肿瘤分析测试

p 　　美国食品和药物管理局近日表示，已经授权Memorial Sloan Kettering癌症中心的MSK-IMPACT新一代测序肿瘤分析测定法作为体外诊断测试。此外，该机构还表示，它已经认可了纽约州卫生局(NYSDOH)作为FDA第三方IVD审查单位，包括类似的肿瘤分析测试。 /p p 　　FDA还正在建立一个II级监管通路，用于审查用于癌症患者的其他基于NGS的肿瘤分析测试。这个名称使得这些测试有资格进行510(k)的许可流程，可以直接向FDA申请，也可以通过NYSDOH等认可的第三方审核机构。 /p p 　　MSK-IMPACT分析了匹配的实体瘤/正常样品中的468个基因的突变，并寻找其他分子变化。其结果可能会告诉患者的癌症治疗，虽然他们不是结论性的或规定使用特定药物的标签。这是FDA批准的第一个实验室开发的肿瘤分析测试。根据该机构的说法，这项检测可以鉴定出比之前评估过的任何检测都更高的癌症特异性突变或生物标志物。 /p p 　　MSK医师José Baselga在一份声明中表示：“这一里程碑式的授权证明了MSK在快速扩大的基因组肿瘤领域的专业知识，将为今后的这种类型的批准开创先例。迄今为止，已有超过20,000名晚期癌症患者用MSK-IMPACT测序了他们的肿瘤。 /p p 　　该机构表示，其对MSK-IMPACT的行动提出了一个政策框架，为其他基于NGS的癌症谱分析工具的有效检查和可用性铺平了道路。“ /p p 　　作为其中的一部分，FDA最近将纽约州卫生部认定为IVD的第三方审查机构。展望未来，基于NGS的肿瘤分析测试已获得NYDOH批准的实验室不需要向FDA提交单独的510(k)申请，但可以要求其纽约州申请以及该州的审查备忘录和建议，被转交给FDA可能的510(k)许可。 /p p 　　FDA表示，它可能会认可其他第三方进行此类审查，并向该机构提出清理建议。 /p p 　　FDA专员Scott Gottlieb在一份声明中表示：“允许基于NGS的肿瘤分析测试由认可的第三方进行审查的目标是减轻测试开发者的负担，并简化这些类型创新产品的监管评估。他说：“随着研究领域的不断进步，我们正在对FDA的方法进行现代化改造，以便对开发商自愿寻求501(k)许可的实验室测试进行有效的授权。” /p p 　　Gottlieb说：“这是FDA正在努力寻找创新和灵活的监管方法的另一个例子，促进了创新技术的发展和高效交付。 “我们将继续寻找机会，在可能的情况下提高监管效率，以推动改善美国健康的工具的更广泛的获取，同时保持患者应该从他们的FDA审查产品期望的安全性和有效性标准。 /p p 　　FDA设备和放射卫生中心主任Jeff Shuren表示，FDA认识到患者肿瘤突变对于护理计划的重要性及其结果，FDA与NYSDOH和Memorial Sloan Kettering密切合作，评估MSK-IMPACT测试。他说：“这次合作是FDA如何能够与医疗和发展界合作，尽快审查创新测试的一个很好的例子。 /p p 　　FDA通过重新上市前审查路径审查了MSK-IMPACT测试，该路径专为中低风险设备设计，这些设备是新颖的，而且没有合法销售或预测的设备。 /p p 　　对测试分析性能的评估发现，它的准确率超过了99%，并且以大约5%的频率检测到突变。此外，该测试检测了微卫星不稳定性，在多种癌症类型的175个病例中与传统方法的92%一致。 /p p 　　纽约州以前曾批准实验室开发的检测方法在纽约州作为临床检测使用。 MSK向FDA提交了一份MSK-IMPACT的重新申请，其中包括并延长了提交给纽约州的信息，以便通知和加快FDA的授权。 /p p & nbsp /p

只要抽一管约5ml的外周血就可检测28种常见肿瘤。昨天，由苏州海苗生物科技有限公司自主研发的泛基因检测试剂正式上市，其检测灵敏度达93.76%，特异性达84.79%，阴性预测值达98.07%，实现了国内泛肿瘤早筛领域的重大突破。在当天举行的研发新产品发布会上，海苗生物展示了其产品的创新技术与性能特点。该款泛癌基因检测试剂，基于甲基化特异性PCR（MSP)技术，实现了对血浆样本中目标基因甲基化的检测。通过对检测结果进行矩阵化、多维度的异常甲基化水平评估，从而为胰腺癌、肝癌、胃癌等28种常见和高发癌症提供有效的辅助诊断依据。其采用独创的 ECS纳米磁珠提取技术极大地提高了低浓度小片段游离核酸提取效率，MOLOCK纳米抗体分子锁技术、UMSA超多重PCR扩增技术等大幅提高检测的灵敏度和特异性；独创的AI算法显著提高数据分析的专业性、科学性，大大提升了样本检测结果的准确性和可靠性。图说：由苏州海苗生物科技有限公司自主研发的泛基因检测试剂正式上市。主办方 供图（下同）在全球泛肿瘤早筛赛道，美国Grail公司是公认的领军企业，目前仅有其泛肿瘤早筛产品Galleri实现了“一管血检验几十种癌症”。“与Grail公司采用NGS技术不同，海苗生物采用的是QPCR技术，不仅成本更低，效率也更高。”海苗生物创始人谭淼博士表示，在国际市场上，Grail公司的同类型泛癌检测产品市场客单价在1万美元左右，一周左右才出结果；海苗生物公司产品的客单价可以降至300美元左右，且一天内就能出具报告。公司也因其在泛肿瘤早筛领域的突破性创新优势，在2024第三届ZAODX世界肿瘤早筛大会上荣获“金筛奖最具投资价值潜力企业”。发布会上，来自美国的全球生命科学领域领军企业和国内知名医疗集团分别与海苗生物签署了项目合作与新品合作协议。一直以来，海苗生物专注于基因表达调控与癌症发病机理的研究，以及新发突发传染病领域诊断试剂的开发。其研发团队在美国诺贝尔化学奖技术平台上进行了自主技术研发创新，将技术平台检测灵敏度提高了100倍，通过了该诺奖发明公司实验室的验证和认可，并获得其独家A轮投资。图说：新品签约仪式。以公司获得美国FDA证书的产品为例，“IVD行业要拿到美国FDA证书很难。当初海苗生物研发出了产品，但对出口的具体流程并不熟悉，在政府领导调研时反馈了这一需求，立刻就得到了指导，是政府相关部门手把手牵着海苗生物出海。”发布会上，谭淼回忆这款产品出海的经历，对“苏州速度”赞不绝口。如今她把企业落户在太仓，把家也搬过来，成为一名新苏州人。图说：泛癌基因甲基化检测试剂盒。目前，海苗生物公司已申请专利48项，获得授权专利18项， 11个产品取得中国医疗器械证书，59个产品获得欧盟CE证书，通过了ISO13485体系认证。先后获评国家高新技术企业、江苏省级研发型企业、江苏省“双创计划”扶持企业、姑苏创新创业领军人才企业等殊荣。

背景介绍近期，阿斯利康公司药物研发部门的Eleonora等人对抗肿瘤药AZD4635的合成工艺进行了优化，通过引入连续流氧化以及在线气液分离和在线监控技术，完成了该原料药的合成。连续流技术的引入，将工艺从传统的5步反应缩短为3步，总收率提高了4个百分点。其中亮点多多，请随小编一起了解一下他们的研究细节吧！现有的工艺合成AZD4635需要5步反应，虽然实现了6.5kgAPI的合成，但是该工艺步骤繁琐，且需要使用Pd、Ir等贵金属催化剂。图1. 3步合成新工艺与现有5步合成工艺对比新工艺只需三步即可得到最终产物。且使用价廉物美的氧气作为氧化剂，大大节省了原材料成本。氧气是一类十分清洁的氧化剂，廉价易得，且反应不产生副产物。然而，氧气也是一类助燃剂，在间歇釜条件下，极易因为静电或者局部过温，发生燃烧甚至爆炸等事故。所以化工行业有“宁做十个还原，不做一个氧化”的说法。连续流技术的应用，可以通过技术手段及时消除静电并精确控制温度，从而极大降低反应失控风险。具体研究内容一、反应条件初步探索作者先使用间歇釜对反应的溶剂、催化剂和碱等条件进行了探索。最终DMSO被选作溶剂，Cu(OAc)2被选作催化剂，进行后续研究。表1. 釜式反应条件测试实验二、连续流装置搭建连续流工艺流程图如下图所示，原料（化合物3）溶解在DMSO中，加入5 mol%Cu(OAc)2作催化剂，以3ml/min的流速泵入连续流反应器（长度90mm，内径9.5ml，持液体积3ml）。反应物氧气通过质量流量计后，以约20ml/min的流速进入反应器，在120℃左右的温度下反应，物料经背压阀（压力设定35bar）流出后，经过Zaiput分离器完成气液分离，液体物料流过原位红外流通池后，进入收集罐。表2. 连续流工艺条件优化作者在反应出口设置了Zaiput分离器，将未反应的氧气与原料进行在线分离，并以1L/min的流速的氮气对剩余氧气进行稀释（使尾气中氧气的含量在2%以下），确保尾气的安全。【编者】Zaiput分离器，主要原理为两相不互溶的流体在多孔分离膜的表面张力差不同。本实验中氧气和反应后有机混合溶液形成两相不相容的混合流体，通过Zaiput将氧气分离出来。这样可以减少由于流通池中的氧气气泡而产生的背景噪声，提高在线原位红外测试结果的稳定性和准确性。康宁在大中华区独家代理的MIT 孵化的Zaiput连续分离器，不仅用于气液相的分离，在液液相连续分离中也有着广泛的应用。与康宁微通道反应器相配套，Zaiput分离器产品覆盖实验室小试到千吨级工业化生产。感兴趣的朋友，可拨打下方400电话，联系我们。红外光谱图中，化合物3和4分别在1689cm-1和1675 cm-1，1693 cm-1有不同的吸收峰，所以反应过程中可以用原位红外光谱（Mettle-Toledo React IR 15）进行在线分析，对反应过程进行在线监控。三、连续流工艺优化在连续流装置上，作者对反应温度、物料浓度、催化剂用量以及氧气的摩尔当量等参数进行了快速优化，并通过红外和HPLC等对反应过程进行检测。最后选择20倍体积的DMSO作溶剂， Cu(OAc)2用量5mol%，原料流速3ml/min，氧气流速20ml/min（约3当量），在120℃条件下，连续反应，表观停留时间约52s，获得了85%分离收率。作者用70g化合物3为原料，连续运行约7小时，未发生任何固体堵塞。所收集的反应混合液加入等体积的水析出固体，浆液过滤后干燥后获得黄色固体化合物4（分离收率85%）。化合物4经过缩合反应后，获得原料药AZD4635.研究结果通过使用连续流反应器进行连续氧化，缩短了AZD4635的合成路线，总收率提高4个百分点；使用连续流反应器对反应温度、物料浓度、催化剂用量以及氧气的摩尔当量等参数进行了优化，最终获得了最优的反应条件；三步反应全连续，在线分离和检测，极大地提高了过程效率；连续氧化反应工艺以70g化合物3为原料，连续反应7小时，未发生堵塞，并最终以85%的分离收率获得目标化合物4；解决了传统间歇釜工艺的安全性问题，工艺简单、原子经济性好，绿色环保。参考文献：Org. Process Res. Dev. 2022, 26, 1048−1053编者语该工艺是典型的气液非均相反应，这一类反应在微通道反应器上，尤其是康宁微通道反应器上，具有很高的可行性。由于康宁反应器可以实现从实验室到生产的无缝放大，可以快速实现该类工艺的规模化生产。康宁在氧气氧化反应中，已经有积累了10多年的工业化经验。如果您有空气氧化、氧气氧化或其他氧化反应，欢迎和康宁团队进行交流。康宁代理的Zaiput连续分离器和NMR在线检测设备，可以帮助您实现多步连续反应的全连续。

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p 　　Illumina合作伙伴燃石医学获批中国首个NGS多基因肿瘤临床测试盒。该试剂盒基于Illumina的桌面测序设备MiSeqDx平台开发，燃石医学卓越的临床应用转化开发能力和高质量的测序技术强强联合，为肿瘤临床市场提供了先进的测序解决方案。 /p p 　　Illumina大中华区市场总监倪涛表示，Illumina作为基因测序设备提供者，在中国市场重视与合作方开发基于NGS技术的肿瘤分子诊断试剂盒，此次与燃石医学的合作，正是利用了Illumina先进的MiSeqDx桌面测序设备。此次，燃石医学肿瘤panel在国内的获批，标志着NGS作为临床诊断平台为帮助肿瘤治疗决策方面达成了里程碑式的阶段，未来也将有更多的NGS相关试剂及仪器获批，造福中国患者。 /p p style=" text-align: center " img width=" 600" height=" 332" title=" ZZ.jpg" style=" width: 439px height: 262px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/c2f24a2e-a4f5-48dd-a580-18e202fc223b.jpg" / /p p 　　2018年7月23日，国家药品监督管理局经审查，批准了广州燃石医学检验所有限公司(以下简称 “燃石医学”)的高通量检测创新产品 “ span style=" color: rgb(0, 176, 240) " 人EGFR/ALK/BRAF/KRAS基因突变联合检测试剂盒(可逆末端终止测序法)”(以下简称 “试剂盒”)的三类医疗器械产品的注册。 /span /p p 　　 span style=" color: rgb(0, 176, 240) " 该试剂盒是中国首个基于高通量测序技术(NGS)以及伴随诊断标准审批的多基因肿瘤突变联合检测试剂盒，将用于帮助非小细胞肺癌患者精准选择靶向药物治疗的方式。 /span 2016年9月，国家药品监督管理局批准该试剂盒作为中国首个肿瘤NGS检测产品进入 “创新医疗器械特别审批程序”。而几乎整整两年后，历经临床试验大量临床样本的严谨验证，通过注册生产质量体系的审查考核，国家药品监督管理局终于颁出这意义深远的 “ span style=" color: rgb(0, 176, 240) " 肿瘤NGS第一证 /span ”。 /p p 　　与传统基因检测手段相比，通过NGS技术，患者只需经过一次检测，即可同时了解多个肿瘤治疗相关基因的热点及非热点突变全景，并囊括点突变、插入缺失、重排(融合)等多种变异形式，为医生及患者提供多种靶向药物的一站式检测解决方案，节省检测样本和检测时间。 /p p 　　NGS在精准医疗及伴随诊断领域的价值已经获得临床专家的广泛认可。而由于其技术的复杂性，NGS质量体系的标准化、规范化成为它在临床常规开展的瓶颈。随着燃石医学这一试剂盒的获批，肿瘤NGS检测将得以正式进入临床医院检测科室。毋庸置疑，这对于NGS检测惠及更多肿瘤患者具有深远的里程碑式的意义。 /p p 　　与此同时，位于广州的燃石医学-CTONG联合实验室已于今年5月获得国家卫生健康委员会临检中心颁发的“ span style=" color: rgb(0, 176, 240) " 高通量测序实验室” 技术审核合格证书。燃石医学的NGS检测平台可作为自建项目(LDT)为更多癌种、更多疾病阶段的肿瘤患者提供临床样本检测服务 /span 。目前，这是我国唯一获得中国肿瘤高通量测序实验室技术审核与美国CLIA实验室NGS自建项目双重认证的机构，检测能力经过国内外相关质控规范系统双重严格评审。 /p p 　　燃石医学创始人兼首席执行官汉雨生先生表示： “燃石医学始终致力于开发专业、准确、灵敏的肿瘤二代测序检测技术。感谢国家相关监管单位和广大专家为将优秀的创新技术加速引入临床的不懈努力。燃石医学正在攻坚技术，研发肿瘤早筛产品，希望将肿瘤诊断时间进一步提前，助力提高肿瘤治疗生存率。” /p p /p

【人物专访】从事分析化学的人都知道，红外光谱法作为一种近代仪器分析方法，已经成为对各类化合物进行定性分析、结构分析以及定量分析的有力手段，在化学分析中应用得非常广泛，但是把它应用在肿瘤诊断中却是大家所不熟悉的。2004年6月，北京市科委通过了由北京大学化学院吴瑾光教授牵头，北京大学第三医院、北京大学口腔医院、中国科学院化学研究所徐端夫院士课题组、西安交通大学第一医院、北京瑞利分析仪器公司共同完成的“肿瘤临床诊断的红外光谱新方法”的科研项目的成果鉴定。该项目率先提出了一种可用于肿瘤诊断和临床医疗应用的红外光谱肿瘤检测的新方法，它可在3-5分钟快速准确地判断肿瘤，实现了对肿瘤的在体、原位、实时检测，可为外科医生选择手术方案提供快速诊断报告，对手术治疗过程很有帮助。检测结果与病理诊断结果对照，两者符合率在90%以上，该成果具有原创性并拥有自主知识产权。成果通过鉴定的信息在本网发布以后，引起了广大网友的兴趣和关注。因此，笔者（以下简称：instrument）近日专程走访了该项目的负责人北京大学吴瑾光教授（以下简称：吴）及项目合作者中科院化学所徐端夫院士（以下简称：徐）。　　Instrument：吴教授，您好！我们知道这个课题是您牵头做的，您最初是怎么想到要用红外光谱进行肿瘤诊断的呢？　　吴：我之所以能做这方面的研究，有几个原因。首先，要感谢北京大学宽松的学术环境。北京大学在不耽误正常教学与科研工作的前提下，允许和鼓励我们大家做自由选择的研究工作。正是北京大学给我们创造了这样宽松的学术氛围，我才有了这个条件。我认为这也是每一个潜心做探索性基础研究的科学工作者不可缺少的基本条件。其次是我的家庭背景。我家有好些人是从事医学工作的，有一些还是肿瘤专家。我本人也有许多医学界的朋友。在工作之余经常交流讨论，耳濡目染，也就自然而然地关心这方面的问题，有机会了解和接触到一些与临床医学有关的实际问题，有了化学和医学结合的机会。再有就是我的本职工作，我从上世纪60年代起就一直用光谱方法研究络合物结构。70年代末，开始与外科大夫合作，研究成分和结构都不清楚的胆结石。通过和北京大学第三医院、西安医科大学第一医院和国外医疗专家的长期合作，有机会接触临床医学第一线，深入了解和共同探索临床医学中的难题。通过学科交叉和建立良好的人际关系，为我做肿瘤研究打下了坚实的基础。到了90年代，当肿瘤成为人类社会共同关注的医学难题，而现有的各种诊断方法都满足不了手术治疗的需求，非常迫切需要发明一种更快捷，更有效的检测新方法时，我们就把研究重点转移到肿瘤问题了。　　instrument: 徐院士，您的课题组作为这个项目的合作单位，您怎么看这个问题？　　徐：除了以上这些客观原因外，我想说最重要的是“创新性研究的突破性进展源于长期基础研究的科技积累”。如果没有深入细致的基础研究很难出这样的成果。吴教授是化学家，是从事红外光谱和稀土化学研究的。她想到了把红外光谱应用在肿瘤诊断上是化学和医学的结合，是化学和医学的学科交叉研究，也是化学家和医疗专家合作的结果，这是国内和国外都在大力倡导的模式。然而，如果没有吴教授自80年代以来对多种重要生物分子红外光谱基础研究的功底和素质，一般是想不到做这种课题的，而她在做上述基础研究时也并没有将用于癌症诊断的明确目标。因此，分子光谱作为一种基础研究手段，到了适当时候就可能转化为发明、创造。　　Instrument: 吴教授,您能给我们介绍一下这个项目的科研过程吗？　　吴：好。这个项目的科研过程可以归纳为三个阶段。　　第一个阶段是理论分析。传统方法对肿瘤作病理检验至少需要30分钟，这样长的化验时间远远落后于临床手术治疗的需求。而且常规的影像学检验方法大约只能检测1厘米以上的肿瘤，这时候肿瘤往往已经比较难治了。我们换个角度，以化学家对分子结构变化的观点来考虑这个问题，我们认为癌变过程就是组成细胞内的生物分子结构发生了变化。从理论上讲，红外光谱法应该能在细胞发生分子结构变化的时候检测出这种变化。这是我们研究的理论基础和出发点。　　第二个阶段是实验阶段。现在国际上通常用匀浆或切片等方法检测红外光谱，这些常用的方法满足不了我们的要求。因此，我们突破常规思维模式，发展了一些新的检测方法。现在可做到在不破坏样品的前提下直接对肿瘤样品进行检测。我们和医院合作，首先对冷冻保存的样品进行检测，然后把红外光谱仪搬到手术室，在手术治疗现场进行肿瘤检测。到目前为止，已经积累了多种肿瘤的红外光谱图近20000张，较系统地研究了10多种肿瘤，包括食道、胃、肠、肝、胆囊、肾、肺、甲状腺、腮腺、乳腺等等。根据其光谱特性归纳比较这些实验数据，从化学原理上反复论证红外光谱法检测肿瘤的新方法的科学依据，并把检测结果与常规病理检测相比较，严格论证该方法的普遍适用性和实际应用的可能性。初步研究结果表明，两者的符合率可高达94%。　　第三阶段就是我们即将进行的临床实验研究。到现在为止，我们还处于科学原理的发现、发明阶段，到真正的临床医学实际应用还有一段距离。我们将扩大合作医院的范围，加快进行医院临床研究的步伐。这是我们今年的主要工作。　　Instrument:徐院士，这个过程您也都了解，那么您觉得在这个过程中最困难的是什么呢？虽然红外光谱诊断法与病理检测结果符合率已经高达94%，但对于剩下的6%是否有人质疑呢？　　徐：发现和发明一个肿瘤快速诊断新方法是一个艰苦的漫长的探索过程。其次是一个大量原始数据积累和数据分析、归纳整理的总结提高过程。困难一定很多！不但我们没有经验，国外也没有这方面的经验可供参考借鉴。我认为最重要是要突破框框，突破传统思维模式和传统观念。深入临床第一线，亲自做调查研究，一切从实际出发，而不是简单地跟踪国外文献报道的轨踪。不但对自己走的路有自信心，还要使外行的专家相信你，支持你，这是最重要的！也是最困难的！第二就是谱图辨认。谱图的辨认是肿瘤诊断中非常重要的环节。能否找到规律性，直接影响项目的成功与否。为辨认这些谱图首先要自行建立肿瘤光谱数据库，要有超前的意识和雄厚的基础，工作量非常大。通过大量实验研究，我们才能界定良性与恶性的肿瘤分子光谱判据。　　至于6%的不符合率，我们认为，这是很正常的现象。虽然病理切片检验结果是金标准，但是金标准也不一定是十全十美的。随着学术研究和医疗水平的提高，对肿瘤的恶性、良性或中间过渡状态，红外光谱法与显微镜病理检验有一定差别，红外法可提出更深入的认识，发现和研究这种差别将深化对肿瘤分子结构的认识。　　Instrument:吴教授，您发明了红外光谱肿瘤诊断新方法，它与传统的红外光谱法进行化学分析测试相比有什么区别？它有什么优势？对于仪器有什么特殊要求？北京瑞利分析仪器公司在这个项目中发挥了什么样的作用？　　吴：红外光谱用于肿瘤诊断和用在化学测试的原理是一样的。两者的区别在于红外光谱仪用于肿瘤诊断要符合医疗工作的要求。仪器较特殊之处就是有光纤附件，这种光纤需要能够承受消毒液的消毒及外科手术过程必须经历的一切程序。　　红外光谱法与其他各种肿瘤诊断法相比，优点表现在：　　1． 常规冰冻切片检验法大约要半个小时，红外光谱法只需要3-5分钟。　　2. X射线检查法可能对人体有害，而红外光谱法对人体没有伤害，无任何副作用。　　3. 影像学诊断法是根据物理性质差别来判别肿瘤的，而红外光谱法是根据肿瘤与正常组织的化学组成和分子结构不同来判别肿瘤的。　　4. 两者的原理不同，各有各的优点。　　北京瑞利分析仪器公司是我们的合作单位，主要负责研制适用于肿瘤检测或诊断的医疗专用红外光谱仪。他们按照我们的实验要求，专门设计制造这种新型的红外光谱仪，从软件到硬件都做了许多改进。该仪器有下列优点：　　1. 在仪器研究中，采用了很多新的技术，有很多不同于常规红外光谱仪的特点。　　2. 体积小，方便携带。　　3. 仪器性能稳定可靠，可以随意搬动。　　4.仪器价格低廉，有相当强的市场竞争力。 　　Instrument:吴教授，无创伤红外光谱诊断肿瘤新方法是你们的最新成果，请您简单介绍一下。　　吴：我们发现，当甲状腺、腮腺和乳腺等皮下腺体长肿瘤时，患者皮肤的红外光谱会有变化。我们前前后后做了几百次实验，证实了正常组织与病变组织体表皮肤的红外光谱确有差别，且有规律性，这种测定方法相当简单，无创伤、无痛苦。红外光谱的变化规律与病理诊断结果有相关性。这是一个突破性新发现。我们正在做更深入细致的研究。　　Instrument:徐院士，这个工作已经做了这么多年，您再给我们介绍一下这个课题今后还有哪些工作要做，好吗？　　徐：今后要做的工作还有很多，现在做的这些工作只是万里长征的第一步。今后首先要尽快把红外光谱数据库建立起来。谱图库要把病人的基本资料、病理、谱图、谱图说明等内容都输进去。现在我们已经积累了20000个谱图，但是还不够丰富。这项工作要消耗大量的人力、物力。更为重要的一项工作就是我们希望通过临床研究，使这项成果尽快接受大量临床医学研究的考验，并能为广大医疗专家、病理专家和病人所接受。希望医疗专用的红外光谱仪器设备逐渐完善，早日定型。还有就是希望该方法的基础研究和应用研究不断深入，不断完善。 　　不知不觉半天的时间就在我们轻松愉快的交谈中过去了，采访结束的时候，吴教授、徐院士一再强调，这个新方法还只是原理性的研究，希望能对于临床医学研究添砖加瓦，探索一条新路。这项研究成果目前还不具备大规模推广的条件，还有很多工作要做，还需要很多方面的共同支持。　　最后我们仪器信息网衷心地祝愿吴教授、徐院士的科研工作早日通过临床研究成果鉴定，到那一天，我们再相约！ 　　联系人：吴瑾光　　联系电话：010-62757951　　E-mail：wujg@pku.edu.cn　　单位地址：北京大学化学院

p style=" text-align: justify " & nbsp & nbsp 近日，CFDA评审委员会批准天津诺禾致源生物信息科技有限公司（下文简称“诺禾致源”）配套的“人EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突变检测试剂盒（半导体测序法）”分析软件上市，这也是国内首个基于肿瘤NGS数据分析软件的III类医疗器械注册证。 br/ img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201809/uepic/0b7aa31e-a98f-4d98-8c49-a7859e09e5ec.jpg" title=" 1.jpeg" alt=" 1.jpeg" / /p p /p p style=" text-align: justify " & nbsp & nbsp “人EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突变检测试剂盒（半导体测序法）”于2018年8月13日获批上市，是基于多重PCR目标区域富集建库与半导体测序的技术体系开发，用于检测非小细胞肺癌患者肿瘤组织中与靶向治疗密切相关的六个基因的突变状态，全面提示患者治疗相关的敏感、潜在耐药及基因共突变信息，筛选适合接受靶向药物治疗的患者。 /p p /p p style=" text-align: justify " & nbsp & nbsp 分析软件主要是配合该已获批的“人EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突变检测试剂盒（半导体测序法）”在DA8600测序仪上使用，临床上用于对来源于人体的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织样本经半导体测序法测序产出的基因测序数据（包括DNA数据和RNA数据）进行读取和分析，给出非小细胞肺癌相关基因EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1的单核苷酸突变（SNV）、短序列插入或缺失（InDel）突变以及基因的融合（Fusion）信息，并出具检测报告。为临床对非小细胞肺癌选择肿瘤靶向药物治疗阶段提供参考。该分析软件适用于医院、第三方临床检测机构、科研院所和高校对需要进行FFPE样本中的DNA和RNA进行基因突变检测的人，样本分析流程图如下： br/ /p p style=" text-align: center " img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201809/uepic/ff75a7cf-5aae-49d0-b7a8-9f12bebc8bc6.jpg" style=" " title=" 2.jpeg" / /p p style=" text-align: center " img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201809/uepic/44b64b22-9f6e-42c6-a959-7ed150e13d72.jpg" style=" " title=" 3.jpeg" / /p p /p p /p p /p p style=" text-align: justify " & nbsp & nbsp 软件的特点和优势主要体现在三个方面：（1）分析流程自动化。DA8600产生的数据可自动导入分析软件，搜集DNA的SNV和InDel的检测结果，对RNA数据进行融合（Fusion）基因检测，整合结果生成报告，从而实现测序数据的分析自动化。（2）系统实时监控。对计算机的CPU、内存和SWAP以及磁盘使用量实时检测，避免使用量过大而影响数据分析。（3）效率高。在确保与测序仪的连接速度& gt 10MB/s情况下时，完成一个run的测序数据（文件大小10GB ）分析需要的时间＜2小时。 /p p style=" text-align: justify " & nbsp & nbsp 性能验证结果显示，对EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA的检测灵敏度可达100%，特异性均在99.24%以上；对于ALK、ROS1融合基因的检测灵敏度可达100%，特异性均在99.74%以上。 /p p style=" text-align: justify " & nbsp & nbsp 诺禾致源的“人EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突变检测试剂盒（半导体测序法）”分析软件的获批将提高检测数据分析的效率和准确度，简化报告出具过程，配合试剂盒使用，将使更多的NSCLC患者接受更全面、精准、快速的靶向治疗相关基因检测。同时，此次多基因检测试剂盒及配套的分析软件系统的获批，更是诺禾致源布局肿瘤NGS分子诊断领域的重要起点。此前，诺禾致源围绕该检测试剂盒进行了一系列的DNA提取备案等，结合此次多基因检测试剂盒和“癌症基因数据处理软件”的获批，诺禾致源实现了从核酸提取试剂盒、建库测序试剂盒、数据分析软件全流程的产品备案及注册，力图为医院提供一站式肿瘤NGS分子病理诊断整体解决方案。 /p p br/ /p

p 　　国家卫计委11月30日消息，目前我国正在制定“精准医疗”战略规划，或将纳入到“十三五”重大科技专项中。 /p p 　　精准医疗主要由基因测序等顶尖技术构成，将改变现有的诊断、治疗模式，为医学发展带来一场变革。据透露，我国将研发一批国产新型防治药物和医疗器械，形成一批我国定制、国际认可的疾病诊疗指南、临床路径和干预措施，显著提升重大疾病防治水平，针对肿瘤、心脑血管疾病、糖尿病、罕见病分别制定8-10种精准治疗方案，并在全国推广。 /p p strong 　　政府高度重视 /strong /p p 　　国家卫计委官员告诉中国证券报记者，本次制定的“精准医疗”战略规划，系国家卫计委会同国家科技部、中国科学院等中央部委，按照中央领导同志的批示，联合一批顶尖科学家研究制定的。 /p p 　　据透露，国家相关部委获悉美国的精准医疗计划后，很快将这一计划专文上报国家高层，高层随即批示国家科技部牵头调研，国家科技部鼓励中国科学院北京基因组研究所在这一领域深入钻研。 /p p 　　关于这项顶尖的科研计划，今年以来政策方连续推出举措：今年3月27日，我国发布了第一批肿瘤诊断与治疗项目高通量基因测序技术临床试点单位名单。4月15日，国家卫计委和科技部组织生物医药等领域专家，同中国科学院等部门共同研讨精准医学研究计划。5月10日，国务院发布《关于取消非行政许可审批事项的决定》，其中第31项是关于取消第三类医疗技术临床应用准入审批，取消的审批项目包括原来由国家卫计委负责的造血干细胞移植、基因芯片诊断、免疫细胞治疗等第三类医疗技术临床应用。 /p p 　　据介绍，在精准医疗领域行动最快的是英国。英国政府2012年发起大型测序研究项目——“10万基因组计划”，即对英国国民医疗保健制度记录(NHS)中的10万名病人的完整基因组进行测序，目标是根据基因组学和临床数据制定个性化的癌症和罕见疾病疗法，并使NHS成为“世界上第一个将提供基因组医学作为日常护理一部分的主流健康服务体系”。迄今为止，英国已经对几百个基因组进行了测序，预计2016年测序完成1万个样本，到2017年完成10万个样本。 /p p strong 　　大数据分析护航 /strong /p p 　　精准医疗要做到个性、高效及预防，前提是疾病的筛查和诊断。因此，开展精准医疗，首先是要发展基因测序和大数据应用。从精准医疗的过程来看，产业链可以简单分为诊断和治疗两个部分。诊断过程主要涉及分子诊断技术、大数据及云计算的应用，通过对单个患者相关样本的采集检测，并与数据库中相关疾病的资料进行比对，得出相关诊断结果。在治疗阶段则可以根据诊断的结果实行“量体裁药”。 /p p 　　大数据分析将在精准医疗中发挥巨大作用。精准治疗实施的前提是基因测序技术，而基因测序后产生的数据则有赖于大数据的比对分析。一个完全测序的人类基因组包含100GB-1000GB的数据量，这在解读上有很大困难，需要专门的数据库进行数据信息的横向与纵向比对分析。国外很多公司都建立了自己的大型数据库并开发相关的软件进行快速数据分析。例如Myriad genetics公司拥有专有数据库来进行大数据的一体化分析，可用来解释不确定的遗传检测结果。Illumina公司开发出BaseSpace的云计算与存储平台。SevenBridges Genomics在人类基因组排序和分析中综合应用了云计算和NoSQL数据技术，推出EC2、S3和MongoDB等。 /p p 　　A股上市公司荣之联(002642,股吧)凭借在高性能计算和大容量存储方面积累的技术优势，为华大基因设计、建设和维护位于深圳和香港的生物信息超算中心，成功地解决了基因测序形成的海量数据在并行计算和存储等方面的难题。目前，华大基因具备了每秒运行157万亿次的超级计算能力，数据存储量达12.6PB，基因测序能力位居全球第一。 /p p 　　大数据比对分析后所得到的信息，可为个体化药物设计提供指导，实现“量体裁药”。目前众多预测性基因检测项目中最具有实际应用意义的是“药物基因型检测”，即针对人体发病基因片段设计靶向药物，并用大数据分析药物将要产生的反应、药效、敏感性以及副作用的情况，从而筛选出最佳治疗方法和个体化的给药方案。“量体裁药”将在很大程度上减少临床用药不当，提高疗效与降低医疗费用，为未来医学指明方向。 /p p 　 strong 　肿瘤检测市场先行 /strong /p p 　　国家卫计委医政医管局今年4月公布首批肿瘤高通量基因测序临床应用试点单位名单。意味着肿瘤病种的基因测序得到监管层首肯。 /p p 　　达安基因控股孙公司广州达安临床检验中心及迪安诊断全资子公司杭州迪安医学检验中心入选首批试点单位名单。卫计委指出，将通过试点，做好高通量基因测序技术的验证与评价，逐步完善相关技术规范，提高高通量基因测序技术在肿瘤诊断与治疗方面的应用和管理水平。除上述两家外，入选首批试点的单位还包括中山大学附属肿瘤医院、深圳华大临床检测中心等。 /p p 　　2006年我国第三次居民死亡原因抽样调查结果显示，30年来，乳腺癌死亡率上升了96%，而肺癌死亡率更是狂飙465%。根据《世界癌症报告》统计，2012年中国癌症发病人数为306.5万，约占全球发病的1/5 癌症死亡人数为220.5万，约占全球癌症死亡人数的1/4。对这类恶性疾病的治疗，一方面是加大治疗药物的研发突破，另一方面应从精准治疗角度进行治疗技术的突破。 /p p 　　业内人士介绍，当前的肿瘤治疗正逐渐从宏观层面对“症”用药向更微观的对基因用药转变，实现“同病异治”或“异病同治”，精准治疗已经成为肿瘤治疗的公认趋向。鉴于肿瘤基因测序的市场广阔的前景，继无创产前测序争夺战开展数年后，国内多家基因公司开始进入肿瘤检测市场，开始争夺这块大蛋糕。 /p p 　　此前，肿瘤个体化治疗仅由国家卫计委批准了中南大学湘雅医学检验所、北京博奥医学检验所和中国医科大学第一附属医院，三者皆为政府背景，开展进度缓慢。随着3月底国家卫计委公布了首批肿瘤高通量基因测序临床应用试点后，个别公司已先下手为强。华大基因旗下华大医学的进展最为快速，肿瘤检测即华大医学“生死战略”战略中的“死”战略之一。 /p p 　　华大医学的肿瘤套餐已于近日出炉并正在推向市场，目标客户既包括健康人群、高危人群，也可辅助治疗、预后监控。此套餐涉及肿瘤种类是目前中国市场上最为全面的。健康、高危人群适用于“遗传性肿瘤筛查”，其中包括男性15种、女性16种常见肿瘤的筛查，乳腺癌、卵巢癌、肺癌等常见癌症均在套餐范围内 罹患肿瘤的患者则适用于个体化治疗套餐，定位于针对性用药、预后复发监控等。 br/ /p

p 　　2018年8月13日国家药品监督管理局批准了诺禾致源的“人EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突变检测试剂盒(半导体测序法)”下文简称“多基因检测试剂盒”)。该多基因检测试剂盒用于体外检测非小细胞肺癌(NSCLC)患者肿瘤组织样本中基因的变异状态，辅助临床医生判断患者从吉非替尼、奥希替尼、克唑替尼等靶向药物中的获益情况。该多基因检测试剂盒的获批是诺禾致源强势布局肿瘤分子诊断检测市场的标志性事件。 /p p style=" text-align: center " img width=" 600" height=" 345" title=" 2018.8.14 1-2.jpg" style=" width: 431px height: 254px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/770bbfbe-6270-40cb-97ef-d5e6626becbc.jpg" / /p p 　　该多基因检测试剂盒是目前已获批产品中基因数目最多、位点最多、报告周期最短的试剂盒。除此之外，诺禾致源还围绕该检测试剂盒进行了的核酸提取试剂盒备案、癌症基因数据处理软件III类医疗器械的申报等一系列工作。 /p p style=" text-align: center " img width=" 599" height=" 400" title=" 2018.8.14 1-1.jpg" style=" width: 416px height: 248px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/9be1baed-16d0-411a-91c8-7c212d5b10f8.jpg" / /p p 　　此次选择Thermo Fisher技术平台的DA8600测序仪作为其NGS试剂盒的首发注册平台，背后的取舍必然有其独到的逻辑。横向对比现有的NGS测序平台，DA8600已获CFDA批准用于肿瘤基因检测，同时具备对环境要求相对较低、通量适中、检测周期短等优势，尤其适合在医院内开展肿瘤基因检测。2017年6月，基于该技术体系的Oncomine Dx Target Text试剂盒获FDA批准上市，全球最大规模的临床试验NCI-MATCH也采用了该技术体系。诺禾致源早在2014年便开始基于该技术平台开展试剂盒的注册申报工作，三方在技术平台选择中的一致性或许并非巧合，临床应用中的多项优势才是该平台深受亲睐的关键。 /p p 　　“随着肿瘤致病机制研究的不断深入，基因测序技术在新型药物的研发和临床试验中积累了大量的数据。在巨大的临床需求推动下，FDA已相继批准了MSKCC-IMPACTTM、FoundationOne CDx等包含数百个基因的大型panel产品。 /p p 　　从NIPT到肿瘤分子病理,高通量测序技术为临床带来了越来越多的诊疗手段，随着肿瘤NGS检测试剂盒的获批，肿瘤高通量测序技术在临床的应用也将逐步趋于规范化。在可见的未来，多方企业和临床工作者的积极参与必将继续推动NGS技术的革新，更多稳定可靠的检测产品或将为患者提供可及的肿瘤诊疗服务。 /p p & nbsp /p

p style=" text-indent: 2em margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 深圳华大基因股份有限公司（以下简称“公司”）全资子公司华大生物科技 （武汉）有限公司（以下简称“武汉生物科技”）于 2019 年4月1日向国家药 品监督管理局（以下简称“国家药监局”）提交 EGFR/KRAS/ALK 基因突变联 合检测试剂盒（联合探针锚定聚合测序法）的注册申请并获得受理。近日，武汉生物科技的上述试剂盒产品取得国家药监局颁发的医疗器械注册证。 /p p style=" text-indent: 2em margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 本次获批的试剂盒产品用于定性检测非小细胞肺癌患者 FFPE 病理组织样本 中 EGFR/KRAS/ALK 基因突变，可用于吉非替尼、盐酸埃克替尼、克唑替尼药物的非小细胞肺癌适应症的伴随诊断检测。该试剂盒基于国产高通量测序平台，搭载自动化建库和报告解读系统，具有检测灵敏度高、多测序平台通量配置灵活的特点，可满足临床用户的多样化和个性化需求。 /p p style=" text-indent: 2em margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " strong 据悉，这是中国首个基于国产高通量测序仪的肿瘤基因检测试剂盒，或将打破进口测序仪在肿瘤基因检测试剂盒领域的垄断局面，这是国产高通量测序仪在肿瘤临床领域所取得的重大突破。 /strong /p p style=" text-indent: 2em margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 华大基因在其公司公告中表示，该试剂盒产品的《医疗器械注册证》的取得，丰富了公司肿瘤防控业务产 品线，有助于公司构建肿瘤“预、筛、诊、治、监”闭环防控体系，进一步提升 了公司在肿瘤靶向用药基因突变检测方面的核心竞争力和市场拓展能力。同时也意味着肿瘤临床基因检测领域，国产高通量测序仪已完全具备和进口测序仪相当的竞争力。 /p

最近数十年以来肿瘤的免疫治疗相关研究取得了革命性的突破，特别是基于PD-1、CTLA-4等类似的免疫检查点抑制剂的治疗方案表现尤为突出。但是即便如此，肿瘤的免疫治疗领域仍然面临巨大的挑战，比如治疗效果的不确定性、患者反应的不可预估性、免疫治疗耐药抵抗及检测生物标志物缺乏等都制约了对肿瘤患者的精准有效治疗。Balkwill F R, Capasso M, Hagemann T. The tumor microenvironment at a glance.当前大量的临床案例和科学研究表明肿瘤免疫微环境的深度解析将是破除肿瘤免疫治疗障碍的关键所在。肿瘤免疫微环境在肿瘤发生、侵袭、转移及治疗耐受过程中占据重要位置，细化免疫微环境的细胞免疫分型，切实有效的分子分型定量研究是指导肿瘤精准治疗的基础，也是在精准医学时代背景下亟需解决的难题。独特的PhenopticsTM多光谱组织微环境景观分析方案融合了Opal多色荧光样品标记、Vectra多光谱成像和inForm智能组织定量分析技术，可以实现传统分析方案难以解决的技术难题，从而更好的实现对于肿瘤患者的精准诊断和治疗。2019年6月26日，Nature杂志在线发表了巴黎大学Jér?me Galon教授研究组题为Immune evasion before tumor invasion in early lung squamous carcinogenesis的研究论文，该文利用了PhenopticsTM组织微环境分析方案对于肺癌病人样本的肿瘤免疫细胞进行了深度的分型分析，阐述了肺鳞状细胞癌发生过程在侵袭前病变组织和肿瘤微环境的细胞分型改变以及相关免疫细胞空间分布定位的差异性变化，从而揭示肿瘤免疫微环境的重塑有利于对肿瘤的发生发展进行调控和精准治疗，为提高肿瘤免疫治疗的有效率提供了新的技术思路和方法。Nature. 2019 Jun 26. doi: 10.1038/s41586-019-1330-0该研究工作的领导者Jér?me Galon教授利用PhenopticsTM组织微环境分析方案进行肿瘤免疫治疗研究和新的免疫治疗组合策略方案开发。附图来自Jér?me Galon教授基于Opal多色荧光标记技术获取的肿瘤组织免疫微环境描绘图片，为肿瘤免疫诊断和精准治疗提供重要的参考依据。来源：https://www.epo.org/learning-events/european-inventor/finalists/2019/galon.html全新的PhenopticsTM组织微环境分析方案可以实现在组织切片样本上实现多达9色的靶点抗原荧光标记和检测，并且进行多种类型细胞的分型定量研究深度挖掘组织微环境所蕴含的生物学信息，从而为肿瘤的免疫学研究和精准治疗提供可靠依据。Phenoptics™ 组织微环境分析方案—Opal 9色荧光标记示例图关于珀金埃尔默：珀金埃尔默致力于为创建更健康的世界而持续创新。我们为诊断、生命科学、食品及应用市场推出独特的解决方案，助力科学家、研究人员和临床医生解决最棘手的科学和医疗难题。凭借深厚的市场了解和技术专长，我们助力客户更早地获得更准确的洞见。在全球，我们拥有12500名专业技术人员，服务于150多个国家，时刻专注于帮助客户打造更健康的家庭，改善人类生活质量。2018年，珀金埃尔默年营收达到约28亿美元，为标准普尔500指数中的一员，纽交所上市代号1-877-PKI-NYSE。了解更多有关珀金埃尔默的信息，请访问www.perkinelmer.com.cn

详细信息 智能化采血工作站 福建省-厦门市-思明区 状态：公告 更新时间： 2024-03-04 招标文件: 附件1 项目基本信息采购项目编号[350201]GWCG[GK]2024008采购人复旦大学附属肿瘤医院厦门医院采购代理名称厦门市公物采购招投标有限公司联系人陈志生、杜亚娟采购方式公开/邀请招标联系电话0592-2518932、2233020采购项目公告 项目概况受复旦大学附属肿瘤医院厦门医院委托，厦门市公物采购招投标有限公司对[350201]GWCG[GK]2024008、智能化采血工作站组织公开招标，现欢迎国内合格的供应商前来参加。智能化采血工作站的潜在投标人应在福建省政府采购网(zfcg.czt.fujian.gov.cn)免费申请账号在福建省政府采购网上公开信息系统按项目获取采购文件，并于2024年03月25日 09时15分00秒（北京时间）前递交投标文件。 一、项目基本情况项目编号：[350201]GWCG[GK]2024008项目名称：智能化采血工作站采购方式：公开招标预算金额：3,500,000.00元采购包1(智能化采血工作站):采购包预算金额：3,500,000.00元采购包最高限价： 3,500,000.00元投标保证金： 0元采购需求：（包括但不限于标的的名称、数量、简要技术需求或服务要求等） 品目号 品目编码及品目名称 采购标的 数量（单位） 允许进口 简要需求或要求 品目预算(元) 中小企业划分标准所属行业 1-1 A02321900-临床检验设备 智能化采血工作站 1(套) 否 详见招标文件 2,500,000.00 工业 1-2 A02321900-临床检验设备 全自动血细胞分析仪 2(套) 否 详见招标文件 1,000,000.00 工业 本采购包不接受联合体投标合同履行期限：自合同签订之日起60日 二、申请人的资格要求：1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定 2.落实政府采购政策需满足的资格要求：采购包1：（1）本采购包落实中小企业扶持政策要求的方式：预留份额专门面向中小企业采购。 （2）预留比例：中小企业制造的产品金额不低于投标总额的40%，其中小微企业制造的产品金额不低于投标总额的24%。 （3）投标人需按第五章补充条款要求提供相关材料，否则投标无效。3.本项目的特定资格要求：采购包1：(1)1、信用信息查询渠道：通过“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）、中国政府采购网（www.ccgp.gov.cn）、“信用厦门”网站（credit.xm.gov.cn）查询所有供应商的信用信息。 2、截止时点：查询供应商截止开标当天前三年内的信用信息。 3、查询记录和证据留存方式：将查询结果网页打印后随采购文件一并存档。 4、信用信息的使用规则：（1）查询结果显示供应商存在不良信用记录（包含列入失信被执行人、重大税收违法案件当事人名单、政府采购严重违法失信行为记录名单及其他不符合《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定条件）的，其资格审查不合格。（2）因查询渠道网站原因导致查无供应商信息的，不认定供应商资格审查不合格；评审结束后，通过其他渠道发现供应商存在不良信用记录的，不认定为资格审查错误，将依照有关规定进行调查处理。（3）联合体成员存在不良信用记录的，视同联合体存在不良信用记录，联合体资格审查不合格。 5、供应商无需提供信用信息查询结果。若供应商自行提供查询结果的，仍以评标当天查询结果为准。 ；(2)本项目允许采用“信用承诺制”，根据《厦门市财政局关于进一步减轻供应商参与政府采购活动成本负担的通知》（厦财采〔2021〕5号）规定，投标人提供“资格承诺函”的即可参加采购活动，在投标文件中可不再提供财务状况报告、依法缴纳税收和社会保障资金的相关证明材料。投标人应当遵循诚实信用原则，不得作虚假承诺。投标人承诺不实的，属于提供虚假材料谋取中标，应依法承担相应的法律责任。；(3)每年1月-6月期间开标的项目，投标人也可提供上上年度的年度财务报告。；(4)1.投标人须根据所投的医疗器械分类，提供以下材料：第一类医疗器械提供《产品备案证明》；第二类、第三类医疗器械提供相应的《医疗器械注册证》。；(5)2.投标人所投的医疗器械若含有第二类医疗器械的，投标人应提供其《医疗器械经营备案凭证》或《食品药品生产经营许可证》；若含有第三类医疗器械的，投标人应提供其《医疗器械经营许可证》或《食品药品生产经营许可证》。。 三、采购项目需要落实的政府采购政策进口产品：本项目不接受进口产品参与投标。节能产品：按照节能产品政府采购品目清单执行。环境标志产品：按照环境标志产品政府采购品目清单执行。 四、获取招标文件时间： 2024-03-04 至 2024-03-11 ，（提供期限自本公告发布之日起不得少于5个工作日），每天上午00:00:00至12:00:00，下午12:00:00至23:59:59（北京时间，法定节假日除外）地点：招标文件随同本项目招标公告一并发布；投标人应先在福建省政府采购网(zfcg.czt.fujian.gov.cn)免费申请账号在福建省政府采购网上公开信息系统按项目下载招标文件(请根据项目所在地，登录对应的(省本级/市级/区县)）福建省政府采购网上公开信息系统操作)，否则投标将被拒绝。方式：在线获取售价：免费 五、提交投标文件截止时间、开标时间和地点2024-03-25 09:15:00（北京时间）（自招标文件开始发出之日起至投标人提交投标文件截止之日止，不得少于20日）地点：福建省厦门市湖里区云顶北路842号（市政务服务中心4层）C区开标室4（厦门市公共资源交易中心） 六、公告期限自本公告发布之日起5个工作日。 七、其他补充事宜本项目采用 ldquo 远程开标 rdquo ，投标人可到开标现场，也可不到开标现场，由投标人自行决定。远程开标事项说明详见第五章补 充条款，补充条款内容与招标文件其他地方内容不一致的，以补充条款内容为准。请投标人仔细阅读。 八、对本次招标提出询问，请按以下方式联系。 1.采购人信息名称：复旦大学附属肿瘤医院厦门医院地址：福建省厦门市海沧区东孚西路99号联系方式：0592-6058802 2.采购代理机构信息（如有）名称：厦门市公物采购招投标有限公司地址：福建省厦门市思明区湖滨南路81号21层D单元联系方式：0592-2518932、2233020 3.项目联系方式项目联系人：陈志生、杜亚娟电话：0592-2518932、2233020网址： zfcg.czt.fujian.gov.cn开户名：厦门市公物采购招投标有限公司厦门市公物采购招投标有限公司2024年03月04日8a1d09ac8dfb5b5f018e08b368de3ae3.zip × 扫码打开掌上仪信通App 查看联系方式 基本信息 关键内容：血球分析仪,细胞计数器 开标时间：2024-03-25 09:15 预算金额：350.00万元 采购单位：复旦大学附属肿瘤医院 采购联系人：点击查看 采购联系方式：点击查看 招标代理机构：厦门市公物采购招投标有限公司 代理联系人：点击查看 代理联系方式：点击查看 详细信息 智能化采血工作站 福建省-厦门市-思明区 状态：公告 更新时间： 2024-03-04 招标文件: 附件1 项目基本信息采购项目编号[350201]GWCG[GK]2024008采购人复旦大学附属肿瘤医院厦门医院采购代理名称厦门市公物采购招投标有限公司联系人陈志生、杜亚娟采购方式公开/邀请招标联系电话0592-2518932、2233020采购项目公告 项目概况受复旦大学附属肿瘤医院厦门医院委托，厦门市公物采购招投标有限公司对[350201]GWCG[GK]2024008、智能化采血工作站组织公开招标，现欢迎国内合格的供应商前来参加。智能化采血工作站的潜在投标人应在福建省政府采购网(zfcg.czt.fujian.gov.cn)免费申请账号在福建省政府采购网上公开信息系统按项目获取采购文件，并于2024年03月25日 09时15分00秒（北京时间）前递交投标文件。 一、项目基本情况项目编号：[350201]GWCG[GK]2024008项目名称：智能化采血工作站采购方式：公开招标预算金额：3,500,000.00元采购包1(智能化采血工作站):采购包预算金额：3,500,000.00元采购包最高限价： 3,500,000.00元投标保证金： 0元采购需求：（包括但不限于标的的名称、数量、简要技术需求或服务要求等） 品目号 品目编码及品目名称 采购标的 数量（单位） 允许进口 简要需求或要求 品目预算(元) 中小企业划分标准所属行业 1-1 A02321900-临床检验设备 智能化采血工作站 1(套) 否 详见招标文件 2,500,000.00 工业 1-2 A02321900-临床检验设备 全自动血细胞分析仪 2(套) 否 详见招标文件 1,000,000.00 工业 本采购包不接受联合体投标合同履行期限：自合同签订之日起60日 二、申请人的资格要求：1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定 2.落实政府采购政策需满足的资格要求：采购包1：（1）本采购包落实中小企业扶持政策要求的方式：预留份额专门面向中小企业采购。 （2）预留比例：中小企业制造的产品金额不低于投标总额的40%，其中小微企业制造的产品金额不低于投标总额的24%。 （3）投标人需按第五章补充条款要求提供相关材料，否则投标无效。3.本项目的特定资格要求：采购包1：(1)1、信用信息查询渠道：通过“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）、中国政府采购网（www.ccgp.gov.cn）、“信用厦门”网站（credit.xm.gov.cn）查询所有供应商的信用信息。 2、截止时点：查询供应商截止开标当天前三年内的信用信息。 3、查询记录和证据留存方式：将查询结果网页打印后随采购文件一并存档。 4、信用信息的使用规则：（1）查询结果显示供应商存在不良信用记录（包含列入失信被执行人、重大税收违法案件当事人名单、政府采购严重违法失信行为记录名单及其他不符合《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定条件）的，其资格审查不合格。（2）因查询渠道网站原因导致查无供应商信息的，不认定供应商资格审查不合格；评审结束后，通过其他渠道发现供应商存在不良信用记录的，不认定为资格审查错误，将依照有关规定进行调查处理。（3）联合体成员存在不良信用记录的，视同联合体存在不良信用记录，联合体资格审查不合格。 5、供应商无需提供信用信息查询结果。若供应商自行提供查询结果的，仍以评标当天查询结果为准。 ；(2)本项目允许采用“信用承诺制”，根据《厦门市财政局关于进一步减轻供应商参与政府采购活动成本负担的通知》（厦财采〔2021〕5号）规定，投标人提供“资格承诺函”的即可参加采购活动，在投标文件中可不再提供财务状况报告、依法缴纳税收和社会保障资金的相关证明材料。投标人应当遵循诚实信用原则，不得作虚假承诺。投标人承诺不实的，属于提供虚假材料谋取中标，应依法承担相应的法律责任。；(3)每年1月-6月期间开标的项目，投标人也可提供上上年度的年度财务报告。；(4)1.投标人须根据所投的医疗器械分类，提供以下材料：第一类医疗器械提供《产品备案证明》；第二类、第三类医疗器械提供相应的《医疗器械注册证》。；(5)2.投标人所投的医疗器械若含有第二类医疗器械的，投标人应提供其《医疗器械经营备案凭证》或《食品药品生产经营许可证》；若含有第三类医疗器械的，投标人应提供其《医疗器械经营许可证》或《食品药品生产经营许可证》。。 三、采购项目需要落实的政府采购政策进口产品：本项目不接受进口产品参与投标。节能产品：按照节能产品政府采购品目清单执行。环境标志产品：按照环境标志产品政府采购品目清单执行。 四、获取招标文件时间： 2024-03-04 至 2024-03-11 ，（提供期限自本公告发布之日起不得少于5个工作日），每天上午00:00:00至12:00:00，下午12:00:00至23:59:59（北京时间，法定节假日除外）地点：招标文件随同本项目招标公告一并发布；投标人应先在福建省政府采购网(zfcg.czt.fujian.gov.cn)免费申请账号在福建省政府采购网上公开信息系统按项目下载招标文件(请根据项目所在地，登录对应的(省本级/市级/区县)）福建省政府采购网上公开信息系统操作)，否则投标将被拒绝。方式：在线获取售价：免费 五、提交投标文件截止时间、开标时间和地点2024-03-25 09:15:00（北京时间）（自招标文件开始发出之日起至投标人提交投标文件截止之日止，不得少于20日）地点：福建省厦门市湖里区云顶北路842号（市政务服务中心4层）C区开标室4（厦门市公共资源交易中心） 六、公告期限自本公告发布之日起5个工作日。 七、其他补充事宜本项目采用 ldquo 远程开标 rdquo ，投标人可到开标现场，也可不到开标现场，由投标人自行决定。远程开标事项说明详见第五章补 充条款，补充条款内容与招标文件其他地方内容不一致的，以补充条款内容为准。请投标人仔细阅读。 八、对本次招标提出询问，请按以下方式联系。 1.采购人信息名称：复旦大学附属肿瘤医院厦门医院地址：福建省厦门市海沧区东孚西路99号联系方式：0592-6058802 2.采购代理机构信息（如有）名称：厦门市公物采购招投标有限公司地址：福建省厦门市思明区湖滨南路81号21层D单元联系方式：0592-2518932、2233020 3.项目联系方式项目联系人：陈志生、杜亚娟电话：0592-2518932、2233020网址： zfcg.czt.fujian.gov.cn开户名：厦门市公物采购招投标有限公司厦门市公物采购招投标有限公司2024年03月04日8a1d09ac8dfb5b5f018e08b368de3ae3.zip

近年来肿瘤免疫治疗取得了一系列突破性成果，成为继肿瘤手术治疗、放化疗及靶向治疗之外的革命性治疗手段，特别是基于PD-1、CTLA-4等免疫检查点抑制剂的治疗方案表现尤为突出。即便如此，肿瘤的免疫治疗仍面临巨大挑战，如疗效不确定性、总体有效率低、耐药抵抗及检测生物标志物缺乏等都制约了对患者的精准治疗。大量的临床案例和科学研究表明肿瘤免疫微环境的深度解析将会是突破免疫治疗障碍的关键所在，独特的Phenoptics分析方案可以完美的解决这一难题。该方案可以实现对肿瘤样本内多达9种生物标志物的原位标记和描绘，同时实现多种生物标志物的联合分析及空间分布分析，从而实现生物学数据的深度挖掘，为肿瘤精准诊疗提供重要依据。 接下来跟随小编一起来看几篇发表在顶尖杂志的相关研究论文，一探究竟吧！1、JAMA Oncology2019年7月18日来自美国约翰霍普金斯大学、耶鲁大学、范德堡大学及西北大学等科研单位联合在肿瘤学权威期刊JAMA Oncology(IF 22.4)发布了一项肿瘤学免疫诊疗重要研究成果(Comparison of Biomarker Modalities for Predicting Response to PD-1/PD-L1 Checkpoint Blockade A Systematic Review and Meta-analysis)，系统阐述了利用Phenoptics免疫标志物mIHC/IF多重免疫组化(即Opal多重免疫组化)分析方案对于肿瘤微环境进行深度分析，其结果对比传统检测手段对于疗效预测有着更为突出的优势，可以更好地为肿瘤的诊断和免疫治疗提供可靠依据。文章对比了广泛应用的几种肿瘤学生物标志物检测方案，如传统PD-L1免疫组化检测、TMB肿瘤突变负荷分析、GEP基因表达谱分析及mIHC/IF多重免疫组化检测等方案与临床案例的诊断准确性及免疫治疗应答率进行了深度整合分析。研究人员通过Meta分析统计了2013年-2018年间公开发表及重大学术会议公布的肿瘤免疫治疗及免疫检查点抑制剂56篇研究案例，包含 10种以上不同类型的肿瘤样本总计8135份的完整临床数据(包括黑色素瘤、肺癌、尿路上皮癌、头颈癌、结肠癌、肝细胞肝癌、宫颈癌、胃癌、默克细胞瘤、肾细胞癌等)，系统关联分析了肿瘤治疗应答率和生物标志物的表达水平，根据其比值权重依据敏感性和准确度统计出sROC曲线并分析计算曲线下面积AUC数据进行准确度评估用于判断该检测方案的敏感度和特异度，这两项指标与肿瘤的免疫治疗应答率具有高度相关性。数据统计分析显示，mIHC/IF多重组化检测方案的数据结果权重分析条件下AUC=0.79显著优于其他分析方案，PD-L1传统免疫组化IHC检测(AUC=0.65,P2、Nature近来关于肿瘤微环境分析与免疫治疗相关研究成果接连发表，2019年6月26日Nature发表了巴黎大学Immune evasion before tumor invasion in early lung squamous carcinogenesis的研究论文，该文利用Phenoptics组织微环境分析方案对于肺癌病人样本的肿瘤免疫细胞进行了深度的分型分析，阐述了肺鳞状细胞癌发生过程相关免疫细胞空间分布定位的差异性变化，从而揭示肿瘤免疫微环境的重塑有利于对肿瘤的精准治疗。3、Nature Immunology2019年7月8日来自美国希望之城癌症中心的科研人员在Nature Immunology发文同样阐述了Phenoptics肿瘤微环境分析方案在乳腺癌的诊断和治疗方面具有极大的潜力和价值(Connecting blood and intratumoral Treg cell activity in predicting future relapse in breast cancer)，可以有效的对乳腺癌病人治疗后的复发风险进行预测，从而为患者的精准诊疗提供重要的数据支持。4、Nature Communications2018年度诺贝尔奖生理学或医学奖得主James Allison教授早在2017年领导的一项研究就应用Phenoptics多重免疫组化方案深度分析了胰腺癌病例肿瘤组织微环境与临床预后信息具有极高的相关性，该研究成果发表在Nature子刊 Nature Communications (Spatial computation of intratumoral T cells correlates with survival of patients with pancreatic cancer)，而相关的研究方案将为肿瘤的免疫治疗提供新的诊疗依据从而更好的给肿瘤患者制定有效的治疗方案。总结：独特的Phenoptics多光谱组织微环境景观分析方案融合了Opal多重免疫组化染色、Vectra多光谱成像和inForm智能组织定量分析技术，可以完美实现传统肿瘤检测方案难以解决的技术难题，从而更好的实现对于肿瘤患者的精准诊断和治疗。网络讲座讲座时间：2019年8月27日12:00 PM(北京时间)讲座题目：Comprehensive Meta-analysis of Biomarker Technologies for Predictive Response of PD-1/PD-L1 Checkpoint Therapies主讲人：霍普金斯大学 Steve LuAkoya Biosciences Cliff Hoyt内容简介：详细分享Phenoptics分析方案的特点和技术优势，包括多种生物标记技术预测PD-1/PD-L1免疫治疗的预测指标分析，免疫细胞亚群定量蛋白检测的重要性以及疾病状态下细胞空间分布差异比较与应用，用于稳定且高通量临床研究的多重免疫荧光方法的最新进展等内容。会议地址：https://www.labroots.com/ms/webinar/akoya-biosciences-series-comprehensive-metaanalysis-biomarker-technologies-predictive-response-pd-1参考文献1. Wang L, Simons D L, Lu X, et al. Connecting blood and intratumoral T reg cell activity in predicting future relapse in breast cancer[J]. Nature immunology, 2019: 1.2. Lu S, Stein J E, Rimm D L, et al. Comparison of Biomarker Modalities for Predicting Response to PD-1/PD-L1 Checkpoint Blockade: A Systematic Review and Meta-analysis[J]. JAMA oncology, 2019.3. Carstens J L, De Sampaio P C, Yang D, et al. Spatial computation of intratumoral T cells correlates with survival of patients with pancreatic cancer[J]. Nature communications, 2017, 8: 15095.4. Mascaux C, Angelova M, Vasaturo A, et al. Immune evasion before tumour invasion in early lung squamous carcinogenesis[J]. Nature, 2019: 1.5. Soo R A, Lim J S Y, AsuncionB R, et al. Determinants of variability of five programmed death ligand-1 immunohistochemistry assays in non-small cell lung cancer samples[J]. Oncotarget, 2018, 9(6): 6841.关于珀金埃尔默：珀金埃尔默致力于为创建更健康的世界而持续创新。我们为诊断、生命科学、食品及应用市场推出独特的解决方案，助力科学家、研究人员和临床医生解决最棘手的科学和医疗难题。凭借深厚的市场了解和技术专长，我们助力客户更早地获得更准确的洞见。在全球，我们拥有12500名专业技术人员，服务于150多个国家，时刻专注于帮助客户打造更健康的家庭，改善人类生活质量。2018年，珀金埃尔默年营收达到约28亿美元，为标准普尔500指数中的一员，纽交所上市代号1-877-PKI-NYSE。了解更多有关珀金埃尔默的信息，请访问www.perkinelmer.com.cn。

新一代测序 (NGS) 正迅速成为肿瘤分子分析的首选平台，因为它能够同时报告多个生物标志物。然而，冗长的周转时间会限制这些结果的临床效用。为了满足快速基因组观察的需求，赛默飞世尔科技今天推出了用于临床实验室的 CE-IVD (IVDD) Oncomine Dx Express Test 和 Oncomine Reporter Dx。Oncomine Dx 快速测试使用靶向 NGS 技术，可在短短 24 小时内提供临床相关的肿瘤突变分析，以根据专业指南帮助医疗保健专业人员对癌症患者进行治疗管理。定性体外诊断 (IVD) 测试可检测实体恶性肿瘤 FFPE 肿瘤组织样本中 DNA 和 RNA 的 42 个基因中存在的缺失、插入、替换和拷贝数增加以及 18 个基因中的融合或剪接变体。该检测还检测了从非小细胞肺癌 (NSCLC) 血浆样本中提取的 cfTNA 中 42 个基因的缺失、插入、替换和 7 个基因的融合或剪接变体。该测定需要最少的样品输入，最大限度地提高样品成功率。Oncomine Reporter Dx 软件可确保从业者能够快速评估基因组测试结果。该软件将变异数据与相关证据相匹配，包括批准的疗法、指南、临床试验和同行评审的文献，并提供用户友好且可定制的报告。“精准肿瘤学中的基因组分析正在改变癌症治疗，但真正的临床效用取决于及时、可操作的结果，”赛默飞世尔科技临床下一代测序和肿瘤学总裁 Garret Hampton 说。“通过IVD NGS解决方案提供的快速结果用最少的培训和操作时间，我们正在努力使这些见解在任何实验室或医院都可用，以帮助患者与精确的肿瘤学治疗建立联系。”新的 NGS 分析和基因组报告软件，连同最近推出的Ion Torrent Genexus Dx 集成测序仪，提供了自动化的端到端 CE-IVD 工作流程。从单一软件界面操作，整个过程不到 20 分钟的动手时间，以前所未有的快速周转时间提供结果。该工作流程使任何实验室都能够将基因组测试的力量带到内部，改善对患者的访问，并为那些受益最大的人推进精准肿瘤学。

2023年3月2日，北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)近日宣布其 xCELLigence RTCA HT（实时细胞分析高通量）平台现已与 BioTek BioSpa 8全自动培养箱集成。为了响应市场需求，安捷伦将二者组合，实现了更高水平的自动化工作流程，为免疫肿瘤学领域的无标记高通量效价分析和疫苗市场的高通量病毒介导的细胞病变效应 (CPE) 检测提供了全新功能。制药研究人员要完成免疫肿瘤治疗的使命，面临着激烈的竞争，因此正在不断开发使临床研究加速成功的方法。同样，由于存在不断变化的公共卫生威胁，疫苗开发人员也面临着前所未有的压力。自动化工作流程可以提升候选药物筛选能力，是一种更快、更有效将研究转化为发现的手段。然而，许多现有的自动化工作流程解决方案仍然依赖大量的手动干预步骤，从而阻碍了通量并限制了方案开发的范围。配备 BioTek BioSpa 8 全自动培养箱的 xCELLigence 实时细胞分析高通量 (RTCA HT) 平台xCELLigence RTCA HT - BioSpa 8 的集成可为细胞增殖和细胞毒性提供无标记的非侵入性动力学结果，使研究人员能够分析多达八个 384 孔 板，从而提高通量并减少样品量。BioSpa 8 培养箱提供实时温度和 CO2/O2 控制，以及湿度监测功能。xCELLigence 仪器配备加热支架，因此可以保护细胞在从培养箱自动转移期间，免受不必要的扰动和培养条件的波动。用户友好的软件便于进行自动化检测和数据分析，使其成为真正无人值守的系统，此系统可用于鉴别对抗疾病的治疗方法，并为这一技术组合提供一定的自动化支持。安捷伦副总裁兼细胞分析事业部总经理 Todd Christian 说道：“这是免疫肿瘤治疗和疫苗开发的创新解决方案，表明安捷伦一直致力于抗击癌症和传染病。将我们的非侵入式实时细胞分析检测功能与生理条件的孵育培养结合，可提供简单的自动化工作流程，以提高生理条件下的通量和筛选灵活性。”范德堡大学医学中心范德堡疫苗中心副主任 Robert Carnahan 博士谈道：“xCELLigence RTCA HT 技术一直是促进高通量、快速和定量细胞病变效应 (CPE) 监测的关键，它是一种评估中和活性和效价的工具。我们能够绕过空斑或病灶形成实验中所需的众多动手、多步骤过程来测量病毒活性。”安捷伦提供包括用于实时细胞和代谢分析的工具，以及流式细胞仪、孔板和成像/显微镜平台，这些产品和服务有助于利用广泛的学科和方法进行药物发现。此次推出的这一全新集成解决方案展现安捷伦应对解决现实挑战的能力，兑现作为药物开发领域合作伙伴的承诺。关于安捷伦科技安捷伦科技有限公司（纽约证交所:A）是生命科学、诊断和应用化学市场领域的全球领导者，致力于为提高生活质量提供敏锐洞察和创新经验。安捷伦的仪器、软件、服务、解决方案和专家能够为客户最具挑战性的难题提供更可靠的答案。2022财年，安捷伦的营业收入为68.5亿美元，全球员工数为18,000人。如需了解安捷伦公司的详细信息，请访问 www.agilent.com。

仪器信息网讯 近日宣布其xCELLigence RTCA HT（实时细胞分析高通量）平台现已与 BioTek BioSpa 8 全自动培养箱集成。为了响应市场需求，安捷伦将二者组合，实现了更高水平的自动化工作流程，为免疫肿瘤学领域的无标记高通量效价分析和疫苗市场的高通量病毒介导的细胞病变效应 (CPE) 检测提供了全新功能。制药研究人员要完成免疫肿瘤治疗的使命，面临着激烈的竞争，因此正在不断开发使临床研究加速成功的方法。同样，由于存在不断变化的公共卫生威胁，疫苗开发人员也面临着前所未有的压力。自动化工作流程可以提升候选药物筛选能力，是一种更快、更有效将研究转化为发现的手段。然而，许多现有的自动化工作流程解决方案仍然依赖大量的手动干预步骤，从而阻碍了通量并限制了方案开发的范围。xCELLigence RTCA HT - BioSpa 8 的集成可为细胞增殖和细胞毒性提供无标记的非侵入性动力学结果，使研究人员能够分析多达八个 384 孔 板，从而提高通量并减少样品量。BioSpa 8 培养箱提供实时温度和 CO2/O2 控制，以及湿度监测功能。xCELLigence RTCA HT（实时细胞分析高通量）平台xCELLigence仪器配备加热支架，因此可以保护细胞在从培养箱自动转移期间，免受不必要的扰动和培养条件的波动。用户友好的软件便于进行自动化检测和数据分析，使其成为真正无人值守的系统，此系统可用于鉴别对抗疾病的治疗方法，并为这一技术组合提供一定的自动化支持。安捷伦副总裁兼细胞分析事业部总经理 Todd Christian 说道：“这是免疫肿瘤治疗和疫苗开发的创新解决方案，表明安捷伦一直致力于抗击癌症和传染病。将我们的非侵入式实时细胞分析检测功能与生理条件的孵育培养结合，可提供简单的自动化工作流程，以提高生理条件下的通量和筛选灵活性。”范德堡大学医学中心范德堡疫苗中心副主任 Robert Carnahan 博士谈道：“xCELLigence RTCA HT 技术一直是促进高通量、快速和定量细胞病变效应 (CPE) 监测的关键，它是一种评估中和活性和效价的工具。我们能够绕过空斑或病灶形成实验中所需的众多动手、多步骤过程来测量病毒活性。”安捷伦提供包括用于实时细胞和代谢分析的工具，以及流式细胞仪、孔板和成像/显微镜平台，这些产品和服务有助于利用广泛的学科和方法进行药物发现。此次推出的这一全新集成解决方案展现安捷伦应对解决现实挑战的能力，兑现作为药物开发领域合作伙伴的承诺。关于安捷伦安捷伦科技有限公司（纽约证交所：A）是生命科学、诊断和应用化学市场领域的全球领导者，致力于为提升人类生活品质提供敏锐洞察和创新经验。安捷伦的仪器、软件、服务、解决方案和专家能够为客户最具挑战性的难题提供更可靠的答案。2022 财年，安捷伦营业收入为 68.5 亿美元，全球员工数约为 18,000 人。

p 　　2018年4月10日，Illumina和Loxo Oncology宣布，他们将计划为Loxo的两种靶向肿瘤药物开发基于测序的泛癌伴侣诊断试剂。 /p p 　　这些公司将使用Illumina的TruSight 170平台版本，该平台是2017年初推出的混合型捕捉平台，可分析DNA和RNA。测试将在Illumina的NextSeq 550Dx平台上运行。 /p p 　　这两家公司的目的是分别验证NTRK融合蛋白和RET融合/突变组合作为美国食品和药物管理局三级批准的诊断试剂，与Loxo的larotrectinib和LOXO-292联合使用。去年，Loxo提供了larotrectinib的临床数据作为肿瘤患者TRK融合的治疗方案。 Loxo目前正在进行LOXO-292的I期临床试验。 /p p 　　此外，这两家公司计划寻求TST 170平台上其他内容的监管批准，将其作为II类肿瘤分析测试进行销售。Illumina也将为该检测寻求CE标志。 /p p 　　Loxo首席业务官Jacob Van Naarden在一份声明中表示，该公司已经测试了多种不同的NGS检测方法，TST 170“通过对DNA和RNA的评估一直表现出强劲的表现”，并能够识别患有NTRK融合，RET融合，RET突变和其他改变。 /p

p 　　基因突变是肿瘤产生和发展的重要原因。随着细胞分离技术和基因测序技术的发展，液体活检在肿瘤精准医疗中的价值日益凸显。通过采集患者血液、尿液等体液标本中的肿瘤相关产物，包括血液中游离的循环肿瘤细胞(CTC)、循环肿瘤DNA(ctDNA)和外泌体等，液体活检可以实现对肿瘤基因图谱的非侵袭性检测，从而对肿瘤疾病进行诊断和辅助治疗。相较于通过手术、组织活检获取肿瘤标本的传统方式，液体活检技术能很好地克服肿瘤时空异质性，重复检测方便，可用来发现及追踪分子水平的变化，具有广阔的临床应用前景。 /p p style=" text-align: center" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/ab7e1034-1437-4b25-a403-af518c3d4925.jpg" title=" 00.jpg" / /p p style=" text-align: center " 中山大学附属肿瘤医院肿瘤内科副主任医师蔡修宇博士 /p p 　　日前，在第四届全国检验医学技术与应用学术会议暨‘一带一路’检验高峰论坛期间，中山大学附属肿瘤医院肿瘤内科副主任医师蔡修宇博士在“2018 智.创未来——中欧医学检验论坛”上，分享了液体活检特别是ctDNA检测在肿瘤临床诊疗上的应用现状及前景，为肿瘤治疗方案的制定提供了很多新思路。 /p p 　　蔡修宇博士表示：“ctDNA检测作为液体活检主流方向，凭一管液体就可以进行肿瘤诊断、疗效评估、实时监控、个体化用药、预测复发等，在精准医疗大趋势下，既具有极高的科研价值，又具备推进精准医疗临床实践的巨大潜能，为实现肿瘤临床治疗的全流程管理提供强有力的支持。” /p p span style=" color: rgb(255, 0, 0) " strong 　　NGS+ctDNA精准跟踪抗性突变，优化治疗策略 /strong /span /p p 　　ctDNA是体液中全部游离循环DNA(cfDNA)的一种，是仅有肿瘤细胞释放的携带有肿瘤特异性遗传学改变的自由基因组片段[1]，能够揭示肿瘤综合性的遗传信息，更准确反映肿瘤组织的异质性及肿瘤负荷[2]，并可在同一患者身上反复进行，具有潜在的纵向监测能力。 /p p 　　随着科学发展，ctDNA检测已成为当前肿瘤领域的诊疗新热点。其主要检测方法包括微滴式数字 PCR(ddPCR)，扩增阻滞突变PCR(ARMS PCR) 和二代测序(NGS)等。其中，NGS可实现对多基因核酸片段进行高通量平行深度测序，能够同步检测多个基因、不同形式及未知突变，在预后和疗效判断的时候，多基因的参与可能对预后效果产生非常大的影响。 /p p 　　蔡修宇博士指出：“以肺癌为例，检测难点就是检验组织的获取，NGS用测序多个位点代替单个位点检测，不需要通过手术获取大量组织送往不同实验室进行检测。因此，NGS在诊断、分期、治疗和预后等方面，对于肿瘤个体化治疗和全程管理具有巨大优势。” /p p style=" text-align: center" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/4758138b-3e4a-439b-8348-0f308091a664.jpg" title=" 1.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong 图 1：NGS+液体活检扩大总体优势[3] /strong /p p 　　癌症患者在接受靶向治疗受益一段时间后，往往会因为基因的二次突变出现耐药机制。间变性淋巴瘤激酶(ALK)重排是非小细胞肺癌(NSCLC)中较为少见的一类分型，ALK阳性患者在经过ALK抑制剂(TKI)治疗后反应良好，患者生存期和生存质量都得到了很大提高，但获得性耐药问题依旧不可避免。研究发现，不同ALK TKI耐药机制不同，对获得性耐药突变敏感性差异很大[4]，这就说明了对于ALK TKI获益的患者耐药后再次活检的重要性。 /p p 　　一项纳入 49 例既往接受过克唑替尼(crizotinib)治疗的局限进展或转移性NSCLC 患者的 II 期研究中，采用 AVENIO ctDNA检测经阿雷替尼(alectinib)治疗前后的 cfDNA 样本。结果显示，26/49例患者中检测到ALK基因融合。Alectinib治疗后，耐药性突变显著增加，而敏感性突变减少。“通过对ctDNA检测可以鉴定药物治疗过程中产生的耐药突变，追踪药物响应，指导临床及时采取进一步措施。AVENIO ctDNA检测可应用于监测治疗中ALK TKI耐药突变出现的可能性，从而有助于局部转移或晚期NSCLC患者治疗策略的制定。”蔡修宇博士指出。 /p p style=" text-align: center" img style=" width: 450px height: 437px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/34fa0674-3826-4588-a912-2c5e75aa7876.jpg" title=" 2.jpg" height=" 437" hspace=" 0" border=" 0" vspace=" 0" width=" 450" / /p p style=" text-align: center " strong 图 2：肺癌中 NGS+ctDNA 目前和未来的应用领域[5] /strong /p p 　　 span style=" color: rgb(255, 0, 0) " strong 有效评估疗效及预测复发，指导临床个性化诊疗 /strong /span /p p 　　ctDNA用于肿瘤疗效评估和预后监测的优势也在很多临床实验中得到了证实。在癌症疗效评估时，ctDNA基线水平较低和ctDNA水平持续应答者可获更好预后[6]，诱导前后肿瘤异质性(以MATH计)升高预示较差临床结局[7]。 /p p 　　一项采用AVENIO ctDNA监测试剂盒对145例II/III期R0切除术后结直肠癌(CRC)患者的微小残留病灶(MRD)进行定性检测，根据术后血浆中ctDNA检测结果将患者分为ctDNA阳性和ctDNA阴性。研究发现，术后ctDNA阳性患者在复发时间、无复发生存期及总生存率上均显著短于ctDNA阴性患者(如图3)，证明MRD检测可识别II/III期CRC高复发风险人群。[8]对于高复发风险的患者可考虑更为积极的辅助治疗，并增加随访，以期改善预后。 /p p style=" text-align: center" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/324491dc-2307-470f-acf3-2b42a5f49da3.jpg" title=" 3.jpg.png" / /p p style=" text-align: center " strong 　　图3：MRD检测可识别II/III期CRC高复发风险人群 /strong /p p 　　在另一项共入组40例Ib-III期局限性肺癌患者的复发预测研究中，治疗结束后4个月内首次(MRD 界标点)进行血浆ctDNA分析，之后每3-6个月动态监测ctDNA水平。研究结果显示，ctDNA检测可早于72%的影像学诊断的肿瘤复发，中位提前时间为5.2个月[9]。证明ctDNA检测的灵敏度及特异性较高，且显著早于影像学可诊断的微小复发灶，可用于MRD的早期诊断，并以此指导这部分患者的早期干预和个体化的辅助治疗。 /p p 　　在对大b细胞淋巴瘤(DLBCL)患者进行预测复发管理中，平行使用癌症个体化深度测序分析方法(CAPP-Seq)与IgHTS检测ctDNA水平监测肿瘤负荷。在112天与224天时，ctDNA水平已超出IgHTS检测下限，因此出现假阴性 首次检测到ctDNA阳性到复发平均为188天，73%患者在疾病进展前检测到ctDNA阳性。[10]研究证实治疗后ctDNA阳性的患者在随访周期内的复发率远远高于ctDNA阴性的患者，ctDNA 检测MRD可预测DLBCL进展风险。 /p p 　　蔡修宇博士表示：“基因测序作为精准医疗的重要一环，是未来癌症个体化诊疗的主要发展方向。ctDNA检测在微小残留病灶和复发预警中具有潜在临床应用价值，能够帮助我们更好地管理癌症，让更多患者从中获益。” /p p 　　罗氏诊断AVENIO ctDNA 检测技术在不同临床研究中已有应用。该技术能帮助解决许多液体活检研究中遇到的挑战，在不同实验室间均能保持良好的稳定性和可重复性。AVENIO ctDNA分析试剂盒包含所有NGS实验室进行ctDNA检测时所需的试剂及生物信息学分析软件。AVENIO ctDNA靶向试剂盒包含17个全癌基因检测位点，用于鉴定美国国立综合癌症网络(NCCN)指南相关生物标志物 扩展试剂盒包含77个全癌基因检测位点，包含NCCN指南相关及临床研究中常用突变位点的生物标记 监测试剂盒包含197个基因检测位点，纵向监测肺癌及结直肠癌等多种肿瘤负荷，检测微小残留灶，评估并监测复发、进展风险。 /p p 　　[1] Nature.2014 Jul 31 511(7511):524-6 /p p 　　[2] Jianjun Zhang et al. Science 346, 256 (2014) Intratumor heterogeneity in localized lung adenocarcinomas elineated by multiregion sequencing. Siravegna et al., Nature Reviews Clinical Oncology 2017 /p p 　　[3] Zhang YC, et al. J Hematol Oncol. 2017. /p p 　　[4] Justin F. Gainor, et al. Cancer Discovery. 2016 /p p 　　[5] Zhang YC, et al. J Hematol Oncol. 2017. /p p 　　[6] 2018 ASCO Abstract 12077 & amp 12088 /p p 　　[7] 2018 ASCO Abstract 3545 /p p 　　[8] 2017 ASCO Abstract 3591 /p p 　　[9] Chaudhuri A A, , et al.. Cancer discovery, 2017 /p p 　　[10] Scherer F, et al. Science translational medicine, 2016 /p p br/ /p

p style=" line-height: 1.75em " & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 近日，重庆西南医院综合实验研究中心专家首次发现石墨烯有助于肿瘤早期诊断，相关研究成果日前发表于国际权威期刊《分析化学》，这对于各类肿瘤的早期诊断、治疗具有重要意义。 /p p style=" line-height: 1.75em " 　　临床上，大部分肿瘤被发现时往往已至晚期。常规的肿瘤检测方法B超、X线、CT等灵敏度有限，且具有放射性，不适合作为普通人群早期筛查肿瘤的方法。体液肿瘤标志物是目前临床最理想的无创筛查方式，但相关体液肿瘤标志物，往往是在肿瘤已经发展到成熟的阶段才会产生。 /p p style=" line-height: 1.75em " 　　“为破解肿瘤早期发现的难题，我们必须在机体发生异常的早期，从更早的分子层面，找到检测目标。”研究团队成员邱晓沛说，核酸分子生物标志物cmocroRNA在机体出现异常情况时，它的含量也会随之改变，经反复试验，其团队发现在血清、尿液以及唾液中存在cmocroRNA。 /p p style=" line-height: 1.75em " 　　邱晓沛介绍，发现cmocroRNA的存在只是第一步，在肿瘤早期由机体主动释放至血液、尿液中的cmocroRNA极其微量，普通常规的核酸检测方法很难检测到。研究团队目光放在了DNAase上，这是一种特异性的核酸酶，它能通过“无限循环酶切”将检测信号放大，而实现信号放大的前提是有极大量的探针。为此，他们引入了吸附性强的石墨烯，其让捕获cmocroRNA探针数量提高10倍，使检测的灵敏度大大提高，最终实现对cmocroRNA的捕捉。 /p p style=" line-height: 1.75em " 　　据介绍，通过对捕捉到的cmocroRNA进行综合性分析，即可得出机体是否出现癌变，以及是哪种癌症，对于各类肿瘤的早期诊断、治疗具有重要意义。目前，该研究已经进入试剂盒研究阶段，有望在两三年内应用于临床。 /p

肿瘤浸润白细胞( Tumor Infiltrating Leukocytes, TIL) 作为深入实体肿瘤内部的免疫细胞群体，在肿瘤-免疫学研究中占据重要地位。MACS Technology以卓越的技术致力于高质量TIL新发现，并助力肿瘤微环境研究。Agenda：肿瘤微环境与肿瘤浸润白细胞研究肿瘤浸润白细胞的目的肿瘤浸润白细胞研究的困难及挑战美天旎肿瘤浸润白细胞研究解决方案Q&A主讲人简介：田瑜博士，Ph.D., Product Manager, Miltenyi Biotec复旦大学神经生物学国家重点实验室取得博士学位，后就职于Prof. Brian Seed研究室从事单克隆抗体表达系统的研发工作。2016年进入生命科学产品营销领域，现任美天旎中国产品经理。直播时间：2020年3月26日（本周四）下午3：00—4：00报名方式：扫描上方二维码，即可报名参与！

一次肿瘤细胞的意外死亡，让一种明星分子浮出水面。日前，在科技成果评价机构组织的鉴定会上，一种独特的免疫蛋白分子引起了评审专家的兴趣。“肿瘤细胞死亡时的照片上，周边有起泡的现象非常有意思。”国家重点研发计划首席科学家、南京大学李朝军教授表示，这个情况和细胞焦亡挺像，值得更进一步的研究和应用。“这种分子是在七鳃鳗的免疫系统中找到的，它能够识别出人体肿瘤细胞，并从外面打孔，让肿瘤细胞死亡。”研发团队带头人、辽宁师范大学原副校长李庆伟教授介绍，目前正利用这种明星分子推动癌症早筛工作。本想向肿瘤细胞学习，却把它杀死了七鳃鳗在地球上已经生活了5.5亿年，被戏称为“僵尸鱼”，介于无脊椎动物和脊椎动物之间。“我们想把七鳃鳗细胞和肿瘤细胞放在一起培养，借助肿瘤细胞增殖因子，帮助七鳃鳗细胞繁衍。”李庆伟回忆，没想到的是，肿瘤细胞都死亡了。换了不同的肿瘤细胞结果仍一样。研究团队感觉七鳃鳗细胞一定分泌了一种独特的物质，对肿瘤细胞是致命的。为了找到这种物质，团队大量收集细胞培养上清，通过蛋白质组学技术最终锁定了LIP蛋白。围绕这一蛋白的系统研究在后来的十几年中逐渐推展开——破解蛋白结构、解码对应DNA序列、分析蛋白结构中的不同功能… … 谜题一一解锁，但人们最关心的是：古蛋白究竟是怎么杀死肿瘤细胞的？古老蛋白“一招夺命”肿瘤细胞光学显微镜下，一场杀戮由近及远次第展开。“我们给LIP‘镀上’荧光，标记了荧光基团的蛋白分子进入肿瘤细胞培养液，能从显微镜下看到荧光迅速聚集到了肿瘤表面，肿瘤细胞膜随后破裂。”辽宁师范大学生命科学学院教授逄越展示的照片复盘了整个过程：肿瘤细胞表面出现了大的孔洞，肿瘤细胞里的内容物全部外泄，一招夺命。更有趣的结果发生在研究团队“打扫战场”时。他们把肿瘤细胞表面的古蛋白做了收集检测发现，杀伐时蛋白不单兵作战，而是“组团”的聚合体。“我们提出了识别、定位、聚集、杀伤的机制。”逄越说，研究表明聚合体越多杀伤作用越大。整个机制的解析花了团队5年时间，终于弄清楚，蛋白上“凝集素”的结构域负责“指认”，“气单胞菌溶素”结构域能深深地插入肿瘤细胞膜搞破坏。明星分子“小试牛刀”机制清晰，研究走到了应用阶段。团队决定先让明星分子小试牛刀，在检测领域做验证。健康中国行动要求强化癌症早筛。膀胱癌检测一直痛苦得让患者望而却步，不愿早筛，实现“滴尿”筛查将让癌症发现大大提前。“我们将明星分子做成了检测试纸。尿液中脱落的膀胱表皮细胞如果有肿瘤的迹象，马上会被预警。”辽宁师范大学生命科学学院副教授韩英伦告诉科技日报记者，团队先从学校职工体检的尿检入手建立了指示分子含量的对照表，然后与大连市的几家医院合作进行临床研究，肿瘤患者的值会高过正常值2—3倍。相关研究数据显示，利用LIP特异性识别肿瘤细胞技术，尿液检测膀胱癌的LIP免疫荧光试纸灵敏性达到85%，特异性可达92%，简单、快速、微量、无创。“国际上这类检测试剂不多，美国FDA目前有三款试剂盒上市。”评审专家、大连医科大学附属第二医院院长刘志宇教授表示，作为我国自主研发的检测产品，尤其是从靶点开始的源头创新，目前的研究进展令人震撼。评审专家一致认为，该项目具有完全自主知识产权，达到国际领先水平。据介绍，相关研究多年来得到科技部国家重点基础研究发展计划、国家自然科学基金、辽宁省高等学校重大科技平台等项目支持。

人类大多数肿瘤是异质性的，由具有不同性质的细胞克隆组成，呈现出不同的特点。高度异质性肿瘤具有较差的临床疗效，但其潜在机制仍不清楚。肿瘤的转移性是大多数癌症患者死亡的原因。因此，了解转移进程的驱动因子是改善临床结果的关键。癌症基因组测序研究已经确定了原发性和转移性肿瘤之间具有极小的遗传差异，并显示原位肿瘤和远处转移病灶具有显著的亚克隆异质性。最近的一些研究表明：微观环境变化是肿瘤转移传播和生长的主要媒介，从而突出了在肿瘤进展中的非细胞自发因子的作用。本期IVIS视角小编带您探究一下Nature最近发表的论文：《亚克隆合作通过修饰局部和全身的免疫微观环境驱动肿瘤转移》本文揭示了表达IL11和FIGF (VEGFD)的乳腺癌细胞的小亚克隆协同作用促进转移进展并产生了驱动性和中性亚克隆组成的多克隆转移。单克隆、多克隆原发灶和转移灶的上皮细胞及基质细胞表达谱分析显示了这种协同作用是间接的，是通过局部和系统微环境介导的。作者确定中性粒细胞为主的白细胞群受表达IL11小亚克隆的调节，敲除中性粒细胞的表达，可以阻止肿瘤转移的生长。来自原发性肿瘤、血液和肺的CD45阳性细胞群的单细胞RNA-seq显示IL11作用于骨髓间充质基质细胞，可诱导产生致瘤性和转移性中性粒细胞前体。本文结合IVIS活体成像系统研究发现了非细胞自发因子和小亚克隆在肿瘤转移中起着关键作用。探究驱动转移的亚克隆协同作用分子机制本文用人类乳腺癌细胞系(MDAMB-468)的肿瘤（来源于异质性肿瘤异种移植模型），研究亚克隆在肿瘤表型之间的相互作用。作者之前已经证实一个小的亚克隆通过非细胞自主的相互作用可以驱动肿瘤生长。本文测试了18个亚克隆，每一种表达一种与转移和血管再生有关的分泌蛋白。并发现具有全部18个亚克隆的多克隆肿瘤生长最快（上图a）。相反只有白细胞介素11 (IL11) 和趋化因子 (C-C motif) 配体5在单克隆肿瘤能够促进肿瘤生长。我们还确定了表达IL11和低聚果糖诱导生长因子（FIGF也被称为VEGFD）的亚克隆两者的混合物在很大程度上能够复制肿瘤这种生长特点。克隆之间合作导致多克隆转移Nature Cell Biology :Published: 01 July 2019https://www.nature.com/articles/s41556-019-0346-xIL11缺失的多克隆肿瘤阻止了肿瘤的生长，揭示了IL11和FIGF因子在肿瘤生长中的协同作用。此外，多克隆肿瘤和仅包括IL11和FIGF亚克隆的肿瘤具有高度的转移性（上图b）。本文首先验证含有IL11+和FIGF+驱动因子的原发性转移瘤MDA-MB-468的克隆能力，像中性子亚克隆。单克隆或绿色荧光蛋白 (GFP)的多克隆混合物荧光素酶表达亲本细胞，红色荧光蛋白 (RFP)植入v5标记的IL11+细胞、RFP+FIGF+细胞植入到免疫缺陷NOG小鼠的乳腺脂肪垫。我们每周用卡尺测量原发肿瘤的生长情况并通过每周生物发光观察转移病灶成像。多克隆肿瘤（含5% IL11+、5%的FIGF+RFP+细胞和90%的GFP+亲本细胞）生长较快，转移性更强与单克隆和亲本肿瘤相比（如下图a）。中性粒细胞的系统性表达降低抑制了由IL11+和FIGF+亚克隆驱动的多克隆肿瘤的转移扩散(或生长)，因此，中性粒细胞的表型和功能特点取决于宿主环境。CD45+细胞群的单细胞分析鉴于作者之前的结果表明，中性粒细胞促进肿瘤转移。作者比较了DOX+或DOX-诱导小鼠血液和肺中性粒细胞单细胞转录组特点。IL11和FIGF诱导上调了几个信号通路如：TGFβ和JAK-STAT信号通路，它们与中性粒细胞的免疫系统中肿瘤预生成和预转移有关，这些特征来自肺部，而不是来自血液。尽管中性粒细胞在肺部有变化，作者通过single-cell RNA-seq没有检测到IL11或GIGF受体的表达。然而，IL11RA的细胞转录本在单独的细胞组中明显存在，这些细胞不能归为中性粒细胞或其他白细胞亚群。这些IL11RA阳性细胞表达编码GP130和SATA3的IL6ST基因，GP130是IL11信号通路中所必需的共同受体。STAT3是LI11下游的作用因子。基于细胞群中基因表达情况，其中还包括细胞外基质和发育相关蛋白，作者将该群体标记为和IL11反应的间充质基质细胞 (MStrCs)。虽然这个群体没有表达典型的间充质干细胞 (MSC)标记物，但其表现了普遍存在于干细胞相关基因的显著特征，这表明它可能是一种未特征化的间充质干细胞前体。之前的研究已经描述过间充质干细胞与白细胞之间的相互作用由多种细胞因子和趋化因子调节的。在本文的研究中，作者着重于研究两个分泌因子，选择的基础是基于作者之前的数据，它是由较小的亚克隆表达的且协同作用促进转移。IL11属于IL6家族的细胞因子，并在多种癌症的耐药性进展中起着重要的作用，包括前列腺癌和结肠癌。在乳腺癌中，IL11被认为和治疗的耐药性和骨转移相关，以及作为不良预后的标志物。FIGF是VEGFR2和VEGFR3的配体，可以刺激血管生成和淋巴管生成。本文发现白细胞可能不是IL11直接作用的细胞靶点，但可通过间充质基质细胞分泌因子（MStrCs）间接影响IL11。有趣的是，这些基质细胞也表达PLXDC2和ANTXR1，这在肿瘤相关的内皮细胞中是高表达的。因此，这些IL11RA阳性的间充质基质细胞可能是产生多种细胞类型的祖细胞。对中性粒细胞亚型的进一步认识和开发导致肿瘤转移的中性粒细胞靶向工具结合抗肿瘤细胞靶点的药物，有可能被用于预防乳腺癌转移研究。PerkinElmer IVIS小动物活体成像系统在该研究中提供了支持，如需了解详情欢迎与我们的工程师取得联系。点击链接了解IVIS小动物活体成像系统：https://url.cn/5fSl2r4关于珀金埃尔默：珀金埃尔默致力于为创建更健康的世界而持续创新。我们为诊断、生命科学、食品及应用市场推出独特的解决方案，助力科学家、研究人员和临床医生解决最棘手的科学和医疗难题。凭借深厚的市场了解和技术专长，我们助力客户更早地获得更准确的洞见。在全球，我们拥有12500名专业技术人员，服务于150多个国家，时刻专注于帮助客户打造更健康的家庭，改善人类生活质量。2018年，珀金埃尔默年营收达到约28亿美元，为标准普尔500指数中的一员，纽交所上市代号1-877-PKI-NYSE。了解更多有关珀金埃尔默的信息，请访问www.perkinelmer.com.cn。

3月31日，在2024肿瘤健康管理大会暨分子肿瘤学全国重点实验室年会上，备受瞩目的《中国临床肿瘤类器官标准化实验室及样本库建设》专场活动顺利召开，继1月6日全国项目启动会召开后，本次大会上又重磅发布了《中国临床肿瘤类器官标准操作及样本管理质控标准及推荐建设方案》以及《中国临床肿瘤类器官标准化操作及应用能力提升项目》两项重要内容，为中国临床肿瘤类器官标准化建设推进迈出重要一步。为此，特别邀请国家癌症中心/中国医学科学院肿瘤医院马飞教授就中国临床肿瘤类器官的应用现状及该项目对推动中国临床肿瘤精准诊疗发展的重大意义进行权威解析。Q1：近年来，3D类器官技术如热浪席卷科研界，肿瘤类器官被誉为“试药替身” ，请您谈谈肿瘤类器官在优化肿瘤临床生态的应用前景及价值。马飞教授：当前肿瘤研究领域面临两大共性问题——异质性及肿瘤进化，相关临床诊疗及科研活动主要围绕这两方面开展。类器官是利用组织样本或多能干细胞进行体外3D培养而形成的具有一定空间结构的组织类似物，能够在结构和功能上模拟真实器官，具有组织器官功能，并可以稳定传代，因此也称为“微型器官”。肿瘤类器官是将类器官和肿瘤结合起来的概念，由患者的肿瘤样本直接构建的肿瘤类器官，高度还原人源肿瘤的组织结构和基因谱系，可以保持肿瘤的异质性。肿瘤类器官为肿瘤研究和体外高通量筛选药物提供了比传统2D细胞系或小鼠模型更有效的检测模型，同时其精准度、周期、准确率以及成本等，相较于传统NGS等间接手段，也具有巨大优势。目前，肿瘤类器官技术在肿瘤精准治疗、基础医学研究、新药开发三个应用领域价值越来越凸显，例如更快更精准地为肿瘤患者制定治疗方案，同时对临床用药方案进行疗效评估；构建更精准地肿瘤疾病模型；创造更高效的新药研发的实验工具，而这三方面的应用正是精准医学时代最重要的三个价值领域。当然，随着生物技术的快速发展，肿瘤类器官技术不仅可以作为当前循证医学的重要手段补充，甚至在药物经济学、临床和科研应用转化等方面有着无可替代的优势。Q2：目前，与国际相比，中国类器官技术正处于什么阶段？主要挑战是什么？马飞教授：目前，我国类器官培养技术正处于技术爆发和科研成果井喷的阶段。从发表的论文数量来看，2022年我国发表文章占比达到了14%，仅次于美国，处于全球领先水平。再加之，近年来国家政策的大力支持，为我国肿瘤类器官事业的发展吹响了时代的号角。2021年，类器官技术纳入首批“十四五”重点专项加强重大难治性疾病类器官模型研究。国务院发布《医疗器械管理条例》明确医疗机构可自行研制、使用有临床需要的检测项目（LDT模式）。2023年国家药监局药品审批中心发布《人源干细胞产品非临床研究技术指导原则（征求意见稿）》明确类器官模型可作为非临床研究替代性模型应用。尽管类器官是一种革命性的体外疾病模型，在干细胞与发育、再生医学、肿瘤研究、药物开发和精准医疗等领域的应用发展迅猛，但由于国内对肿瘤类器官构建、鉴定、保存及应用尚无质量控制标准，同时也缺乏针对肿瘤类器官技术标准统一的操作流程及平台建设方案，很大程度上间接制约了肿瘤类器官技术转化及产业化进程。回归到临床和科研转化上，无论是在临床常规药敏检测服务还是临床科研（尤其是多中心临床科研研究）的开展过程中，临床肿瘤类器官（Clinical Patient-derived organoids,CPDOs) 培养的稳定性、培养周期、通量、成本等方面的要求均远高于常规实验室基础研究所需的培养要求，堪比军工级别和民用级别的差别。因此，临床肿瘤类器官（CPDOs）技术要想实现普及和更充分的价值转化，标准化建设势在必行。基于此，今年1月6日，我们在北京正式启动了《中国临床肿瘤类器官标准化实验室及样本库建设项目》；同时在本次肿瘤健康管理大会上，隆重发布了全国首个通用的临床肿瘤类器官标准化实验室及样本库建设方案及质控标准，这将为肿瘤类器官技术的临床规模化普及应用提供引领性指导，开启我国临床肿瘤类器官（CPDOs）标准化、规范化、规模化新纪元。Q3：如您前面提及，我们也观察到从1月6日《中国临床肿瘤类器官标准化实验室及样本库建设项目》全国启动以来，在全国肿瘤临床诊疗及科研领域反响巨大，能否请您再详细介绍下该项目阶段性目标和主要内容？马飞教授：《中国临床标准化实验室及样本库建设项目》是由国家癌症中心分子肿瘤学全国重点实验室、博鳌肿瘤创新研究院联合开展，该项目本着同质互助原则，汲取当前国内外最新前沿类器官技术，竭力帮助所有项目参与单位熟练掌握相关技术操作及科研能力。在国家癌症中心的牵头指导下，分子肿瘤学全国重点实验室及博鳌肿瘤创新研究院联合发起，邀请国内各省市权威医疗中心临床、科研专家团队参与，同时得到包括嘉士腾等企业单位支持，从理论基础到技术应用全流程帮助参与中心提升相关技术能力。该项目主要目标是统一技术标准、建设规范平台、凝聚行业共识和实现价值转化。第一阶段目标是通过1年左右建设时间多维度实现：1）建立一组科学、规范的符合项目专家委员会认证的肿瘤类器官标准实验室及样本库建设标准（人员技能、设备配置、流程规范、质控体系）；2）制定一系列关于类器官技术开展及应用转化的专家共识、质控标准、指导手册、培训及验收体系；3）建设若干国际水准的高素质类器官实验室科研团队；4）建设若干国家或区域级肿瘤类器官标准样本库。同时，在全国率先建立至少15家以上符合项目建设标准的肿瘤类器官标准实验室和样本库，包括京津冀、长三角、川渝、华中华南等多个区域的权威医疗中心，同心协力，带动区域普及。此外，2024年项目关键文件成果产出，例如《中国临床肿瘤类器官标准实验室及样本库建设方案》操作手册（2024第一版）、《恶性肿瘤类器官标准化建设与应用》专著（清华大学出版社）、《中国临床肿瘤类器官标准化操作及样本管理质控标准》（2024第一版），以统一标准促进技术广泛普及。在完成关键的第一阶段建设后，在2025年将会进入全面建设期，届时会进行全国第二批更大规模的标准化中心建设，实现该技术在临床的全面普及。当然，我们期待全国更多优秀中心和科研团队能从现在开始就积极报名参与第一阶段的技术引进和平台建设，共同推动肿瘤类器官技术标准化和规范化建设。Q4：近年来，国内涉足推广类器官技术的企业不断增加，但当前国内仍缺乏相对统一的技术及质控标准，培养体系及试剂耗材繁杂，不同体系及试剂可靠性、稳定性参差不齐。对此，在临床肿瘤类器官（CPDOs）类器官标准化培训上是否有一些探索？马飞教授：随着我国越来越多临床科研转化成果的产出，临床及科研人员对类器官技术的关注愈发强烈，国内临床医疗机构对临床肿瘤类器官（CPDOs）技术的学习需求日趋增加。基于“中国临床肿瘤类器官标准化实验室和样本库建设项目”，建立了“临床肿瘤类器官标准化实验室建立和应用的培训体系”。通过线上线下一体化模式，开展“临床肿瘤类器官（CPDOs）类器官标准化培训”，内容包括全国直播课、线下实操培训、线下科研培训等，以促进广大临床和科研团队了解肿瘤类器官的原理和方法，掌握临床主流癌种类器官的标准化培养操作、样本管理及相关科研开展能力，进而推动国家级标准化肿瘤类器官样本库建设、临床精准化诊疗应用及相关技术科研成果转化。最后，结合本次中国肿瘤健康管理大会上发布的《中国临床肿瘤类器官标准化操作及样本库管理质控标准及推荐建设方案》，计划于在4月6日（周六），由博鳌肿瘤创新研究院牵头，在20余家医学媒体及相关单位的支持下，以线上形式，召开《中国临床肿瘤类器官标准化操作及应用能力提升项目》暨中国临床肿瘤类器官标准化操作技术引进及科研培训合作沟通交流会。在此也邀请国内所有目前正在开展细胞生物相关科研技术活动的实验室机构、团队、专家同道们共同参与本次线上沟通会及后续相关技术引进与科研培训合作开展，共同推动我国临床肿瘤类器官（CPDOs）技术标准化、规范化发展，共同迎接中国肿瘤精准诊疗拐点的到来。2024年4月6日(星期六)上午9:00云端相见，不见不散！

会议简介：类器官在癌症研究、神经生物学、干细胞研究和药物发现领域变得越来越重要，因为它们可以增强人体组织建模。类器官源于干细胞，并可扩展为多种组织类型，包括肝脏、肺、脑、肾脏、胃和肠。由于这些 3D 微小组织能够模拟体内器官，因此在人类发展和疾病机制方面能为研究人员提供更多见解。2023年3月9日，分析 测试百科网联合美谷分子举办本次研讨会，将邀请行业专家，通过与大家共同讨论类器官在肿瘤中的研究现状及应用，希望能对行业内工作者带来帮助和启发。会议日程：时间演讲题目主讲人14:00-14:30类器官在消化道肿瘤的发展和应用蒋明研究员浙江大学14:30-15:00类器官自动化解决方案及高内涵3D成像分析吴霜高内涵产品应用科学家美谷分子仪器（上海）有限公司蒋明，浙江大学研究员：毕业于复旦大学生命科学学院，获得生物物理学博士学位。先后在美国罗切斯特大学、哥伦比亚大学进行研究工作。入选国家千 人计划青年项目。长期从事前肠起源的器官包括食管、胃和肺的干细胞在器官损伤再生及在肿瘤中的功能研究。以类器官结合动物模型，鉴定不同类型和起源的干细胞在参与损伤后再生以及在肿瘤形成过程中的作用，已发表一系列高水平SCI研究论文，包括Nature，Journal of Clinical Investigation、Developmental Cell和PNAS等多篇领域内顶 级期刊。承担科技部重点专项和国家自然科学基金等研究课题。获得国家发明专利1项。吴霜，Molecular Devices高内涵产品应用科学家：细胞生物学博士，毕业于中国科学院上海生命科学研究院。具有5年显微成像产品使用经验，擅长高端显微镜和共聚焦的使用和分析，目前担任Molecular Devices高内涵产品应用科学家。报名请扫码：会议时间：2023年3月9日下午14:00-15:00

肿瘤标志物联合检测法在早期发现、病程监控、机制研究、肿瘤转移及预后监测中应用 据统计，我国每年新患癌症的病人约160万人，每年因癌症死亡的人数约130万人。我国大、中城市居民的许多死亡原因中，癌症是第一位死因。 世界卫生组织作出最新权威性结论，癌症患者如能早期发现，治愈率可达80%以上。肿瘤标志物可以比影像学更早的发现肿瘤，因而对于治疗癌症意义深远。肿瘤标志物的分泌来源于肿瘤微环境的基质细胞以及肿瘤细胞，存在于细胞、组织或体液中，能用化学或免疫方法定量证实肿瘤存在，监测肿瘤治疗和预后的物质。 图1：常见肿瘤标志物联合检测方案 目前为止，还没有找到灵敏度、特异性100%的肿瘤标志物。单一指标、单一因子的检测很难准确的实现肿瘤早期检测、病程监控及预后治疗效果的评估等。如传统的Elisa方法，仅能进行单一蛋白因子的检测。若要提高检测的准确性和特异性，需要进行多个Elisa实验检测不同的蛋白因子。以10个蛋白因子检测为例，需要10个Elisa试剂盒，至少1ml的样本，一周时间才能得到结果。无论从人力、财力还是时间和样本量来说，都不是很好的选择。而且10个因子不是同时检测也可能造成结果的误差。图2 检测对象越丰富疾病区分度越好（class代表指标分类，marker代表具体指标） 目前，实现肿瘤标志物联合检测的最便捷最高效的技术手段之一就是xMAP技术。xMAP技术基于不同荧光编码的微珠。每一种编码微珠标记一种可捕获相应目标分子的抗体，根据检测靶标的数量，选择1-100种标记的微珠，混合后与样品中待测的靶标分子作用，然后在液流驱动下逐个通过检测窗口，两束不同波长激光对每个微球进行检测，635nm激光检测微球的色标编码从而确定检测的靶标，532nm激光检测相应靶标上的荧光标记进行定量，通过计算机分析和标准曲线拟合，直接对每一种目标分子进行定量。该技术利用Luminex多功能液相芯片平台实现了对蛋白、核酸等靶标分子的多重检测，是唯一被纳入美国临床实验室质控的高通量技术，被誉为真正的临床型生物芯片。 图3 xMAP技术原理图 视频1：xMAP技术原理及Milliplex技术平台介绍基于xMAP技术的多重检测平台的优势：- 多重检测：实现1-500重因子同时检测，为微量样本的精确检测提供技术保障；- 高灵敏度：精密的光学设计提升检测灵敏度，可低至0.04pg/ml；- 快速/高通量：96/384孔板自动化高通量检测，每小时数据量可达9,600个结果；- 微量样本：仅需10-50ul的样本量使得跟踪动物模型的阶段性变化成为可能，避免个体差异带来的实验误差。 目前，已有几千篇文献报道利用xMAP技术进行肿瘤标志物联合检测以提高肿瘤检查准确性和特异性。例如，Irene等人采用非侵入性方法（血清）对卵巢癌6个标志物进行检测，发现6个标志物联合诊断比原来的单个CA-125检测准确率明显提升（95.3% vs 72%）,从而能够展开卵巢癌的早期治疗（图2）。 图4：Irene等人卵巢癌早期检测研究已发表于Clinic Cancer Research(IF: 8.19) 作为Luminex 最早的全球合作伙伴，Merck提供包括Luminex仪器、Milliplex高通量多因子检测试剂盒、Milliplex Analyst 软件和Biomarker service在内的一整套高通量多因子检测平台。Merck始终致力于生物标志物多重检测技术与研发，拥有三十多年的研发和服务经验。目前可以提供8个种属超过1200个蛋白因子的检测，涉及免疫、代谢、肿瘤、神经、信号通路、干细胞等多个热门研究领域，能够满足多数肿瘤标志物开发与诊断需求。此外，Merck已与全国各地肿瘤医院与研究所合作，提供检测平台和服务，积累了二十年检测与分析的经验，因此开设肿瘤标志物联合检测法应用专题，分享成功经验给广大临床及诊断研究工作者。 本专题将分成多期探讨肿瘤的早期发现、病程监控、机制研究、肿瘤转移及预后监测等方面的标志物多重检测应用。欢迎订阅Merck生物标志物期刊，掌握最新研究进展。 点击此处订阅 若以上链接无法点击，请扫描二维码。专题下一期预告：肿瘤早期诊断之多重生物标志物检测法默克生命科学Tel: 021-38529074Email: china.marketing.online@merckgroup.comweibo: 默克生命科学新浪微博wechat: 公众号默克生命科学

肿瘤异质性对癌症预后和治疗反应有显著影响。传统的基因组和转录组分析被广泛用于研究不同的癌症类型，在预测预后和对不同治疗的反应以及为癌症治疗提供靶点方面具有潜在作用。不同癌症类型的单细胞分析表明，肿瘤免疫微环境的详细信息在多种癌症类型之间共享。目前，自从发现检查点抑制剂以来，免疫治疗彻底改变了癌症治疗并引起了越来越多的关注。肿瘤免疫微环境由非细胞成分(血管、细胞外基质、信号分子等)和细胞成分(T细胞、髓细胞、成纤维细胞等)组成。尽管传统的基因组和转录组学分析，也强调免疫相关途径和计算方法，并已应用于预测免疫细胞成分，但技术限制阻碍了时间的精确表征。传统的批量基因组和转录组分析获得的信号均来自不同细胞，掩盖了特定细胞类型和状态的识别。原位杂交和免疫组织化学已被用于探索单个细胞的基因组、转录组和蛋白质组学特征，但其产量相对较低。流式细胞术能够分析数千或数百万个单细胞蛋白质组学图谱；然而，这些方法需要事先选择感兴趣的抗体。随着细胞分离和测序技术的突破，单细胞转录组测序已经能够在单次运行中在单细胞水平上对许多细胞进行无偏好的全基因组分析。单细胞转录组测序已被用于分析单个细胞的转录组学，用于解析细胞间的异质性。肿瘤免疫微环境在诊断、治疗和预测不同类型癌症的预后方面显示出了潜力。与传统方法相比，scRNA-seq可用于识别新的细胞类型和相应的细胞状态，加深了我们对肿瘤免疫微环境的理解。1.介绍了scRNA-seq的原理，并比较了不同的测序方法。2.根据肿瘤免疫微环境中新的细胞类型、持续的过渡状态以及肿瘤免疫微环境成分之间的相互通讯网络找到了癌症的预后预测和治疗的潜在靶点。3.总结出在肿瘤免疫微环境中应用scRNA-seq后发现的由癌症相关成纤维细胞、T细胞、肿瘤相关巨噬细胞和树突状细胞组成的新型细胞簇。4.提出了肿瘤相关巨噬细胞和耗尽的T细胞的发生机制，以及中断这一过程的可能靶点。5.对肿瘤免疫微环境中细胞相互作用的干预治疗进行了总结。几十年来，肿瘤免疫微环境中的细胞成分定量分析已被应用于临床实践，预测患者生存率和治疗反应，并有望在癌症的精确治疗中发挥重要作用。总结目前的研究结果，我们认为单细胞技术的进步和单细胞分析的广泛应用可以导致发现癌症治疗的新观点，并应用于临床。最后，作者提出了肿瘤免疫微环境研究领域的一些未来方向，并认为通过scRNA-seq对这些方向进行辅助。相关会议预告：8.30召开，点击报名scRNA-seq在刻画肿瘤免疫微环境中的应用scRNA-seq技术进展scRNA-seq程序主要包括单细胞的分离和提取、cDNA合成、核酸扩增、测序和数据分析。与传统的批量测序相比，scRNA-seq单个细胞中的RNA量相对较少。因此，需要更有效的扩增方法。研究人员已经成功建立了稳定的单细胞文库构建过程，以产生足够的cDNA用于测序。单细胞分离和捕获是scRNA-seq在不同方法中的基本程序。目前单细胞分离和捕获的常用方法。这些程序分为四大类：激光捕获微切割、油滴包裹技术、流式细胞荧光分选技术和微流控微孔技术。scRNA-seq技术的未来发展可能会降低成本并增加细胞产量，使scRNA-seq成为研究单个细胞转录组的标准工具。肿瘤免疫微环境的细胞成分肿瘤免疫微环境的细胞成分包括淋巴细胞(T和NK细胞)、髓细胞(巨噬细胞和树突状细胞)、成纤维细胞和其他免疫细胞。成纤维细胞传统上被归类为基质细胞，因为它们在构建细胞外基质中发挥着重要作用。在这里，作者将肿瘤免疫微环境的癌相关成纤维细胞包括在内，因为它们分泌丰富的促炎和抗炎因子来重塑免疫微环境。细胞毒性CD8+T细胞识别肿瘤细胞上的特异性抗原并随后消除它们，是免疫微环境最常见和最有效的免疫细胞。CD8+T细胞的细胞毒性功能依赖于CD4+T Th1细胞。其他CD4+T细胞，包括Th2细胞和Th17细胞，也促进肿瘤微环境中的免疫反应。调节性T细胞抑制肿瘤免疫微环境并加剧肿瘤进展。自然杀伤T细胞和自然杀伤细胞也参与其中。它们的受体识别肿瘤细胞，从而激活其他免疫细胞。作为先天免疫的重要组成部分，骨髓细胞，包括肿瘤相关巨噬细胞和树突状细胞，在肿瘤免疫微环境中发挥着重要作用。巨噬细胞通常分为促炎M1和抗炎M2表型。肿瘤相关巨噬细胞主要由M2巨噬细胞组成，通过产生生长因子和细胞因子促进肿瘤生长、肿瘤存活和血管生成。DC对于T细胞的抗原呈递至关重要，连接先天免疫和适应性免疫。癌症相关成纤维细胞在肿瘤免疫微环境中维持增殖和分泌调节因子，可分为炎症性CAF和肌纤维母细胞CAF。炎症性CAF具有较高的细胞因子和趋化因子分泌，而肌纤维母细胞CAF高度表达收缩蛋白，成纤维细胞对免疫微环境起相互抑制作用。研究表明，成纤维细胞募集M2巨噬细胞和调节性T细胞，抑制肿瘤微环境中的免疫反应。肿瘤相关成纤维细胞也被发现在某些情况下会支持抗肿瘤免疫。除了分泌抗体，B细胞还通过产生与T细胞相互作用的细胞因子参与细胞免疫。研究表明，B细胞抑制细胞毒性T细胞并诱导CD4+T细胞分化为调节性T细胞。B细胞也是最近引入的三级淋巴结构的重要组成部分，富含B细胞的三级淋巴结构与各种肿瘤的生存和免疫治疗反应有关。先前的研究强调了细胞成分在时间中的重要作用。然而，免疫细胞的鉴定常基于有限的细胞标记，并借助免疫组织化学。个体免疫细胞的转录组图谱是探索不同免疫细胞及其相应功能所必需的。为了理解细胞进化过程及其决定因素，有必要应用scRNA-seq观察每个细胞的转录动态。利用scRNA-seq探索免疫微环境的新发现聚类和注释对于解释scRNA-seq数据探索至关重要。根据细胞相似性对数据进行划分，挑战在于在不提供先验知识的情况下估计固有的簇数或密度。可能的解决方案是采用分层聚类方法来揭示细胞的分层结构，这也与细胞本体相一致。给定聚类方法产生的数据划分结果，需要细胞类型注释来提供生物学意义。注释的主要挑战是确定每个聚类中存在多少细胞类型，以及是否存在当前未发现的细胞类型。在实践中，研究人员通常首先识别每个聚类的标记基因，然后根据专业知识和文献对其进行注释。scRNA-seq使研究人员能够以更高的分辨率将免疫细胞分类为具有不同功能的亚群，描述了免疫细胞的常规亚型。利用scRNA-seq发现的淋巴细胞(T和NK细胞)、髓细胞(巨噬细胞和树突状细胞)和成纤维细胞的组成(图2)。人和小鼠样本的scRNA-seq表明，成纤维细胞可分为抗原呈递CAFs、癌症相关成纤维细胞或肌成纤维细胞。抗原提呈CAFs独特地表达主要组织相容性复合体(MHC)II类基因，包括激活CD4+T细胞的CD74。在结直肠癌中也观察到类似的抗原提呈CAFs亚群。乳腺癌症基因工程小鼠模型中成纤维细胞的scRNA-seq进一步鉴定了血管CAF、基质CAF、发育CAF和循环CAF。血管CAF、基质CAF和发育CAF似乎起源于固有成纤维细胞和恶性细胞发生上皮-间充质转化时的血管周围位置。循环CAF是血管CAF群体中增殖的部分。在其他小鼠模型中也发现了血管CAF和基质CAF，它们在患者乳腺肿瘤样本中是保守的，并且发现它们会增加乳腺癌症细胞的转移。提高CAF的分辨率为开发精确靶向CAF的药物提供了生物标志物。另一项关于乳腺癌症的scRNA-seq研究将调节性T细胞分为五类：共表达细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4的调节性T细胞、具有Ig和ITIM结构域的T细胞免疫受体，以及相互或仅表达相同基因的GITR和其他调节性T细胞，它们具有不同的功能。不同预后的患者具有不同比例的调节性T细胞簇，为个性化治疗提供了靶点。免疫微环境对T细胞和髓细胞进行了更详细的泛癌研究，发现存在颗粒酶K+T细胞、干扰素刺激基因+T细胞、杀伤细胞免疫球蛋白样受体在记忆性T细胞和NK细胞上表达、转录因子7+CD8+T细胞，ficolin 1+常规DC2、分泌性磷酸蛋白1+TAM，以及肿瘤微环境中的叶酸受体β+TAMs。基于scRNA-seq数据，免疫微环境还发现了新的免疫细胞亚群。葡萄膜黑色素瘤的scRNA-seq鉴定了以前未识别的细胞类型，包括主要表达检查点标记LAG3而不是程序性死亡-1或CTLA-4的CD8+T细胞。同时，在肝细胞癌中发现浸润耗尽的CD8+T细胞和具有高表达layilin的记忆T细胞的克隆富集，这些研究为癌症免疫治疗提供了新的靶点。因为CD8+T细胞是参与消除恶性细胞的主要成分。大肠癌CXC基序趋化因子的scRNA-seq鉴定配体BHLHE40+Th1样细胞与干扰素-γ调节转录因子BHLHE40。在不稳定肿瘤中，这些细胞对免疫检查点阻断有良好的反应，可能会提高免疫疗法的疗效。树突状细胞对于呈递抗原以激活肿瘤免疫微环境中的T细胞是必不可少的。胃癌的scRNA-seq揭示了一个新的树突状细胞簇，表达吲哚胺2,3-双加氧酶1和趋化因子C–C基序趋化因子配体(CCL)22、CCL17、CCL19和白细胞介素-32，它们参与T细胞的募集。胰腺导管腺癌的scRNA-seq还鉴定了除了常规细胞标记物之外还高表达吲哚胺2,3-双加氧酶1的树突状细胞簇。吲哚胺2,3-双加氧酶1对于催化色氨酸消耗和犬尿氨酸产生、抑制T细胞增殖和细胞毒性至关重要，这揭示了树突状细胞和T细胞之间的密切相互作用。此外，通过scRNA-seq鉴定了溶酶体相关膜蛋白3+树突状细胞，并且似乎是经典树突状细胞族的成熟形式。溶酶体相关膜蛋白3+DC可以迁移到淋巴结，并高度表达与T细胞相互作用的配体。这些表达特异性标记物的新型树突状细胞簇的发现为癌症免疫治疗提供了一个新的视角。使用scRNA-seq在肺腺癌中发现了肿瘤相关巨噬细胞的新特征基因，包括髓系细胞触发受体2、CD81、具有胶原结构的巨噬细胞受体和载脂蛋白E。此外，乳腺癌症的scRNA-seq表明，除了M2型基因如CD163、跨膜4域A6A和转化生长因子β1外，血管生成因子纤溶酶原激活剂、尿激酶受体和IL-8也在肿瘤相关巨噬细胞中表达。肿瘤相关巨噬细胞中这些新的基因特征图谱与患者生存相关，并为癌症治疗提供了新的潜在靶点。肿瘤样本scRNA-seq显示，一个肿瘤相关巨噬细胞亚群呈现出SPP1、巨噬细胞清除剂受体MARCO和MHC II类基因的高表达。MARCO和SPP1是巨噬细胞激活中的抗炎和免疫抑制信号，而MHC II类基因与促炎功能有关。其他scRNA-seq研究表明，肿瘤相关巨噬细胞经常同时具有促炎和抗炎特征。这一现象表明，肿瘤微环境中的巨噬细胞活化与传统的M1/M2极化不一致。图2：利用scRNA-seq揭示免疫微环境中的新的免疫亚群单细胞数据揭示免疫细胞进化大多数免疫细胞都处于细胞发育过程中。大量的免疫细胞处于发育轨迹的瞬态状态，而不是分化良好的细胞的离散状态。借助scRNA-seq和深入分析，研究人员可以探索分化细胞的特征、特定细胞类型的转变及其可能的机制。最常用的计算方法是拟时序分析。轨迹描述了细胞的发育过程，其特征是基因表达的级联变化。分支点代表细胞分化的显著差异。各种机器学习计算方法已被用于构建轨迹，包括Monocle3、DTFLOW、DPT、SCORPIUS和TSCAN，这些方法已在单独的综述中进行了评估和比较。由于肿瘤相关巨噬细胞和T细胞代表了免疫微环境中最丰富的免疫细胞类型，这里主要关注这两种细胞类型。scRNA-seq显示，TAMs经常共表达M1基因，包括TNF-α和M2基因，如IL-10，并且肿瘤相关巨噬细胞的分化和状态与其抗肿瘤作用直接相关。拟时序轨迹分析证实，肿瘤相关巨噬细胞在M1和M2表型之间连续转换。转录因子IRF2、IRF7、IRF9、STAT2和IRF8似乎在决定TAMs分化中很重要，并可作为表观遗传学靶点诱导肿瘤相关巨噬细胞的M1极化，从而产生促炎和抗肿瘤的微环境。使用环境刺激和抗原T细胞受体(TCR)刺激测定T细胞表型。不同状态的细胞之间TCR库的重叠，即TCR共享，也可用于研究T细胞的进化。结合scRNA-seq和TCR追踪在结直肠癌中发现20个具有不同功能的T细胞亚群。在黑色素瘤肿瘤的耗竭T细胞中发现了28个基因的耗竭特征，包括TIGIT、TNFRSF9/4-1BB和CD27，并且在大多数肿瘤的高耗竭细胞中也被发现上调。另一项关于T细胞的研究进一步鉴定了CD8+T细胞中的其他耗竭标记物，如LAYN、普列可底物蛋白同源物样结构域家族A成员1和突触体相关蛋白47。拟时序轨迹分析表明，T细胞在时间上处于连续激活和终末分化(衰竭)状态(图3)。已经进行了额外的研究来研究耗尽的T细胞的进化和逆转T细胞耗尽的潜在靶点。scRNA-seq与TCR分析相结合表明，功能失调的衰竭T细胞和细胞毒性T细胞可能在时间上与发育有关。因此，研究集中在CD8+T细胞从效应细胞到衰竭T细胞的过渡过程。scRNA-seq鉴定出两个CD8+T细胞簇为非小细胞肺癌中预先耗尽的T细胞。在肺腺癌中，预先耗尽与耗尽的T细胞比率与更好的预后相关。因此，在耗尽前中断预先耗尽的T细胞可能对癌症免疫治疗至关重要。由于免疫细胞和恶性细胞之间的密切相互作用，恶性细胞的进化在免疫细胞进化中也起着至关重要的作用。拟时序轨迹分析表明，转移性肺腺癌的轨迹分支不同于向纤毛细胞和肺泡型细胞的正常分化。受恶性细胞进化的影响，正常的骨髓细胞群体被单核细胞衍生的巨噬细胞和新型树突状细胞取代。T细胞也被发现会衰竭，从而构建免疫抑制的肿瘤微环境。同样，另一项研究表明甲状腺癌症细胞来源于乳头状甲状腺癌症细胞亚簇，其中构建了不同的肿瘤免疫微环境，导致预后显著恶化。图3：肿瘤相关T细胞和巨噬细胞的进化过程免疫微环境中不同细胞间的通讯网络免疫微环境上的细胞通讯与肿瘤进展有关。配体-受体相互作用是一种重要的细胞通讯类型，对于构建免疫微环境和识别潜在的治疗靶点至关重要。scRNA-seq是在细胞基础上进行的，这使得研究未发现的细胞相互作用变得可行。已经开发了许多基于scRNA-seq数据研究配体-受体相互作用的分析工具，包括iTALK、CellTalker和CellPhoneDB。这些工具利用了已知配体-受体对相互作用的数据库。其中，CellTalker利用差异表达的基因，而CellPhoneDB包括配体和受体的亚基结构。其他工具，如NicheNet，也考虑了受体细胞下游通路的变化。在肿瘤进展过程中，恶性细胞导致免疫细胞的募集和功能障碍，从而相互影响肿瘤的发生和恶性细胞的进化，形成恶性循环(图4)。发现TAMs通过表皮生长因子受体-双调节蛋白配体受体对与恶性细胞相互作用。在基底样乳腺癌细胞系中AREG的调节导致抗炎TAMs的招募。同时，基于scRNA-seq，发现了一种EGFR相关的反馈回路可促进胰腺腺鳞癌的进展。来源于TAMs的抑瘤素M也与其在恶性细胞上的受体相互作用，以激活信号转导子和转录激活子3。研究人员通过整合素受体与胶原蛋白、纤维连接蛋白、血小板反应蛋白1配体和富含亮氨酸重复序列的G蛋白偶联受体4-R-反应蛋白3的相互作用，发现CAF与胃癌细胞之间的通信，这些配体调节干细胞。此外，胰腺导管腺癌的scRNA-seq揭示了TIGIT与T细胞和NK细胞中的甲型肝炎病毒细胞受体2之间的相互作用，以及它们在恶性细胞中的相应配体PVR和LGALS9，导致免疫细胞功能障碍和胰腺癌症进展。因此，基于单细胞数据探索免疫细胞和恶性细胞之间的细胞相互作用提供了可能治疗靶点，以打破肿瘤进展的恶性循环。除了恶性细胞外，scRNA-seq和随后的分析还预测了免疫细胞之间在时间上的相互作用，这表现出相反的功能(图3)。例如，研究发现TAM降低了CXCL12-C-X-C基序趋化因子受体3和CXCL12-CXCR4的相互作用，增强了鼻咽癌细胞毒性T细胞和Tregs之间的CD86-CTLA-4相互作用，导致肿瘤免疫微环境加重癌症进展。此外，CAFs通过分泌CXCL12募集Tregs，并通过periostin与M2巨噬细胞相关。图4：免疫微环境中的细胞通讯网络基于scRNA-seq的肿瘤免疫微环境的临床应用和潜在靶点几十年来，临床实践中一直采用时间的量化来预测患者的生存率和对治疗的反应。利用免疫组化分析的免疫评分，量化肿瘤中的原位免疫细胞浸润。与传统的免疫评分相比，scRNA-seq在免疫微环境上提供了前所未有的渗透免疫细胞分辨率。已经鉴定出与预后相关的新的免疫细胞簇。例如，在早期复发的肝细胞癌中发现了一种独特的低细胞毒性先天性样CD8+T细胞表型。这些T细胞过表达KLRB1，同时下调共刺激和耗竭相关分子，包括肿瘤坏死因子受体超家族、成员9、CD28、诱导型T细胞共刺激因子、TIGIT、CTLA-4和HAVCR2。这种T细胞簇的浸润与癌症的不良预后相关。此外，基于scRNA-seq的细胞相互作用也被计算在预测模型中。基于细胞间通讯相关基因构建了机器学习模型，以预测肺腺癌的复发。将八个细胞间通讯相关基因和患者的临床信息相结合，获得了0.841的受试者-操作者特征曲线下面积。除了预后预测外，肿瘤免疫微环境中独特的细胞相互作用也与免疫疗法的反应有关。scRNA-seq分析发现，抗PD-1治疗的应答者和非应答者之间存在不同的细胞-细胞通信网络，有可能预测患者对抗PD-1疗法的反应。因此，在scRNA-seq的帮助下，可以更准确地预测患者的预后和对免疫疗法的反应。利用scRNA-seq在精准医学中具有启发性，例如帮助靶向治疗克服耐药性。例如，医生在使用替比法尼治疗的非CR肌肉浸润性膀胱癌症患者治疗前后应用患者衍生异种移植物的scRNA-seq。在治疗后的PDX中发现PD-L1的上调，并降低了免疫细胞的抗肿瘤作用。因此，选择了用PD-L1抑制剂进行额外治疗。随后，患者获得了良好的反应。此外，在单药耐药性肿瘤中，通过scRNA-seq鉴定了新的免疫亚型。用抗集落刺激因子1受体阻断TAMs不能减少胆管癌的肿瘤进展。scRNAs-eq鉴定了表达APOE的粒细胞髓系衍生抑制细胞的补偿富集，其介导T细胞抑制。TAMs和粒细胞性骨髓源性抑制细胞的双重抑制与抗CSF1R和抗淋巴细胞抗原6复合物、基因座G治疗联合增强了小鼠的免疫检查点阻断效果小鼠模型，这在临床实践中很有前景。除了治疗耐药肿瘤外，scRNA-seq在免疫微环境上的应用也突出了需要进一步研究的潜在新靶点。T细胞是免疫微环境中去除恶性细胞最重要的免疫细胞。然而，在不同的肿瘤中，耗尽的CD8+T细胞会导致不利的预后。除了众所周知的免疫抑制检查点外，scRNA-seq还鉴定了高表达内皮前体蛋白、酪氨酸酶相关蛋白1和内皮素受体B型的耗尽CD8+T细胞，这些细胞可以作为新的潜在靶点。髓细胞是免疫微环境招募免疫细胞所必需的。通过scRNA-seq鉴定TREM2/APOE/补体组分1，q亚组分阳性巨噬细胞浸润为透明细胞肾癌复发的预后生物标志物。另一项研究证实，小鼠中靶向TREM2的抗体与缺乏MRC1+和CX3CR1+巨噬细胞以及表达免疫刺激分子的髓系簇的扩增有关，这促进了T细胞反应并导致更好的预后。细胞相互作用也可以用作治疗靶点。肝内胆管癌的scRNA-seq揭示了血管CAFs与肝内胆管细胞之间的串扰。血管CAFs分泌的IL-6诱导Cajal间质细胞细胞的表观遗传学改变，从而增强恶性肿瘤。因此，IL-6信号在Cajal间质细胞的中断变得非常有趣。表1总结了scRNA-seq显示的癌症治疗的潜在靶点。表1：scRNA-seq显示的癌症治疗的潜在靶点总结scRNA-seq可以绘制全面的肿瘤免疫微环境细胞图谱，为各种肿瘤的临床应用提供了新的视角。此外，免疫微环境的细胞成分和通讯为癌症治疗提供了潜在靶点，并有助于精确医学的发展。技术的进步和单细胞分析的广泛应用可以发现癌症治疗的新观点，助力临床研究。作为突破性的新技术，单细胞分析技术有望逐渐取代传统的整体样本二代测序。单细胞分析技术在临床和药物开发方面的应用前景更为广阔，可以代替或补充分子、细胞和组织病理检测的现有技术，也可以用于新兴的细胞治疗。

p 　　 strong 前言：液体活检的产业发展概况 /strong /p p 　　2017年6月，世界经济论坛与《科学美国人》杂志的专家委员会联合选出了2017年度全球十大新兴技术榜单，其中肿瘤的无创诊断技术成功入选并荣膺榜首。肿瘤无创诊断技术即液体活检(liquid biopsies)的出现，标志着人类在攻克肿瘤的道路上又前进了一大步。与传统的组织活检相比，液体活检具备实时动态检测、克服肿瘤异质性、提供全面检测信息等独特优势。目前，临床研究中，液体活检主要包括游离循环肿瘤细胞(CTCs)检测、循环肿瘤DNA(ctDNA)检测、外泌体及循环RNA(Circulating RNA)检测等，与传统的依靠临床症状或影像学诊断技术比较，利用液体活检技术可以更早地发现疾病进展。 /p p 　　近十年来，肿瘤液体活检研究热度不断攀升，多个国家及地区积极投入其中。目前，美国的 CTC 临床研究水平遥遥领先于其他国家。而在近几年中国的CTC临床研究水平发展势头迅猛，实力不可小觑。援引21世纪经济报的统计，中国目前有47家公司在从事肿瘤液体活检，其中，26家公司选择ctDNA路线，9家公司选择CTC，代表性企业包括华大基因、药明康德、燃石生物、普世华康等。JP摩根和高盛预测，液体活检在全球的市场规模高达230亿美元，其中，美国占据61%的市场份额。中国液体活检市场在5-10年内的市场潜力约为200亿，近年来，肺癌、结直肠癌、胃癌、乳腺癌等癌症的患病率在中国逐年增加，肿瘤分子诊断的需求不断增加。根据国家癌症中心发布的数据，我国5年内诊断为癌症且仍存活的病例数约为749万，适合使用液体活检技术的肿瘤病人至少为 542 万人，占比达到了72%[1]。 /p p style=" text-align: center " img title=" 001.png" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/f169c5ec-0a68-4632-a402-6e5f09b33e47.jpg" / /p p 　　ctDNA检测作为一种“液体活检”技术，其具有简便、快捷，且在一定程上能克服肿瘤时间和空间异质性等优势，近年来被广泛用于治疗前肿瘤分子分型，参与靶向治疗选择性决策，以及在患者治疗过程中评估肿瘤动态和负荷变化，实时监测治疗的有效性，及监测患者机体的微小残留病灶、复发、预后评估、耐药的产生等多个方面。 /p p style=" text-align: center " img title=" 002.png" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/62a15883-e36d-4ace-9040-c9cb57d5a179.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong 　　近10年CTC相关发表文章数 /strong /p p style=" text-align: center " strong img title=" 003.png" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/84f91e00-1c73-4c5f-9df4-e006551a4625.jpg" / /strong /p p style=" text-align: center " strong 　　近10年ctDNA相关发表文章数[2] /strong /p p strong 　　技术的成熟催生了资本市场的火爆 /strong /p p 　　2015年，液体活检技术被《MIT Technology Review》评为年度十大科技突破之一。根据Piper Jaffray预测，2026年广义液体活检全球市场总容量约326亿美元，包括肿瘤领域286亿美元、无创产前诊断(NIPT)20亿美元、器官移植20亿美元。而2026年全球肿瘤液体活检市场容量可达286亿美元，其中早期筛查150亿美元、伴随诊断17亿美元、治疗监测50亿美元、复发监测69亿美元。[3] /p p 　　目前国外从事液体活检的主要公司包括：Grail、Guardant Health、Personal Genome、Trovagene、Genomic Health、Janssen Diagnostics、Qiagen、RainDance和Biocept等，其中不乏有Illumina、罗氏等巨头涉足其中，他们通过成立子公司或并购等方式，布局ctDNA领域，甚至完成大量融资来进行肿瘤早筛的临床研究。而国内的主要参与者包括华大基因、泛生子、达安基因、安诺优达、药明康德、贝瑞和康、诺禾致源等公司。涉及液体活检的基因检测公司早已被具有敏锐嗅觉的资本追捧，有些公司估值已经到了10亿以上。 /p p style=" text-align: center " img title=" 004.png" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/67d60a4d-daf4-4b9f-bd9f-a9724123dcf2.jpg" / /p p style=" text-align: center " img title=" 005.png" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/79e478b4-6cb8-4ef5-8536-3f19c3d37f9a.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong 国外CTC、ctDNA、外泌体公司[4] /strong /p p 　　基于目前行业火爆的现状，业界对于液体活检市场未来的发展也普遍持乐观态度。2017年2月，MARKET RESEARCH FUTURE发布了《Liquid Biopsy Market Research Report Global Forecast to 2022》，该报告预测：2016年至2022年，全球液体活检市场将以21.6%的复合年增长率增长 成本效益和消费者偏好的改变，将推动市场的发展。[5] /p p 　 strong 　液体活检如何一步步成为时代焦点? /strong /p p 　　早在1000年以前，阿拉伯医生Abulcasis就发明了活检技术，该技术的好处是医生可以根据病灶组织学结构对病情做出判断。随着近几年测序技术的发展与成熟，医生还可以对患者的肿瘤组织测序，进而给出更加精确的诊断结果。 /p p 　　但随着科学家们对肿瘤研究的深入，他们发现在肿瘤的诊断和治疗过程中组织活检技术具有一定局限。 /p p 　　液体活检作为体外诊断的一个分支，通过收集患者的血液或尿液等对肿瘤等疾病做出诊断。其中ctDNA作为一种无创肿瘤标志物，被认为具有良好的发展前景，但当时在ctDNA的检测技术上仍面临一些问题，如敏感性不足、适用范围有限等。 /p p 　　这里就不得不提到一篇突破性的研究，2014年4月，发表在Nature Medicine杂志上的一篇研究报告中[6]，来自斯坦福大学医学院的研究人员就开发了一种高敏感性的ctDNA定量检测方法(cancer personalized profiling by deep sequencing，Capp- Seq) ，有助于解决敏感性、适用范围等困难。 /p p 　　参与该研究的Maximilian Diehn博士说：“我们的目标是开发出一种能够克服ctDNA领域两大关键障碍的方法：首先，极高的检测灵敏度，能够检测出血液中极少量的ctDNA 第二，能广泛应用于绝大多数癌种，适于临床应用。” /p p 　　即便是在晚期肿瘤患者体内，绝大多数的循环DNA(cfDNA)都来自于正常的、非癌性细胞。因此需要采用一种综合性的策略从血液中分离出循环肿瘤DNA(ctDNA)，检测ctDNA的变异情况。为了提高这一技术的灵敏度，研究人员在提取、处理和数据分析方面进行了优化。 /p p 　　研究人员将这种通过深度测序来进行肿瘤个体化变异分析的技术命名为CAPP-Seq。该研究报道了CAPP-Seq技术在非小细胞肺癌(NSCLC)中的应用，研究人员在NSCLC引入Capp-Seq技术，设计为能够覆盖在95%以上肿瘤中鉴别出的体细胞突变，利用该技术，研究人员能够在100%的II-IV期NSCLC患者及50%的I期NSCLC患者的血液中检测到ctDNA的存在。在检测突变率低至0.02%的等位基因突变时，该技术的特异性能够达到96%。 /p p 　　尽管本研究的样本源自罹患非小细胞肺癌的患者(包括大多数的肺癌，如肺腺癌、肺鳞状细胞癌和大细胞癌)，但研究者发现这种方法应该可以广泛适用于不同的实体瘤。未来，其应用场景将不仅局限于追踪肿瘤确诊患者的病情进展，还能够用于健康或高危人群早期的肿瘤筛查。 /p p 　　两年后，同样是斯坦福大学医学院的研究人员进一步开发出一种称为集成数字错误抑制(IDES)的校正方法，能够检测到频率低至0.004%的基因突变，相关研究于2016年5月刊登于国际杂志Nature Biotechnology上[7]。2014年时，Capp-seq技术的检测极限是0.02%，存在一定的错误率，为矫正这些错误，研究团队首先设计了一种分子标签技术，许多ctDNA检测开发者也采用这种方案来降低错误率。由于单链DNA和双链DNA分子标签技术各有优劣，双链DNA分子标签技术在降低错误上效果更佳，但效率不及单链DNA，因此不适合ctDNA量有限的样本。为此，斯坦福大学的研究人员着手设计出一种混合策略。首先，他们设计出测序接头，可用于单链和双链的分子标签 第二步，斯坦福的团队设计了一种计算工具，可以校正测序或PCR的系统错误。 /p p 　　随后，研究人员在NSCLC患者样本上验证了上述检测。首先，他们检测了41名晚期NSCLC患者的EGFR热点突变。从88个血浆样本中检测到412个EGFR变异，所有变异都已经通过肿瘤活检样本确认。接着，他们在参考细胞系上评估了检测的技术限制，创建了参考细胞系混合物，等位基因的变异频率在0.05-1.6%。他们发现，分子标签技术和计算校正方法是互补的，结合使用效果更佳。这种方法的理论检测极限是0.00025%。最后，他们利用这种方法来监控30名NSCLC患者中的突变(这些患者的肿瘤已经过基因分型)研究人员发现，他们能够检测到频率低至0.004%的突变。 /p p 　　在有了优秀的技术后，斯坦福大学的科研人员创立了Capp Medical公司，致力于通过基因组学的方法来检测患者肿瘤类型。 /p p 　　而另一边，跨国公司罗氏早在几年前就已经开始着手开发基因组学检测肿瘤的新方法。2008年罗氏公司以34亿美元的价格收购了Ventana Medical Systems公司，迈出了基因检测肿瘤患者的第一步。 /p p 　　2015年4月，研发出CAPP-seq技术的团队以及其归属的Capp Medical公司也被罗氏收于麾下，不难看出罗氏希望在液体活检这一领域继续深入的决心。 /p p 　　罗氏公司拥有世界上最强大的肿瘤研发部门，在获得了优秀的团队和技术的条件下，自然是如虎添翼。2017年5月8日，罗氏宣布在全球推出AVENIO ctDNA分析试剂盒，其能针对靶向用药、耐药机制研究、动态监测三个不同临床应用方向，推出了三款Panel，包括AVENIO ctDNA Targeted Analysis Kit、AVENIO ctDNA Expanded Analysis Kit及AVENIO ctDNA Surveillance Analysis Kit。此三款Panel可以全面的检测包括SNP、InDel、SV及Fusion在内的肿瘤变异类型，并且匹配后续的数据分析服务器、分析软件，提供一站式的ctDNA检测整体解决方案。这款产品结合了肿瘤液体活检的便捷性与NGS的高效性，能够帮助研究人员自行完成检测及分析。同时，多项研究结果验证了AVENIO ctDNA分析试剂盒在不同的实验室均能保持良好的稳定性和可重复性。 /p p style=" text-align: center " img title=" 007.png" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/f0ad901c-cf56-4b6e-a67e-9da1b8af7e25.jpg" / /p p 　　基于NGS方法检测的三款试剂盒可广泛应用于肿瘤学研究： /p p 　　AVENIO ctDNATargeted试剂盒是基于靶向捕获测序技术的肿瘤液体活检基因分型检测试剂盒，包含17个NCCN等权威指南推荐的基因，用于肺癌、结直肠癌、胃癌、乳腺癌等多种肿瘤靶向用药基因检测。 /p p 　　AVENIO ctDNA Expanded 试剂盒是基于靶向捕获测序技术的肿瘤液体活检基因分型检测试剂盒，包含77个NCCN等权威指南推荐的基因及临床研究热点基因，可应用于肺癌、结直肠癌、胃癌、乳腺癌、卵巢癌等多类肿瘤耐药机制研究。 /p p 　　AVENIO ctDNASurveillance试剂盒是基于靶向捕获测序技术的肿瘤液体活检试剂盒，包含NCCN等权威指南推荐基因在内的197个基因，用于肺癌和结直肠癌等肿瘤突变负荷长期监测研究 /p p 　　在这儿不得不提到罗氏强大的战略思维和长远眼光。从早年的Genetech到液体活检领域的“祖师爷”Capp-seq技术，罗氏优秀的投资和并购策略让其在生命科学领域成为了强大的中流砥柱。 /p p strong 　　液体活检技术的缺点及行业壁垒 /strong /p p 　　凭借一管血液来检测肿瘤是数十年来全球医学界共同的梦想。而液体活检技术能利用各种检测手段从血液中捕捉肿瘤相关基因变异信息，用于肿瘤分子分型、靶向用药、耐药机制研究、复发监测等，可避免传统组织检测方法难以解决的肿瘤异质性问题、无法实时动态监测等局限。 /p p 　　尽管如此，液体活检技术还存在一定的技术缺陷。对于肿瘤早期筛查而言，CTC和ctDNA检测都面临的一个共同挑战，即二者DNA浓度较低，对检测技术的灵敏度要求极高。其次，液体活检的另一个挑战来自成本。在高成本的基因检测领域中，价格因素可能会影响液体活检的广泛应用。第三个挑战是液体活检并不适用于所有类型的肿瘤，由于血脑屏障会阻碍ctDNA进入血液，比如，胶质母细胞瘤释放到外周血中的ctDNA极低，并不适合液体活检。 /p p style=" text-align: center " img title=" 008.png" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/9ef9005c-1ea0-4b3c-b02b-7df5a7dbad43.jpg" / /p p 　　除了技术层面的问题以外，将液体活检研究成果转化为临床应用仍面临几个关键的壁垒。 /p p 　　一、缺乏检测标准，从Panel设计中基因位点的选择、实验过程中的质控标准建立、生物信息学分析流程的标准化，以及变异解读中数据库的选择，不同实验室之间并未形成统一的标准，检测结果可比性不强，因此，目前这种检测方法进入常规临床检测存在着一定障碍。标准化的试剂盒、规范化的数据分析流程、专业的遗传咨询解读，以及全流程整体解决方案是液体活检在临床广泛应用的前提。 /p p 　　二、患者或消费者的经济承受力。包括我国在内的许多国家并未将液体活检纳入医保报销范围内，而液体活检产品往往价格不菲。此外，肿瘤液体活检并未纳入肿瘤患者管理的标准临床指南中，这进一步影响了保险机构的承保决定，阻碍了液体活检的普及。 /p p 　　三、基础研究人员和临床医生间的信息互通。基础研究是液体活检技术发展的基石，而临床医生则负责落实患者的具体治疗方案，双方是否能够非常顺畅地交流信息，并且对于患者的检测报告以及治疗方案达成共识，这直接决定了液体活检技术能否真正让患者获得更好的个性化治疗。 /p p 　　随着检测手段的不断进步，检测灵敏度和稳定性的逐步提高，技术瓶颈终将突破，监管政策也将逐步完善。 /p p strong 　　科学研究仍未停止脚步 /strong /p p 　　2017年关于液体活检的研究依然如火如荼地进行，世界各地不断出现重磅级的研究成果。 /p p 　　今年不得不提到8月份NEJM杂志刊登了香港中文大学的卢煜明(Dennis Lo)教授的重磅级研究成果。 /p p 　　由于ctDNA在血液中的含量非常低，因此卢煜明教授带领其研究团队将研究对象转为会引起鼻咽癌的EB病毒的DNA。研究人员优化了筛查方法，结果显示，该种方法有效提高了鼻咽癌的早期检测和生存率。[8] /p p 　　EB病毒与鼻咽癌的发生有密切相关性，因此实验设计寻找从肿瘤进入血液大量的病毒DNA，而不是癌细胞本身的DNA。研究人员在约2万名进行筛选的男性中，发现1112人(5.5%)检测出病毒DNA。其中309人在一个月后进行了验证性实验。通过内窥镜检查和核磁共振检查后，确认34人得了肿瘤。34种肿瘤中有16例是非常早期的，这种肿瘤在早期阶段不会有任何症状。三年后，除了一个病人外，所有的病人都活了下来，在接受标准放疗后没有肿瘤的迹象。相比之下，通常只有70%的鼻咽癌患者能够存活。 /p p 　　使用肿瘤筛查也能够改善很多肿瘤患者的生存率，但研究人员认为肿瘤筛查的费用较为昂贵，据统计593名个体共需要花费28600美元来筛查一种肿瘤。要知道在诸如美国等地方，鼻咽癌非常罕见，用过高的花费来筛查鼻咽癌显得没有必要。而这种通过检测EB病毒DNA的液体活检筛查技术非常具有潜力，未来能够帮助挽救众多肿瘤患者的生命。 /p p 　　另外，8月14日，发表在Cancer Cell杂志上的一篇研究报告中，来自荷兰阿姆斯特丹自由大学医学中心的研究人员设计了一种新型的液体活检途径，即通过检测被循环血小板(circulating platelets)吸收的肿瘤RNA。这种名为thromboSeq的新型检测技术能够以接近90%的准确率对非小细胞肺癌进行诊断[9]。 /p p 　　研究人员表示，thromboSeq技术可以检测到血小板中约5000种不同的RNA分子，通过不断优化它的RNA基因panel(panel of RNA genes)，最终找到了少数能够预示肿瘤的RNA。研究人员利用这一检测方法对血液样本进行了测试，以确定其在肿瘤诊断中的准确性。结果证实，thromboSeq诊断早期肿瘤的准确率为81%，诊断晚期肿瘤的准确率为88%。在一个匹配年龄、吸烟状况和血液存储时间的验证对照组中，该方法的准确率高达91% 研究人员表示，这种新型技术未来有望进入临床试验中。 /p p 　　2017年10月，一项发表在国际杂志Nature Materials上的研究报告中，来自加州大学圣地亚哥医学院、穆尔斯肿瘤中心和中山大学癌症研究中心等机构的研究人员基于对包含循环肿瘤DNA(ctDNA)的血液样本进行研究，开发了一种用于肝细胞癌早期诊断和预后判断的新型液体活检技术[10]。 /p p 　　该研究中研究者共使用了1098例肝癌患者和885例正常人的临床样本数据。首先根据肝癌样本和正常样本的临床数据，从485，000个甲基化标记(来源于TCGA数据库)中筛选出了1，000个甲基化标记，随后挑选出扩增效率较高及甲基化特征多样化的401个甲基化标记进行深入研究。通过计算机深度学习715个肝癌患者ctDNA和560个正常样本的临床数据后，从401个甲基化标记中筛选出了10个甲基化标记，建立了肝癌的综合诊断模型cd-score。随后研究人员针对1049例肝癌患者的临床数据进行分析，得到综合预后模型cp-score(combined prognosis score)，并拟合出了Kaplan–Meier 曲线。研究发现，预后情况不同的肝癌患者其cp-score具有显着不同。多变量分析显示cp-score和风险分级密切相关，并且可以作为一个独立的风险因子用于肝癌的风险分级。 /p p strong 　　逐渐完善的监管政策 /strong /p p 　　除了有技术上的突破，近年来国家在政策上对于包括液体活检在内的测序行业也逐渐利好。 /p p 　　目前我国对于基因检测项目进入临床，实行的是双重监管。根据CFDA 在2014 年1 月公布的《食品药品监管总局办公厅关于基因分析仪等三个产品分类界定的通知》，基因测序诊断产品(包括基于测序仪及相关诊断试剂和软件)，符合医疗器械的定义，应作为医疗器械管理，其中测序反应通用试剂盒(测序法)划为I 类医疗器械管理产品，基因测序仪作为III 类医疗器械管理。 /p p 　　2015年4月国家卫计委发布了《关于开展肿瘤诊断与治疗高通量测序检验(多基因检测)室内质量评价预研的通知》，2015年7月卫计委又发布《药物代谢酶和药物作用靶点基因检测技术指南(试行)》和《肿瘤个体化治疗监测技术指南(试行)》。 /p p 　　总的来说，所有仪器设备，试剂归CFDA 报批管理，临床实验归属卫计委管理。 /p p style=" text-align: center " img title=" 009.png" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/ef35b33c-6d37-430a-94d6-981e3f1b8e8e.jpg" / /p p 　　经历了“全面叫停”后，近年来国家政策对于基因测序、精准医疗行业的发展起了很大的推动作用。2015年3月卫计委发布《国家卫生计生委医政医管局关于肿瘤诊断与治疗项目高通量基因测序技术临床应用试点工作的通知》，试点包括了14家医疗机构和6家第三方检验实验室。另外还发布了以肿瘤个体化治疗、药物代谢酶及作用靶点基因检测的技术指南，旨在规范化推广相关技术。 /p p 　　2016年4月国家发改委下发了《关于第一批基因检测技术应用示范中心建设方案的复函》正式批复27个省市发改委关于基因检测技术应用示范中心的建设方案。 /p p 　　2017年1月，国家发改委正式印发了《“十三五”生物产业发展规划》，明确了基因检测能力覆盖50%以上出生人口的目标，强调了以个人基因组信息为基础，结合蛋白质组、代谢组等相关内环境信息，整合不同数据层面的生物学信息库。 /p p 　　2017年11月，CFDA和卫计委联合颁布《医疗器械临床试验机构条件和备案管理办法》，规定了对列入需进行临床试验审批目录的第三类产品，应当在三级甲等医疗机构专业范围内开展临床试验 规定开展创新医疗器械产品或需进行临床试验审批的第三类医疗器械产品临床试验的主要研究者应具有高级技术职称并且参加过3个以上医疗器械或药物临床试验等等。 /p p 　　综合来看，国内政策对于液体活检和其他基因测序产品，经历了“叫停”、“试点”、“规范发展”三个阶段，未来的市场仍有很大的空间。 /p p 　　令人振奋的是，2017年11月，FDA在一个月内先后批准了纪念斯隆凯特琳癌症研究中心的多基因检测分析产品MSK-IMPACT?，以及Foundation Medicine 的 FoundationOne CDx，这两款产品的获批在美国甚至全球都具有相当重要的意义。 /p p 　　从FDA的审批标准中，我们不难看出对于肿瘤基因检测产品，FDA在检测结果的精准性、数据的管理更新过程、和报告解读能力三个方面均高度关注，这也是给国内从业者的一些启示。 /p p 　　CFDA对于国内的政策制定，很大程度上都会借鉴FDA的做法，包括目前对于基因检测临床的双重监管等，而FDA在批准基于NGS的肿瘤检测产品的实践中，已经踏出了重要的一步。这个消息公布后，对于业内人士来说是机会和挑战并存，但对于整个行业来说，无疑是前景大好。 /p p strong 　　结语 /strong /p p 　　液体活检是一项富有挑战性的新技术，在肿瘤精准医学中扮演着越来越重要的角色。随着检测技术的标准化，检灵敏度和特异性的提高，液体活检将成为肿瘤诊断的重要技术手段。液体活检要广泛进入临床应用，不仅需要检测技术灵敏度和特异性的提升、临床研究的广泛积累，还需要建立相应的检测标准、建设规范的监管体系。 /p p 　　如今，越来越多的科研单位和企业已投身该领域，2017年即将结束，相信2018年液体活检技术将在肿瘤分子分型、靶向用药、耐药机制研究、复发监测，甚至肿瘤早期筛查等多个领域实现不断地突破与发展。 /p p 　　参考资料： /p p 　　[1].《肿瘤液体活检市场初成预计中国市场规模200亿》，21世纪经济报 /p p 　　[2].数据来源Pubmed数据库 /p p 　　[3].数据来源Piper Jaffray测算 /p p 　　[4].数据来源火石hsmap /p p 　　[5].Liquid Biopsy Market Research Report Global Forecast to 2022， MARKET RESEARCH FUTURE /p p 　　[6].An ultrasensitive method for quantitating circulating tumor DNA with broad patient coverage. Nat Med. 2014 May 20(5)：548-54. /p p 　　[7].Integrated digital error suppression for improved detection of circulating tumor DNA. Nat Biotechnol. 2016 May 34(5)：547-555. /p p 　　[8].Analysis of Plasma Epstein-Barr Virus DNA to Screen for Nasopharyngeal Cancer. N Engl J Med. 2017 Aug 10 377(6)：513-522. /p p 　　[9].Swarm Intelligence-Enhanced Detection of Non-Small-Cell Lung Cancer Using Tumor-Educated Platelets. Cancer Cell. 2017 Aug 14 32(2)：238-252.e9. /p p 　　Circulating tumour DNA methylation markers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma. Nat Mater. 2017 Nov 16(11)：1155-1161. /p p & nbsp /p

据国家癌症中心数据，我国每年新增癌症患者约406万，每年因癌症死亡人数达241万，恶性肿瘤防控形势十分严峻。肿瘤与基因密切相关，部分基因突变可能增加患病风险。研究显示，遗传性肿瘤在所有肿瘤中占5%～10%，具有家族遗传特点。华大基因遗传性肿瘤基因检测的临床意义在于：检测个体潜在风险，辅助肿瘤相关遗传变异的风险识别，为临床治疗提供参考；评估直系亲属的遗传风险，提供风险管理和健康建议。根据最新NCCN指南的建议，遗传性肿瘤应进行相关的基因检测，以期筛查和预防肿瘤的发生。华大基因作为基因组科学和精准医疗领域的领军者，凭借自主研发的测序平台、尖端实验技术和生物信息算法，成功构建了肿瘤基因检测产品的“预筛诊监”闭环服务矩阵。在肿瘤预防领域，华大基因推出了遗传性肿瘤基因检测产品，旨在评估遗传性肿瘤风险，并辅助识别与肿瘤相关的遗传基因变异，为高风险人群制定个性化的健康管理方案提供有力支撑。华大基因基于最新获批的DNBSEQ-G99测序机型，推出遗传性肿瘤基因检测试剂盒。该试剂盒可检测男女各20余种肿瘤的90个遗传易感基因及HRR通路基因突变。它解决了高通量测序产品医院本地化运行时样本量少、需凑样、检测周期长等问题，助力医疗机构快速获取准确基因检测结果，实现3.5天极速交付，提升诊疗效率。同时，该试剂盒为医院提供优化的高通量测序实验室解决方案，推动肿瘤基因检测在院内的发展。随着精准医学的深入发展，国内医疗机构正加速建设精准医学中心，以推动其在医院内的研究与实践。医学平台建设作为精准医学发展的关键一环，显得尤为重要。针对此需求，华大基因依托自主研发测序平台，提供全面精准医学基因检测方案。其中，HALOS一体机以其独特设计，成为高通量测序实验室的首选。这款一体化平台集成了样本管理、实验管理、生物信息分析及报告解读等功能，与测序仪等设备无缝对接，实现临床样本测序数据的自动化分析、注释与解读。通过一键式操作，医院可轻松实现本地化报告出具，确保数据安全高效利用。预防胜于治疗，对于癌症而言更是如此。只有早期发现、早期诊断、早期治疗，才能更有效地降低癌症的发病率和死亡率。华大基因始终践行“以基因科技造福人类”的使命，致力于为更多癌症患者提供精准、普惠、可靠的基因检测服务以及安全有效的治疗方案，推动我国癌症精准防治水平的提升。

会议简介类器官在癌症研究、神经生物学、干细胞研究和药物发现领域变得越来越重要，因为它们可以增强人体组织建模。类器官源于干细胞，并可扩展为多种组织类型，包括肝脏、肺、脑、肾脏、胃和肠。由于这些 3D 微小组织能够模拟体内器官，因此在人类发展和疾病机制方面能为研究人员提供更多见解。2023年5月26日，fenxi测试baikewang联合徕卡举办本次研讨会，将邀请行业专家，通过与大家共同讨论类器官技术在肿瘤研究中的应用与展望，希望能对行业内工作者带来帮助和启发。报名方式长按识别二维码 预约报名会议日程演讲人蒋明 浙江大学 研究员毕业于复旦大学生命科学学院，获得生物物理学博士学位。先后在美国罗切斯特大学、哥伦比亚大学进行研究工作。长期从事前肠起源的器官包括食管、胃和肺的干细胞在器官损伤再生及在肿瘤中的功能研究。以类器官结合动物模型，鉴定不同类型和起源的干细胞在参与损伤后再生以及在肿瘤形成过程中的作用，已发表一系列高水平SCI研究论文，包括Nature，Journal of Clinical Investigation、Developmental Cell和PNAS等多篇领域内顶级期刊。承担科技部重点专项和国家自然科学基金等研究课题。获得国家发明专利1项。赵梦路徕卡 高级应用专家2017毕业于中国药科大学生物医学工程与分子影像实验室，主要研究肿瘤标志物配体亲和力，肿瘤靶向探针荧光成像、近红外成像。加入徕卡后主要负责超高分辨显微镜STED，FLIM荧光寿命检测，高端共聚焦FRAP FRET技术支持工作。同时在高端宽场显微镜THUNDER、TIRF、Scanner、激光显微切割技术方面有丰富经验。胡浩伯桢生物 联合创始人，市场总监中科院学术新人、清华大学博士后，联合创立伯桢生物，开发类器上游技术和产品模块，致力于推进类器官技术标准化，多维度打造类器官产业转化和医药应用行业新生态，共享模型价值、引领医药创新。具有结构生物学、免疫、病毒和疫苗交叉学科背景；拥有国家重点实验室、清华大学综合医学研究中心多年科研经历，以第一作者身份于国际权威期刊Genes Dev、Developmental Cell等发表多篇研究论文；具有50+个科研、医院、药企类器官平台合作经验。相关产品MICA全场景显微成像分析平台了解更多：徕卡显微