数据处理软件

雪景新型固态热调制器是世界上第一台商业化的基于固态半导体制冷技术的热调制器，使传统的全二维气相色谱彻底摆脱了液氮和其他制冷剂的使用。独特的机械和热管理设计保证了产品与目前主流热调制器相当的调制性能。其小巧的结构和方便的操作极大地简化了GC×GC技术的使用难度和运营成本，适合于在广大常规实验室和野外检测的分析实践中进行推广应用。　　固态热调制器还可以安装与任意GC平台上，配合独立的控制软件和全二维数据处理软件，非常方便地将常规的一维GC或者GCMS升级成全二维气相色谱系统，极大提高原有系统的峰容量和分离能力。　　固态热调制器控制软件 SSM Viewer　　主要功能包括：固态热调制器状态实时监测；固态热调制器参数(冷热去温度、程序升温、调制周期等)设定与控制；外部设备同步，支持手动启动；方法编辑和进样序列编辑。　　全二维气相色谱系统配置软件　　全二维GC计算器是配置GC分析柱和气流系统，特别是包括多个分析柱和多点流路控制的参数设置工具。系统应用包括分析柱反吹，流出物分流，中心切割，气流调制/热调制的全二维GC或以上的任意组合系统。　　全二维数据处理软件Canvas　　雪景科技Canvas能够直接读取安捷伦数据文件，同时支持其他通用色谱质谱数据文件格式。　　主要功能包括：二维数据可视化、色谱峰自动检测与积分、质谱数据分析和NIST库检索、化合物族建立和分析、色谱图比较与差异分析、基本定性和定量以及其他定制功能。

10月6日，厦门大学生命科学学院韩家淮教授课题组在Nature子刊《Nature Methods》上发表题为“Group-DIA: analyzing multiple data-independent acquisition mass spectrometry data files”的文章。　　在生物学研究中，比较多个样品中蛋白量的变化是经常要解决的问题。定量蛋白组作为一个很重要的技术手段，经常被用来寻找多个生物样品中有差异变化的蛋白。SWATH-MS是一种新型的蛋白质定量技术，其拥有高定量精度和良好的多样品定量一致性等特点，可以用来寻找多个生物样品中的差异表达蛋白。虽然SWATH-MS技术具有很多优点，但是其数据处理一直是个难题。现有两款软件OpenSWATH和DIA-Umpire，其中OpenSWATH作为最先被报道的软件，其在数据处理方面较繁琐，DIA-Umpire在数据处理方面具有优势，但鉴定肽段数量方面稍显弱势。　　韩家淮课题组开发了一个名为Group-DIA的SWATH数据处理软件，其在数据处理方面和DIA-Umpire具有相同优势，在鉴定肽段数量方面比DIA-Umpire软件多30-50%。韩家淮课题组研究人员对TNFR1(TNF 受体蛋白1)免疫共沉淀样品的SWATH数据进行了分析，发现Group-DIA软件可以比其他两款软件鉴定出更多的TNFR1相互作用蛋白，假阳性率则较其他两款软件低。综上所述，Group-DIA软件是目前分析SWATH数据最好的软件，它的开发推动了SWATH-MS在生物学研究中的应用，为寻找信号通路中的关键节点蛋白提供了很好的途径。　　该论文主要工作由博士生李渊越和博士后钟传奇承担，通讯作者为博士后钟传奇和韩家淮教授。

日期: 2017年12月21日时间: 14:00 – 16:00地点: 网络讲座语言: 简体中文 在本期讲座，我们会深入探讨代谢组学数据处理的难点。如何实现代谢组学数据的真实提取？如何选择归一化算法？以及详细解析统计分析软件EZinfo以及代谢通路检索工具IMPaLA。欢迎各位老师参加！ 讲座概要： 峰提取和共检测全化合物归一化算法EZinfo统计分析软件IMPaLA代谢通路分析工具 主讲人：白旭（沃特世市场部资深应用工程师） 登录沃特世官网并搜索“代谢组学数据处理软件Progenesis QI 高级培训”即可进行注册报名。 此网络讲座免费报名参加。您只需要使用一台链接网络的电脑即可参加，收到您的注册信息后我们会筛选并在讲座前一天通过电子邮件给您发送讲座登录链接。如有任何问题请拨打电话：021-61562642或发送邮件至minxing_guo@waters.com，谢谢。

日期: 2017年11月23日时间: 14:00 – 16:00地点: 网络讲座语言: 简体中文 代谢组学作为当代新兴的科研方法学工具，愈来愈受到科学家的青睐。 Progenesis QI 可以处理主要厂家液相质谱联用产品采集的代谢组学数据，其真实提取数据，最佳的归一化算法，灵活全面的代谢物鉴定方式，全面的代谢通路检索功能以及没有限制的数据处理能力获得了广大代谢组学工作者的认可。 本讲座介绍Progenesis QI的操作流程和使用技巧，交流Progenesis QI的使用心得。 讲座概要： 1.Progenesis QI 的安装和激活2.Progenesis QI 工作流程3.交流使用心得 主讲人：白旭（沃特世市场部资深应用工程师） 登录沃特世官网并搜索“代谢组学数据处理软件Progenesis QI 操作培训”即可进行注册报名。 此网络讲座免费报名参加。您只需要使用一台链接网络的电脑即可参加，如果您需要在讲座中加入讨论或语音提问，请您提前准备好麦克风。收到您的注册信息后我们会筛选并在讲座前一天通过电子邮件给您发送讲座登录链接。如有任何问题请拨打电话：021-61562642或发送邮件至minxing_guo@waters.com，谢谢。

p 　　沃 span style=" font-family: times new roman " 特世公司在2016年6月2日发布了一款用于实验室数据采集和归档大数据的服务器应用软件Symphony& nbsp Data Pipeline。该软件提高了LC-MS数据采集与传输工作的自动化程度，从而提高了分析工作的速度节约了时间，并且能够降低人为误差，将科学家从重复的工作中释放，来做更为有意义的工作。 /span /p p span style=" font-family: times new roman " 　　“使用新的软件使我们在活化色谱柱的同时，就能够轻松的一步完成将原始数据复制到远程文件中，最大程度的扩大分析仪器的利用率。” 南安普顿大学蛋白组学研究中心主管Paul Skipp博士说，“此前，在分析开始前，仪器操作人员复制数据的几个小时，质谱仪常处于空闲状态。现在用了新软件，我们实验室的3台Synapt质谱能够24/7的产生数据，对于我们来说仅这一点就是巨大的提升。” /span /p p span style=" font-family: times new roman " 　　Symphony Data Pipeline在提高实验室效率方面还有很多表现。 /span span style=" font-family: times new roman " “我们认为软件的模块化很有价值，令我们可以快速响应用于试验数据处理的新方法，如实时质量控制、故障监测、保证数据完整性。” 帝国理工学院MRC-NIHR 信息学经理Jake Pearce说。“不仅如此，该软件在节省大量处理时间的同时还能够降低噪音和实现字节级的文件储存。” /span /p p span style=" font-family: times new roman " 　　Symphony软件能够让科学家在使用Waters MassLynx 质谱软件采集UPLC-MS数据时能够根据需要实现个人定制。Symphony软件将对数据文件进行多种操作，包括将数据文件移动到服务器、降低背景噪音、对数据进行压缩重命名和复制、运行可执行文件。操作者可对数据处理进行个性设计，且单台电脑、网络电脑都可以采集数据。 /span /p p & nbsp /p

长期以来，国外公司对核磁共振数据处理和解释方法实施技术封锁。在运用国外先进仪器进行油井探测中，他们仅仅只提供服务而不卖处理软件。经过10余年的攻关，长江大学何宗斌博士独立开发出了具有自主知识产权的核磁共振测井数据处理和解释软件系统，一举打破了这一垄断格局。 　　“有了这项技术，可以准确解密国外的测井数据处理技术，为我国的测井仪器研发与设计提供指导，对采油提供强力支持。”何宗斌博士说。这一技术得到中国石油勘探开发研究院李宁教授的首肯，他说：“何博士发展的核磁共振数据处理方法可叫‘何宗斌方法’。” 　　李宁教授介绍，一般来说，国内开发的相关软件最多只能处理一两种数据，国外的软件也只能处理自已公司的仪器数据，而此技术却能有效处理国外三大石油服务公司(斯仑贝谢、哈里伯顿、贝壳休斯)四种类型的核磁共振测井仪的数据，具有统一的测井数据处理解释软件平台。 　　对最原始数据准确进行解码，是该技术的另一大亮点。“在清楚分析核磁共振测井仪的原始数据结构、数据保存方式、测量模式的基础上，就能全面评估测井质量与校验错误数据。”何博士比喻道，“就像VCD、DVD播放碟片，如果解码不过关，屏幕会出现马赛克现象，造成视觉的模糊，我们的软件具有修订错误的功能，能有效避免马赛克现象。” 　　此技术已在油田定性与定量评价油气中得到有效检验。河南油田一口探井在进行核磁共振测井后，解释了许多油层，但油田进行三次试油的结果却是全部出水。采油方认为该井将打空(无油气)，现场专家也对核磁共振测井失去了信心。受邀诊断的何博士在收集、分析资料后，提出了唯一的试油层位，结果试油压喷日产油7.46吨，达到了工业油气流价值，避免了该区块无油的结论。 　　目前，该技术已在中石油、中石化、中海油三大公司的测井数据处理中得到普遍运用。“这一技术对我们的生产具有很大的帮助。”中海油勘探开发部经理徐立强感慨。迄今，越来越多的研究机构和石油企业邀请何博士讲课和现场指导，联合进行课题攻关。去年，何博士就与北京石油勘探院、长城钻探、中海油签订合作项目，总经费达400万元。

2016年9月26日，由大连达硕信息技术有限公司独立开发，在近红外数据分析处理方面具有巨大优势的魔力软件系统，发布新版本(v2.0)。在原有v1.0版本的基础上，系统新增模型传递的功能，解决仪器标准化问题，并极大地提升系统的模型分析效率，改善用户体验。魔力软件v2.0版新增的模型传递功能，提供多个方法，有效校正不同仪器间的近红外数据变化与差异，达到仪器数据的标准化，从而提升定性定量分析结果的可比性与可用性；同时新版本在大数据量的文件载入、工程文件的保存与打开、内存的高效利用，以及用户体验等诸多方面做足文章，力争把该产品打造成近红外数据智慧分析处理的完整解决方案，在数据分析的智慧化，分析方法的全面性，以及用户使用的便捷性等各个方面，极大超越现有的软件系统，完美解决广大科研工作者与应用工程师在近红外分析中遇到的数据处理难题。 魔力软件系统在近红外数据分析处理中的显著优势，可概括为如下几个方面： 批量载入某一文件夹下多种类、复杂格式的数据多变量数据分析前，通常需将待分析的数据整合成数据矩阵形式。然而多重因素的影响导致数据分析工作者较难实现这个过程，比如不同样本产生的多个数据、样本分析条件差异导致的数据长度差异、数据类型的变化，以及数据中同时含有数字和字符等等。怎么办？魔力软件可快速解决！文件行，文件夹也可以！ 一键构建算法流，快速、智能完成数据建模复杂多变量数据分析的流程长、方法多，传统逐步分析的策略费时、费力。魔力软件创新实现基于算法流的数据分析，即用户可任意构建包含多个数据分析方法的方法组合，进而达到建模中的一键处理、多模型处理、方法参数修改后的快速建模与快速重建模，是智慧型数据分析的创新发展。 数据分析过程中，任一阶段随时随地的数据建模数据分析的本质是“让数据开口说话”，告诉你数据背后的隐含内容。优异的数据分析流程应在数据分析的任意阶段，依据用户需求随心所欲地产生新数据、分析新数据、建立数据分析闭环。魔力软件就是这么做的：建立数据、图表、模型、结果间的任意流动，使得数据分析更加得心应手！ 全面的数据预处理、变量选择、分类与回归建模方法不同的数据处理方法有不同的适应性，得到满意的数据分析模型或结果，可能需要对系列方法进行优化选择。魔力软件包括16大类、31小类的数据预处理方法，以提高数据质量；15大类、36小类的特征选择方法，优选变量；15个数据建模方法，用于探索性分析、分类与回归分析。有如此多方法的支持，不再为发文章而发愁，魔力软件：发文章的利器一枚！ 优异的用户体验：数据库管理、工程式文件、使用向导、完美报表等魔力软件独创一键式的数据处理流程，同时模型训练、验证与预测，便捷的导航栏与工程式的文件管理，强大的数据操作与可视化功能，加上丰富的算法与智慧化的分析过程，带给您不一样的用户体验。一个字：爽！(魔力软件功能菜单)目前魔力软件系统的新版本已经全面开放试用，欢迎联系公司获取试用版。与此同时，公司推出促销大惊喜。凡是在2016年12月30号之前购买产品的企业单位，或者高校、科研院所，均可获得惊喜促销价。欢迎垂询。 已经购买魔力软件的用户，可获得免费升级服务；已经试用过魔力软件v1.0版本的用户，亦可重新申请试用v2.0新版本。 大连达硕信息是国家高新技术企业，专注化学与生物行业数据的整合分析与深度挖掘，辅助决策支持。公司全方位提供数据分析服务、数据处理产品，以及数据应用整体解决方案，是我国化学与生物数据应用领域的领头羊。公司技术力量非常雄厚，在化学与生物数据分析领域积累了非常丰富的经验，深受客户好评

仪器信息网讯，2010年5月15日，蛋白质组数据处理暨全国生物质谱学术交流会”在云南省丽江市召开。会议为期两天，主要讨论了蛋白质组学技术和应用、数据挖掘和生物质谱等方面的现状及其进展。在所有的大会报告中，除一些关于蛋白质组学技术最新研究进展的大会特邀报告外，第一天的专家报告集中讨论了糖蛋白组的最新分析技术与研究进展，第二天的报告集中讨论了蛋白质数据处理技术，包括蛋白质组生物数据库及分析平台的构建、数据统计分析方法的研究等方面。 　　蛋白质组数据库被认为是蛋白质组知识的储存库，包含所有鉴定的蛋白质信息。而基于质谱技术的蛋白质组学数据分析，是识别新型生物标记物模式的有效手段。质谱仪检测的数据含有大量潜在信息，因此，建立完善的蛋白质组学数据库，开发实用性强的数据处理软件工具，以及提供良好的蛋白质组数据分析、处理方对蛋白质组学的发展至关重要。在本次大会上，中国科学院计算技术研究所贺思敏研究员、浙江大学生物医学工程与仪器科学学院段会龙教授、国防科技大学机电工程与自动化学院谢红卫教授等专家学者作了关于此方面最新研究进展的报告，本文作简要报道： 　　报告题目： 蛋白质组数据分析软件pFind系统新进展 　　报告人：中国科学院计算技术研究所贺思敏研究员 贺思敏研究员 　　pFind系统是中国科学院计算技术研究所自2002年开始持续研发的蛋白质组数据分析软件，可以替代同类国际主流软件，已安装在国内多家蛋白质组学重点研究单位，并在ABRF组织的国际评测以及核心岩藻糖化修饰位点鉴定等科研实战中表现出色。 　　贺思敏研究员在报告中首先介绍pFind系统不同于国际同类软件的核心算法设计和系统实现，然后介绍pFind系统近期在开放式修饰类型发现、高精度一级质谱分析、新型碎裂方式串联质谱分析、肽序列从头测序、标记定量分析以及并行加速系统研制等方面的进展，最后介绍了pFind系统的下一步研究设想。 　　报告题目：构建心血管蛋白质组生物医学数据库及分析平台 　　报告人：浙江大学生物医学工程与仪器科学学院段会龙教授 段会龙教授 　　心血管疾病是威胁人类健康的主要疾病。以高分辨率质谱技术为基础的心脏蛋白质组研究是发展心血管研究的一个重要方向。段会龙课题组通过对心血管医学和生物学、蛋白质组学和生物医学信息学的多学科交叉研究，构建了心血管生物医学数据库，重点在心血管蛋白质组数据集成、处理和分析，生物医学数据库体系构建、数据共享和发布等诸多关键技术上进行突破。 　　该课题组目前已完成了如下工作： 　　(1)心血管蛋白质组数据体系结构：构建了以蛋白质组信息为主体的数据库体系结构，以心脏线粒体蛋白质组为基础建立了核心数据集，该核心数据集包含了1663种心脏线粒体蛋白质以及与之相对应的2万7千多个生物质谱谱图。 　　(2)心血管蛋白质组数据库搜索引擎：初步建立了数据搜索引擎，可通过蛋白、肽段序列等信息对相应的生物质谱谱图进行检索，实现了与欧洲生物信息学研究所 (EBI) 的IPI蛋白质数据库间的数据关联。 　　(3)心血管生物医学数据库平台：研究和开发了相应的数据库网络公共平台。该网络平台的首个版本将在2010年末面向全世界发布，通过对心血管生物医学数据信息和资源的实时共享，服务于全世界心血管研究群体。 　　报告题目：大规模蛋白质组研究中的质谱数据定量分析方法 　　报告人：国防科技大学机电工程与自动化学院谢红卫教授 谢红卫教授 　　谢红卫教授利用一系列大规模定量分析的数据集，包括稳定同位素标记和进行重复实验的无标记定量数据，进行了一系列分析和研究，目前取得了很大的结果： 　　(1)总结了无标记和稳定同位素标记定量数据分析的典型流程，并且结合实际的数据分析结果，初步研究了各种分析流程优势和问题。 　　(2)针对丁来那个信息提取问题，利用重复实验数据集，比较优化了其关键步骤。 　　(3)利用实际实验数据，初步研究了同位素分布实验误差和质荷比误差等对定量分析参数选择有重要影响的问题。 　　(4)针对定量计算速度慢的问题，提出了索引文件和基于hash表的信息检索方式，将定量计算的时间缩短为原来的1/10。 　　(5)设计了一种可逆的色谱保留时间对齐模型，大大缩短了无标记定量数据处理中色谱保留时间对齐的计算复杂度。 　　(6)提出了一种以信号强度为参量的差异分布模型，能够提高差异检验的灵敏度。 　　(7)开发了无标记定量软件LFQuant、标记定量软件SILVER，已经无鉴定定量分析工具XICFinder。其中SILVER能够支持自定义标记方法，提供了图形化界面。LFQuant速度和定量精度等性能经过了多次优化。 　　报告题目：多层次蛋白质磷酸化分析中的数据处理方法研究 　　报告人：中国科学院大连化学物理研究所叶明亮研究员 叶明亮研究员 　　叶明亮研究员在报告中提到，根据研究目的的不同，蛋白质磷酸化的分析可以划分为三个层次：信号转导通路中关键节点蛋白质的磷酸化、生物体内的所有蛋白质的磷酸化(即磷酸化蛋白质组)、生物体内的所有激酶与底物的相互作用(磷酸化调控网络)。不同层次的分析有不同的目的，样品的复杂度也不同，因此需要不同的数据处理方法。 　　在节点蛋白质的磷酸化分析方面，为实现对某一感兴趣蛋白质中磷酸化位点的全面分析鉴定，发展了一种基于改进的目标-伪数据库用于数据检索，来高覆盖率、高可靠鉴定简单蛋白样品中的磷酸化位点信息的方法。并且从搜库耗时上，允许用多种低特异性的酶来提高简单蛋白样品的序列鉴定的覆盖度，从而更加全面的鉴定样品的磷酸化位点信息。 　　在磷酸化蛋白质组层次上要实现在保持较高可信度和灵敏度的情况下对海量质谱数据以及检索数据进行自动化处理。针对磷酸化蛋白质组学中磷酸化肽段鉴定难，假阳性率高，主要依赖于人工验证的现状，发展了一种结合MS2和MS3图谱以及正伪数据库检索的自动磷酸化肽段鉴定方法。该方法结合了MS2和MS3的鉴定信息，提高了磷酸化肽段鉴定的灵敏度和可信度，可以自动的对磷酸化肽段进行鉴定而无需进一步的人工验证。利用这种方法，结合磷酸肽的多维分析已经可以从人肝组织中鉴定超过8000个磷酸化位点。最近，其课题组还发展了一种基于分类筛选的磷酸化肽段鉴定方法，该方法结合了MS2/MS3方法的高可信度，并且考虑了部分不易发生中性丢失的磷酸化肽段的鉴定，进一步提高了磷酸化肽段鉴定的灵敏度。 　　在磷酸化调控网络层次主要是揭示激酶与底物蛋白质上磷酸化位点的对应关系，叶明亮研究员表示，这是该课题组今后研究的一个重要方向，目前已经在与合作者利用生物信息学的方法模拟构建磷酸化网络图。

本文由马尔文帕纳科亚太应用中心技术经理朱晓东供稿本文摘要XRD的实验人员如何从繁重的数据处理重复劳动中解脱出来，提高数据处理的效率呢？今天为您介绍Empyrean锐影XRD上的自动处理程序（Automatic Processing Program，简称APP），并通过实例让大家了解到”APP软件"如何让材料研究的数据处理变得简单!材料研究有时候是枯燥和乏味的过程，碰到大量类似样品的筛分时，悲催的研究“猿”们就得化身无情的数据处理机器，一遍又一遍的重复脑力甚至体力劳动。那有没有办法从不必要的重复劳动中解脱出来，提高数据处理的效率呢？对于使用马尔文帕纳科落地式X射线衍射仪的小伙伴们，这里隆重推荐一下APP。当然，此APP非彼APP（手机应用），而是Automatic Processing Program软件的简称，它会随着测量软件Data Collector一起安装，安装后默认会和Windows系统一起启动，您可以在Windows系统右下角的系统栏里找到下列图标：注意：2.4版本后的软件图标变为：如果没在系统栏里找到 的话，您也可以通过开始菜单的PANalytical XRD Tools - Automatic Processing Program来启动APP。APP相当于对XRD数据自动处理的总控程序，它会监控Data Collector软件测量得到的数据文件，并根据设定好的规则调用可执行程序（可以是马尔文帕纳科提供的XRD分析软件，也可以是支持命令行格式的第三方分析软件）或脚本来执行一些常规任务。图1 APP和它的小伙伴们 通过右键点击系统栏里的APP图标，然后在弹出菜单里点击Rules项，您可以在所打开的对话框里设置处理规则。图２　APP的规则设置对话框①　规则列表最左侧的可选框可直接点击设置是否勾选（表示该条规则是否起效用）；选中某条规则后，底下Build rule框中会显示该规则的各项设置，可以在修改后点击Accept Changes按钮保存修改，或点击Add to Rules List按钮保存成一条新规则；APP允许同一触发条件有多条规则，它将按这些规则在列表中的次序依次执行；列表中无法直接调整规则的排列次序；如果某条规则不需要了，可以选中后点击Delete Rule按钮删除；②　触发条件选中Measurement program type，则该规则由测试扫描数据所用的测量程序类型（在下拉列表中选择）触发；选中Measurement program name，则该规则由测试扫描数据所用的测量程序的名称（可点击右侧的Select Program按钮选择）触发；③　所调用的软件／脚本及参数在Command行点击右侧的按钮定位该规则所要调用的软件或脚本的路径； APP支持.exe或.com格式的可执行程序、.bat或.cmd格式的批处理程序以及.vbs或.js格式的脚本程序；在Arguments行输入软件/脚本所必要的选项代码和参数（如要处理的数据的路径）；选项和/或参数之间用至少一个空格隔开，参数（如路径）如含空格则整个都用英文双引号引起来；使用APP的目的一般是自动处理数据，所以刚测试得到的数据文件的路径和文件名是必需的，可以用代码 %XRDMLFILE% 指代；④　注释说明列表中的规则看起来都差不多，在Comment框中填写注释以说明各规则的用途等信息，更方便区分这些规则；⑤　规则有效性勾选上Active可选框，则代表这个规则有效等待触发，反之亦然；已经在列表里的规则可以直接点击列表行最左侧的可选框来勾选或取消勾选；⑥　运行时长限制如勾选上Time-out for this rule项并在文本框中设置超时时长（单位：分钟），则当规则被触发后，所调用的软件/脚本处理数据的时间超时时，APP会中止掉该规则的当次运行，并继续运行后续被触发的规则；APP软件安装时自带了一些.vbs脚本程序，位于C:\PANalytical\Automatic Processing Program \scripts 目录下；这些脚本程序所需要的选项/参数详见APP的帮助文件；除了数据备份，其它的脚本程序都需要Data Viewer软件的支持；Data Collector软件测量得到的数据文件都是.XRDML格式的文件，有些情况下数据要用第三方软件进行处理但第三方软件不支持.XRDML格式，那就需要讲数据文件格式进行转换。下面我们就以测量完成即进行数据格式转换为例来设置一条APP的规则。1. 右键点击屏幕右下角的APP图标，并在弹出菜单中点击Rules；图3 APP系统栏图标及其弹出菜单2.本例中，想对所有绝对扫描程序（注：粉末衍射、反射率测试、透射等扫描大多使用这种程序类型）测量得到的数据进行格式转换，因此在规则设置对话框的Build rule框中选中Measurement program type，并在下拉列表中选中“Absolute scan”；图4 设置触发条件3. 点击Command行右侧如下按钮：并在打开的对话框中找到并选中 C:\PANalytical\Automatic Processing Program\scripts\ConvertXRDMLFile.vbs 脚本文件后，点击Open按钮；图5 选择所要调用的软件或脚本从APP的帮助文件中可以查到这个脚本有以下选项和参数：4. 本例中，想要把数据转换为.CSV格式和.XY格式，并且都输出到某个目标目录中，那可以在Arguments框中输入：“%XRMDLFILE% /Destination="D:\Format converted files" /format=c0”。图6 设置选项和参数5. 在Comment框中输入一些注释以说明这个规则的作用以同其它规则区分：图7 设置注释及有效性6. 勾选上Active项让这个规则起作用，并点击Add to Rules List按钮把这个规则加到规则列表中。如此，一个自动数据处理的规则就完成了。以后当我们在Data Collector软件中用绝对扫描程序进行测量时，当测量结束生成.XRDML格式的数据文件后，会自动进行格式转换并把转换完的文件保存到目标目录中。

近日，在国内高等学府清华大学医学部的高性能计算系统项目招标中，中国国产服务器第一品牌曙光公司再传捷报，经过用户的测试比较，曙光解决方案在spider(扫描电镜后处理软件)上面运行的成绩明显优于竞争对手，届时曙光5000高性能计算系统平台将全面运用于清华大学医学部。 　　据了解，扫描电镜是生命科学研究中必不可少的仪器设备，获得重要科研进展的重要工具，这种实验设备往往科技含量，价格昂贵。扫描电镜系统则是通过用极细的电子束在样品表面扫描，获得原始数据(RAW DATA)然后通过软件进行提纯和分析，将产生的二次电子用特制的探测器收集，形成电信号运送到显像管，在荧光屏上显示物体，(细胞、组织)表面的立体构像，摄制成照片，获得人类认知范畴之内的信息。 　　随着社会经济的发展，人类越来越注重身体的健康，生命科学和医学被认为是当今世界科学技术领域最活跃、最有希望取得关键性突破的学科之一，医学部充分利用清华的师资和实验室条件，完成相关理工学科基础教学任务，建立起一套比较完整、先进的基础及临床医学的教学系统平台。 　　立足于清华大学医学部对计算的需求特点，曙光为清华大学选用了扫描电镜后处理软件spide，但是最重要的应用电镜后处理软件spider，占整个应用的70%以上 ，针对spider软件的计算量大，对内存容量和带宽要求高，曙光使用具有直连架构的AMD 六核处理器，将内存的容量扩展至32GB，从而有效消除前端总线的瓶颈，大幅提高内存的容量和内存访问带宽。 　　Spider软件的应用主要以openmp方式为主，普通刀片的计算能力和内存容量难以满足需求，在大部分的计算都能通过刀片集群满足用户需求的情况下，曙光配置了一台高性能的SMP胖节点，该计算节点的计算能力达到单台32核心，内存容量更是扩展到128GB。 　　管理软件方面，考虑到系统的易管理、易维护、易使用性，保证系统的高效运行，曙光大型管理监控软件Gridview，提供统一的集中式监控平台，具备可扩展性、集成性、可靠性和易用性，提供对各种商用、自己研发的管理工具的集成接口，从而满足同时对各不同厂家大型机的环境、硬件、软件等各方面进行监控的需求。中文的浏览器管理界面，高效的图形界面的作业调度系统，真正降低用户的使用难度，保证了系统的高效运转。 　　而在服务方面，曙光将在原有服务的基础上进行升级，承诺7*24小时，五年原厂工程师免费上门服务，在接到报修后，曙光的技术人员会在30分钟内进行电话反馈。如果确认需要现场服务，曙光工程师将在4小时内上门(或在途)。 　　此次清华大学医学部曙光5000高性能计算系统平台的建设不仅能有效的满足目前的计算需求，整个系统的架构还可以满足未来几年技术和应用发展的需要，能够达到保护用户投资的目的。同时，该系统平台解决方案的完整性和先进性等优势必将为清华大学医学部研究水平的提升起到关键性的作用，并将为清华大学走向世界的奋进目标迈出了重要一步

牛津仪器发布 Relate 联用技术图像处理软件牛津仪器纳米分析部近日发布了Relate 联用技术图像处理软件，用于EDS, EBSD, SEM/TEM和AFM等数据的高精度联用分析，为牛津仪器用户提供更好的材料表征工具。本产品与行业标准Mountains® 表面和图像分析软件平台的创建者Digital Surf合作推出，高品质值得信赖。无论您从事科研教学工作，亦或工业产品开发质检工作，无论涉及半导体、可再生能源、采矿、冶金和法医学，都可以利用Relate 联用技术图像处理软件将不同设备的软硬件优势结合起来。*Relate效果图Relate 联用技术图像处理软件通过提供准确、创新的可视化、分析和报告工具，使用户能够从数据中获得更多信息，特别是： 显微分析数据(EDS和EBSD)与AFM数据和显微图像的相关性分析，使用易操作的工具快速手动和半自动关联多个图像。 3D和2D可视化EDS, EBSD和EM图像与AFM测量的形貌和材料性质复合的数据，有助于揭示样品的微观和纳米特性。 除了定性图像（例如元素的面分布图）外，还通过提取基础数据值来分析相关的定量数据。 轻松生成报告：数据和图像可以以流行格式（PDF, Word等）组织和发布。 文件化、交互式工作流程，在图像分析过程中提供灵活性和可追溯性。牛津仪器EDS-EBSD采集软件AZtec中的图像配准Image Registration功能，可以利用AFM、光学显微镜等照片进行导航及定位，以获得同一区域的成分、取向等结果，便于Relate联用技术的实现。纳米分析部生命科学产品经理Louise Hughes表示：“Relate 联用技术图像处理软件是一个高精度的联用分析工具，可供研究人员使用多种不同的仪器技术（EM, AFM和微区分析）进行联用分析。多种数据在同一软件平台下进行组合及叠加分析，有助于提高分析效率并获得更有意义的结果。”

2012年第三期&ldquo 在线单颗粒气溶胶质谱仪使用及数据处理&rdquo 培训班于11月26日至12月4日在广州禾信分析仪器有限公司顺利举办，并圆满结业。参加此次培训的学员有来自北京环境监测中心站的研究人员、香港生億国际有限公司的负责人和上海大学的研究生。通过此次培训，达到了让学员掌握仪器的特点及应用、仪器基本操作、仪器的使用注意事项及日常维护、简单故障处理和数据处理软件的使用与初步的数据分析方法等目的。 学员均顺利取得结业证书 禾信公司对本次培训准备充分，时间安排紧凑，内容形式多样全面，培训过程气氛活跃，学员反应热烈，培训过程中还安排学员观看番禺长隆国际大马戏，到广州著名的上下九步行街及陈家祠景点游玩，感受广州的风土人情，这体现了禾信在培训业务上的重视与专业和在待人接物上的热情与周到。 讲师为学员们授课 培训结束后，学员们纷纷表示：此次培训对他们了解单颗粒气溶胶质谱仪的硬件设计以及掌握仪器操作和数据分析方法具有很大的帮助，并将促进他们的科研工作更好地进行。

近年来，采用涡动相关(eddy-covariance，EC)方法测量温室气体通量的站点数量在迅速增加，但是要在科学目的、工程标准、安装运行成本和实用性之间做出平衡，寻找到最佳的解决方法，仍是一个具有挑战的工作。从观测结果准确性和精确度来说，选址、建塔等站点设计的环节是重中之重。1、位置选择站点选址的基本原则是，该站点能够尽量观测到全部的研究对象，这涉及到两个问题，一个是方向，一个是架设高度。首先是确定观测区域近几年的主风向，可以参考近几年的气象数据。由于中国大部分地区是季风气候，一般在春夏和秋冬会有两个主风向，这时候要考虑通量仪器的架设方向，实验观测的主要周期等。如果仪器架设方向可以随主风向的改变方便调整，或者实验周期是明确区分了春夏或者秋冬，那么在选址时可以选在观测对象的下风向，这样可以尽可能多的观测到目标对象；如果不能改变通量仪器的架设方向，且是长期定位观测，那尽量将观测地点选址在观测对象的中央位置，或者沿主风向的中点位置，这样可以尽可能的在不改变仪器方向和位置的前提下，观测到尽可能多的研究对象。确定架设高度要满足通量仪器的基本观测条件， 即满足湍流运动的充分交换。一般的架设高度是下垫面冠层高度的1.5到2倍（具体确定观测高度的经验法则见图 1）；在相对平坦和均匀的下垫面条件下，观测距离大约是观测有效高度的100倍（风浪区原理），具体范围需要根据footprint源区计算，随着湍流运动强度和下垫面情况会有所改变。图 1 确定观测高度的经验法则通量源区代表性分析(Footprint分析)是检验一个通量站质量的重要手段，可以用来进行实验方案的设计指导，观测数据的质量控制，以及通过特定传感器的源区分布和来自感兴趣下垫面(植被)的通量贡献，从而对观测结果进行分析解释。图 2 Footprint分析2、下垫面的影响2.1植被类型涡动相关法测量温室气体通量要求仪器安装在常通量层内，而常通量层假设要求稳态大气、下垫面与仪器之间没有任何源或者汇、足够长的风浪区和水平均匀的下垫面等基本条件。在涡动相关传感器能监测到的“源区域”内植被类型均匀一致的情况下，其观测到的通量结果是比较有意义的，可以用来解释生态系统的温室气体收支情况。但当涡动相关传感器的“源区域”覆盖到不同植被类型时，情况就会变得复杂起来。一个极端的例子是：某站点周围具有两种不同的森林植被类型，每天周期性地，白天，风从一种植被类型吹向另一种；夜间，则正好相反。那么，该站点观测得到的通量资料的日平均值将毫无意义。这种极端的情况虽然极少出现，但许多站点都会有微妙的风向变化，在数据分析时需要做仔细考虑。此外，光、土壤湿度、土壤结构、叶面积以及物种种类组成的空间异质性会导致温室气体源／汇强度的水平梯度。而其植被类型的变化也会造成表面粗糙度的变化，当风通过不同粗糙度或者不同源/汇强度表面的区域时，就会产生非常明显的平流效应（Raupach & Finnigan, 1997 Baldocchi et al., 2000）。图 3 不同下垫面的地表粗糙度（参考 于贵瑞&孙晓敏，2006）地表植被类型的突然变化会导致气流的变化，如气流在从高大森林向低矮草地移动时，会在森林边缘形成回流区(如图 4所示)，导致近地面和上方气流方向不一致，其水平长度尺度(距离)等于冠层高度的2-5倍(Detto et al., 2008)。图 4森林边缘附近湍流结构的概念模型（参考Detto et al., 2008）2.2冠层高度通量足迹Footprint描述了EC系统能够观测到的“源区域”，提供了每个表面元素对测量的垂直通量的相对贡献。Footprint取决于观测高度、表面粗糙度和大气稳定度等。如图 5所示，通常来说，传感器的观测高度越高，就越能观测到更远、更广的区域（Horst & Weil, 1994），也便于捕捉植物冠层上方混合良好的边界层中的通量交换。但是观测高度也不是越高越好，在大气层结稳定的条件下（如夜间），过高的观测高度可能会使观测到的“源区域”超出感兴趣的研究区域。因此应该预先计算并确保来自感兴趣区域的通量贡献至少为90％（Gö ckede et al., 2004），在稳定条件下至少50％的时间以确保适当的数据覆盖不同的风向和不同的天气条件。图 5观测高度与通量足迹基于Munger（2012）等确定塔/测量高度（hm）的原则（如图 1），可能存在准确测量实际观测高度和冠层高度的困难，需要考虑后期调整高度的可能性。观测高度必须用三维超声风速计测量路径的中心来确定，其值取决于感兴趣的生态系统的冠层高度（hc），冠层高度值不需要特别准确：采用主要冠层的平均预期高度是合理的。对于冠层高度在生长季节中快速变化的农田、草地和种植园以及同样具有快速变化特性的冰雪下垫面，塔架设计必须考虑允许通过改变塔架高度（例如伸缩式塔架设计）或通过移动传感器来改变测量高度。随着时间的推移为了确保相同的通量观测源区，可以考虑改变测量高度，遵循的原则是测量高度与冠层高度的0.76倍之间的差值保持在一个确定数值的±10%左右。但这种调整的频率不用特别频繁，最多在植被生长期或在积雪季节每隔一周进行。假设在植被生长期开始时的裸土，其测量高度为2 m，在冠层高度达到1.2 米前，不需要改变测量高度；在植被达到1.2米后（例如增加约0.5-0.8米）开始提高测量高度，然后保持测量高度与冠层高度的0.76倍之间的差值保持在一个确定数值。改变表面高度（由于生长和积雪）以及改变测量高度必须准确记录，因为这必须在后期数据处理中考虑。2.3地形影响EC法测量通量假设了地形水平，这样可以保证地形的坐标系和传感器坐标系方向一致，避免平流、泄流效应的影响。图 6复杂地形对EC观测的影响在复杂的地形条件下，风吹过小山时会引起气流的辐合或辐散运动，产生平流效应（Kaimail & Finnigan, 1994）。存在有局地风场影响的站点，在夜间大气稳定，垂直湍流输送和大气混合作用较弱，CO2的水平和垂直平流效应的影响是很重要的（于贵瑞&孙晓敏，2006）。Mordukhovish & Tsvang（1966）的研究表明，斜坡地形能导致水平异质和通量的辐散。对于设在地势较高的观测塔，在夜间对流比较弱时，通常会因CO2沿斜坡泄流而造成大气传输的通量低估，最后导致生态系统净生产力的估算偏高；对于在地势较低沟谷中的观测塔，其问题更加复杂，如果外部的大气平流/泄流通过观测界面进入生态系统，会高估光合作用吸收CO2的能力；如果外部的大气平流/泄流不能通过观测界面，而是从观测界面下部直接进入生态系统，则会在生态系统中暂时储存，最终输出生态系统，造成对呼吸作用的高估。在大多数情况下，实际地形难以满足地形水平的假设，这就需要进行坐标旋转，以消除平流项的影响。当安装铁塔的斜坡坡度特别大时，可以考虑将原本应水平安装的超声风速计调整为与地面平行。3、塔及塔附属设施的影响3.1塔体本身塔本身对观测的影响可分为塔本身对风场的影响，以及塔的偏转、震荡对测量过程的影响两种。3.1.1 对风场的影响自然气流无论是经过几十米的观测塔，还是遇到几毫米的仪器翼梁或电缆，各种尺度的障碍物都会使流线发散，从而导致用于计算通量的流线分离，称为流体失真，流动失真以难以看见的方式影响测量，其影响只能在塔的设计建造阶段进行最小化。在塔的迎风侧（上游），风速受到影响会有所降低。受流动失真影响的逆风距离与障碍物大小的立方成比例，并随着距离的立方体而减小(Wyngaard, 1981, 1988)。在塔的背风侧（下游），风速也减弱，这种效果随着风速的增加而减小（湍流的更快速重构）并且受到障碍物的长度和宽度的影响。图 7 展示了在高塔的迎风侧观察到的风向上的偏转与加速， 图 8则展示了高塔顶部和底部方向迥异的风向。这是由于在背风侧下方产生的回流区造成的，障碍物(塔)尺寸越大，回流区就越容易发展得更大。在塔基通量观测中，森林生态系统的观测常需要10m以上的高塔作为基础，容易导致回流区的产生，回流也增加了向上流动的倾向，并加强了烟囱效应，这可能会显著影响风的测量和干扰混合比梯度。图 7 在塔的迎风侧观察到风向上偏转和加速(引自Sanuki and Tsuda, 1957)图 8 塔顶部的西风流（离地面10米）和离地面2米处的东风回流(引自Vaucher et al., 2004)在建造塔时，尽量选择塔身纤细、结构较少的铁塔，避免对风场的影响，也要注意控制林窗的大小，避免人为形成回流区域。此外，应该尽量减少树木和树枝的移除，因为它们对风的阻力作用可以减少这些回流区域的形成。选择纤细塔体的同时也要保证塔体足够坚固，以确保安全的维护通道和应对整个观测周期中的极端环境。当塔架底座和结构由于受到外界辐射而加热引起对流循环时，可以观察到烟囱效应。这增强了气流的垂直偏转，从而使更多的空气向上移动。烟囱效应取决于基础和塔的质量和热容量、塔的形状、对树冠的干扰程度（清理/切割塔构造的树木）和站点的净辐射量等。烟囱效应是不可避免的，应尽量减少混凝土基础和塔架结构，塔的的横截面也尽量不超过2 x 3 m (Munger et al., 2012)。塔体结构对经过气流的扭曲变形和烟囱效应应该通过专业的方式或通过建模方法（Griessbaum & Schmidt，2009）进行调查（Serafimovich et al., 2011）。3.1.2 对测量过程的影响塔体本身随风速的运动会导致测量中的系统不确定性；塔的移动应限制在0.02 m s-1（即测量风速的精度），并且不应具有在1到20 Hz之间与风向共同变化的力矩（谐波效应）；快速响应加速度设备可用于量化塔运动，逐点校正还需要快速响应测斜仪测量以确定旋转速率以及加速度；由于在塔上工作的人员而导致的塔架运动不会随着风或标量交换而变化，但可能会扰乱风场。3.2塔上横臂在1976年的国际湍流对比实验中，一些报告显示直径0.05 m的水平支撑结构造成的平均上升风速为0.1 m/s (Dyer, 1981)，它大到足以使涡动相关测量无效。因此，风速计安装臂的尺寸也要尽量小，只需要提供一个安全稳定的测量平台就可以了。王国华等利用成熟的计算流体软件，对布置多个支撑观测仪器的支架所导致的大气边界层风场失真进行定量仿真。他们发现，当支架间距小于6倍的支架直径D或来流风向角小于30°时支架附近流场受到明显的相互干扰。通过对不同来流风向及支架间距离模拟结果的对比分析，认为使用多支架进行多点联合观测时，支架应沿垂直于观测地点常年来流主风向的展向布置。为避免不同支架相互干扰，支架间的最小距离L应大于9倍的支架截面直径。此外，横臂本身需要足够稳定以支撑仪表，可以通过增加侧臂和拉索的方式，以避免横臂的扭矩和振荡。3.3塔下建筑物3.1.1一节讨论了塔体本身对风速和风向造成扭曲从而影响风场的作用，塔下其他障碍物（如设备房间、供电小屋等）也存在这种作用，如图 9 所示。图 9 从障碍物侧面看的迎风流畸变和背风侧流畸变的概念图（引自Davies and Miller, 1982）回流效应在高大的森林冠层中最为明显，但较矮的草地和作物冠层也必须考虑，特别是在附近存放其他设备的房屋的情况下。因此，应尽可能地减少这种流动变形源，在不可减少的情况下，障碍物应远离观测塔，避免对风场的影响。参考文献1. Raupach M R , Finnigan J J . The influence of topography on meteorological variables and surface-atmosphere interactions[J]. Journal of Hydrology, 1997, 190(3-4):182-213.2. Baldocchi D , Falge E , Wilson K . A spectral analysis of biosphere-atmosphere trace gas flux densities and meteorological variables across hour to multi-year time scales. 2000.3. 于贵瑞, 孙晓敏. 陆地生态系统通量观测的原理与方法[M]. 高等教育出版社, 2006.4. Detto M, Katul G G, Siqueira M, et al. The structure of turbulence near a tall forest edge: The backward‐facing step flow analogy revisited[J]. Ecological Applications, 2008, 18(6): 1420-1435.5. Horst T W, Weil J C. How far is far enough?: The fetch requirements for micrometeorological measurement of surface fluxes[J]. Journal of Atmospheric and Oceanic Technology, 1994, 11(4): 1018-1025.6. Gö ckede M, Rebmann C, Foken T. A combination of quality assessment tools for eddy covariance measurements with footprint modelling for the characterisation of complex sites[J]. 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对于SEM使用者来说，最直观的数据来源就是图像，但是对于很多用户来说，仅仅靠直观的图像并不能精确的得到定量的结果。必须要进行图像的处理再分析才能得到精确的定量结果。对于很多材料来说，其相组织的分布不同会直接影响其力学性能。例如钛合金，通过扫描电镜得到的图像，我们可以直接看出多相结构的存在，但是如何才能定量的统计各个相在其中的分布规律以及比例成为了很多材料学家遇到的难点。钛合金SEM图像那么采用MIPAR软件可以轻松进行图像的分析以及统计。我们可以得到不同相的比例以及分布特点。下图所示红色区域为Alpha相，绿色的区域为Beta相。同时运用MIPAR还可以分析样品的形态特点，得到颗粒形状组织以及片层状的组织分布规律，得到统计量化的功能。相分布，红色为Alpfa相，绿色为Beta相组织形态分布，紫色为颗粒状组织，黄色为片状组织经过以上的图像分析，这样就可以获得材料的热处理条件对其组织影响的定量结果。对材料的生产工艺以及组织演化带来了有意义的指导信息。MIPAR在以下几个方面助力科研图形分析以及生产研发：1、极大提高图形数据分析的效率，为您节省宝贵的时间；2、减少或避免人为主观因素造成的统计数据失误，提高科研数据的准确性与可重复性；3、快速准确的提取图片中感兴趣区域，对图片进行着色后，突出显示；4、您将拥有一支图形数据处理技术团队，为您随时提供专业、个性化的技术支持。

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大连达硕信息技术有限公司(以下简称“达硕信息”)专注企业级数据的分析整合、深度挖掘与商业智能，掌握数据核心技术，提供专业化的数据处理软件产品，个性化的数据整体解决方案，以及平台级的数据整合服务。公司目前推出多款数据分析软件产品，欢迎试用。魔力TM复杂多变量数据智慧化处理软件系统 (ChemDataSolution)科学仪器数据因其高维、高通量与高复杂度的特征，价值密度大，但分析处理的困难度亦很高。食品快检与安全监测、工业过程分析与生物组学研究等众多领域所面临的在线与动态、快速与实时，以及模型共享与大数据分析等诸多问题，对智慧型数据挖掘与深度价值利用提出了现实的需求。与传统的多变量数据分析产品或仪器自带的软件相比，ChemDataSolution系统在复杂情形下的文件夹数据批载入、智能算法流、一键数据处理与多模型分析、同时模型构建、验证与预测、多线程与并行计算以及用户体验等各个方面具有开创性，是分析处理色谱和质谱，尤其是近红外等光谱数据的强大工具。主界面截图 (ChemDataSolution)该系统具有如下的特色与优势： 1、数据分析算法流算法流是指构造包含不同数据处理方法的数据整合与优化流程，设置算法参数，在实际的数据分析处理中，仅需往算法流中添加待分析数据即可获得最终结果，完整保留中间计算结果以备查验，实现更快速便捷，准确智能的分析模式。 2、一键处理与多模型处理因算法流思想可实现数据处理方法的逐级串联与优化整合，将训练集、验证集或预测集同时添加到算法流中，达到一键处理即获得所有分析结果的目的。 3、同步建模、验证与预测在算法流的使用中，用户可分别添加建模、验证与预测数据，系统先构造模型，然后再将验证与预测数据进行相同的预处理或特征选择操作，基于已构建的模型获得计算结果，同样可极大减少用户的操作步骤。 4、智能数据批载入与数据库数据载入是数据分析的基础，实现复杂情形下的数据批载入是实现智慧型数据分析的前提。通过研究不同类型数据结构，尤其是数据自动载入时可能遇到的各种情形，提出数据智能载入的整体解决方案，如数据类型与长度、数据与字符、数据分隔符、化学坐标处理、数据头文件、数据排列方式、数据载入后是否放入已经存在的数据文件中，以及多个数据文件的上述处理方式是否存在差别等。 5、用户体验ChemDataSolution实现了非常人性化的用户体验与功能，比如基于XML技术的参数预设值、保存与调用，用户偏好设置，自定义报表，特别是基于导航栏文件式的数据、图形、算法流与模型结果管理等。 代谢组学小分子化合物快速鉴定软件系统该系统由达硕信息与中国科学院大连化学物理研究所共同开发完成，是未知代谢物定性分析的不二选择。系统融合多级质谱的精确质量数与保留时间信息，实现未知代谢物的多层次鉴定分析。系统主要具有如下功能与特色： 1、完备的代谢标准化合物数据库系统以SOP的方法，在正、负二个电离模式，以及三个不同检测电压下，采用先进的AB SCIEX 5600+仪器，构建2,000个不同代谢物的LC-MSn数据库，同时包含高分辨精确一级和二级质谱，以及保留时间的信息。这也是系统的核心优势之一。 2、定性经验的传递基于LC-MSn分析的化合物鉴定，经验性极强，初学者或者研究生需要花费很大的时间与精力才能基本掌握；而且学生一旦毕业，其定性结果与经验又无法为实验室继续利用，导致学生循环往复，研究组的积累却很是有限。系统通过不同成员构建灵活的扩展库数据库、未知物数据库，本地与局域网互联互通，以及强大的数据库功能，达到这样的目标：“研究生毕业不要紧、定性知识留下来”，“新进实验室不要紧，站在师兄师姐的肩膀上”。 3、多层次定性分析除上述自建标准化合物数据外，系统集成HMDB、Metlin、LIPID MAPS以及MMCD网络数据库，用户可在系统直接批量搜索这些数据库，实现与自建数据库分析结果的比较、融合与定性结果相互补充、扩展。在此基础上，用户可实现自建标准化合物数据库、网络数据库、扩展数据库，以及未知物数据库的综合定性分析，并可在不同数据库所得到的结果间相互比较分析，以获得最可靠的鉴定结果。此外，系统通过先进的样本间数据校正、定性匹配算法、原始数据批载入，批量定性分析，快速丰富查询(如中性丢失等)，以及优越的用户体验等功能，实现代谢小分子化合物的快速鉴定。主界面截图 (代谢小分子化合物快速鉴定软件系统)

p 　　 strong 普林斯顿仪器公司(PI)和特征向量研究有限公司(Eigenvector)很高兴地宣布，将PI的专有光谱和图像数据格式(.SPE)加入到Eigenvector公司即将推出的PLS_Toolbox和Solo软件版本中。 /strong /p p 　　 span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 普林斯顿仪器公司为定性和定量拉曼、光致发光、吸收和高光谱影像测量提供高性能光谱和图像产品，例如FERGIE和IsoPlane光谱仪和BLAZE CCD探测器。 /span PI的LightField软件使用的.SPE数据格式是 span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 一种灵活的数据格式，可储存光谱和影像数据。 /span 按照惯例，.SPE文件还包括 span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 仪器设置的详细实验信息的元数据，以及应用于数据的数据处理历史。 /span 基于PLS_Toolbox的MATLAB及其独立版本Solo均为应用最广泛的多元校正和模式识别软件工具的一部分。PLS_Toolbox/Solo 8.6.2将于2018年六月发布，允许用户直接从GUI软件中打开.SPE数据文件。 /p p 　　 span style=" color: rgb(31, 73, 125) " i “普林斯顿仪器公司以多种编程语言提供.SPE文件的浏览器。在PLS_Toolbox/Solo中打开我们的.SPE数据文件的功能为用户带来了极大的方便。Eigenvector公司提供了强大的数学工具来帮助我们的客户从光谱或图像数据中提取有价值的信息。.SPE文件格式的引入是十分重要的第一步。我们预见到通过与Eigenvector公司在现在与未来的合作会为我们的客户带来巨大的价值，” /i 普林斯顿仪器公司的产品经理Peng Zou博士解释道。 /span /p

全新的BioPhotometer plus数据传输软件 BioPhotometer/ Biophotometer Plus核酸蛋白测定仪更新了数据传输软件。新型数据传输软件无需数据线可以直接传输所有的检测和校准数据至PC电脑。该软件不但可以清晰罗列并打印所有的数据结果，还可将数据导入Excel或其它电子表格数据处理软件作进一步处理。新软件还提供数据存档功能，并具备搜索功能，便于用户搜索数据。所有功能均可由一个用户进行管理。 数据输出： 电子表格数据处理： 存档文件： 搜索功能：

二代测序技术的发展对测序数据的处理分析提出了很高的要求。目前二代测序数据分析软件很多，但是绝大多数软件仅能完成单一的分析功能(例如：仅进行序列比对或变异读取或功能注释等) ，如何能正确高效地选择整合这些软件已成为迫切需求。 　　来自中国医学科学院，北京协和医学院等处的研究人员设计了一套基于 perl 语言和 SGE 资源管理的自动化处理流程来分析 Illumina 平台基因组测序数据。该流程通过自动化并行脚本控制流程的高效运行，一站式输出分析结果和报告，简化了数据分析过程中的人工操作，大大提高了运行效率。相关文章公布在《遗传》杂志上。 　　二代测序技术(Next-generation sequencing)大幅度降低了测序的时间和成本，使得大规模测序逐渐成为常规的实验室研究和临床检测手段。测序产生的数据量急剧增加，如何高效地分析这些数据，已成为迫切需要解决的问题。目前，分析序列信息的生物信息学软件纷繁复杂，但基本上每个软件只能完成单一的分析功能，实现一个完整的分析流程则需要对众多软件进行整合，而手动串联的效率往往不尽人意 同时，这些软件需要在Linux工作环境下以命令行运行，要求用户具备较好的计算机背景 另外，即便一些实验室完成了分析流程的构建，他们往往不会公开许多细节，新用户仍然要从头建起。 　　针对这一问题，研究人员希望能通过构建经典的二代测序数据分析流程，并实现各个环节的高效自动化管理和分析，减轻研究者前期的工作负担，促进相关领域进一步对基因组测序研究项目的顺利开展。 　　研究人员为此设计了一套基于 perl 语言和 SGE 资源管理的自动化处理流程来分析 Illumina 平台基因组测序数据。该流程以测序原始序列数据作为输入，调用业界标准的数据处理软件(如：BWA，Samtools，GATK，ANNOVAR 等)，最终生成带有相应功能注释、便于研究者进一步分析的变异位点列表。 　　这一流程通过自动化并行脚本控制流程的高效运行，一站式输出分析结果和报告，简化了数据分析过程中的人工操作，大大提高了运行效率。用户只需填写配置文件或使用图形界面输入即可完成全部操作，为广大研究者分析二代测序数据提供了便利的途径。 　　目前测序数据处理软件很多，研究人员综合考虑了适用性和效率，整合出了一套标准的数据处理流程。具体来说，获得 FASTQ格式的原始测序数据后，需要数据进行以下处理： (1)使用BWA 软件把这些短序列和参考基因组进行对比，确定短序列在基因组上的位置，把短序列组装成完整的人类参考基因组 (2)使用 Samtools 软件把这些短序列调整成按一定顺序(1-22，X，Y，其他)排列的序列，并进行数据格式的转换 (3)使用 Picard 软件把测序产生的冗余信息和噪声去掉 (4)使用 GATK 寻找样本测序数据与参考基因组的差异，列出这些差异点 (5)使用 Annovar对这些变异位点进行功能注释，得到一个易于理解的变异位点列表。 　　这一项目成功整合了一系列二代测序数据分析软件，形成了一套经典的数据分析流程。这一流程通过并行化设计和自动化处理，一方面简化了操作成本、缩短了数据分析周期，另一方面也使本流程可以引入更完善的数据校验步骤，增强结果的可信度。 　　流程针对Illumina 平台双端测序数据开发，满足了大部分处理需求，并对其他用户提供了一个很好的参考，后续研究人员还将根据用户需求对该自动化流程进行持续维护。 　　随着二代测序技术的逐步发展，二代测序已经广泛应用于科研和临床研究。这一流程提高了二代测序数据分析的入门和运转效率，其必将在二代测序相关基因组学研究中，促进广大科研人员工作的高效进行。

本月30日，港东科技旗下另一家全资子公司光谱仪通用光谱分析处理软件项目获得科技部科技型中小企业创新投资引导基金30万元的无偿资助。（供稿人：张铂）

01 XPS简介XPS（X-ray Photoelectron Spectroscopy），译为X射线光电子能谱，以X射线为激发光源的光电子能谱，是一种对固体表面进行定性、定量分析和结构鉴定的实用性很强的表面分析方法。XPS是一种高灵敏超微量表面分析技术，样品分析的深度约为20埃，可分析除H和He以外的所有元素，可做定性及半定量分析。定性：从峰位和峰形可以获知样品表面元素成分、化学态和分子结构等信息 半定量：从峰强可以获知表面元素的相对含量或浓度▲ XPS测试过程示意图 ▲02 功能和特点（1）定性分析--根据测得的光电子动能可以确定表面存在哪些元素，a. 能够分析除了氢，氦以外的所有元素，灵敏度约0.1at%，空间分辨率为 100um, X-RAY 的分析深度在 2 nm 左右，信号来自表面几个原子层，样品量可少至10的-8次方g，绝对灵敏度高达10的-18次方g。b. 相隔较远，相互干扰较少，元素定性的相邻元素的同种能级的谱线标识性强。 c.能够观测化学位移，化学位移同原子氧化态、原子电荷和官能团有关。化学位移信息是利用XPS进行原子结构分析和化学键研究的基础。（2）定量分析--根据具有某种能量的光电子的强度可知某种元素在表面的含量，误差约20%。既可测定元素的相对浓度，又可测定相同元素的不同氧化态的相对浓度。（3）根据某元素光电子动能的位移可了解该元素所处的化学状态，有很强的化学状态分析功能。（4）结合离子溅射可以进行深度分析。（5）对材料无破坏性。03 基本原理当单色的X射线照射样品，具有一定能量的入射光子同样品原子相互作用： 1）光致电离产生光电子；2）电子从产生之处迁移到表面；3）电子克服逸出功而发射。用能量分析器分析光电子的动能，得到的就是X射线光电子能谱。▲ 基本原理 ▲这方面很多书上都介绍了，归根结底就是一个公式：E(b)= hv-E(k)-WE(b): 结合能（binding energy）hv: 光子能量 （photo energy）E(k): 电子的动能 （kinetic energy of the electron）W: 仪器的功函数（spectrometer work function）通过测量接收到的电子动能，就可以计算出元素的结合能。铝靶：hv=1486.6 eV镁靶：hv=1253.6 eV04 具体定性分析步骤A：对化学成分未知的样品——全谱扫描（0-1200eV）图谱分析步骤：1、在XPS谱图中首先鉴别出C1s、O1s、C(KLL)和O(KLL)的谱峰（一定存在且通常比较明显）。 2、鉴别各种伴线所引起的伴峰 3、确定主要元素的最强或较强的光电子峰（或俄歇电子峰），再鉴定弱的谱线。 4、辨认p、d、f自旋双重线，核对所得结论。鉴别通常采用与XPS数据库和标准谱图手册的结合能进行对比的方法：XPS数据库一般采用NIST XPS database:https://srdata.nist.gov/xps/selEnergyType.aspx通过这个网站你可以查到几乎xps所需的所有数据包括：对双峰还应考虑两个峰的合理间距、强度比等。▲ 网站截图 ▲XPS表征手册一般采用：Handbook of X-ray photoelectron spectroscopy: a reference book of standard spectra for identification and interpretation of XPS data. 1995.还可以对比XPS电子结合能对照表进行查找（文末资源包内含），有了这些表，你就可以指导每个元素分峰的位置。▲ 结合能对照表部分内容 ▲B：分析某元素的化学态和分子结构——高分辨谱测化学位移扫描宽度通常为10-30eV，以确保得到精确的峰位和良好的峰形。05 具体定量分析步骤经X射线辐照后，从样品表面出射的光电子的强度（I，指特征峰的峰面积）与样品中该原子的浓度（n）有线性关系，因此可以利用它进行元素的半定量分析。简单的可以表示为：I = n*SS称为灵敏度因子（有经验标准常数可查，但有时需校正）对于对某一固体试样中两个元素i和j, 如已知它们的灵敏度因子Si和Sj,并测出各自特定谱线强度Ii和Ij,则它们的原子浓度之比为:ni:nj=(Ii/Si):(Ij/Sj）06 数据处理这里小编向大家推荐三款软件Xpspeak、Avantage以及我们最常用的origin篇幅有限，作图过程在这里就不详细说了07 常见问题解答1、XPS样品制备：粉末制样• 压片• 粘到双面胶带上• 分散到挥发性有机溶剂中，形成悬浊液滴到硅片等固体基片、金属箔或滤膜、海绵等基底上纤维细丝（网）样品• 缠绕或压在架子或回形针上，或样品台的孔中 央，分析区域内纤维丝悬空，避免基底元素干 扰分析结果；• 包裹在有孔的铝箔中，用小束斑XPS分析孔内样品；液体、膏状样品• 滴到Si片、聚乙烯/聚丙烯、金属片、滤膜、树 脂、海绵等固体基片上晾干或冷冻干燥2、H和He为什么不能测XPS主要原因有三点：1) H和He的光电离界面小，信号太弱；2) H1s电子很容易转移，在大多数情况下会转移到其他原子附近，检测起来非常困难 3) H和He没有内层电子，其外层电子用于成键，H以原子核形式存在。所以用X射线去激发时，没有光电子可以被激发出来。3、什么是荷电校正，如何进行荷电校正XPS分析中，样品表面导电差 样品表面导电差，或虽导电但未有效接地。此时，当X射线不断照射样品时，样品表面发射光电子，表面亏电子， 出现正电荷积累（XPS中荷正电），从而影响XPS谱峰，影响XPS分析。在用XPS测量绝缘体或者半导体时，需要对荷电效应所引起的偏差进行校正，称之为“荷电校正”。最常用的，人们一般采用外来污染碳的C1s作为基准峰来进行校准。以测量值和参考值(284.8 eV)之差作为荷电校正值(Δ)来矫正谱中其他元素的结合能。具体操作：1) 求取荷电校正值：C单质的标准峰位(一般采用284.8 eV)-实际测得的C单质峰位=荷电校正值Δ；2)采用荷电校正值对其他谱图进行校正：将要分析元素的XPS图谱的结合能加上Δ，即得到校正后的峰位（整个过程中XPS谱图强度不变）。将校正后的峰位和强度作图得到的就是校正后的XPS谱图。4、磁性元素对XPS有没有影响有，磁性样品最好进行退磁、消磁处理也可在测试中采用磁透镜模式或静电透镜模式

LabSolutions CS网络化数据处理系统 司法检测机构实验室的应用需求随着司法行业整顿的逐步深入，司法检测机构的信息化建设进入攻坚阶段。鉴定机构资质的定期审核，鉴定人员专业鉴定资质的年审等工作增加实验室管理者的工作量。各地司法机关在加强管理的同时也开始开发适用于本地实际需要的网络化管理系统以减少人工操作。系统具备鉴定报告信息的实时上传，鉴定人（鉴定资质）的在线审核等管理功能。但是对于物证鉴定中对检验数据安全性管理，长期缺乏适合的专业管理软件及必要的流程化方案。 以岛津LabSolutions CS为代表的化学分析实验室网络化数据处理系统成为解决这类问题的有效手段。 岛津LabSolutions CS系列网络化数据处理系统应用优势岛津LabSolutions CS系列网络化数据处理系统不但可实现客户端远程访问、仪器控制及数据处理等常规仪器操作功能。软件更可根据仪器的不同，实现原始采集数据、分析方法、实验条件等仪器相关信息类文件的服务器端同步存储。 授权用户可通过客户端实现控制系统中多台仪器的仪器方法设定、检测数据处理以及报告制作等操作。同时也可分级实现分析仪器登录访问、远程控制权限的分级化管理。 特色功能：● 一体化管理实验室所有仪器和数据● 轻松对接LIMS系统、支持SDK二次开发● 内置色谱柱管理功能，色谱柱信息、使用记录、审计追踪、性能确认尽在掌握● 数据、日志、审计追踪等信息可整合为一份报告，提高审核效率● 多数据报告功能（选配），一键生成试验报告及最终结果报告，智能高效 LabSolutions CS应用场景1.可实现实验室仪器的在线链接，操作控制、数据处理和数据安全存储。提升案件检验数据安全性，也同时提升案件中关键物证鉴定结论的有效性。设定非人为可修改的实验室检测数据安全体系是完善质证双方证据链完整性、安全性的优选方案。 2.与实验室管理系统的无缝各省份司法部门对于鉴定管理网络化软件的需求差异较大，导致实验室管理系统（LIMS）软件的供应商/运营商也不同。为了满足分析仪器数据管理系统差异化需求，岛津LabSolutions CS系列软件支持主流的2种实验室管理系统接入方式： *1.网络版CDS数据共享，LabSolutions CS可通过共享文件夹的方式单方向上传分析仪器数据文件和分析方法相关信息。平台开放上传权限可提供PDF，TXT，CSV等常见分析用数据文件格式。*2.双方SDK互换协议方式，LabSolutions CS可实现双方数据交换协议的互换。在实现数据实时上传分享的同时，也可实现实验室管理系统中备案的案卷相关信息数据文件的下载和备份。另外，通过实验室管理系统的软件界面也可实现对分析仪器设备的反控和常规功能性操作。注：选择哪种软件接入方式，可根据LIMS系统服务商的情况和实验室管理智能化需求的实际情况进行选择。 3.色谱柱信息的电子化管理可在LabSolutions CS内管理气相、液相类型色谱柱，包括色谱柱使用记录、期间核查及分离度，随时监测色谱柱的使用状态。并对色谱柱的分析结果的有效性进行检查和追踪，减少手工记录的错漏和档案保管等工作，提高实验室综合管理水平。 4.可视化工作流程，提高报告审核效率一体化软件集成分析序列、谱图报告、操作日志等关键信息于一个PDF报告中，方便整体确认，大幅提升审核效率。 5. 多数据报告功能（选配）通过调用多种分析仪器采集的数据结果制作综合分析报告，特别适用于大量数据和复杂函数运算的报告制作。采用类似Excel的操作界面，可简单快速地制作报告模板，并支持自动生成PDF格式的检测报告。 本文内容非商业广告，仅供专业人士参考。

超~便捷的数据处理流程，只为中药农残检测的"你"关注我们，更多干货和惊喜好礼 Chromeleon一千个人眼里，可能有一千个“变色龙”。Chromeleon色谱数据系统支持自定义变量及公式，实现不同应用场景下的不同分析流程。同时，友好的界面及强大的审计追踪功能，向我们提供了强大的数据管理体验。针对已经实施的中国药典第五法，结合工程师多年的经验，设计了一套数据处理流程。下面，我们来看看吧。01方法包导入Chromeleon支持一键将序列所有原始文件打包，压缩率至少70%。用户可一键导入方法包文件，并将其改为只读模式（read only）,防止误修改。02采集数据将导入的方法包文件复制到新建序列中，选择进样方法和处理方法后，即可采集数据。03处理数据如动画所示，只需挪动鼠标即可完成峰识别，并将保留时间更新到方法中。数据采集完毕，即可切换到定量视图中。Chromeleon会自动计算序列中所有进样的内标峰面积RSD值，可及时发现内标错加、漏加的情况。如动画所示，用户可随意挑选样品进行RF计算，计算结果如若超出离群值（可设定）即可红色（可设定）显示。用户依据实际配制情况，输入校正浓度和级别，即可给出校正曲线及详细信息。其中“RSD”为回读值与校正理论值的偏差，可通过不同颜色显示出不同范围的离群值。“基质背景”则可让用户直观看出所采用的基质是否有农残本底检出。如有，可随时更换为标准加入法进行定量。如若需要计算回收率，只需输入加标浓度对应的级别，即可算出回收率。回收率结果超出离群值的（130%）则以红色显示。Chromeleon会自动计算单体之和，并将结果与药典规定定量限做对比，给出判定结果。同时给出离子对比率判定结果供用户参考。04报告数据如上，完成数据处理后，可直接调用方法包内置报告模板生成不同格式的报告或直接打印报告。05管理数据用户可对序列做备注。同时强大的审计追踪功能会记录先前的每一步操作。用户可恢复至其中任一状态（当然该操作也会被记录下来哦）。可以把序列改为只读（read only）状态，防止修改。视频指导当然，以上操作均有录制视频指导用户。怎么样？快来尝试Chromeleon色谱数据系统的强大功能吧！填写以下表单即可获取样本，想咨询完整视频也可通过表单告诉我们~

近日，日本的日刊工业新闻社评选出了2013年“十大新产品奖”的获奖企业。“十大新产品奖”是从参加评选的企业当年开发、投产的新产品中，根据对制造业发展的贡献、国际竞争力等方面进行评选。今年是第56届，本次参选产品共计68件，来自68家公司。此次的“十大新产品奖”分别颁发给了NEC、日立金属等10家公司的10件产品。“日本力奖”是颁发给用日本的技术引领世界市场的产品，夏普等3家公司的3件产品获此奖项。“产品创作奖”则是颁发给基于优秀的制作技术制作出的产品，OKUMA等3家公司的3件产品获此奖项。所有参选产品中，对被认定是特别优秀的产品会颁发“增田奖”，日立制作所的大数据处理平台获此殊荣。该平台能在短时间内完成1000兆大容量数据的检索处理，运用了日本国内最先进的研究开发支持程序（FIRST）并将其推广。 关于日立集团　　日立作为一家集团企业，业务涉及信息、通信系统、电力系统、电子产品、家电、以及相关主要元件和材料等广泛领域，并致力于发展“社会创新事业”（通过IT实现高度先进化的社会基础设施业务）。日立集团在全球拥有约32万6千名员工，2012年度的合并销售额达到9兆410亿日元（约961亿美元）。　　详细信息请参见日立制作所官方网站(http://www.hitachi.com)。 关于日立高新技术公司:日立高新技术公司，于2013年1月，融合了X射线和热分析等核心技术，成立了日立高新技术科学。以“光”“电子线”“X射线”“热”分析为核心技术，精工电子将本公司的全部股份转让给了株式会社日立高新，因此公司变为日立高新的子公司，同时公司名称变更为株式会社日立高新技术科学，扩大了科学计测仪器领域的解决方案。日立高新技术集团产品涵盖半导体制造、生命科学、电子零配件、液晶制造及工业电子材料，产品线更丰富的日立高新技术集团，将继续引领科学领域的核心技术。更多信息请关注：http://image.instrument.com.cn/DoubleClick/click.asp?ADMID=11366&ADFID=8745

安捷伦科技公司将数据处理业务拓展至分子病理学Cartagenia Bench 有力解决了体细胞变异评估的固有挑战 2016 年 11 月 10 日，北京 安捷伦科技公司（纽约证交所： A）今日发布了一款新版实验室软件 Cartagenia Bench Lab 5.0，具有用于体细胞变异分类和报告的新功能。 Cartagenia Bench Lab 旨在帮助那些进行临床遗传学和分子病理学研究的实验室对基因组变异进行高效地解读和报告。 此临床级软件平台在美国获得了 I 类医疗器械注册证，已成为高通量诊断实验室的首选平台，帮助科研人员验证变异评估和报告流程，并使这二者实现自动化。 此软件使临床遗传学家和分子病理学家通过一次分析就能获得单核苷酸多态性、小的重复和缺失 (INDEL) 以及拷贝数变异的相关信息。 变异精选工具使他们能够检查变体、协作建立证据并安全地与同行和其他组员分享信息。 Cartagenia Bench Lab 5.0 具有体细胞变异分类、检查和精选等一系列新功能检查和处理等一系列新功能，它的发布代表了分子病理学实验室在数据处理能力上的重大飞跃。 通过 Bench 软件平台可直接访问 100 多种专业数据库和公开数据库，囊括了可用药变异、试验、药物和治疗选择的信息，例如 CIViC、COSMIC、N-of-One、OncoMD 以及 CollabRx。 该软件的变异精选工具有助于实验室建立一个内部知识库，收录之前被精选的变异的预前、预后、诊断性以及功能性的证据。 通过访问精选数据库和公开数据库中有关肿瘤类型本体和变异的信息，实验室能够有效地执行其变异评估标准操作程序，从而更有效地过滤变异，了解肿瘤组织类型的相关信息。 安捷伦基因组学解决方案部和临床应用部副总裁兼总经理 Herman Verrelst 谈道：“我们始终与客户保持密切合作，准确了解他们的需求，继而开发出能够解决问题的新型软件。 将基因组学数据转化成有用信息极具挑战性。 今天发布的这款产品能够表明我们始终致力于为临床诊断提供顶尖的解决方案。 5.0 版软件的发布为分子病理学实验室提供了获取临床级分析工具和知识的途径，成功解决了常规肿瘤学检测中实施新一代测序的其中一个关键难点，帮助实验室有效地解读肿瘤样本的测序数据，此外，通过访问含有同行对于诊断性、预后以及治疗性变体评审证据的公开数据库和专业数据库，为实验室提供有用信息。” 来自荷兰阿姆斯特丹的荷兰癌症研究所分子诊断学科负责人 Petra Nederlof 讲道：“自从我们在安捷伦 Bench 软件平台上执行常规诊断流程以来，安捷伦公司的团队与我们密切合作，并且将我们的需求及时准确地加入到新版本中，我们十分满意。” 来自密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院 McDonnell 基因研究所的 Malachi Griffith 博士谈道：“我们非常高兴能够与安捷伦合作，我们的视野被带到了全球分子病理学界。 如今，通过安捷伦 Bench 软件平台中现有的 CIViC 知识库，所有用户都可以直接获取由 CIViC 领域专家整理的预前、预后以及诊断性证据。” 安捷伦将于 11 月 30 日至 12 月 2 日在荷兰癌症研究所的 NGS 分子病理学研讨会上展示 Cartagenia Bench Lab 5.0 和其他解决方案。 荷兰癌症研究所分子诊断学科负责人 Nederlof 讲道：“我们很高兴与安捷伦共同组织这次活动。我们计划了含金量非常高的国际专家议程，他们将会分享临床诊断实践中的专业知识。” 研讨会的讨论内容将包括临床变异评估和实验室报告、自动化、体细胞变异分类、NGS 试剂盒组成以及数据共享计划。关于安捷伦科技公司 安捷伦科技公司（纽约证交所：A）是生命科学、诊断和应用化学市场领域的全球领导者，是致力打造美好世界的顶级实验室合作伙伴。 安捷伦与全球 100 多个国家和地区的客户进行合作，提供仪器、软件、服务和消耗品，产品可覆盖到整个实验室工作流程。 在 2015 财年，安捷伦的净收入为 40.4 亿美元，全球员工数约为 12000 人。如需了解安捷伦公司的详细信息，请访问 www.agilent.com。

在仪器分析人员的日常工作中，可能经常会碰到如下的问题：如何判定测出的数据是准确、可靠的？如何评价分析方法？如何通过解析实验数据以获得有限分析对象的最大限度的信息？如何正确地使用标准物质检定、校准仪器？如何利用标准物质控制进行质量控制？如何建立实验室（间）质量保证……为解决仪器分析人员在日常工作中，可能经常会碰到上述问题，仪器信息网同中仪标化（北京）技术咨询中心和中国仪器仪表学会分析仪器分会联合举办“仪器分析中的数据处理与分析质量控制”培训班。欢迎大家前来参加。 时间地点：2009年5月11日-15日 北京 11日报到 主讲专家：王庚辰研究员（国家标准物质中心，CNAS资深评审员）、臧幕文研究员（北京有色金属研究总院） 培训费用：1500元/人（包括授课费、讲义、文具、证书费、资料费）食宿统一安排，费用自理。 培训内容： 1、分析测试数据处理的必要性 2、分析测试数据的基本特性 3、分析测试数据的可靠性检验 4、回归分析－校准曲线 5、协同分析测试中的数理统计方法、分析测试结果不确定度的评定 6、常规分析的质量管理与控制图 7、分析测试中的量和单位及其使用中的常见错误 8、分析仪器的检定与校准 9、标准物质的选择及在测量分析中的应用、标准物质在分析质量控制中的应用 10、 标准物质在实验室比对、能力测试、实验室认可中的应用。 培训结束后由中国仪器仪表学会分析仪器分会颁发培训合格证书及中国仪器仪表学会会员证书，查看更多培训班信息，请访问http://training.instrument.com.cn 咨询及报名联系方法电话：010-5129927-101 13269178446 传真：010-51413697 Email：training@instrument.com.cn

2014年7-8月仪器信息网网络讲堂成功邀请国家环境分析测试中心分析测试技术研究室主任李玉武老师为网友在线讲解《分析化学数据处理专题》系列讲座，三次讲座累计报名600余人，出席400余人，整体出席率超过65%，高品质的讲座内容和充满干货的课后分享文件包，在用户中形成良好的口碑，不少网友同时邀请了圈内好友来在线听课，最后一次讲座报名人数超过300人。 《分析化学数据处理专题》系列讲座介绍： 《稳健统计-迭代法在分析化学中的应用》 会议时间：2014年7月1日 会议简介：介绍稳健统计-迭代法的基本原理、计算步骤，对稳健统计-迭代法在实验室常规检测数据处理及测量不确定度评估中的应用也简要进行了介绍。 《用于测量不确定度评定top-down方法应用概论》 会议时间：2014年7月22日 会议简介：介绍了&ldquo top-down&rdquo 法的核心理念及4种方法。&ldquo top-down&rdquo 法利用从方法确认、实验室内质控和/或实验室间协作定值、能力验证等数据，注重从整体上、通过数月、数年等一段期间反映样品检测全过程的期间精密度数据直接评估测量不确定，对于基层实验室更为实用。 《方法检出限几种计算方法标准解读》（近期上传） 会议时间：2014年8月26日 会议简介：检出限是分析方法基本性能参数之一，无论是开发新方法，制修订标准，以及实验室检测能力确认，常规检测报告附录，都会涉及方法检出限的实验设计和评估。本次讲座对国内涉及计算检出限的三个标准：HJ 168-2010，GB 17378.2-2007，GB 27415-2013进行了梳理，介绍了不同方法的特点、适用范围及应用实例。 未能在线听课但对《分析化学数据处理专题》系列讲座非常有兴趣的用户，可点击报告名称观看会议视频，需下载本讲座的课后分享文件包的用户，请加入QQ群231246773自助下载群共享文件。 网络讲堂还将为大家呈现更多精彩专家讲座，敬请期待。 报名中专家讲座： 林崇熙核磁共振系列讲座： http://www.instrument.com.cn/webinar/meeting/ExpertMeeting?id=15 向华饮用水检测及前处理技术系列讲座： http://www.instrument.com.cn/webinar/meeting/ExpertMeeting?id=19

p 　　多位专家基于大量的科研文章审稿经验，发现了部分文章存在以下问题： /p p 　　1. 制图不规范、不完整，没有充分利用测试结果给予的信息(无温度、失重率、热量等标出) /p p 　　2. 无再现性说明(严格讲要5次) /p p 　　3. 样品制备和鉴定方面：样品错了，结果不对 样品纯度没有使用物质的量表示 未提及使用何种方法 晶体没有纯晶体数据 高压液相、质谱等，滥用元素分析。 /p p 　　4. 实验条件的选择不合适 /p p 　　5. 操作不规范 /p p 　　具体到DSC分析测试结果中，出现了3个需要注意的问题： /p p 　 strong 　1. 基线需要修正 /strong /p p strong 　　 /strong 一般来说，基线应该是水平的。但实际由于样品受热，热容的改变，曲线向上或向下是正常的。 /p p style=" text-align: center " 　　 img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 260px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/515a1850-eec0-4722-b787-62f0121ec454.jpg" title=" 627-1.png" alt=" 627-1.png" width=" 400" height=" 260" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 269px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/f0f92f9c-f771-4e52-8c97-f04cf60ae9e8.jpg" title=" 627-2.png" alt=" 627-2.png" width=" 400" height=" 269" border=" 0" vspace=" 0" / /p p 　　 /p p 　　对于实际测得的DSC结果，基线的修正是很有必要的，基线修正的意义在于： /p p 　　(1)确保系统的稳定性和可靠性良好, 测量重复性高并且具有极高的灵敏度。 /p p 　　(2)基线处理方法的应用使得所获得的实验数据更加精确, 可靠性更强，从而为进一步的实验和分析工作可奠定良好基础, 提供有利的保障。 /p p 　　(3)每次实验的进行都应该进行基线的测量和相应的处理, 才能确保科学研究的严谨性和合理化. /p p style=" text-align: center " 　　 img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 342px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/8de4e80b-5324-4bcb-8be0-8c9d63c3391c.jpg" title=" 627-3.png" alt=" 627-3.png" width=" 400" height=" 342" border=" 0" vspace=" 0" / /p p 　　 strong DSC基线如何修正? /strong /p p 　　一般，DSC仪器自带的软件都具有基线校正、数据曲线平滑等功能。 /p p 　　TA 仪器设计了一种新的具有独特的内部 TzeroTM 参比温度的DSC 传感器, , 可检测到仪器不对称并在其测量电路中进行补偿。利用 TzeroTM 技术可以用含四个项的热流方程以及独特的电池校准技术消除由DSC 传感器的轻微不对称导致的基线失真问题的影响。其结果是真实地表示进出样品的热流信号本身, 不受仪器系统的影响。 /p p style=" text-align: center " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 295px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/b2927d59-e8da-41a1-83a4-b81a17ae6b82.jpg" title=" 627-4.png" alt=" 627-4.png" width=" 400" height=" 295" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 259px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/3dc65ef6-86fd-4ed0-a5e0-2da20129e01a.jpg" title=" 627-5.png" alt=" 627-5.png" width=" 400" height=" 259" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 371px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/9e6fdb1f-767f-4f93-9bb2-cd35b526b90c.jpg" title=" 627-6.png" alt=" 627-6.png" width=" 400" height=" 371" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 227px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/66758c8f-97f8-4236-9886-5e6204537bae.jpg" title=" 627-7.png" alt=" 627-7.png" width=" 400" height=" 227" border=" 0" vspace=" 0" / img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 329px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/d982f393-083a-4331-960f-f08adb5be82b.jpg" title=" 627-8.png" alt=" 627-8.png" width=" 400" height=" 329" border=" 0" vspace=" 0" / /p p 　　 strong 基线漂移对DSC曲线采样信号的特征信息准确提取带来很大困难，那么实验后期基线的修正是否可行呢? /strong /p p 　　现在很多仪器公司利用小波变换的良好分辨率分析特性,或者曲线拟合法以及FIR和IIR滤波的方法,提出基于多分辨率分析的DSC基线漂移矫正算法，并编程，使用软件“平滑”实验曲线。 /p p 　　专家以为这是不妥的。因为这样的处理很易丢掉小的峰形、改变原先的峰形，造成失真。 /p p style=" text-align: center " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 258px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/1fc4970b-81c3-4ee1-a765-b07168be7b1a.jpg" title=" 627-9.png" alt=" 627-9.png" width=" 400" height=" 258" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center " 　　 strong 国产RD496-2000型热量计使用了矫正 /strong /p p 　　对反应前后基线不变或变化甚微的热谱，一般不作基线移位热动谱峰面积的校正。对反应前后基线变化的热谱，都作基线移位热动谱峰面积的校正。 /p p 　　 strong 2.人为取点位置(同样样品，结果的曲线取点温度范围)应统一 /strong /p p 　　取点方法不同，DSC测试得到的结果也会产生很大的不同。现在比较常用方法是切线法外推出对应的温度。 /p p style=" text-align: center " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 267px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/bfed997d-25b4-4b40-bfda-850e8595fa19.jpg" title=" 627-10.png" alt=" 627-10.png" width=" 400" height=" 267" border=" 0" vspace=" 0" / /p p 　　 strong 3.应该建立物质测定的统一标准 /strong /p p 　　对于一个同样的样品，即便做到操作规范，但结果也往往不一致，原因是多因素对实验结果的影响，比如升温速率、气氛、样量、坩埚& #8230 & #8230 /p p 　　因此，为了确保实验的重复性和可靠性，对实验过程的基本要求是：操作要规范，测定要准确，解析要合理，结果要全面。 /p p 　　 /p p 　　参考文献 /p p 　　张均艳, 李成栋, 田学雷. 山东大学学报(工学版), 2002, 32(6): 552 /p p 　　夏郁美, 韩 莉, 王世钧. 分析测试技术与仪器, 2014, 20(1): 52 /p p 　　致谢：本文由西北大学教授高胜利所提供相关资料经编辑整理撰写而成，特此致谢！ /p

p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 近日，中国科学院古脊椎动物与古人类研究所副研究员卢静、澳大利亚国立大学博士生胡雨致，与澳大利亚国家计算中心博士Ajay Limaye，在《皇家学会开放科学》（ i Royal Society Open Science /i ）上发表了在三维重建和可视化计算机软件开发方面取得的新进展。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " X射线断层成像扫描技术（X-Ray Computed Tomography，X-CT）能无损获取样本的内部结构形态，在古生物学等领域得到应用，这对CT数据的处理，特别是其三维重建和可视化提出了更高的需求。目前，已有若干商业软件支持对CT数据的三维重建，但价格昂贵，且通常并没有针对古生物学、形态学和比较解剖学教学研究要求的特别优化。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " span style=" text-indent: 2em " 该研究以一组澳大利亚早泥盆世盾皮鱼化石的CT扫描数据为例，介绍了三维成像数据处理软件Drishti最新版本中的执行数据重建分割 i Drishti& nbsp Paint /i 模块， i Drishti /i 软件三个模块之间的关系和交互，以及体积探索、体渲染的应用功能等内容。该研究介绍了一种用于对体积数据进行阈值处理（即梯度阈值处理）的新工具，以及使用3D Freeform Painter工具执行三维分割的新方法。这些新工具和工作流程可以实现更准确，更精确的重建，建模和3D打印。该研究为CT数据的分割和重建提供了新的工具和思路，对于精准分割体数据，优化三维重建，三维模型制作、渲染和3D打印效果具有重要意义。& nbsp /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " a href=" https://royalsocietypublishing.org/doi/10.1098/rsos.201033" target=" _self" style=" color: rgb(0, 112, 192) text-decoration: underline " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 论文链接 /span /a /p p style=" text-align: center " img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202012/uepic/f426dd19-1764-4571-8d53-91cd4d0a6926.jpg" title=" 图1.jpg" alt=" 图1.jpg" / /p p style=" text-indent: 2em " 图1. i Drishti paint /i 中使用3D Freeform Painter工具对澳大利亚早泥盆世盾皮鱼头部化石执行三维分割 /p p style=" text-indent: 0em text-align: center " img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202012/uepic/0de4da24-6159-4a47-bfd8-75fc082a4a9c.jpg" title=" 图2.jpg" alt=" 图2.jpg" / strong br/ /strong /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 图2.使用 i Drishti Paint /i 对澳大利亚早泥盆世盾皮鱼颌骨脉管结构进行三维重建& nbsp /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " br/ /p

株式会社岛津制作所（以下简称“岛津制作所”）、富士通株式会社（以下简称“富士通”）、株式会社富士通研究所（以下简称“富士通研究所”）经共同研究※1，成功开发出可应用于大数据处理中的AI（人工智能）技术，该技术在质谱分析结果的解析过程中不可或缺。截至目前的所有研究成果，已在日前召开的“第11届代谢组学研讨会”上发表。作为ICT（信息通信技术）企业，富士通为实现数字革新，不断探究AI新型商业模式。作为分析仪器制造商，岛津公司受客户委托，致力于“实现复杂数据的高精度自动解析”。诉求一致的两家企业自去年11月起，开始推进数据自动化解析领域AI的共同研究。随着仪器灵敏度、分析速度的不断提升，用于疾病早期发现的技术确立、食品农残检测等各领域研究以及品质管理等用途的质谱分析仪，获得的数据量也急剧增加。在此影响下，被称为“peak picking ”※2的数据解析方式成为作业工程中的一大瓶颈。由于较难实现完全的自动化，并且在一定程度上仍需手动调整，该作业方式存在操作人员操作失误或数据篡改的漏洞，各操作人员间的解析准确率亦参差不齐。近年，在医疗及制药领域，对排除属人为属性的高精度自动化需求愈演愈烈。为此，3家企业模仿脑神经细胞的神经网DEEP LEARNING（深度学习）的适用性开展探讨，欲通过活用AI解决上述问题。但在研究过程中，遇到两大难题：其一， 训练数据※3不充分；其二，将分析仪器输出数据直接导入深度学习网络后，无法开展学习训练。通过共同研究期间的不懈努力，岛津成功开发出“可弥补训练数据不足的数据生成技术”，富士通?富士通研究所成功开发出“分析仪器输出特征的图像转换技术”及“可学习熟练工解析诀窍的特征提取技术”。目前，已将通过上述技术生成的３万多条训练数据输入深层学习网，供其学习。与经验者手动peak picking 结果比对后发现，AI自动peak picking 的错误率为7%、未检率为9％※4。即自动peak picking 并不逊色于经验者操作，相关结果达到可使用状态。在岛津公司2017年4月开展的中期经营计划中，制定了“致力先进医疗、为预防、诊断、治疗以及制药领域提供革新产品及服务”的目标。本次开发的AI，其最初使用的“代谢组学”研究即为其中的一环。代谢组学是一种检测代谢产物并根据其性状特征对细胞开展检查的生物技术。在生理?病理组织的解析、疾病生物标志物的探索等领域备受瞩目。2015年11月，富士通将积累了超过30年的AI（人工知能）相关知识技术，以“FUJITSU Human Centric AI Zinrai”形式公开发表，积极推进面向各领域用户、商品服务的AI实际应用。目前，又在深度学习的全新领域聚焦“代谢组学”，积极开展可实现数据分析自动化的AI研发。岛津与富士通的目标为，2018年能将本次成功研发的AI技术导入质谱分析仪器专用软件。 ※1 从大阪大学研究生院工学研究专业福崎英一郎教授、该校信息科学研究专业松田史生教授处获得研究人员需求。在岛津制作所、大阪大学开设以代谢组学分析技术研发为目的的“大阪大学?岛津分析革新共同研究讲座”。※2 从质谱分析数据（图表）中，读取峰宽及峰高的工程。※3 供深度学习网络开展学习的数据。对输入网络的数据及其输出结果进行编组。本技术应用中，为分析仪器输出数据与相应经验者peak picking 结果的比对组合。※4 将经验者手动peak picking 结果称作“正确范围”，与AI自动peak picking 结果“预测范围”进行比较。如两者重叠率超过50％，则判断为“匹配”，反之则为“不匹配”。在“匹配”情况下，除被正确检测的峰值外，将预测范围中出现、但无法与正确范围匹配的项目定义为“错误检测”，将正确范围中出现、但无法与预测范围匹配的项目定义为“未检测”。错误检测率计算公式为：错误检测数 / (检测数＋错误检测数)、未检测率计算公式为：未检测数 / (检测数＋未检测数)。关于岛津 岛津企业管理（中国）有限公司是（株）岛津制作所于1999年100%出资，在中国设立的现地法人公司，在中国全境拥有13个分公司，事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心，并拥有覆盖全国30个省的销售代理商网络以及60多个技术服务站，已构筑起为广大用户提供良好服务的完整体系。本公司以“为了人类和地球的健康”为经营理念，始终致力于为用户提供更加先进的产品和更加满意的服务，为中国社会的进步贡献力量。