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高危病毒研究

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高危病毒研究相关的资讯

  • Tecan Infinite 200 PRO 酶标仪-研究危险病毒的得力助手
    坐落于法国里昂的P4 Inserm-Jean Mé rieux实验室是欧洲最大的最高生化安全级别(BSL4)病原体研究实验室,该实验室凭借灵活、耐用、可靠的Tecan Infinite® 200 PRO多功能酶标仪对高危险性病原体进行研究,其中包括许多危险级别为4(最高)的病毒,如埃博拉病毒(Ebola)、马尔堡出血热(Marburg)、拉沙热(Lassa)、尼帕病毒(Nipah)和亨德拉病毒(Hendra)等。P4体外实验及诊断团队生物技术工程师Sté phane Mely解释道:&ldquo 我们之所以选择Tecan Infinite® 200 PRO多功能酶标仪,主要是看中了它能够在非常严苛的最高生化安全别级BSL4条件下进行光吸收、发光和荧光检测,可以顺利完成包括酶联免疫吸附(ELISAs)、基于荧光素酶活的发光检测和病原体分子荧光检测在内的各种实验。 &ldquo 对于4级生化安全实验室使用的仪器而言,最重要的要求之一就是耐用稳固性,不仅仅是出于进入实验室对设备进行维护和维修有所受限的考虑。Tecan Infinite® 200 PRO多功能酶标仪对多种消毒产品&mdash &mdash 如双氧水等,具有良好的耐受性,这一点对我们的工作来说非常重要。此外,它的四光栅系统可以让我们任意选择所需的检测波长,无须担心是否拥有合适波长的滤光片。总之,这款仪器操作简便、外形轻巧,并且耐用稳固&mdash &mdash 这是Tecan产品的共性。&rdquo 更多关于Tecan Infinite® 200 PRO多功能酶标仪的信息,请访问以下网站或咨询Tecan当地员工/经销商: www.tecan.com/infinite200pro P4实验室的科研人员正在进行实验 Talk to Tecan 欲知更多详情,请联系帝肯上海 市场部:Libby Zhu Tel: 021 2206 3206 / 010 8511 7823 Fax: 021 2206 5260 / 010 8511 8461 Email:infotecancn@tecan.com www.tecan.com
  • 新研究:检测血液蛋白或可提前十多年识别痴呆症高危人群
    近日刊发在英国《自然老化》杂志上的一项新研究指出,大规模筛查研究结果显示,检测血液蛋白或可在症状出现十多年前识别阿尔茨海默症等痴呆症高危人群。来自中国复旦大学的研究人员分析了英国生物医学数据库采集的5万多名健康人士的血液样本,其中1417人在采样后14年内患上了痴呆症。研究人员发现,在筛查的1463种血液蛋白中,有4种蛋白(GFAP、NEFL、GDF15和LTBP2)的水平超标情况与痴呆症密切相关。该研究显示,在日后患痴呆症者的血液样本中,这4种蛋白水平在症状出现前的十多年就已超出正常范围。研究还发现,血液中GFAP蛋白水平较高的人患痴呆症的可能性是正常人的2倍以上,患阿尔茨海默症的可能性是正常人的近3倍。研究人员利用机器学习技术设计了预测算法,将上述4种蛋白“生物标志物”与年龄、性别、教育和家族史等因素结合起来。他们根据三分之二参与者的数据训练模型,并使用其余参与者的数据对该预测算法进行测试。结果显示,这一模型利用参与者被正式诊断前十多年的数据,预测了包括阿尔茨海默症在内的3种痴呆症的发病率,准确率约为90%。研究人员表示,该发现可用于研发血液检测新方法,以识别患痴呆症的高危人群。但新的生物标志物在用作临床筛查工具之前还需要进一步验证。研究人员指出,人们通常只有当注意到记忆出现问题或其他症状时才会去医院进行诊断,而一旦被诊断出患痴呆症则为时已晚,因为这种病可能已发展多年。
  • naica®微滴芯片数字PCR系统量化造血干细胞移植儿童巨细胞病毒感染的病毒载量
    导读中国疾病预防控制中心国家病毒病预防控制研究所和中国首都儿科研究所的科学家在Canadian Journal of Infectious Diseases and Medical Microbiology上发表了题为The Viral Load of Human Cytomegalovirus Infection in Children following Hematopoietic Stem Cell Transplant by Chip Digital PCR的文章。文中应用naica® 微滴芯片数字PCR系统建立了芯片数字PCR(cdPCR)方法,能够精准定量HSCT前后儿童HCMV感染的病毒载量。质粒pUC57-UL83的cdPCR检测限为103拷贝/ml,qPCR检测限为297拷贝/ml。cdPCR检测HCMV AD169毒株的结果为146拷贝/ml,表明cdPCR的灵敏度高于qPCR。人类巨细胞病毒(HCMV)是一种普遍存在的β-疱疹病毒,已感染发展中国家高达90%的人口。作为一种常见病原体,HCMV感染在免疫抑制个体中引起了显著的发病率和死亡率,特别是在接受了造血干细胞移植(HSCT)的患者中,原因是原发感染后潜伏感染的主要靶细胞是造血细胞。对于HSCT后的高危儿童,应在出现临床症状之前检测HCMV感染,因为HCMV病毒的载量及变化与HSCT儿童HCMV感染的发展和严重程度高度相关。因此,HCMV病毒载量的定量检测对患儿的治疗至关重要。应用亮点:▶ 使用naica® 微滴芯片数字PCR系统开发了一种快速、直观、简便和准确的检测HSCT前后儿童HCMV病毒的绝对定量方法。▶ 通过质粒和培养毒株验证naica® 微滴芯片数字PCR系统灵敏度、特异性和重复性。实验方法:作者从首都儿科研究所儿童医院收集了122名异体造血干细胞移植患儿、3名自体造血干细胞移植患儿样本(男/女:73/52),中位年龄7.5岁。该研究通过质粒和培养毒株验证naica® 微滴芯片数字PCR系统灵敏度、特异性和重复性均优于qPCR。在HSCT前后,通过qPCR和cdPCR检测所有供体和受体血清中的HCMV病毒载量。实验结果:作者通过含有pUC57-UL83基因的质粒DNA分别评估cdPCR和qPCR的动态范围。cdPCR的检测限 (LOD) 为103拷贝/ml (2.0拷贝/反应),qPCR的LOD为297拷贝/ml。结果表明,cdPCR的灵敏度高于qPCR。为了评估cdPCR数据的重现性,作者使用质粒建立了HCMV DNA拷贝数的标准曲线。分析cdPCR检测的变异系数(CV、标准差/平均值)。结果表明,cdPCR检测具有良好的重复性(CVHCMV在125个HSCT患儿的检出率为30.40% (38/125),HCMV病毒载量范围为107拷贝/ml-6600拷贝/ml。男性组的检出率为30.14% (22/73),女性组的检出率为30.77% (16/52)。在0-12岁HSCT后HCMV阳性儿童中,HCMV的检出率为89.47% (34/38)。在0-6岁组中,男性的检出率为25.64% (10/39),女性的检出率为22.58% (7/31)。在7-12岁组中,男性的检出率为39.29% (11/28),女性的检出率为40% (6/15)。12岁以上患儿HCMV检出率为33.33% (4/12),男性检出率为16.67% (1/6),女性检出率为50% (3/6)。结果如表3所示。综上所述, cdPCR方法在HCMV检测领域比qPCR更敏感,能快速、直观、简便和准确的检测HSCT患儿HCMV感染率及病毒载量。参考文献:1.P. Griffiffiffiths, I. Baraniak, and M. Reeves, “,e pathogenesis of human cytomegalovirus,” Journal of Pathology, vol. 235, no. 2, pp. 288–297, 2015.2.L. Dupont and M. B. Reeves, “Cytomegalovirus latency and reactivation: recent insights into an age old problem,” Reviews in Medical Virology, vol. 26, no. 2, pp. 75–89, 2016.naica® 六通道微滴芯片数字PCR系统法国Stilla Technologies公司naica® 六通道微滴芯片数字PCR系统,源于Crystal微滴芯片式数字PCR技术,自动化微滴生成和扩增,每个样本孔可实现6荧光通道的检测,智能化识别微滴并进行质控,3小时内即可获得至少6个靶标基因的绝对拷贝数浓度。
  • 江门50多学生染诺如病毒 生蚝色拉或带病毒
    连日来,江门五邑大学五十多名学生集体感染上了诺如病毒,出现腹泻、头晕、发烧等症状。有关的研究专家———广东省微生物研究所所长吴清平及副研究员寇晓霞就此事接受本报访问,他们指出:诺如病毒所引起的疾病主要是在秋冬季流行,贝类是诺如病毒传播的高危食品。而预防诺如病毒感染最好的办法就是勤洗手和少吃生食。   病症可能反复多次发作   寇晓霞说,诺如病毒发病率最高的季节是秋冬,感染的潜伏期只有1至2天,自然病程较短,一般患者三天左右即可自愈,因此不少患者并未就医,或被诊断为“胃肠型感冒”。它多导致儿童发病,这可能与其消化道和机体免疫系统发育尚不完全有关。   一般来说,这种病很少导致死亡,但患者在症状消失后,还会有几周的排毒期。其中,体弱的老人和儿童容易继发肺部感染,或伴随脱水而危及生命。   寇晓霞还提醒,这种病症可怕之处在于可能反复感染,而人体很难对其产生持续性免疫。有的患者甚至隔一两个月就感染一次,而且随着感染次数的增多,病毒毒性并不衰减。   病毒易传播于集体饭堂   吴清平说,诺如病毒既通过消化道传播,也通过人与人之间的密切接触传播,甚至空气也会成为传播媒介。   病毒最易存在于贝类、色拉等食物中。如果人们进食没有煮熟的贝类的话,很容易发生食用后病毒感染的现象。该病毒也可能通过砧板传播,因此在人口比较密集的生活场所,如幼儿园、敬老院等的集体饭堂也容易引起传播。   “目前对其感染者尚无特效的抗病毒药物,以对症支持治疗为主,一般不需使用抗菌素。脱水是诺如病毒感染性腹泻的主要死因,对严重病例尤其是幼儿及体弱者应及时输液或口服补液。”吴清平解释说。   七年研究阻击病毒来侵   这次食源性传染病,以及近年SARS和禽流感的连续暴发流行警示我们:人类社会已经进入病毒威胁的高风险时间窗口。   尤其针对新的重大食源性传染病毒,政府重视加强战略性和前瞻性的科技攻关尤显重要。寇晓霞说,我国过去对这一病毒的了解有许多空白,特别是其主要在哪些食物中存在,以及有关的检测方法。病毒一旦入侵,就束手无策。   省微生物研究所的专家们在国家和省等科技项目的支持下,对诺如病毒进行了七年的专项研究,特别是对贝类和水体中病毒的检测做了较为深入的研究。他们建立了诺如病毒的RT-PCR检测方法,首次以自行研制标记物对诺如病毒在蚝身上的分布情况进行分析,首次发现其鳃是检测诺如病毒的最佳靶位点,建立起贝类中诺如病毒检测体系对保障食品安全具有重要意义。
  • 接管苏联病毒厂 美援建中亚最大病毒实验室
    据俄罗斯《报纸报》4月7日报道,美国驻哈萨克斯坦大使理查德• 霍乌格兰德4月1日在哈首都阿拉木图表示,美国将投资6000万美元支持哈萨克斯坦建造中亚地区规模最大的病毒实验室,接管苏联留下的数百种危险病毒。   接管苏联220种病毒   报道称,新实验室将于2013年在阿拉木图建成,预计有250名科研人员从事人类及动物病毒的分析研究。哈卫生部表示,实验室将有两个功能:科研功能和保存极度危险病毒的功能。   美国斥资新建的实验室将用于取代哈国原设在咸海深处的复兴岛农业研究所,那里早年是苏联秘密生物武器实验靶场。苏联时期,该所下辖19个实验室,主要任务是研究对付生物武器袭击的方法和研制防病毒疫苗,曾试验过西伯利亚瘟疫、鼠疫、兔死病病毒等生物武器,保存有220种微生物菌株,其中40种具有高危性。1991年苏联解体后,哈国将研究所原班人马接收下来,并将原来的19个实验室减到11个。但由于哈国没有足够的资金保证其正常运作,研究所仍在使用苏联时代的老旧仪器。更要命的是,随着全球干旱的加剧,咸海水位持续下降,复兴岛与附近大陆融为一体只是时间问题,届时岛上危险物质将严重威胁周围居民的生命安全。此前,哈国防化兵曾用清除病菌的氯来清理复兴岛,非但没起到应有的作用,反而让有害物质渗入地下,破坏了里面的土壤。   美病毒站遍布独联体国家   报道称,美国此次援建的病毒实验室是中亚地区规模最大的,此前美国已在独联体国家援建过18个病毒监测站。   俄罗斯《红星报》曾披露,在上世纪70年代中期,苏联在哈萨克斯坦、白俄罗斯和俄罗斯新建了许多“药剂工厂”,它们生产的全都是具有大规模杀伤性的生物武器。其中大型生物工厂主要有3座,分别位于哈萨克斯坦的斯捷普诺戈尔斯克、俄罗斯的奥穆特宁斯克和别尔茨克。除了这些大工厂外,还有一些车间分布在奔萨、库尔干等城市。其中,哈萨克斯坦的斯捷普诺戈尔斯克在苏联时期的秘密代号为“19E”。1983-1987年期间,“19E”所产的生物武器比苏联战后40年生产的总和还多。苏联解体后,该厂陷入混乱,美国政府多次资助哈国,解决病毒工厂问题,截至2009年12月,美国已在哈萨克斯坦援建三个“病毒武器监测站”,斯捷普诺戈尔斯克生物武器工厂也已被完全“非军事化”。   目前美国的病毒监测站已经遍布独联体国家,可以说哪里曾有苏联病毒工厂,哪里就有美国监测站。据报道,除了哈萨克斯坦的3座监测站外,美国“援建”的其他监测站分别位于阿塞拜疆(1座)、格鲁吉亚(5座)、乌克兰(1座)以及乌兹别克斯坦(8座)。   “纳恩-卢格尔”特别预算   报道称,美国这次用于援建病毒实验室的6000万美元来自五角大楼“纳恩-卢格尔”特别预算。在2009至2010财年,美国设立了10亿美元的特别预算,用于削减其他国家的大规模杀伤性武器。   1991年,美国参议员萨姆• 纳恩和理查德• 卢格尔提出的一项立法草案被通过,这项立法规定每年从美国国防预算中拨出特别经费来资助新独立的原苏联国家销毁核武器和加强防止核扩散计划。此后该项目共拆除了7504个战略核弹头,销毁了752枚洲际弹道导弹、31艘能够发射弹道导弹的核潜艇以及155架轰炸机,哈萨克斯坦拥有的1410枚核弹头被全部拆除,除俄罗斯以外的原苏联国家也都成为了无核国家。   但“纳恩-卢格尔计划”并未因处理核武器工作的结束而终结。2001年“9• 11”恐怖袭击发生后,美国认为那些经济凋敝的独联体国家所继承的苏联“病毒遗产”具有非常大的威胁,缺乏监管的苏联科研成果可能会被恐怖分子和极端分子窃取。因此,美国近年来通过“援建”等方式加紧接管苏联病毒工厂。分析人士认为,此举不仅让美国加强了对世界上生物武器的控制,而且使其轻松掌握了苏联投入巨大精力获得的病毒战研究成果,从而取得新的军事优势。
  • 发霉药事件续:将加强检测高危病患用药
    15间公立医院昨日起为全港4万名服用“别嘌醇”的病人换药。图片来源:文汇报   新华网消息 据香港文汇报报道,“发霉”降尿酸药事件令人担心“药物灾难”一触即发!据了解,生产700款药品的欧化药业还有5间“姊妹”药厂,隶属于一个药业集团,有药剂师表示,若欧化药业使用的原材料出现问题,同一集团的药厂药物难免遭殃,波及公营及私营医疗药物。食物及卫生局局长周一岳表示,卫生署已派员抽查其他药物作化验,并追查原材料是否出现污染 稍后会研究加强检测高危人士的口服药物,确保药物出厂前及出售前做足细菌或霉菌测试。   欧化的降尿酸药“别嘌醇”因受污染被劝吁停用,但该药厂出产的其他药品仍有售,公立医院当前仍使用欧化的41种药物。周一岳昨出席公开活动后称,卫生署人员上周五已到欧化厂房抽取其他药物化验,数天内会有结果,现时最重要是追查污染源头,是否有原材料受污染,政府继续检查该药厂同一生产线的药物。   欧化其他药暂毋须停用   周一岳表示,暂未有证据显示欧化其他药物受到污染,毋须停用,若发现是药厂问题,有需要采取执法行动,会征求律政司意见。他续称,稍后会研究加强检测高危人士的口服药物,确保药物出厂前及出售前做足细菌或霉菌测试。他又称,霉菌存在于日常环境,但为谨慎起见,已要求停售该受污染药物。   欧化药业与新×制药和正×药品等6间药厂,同属雅×臣药业有限公司,向私营及公营的医疗市场供应药物。香港执业药剂师协会前会长钟永明表示,欧化同一集团的药厂现仍在本港生产及运作,若查明今次事件属于原材料受到污染,难保与欧化药业和相连的“姊妹”药厂,同样存在原材料受到污染的风险。   学者:增检测存技术困难   港九药房总商会理事长刘爱国表示,欧化同一集团药厂所生产的药品,在本港市场占有率3成,但他认为其他药厂同样受污染的机会较微。他解释,雅×臣药业下的不同药厂各自独立采购和生产,有不同的管理制度,应不会出现同样的污染问题。他认为,欧化生产的'别嘌醇"受污染只属个别事件。   对于政府有意加强检测高危人士服用的药物,香港医院药剂师学会教育总监崔俊明表示支持,但相信执行有技术困难。他指高危人士有可能同时服用感冒药、糖尿病药、心脏药及高血压药,难以逐一化验。他建议病人在接受化疗前才化验其服用药物是较可行 他又称,若由药厂化验费用较高,或将成本转嫁予病人。
  • 青岛今年快速检测一万批次高危食品
    今年,青岛将开展餐饮服务食品安全专项整治行动,年内将进行一万批次高危食品、高危环节餐饮安全快速检测。包括小饭桌在内的1.5万个无证小餐饮单位将纳入岛城餐饮监管系统。   2月28日,青岛市召开2013年餐饮服务食品安全监管工作会议,决定继续深入开展餐饮服务食品安全专项整治。   餐饮服务食品安全专项整治以食用油、肉类等大宗食品和食品添加剂为重点品种,以原材料采购、生食水产品和凉菜制作、餐饮具清洗消毒保洁为重点环节,将在旅游景区、农村、城乡结合部、学校周边等重点区域和节假日、中高考、重大活动举办等位重点时段进行综合治理,全面排查和重点整治带有行业共性的隐患和“潜规则”问题,防范区域性、系统性餐饮安全风险。   在餐饮服务食品安全专项整治过程中,将突出乳制品、食用油、酒类、肉类、食品添加剂等重点品种综合治理。青岛市食品药品监督管理局副局长柏建超介绍,在专项整治过程中,食药监部门将积极探索小饭桌等无证小餐饮管理模式,对无证小餐饮实施社会化监管,确保小餐饮单位的监管率达到50%以上,全市将有15000无证小餐饮单位将纳入岛城餐饮监管系统。同时,全市持证餐饮服务单位的首次动态等级评定工作也将于今年6月全面完成。   柏建超称,今年将推行餐饮单位“厨房亮化”工程,通过玻璃幕墙、在后厨操作间安装电子监控等方式,对后厨关键风险点进行全程监控。便于消费者对操作间的卫生条件、原材使用、操作过程等进行全面监督。   同时,食药监部门还将督促餐饮单位向社会公开承诺食品安全,鼓励餐饮服务单位实施危险分析和关键控制点(HACCP)等先进管理制度和高危食品、高危环节餐饮安全快速检测制度。今年将对一万批次高危食品、高危环节餐饮安全进行快速检测。
  • 最新!卫健委解读《新冠病毒核酸20合1混采检测技术规范》
    《新冠病毒核酸20合1混采检测技术规范》解读  为进一步做好新冠病毒核酸检测,给疫情防控争取宝贵时间,在目前5合1、10合1混采检测基础上,国务院联防联控机制医疗救治组积极组织专业机构和专家论证,研究提出进一步提高核酸检测效率的技术方法。经开展临床真实样本验证,在确保核酸检测质量的基础上,决定稳步实施20合1混采检测技术,并组织制定了《新冠病毒核酸20合1混采检测技术规范》(以下简称《规范》)。  20合1混采检测可大幅度提高检测效率,更加适用于大规模人群核酸筛查工作。与10合1混采检测技术相比,主要是在采样管方面做出调整。《规范》共分为10个部分,主要包括:样本采集耗材规格、采集地点要求、采集流程、标本送检、实验室接收、标本检测与质量控制、检验结果处理、检测后样本处理、技术人员基本要求、生物安全防护等。  新冠病毒核酸20合1混采检测技术规范  为指导各地开展新冠病毒混采检测工作,进一步提升核酸检测能力和效率,在已有10合1混采检测技术的基础上,针对新冠病毒核酸20合1混采检测(20-in-1test)技术(指将采集自20人的20支拭子集合于1个采集管中进行核酸检测的方法),制定本规范。  一、样本采集耗材规格  (一)病毒采集管。管帽和管体应当为聚丙烯材质,螺旋口可密封,松紧适度。管体透明,可视度好。采集管高度(含管帽)(100±5)mm,容量企业定标20-30ml,内含11-12mL胍盐或其他有效病毒灭活剂的保存液。保存液应当带有易于观察、辨识的颜色(如粉红色),并保持一定的流动性,方便取样。  (二)采集拭子。宜选用聚酯、尼龙等非棉质、非藻酸钙材质的拭子,且柄部为非木质材料。折断点位于距拭子头顶端3cm左右,易于折断。  二、采集地点要求  选择空旷、通风良好的场地作为大规模人群筛查集中采集地点。根据原有场地条件,划分为等候区、采集区、缓冲区和临时隔离区,有效分散待检人员密度。应当设置急救设备备用。  (一)等候区。设置人行通道,同时设置一米线保证等候人员的防护安全。根据天气条件配备保温、降温,遮阳、遮雨等设施。老年人、儿童、孕妇和其他行动不便者优先采集。  (二)采集区。根据气候条件,配备帐篷、冷/暖风扇、适量桌椅,保证医务人员在相对舒适环境下工作。配备采集用消毒用品、拭子、病毒采集管,并应当为受检人员准备纸巾、呕吐袋和口罩备用。标本如无法及时运送至实验室,需准备4℃冰箱或低温保存箱暂存。应当制定防止病原微生物扩散和感染的应急预案。  (三)缓冲区。空间应当相对密闭,可供采集人员更换个人防护装备,放置与采样点规模相匹配的防护用品、采集用消毒用品、拭子和采集管,户外消杀设备。  (四)临时隔离区。用于暂时隔离在采集过程中发现的疑似患者或高危人群。  三、采集流程  (一)标识及信息登记。  1.登记流程。工作人员在采集前分配20个受检者为一组,采集前收集并登记受检者相关信息(包括姓名、性别、身份证号、联系电话、采集地点、采集日期和时间),按照组别进行采集管编号。因20人相对较多,为避免不同组人员弄混,采样时,可采用2米线将下一组等候人员与正在采集的一组人员严格分隔开来,该组人员采完后,下一组人员才能有序进入采样区。  2.登记要求。推荐使用身份证读卡器、二维码条码等信息化手段关联受检者信息,提高信息读取效率和准确性。  (二)采集方法。被采集人员头部微仰,嘴张大,发“啊”音,露出两侧咽扁桃体,采集人员将拭子越过被采集人员舌根,在两侧咽扁桃体稍微用力来回擦拭至少3次,然后在咽后壁上下擦拭至少3次。操作完毕后,将拭子头置入管中、拭子折断点置于管口处,稍用力折断使拭子头落入采集管的液体中,弃去折断后的拭子杆,旋紧管盖,将采集管置于稳定的置物架上。每例采集后采集人员均应进行手消毒。  (三)混合拭子。依照上述采集方法依次采集其余19支拭子,将完成采集的拭子放入同一采集管中,动作轻柔,避免气溶胶产生。连续采集20支拭子以后,旋紧管盖,防止溢洒。注意咽拭子需浸入保存液内。如采集管内拭子不足20支,应做好特殊标记并记录。  四、标本送检  (一)核对信息。核对采集管标签与混采登记表信息,确保准确完整,编号一致。  (二)标本放置要求。将核对后的采集管放入透明塑料密封袋(一层容器)中并封严袋口,用75%乙醇喷洒密封袋外部。将密封袋放入二层容器(可选内配适量吸湿材料的包装盒或双层医用垃圾袋),密封后用75%乙醇喷洒消毒。将二层容器放入具有“生物危害”标识的专用标本转运箱(推荐使用符合《危险品航空安全运输技术细则》A类物品运输UN2814标准的转运箱),二层容器和转运箱之间应当放置降温凝胶冰袋。二层容器应当固定在转运箱中,保持标本直立。密封转运箱后,使用75%乙醇喷洒消毒,转运箱表面洁净无污染。  (三)标本转运要求。标准转运箱应当由专门标本运送人员负责运送。标本应当在采集后2-4小时内送至实验室。不能立即送检的,应当配备专门的冰箱或冷藏箱保存,并做好标本接收、保存登记。标本采集后24小时内可置于4℃保存。  五、实验室接收  (一)标本签收。运送和接收人员应当对标本进行双签收。接收人员检查转运箱、二层容器有无破损。  (二)标本打开。应当在生物安全二级实验室核心区打开转运箱,取出二层容器。在生物安全柜中打开二层容器,用75%乙醇喷洒或擦拭消毒后,取出密封袋,用75%乙醇试剂喷洒或擦拭消毒,并检查是否密封完好。  (三)标本检查。取出采集管,检查管壁是否有破损、管口渗漏等,确认无破损、渗漏后用75%乙醇喷洒或擦拭消毒。如有破损、渗漏,应当立即停止操作,用吸水纸覆盖后使用0.55%含氯消毒剂进行消毒处理,做好不合格登记后销毁。  (四)标本保存。不能及时检测的标本放入专用冰箱保存。24小时内检测的标本可置于4℃保存。24小时内无法检测的标本应当置于-70℃或以下温度保存。如无-70℃保存条件,则于-20℃暂存。避免标本反复冻融。设立专库或专柜保存标本,双人双锁管理。  (五)转运容器移出。使用后的二层容器内外壁经75%乙醇擦拭消毒后移出生物安全柜,实验结束后使用紫外灯照射消毒。  六、标本检测与质量控制  按照《医疗机构新冠病毒核酸检测工作手册(试行第二版)》相关要求执行。  七、检验结果处理  新冠病毒核酸定性检测报告应当包括检测结果(检出/阳性、未检出/阴性)、方法学、检测限等。  (一)结果判断。依据所用扩增试剂说明书,判断检测结果为未检出/阴性或者检出/阳性。  (二)阳性结果复核。  1.混采检测结果为阳性、灰区或单个靶标阳性,通知相关部门对该混采管的20个受试者暂时单独隔离,并重新采集单管拭子进行复核。  2.复核单管核酸检测如均为阴性,则按照阴性结果回报。暂时隔离人员即解除隔离;如检测结果阳性,按程序上报。  八、检测后样本处理  检测后的标本处理按《全员新型冠状病毒核酸检测组织实施指南(第二版)》相关要求进行。  九、技术人员基本要求  采样人员和检测人员要求应满足《医疗机构新型冠状病毒核酸检测工作手册(试行第二版)》要求。  十、生物安全防护  标本采集和运送人员、实验室工作人员的防护按照《新型冠状病毒肺炎防控方案(第八版)》相关要求进行。
  • 从韩春雨事件看论文中的高危因素
    p   8月3日,韩春雨发表在《自然-生物技术》上的那篇著名论文正式撤稿,但是围绕这件事情的议论和反思,显然还会继续下去。 /p p   人们很容易由此联想到此前日本女科学家小保方晴子的学术造假事件。但这两起事件的最大不同在于,小保方晴子论文中的关键实验结果图曾被人为修改,而目前无人指出韩春雨论文的图片存在“PS”痕迹。 /p p   这是性质上的根本不同,但也让韩春雨实验结果不可重现的真实原因更加扑朔迷离。 /p p   一个令人扫兴的事实是,科研成果难以重复的现象,在学术圈并非鲜见。2012年,世界最大的制药公司之一安进公司的研究人员宣称,他们试着重复癌症研究领域53篇“里程碑式进展”论文的研究结果,有47篇的结果无法再现。特别在生物学领域,由于生命活动本身的复杂性,影响实验结果的主客观因素更是多如牛毛,难以全部避免。 /p p   然而,可重复性终究是科研活动的生命。科学家毕生的工作,就是为某一个领域某一个具体问题,找到一个普适性的答案,揭示具有普遍意义的客观真理。不可重复的结果,就是不能走出“娘家”实验室,不能兑现价值的成果。 /p p   韩春雨这篇论文的撤稿,固然是“发表后同行审议的胜利”,但这场胜利,是有一定偶然性的。首先这是一项应用性很强的研究,如果成果靠谱,将给众多科研工作者带来一个空前好用的基因编辑工具,技术的革新甚至有可能带动整个学科的迅猛发展。正因如此,这篇论文甫一发表,就引起了来自国内外同行的高度关注。 /p p   其次,有科研人员指出,该论文中涉及的实验并不复杂,在材料和实验条件都具备的情况下,一周内就能完成一次全操作。这也引来国内外众多实验室纷纷加入重复验证的大军。当然,金钱、头衔、荣誉,以及铺天盖地的宣传报道,也都在为这场“真伪之争”推波助澜。 /p p   然而,在烈火烹油的“韩春雨事件”背后,又有多少不可重复的论文安然躺在期刊中,被学习、被引用、被作为下游研究的起点和依据? /p p   导致学术论文不能被重复的高危因素很多。一些高校和机构中常见的工作模式是,学术带头人只负责提供指导和把握方向,并不亲自着手实验操作。大量科技论文虽然挂着知名科学家的名头,但主要还是课题组里博士甚至硕士研究生的工作。如果部分研究生存在客观上的经验能力不足,甚至主观上的投机取巧,就会给论文的真实正确性埋下隐患。 /p p   其次,数据造假也可以以一种非常隐晦的方式进行。例如进行大量重复样本实验,然后在其中挑取“合意”的数据。对于那些样本制备过程复杂、实验周期较长的研究,由于很少有人去重复全过程的实验,因此更难被发现。 /p p   此外,不易察觉的仪器故障、样品污染、试剂质量问题,甚至更加隐蔽的实验区域气溶胶污染……都在论文中埋下了一颗颗不定时炸弹。遗憾的是,重复实验没有经费支持,又大多不能形成新的论文,很少有人愿意承担“雷锋”的角色,去费时、费力、费钱地做这种扫雷工作。 /p p   随着政府、社会对科研成果和科技工作者重视程度的提高,越来越多科学家凭借优异的工作获得了不同程度的奖励,各领域的“天价论文”也陆续出现。人们在乐见其成之余,是不是也应该反思,如何在科研体系内,尽可能减少学术论文有意造假和无意出错的高危因素,让不可重复的隐患论文越来越少,让实至名归的成果越来越多。 /p
  • 多功能单细胞显微操作技术在病毒研究中的应用 ——在单病毒粒子--单细胞水平上研究病毒的感染
    病毒的感染研究通常是在大量细胞实验中进行的,一般要将许多培养细胞同时暴露于病毒中,这就使得研究单个病毒侵入事件和研究病毒在单个细胞之间的感染传播十分困难。多功能单细胞显微操作FluidFM技术通过温和的、微通道和力反馈控制的探针,将单个病毒粒子突破性的沉积在选定的单个细胞上,从而实现前所未有的控制,在单个病毒粒子--单个细胞水平上研究病毒感染。FluidFM技术可以帮助阐明关于毒性、病毒复制或宿主免疫应答的基本问题,从而促进新型抗病毒药物和疫苗的开发。放置单个病毒粒子单个病毒粒子可以被放置在您选择的细胞上的确切位置注入单个病毒粒子直接将单个病毒粒子注入特定细胞的细胞质或细胞核中测量生物量的变化测量细胞硬度的变化和单细胞力谱对感染细胞进行分离、提取和分析分离被感染的细胞,或进行单细胞活细胞提取,进而进行测序、质谱等分析观察和监测通过集成的成像系统和追踪软件对细胞进行长时间连续监测 FluidFM技术如何提升您的病毒学实验? 1. 在病毒感染方面获得全新的视角FluidFM技术为病毒学研究引入了新的实验可能性,允许在贴壁细胞培养中控制病毒粒子与您所选择的细胞进行的相互作用。这为我们提供了全新的视角:细胞进入和感染机制方面;细胞反应、病毒协同性和病毒生命周期阶段;增殖,扩散率和细胞间感染方面FluidFM操作病毒的工作原理 2. 量化宿主防御和病毒协同性通过在细胞上放置一定数量的病毒粒子,宿主细胞对病毒的防御就可以被量化。因此,可以研究感染概率、宿主防御的局限性以及病毒粒子之间的合作关系。1个病毒粒子通过FluidFM微管的空心悬臂准备放置。图片由苏黎世联邦理工学院P. Stiefel提供。4个病毒粒子沉积在一个选定的单细胞上。图片由苏黎世联邦理工学院P. Stiefel提供。 3. 监测病毒在细胞间传播FluidFM技术一体机集成了CO2和温度控制的活细胞模块,同时也集成了成像模块。这保证了受感染细胞的细胞培养环境,并与软件支持的自动追踪功能一起,允许长时间观察受感染或操纵受感染细胞。这使得我们可以详细了解病毒感染是如何从宿主细胞传播到邻近细胞乃至传播到其他培养细胞的。 4. 将单个受感染细胞导入正常培养基,或将单个正常细胞导入处理培养基轻柔地从贴壁或悬浮培养中取出单个细胞,以高的精度定位地将其放入另一个孔板中,这样的操作可以充分保证细胞的活力。使得将单个感染细胞引入健康培养基后的进一步研究成为可能。同样的方法也可以用于将健康细胞、耐药细胞或药物处理后的细胞放置于受感染的培养基中。分离单个细胞 5. 单细胞活细胞的提取,以便进一步分析FluidFM技术可以根据形态学或荧光标记从培养物中分离出单个细胞。在保持完全存活的情况下,这些感兴趣的细胞可以在新的培养皿中扩增,或进行进一步的蛋白质组学或转录组学分析。甚至可以进行单细胞活细胞检测,如Live-Seq、TOF等。 6. 从感染的单细胞中获得单细胞力谱FluidFM探针集成了力学反馈功能,允许定量的机械相互作用,可达pN别的力学分辨率。测量由单个细胞感染引起的生物物理变化,如硬度的变化,粘附力的变化,甚至质量的变化。因此,FluidFM可以将病毒在宿主细胞上引起的形态变化与机械变化联系起来。单个细胞从完全贴壁、融合的培养状态中被拽离出来,并记录单细胞力谱。视频由德国Würzburg大学医药与牙医科学院A. Sancho和J. Groll提供参考文献:[1]. Koehler, M., Petitjean, S.J.L., Yang, J., Aravamudhan, P., Somoulay, X., Lo Giudice, C., Poncin, M.A., Dumitru, A.C., Dermody, T.S. & Alsteens, D. Reovirus directly enganges integrin to recruit clathrin for entry into host cells. (2021) Nature communications, 12, 2149.[2]. J. Yang, J. Park, M. Koehler, J. Simpson, D. Luque, J.M. Rodriguez & D. Alsteens. Rotavirus Binding to Cell Surface Receptors Directly recruiting a-integrin. (2021). Advanced Nanobiomed Research.[3]. Guillaume-Gentil, O., Rey, T., Kiefer, P., Ibáñez, A. J., Steinhoff, R., Brönnimann, R., Dorwling-Carter, L., Zambelli, T., Zenobi, R., & Vorholt, J. A. (2017). Single-Cell Mass Spectrometry of Metabolites Extracted from Live Cells by Fluidic Force Microscopy. Analytical Chemistry, acs.analchem.7b00367.[4]. Guillaume-Gentil, O., Grindberg, R. V., Kooger, R., DorwlingCarter, L., Martinez, V., Ossola, D., Pilhofer, M., Zambelli, T., & Vorholt, J. A. (2016). Tunable Single-Cell Extraction for Molecular Analyses. Cell, 166(2), 506–516.[5]. Guillaume-Gentil, O., Zambelli, T., & Vorholt, J. A. (2014). Isolation of single mammalian cells from adherent cultures by fluidic force microscopy. Lab on a Chip, 14(2), 402–414.[6]. Guillaume-Gentil, O., Potthoff, E., Ossola, D., Dörig, P., Zambelli, T., & Vorholt, J. A. (2013). Force-controlled fluidic injection into single cell nuclei. Small, 9(11), 1904–1907.[7]. P. Stiefel, F.I. Schmidt, P. Dörig, P. Behr, T. Zambelli, J. A. Vorholt, and J. Mercer. Cooperative Vaccinia Infection Demonstrated at the Single-Cell Level Using FluidFM. Nano Letters, 2012.
  • 新代谢的新冠病毒测试:质谱和机器学习
    巴西的科学家基于质谱和机器学习开发了一种针对新冠病毒的新诊断测试,该测试可测量参与甘油磷脂途径的代谢产物的丰度。它可以在数分钟内给出结果,还可以预测患者患该疾病的风险低还是高。新冠病毒测试自从新冠病毒大流行开始以来,医药界迅速制定了许多诊断测试方法,以便可以检测到病毒并将其控制。它们一般基于抗原检测,抗体检测和RNA扩增,并提供了对比程度的敏感性和特异性。现在,巴西的一大批科学家开发了一种新的测试方法,该测试方法采用了另一种方法,以寻找被新冠病毒感染扰乱的代谢物。它受到机器学习的支持,该机器学习用于识别和建模潜在的生物标记。该测试是在3组患者中使用合并血浆开发而成的,包括442名确诊的新冠病毒患者,23名未确诊的可疑病例和350名对照。用甲醇简单预处理并离心后,将血浆上清液用酸化的甲醇稀释,然后直接注入高分辨率质谱仪中。以正离子模式在140,000 FWHM的高分辨率下运行,无需进行初始色谱分离即可加快整个分析过程。使用离子m / z值,强度,宽度和分辨率对质谱数据进行预处理,并进行对齐,归一化和去噪。使用机器学习算法(例如自适应树增强,梯度树增强,随机森林,极端随机森林,偏最小二乘和支持向量机)确定了最有区别的特征。使用累积分布函数分析评估了代谢物作为潜在生物标志物的重要性,该分析将阳性新冠病毒血浆的值与对照组的值进行了比较,并确定了它们对疾病的正向或负向影响。进行了两轮培训和验证。新冠病毒区分代谢物该过程共鉴定出26个判别离子。在这些模型中,有7个无法确定,但是其余的19个模型被采用,其中8个对疾病有积极贡献,而第十一个则有负面贡献。将离子用于成对模型中的训练和验证,该模型利用成对的生物标志物强度之间的关系,而不是相对丰度。这种方法用于“尽管输入数据有所变化,但仍为模型增加了稳健性”。经过方法培训和验证后,这些离子用于新冠病毒的盲法测试中,特异性为96%,灵敏度为83.1%。这些数字至少与当前的血清学和PCR方法一样好。这些特殊的代谢物的使用得到了支持,因为许多是参与甘油磷脂代谢的脂质。它们包括七种甘油磷脂,三种固醇脂质,三种甘油脂,两种脂肪酸,一种鞘氨醇,一种嘌呤代谢产物和两种未知肽。在新冠病毒感染期间,它们各自的上升或下降反映了在其他情况下的行为,例如败血症和急性呼吸应激综合症。这些生物标记物还能够将住院十天以上,机械通气或死亡的高危患者与中度或轻度症状的低危患者区分开。他们还可以区分低风险患者和没有症状的患者。研究小组得出结论,他们的方法“在一个解决方案中,汇总了人口新冠病毒筛查的另一种选择,并通过风险分类为公共卫生工作提供了指导”。(编译:符斌 北京中实国金国际实验室能力验证研究中心研究员)根据Covid-19 Automated Diagnosis and Risk Assessment through Metabolomics and Machine Learning编写Published: Jan 20, 2021Author: Jeany Delafiori
  • 重磅!首个国产抗新冠病毒特效药获批准上市 !
    据清华大学官方消息,12 月 8 日,由清华大学医学院、清华大学全球健康与传染病研究中心与艾滋病综合研究中心主任张林琦教授领衔研发的新冠单克隆中和抗体安巴韦单抗(BRII-196) / 罗米司韦单抗(BRII-198)联合疗法,获得中国药品监督管理局的应急批准上市。这两款药由腾盛华创公司制造。这是我国首家获批的自主知识产权新冠病毒中和抗体联合治疗药物。这一疗法用于治疗新型冠状病毒(SARS-CoV-2)检测结果为阳性,同时伴有进展为重型 COVID-19 危险因素的成人和青少年(≥12 岁,体重≥40 kg)患者。本次获批,意味着中国拥有了首个全自主研发并经过严格随机、双盲、安慰剂对照研究,证明有效的新冠病毒特效药。这一疗法由张林琦教授的团队经过 600 多天研发。临床试验结果显示,该疗法将新冠重症和死亡率降低了 80%。这种药不仅可以抗病毒,而且持久性很强,可以预防新冠病毒感染。根据财经网消息,可靠消息人士透露,安巴韦单抗注射液(BRII-196)及罗米司韦单抗注射液(BRII-198),每剂价格约为 8000 元人民币,而美国的同类抗体平均每剂价格为 2000 美元(约 12700 元人民币)。张林琦教授表示:“安巴韦单抗/罗米司韦单抗联合疗法的获批,为中国带来了首个新冠治疗特效药。这一联合疗法在国际多中心试验中展现了优异的安全性和保护性,是至今为止在全世界范围内唯一开展了变异株感染者治疗效果评估并获得最优数据的抗体药物。该抗体联合疗法为我国抗击新冠疫情提供了世界一流的治疗手段,充分展示了清华大学在抗击传染病领域的深厚积淀与技术储备,以及召之即来、来之能战、战之能胜的担当与能力,为我国乃至全球疫情防控工作作出了重要贡献。我们非常荣幸与深圳市第三人民医院及腾盛博药在基础、临床和转化研究等方面的高质量合作,取得这一具有里程碑意义的优异成绩,下一步将继续研究单抗联合疗法在高危和免疫缺陷等人群中的预防作用。”公开信息显示,腾盛华创是港股上市公司腾盛博药旗下子公司。2020年3月31日,腾盛博药与清华大学、深圳市第三人民医院达成合作,宣布共同推进针对新冠病毒的全人源单克隆中和抗体的研究、转化、生产和商业化,之后三方成立合资公司腾盛华创,以共同开发BRII-196和BRII-198新冠中和抗体。今年11月底,公开消息显示,BRII-196和BRII-198新冠中和抗体有望12月底前获批国内附条件批准上市。
  • 核酸质谱之漫话三:核酸质谱法在人乳头瘤病毒(HPV)分型检测中的应用
    导读在女性恶性肿瘤中,宫颈癌的发病率仅次于乳腺癌,而大多数宫颈癌是由人乳头瘤病毒(HPV)感染所致。目前已分离出的HPV达100多型,其中至少14型可导致宫颈癌或其他恶性肿瘤。全球范围内,大多数的宫颈癌中可测出高危型HPVl6和18亚型,其中HPV16亚型诱发癌变的潜力最大。东西分析基于飞行时间质谱技术平台成功开发出40多种HPV分型的应用方案,为临床提供早期宫颈癌的精准诊断,并为治疗提供准确的参考建议。人乳头瘤病毒(HPV),是一种乳头瘤空泡病毒,女性患病率通常高于男性。部分类型的HPV感染是宫颈癌的高危因素。感染后主要累及人体的皮肤和黏膜,可分为低危型和高危型。高危致癌型HPV分布于α属第5,6,7,9,11五个种。高危型HPV感染是宫颈癌、口腔癌、直肠癌、食道癌等恶性疾病的危险因素之一。而在在女性恶性肿瘤中,宫颈癌的发病率仅次于乳腺癌,大多数宫颈癌是由HPV感染所致。已分离出的HPV达100多型,其中至少14型可导致宫颈癌或其他恶性肿瘤。全球范围内,大多数的宫颈癌中可测出高危型HPVl6和18亚型,其中HPV16亚型诱发癌变的潜力最大。HPV基因分型检测的意义HPV的感染在治疗前后,可能存在型别的差异,这可以作为医生治疗效果的评估指标;连续两次HPV分型检测显示单一型别的高危亚型的感染,显示宫颈癌发生的可能性增大;HPV的感染在不同的地区,占主要地位的型别有所不同,分型检测有利对于各地研究、使用疫苗进行HPV感染的预防控制。因此,HPV基因分型检测能够:确认感染危险程度 极高危型HPV16型感染会在几年内发展为宫颈上皮内瘤变三级(CIN3)+至浸润性癌,而非致癌型HPV61的感染,持续很长时间也不会发展为癌。确认是否持续感染高危型持续感染是导致宫颈癌的最主要因素。大多数HPV感染在1-2年内可清除,当间隔一年以上、连续两次以上检测出同一种或组HPV基因型时,被认为是持续性感染。若第一次HPV检测结果阳性,很难确定感染的时间。从感染HPV到发生宫颈癌最少需要8-10年的潜伏时间,连续检测可以有效避免错过治疗纠正的机会。识别传染源人所感染的HPV与感染源的基因型相同。可以使用安全措施及共同治疗和检测进行,有助于持续性感染纠正。疫苗接种指导 只要没有感染疫苗覆盖的类型,接种都是有益的。目前HPV 技术检测面临的问题L1靶标基因整合后脱落漏检现有的技术平台,几乎所有的HPV检测产品均以L1为靶点。无法避免病毒进入细胞后从游离态变为整合态,L1基因脱落,导致恶变样本漏检。动态范围窄,高危低载量出现漏检以目测法和荧光法定性的检测,动态范围窄。当多基因型混合感染时,无法检出高危低载量HPV病毒,导致高危致癌型漏检。致癌高中危型未全覆盖,造成漏检目前试剂盒无法同时检测IARC在2012年提出的2B类以上27个致癌HPV基因型,从而导致中危致癌型漏检。应用核酸质谱技术进行人乳头瘤病毒(HPV)分型检测的优势对高危型采用致癌基因E6,极高危HPV 16/18型采用E6/L1双基因,从而避免病毒基因整合造成的假阴性,能够最大限度避免出现漏检;高灵敏度:可扫描超过40种HPV基因型。特异性PCR扩增+探针单碱基标记,以分子量分型,灵敏度达个位拷贝,超宽动态范围超过9个数量级。能够防交叉反应以及防扩增污染,从而有效避免假阳性。高通量:每天可检测上千个样本。东西分析经过多年的开发,基于飞行时间质谱技术平台成功开发出40多种HPV分型的应用方案---能够同时快速检测出超过20种高危和低危致癌及常见致疣HPV型以及超过20种可能致癌和低危致疣HPV型。能够有效避免恶变样本漏检和假阳性,从而为临床提供早期宫颈癌的精准诊断,并为治疗提供准确的参考建议。Ebio Reader 3700 Plus飞行时间质谱仪操作简单无需复杂的样品前处理。性能稳定长寿命固体激光器;飞行管随环境温度、湿度的变化小,保证检测的稳定 ;高效网筛离子源,提高仪器的灵敏度 ;PIE高压脉冲电源控制,实现离子的延迟推斥,提高整体仪器的分辨能力。软件智能基于神经网络聚合分类法的人工智能软件;拥有强大数据库,实现对菌种的实时鉴定;具备聚类分析功能,可进行T-test等数据分析;具有自建库功能,可根据用户实际情况建立自有菌种库 ;可根据用户具体需求,进行相应升级,用于疾病蛋白标志物和核酸基因分型的检测。应用范围广广泛用于临床、疾控、食品安全、农业、工业、出入境检疫等领域。往期回顾BREAK AWAY核酸质谱之漫话一:什么是核酸质谱核酸质谱之漫话二: 核酸质谱法鉴定结核病及其耐药性
  • 合肥市首家区级艾滋病HIV病毒初筛实验室成立
    合肥市首家区级艾滋病HIV病毒初筛实验室近日在蜀山区落户。21日,记者从蜀山区疾控中心了解到,蜀山区作为合肥市首家承担中央与省共建“全国艾滋病综合防治示范区”项目的市级行政区,为做好艾滋病防治工作,该区疾控中心在全市建立了第一家区级艾滋病HIV病毒初筛实验室。   据了解,该区疾控中心在HIV筛查实验室内安装了室内温控系统、洗眼装置,配备了-20℃低温冰箱、酶标仪等设备和足量的安全防护品。   与此同时,制定了生物安全应急处理预案 规范了质量控制标准,定期校准酶标仪、移液器等,确保各种检测设备准确运作。   为保证筛查质量,实验室专门配备了一名生物系专业毕业的研究生和三名专职检验技师,他们经过专项培训和实际操作演练与考核均取得了上岗资格。   目前,该实验室已顺利通过了省级专家组盲样考核和现场评审。   该区艾滋病筛查实验室的建立,对HIV感染者及哨点监测,尤其是高危人群的血清学监测网络体系提供了有力的保障,今后蜀山区范围内的高危人群可就近在家门口查HIV抗体。
  • 厦大牵头研发的鼻喷流感病毒载体新冠肺炎疫苗获批紧急使用!
    12月2日,经国家卫生健康委提出建议,国家药品监督管理局组织论证同意,由厦门大学、香港大学、万泰生物联合研发的鼻喷流感病毒载体新冠肺炎疫苗(以下简称“鼻喷苗”)获批紧急使用!该疫苗是我国布局新冠疫苗应急攻关的五条技术路线之一,也是全球最早进入临床试验以及迄今唯一在三期临床试验中验证了安全性和广谱有效性的黏膜免疫新冠疫苗。鼻喷苗采用经特别改造以提高安全性和有效性的双重减毒甲型流感病毒作为载体,插入新冠病毒刺突蛋白RBD基因片段研制而成。流感病毒具有与新冠病毒(尤其是奥密克戎变异株)高度重叠的从鼻腔开始的全呼吸道易感细胞解剖分布特点,因此该疫苗通过鼻腔喷雾方式接种可以模拟病毒自然感染方式在呼吸道形成预防新冠病毒入侵的第一线免疫屏障,且与肌肉注射式新冠疫苗诱导全身性保护的机制彼此互补,有利于形成更全面的保护。研究显示鼻喷苗可诱导包括细胞免疫、体液免疫、固有免疫和训练免疫等多维度保护性免疫应答从而发挥广谱保护效果,因此基本不受病毒抗体逃逸突变的影响,对原型株或是包括奥密克戎BF.7、XBB、BQ.1.1变异株在内的迄今各主要变异株的保护性免疫应答强度相当。鼻喷苗三期临床试验是全球第一个黏膜免疫新冠疫苗的随机对照保护效力试验,在菲律宾、南非、越南和哥伦比亚等国入组了31038名18-91岁志愿者。临床试验数据显示,无论作为基础免疫还是序贯加强免疫,鼻喷苗对奥密克戎变异株感染导致的新冠病毒病(COVID-19)具有良好保护效果:(1)对住院及以上严重疾病的保护效力为100%;(2)在既往无其它新冠疫苗免疫史人群中,对症状较明显病例(具有3个及以上新冠相关症状)的保护效力为67%;对包括仅有轻微症状者在内的所有症状性感染的保护效力为55%;(3)在既往有新冠灭活疫苗免疫史的人群中,序贯加强鼻喷苗与用安慰剂加强相比,对症状较明显病例的相对保护效力为63%。此外,鼻喷苗安全性极佳,疫苗组和安慰剂组不良反应发生率相同且症状轻微,未发生疫苗相关严重不良事件。基于老年人和有基础慢病等脆弱人群是疫苗应用的最优先群体的考虑,该研究特别提高了志愿者中的老年人和有基础慢病人群的比例,共包含了4557名60岁以上老年人、4441名慢病患者(高血压、糖尿病、呼吸道疾病等),结果显示鼻喷苗对老年人、慢病人群的保护效力不弱于中青年健康人群,在各个群体中均表现出很好的安全性,疫苗组的不良反应情况与安慰剂对照组相当。鼻喷苗有效性好、广谱抗变异、安全性高、便捷无痛、接受度高,并且在老年人群、慢病人群中同样有极佳安全性和有效性,接种禁忌症少,可为我国高危群体疫苗犹豫难题的破解提供有力武器。鼻喷苗优先用于老年/慢病等高危人群的序贯加强以及疫苗犹豫人群的免疫,可显著降低我国高危人群的重症及死亡风险,避免医疗资源挤兑的大规模发生,为今后我国全面开放提供更全面保障。鼻喷苗的研发工作由夏宁邵教授牵头,获得了国家重点研发计划应急攻关项目、国家自然科学基金专项项目、教育部疫苗与分子诊断集成攻关大平台项目、教育部高校新冠肺炎防治科技攻关重点项目、福建省科技重大专项应急攻关项目、福建省自然科学基金杰青/重点项目、厦门市科技计划专项应急攻关项目、厦门大学“双一流”学科建设项目等支持。
  • 一文了解|登上热搜的“诺如病毒”
    日前,“诺如病毒”登上热搜。国内多地疾控部门发布紧急提醒,诺如病毒引起的急性感染腹泻已经进入发病高峰期,常在学校、托幼机构、医院等处引起集体暴发,疾控呼吁大家加强重视,做好防控。关于诺如病毒是什么、传播方式以及检测方法等核心问题,小编特地汇总整理了已有的公开信息,以飨读者。什么是诺如病毒?诺如病毒(Norovirus,NV)属于杯状病毒科的单链正股RNA病毒,是引起急性胃肠炎常见的病原体之一。诺如病毒具有感染剂量低、排毒时间长、外环境抵抗力强等特点,容易在学校、托幼机构等相对封闭环境引起胃肠炎暴发。诺如病毒为RNA病毒,极容易发生变异,每隔几年就有新的变异株出现,引起全球或区域性暴发流行。所有年龄段的人群对诺如病毒普遍易感,儿童、老年人及免疫缺陷者属高危人群。图源网络诺如病毒的传播途径如何?病例和隐性感染者为诺如病毒感染的传染源。传播途径多样,主要通过摄入被粪便或呕吐物污染的食物或水、接触患者粪便或呕吐物、吸入呕吐时产生的气溶胶、以及间接接触被粪便或呕吐物污染的物品和环境等感染。感染后有哪些主要症状?诺如病毒感染潜伏期为12-72小时,通常为24-48小时。常见症状主要为恶心、呕吐、发热、腹痛和腹泻,部分患者有头痛、畏寒和肌肉酸痛等。儿童以呕吐为主,成人则腹泻居多,粪便为稀水便或水样便。诺如病毒如何检测?食品安全国家标准GB4789.42-2016中规定,食品中诺如病毒检测主要采用实时荧光RT-PCR检测方法。参考资料:中国疾控中心、食品安全国家标准GB4789.42-2016附件:GB 4789.42-2016 食品安全国家标准 食品微生物学检验 诺如病毒检验.pdf
  • 研究发现病毒通过微塑料“搭便车”在淡水中生存
    研究人员发现,危险的病毒可以通过在微塑料上“搭便车”而在淡水中保持长达三天的传染性。导致腹泻和胃部不适的肠道病毒,如轮状病毒,被发现通过附着在微塑料(长度小于5毫米的微小颗粒)上在水中生存。斯特灵大学的研究人员发现,它们仍然具有传染性,构成了潜在的健康风险。该项目的首席研究员,来自斯特灵大学Richard Quilliam教授说:“我们发现,病毒可以附着在微塑料上,这使它们可以在水中生存三天,甚至更长的时间。”该研究结果是自然环境研究委员会资助的185万英镑项目的一部分,该项目研究塑料如何运输细菌和病毒,结论是微塑料使病原体在环境中转移。这篇论文发表在《环境污染》杂志上。研究人员测试了两种类型的病毒:周围有包膜的病毒,“一种有脂质外壳”,如流感病毒;一种没有包膜的病毒--肠道病毒,如轮状病毒和诺瓦克病毒。研究发现,在那些有包膜的病毒中,包膜迅速溶解,病毒死亡,而那些没有包膜的病毒则成功地与微塑料结合并存活。
  • 基于代谢组学技术的病毒传染性疾病研究
    p style=" text-indent: 2em line-height: 1.75em " strong span style=" text-align: justify text-indent: 2em font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " 仪器信息网讯 /span /strong span style=" text-align: justify text-indent: 2em font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " & nbsp 代谢组学是继基因组学、转录组学及蛋白质组学之后发展起来的一门新兴组学,是整合包括色谱联用质谱和核磁共振等现代分析技术、生物化学以及生物信息学等学科的一门交叉学科技术,用于研究生命活动链条下游的代谢物内稳态情况。& nbsp /span /p p style=" text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" color: rgb(192, 0, 0) " strong span style=" text-align: justify text-indent: 2em font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " 代谢组学概念及常用技术 /span /strong /span /p p style=" text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai text-align: justify text-indent: 2em " 代谢组学是系统地对代谢物及其水平变化进行快速识别分析,其中代谢物是基因表达的最终产物,且代谢物的水平是由代谢途径中所有酶的活性及作用于这些酶的效应物所决定的,因此代谢组学所涉及的代谢物变化与机体的生理、病理、发育状态直接相关。 /span /p p style=" text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai text-align: justify text-indent: 2em " /span /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 436px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/12f47ba2-459a-4d53-9b14-2155144401a4.jpg" title=" 截屏2020-04-03下午6.13.20.png" alt=" 截屏2020-04-03下午6.13.20.png" width=" 600" height=" 436" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-indent: 2em line-height: 1.75em text-align: center " 代谢组学研究方法 br/ /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " 代谢组学主要的两种分析技术,其一是核磁共振,另一种是质谱技术。与质谱技术相比,核磁共振确实具有一些明显的特色,如分析样品只需要简单甚至无需前处理、成本低、快速、重复性好等,但在灵敏度和代谢物识别的覆盖范围上不如质谱,因此限制了其应用, /span span style=" text-indent: 2em font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " 目前研究使用最多的代谢组学技术依然是质谱技术。 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" text-indent: 2em font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " 质谱分析技术为代谢物提供了高专一性的、与化学结构直接相关的分子质量或特征碎片离子等质谱信息,这些信息可通过与数据库中的标准图谱进行化学结构匹配来确定代谢物,或用于位置代谢物结构的推导。 /span span style=" text-indent: 2em font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " 质谱技术与色谱分离技术的联用可实现复杂样品的代谢组学分析,从本质上提高了以质谱技术为基础的代谢组学的研究能力和范围。 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai text-indent: 2em " 此外,代谢组学包括靶向代谢组学和非靶向代谢组学,前者是针对特定的代谢通路所涉及的代谢物进行定性和定量研究;相比较前者,后者采用高端分析技术进行代谢物全谱(理论上)轮廓差异分析、发现特异性代谢物并进行结构表征和代谢通路分析。在非靶向代谢组学研究中,由于代谢物的种类多、物化性质和浓度差异大,因此需要通过多种技术的整合,才能够比较全面和准确地实现代谢调控所涉及的差异性代谢物识别和定量分析的全谱覆盖。 /span br/ /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai text-indent: 2em " 结合当前疫情,我们来关注下代谢组学技术在病毒感染及病毒宿主间的相互作用机制研究,下文将介绍一些基于代谢组学技术的病毒传染性疾病的相关研究应用。 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" color: rgb(192, 0, 0) " strong span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " 基于代谢组学技术的病毒传染性疾病研究中的应用案例 /span /strong /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " strong span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " 案例1:中东综合征(Middle East Respiratory Syndrome,MERS)研究中的多组学技术 /span /strong /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " MERS是由冠状病毒(MERS-CoV)感染引起的一种呼吸道传染性疾病,主要表现为非典型肺炎和急性呼吸综合征,重症病例可发展为急性肾衰竭而导致死亡。 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai text-indent: 2em " 2016年,Nakayasu等开发了MPLEx(metabolite, protein, and lipid extraction)样本制备法,该方法简单快速且适用于多组学的研究。基于该方法,研究者以侵染MERS-Cor的肺泡上皮细胞Calu-3为研究对象,通过蛋白组学、代谢组学和脂质组学研究,发现病毒感染过程中糖酵解/糖异生变化,以及脂肪酸、磷脂酰胆碱和神经酰胺等变化,为MERS-CorV感染人体机制的研究提供有力的数据支撑。 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai text-indent: 2em " /span /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 300px height: 317px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/960a0f6a-4e07-439d-88b9-6a94ceff4364.jpg" title=" 截屏2020-04-03下午5.42.04.png" alt=" 截屏2020-04-03下午5.42.04.png" width=" 300" height=" 317" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai text-indent: 2em " /span /p p style=" text-align: center text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " /span /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 300px height: 275px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/f9bd73e2-dba3-41b2-8a4a-17b6d84d9ed4.jpg" title=" 截屏2020-04-03下午5.43.10.png" alt=" 截屏2020-04-03下午5.43.10.png" width=" 300" height=" 275" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " & nbsp /span span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai text-align: justify text-indent: 2em " 多组学代谢网路图 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " strong span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " 案例2: 埃博拉(Ebola hemorrhagic fever, EBHF)病毒研究中的多组学技术 /span /strong /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " & nbsp /span span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai text-indent: 2em " EBHF是由埃博拉病毒感染导致的急性出血性、动物源性传染病,1976年在非洲的苏丹和扎伊尔首次暴发,主要通过病人的血液、唾液、汗水和分泌物等途径传播。 /span span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai text-indent: 2em " 2017年,西北太平洋国家实验室及东京大学等的研究人员对来自感染埃博拉病毒患者的单核细胞和血浆,基于转录组学、蛋白质组学、代谢组学及脂质组学平台,发现血浆游离氨基酸、葡萄糖、果糖、二酰基甘油磷酸甘油、单酰基甘油磷酸丝氨酸、神经酰胺、可溶性VSIG4、骨髓细胞趋化因子受体等的变化,并由此推断肠组织损伤、T细胞激活受损、炎症、胰腺组织损伤和胰酶释放等可能在EVD发病机制中的作用,研究结果有助于改善高危患者的预后。 /span /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 597px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/920116f3-8e24-4d61-a902-a68df7319791.jpg" title=" 图片 2.png" alt=" 图片 2.png" width=" 600" height=" 597" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " 总体流程图 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " & nbsp strong 案例3: 水痘-带状疱疹病毒(Varicella zoster virus, VZV)研究中的代谢组学技术 /strong /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " 水痘是由水痘-带状疱疹病毒(Varicella zoster virus, VZV)初次感染引起的急性传染病,主要发生在婴幼儿和学龄前儿童,相比儿童,成人发病症状更为严重。 /span span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai text-indent: 2em " 2018年,Kuhn M等基于靶向代谢组学研究平台,对水痘不同亚型患者及对照样本的脑脊液样本进行研究,发现与VZV相关的4个代谢物,进一步的分析表明与VZV相关的代谢物增加可能与神经炎症/免疫激活、神经信号和细胞压力等相关。 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " /span /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 714px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/9a1768c5-247e-463d-baa5-4e7720355852.jpg" title=" 截屏2020-04-03下午5.44.43.png" alt=" 截屏2020-04-03下午5.44.43.png" width=" 600" height=" 714" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " & nbsp /span span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai text-align: center text-indent: 2em " 差异代谢物结果展示 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " & nbsp strong 案例4: 拉沙病毒研究中的代谢组学技术 /strong /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " 拉沙热(Lassa fever, LASV)是一种急性、传染性强烈的国际性传染病,是由拉沙病毒引起,于1969年在尼日利亚东北地区的拉沙镇发现。绝大多数的人类感染表现为轻症或无症状,其他表现为严重多系统疾病;主要通过直接接触拉沙热患者的血液、尿、粪便或其它身体分泌物进行传播,还可在人之间传播。 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai text-indent: 2em " Gale TV等收集拉沙热患者血清进行非靶向代谢组学研究,发现LASV感染对血液凝集、脂质、氨基酸和核苷酸代谢通路产生较大影响;同时,作者也发现PAF及其类似物等可能作为潜在的生物标志物。 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai text-indent: 2em " /span /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/b1d086f4-f673-4c62-855c-829a6f787b28.jpg" title=" 截屏2020-04-03下午5.45.49.png" alt=" 截屏2020-04-03下午5.45.49.png" / /p p style=" text-align: center text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai text-indent: 2em text-align: center " 拉沙热潜在生物标志物 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " & nbsp strong 案例5: SARS病毒研究中的多组学技术 /strong /span span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai text-indent: 2em " & nbsp /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " SARS(重症急性呼吸综合征)为一种由SARS冠状病毒(SARS-CoV)引起的急性呼吸道传染病,WHO将其命名为重症急性呼吸综合征,2002年出现在中国广东省。 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " Wu Qi等收集感染SARS康复患者12年后的血清样本与健康样本进行常规代谢组学(GC-MS/LC-MS)和脂质组学分析,发现磷脂酰肌醇和溶血磷脂酰肌醇在康复患者体内升高,可能与使用高剂量的甲基强的松龙有关。 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " /span /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 897px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/7ad3415c-fe4c-4f86-abcf-5be68dc6b551.jpg" title=" 截屏2020-04-03下午5.46.56.png" alt=" 截屏2020-04-03下午5.46.56.png" width=" 600" height=" 897" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " & nbsp /span span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai text-indent: 2em " 肌醇含量分布 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " & nbsp /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " strong span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " 参考文献 /span /strong /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " Nakayasu ES, et al. MPLEx: a Robust and Universal Protocol for Single-Sample Integrative Proteomic, Metabolomic, and Lipidomic Analyses. mSystems. 2016 May 10 1(3). /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " Eisfeld AJ, et al. Multi-platform & #39 Omics Analysis of Human Ebola Virus Disease Pathogenesis. Cell Host Microbe. 2017 Dec 13. /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " Kuhn M, et al. Mass-spectrometric profiling of cerebrospinal fluid reveals metabolite biomarkers for CNS involvement in varicella zoster virus reactivation. J Neuroinflammation. 2018 Jan 17 15(1):20. /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " Gale TV, et al. Metabolomics analyses identify platelet activating factors and heme breakdown products as Lassa fever biomarkers. PLoS Negl Trop Dis. 2017 Sep 18 11(9):e0005943. /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " Wu Q, et al. Altered Lipid Metabolism in Recovered SARS Patients Twelve Years after Infection. Sci Rep. 2017 Aug 22 7(1):9110.& nbsp & nbsp /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " br/ /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai font-size: 16px " & nbsp /span /p p br/ /p
  • 人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测及相关试剂盒2项团体标准发布
    近日,浙江省分析测试协会发布T/ZJATA 0005—2021《人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测 杂交捕获-化学发光法》、T/ZJATA 0006—2021《人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测试剂盒(杂交捕获-化学发光法)》团体标准。该2项团体标准将于2022年1月20日实施。T/ZJATA 0005—2021《人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测 杂交捕获-化学发光法》标准详细信息标准状态现行标准编号T/ZJATA 0005—2021中文标题人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测 杂交捕获-化学发光法英文标题Detection of human papillomavirus(HPV)nucleic acid - Hybrid capture - CLIA国际标准分类号11.100中国标准分类号C 44国民经济分类Q849 其他卫生活动发布日期2021年12月20日实施日期2022年01月20日起草人韩斌、寿莹佳、华绍炳、石林、周晨楠。起草单位杭州德同生物技术有限公司、湖州市南浔区佰通标准化研究院。范围本文件规定了基于杂交捕获和化学发光的人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测方法的缩略语、方法原理、仪器设备、试剂或材料、样本、检测步骤和检测报告。 本文件适用于采用杂交捕获—化学发光原理进行人乳头状瘤病毒(HPV)的核酸检测。主要技术内容现有的宫颈癌初筛主要是通过细胞学方法,检测结果受到很多主观因素影响。人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测杂交捕获-化学发光法,是基于病因学的分子水平检测方法,是近几年医学界刚刚发明并开展起来的一种快速、有效的检测方法,可一次检测所有引致宫颈癌的14个高危型HPV病毒,使宫颈癌检出率达99%以上。这种方法是目前国内外公认的HPV检测技术“金标准”方法,具有灵敏度高、重复性好、不易漏诊、简便易行、无创伤、无痛苦等优点,普通实验室即可开展,且能更加客观地评估受检女性是否已经有宫颈癌癌前病变或存在进展为癌前病变的高风险。目前,人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测杂交捕获—化学发光法技术的使用已经在国内逐渐成熟,但国内外目前均没有成熟的检测标准。因此,此次拟建立人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测杂交捕获—化学发光法团体标准,旨在填补国内空白,为检测机构对人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测的测定提供确切的检测依据,保障检测的可靠性。是否包含专利信息是标准下载链接:https://www.instrument.com.cn/download/shtml/1014906.shtmlT/ZJATA 0006—2021《人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测试剂盒(杂交捕获-化学发光法)》标准详细信息标准状态现行标准编号T/ZJATA 0006—2021中文标题人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测试剂盒(杂交捕获-化学发光法)英文标题Human papillomavirus (HPV) nucleic acid detection kit(Hybrid Capture - CLIA)国际标准分类号11.100中国标准分类号C 44国民经济分类Q849 其他卫生活动发布日期2021年12月20日实施日期2022年01月20日起草人韩斌、寿莹佳、华绍炳、石林、周晨楠。起草单位杭州德同生物技术有限公司、湖州市南浔区佰通标准化研究院。范围本文件规定了人乳头状瘤病毒核酸检测试剂盒(以下简称“试剂盒”)的技术要求、试验方法、检验规则、标识、标签、使用说明书、包装、运输、贮存和质量承诺。 本文件适用于采用杂交捕获—化学发光法的人乳头状瘤病毒核酸检测试剂盒。主要技术内容人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测试剂盒是人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测杂交捕获—化学发光法的必要配套检测产品,用于高危型人乳头状瘤病毒感染的 DNA 检测,可作为宫颈疾病辅助诊断及处理后定性监测的主要手段之一。目前,人乳头状瘤病毒核酸检测杂交捕获—化学发光法技术的使用已经在国内逐渐成熟,关于杂交捕获—化学发光法生产的人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测试剂盒,经查询,未查到ISO、IEC对应的产品标准,国际上生产的人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测试剂盒执行的都为企业标准。目前国内行业标准YY/T 1226—2014《人乳头瘤病毒核酸(分型)检测试剂(盒)》,该标准对采用实时荧光PCR法、PCR杂交原理法、酶切信号放大法等多种方法的通用标准,对应用杂交捕获—化学发光法的人乳头瘤病毒核酸(分型)检测试剂(盒)的技术要求和试验方法没有量化和细致的规定,标准本身较为落后。例如:检测限指标不够先进、没有规定企业阴性参考品的交叉反应率要求、以及重复性中相对光子数的变异系数要求。检测试剂盒产品的质量好坏将直接决定了检测结果的准确与否,因此制定一个人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测试剂盒(杂交捕获—化学发光法)标准十分有必要。此次拟建立的人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测试剂盒(杂交捕获—化学发光法)团体标准,完善了国内基于杂交捕获—化学发光法的检测试剂盒标准,将为该类试剂盒的质量提供保障。是否包含专利信息否标准下载链接:https://www.instrument.com.cn/download/shtml/1014907.shtml
  • 徕卡超高分辨显微技术-病毒学相关研究应用
    引言2020年注定是不平凡的一年,也将是载入史册的一年。一个不太热门的研究,一下子进入了公众视野,给我们上了一堂沉重的课。那么如何有效防范病毒传播,如何进行专业防控和疫苗研发,这都需要对病毒基本特征和机理深入研究。 然而,由于受到光学衍射极限的限制,普通光学显微镜分辨率只能达到200nm,而通常病毒和亚细胞结构的尺寸只有几十到200多纳米,远远小于普通光镜的分辨率。超高分辨显微技术的出现,为观测这类精细结构提供了可能,因此也得到了越来越广泛的应用。作为超高分辨技术的先驱,受激发射损耗(STimulated Emission Depletion, STED)技术更是在生命科学领域尤其是病毒学相关研究中发挥着重要作用。 本次为大家分享STED技术在病毒学研究中的应用和新进展,助力生命科学研究和发展。 STED基本原理2014年诺贝尔化学奖授予三位科学家,以表彰他们发明超高分辨显微技术。其中Stefan Hell发明了STED技术,而徕卡公司也是第一个将其商业化。从2007年开始,徕卡STED产品不断创新和优化,已经拥有近13年的STED技术积累。2014年首次推出SP8 STED 3X,即荣获当年的R&D100大奖。2019年更是创新性的推出了τ-STED,进一步在提升分辨率的同时降低了激光功率,更适合活细胞超高分辨成像。2014年诺贝尔化学奖获得者,左起分别是:Eric Betzig、Stefan W. Hell、William E. Moerner说了这么多,STED技术原理到底是什么呢?很简单。我们想象一下,一个点发射出的荧光信号,被检测后通常是一个衍射斑;如果我们同时使用一个甜甜圈样的激光将其周围的信号擦除掉,只允许中心很小的荧光信号发射出来,这样分辨率不就提高了吗。这个起擦除作用的激光便是STED激光,也叫损耗光,利用的是荧光的受激发射损耗原理。之后,通过对图像的扫描,即可直接呈现超高分辨图像,无需任何后续计算过程。同时,根据公式,可通过增加STED激光功率来提升图像分辨率。STED原理示意图:STED通过受激发射损耗去除衍射环上的荧光信号,大大缩小有效的激发区域,从而改写了分辨率公式,提高了光学分辨率 STED技术在病毒学研究中的应用实例 01第一个应用实例,是对病毒精细结构的观察。2012年发表在国际顶级期刊science上,标题为:荧光纳米显微镜(STED)揭示成熟依赖的HIV-1病毒表面蛋白的再分布特征【1】。图中绿色代表HIV-1病毒粒子,红色表示病毒表面的膜蛋白。可以看到,通过普通共聚焦无法分辨膜蛋白的具体定位位置,很模糊。包膜糖蛋白gp120(红色)与病毒粒子(绿色)90%共定位,信号模糊,分辨不出细节。而STED成像可以发现,大多数成熟病毒粒子表现出单一的包膜蛋白Env信号或焦点(图1B),而大多数未成熟粒子表现出两个或两个以上的包膜蛋白Env信号(图1D)。 02第二个应用实例,是对病毒成熟过程的观察。标题为:STED纳米显微镜揭示HIV病毒蛋白水解成熟的时间过程【2】。利用STED显微镜发现在HIV-1病毒成熟和未成熟条件下,可非常清晰区分其Gag蛋白的不同结构特征。未成熟病毒的Gag蛋白呈中空环状(图a),而成熟病毒中呈实心固缩状(图b)。作者巧妙的利用光控方法,进行STED时间序列成像。在400nm紫外光照后,PDI(光催化降解的蛋白酶抑制剂)降解,Gag蛋白能够被蛋白酶水解切割,进而病毒成熟。STED时间序列成像可轻松捕获病毒从未成熟到成熟过程,Gag蛋白重排的结构变化过程。03第三个应用实例,是对病毒基因组示踪。标题为:以单分子分辨率示踪宿主细胞中的病毒基因组【3】。腺病毒DNA通过AF594标记的叠氮点击反应显示,衣壳蛋白通过抗hexon的抗体识别,并且只有在脱壳后,病毒DNA才可以被反应检测到荧光信号。 通过gated STED超高分辨显微成像,可显著提高分辨率,清晰呈现病毒衣壳和DNA的真实尺寸大小。腺病毒衣壳实际大小约80nm,gSTED显示约110nm(包含一二抗尺寸),与实际一致。gSTED显示被衣壳蛋白包裹的病毒DNA尺寸略小于80nm,也与衣壳尺寸符合。 04第四个应用实例,是对病毒基因组复制的观察。标题为:利用STED超高分辨显微镜观察复制的HSV-1病毒【4】。值得一提的是,本文由中科院昆明动物所周巨民老师课题组与徕卡公司合作完成。病毒基因组复制是单纯疱疹病毒 1 (HSV-1) 溶解感染周期的重要事件。目前由于检测和观察方法的局限,病毒复制过程的细节仍难以捕捉。为了获得更加详细的 HSV-1 复制机制,本文使用了STED受激发射损耗显微镜,结合荧光原位杂交 (FISH) 和免疫荧光,对HSV-1 复制过程进行了精细观察。 作者设计了位于HSV-1病毒基因组两端的探针,分别以DIG(绿色)和Biotin(红色)进行标记,在病毒复制的早期和晚期,分别成像观察。STED成像发现,在复制的早期,红绿两色信号的共定位程度较高;而在复制后期,两个系数均发生了明显降低,表明HSV-1 基因组在复制过程中经历了从紧凑到松弛的动态结构变化,同时需要占用较大的空间进行复制。 05第五个应用实例,是对病毒侵染和传播过程捕获的研究。标题为:ARP2和病毒诱导的丝状伪足促进了人类呼吸道合胞体病毒的传播【5】。利用STED超高分辨显微镜进行成像,发现感染了RSV病毒的细胞(图A第一行,标记为A和C)外存在大量的丝状伪足(红色),且富集有大量病毒颗粒(绿色);暗示可通过丝状伪足将RSV病毒传递给邻近细胞。而在ARP2敲除的细胞中(图A第二行),即便感染了RSV病毒,细胞的丝状伪足数量都大量减少,病毒在细胞间的传播不明显。放大图像(图B),可观察到RSV病毒主要分布在丝状伪足的尖端,进一步验证了病毒可通过诱导丝状伪足的产生来促进其在细胞间的传播。 如何进一步提高STED分辨率?根据公式我们可以知道,通过增加STED激光功率就可直接增加图像的分辨率,这个方法最为简单;但问题是不利于活细胞成像。那么如何在不提高激光功率的前提下,进一步提高STED分辨率呢?有以下三种方法,分别是gated STED,gated STED + Lightning,和徕卡新推出的τ-STED。 01以两个距离76nm的DNA Origami为例,gated STED在不改变STED激光功率的前提下,逐步缩小荧光寿命的检测范围,可逐步提高分辨率,清晰地分辨两个点信号。02对中心粒的gated STED + Lightning成像结果,分辨率(半高宽)可达22nm!03新一代STED:τ-STED,即将STED和超快速的荧光寿命相结合,实时呈现超高清分辨图像。它在已有STED优势的基础上,可以更低激光功率获得更高图像分辨率,进一步拓展荧光染料的选择,非常适合长时间的活细胞成像。结语徕卡STED拥有13年的研发、技术和服务经验,也具有以下突出优势特点,是病毒学研究的绝佳利器:“纯光学”超高分辨显微技术,所见即所得全光谱、多色超高分辨成像,提供592nm/660nm/775nm三根 STED谱线专为STED设计的多款满足不同应用需求的物镜使用常规荧光染料及荧光蛋白,制样简单、方便τ-STED低光毒性,更适合活细胞超高分辨成像快速扫描头能够更好的保护样品LAS X Navigator能够轻松寻找目标视野 此外,整个STED是搭载在徕卡共聚焦平台上的,因此也拥有共聚焦的所有优点。相信徕卡STED超高分辨显微镜能够更多地贡献超高清图像结果,助力病毒学和生命科学研究发展。 参考文献:【1】Chojnacki J, Staudt T, Glass B, et al. Maturation-dependent HIV-1 surface protein redistribution revealed by fluorescence nanoscopy.[J]. Science, 2012, 338(6106): 524-528.【2】Hanne J, Gottfert F, Schimer J, et al. Stimulated Emission Depletion Nanoscopy Reveals Time-Course of Human Immunodeficiency Virus Proteolytic Maturation[J]. ACS Nano, 2016, 10(9): 8215-8222.【3】Wang IH, Suomalainen M, Andriasyan V, et al. Tracking viral genomes in host cells at single-molecule resolution. Cell Host Microbe. 2013 14(4):468–480. 【4】Li Z, Fang C, Su Y, et al. Visualizing the replicating HSV-1 virus using STED super-resolution microscopy[J]. Virology Journal, 2016, 13(1): 65-65.【5】Mehedi M, Mccarty T, Martin S E, et al. Actin-Related Protein 2 (ARP2) and Virus-Induced Filopodia Facilitate Human Respiratory Syncytial Virus Spread[J]. PLOS Pathogens, 2016, 12(12).
  • 病毒研究 | 日立电镜带你直面诺如、甲流病毒
    诺如病毒可能引起急性肠胃炎的 一种病毒 《试验样品提供者》 日本国立感染症研究所 客座研究员Etsuko Utagawa老师诺如病毒,又称诺瓦克病毒是人类杯状病毒科属的一种病毒。是一组形态相似、抗原性略有不同的病毒颗粒。诺如病毒感染性腹泻在全世界范围内均有流行,全年均可发生感染,感染对象主要是成人和学龄儿童,寒冷季节呈现高发。诺如病毒感染性腹泻在全世界范围内均有流行,全年均可发生感染,感染对象主要是成人和学龄儿童,寒冷季节呈现高发。甲型H3N2流感病毒与普通的感冒相比, 传染能力较强,甲型H3N2流感是一种由粘病毒引起的呼吸系统疾病,可以通过多种动物的呼吸道传播(狗,鸡,鸭等),患者多表现出普通流行性感冒的症状,有时会出现腹泻和呕吐。腺病毒可能导致结膜炎、 肺炎等的一种病毒导致禽流感、诺如病毒等疾病的罪魁祸首即病毒,它的大小仅为30〜 150纳米(1纳米:十亿分之一米),只有通过电子显微镜才能观察到。 电子显微镜在这些病毒的治疗方案研究和药品研发方面,发挥着十分重要的作用。公司介绍:日立科学仪器(北京)有限公司是世界500强日立集团旗下日立高新技术有限公司在北京设立的全资子公司。本公司秉承日立集团的使命、价值观和愿景,始终追寻“简化客户的高科技工艺”的企业理念,通过与客户的协同创新,积极为教育、科研、工业等领域的客户需求提供专业和优质的解决方案。 我们的主要产品包括:各类电子显微镜、原子力显微镜等表面科学仪器和前处理设备,以及各类色谱、光谱、电化学等分析仪器。为了更好地服务于中国广大的日立客户,公司目前在北京、上海、广州、西安、成都、武汉、沈阳等十几个主要城市设立有分公司、办事处或联络处等分支机构,直接为客户提供快速便捷的、专业优质的各类相关技术咨询、应用支持和售后技术服务,从而协助我们的客户实现其目标,共创美好未来。
  • 《新型冠状病毒感染诊疗方案(试行第十版)》发布 增加抗原检测阳性为诊断标准
    为进一步做好新型冠状病毒感染医疗救治工作,切实提高规范化、同质化诊疗水平,国家卫生健康委会同国家中医药管理局,根据新冠病毒感染乙类乙管及疫情防控措施优化调整相关要求,结合奥密克戎变异毒株特点和感染者疾病特征,组织对《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第九版)》进行了修订,形成了《新型冠状病毒感染诊疗方案(试行第十版)》。重点修订内容如下:一、对疾病名称进行了调整根据国务院联防联控机制综合组《关于对新型冠状病毒感染实施“乙类乙管”的总体方案》,将疾病名称由“新型冠状病毒肺炎”更名为“新型冠状病毒感染”。主要考虑,疫情早期新冠病毒致病力较强,临床上大部分有肺炎表现。随着新冠病毒不断变异,奥密克戎毒株成为主要流行株后,病毒致病力减弱,感染人体主要表现为咳嗽、发热、咽痛等,仅有少部分感染者会进展为肺炎。因此,“新冠病毒感染”能够更加准确地反映疾病特征。二、不再判定“疑似病例”随着诊断手段的日益丰富和诊断效率的不断提高,目前新冠病毒感染已可通过核酸和抗原检测等实现及时、快速、准确诊断。绝大多数情况下,不会出现因流行病学史、临床表现符合疾病特点但病原学检测较长时间不能明确的情况。因此,为进一步提高临床诊疗效率,更好实现快速收治,十版方案不再判定“疑似病例”。三、增加新冠病毒抗原检测阳性作为诊断标准抗原检测对于病毒载量较高的感染者具有较好的检测灵敏性。随着抗原检测技术的不断成熟和检测准确性的不断提高,新冠病毒感染者特别是传染性较强的感染者,能够通过抗原检测得到及时诊断。且考虑到多数感染者居家治疗,抗原检测操作简便,方便感染者进行快速自我检测。因此,十版诊疗方案在诊断标准中增加了“新冠病毒抗原检测阳性”。四、进一步优化“临床分型”从疾病临床表现来看,普通型一般代表了疾病最常见的典型表现。新冠病毒早期致病力较强,相当数量感染者出现典型的肺炎表现,因此,在临床分型上采用了“轻型、普通型、重型、危重型”的分类方式。随着病毒不断变异,特别是奥密克戎毒株流行以来,病毒致病力逐渐减弱,疾病特点发生了明显变化,大多数感染者症状较轻,发生肺炎的比例大幅降低。为更好体现疾病特点,十版方案对临床分型进行了调整,主要根据感染者病情严重程度,分为“轻型、中型、重型、危重型”,更加符合临床实际。五、不再要求病例“集中隔离收治”随着乙类乙管措施的实施,新冠病毒感染者可根据病情救治需要选择居家治疗或到医疗机构就诊,各类医疗机构均可收治新冠病毒感染者。为此,十版方案因时因势调整收治策略,不再要求病例集中隔离收治。六、进一步完善了治疗方法一是将我国已经批准上市的抗新冠病毒治疗药物纳入新版诊疗方案,进一步丰富抗病毒治疗手段。二是进一步完善了重型、危重型病例诊断标准和预警指标,对新冠病毒感染重症病例进行科学准确判定,同时将未全程接种疫苗的老年人加入重症高危人群,将生命体征监测特别是静息和活动后的指氧饱和度监测指标等加入重症早期预警指标。三是进一步强化新冠病毒感染与基础疾病共治理念,强调要加强感染者基础疾病相关指标监测,并针对基础疾病给予相应治疗,更加有利于促进患者全面恢复健康。四是进一步优化了儿童病例临床表现和救治相关内容,结合临床实际提出了儿童感染奥密克戎毒株的特点,完善了儿童重型病例早期预期预警指标,对儿童感染者可能出现的急性喉炎、神经系统并发症等特殊情况提供了治疗方案。五是进一步完善了中医治疗相关内容。加强了对重型、危重型病例中医药救治指导,增加随症用药方法,更加贴合临床。在此基础上,进一步完善儿童病例中医药治疗方案,增加针灸治疗方法,结合部分患者恢复期咳嗽明显等情况,提供了相应的中医治疗措施。七、调整“出院标准”新冠病毒感染乙类乙管措施实行后,不再强化对感染者的隔离管理,而是可按乙类传染病予以诊断治疗。为此,十版方案不再对感染者出院时核酸检测结果提出要求,而是由临床医生根据患者新冠病毒感染、基础疾病或其他疾病诊疗及健康恢复状况等进行综合研判。当患者病情明显好转,生命体征平稳,体温正常超过24小时,肺部影像学显示急性渗出性病变明显改善,可以转为口服药物治疗,没有需要进一步处理的并发症等情况时,可考虑出院。八、调整医疗机构内感染预防与控制疫情防控政策调整后,所有医疗机构都有接诊新冠病毒感染病例的可能,我们在十版诊疗方案中对医疗机构内感染预防与控制有关内容进行了调整,使感染防控措施更加科学精准,更具针对性、可操作性。一是进一步落实门急诊预检分诊制度,做好患者分流。同时,指导就诊患者和陪同人员佩戴医用外科口罩或医用防护口罩,提供手卫生、呼吸道卫生和咳嗽礼仪指导。二是加强诊室、病房、办公室和值班室等区域清洁消毒和通风。三是根据暴露风险落实医务人员个人防护要求。四是规范处理医疗废物,落实患者转出或离院后的终末消毒。附相关资料:最新:新型冠状病毒感染诊疗方案(试行第十版)附件:新型冠状病毒感染诊疗方案(试行第十版).pdf
  • 深圳口岸采用甲型流感病毒检测试剂盒用防控甲流
    深圳检验检疫局2月14日通报,2月12日起,首批1000个甲型流感病毒检测试剂盒在全市各个旅检口岸使用,口岸旅检现场对入境旅客进行甲型流感病毒抗原的快速定性测定后3分钟内即可得到可信结果。这是深圳口岸首次使用该试剂盒防控甲流。   当前正值冬春季呼吸道传染病高发季节,周边地区流感疫情呈上升趋势,因甲流导致的重症病例和死亡病例也不断增加。对此,深圳检验检疫局进一步严格健康申报、体温检测、医学巡查等卫生检疫措施,同时,在旅检口岸配备甲型流感病毒检测试剂盒,对高危人群实施口岸甲型H1N1流感快速检测防控策略,防止甲型H1N1流感经口岸传入。   甲型流感病毒检测试剂盒可以在口岸旅检现场对人体的鼻腔抽吸液、鼻腔擦拭液和咽喉擦拭液标本,进行甲型流感病毒抗原的快速定性测定,在3分钟内就可得到可信结果,大大缩短了送检和检测时间,更有利于甲型H1N1的防控工作,尤其适合深圳口岸多、客流量大的特点。为确保使用效果,深圳检验检疫局还特地对相关工作人员进行了培训。
  • Naica数字PCR用于取样困难病人的血浆、粪便、尿液等复杂样本新冠病毒检测
    截止目前,针对疫情相关人群做新冠肺炎筛查时,主要采用鼻咽拭子核酸检测,原因是方便快捷,适合大规模筛查。但是,对于一些无症状感染者或轻症感染者来说,感染后病情恢复得很快,可能3至5天咽部核酸就检测不到了。通过研究发现,一部分感染者粪便或肛拭子核酸阳性的持续时间比上呼吸道持续时间更长。因此,增加肛拭子等复杂样本的核酸检测能够提高感染者检出率,减少漏诊。日前,湖南省疾控研究人员对已经确诊的3例新型冠状病毒肺炎患者不同时间的全血、尿液、粪便标本同时进行qPCR和Naica数字PCR(cd-PCR)的核酸检测,并比较了两种方法检测各类样本中2019-nCoV的差异性,提出改进2019-nCoV核酸检测的综合策略,为核酸检测阴性患者提供更多诊断支持。本实验中数字PCR在病例发病早、中、晚期标本中均能检测到阳性微滴,而qPCR漏检了发病小于5天的标本,检测到的阳性核酸均以中晚期为主。这也解释了受检测方法灵敏度的局限性,目前大部分假阴性患者都处于疾病发展的早期。此外,在本次实验中数字PCR在重症病例的三种标本中均测到阳性微滴,但因为血、尿和可疑粪便的标本病毒载量偏低,qPCR检测均为阴性。总之,数字PCR技术可以有效克服qPCR灵敏度不足的难题,捕捉到病毒载量较低的血液、尿液和可疑的粪便或肛拭子标本,是qPCR的有益补充,为帮助临床医生准确判断早期感染及患者是否真正痊愈起到了积极的作用,对2019-nCoV的长期监控有重要的意义。Naica数字PCR技术进行新冠病毒检测,依托高灵敏度、全封闭、判读快捷等优势,可应用于以下场景:1. 低浓度样本检测,如ct值37个循环的样本,ct值为零的高危密接样本,排除假阴性结果;2. 医院样本的准确复核;3. 出院标准的确证;4. 阳性病人的出院后定期跟踪检测;5.取样困难病人的复杂样本检测:血浆、粪便、尿液等;6.捐献库、样本库、血库中样本新冠筛查;7.群采检测和单采群检,提高日检测能力,筛选灵敏度高。新冠相关文章:• 文献速递|湖南省疾控两篇连发Naica™ 数字PCR系统检测精子/全血/尿液/粪便中的 新冠病毒SARS-CoV-2• 数字PCR方法高灵敏度群体检测新冠病毒解决方案:基于Naica自动化数字PCR系统• 深蓝云生物最新三通道高灵敏全封闭数字PCR检测新冠病毒整套方案• Naica数字PCR系统解决方案抗击Covid-19,可靠检测SARS-CoV-2病毒同时获得病毒载量
  • 农贸市场新冠病毒环境监测技术规范发布 这些仪器必不可少
    p   日前,国务院应对新型冠状病毒肺炎疫情联防联控机制综合组发布关于印发农贸(集贸)市场新型冠状病毒环境监测技术规范的通知。通知详细描述了样本要求、采样方法、样本分装和保存、检测等各环节的注意事项,并明确了每一步的实验步骤、防护措施、所需的仪器及相关设备:比如 a href=" https://www.instrument.com.cn/zc/879.html" target=" _blank" 核酸提取仪 /a 、 a href=" https://www.instrument.com.cn/zc/879.html" target=" _blank" 实时荧光定量PCR /a 、 a href=" https://www.instrument.com.cn/zc/164.html" target=" _blank" 离心机 /a 、病毒采样箱、病毒采样管、气溶胶采集器、样品记录单、手消设备、洁净采样袋、冰袋、高危险生物样本转运箱和生物安全垃圾袋等& #8230 & #8230 /p p style=" text-align: center " strong 农贸(集贸)市场新型冠状病毒环境监测 /strong strong 技术规范 /strong /p p   农贸(集贸)市场是新冠肺炎疫情防控的重点场所,加强对农贸(集贸)市场新冠病毒环境监测,对于深入开展病毒溯源和疫情防控意义重大。为科学规范指导开展农贸(集贸)市场新冠病毒环境监测工作,特制定本技术规范。 /p p   一、监测对象 /p p   监测重点为具备区域辐射能力的大型农贸(集贸)市场,特别是包括冷冻、冷藏功能的肉类和海鲜水产交易摊位,或者存在潮湿、密闭空间的市场。 /p p   二、监测内容 /p p   (一)市场内重点摊位的设施、用具表面病毒检测。重点对摊位台面、面板、地面、把手,以及各种制作和使用器具等表面,包括脱毛或切割机械、刀具等,采集拭子样本。 /p p   (二)市场内重点摊位从业人员咽拭子、衣物表面、手部病毒检测。对处于工作状态的从业人员手部表面,采集拭子样本。 /p p   (三)市场内重点摊位存放食品的冰箱、冷藏柜内部表面病毒检测。对储藏食物过程中经常触及的冰箱、冷藏柜内表面,采集拭子样本。 /p p   (四)市场内销售的肉、禽类和海鲜水产类食品的病毒检测。对市场内销售的食品应当按照无包装食品和有包装食品加以区分,其中有包装类食品重点是需要冷藏运输的肉、禽类和海鲜水产类食品,采集拭子样本。 /p p   (五)市场内排水系统中污水的病毒检测。重点包括市场内海鲜水产、肉禽类产品摊位来源的污水,采集拭子样本或污水样本。 /p p   (六)市场内公共空间中人员接触较多的部位,包括主要进出口的电梯按钮、楼梯扶手、门把手表面,茶水间、卫生间等公用设备设施表面,潮湿的公共通道和卫生间地面、墩布池等采集拭子样本。 /p p   (七)市场内经常性跨区域移动的工具或物品,包括垃圾车、垃圾桶、墩布等清洁工具,转运物品的拖车等,采集拭子样本。 /p p   (八)市场内工作人员聚集、通风不良的环境,包括办公室、工具间、休息间、局部交易环境等环境拭子及气溶胶样本。 /p p   三、样本采样 /p p   (一)样本要求。 /p p   1.从业人员咽拭子、手部、衣物和其他物体表面拭子样本:要求用病毒采样管中的病毒保存液,充分浸润采样棉签后,对拟采集的手部或物体(包括公共通道的地面)的表面重复涂抹、涮洗3次以上。同时要满足对采样对象表面,进行多点分布式采样。 /p p   2.食品表面拭子样本:食品样本不可直接进行采集,应当首先将拟采集的食品小心分离,并存放于洁净采样袋后,再进行拭子样本的采集。要求用病毒采样管中的病毒保存液,充分浸润采样棉签后,对拟采集食物样本的表面重复涂抹、涮洗3次以上。同时要满足对样本表面,进行多点分布式采样。 /p p   3.污水样本:按照市场内排水系统分布情况,选取2-3处污水采样位置,重点为内部管网汇集处、水流方向的下游或与市政管网的连接处。采集拭子样本要求,用采样棉签浸入污水中,使其吸附污水并在采样管中对涮洗3次以上。采集污水样本要求,用聚乙烯塑料瓶收集30-500mL污水水样 大于500mL体积的污水采集可以使用聚乙烯塑料桶或现场水样专用富集设备。同时要满足对污水采样位置,进行多点分布式采样。 /p p   4.动物样本:对于活体动物,可分别用采样棉签采集其体表拭子、口咽拭子和肛拭子,也可以采集其排泄物或分泌物样本,并在记录单上进行相应记录。对于以经过剥皮等处理的动物样本,分别用棉签采集其体表和体腔拭子样本,要求用病毒采样管中的病毒保存液,充分浸润采样棉签后,对拟采集食物样本的表面重复涂抹、涮洗3次以上。同时要满足对样本表面,进行多点分布式采样。 /p p   5.其他器具:笼具或鱼缸等装运、养殖动物的容器,需首先观察或了解该容器具体存放、养殖过的动物类型,采集容器内壁拭子样本或内容物液体样本。 /p p   6.人员聚集、通风不良的局部交易区域、办公室、休息间等环境采集气溶胶样本。 /p p   (二)采样方法。 /p p   1.采样周期:对重点大型集贸市场(特别是销售生鲜类产品的市场)按照1次/周,对其余需要监测的集贸市场按照1次/月的频次进行病毒监测。 /p p   2.采样实施:现场采样由两名以上的工作人员参与完成,采样时应当穿戴防护服、防护口罩、鞋套和医用一次性手套。采样过程需开启现场采样视频记录设备。 /p p   3.采样装备:病毒采样箱、病毒采样管、气溶胶采集器、样品记录单、手消设备、洁净采样袋、冰袋、高危险生物样本转运箱和生物安全垃圾袋等。 /p p   4.采样记录:样本信息应当包括样本采集的采样时间、地点、集贸市场名称、摊位编号、采样类型、样本编号以及采样人等信息。 /p p   5.采样操作:采样开始前,要求穿戴防护服、口罩、鞋套和手套等个人防护用品进入采样现场,并使用手消进行手部消毒。拭子样本采样过程中,采样棉签只能接触当前采集的样本,避免触碰到其他物体。污水样本采集前,先充分搅匀,然后取样。污水分三层以上,不能搅匀时,可按各层量的多少的比例分层取样。气溶胶样本采集使用气溶胶采集器,设定采集高度、空气通量和采集时间,进行气溶胶采集,将采集后的吸收液或滤膜放置在特定的低温容器进行转运。采样结束后,清理废弃物后离场。 /p p   6.样品转运:采集样品连同采样记录单应当在24小时内运送至当地指定的病毒监测机构进行检测,样本建议冷藏存放于高危险生物样本转运箱中,并由专人、专车进行转运。 /p p   四、检测 /p p   (一)样本分装和保存。 /p p   1.样本分装:标本采集后应当在生物安全二级实验室生物安全柜内分装,但个人防护装备参照生物安全三级实验室的防护要求。所有采集对环境标本应当分装到大小适合的带螺旋盖内有垫圈、耐冷冻的样本采集管里,按照1000ul/管进行分装。容器(采集管)外注明样本编号、种类及采样日期。用于后续核酸提取和病毒分离等实验室检测工作。 /p p   2.样本保存:用于病毒分离和核酸检测的标本应当尽快进行检测,能在24小时内检测的标本可置于4℃保存 24小时内无法检测的标本则应当置于-70℃或以下保存(如无-70℃保存条件,则于-20℃冰箱暂存)。 /p p   (二)污水水样前期处理。使用离心技术去除污水中杂质。先打开低温离心机,待温度降至4℃左右,建议4654离心力离心30分钟,取上清。再使用膜吸附技术或超滤技术进行上清液的浓缩。 /p p   (三)核酸提取。新型冠状病毒的常规检测方法是通过实时荧光RT-PCR鉴定。任何新型冠状病毒的检测都必须由经过相关生物安全及技能培训的人员进行操作。对已经灭活的样本,应当在生物安全二级(BSL-2)实验室内,使用自动化核酸提取仪,配套核酸提取试剂盒进行病毒核酸的提取。核酸提取后,应当将核酸产物进行分装,用于后续核酸实时荧光定量(RT-PCR)及深度测序。核酸提取操作参考相关厂家试剂盒说明书开展。 /p p   (四)实时荧光定量PCR。在BSL-2实验室中对所有已提取的核酸样本,应当用经CFDA批准的RT-PCR诊断试剂进行新型冠状病毒核酸检测,以保证实验结果的正确可靠。RT-PCR反应体系和操作参考相关厂家试剂盒说明。每一次RT-PCR反应均应当设置阴性对照、阳性对照和无模板空白对照,以确保扩增体系工作正常。 /p p   五、实验室生物安全 /p p   实验室安全级别参照最新版《新型冠状病毒实验室生物安全指南(第二版)》的相关内容进行管理。采集的环境样本属于未经培养的感染性材料,在采用可靠的方法灭活前进行的病毒抗原检测、血清学检测、核酸提取、生化分析,以及临床样本的灭活等操作,应当在生物安全二级实验室进行,同时采用生物安全三级实验室的个人防护。环境样本在采用可靠的方法灭活后进行的核酸检测、抗原检测、血清学检测、生化分析等操作应当在生物安全二级实验室进行。 /p p br/ /p
  • 厦大牵头研制!全球首个戊型肝炎病毒抗原尿液检测试剂盒获批上市!
    25日,记者从厦门大学国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心获悉,近日,由厦门大学、中国食品药品检定研究院和万泰生物联合研制的戊型肝炎病毒抗原尿液检测试剂盒(胶体金法、荧光免疫层析法)获得国家药品监督管理局批准上市。该试剂为全球首个以尿液抗原为靶标的戊肝诊断试剂,填补了相关产品和技术空白,其临床评估结果显示检测准确度为98.58%,对全球戊肝患者的临床诊断与治疗管理具有重大意义。戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)是全球范围内病毒性肝炎最主要的病原体之一。全球每年新发HEV感染2000万例,死亡44000例。在我国,戊肝是急性病毒性肝炎的首要病因,其发病人数正逐年上升。慢性肝病患者、孕妇、老年人是HEV感染的高危人群。慢乙肝患者重叠感染HEV后,与未重叠感染HEV的患者相比,肝衰竭发生风险升高至10.9倍,死亡风险升高至8.54倍。有报道显示孕妇特别是妊娠晚期孕妇,感染HEV后的病死率高达15%~25%,且死胎率、早产率高。老年人感染HEV容易导致重型肝炎,占比达14%。我国现阶段戊肝的临床诊断主要依赖HEV IgM抗体检测(《戊型病毒性肝炎诊疗规范》,2009),但仅依赖血清学检测指标难以判断是否为戊肝现症感染,因此亟需病原学检测方法。作为RNA病毒,HEV的核酸检测存在操作复杂、成本高、易污染等问题,因而未能大规模的推广和使用。HEV抗原检测虽然是更便捷的诊断手段,但此前的抗原试剂存在灵敏度不高、阳性周期短等问题。研究团队以尿液中pORF2抗原为靶标研制了全球首个HEV抗原尿液检测试剂盒,首次在全球范围内将临床肝炎的诊断与治疗指导由血液或者粪便靶标转移至尿液中。据介绍,尿液抗原检测为戊肝临床诊断提供了最有效的手段。同时其采样简便、安全无创、检测快速,将极大提高戊肝临床诊断可及性和诊断效率,尤其是在戊肝主要流行的非洲、东南亚等发展中地区。该试剂具有我国自主知识产权,在戊肝诊断方面实现了重要突破,为全球肝炎防治贡献了中国力量。据悉,该试剂近期将投入市场,未来将出现在医院、疾控中心等场所用于戊肝的快速精准诊断。
  • 质谱流式技术在消化道病毒和人乳头瘤病毒研究中的应用
    p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 消化道相关病毒对人体健康产生重大威胁,尤其是乙型肝炎病毒和丙型肝炎病毒,在中国有数量庞大的患者。乙型肝炎病毒感染者无论在潜伏期、急性期或慢性期,其血液都具有传染性。临床上主要通过注射乙肝疫苗来达到预防的目的。一旦感染乙肝,目前治疗方案主要有NUC治疗,而NUC治疗只能干扰DNA合成,并不能将乙肝病毒从患者体内清除,因此具有很高的反复性。丙型肝炎病毒(慢性感染)为一类致癌物。临床丙型肝炎病人50%可发展为慢性肝炎,甚至部分病人会导致肝硬及肝细胞癌。非常遗憾的是医学界尚未研制出有效预防丙肝的疫苗。因为丙肝病毒是RNA病毒,极易变异,研制疫苗的难度很大。质谱流式在这两种病毒方向的应用主要涉及到临床治疗方案的改善,疫苗的效价评估及潜在治疗靶点的探索。 /p p style=" text-align: center text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 消化道相关病毒 /strong /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 目前质谱流式在消化道相关病毒的研究主要集中在轮状病毒,乙型肝炎病毒HBV和丙型肝炎病毒HCV三种病毒领域。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 轮状病毒( rotavirus)肠炎是由轮状病毒所致的急性消化道传染病。病原体主要通过消化道传播,主要发生在婴幼儿,常由A组轮状病毒引起,发病高峰在秋季,故名婴儿秋季腹泻。B组轮状病毒可引起成人腹泻。轮状病毒领域目前已发表文献涉及到T细胞结合表位筛选和寻找轮状病毒特异性B细胞亚群。T细胞结合表位筛选利用新发现的质谱流式和MHC四聚体技术相结合,创建了一种高通量筛选的技术。该技术用金属标签替代四聚体上的荧光基团,进而可以用质谱流式进行检测,从根本上解决荧光串色问题,提升单次检测通道。加之他们用三金属组合的方式标记四聚体来取代传统单金属标记的方法,进一步增加筛选的通量,用10种金属就可以实现120种抗原肽的筛选。利用该方法,Newell等人对人体内轮状病毒的109个MHC四聚体上77个T细胞潜在结合位点进行筛选,在健康个体的血液中鉴定出6个限制于人白细胞抗原(HLA)-A *0201的T细胞表位。值得一提的是,研究还发现特异性结合轮状病毒VP3蛋白的T细胞具有独特的表型,并在肠道上皮中大量存在。轮状病毒相关B细胞研究中,Nair, N.等人在轮状病毒上标记金属离子,进而研究在肠道中特异性结合在轮状病毒VP6结构性蛋白的B细胞亚群特征,揭示肠道B细胞组成异质性及其与肠道分泌细胞之间的关系。这些研究揭示出轮状病毒感染后抗原呈递及免疫反应特征,对于今后轮状病毒治疗及疫苗研发提供重要的理论基础。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " HBV相关研究涉及到感染进程及临床治疗两个方向。利用上述质谱流式和多肽-MHC四聚体技术的结合,Cheng, Y.等人对不同阶段HBV患者体内T细胞进行HBV基因组中HLA-A*1101限制性484种T细胞潜在结合位点进行了筛选,最终发现特异性结合HBV(pol387)和HBV(core169)表位的T细胞随着疾病发展呈现出明显分化和异质性。根据这些T细胞表型变化,作者绘制出HBV疾病进展图谱。如此深入的研究对于今后HBV感染阶段分型及治疗策略有很好的指导意义。临床治疗方面,Rivino, L.等人利用质谱流式探索HBV感染后NUC治疗停止治疗判定标准。发现患者体内是否存在功能性HBV-特异性T细胞亚群可作为慢性HBV患者停药的潜在生物标志物。慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染引起的慢性炎症增加了肝细胞癌(HCC)的风险。但是,关于HBV相关HCC的免疫状况及其对有效癌症免疫疗法设计的影响知之甚少。Lim, C. J.等人利用免疫组化和质谱流式技术,对HBV相关的HCC和非病毒相关的HCC的免疫微环境进行了细致研究,找到HBV相关HCC的独特免疫亚群,结合患者预后信息,作者发现Treg与HCC的预后不良相关,而Trm与HCC的预后良好相关。这种深入的研究对今后HCC的治疗和免疫疗法的适当应用具有重要意义。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " HCV感染全球数以百万计的人,是肝硬化和肝细胞癌的主要原因。而针对丙型肝炎病毒(HCV)的保护性疫苗仍未满足临床需求。已有成果利用质谱流式对新研发HCV疫苗疗效进行评价,单次实验可分析更多的免疫亚群反应。Doyle, E. H.等人用质谱流式对HCV感染后肝脏中的pDC功能进行分析,发现pDC是肝脏中唯一的单个核细胞,依旧具备多功能性,可大量分泌IFNα等多种细胞因子。可在今后治疗方案改善中作为潜在靶标。这些研究对于临床均具有重要的应用和指导意义。 /p p style=" text-align: center text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 人乳头瘤病毒(HPV) /strong /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " HPV感染会引发的宫颈癌和口咽鳞状细胞癌。质谱流式对两种肿瘤免疫微环境的研究发现。虽然是同一种病毒感染,但是由于组织类型的不同,其免疫微环境呈现出很大的差异性。这说明组织类型会显著影响肿瘤中的免疫渗透概况。这对治疗方案的调整有很大的指导意义。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 口咽鳞状细胞癌的可分为HPV阴性和HPV阳性。质谱流式对这两种类型患者的综合免疫亚群分析结合临床情况,发现患者肿瘤内存在I型HPV16特异性T细胞会提升其整体生存率,缩小肿瘤大小,减少淋巴结转移。并且会改变肿瘤微环境,使其呈现出响应标准治疗的特征。这些发现说明在口咽鳞状细胞癌中引入HPV16特异性T细胞会提升治疗效果。对临床治疗具有很大的启发。 /p p style=" text-align: center text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 小结 /strong /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 本文对质谱流式在消化道相关病毒和人乳头瘤病毒方向的文献进行汇总,所列文献涉及到的应用方向如下:1、病毒感染T细胞识别表位筛选,2、疫苗评估,3、确定疾病分型标准,发现biomarker的研究。在这些应用方向,质谱流式的单细胞多通道检测有其不可替代的优势。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 2013年开始兴起的技术——质谱流式与多肽-MHC四聚体技术相结合——在近两年呈现出越来越多的高水平成果。得益于质谱流式的单细胞多通道检测,利用该技术在筛选T细胞表位的同时,还可以对抗原特异的T细胞进行多参数的表型和功能分析;一次得到更多更准确的病毒特异性T细胞及抗原呈递信息,这对疫苗的研发有着举足轻重的作用。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 疫苗研发和效价评估方面。疫苗注射后所引起的免疫反应也是全方面的。能够评估的免疫亚群越全面,对于效价的评估越准确。质谱流式在这方面有其得天独厚的优势。从最开始的抗原表位筛查到注射疫苗后免疫反应的评估,质谱流式都可以大大提升覆盖度,使得研究更加快速,结果更加准确。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 综上,质谱流式在:1、病毒感染T细胞识别表位筛选,2、疫苗评估,3、确定疾病分型标准,发现biomarker的研究领域都有着传统流式无法比拟的优势,可助力研究人员在单次实验中拿到更多的信息,对免疫系统进行更加综合全面系统的评估。 /p p br/ /p
  • 记者实地探访病毒实验室揭秘病毒研究
    据中国之声《央广夜新闻》报道,日本教授研制超级流感病毒,一旦泄漏人类将&ldquo 无解&rdquo 引发争议 美国一实验室发生炭疽菌病毒泄漏引发危机。全球实验室病毒泄漏事件时有发生,美国在过去七年间发生过多达六百多起病毒泄露。揭秘病毒研究:科学研究和公共安全,到底孰轻孰重?高度敏感的实验室该如何确保安全?   针对一系列的问题,我们的记者今天走访了多所不同等级的实验室,了解那里的情况。让我们先去浙江桐乡的HIV血清抗体检测实验室看看:   记者跟随专业人员走进浙江桐乡疾控中心的HIV血清抗体检测实验室。实验室分为好几个区,每个区之间都用玻璃门做间隔。桐乡疾控中心检验科陈国征:&ldquo 实验室是分区的 这里是清洁区,这里是半污染区, 这里是污染区,检测人员就在这里工作。&rdquo   记者跟随专业人员又来到PCR实验室,PCR实验室主要进行呼吸道方面的病毒检测,在H7N9流感大规模爆发的时间,这个实验室每天都要进行病毒核酸的检测。在这个实验室,防护级别更高了,进入实验室要经过两道门,门与门之间的走廊是缓冲区。每个分区之间有传递窗口,实验进行过程中,标本是不允许接触外面的。实验人员的防护工作更是高要求:&ldquo 专门的防护服 跟电视上一样 口罩戴上 防护眼镜戴上 在做的时候以前有照片的 完完全全人认不出他是谁。&rdquo   疫苗方面,桐乡的疫苗一类二类疫苗都由省疾控中心统一采购分发,通过冷链车送达嘉兴,再由嘉兴疾控中心送达桐乡后存放在桐乡疾控中心仓库内,仓库设有专用冰箱和信息化监控系统,一旦温度发生异常或者有外界生物闯入,就会触发报警器。桐乡疾控中心传染病防治科许皓:&ldquo 仓库里面有防盗报警器,就算飞进一只鸟,跑进一只猫都会叫起来。&rdquo   许科长说,一类二类疫苗都由国家统一管理,接种人群比较固定,对外销售不会有市场,相对来说不太会被不法分子利用。但他们还是严格做好疫苗的出入库管理工作:&ldquo 每个月我们都有疫苗出入库的盘账,要做好帐物相符,少了一支疫苗,账务就不符了,不符我们会追溯原因,几月几号谁拿过什么疫苗,所有的来龙去脉都有一个纸质张和一个电脑账。&rdquo   很多人好奇,实验室病毒的管理是如何进行的,是否会存在感染的风险。接下来让我们跟随河南台记者勇生的话筒,到河南省疾控中心传染病所实验室去了解一下:   黄学勇博士是河南省疾控中心传染病所实验室的主任,在他所负责的实验室的安全门上写着&ldquo 外来人员 严禁入内&rdquo 的提示语,安全门需要密码才能进入,每次有人员进出都会随手关上实验室的门。根据规定,我们对黄学勇的采访在实验室外的办公室里进行:&ldquo 我们实验室主要做的是手足口病毒和发热伴血小板减少综合症,这是我们主要做的病毒。&rdquo   黄学勇说,他们实验室里所做的病毒研究都是致病性相对较低的项目,从接触病毒样本到最后的垃圾处理,都会有详细的记录:&ldquo 实验室污染性的东西,我们要经过高压消毒,消毒了以后保证生物安全性不流向社会,我们进行消毒以后,再进行垃圾方面的焚烧处理。&rdquo   河南省疾病预防控制中心质量管理室主任贾松树说,生物实验室按照危险程度分为四个等级,像黄学勇博士负责的实验室是P2级别的,也就是适用于对人和环境有中等潜在危害的微生物实验室,目前河南最高级别的是P3级别的实验室,也就是适用于主要通过呼吸途径使人传染上严重的甚至是致死疾病的致病微生物或其毒素实验室。对于不同等级的实验室,要求的防护标准是不一样的:&ldquo 根据级别不一样,带的口罩也不一样,具体的根据病毒的情况,致病强度,致病越强,要求越高,有些隔离衣可能就不只一层,有些可能就穿几层,特别高的就要在P4实验室。&rdquo   贾松树坦言,实验室的工作人员按照防护要求的规范进行操作,可以在最大程度上减少被感染的风险,但并不绝对:&ldquo 防护他只能是做到希望达到最高的程度,也不能说绝对保证,我防护了就一定不会被感染,只能说降低他被感染的概率。&rdquo   贾松树说,病毒也不一定都是致病性的,我们平常所接种的疫苗有的就是活体病毒,通过注射让人体产生抗体,反而能够预防疾病的发生:&ldquo 比如脊髓灰质炎疫苗,他是活的,他就是刺激人要产生抗脊髓灰质炎病毒的抗体,他也是减毒的病毒,但是不至于让人产生脊髓灰质炎,但是也不是绝对的,也有几十万分之一的可能,有疫苗产生的病毒,但是绝对大多数产生抗体了,不至于产生疾病。&rdquo
  • 专题推荐|低压透射电子显微镜LVEM在病毒学研究中的应用
    病毒作为一种病原体一直受到学术界的广泛关注。然而由于病毒通常尺寸较小,传统的光学显微镜往往难以满足其形态观测的需求,这使得高分辨率的透射电子显微镜成为了当前病毒学研究的一个重要手段(图1),可以用来研究病毒的结构和成分。目前使用的透射电子显微镜进行病毒颗粒的检测和识别仍面临着巨大的挑战。这是因为病毒的主要组成部分多为含碳的轻元素有机物,这类样品很容易被高能电子束穿过,造成其光学衬度较低,且由于共价键化合物的低稳定性使得其在传统电子显微镜的高加速电压 (一般为80-200 kV) 下非常不稳定,不适合直接进行观察。因此病毒的形态学观察一般采用负染色成像技术,需要在观测前对样品进行复杂的负染操作,占有大量的时间,且可能会掩盖掉一些病毒的形貌特征,造成使用透射电子显微镜观测病毒的门槛较高。图1. (A)80 kV 和 (B)5 kV加速电压下透射电子显微镜下观测到的SV40感染的小鼠胰腺切片(Microscopy Research and Technology, DOI:10.1002/jemt.20603)为了解决这一难题,低压透射电子显微镜(Low Voltage Electron Microscope, LVEM)应运而生。LVEM突破了传统透射电子显微镜的80 kV加速电压的低限,研究人员可在低压下观察轻质生物样品,无需染色,简化了样品制备流程;同时该设备可在保证高图像对比度的前提下,使用温和的加速电压进行病毒形态学的检测和识别,能够识别以往可能被污渍和负染的瑕疵所掩盖的病毒特征。Delong Instruments公司的LVEM 5&25是一类专门针对低电压设计研发出的透射电子显微镜。LVEM使用特殊设计的倒置式肖特基(Schottky)场发射电子枪,提供高亮度高相干性的电子束,这种低能电子束与样品的相互作用比传统透射电子显微镜中的高能电子要强得多,使得电子被轻质有机材料强烈散射,导致了特征的异常分化(Microscopy Research and Technology, DOI: 10.1002/jemt.22428)。在病毒学研究方面,该设备大放大倍数高于通常观测病毒所需要的大约50,000倍的放大率,且依然保持不错的分辨率(2 nm),可满足病毒形态和结构研究的需求。相比于高电压,5kV 的加速电压提供的电子束与样品的作用更强,对密度和原子序数有更高的灵敏度,对低至0.005 g/cm3的密度差别仍能得到很好的样品图像对比度,有效提高了轻元素样品的成像质量,适合针对病毒学的研究。需要指出的是,LVEM 25与LVEM 5建立在相同的平台之上,前者在一个稍高的加速电压下工作,在满足轻元素样品观测的要求下可进一步提高终的图像分辨率。图2. LVEM 5的结构示意图(A)和小鼠心脏超微结构成像 (B) 。(Microscopy Research and Technology, DOI:10.1002/jemt.22659)LVEM 5&25显微镜可用于检测腺病毒(图3A)、HIV(图3B)、轮状病毒(图3C)、球状病毒(图3F)、棒状病毒(图3 G-H)、星形病毒、杯状病毒、诺瓦克样病毒、疱疹病毒和乳头瘤病毒等。另外对于类病毒载体的研究,LVEM 5&25也是一项利器。它能够在不负染的情况下直接观测类病毒载体的形态,帮助研究者快速筛选载体,解决传统电镜制样难,机时紧张等问题(Journal of Nanobiotechnology, DOI: 10.1186/s12951-016-0241-6)。图3. (A-C) LVEM 5观察多种非负染的病毒样品 (D-E) LVEM 5&25 实物图 (F-H) LVEM 25观察多种负染后的病毒样品。 (图片来源于Delong Instruments官网)LVEM的高对比度成像技术匹配快速的时间-图像周期、高通量研究,可作为一种快速诊断方法,用于识别病毒感染源和辅助病理研究,是快速检测具有公共卫生重要性病原体的有力工具。LVEM 5&25 更是一台多种功能集成的电子显微镜,具有四种不同的成像模式——透射电镜(TEM)、扫描电镜(SEM)、扫描透射电镜(STEM)和电子衍射(ED),能够为病毒学研究工作者同时提供多种表征所需的成像模式,全面的对病毒样品的结构和成分进行分析(图4)。图4. 使用LVEM 5 对HIV膜蛋白结构同时进行(A)TEM和(B)ED分析。(Journal of Virology,DOI:10.1128/JVI.01526-19.)除了拥有高质量成像和多功能集成的特点外,LVEM 5&25的体积小 (无需专业实验室),维护费用低廉(无需冷却水和专用电源),在使用期间基本不会产生任何额外的费用,大大降低了研究所需的成本。另外它采用了真空自闭锁技术,换样仅需3分钟,降低了仪器操作难度,对广大的非专业用户变得更加友善。我们相信随着低压透射电镜的不断发展,LVEM 5&25将成为一个强有力的工具,使得病毒形态的观测变得越来越简单,更多以往被传统电镜所忽略的细节结构信息将被挖掘出来,大的提高研究人员对病毒结构和成分的认知,为人们的科研和生活服务。
  • 我国学者利用超分辨显微镜研究HSV-1病毒复制取得进展
    单纯疱疹病毒(Herpes Simplex Virus, HSV)是影响人类健康的重要病毒之一。HSV-1潜伏感染近90%的人群,重激活时会引起一系列临床症状,轻者有口腔疱疹,重者会导致单纯疱疹病毒脑炎。DNA复制是HSV-1裂解感染阶段的核心事件,涉及到HSV-1基因组、病毒蛋白和宿主蛋白等众多方面的动态变化和有序调控,但是受到现有分子生物学手段和传统荧光显微镜的限制,病毒复制的细节一直难以进行观察。受激发射损耗显微镜(stimulated emission depletion, STED)的分辨率远低于衍射极限,将STED显微技术与传统的免疫荧光(immunofluorescence, IF)和荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization, FISH)技术相结合,能够在亚衍射极限水平获得HSV-1复制过程中的更多细节和信息。  中国科学院昆明动物研究所周巨民课题组与上海徕卡显微镜公司合作,对不同复制阶段的HSV-1基因组、病毒蛋白和宿主蛋白进行超高分辨率图像采集,通过分析发现:(1)STED显微镜能够更可靠地分辨HSV-1基因组的不同区域 (2)HSV-1基因组进入宿主细胞核后,逐渐由压缩状态转变为松散状态,并占据更大的空间位置 (3)病毒蛋白ICP8与复制中的HSV-1基因组密切相关 (4)虽然HSV-1的复制和转录都在病毒复制区内进行,但是这两种生物学过程发生在病毒复制区不同的亚结构内。  该研究工作在线发表在病毒学领域专业期刊Virology Journal上。周巨民课题组的博士研究生李卓然为第一作者,周巨民研究员为通讯作者。该项研究工作得到了中科院百人计划、云南省高端人才项目和云南省自然科学基金重点项目的资助。 文章链接
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