxiv.2021:2021.2005.2026.445678.2. Prodanov T, Bansal V.Sensitive alignment using paralogous sequence variants improves long-read mapping and variant calling in segmental duplications. Nucleic Acids Research.2020 48(19).3. Bailey JA, Yavor AM, Massa HF, Trask BJ, Eichler EE.Segmental duplications: Organization and impact within the current Human Genome Project assembly. Genome research.2001 11(6):1005-1017.4. Courseaux A, Richard F, Grosgeorge J, Ortola C, Viale A, Turc-Carel C, Dutrillaux B, Gaudray P, Nahon JL.Segmental duplications in euchromatic regions of human chromosome 5: a source of evolutionary instability and transcriptional innovation. Genome research.2003 13(3):369-381.5. Giannuzzi G, Pazienza M, Huddleston J, Antonacci F, Malig M, Vives L, Eichler EE, Ventura M.Hominoid fission of chromosome 14/15 and the role of segmental duplications. Genome research.2013 23(11):1763-1773.6. Young E, Abid HZ, Kwok PY, Riethman H, Xiao M.Comprehensive Analysis of Human Subtelomeres by Whole Genome Mapping. PLoS genetics.2020 16(1):e1008347.7. Lander ES, Linton LM, Birren B, Nusbaum C, Zody MC, Baldwin J, Devon K, Dewar K, Doyle M, FitzHugh W et al.Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature.2001 409(6822):860-921.8. Seluanov A, Chen ZX, Hine C, Sasahara THC, Ribeiro AACM, Catania KC, Presgraves DC, Gorbunova V.Telomerase activity coevolves with body mass not lifespan. Aging Cell.2007 6(1):45-52.9. Bromham L.The genome as a life-history character: why rate of molecular evolution varies between mammal species. Philos T R Soc B.2011 366(1577):2503-2513.10. Shay JW.Role of Telomeres and Telomerase in Aging and Cancer. Cancer discovery.2016 6(6):584-593.11. Sharp AJ, Locke DP, McGrath SD, Cheng Z, Bailey JA, Vallente RU, Pertz LM, Clark RA, Schwartz S, Segraves R et al.Segmental duplications and copy-number variation in the human genome. American journal of human genetics.2005 77(1):78-88.12. Hartasanchez DA, Braso-Vives M, Heredia-Genestar JM, Pybus M, Navarro A.Effect of Collapsed Duplications on Diversity Estimates: What to Expect. Genome Biol Evol.2018 10(11):2899-2905.13. Numanagic I, Gokkaya AS, Zhang L, Berger B, Alkan C, Hach F.Fast characterization of segmental duplications in genome assemblies. Bioinformatics.2018 34(17):i706-i714.14. Vollger MR, Dishuck PC, Sorensen M, Welch AE, Dang V, Dougherty ML, Graves-Lindsay TA, Wilson RK, Chaisson MJP, Eichler EE.Long-read sequence and assembly of segmental duplications. Nature methods.2019 16(1):88-94.15. Rhie A, McCarthy SA, Fedrigo O, Damas J, Formenti G, Koren S, Uliano-Silva M, Chow W, Fungtammasan A, Kim J et al.Towards complete and error-free genome assemblies of all vertebrate species. Nature.2021 592(7856):737-+.16. Nurk S, Koren S, Rhie A, Rautiainen M, Bzikadze AV, Mikheenko A, Vollger MR, AltemoseN, Uralsky L, Gershman A et al.The complete sequence of a human genome. bioRxiv.2021:2021.2005.2026.445798.17. Zhu Y, Liu X, Ding X, Wang F, Geng X.Telomere and its role in the aging pathways: telomere shortening, cell senescence and mitochondria dysfunction. Biogerontology.2019 20(1):1-16.18. Tabarestani S, Motallebi M, Akbari ME.Are Estrogen Receptor Genomic Aberrations Predictive of Hormone Therapy Response in Breast Cancer? Iranian journal of cancer prevention.2016 9(4):e6565.

2022年9月22日，中国农业科学院作物科学研究所联合中国科学院微生物所、山东省农业科学院农作物种质资源研究所、国际半干旱热带作物研究所和澳大利亚默多克大学等国内外多家单位在Nature Genetics上以长文的形式发表了题为Improved pea reference genome and pan-genome highlight genomic features and evolutionary characteristics的研究论文。研究团队完成了中国豌豆主栽品种“中豌6号”的基因组组装和解析，解决了长期以来悬而未决的豌豆基因组精细物理图谱组装难题，揭示了豌豆基因组结构和进化的独特特征，发掘了一批与粒型、株高和荚型等孟德尔性状和重要农艺性状相关的位点和基因，同时构建了栽培和野生豌豆泛基因组，展示了豌豆近缘野生种和地方品种作为未来豌豆育种改良资源的巨大潜力。高质量的参考基因组、注释和泛基因组对豌豆种质资源挖掘利用和育种改良的基础与应用研究具有重要参考价值和指导作用，同时也为其他豆科作物基因组和泛基因组研究提供了重要借鉴。自孟德尔发现遗传定律以来，豌豆作为遗传研究的“明星”植物，受到了学界和公众的广泛关注。豌豆 (Pisum sativum L., 2n=2x=14) 是一年生冷季食用豆类，属于豆科（Leguminosae）、蝶形花亚科（Papilionoideae）、野豌豆族（Viceae）、豌豆属（Pisum L.）。豌豆富含蛋白质、淀粉、纤维素和多种矿物质，是粮菜饲兼用的食用豆类作物，在世界范围内广泛种植。据FAO统计资料显示（http://www.fao.org/faostat/），世界豌豆的总产量和种植面积逐年增加，中国豌豆特别是鲜豌豆的总产量与种植面积也增长迅速。同时，豌豆的生物固氮能力可以减少氮肥使用，有效改善土壤结构，还可作为倒茬作物减少病虫害，促进农业和自然生态系统的可持续发展。作物种质资源是支撑农业发展创新和作物遗传改良的物质基础，目前国家作物种质库保存豌豆种质资源达到7000余份，蕴藏着丰富的遗传多样性，亟待深入挖掘和利用【1】。图1 中豌6号形态特征及豌豆种质资源多样性豌豆基因组大小约为4.28 Gb，远大于大豆（4倍）、鹰嘴豆（6倍）、普通菜豆（7倍）、绿豆和小豆（8倍）等其他豆科作物基因组，其基因组中有超过80%的重复序列。由于豌豆基因组的复杂性，直到2019年，国际上才公布了第一版以二代测序技术（Next Generation Sequencing, NGS）为主的豌豆参考基因组，为豆科植物基因组进化提供了新的见解【2】。然而，由于NGS技术的短板，这一版基因组组装得到的218,010个contigs的 N50 值仅为37.9 Kb，组装结果碎片化严重，尤其是在复杂的重复区域，与高质量参考基因组的标准相去甚远【2】。此外，研究表明，与国外豌豆种质资源相比，中国豌豆具有独特的遗传背景和丰富的遗传变异【3】。由于缺乏豌豆高质量基因组和精细物理图谱，严重滞后了豌豆重要农艺性状的遗传解析和种质资源挖掘利用进展，尤其阻碍了对国内外不同豌豆种质资源的综合利用。为了解决上述科学难题，研究团队利用中国豌豆主栽品种“中豌6号（ZW6）”，以PacBio 单分子实时 (SMRT) 测序为基础，结合 10x 长片段测序、Bionano 光学图谱和染色质三维构象捕获 (Hi-C)，以及 Illumina NGS 技术，联合优化多种组装策略，完成了迄今为止最高质量的豌豆基因组精细图谱和基因注释（图2）。该基因组组装大小约为3.8 Gb，序列对总共7条染色体的定位率达到97.96%，组装的contig水平N50达到了8.98Mb。通过遗传图谱一致性评估、BUSCO分析、Merqury分析以及LAI分析在内的综合基因组组装评估方法，均表明该组装在连续性、准确性和完整性方面表现优异。此外，该组装共注释出47,526个编码基因，并且在基因完整性、调控区完整性、转座子组装完整性和注释完整性方面均得到了明显改善。豌豆基因组高质量精细物理图谱的获得，拓宽了我们对豌豆巨大基因组背后遗传学的了解，为豌豆重要农艺性状的遗传解析和种质资源的挖掘利用提供了宝贵基因组资源。图2. 豌豆基因组的重要特征。豌豆大约在10,000 年前被驯化，被认为是最早驯化的豆类作物之一。然而，尽管它在推进植物遗传学方面发挥了关键作用，但豌豆属内的物种划分长期存在争议，其驯化过程仍不清楚【4】。研究团队基于118个栽培和野生豌豆的全基因组重测序数据，不仅揭示了栽培和野生豌豆SNP、InDel和SV等不同变异类型的基因组多态性特征，同时基于SNP和SV多态性变异信息的群体遗传结构和系统发育分析，阐明了栽培和野生豌豆的群体遗传结构，支持豌豆属内包含3个物种P. fulvum、P. sativum 和 P. abyssinicum的结论。同时在 P. sativum中鉴定出了三个遗传分组，其中 P. sativum II (PSII) 和 P. sativum III (PSIII) 主要对应于代表亚洲和欧洲不同地理区域栽培豌豆的两个遗传分组，可能与豌豆驯化后的传播途径有关（图3）。以上结果解决了长期以来关于豌豆属物种划分的争议，为豌豆起源驯化提供了新的基因组学证据，也为豌豆种质资源的综合开发利用提供了科学依据。图3 基于SNP (a, b, e)和SV (c, d, f)的118份栽培和野生豌豆的群体遗传结构。孟德尔通过研究豌豆的七个性状发现了遗传规律，开创了遗传学研究的先河。在过去的几十年中，孟德尔研究的四个性状包括粒型（R/r）、株高（Le/le）、子叶颜色（I/i）以及种皮和花色（A/ a)的四个基因位点已经被克隆并进行了功能分析；而其他三个孟德尔性状，果荚颜色 (GP/gp)、荚型 (V/v) 和花的位置 (Fa/fa)相关的基因位点尚未解析【5】。为了探索豌豆重要农艺性状的遗传基础，研究团队利用GBS测序对WJ×ZW6杂交构建的300个F2群体中的12个农艺性状进行了QTL分析（图4），鉴定出了25 个与12个农艺性状相关的QTLs，其中有三个为孟德尔性状相关位点和基因，包括控制粒型（圆粒/皱粒，R/r）和株高（高/矮，Le/le）的孟德尔基因，以及与荚型（硬荚/软荚，V/v）相关的候选基因。图4 豌豆12个农艺性状QTL分析结果以及与孟德尔性状相关的3个QTL位点和基因【5】。越来越多的研究表明，单一的参考基因组不足以代表一个物种，特别是对于豌豆这类经历过长期驯化的物种，而泛基因组分析为作物种质资源变异解析和挖掘利用提供了有效手段。为了更深入地了解栽培和野生豌豆的多样性，研究团队构建了基于116个栽培和野生豌豆全基因组测序的泛基因组（图5），发现栽培和野生豌豆种质资源大部分泛基因组多样性主要存在于不同物种和遗传分组之间，并且以特有基因组序列的形式存在。对豌豆泛基因的存在/缺失变异模式（PAV）分析发现，随着新基因组数目的增加，核心基因的数量减少，而泛基因的数量增加，并逐渐趋于饱和（图5a）。同时，在多个豌豆基因型中存在的核心基因在其他27 个植物基因组中也更保守（图5b），表明它们具备通用的核心功能。基于跨基因组同源基因系统发育分类方法（HOG），研究人员将116个泛基因组的基因聚类生成 112,776个泛基因簇，在不同物种之间显示出差异显著的PAV模式（图5c）。对不同泛基因分组中特有泛基因的 GO 分析显示出保守基因和可变基因之间的不同功能富集。值得注意的是，P. abyssinicum独特的泛基因在刺激和化学反应方面富集，而P. fulvum的泛基因在发育、生长、繁殖、细胞骨架等方面富集，进一步证实了豌豆野生近缘种和地方种质资源作为育种材料在未来提高豌豆品种抗性和产量方面的潜在价值。图5 116个代表性栽培和野生豌豆的泛基因组分析结果（包括 ZW6）。总之，研究人员克服了复杂基因组组装的多重障碍，成功绘制了中国豌豆基因组高质量精细物理图谱，还构建了栽培和野生豌豆泛基因组，揭示了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构与重要性状的分子基础，为豌豆起源驯化、基因挖掘、种质创新和育种改良以及豆科植物比较基因组学研究提供了重要借鉴和宝贵资源。这项研究邀请了澳大利亚默多克大学Rajeev K Varshney教授共同开展国际合作研究，他认为这次研究成果为公众提供了高质量的豌豆参考基因组，产生的基因组资源不仅有助于豌豆的遗传基础研究，以应对气候变化带来的挑战，还将促进豌豆优异基因的挖掘和优良品种的开发。此外，宗绪晓课题组及其合作团队还建立了豌豆遗传转化体系，利用CRISPR/Cas9基因编辑体系成功实现对豌豆PDS基因的编辑【6】。恰逢孟德尔诞辰200周年，豌豆高质量基因组和泛基因组的发布，以及豌豆基因编辑技术体系的建立将为豌豆重要农艺性状的遗传解析和种质资源的挖掘利用提供有力的技术支撑。中国农业科学院作物科学研究所杨涛副研究员和刘荣助理研究员、中国科学院微生物研究所骆迎峰副研究员和胡松年研究员以及山东省农业科学院农作物种质资源研究所王栋助理研究员为论文的共同第一作者。中国农业科学院作物科学研究所宗绪晓研究员、中国科学院微生物所高胜寒特别研究助理、山东省农业科学院农作物种质资源研究所丁汉凤研究员、国际半干旱热带作物研究所和澳大利亚默多克大学Rajeev K Varshney教授为论文的共同通讯作者。中国科学院植物研究所葛颂研究员，西北农林科技大学徐全乐副教授、山东省农业科学院作物种质资源研究所李娜娜副研究员、云南省农业科学院何玉华研究员、青海大学刘玉皎研究员、江苏沿江地区农业科学研究所王学军研究员、四川省农业科学院项超副研究员以及中国农业科学院作物科学研究所研究生王晨瑜、李冠、黄宇宁、季一山、李孟伟，国际半干旱热带作物研究所Manish K Pandey和Rachit K Saxena博士，也参与了该项研究。辽宁省农业科学院李玲研究员，澳大利亚谷物种质库Bob Redden教授和美国农业部农业研究中心、华盛顿州立大学胡锦国教授对项目开展提供了重要帮助。豌豆基因组研究得到了科技部国家重点研发计划（2018YFD1000701/2018YFD1000700）、中国科学院青年创新促进会（2017140）、山东省农业品种改良项目（2019LZGC017）、中国农业农村部食用豆现代产业技术体系（CARS-08）、国家自然科学基金（31371695和31801428）、山东省农业科学院科技创新项目（CXGC2018E15）、作物种质资源保护（2130135）、山东省农科院科技创新项目产业团队农业科学（CXGC2016A02）、山东省现代农业产业技术体系粗粮创新团队（SDAIT-15-01）、中国农业科学院创新工程（ASTIP）和山东省农业科学院青年研究基金（2016YQN19）等项目的支持。

各有关单位： 　　为更好指导农业用基因编辑植物安全评审工作，扎实做好安全管理，我办制定了《农业用基因编辑植物评审细则（试行）》，现予印发。 　　农业用基因编辑植物评审细则（试行） 　　一、分子特征 　　（一）靶基因编辑情况。提供覆盖编辑位点的PCR扩增测序或全基因组测序等资料，对于采用全基因组测序的，还应提供在编辑位点的覆盖度分析资料。相关数据应能够说明基因编辑植物中靶基因编辑情况。 　　（二）载体序列残留情况。提供全基因组测序及其在转化载体上的覆盖度分析等资料。相关数据应能够说明基因编辑植物中载体序列残留情况。 　　（三）脱靶情况。提供预期脱靶位点的PCR扩增测序或全基因组测序等资料，应采用生物信息学等方法分析预期脱靶位点，对于采用全基因组测序的，还应提供在预期脱靶位点的覆盖度分析资料。相关数据应能够说明基因编辑植物的脱靶情况。 　　二、环境安全 　　（一）可能直接改变物种关系的基因编辑植物，如抗病虫、耐除草剂性状。应提供以下资料： 　　1.目标性状和功能效率评价。 　　2.生存竞争能力，包括株高、覆盖率、繁育系数、落粒性以及种子数量、重量和发芽率等。 　　3.对生态系统群落结构和有害生物地位演化的影响。 　　4.抗病虫基因编辑植物还应提供对可能影响的非靶标生物的室内生物测定。 　　5.耐除草剂基因编辑植物还应提供对至少3种其他常用（非目标）除草剂耐受性的测定。 　　（二）其他基因编辑植物，如抗逆（抗旱、耐盐碱、抗冻、抗高温等）、品质改良、生理性状改良（养分高效利用、生育期改变、高产等）。应提供以下资料： 　　1.目标性状和功能效率评价。 　　2.生存竞争能力，包括株高、覆盖率、繁育系数、落粒性以及种子数量、重量和发芽率等。 　　三、食用安全 　　（一）可能改变关键成分的基因编辑植物，如品质改良、高产等。应提供以下资料： 　　1.关键成分分析（包括营养素、功能成分、抗营养因子、内源毒素、内源过敏原等）。 　　2.最大可能摄入水平对人群膳食模式影响评估。 　　3.基因编辑导致某种蛋白质表达量显著增加的，还应提供该蛋白质的表达量及其与已知毒蛋白质、抗营养因子和致敏原氨基酸序列相似性比较。 　　4.基因编辑导致产生新蛋白质的，还应提供：（1）新蛋白质的表达量；（2）新蛋白质与已知毒蛋白、抗营养因子和致敏原氨基酸序列相似性比较；（3）新蛋白质体外模拟胃液蛋白消化稳定性、热稳定性试验；（4）新蛋白质毒理学试验。 　　5.若上述数据资料（1—4项）表明目标性状可能增加食用安全风险，还需提供大鼠90天喂养试验。 　　（二）不改变关键成分的基因编辑植物，如抗病虫、耐除草剂、抗逆（抗旱、耐盐碱、抗冻、抗高温等）、生理性状改良（生育期改变、养分高效利用等）。应提供以下资料： 　　1.关键成分分析（包括营养素、功能成分、抗营养因子、内源毒素、内源过敏原等）。 　　2.基因编辑导致某种蛋白质表达量显著增加的，还应提供该蛋白质与已知毒蛋白质、抗营养因子和致敏原氨基酸序列相似性比较。 　　3.基因编辑导致产生新蛋白质的，还应提供：（1）新蛋白质与已知毒蛋白、抗营养因子和致敏原氨基酸序列相似性比较；（2）新蛋白质体外模拟胃液蛋白消化稳定性、热稳定性试验；（3）新蛋白质毒理学试验。 　　4.若上述数据资料（1—3项）表明目标性状可能增加食用安全风险，还需提供大鼠90天喂养试验。 　　四、评审程序 　　上述分子特征、环境安全和食用安全评价都可在中间试验阶段进行，若中间试验阶段获得的数据资料表明目标性状不增加环境安全风险，经评价合格后可直接申请安全证书。 　　若中间试验阶段获得的数据资料表明目标性状可能增加环境安全风险，需开展环境释放或生产性试验，经安全评价合格后方可申请安全证书。环境释放或生产性试验应在试验植物的主要适宜生态区进行。申请生产应用安全证书，应在每个主要适宜生态区至少设一个试验点。 农业用基因编辑植物评审细则（试行）.pdf

第五届国际基因组学大会11月16日在深圳大梅沙拉开帷幕。这次大会由深圳华大基因研究院、美国特拉华大学、美国加利福尼亚大学圣地亚哥分校、美国康乃尔大学及中国科学院海洋研究所共同举办。来自各国的400多位基因组学专家和学者出席会议。 　　当日（11月16日）上午9时，中国科学院院士杨焕明教授主持了会议的开幕式。深圳盐田区委常委、常务副区长龙岳华先生出席并致欢迎辞。 　　杨焕明院士首先对基因组学领域近10年的发展成果进行了总结，系统阐述了基因组学给人类社会发展带来的深远影响和无限机遇。华大基因执行总裁王俊教授接着介绍了华大基因作为基因组学的领军团队所获得的系列重要成果及在推动基因组学研究技术革新中所发挥的突出作用，并对未来基因组学在人类健康与疾病、农业及生物能源等领域的应用前景进行了展望。随后，国际人类基因组计划与千人基因组计划的主要负责人之一、英国Sanger研究所生物信息专家Richard Durbin博士 美国Bio-IT World 杂志主编Kevin Davies博士 人类肠道宏基因组计划(MetaHIT)负责人之一、法国国家农业科学院(INRA)S. Dusko Ehrlich教授 加拿大麦吉尔大学药理和治疗学部门Moshe Szyf教授，丹麦哥本哈根大学生物系主任Karsten Kristensen教授等国际知名专家在大会上分别作了精彩报告。 　　他们均表示，大会在国际上的知名度和影响力越来越大，已成为世界生物基因领域的学术交流盛会。通过会议，他们获得了与不同学术领域科学家深入沟通交流与扩大合作的机会，并且更加深入全面地了解到基因组学的最新研究与应用进展。 　　会议将持续3天。在随后的议程中，还将同步举办7个研讨会，分别以水产基因组学、中国仓鼠卵巢细胞研究与基因组学、园艺作物生物学和基因组学、人类自身免疫病遗传学、癌症基因组学与分子标记、测序与农业、测序与生态学为主题，分别进行深入集中的学术交流。他们还将讨论当前世界基因组学和生物信息学研究领域的最新进展，并深入探讨基因组学在科学发现及产业应用中的广阔前景。 　　杨焕明院士说：&ldquo 当前科学研究的主要目标是改善人类健康、发展可持续性农业、开发生物能源、保护环境。基因组学等组学技术以及生物计算研究的发展，将为实现这些目标奠定坚实的基础。&rdquo 　　参加会议的还有来自全球众多知名的研究机构、生物技术公司和权威科学期刊，包括法国农业科学院、加拿大麦吉尔大学、丹麦哥本哈根大学、新加坡基因组学研究所、英国桑格研究所、澳大利亚昆士兰大学、日本国立遗传学研究所、韩国科学技术院、中国科学院、北京大学、中山大学、清华大学等几十所科研院所，以及Illumina、Pacific Biosciences、Life Technologies、Affemetrix等研发机构。

4月2日，由多国农作物遗传学家参与的国际花生基因组计划传来喜报：在历经数年研究后，成功完成世界上首个花生全基因组图谱的绘制工作。花生基因组测序的完成和序列的公布将为全球研究人员和植物育种专家培育出更高产、适应性更广的花生新品种提供了 重要的支撑及宝贵的遗传资源。 据了解，中国是国际花生基因组测序计划的重要参与方。此次参与基因组测序的中方合作单位包括华大基因、河南省农业科学院经济作物研究所、中国农业科学院油料作物研究所和山东省农业科学院生物技术研究中心。华大基因参与了全基因组测序、拼接、组装和信息分析工作。 除花生基因组外，华大基因与全球合作方还成功破译了众多其他重要的经济农作物，如水稻、谷子、大豆、高粱、玉米、木豆、小麦、棉花、芝麻等，为育种专家培育优良品种，改良农作物性状，提高农作物产量等提供了重要的遗传资源。

华大基因3月22日宣布将参与全球最大微生物基因组研究项目EarthMicrobiomeProject(简称&ldquo EMP&rdquo )，将负责EMP亚洲地区所有样本的收集和鉴定，并对整个项目提供DNA提取、扩增、建库、宏基因组测序，以及研发生物信息学分析流程所需的计算资源。 　　EMP将对来自全球的20万个样本进行环境DNA测序或者宏基因组测序，从而建立一个全球性的基因图谱，旨在全方位、系统性地研究全球范围内的微生物群落的功能及进化多样性，以便更好地造福社会及人类。参与该项目的主要单位有华大基因(BGI)、阿拉贡国立实验室、芝加哥大学、科罗拉多大学、劳伦斯· 伯克利国立实验室和美国基因能源联合研究所。 　　据介绍，与以往的微生物研究有所不同，该项目的研究对象不仅集中于海洋和人体环境中微生物群落，还包括土壤、空气、淡水生态系统等整个地球表面的绝大多数的微生物群落。 　　华大基因理事长、中国科学院院士杨焕明表示，&ldquo 我们非常荣幸能够作为主要参与者参加如此重要的研究项目。微生物对地球上所有的生命具有至关重要的作用，而我们对微生物的复杂性和多样性认识不足，征服这个未知的领域是非常有必要的。华大基因拥有国际先进水平的测序平台和强大的生物信息学分析能力，我们相信可以为促进人类对微生物群落重要性的了解贡献出价值和力量&rdquo 。 　　据悉，今年6月13日至15日，华大基因将联合EMP联盟在深圳共同举办第一届EMP大会。作为本次大会的主办方，华大基因将与来自各地的学者分享微生物学、微生物基因组学及相关生态、健康、医学、工业、农业等各领域最新的学术成果及应用前景。

p 　　中国科学院遗传与发育生物学研究所李家洋研究组与中国农业科学院、中国热带农业科学院等合作，在橡胶草基因组序列解析方面取得重要进展，标志着以橡胶草作为模式植物进行天然橡胶合成研究进入后基因组时代。研究成果近日在线发表在权威学术期刊《国家科学评论》(National Science Review)杂志上。 /p p 　　科研人员独立组装完成了高质量的橡胶草基因组草图，该基因组大小为1.29Gb，包含46,000多个基因和约70%重复序列。橡胶草基因组也因此成为目前能够产生高分子量橡胶的植物中，唯一完成基因组测序的草本植物。 /p p 　　通过产胶植物与非产胶植物之间的比较基因组研究，研究人员鉴定了橡胶草中橡胶合成途径和菊糖合成途径，并阐述了橡胶链延长过程中CPT/CPTL和REF/SRPP两个重要基因家族的进化历程。此外，他们还发现了橡胶草基因组中与自交衰退相关的可能候选区域。该成果并将大大加速橡胶草从野生植物向经济作物的驯化，推动我国天然橡胶产业的发展。 /p p 　　天然橡胶是与石油、钢铁、煤炭并重的世界四大工业原料之一，2015年全球消耗总量达12.14百万吨，产值约170亿美元。巴西三叶橡胶树一直是天然橡胶的主要来源，但由于种植面积限制、生产成本增加、遗传背景狭窄和病虫害严重等因素，橡胶生产逐渐难以满足需求。我国是天然橡胶消费大国，而巴西三叶橡胶树可种植面积极少，导致我国对外依赖度已超过80%。因此，开发生产天然橡胶的替代资源具有重要的战略意义和经济价值。 /p p 　　橡胶草又名俄罗斯蒲公英，根部可合成高分子量的天然橡胶和菊糖。由于具有生长范围广，天然橡胶含量高，生长周期较短，相对简单的基因组和遗传转化与基因编辑比较容易等特点，它被认为最有可能成为替代生产天然橡胶的经济作物和科学研究的模式植物。21世纪以来，世界各国相继成立了天然橡胶研究计划，相比之下，我国则研究相对较少。2015年4月中国“蒲公英橡胶产业技术创新战略联盟”正式成立。 /p p /p

2010年下旬，河南安阳曹操墓真伪之辩正酣。而一则来自上海的重磅消息更是引发了多方关注。复旦大学现代人类学教育部重点实验室宣布，向全国征集曹姓男性DNA样本，拟用基因组科学的手段验证出土的头骨是否为曹操本人。 　　一下子，基因组科学成为热门，这一话题&ldquo 落入寻常百姓家&rdquo 。 　　事实上，伴随着2000年人类基因组框架图和2003年人类基因组完成图的发表，近十年来，DNA测序技术继续高速发展，基因组科学极大地推动了生命科学的发展，并一直受到各国政府和学术组织高度重视。 　　2010年，基因组科学研究更是取得了重大进展。在美国《科学》杂志评出的当年十大科学进展中，涉及基因组科学的共有3项&mdash &mdash 尼安德特人基因组、外显子组测序、下一世代的基因组学。这也从一个侧面反映了该项科学在2010年的蓬勃发展。 　　多个重要物种基因组图谱完成 　　2010年，期待已久的大豆基因组序列终于测通。 　　当年1月，来自美国农业部、美国能源部联合基因组研究所等单位的研究人员联合在《自然》宣布，该研究团队利用&ldquo 全基因组鸟枪测序法&rdquo 对大豆基因组的11亿个碱基进行测序，公布了第一张豆科植物完整基因组序列图谱。这也是目前利用全基因组鸟枪测序完成的最大植物基因组。 　　&ldquo 这是大豆研究一个重要的里程碑。&rdquo 美国能源部大豆生物技术国家中心主任Gary Stacey博士认为。 　　伴随着该图谱的绘制完成，作为世界上主要油料来源的大豆，其基因组科学研究进展又获新突破。 　　2010年11月，由香港中文大学、华大基因研究院、农业部基因组重点实验室、农业科学研究院等单位宣布，他们对17株野生大豆和14株栽培大豆进行了全基因组&ldquo 重测序&rdquo ，总共发现了630多万个SNP(单核苷酸多态性位点)，建立了高密度的分子标记图谱，并作为封面故事刊登于《自然&mdash 遗传学》杂志。 　　&ldquo 这是世界上首次大规模获得野生和栽培大豆群体基因组数据。&rdquo 华大基因研究院徐讯博士告诉《科学时报》记者。 　　精确的大豆基因组序列图谱和其全基因组大规模遗传多态性分析，为大豆遗传性状的鉴定提供了便利，而有关其他物种基因组的研究也不遑多让。 　　最牵动国人神经的基因组图谱绘制，莫过于国宝大熊猫。 　　由深圳华大基因研究院、中国科学院昆明动物研究所、中国科学院动物研究所、成都大熊猫繁育研究基地和中国保护大熊猫研究中心等单位共同完成的《大熊猫基因组测序和组装》，于1月21日以封面故事形式在国际权威杂志《自然》上发表，并获评2010年中国十大科技进展。 　　该项研究表明，大熊猫有21对染色体和2.4亿对碱基，包含基因2万多个，并且其基因组仍然具备很高的杂合率。&ldquo 这同时也标志着基于短序列的基因组测序、拼接和组装技术获得了重大突破。&rdquo 徐讯指出。或许，这项研究进展将让人类更早地知道大熊猫的&ldquo 黑眼圈&rdquo 之谜。 　　此外，在过去的12个月里，先后有包括中国在内的多国研究人员在《自然》《科学》等杂志上报告完成了苹果、青蒿、黄瓜、寄生性金小蜂、蚂蚁、蚜虫、珍珠鸟等多个重要物种的基因组图谱。 　　今后，基因组测序规模将越来越大。记者从华大基因研究院获知，仅仅2011年，就可能有土豆、绵羊、牦牛、几种鸟类等多项物种的基因组图谱陆续绘制完成。 　　基因组科学揭示人类变迁 　　本文开头提到的&ldquo 利用曹姓DNA鉴定曹操头骨&rdquo 并非国人专利。据英国《每日邮报》报道，比利时学者曾对希特勒家族的39位亲属进行DNA检测，来证明希特勒的族裔。 　　这些工作的开展，借助的正是&ldquo 基因留有祖先深刻烙印&rdquo 这一事实。 　　而以基因为研究目的的基因组科学，恰恰使描述人类及动物变迁等地理基因组学和人类学研究成为可能。 　　2010年，世界各地的科研人员在该方面研究均有较大进展，我国科学家的研究也同样呈现多点开花局面。 　　2009年12月15日，美国《国家科学院院刊》刊载的中国科学院院士、中科院昆明动物研究所研究员张亚平等人的文章称，通过对680份藏族人群线粒体DNA样本分析表明，现代藏族人的绝大部分母系遗传组分，可能追溯至新石器时期以来迁入青藏高原的中国北方人群。 　　2010年，来自复旦大学的研究人员也对西藏地区居民进行了&ldquo 基因普查&rdquo 。研究人员推测，西藏居民可能最早来自北亚人群，接近蒙古和贝加尔湖区域等地区的北方人群。而国家计划生育研究所和北京基因组研究所的最新研究结果则进一步揭示，藏族先民可能是经横断山脉向上游迁徙，最后抵达青藏高原。 　　发现还不止于此。同样是2010年，华大基因研究院对我国藏族、汉族人群常染色体EPAS1基因进行分析，研究结果刊于美国《科学》杂志。这项研究初步推测出该基因在青藏高原世居藏族人和平原汉族人中出现分离的年代。 　　除了在藏族人类学领域取得了重要成就，科学家在2010年仍大有收获。如果佐以社会学的相关研究，基因组科学或将在人类学研究领域获得更大的空间。 　　另一项关于古人类的基因组学研究更在2010年震惊世界，并同时位列多个不同机构评选的世界十大科学新闻。 　　2010年5月6日，多家国际著名机构在《科学》杂志上发文表示，研究人员通过DNA两轮靶向序列捕获的测序新技术，实现了分别对3个古代尼安德特人头骨化石片段DNA的测序。 　　尼安德特人在进化学上是与我们最为接近的亲族。它们出现在大约40万年前，分布遍及欧洲和西亚，并于3万年前灭绝。 　　研究表明，所获得的基因组序列图占其整个基因组中的60%之多，而现代人具有约1%～4%尼安德特人的基因。 　　来自马普研究所的Svante Paabo兴奋地表示：&ldquo 尼安德特人基因组序列首个版本的获得，完成了人类长期以来的一个梦想。我们首次发现了将我们与其他所有生物区别开来的基因特征，包括那些在进化过程中距离我们最近的亲族。&rdquo 　　中国的发现也同样令人振奋。中国科学院院士、中国农业大学教授李宁等成功提取出距今已有9000年历史的猪骨化石DNA，通过测序研究发现，其是经过驯化的家猪，这将中华民族的家畜驯化史推到万年层面。 　　或许，在今后的基因组科学研究中，有关人类历史学的观点将不断更新。 　　下一世代测序技术令人翘首 　　古DNA的成功测序和组装依赖于测序技术的进步。同样，有别于前两代的下一世代测序技术也在2010年的基因组科学研究中&ldquo 小荷已露尖尖角&rdquo ，并入选世界十大科学进展。 　　下一世代测序技术，是基于纳米孔的单分子读取技术，可以直接读取序列信息，简便快捷 反观之前的两代技术，则需要荧光或化学发光物质的协助, 通过读取整合到DNA链上的光学信号而间接确定。 　　虽然该测序方法仍有基因组覆盖不完整等缺陷，但并不影响其风生水起。 　　例如，斯坦福大学的生物工程师Stephen Quake等研究人员在《自然&mdash 生物技术》发文称，他们利用一台新开发的单分子测序仪，对其本人的基因组进行了测序，仅耗时4个星期，试剂费约48000美元。 　　与此同时，离子激流公司的下一代硅芯片测序仪也获得突破。利用该技术，科学家们于2010年在《科学》杂志上公布了3个低成本的完整人类基因组序列。 　　就此，英国纳米孔公司总裁发表评论说，这一技术预示了基因测序领域的跳跃变化，或许今后不超过1000美元就可以完成一个基因组测序。 　　中科院基因组研究所副所长于军告诉《科学时报》记者，基于现在的经验曲线，即使目前广泛运用的第二代测序技术，也可能在一两年内实现&ldquo 千美元基因组&rdquo 的设想 但是对于&ldquo 百美元基因组&rdquo 的设想可能还有一段路要走，急需革命性技术的出现。 　　然而，我们已然看到了希望。2010年4月6日，日本大阪大学产业科学研究所的川合知二和谷口正辉宣布，新一代DNA测序技术的可行性首次通过验证。 　　这篇发表在《自然&mdash 纳米技术》上的文章显示，研究者通过电测方法，利用只有1纳米的超短距离电极，成功地测量出构成DNA的1个核酸碱基分子中流动的电流，成功识别了核苷酸。 　　令人欣喜的是，科学家们并没有&ldquo 喜新厌旧&rdquo 。&ldquo 不同代的测序技术并不互相排斥，尤其是化学原理不同的基本技术，它们在具体应用方面存在功能上的互补性，将长期共存。&rdquo 于军强调。 　　在测序技术快速发展的2010年，中国科学家同样不甘落后。 　　据了解，中科院的基因组研究所及半导体所联合开发、具有部分自主知识产权的第二代测序仪预计在今年3月下线，这不但能打破国外测序仪公司的垄断，还将大大降低我国基因组测序的成本。 　　此外，中科院基因组研究所已和浪潮集团成立了联合实验室，将共同研发第三代基因测序仪，预计第一台样机于2013年问世。 　　毫无疑问，新一代的测序技术必将对人类的未来生活产生深远影响。 　　测序分析理念迎来突破 　　随着新一代测序技术的广泛使用，测序速度将越来越快，成本则大大降低。但是，测序产生的大量数据却会给后期的生物信息分析带来巨大压力。 　　&ldquo 我认为生物信息分析是在基因组测定过程中最关键的一项技术。&rdquo 华大基因研究院副院长王俊曾这样表示。 　　不过，就在2010年，基于基因组的生物信息学分析研究也取得了丰硕成果。 　　当年10月, 中科院基因组研究所、中科院上海生科院植物生理生态研究所等单位在《自然&mdash 遗传学》杂志发表文章。研究人员结合第二代测序技术和自主开发的基因型分析方法，构建了高密度的水稻单体型图谱，并对籼稻品种的14个重要农艺性状进行全基因组关联分析, 确定了这些农艺性状相关的候选基因位点。 　　同样来自《自然&mdash 遗传学》等杂志的文章还显示，伦敦帝国理工学院的研究人员也通过多次全基因组关联分析，发现了多个包括糖尿病、冠心病在内的与现代热点疾病相关的基因。 　　事实上，研究人员还表示，对两个毫不相干的人进行&ldquo 全基因组关联分析&rdquo 对比，或许能够得出许多有用的研究信息，但如果辅以家庭遗传关系，那么测序数据会更加准确。 　　《科学》杂志在2010年3月发表文章称，美国首次为一个四口之家进行了全基因组测序。由于有家庭遗传背景关联，研究人员更精确地锁定了与米勒综合征相关的4个基因。 　　&ldquo 家庭测序将成为今后基因研究和疾病治疗方面的一个新工具。&rdquo 于军表示。 　　随着研究的深入，一项世界最大的表观遗传学研究项目也已启动。据了解，华大基因研究院与伦敦国王学院TwinsUK团队将通力合作，对5000对双胞胎的基因组的化学修饰进行深入研究。 　　除了对测序结果分析方法及样本选择的拓展，2010年，研究人员还对测序理念和方式进行了全新尝试。 　　2010年5月，刊于《自然&mdash 遗传学》的一篇杂志文章称，科学家们使用基因组定向捕获工具&mdash &mdash 安捷伦的SOLiD，成功捕获了4个患病婴儿的外显子组并测序成功 而华盛顿大学医学院的研究人员也在《科学》上表示，他们利用外显子测序，找到了一种恶性眼疾的关键基因。 　　毫无疑问，这项备受各方关注、位列世界十大科学进展的技术将会越来越多地应用于更多疾病研究，用来寻找包括癌症在内的多重疾病的致病基因和易感基因。 　　于军评论说，与全基因组重测序相比，外显子组测序相对经济、高效。它只需针对外显子区域的DNA即可，覆盖度更深、准确性更高。 　　而公共数据库提供的大量外显子组数据，更是为科学家更好地解释研究结果提供了便利。 　　显而易见，在未来，基因组测序分析理念将随着测序技术的升级而不断变革。 　　各方眼中的基因组科学 　　正如上文所述，在已经过去的2010年里，全世界每个月几乎都有两到三个家族全基因组和外显子组测序被用于检测疾病的基因突变。 　　由此可以看出，基因组科学离人们的生活越来越近。英国医学研究临床科学中心的分子遗传学家Tim Aitman表示，基因组测序在未来的10年到20年内将更加普及。 　　在美国，尽管其食品与药品管理局严格控制私人基因组公司的产品，但随着基因组测序费用的不断降低，越来越多的医生开始利用全基因组或外显子组测序技术进行诊断。 　　基因组科学带给普通患者治愈疾病的希望，那么对科学研究又会有怎样深远的影响? 　　《自然》杂志对超过1000名生物学家的一项调查显示，几乎所有生物学家都在一定程度上受到人类基因组计划的影响。 　　绝大部分人认为自身的研究获益于人类基因组的测序, 其中46%的人认为影响巨大 同时,有接近1/3的人几乎天天都使用到基因组 甚至有69%的受访者表示，是人类基因组计划改变了他们的职业和研究方向。 　　&ldquo 对于像我这样的年轻研究者，没有基因组，很难想象将如何工作。&rdquo 一位受访者如此表示。 　　除了能够对生命科学领域的研究快速推进，各国政府都在期待基因组科学的进一步发展。 　　2008年初，一项被称为&ldquo 千人基因组&rdquo 的计划由来自英国桑格研究所、美国国立人类基因组研究所、中国华大基因研究院等多家机构共同启动。据称，科学家们将对全球至少2000个人类个体的基因组进行测序，从而生成一个庞大的、公开的人类基因变异目录，来寻找基因与人类疾病间的秘密关系。 　　在2010年，非洲也宣布加入基因组革命。同年，世界各国政府和组织纷纷推出了最新的基因组计划，其中就包括基因地理计划、英国10K计划等。此前，中国对人和水稻基因组研究计划的实施也引起世界瞩目。 　　&ldquo 近来中科院基因组研究所与沙特王国阿卜杜拉阿齐兹国王科技城合作开展的椰枣相关基因组研究计划，也标志着中国基因组科学在国际上的重要地位。&rdquo 于军非常自豪。 　　过去的一年，基因组科学的发展一日千里。人们有理由相信，在DNA测序技术飞速发展的引领下，中国和世界基因组科学将走向更加辉煌的未来。

中国科协第114期新观点新学说学术沙龙专家称我国基因组编辑技术须破壁前行　　本报讯(实习生曾云 本报记者潘希)近日，中国科协第114期新观点新学说学术沙龙以“基因组编辑新技术的兴起将带来的冲击”为主题，邀请相关专家讨论了基因组编辑技术在国内外的现状与发展。　　近几年，由于CRISPR(规律成簇间隔短回文重复)等工具的不断问世，基因组编辑技术迎来了新的浪潮。“CRISPR能完成90%的工作，但核心的专利仍掌握在西方人手中。”中科院动物所研究员王皓毅直言，一定要开发新的工具，寻找比CRISPR效率更高的酶。　　“国内科学家要协调合作，思考如何在坚持国际合作的同时，又保持国内优势。”中科院院士、华大基因研究院理事长杨焕明表示，同时应该加强科普避免重蹈转基因的覆辙，也不要在基因组编辑研究中一哄而上。　　在杨焕明看来，现在可以考虑借CRISPR的东风讨论生命科学的服务问题。　　目前，我国也处在CRISPR研究的前沿。例如在植物研究领域，中科院遗传与发育所运用TALEN和CRISPR技术在六倍体小麦中实现了3个同源等位基因的编辑，解决了小麦白粉病广谱持久抗性世界性难题，得到国际上的高度评价。　　不过，专家也列出了目前基因组编辑技术面临的一些技术难题，例如如何提高敲除效率、减少脱靶效应、提高同源重组效率、实现基因定点替换或插入等。　　华南农业大学教授刘耀光认为，对基因的定点替换以及插入等基因靶向修饰来说，技术上还有瓶颈，现在能够做到替换的例子很少。对植物来说，仍然需要提高效率达到实用性。“希望在不久的将来有实用突破”。　　在讨论中，知识产权等问题也成为专家对国内基因组编辑发展的担忧。中科院遗传发育所研究员高彩霞表示，技术的推广需要强大的知识产权支撑，应分析哪些能做哪些不能做，利用自身优势加快推广速度。　　“可以通过合作把专利的渠道拓宽。” 大北农生物科技有限公司专家杨进孝认为，企业要通过服务的方式参与进来，加强研究机构与企业的合作，促进产品落地。　　杨焕明表示，基因组编辑应用的大门已经打开，国内要创造成熟的条件来推动我国基因组编辑技术的研究与推广。

由深圳华大基因研究院联合中国微生物领域顶尖研究机构、院校和企业组成的&ldquo 万种微生物基因计划&rdquo ，八月一日在深圳启动。 　　据悉，该计划是深圳华大基因研究院在&ldquo 国际千人基因组计划&rdquo 后启动的又一重大基因组计划，目前该计划的地位为亚洲第一、世界第三。 　　该计划预计在三年内完成一万种微生物物种全基因组序列图谱的构建，并以此为核心开展一系列基因水平上的探索和研究，将推动中国微生物基因组学深入、系统的研究。其目的是打造微生物全基因组的&ldquo 百科全书&rdquo ，完成&ldquo 生命之树&rdquo 计划的微生物分支，并带动相关学科及产业的发展。 　　该计划的研究领域涵盖了工业微生物、农业微生物、医学微生物等，研究种类包括古细菌、细菌、真菌、源生物、藻类和病毒。 　　据介绍，微生物是地球上种类最多、分布最广、与人类关系最为密切的物种，也是工业生物技术的核心及重要的国际竞争战略资源之一。&ldquo 万种微生物基因组计划&rdquo 将促进发酵业、制药业、食品加工业的升级换代和推动新型生物能源、绿色制造、疫苗生产、环保产业的发展，为解决&ldquo 三农&rdquo 问题，实现节能减排和生物安全，拉动内需提供重要的科技支持。 　　中国科学院院士杨焕明表示，&ldquo 万种微生物基因组计划&rdquo 标志着微生物科学的新开始，表明了微生物研究探索出崭新的研究策略和中国科学家勇于攀登的精神。 　　华大基因成立于一九九九年，目前拥有世界顶尖的测序及信息分析能力，已完成了一系列重要物种的基因组计划。

日前，由中国农业科学院特产所牵头的中国梅花鹿全基因组测序计划启动。 　　该计划将采用测序深度达30X的新一代高通量测序技术(鸟枪法)，联合新西兰皇家农业科学院茵沃梅农业研究中心、加拿大阿尔伯塔大学以及国内外相关单位，合作完成中国梅花鹿基因组的测序、组装和注释工作，以奠定中国梅花鹿功能基因组学、蛋白组学和分子遗传育种的研究基础。 　　该计划的实施将使中国梅花鹿成为世界上第一个全基因组测序的鹿种。基因组序列框架图谱的绘制将大大加速中国梅花鹿的育种过程，对于寻找与鹿生产性能有关的SNP标记和功能基因，特别是寻找控制鹿茸再生的相关基因具有重大的意义。

12月9日，由中国农业科学院烟草研究所参与规划设计与实施的全球第一套烟草全基因组序列图谱&mdash &mdash 绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱完成，这是继马铃薯和番茄基因组之后，全球完成的第三种茄科植物全基因组序列图谱。 　　烟草是重要的科研模式植物，绒毛状烟草和林烟草是栽培烟草的两个祖先种。这两个品种的全基因组序列图谱是目前已知植物基因组序列图谱中基因组最大、组装精度最高、组装结果最好的2个图谱。此项工作的完成标志着烟草研究从此全面进入基因组时代。 　　绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱测序是中国烟草基因组计划的一部分。中国烟草基因组计划于2010年12月启动，由国家烟草基因研究中心、中国农业科学院烟草研究所等单位承担。目前，重大专项已在多个领域取得突破性进展，烟草突变体库创制已达27万份并正在进行大规模鉴定和分析，烟草分子遗传图谱构建和重要突变基因定位克隆也取得了突破。在此基础上，科研人员将有序开展绒毛状烟草和林烟草的遗传图谱和物理图谱绘制，并启动大量四倍体栽培烟草的基因组测序工作。

基因组学的发展日新月异，已经渗透到生命科学领域的各个方面，并显示出强大的发展活力，如何利用新技术来解决重大科学问题已成为基因组学面临的最大挑战。 　　中科院北京基因组所继2012年首次在北京、2014年在合肥举办前两次研讨会后，定于今年回到北京举办第三届&ldquo 基因组学前沿研讨会&rdquo ，本系列研讨会与中科院北京基因组所每两年举行一次的&ldquo 国际基因组学大会&rdquo 互为补充，追踪本学科的研究前沿，促进学术交流。系列研讨会主席为中科院北京基因组所于军研究员。 　　本次研讨会将有三个主题：RNA修饰、单细胞组学和基因组高级结构。目前确认将参会的主题报告人包括：中科院生物物理所的陈润生院士，美国哈佛大学的谢晓亮院士、法国CNRS的Giacomo Cavalli博士、美国华盛顿大学的段治军博士、美国德克萨斯大学达拉斯分校的张奇伟博士、以色列威兹曼科学院的Jacob Hanna博士、日本东京大学的Akimitsu Okamoto博士和中科院北京基因组所于军博士，并邀请了北京大学汤富酬博士、中科院生物物理所李国红博士及中科院北京基因组所杨运桂博士等国内外知名大学和研究所研究人员作报告，总报告人约为30人。研讨会规模预计在150人左右，将就基因组学当前研究热点进行研讨，积极促进相关领域科研工作者的交流和合作，共同进取。 　　会议时间：2015年7月16-19日 　　会议地点：北京 　　会议网址：http://gpb.icgchina.org/ 　　主办单位：中国科学院北京基因组研究所 　　承办单位：Genomics Proteomics & Bioinformatics (GPB) 　　北京路思达生物信息科技有限公司 　　组织委员会： 　　主席：于军 中科院北京基因组研究所 　　委员：陈非 中科院北京基因组研究所 　　方向东 中科院北京基因组研究所 　　胡松年 中科院北京基因组研究所 　　雷红星 中科院北京基因组研究所 　　李国亮 华中农业大学 　　林巍 美国贝勒免疫学研究所 　　刘江 中科院北京基因组研究所 　　王德强 中科院重庆绿色智能技术研究院 　　肖景发 中科院北京基因组研究所 　　杨运桂 中科院北京基因组研究所 　　章张 中科院北京基因组研究所 　　张治华 中科院北京基因组研究所 　　张猛 北京路思达生物信息科技有限公司 　　周水庚 复旦大学 　　会议主题： 　　RNA修饰 　　单细胞组学 　　基因组高级结构 　　主题报告人：(已确认人员如下，持续更新中) 　　Giacomo Cavalli 法国CNRS 　　陈润生 中科院生物物理研究所 　　段治军 美国华盛顿大学 　　Jacob Hanna 以色列威兹曼科学院 　　Akimitsu Okamoto 日本东京大学 　　谢晓亮 美国哈佛大学 　　于军 中科院北京基因组研究所 　　张奇伟 美国德克萨斯大学达拉斯分校 　　报告人：(已确认人员如下，持续更新中) 　　陈月琴 中山大学 　　贺建奎 南方科技大学 　　侯春晖 南方科技大学 　　贾桂芳 北京大学 　　李国红 中科院生物物理研究所 　　李响 华中农业大学 　　林巍 美国贝勒免疫学研究所 　　刘默芳 中科院上海生命科学院生化细胞所 　　宁康 华中科技大学 　　戚益军 清华大学 　　宋旭 四川大学 　　汤富酬 北京大学　　田卫东 复旦大学 　　王德强 中科院重庆绿色智能技术研究院 　　汪小我 清华大学 　　杨朝勇 厦门大学 　　杨运桂 中科院北京基因组研究所 　　伊成器 北京大学 　　会议安排: 详见会议网站http://gpb.icgchina.org/ 会议日程 7月16日 报到；大会报告-基因组高级结构 7月17日 大会报告-单细胞组学 7月18日 大会报告-RNA修饰 7月19日 GPB编委会；离开 关键时间点 6月15日（含） 大会摘要提交截止；注册优惠截止 7月15日（含） 在线注册截止 7月16日 现场注册 注册日期 国内科研人员 国内学生 国际人员 6月15日以前（含） RMB1000 RMB 800 US$300 6月16日&mdash 7月15日 RMB1350 RMB 1000 US$300 7月16日 RMB1500 RMB 1200 US$300

5月28日，北京诺赛基因组研究中心(国家人类基因组北方研究中心)、北京师范大学、中国科学院微生物研究所与美国加州大学戴维斯分校在北京师范大学就&ldquo 十万食源性病原微生物基因组计划&rdquo 达成合作协议。据悉，中美双方将共同参与十万食源性病原微生物基因组计划的研发，建立重要的食源性致病微生物基因序列综合数据库，共享未来的研究成果，包括试剂盒、大样本数据分析以及在产业化和商业化中的应用。 　　查找食源性病原微生物基因 　　食源性疾病是食品安全的主要问题，世界卫生组织将食源性疾病定义为：凡是通过摄食进入人体的，引发人体罹患感染性或中毒性的疾病，其中包括由食品微生物污染和化学性物质引起的食源性疾病，微生物引起的食源性疾病是食品安全的主要问题。 　　&ldquo 十万食源性病原微生物基因组计划&rdquo 是由美国食品药品监督局(FDA)支持，美国国家卫生院、农业部、国家疾控中心和欧盟等国家参与，加州大学戴维斯分校牵头的一个国际基因组项目，其目标是通过大规模病原基因组研究，获得新方法新技术，以保证对食品安全问题提供解决方案。此项目是一个里程碑式的大规模研究，于2013年初启动，旨在创建一个包含大多数食源性致病菌基因组的公共数据库。 　　&ldquo 十万食源性病原微生物基因组计划&rdquo 负责人、美国加州大学戴维斯分校(UC Davis)教授Bart Weimer教授在北京接受科技日报记者采访时表示，&ldquo 我们正在创建一个免费的、在线的基因组百科全书或参考数据库，以确保在食源性疾病暴发时，科学家和公共卫生专家可以很快确定致病微生物的种类，并且使用自动化信息处理方法追踪到其在食物供应中的源头。&rdquo 　　中美双方将开展多项合作 　　随着食品供应成为一个全球性的产业，食品安全已成为全球的责任，Bart Weimer教授希望通过全球的合作，为国际公共健康管理带来一种新的模式。他说，该项计划还将彻底改变农业检测中现行的一些方法，以提高对食物链各环节(从农场到餐桌)分子检测的精确性和稳定性。 　　在中国，对于食源性致病菌的基因研究还刚刚开始，北京诺塞基因组研究中心有限公司曾参与2003年全人类基因组测序项目，并一直关注着基因检测领域的研究和发展趋势。此次由该中心牵头，联手中国科学院微生物研究所病原微生物与免疫重点实验室和北京师范大学生命科学研究院基因资源与分子发育北京市重点实验室三方形成中国科学家团队，与美国加州大学戴维斯分校Bart Weimer博士实验室开展合作研究，将在全球食源性致病菌基因研究中扮演积极的角色，为数据共享、市场开发和技术应用提供有效的应用平台。 　　记者了解到，在&ldquo 十万食源性病原微生物基因组计划&rdquo 签约项目中，中美双方的合作包括以下七大方面：一是中美专家在科学和技术人员之间培训和交流 二是&ldquo 十万病原基因组项目&rdquo 的基因组测序技术在亚洲范围内的扩大合作 三是生物资源的交换 四是项目相关信息和生物信息学的交换 五是联合发表科学出版物 六是争取两国对此合作项目联合资助。 　　中国将建立综合性基因数据库 　　中美合作开展&ldquo 十万食源性病原微生物基因组计划&rdquo ，对于诺赛基因组研究中心的发展是一次新的机遇。北京诺赛基因组研究中心总经理李秉珅表示，诺赛基因组研究中心最初是为了完成人类基因组计划而建立的，但是随着人类基因组计划的完成，诺赛研究中心的发展亟须新活力的注入，实现体制上的改革与转变。&ldquo 此次国际合作的开展对于诺赛的未来发展意义深远，诺赛将再前期投入500万元用于平台建设和研发需要，我们也期待着政府能够给予项目更多的支持&rdquo ，李秉坤强调。 　　在本次合作中，中国科学院微生物所的主要职责是进行食源性病原微生物的基因测序与收集工作，同时，以高通量测序技术建立和完善生物信息分析平台。中国科学院微生物研究所病原微生物与免疫重点实验室负责人朱宝利教授称,他们将实现对大样本食源性病毒基因的总监控，对外公布基因测序相关数据，并且建立综合性基因数据库。 　　北京师范大学生命科学研究院王英典院长告诉记者，病源性病菌基因数据库的建立对于国家食品安全问题的解决具有重大战略意义。当前，中国市场上食品并未进行食源性病源微生物检测，因此，与美国合作建立病源性基因组数据库，将为粮食安全、食品安全以及环境安全问题提供更加有效便捷廉价的解决方案。北京师范大学将利用&ldquo 基因资源与分子发育北京市重点实验室&rdquo ，与诺赛基因组研究中心和中科院微生物所共同建立技术平台和功能实验室。 　　作为北京市生物医药产业发展的重要平台，北京生物技术和新医药产业促进中心一直承担着引领技术创新，促进国际交流和成果转化的作用，该中心主任雷霆在阐述此次国际合作的意义时指出，中美双方在国际化平台上，将打破原有的研发合作模式，遵循各项法律法规，强调生物材料如微生物分离株、DNA序列及微生物综合数字的转移和共享，同时，对于知识产权将做出合理的界定，为推动基因组测序技术推广、学术交流和人员培训开展更多合作。 　　北京市科委主任闫傲霜对于&ldquo 十万食源性病原微生物基因组计划&rdquo 的国际合作平台的建立给予了积极肯定。她表示，目前的食品安全、土地环境污染以及农业技术的可持续发展都面临着严峻的形势，而基因技术将为上述领域带来跨越式飞跃，尽管现在应用还不很明朗，但是，未来技术产业化和市场空间前景不可预期。她说，&ldquo 北京生物医药产业发展非常强调国际合作，此次与美国加州大学戴维斯分校Bart Weimer博士建立合作，将在创新技术、人才培养、信息资源共享以及企业成果转化上开辟出新的模式。 　　据了解，中美双方关于&ldquo 十万食源性病原微生物基因组计划&rdquo 已正式签订合作备忘录，并制定了合作框架，有望于今年下半年正式开始基因测序样本的研发和数据库建立。