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低成本测序

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  • 【分享】PNAS:新技术实现纳米孔内快速测序DNA

    据《每日科学》近日报道,由美国华盛顿大学物理学家领导的研究小组设计了一种新技术,可在纳米孔内对DNA进行快速测序,而且价格比较便宜。新方法可为癌症、糖尿病或某些成瘾患者量身绘制个性化基因测序蓝图,提供更加高效的个体医疗。相关论文发表于美国《国家科学院院刊》(PNAS)。 论文主要作者、华盛顿大学物理教授简斯·冈德拉克表示,他们结合了生物和纳米技术,研制出这种DNA阅读器,阅读器内纳米微孔使用了一种取自耻垢分支杆菌的细胞外膜孔道蛋白A。这种纳米微孔只有1个纳米大小,仅够用来测量一个DNA的单分子链。 研究人员把微孔放在一层浸泡在氯化钾溶液中的膜上,并施加一个小的电压,让电流通过微孔。不同的核苷酸通过纳米微孔时,回路中的电流就会随之改变,这些电流称为特征信号。胞核嘧啶、鸟嘌呤、腺嘌呤和胸腺嘧啶这些DNA的基本组成要素,会生成不同的特征信号。 研究小组解决了两个主要问题,一是生成仅容一条DNA单链通过的纳米微孔,且每次只能通过一个DNA分子。伯明翰亚拉巴马州立大学的迈克尔·涅德维斯改良了细菌,生成了合适的微孔。第二个问题是让核苷酸以每秒100万个的速率通过纳米微孔,冈德拉克说,这实在太快了,阅读器还无法在这种速度下对每个DNA分子信号分类整理。为了解决这一点,研究人员在每个要测量的核苷酸之间附带了一段双链DNA,双链DNA在微孔中流动不那么顺畅,磕磕绊绊地通过微孔,便可将下一个通过微孔的单链延迟几毫秒。这种延迟尽管只有千分之几秒,电信号却有了充足时间来识别目标核苷酸,从而从示波器轨迹上准确读出这些DNA序列。 这项研究由美国国家卫生研究院和美国人类基因研究院资助,旨在降低成本,使人类基因组完整测序成本降到1000美元或更少。该研究始于2004年,当时完整测序一个人的基因要花费1000万美元,而新的测序技术使人们向1000美元测序的目标迈进了一大步。

  • 低成本高消耗和高成本低消耗哪个更好?

    低成本高消耗,前期投入少可以很快投入运行,但随着时间的推移成本会很高。高成本低消耗,前期投入较高资金可能无法一步到位,不能马上投入运行,但今后运行的成本会很低。你们认为哪个更好?

  • 【资料】高级采购师--招标采购降低成本

    高级采购师--招标采购降低成本一、招标采购 (一)定义 所谓招标又称公开竞标,它是现行采购方法常见的一种。这是一种按规定的条件,由卖方投报价格,并择期公开当众开标,公开比价,以符合规定的最低价者得标的一种买卖契约行为。 (二)特点 此类型的采购具有自由公平竞争的优点。可以使买者以合理的价格购得理想物料,并可杜绝询私、防止弊端。不过手续较繁、费时,对于紧急采购与特殊规格的货品无法适用。 二、招标采购的成本意义 招标采购适用于政府机关、大型的集团公司采购,招标采购有如下特点。 招标采购不需采购组织花费精力与时间去市场开发供应商,而是供应商会亲自上门,在一个公开的环境下招标采购,让供应商公开论价比价,方便采购组织寻找到最低采购价格的采购品;同时也防止了采购员与供应商的私下作业。 因此招标采购对于采购成本来说: ◎ 削减了供应商的开发成本; ◎ 有效地控制了采购物品的价格。 三、招标采购的实施 招标采购必须按照规定作业程序来进行。一般而言,招标采购的流程可分为:发标、开标、决标、签订合约四个阶段。 招标采购的实施步骤: 阶段一 发标 发标之前须对采购物品的内容,依其名称、规格、数量及条件等详加审查。若认为没有缺失或疑问,则开始制发标单、刊登公告并开始准备发售标单。 阶段二 开标 开标之前须先做好事前准备工作,如准备开标场地、出售标单;然后再将厂商所投的标启封,审查厂商资格。若没有问题再予以开标。 阶段三 决标 开标之后,须对报价单所列各项规格、条款详加审查是否合乎规定;再举行决标会议公布决标单并发出通知。 阶段四 签订合约 决标通知一经发出,此项买卖即告成立;再依招标规定办理书面合约的签订工作,合约一经签署,招标采购即告完成。 四、招标书 (一)订定标书的原则 [color=#3333

  • 3D技术获突破:低成本移动全息图将成现实

    2013年06月30日 来源: 新浪科技http://www.stdaily.com/stdaily/pic/attachement/jpg/site2/20130630/00234edd254e1339d4a01b.jpg  美国麻省理工大学的科学家攻克了一个重大技术难关,让制造低成本高品质全息显示器的梦想照进现实。与3D图像一样,全息影像允许观察者四处走动,从任何一个角度进行观察http://www.stdaily.com/stdaily/pic/attachement/jpg/site2/20130630/00234edd254e1339d47d1a.jpg  美国麻省理工大学的科学家攻克了一个重大技术难关,让制造低成本高品质的全息显示器的梦想照进现实。据科学家估计,采用他们研发的新技术制造全息显示器的成本不到320英镑(约合500美元)  新浪科技讯 北京时间6月30日消息,据国外媒体报道,美国麻省理工大学的科学家攻克了一个重大技术难关,让制造低成本高品质全息显示器的梦想照进现实。不久后,消费者便可以使用笔记本电脑观看到《星球大战》中出现的移动全息图。  全息视频经常在科幻作品中出现,最著名的例子当属《星球大战》中莉亚公主的全息影像。当前用于投射全息影像的系统不仅造价高,同时存在重大缺陷,其中最主要的缺陷就体现在空间光调制器上。这种装置负责在三维空间内引导光线,形成光点。如果采用当前的技术,全息影像的尺寸、观看角度、帧速以及景深等主要指标均受到限制。  麻省理工大学的科学家研制出一种全新的空间光调制器,能够克服绝大多数缺陷。这一研究成果让全息影像从科幻走进现实成为一种可能。研究发现刊登《自然》杂志上。据科学家估计,采用这项新技术制造全息显示器的成本不到320英镑(约合500美元),这还不包括光源的费用。  此项研究由迈克尔-伯维博士领导。研究小组在论文中指出:“我们正在研制基于这种装置阵列的显示器,例如小型PC驱动的全息视频显示器和宽度超过1米,由专业硬件驱动的大型全息显示器。借助于我们研发的新技术,制造全色标准视频解析度和30 Hz刷新率的全息视频显示器能够成为一种可能。”与3D图像一样,全息影像允许观察者四处走动,从任何一个角度进行观察。(孝文)

  • 国产新一代基因测序仪产品样机亮相

    科技日报讯 (记者王怡)中国科学院北京基因组研究所和吉林中科紫鑫科技有限公司4月18日在长春联合召开国产新一代基因测序仪样机观摩研讨会,向与会的国内基因测序领域专家和应用单位代表展示这一合作成果,同时向社会公开征集部分应用单位进行免费测试使用,测试工作将于今年下半年开展。 据了解,新一代基因测序仪样机是目前唯一技术性可以匹敌国际市场主流产品的国产基因测序系统,与国外第二代高通量测序系统相比,已经成功解决“读长较短”这一关键技术难题。该基因测序仪已经达到和部分超越国际主流设备技术指标,其成本低于进口设备1/3以上,应用成本低于进口设备1/5以上,使新一代测序技术真正达到进入广泛应用市场的经济条件,并将彻底解决我国基因测序仪完全依赖进口的局面。截至目前,该系统已获得7个发明专利和1个实用新型专利授权,还有多项专利正在申报。 中科院北京基因组研究所研究员于军介绍,新一代基因测序仪对传染性疾病的预防控制和诊疗,生物恐怖因子、食源性致病因子和转基因成分鉴定,口岸卫生和有害生物防御性检疫,以及针对人类遗传多样性而产生的疾病早期预警和个体化用药相关基因的检测分析等实践应用,提供强有力的技术支持。 据悉,测序仪今年下半年将在医疗、检验检疫、疾病防控、高校、研究院所等20家应用单位进行免费测试使用。已经确认参加测试应用的单位包括中国检验检疫科学研究院、北京出入境检验检疫局、青岛海洋大学等10余家单位。测试工作主要包括对系统性能的优化和改进,以及根据应用领域的不同进行应用产品的共同开发,即在基础试剂产品的平台上衍生出一系列专用型试剂产品,并开发相应的数据分析算法和数据库,实现测序技术实践应用的全面解决方案。来源:中国科技网-科技日报 2014年04月20日

  • 焦化废水低成本“零排放”技术

    焦化废水的低投入、低成本、无害化处理利用,有助于焦化企业摆脱环保困境,而通过增加城市供热、供气、废水、垃圾处理等社会化功能,也有利于焦化企业转型,减少损失。在目前可选择处理的技术中,在焦炉烟道气净化过程中处理利用焦化废水被认为是比较可行的低成本、甚至是有效益的解决方案。该工艺有望同时一次性解决焦化脱硫废液处理、焦化废水深度处理回用和焦炉烟道气脱硫脱硝三大难题。  1 在焦炉烟道气净化过程中处理利用焦化废水  焦化废水主要包括脱硫废液、剩余氨水(主要部分)、其他焦化废水等。焦炉烟道气是炼焦过程中焦炉煤气或混合煤气燃烧过程中产生的烟气,有时会混入少量串入的焦炉煤气。过去,焦炉烟道气都是通过地下大烟道、烟囱直排的;现在,环保要求净化后排放。参考某厂焦炉烟道气的原始参数、环保控制标准(见表1),除环保严格要求的除尘、脱硫、脱硝外,还涉及余热回收利用、节水和湿法脱硫后的除湿“脱白”。1.jpg  焦炉烟道气净化处理利用焦化废水的工艺,如图1所示。在焦炉大烟道的适当位置开孔,通过旁通的方式将焦炉烟道气引出,首先可以选择用余热锅炉回收蒸汽,烟气温度降低到约160℃进入烟道气净化系统,通过循环喷淋焦化废水和清水净化,净烟气单独排放,原烟道和烟囱作为脱硫系统事故备用,以确保焦炉的安全运行。2.jpg  主要设备由脱硫废液喷雾干燥塔、高效氨法脱硫塔、湿式风机水洗除氨和湿烟气除湿“脱白”几部分组成。  喷雾干燥塔:采用双流空气雾化喷枪,将脱硫废液喷入喷雾干燥塔,首先利用烟道气的余热和含氧量,实现脱硫废液中酚、氰等有机有毒成分(COD、BOD)的热解和热氧化,转变成二氧化碳和水,低成本实现无害化。焦炉烟道气温度从240-300℃降低到90-120℃,理论计算可以处理10-12t/h焦化废水,首先确保全部处理脱硫废液,不足部分处理剩余氨水,剩余氨水中的氨与二氧化硫、氮氧化物发生化学反应,焦炉烟道脱硫脱硝的同时生成硫酸铵、硝酸铵颗粒,与脱硫废液中所含的盐一起,以干燥杂盐形式分离出来,从塔底定期排出,初步净化后的烟气进入高效喷淋洗涤。  高效喷淋洗涤脱硫:由于焦化脱硫废液和剩余氨水中的氨含量不高,离开喷雾干燥塔顶部的烟道气,首先进入二次蒸发管道,继续循环喷剩余氨水进行二次蒸发冷却到饱和温度,再用剩余氨水喷射式洗涤脱硫系统,喷入到一定液面的剩余氨水池中,进行湿式氨法脱硫,实现残余污染物的净化,进入循环氨水中。剩余氨水密闭循环富集到一定盐浓度后,送入前面的喷雾干燥塔处理干燥提盐,或净化后送回硫氨原料系统。烟道气温度从90-120℃降低到约50℃。  湿式风机水洗除氨和除湿“脱白”:为了防止烟气中残余的氨、有机有毒污染成分放散,脱硫后净烟气进入湿式风机洗涤净化,湿式风机在为系统提供排烟动力的同时,还有高效除尘、脱硫、除酸、防止氨逃逸等多种功能,而且由于烟气温度低、含蒸汽量减少等因素,其运行功率只有干式引风机功率的约50%,具有显著的节电效益。洗气机洗涤采用循环净水,烟气温度从约50℃降低到40℃以下,可以回收烟气中43%的饱和水蒸气和携带的余热,同步冷凝净化烟气中的细颗粒粉尘、二氧化硫、氮氧化物、氨等污染成分,确保焦化废水中的有机有毒有害成分不会转移到大气中,净化达标烟气通过除湿干燥塔顶的烟囱排放。  2 焦炉烟道气脱硫消纳利用焦化废水的原理  根据有关研究结果和经验,采用高温热解和热氧化焚烧后再急冷的方式处理焦化废水等有机有毒含盐废水能彻底实现废水的无害化,也属于焦化等有机有毒废水深度处理的方法之一,但长期以来,一直存在的难题是处理投资和运行费用过高。焦化废水焚烧除了焚烧炉外,还要配备余热回收利用、急冷、除尘、脱硝、脱硫等设备,设备投资高、运行成本均高。利用焦炉烟道气脱硫过程消纳和处理焦化废水则解决了运行成本和投资高的难题,主要相关反应见下:  1)酚: C6H6O+ 7O2 = 6CO2↑+ 3H2O +△Q  2)苯:C6H6+15/2 O2 = 6 CO2↑+3 H2O +△Q  3)氨:2NH3+7/2 O2 = 2NO2↑+3 H2O +△Q  4)硫化氢:2H2S + 3O2 = 2SO2↑+3 H2O +△Q  5)氰化氢:2HCN+ 9/2O2=2CO2↑ + 2NO2 + 3 H2O + △Q  硫酸铵、硫酸钠等盐类:喷雾干燥分离  前两个反应可以实现焦化废水主要有机污染成分的无害化;有关研究还表明,反应式3)和5)的主要反应产物中部分为氮气,也实现了两种主要有毒成分的无害化。退一步讲,就算是生成SO2、NO2,也易溶于水中,被循环氨水洗涤吸收后会与废水中的氨发生反应,生成固体,或液态硫酸铵、硝酸铵,实现无害化。焦化废水被喷入焦炉烟道气后,有三个主要去向:放散烟气、干灰和污水污泥。干灰、污水和污泥都是在焦化企业内部循环不外排,唯一可能转移排入大气的途径只有放散烟气。采用本工艺通过后步多级清水洗涤净化,可确保焦化废水中的有机有毒成分不外排。  3 应用效果  山西一焦化公司现有1座4.3m焦炉,按照环保要求,焦化脱硫废液需要提盐处理、剩余氨水经过蒸氨、生化处理后,还得深度处理,焦炉烟道气则需要除尘、脱硫、脱硝净化,采用市场现有技术,企业需要投资数千万元、甚至上亿元,并且投入后还大幅增加运行成本,目前焦炭市场不景气、企业在微利甚至亏损的情况下难以承担,但不解决这些问题,又面临日益严格的环保压力。为此,借鉴转炉除尘系统中消纳处理利用焦化废水的成功经验,用户决定在焦化烟道气脱硫系统中,进行消纳和利用焦化废水的工业试验,可以处理全部焦化脱硫废液和部分剩余氨水,一次性解决焦化脱硫废液、焦化废水深度处理和焦炉烟道气脱硫三大难题。  工业试验于2016年5月5日开工、6月30日开始调试运行,至今已经成功运行120多天。系统安装了在线监测设施,并已接入当地环保部门实时监控系统。监测结果:焦炉烟道气脱硫后粉尘含量小于10mg/m3、二氧化硫小于5mg/m3、氮氧化物小于150mg/m3,系统进口烟道气和净化后排烟温度分别为260℃、50℃。现有焦化废水蒸氨和生化负荷大幅降低,仅用于处理化产系统生产废水。  4 问题与改进  焦炉烟道气脱硫消纳和处理利用焦化废水技术得到了初步验证,可以低投入、低成本解决焦化脱硫废液、焦化废水深度处理和焦炉烟道气净化三大难题。考虑到节省开发投资和控制风险,此项技术还存在以下问题,需改进提高。  4.1 烟道气脱硝  研究检测表明,焦炉烟道气中所含的NOx大部分是NO,现有工艺虽然达到了较高的脱硝率,但距离超低排放指标还有差距。计划研发低温湿式氧化吸收的工艺,选择适当的氧化剂(臭氧、双氧水、次氯酸、或硝酸)对烟气中NO进行有效氧化,然后就可以在后步的喷淋洗涤除湿过程中脱除,确保国家超低排放要求的小于50mg/m3指标。  4.2 提纯精盐  焦化脱硫废液处理近几年主要以提盐法为主,投资多、处理成本高,回收的杂盐成了新的固废。本工艺解决了投资和处理成本高的问题,下一步计划开发提纯盐分离技术,生产高纯度硫氰酸钠、硫氰酸铵、硫代硫酸钠、硫酸钠等精盐,在解决污染成分彻底无害化的同时,还可预期较好的经济效益。  4.3 原有废水处理设施和能力的利用  采用焦炉烟道气脱硫消纳处理焦化废水后,原有的焦化废水处理蒸氨可以停止运行,生化系统将出现能力富裕,可以利用其资源化回收和利用城市垃圾渗漏液、化工废水、城市生活污水,而减少企业对自然水源的取水量,并实现整个企业废水的零排,这对低成本保护我们赖以生存的自然水资源很重要,特别是处理城市污水直接利用,可以降低企业成本、获得当地政府的污水处理设施投资和财政补贴。  4.4 焦炉烟道气排烟除湿干燥  目前系统排放烟气温度为50℃,含湿量还比较高。下步计划采取直接喷淋冷凝换热和混风干燥的方式实现排烟除湿干燥,彻底实现“脱白”,同时回收放散烟气中的水分和余热,通过热泵技术提温后,用于焦炉入炉煤的加热或居民采暖和生活热水。  5 结论与建议  1)在焦炉烟道气脱硫系统消纳处理焦化脱硫废液和剩余氨水的工业性试验证明,采用本工艺有望同时一次性解决焦化脱硫废液、焦化废水深度处理回用和焦炉烟道气脱硫脱硝三大难题,为煤焦化企业环保达标、节能降低成本、增加效益和淘汰焦化企业转型发展提供了解决方案。  2)焦炉烟道气实现消纳利用焦化废水的功能后,能力富裕的焦化废水处理设施具备消纳利用城市生活污水等其他类似废水的条件,发挥利用这些潜力可以实现企业和有关污水排放企业废水的“零排放”和降低成本,特别是对改善和保护自然环境有利。  3)本工艺主要提高方向是低温氧化吸收脱硝、除湿“脱白”、回收低温冷凝水节水、回收低温余热用于供暖和生活热水、回收精盐和节电。

  • 【第二届网络原创大赛】废物利用,降低成本。

    【第二届网络原创大赛】废物利用,降低成本。

    [color=#DC143C]废物利用,降低成本。[/color][img]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2009/11/200911301855_187113_1610969_3.jpg[/img][color=#00008B]前言:[/color] 近期,集团内掀起了“降成本”风暴,各种宣传、会议、条幅、口号布满了集团的每一个角落。我想:不仅是我们这里这样,为了创造更大利润,每个工厂、集团都想降低自己的成本。为了响应公司号召。我就拿着相机,去了实验室。搜集下体裁,收获不大。发现了很多处可以改善、降低成本的小细节。降低的数目毕竟小,但是毕竟还是节约的。[color=#DC143C]希望我的发现与改善,能够能给大家带来灵感,减少自己实验室的消耗。[/color]还是那句话,[color=#00008B]抛砖引玉[/color]。如有什么好点子,大家相互分享、相互学习。

  • 中科院自主研发基因测序技术将实现产业化

    来源:中国科技网-科技日报 作者:王怡 2013年10月31日 原标题:我自主研发基因测序技术将实现产业化 科技日报讯(记者王怡)2013年国际基因组学大会10月29日在青岛举行。在开幕现场,中国科学院北京基因组研究所与吉林紫鑫药业股份有限公司就合作开发第二代高通量测序系统项目签订投资意向协议,这标志着由中科院自主研发的第二代测序仪项目即将进入市场转化和产业转化阶段。 基因测序技术,自人类基因组计划实施以来长期占据着国际生命科学技术研究的制高点,随着第二代基因测序技术的发展日趋成熟和成本急剧降低,该项技术被越来越多的科研和实践领域所应用,形成庞大市场。目前我国市场上所有高通量测序设备和试剂均来源于进口,据估计仅2013年我国在仪器和试剂上的投入就超过20亿元。 “我们的基因组学研究一直处于世界前列,源于我们最早参与人类基因组测序的工程,但是我们使用的设备一直都依靠国外的进口设备,中国科学院作为国立科研机构,我们有义务自主研制开发基因测序仪打破国外垄断。”中科院北京基因组研究所党委书记杨卫平说。 在中科院资助下,历时两年半时间完成第二代测序仪研发项目,于2011年实现原理样机和性能验收,部分性能指标超越同类进口产品。其后中科院北京基因组研究所自主投入完成该项目的工程化和产品化开发,并形成其自主知识产权群,目前已有9个专利获得授权。 “第二代高通量测序仪的产业化发展是我们的第一步,后面我们希望能有更多的进展,比如在试剂、数据库和后台都能实现国产化。”杨卫平说。

  • 硅谷聚集基因测序技术新产业

    美国加州的山景城是“硅谷”的重要组成部分。现在,一个与硅芯片相关的潜力大产业正在这里兴起,那就是基因组测序技术产业。这个产业的发展是随着多家大公司的激烈竞争开始的。不过,一家名为“整合基因”(Complete Genomics,CG)的公司不像别的公司一样研发和销售测序仪器,而是为科学家提供外包的测序服务,更绝的是,在这家公司里做测序的,并不是研究人员,而是一排排的机器人。近日,《新科学家》杂志探秘了这家充满科幻意味的公司。前台都是“机器人”走进CG公司,连前台都由计算机终端出任。它会主动向来客问好,询问姓名、身份和来访意图。旁边连接的一台打印机则自动打出访客挂牌。与此同时,一份电子邮件已经发送到内部接应人员的电脑上。这家公司的生产线更像科幻电影里的实验室,昏暗蓝色的房间里到处都是高级仪器,室内温度保持在28℃和相对较高的湿度,几名穿着实验服,带着发罩的工作人员在监视着电脑屏幕,查看着机器人的运作状态。这儿已经成为了世界上最大的人类基因组测序工厂。只是在这里工作的不是人类,而是机器人。在一个大约只有半个网球场大的房间里,“坐着”16台机器人,不间断地进行着人类基因组测序的工作。去年,它们完成800个人的DNA测序工作其中三分之一是后半年做出来的。到了今年,它们已经可以每个月生产出400个人的基因了。CG公司只是目前迅速形成产业的诸多基因组测序公司中的一家,但是它十分独特。公司市场总监图柯特(Jennifer Turcotte)对《新科学家》杂志解释说,通常而言,DNA测序是在一个密封的机器里进行的,但在这家公司的实验室里,机器人却是在一个开放暴露的环境下做基因组测序,这是为了便于维修。实验室特定的温度和湿度是为了符合测序中出现的生化反应,微弱的蓝光是为了避免荧光探测剂在探测基因代码符号时受到其他频率光波的破坏。这儿所进行的基因组测序,已是目前最新的第三代基因组测序技术,称为“DNA纳米球测序技术”。这种新方法是将DNA链放置在一小块硅芯片上进行调节,自我组装成所谓的“纳米球”。这样的测序所需要的试剂更少,得到的数据则更多。技术人员都穿着无尘室服装,因为任何一点灰尘都会干扰测序,除非哪儿出问题了,一般而言这些技术人员不会干预机器人的工作。机器人则会自动添加试剂,操作样本,每个DNA纳米球上携带着70个核苷酸,其排列顺序会通过光信号被拍摄记录下来。费用正在逐步降低这些机器人正在做的工作,是一个浩大庞杂的工程蓝图中的第一步,所有的人类基因组中有着30亿对碱基对,而CG计划将其全部组装出来。这需要非常大的计算量,公司为此也建了一个自动数据中心。不过,这个数据中心设在距离公司大约有20分钟车程的地方那儿的电费更便宜。目前CG公司只针对研究者和制药公司开放,个人还没法购买他们的服务。在这里,每对基因组测序要价9500美元,如果购买1000对以上,则每对价格降为5000美元。这个价格是随着基因组测序技术突飞猛进而急剧下降的,要知道,十年前,第一对人类基因组序列完成时,其价格是以十几亿美元计量的。而科学家现在已经预计几年后,基因组测序的价格可能会降到一般人都可能支付得起的程度。基因组测序的流水线完全是由机器人来做的,而职员做什么呢?公司共有185名职员,部分是科研人员,忙于改善公司的测序技术,另一部分则是做市场和联络,与各类客户打交道。基因组测序工程是一项既有非常光明的前途但又异常庞大的科学工程,而自动化则可能成为处理这项工作的最佳工具。基因学家们认为,通过一些基因扫描,是可以找到导致人类易感疾病的一些基因变异,人类基因谱上,有一些常见明显变异,但是就整个遗传问题来看,还有大量的混乱的遗传变异隐藏在DNA双螺旋体中,这些也导致了世界上千奇百怪的遗传疾病。如何去捕猎这些神秘莫测的错误基因代码呢?只剩下一个方法,那就是将整个人类基因谱测序,来捕捉一些可能和疾病有关的基因变异。这个方法虽然听上去如同“大海捞针”一样不靠谱,但目前一些迹象表明,今后或许基因组序列会成为医疗记录的一部分,或者科学家可以通过家庭的基因组测序来纠正基因错误。比如,去年西雅图系统生物学研究所的胡德(Leroy Hood)及其小组与CG公司进行了合作,在《科学》杂志上刊登了一篇论文。他们对一家四口的基因组进行了测序。这是个特殊的家庭,两个孩子都患有两种隐性遗传病米勒综合征和纤毛运动障碍,而父母则完全正常,在分别测出这家人的基因序列后,研究者将父母和子女基因组序列进行比较,验证了米勒综合征这种非常罕见遗传病的致病突变。提供测序外包的服务目前,站在基因组测序产业化起跑线上的企业包括了同样位于加州的生物科学公司Pacific Bio。这个公司创立了首次可以对单个DNA进行测序的仪器。和CG公司一样,目前,这家公司也只向研究者提供服务。有一些大型的、从事基因组测序产业的公司已经将基因组测序做到医院和个人普及的地步了,如研发制造大型测序分析仪器的Illumina公司。这个公司在2008年美国成长最快的科技公司评选中,风头甚至盖过了Google。它们提供的产品甚至可以直接给病人使用。而另一位基因创业企业家罗斯伯格(Jonathan Rothberg)甚至发明了可以放在桌子上的基因解码器,可以在2小时之内以很高的精度解读出1000万个基因代码符号。大部分的基因组测序企业都站在一个竞争线上,尽力提高DNA测序的速度,降低费用。而CG公司其实并非和它们是严格意义上的竞争对手他们计划组装出所有的人类基因序列,研发也是为此目的而进行。此外,他们并不如其他公司一样开发更高级更小巧的基因组测序仪,而是为科学家提供基因组测序的外包服务,也就是说,研究人员无需购买、安装、培训、运行和维修仪器,而只要将样品交给这家公司,等待结果到来就可以。虽然很多人不理解他们的做法,但这家公司始终坚持自己的观点,认为这样的服务最能让科学家将时间从捣腾仪器设备的工作中解放出来,专心放在生物学和假说验证上。从这几年CG公司取得的成绩来看,这种做法确实是有效的。2009年,CG公司宣布其测出了第一个人类基因序列,并移交给美国生物科技信息中心数据库。同一年,他们在《科学》上刊文,发布了三个完整人类基因组序列分析的结果,当时文章还宣布,测序的成本已经可以降到1726美元。这在生物界引起了轰动。到了那一年结束,他们已经做出了50个人的基因序列。此外,他们的名字也随着来自各地的科学家一起多次登上了权威学术杂志。除了去年帮助科学家解开了米勒综合征突变难题给科学界留下难忘的印象之外,美国的罗氏公司还曾经借助CG的基因组测序技术,完成了人类科学史上第一例肺癌患者的全基因组比较。相关研究结果刊登在《自然》杂志上。而美国癌症学会也开始和CG公司联手,希望通过其服务比较正常人和癌细胞基因组序列的差异。或许在不久的将来,解开癌症之谜的第一个贡献就属于这些蓝光照耀下的机器人。

  • 互联网+全球采购”:Zber引领中国企业“眼睛向内降低成本”

    降本增效,是中国企业的普遍面临的痛点和难题。 中央政府提出“降本增效”后,各地政府给出了“降低用工、用能成本和物流成本、用地成本、融资成本、税费负担、制度性交易成本和创新创业成本”等诸多措施。降成本,政府责无旁贷,但是降成本的核心,还在企业内部。但是如何实现“眼睛向内降低成本”呢? 作为中德两国总理见证的Zber全球供应链交易协同(B2B)平台给出了一系列案例实践,很好地回答了这个问题。 Zber负责人指出,企业发展无外乎“两端”,一端是销售驱动,重点发力点是市场和销售,获取更多订单和扩大生产规模,然后再扩大到产业链上下游,或者多元化经营,这似乎是中国企业普遍路径;另外一端就是采购驱动,重点发力点是创新和采购供应链,发现市场的痛点和频率进行创新,然后通过“互联网+采购”获得全球最优秀的供应商,并通过供应链的核心——计划性,来降低企业供应链上总成本,最终形成企业自身的竞争优势,这是发达国家的企业常规发展路径。 Zber负责人认为,全球经济快速增长的形势下,中国企业采取“销售驱动”快速扩大和占领市场的做法似乎无可厚非,但是这种“高增长、高成本”的粗放式发展模式难以持久,很容易形成企业缺乏核心竞争力的后遗症,尤其是当全球经济处于持续低迷的局势下,“销售驱动”的发展模式就变得难以为继,需要转变思想从“采购端”发力,“眼睛向内”降低企业供应链总成本,练好内功,迎接全球制造业的新一轮挑战。Zber供应链中心负责人告诉记者说:Zber易竞价的产品属性是“互联网+降本增效”,其原理是利用全球最顶级的采购平台工具和相应的竞价策略制定,通过多轮在线竞价将企业采购成本降下来,所有竞价过程完全实现数字化和阳光化。易竞价1.0产品是4月1日推出的,4月10日即收到第一单来自东北沈阳的“易竞价”订单,4月16日又收到第二个来自南京的“易竞价”订单,截至5月10日共收到21个“易竞价”订单,竞价采购金额达到38367万元,目前已经完成交付12个“易竞价”订单,在原有采购历史价格的基础上平均节省18.3%,“互联网+降本增效”十分明显。随后,Zber供应链中心负责人现场随机向记者抽取了几个实战案例(基于商业秘密保护隐去企业名称)。首单“互联网+降本增效”的采购商是沈阳一家空气源热泵机组的研发、生产新能源企业,采购品类是“循环水泵”,有7种规格,用量1700台/年,原有供应商数量1家,原有采购痛点是“供应商资源少,采购成本高,供应商竞争不充分,内部协调差”等,本次“互联网+降本增效”整个实施周期共计15天,包括寻找新的供应商、供应商培训和竞价策略制定等,在线竞价时间总计18分钟,竞价策略是“供应商开发+线上逆向竞标”,平台新开发竞价供应商4家,最后“互联网+降本增效”结果是7种规格品类平均降价比例14.69%,最高降价比例22.5%。第二单“互联网+降本增效”的采购商是来自江苏的一家生产经编机、数控机床、高端纺织品的高新技术企业,采购品类为轴承、减速机、紧固件等,原有供应商数量3家,原有采购痛点是“供应商竞争不充分,采购周期较长,单笔订量少议价难”,本次“互联网+降本增效”竞价策略是“线上逆向竞标+同型号半年用量+总价竞标”,整个实施周期共计12天,最后“互联网+降本增效”结果是平均降低成本比例14.45%,最高降本比例59.3%。Zber供应链中心负责人告诉记者说,SAP Ariba是全球最大采购平台,覆盖全球192个国家和地区,全球2000强的76%在该平台上完成采购,2016年交易额实现1.3万亿美元,拥有300万家全球优质供应商,平台可以实现采购寻源、采购执行和采购协同全流程数字化管理,Zber作为SAP Ariba全球供应链(BPO)战略授权合作伙伴,创造全新的“互联网+降本增效”本土化服务模式,可以帮助中国企业在全球维度下实现“眼睛向内降低成本”。

  • 海勒heller1826MKV系列SMT回流焊-低成本高回报的最佳选择

    海勒heller1826MKV系列SMT回流焊-低成本高回报的最佳选择

    [b]低成本高回报[/b]海勒1809/1826Mark5系列SMT回流焊系统以其出色的性能和卓越的节能特点,为客户带来了低成本和高回报。利用海勒独有的平衡流加热器模块(BFM)技术,氮气运行成本可降低多达50%!同时,采用LOW KW功能将耗电量降低了40%。这项创新技术使得我们的客户每年可以节省总计$ 15,000-$ 18,000 的氮气和电力成本。此外,全新的Mark III系统还实现了行业内蕞快的投资回报率(ROI),每年可节省总计$ 22,000-$ 40,000。[img=,690,460]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2023/07/202307101441310736_2312_5802683_3.jpg!w690x460.jpg[/img][b]HELLER Mark5 回流焊机管理软件介绍Heller 的独家专有能源管理软件:[/b]Heller 独有专利的能源管理软件在不同批量生产状态下优化能源消耗。不论是进行全裁生产、半载生产还是设备闲置时,通过设定程序实现蕞大程度上减少能源消耗。[b]一步到位的 Profiling 软件:[/b]我们与合作伙伴 KIC 公司共同开发了这款软件,它能根据 PCB 板的长、宽和厚度快速完成 PROFILE 的设置。通过动态图形结构展示的 PROFILE 和数据,轻松解决焊接回流工艺中的难题。[b]SMT 焊接回流炉绿色制造解决方案[/b]MK7 回流焊炉在设计时充分考虑了绿色制造。所有 MK7 SMT 回流焊炉都具有低高度顶壳和双重绝缘设计,可降低生产过程中的能源和氮气使用量多达15%。智能能源管理软件进一步降低能源成本,通过在低容量时智能地将设备置于待机模式。此外,统一的气体管理系统还实现了“净流量”的消除,并减少整体氮气消耗量。如果您正在寻找以蕞优质性价比提供出色性能和节约运营成本的SMT回流焊设备,就选择海勒1809/1826MKV系列SMT回流焊系统吧!无论是借助我们创新的能源管理软件和 Profiling 软件,还是享受绿色制造解决方案带来的环保和节能优势,您都将获得低成本和高回报的蕞佳选择。[b]苏州仁恩机电科技有限公司[/b]的制造设备在汽车、医疗、3C、航天、军工、电力等电子行业广泛应用,heller回流焊由于其卓越的技术和优质的品质备受好评。

  • DNA测序问题大汇总

    以下问题是我摘抄的,当时记在我的记录本上,所以没有记下名字,很是抱歉。但是我想拿出来这是对大家的一种共享,所以祈求大家原谅。Q:我将PCR产物纯化后送测,结果说是双模板,测序峰重叠,请问是模板不纯吗?A:应该指的是模板不纯。可能是割胶纯化时,范围偏大,非目的基因片断亦混入其中。该非目的片断的大小与目的片断也类似。如果片断长度大的话,可以先连一下克隆载体,这样测序应该没有问题。 测序峰重叠不知道你讲的时双峰类型的还是指比较杂乱的而且无序的重叠: 如果是双峰(TP),有可能是标本来源是杂合子的缘故,如果是后者,原因很多,一般看打印出的测许结果大致可以判断。原因:1。有时候PCR产物可能就是失败的产物或者浓度很低。2.提纯不好,非目的片段保留。3.测序时Matrix等条件的错误。Q:测序结果不好,测序峰比较乱,基线不平,测许公司说含有复杂结构,现急需要该序列,请问高手这种情况该怎么办?有什么测许方法?A;我自己曾经亲自做过测序,对于这种情况,一般是有解决的方法的。不过公司不愿意为了你自己的一个样品去专门摸索条件。1. 最大可能是提取的质粒不纯,可以将质粒再次转化后挑单克隆重做(很奏效)。2. 直接在测序前的模板热变性使用86度,5分钟而不是大多数的96度3分钟3. 实在不行切后分别放到T载体上,一般都可以保证顺利读出序列。最后值得一提的是如果能自己根据理论序列给设计几个比较合理的测序引物可能一切就OK了。Q:上星期将我的PCR纯化产物拿到TAKARA测序,结果今天公司打电话来说测了100多个bp就读不下去了,建议我克隆后再测,我的PCR产物纯化只有很亮的一条带,不知道为什么测不出来。答:测不下去的原因主要是序列里面有困难序列,二级结构或短序列重复,比如发卡结构和AT长重复等,甲基化的影响不大清楚,本人认为不会影响测序。所以,PCR产物测不下去的话,克隆后也很难保证测过去。其实就测序来说,PCR产物还是质粒都无所谓,只要样品纯可以了。正向测不通反向再测也可能会测通,因为DNA中正链和反链二级结构不是完全一样的,正链中遇到困难序列在反链中可能相对简单,测序酶可能可以急需合成DNA。另外,还可以改一下测序PCR的反映条件等等,也可以测通。

  • 关于测序电泳槽???

    各位大神: 最近有个朋友跟我提到了一个测序电泳槽,想问问各位大神什么事测序电泳槽啊?它的工作原理是怎么样的,电泳基本知识我知道,但测序电泳它是如何实现测序和微卫星分析等等功能的?

  • 低价转让基因测序仪

    公司现有1台ABI3100 测序仪,成色较新,价格优惠,质量保证,可预约试机。电话:13717963569自动化程度高:提供连续,无监控的操作,自动灌胶,上样,电泳分离,检测及数据分析,可连续运行24小时无需人工干预。样品分析量大:可同时对16个样品进行全自动分析,一天可完成数百个样品的测序或片段分析工作先进的荧光检测系统:采光栅分光,CCD摄像机成像技术,实现多色荧光同时检测应用广泛:除了新基因测序或比较测序工作外,可进行多种片段分析,包括微卫星DNA分析,比较基因型分析,单核苷酸多态性(SNP)研究

  • 奶粉再曝黄曲霉毒素M1超标,迪马SPE法助您实现快速、低成本检测

    7月20日,广州市工商局在官网公布了近期对市面上乳制品及含乳食品的抽检结果。由湖南长沙亚华乳业有限公司生产的南山奶粉问题最为严重,5个批次的婴幼儿奶粉均检出含有黄曲霉毒素M1。值得注意的是,知名品牌光明奶油、本土沙湾姜汁撞奶均在不合格之列,爱馨多洋奶粉更是两月三登“黑榜”。 目前检测黄曲霉毒素的方法通常为免疫亲和层析净化高效液相色谱法和酶联免疫吸附法(ELISA)这两种方法。酶联免疫吸附法(ELISA)操作简单,快速,但灵敏度低且会出现假阳性,需使用免疫亲和柱法进行精确定性、定量,而免疫亲和柱又存在使用繁琐、价格昂贵、储存条件苛刻、保存期短等缺点。 针对上述问题,迪马科技最新开发出新型、快速、低成本的ProElutTM固相萃取方法。该方法可实现与免疫亲和柱法相当的高精度回收率结果,但使用成本却大大降低。ProElutTM固相萃取法单个样品的检测成本为免疫亲和柱法的1/4,酶联免疫法的1/2,同时ProElutTM固相萃取法简单易操作、不需要专用的大型设备、对操作人员要求不高,特别适用于各种食品生产企业及检测机构,将大大降低黄曲霉毒素的检测成本。 以下为使用ProElutTM固相萃取柱开发的黄曲霉毒素M1的检测方案,供您参考!

  • 测序结果的分析

    测序都是从5'端进行的,正向和反向测序是指对DNA的两条互补链分别测序,通常两个方向测序结果经校读后完全一致才能认为得到可靠结果。生工测序结果一般都提供两个文档,一个是TEXT的序列文档,一个是用Chromas软件打开的ABI文档。1.寻找引物http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 比对,去除引物序列,找到目的片段。在DNAMan上进行比对,看引物能不能比对上(一个不变,一个反向互补),如果比不上,那可能就不是你要的序列,如果能比上,上游以引物第一个为分界线,去除前面的;下有一最后一个为分界线,去除后面的,剩下的就是目的序列。然后在NCBI上Blast.就OK了。批注:PCR产物进行测序的结果可能不包含引物序列2.将找到的对应目的片段转成*.txt格式3.下载BioEdit软件第一:打开Bioedit软件,导入拼接好的样品序列与标准亚型参考序列File—New Alignment—Sequence—New Sequence—导入拼接好的样品序列和标准参考序列(从TEXT文档利用复制粘贴工具)—Apply and close —保存结果—关闭窗口第二:点击菜单栏上按钮“Accessory Application”,选择“Clustalw Multiple Alignment”File—Open—Accessory Application—Clustalw Multiple Alignment第三:比对结束后,删除比对序列两端的多余序列,使所有序列等长选择需要编辑的序列—Sequence—Edit Sequence—进行序列的编辑—保存修改后结果第四:选择“Sequence”菜单下的“Gaps”,点击“Lock Gaps”第五:将比对后的序列保存为Fasta 格式文档4.下载MAGE4.0软件1) 打开MEGA软件,选择“File”菜单栏中的“Convert To MEGA Format”,把序列文件的格式转换为meg文档保存;2) 双击序列的meg文档,选择“Nucleotide Sequences”,点击“OK”;3) 程序运行中询问是否为蛋白编码序列,选择“NO”;4) 在MEGA操作界面选择“Phylogeny”菜单栏下“Bootstrap Test of Phylogeny”中的“Neibour-Joining”;5) 选择“Test of Phylogeny”栏中的“Bootsrap”,“Replications”设定为1 000;在“Options Summary”栏中的“Model”项中,设定参数为“Kimura 2-Paramete”r,最后选择“Compute”;6) 将分析结果采用Los Alamos HIV序列库提供的HIV-BLAST和Subtyping工具进行验证。

  • Heller 1809和1826MKV系列SMT回流焊:低成本高回报

    Heller 1809和1826MKV系列SMT回流焊:低成本高回报

    [b]拥有成本大幅降低的海勒1809/1826MKV系列SMT回流焊[/b]Heller 1809/1826Mark V系列SMT回流焊系统采用平衡流加热器模块(BFM)技术,使氮气运行成本降低了多达50%。同时,通过LOW KW功能,耗电量也减少了40%。这意味着我们的客户每年可以节省$15,000至$18,000的氮气和电力成本。[b]蕞优投资回报率[/b]全新的Mark III系统可实现业界蕞快ROI(投资回报率),每年总共可节省$22,000至$40,000。[img=,690,466]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2023/06/202306051509116482_871_5802683_3.jpg!w690x466.jpg[/img][b]HELLER mk5手册特点优势1.消除空洞效果显著:[/b]在真空情况下,只需15秒即可将总空洞面积控制在小于1%。[b]2.高效助焊剂回收系统:[/b]避免助焊剂残留在炉膛内,并具备不停机保养功能。[b]3.特殊防助焊剂凝结设计:[/b]真空模组内管道、球阀和蝶阀以及于式真空泵均可加热,保持高温,防止助焊剂凝结。[b]功率器件封装行业无空隙方案介绍1.对无空隙的需求:[/b]电力电子趋向更小的外形尺寸,同时保持或增加整体功率要求。为了满足当今更严格的可靠性标准,需要使用无空隙的焊接点和连接。[b]2.解决方案:[/b]压缩机制造商已经推出新型设备来实现这一目标。例如,采用直接铜键合技术可以消除传统间隔垫并充分利用散热表面。此外,在高压应用中还可以使用金属氧化物半导体场效晶体管(MOSFET)芯片上下两端之间没有任何间隔的“裸片”键合技术。总之,Heller 1809/1826MKV系列SMT回流焊系统是一种低成本高回报的选择。而对于需要无空隙方案的客户来说,压缩机制造商正在推出新型设备来满足这一需求。[b]仁恩机电科技有限公司[/b]是一家位于苏州的半导体设备供应商,在行业内拥有多年的丰富经验和技术积累。除了高端半导体设备,我们还提供其他电子制造相关设备的集成供应服务,让您在一站式采购过程中省去繁琐的对接环节。

  • DNA测序仪原理和方法

    DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括Sanger双脱氧链终止法和Maxam-Gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今DNA序列分析的主流。美国PE ABI公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等DNA测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最多的一种型号。本实验介绍的是ABI PRISM 310型DNA测序仪的测序原理和操作规程。【原理】ABI PRISM 310型基因分析仪(即DNA测序仪),采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司专利的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法),因此通过单引物PCR测序反应,生成的PCR产物则是相差1个碱基的3'''端为4种不同荧光染料的单链DNA混合物,使得四种荧光染料的测序PCR产物可在一根毛细管内电泳,从而避免了泳道间迁移率差异的影响,大大提高了测序的精确度。由于分子大小不同,在毛细管电泳中的迁移率也不同,当其通过毛细管读数窗口段时,激光检测器窗口中的CCD(charge-coupled device)摄影机检测器就可对荧光分子逐个进行检测,激发的荧光经光栅分光,以区分代表不同碱基信息的不同颜色的荧光,并在CCD摄影机上同步成像,分析软件可自动将不同荧光转变为DNA序列,从而达到DNA测序的目的。分析结果能以凝胶电泳图谱、荧光吸收峰图或碱基排列顺序等多种形式输出。它是一台能自动灌胶、自动进样、自动数据收集分析等全自动电脑控制的测定DNA片段的碱基顺序或大小和定量的高档精密仪器。PE公司还提供凝胶高分子聚合物,包括DNA测序胶(POP 6)和GeneScan胶(POP 4)。这些凝胶颗粒孔径均一,避免了配胶条件不一致对测序精度的影响。它主要由毛细管电泳装置、Macintosh电脑、彩色打印机和电泳等附件组成。电脑中则包括资料收集,分析和仪器运行等软件。它使用最新的CCD摄影机检测器,使DNA测序缩短至2.5h,PCR片段大小分析和定量分析为10~40min。由于该仪器具有DNA测序,PCR片段大小分析和定量分析等功能,因此可进行DNA测序、杂合子分析、单链构象多态性分析(SSCP)、微卫星序列分析、长片段PCR、RT-PCR(定量PCR)等分析,临床上可除进行常规DNA测序外,还可进行单核苷酸多态性(SNP)分析、基因突变检测、HLA配型、法医学上的亲子和个体鉴定、微生物与病毒的分型与鉴定等。【试剂与器材】1.BigDye测序反应试剂盒 主要试剂是BigDye Mix,内含PE专利四色荧光标记的ddNTP和普通dNTP,AmpliTaq DNA polymerase FS,反应缓冲液等。  2.pGEM-3Zf(+)双链DNA对照模板0.2g/L,试剂盒配套试剂。  3.M13(-21)引物TGTAAAACGACGGCCAGT,3.2μmol/L,即3.2pmol/μl,试剂盒配套试剂。  4.DNA测序模板 可以是PCR产物、单链DNA和质粒DNA等。模板浓度应调整在PCR反应时取量1μl为宜。本实验测定的质粒DNA,浓度为0.2g/L,即200ng/μl。  5.引物 需根据所要测定的DNA片段设计正向或反向引物,配制成3.2μmol/L,即3.2pmol/μl。如重组质粒中含通用引物序列也可用通用引物,如M13(-21)引物,T7引物等。  6.灭菌去离子水或三蒸水。  7.0.2ml或和0.5ml的PCR管,盖体分离,PE公司产品。  8.3mol/L 醋酸钠(pH5.2)称取40.8g NaAc·3H2O溶于70ml蒸馏水中,冰醋酸调pH至5.2,定容至100ml,高压灭菌后分装。  9.70%乙醇和无水乙醇。  10.NaAc/乙醇混合液 取37.5ml无水乙醇和2.5ml 3mol/L NaAc混匀,室温可保存1年。  11.POP 6测序胶 ABI产品。  12.模板抑制试剂(TSR)ABI产品。  13.10×电泳缓冲液 ABI产品。  14.ABI PRISM 310型全自动DNA测序仪。  15.2400型或9600型PCR仪。  16.台式冷冻高速离心机。  17.台式高速离心机或袖珍离心机。

  • 科普之基因测序原理讨论

    基因测序的基本原理是边合成边测序。在Sanger等测序方法的基础上,通过技术创新,用不同颜色的荧光标记四种不同的dNTP,当DNA聚合酶合成互补链时,每添加一种dNTP就会释放出不同的荧光,根据捕捉的荧光信号并经过特定的计算机软件处理,从而获得待测DNA的序列信息。

  • 【资料】自动多肽/蛋白质测序仪

    Edman降解法是测定蛋白质序列的经典方法,该方法由瑞士生物化学家佩尔维克托于1950年创立。Edman降解法通常是以周期的形式来表征。对于一个完整的周期,异硫氰酸苯酯标记上指定肽段的N末端,环化,之后被标记的氨基酸在酸性条件下从肽链中游离出来,进一步酸化后形成一个更加稳定的乙内酰苯硫脲-氨基酸(PTH-AA)衍生物。PTH-AA衍生物可以通过高效液相色谱鉴定。埃德曼降解周期就是通过反复地将多肽的氨基酸依次降解下来,从而鉴定氨基酸序列。  1982年,美国应用生物系统(ABI)公司了将第一台商用自动多肽测序仪推向市场,并被实践证明是可靠和耐用的。实际上,在过去几十年中,自动多肽测序仪只有屈指可数的一些改进,但此类自动肽测序仪仍是测定肽序列的黄金标准。然而,串联质谱的使用已经成为日益重要的肽序列测定工具。质谱,特别是串联飞行时间(TOF-TOF 和QTOF)质谱仪可以对少量样本进行更快速的分析。  与质谱相比,自动Edman降解测序的明显优势在于:已被化学验证的精确性、系统初始投资较小 然而,它的缺点是:分析时间较长、测得序列数有限,典型的测量长度范围是20~50个氨基酸序列。而对于低丰度的肽、无法获得N末端的肽,或者需要更短的分析时间,质谱则是理想的工具。但是,质谱价格高且无法区分同分异构的氨基酸。  虽然美国应用生物系统(ABI)公司主导了自动多肽测序仪的市场,但由于市场疲软,ABI于2008年6月停止生产自动多肽测序仪。然而岛津公司看准了机会,在2009年匹兹堡会议上将其PPSQ自动多肽测序仪推向北美市场,PPSQ已在日本广泛应用超过20年。另一方面,对用质谱测定蛋白质序列的方法改进的需求保持旺盛,布鲁克道尔顿公司最近推出了Edmass Micro MALDI-TOF和 Edmass Ultra TOF-TOF 系统,这是专门为没有质谱使用经验的多肽化学家们设计的。  自动多肽测序仪的市场主要来自于科研机构,但过去几年中自动多肽测序仪的市场需求增长处于某种停滞状态,尤其是质谱变得容易获得。但是,随着肽自动测序仪在连续使用过程中的老化,Edamn化学家们正在准备购买新设备。售后服务、附件、耗材及试剂有望在短期内对自动多肽测序仪市场产生推动作用。

  • 新型、快速、低成本SPE法检测黄曲霉毒素B1、B2、G1、G2、M1

    新型、快速、低成本SPE法检测黄曲霉毒素B1、B2、G1、G2、M1

    2011年岁末,国家质检总局公布了液体乳产品质量国家监督抽查结果,蒙牛乳业(眉山)有限公司和福建长富乳品有限公司各1个批次产品中黄曲霉毒素M1超标,引发公众广泛关注。一时间,黄曲霉毒素的检测成为当务之急,各个检测机构加班加点检测各种可能出现黄曲霉毒素超标的产品;各个色谱产品,消耗品供应商纷纷发布相关的解决方案,忙的不亦乐乎http://simg.instrument.com.cn/bbs/images/brow/em09501.gif根据国标的规定:黄曲霉毒素的检测通常使用免疫亲和层析净化高效液相色谱法和酶联免疫吸附法(ELISA)这两种方法。估计这一事件让免疫亲和柱的供应商着实忙到下订单到手软。http://simg.instrument.com.cn/bbs/images/brow/em09502.gif回过头来我们来说说这两种黄曲霉毒素检测国标方法,酶联免疫吸附法(ELISA)操作简单,快速,但灵敏度低且会出现假阳性,需使用免疫亲和柱法进行精确定性、定量,而免疫亲和柱又存在使用繁琐、价格昂贵、储存条件苛刻、保存期短等缺点。如何找到一种既快速,简便,又低成本的检测方案成为我们技术部各位精英的努力方向。2012年初,刚刚从新年的欢乐气氛中抽离出来,迪马技术部即投入到开发新的固相萃取法检测黄曲霉毒素的攻关任务中,经过几个昼夜的努力,ProElut SPE法检测黄曲霉毒素M1及黄曲霉毒素B1、B2、G1、G2、M1的解决方案精彩呈现。迪马科技当然也不会忘记一直关心支持这我们的广大版友,这不我放下手头的其他事情,第一时间将这新鲜出炉的新型、快速、低成本SPE法检测黄曲霉毒素的解决方案与大家分享,算是一份稍晚的新年礼物吧。该方法可实现与免疫亲和柱法相当的高精度回收率结果,但使用成本却大大降低。ProElutTM固相萃取法单个样品的检测成本为免疫亲和柱法的1/4,酶联免疫法的1/2,同时ProElutTM固相萃取法简单易操作、不需要专用的大型设备、对操作人员要求不高,特别适用于各种食品生产企业及检测机构,将大大降低黄曲霉毒素的检测成本。还请大家笑纳呀http://simg.instrument.com.cn/bbs/images/brow/em09511.gif乳制品中黄曲霉毒素B1、B2、G1、G2、M1的检测1 适用范围 适用于牛奶、奶粉等乳制品中黄曲霉毒素B1、B2、G1、G2、M1的检测。2 样品准备/提取2.1 牛奶、原料乳等液态奶制品(1) 称取2 g样品,加入2 mL乙腈,涡旋混合1 min;(2) 再加入4 mL乙腈,涡旋混合1 min,4000rpm,离心5 min;(3) 取上清液4 mL,作为上样液待净化。2.2 奶粉等固体奶制品(1) 称取2 g样品,加入5mL[font=

  • 英开发出简化的基因组测序新方法

    无需进行文库制备,所用DNA样本比标准方法更少2012年12月13日 来源: 中国科技网 作者: 陈丹 中国科技网讯 据物理学家组织网12月12日(北京时间)报道,英国研究人员简化了基因组测序的标准流程,首次无需进行文库制备便完成了DNA(脱氧核糖核酸)单分子测序,而且新方法只要很少量的DNA就能获得序列数据,用量可低至不到1纳克(10亿分之一克),仅为常规测序方法的500分之一到600分之一。 文库制备是指从测序前基因组样本中提取不同长度的DNA片段,这一过程不仅费力、费时,还会浪费DNA,而新技术能极大地减少DNA的损耗,并缩短测序时间。 该研究论文的第一作者、英国威康信托基金会桑格研究所的保罗·库普兰说:“我们用这种方法对病毒和细菌的基因组测序后发现,即使在相对较低的水平,我们也能够确定所检测的是何种有机物,不论样本中是否存在特定的基因或质粒(这对于确定抗生素耐药性很重要),或者其他信息,如对特定DNA碱基的修改等。”他表示,一旦技术得到优化,将在快速、高效地识别医院和其他医疗场所中的细菌和病毒方面具有很大的应用潜力。 研究小组利用第三代单分子测序系统PacBio RS演示了这种简化的直接测序方法。他们仅仅用800皮克(千分之一纳克)DNA来分析一个生物体的基因组,尽管测序仪只读取了基因组的70个序列片段,相对于常规测序方法获得的数据来说不过是很小的一部分,但这些信息足以让研究人员确定他们所检测的生物体的品种。 这项技术也使得科学家能够对此前无法识别的宏基因组(也称微生物环境基因组)样本中的生物体进行确认。“为微生物测序,首先需要能够在实验室中培养它们。”论文的主要作者、英国巴布拉汉研究所的塔米尔·钱德拉说,“这不仅耗费时间,而且有时候微生物不生长,为它们的基因组测序极其困难。”他表示,新方法可以直接对微生物测序,短时间内便可确定其“身份”。 论文的另一主要作者、威康信托基金会桑格研究所的哈罗德·斯维尔德洛说:“我们的技术可以在对所测序列没有任何先验知识、没有特定微生物试剂的条件下,在很短的时间内操作,这是一种很有前途的替代手段,可应用于控制感染等临床需要。”(记者陈丹) 总编辑圈点 长久以来,基因测序等围绕基因科学所展开的研究,都被人们贴上了从本源上解开人体生命奥秘、彻底解除遗传疾病威胁等殷切的标签。多国为提高社会健康水平,都开展了解码国民DNA的活动,有些甚至覆盖全基因组。然而,面对由30亿个碱基对构成的人类基因组,精确测序注定将是一场浩大而又漫长的工程。如何能快速、准确地将海量DNA数据转化为有帮助的实用信息,已经成为该领域科学家们面临的重大挑战之一。因而我们说,英国科学家此番取得的突破,不管是从整个学科研究的方法论层面,还是从临床应用的角度,都提高了基因研究服务于人类的速度。 《科技日报》(2012-12-13 一版)

  • DNA测序的准确性

    请问DNA测序的准确性有多高呢?如果一个样品两次的测序结果不同该怎么办?

  • 微生物基因组测序的应用

    基因组测序和序列的组装,为快速研究该致病菌株的致病机理创造了条件。与此同时华大基因与德国汉堡-Eppendorf医疗中心合作,也宣布完成了对致病菌株的测序工作。Guenther说:"在有限的时间里完成了对微生物的全基因组测序,极大的方便了研究者从一个整体的水平上去研究微生物,进而揭示在这些目标微生物的基因组究竟发生了哪些改变。"事实上也的确如此,科学家根据从基因组测序的数据所获得的证据,将本次的致病型大肠杆菌鉴定为致病型大肠杆菌的一个新杂交品种,并且携带了一些抗性基因。"从宏观的基因组水平上来研究这类细菌,将在很大程度上革新我们对传染病暴发的认识,3-4天内完成对某种微生物的全基因组测序及基因标注,将会开启一个新的研究领域。"在新奥尔良召开的美国微生物学会年度会议上,一些研究者指出,分子鉴定的方法正被用来打造基因组传染病学这一领域,基因组传染病学致力于重构传染病暴发的过程,以求在将来能够对传染病能进行实时有效的监控和快速反应。

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