蛋白质芯片

HuProtTM人类蛋白质组芯片，涵盖~20,000个人重组蛋白质，是迄今为止通量最高的人类蛋白质组芯片，为蛋白质组学研究提供了强大的工具。该芯片已经在各个蛋白质组学和其他生命科学研究领域得到广泛的应用，如癌症及自身免疫疾病的生物标志物的发现、蛋白-蛋白相互作用研究、翻译后修饰、酶学研究等。 作为蛋白质芯片技术的鼻祖和人类蛋白质组芯片的开发者，朱衡教授已在该领域发表近100篇研究论文，被引用次数累计近10,000次，单篇被引次数2,000次。 朱衡教授现为美国约翰霍普金斯大学医学院药理系终身教授，是世界上蛋白质芯片技术的主要创始人之一（详见论文 Science,2001, 293: 2101-2105), 也是HuProtTM人蛋白质组芯片的开发者，在蛋白质芯片技术和应用领域有着举足轻重的地位。朱衡教授目前主要的研究领域是利用蛋白质芯片技术研究疾病相关蛋白的细胞信号转导/网络及其它延伸领域。朱衡教授在美国作为项目负责人现主持美国国立卫生研究院(NIH) R01课题多项，2007年获得美国 Smith Welcome Trust 杰出科学家奖，在Cell、Nature、PNAS 等国际顶尖杂志发表了近100篇研究论文。 仪器信息网 网络讲堂 特邀 朱衡教授将于2015年4月17日 10:00 通过网络会议形式在线讲解&ldquo 蛋白质芯片技术&rdquo 。本次网络会议中朱衡教授将围绕人类蛋白质组芯片的开发过程、技术要点和应用前景展开讲述，并深入探讨如何利用蛋白质组芯片来进行蛋白质组学的研究。 本次会议采取在线自助报名形式，通过资格审核的用户可免费参会。报名地址如下： http://www.instrument.com.cn/webinar/meeting/meetingInsidePage/1397

p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " 药品标准直接关乎药品质量，它是从源头上控制药品的安全性，有效性及质量可靠性的尺度。随着生物技术药物的发展，生物制品安全问题也越来越引起人们的重视。目前经批准的生物技术药物主要为重组蛋白质药物与单克隆抗体，该类药物的开发已成为当今生物技术及制药工业中最为活跃的领域之一，显示出巨大的社会效益和经济效益。但由于该类药物的结构复杂，用量很小，且生物体内有大量相似物质的干扰，其为质量控制和检测增加了难度。它需要应用生物化学、免疫学、微生物学和分子生物学等多门学科的理论和技术，进行综合性监测分析和评价，确保生物技术药物的安全有效性。而微流控芯片的研究和发展给蛋白质药物质控开拓了新的思路。 /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 微流控是一个快速发展的跨学科领域，融合贯穿了物理、化学、生物医学和微系统工程学科等。所谓“微流控芯片”，又称芯片实验室（Lab-on-a-Chip），是指把生物和化学领域中所涉及的样品制备、生物与化学反应、分离检测等基本操作单位集成或基于一块几平方里面的芯片上，用以完成不同的生物或化学反应过程，并对其产物进行分析的一种技术。其最大特点是在一个芯片上可以形成多功能集成体系和数目众多的复合体系的微全分析系统。结合不同分析检测手段（如：光学检测法、电化学检测法以及质谱检测法等），对样品进行快速、准确、高通量以及多维度分析。它不仅使生物样品于试剂的消耗降低至纳升甚至皮升级，而且使分析速度大大提高，分析费用大大降低。充分体现了当今分析设备微型化、集成化和便携化的发展趋势。 /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 随着蛋白质药物研究的发展，对产品进行质量控制也趋于自动化和微型化，实时快速地对产品进行分析测定，为医药、临床病理等蛋白质领域研究提供了强有力的手段。微流控芯片作为一种集成、快速、高效、高通量、试剂用量小的微型实验室，将极大地促进蛋白质药物质控的研究。我们希望能够通过建立相应的微流控芯片平台，针对重组蛋白质药物或单抗药品一些关键质量属性（如：电荷变异体分析、糖基化鉴定、聚集体和片段分析等），通过研制具有溯源性的高准确度测量装置和方法，提高测量结果的准确度和精准度，支撑蛋白质药物的安全性、有效性评价以及服务产业发展。 span style=" text-align: center text-indent: 0em " & nbsp /span /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 550px height: 310px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202011/uepic/968aed89-2fd2-4dd2-8585-b5b54bbc4bad.jpg" title=" 图片12.png" alt=" 图片12.png" width=" 550" height=" 310" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em text-align: center text-indent: 0em " 图1：微流控芯片-质谱联用平台。在芯片上集成不同的功能单元, 分别进行药物灌输、生物/化学反应、样品预富集及ESI-MS在线检测。 /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em text-align: right " （文稿：张炜飞） /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " 2020年11月10-12日，中国计量科学研究院和国际计量局拟联合举办第三届 “药物及诊断试剂研发与质控——测量与标准，质量与安全（TD-MSQS 2020）” 国际研讨会，以期进一步促进该领域的学术交流和技术发展，提升企业的研发水平和产品质量。本次会议将在南京市政府的支持下，在江苏省南京市举行。 /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " 本次会议可通过官方网站http://tdmsqs.ncrm.org.cn注册或扫描二维码注册，注册成功后请填写参会回执发送至会议邮箱pptd@nim.ac.cn。 /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " & nbsp /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202011/uepic/8750474c-7644-477e-be6c-8cc21824717b.jpg" title=" 11.jpg" alt=" 11.jpg" / /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " 欢迎各位专家、同仁报名参会！ /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " 更多信息请关注会议官方网站：http://tdmsqs.ncrm.org.cn。 /p

瑞士，Mä nnedorf，2013年2月21日&ndash 亚利桑那州立大学(ASU)生物设计研究所-弗吉尼亚皮蓬个体化诊断中心(the Virginia G. Piper Center) 的研究人员从Tecan公司购买了一台 HS 4800&trade Pro 全自动原位杂交工作站和两台 PowerScanner&trade 生物芯片扫描仪来处理蛋白质芯片。该中心主任Joshua LaBaer博士提到，&ldquo 我们采用独特的功能蛋白质组技术，可以将合成蛋白质的基因打印到载玻片上并添加无细胞提取物来原位合成蛋白质。准确地说，在我们测试前一小时蛋白质才被合成出来。&rdquo Joshua LaBaer博士继续说道，&ldquo 我们最近购买的Tecan仪器可以进行高负荷运转，HS 4800 Pro全自动原位杂交工作站可全天候自动运行，单程序完成蛋白质在载玻片上的原位合成、洗脱、甚至孵育等步骤， 无需人工干预。该仪器还具有高度的可重复性；我们在不同的时间进行相同的芯片分析可以得到完全一致的结果。另外，PowerScanner扫描仪也是必不可少的，它具有先进的光学性能，可以为我们提供清晰的信号。需要重复处理大批量样本时， PowerScanner 扫描仪的自动装卸样本功能，可以为我们省去极其枯燥的手工添加、移除样本工作。&rdquo Joshua LaBaer博士总结说：&ldquo 上述这些仪器都是当前市场最先进的仪器。以PowerScanner扫描仪为例，它所具有的自动装卸样本功能、图片以及软件的集成系统是无可比拟的，其他公司的设备远远达不到这个水平。&rdquo 欲了解更多Tecan生物芯片产品更多信息，请点击 www.tecan.com/microarray。 该中心的主要成员，前排(从左到右)：Josh LaBaer博士和Ji Qiu博士，后排（从左到右）：Mike Gaskin, Mitch Magee博士和 Alex Mendoza 更多详情，欢迎您联系： 帝肯（上海）贸易有限公司 Libby Zhu Tel: 021 2206 3206 / 010 8511 7823 Fax:021 2206 5260 / 010 8511 8461 infotecancn@tecan.com www.tecan.com 关于帝肯 瑞士Tecan是全球领先的生命科学与生物制药、法医和临床诊断领域自动化及解决方案供应商。公司成立于1980年，总部设在瑞士Mä nnedorf，分别在瑞士、北美和奥地利设有自己的研发和生产基地，目前公司主要经营的产品有三大类：全自动化液体处理平台 ( Liquid Handling & Robotics )、多功能酶标仪(Multimode Reader)和OEM组件。销售服务网络遍布世界52个国家，客户覆盖制药企业、生物技术公司、科研院所、法医、医院、血站系统和疾病控制中心(CDC)等。其液体处理技术已拥有行业经验32年，在全球处于领先地位，备受世界领先生命科学实验室的青睐。作为原始设备制造商(OEM)，Tecan同样在OEM设备和组件开发和生产方面占有世界领先地位。2011年，Tecan创造了3.77亿瑞士法郎（即4.24亿美元；或3.06亿欧元）的销售业绩。Tecan集团的注册股票在瑞士证券交易所交易 (TK: TECN/Reuters: TECZn.S/ ISIN: 12100191)。欲了解更多信息，请浏览公司网站：www.tecan.com。 关于帝肯中国 瑞士Tecan于2004年在北京开设代表处，正式进驻中国市场。2008年4月在上海浦东成立帝肯（上海）贸易有限公司， 作为Tecan集团在亚太地区（日本及韩国除外）总部，全面负责Tecan集团在中国的所有商业活动，包括销售、市场活动与合作、以及客户支持。帝肯（上海）目前拥有一支专业的售前和售后服务团队，在科研、制药、公安刑侦、医院、血站、CDC和CIQ领域构建了良好的经销和售后服务网络，并以&ldquo 力求比客户期望做的更好&rdquo 的服务理念，给广大的终端用户提供专业的服务。我们致力于成为包括客户在内的所有合作方的首选合作伙伴(Partner of Choice)。 欲了解更多信息，请浏览公司网站：www.tecan.cn。

arrayjet advance生产服务为客户提高芯片产量的同时减少样品消耗 ultra marathon ii 在美国巴尔的摩安装后，客户对仪器非常满意。ultra marathon ii 加上jetmax 环境控制系统，实现在极低的温度下进行点样。 案例cdi实验室是一家美国蛋白质组学公司，之前采用低通量接触式的针式点样平台。他们经历了频繁的生产延误，产量降低，批间差异大，样品损失等问题。他们缺少生产高通量、高质量的蛋白芯片的技术平台。随着需求的不断增加，cdi面临有效商业化他们的产品，降低不断上升的设备维修费用的压力。 arrayjet adance 芯片点样服务arrayjet的 adance 芯片点样服务起始于2011年，非常有效的支持了cdi公司的项目。这种直接面向客户的芯片服务，客户可以直接得到arrayjet 总部75年的全面的生物芯片经验的支持，来实现他们的蛋白芯片的技术优化，转让和商业化。 实验优化人类蛋白库中的一部分人类蛋白通过arrayjet公司的ultra marathonii飞行喷墨式生物芯片点样平台点到环氧硅烷（图2）和硝酸纤维素膜上，整个点样环境通过jetmax环境控制系统控制在4°c。通过测试各种点样体积来优化最后的每个点的样品体积。14个微矩阵重复中，样品点圆形形态合格率大于99%。采用该微矩阵获得预期的表达图谱。 图2: 在环氧硅烷芯片上进行试验优化 批量点样更多来自cdi人类蛋白库的蛋白样品被点到200张环氧硅烷和硝酸纤维素玻片上，来进一步分析点样的重复性点样形态（图3）。arrayjet 的jetguard 确保在长时间点样过程中最少的样品蒸发。 图3：从人类蛋白库中纯化的一个小组的蛋白样品被点到200块相同的grace bio-lab path 硝酸纤维素膜上。 高密度点样通过功能学蛋白实验确认，我们成功的进行从针点到arrayje飞行喷墨式点样的方法学转移。我们进一步评估了ultra marathon ii飞行喷墨式点样平台进行高密度点样的能力。cdi 人类蛋白库的样品进行一个高密度的六边形矩阵喷点，来评估在不同点样基质上，芯片内和芯片间点样的重复性，以及背景信号。结果显示，芯片具有出非常好的矩阵，没有点的重叠。 全人类蛋白组芯片制备超过19000个gst融合蛋白从cdi 人类蛋白质库中纯化出来，并被重复的喷点到500张芯片上，每个点200pl 的样品 (图4)。实验成功的标准如下：?97%的样品需要被点到芯片上?圆形点数量90%?芯片内和芯片间的cv通过方法学的成功转移，cdi 公司目前能生产全球最大的人类蛋白组芯片，一个批次能生产100张3.1 版本的huprot 芯片。采购ultra marathon ii飞行喷墨式点样平台让cdi能够制备蛋白组芯片和其他客户定制的芯片。通过这些芯片，客户能使用最小量的临床样品进行上万种蛋白的分子相互作用检测。arrayjet advance芯片服务和非接触压电式点样技术显著的提高大规模、高质量的蛋白芯片生产效率。环境控制单元不仅仅保证了完美的样品点形态和矩阵，同时保护了蛋白的天然构象，最终证保实验结果的一致性。 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------“cdi 采购ultra marathon ii 飞行喷墨式点样平台用于研发和生产huprot 蛋白芯片和杂交瘤细胞筛选项目的特定芯片。cdi正在计划在不远的将来，采用该新技术平台制备单克隆抗体芯片和膜蛋白芯片。 我们选择arrayjet 是因为我们需要实现通量5倍的提升，而且最好是一台仪器来实现这个目标。arrayjet的高科技，精确和用户友好的设计是一个明显的优势。 另一个arrayjet 公司结构的优势在于，他还通过arrayjet advance 提供内部芯片服务。我们可以通过数个月，多个项目的测试，来再次加深我们对该平台的信任, 这个平台可以在多个方面提升我们目前运营。” dr. ignacio pino, ceo, cdi laboratories“ arrayjet 的jetspyder 样品进样装置有效的减少了蛋白样品间任何的交叉污染，我们的蛋白芯片的质量有了显著的提高。此前，我们一个批次仅仅能生产150片质量合格的芯片，这个通量不能满足规模生产和目前以及未来增长的需求。arrayjet的技术平台能够快速高效的制备1000张芯片的特点对我们有很大的吸引力。”dr. heng zhu, professor, johns hopkins school of medicine

概念蛋白质芯片技术是在ＤＮＡ芯片技术基础上发展的一项蛋白质组学技术。其原理是将大量不同的蛋白质分子（如酶、抗原、抗体、受体、配体、细胞因子等）通过微阵列的形式有序排列在固相载体表面，利用蛋白质与蛋白质或者蛋白质与其他分子之间的特异性结合，获得与之特异性结合的待测蛋白（如血清、血浆、淋巴、间质液、尿液、渗出液、细胞溶解液、分泌液等）的相关信息，便于我们分析未知蛋白的组分、序列，体内表达水平、生物学功能、与其他分子的相互调控关系、药物筛选、药物靶位的选择等。蛋白质芯片技术的出现，为我们提供了一种比传统的凝胶电泳、Western blot和Elisa更为方便和快速研究蛋白质的方法。该方法具有高通量，微型化和快速平行分析等优点，不仅对基础分子生物学的研究产生重要影响，也在临床诊断、疗效分析、药物筛选及新药研发等领域有着广泛应用。特点①蛋白芯片具有高特异性、重复性、准确性。这是由抗原抗体之间、蛋白与配体之间的特异性结合决定的。②蛋白芯片具有高通量和操作自动化的特点，在一次实验中可对上千种目标蛋白同时进行检测，效率极高。③可发现低丰度、小分子量蛋白质，并能测定疏水蛋白质，特别是膜蛋白质。④蛋白芯片具有高灵敏性，只需0.5-5μL样品，或2000个细胞即可检测。蛋白芯片技术在分子生物学及生物化学基础研究中的应用01 在蛋白质水平上检测基因的表达由于基因转录产物mRNA数量并不能准确反映基因的翻译产物蛋白质的质与量，因此在蛋白质水平上检测基因的表达对于了解基因的功能非常重要。蛋白质芯片技术产生前，蛋白质双向电泳技术是蛋白质组规模上进行蛋白质表达研究的唯一方法，但这种技术操作繁琐而且难以快速检测样品中成百上千种蛋白质的表达变化。蛋白质芯片的特异性、灵敏性和高通量等特点，在检测基因表达终产物蛋白质谱的构成及变化中发挥着不可替代的作用。02 高通量筛选抗原/抗体相互作用目前蛋白质芯片检测利用最广泛的生物分子相互作用是抗原抗体的特异性识别和结合，单克隆抗体是蛋白质芯片检测中使用最广泛的生物分子。运用蛋白质芯片可以研究不同抗原/抗体的特异性作用，而且对于检测样品中极微量的抗原/抗体分子作用非常有利。03 蛋白质/蛋白质相互作用分析酵母双杂交系统是近年来基因组规模上研究蛋白质相互作用的主要方法，但存在体内操作、假阳性、假阴性和外源蛋白质折叠、修饰等局限。蛋白质芯片技术不依靠任何生物有机体而在体外直接检测目标蛋白质，实验条件可随意控制，同时实验步骤自动化程度高，一次分析的蛋白质数量巨大，因而成为目前除酵母双杂交系统外进行大规模研究蛋白质相互作用的主要方法。04 酶/底物作用分析耶鲁大学的Snyder小组用蛋白芯片对酵母基因组编码的119种蛋白激酶的底物专一性进行了研究。实验中将蛋白激酶表达为谷胱甘肽转移酶（GST）融合蛋白，针对17种不同的底物，平行测定了119种GST2蛋白激酶融合蛋白的底物专一性，发现了许多新的酶活性，大量蛋白激酶可以对酪氨酸进行磷酸化，而这些激酶在催化区域附近有共同的氨基酸残基。也证明了蛋白质芯片可作为高通量筛选酶-底物作用的良好平台。蛋白芯片的检测目前蛋白芯片的检测主要有两种方式。一种是以质谱技术为基础的直接检测法，采用表面增强激光解析离子化-飞行时间质谱技术，用激光解析电离的方法将保留在芯片上的蛋白质解离出来。具体过程为：芯片经室温干燥后，加能量吸附因子如芥子酸，使其与蛋白质结合成混合晶体，以促进蛋白质在飞行时间质谱检测中的解析和离子化，利用激光脉冲辐射使芯池中的分析物解析成荷电粒子，根据不同质荷比离子在仪器场中的飞行时间长短不一，通过飞行时间质谱来精确地测定出蛋白质的质量，并由此绘制出一张质谱来，以分析蛋白质的分子量和相对含量。另一种为蛋白质标记法，样品中的蛋白质预先用荧光染料或同位素等标记，结合到芯片上的蛋白质就会发出特定的信号，用CCD照相技术及荧光扫描系统等对激发的荧光信号进行检测。与飞行时间质谱相比，该方法定量更加准确，操作也更加简便。与DNA芯片一样，蛋白质芯片同样蕴含着丰富的信息量，必须利用专门的计算机软件进行图像分析、结果定量和解释。其中应用最广的是荧光染料标记法，原理较为简单、使用安全、灵敏度高，且有很好的分辨率。可直接用广州博鹭腾 GelView 6000Plus进行拍摄。图1.GelView 6000Plus智能图像工作站GelView 6000Plus 配备600万像素科学级制冷CCD相机，制冷温度为环境温度下 55℃，极低的暗电流，很大程度降低背景干扰。而且独有的红外感应开关，自动控制样品台的开启与关闭，同时也减少了实验时对仪器的污染。

根据MarketsandMarkets发布的新的市场研究报告，2017年全球蛋白质组学市场将增加到172亿美元。尽管当前的经济气候不佳，但复合年增长率相当于14.2%。 　　该报告共504页,分为三个部分，包括四个地区：美国、欧洲、亚洲和世界其他地区。仪器技术部分包括蛋白质微阵列、光谱、x射线结晶学、色谱法、电泳、表面等离子体共振系统、蛋白质分离系统；试剂部分包括芯片、光谱、x射线结晶学、色谱法、电泳、免疫、微球、蛋白质分离试剂；最后一部分是服务，包括分析实验室服务和数据分析与维护。 　　该报告还包括了一个市场概述、地理分析、本领域21个公司的简介。蛋白质组学领域主要公司有Thermo Fisher, Agilent, Life Tech, Sigma-Aldrich, Danaher, Waters, Roche, Bio-Rad and Luminex。

1．蛋白质组学研究的研究意义和背景 随着人类基因组计划的实施和推进，生命科学研究已进入了后基因组时代。在这个时代，生命科学的主要研究对象是功能基因组学，包括结构基因组研究和蛋白质组研究等。尽管现在已有多个物种的基因组被测序，但在这些基因组中通常有一半以上基因的功能是未知的。目前功能基因组中所采用的策略，如基因芯片、基因表达序列分析(Serial analysis of gene expression, SAGE)等，都是从细胞中mRNA的角度来考虑的，其前提是细胞中mRNA的水平反映了蛋白质表达的水平。但事实并不完全如此，从DNA mRNA 蛋白质，存在三个层次的调控，即转录水平调控(Transcriptional control )，翻译水平调控(Translational control)，翻译后水平调控(Post-translational control )。从mRNA角度考虑，实际上仅包括了转录水平调控，并不能全面代表蛋白质表达水平。实验也证明，组织中mRNA丰度与蛋白质丰度的相关性并不好，尤其对于低丰度蛋白质来说，相关性更差。更重要的是，蛋白质复杂的翻译后修饰、蛋白质的亚细胞定位或迁移、蛋白质－蛋白质相互作用等则几乎无法从mRNA水平来判断。毋庸置疑，蛋白质是生理功能的执行者，是生命现象的直接体现者，对蛋白质结构和功能的研究将直接阐明生命在生理或病理条件下的变化机制。蛋白质本身的存在形式和活动规律，如翻译后修饰、蛋白质间相互作用以及蛋白质构象等问题，仍依赖于直接对蛋白质的研究来解决。虽然蛋白质的可变性和多样性等特殊性质导致了蛋白质研究技术远远比核酸技术要复杂和困难得多，但正是这些特性参与和影响着整个生命过程。 传统的对单个蛋白质进行研究的方式已无法满足后基因组时代的要求。这是因为：(1) 生命现象的发生往往是多因素影响的，必然涉及到多个蛋白质。(2) 多个蛋白质的参与是交织成网络的，或平行发生，或呈级联因果。(3) 在执行生理功能时蛋白质的表现是多样的、动态的，并不象基因组那样基本固定不变。因此要对生命的复杂活动有全面和深入的认识，必然要在整体、动态、网络的水平上对蛋白质进行研究。因此在上世纪90年代中期，国际上产生了一门新兴学科－蛋白质组学（Proteomics），它是以细胞内全部蛋白质的存在及其活动方式为研究对象。可以说蛋白质组研究的开展不仅是生命科学研究进入后基因组时代的里程碑，也是后基因组时代生命科学研究的核心内容之一。 虽然第一次提出蛋白质组概念是在1994年，但相关研究可以追溯到上世纪90年代中期甚至更早，尤其是80年代初，在基因组计划提出之前，就有人提出过类似的蛋白质组计划，当时称为Human Protein Index计划，旨在分析细胞内的所有蛋白质。但由于种种原因，这一计划被搁浅。90年代初期，各种技术已比较成熟，在这样的背景下，经过各国科学家的讨论，才提出蛋白质组这一概念。 国际上蛋白质组研究进展十分迅速，不论基础理论还是技术方法，都在不断进步和完善。相当多种细胞的蛋白质组数据库已经建立，相应的国际互联网站也层出不穷。1996年，澳大利亚建立了世界上第一个蛋白质组研究中心：Australia Proteome Analysis Facility ( APAF )。丹麦、加拿大、日本也先后成立了蛋白质组研究中心。在美国，各大药厂和公司在巨大财力的支持下，也纷纷加入蛋白质组的研究阵容。去年在瑞士成立的GeneProt公司，是由以蛋白质组数据库“SWISSPROT” 著称的蛋白质组研究人员成立的，以应用蛋白质组技术开发新药物靶标为目的，建立了配备有上百台质谱仪的高通量技术平台。而当年提出Human Protein Index 的美国科学家Normsn G. Anderson也成立了类似的蛋白质组学公司，继续其多年未实现的梦想。2001年4月，在美国成立了国际人类蛋白质组研究组织（Human Proteome Organization, HUPO）,随后欧洲、亚太地区都成立了区域性蛋白质组研究组织，试图通过合作的方式，融合各方面的力量，完成人类蛋白质组计划（Human Proteome Project）。2．蛋白质组学研究的策略和范围 蛋白质组学一经出现，就有两种研究策略。一种可称为“竭泽法”，即采用高通量的蛋白质组研究技术分析生物体内尽可能多乃至接近所有的蛋白质，这种观点从大规模、系统性的角度来看待蛋白质组学，也更符合蛋白质组学的本质。但是，由于蛋白质表达随空间和时间不断变化，要分析生物体内所有的蛋白质是一个难以实现的目标。另一种策略可称为“功能法”，即研究不同时期细胞蛋白质组成的变化，如蛋白质在不同环境下的差异表达，以发现有差异的蛋白质种类为主要目标。这种观点更倾向于把蛋白质组学作为研究生命现象的手段和方法。 早期蛋白质组学的研究范围主要是指蛋白质的表达模式（Expression profile）, 随着学科的发展，蛋白质组学的研究范围也在不断完善和扩充。蛋白质翻译后修饰研究已成为蛋白质组研究中的重要部分和巨大挑战。蛋白质-蛋白质相互作用的研究也已被纳入蛋白质组学的研究范畴。而蛋白质高级结构的解析即传统的结构生物学，虽也有人试图将其纳入蛋白质组学研究范围，但目前仍独树一帜。3．蛋白质组学研究技术 可以说，蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否，很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基（20/ 4）, 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰，如磷酸化和糖基化等，给分离和分析蛋白质带来很多困难。此外，通过表达载体进行蛋白质的体外扩增和纯化也并非易事，从而难以制备大量的蛋白质。蛋白质组学的兴起对技术有了新的需求和挑战。蛋白质组的研究实质上是在细胞水平上对蛋白质进行大规模的平行分离和分析，往往要同时处理成千上万种蛋白质。因此，发展高通量、高灵敏度、高准确性的研究技术平台是现在乃至相当一段时间内蛋白质组学研究中的主要任务。当前在国际蛋白质组研究技术平台的技术基础和发展趋势有以下几个方面：3.1 蛋白质组研究中的样品制备 通常可采用细胞或组织中的全蛋白质组分进行蛋白质组分析。也可以进行样品预分级，即采用各种方法将细胞或组织中的全体蛋白质分成几部分，分别进行蛋白质组研究。样品预分级的主要方法包括根据蛋白质溶解性和蛋白质在细胞中不同的细胞器定位进行分级，如专门分离出细胞核、线粒体或高尔基体等细胞器的蛋白质成分。样品预分级不仅可以提高低丰度蛋白质的上样量和检测，还可以针对某一细胞器的蛋白质组进行研究。 对临床组织样本进行研究，寻找疾病标记，是蛋白质组研究的重要方向之一。但临床样本都是各种细胞或组织混杂，而且状态不一。如肿瘤组织中，发生癌变的往往是上皮类细胞，而这类细胞在肿瘤中总是与血管、基质细胞等混杂。所以，常规采用的癌和癌旁组织或肿瘤与正常组织进行差异比较，实际上是多种细胞甚至组织蛋白质组混合物的比较。而蛋白质组研究需要的通常是单一的细胞类型。最近在组织水平上的蛋白质组样品制备方面也有新的进展，如采用激光捕获微解剖(Laser Capture Microdissection, LCM) 方法分离癌变上皮类细胞。3.2 蛋白质组研究中的样品分离和分析 利用蛋白质的等电点和分子量通过双向凝胶电泳的方法将各种蛋白质区分开来是一种很有效的手段。它在蛋白质组分离技术中起到了关键作用。如何提高双向凝胶电泳的分离容量、灵敏度和分辨率以及对蛋白质差异表达的准确检测是目前双向凝胶电泳技术发展的关键问题。国外的主要趋势有第一维电泳采用窄pH梯度胶分离以及开发与双向凝胶电泳相结合的高灵敏度蛋白质染色技术，如新型的荧光染色技术。 质谱技术是目前蛋白质组研究中发展最快，也最具活力和潜力的技术。它通过测定蛋白质的质量来判别蛋白质的种类。当前蛋白质组研究的核心技术就是双向凝胶电泳－质谱技术，即通过双向凝胶电泳将蛋白质分离，然后利用质谱对蛋白质逐一进行鉴定。对于蛋白质鉴定而言，高通量、高灵敏度和高精度是三个关键指标。一般的质谱技术难以将三者合一，而最近发展的质谱技术可以同时达到以上三个要求，从而实现对蛋白质准确和大规模的鉴定。3.3 蛋白质组研究的新技术 做过双向凝胶电泳的人一定会抱怨它的繁琐、不稳定和低灵敏度等缺点。发展可替代或补充双向凝胶电泳的新方法已成为蛋白质组研究技术最主要的目标。目前，二维色谱 (2D-LC)、二维毛细管电泳 (2D-CE)、液相色谱－毛细管电泳 (LC-CE) 等新型分离技术都有补充和取代双向凝胶电泳之势。另一种策略则是以质谱技术为核心，开发质谱鸟枪法(Shot-gun)、毛细管电泳-质谱联用 (CE-MS)等新策略直接鉴定全蛋白质组混合酶解产物。随着对大规模蛋白质相互作用研究的重视，发展高通量和高精度的蛋白质相互作用检测技术也被科学家所关注。此外，蛋白质芯片的发展也十分迅速，并已经在临床诊断中得到应用。3.4 蛋白质组生物信息学 蛋白质组数据库是蛋白质组研究水平的标志和基础。瑞士的SWISS-PROT拥有目前世界上最大，种类最多的蛋白质组数据库。丹麦、英国、美国等也都建立了各具特色的蛋白质组数据库。生物信息学的发展已给蛋白质组研究提供了更方便有效的计算机分析软件；特别值得注意的是蛋白质质谱鉴定软件和算法发展迅速，如SWISS-PROT、Rockefeller大学、UCSF等都有自主的搜索软件和数据管理系统。最近发展的质谱数据直接搜寻基因组数据库使得质谱数据可直接进行基因注释、判断复杂的拼接方式。随着基因组学的迅速推进，会给蛋白质组研究提供更多更全的数据库。另外，对肽序列标记的从头测序软件也十分引人注目。4． 蛋白质组学发展趋势 在基础研究方面，近两年来蛋白质组研究技术已被应用到各种生命科学领域，如细胞生物学、神经生物学等。在研究对象上，覆盖了原核微生物、真核微生物、植物和动物等范围，涉及到各种重要的生物学现象，如信号转导、细胞分化、蛋白质折叠等等。在未来的发展中，蛋白质组学的研究领域将更加广泛。 在应用研究方面，蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标最有效的方法之一。在对癌症、早老性痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治疗方面蛋白质组技术也有十分诱人的前景，目前国际上许多大型药物公司正投入大量的人力和物力进行蛋白质组学方面的应用性研究。 在技术发展方面，蛋白质组学的研究方法将出现多种技术并存，各有优势和局限的特点，而难以象基因组研究一样形成比较一致的方法。除了发展新方法外，更强调各种方法间的整合和互补，以适应不同蛋白质的不同特征。另外，蛋白质组学与其它学科的交叉也将日益显著和重要，这种交叉是新技术新方法的活水之源，特别是，蛋白质组学与其它大规模科学如基因组学，生物信息学等领域的交叉，所呈现出的系统生物学（System Biology）研究模式，将成为未来生命科学最令人激动的新前沿。

几种不同折叠模式的蛋白质模型(图片来源Protein Data Bank Japan ) 　　上个世纪初，科学家们认为蛋白质是生命体的遗传物质，而具有独特的作用。随着这个理论被证伪，真正的遗传物质DNA的结构被给予了很大关注。然而，蛋白质作为生命体的重要大分子，其重要性也从未被忽视，而且在1950年代开始，科学家一直在探寻DNA序列和蛋白质序列的相关性。与此同时，蛋白质测序和结构解析蛋白质结构的努力开始慢慢获得回报。更多的生化研究揭示了蛋白质的功能重要性，因此蛋白质的三维结构的解析对于深入理解蛋白质功能和生理现象起着决定性作用。 　　本文简要回顾了蛋白质结构解析的重大历史事件，并总结了蛋白质结构解析的常用方法和结构分析方向。通过了解蛋白质结构，能够让我们更好地理解生物体的蛋白的理化特性，以及其相关联的化学反应途径及其机制，对于我们认识生物世界和研发治疗方法和药物都起着关键作用。在即将召开的2015高分辨率成像与生物医学应用研讨会上，各位专家学者将会进一步讨论相关议题。 　　蛋白质结构解析六十年来大事件 　　在1958年，英国科学家John Kendrew和Max Perutz首先发表了用X射线衍射得到的高分辨率的肌红蛋白Myoglobin的三维结构，然后是更加复杂的血红蛋白Hemoglobin。因此，这两个科学家分享了1962年的诺贝尔化学奖。事实上，这项工作在早在1937年就开始了。 　　然后在1960年代，蛋白质结构解析方法不断进步，获得了更高的解析精度。这个时期，蛋白质序列和DNA序列间关系也被发现，中心法则被Francis Crick提出，然后科学界见证了分子生物学的崛起。分子生物学(Molecular Biology)的名称在1962年开始被广泛接受和使用，并逐渐演变出一些支派，如结构生物学。然后在1964年，Aaron Klug提出了一种基于X射线衍射原理发展而来的全新的方法电子晶体学显微镜(crystallographic electron microscopy )，可以解析更大蛋白质或者蛋白质核酸复合体结构。因为这项研究，他获得了1982诺贝尔化学奖。1969年，Benno P. Schoenborn 提出可以用中子散射和原子核散射来确定大分子中固定位置的氢原子坐标。 　　进入1970年代，很多新的方法开始发展。存储蛋白质三维结构的Protein Data Bank(1971年) 开始出现，这对于规范化和积累蛋白质数据有着重要意义。1975年新的一种仪器叫做多丝区域检测器，让X-ray的检测和数据收集更加快速高效。次年，Robert Langride将X-ray衍射数据可视化，并在加州大学圣地亚哥分校成立了一个计算机图形实验室。同年，KeithHodgson和同事首次证明了可以使用同步加速器获得的X射线并对单个晶体进行照射，并取得了很好的实验效果。然后在1978年，核磁共振NMR首次被用于蛋白质结构的解析 同年首个高精度病毒(西红柿丛矮病毒)衣壳蛋白结构被解析。 　　在1980年代，更多蛋白质结构被解析，蛋白质三维结构的描述越来越成熟，而且蛋白质结构解析也被公认成为药物研发的关键步骤。在1983年，冷冻蚀刻的烟草花叶病毒结构在电子显微镜结构下得到描述。两年后德国科学家John Deisenhofer等解析出了细菌光合反应中心，因此他们共享了1988年的诺贝尔化学奖。次年，两个课题组解析了HIV与复制相关的蛋白酶结构，对针对HIV的药物研发提供了理论基础。 　　下一个十年，因为大量同步加速器辅助的X射线衍射的使用，数千个蛋白质结构得到解析，迎来了蛋白质结构组的曙光。1990年多波长反常散射方法(MAD)方法用于X射线衍射晶体成像，与同步辐射加速器一起，成为了近二十多年来的最常用的的方法。Rod MacKinnon在199年发表了第一个高精度的钾离子通道蛋白结构，对加深神经科学的理解起了重要作用，因此他分享了2003年的诺贝尔化学奖。Ada Yonath等领导的课题组在1999年首次解析了核糖体结构(一种巨大的RNA蛋白质复合体)。　　进入新千年，更多的技术细节被加入到蛋白质解析研究领域。2001年，Roger Kornberg和同事们描述了第一个高精度的RNA聚合酶三维结构，正因此五年后他们共享了诺贝尔化学奖。2007年，首个G蛋白偶联受体结构的解析更是对药物研究带了新的希望。近些年来，越来越多的大的蛋白质结构得到解析。Cryo-EM超低温电子显微镜成像用于超大蛋白质结构成像的研究日益成熟，并开始广泛用于蛋白质结构的解析。 　　蛋白质结构解析的常用实验方法 　　1.X-ray衍射晶体学成像 　　X射线衍射晶体学是最早用于结构解析的实验方法之一。X射线是一种高能短波长的电磁波(本质上属于光子束)，被德国科学家伦琴发现，故又被称为伦琴射线。理论和实验都证明了，当X射线打击在分子晶体颗粒上的时候，X射线会发生衍射效应，通过探测器收集这些衍射信号，可以了解晶体中电子密度的分布，再据此析获得粒子的位置信息。利用这种特点，布拉格父子研制出了X射线分光计并测定了一些盐晶体的结构和金刚石结构。首个DNA结构的解析便是利用X射线衍射晶体学获得的。 　　后来，获得X射线来源的技术得到了改进，如今更多地使用同步辐射的X射线源。来自同步辐射的X射线源可以调节射线的波长和很高的亮度，结合多波长反常散射技术，可以获得更高精度的晶体结构数据，也成为了当今主流的X射线晶体成像学方法。由X射线衍射晶体学解析的结构在RCSB Protein Data Bank中占到了88%。 　　X射线衍射成像虽然得到了长足的发展，仍然有着一定的缺点。X射线对晶体样本有着很大的损伤，因此常用低温液氮环境来保护生物大分子晶体，但是这种情况下的晶体周围环境非常恶劣，可能会对晶体产生不良影响。而且，X射线衍射方法不能用来解析较大的蛋白质。 　　上海同步辐射加速器外景(图片来源 上海同步辐射光源网站) 　　2.NMR核磁共振成像 　　核磁共振成像NMR全称Nuclear magnetic resonance，最早在1938被Isidor Rabi (1946年诺贝尔奖)描述，在上世纪的后半叶得到了长足发展。其基本理论是，带有孤对电子的原子核(自选量子数为1)在外界磁场影响下，会导致原子核的能级发生塞曼分裂，吸收并释放电磁辐射，即产生共振频谱。这种共振电磁辐射的频率与所处磁场强度成一定比例。利用这种特性，通过分析特定原子释放的电磁辐射结合外加磁场分别，可以用于生物大分子的成像或者其他领域的成像。有些时候，NMR也可以结合其他的实验方法，比如液相色谱或者质谱等。 　　RCSB Protein Data Bank数据库中存在大约11000个用NMR解析的生物大分子结构，占到总数大约10%的结构。NMR结构解析多是在溶液状态下的蛋白质结构，一般认为比起晶体结构能够描述生物大分子在细胞内真实结构。而且，NMR结构解析能够获得氢原子的结构位置。然而，NMR也并非万能，有时候也会因为蛋白质在溶液中结构不稳定能难得获取稳定的信号，因此，往往借助计算机建模或者其他方法完善结构解析流程。 　　使用NMR解析的血红蛋白结构建模(图片来源RCSB PDB) 　　3.Cryo-EM超低温电子显微镜成像 　　电子显微镜最早出现在1931年，从设计之初就是为了试图获得高分辨率的病毒图像。通过电子束打击样本获得电子的反射而获取样本的图像。而图像的分辨率与电子束的速度和入射角度相关。通过加速的电子束照射特殊处理过的样品表明，电子束反射，并被探测器接收，并成像从而获得图像信息。具体做法是，将样品迅速至于超低温(液氮环境)下并固定在很薄的乙烷(或者水中)，并置于样品池，在电子显微镜下成像。图像获得后，通过分析图像中数量众多的同一种蛋白质在不同角度的形状，进行多次的计算机建模从而可以获得近原子级别的精度(最低可以到2.0埃)。 　　Cyro-EM解析TRPV1离子通道蛋白(图片来源Structure of the TRPV1 ion channel ) 　　将电子显微镜和计算机建模成像结合在一起的大量实践还是在新世纪之后开始流行的。随着捕捉电子的探测器技术(CCD技术，以及后来的高精度电子捕捉、电子计数electron counting设备)的提升，更多的信息和更低的噪音保证了高分辨率的图像。 　　近些年来，Cryo-EM被用来解析很多结构非常大(无法用X-ray解析)的蛋白质(或者蛋白质复合体)，取得了非常好的结果。同时，单电子捕捉技术取代之前的光电转换成像的CCD摄像设备，减少了图像中的噪音和信号衰减，同时并增强了信号。计算机成像技术的成熟和进步，也赋予了Cryo-EM更多的进步空间。然而，Cyro-EM与X-ray不同，该方法不需要蛋白质成为晶体，相同的是都需要低温环境来减少粒子束对样品的损害。 　　除去介绍的这三种方法以外，计算机建模技术也越来越多地被用在了蛋白质结构解析中。而且新解析的结构也会提高计算机建模的精确度。未来，我们或许能够用计算机构建原子级别的细胞模型，构建在芯片上的细胞。 　　蛋白质结构对了解生命体的生化反应、有针对性的药物研发有着重要意义。从1958到如今已经接近60年，蛋白质结构解析得到了较快的发展。然而，在如今DNA测序如此高效廉价的时代，蛋白质和DNA结构解析并没有进入真正高速发展阶段，这也导致了在如此多的DNA序列数据非常的今天，结构数据却相对少的可怜。大数据时代的基因组、蛋白质组、代谢组、脂类组等飞速发展的时候，蛋白质结构组也得到了更加广泛的重视。发展高精度、高效的结构解析技术也一直都有着重要意义。未来，蛋白质结构解析，对针对蛋白质的药物筛选，和计算机辅助的药物研究研究不应被低估。未来说不定在蛋白质结构领域有着更多惊喜，让我们拭目以待。 第一届电镜网络会议部分视频回放

继人类基因组计划（HGP）之后，以蛋白质组学为核心的组学技术正成为生命科学和生物医学研究的核心驱动力。随着质谱技术的飞速发展，蛋白质组学的研究边界不断拓展，在药物开发、临床医学、转化医学等研究中展现出巨大潜力。 然而，传统的蛋白质组学实验流程复杂，特别是在样品前处理阶段，人工操作不仅耗时耗力，还容易引入人为误差，影响样品的稳定性和实验的重现性。为了应对这一挑战，AI 与自动化技术的结合为蛋白组学研究带来了新的解决方案。为了探讨这一领域的最新进展与应用实践，Opentrons 联合仪器信息网将于 7 月 31 日 14:00-15:30 举办“AI 自动化移液技术揭开蛋白质组学研究新篇章”线上研讨会。√ 重塑研究范式，提升效率与精度√ 智能优化，解锁复杂样本分析√ 推动跨学科融合，开启创新之门 会议日程时间报告题目嘉宾报告摘要14:00蛋白质组学样品制备技术及发展趋势胡水旺南方医科大学 高级实验师蛋白质组学技术已经成为系统生物学时代最常用的研究工具之一。最常用的技术平台包括双向电泳、高效液相色谱和质谱。但是蛋白质样品制备是蛋白质组学研究的第一步，也是最关键的步骤，很容易被忽视。本报告主要围绕蛋白质组学样品制备技术及发展趋势展开话题，希望能为正在或将要开展蛋白质组学研究的同仁带来帮助。14:30人工智能移液工作站在高效蛋白组学实验中的创新实践与应用文梃棡合创生物工程(深圳)有限公司 大中华区应用科学家人工智能移液工作站在高效蛋白组学实验中的创新实践与应用15:05微量与空间蛋白组学新技术及其应用申华莉复旦大学 研究员单细胞水平 DNA 和 RNA 高通量测序结果表明，细胞的分子异质性比我们想象的更复杂和多样。本报告主要介绍我们团队近年来发展的一系列针对微量细胞和组织样本蛋白组学的新方法新技术，包括适用于微量样品的一体化快速蛋白酶解方法 SMID 技术、微量样品磷酸化蛋白组学技术 mini-Phos，用于快速酶解的 MOSF 技术、以及适用于单细胞样本蛋白组学分析的 SMID-MOSF 技术等。我们应用这些方法对阿尔茨海默症、睡眠-觉醒障碍等生物医学问题进行了深入探讨。2轮抽奖，3重大礼包：智能手环、保温杯、杜邦手提袋

大家好，本周为大家分享一篇发表在Analytical Chemistry上的文章，Microfluidic Platform for Time-Resolved Characterization of Protein Higher-Order Structures and Dynamics Using Top-Down Mass Spectrometry [1]，文章的通讯作者是北京大学生物医学前沿创新中心的王冠博教授和中国科学院深圳先进技术研究院的门涌帆副研究员。　　蛋白质的高阶结构和动力学特性对理解蛋白质的生物学功能和揭示其潜在机制至关重要。自顶向下质谱法(Top-down MS)在完整蛋白水平和肽段碎片水平都能获得结构信息。非变性Top-down MS可以分析蛋白质复合体的结构以及完成亚基鉴定和修饰分析。自顶向下氢/氘交换质谱(Top-down HDX MS)为构象或结合界面分析提供了高空间分辨率，并实现了构象特异性表征。微流控芯片可以为这些质谱工作流程的前端反应提供优越的平台。然而，目前大多数质谱微芯片装置是为Bottom-up或Top-down蛋白质组学设计的。本文中，作者提出了一种用于蛋白质高阶结构和动态Top-down MS分析的芯片设计策略。它适用于时间分辨的非变性质谱和HDX质谱，该设计旨在有效电离完整的蛋白质复合物，灵活控制多种反应物流动，并在较大的流速范围内精确控制反应时间在亚微升/分钟。本文通过对单克隆抗体、抗体-抗原复合物和共存蛋白构象等体系的分析来验证该装置的性能。　　TDK-MS(Top-down and kinetic MS)芯片的结构如图1A所示，该方法可以有效电离完整的蛋白质，包括单克隆抗体(mAb)和抗体-抗原复合物(图1 B, C)。　　图1. 完整蛋白质和蛋白质复合体在非变性条件下的高效电离　　虽然分析蛋白质组合化学计量学和监测构象变化需要保持蛋白质高阶结构和非共价相互作用的完整性，然而为了推导结构信息或在串联MS中展开蛋白质以提高碎裂效率，往往需要不同程度的变性来产生亚复合体，因此变性剂的浓度和变性的时间对变性程度至关重要。本文中，作者采用交错人字微结构(Herringbone microstructure, HM)(图2A, B)，并对其性能进行了评估(图2C−E)。如此高的混合效率为进一步微型化芯片混合模块提供了可能。在监测Mb的变性时，作者使用TDK-MS芯片和商用混合三通管平行混合holo-Mb溶液(5 μM)与乙腈(ACN)，并比较它们在混合比例变化时的响应(图2F)。TDK-MS芯片在非变性和变性条件之间切换的快速响应通过NIST mAb的变性得到了证明，在向NIST mAb溶液中添加甲酸后，响应时间小于5分钟(图2G)。　　图2. 高效混合和快速响应的流体控制　　微芯片的灵活通道设计允许引入独立控制的溶液。例如，尽管酸和有机溶剂都能诱导变性，但这两种变性剂同时存在时，对变性途径的影响是不同的。Mb和Hb是血红素蛋白，其中血红素基团分别非共价连接在1条多肽链和4条非共价组装链上，因此这是研究共存复合体解离动力学和亚基构象变化的理想模型。将5 μM holo蛋白溶液与ACN和FA按一定的混合比例依次混合，可以通过解离产物的出现和蛋白质离子电荷态分布的变化来表征复杂的解离和蛋白质的展开。在固定ACN浓度下，随着FA浓度从0.01增加到0.3% (v/v)，依次观察到的主要现象是血红素丢失、apo-Mb展开以及折叠的holo-Mb转化为展开的apo-Mb(图3A)。相比之下，在FA浓度恒定的情况下，当ACN从1增加到50%时，Mb主要表现为血红素损失，只有中等程度的apo-Mb展开，这可能是由于展开的部分迅速聚集(图3B)。　　图3. (A)增加FA浓度，固定ACN浓度和(B)增加ACN浓度，固定FA浓度时获得的Mb和Hb的质谱图。　　在HDX MS检测中，TDK-MS芯片提供了快速和有效的氘代及淬灭，精确控制HDX反应时间，并在2H-标记形式下高效电离完整蛋白质(图4)。　　图4. 2H标记完整的(A)Mb、(B)Hb α亚基和(C)Hb β亚基在不同反应时间下的HDX质谱图　　由于过大的流速不利于电离效率，并且有可能会增加堵塞或流动中断的风险，因此流速应保持在最佳范围内，这又限制了混合通道中HDX时间的可调节范围，从而影响了HDX动力学分析的灵活性。为了解决这一问题，作者设计了一个具有多个不同长度反应通道的混合模块，在不更换芯片的情况下，除了改变流速外，还可以通过通道切换在更大范围内调整反应时间。在原型芯片中，5个不同长度的通道可以在对蛋白质电离和流动稳定性都最优的流速下，产生从几秒到几分钟不等有效的HDX时间(图5)。　　图5. Top-Down HDX MS 分析　　本文中作者开发的策略将有利于生物大分子结构的精细分析，并有助于质谱微芯片的方法开发。

第6届蛋白质组学大会 时间：7月28~30号 地点：江苏泰州 届时德祥将有 瑞士Hamilton、德国POSTNOVA、英国Genevac、美国semba、Glas-Col和 Labcon 参加展会，我们德祥作为主要赞助商之一，将在会上进行POSTNOVA场流分离的专题讲座，同时还有Hamiton公司提供的Robotics工作站样机在展会上展示！ 第六届蛋白质组学大会德祥日程安排 7月28号 会前技术专题讲座 《Postnova场流用于蛋白组学分离的最新技术》 7月29~30号 仪器展会 瑞士Hamilton全自动生化处理工作站 （展位号：23） 背景链接： 蛋白质组学大会由CNHUPO主办，北京蛋白质组研究中心和复旦大学共同承办，代表着中国蛋白质组学研究的最高水平的盛会。汇聚了国内蛋白质组和功能基因组学研究领域的*科学家和研究团队。贺福初、强伯勤、饶子和、汪尔康、王红阳、张玉奎、施蕴渝、陈志南等院士，以及来自中国科学院、军事医学科学院、中国医学科学院、清华大学、北京大学、复旦大学、南开大学、国家基因组研究中心、国家生物芯片研究中心等一大批*科学家和研究团队济济一堂。 应该说此次大会将是国内生化领域新技术及新方法的风向标。

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“蛋白质组”是“一种基因组所表达的全套蛋白质”，或一种生物、一种细胞组织所表达的全套蛋白质。研究表明，生命体的统一性源于基因组，但生命体的多样性、复杂性和功能性则源于蛋白质组。人体绝大多数疾病都是由蛋白质组的变异或被破坏引起的，而药物也大多是通过影响或修复蛋白质组起作用的。因此，人类蛋白质组研究对直接揭示生命活动规律和本质、发现人类重大疾患发生发展规律具有深远的意义。 　　在本次中国蛋白质组学大会上，多位专家、学者围绕“蛋白质组学研究的现状及其进展”的会议主题作了大会报告，着重探讨了“人类蛋白质组计划、疾病蛋白质组学、功能蛋白质组学、药物蛋白质组学、结构蛋白质组学、蛋白质化学、生物信息学、蛋白质修饰和相互作用、抗体相关技术、蛋白质组微分析、蛋白质芯片以及蛋白质组新技术新方法”等研究领域的内容。以下为部分专家在大会上作学术报告： 饶子和院士 南开大学 报告题目：Structural proteomics of important pathogens 贺福初院士 北京蛋白质组研究中心 报告题目：Systematic-omics analysis of HBV-associated hepatocellular carcinoma 王红阳院士 第二军医大学 报告题目：Novel cancer biomarkers and molecular classification: what they could do and what we should do 杨芃原教授 复旦大学 报告题目：Chinese Human Proteome Project—problems and prospective 刘斯奇研究员 中国科学院北京基因组研究所 报告题目：Screening cancer biomarkers in body fluid with antibody-based 丁建平研究员 中国科学院上海生命科学研究院 报告题目：Molecular basis of the high fidelity in protein synthesis 　　除大会报告外，大会还举办了分会(专题)报告和墙报另外两种报告形式，并有Agilent Technologies、Thermo Scientific、Waters、GE Healthcare、Applied Biosystems Trading、Dionex等6家国外知名仪器厂商举办了技术交流会。此外，会议同期还举办了与生物化学与分子生物学、蛋白质组学等研究领域相关的仪器、设备、试剂展览会。 　　分会(专题)报告： 　　中国蛋白质组学大会组委会7月19日和30日在海燕大酒店的不同会议室举分别办了“疾病蛋白质组学、功能蛋白质组学、蛋白质组学支撑技术”为主题的分会，多名国内著名专家、教授作精彩演讲。 疾病蛋白质组学专题会议现场 功能蛋白质组学专题会议现场 蛋白质组学支撑技术专题会议现场 　　大会墙报： 展会两边的大会墙报 　　厂商技术交流会： 6家国外知名仪器厂商的专家在技术交流会上做技术讲解 　　会议同期举办的展会： 展会上的部分展商 　　据了解，中国蛋白质组学大会由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会主办，旨在促进中国蛋白质组学专家和学者的学术交流与合作。该活动每年举行一次，代表着该领域的国内最高水平，已成为本领域及相关交叉学科领域信息交流与科研合作的重要平台。

仪器信息网讯 每年年底，《自然-方法》(Nature Methods)都会对过去一年中推动生物学发展的技术方法做出回顾与总结，由此评选出当年最受瞩目、影响力最大的技术。2012年，定向蛋白质组学技术(targeted proteomics)荣膺《自然-方法》年度生命科学技术。 　　定向蛋白质组学是基于质谱技术快速检测目标蛋白的技术，该技术具有灵敏度高、重复性好的特点。基于质谱的鸟枪蛋白质组学研究是将蛋白质酶解，片段化成肽片段进行质谱分析。 　　在典型的蛋白质分析中，蛋白混合物消化成肽段，并在质谱上进行分析，可以检测到样品中所有蛋白，这种分析工作量极大，而且需要大量资源。对于大多数研究人员来说，他们不需要获得所有蛋白的数据，只是想对少数特定蛋白进行定性定量。 　　定向蛋白质组学方法的建立为广大的研究人员带来了福音，它提供了更高的灵敏度和分析速度，可以在质谱分析中准确鉴定并定量某种蛋白。 　　定向蛋白质组学分析技术并不是非常新的尖端技术，它其实可以追溯到上个世纪60年代出现的放射免疫分析技术。这种技术依赖于抗体试剂和Western blot实验，但定向蛋白组学在最近几年获得了高速发展，在《Nature Methods》整理的2009年最值得关注的技术中，定向蛋白质组学就是其中之一。而在Ruedi Aebersold, Paola Picotti 和 Bernd Bodenmiller 发表的“Proteomics meets the scientific method”文章中，让我们看到了易于操作的定向质谱实验替代繁重的Western blot实验的可能性。 　　在荧光显微镜，流式细胞仪，蛋白质芯片等现代技术中，抗体检测法仍然是非常重要的，但依赖于抗体的蛋白质检测存在着很多缺陷，最大的缺陷就是抗体的可用性和质量差别很大。而进行蛋白质组学研究的另外一种技术便是依赖于质谱，该方法可以特异分析感兴趣的目标蛋白。 　　在最成熟的定向分析技术，即选择反应监控技术(selected reaction monitoring，SRM)中，三重四极杆质谱仪(triple quadrupole)技术能够检测到特定肽段，帮助研究人员高灵敏度，可重复的定量监测这些蛋白。 　　质谱方法比起依赖于抗体检测的优势在于开发出一个新的定向分析方法要比生产一个新的抗体要快得多，并减少了检测特异性的问题。虽然抗体在低丰度蛋白检测的灵敏性方面具有一定优势，但是质谱技术的一个明显优势就是能在一次实验中准确地检测多种蛋白。 　　以质谱为基础的定向蛋白质组学研究已经开展了相当长的时间，在上世纪70年代，三重四极杆质谱仪就已经出现，并在上世纪80年代发表的文章中首次论证了它可以用来检测肽段。在过去的几年间，定向质谱技术的应用范围迅速扩大，质谱为基础的蛋白质组学一直被认为应用过于复杂，但定向质谱实验易于操作，一旦建立了可靠的蛋白分析方法，数据分析就简单的多。 　　尽管Nature Methods主要关注基础生物学的研究方法，但也不能忽视定向质谱方法在临床蛋白质组学研究中的重要性，未来，这种技术必然会在疾病候选生物标记物验证等临床研究方面有更广泛的应用。 撰稿：裴熙详

日前，在第二十届全国色谱学术会议上，中科院院士、中科院大连化物所研究员张玉奎指出，中国的色谱学科队伍已经是世界上最大的，色谱学科论文的数量已有飞跃发展。在蛋白质组学研究中，蛋白质的分离和鉴定依然是目前最基本的任务和目标，“随着蛋白质组学研究的不断深入，蛋白质分离鉴定技术将得到更加广泛的关注”。张玉奎　　张玉奎指出，我国作为目前世界经济增长速度最快的国家之一，面临着资源、环境、人口与健康、社会可持续发展等诸多挑战，“但同时可以看到，色谱科学和技术，在解决这些重大问题中正发挥越来越重要的作用”。　　色谱是一个具有百年历史的分离分析学科，伴随着社会发展和科学发展的需求，在分离分析新理论、新方法、新技术、新仪器等方面不断创新，色谱队伍不断壮大，英才辈出。　　“近两年来，我国色谱学科在色谱理论研究、多维色谱仪器、新型色谱填料和色谱柱、样品前处理方法、应用领域等方面得到了突飞猛进的发展。”张玉奎进一步指出，当前，色谱的应用领域也在不断扩大，尤其是在与生命科学和环境科学密切相关的代谢组学、蛋白质组学、中药分离分析、环境分析等领域发挥越来越重要的作用。　　他还举例说明了色谱方法在蛋白质组学领域的应用。在2014年，来自约翰斯霍普金斯大学的蛋白质组研究员Akhilesh Pandey，与来自印度生物信息学研究所等机构的研究人员合作，分析了30种不同的组织类型，标绘了人类蛋白质组的绝大部分。这项研究识别出17294个蛋白编码基因，并通过表达分析证明了组织和细胞特异性蛋白的存在。同年，德国慕尼黑工业大学的Bernhard Kster等人创新性地推出了一个搜索性公共数据库，公布了18097个基因获得的蛋白，占目前预计人类蛋白总数的92%。　　“这两个研究组都利用了质谱方法来分析人类组织。”张玉奎指出，Pandey研究组分析的是全新的数据，针对多种健康人体组织的数据，其中包括7种胎儿组织和6种血细胞类型。而Kster研究组则采用了稍微有些不同的方法，他们汇集了已有质谱分析数据，同时构建了自己的质谱数据。目前，中科院大连化物所近年来也在蛋白组学研究上取得了一系列进展。　　张玉奎最后表示，在蛋白质组学研究中，蛋白质的分离和鉴定依然是目前最基本的任务和目标。随着蛋白质组学研究的不断深入，蛋白质分离鉴定技术将得到更加广泛的关注。　　“新型的高通量、高灵敏多维分离鉴定技术的发展，例如集成化蛋白分析平台，芯片多维液相色谱等，将为蛋白组研究带来新的革命。”张玉奎说。

p 　　 span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 近日，浙江大学方群团队联合北京大学黄超兰团队在单细胞蛋白质组学分析研究领域取得了突破性进展。 /span 此项成果近日以全文形式在线发表于美国化学会的Analytical Chemistry杂志上(影响因子 6.32)，论文题目为“Nanoliter-Scale Oil-Air-Droplet Chip-Based Single Cell Proteomic Analysis”。 /p p style=" text-align: center " img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201805/noimg/0d88aade-7372-4d68-b5da-4d57efa64b73.jpg" title=" 001.jpg" width=" 650" height=" 478" border=" 0" hspace=" 0" vspace=" 0" style=" width: 650px height: 478px " / /p p style=" text-align: center " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 图：纳升级油-气-液滴(OAD)芯片和自动定位(SAM)装置的结构示意图(a)和用于单细胞蛋白质组分析的样品前处理和上样的全流程图(b)。 /strong /span /p p 　　蛋白质组学是后基因组计划之一，也是近年来的热点研究领域。作为生命体内功能直接执行者的蛋白质，和基因相比在揭示生命发育和疾病的发生发展的机制方面有更重大的意义。近年来，基于细胞群体内的蛋白质组学研究，因为不可避免地会将大量细胞内的信息平均化，已经越来越难以满足对生命功能更加深入探究的需要。从单细胞层面去了解细胞特征以及彼此之间的相互影响，可以为生物系统中细胞间的异质性提供更宝贵的信息，因此有着越来越大的迫切需求。 span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 鉴于蛋白质不具有直接扩增的特性，以及蛋白质组学分析灵敏度的限制，目前对于少量乃至单细胞内蛋白质的检测在技术上还是极具挑战的。 /span /p p 　　 span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 单细胞内蛋白质含量极少，就典型体细胞而言仅为0.1- 0.2 ng，远远小于常规蛋白质组学样品前处理所需要的微克级蛋白量。 /span 并且细胞内的蛋白质通常需要在离心管内完成复杂多步的前处理操作，包括细胞裂解和蛋白质释放、蛋白质沉淀纯化、蛋白质还原和烷基化、酶切等，一个全细胞裂解蛋白质组的最后反应体积均是几十甚至过百微升，在这个蛋白质组学常规前处理的过程中，由于样品与离心管的接触、多步的样品转移和不完全上样等原因，在进入质谱之前不可避免地带来了蛋白质的损失。用此流程来处理单细胞，即使之后结合液相色谱仪器的自动进样阀可以以小于十微升的体积完成上样也无济于事，因为尚未等到分离蛋白质样品就有可能已经损失大半了。 /p p style=" text-align: center " img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201805/noimg/ce546442-97dc-4a87-a243-558d62afe43e.jpg" title=" 003.png" / /p p 　　 span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 如果说单细胞蛋白质组学是在米粒上雕刻，那么两个团队就是造出了适合在米粒上雕刻的工具刀。 /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 该项研究起自2014年，两个团队的研究人员协同合作将微流控液滴技术与蛋白质组分析技术相结合，发展了一种微型化的油-气-液“三明治”芯片及相应的纳升级液体操控和进样方法，能够在原位静态的纳升级液滴中完成少量细胞蛋白质组学分析所必需的多步样品前处理操作，并且实现了将液滴样品直接高效地注入到色谱分析柱内完成后续的液相色谱分离与质谱检测。 /span 通过采用优化后的芯片材料、裂解试剂、酶切比例和色谱质谱参数等实验条件，该芯片系统可以分别成功地从100、50、10和1个HeLa细胞内鉴定到1360、612、192和51个蛋白质。更重要的是，研究人员首次实现了以单个鼠卵母细胞为初始样本的蛋白质组学分析，一共鉴定到355种蛋白质，其中存在一系列与生殖发育(Ovgp1和Pabpc1)、疾病相关(AnxA6，Kpna2，Cct6a和Pcbp2)的基因。在该工作中，还采用两种常规的基于离心管的前处理方法进行了对照实验，实验结果明确证实了微流控液滴体系具有更低的样品吸附损失、更高的酶切效率和更高效的疏水性蛋白质鉴定能力等明显优势，更适用于微量蛋白质样品的蛋白质组学分析。 /p p 　　 span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 此项研究带来三个突破 /span ：首先是成功发展了适合进行单细胞及类似微量样品的蛋白质组学分析样品前处理芯片和方法。芯片内550 纳升的液滴与芯片的接触面积仅为常规离心管模式下的十五分之一，显著减少了样品与反应器接触所带来的损失；二是发展了一种实现纳升级液滴的直接进样方法，利用3D打印加工的自动定位装置和高压气泵高效地(& gt 99%)将液滴样品注入到分析色谱柱内，完全避免了样品转移和经过液相仪器内复杂管路带来的损失；第三是为避免在常规微流控液滴系统中由于油相直接接触液滴而造成的缺陷，提出了一种采用气相来间隔液滴相和油相的新型液滴芯片结构，在成功防止液滴明显蒸发的同时，还避免了油相和液滴相直接接触带来的脂溶性样品的损失，也使系统能更方便地进行后续的分离柱进样、色谱分离和质谱检测。 /p p 　　 span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 该项研究在基于质谱的单细胞及微量样品的蛋白质组学分析方面开启了全新的技术，其所具有的系统结构简单、容易搭建、操作方便、可靠性高等特点，使其有望被广泛应用到细胞间异质性的研究以及与临床相关的研究，包括稀有的循环肿瘤细胞分析、生殖细胞相关研究和疾病诊疗等方面，因此在未来具有巨大的持续开发和应用转化前景。 /span /p p style=" text-align: center " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201805/noimg/91e71d83-0fde-4b69-8b5f-10de6af33876.jpg" title=" 未命名_meitu_0.jpg" width=" 400" height=" 400" border=" 0" hspace=" 0" vspace=" 0" style=" width: 400px height: 400px " / /span /p p style=" text-align: center " strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " （左上：浙江大学 /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 教授 /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 方群、 /span /strong strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 右上： /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 北京大学 /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 教授 /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 黄超兰、 /span /strong strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 左下： /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 浙江大学博士生李紫艺、 /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 右下：前国家蛋白质科学中心· 上海高级工程师 /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 黄敏 /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " ） /span /strong /p p 　　该论文的第一作者为浙江大学博士生李紫艺，通讯作者为浙江大学化学系微分析系统研究所方群教授和北京大学医学部精准医疗多组学研究中心主任黄超兰教授。工作得到了国家自然科学基金和中国科学院杰出技术人才项目的支持。黄超兰教授的部分工作在前单位中科院国家蛋白质科学中心· 上海完成，特此鸣谢! /p p style=" line-height: 16px " img src=" /admincms/ueditor1/dialogs/attachment/fileTypeImages/icon_pdf.gif" / a href=" http://img1.17img.cn/17img/files/201805/ueattachment/b0d2802c-066e-4fdf-86c9-b683f1c317de.pdf" style=" color: rgb(0, 112, 192) text-decoration: underline " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " Nanoliter-Scale Oil-Air-Droplet Chip-Based Single Cell Proteomic Analysis.pdf /span /a /p p span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 文章链接： /span a href=" https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.8b00661" _src=" https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.8b00661" style=" color: rgb(0, 112, 192) text-decoration: underline " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.8b00661 /span /a /p

为了积极促进我国蛋白质组学的研究与发展，由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)主办，北京蛋白质组研究中心和复旦大学共同承办的第六届中国蛋白质组学大会定于2009年7月28日—31日在江苏省泰州市召开。 　　一、会议安排 　　本届学术会议设有大会报告、分会(专题)报告和墙报三种形式。大会将邀请蛋白质组学及相关领域的国内外著名专家和教授作大会报告或专题报告，会议规模约600人左右。 　　会议同时举办与生物化学与分子生物学、蛋白质组学等研究领域相关的仪器、设备、试剂和新技术的展览、展示会。 　　大会安排于2009年7月28日举办蛋白质组学新技术培训，届时将邀请蛋白质组领域的国内、外知名专家授课。 　　二、会议议题 　　会议主要讨论蛋白质组学研究的现状及其进展，内容包括：疾病蛋白质组学，功能蛋白质组学，药物蛋白质组学，结构蛋白质组学，蛋白质化学，生物信息学，蛋白质修饰和相互作用，抗体相关技术，蛋白质组微分析、蛋白质芯片以及蛋白质组新技术新方法等研究领域。 　　三、会议语言 　　中文和英文 　　四、会议组织 　　组织单位 　　主办单位：中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO) 　　承办单位：北京蛋白质组研究中心 复旦大学 　　主 席：贺福初院士 　　顾问委员会：(按姓氏汉语拼音顺序排列) 　　陈志南院士 强伯勤院士 饶子和院士 施蕴渝院士 汪尔康院士 王红阳院士 　　张玉奎院士 　　执行主席：钱小红 杨芃原 　　组织委员会 　　主 任：贺福初院士 　　副 主 任：杨芃原 杨晓明 钱小红 　　委 员：(按姓氏汉语拼音顺序排列) 　　陈志南院士 丁建平 高友鹤 何大澄 贺福初院士 李 明 梁宋平 刘斯奇 陆满晴 潘全威 钱小红 　　饶子和院士 施 前　王东根 杨芃原 杨晓明 杨秀荣 张先恩 张玉奎院士 甄 蓓 　　秘 书 长： 王东根 　　副秘书长：甄 蓓 施 前 　　学术委员会 　　主 任：饶子和院士 　　副 主 任：王红阳院士 张玉奎院士 　　委 员：(按姓氏汉语拼音顺序排列) 　　陈正军 陈志南院士 丁建平 高友鹤 何大澄 贺福初院士 李亦学 梁宋平 刘斯奇 刘银坤 钱小红 　　强伯勤院士 饶子和院士 施 前 施蕴渝院士 汪尔康院士 王红阳院士 杨芃原 杨晓明 张学敏 　　张玉奎院士 赵晓航 曾 嵘 　甄 蓓 　　秘 书 长：钱小红 　　副秘书长：甄 蓓 施 前 　　秘书处 　　北京昌平区科学园路33号北京蛋白质组研究中心 　　电话：010-80705188 传 真：010-80705155 　　E-mail: cnhupo6@163.com 　　五、征文范围及要求(参照模版) 　　投稿论文收录入会议论文集，大会将组织优秀论文评选。参加会议代表将授予继续教育学分10分。 　　凡未在国内外公开刊物发表过的研究成果，均可投稿，具体要求如下： 　　征文范围：有关蛋白质组学及相关领域近年来研究的学术成果，以英文论文摘要形式投稿。 　　稿件要求：每篇论文摘要按正式发表论文要求撰写，限A4纸1页，使用Word软件撰写。文责自负。(参照模版) 　　字体要求：标题—Times New Roman四号加粗 　　作者—Times New Roman五号居中，拟作报告者请在其姓名下方划一横线。 　　注：大会报告幻灯片一律要求英文准备， 　　单位、地址、邮编、E-mail—Times New Roman小五号居中 　　摘要—Times New Roman五号 　　参考文献(Times New Roman五号)。 　　投稿方式：论文摘要请用E-mail附件传递，并在E-mail信中“主题”栏内写明“蛋白质组学会议” 若无上网条件请邮寄论文摘要一式两份，同时提交光盘(未提交者会议将不予录用)。 　　E-mail: cnhupo6@163.com 　　投稿地址：北京昌平区科学园路33号北京蛋白质组研究中心第六届中国蛋白质组学大会收 　　邮编：102206 　　截至日期：论文摘要投稿截至日期为2009年5月31日，以当地邮戳为准。 　　六、报到时间 　　2009年7月27日(参加培训的人员报到时间)、28-29日 　　七、会议注册费(国内代表) 　　2009年6月20日前注册：800元(人民币)/位(在读学生：500元/位) 　　2009年6月20日后注册：900元(人民币)/位(在读学生：600元/位) 　　技术培训费(与注册费一并交纳)：100元(人民币)/位 　　八、重要时间提示 　　回执截止日期：2009年5月31日前(以当地邮戳为凭) 　　征稿截止日期：2009年5月31日前(以当地邮戳为凭) 　　会前注册时间：2009年6月20日前(以当地邮戳为凭) 　　九、交通指南 　　由于参会人员较多，大会组委会不安排车辆接送。请代表自行乘车抵达报到地点，望参会代表谅解。 　　十、注册须知 　　1.请与会代表携带本人身份证，学生代表需携带学生证。已交费代表请带好汇款凭证，以备核对。 　　2.注册代表权益： 　　正式代表和学生代表，可以参加会议组织的所有活动、注册费包括会务费、资料礼品费、会议安排旅游及7月29日—31日早餐、午餐和晚餐费用。 　　十一、会议地址和住宿宾馆 　　 会议地址：江苏省泰州市扬子江药业集团海燕大酒店(江苏省泰州扬子江南路1号) 　　 邮编:225300 　　 住宿安排：海燕大酒店——标准间280元/天，单人间280元/天， 　　扬子江大酒店——标准间160元/天(距会场5分钟车程，会议期间班车接送) 　　十二、学术发言及证书登记 　　大会和分会发言及壁报交流的参会代表，请在注册当日(2009年7月27、28日)将报告材料或壁报资料(国际标准大小1.0m×1.2m)交至大会学术组，报告材料须为Powerpoint文件，一律要求英文准备，存储于移动硬盘、USB闪盘或光盘之中，大会提供笔记本电脑和幻灯放映设备，不接受个人电脑接入。如有特殊需求，请提前与大会学术组联系。大会发言鼓励使用英文，如有不便可使用中文。 　　论文被录用的参会代表可登记领取会议论文证书，所有参会代表可登记领取学分证书。 　　十三、旅游及定票须知 　　大会组委会设有旅游票务组专门负责参会代表的旅游及定票事宜。 　　组委会指定旅行社负责组织本次会议的会后(7月31日)旅游，会议期间请参会代表尽量不要安排旅游活动。旅游费用现场交纳并开具发票。军人和学生代表请携带相关证件，可享受门票优惠。 　　请参会代表至少提前两周提交返程票务预定单(附件二)，否则组委会无法保证其预定。费用现场交纳，预订火车票须加收手续费，预订飞机票需向秘书组告知姓名及身份证号，不加收任何费用。 　　参会代表在注册报到时，须在旅游票务组登记确认自己的旅游和返程票务事宜，并交纳费用。会议期间如有问题，请随时与旅游票务组或大会秘书处联系。 　　十四、退费说明： 　　已交费的参会代表因个人原因不能参会或其他原因需要退款，请提前与会务组联系。退费原则：7月1日前退还所交款项的80%，7月1日~26日退还所交款项的50%，7月27日及以后恕不退款。(已预订火车票者扣除票价退票费和手续费后进行退费) 　　十五、联系方式 　　会议回执和论文发送或邮寄至： 　　第六届中国蛋白质组学大会会务组 　　电话：010-80705188 80705116 80705166 　　传真：010-80705155 　　E-mail：cnhupo6@163.com 　　地址：北京昌平区科学园路33号北京蛋白质组研究中心 　　邮编：102206 　　*请注明：“蛋白质组学大会” 　　注册费汇至： 　　帐 户：中国人民解放军62032部队 　　开户行：北京工商行永定路支行 　　帐 号： 0200004909008520585 　　* 务必注明：蛋白质组学大会*(汇款前请先打电话联系，汇款后将汇款凭据传真至我处，以确保汇款安全到帐) 　　十六 、附件 　　附件1：第一轮通知回执 　　附件2：返程票务预订单 　　附件3：论文摘要模板。 　　第六届中国蛋白质组学大会秘书处 　　二OO八年十二月一日 　　附件1 　　第六届中国蛋白质组学大会 　　第一轮通知 回 执 　　姓名： 性别： 职称： 联系电话： 　　工作单位： 传真： 　　通讯地址： 邮编： 　　E-mail： 参加会议： 是 □ 否 □ 　　论文摘要题目： 　　所属专业：系统生物学□ 疾病蛋白质组学□ 功能蛋白质组学□ 　　药物蛋白质组学□ 结构蛋白质组学□ 蛋白质化学□ 生物信息学□ 　　蛋白质修饰和相互作用□抗体相关技术□ 蛋白质组微分析□ 蛋白质芯片□ 　　蛋白质组新技术新方法□ 其他□ 　　拟作报告形式： 大会报告 □ 分会报告 □ 墙报 □ 参加技术培训： 是 □ 否 □ 　　住宿标准： 　　海燕大酒店 　　(四星)标准间单人间 　　280元/天280元/天 　　扬子江大酒店 　　(三星)标准间 　　160元/天 　　选择房间类型： 　　海燕大酒店 标准间□ 单人间□ 　　扬子江大酒店 标准间□ 　　入住时间： 月 日～ 月 日 　　参加会议者请将回执于2009年5月31日之前发送或邮寄至： 　　E-mail: cnhupo6@163.com 　　投稿地址：北京昌平区科学园路33号北京蛋白质组研究中心第六届中国蛋白质组学大会收 　　邮编：102206 　　附件2 　　返程票务预订单 　　返程日期航班号 　　(车次)目的地代表签字 　　备注 　　附件3 　　Identified the nonspecific binding proteins in depletion of Albumin and IgG from Human plasma 　　Wang Yundan1, Ning Yunshan1,3, Jiang Yin2, Deng Xinyu2, Fang Qinmei2, Hong Yanhua3, 　　Li Ming1,3 　　1 College of Biotechnology, Southern Medical University, Guangzhou, P. R. China, 510515 　　2 Beijing Institute of radiation Medicine, Beijing, P. R. China, 100850 　　3 Boang Antibody Company, Shanghai, P. R. China, 200233 　　tommy604@fimmu.com 　　Depletion of high abundant proteins in plasma samples was necessary for the further study of new biomarkers mining in HPPP. We used the high specific mouse mAb against human albumin and Protein G to remove Albumin and IgG respectively from human plasma in denatured condition and native condition. We observed the different capacity of depletion in the presence of chaos reagents, non-ionic detergent and high concentration of salts. In native condition, the elution proteins were separated by 2DE and 104 spots in the gel were excised and trypsin digested for tandem mass spectrum (MS/MS) analysis. The binding proteins including Albumin, IgG, Fibrinogen, Vitamin D binding protein, Alpha-1 antitrypsin, transferrin, Transthyretin, Proapolipoprotein, Keratin, Complement component 3. The remained spots are albumin and IgG fragments. In denatured condition, the capacity of depletion for albumin become lower but IgG not affected. The concentration of nonspecific binding proteins including the fragments of Albumin in elution sample was lower. The results may explain the relation between low non-specific binding and presence of albumin fragments in condensed plasma samples processed by MARC or MARS system using commercial buffer. 　　Keywords: 　　High abundant protein / Depletion / 2-DE / MS / Nonspecific / Human plasma protein / Monoclonal antibody / Denature 　　References 　　1. Huang, H. L., Stasyk T., Morandell, S., Mogg, M., et al., Electrophoresis 2005, 26, 2843-2849 　　2. Anderson, N. L., Polanski M., Pieper, R., Gatlin, T., et al., Molecular & Cellular Proteomics 2004 Apr 3(4):311-26. 　　3. Shen, Y. F., Kim, J. K., Strittmatter, E. F., Jacobs, J.M., et al., Proteomics 2005, 5,4034-4045 　　4. Omenn, G. S., States D. J., Adamski M., Blackwell T. W., et al., Proteomics 2005, 13, 3226-3245

2009年11月30日，北京——系统生物学研究所(ISB)和安捷伦科技公司(NYSE: A)今天宣布，合作开发人类多反应监测(MRM)Atlas，一种让科学家对所有人类蛋白质进行定量分析的综合方法。该项目将有望使生物标志物的发现与验证，以及基于蛋白水平的诊断检验、个性化医疗、人类健康监测等工作获得重要进展。 　　该项目获得“美国复兴与再投资法案——投资机会”项下国立卫生研究院国家人类基因组研究所提供的460万美元资助，由ISB的Robert Moritz 和 Leroy Hood开发“全人类多肽和MRM Atlas ”。苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold 也将携欧洲科研理事会提供的经费加入该项合作研究。 　　该研究将历时2年，分别在西雅图的ISB和苏黎世ETH进行，将使用安捷伦三重串联四极杆和四极杆飞行时间液相色谱/质谱(LC/MS)系统和纳流液相色谱-芯片/质谱系统。 　　“我们相信这将是蛋白质分析领域一个革命性的进展，”ISB成员兼蛋白质组学负责人Rob Moritz说，“这将促进蛋白质定量的常规应用，在人类疾病的机理研究、早期诊断和监测中发挥重要作用。” 　　“安捷伦很高兴共同担纲开发人类MRM Atlas，并且基于MRM方法，支持蛋白定量研究，”安捷伦LC/MS营销负责人Ken Miller说，“我们的三重串联四极杆质谱系统、蛋白质分析专用软件工具、以及独特的液相色谱-芯片/质谱技术，构成了分析这些大量样品稳定而灵敏的平台。” 　　MRM Atlas旨在让科学家们能够对人类组织、细胞系和血浆中大约20,000种蛋白质进行定量处理，从而对关乎人类健康的众多领域产生影响。该计划对每个人类蛋白编码基因，可生成多达四种多肽的数据库，经过快速精确的质谱MRM方法分析验证，实现对人类蛋白质组中几乎所有蛋白的明确鉴定与定量，从而将对普通生物学研究和大规模蛋白质组研究产生积极推动作用。

2020年是蛋白质组学发展关键的一年，全球新冠疫情突显了蛋白质组学在应对公共卫生危机中的临床应用。人类可以从这次新冠疫情中汲取许多经验，毫无疑问地，这些将在未来几年内影响蛋白质组学发展。近日，Technology Networks与布鲁克道尔顿生命科学质谱执行副总裁Rohan Thakur博士进行了交流，讨论了蛋白质组学的研究现状以及蛋白质组学在新冠疫情研究中发挥的作用。Rohan Thakur：我认为HUPO Connect 2020大会有两个特别的亮点：PaSER的推出和实现真正意义上的单细胞分析。首先是PaSER的推出，这是我们IPA并购的第一款基于GPU强大数据处理功能的搜索引擎软件。PaSER适用于翻译蛋白质组学，其涉及到很多运算并产生的文件格式较大。当您进行搜库时，这些生成的大量数据集将遇到很多问题，如假阳率等。PaSER致力于解决减少搜库时间以至于花费更少的时间用在数据分析上。间由传统60-90分钟的运行缩短到11分钟。例如Roman Fischer博士和Andrew Webb博士的研究就利用timsTOF Pro成功缩短了分析时间。 布鲁克于2020年5月8日完成了与IPA的资产并购，并在HUPO 2020大会推出了新产品PaSER，实现了“实时数据采集与分析”功能，当数据采集完成时很快即可以获得蛋白与肽段信息。第二个亮点是Matthias Mann教授发表了关于单细胞蛋白质组学在原型系统上取得了早期数据。从这个系统得到的单细胞的数据实现真正的单细胞蛋白质组学分析，而不是仅仅将多个细胞放在一起并称之为单细胞分析。这是蛋白质组学中一个突破性成就，Matthias展示的数据非常让人震撼。Rohan Thakur：Catherine Wong（黄超兰）教授在《Nature Communications》上发表的一篇关于COVID-19的研究论文。他们利用timsTOF Pro得到蛋白质组学数据并提出了新冠肺炎两阶段的发病机制。Rohan Thakur：由于许多软件都是为分析小型数据而编写的，所以我们现在面临最根本的挑战是如何处理成爆发势态的海量数据。如果需要比较蛋白质组学与基因组学，您需要通过取得基因组学、蛋白质组学、糖组学、代谢组学等一系列数据，比较多组学数据才能提供生物护照或完整个人报告，这也是为什么个性化医疗从五年前开始如此流行的原因。近年来，蛋白组学处理数据速度不同往昔，高速的数据采集与处理允许您首先决定蛋白质组学研究数据是否合理。科学家们可以成功进行全群体的蛋白质组学研究，这些在短短两三年内取得的进步，实际正在改变人们对数据的看法，我认为这是我们所有人都面临的挑战。Rohan Thakur：MetaboScape是布鲁克代谢组学分析的关键软件包，SCiLS是一款出色的成像软件。在MALDI-2发布后，我们使用SpatialOMx从一个组织样本中收集蛋白质组学和代谢组学数据。通过综合这些信息并将其提供给技术人员、病理学家或肿瘤科医生，他们可以根据治疗或疾病进展来查看不同的分子特征，并决定如何进行个性化治疗。这就是我们正在进行的工作——连接软件生态系统，为用户提供各组学间的无缝体验，加速或扩宽用户决策过程并提供更合理的治疗方案。但是，目前生成的海量数据只会带来新的问题，还不能帮助科学家做出具有可行性的决定，这也是布鲁克主要想解决的目标。Rohan Thakur：我们有两项主要工作。一个是澳大利亚JeremyNicholson教授团队在研究COVID-19相关代谢和代谢物方面展现了出色的研究成果，为了解新冠后综合症铺平了道路。图：澳大利亚国家表型研究中心（ANPC）第二个项目是，Catherine Wong（黄超兰）教授团队用timsTOF Pro技术对COVID-19患者与健康志愿者的尿液样本进行蛋白质组学分析。这项研究利用dia-PASEF等方法可以检测到更多蛋白质提高了蛋白的覆盖深度。我认为新冠疫情带来的积极面在于为组学带来前所未有的关注度，科学家试图利用蛋白质组学和代谢组学来了解全世界的疾病，这几乎接近“登月”式的共同努力，有助于突出“组学”的运用来解决真正影响人类健康的问题。

基因测序技术飞速发展，使得几十个甚至上百个基因的测序能够在几天之内完成，近日，&ldquo 蛋白质测序仪器和试剂国产化&rdquo 项目实施工作会议在北京大学顺利落幕，会议得到了北京大学前沿交叉学科研究院方竞院长的大力支持。 　　90年代人类基因组计划，中国科学家承担了1%的任务 而2010年代的人类蛋白组计划，则是由中国科学家领军 20年来，从承担人类基因组计划1%到人类蛋白组计划的领袖全球，证明了中国科学的长足进步，也体现了中国科学家的卓越贡献。此次工作会议是科研与产业化结合非常好的范例，由国内蛋白组领域的重要企业参会，并成立了&ldquo 中国人类蛋白质计划企业工作组&rdquo ，由知名企业担任企业工作组组长，努力打破生物质谱被国外企业垄断的局面，迅速将相关的研究成果运用于临床诊断。 　　&ldquo 蛋白质测序仪器和试剂国产化&rdquo 项目，基于&ldquo 中国人类蛋白质组计划&rdquo ，项目共分9个课题，其中&ldquo 激光解析基体辅助离子源-蛋白测序仪器&rdquo 课题，是一重点研究方向，将会加大蛋白质组学在临床领域的研究与应用，快速推动生物质谱技术在临床医疗领域的应用。 　　利用对人体DNA分子的鉴定来辅助诊断的技术(分子诊断技术)在上个世纪就已经出现了，比如，FISH等核酸杂交技术已经可以进行染色体和基因水平的分析。上世纪90年代，定量PCR技术的兴起大大加快了突变鉴定的速度，可以进行DNA上单个位点突变的鉴定，被广泛应用于临床。本世纪初，人类基因组草图绘制的完成标志着第一代基因测序技术的成熟，对一个或几个基因的测序开始应用在临床上，对基因突变测量的分辨率得以提升，在传染病的鉴定以及癌症等致命性疾病的靶向治疗中应用广泛。 　　除了精度的提高，基因芯片技术的发明使得同时检测许多基因的变化成为可能。如今新一代测序技术的进展使得大规模测序的速度急剧提高，成本急剧降低，越来越多的疾病找到了可用于诊断或分型的分子标志物，同时检测几十个基因的微小变化也不再困难，对传染病病原体的鉴定变得更加快速，许多遗传性疾病都可以实现无创的产前诊断。 　　科技的进步应用于医疗领域需要经过一段时间，与IT等领域不同，医疗领域是政府监管最为严格的领域，合规性是临床应用上绕不开的问题。一项技术的成熟必须得到政府监管部门的认可才能得到应用，而新技术的批准、质控可溯源体系的建立、收费标准的建立等需要耗费时间。新一代测序的应用涉及到测序仪器、测序试剂、生物信息软件与数据库的相互配合，虽然这项技术在21三体综合症的产前诊断等应用方面展现出了极好的前景，但我们必须承认，在从基因序列到疾病的探索中，还有许多未知的问题需要解决。

蛋白质组学与转化医学第七届中国蛋白质组学大会暨第三届国际蛋白质组学论坛 　　(第二轮通知) 　　为积极促进蛋白质组学的研究与发展，增进国际间合作交流，由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)和国际蛋白质组学论坛(IFP)主办，北京蛋白质组研究中心、国际蛋白质组学论坛组委会及浙江大学共同承办的第七届中国蛋白质组学大暨第三届国际蛋白质组学论坛定于2011年4月15日—18日在浙江省杭州市召开。 　　一、会议安排 　　本届会议设有大会报告、分会(专题)报告和墙报三种形式。大会将邀请蛋白质组学及相关领域的国际著名专家和教授作大会报告或专题报告，会议规模约1000人左右。 　　拟邀请大会报告人：路甬祥、陈 竺、沈 岩、饶子和、王红阳、贺福初 　　Roger Y. Tsien (诺贝尔奖获得者，University of California, San Diego, USA) 　　John Yates (The Scripps Research Institute, USA) 　　Ruedi Aebersold (Institute of Molecular Systems Biology, Switzerland) 　　Matthias Mann (Max Planck Institute for Biochemistry, Germany) 　　Amos Bairoch (Swiss Institute of Bioinformatics, Swiss) 　　Christopher M. Overal (University of British Columbia, Canada) 　　同时将邀请Profs. Gilbert Omenn, Henry Rodriguez, Daniel Chan, Julio Celis, PeipeiPing，秦钧, 刘斯奇, 杨芃原, 郑树森, 钱小红等 　　大会安排2011年4月15日上午举行“第七届中国蛋白质组学大会暨第三届国际蛋白质组论坛”开幕式及大会报告， 　　4月15日下午举办“国际蛋白质组学论坛” 　　4月16-17日召开“第七届中国蛋白质组学大会”， 　　4月15-16日中午举办蛋白质组学培训班。 　　会议同时举办与生物化学与分子生物学、蛋白质组学等研究领域相关的仪器、设备、试剂和新技术的展览、展示会。 　　二、会议议题 蛋白质组学与转化医学 组织/器官蛋白质组 蛋白质翻译后修饰 定量蛋白质组 蛋白质组新技术新方法 蛋白质相互作用 信号转导与调控 计算蛋白质组学 植物蛋白质组 代谢蛋白质组 临床蛋白质组 抗体及芯片 模式动物蛋白质组 结构蛋白质组 　　三、会议语言 　　英文 　　四、会议组织 　　组织单位 　　 主办单位：中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO) 　　国际蛋白质组学论坛(IFP) 　　 承办单位：北京蛋白质组研究中心 国际蛋白质组学论坛 浙江大学 　　 主 席：贺福初，Ping Peipei，段会龙 　　学术委员会 　　 主 席：John Yates (TSRI, USA) 　　Ruedi Aebersold (ETH-IMSB) 　　 委 员： (按姓氏汉语拼音顺序排列) 　　陈正军 陈志南 丁建平 高友鹤 何大澄 贺福初 李亦学 梁宋平 刘斯奇 　　刘银坤 钱小红 强伯勤 秦 钧 饶子和 施 前 施蕴渝 汪尔康 王红阳 杨芃原 杨晓明 张学敏 张玉奎 赵晓航 　　组织委员会 　　 主 任：贺福初 　　 副主任：杨芃原 杨晓明 秦 钧 　　 委 员：(按姓氏汉语拼音顺序排列) 　　陈志南 丁建平 高友鹤 何大澄 贺福初 李 明 梁宋平 刘斯奇 陆满晴 潘全威 钱小红 秦 钧 饶子和 施 前 王东根 徐 平 杨芃原 杨晓明 杨秀荣 张先恩 张玉奎 甄 蓓 　　 秘 书 长：钱小红 　　 副秘书长：甄 蓓 施 前 　　秘书处 　　 北京昌平区科学园路33号北京蛋白质组研究中心 　　 联系人： 甄 蓓 北京蛋白质组研究中心 　　邓 宁 浙江大学 　　张雪莉 北京蛋白质组研究中心 　　 电 话：010-80705188 传 真：010-80705155 　　 E-mail：cnhupo@163.com 　　 会议网站：www.cnhupo-congress.cn 　　http://61.50.138.116/bprchy/cn 　　媒体支持 　　仪器信息网 生物谷中国卫生检验杂志 　　五、征文范围及要求(参照模版) 　　投稿论文收录入会议论文集，大会将组织优秀论文评选。参加会议代表将授予继续教育学分10分。 　　凡未在国内外公开刊物发表过的研究成果，均可投稿，具体要求如下： 　　征文范围：有关蛋白质组学及相关领域近年来研究的学术成果，以英文论文摘要形式投稿。 　　稿件要求：每篇论文摘要按正式发表论文要求撰写，300字以内，使用Word软件撰写。文责自负。(参照模版) 　　字体要求：标题—Times New Roman四号加粗 　　作者—Times New Roman五号居中，拟作报告者请在其姓名下方划一横线。 　　注：大会报告幻灯片一律要求英文准备 　　单位、地址、邮编、E-mail—Times New Roman小五号居中 　　摘要—Times New Roman五号 　　参考文献—Times New Roman五号 　　投稿方式：请登录 http://61.50.138.116/bprchy, 点击会议注册, 阅读注册须知, 在页面下端点击 “已阅读完注册须知,点击开始注册”, 进入注册界面. 红字显示选项为必填项. 用户ID请使用有效邮箱信息. 您可以登录网站修改您的个人信息及摘要信息. 注册之后,您可以根据需要提交会议摘要, 并进行酒店预订等. 　　E-mail:cnhupo@163.com 　　截至日期：论文摘要投稿截至日期为2011年3月15日 　　六、报到时间 　　2011年4月14日 　　七、会议注册费(国内代表) 　　2011年1月20日前注册：1200元(人民币)/位(在读学生：900元/位) 　　2011年1月20日后注册：1400元(人民币)/位(在读学生：1100元/位) 　　技术培训费(与注册费一并交纳)：200元(人民币)/位 　　八、注册须知 　　1.请与会代表携带本人身份证，学生代表需携带学生证。已交费代表请带好汇款凭证，以备核对。 　　2.注册代表权益： 　　正式代表和学生代表，可以参加会议组织的所有活动、注册费包括会务费、资料礼品费、会议安排旅游、4月15日—17日中晚餐及4月14日晚餐费用。 　　九、会议地址和住宿宾馆 　　 会议地址：浙江杭州 第一世界大酒店(浙江杭州萧山区湘湖路92号) 　　 酒店电话：086-0571-83866888 　　 住宿安排：浙江杭州 第一世界大酒店 　　五星：标准间480元/天，单人间480元/天 　　四星：标准间350元/天，单人间350元/天 　　十、学术发言及证书登记 　　大会和分会发言及壁报交流的参会代表，请在注册当日(2011年4月14日)将报告材料或壁报资料(国际标准大小1.0m×1.2m(宽×长))交至大会学术组，报告材料须为Powerpoint文件，一律要求英文准备，存储于USB闪盘之中，大会提供笔记本电脑和幻灯放映设备，不接受个人电脑接入。如有特殊需求，请提前与大会会务组联系。 　　所有参会代表可登记领取学分证书。 　　十一、退费说明 　　已交费的参会代表因个人原因不能参会或其他原因需要退款，请提前与会务组联系。退费原则：2011年3月15日前退还所交款项的80%，3月15日~4月1日退还所交款项的50%，4月1日及以后恕不退款。 　　十二、会后旅游 　　湘湖半日游：湘湖被誉为西湖的“姊妹湖”，横跨8000年的古文明。湘湖旅游度假区规划总面积51.7平方公里，恢复湖面7.5平方公里。“湘湖八景”在生态湘湖、文化湘湖的基础上，建立科学的湘湖生态系统，形成飞鸟禽鱼的乐园，营造出一处湘湖古越文化氛围。 　　具体旅游安排以会议第三轮通知为准。 　　十三、联系方式 　　会议网址：http://www.cnhupo-congress.cn 　　http://60.191.25.30/bprchy 　　大会会务组: 　　电 话：010-80705188(学术) 80705166(招商) 　　传 真：010-80705155 　　E-mail：cnhupo@163.com 　　地 址：北京昌平区科学园路33号北京蛋白质组研究中心 　　邮 编：102206 　　*请注明：“蛋白质组学大会” 　　注册费汇至： 　　帐 户：中国人民解放军62032部队 　　开户行：北京工商行永定路支行 　　帐 号： 0200004909008520585 　　* 务必注明：蛋白质组学大会*(汇款前请先打电话联系，汇款后将汇款凭据传真至我处，以确保汇款安全到帐) 　　十四 、附件 　　附件：论文摘要模板.doc 　　第七届中国蛋白质组学大会 　　秘书处 　　二〇一〇年十一月

p style=" text-align: center " img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201606/insimg/c515b6e1-89c3-49e4-b31e-1732d8315977.jpg" title=" 1466390046e19346b81bc11e2a.jpg" width=" 570" height=" 292" border=" 0" hspace=" 0" vspace=" 0" style=" width: 570px height: 292px " / 　 /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 生物传感器由于其具有灵敏度高、检测速度快、操作简便、成本低、可进行连续动态监测等优点而成为蛋白质检测的一种重要方法。但是，目前研制的蛋白质生物传感器为了减小误差多为一次性使用。由于不同传感器的制作方式不同，不可避免会给蛋白质的检测带来差异性。而且，有些传感器的制作比较复杂，一次性使用成本较高。因此，为了减小蛋白质检测的差异性并节约成本，急需发展一种可再生并能重复利用的蛋白质生物传感器。 /p p 　　湖北中医药大学张国军教授和北京大学张志勇教授及武汉大学黄卫华教授合作利用石墨烯优异的电学特性和二氧化钛良好的光催化性能构建出基于石墨烯/二氧化钛的光催化诱导可再生场效应晶体管生物传感器，这种生物传感器不仅能实现对蛋白质高灵敏和高特异的检测，而且在检测完成后可以通过紫外灯照射彻底清除传感表面的蛋白质分子和其它有机分子从而达到传感器的再生。这种能再生的场效应晶体管蛋白质生物传感器能达到使用同一块芯片检测不同蛋白质的目的，极大地降低了生物芯片的制作成本，为蛋白质检测提供了一种新的方法。 /p p 　　这一研究成果发表于 a href=" http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.analchem.6b00374" target=" _blank" title=" " 《Analytical Chemistry》 /a 上。 /p

2023年8月8日，应脉医疗科技(上海)有限公司(下称：应脉医疗)与上海康昱盛生物科技有限公司(下称：康昱盛)在上海签署战略合作协议，合作推广美国Seer公司的高深度无偏蛋白质组学新技术，助力基于血液的蛋白质组学精准医疗进入新时代，这是应脉医疗继2021年宣布与Seer达成合作进军中国蛋白质组学市场后的又一战略合作。　　生物信息巨头布局中国蛋白质组学市场　　2021年，Seer宣布与应脉医疗达成独家经销协议，重点是加速公司蛋白质图谱产品套件（Proteograph系统平台）的商业扩张。根据协议条款，应脉医疗将负责Seer Proteograph系统平台在中国的销售、市场营销和客户服务，并为在中国拓展这一颠覆性技术铺平道路。Seer公司拥有专有的纳米粒子(Nanoparticle, NP)技术，让血液蛋白质组在实现深度和通量上的“非特异性选择”方法成为可能。Seer公司提供的Proteograph™XT平台利用经过特殊制作的纳米粒子磁珠，在跨数十个数量级丰度之间，非特异性地结合各类蛋白，无需额外去除高丰度蛋白，再利用高性能的质谱技术，达到高精度测量。在兼顾深度，增强蛋白组分析通量的情况下，实现对大规模血液蛋白的可重复性定量分析，创造了无偏差高通量探寻生物标记物的机会。　　作为Seer在中国市场的独家经销商，应脉首席运营官边英男博士表示，非常高兴能与康昱盛达成本次合作，康昱盛具有丰富的客户资源，专业的技术支持。双方将发挥各自在擅长领域的优势，产生一加一大于二的倍增效果，推动创新的血浆蛋白质组学技术在生命科学、医疗健康领域的应用。　　康昱盛总经理林建成先生表示，应脉医疗的资源丰富、市场洞察力敏锐。相信高深度无偏蛋白质组学技术具有非常巨大的市场潜力，期待与应脉医疗共同为基于质谱的血浆/血清蛋白质组学研究与应用开启新的篇章。　　中国的生命科学和医药市场是世界上规模最大、增长最快的市场之一，并且拥有蛋白质组学的巨大潜力。 随着肿瘤学、神经学和免疫学在全球卫生保健需求的激增，我们需要新的工具来加速对生物学的见解，识别生物标志物，并开发新的治疗方法。Seer提供的无偏、深入和大规模的蛋白质组学平台解决了这一需求，使制药和生物医学研究人员能够发现新的生物标记物，用于诊断和治疗癌症及其他疾病，并更好地了解健康细胞的功能。　　关于康昱盛　　康昱盛是一家专门提供生物制药领域科学信息整体解决方案的公司。公司由一批多年从事生物医药信息学前沿技术研究、科学咨询、技术服务以及产品研发的科学家于2009年创立。经过10多年的技术积累并得益于我们与国内优秀科研机构的紧密合作，我们拥有一支专业的技术服务团队和资深的专家咨询团队，服务于生物医药领域的各种创新研发型公司、学术科研机构、大学以及政府部门，提供从药物设计分子模拟、生物信息学、化学信息学与研发信息管理系统、化合物毒性预测分析、蛋白质组学、代谢调控分析、二代测序变异与疾病关联分析，到临床前、临床的数据分析以及管理等一系列国际知名的科研软件产品、平台以及成熟的科学信息解决方案。我们目前在中国服务超过900家生物医药行业的企业与学术客户，竭诚为他们研发创新提供强有力的技术服务与产品支持!

为了积极促进我国蛋白质组学的研究与发展，由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会（CNHUPO）主办，北京蛋白质组研究中心和复旦大学共同承办的第六届中国蛋白质组学大会定于2009年7月28～31日在江苏省泰州市召开。 本届学术会议设有大会报告、分会（专题）报告和墙报三种形式。大会将邀请蛋白质组学及相关领域的国内外著名专家和教授作大会报告或专题报告，会议规模约600人左右。 会议同时举办与生物化学与分子生物学、蛋白质组学等研究领域相关的仪器、设备、试剂和新技术的展览、展示会。 大会安排于2009年7月28日举办蛋白质组学新技术培训，届时将邀请蛋白质组领域的国内、外知名专家授课。 会议主要讨论蛋白质组学研究的现状及其进展，内容包括：人类蛋白质组计划、疾病蛋白质组学，功能蛋白质组学，药物蛋白质组学，结构蛋白质组学，蛋白质化学，生物信息学，蛋白质修饰和相互作用，抗体相关技术，蛋白质组微分析、蛋白质芯片以及蛋白质组新技术新方法等研究领域。 戴安公司为改成改成会议的银牌赞助单位，届时戴安公司将派出蛋白质组学专家为广大客户答疑解惑。 戴安中国市场部

大家好，本周为大家分享一篇2024年发表在Analytical Chemistry上的文章，Panda-UV Unlocks Deeper Protein Characterization with Internal Fragments in Ultraviolet Photodissociation Mass Spectrometry1。该文章的通讯作者是来自北京蛋白质组学研究中心的常乘研究员以及中国科学院大连化学物理研究所的王方军教授。　　在过去的十年里，UVPD (193nm)因其出色的碎裂效率而备受关注。它能够产生a/x, b/y, c/z等多种类型离子，并能够对小于30 kDa的蛋白质提供近乎完整的序列裂解。它是完整蛋白表征的有利工具，能够提供序列、PTM、次级结构等丰富信息。常规的UVPD分析主要依赖于识别N-端或C-端碎片(a/x, b/y, c/z)，尽管已经满足大部分的小分子蛋白质(　　图2. Panda-UV工作流程　　通过在三种模型蛋白质上进行全面基准测试，展示了Panda-UV强大性能(图3)。内部片段的加入使得识别的片段数量提高了26%，并将平均蛋白质序列覆盖率提高到了93%，解锁了模型蛋白质中最大蛋白碳酸酐酶II的隐藏区域。此外，平均65%的内部片段可以在多次重复实验中被识别，展示了Panda-UV识别片段的高置信度。与现有的内部片段匹配软件ClipsMS进行对比，Panda-UV通过对代码框架的优化，搜索模型蛋白的一个质谱数据不超过9分钟，比ClipsMS快50倍。最后，在分析单克隆抗体时，Panda-UV将识别的片段数量翻倍，mAb亚基的序列覆盖率可以提高到86%，并且CDR几乎完全测序，显著提高了mAb的识别准确性(图4)。　　图3. A) B)Panda-UV与C) D)Clips MS解析CA、Mb、Ub三种蛋白的UVPD数据对比　　图4. Panda-UV在mAb UVPD数据分析中的应用　　总的来说，Panda-UV赋予研究人员解锁UVPD数据中内部片段的能力。尽管Panda-UV是专门为UVPD设计开发的，但是用一般解离方法(例如：HCD、ETD)得到的质谱图也是兼容的。Panda-UV揭露了完整蛋白质表征的隐藏深度，为蛋白质组学top-down深度分析提供了帮助。　　撰稿：刘蕊洁编辑：李惠琳文章引用：Panda-UV Unlocks Deeper Protein Characterizationwith Internal Fragments in Ultraviolet Photodissociation Mass Spectrometry　　参考文献　　1. Zhu Y, Liu Z, Liu J, et al. Panda-UV Unlocks Deeper Protein Characterization with Internal Fragments in Ultraviolet Photodissociation Mass Spectrometry. Anal Chem. 2024 96(21): 8474-8483.

美国科学家主导的国际科研团队在最新一期《科学》杂志撰文指出，他们利用人工智能和进化分析，绘制出了真核生物的蛋白质之间相互作用的3D模型，首次确定了100多个可能的蛋白质复合物，并为700多个蛋白质复合物提供了结构模型，深入研究蛋白质相互作用有望催生新的药物。　　研究负责人之一、美国西南大学人类发育与发展中心助理教授丛前（音译）称，研究结果代表了结构生物学新时代的重大进步。　　丛前解释说，蛋白质通常成对或成组工作，形成复合物，以完成生物体存活所需的任务。虽然科学家已经对其中一些相互作用开展了深入研究，但许多仍是未解之谜。了解蛋白质之间所有的相互作用将揭示生物学的许多基本方面，并为新药研发提供参考。　　但半个世纪以来，鉴于许多蛋白质结构的不确定性，科学家们很难了解这些相互作用。2020年和2021年，深度思维公司和华盛顿大学戴维贝克实验室独立发布了两种人工智能技术“阿尔法折叠”和RoseTTAFold，它们使用不同的策略预测蛋白质结构。　　在最新研究中，丛前等人通过对许多酵母蛋白复合物建模，扩展了人工智能结构预测工具箱。为了找到可能相互作用的蛋白质，科学家们首先搜索相关真菌的基因组，寻找发生突变的基因，然后使用上述两种人工智能技术来确定这些蛋白质是否可以3D结构结合在一起。　　他们确定了1505种可能的蛋白质复合物，其中699个结构已被表征，验证了其方法的实用性；另外700个复合物目前获得的数据有限，剩下106个从未被研究过。为更好地理解这些很少被描述或未知的复合物，团队研究了类似的蛋白质，并根据新发现的蛋白质与此前已知蛋白质的相互作用，确定了新发现蛋白质的作用。

安捷伦金牌赞助第七届中国蛋白质组学大会暨第三届国际蛋白质组学论坛 　　2011年4月15-18日，第七届中国蛋白质组学大会暨第三届国际蛋白质组学论坛在美丽的花园之城杭州隆重召开。本次会议盛状空前，来自海内外不同地区和国家共计约1000名蛋白质组学工作者参与了本次会议。 　　作为大会唯一的金牌赞助商，安捷伦公司通过对大会全面、积极的参与再次表达了对祖国蛋白质组学事业的支持与关注，同时也以其先进的技术及解决方案再次证明了安捷伦公司在蛋白质组学领域的进步与实力。 　　4月15日中午进行的新产品暨新技术交流活动中，安捷伦公司液质联用及蛋白质组学应用工程师陶定银博士为大家进行了题为《安捷伦Chipcube Q-TOF系统应用于蛋白质组学研究》的精彩技术报告。报告重点介绍了将IMER技术与安捷伦公司的Chip-cube Q-TOF系统进行联用，发展了蛋白质的集成化技术包括蛋白质的在线酶解、肽段的HPLC-Chip在线捕集以及在线分离和Q-TOF 6520检测和鉴定；同时陶博士也为在场听众详细介绍了安捷伦最新单克隆抗体-糖链芯片（mAb-Glyco-Chip）巧妙的原理构造及突出的应用优势等。创新的技术与精彩的内容赢得在场用户的热烈关注，现场讨论气氛浓厚。来自某著名研究单位的资深专家在会上这样评价安捷伦HPLC-Chip/MS系统：&ldquo 安捷伦将芯片液相色谱技术与质谱技术相结合，这一创新为蛋白质组学的发展做出了巨大的贡献。&rdquo 　　随后进行的第一届中欧论坛会议中，来自美国东北大学的著名教授Billy Wu先生与在场专家交流了题为《Detection of Protein Glycosylation by a Novel LC-MS Approach》的精彩内容。报告着重介绍了使用安捷伦6520 QTOF进行普通及突变的糖蛋白的鉴定研究工作。研究中发现一个有趣的现象，蛋白点突变能够将原本高甘露糖构造的糖基化模式改变为 更为复杂的糖链模式。源于单核苷酸多态性的蛋白突变常见于很多癌症患者，因此该法对于发现潜在癌症生物标志物具有重要研究价值。 　　　　　　　　　 　　　　　　　　　　　　　　　　Billy Wu教授做专题报告 　　傍晚隆重举行的由安捷伦公司赞助并冠名的千人开幕晚宴无疑为当天的活动画上了完满的句号。安捷伦公司大中华区生命科学事业部销售经理赵影女士代表公司进行了开幕致辞，同时对长久以来彼此支持的广大蛋白质组学用户表示了衷心的感谢。在古典乐器与现代节奏交融、高雅旋律与民族艺术贯通的丰富文艺节目中，代表们在进行了学术交流之余，也充分感受到了身心的放松，席间充满喜庆与祥和。 　　　　　　　　　 　　　　　　　　　安捷伦公司大中华区生命科学事业部销售经理赵影女士致辞 　　4月16日的会议报告中，来自Genor BioPharma Co., Ltd, （Wison Group）的高级总监George Wang博士为大家带来题为《Protein biologics characterization using HPLC-chip liquid chromatography mass spectrometry》的精彩报告。王博士与大家分享了基于安捷伦HPLC-chip/MS方法进行糖基化单克隆抗体的研究。传统的糖蛋白分析方法由于样品前处理等步骤所限，通常需要3-5天的分析周期，而最新mAb-Glyco-Chip-MS方法在10-30分钟内便可实现全部分析，在快速、灵敏、准确、耐用的基础上，还可极大幅度地降低研发成本，该法在生物医药及单克隆抗体领域具有极大的发展空间和应用前景。 　　　　　　　　　 　　　　　　　　　　　　　　　George Wang博士做专题报告 　　4月17日晚大会闭幕式顺利召开，在安捷伦冠名并颁奖的大会奖项中，共计产生六个优秀青年学者报告奖及十个优秀墙报奖，安捷伦公司大中华区学术业务发展经理舒放先生同组委会领导一起为获奖者颁奖并祝贺。 　　　　　　　　　 　　　　　　　　　　　　　　优秀青年学者报告奖及优秀墙报奖颁奖 　　在本次会议的展览区域内，安捷伦公司的展台成为展会的一大亮点。在热带雨林的主题环绕下，以橘红色调亮相的安捷伦展台恰似万绿丛中一点红，成为本次会议关注人数最多与好评指数最高的展台。展台内展出了包括2100生物分析仪、3100等电聚焦电泳分析仪、最新1260液相色谱仪、6540超高解析度四级杆-飞行时间质谱（UHD-Q/TOF）以及6490超高灵敏度三重四级杆质谱在内的众多蛋白质组学相关方案产品，充分展示了安捷伦公司蛋白质组学从样品前处理到数据采集分析再到最终给出生物学解释的&ldquo Sample in, Results out&rdquo 的完整解决方案；同时也从另外一个层面展示了安捷伦公司将基因组学、转录组学、蛋白质组学及代谢组学实现全面整合的系统生物学流程与解决方案。 　　　　　　　　　 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　安捷伦展台 关于安捷伦科技 安捷伦科技（NYSE: A）是全球领先的测试测量公司，是化学分析、生命科学、电子和通信领域的技术领导者。公司18,500名员工为世界上100多个国家的客户提供服务。安捷伦2010财政年度的业务净收入为54亿美元。了解有关安捷伦科技的详细信息，请访问：www.agilent.com.cn 。

俗话说：文无第一，如果非要整出个蛋白质质谱与蛋白质组学领域世界第一牛人，显然并不是一件容易的事，也注定是一件有争议的事。作为一个半路出家的准业内人，我就本着无知者无畏的革命精神，说一下我自己心目中的第一牛人：Ruedi Aebersold。 　　考虑到科学网的大多数网友对蛋白质组学并不了解，先简单科普一下，根据百度百科的定义：“蛋白质组学(Proteomics)一词，源于蛋白质(protein)与 基因组学(genomics)两个词的组合，意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。” 1995年(也有1994，1996年之说)Marc Wikins首次提出蛋白质组(Proteome)的概念1，1997年, Peter James(就职于有欧洲MIT之称的瑞士联邦工学院(ETH))又在此基础上率先提出蛋白质组学的概念2。基因组学和蛋白质组学的概念又进一步催生了N多的各种各样的组学(omics)，两者的诞生的发展，也使系统生物学成为可能，本文的主人公Ruedi Aebersold与Leroy Hood一起于2000年在美国西雅图创办了系统生物学研究所(ISB),该所的建立不但标志着系统生物学作为一门独立的学科的诞生(此句话貌似不靠谱，参见文后14楼的评论)，也带动了包括蛋白质组学在内的多种组学的发展，当然各种组学的发展也同时促进了系统生物学的发展。尽管日本也于2000年在东京建立了系统生物学研究所，但是同为第一个吃螃蟹的，东京的这个所，无论是学术水平还是世界影响都无法和西雅图的那个系统生物学领域的麦加相提并论。闲话少叙，我之所以认为Ruedi Aebersold是蛋白质质谱与蛋白质组学领域世界第一牛人，是基于如下原因： 　　Ruedi Aebersold对蛋白质组学的最大贡献可谓是同位素代码标记技术(ICAT)，现在这一蛋白组定量技术自从1999年在Nature上发表以来，该技术已世界广泛应用，该论文迄今(截至2013年1月11日)已被引用了近3000次。Web of Science的检索结果显示，蛋白组学领域迄今已经至少有超过10万篇论文发表，按照被引用次数排名，该论文位居第三位。有意思的是，被引用次数排第四位的是Ruedi Aebersold和另外一位牛人Mathias Mann(下面会介绍)于2003年发表在Nature上的有关蛋白质质谱与蛋白质组学的综述论文，迄今也已被引用近2800次。而引用次数排第一和第二的两篇论文的通讯作者并算不上是蛋白质质谱与蛋白质组学领域的，蛋白质组学仅仅是他们使用的工具，他们的影响也在这个领域之外。蛋白质组学领域，最重要的专业协会应该算是HUPO (国际人类蛋白质组组织), 最重要的专业会议也当属HUPO世界大会，Ruedi Aebersold曾获HUPO含金量最高的成就奖，他本人也经常是HUPO世界大会的分会主席或大会特邀报告人。当然Aebersold还获得了包括美国质谱协会(ASMS)大奖在内的许多专业大奖。可能有人会列出另外的自己心中的第一牛人(如上述的Mathias Mann)，但Ruedi Aebersold无疑至少是领域内公认的前几位的世界级牛人。另外，顺便说一下德国马普所的Mathias Mann(其在丹麦首都也有实验室)，Mann和Aebersold可谓是蛋白质组学领域的双子星座，都是该领域的顶级牛人，Mann发表的论文有多篇都在蛋白质组学领域被引用次数前10位，不少被引用次数都上千次。上述的Mann和Aebersold两人能在Nature发表综述论文也说明了他们的江湖地位。Aebersold和Mann所发表的论文总被引次数分别超过了5万和3万次，这个数字在世界所有领域都是惊人的。另外，Mathias Mann在蛋白质组学最大的贡献可以说是发明了蛋白质组体内标记技术SILAC3,这种技术与Ruedi Aebersold发明的ICAT已及另外一种标记iTRAQ是公认的应用最为广泛的蛋白质组学定量标记技术。 　　今年年近花甲的Ruedi Aebersold是世界蛋白质组学的开拓者之一，现在在上述的ETH的工作，和最早提出蛋白质组学Peter James在同一个大学。作为土生土长的瑞士人，Ruedi Aebersold是在2004年底、2005年初才开始在ETH全职工作的，可谓是瑞士的大海龟。Ruedi Aebersold此前在西雅图的ISB和华盛顿大学工作，作为ISB的元老和共同创办人，Ruedi Aebersold现在还是ISB的兼职教授，发表论文时也还署ISB地址。Mann和Aebersold都是欧洲人，现在又都致力于将蛋白质质谱与蛋白质组学应用到临床，尽管蛋白质组学已有十多年发展历史，现在最大的一个瓶颈可以说在基本无法应用到临床，现有的技术，对于临床应用而言，时间和经济成本都太高(无法高通量、检测成本太贵)。这一块硬骨头显然不是一般人能够啃得动的，需要从临床样品制备、质谱技术到数据分析都要有突破甚至革命性的创新，我很期待，也相信Mann和Aebersold有能力最终使蛋白质组学(尤其是基于此的生物标志物鉴定技术)应用到临床。 　　我国在蛋白质质谱与蛋白质组学领域在世界上最出名的无疑非贺福初莫属，贺福初的名字在国内搞蛋白质组学应该都知道他的名字，他的头衔很多(如将军、院士)，我就不一一列举了，新年伊始他又多了一个牛头衔：万人计划中的科技领军人才。贺的工作和学术水平，我不熟悉，不敢评头论足。他的文章被引用次数最高的是发表在Cancer Research一篇论文，迄今已有126次，但并非是蛋白质组学领域。在蛋白质组学领域，他的被引次数(含自引)最高的论文是2007年发表在蛋白质组学顶级期刊MCP的文章4，迄今已有105次引用。蛋白质质谱领域，我国在世界上最出名的学者估计要数复旦大学的杨芃原了，他的被引用次数最高的一篇论文，是2005年发表在化学顶级期刊德国应用化学的文章5，迄今已被引用70次，杨芃原为该论文的共同通讯作者。我国在蛋白质组学目前被引用次数最高的是南开大学王磊(澳大利亚海归、长江学者)2007年发表在美国科学院院刊(PNAS)的论文6，迄今被引次数已经超过500次。 　　蛋白质质谱仪主要生产商Thermo Fisher(即原来的Finnegan), 最近新出了本挂历，这本特别的挂历上列了13位在蛋白质质谱与蛋白质组学领域的牛人，上述的Ruedi Aebersold和Mathias Mann都在之列，其余11位简单介绍、列表如下。 姓 名 工作单位 主要贡献 Richard D. Smith 美国太平洋西北国家实验室 1990年首次用三重四级杆质谱Top-down（自上而下）分析完整蛋白 John Yates III 美国Scripps研究所 SEQUEST MS/MS数据库搜索程序 Joshua Coon 美国威斯康星大学麦迪逊分校 发明了电子转移解离技术(ETD) Neil Kelleher 美国西北大学 Top-down蛋白质组学 Kathryn Lilley 英国剑桥大学 蛋白质组学定量技术 Pierre Thibault 加拿大蒙特利尔大学 应用生物质谱和蛋白质组学到细胞生物学 Michael MacCoss 美国华盛顿大学（西雅图） 稳定同位素标记技术 Albert Heck 荷兰Utrecht大学 基于质谱的结构生物学 Catherine Costello 美国波士顿大学 HUPO前任主席，质谱技术发展及应用 Alexander Makarov 德国Thermo Fisher Scientific 生物质谱全球研发总监 领导研发Orbitrap质谱仪 Donald Hunt 美国弗吉尼亚大学 FT-MS and ETD 　　简单的说，上述13位世界级牛人都来自欧美，没有一位来自亚洲，也没有一位华人。我不知道以Ruedi Aebersold代表的上述牛人是如何炼成的，但可以肯定的是：他们不是欧美版的“百人”计划，也不是“千人”计划，更不是“万人”计划而“计划”出来的。网上的公开信息表明：Ruedi Aebersold除了在国际专业协会和期刊有学术兼职外，没有任何行政职务，就是一普通教授，但是这不妨碍他成为蛋白质质谱与蛋白质组学领域世界第一牛人。

2011年4月15-17日，第七届中国蛋白质组学大会暨第三届国际蛋白质组学论坛在浙江省杭州市第一世界大酒店隆重召开，会议为期三天，该会议及论坛发展代表了当前蛋白质组学及相关领域研究的最高水平，对积极促进蛋白质组学的研究与发展有着深远的意义。本届会议由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)和国际蛋白质组学论坛(IFP)主办，北京蛋白质组研究中心、国际蛋白质组学论坛、浙江大学及加利福尼亚大学洛杉矶分校共同承办，来自国内外科研院所、蛋白质分析及研究的高校及有关人士参加了本届大会。 戴安中国有限公司作为此次大会的参展商在会上展示并介绍公司在蛋白质分析上的技术及应用，在第一世界厅的分离与蛋白芯片技术分会场上，戴安公司生物及微流液相产品经理Remco Swart博士做了题为&ldquo 使用Nano UHPLC 系统最大限度的提高肽及蛋白的鉴定结果&rdquo 的报告，针对NanoLC分离性能的优化、峰容量及钛/蛋白鉴定效果的关系、完整蛋白的分离应用做了介绍，并重点介绍了戴安在生物分析上的特色技术：多维液相，并列出多维液相的具体应用实例。 戴安中国有限公司展位 戴安公司生物及微流液相产品经理Remco Swart博士做分会报告 ★ 关于戴安 戴安公司成立于1975年（纳斯达克股票：DNEX），位于美国硅谷Sunnyvale。公司奋斗目标是不断为全球化学工作者提供高科技产品，帮助减少繁复而耗时的实验室工作环节。戴安公司成立同年推出了世界第一台商品化的离子色谱，该项革命性的分析技术使得全球化学工作者能够从混合物中快速分离鉴别出各项离子成分。历经几十年的发展，到目前为止戴安各项成熟技术已被大大扩展，包括离子色谱仪IC，高效液相色谱HPLC包括毛细管和微流量液相色谱Nano-LC，氨基酸直接分析仪AAA-Direct，快速溶剂萃取仪ASE和固相萃取仪Autotrace及在线分析仪器等。

2010年“蛋白质组学与疾病”专题研讨会Symposium on Proteomics and Disease 2010 　　时间：2010年9月15-17日 　　地点：上海新国际博览中心W2馆W2-M9会议室 　　主办单位：中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO) 　　承办单位：北京蛋白质组研究中心、德国慕尼黑国际博览集团 　　会议主席：钱小红 北京蛋白质组研究中心研究员，中国人类蛋白质组组织(CNHUPO)秘书长 　　名誉主席：贺福初 中科院院士，发展中国家科学院院士，军事医学科学院院长 　　会议主题：蛋白质组学与疾病：重点围绕蛋白质组学及其在疾病研究中的应用取得的新进展进行研讨。 　　会议日程： 2010年9月15日 9:30-10:00 开幕式 10:00-10:40 鼻咽癌发生发展的动态蛋白质组研究 陈主初 中南大学湘雅医学院 10:40-11:20 蛋白质芯片检测体液中癌蛋白表面标志物的方法刘斯奇 中国科学院北京基因组研究所 11:20-12:00 分泌蛋白质组学发现胰腺癌生物标志物赵晓航 中国协和医科大学肿瘤研究所 12:00-13:30 午餐 13:30-14:10 基于质谱MRM技术的疾病标志物发现与验证策略钱小红 北京蛋白质组研究中心 14:10-14:50 比较蛋白质组学分析在肝癌早期诊断、预测性生物标志物、发现潜在药物靶点中的研究刘银坤 复旦大学中山医院肝癌研究所 14:50-15:20 利用系统生物学手段研究复杂生物系统——生物标志物发现及鉴定陈伟 安捷伦科技LC/MS产品应用经理 15:20-15:40 茶歇 15:40-16:20 应用蛋白质组学方法研究证实CAV1是癌症转移因子前体杨芃原 复旦大学 16:20-17:00 利用功能蛋白质组学研究肝脏疾病发展姜颖 北京蛋白质组研究中心 17:00-17:30 待定 2010年9月16日 10:00-10:40 现代蛋白质组学秦钧 美国贝勒医学院 10:40-11:20 定量泛素化蛋白质组技术解析神经退行性病变 徐平北京蛋白质组研究中心 11:20-12:00 免疫多肽肿瘤诊断技术与应用 魏开华军事医学科学院放射与辐射医学研究所 12:00-12:30 待定 12:30-13:30 参观展览会 2010年9月17日 游览上海世博会 　　Symposium on Proteomics and Disease 2010 　　Date: September 15-17, 2010 　　Venue: Hall W2, Room W2-M9, Shanghai New International Expo Centre (SNIEC) , China 　　Organized by: China Human Proteome Organisation (CNHUPO) 　　Presented by: Beijing Proteome Research Center / Messe München International 　　Chairman: Dr. Xiaohong Qian, Beijing Proteome Research Center 　　Honorary Chairman: Dr. Fuchu He, Academician of Chinese Academy of Sciences, Academician of Academy of Sciences for the Developing World 　　Theme: The progress of study on the disease mechanism research and application of Proteomics 　　Agenda Sept. 15th, 2010 9:30-10:00 Opening 10:00-10:40 Dynamic proteomics research in nasopharyngeal carcinoma Zhuchu Chen Ph.D.Xiangya School of Medicine, Central South University, China 10:40-11:20 The feasible approaches for cancer protein biomarkers in body fluid using protein array Siqi Liu Ph.D.Beijing Institute of Genomics (BIG), Chinese Academy of Sciences 11:20-12:00 Secretome based proteomics discovery of pancreatic cancer biomarkers Xiaohang Zhao Ph.D. Cancer Institute (Hospital), Peking Union Medical College and Chinese Academy of Medical Sciences, China 12:00-13:30 Lunch 13:30-14:10 Multiple Reaction Monitoring–based Measurements of Biomarker DiscoveryXiaohong Qian Ph.D. Beijing Proteome Research Center, China 14:10-14:50 A comparative proteome analysis for discovering early diagnostic, predictive biomarkers and potential drug target of HCC Yinkun Liu Ph.D. Liver Cancer Institute Zhongshan Hospital Fudan University, China 14:50-15:20 Using a system biology approach to study complex biological systems – Advancement in biomarker discovery and verification Chen Wei Ph.D. Agilent LC/MS Application Manager 15:20-15:40 Tea Break 15:40-16:20 Proteome study explores CAV1 as pro-metastasis factor Pengyuan Yang Ph.D. Fudan University, China 16:20-17:00 Functional proteomic research during the development of liver diseases Ying Jiang Ph.D. Beijing Proteome Research Center, China 17:00-17:30 TBD Sept. 16th, 2010 10:00-10:40 Current Generation Proteomics Jun Qin Ph.D. Baylor College of Medicine, America 10:40-11:20 Quantitative Analysis of Ubiquitin Proteome Technology using in Neurodegenerative Disease Research Ping Xu Beijing Proteome Research Center, China 11:20-12:00 The application of Immune peptides in the tumor diagnosis Kaihua WeiBeijing Proteome Research Center, China 12:00-12:30 TBD 12:30-13:30 Visit analytica China Sept. 17th, 2010 Visit World Expo