材料信息学

目前在学习有关化学信息学方面的知识，寻求有关这方面的教材资料，谢谢

化学信息学: 前言 我在北大化学学院教学 "化学信息学" 有十多年了. 这门课的前身是文献查找课. 早期在化学学院每个系所 (例如有机所, 分析所等) 都有老师开课教学. 在 1998 我留校任教那年, 由院前院长徐筱杰老师倡导, 取消系所的各自教学, 由化学学院成立五人教学组统一教, 课程命名为 "化学信息学", 内容除了以前的文献查找外, 增添了以下较艰深的内容: "信息理论及其在化学中的地位", "信息结构学", "生物信息学", "人工智能与化学专家系统及数据库", "化学信息系统" 等, 由徐老师亲自担纲. 我被延揽入五人教学组, 负责美国化学文章/专利/贝尔斯坦等教学, 其他还有老师负责期刊/图书/工具书/网络教学 (如何制作网页). 几年间这些年轻老师陆续出国, 留下的教学任务由我逐一承担. 在徐老师几年前退休后, 全课程由我一人独教, 我将上述的 "广义" 艰深的内容取消, 改加添 "网络上的化学信息" 一大章.由众多学生的反应以及我个人观点, 化学信息学回归狭义的文献查找课比较合理与实用, 广义内容中探讨的分子结构物化方面的信息, 属于比较专业化的领域, 或许不必将两者硬凑一起."化学信息学" 这个名词十几年前特别响亮, 也举办过几次全国性的研讨会议, 北大化学学院在 2000 年主办了第二届. 近几年似乎有回复早期狭义 "文献查找" 课程的趋势.由于多年习惯, 目前仍将本报导刊载的内容定名为化学信息学.

一个同学学生物信息学专业，毕业好长时间还没找到工作……他说除了学生物学的知识外，他们还学了好多计算机的知识，全国好像有这个专业的学校没有几个啊，为什么找工作这么难啊？各位大侠讨论一下生物信息学这个专业怎么样啊

利用人基因组测序产生信息的竞争正在开始。生物信息学是以基因组为基础的药物发现和开发成功的关键。随着基因组学应用的扩大，提供能帮助制药公司科学家分析基因组学产生的大量数据/资料的软件和数据库的公司数目也相应增加。生物信息学是一个新兴行业，只有为数不多的几家大公司和许多小公司在提供资料。现时，至少有20家药物发现公司开发了将基因知识转译为药物开发的工具和方法。在生物信息学领域领先的公司有Celera、Genomics、IncyteGenomi-cs和RosettaInpharmatics(后者将被Merck公司收购)。　　生物信息业由从事用于分析、储存和组织生物学信息软件和硬件开发的公司组成。这些工具被用于鉴别药物靶的、发现药物、药物毒理学筛选、药物疗效筛选和药物基因组学。基因组测序技术创造了极其大量的信息，科学家需要处理这些信息的新方法。而生物信息学则是快速处理这些资料和收集有用信息的关键。此外，生物信息学可使科学家能跨越国界分享信息资源。基因组工具和技术通过提高R&D过程各步的效率来降低R&D成本。公司如能采取正确的战略决定并有效地加以实施，则可在它们的药物开发过程中节省3亿美元和2年时间。在总计8.8亿美元的药物开发成本中,75%是过程中失败的代价。减少失败的收益甚至超过提高成功机会所得。通过追寻在生物、化学和代谢信息中富含的疾病靶的和药物候选物，科学家和公司可以更精确地选择最有苗头并可能导致临床开发的先导化合物。据估计，在发现研究中，如能将10个药物靶的减少1个，则新药开发的成本可平均减少2亿美元。

化学信息学:前言http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20110430/3278980/化学信息学: 章节介绍http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20110430/3279037/化学信息学: (1).美国化学文摘_章节介绍与总揽http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20110501/3280045/内容不断更新……

chemtoolkits（www.chemtoolkits.com）国内免费化学信息学平台，该平台利用国际知名的开源化学信息学软件进行开发和整合，为国内生物制药行业提供免费的化学信息学服务。 　　目前主要功能有： 　　1. 里宾斯基五规则计算； 　　2. 集成了The OSIRIS Property Explorer进行对化合物的亲水系数、溶解性、毒性等实时计算和预算； 　　3. 化合物的分子描述符计算（Descriptors） 4. 供应商信息查询，支持化合物结构式搜索功能。

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声明：排列次序按跟贴先后排列，并无排名意图。----------------------------------------------------------------:):):):):):):):)-----------------------------------------------------------------国内生物信息学领域权威：----------------------------------------------------------------*.陈润生：是我国最早从事理论生物学和生物信息学研究的科研人员之一。二十多年来在生物信息学领域进行了系统的研究，曾参加我国第一个完整基因组泉生热袍菌 B4基因组序列的组装和基因标识，曾参加人类基因组1%和水稻基因组工作草图的研究。共发表学术论文100余篇，自1996年以来在国际学术会议上共作大会报告及分组会报告十余次。陈教授写过大量的生物信息方面概述性的论文，算是我的启蒙老师吧。http://www.ibp.ac.cn/c/faculty/02/runshengchen.html*.杨焕明:杨焕明教授一直从事基因组科学的研究。他主持完成的 “人类基因组计划—中国卷”使中国成为这一被称为“二十世纪登月计划”的宏伟项目的成员国，得到了各国领导人和国际科学界的高度赞扬。杨焕明教授及其团队“华大基因”）所承担的人类基因组、水稻基因组以及家猪、家鸡、家蚕基因组等重大项目使我国的基因组研究得以跻身于世界前沿。2003年，“华大基因”又在水稻基因组完成图、家蚕基因组“框架图”的绘制以及SARS冠状病毒的基因组研究及建立诊断方法都做出了新的成绩。杨焕明教授还特别关注基因组研究的社会影响和基因知识的普及。http://www.big.ac.cn/big/center/yhm.jsp?id=25*.罗静初:北京大学生物信息中心教授，博士生导师，欧洲分子生物学网络组织中国节点负责人，英国Briefings in Bioinformatics杂志编委。1947年生，1970年毕业于北京大学生物系。1986年起从事DNA和蛋白质序列计算机分析。1987-89赴美国马里兰大学进修访问，从事蛋白质分子模型和计算机在分子生物学中的应用研究。1991-99先后5次赴英国帝国癌症研究所合作研究，从事蛋白质分子模型、蛋白质结构域分析和数据库构建、蛋白质回环数据库构建等研究。1996年起主持和参加863、973、211、985，以及自然科学基金委、教育部、北京市科委等项目。 发表学术论文30多篇，主持翻译《生物信息学概论》、合作编写《生物信息学》、《分子生物学前沿技术》，开设“实用生物信息技术”研究生课程。我入门时看过的很多生物信息学讲义都是罗教授的，个人觉得罗教授的生物信息学讲义是学习生物信息入门的首选。http://www.bio.pku.edu.cn/collegereview/teacherinfo/teacher/luojc.jsp 郝柏林:郝柏林 1934年6月生于北京市。1959年毕业于乌克兰国立哈尔科夫大学物理数学系。后在中国科学院物理研究所工作。1978年晋升为研究员、副所长。1980年11月当选为中国科学院院士。现任物理学系研究员、博士生导师。兼任中国博士后基金会副理事长、陈嘉庚国际学会常务董事。曾任中国科学院理论物理研究所副所长、所长。主要从事理论物理、计算物理、非线性科学和理论生命科学的研究。涉及固体电子能谱和声子谱、金属红外性质、高分子半导体理论、统计物理模型、相变和临界现象、临界动力学、闭路格林函数方法、动力电网计算、天线计算、地震活动性统计分析、群论知识工程系统、计算机程序设计、混沌动力学和符号动力学、DNA序列分析等领域。http://www.fudan.edu.cn/new_teach/hebolin.htm施蕴渝: 1965年7月毕业于中国科学技术大学生物物理系。1965年9月－1970年2月，卫生部中医研究院，实习研究员。1970年2月－中国科学技术大学生物系助教，讲师，副教授，教授。1979年－1981年意大利罗马大学物理化学系访问学者。1984年6月－1985年1月及1990年3月－9月，荷兰格罗宁根大学物理化学系合作研究。1994年1月法国巴黎南大学，C.N.R.S酶学及生化结构实验室合作研究。1995年11月及1996年3月－4月法国NANCY大学CNRS理论化学实验室合作研究。曾任中国科学技术大学生命科学学院首任院长，中国科学技术大学学术委员会副主任，中国科学技术大学学术委员会结构生物学实验室(中国科学院重点实验室)学术委员会主任，教育部高等学校生物科学与工程教学指导委员会主任委员，中国科学院生物学部常委。国家863项目、国家自然科学基金委项目负责人、973项目中的课题负责人以及中国科学院知识创新项目负责人。http://www.zgkjcx.com/Article/ShowArticle.asp?ArticleID=1702张春霆:著名生物物理学家。1936年9月出生于山东省烟台市。1961年毕业于复旦大学物理系，同年起在复旦大学攻读理论物理专业研究生，1965年毕业。1965—1970年在天津工科师范学院任教，1970—1979年在天津轻工业研究所工作，1979—1982年在法国国立理论物理研究中心作访问学者。从1984年起在天津大学物理系工作至今。1995年当选为中国科学院院士。2001年当选第三世界科学院院士。是意大利国际理论物理研究中心境外研究员，美国科学促进协会会员。主要的学术成就：张教授是我国少数生物信息学家之一。他有较强的数学、物理学和计算机技术基础，以此为背景，从20世纪80年代初开始，他转而研究计算生物学和生物信息学，先后在国外SCI刊物上发表论文70余篇，被引用400余次。他的主要贡献在两个方面：一是提出用双Sine—Gordon偏微分方程组来模拟DNA分子在转录和复制过程中碱基运动的动力学机制，此工作得到近100次的SCI引用。二是提出了DNA序列的Z曲线理论，开拓了一条用几何学方法分析DNA序列的新途径。目前，Z曲线理论在基因组学和生物信息学中已获得了重要的应用，成为生物信息学的一个重要研究方向。在理论分子生物学研究中系统地开创了DNA序列分析中的几何学研究途径，得出了关于天然蛋白质的稳定性与密码子的选用之间存在着强关联等的重要结论。在蛋白质结构类的预测研究中取得了世界领先性的成果，提出了预测HIV蛋白酶对蛋白质的剪切活性部位的有效方法；提出了解释细胞内微管蛋白质装配过程的内部运动机制的精妙理论。张教授的研究成果曾获国家教委科技进步一等奖 (1996)，国家自然科学二等奖 (1997) 和何梁何利科技进步奖 (2001)。他还获天津市劳动模范荣誉称号 (2000)。http://www.tju.edu.cn/survey/zhangchunting.htm李衍达: 李衍达院士出生于1936年10月，1959年毕业于清华大学，1979～1981年作为中国第一批赴美访问学者在麻省理工学院访问。现为中国科学院院士、国务院学位委员会委员、中国自动化学会理事长、清华大学校学术委员会主任、教授、博士生导师。李衍达院士长期从事信号处理理论及地震勘探数据处理方法的研究。他研究的仅用相位谱、 幅度谱或附加部分时域采样点恢复有限长离散信号等问题，在信号重构理论及算法的研究上达到了国际先进水平。他将新的信号处理与模式识别方法用于地震勘探数据处理，取得了开拓性成果。李衍达院士发表了《信号重构理论及应用》等多部著作和论文；先后获国家自然科学奖、国家教委科技进步奖、北京市科技进步奖及教学成果国家特等奖。 http://www.pupk.com/discovery/zt1/data/3337.htm[/siz

化学信息学: 章节介绍 报导内容有以下章节:1. Chemical Abstracts (美国化学文摘)2. Beilstein (贝尔斯坦)3. Patents (专利)4. SCI5. Library and Books (图书馆/图书)6. References (工具书)7. Periodicals (期刊)8. Internet of Chemistry (网络上的化学信息)其中, 1. 美国化学文摘有印刷版 (CA), 光盘版 (CA on CD), 网络版 (SciFinder Scholar) 查找.2. 贝尔斯坦摘有印刷版 (Beilstein), 网络版 (Crossfire)3. 专利除了早期的印刷版查找 (到知识产权局), 这十年剧改成方便的网络查找4. SCI 有早已放弃的庞大印刷版, 现在为网络流行的 SCI 信息查找5-7. 图书馆/图书/期刊/工具书: 也大力迈向网络图书馆, 电子图书, 电子期刊以及网络信息查找下载的境界.8. 网络上的化学信息 (Internet of Chemistry): 这些年来更是丰富, 内容章节范例如下: 搜索引擎, 导航系统, 网上化学数据库, 网上化学软件, 网上书店, 网上论坛, 网上化学会议信息,网上化学试剂仪器, 网上化学组织与化工信息, 网上化学教学资源

化学信息学: (8)-0. 网络化学信息_章节介绍与前言(8). 网络上的化学信息(8)-0. 章节介绍与前言本章的章节安排如下:(8)-1. 网上搜索引擎(8)-2. 网上化学资源导航网页(8)-3. 网上化学数据库(8)-4. 网上化学软件(8)-5. 网上化学书店(8)-6. 网上化学论坛(8)-7. 网上化学会议信息(8)-8. 网上化学试剂仪器(8)-9. 网上化学组织与化工信息(8)-10. 网上化学教学资源 国内这十几年来网络的发展快速令人耳目一新. "将网络上的化学信息" 纳入 "化学信息学" 教学内容的感觉逐年强烈. 当共同任教的几位老师陆 续离开 (出国/退休) 后, 终于有机会自行安排, 增添了本章的教学. 类似本章的整理工作, 在美国以及国内都有人做过. 在早期 www 流行不久, 美国就有一些电脑书籍介绍有意思和实用的网站, 得到网络迷的积极认同与欣赏, 我的印象特别深刻, 也购买了几本书, 因为精彩网址的获得常常可遇难求. 本章提供的许多化学相关的网址与简介, 绝大多数都是修课的学生搜寻上传的作业内容 (按照本讲义架构, 提供有意思的化学网址, 并做简介), 因此本章的内容具有独特的以及北大的特色. 网络网址的更新自主权属于对方, 一段时间后一些网址可能失效, 因此本章内容有一定的时间性 (最近的修正日期 2011.5), 未来需要经常修订补充 (可以参考我的 ftp). 但是即使未来信息老旧, 也引该存在浏览价值, 可以了解当年化学信息的类别与丰富的情况; 进而可以依照内容架构, 更新收集, 方便每一时期的网络化学信息查找.

分享之![img]http://www.instrument.com.cn/bbs/images/affix.gif[/img][url=http://www.instrument.com.cn/bbs/download.asp?ID=24747]生物信息学的主要研究方向和进一步的发展[/url]

原创与否-声明：排列次序按跟贴先后排列，并无排名意图。----------------------------------------------------------------:):):):):):):):)-----------------------------------------------------------------国内生物信息学领域权威：----------------------------------------------------------------*.陈润生：是我国最早从事理论生物学和生物信息学研究的科研人员之一。二十多年来在生物信息学领域进行了系统的研究，曾参加我国第一个完整基因组泉生热袍菌 B4基因组序列的组装和基因标识，曾参加人类基因组1%和水稻基因组工作草图的研究。共发表学术论文100余篇，自1996年以来在国际学术会议上共作大会报告及分组会报告十余次。陈教授写过大量的生物信息方面概述性的论文，算是我的启蒙老师吧。http://www.ibp.ac.cn/c/faculty/02/runshengchen.html*.杨焕明:杨焕明教授一直从事基因组科学的研究。他主持完成的 “人类基因组计划—中国卷”使中国成为这一被称为“二十世纪登月计划”的宏伟项目的成员国，得到了各国领导人和国际科学界的高度赞扬。杨焕明教授及其团队“华大基因”）所承担的人类基因组、水稻基因组以及家猪、家鸡、家蚕基因组等重大项目使我国的基因组研究得以跻身于世界前沿。2003年，“华大基因”又在水稻基因组完成图、家蚕基因组“框架图”的绘制以及SARS冠状病毒的基因组研究及建立诊断方法都做出了新的成绩。杨焕明教授还特别关注基因组研究的社会影响和基因知识的普及。http://www.big.ac.cn/big/center/yhm.jsp?id=25*.罗静初:北京大学生物信息中心教授，博士生导师，欧洲分子生物学网络组织中国节点负责人，英国Briefings in Bioinformatics杂志编委。1947年生，1970年毕业于北京大学生物系。1986年起从事DNA和蛋白质序列计算机分析。1987-89赴美国马里兰大学进修访问，从事蛋白质分子模型和计算机在分子生物学中的应用研究。1991-99先后5次赴英国帝国癌症研究所合作研究，从事蛋白质分子模型、蛋白质结构域分析和数据库构建、蛋白质回环数据库构建等研究。1996年起主持和参加863、973、211、985，以及自然科学基金委、教育部、北京市科委等项目。 发表学术论文30多篇，主持翻译《生物信息学概论》、合作编写《生物信息学》、《分子生物学前沿技术》，开设“实用生物信息技术”研究生课程。我入门时看过的很多生物信息学讲义都是罗教授的，个人觉得罗教授的生物信息学讲义是学习生物信息入门的首选。http://www.bio.pku.edu.cn/collegereview/teacherinfo/teacher/luojc.jsp 郝柏林:郝柏林 1934年6月生于北京市。1959年毕业于乌克兰国立哈尔科夫大学物理数学系。后在中国科学院物理研究所工作。1978年晋升为研究员、副所长。1980年11月当选为中国科学院院士。现任物理学系研究员、博士生导师。兼任中国博士后基金会副理事长、陈嘉庚国际学会常务董事。曾任中国科学院理论物理研究所副所长、所长。主要从事理论物理、计算物理、非线性科学和理论生命科学的研究。涉及固体电子能谱和声子谱、金属红外性质、高分子半导体理论、统计物理模型、相变和临界现象、临界动力学、闭路格林函数方法、动力电网计算、天线计算、地震活动性统计分析、群论知识工程系统、计算机程序设计、混沌动力学和符号动力学、DNA序列分析等领域。http://www.fudan.edu.cn/new_teach/hebolin.htm施蕴渝: 1965年7月毕业于中国科学技术大学生物物理系。1965年9月－1970年2月，卫生部中医研究院，实习研究员。1970年2月－中国科学技术大学生物系助教，讲师，副教授，教授。1979年－1981年意大利罗马大学物理化学系访问学者。1984年6月－1985年1月及1990年3月－9月，荷兰格罗宁根大学物理化学系合作研究。1994年1月法国巴黎南大学，C.N.R.S酶学及生化结构实验室合作研究。1995年11月及1996年3月－4月法国NANCY大学CNRS理论化学实验室合作研究。曾任中国科学技术大学生命科学学院首任院长，中国科学技术大学学术委员会副主任，中国科学技术大学学术委员会结构生物学实验室(中国科学院重点实验室)学术委员会主任，教育部高等学校生物科学与工程教学指导委员会主任委员，中国科学院生物学部常委。国家863项目、国家自然科学基金委项目负责人、973项目中的课题负责人以及中国科学院知识创新项目负责人。http://www.zgkjcx.com/Article/ShowArticle.asp?ArticleID=1702张春霆:著名生物物理学家。1936年9月出生于山东省烟台市。1961年毕业于复旦大学物理系，同年起在复旦大学攻读理论物理专业研究生，1965年毕业。1965—1970年在天津工科师范学院任教，1970—1979年在天津轻工业研究所工作，1979—1982年在法国国立理论物理研究中心作访问学者。从1984年起在天津大学物理系工作至今。1995年当选为中国科学院院士。2001年当选第三世界科学院院士。是意大利国际理论物理研究中心境外研究员，美国科学促进协会会员。主要的学术成就：张教授是我国少数生物信息学家之一。他有较强的数学、物理学和计算机技术基础，以此为背景，从20世纪80年代初开始，他转而研究计算生物学和生物信息学，先后在国外SCI刊物上发表论文70余篇，被引用400余次。他的主要贡献在两个方面：一是提出用双Sine—Gordon偏微分方程组来模拟DNA分子在转录和复制过程中碱基运动的动力学机制，此工作得到近100次的SCI引用。二是提出了DNA序列的Z曲线理论，开拓了一条用几何学方法分析DNA序列的新途径。目前，Z曲线理论在基因组学和生物信息学中已获得了重要的应用，成为生物信息学的一个重要研究方向。在理论分子生物学研究中系统地开创了DNA序列分析中的几何学研究途径，得出了关于天然蛋白质的稳定性与密码子的选用之间存在着强关联等的重要结论。在蛋白质结构类的预测研究中取得了世界领先性的成果，提出了预测HIV蛋白酶对蛋白质的剪切活性部位的有效方法；提出了解释细胞内微管蛋白质装配过程的内部运动机制的精妙理论。张教授的研究成果曾获国家教委科技进步一等奖 (1996)，国家自然科学二等奖 (1997) 和何梁何利科技进步奖 (2001)。他还获天津市劳动模范荣誉称号 (2000)。http://www.tju.edu.cn/survey/zhangchunting.htm李衍达: 李衍达院士出生于1936年10月，1959年毕业于清华大学，1979～1981年作为中国第一批赴美访问学者在麻省理工学院访问。现为中国科学院院士、国务院学位委员会委员、中国自动化学会理事长、清华大学校学术委员会主任、教授、博士生导师。李衍达院士长期从事信号处理理论及地震勘探数据处理方法的研究。他研究的仅用相位谱、 幅度谱或附加部分时域采样点恢复有限长离散信号等问题，在信号重构理论及算法的研究上达到了国际先进水平。他将新的信号处理与模式识别方法用于地震勘探数据处理，取得了开拓性成果。李衍达院士发表了《信号重构理论及应用》等多部著作和论文；先后获国家自然科学奖、国家教委科技进步奖、北京市科技进步奖及教学成果国家特等奖。 http://www.pupk.com/discovery/zt1/data/3337.htm贺福初，中国科学院院士，第三世界科学院院士。1962年出生于湖南安乡，1982年毕业于复旦大学后考入军事医学科学院攻读硕士学位并入伍，相继获生物化学硕士、细胞生物学博士学位。现任复旦大学生物医学研究院院长、教授，军事医学科学院副院长、研究员，博士生导师。主要从事基因组学、蛋白质组学与生物信息学研究。曾发现“细胞活性因子的发育相关进化”、“相互作用分子的协同进化”、“mRNA编码区与非编码区的协调进化”及“物种演化中的分子减速进化”等规律性现象；发现并克隆肝细胞生成素、揭示其基因调控机制、研制其重组品，发现其受体及其两条信号转导通路；建立人胎肝转录组及其蛋白质组，从中发现500余种新基因、新蛋白质；发现中国人群常见恶性肿瘤及慢性肝炎等的易感基因10余种;倡导并领衔了人类第一个组织、器官的“人类肝脏蛋白质组计划”，这也是中国第一次领导大型国际合作计划，Nature、Science、Nature Biotechnology等国际著名杂志给予高度评价。以责任作者在国际核心刊物Nature Genetics、PNAS、Gastroenterology、Hepatology、Genome Res、Mol Cell Proteomics、Cancer Res、JBC、Oncogene等

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2013全国生物信息学培训班（第三期）http://train.360bio.com.cn/sites/train.360bio.com.cn/themes/train/images/button_02.jpg 生命科学的迅猛发展以及新一代的测序技术创造了海量的生物数据，但生命的奥妙并未就此解开，众多科研人员泡在数据的海洋里确打捞不到有效的信息；一些宝贵的数据被挖掘后又无法进行科学系统的分析。到底该如何利用生物信息技术挖掘有效数据，如何从大量数据中获得重要的科研成果，请选择生物信息学前沿技术专题培训班！ http://train.360bio.com.cn/sites/train.360bio.com.cn/files/images/675-166.jpg现将有关事项通知如下:培训时间2013年12月10日—2013年12月13日主办单位湖南省赢通基因与细胞工程技术研究中心湖南省生物医学信息专业委员会承办单位中南大学湘雅三医院长沙赢润生物技术有限公司湖南能润医学诊断技术股份有限公司协办单位中南大学湘雅医院中南大学湘雅二医院湖南省医院协会支持单位仪器信息网www.instrument.com.cn中国生物器材网生物帮培训地点湖南省赢通基因与细胞工程技术研究中心培训对象从事生命科学、农学、医学等领域科研工作者和高校教师及研究生培训方式理论讲授和实验操作紧密结合。培训特色 1. 小班授课，环境优雅，一人一机，无需自备电脑； 2. 全程在计算机前讲授和操作，每位学员在辅导教师的指导下，独立完成数据的查询、分析、编辑以及绘图等操作； 3. 精心挑选相应的上机软件及配套练习案例，为每位学员提供充足的实际操作机会,让每位学员学到扎实的操作技能； 4. 技术团队可协助解答学员平时在科研上遇到的疑问和技术难题。培训费用3600 元/人， 费用包括：培训资料、教学、培训期间的午餐；可协助安排住宿，住宿费用自理。本次课程限定名额20名，为确保培训资源得到最佳利用，请尽快申请报名参加。课程安排 时间课程时长第一天基因组学、生物信息学前沿技术动态1.5h常用生物数据及数据库介绍（NCBI、UCSC、ENSEMBL、EBI/SWISSPROT Kegg 、Rice/Silkworm等）2h基因组数据挖掘2h新一代测序技术原理与数据处理1.5h第二天Linux操作基础2h新一代生物信息分析工具平台介绍2h基因组de novo 组装方法与软件4h第三天基因组注释和基因注释2h全基因组或目标区域重测序数据分析3h比较基因组和进化分析3h第四天蛋白质结构分析与预测2hRNA分析原理及其应用（转录组、SmallRNA、long no-coding RNA）2h表观基因组介绍及应用（经典案例分析，经典文章解读，主流技术）3.5h往期培训2013全国分子细胞生物学实验技术培训班 http://train.360bio.com.cn/sites/train.360bio.com.cn/files/styles/medium/public/images/course/2011/IMG_5955_0.JPG?itok=fDuoShlI http://train.360bio.com.cn/sites/train.360bio.com.cn/files/styles/medium/public/images/course/2011/IMG_6007_0.JPG?itok=BEetpMGn http://train.360bio.com.cn/sites/train.360bio.com.cn/files/styles/medium/public/images/course/2011/IMG_6030_0.JPG?itok=BxKP6wOz [url=http://train.360bio.com.cn/sites/train.360bio.com.cn/files/images/course

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化学信息学: 美国化学文摘_章节介绍与总揽(1). 美国化学文摘(1)-0. 章节介绍与总揽本章主要分成三大部分叙述: 印刷版 (CA), 光盘版 (CA on CD), 网络版 (SciFinder Scholar)附带介绍: 化合物的命名规则每种查找, 将穿插许多相关查找练习以及查找范例.对 CA 的具体介绍, 多放在印刷版的章节中. 可能叙述得比较繁琐篇幅略多, 尤其在近十种索引的介绍. 这些相关知识, 多少可以运用到光盘版以及网络版的查找中.在北京大学, 拥有的美国化学文摘印刷版年代: 1907 (创刊年) - 2004光盘版: 1992-2005 (1998 开始购买)网络版: 2005-迄今 (2004.12 试用一年, 2005.12 正式购买)国内其他大学图书馆的 CA 情况, 可能不尽相同. 可能有些图书馆只有部分印刷版但仍在继续收集, 光盘版可能正在补强和继续订阅 (例如北京石科院, 重点在 CAonCD), 其他学校可能未来几年陆续会参与网络版的订购. 因此, 在国内未来这几年中, 美国化学文摘三种检索方式都存在一定的影响力.本章的章节略分如下:(1)-1 美国化学文摘印刷版 (CA) 1. 概况介绍 (特点/出版/编排) 2. 文摘阅读范例 3. 各种索引介绍 4. 检索练习范例(1)-2. 美国化学文摘光盘版 (CA on CD) 1. 概括介绍 2. 检索界面与检索介绍 3. 各种检索范例 (1)-3美国化学文摘网络版 (SciFinder Scholar) 1. 概括介绍 2. 检索界面与检索介绍 3. 各种检索范例

[b]职位名称：[/b]中国科学院自动化研究所-计算生物学/生物医学图像信息学助理研究员/副研究员[b]职位描述/要求：[/b]需求人数：1面向对象：应届毕业生，博士后，社会在职人员工作责任：1.生物医学图像的处理算法与软件的研发。2.申报和承担各个层面的纵向/横向科研项目。3.组织和领导团队开展日常工作，指导研究生。应聘要求：1.生物医学工程/计算生物学/生物信息学/计算机/电子工程/自动化/模式识别或相关专业博士及以上学位。2.具有坚实的图像处理/计算机视觉/模式识别/机器学习的理论基础，在一个或多个领域有深入的研究；在重要核心刊物或核心国际会议上发表过第一作者论文；具有生物/医学研究经验背景优先。3.专业基础知识扎实，英文读写能力较强。4.责任心强，沟通与表达能力强，具有团队精神。所属团队：国家模式识别实验室计算生物学团队[b]公司介绍：[/b] 仪器信息网仪器直聘栏目针对高校科研院所的免费职位发布平台，汇集了全国数十所高校科研院所的招聘信息。发布信息请联系010-51654077...[url=https://www.instrument.com.cn/job/user/job/position/55142]查看全部[/url]

化学信息学: (2)-0 贝尔斯坦_章节介绍与总揽(2). 贝尔斯坦(2)-0. 章节介绍与总揽本章主要分成两大部分叙述: 印刷版 (Beilstein), 网络版 (CrossFire)章节安排如下:(2)-1 贝尔斯坦印刷版 (Beilstein) 1. 概况介绍 (历史/特点/出版编辑) 2. 印刷版检索 (结构简化/卷数定位) 3. 查找流程介绍 4. 查找范例(2)-2. 贝尔斯坦网络版 (CrossFire) 1. 概况介绍 (简介/特点) 2.检索流程介绍 3. 检索范例"贝尔斯坦" 是化学家文献查找时, 除了美国化学文摘 (CA) 之外的另一个重要选择. 如果不知道贝尔斯坦, 就不能算是化学专业人员.贝尔斯坦和美国化学文摘的明显区别有以下几点:1. CA 做文摘报导, Beilstein 做有机化合物数据整理.2. CA 报导的文摘自 1907 年开始, 只有文摘出现的化合物才得以露面; Beilstein 没有年代限制, 可以追溯到人类历史发现的化合物报导.3. CA 报导所有和化学相关的信息, 包括仪器 (例如红外光谱仪) 或现象 (Aldol condensation); Beilstein 只报导有机化合物信息, 相当于 CA 的化学物质索引内容.4. CA 英文报导, 阅览方便; Beilstein 为德文编辑 (虽然最末一套改用英文), 阅览十分困难.以上是针对两者印刷版做比较. 对于网络版 (SciFinder 与 CrossFire), 区别有:1.SciFinder 报导的化合物已含盖人类史上所有化合物, 不受限于 1907 年.2. CrossFire采用英文报导, 不受限于德文阅览.3. CrossFire的售价较 SciFinder 便宜许多, 世界各国高校很多年前便能购买使用; SciFinder 售价昂贵, 年费近百万元人民币. 但卖给高校使用的版本 (SciFinder Scholar,, 去除商业信息) , 经折扣 (3%) 后价格可以接受.4. SchFinder 有同时使用人数限制 (一般定为 5 人); CrossFire 则无此限制. 我们课题组这些年使用 CrossFire 的几率多些, 主要就是这点随查随得信息的方便性. 北京大学的 Beilstein 收藏, 总图书馆中拥有两全套, 分别置于三楼的西文图书室, 以及一楼工具书室. 但此两套应该不是正版, 因为书皮以及 Label 颜色不符. 北京大学化学学院图书室有一套正版的 Beilstein, 是 1998 年某芬兰退休教授来化学学院有机所做报告, 慷慨捐赠的. 经几个月船运送达. 这个厚礼却也给有机所带来了一阵烦恼. 书籍之多占据了整个会议室书架, 经过几年, 终于安排改放置于化学学院图书室. 北京大学在 2003 年开始引进 CrossFire 试用一年, 于 2004 年正式订购. 比 SciFinder Scholar 早订购两年. 在台湾, CrossFire 的订购使用比北大早十年, 由台湾教育部购买让所有高校使用. 对于印刷版 Beilstein, 除了最后一套为英文编辑外, 其他几套都是德文, 查找与阅读

化学信息学: (3)-0 专利_章节介绍与总揽(3). 专利(3)-0. 专利介绍与总揽本章的章节安排如下:(3)-1. 专利概况介绍 (历史/法律/特点)(3)-2. 专利分类 (各国专利分类/ 国家专利分类号)(3)-3. 各国专利 (中国专利/ 其他国家地区专利/ 德温特专利)(3)-4. 网络专利与查找(3)-5. 专利检索范例(3)-6. 专利总结相对于 "美国化学文摘" 与 "贝尔斯坦", 本章的章节安排比较不同, 没有刻意分成印刷版与网络版, 而是强调许多知识性介绍, 在检索方面则几乎着重在网络专利查找. 原因来自专利的特殊情况.根据世界专利组织调查, 90% 以上的最新技术都刊载在专利中, 而且有 70% 不再发表于其他文献. 世界先进国家都非常重视专利. 例如美国化学文摘, 创刊起始就报导专利, 每期仅有的三种期索引也有专利. 相较之下, 国内知识界对于专利的重视太小, 搜索与阅读资料多偏重于图书馆陈列的文献期刊, 工作研究成果也只往这些期刊投递发表. 这是需要校正的观念. 这种偏重图书馆文献的情况有其原因. 十几年前, 检索与阅览专利非常不方便, 必须乘车到国家知识产权局 (专利局) 查找. 因为专利文献的数量庞大, 一般图书馆无法容纳陈列.近年来, 由于电脑网络发达, 查找专利获得原始资料 "专利说明书" 变得非常方便, 几乎世界各国的专利说明书都很方便可以下载进入个人电脑. 相对的, 想获得图书馆收集的某些 "原始文献" 则相对困难. 目前多数这些期刊提供有免费下载近五年的文章内容, 年代久的则无法下载[font=Times Ne

化学信息学: (1)-1-1 美国化学文摘印刷版_概况介绍(1)-1 美国化学文摘印刷版 (CA)(1)-1-1 概况介绍(1)-1-1-1 CA 历史 美国化学文摘是美国化学学会于 1907 年创办的, 其前身是报导 Journal of America Chemical Society (美国化学会誌) 以及 Review of America Chemical Research 两期刊文摘的编辑室. 创刊时设址在 Washington D.C. 国家标准局里面, 次年搬到中北部伊利诺大学校内 (University of Illinois, at Urbana), 1909 年再搬到东部的俄亥俄州立大学校内迄今 (Ohio State University). 可以从网站 www.cas.org 了解美国化学文摘的各种信息.(1)-1-1-2 CA 特点 相较于其他化学检索工具, 美国化学文摘有以下明显的特点:1. 收录广泛且多: 收录了全世界 98% 以上两万多种化学相关的文献. 文献包括有期刊, 会议记录, 技术报告, 学位论文, 新书, 专利等类别.2. 检索途径多: 有近十种不同的检索途径, 例如关键词索引, 普通主题索引, 化学物质索引, 作者索引, 专利索引, 分子式索引, 登记号索引, 环系索引, 以及辅导性的资料来源索引, 索引指南等. 3. 历史悠久: 是现存化学文献搜索工具中历史最早的. 德国的 Chemisches Zentralblatt 虽然在 1830 年创刊, 但是 1969 年已停刊, 通用性也不如美国化学文摘.科学从业人员打算进行系统资料查找时, 立即想到的就是搜索美国化学文摘. 为什么是美国化学文摘? 什么是文摘? 为什么是美国? 中国化学文摘如何? 文摘怎么会和检索挂钩一起?首先回顾文摘 (abstract, 或译为摘要) 的定义. 文摘给出文章的大意[font=Times New

[b]职位名称：[/b]北京大学医学部精准医疗多组学研究中心生物信息数据分析师[b]职位描述/要求：[/b] 工作职责：1）利用各类生物信息软件和统计学方法进行质谱数据处理分析；2）针对特定生物或医学问题用已有方法分析质谱数据，撰写研究报告 招聘要求：1）生物信息学、计算机、自动化、数学、统计学 相关专业博士毕业；2）有生物信息学数据处理分析经验；3）有较强责任感和执行力[b]公司介绍：[/b] 北京大学医学部精准医疗多组学研究中心，在“双一流”的支持下，正式成立于2018年6月，为北京大学医学部直属二级单位。黄超兰教授担任中心主任。中心的发展战略基于临床医学热点和难点问题，通过临床医学，创新技术和基础学科的交叉，开展协同创新研究和研发，攻克医学重大难题。中心是集研发、学术交流、科技成果转化等为一体的研究中心，目标成为国内乃至国际领先的精准医疗研究组织。在“健康中国”的国策之下，中心以重要...[url=https://www.instrument.com.cn/job/user/job/position/57407]查看全部[/url]

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(5)-3 图书馆简介(5)-3-1 传统图书馆图书馆是查找图书以及借阅图书的所在, 占地广, 是一个城市的文明象征之一. 图书馆的布局至少含有以下几个区室:1. 图书室: 提供国内外图书, 供当场或借阅回去阅览.2. 期刊室: 提供国内外期刊, 包括有最新的现刊与书库中的旧刊3. 阅览室: 目前多变成学生复习功课的读书室. 读书环境与气氛良好, 是图书馆的另外一种特色服务.4. 工具书室: 工具书包括词典、手册、百科全书、图谱等, 提供阅读时出现问题的即时解答. 正式的工具书室有许多有意思的收藏与信息提供, 例如申请出国材料与早期地图, 值得进去浏览了解. 在图书或期刊室, 也有相对应小型的工具书书柜提供服务.5. 检索室: 有微缩胶卷室 (阅读数年前的报纸信息方便), CD 与 VCD 室, 以及近几年来逐渐扩大的电脑网络室.6. 目录室: 提供查找图书馆内藏书的信息, 可以按照排检法 (书名/作者/分类/主体) 或按语种 (中/英/俄/日) 查找. 随着电脑网络的发展, 传统年代目录室已逐渐式微, 取代的是电脑查找.7. 服务区: 包括咨询室、出纳台、复印室等各种服务柜台. 服务的内容多样, 包括图书馆馆际借阅服务等.(5)-3-2 网络图书馆随着电脑和网络的兴起, 图书馆开展了相关的业务, 形成虚拟图书馆, 提供更方便的服务, 可以从电脑进行图书查找, 借书预约与续借, 查找电子期刊, 下载信息到自己电脑文件夹中.如今, 每个知名的图书馆都有建立有网页, 提供特种特色的信息服务. 北大附件著名图书馆以及其网页地址如下:1. 北京大学图书馆: www.lib.pku.edu.cn2. 清华大学图书馆: www.lib.tsinghua.edu.cn3. 中科院文献情报中心: www.las.ac.cn4. 北京化工大学图书馆: www.lib.buct.edu.cn/wangluodaohang/shouye.htm5. 中国国家图书馆: www.nlc.gov.cn这些图书馆的网页中提供了国内外其他图书馆的网页, 可以进行链接.国外知名大学的图书馆网页部分如下, 可以从中获得更多其他国外图书馆的链接信息.1. 美国哈佛大学图书馆: www.harvard.edu/museums2. 美国加州大学 Berkeley 分校图书馆: sunsite.berkeley.edu/libweb3. 美国麻省理工学院化工系: www.mit.edu/cheme4. 美国国会图书馆: www.loc.gov5. 英国国家图书馆: http://portico.bl.uk

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8.4 网上化学软件 “工欲善其事，必先利其器”. 化学工作要有效率, 需要熟悉应用相关的电脑软件. 有机化学专业的人员经常用到的电脑软件至少有以下几种:1) Microsoft office: 写报告用的 Words, 储存整理数据的 excel, 总结与学术报告的 PPT2) Adobe Acrobat: 下载阅读与制作 pdf 文档3) Origin: 整理分析实验数据作图4) 波谱数据谱图处理软件: Mestrec, Nuts, Delta, WXNMR, MestreNova5) 化合物结构图绘制软件: Chemwindow, Chemsketch, ISISdraw6) 预测氢谱与碳谱, 咨询化合物命名: Chemdraw7) 查看化学图片: ACDsee, Photoshop8) 截图软件: HyperSnap9) 文件下载: SmartFPT, FlastFTP8.4.1 提供化学软件的网站网络上提供有许多化学相关的软件. 在百度等搜索引擎输入 “化学软件”, 便可以获得许多提供化学软件的网站信息, 有许多提供免费下载或采购的来源, 也有进一步介绍一些化学软件的使用功能或与其他类似软件进行评比.提供有多种特殊功能化学软件的网站有:8.4.1.1 国内化学软件网站1) ChIN 网页 (www.chinweb.com.cn)l 编有Chemical Software 目录，提供许多免费软件的信息以及用途简介.2)化学软件网 (www.truechemsoft.com)l 1.软件范例：Gaussian 98, Chemical Design Lab,