蛋白质实验室

p 耗资7.56亿元、总建筑面积超过3万平方米的高规格实验室，居然免费向各大科研机构开放。 /p p 　　记者8月29日在国家蛋白质科学研究中心(上海)深度体验到这处拥有全世界最顶尖蛋白质相关实验设施的场地如何炫酷。 /p p 　　相关领域的科学家们做尖端实验，再也不用为昂贵的试验设备担心了，通过这个蛋白质研究中心的官网申请，符合要求即可预约在上海做实验，使用全球最好的实验设施。 /p p 　　2017年9月，位于上海的张江实验室揭牌成立，蛋白质实验室成为第一个划入张江实验室的国家重大科技基础设施，由张江实验室统一管理，依托法人单位变更为中科院上海高等研究院。 /p p 　　据悉，只要是获得过国家基金资助的科研项目，无论是高校项目、科研机构项目还是企业项目，都可以通过官网申请到这里来做实验。该试验中心拥有9大技术系统，包括我国自主研制的自动化蛋白质制备系统、蛋白质结构与动态分析系统，300KV电镜为主的集成电镜分析系统、系列质谱组成的蛋白质修饰与相互作用分析系统、超高分辨率显微镜等组成的复合激光显微镜系统等。上述系统各项指标均达到了项目设计的性能指标，部分指标达到国际领先水平。 /p p 　　海归博士后彭超现在是蛋白质实验室质谱系统负责人，他告诉记者，现在质谱系统一周会收到世界各地寄来的约200个样品，每一件样品每一小时都能产生海量的数据，实验室要根据样品提供者的需求，实验并搜集其中有用的数据以帮助科学家们进行下一步研究。 /p p 　　“很多机构的实验室并没有专人做质谱实验、分析，我们的7人团队，能为很多机构专业快速地‘代劳’质谱分析。”彭超说，质检、食药监、公安等部门对质谱分析需求极大，此外质谱分析还可以检测空气污染、尿液小分子超标、疾病蛋白质表达等关键问题，可以发挥的空间很大。 /p p 　　张江实验室脑与智能科技研究院院长、中科院上海分院副院长、院士张旭告诉记者，蛋白质实验室的布局具有重要的战略意义，“蛋白质是脑科学信号传递、采集的主要物质，也是疾病诊断、药物抗体、疫苗、生物技术、现代农业中的重要战略资源。如果把蛋白质相关的生命科学研究和信息技术结合到一起，就可以行进到类脑智能交叉学科。 /p p 　　张旭说，张江这片区域特别适合发展交叉学科的研究。一方面，这里产业、研究机构集聚，“不像大学，一个研究所的研究目的很明确，只研究自己的领域就好” 另一方面，这里正在打造的“张江实验室”为各种机构都提供了进行学科交叉、互动的机会。以蛋白质实验室为例，这里可以进行生命科学、信息技术、工程技术的多方位交叉实验，为未来我国人工智能的发展提供坚实的基础。 /p p br/ /p

蛋白质组学国家重点实验室建设验收会在京顺利召开 　　2009年6月23日，科技部基础研究管理中心在北京组织召开蛋白质组学国家重点实验室(军事医学科学院)的验收会议。实验室验收专家组由9位国内知名专家组成，组长为中国医学科学院的沈岩院士。科技部基础研究管理中心刘燕美副主任，总后勤部卫生部科训局黄殿龙副局长、科技部基础研究司基地建设处周文能处长等出席会议并讲话。 　　验收专家组认真审阅了实验室的建设计划任务书和建设验收申请报告，并通过听取实验室建设报告、现场考察、与实验室固定人员座谈等方式考察实验室的建设情况。一致认为，蛋白质组学国家重点实验室自2007年10月批准建设以来，结合国家需求与学科发展，开展了深入的基础及应用基础研究。凝炼形成了“人类肝脏蛋白质组组成及其功能网络研究”等研究方向。 　　实验室在建设期间，科研成果突出，在蛋白质组新技术新方法、重要蛋白质功能研究、重大疾病分子标志物筛选验证等方面取得了具有国际影响的研究成果，发表了一批高水平学术论文。获得国家自然科学奖二等奖、国家科技进步奖二等奖等4项奖励。 　　实验室队伍规模和年龄结构合理，现有科学院院士1人，国家杰出青年基金获得者4人，并培养和引进了一批年轻的学术带头人和科研骨干，在队伍建设和人才培养方面取得了显著成效。 　　建设期间，实验室健全与完善了各种规章制度，逐渐实现管理制度化。开展了广泛的国内外学术交流，积极参与多项大型国际科技合作计划，举办了3次国际、2次国内学术会议。 　　验收专家组认为，实验室全面完成建设计划任务书中所规定的各项任务。

仪器信息网讯 2014年4月，我国生命科学领域中第一个综合性的国家级重大科技基础设施&mdash &mdash 蛋白质科学研究(上海)设施(以下简称为：上海设施)通过工艺测试，正式进入开放试运行阶段。近日，仪器信息网工作人员参观拜访了上海设施及同步筹建的国家蛋白质科学中心· 上海(以下简称为：上海中心)，一睹这一国家级重大科技基础设施的先进水平和创新风采，上海中心科研项目高级主管汪利俊博士及行政事务主管高馨热情接待了我们。 国家蛋白质科学研究(上海)设施/国家蛋白质科学中心· 上海建筑群 　　为了形成国际一流的蛋白质科学研究体系，并为我国蛋白质科学研究提供&ldquo 利器&rdquo ，2008年11月，&ldquo 蛋白质科学研究设施国家重大科技基础设施项目&rdquo 列入国家高技术产业发展项目计划，项目分北京设施、上海设施两部分，其中北京设施以蛋白质组学研究为主，而上海设施以结构生物学研究为主。 　　两年后的2010年12月，上海设施在上海浦东张江高科技园区内动工建设，总投资7亿元，项目总建筑面积3.3万平方米。而今历经3年多建设，上海设施/上海中心正式进入试运行阶段，预计于今年年底正式面向多用户、多领域开放。 　　据介绍，上海设施配备了蛋白质科学研究所需的各种大型科学仪器设备，以及由上海设施的技术人员自主研发的规模化、系统化技术装备体系。目前，上海设施由基于同步辐射光源的五线六站、规模化蛋白质制备系统、质谱分析系统、核磁分析系统、电镜分析系统、分子影像系统、复合激光显微成像系统、数据库与计算分析系统、动物设施等平台组成，可为在分子水平、细胞水平和个体水平上研究蛋白质、蛋白质复合体、蛋白质机器的结构与功能提供全面和完整的技术与条件保障。 　　在各大平台中，最令上海设施团队自豪的是几项创新：其中一项是将蛋白质表达实现了从&ldquo 手工作坊&rdquo 到&ldquo 智能工厂&rdquo 的转变。目前，在科研界和制药业对于各种蛋白样品的需求日益强烈，但蛋白表达是一个公认复杂、高成本、耗时和资源占用的过程。上海设施规模化蛋白质制备系统自主设计了五套大型自动化装置，将软件控制、硬件设备和生物应用结合在一起，实现了大规模蛋白表达过程的自动化(包括克隆、蛋白表达和纯化)。 高通量自动化克隆系统 　　整个流程实现了自动化，从大规模PCR扩增开始，依次自动进行重组质粒的构建、细胞生长、诱导表达、蛋白表达(构建了大肠杆菌、昆虫细胞、哺乳动物细胞三种表达体系)，最终完成蛋白纯化及蛋白性质表征。以克隆过程为例，实验效率从传统手工一人次一天10个基因克隆提升到一天1000个基因克隆。 　　第二项创新则是分子影像系统自主研发的高精度激光双光镊系统。据悉，设备的所有零部件都购自现成。光镊采用激光辐射压对微米级粒子进行捕获，并通过高精度的测量技术实现亚纳米级位移和亚皮牛级力的测量。依靠这套系统，激光是&ldquo 镊子&rdquo ，能研究蛋白质如何折叠、变形，以及大分子生物酶的工作原理。高精度激光双光镊系统 　　第三项创新则是上海设施团队基于平台开发的相关研究方法。有了最先进的仪器，没有相应的研究方法也是枉然。为此，上海设施/上海中心的年轻PI们除了从事科学研究外，方法开发也是他们工作的重点。 　　以核磁系统分析平台为例，上海设施目前拥有5台核磁共振波谱仪，其中有国内第一台最高磁场强度的核磁共振设备(布鲁克900M NMR)，主要用来测试蛋白质的溶液结构。上海中心PI周界文带着研究人员开展了核磁共振新技术的开发和新方法的研究。目前新方法的主体研究已完成，正进入软件测试阶段，对推广核磁共振技术在结构生物学领域的广泛应用有重要意义，特别是对依托高场强核磁共振设施进行大蛋白质的三维结构测定过程将更加可行。 布鲁克900M 核磁(左)、安捷伦800兆核磁(中)、安捷伦600兆核磁(右) 布鲁克600兆核磁(左)、安捷伦700兆核磁(右) 核磁系统分析平台一览 　　同样，上海设施的质谱分析系统平台也很强大，拥有赛默飞、AB SCIEX、安捷伦、沃特世等主流质谱品牌的仪器13台，是全国目前最大、质谱仪器种类最全的质谱分析平台之一。这个实验室在上海中心PI黄超兰的主持下，已自主研发了一系列国内其他实验室尚不具备的研究手段，吸引了全国各地甚至美国的诺奖获得者的研究组等多家科研单位前来合作，在短短半年间已有超过70多个合作项目在进行。 赛默飞质谱系统 (2台 Q Exactive、1台LTQ Orbitrap XL、1台LTQ Orbitrap Elite、1台 LTQ Orbitrap Elite-ETD) AB SCIEX质谱系统 (左上：QTRAP 6500、左下：Triple TOF 5600+、右：MALDI-TOF/TOF 5800) 安捷伦质谱系统 (1台 6530Q-TOF、1台6550 ifunnel Q-TOF、1台6490 QQQ) 沃特世质谱系统 (左：Xevo TQ-S 右：Synapt G2-Si HDMS) 质谱分析系统平台一览 (左：FEI TitanKrios 300kV 球差矫正透射电镜 右上：FEI TF20 场发射冷冻透射电镜 右下：FEI T12 冷冻透射电镜) 电镜分析系统平台一览 (左上：ZEISS Cell Observer SD 转盘式激光共聚焦 左下：NIKON N-SIM 超高分辨率显微镜 右上：LEICA SP8 激光共聚焦显微镜 右下：OLYMPUS FV1200MPE 双光子显微镜) 复合激光显微成像系统平台一览 　　此外，上海中心还自主研发了一套科研物资管理系统(e-Supply)，所有实验室的研究人员都可通过ID登录系统下单购买实验试剂、耗材，资金从课题组经费账户中扣除，而上海中心则能以&ldquo 团购&rdquo 方式，拿到最优的价格。并且上海设施还为供应商提供了库存仓库，供应商只需付较少的费用就可以把上海设施常用的试剂、耗材存于此，这样也极大方便了研究人员，省去了试剂耗材运送的时间。现该系统已获国家计算机软件著作权，除管理上海中心物资外，还兼管筹建中的上海科技大学的物资，不久有望在中科院其他研究院所推广。 科研物资管理系统(e-Supply) 供应商在上海设施库存的商品 数据库与计算分析系统机房 　　上海设施不仅仅是一个供科学家使用的科研平台，更是一个具有强大科研能力的科学中心。目前，上海中心有PI 14位，仅在上海设施试运行期间，上海中心各研究组就已获得了包括中科院战略性先导科技专项和国家重大科学研究计划项目在内的多项重大课题，相关研究成果已在《自然》、《癌细胞》等国际著名学术刊物上陆续发表。 　　许琛琦研究组在阐明人体免疫机制方面取得突破性进展，首次证明钙离子能够改变脂分子功能来帮助T淋巴细胞活化，提高T淋巴细胞对外来抗原的敏感性，从而帮助机体清除病原体。 　　周界文研究组在研究重要离子通道蛋白p7的精细空间结构以及p7与抑制剂金刚烷胺类药物相互作用的分子机理方面也取得重大突破，相关研究成果将大大推动新一代抗丙型肝炎病毒治疗手段的研发。 　　周兆才研究组研究发现原癌蛋白质YAP的一个天然拮抗剂蛋白&mdash VGLL4，并在蛋白质晶体结构解析的基础上发展出一个针对YAP的多肽类抑制剂，为以胃癌为代表的肿瘤治疗提供了新的策略和途径。 　　雷鸣、张荣光研究组的研究论文首次在原子水平上解析了端粒酶的结构，第一次从原子层面对脊椎动物端粒酶复合物中蛋白质-RNA的相互作用进行了描述。 　　未来，上海设施将对中国乃至全球的科学家开放，旨在让上海设施发挥其更大的作用与价值。(撰稿：杨娟) 　　附录：国家蛋白质科学研究(上海)设施及国家蛋白质科学中心· 上海网址 http://www.sibcb-ncpss.org/ 　　http://www.ncpss.org

日前，国家中医药管理局公布了评审认定的国家三级中医药科研实验室名单，深圳市二医院吴正治研究员为学术带头人创建申报的深圳市中西医结合研究所“蛋白质组学实验室”榜上有名，该实验室是全国唯一的蛋白质组学国家三级实验室。

安捷伦科技总裁拜访中科院生物物理研究所 并为蛋白质组学合作实验室揭牌 2010年4月16日，北京---世界知名测量测试公司安捷伦科技(NYSA:A)今天宣布，安捷伦科技公司总裁兼首席执行官邵律文先生（William P. (Bill) Sullivan）日前访华，拜访了中国生命科学研究领域知名科研机构中科院生物物理研究所，并为生物物理研究所&mdash 安捷伦科技蛋白质组学合作实验室揭牌。 4月13日下午，安捷伦科技公司总裁兼首席执行官邵律文（William P. (Bill) Sullivan）先生、大中华区总裁霍丰先生、生命科学与化学分析集团大中华区总经理牟一萍女士等一行六人参观访问了生物物理研究所，与蛋白质科学国家实验室（筹）主任、生物物理研究所所长助理许瑞明研究员、蛋白质组学技术实验室质谱首席技术专家杨福全研究员等进行了会谈。许瑞明研究员代表生物物理研究所对邵律文先生一行的来访表示热烈的欢迎，并就中国生命科学的发展现状和发展趋势、国家有关的科技政策以及生物物理所的概况及未来规划等做了简要的介绍。随后，杨福全研究员简要介绍了中国蛋白质组学研究的现状和发展趋势，并重点介绍了生物物理所蛋白质组学技术实验室的研究进展和未来发展规划。邵律文先生表示中国科学院以及生物物理研究所一向是安捷伦的重要客户和合作伙伴，非常高兴能够有机会拜访生物物理研究所。邵律文先生随后通报了安捷伦科技近年在全球和中国的发展战略，以及未来业务发展的科学领域和在中国的战略考虑，并表示非常关注和重视中国生命科学市场的发展趋势和巨大潜力，希望通过加强双方高层的联系，进一步深化彼此间的长期合作。 杨福全、许瑞明、邵律文、牟一萍见证蛋白质组学合作实验室启动揭牌 会谈结束后，许瑞明研究员和邵律文先生共同为中国科学院生物物理研究所-安捷伦科技蛋白质组学合作实验室正式启动揭牌，并互赠礼品，衷心祝愿双方的合作取得圆满成功。生命科学与化学分析集团大中华区总经理牟一萍女士表示：&ldquo 生命科学是安捷伦全球战略重点，中国生命科学市场更是关注的重点。此次蛋白质组学合作实验室的启用，就是安捷伦科技公司持续关注中国生命科学领域发展，重视国内科研人员需求的充分证明。&rdquo 许副所长向邵律文总裁赠送礼物 生物物理研究所目前拥有&ldquo 生物大分子国家重点实验室&rdquo 、&ldquo 脑与认知国家重点实验室&rdquo 、&ldquo 蛋白质科学国家实验室&rdquo 等国家级实验室，并且承担了多项国家重大科研任务，在蛋白质科学研究领域已经形成了人才、设备、技术和经验等综合优势。安捷伦科技则是全球著名的专业分析测试设备和服务的高科技公司，在生命科学和分析化学等领域近年来已跃居全球前列。蛋白质组学合作实验室的启动势必成为双方相互协作、相互启发、取长补短、共同研究的科研创新平台。目前，蛋白质组学合作实验室里配备了安捷伦全线的液质联用产品平台，是世界领先分析仪器与中国优秀科研力量的完美结合，将通过国际化合作和资源整合，为中国的蛋白质组学研究做出贡献。 最后，许瑞明研究员和杨福全研究员等陪同客人参观了蛋白质组学技术实验室和院士墙，并在生物物理所主楼前合影。 许瑞明副所长向邵律文总裁介绍实验室 关于安捷伦科技 安捷伦科技（NYSE: A）是全球领先的测量公司，是通信、电子、生命科学和化学分析领域的技术领导者，公司的17,000名员工在110多个国家为客户服务。在2009财政年度，安捷伦的业务净收入为45亿美元。要了解安捷伦科技的信息，请访问：www.agilent.com.cn。

2014年3月12日，上海——今天，GE医疗生命科学与国家蛋白质科学中心上海（简称“中心”）的共建生命科学实验室在张江正式启用。这是GE公司在中国继成都卓越客户中心后又一个专注于科研与应用市场的研究平台。GE医疗生命科学部大中华区总经理牟一萍女士和国家蛋白质科学中心主任雷鸣教授共同出席了启用仪式并为实验室揭幕。 GE医疗作为世界知名的生命科学设备供应商，此次携手具有一流人才与科研水平的国家蛋白质科学中心，整合双方强大的生命科学设备与技术资源，将藉由该共建实验室的成立，创建国内首个合作型蛋白和细胞技术平台，通过方法开发，应用合作和专业人才培养，助力在结构生物学，生物医药、以及转化医学等领域的研究和应用转化，切实推动中国生命科学领域的研究和发展。 牟一萍总经理在致辞时表示，生命科学作为GE医疗集团的核心业务之一，坚持通过不断创新与技术合作来与全世界科学家共同探索生命科学的奥秘。此次与国家蛋白质科学中心合作共建生命科学实验室，是继2012年生命科学研发培训中心Fast Trak在上海落成，2013年生命科学卓越客户中心CoE在成都落成后，GE医疗致力于“立足中国，服务中国”在生命科学领域的又一重大举措。 合作共建生命科学实验室将借助国家蛋白质科学中心强大的蛋白质科学研究平台，引进GE医疗国际领先的技术和设备，实现强强联合，优势互补，携手共赢，共同推进中国生命科学的发展。 雷鸣教授在致词时也表示，中心的成立属于国家“十一五”战略规划之列，旨在结合国家蛋白质科学设施运维、研究及服务外部用户等定位，凝聚人才致力于蛋白质科学的研究。由于中心作为国家的大科学装置，将基于蛋白质设施独一无二的综合性、交叉性的科研仪器设备，重点投入力量推进新技术、新方法的研究与发展。此次中心携手GE医疗集团，将共同推进这一目标的达成。 目前，共建实验室针对蛋白质研究配备了AKTA purifier，AKTA pure，AKTA start系列蛋白纯化系统，Biacore T200生物分子相互作用系统，ITC200等温滴定量热仪，Cytell细胞图像分析仪，NanoVue Plus超微量分光光度计以及双向电泳仪等。未来，双方还将根据研究需要不断完善实验室的硬件设备。 据悉，GE医疗生命科学卓越客户中心未来将根据中国市场，尤其是科研及应用领域用户的需求，开发应用技术和方法，其范围涵盖细胞培养、基因重组、细胞收获、目标分离、目标纯化、目标活性等研究，并开发中药提取、有效成分鉴定、有效成分毒理与药理分析等。 人才培训将是该共建实验室的另一项重要职能。未来，这里作为GE医疗生命科学部在东部地区的主要培训基地，将为广大用户提供更加完善而系统化的产品及应用培训课程，更好满足华东地区客户的需要。 值此共建实验室启用之机，GE医疗生命科学部还举办了GE纯化系统和细胞图像分析仪新品见面会，详细介绍并演示了GE医疗蛋白纯化家族新成员--AKTA start入门级实验室制备色谱系统，以及最新发布的Cytell细胞图像分析仪。两款产品都非常适合蛋白质研究实验室，既操作简便满足常规实验室分析，又具备强大完善的功能为研究人员提供可靠的数据。会后，与会者又参观了位于张江华佗路的GE中国科技园区和生命科学FastTrak实验室。

2010年4月13日下午，安捷伦科技公司总裁兼首席执行官邵律文(William P. (Bill) Sullivan)先生、大中华区总裁霍丰先生、生命科学与化学分析集团大中华区总经理牟一萍女士，中国区公共事务总监付向东先生等一行六人参观访问了中科院生物物理研究所，并举行中国科学院生物物理研究所-安捷伦科技蛋白质组学合作实验室揭牌仪式。 　　蛋白质科学国家实验室(筹)主任、生物物理研究所所长助理许瑞明研究员，国际合作与交流处张蕾处长，蛋白质组学技术实验室质谱首席技术专家杨福全研究员等接待了来访客人，并进行了简短的会谈。许瑞明代表生物物理研究所对邵律文先生一行的来访表示热烈欢迎，并就中国生命科学的发展现状和发展趋势、国家有关的科技政策以及生物物理所的概况及未来规划等做了简要的介绍。许瑞明表示，生物物理研究所目前拥有“生物大分子国家重点实验室”、“脑与认知国家重点实验室”、“蛋白质科学国家实验室”等国家级实验室，并且承担了多项国家重大科研任务，在蛋白质科学研究领域已经形成了人才、设备、技术和经验等综合优势。 　　安捷伦科技是全球著名的专业从事分析测试设备和服务的公司，在生命科学和分析化学等领域近年来已跃居全球前列。希望蛋白质组学合作实验室成为双方相互协作、相互启发、取长补短、共同研究的科研创新平台。随后，杨福全研究员简要介绍了中国蛋白质组学研究的现状和发展趋势，并重点介绍了生物物理所蛋白质组学技术实验室的研究进展和未来发展规划。邵律文先生亦表示中国科学院以及生物物理研究所一向是安捷伦的重要客户和合作伙伴，非常高兴能够有机会拜访生物物理研究所。邵律文先生随后通报了安捷伦科技近年在全球和中国的发展以及未来业务发展的科学领域和在中国的战略考虑，并表示非常关注和重视中国分析市场的发展趋势和巨大潜力，希望通过加强双方高层联系，进一步深化彼此之间的长期合作。 　　会谈结束后，许瑞明和邵律文为中国科学院生物物理研究所-安捷伦科技蛋白质组学合作实验室正式启动揭牌，并互赠礼品，衷心祝愿双方的合作取得圆满成功。最后，许瑞明、张蕾和杨福全等陪同客人参观了蛋白质组学技术实验室和院士墙，并在主楼前合影。 　　中国科学院生物物理研究所-安捷伦科技蛋白质组学合作实验室的成立是研究机构和企业的积极合作，双方的合作将为中国乃至蛋白质组学研究的发展做出贡献。

3月10日，封面新闻记者从天府锦城实验室（未来医学城）获悉，四川大学华西医院临床检验医学研究中心与生物治疗全国重点实验室、天府锦城实验室（未来医学城）耿佳教授和华西第二医院陈路教授联合团队在生物传感与蛋白质测序领域取得重要进展。耿佳教授、陈路教授（左四、左五）与主要作者合影（左至右：陈山川、张丹、张明、王紫纯、唐超）。摄影：谢忱据了解，每个人体内都有超过百万种蛋白质，与水、脂肪和无机物等共同构成生物体。蛋白质是生命活动的主要承担者，例如胰岛素和胰高血糖素控制血糖高低；视紫质能够感应光子，对于正常视觉功能必不可少。许多疾病的发生与蛋白质的异常直接相关，例如缺乏凝血因子会引起血友病；异常淀粉样蛋白斑可损害神经元，是阿尔茨海默病的潜在诱因。破译蛋白质信息是探索生命现象、促进人类健康的关键一环。该研究成果阐明了纳米孔单分子检测新策略，实现了对全部20种天然氨基酸的直接区分，提出并验证了纳米孔外切酶实时多肽测序（Nanopore Exopeptidase Real-time Peptide Sequencing, NEPS）方法，为实现单分子蛋白质测序提供了可行途径，展示出生物传感器技术与人工智能算法结合的优异潜力。NEPS技术为最终破译“生命天书”、更精准的疾病诊断和治疗、更快的药物开发提供有力工具，同时代表我国生物传感技术与蛋白组学工具的原始创新能力进入全球前沿方阵。相关成果日前在线发表于《自然方法》。相关成果日前在线发表于《自然方法》近年来，成都未来医学城围绕高质量发展和科技创新时代主题，依托成渝地区双城经济圈国家战略，以临床医学转化为创新原点，专注创新成果转化、孵化。2023年7月，天府锦城实验室（未来医学城）耿佳教授团队联合卢克锋教授、戚世乾教授、李绘绘教授等团队共同在世界知名学术期刊《Nature Communications》发布学术文章，半年后，天府锦城实验室（未来医学城）耿佳教授团队再传喜报，提出并验证了纳米孔外切酶实时多肽测序（Nanopore Exopeptidase Real-time Peptide Sequencing, NEPS）方法，研发领域成果喜人。截至目前，天府锦城实验室（未来医学城）成功导入高能级科研团队14支，其中院士级团队3支，聚集研发人才200人；承担国家级科研课题3项、省级课题2项，发表SCI论文7篇，注册企业19家。成都未来医学城下一步，成都未来医学城将充分发挥成渝双城经济圈建设国家战略及区位优势，搭建集技术开发、概念验证、小中试等功能为一体的成果创新转化平台，打通基础创新源头和科技成果转化的“最后一公里”，促进创新链、产业链、资金链、人才链深度融合，护航科技创新策源转化，提升创新成果转化效率，助力成都加快形成新质生产力。

仪器信息网讯 1月28日，军事科学院军事医学研究院“蛋白质组学国家重点实验室”，通过国家标准化体系认可，这是全军首家通过这一体系认证的科研实验室。该实验室领衔实施了中国人蛋白质组计划，致力于从蛋白质组学科领域探索攻克癌症的方法。科研成果在国家科技部连续两个5年评估中蝉联优秀。蛋白质组学国家重点实验室成为全军首家通过国家认可单位。军事科学院军事医学研究院副院长夏晓东表示，将以一流的科研管理，规范的科研活动，更好的为一些事业，为人民群众的健康提供更加优良的科研成果。

p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" strong 厦门大学韩家淮院士实验室在Nature Methods上发表了基于SCIEX TripleTOF& nbsp 5600+高分辨液质系统的新型SWATHTM蛋白质组定量技术数据处理方法。 /strong /span /p p br/ /p p style=" TEXT-ALIGN: center" & nbsp & nbsp img style=" WIDTH: 413px HEIGHT: 281px" title=" 1.png" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201510/uepic/ee308b77-9492-4124-b435-cb773c50aca3.jpg" / /p p 左一是文章通讯作者钟传奇博士，左二是SCIEX公司组学应用支持经理郭立海博士，左三是实验室仪器管理员谢昌传博士，左四是分析测试中心副主任陈晋安高级实验师。 /p p br/ /p p br/ /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 中国科学家开展蛋白质组研究已走过十几年历程，在此领域取得了重多成就，然而在里程碑式的学术刊物Nature或Nature系列刊物上发表有关蛋白质组学的文章还是凤毛麟角，完成这个目标一直是从事蛋白质组学研究的中国学者心中的愿望。就在此时，我们得到喜讯，厦门大学韩家淮院士实验室5年磨一剑，高效的团队，在短短的时间内就取得了非常骄人的成果，令所有从事蛋白质组研究的工作者为之骄傲，利用SCIEX的TripleTOF span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 高分辨液质系统将其蛋白质组研究推到了世界顶级水平，并于2015年10月6日在Nature Methods（2014年影响因子32）上发表了他们的成果。成功的在他的实验室开发出新型蛋白质组定量技术SWATH sup TM /sup 的数据处理软件。 /p p br/ /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp SCIEX公司得知用户的工作达到如此高的国际水准非常高兴，这也是对SCIEX公司产品和技术最大的肯定和鼓励。为了解更多韩院士实验室的工作, 我们专门采访了该文的通讯作者之一，韩家淮院士的博士后钟传奇博士，了解他们实验室的工作内容和该文章的核心思想，以便给我们广大的质谱工作者和SCIEX质谱仪器用户有所启发。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 1 韩院士实验室的主要研究内容是什么？有哪些方向？ /span /p p 答：韩老师实验室主要研究内容是在先天性免疫反应中细胞内信号的传导，具体有细胞程序性坏死的机制，p38信号通路在细胞应激反应中的调控机制等等。但是，蛋白质组并不是主要研究方向，只是其中一小部分，只有3-4个人在做这方面的研究，都是在我的带领下进行的。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 2 实验室开展蛋白质组研究的历史或历程？蛋白质组平台是怎样的构成？ /span /p p 答：我（钟传奇博士）在2010年来到韩老师实验室做博士后，韩老师觉得蛋白组是一个强有力的工具，所以要我来负责蛋白组学的研究。现在平台只有2台SCIEX公司的质谱仪，一台TripleTOF span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 5600和一台TripleTOF span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 5600+。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 3 为什么连续购买SCIEX的TripleTOF？怎样评价现在的平台？ /span /p p 答：主要是因为TripleTOF span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 5600是一个高分辨率高灵敏度的质谱，扫描速度快，而且5600可以实现新型的蛋白质组定量技术---SWATH sup TM /sup 。购买之后用了差不多4年，一直运行很稳定，数据产出也很多，我们使用比较满意，所以考虑到生科院的使用情况就又买了一台。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 4 蛋白质组学平台取得了哪些科研成果？ /span /p p 答：蛋白组学平台还是取得了比较多的成绩，在纯蛋白组领域，我们在如下杂志Molecular Cell Proteomics （2012），Proteomics（2014）和Nature Methods (2015)发表了一系列文章. 在其他领域，我们利用蛋白组为工具推进了其他课题研究的进步，在如下期刊JBC (2013), Cell Host Microbe(2015)和Nature Cell Biology (2015)发表了一系列文章。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 5 怎么评价这种SWATH sup TM /sup 全新的蛋白质组定量技术？和其他定量技术比较有什么好处？未来期望哪些地方可以进一步提升？ /span /p p 答：SWATH sup TM /sup -MS 是一个全新的蛋白质组定量技术，是DIA技术的一种。虽然DIA很早之前就出现了，但是SWATH sup TM /sup -MS是第一个把灵敏度和可使用性结合的最好的技术。相比基于IDA的定量技术如SILAC、iTRAQ和label-free，其优点在于能在多个样品之间对肽段进行良好的一致性定量，即SWATH sup TM /sup 的定量准确性、重现性和全面性是其他方法无法比拟的。我觉得，SWATH sup TM /sup -MS的灵敏度还可以再进一步地提高。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 6 为什么仅仅一个软件就可以发表在Nature Methods上？ /span /p p 答：SWATH sup TM /sup -MS是一个全新的，并且拥有很多优点的蛋白组定量技术，已经被该领域广泛接受和应用，其应用有非常好的前景。但是其后续的信息学处理软件却非常缺乏，尤其是SWATH sup TM /sup 数据直接做蛋白质鉴定。所以这个软件开发解决了一个大家都比较关心的问题。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 7 文章里说的Group-DIA的设计思路是什么，比其他的处理软件有哪些优势？ /span /p p 答：SCIEX的SWATH sup TM /sup 2.0商业化软件和Open-SWATH sup TM /sup 在做定量时，需要构建Library，而Group-DIA想解决的主要问题是不需要建library就可以直接实现定量，即对SWATH sup TM /sup 数据同时做蛋白鉴定和定量。其主要的思路是Group-DIA软件在发现母离子和其子离子对的时候，整合了多个样品的信息，故Group-DIA软件能在SWATH sup TM /sup -MS数据里鉴定和定量到比其他软件如DIA-Umpire更多的肽段。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 8 这个软件SCIEX的其他用户可以免费试用吗？到哪里可以下载？ /span /p p 答：当然可以，我们非常欢迎同行来使用这个软件，Group-DIA是开源软件。我们会对软件进行持续更新。我们的Nature Methods文章有提供下载地址。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 9 SCIEX自去年就已经将SWATH sup TM /sup 升级到了2.0，定量数据质量的提升很大，您怎么看待SCIEX公司的商业化SWATH sup TM /sup 2.0数据处理软件？咱们的Group-DIA软件和这个有比较吗？是一个互补吗？ /span /p p 答：我们也购买了SCIEX公司的商业化SWATH sup TM /sup 2.0数据处理软件，用起来很方便。SCIEX公司的SWATH sup TM /sup 2.0数据处理软件是基于库的SWATH sup TM /sup 分析软件，Group-DIA是不依赖于库的SWATH sup TM /sup 分析软件，不是很好比较。这两个软件是很好的互补。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 10 SCIEX公司已经推出了OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 云端多组学数据分析平台，可以在云端来做SWATH sup TM /sup 数据分析，并可以进行后续的生物信息学分析，同时可以和基因组学数据进行整合分析，帮助科学家更方便的一站式挖掘深层次的生物学意义，您怎么看待OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span ? /span /p p 答：SWATH sup TM /sup 的数据处理是一个较复杂的过程，OneOmics sup ? /sup 是一个很好的平台，可以将很多的复杂的过程简单化，处理速度要比本地快很多，利于科学家使用。而且可以在一个云环境里做好多生物信息学分析，非常方便，很容易找到一些有意义的信息。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 11 OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 是一个开放式的云端计算平台，科学家可以将自己开发的软件APP放上去，让更多的人使用，咱们有兴趣将Group-DIA代码放进OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 平台吗？ /span /p p 答：我当然希望能将Group-DIA整合到OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 平台，但是中间可能会有一些兼容问题，我们可以和SCIEX合作解决这些问题，将Group-DIA代码放到OneOmics span style=" FONT-SIZE: 13px" & nbsp /span 平台，让更多的同行来应用。 /p p br/ /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 韩院士实验室在钟博士的带领下，蛋白质组研究能取的这么好的成绩，就像钟博士讲的质谱平台是基础，对质谱和蛋白质组学的技术深入理解是关键，抓技术热点是捷径。所以，我们也希望广大的SCIEX用户能够充分发挥仪器的优势，做出更多更杰出的科研成果，让中国科学家在国际同行中产生更大的影响力。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" strong 韩家淮教授 /strong /span /p p & nbsp /p p img title=" 2.jpg" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201510/uepic/3c3e81b6-c28c-4891-a225-03442b0d6d10.jpg" / /p p br/ /p ul style=" LIST-STYLE-TYPE: disc" class=" list-paddingleft-2" li p 厦门大学生命科学学院教授 /p /li li p “千人计划”特聘教授 /p /li li p 长江学者特聘教授 /p /li li p 中国科学院院士 /p /li /ul p br/ /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 韩家淮教授是先天性免疫信号传导领域的世界知名学者，在世界上率先发现p38信号通路。细胞内存在多条信号通路以介导不同的生物学反应。p38信号通路是细胞内最重要的信号通路之一，它在许多生物学反应包括细胞周期调控、细胞增殖、发育、分化、衰老、凋亡、免疫反应及肿瘤发生中起重要作用。韩家淮教授领导的实验室在p38信号通路的研究领域一直保持世界领先地位。 /p p br/ /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" 细胞应激生物学国家重点实验室 /span /p p span style=" COLOR: rgb(0,176,240)" br/ /span /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp “细胞应激生物学”国家重点实验室（厦门大学）于2010年9月在原“细胞生物学与肿瘤细胞工程”教育部重点实验室和“福建省癌症生物学”重点实验室的基础上申请建设，于2011年10月获科技部批准建设。现任国重实验室主任为韩家淮教授，学术委员会主任为王志新院士。 /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 实验室以细胞应激反应为主线，重点围绕着细胞应对外界刺激的应激反应生物学、细胞应对自身癌变的应激反应生物学、细胞应对代谢状况变化的应激反应生物学这三个方向开展研究。实验室秉承“边建设边运行”的方针，以基础理论研究为根本，结合应用基础研究，从分子、细胞和个体水平上深入地研究炎症应激反应、肿瘤胁 迫应激反应和代谢应激反应等细胞应激生物学研究领域的关键科学问题。通过多方位、多学科、多层次的联合研究，力求全面提高实验室在细胞应激生物学研究领域的综合实力，为国家人口与健康领域的需求做出重大贡献，并以优秀的原创性成果和高水平人才队伍跻身国际知名研究中心和人才培养基地之列。 /p p br/ /p

2009年7月20号，英国赫默尔亨普斯特德&mdash 服务科技，世界领先的赛默飞世尔科技公司在英国的癌症研究院（ICR）宣布一项整合生物网络的合作。癌症研究院是世界上新型、先进的蛋白质组学实验室，配有完整的Thermo Scientific蛋白质组学工作流程。包括Kingfisher Flex自动样品制备系统，TSQ Vantage&trade 三重四级杆质谱和两台最新的LTQ Orbitrap Velos&trade 质谱仪。这套完整的工作流程给癌症研究院的研究提供了强大的技术支持。 癌症研究院的细胞与分子小组主任，Rune Linding博士说：&ldquo 通常情况下，癌症研究主要集中在研究个别基因或蛋白质的功能和行为。而癌症研究院的研究主要是集中在癌细胞网络如何相互作用，在组织中转移、蔓延到整个身体。通过建模和模拟癌细胞如何与更大生物网络发生相互作用，癌症研究院的科学家希望取得突破，研制出新药和治疗办法，阻止癌细胞的转移，这一过程将能救治90%的癌症病人。 Linding博士补充说道：&ldquo 研究动态的细胞网络需要高性能的质谱仪。LTQ Orbitrap Velos 和TSQ Vantage系统能够使我们拓展和全面分析细胞信号网络，并对这些网络进行大规模的动态研究。我们相信癌症的恶化就是由于这些分子网络的变化所带来的，这一研究具有重大的意义。 癌症研究院的细胞与分子生物学部主席，Chris Marshall教授补充说：&ldquo 此外，我们想把质谱分析的数据和其他数据（如RNAi筛选）整合起来，这样可以产生详细的的过程模型，如在侵染和转移方面，如此细致的了解对于研究整体信号网络而不是其中某一个已知的节点是非常重要的&rdquo 。 双方的合作包括一系列赛默飞世尔科技的解决方案，包括实验室仪器，RNA沉默，蛋白试剂，质谱和相关的服务。赛默飞世尔科技蛋白质组团队负责人Anthony Sullivan说，&ldquo 我们非常高兴能够将我们特有的能力应用于研究中，很高兴能够有机会与这么多有天赋的科学家进行紧密的合作。&rdquo 如果需要更多的Thermo Scientific蛋白质组学解决方案的信息，请访问www.thermo.com/proteomics 。 癌症研究院 癌症研究院是是欧洲领先的癌症研究中心，有很多从事前沿研究的科学家。在2009年，癌症研究院在癌症预防、诊断和治疗方面的研究已经有100年了。在2008年12月，癌症研究院被泰晤士报高等教育的卓越表评为英国领先的学术研究中心。癌症研究院依靠的是社会募捐，她也是世界上最有成本效益的癌症研究组织之一，每英镑有95便士直接支持研究。如果需要更多的信息，请访问http://ww.icr.ac.uk Thermo Scientific是科学服务领导者赛默飞世尔科技的首要品牌。 关于Thermo Fisher Scientific（赛默飞世尔科技） Thermo Fisher Scientific(赛默飞世尔科技)（纽约证交所代码：TMO）是全球科学服务领域的领导者，致力于帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。公司年销售额超过105亿美元，拥有员工约34,000人，在全球范围内服务超过350,000家客户。主要客户类型包括：医药和生物公司，医院和临床诊断实验室，大学、科研院所和政府机构，以及环境与工业过程控制装备制造商等。公司借助于Thermo Scientific和Fisher Scientific这两个主要的品牌，帮助客户解决在分析化学领域从常规的测试到复杂的研发项目中所遇到的各种挑战。Thermo Scientific能够为客户提供一整套包括高端分析仪器、实验室装备、软件、服务、耗材和试剂在内的实验室综合解决方案。Fisher Scientific为卫生保健，科学研究，以及安全和教育领域的客户提供一系列的实验室装备、化学药品以及其他用品和服务。赛默飞世尔科技将努力为客户提供最为便捷的采购方案，为科研的飞速发展不断地改进工艺技术，提升客户价值，帮助股东提高收益，为员工创造良好的发展空间。欲获取更多信息，请浏览公司的网站：www.thermo.com.cn

国家蛋白质科学中心上海与美国丹纳赫生命科学公司共建示范实验室正式启用 2014年10月20日，国家蛋白质科学中心上海（筹）与丹纳赫生命科学公司的共建示范实验室在上海国家蛋白质科学中心正式启用。这是丹纳赫公司在中国继北京联合实验室后又一个专注于科研与应用市场的研究平台。上海生科院生化与细胞所副所长&国家蛋白质科学中心上海主任雷鸣教授与丹纳赫集团公司亚太区高级副总裁&中国区总裁Jon Clark共同出席了签约仪式并为实验室揭幕。 图1-双方领导签署并交换合作协议 图2-揭牌仪式 丹纳赫集团作为目前全球最大的跨国仪器公司，此次携手具有一流人才与科研水平的国家蛋白质科学中心，整合双方强大的生命科学设备与技术资源，将藉由该共建实验室的成立，创建国内首屈一指的蛋白质组研究平台，在食品安全、生物医药以及转化医学等领域实现快速的分析检测，切实推动中国生命科学领域的研究进程。用户在此整合实验室，可以体验到蛋白科学研究流程中所需的包括AB SCIEX、Beckman Coulter、Leica Microsystems以及Molecular Devices公司设备在内的各种高端测试仪器、软件和技术。此外，本共建示范实验室还可为用户提供样本处理、技术咨询、工作流程分析，并致力于为生命科学的研究者开展合作与交流提供平台。 图3-合作双方领导团队在签约后合影 雷鸣在接受生物谷记者采访时表示，通过在国家蛋白质科学中心设备建设阶段与丹纳赫集团及旗下生命科学公司AB SCIEX、Beckman Coulter、Leica Microsystems以及Molecular Devices的合作，我们充分体会到了与国外先进公司合作的优势。尤其值得一提的是，我们在与Beckman Coulter公司的合作过程中，建造了五套大型的蛋白质制备和高通量筛选系统，实现了大规模蛋白表达过程的自动化，并且拥有了自己的知识产权，这次合作非常成功。 目前在我国生命科学研究领域中，国产生命科学仪器少之甚少。雷鸣表示，希望与丹纳赫集团的这次合作能够使得新兴的生物技术尤其是生命科学研究仪器技术得到更多的重视，使得我国在高端实验仪器开发及生物技术研制上有更大的进步。“在科研文化方面，希望我国科学家在研究过程中能够着眼于生物产业相关领域，在从科研到产业的转变过程中引入更加先进的思想，同时学习国外先进科学文化氛围，顺应我国经济转型的潮流，创造新的经济增长点。” 据了解，国家蛋白质科学中心与丹纳赫的本次合作领域主要集中在Beckman Coulter克隆、构建、以及蛋白质的表达与提纯环节。国家蛋白质科学中心希望将来能够利用自动化的先进技术，在生命科学的其他领域，例如抗体的筛选、细胞实验、药物筛选等方面与丹纳赫集团展开更加深入的合作。 此次签约仪式也将全面开启国家蛋白质科学中心计划与丹纳赫集团旗下生命科学公司Leica Microsystems、AB SCIEX以及Molecular Devices在相关技术领域的推广、应用及开发的合作洽谈。对于今年因为超高分辨率荧光显微技术而获得诺贝尔奖的显微成像技术领域，雷主任表现出了极大的兴趣。 签约仪式之后，合作双方领导团队对共建实验室进行了参观，并详细介绍了双方合作的多个技术领域及成果。据了解，目前国家蛋白质中心所属的九大技术系统已经配备了多项丹纳赫集团的产品：包括AB SCIEX的串联质谱系统、BeckmanCoulter的高通量细胞培养自动化系统和离心系统、Leica Microsystems的激光扫描共聚焦显微镜以及Molecular Devices的高通量实时克隆挑选分析系统。这些设备都在国家蛋白质中心发挥了不可替代的作用。 图4-共建实验室参观 关于国家蛋白质科学中心上海国家蛋白质科学中心上海（筹）/国家蛋白质科学研究（上海）设施是国家重大科技基础设施，以各种大型科学仪器和先进技术集成为核心的规模化、系统化技术装备体系，具有不同的空间分辨率和时间分辨率的研究技术装备。中心覆盖蛋白质结构与功能在空间尺度和时间尺度变化范围的全部研究技术系统，为在分子水平、细胞水平和个体水平上研究蛋白质、蛋白质复合体、蛋白质机器的结构与功能提供全面和完整的技术与条件保障，为我国的蛋白质科学基础研究提供强有力的支撑，将成为国家蛋白质科学和技术的重要创新基地。详情请点击中心网站：www.ncpss.org. 关于美国丹纳赫集团生命科学公司丹纳赫是全球领先的科学与技术创新产品与服务的设计商及制造商，主要服务于专业领域、医疗领域、工业领域及商业领域的客户。在服务的众多领域中，其主要品牌均获得了用户的高度认可。丹纳赫业务系统为来自全球25个国家的63,000位用户提供了一个平台。仅在2012年期间，丹纳赫集团就创造了183亿美元的总收入。如需了解更多信息，请访问我们的网站www.danaher.com。

2014年10月20日，国家蛋白质科学中心上海（筹）与丹纳赫生命科学公司的共建示范实验室在上海国家蛋白质科学中心正式启用。这是丹纳赫公司在中国继北京联合实验室后又一个专注于科研与应用市场的研究平台。上海生科院生化与细胞所副所长&国家蛋白质科学中心上海主任雷鸣教授与丹纳赫集团公司亚太区高级副总裁&中国区总裁Jon Clark共同出席了签约仪式并为实验室揭幕。 图1-双方领导签署并交换合作协议图2-揭牌仪式丹纳赫集团作为目前全球最大的跨国仪器公司，此次携手具有一流人才与科研水平的国家蛋白质科学中心，整合双方强大的生命科学设备与技术资源，将藉由该共建实验室的成立，创建国内首屈一指的蛋白质组研究平台，在食品安全、生物医药以及转化医学等领域实现快速的分析检测，切实推动中国生命科学领域的研究进程。用户在此整合实验室，可以体验到蛋白科学研究流程中所需的包括AB SCIEX、Beckman Coulter、Leica Microsystems以及Molecular Devices公司设备在内的各种高端测试仪器、软件和技术。此外，本共建示范实验室还可为用户提供样本处理、技术咨询、工作流程分析，并致力于为生命科学的研究者开展合作与交流提供平台。图3-合作双方领导团队在签约后合影雷鸣在接受生物谷记者采访时表示，通过在国家蛋白质科学中心设备建设阶段与丹纳赫集团及旗下生命科学公司AB SCIEX、Beckman Coulter、Leica Microsystems以及Molecular Devices的合作，我们充分体会到了与国外先进公司合作的优势。尤其值得一提的是，我们在与Beckman Coulter公司的合作过程中，建造了五套大型的蛋白质制备和高通量筛选系统，实现了大规模蛋白表达过程的自动化，并且拥有了自己的知识产权，这次合作非常成功。目前在我国生命科学研究领域中，国产生命科学仪器少之甚少。雷鸣表示，希望与丹纳赫集团的这次合作能够使得新兴的生物技术尤其是生命科学研究仪器技术得到更多的重视，使得我国在高端实验仪器开发及生物技术研制上有更大的进步。“在科研文化方面，希望我国科学家在研究过程中能够着眼于生物产业相关领域，在从科研到产业的转变过程中引入更加先进的思想，同时学习国外先进科学文化氛围，顺应我国经济转型的潮流，创造新的经济增长点。”据了解，国家蛋白质科学中心与丹纳赫的本次合作领域主要集中在Beckman Coulter克隆、构建、以及蛋白质的表达与提纯环节。国家蛋白质科学中心希望将来能够利用自动化的先进技术，在生命科学的其他领域，例如抗体的筛选、细胞实验、药物筛选等方面与丹纳赫集团展开更加深入的合作。 此次签约仪式也将全面开启国家蛋白质科学中心计划与丹纳赫集团旗下生命科学公司Leica Microsystems、AB SCIEX以及Molecular Devices在相关技术领域的推广、应用及开发的合作洽谈。对于今年因为超高分辨率荧光显微技术而获得诺贝尔奖的显微成像技术领域，雷主任表现出了极大的兴趣。签约仪式之后，合作双方领导团队对共建实验室进行了参观，并详细介绍了双方合作的多个技术领域及成果。据了解，目前国家蛋白质中心所属的九大技术系统已经配备了多项丹纳赫集团的产品：包括AB SCIEX的串联质谱系统、Beckman Coulter的高通量细胞培养自动化系统和离心系统、Leica Microsystems的激光扫描共聚焦显微镜以及Molecular Devices的高通量实时克隆挑选分析系统。这些设备都在国家蛋白质中心发挥了不可替代的作用。图4-共建实验室参观点击优酷视频，了解更多信息：http://v.youku.com/v_show/id_XODIwMTYzODcy.html关于国家蛋白质科学中心上海国家蛋白质科学中心上海（筹）/国家蛋白质科学研究（上海）设施是国家重大科技基础设施，以各种大型科学仪器和先进技术集成为核心的规模化、系统化技术装备体系，具有不同的空间分辨率和时间分辨率的研究技术装备。中心覆盖蛋白质结构与功能在空间尺度和时间尺度变化范围的全部研究技术系统，为在分子水平、细胞水平和个体水平上研究蛋白质、蛋白质复合体、蛋白质机器的结构与功能提供全面和完整的技术与条件保障，为我国的蛋白质科学基础研究提供强有力的支撑，将成为国家蛋白质科学和技术的重要创新基地。详情请点击中心网站：www.ncpss.org.关于美国丹纳赫集团生命科学公司丹纳赫是全球优秀的科学与技术创新产品与服务的设计商及制造商，主要服务于专业领域、医疗领域、工业领域及商业领域的客户。在服务的众多领域中，其主要品牌均获得了用户的高度认可。丹纳赫业务系统为来自全球25个国家的63,000位用户提供了一个平台。仅在2012年期间，丹纳赫集团就创造了183亿美元的总收入。如需了解更多信息，请访问我们的网站www.danaher.com。

从相加到相乘，合力推动蛋白质组学的医学转化和药物研发2023年2月7日，睿科集团（厦门）股份有限公司与北京青莲百奥生物科技有限公司（下称：“青莲百奥”）战略合作签约仪式在厦举行，双方将共同建设自动化蛋白质组学智慧实验室，为构建诊、疗蛋白质生物标志物在临床端和药企端落地转化，提供自动化完整的解决方案。未来双方将以药物研发及医学转化为主要方向，以蛋白质组学样本前处理自动化设备、智慧实验室的建设为核心，打造新一代蛋白质组学产业链，有效推动蛋白质组学在临床医学的转化。青莲百奥CEO李京丽（左）与睿科集团董事长林志杰签署合作协议并合影留念本次战略合作青莲百奥将以最新的研发成果低丰度富集磁珠解决方案和蛋白质组学全流程全智能样本处理智能机器人、一键式大数据处理的核心算法融合打造的新一代蛋白质组学平台为依托，针对智能实验设备及智慧实验室等可持续发展合作项目作报告演讲，开展技术交流，共同探讨相关领域的应用开发。低丰度磁珠富集解决方案血液低丰度富集磁珠试剂盒蛋白质组学全流程全自动样本智能处理机器人BioLadder生物信息可视化云平台大数据处理核心算法青莲百奥CEO李京丽表示：“在当前的生物医学研究和临床诊断中，蛋白组拥有基因所无法比拟的许多优势并迎来了快速发展期。同时，蛋白组复杂程度高，面临着低丰度的蛋白检出率低、自动化程度低等挑战。青莲百奥与睿科集团在系统开发、硬件设计制造、解决方案等方面优势互补，联手打造蛋白质组学完整解决方案，为临床精准诊疗提供技术支撑。”青莲百奥CEO李京丽致辞睿科集团董事长林志杰表示：“一个人可以跑得很快，但是一群人才能跑得更远，睿科集团于去年并购新拓仪器、与安捷伦签署战略合作，聚势谋远，共绘智慧实验室新蓝图。同样，睿科和青莲百奥怀着相同的初心，我们相信所有的出发点都应基于用户需求，我们携手加速新技术、新产品、新方案开发与应用，以科技驱动精准诊疗！”睿科集团董事长林志杰致辞会议双方进行技术探讨参观睿科智慧展厅及睿科集团下辖的第三方检测服务公司——厦门鉴科检测技术有限公司与会嘉宾合影（从左往右依次为：睿科生化销售经理马军胜、青莲百奥COO孙龙钦、青莲百奥CEO李京丽、睿科董事长林志杰、睿科生化销售总监汪纪波、睿科生化销售经理廖文甲）如果说相加是一种力量的积蓄，那么相乘便是一种共生共长、共荣共进的合力。未来，睿科集团与青莲百奥将持续发挥各自优势，相加相乘、协同精进，为检验检测实验室的现代化建设创造更多可能！关于睿科集团睿科集团是一家专注于检验检测行业效能提升的自动化、智能化实验室整体解决方案供应商。公司核心业务覆盖环境检测、食品安全、药品分析、生命科学、医疗健康五个领域，致力于为客户提供优秀的产品和一站式解决方案服务。关于青莲百奥青莲百奥是一家基于蛋白质组学研究的创新性、平台型CRO企业，致力于临床样本的蛋白质标志物发现和检测，聚焦于低丰度、超微量的血液、外泌体、显微切割等样品类型。全力打造新一代蛋白质组学平台，以临床问题为导向、以源头创新为核心驱动力，为诊、疗蛋白质生物标志物在临床端和药企端落地转化，提供完整的解决方案。

2010年5月24日上午，美国科学院院士、拉斯克奖获得者、洛克菲勒大学Robert G. Roeder教授，美国麻省理工大学白头研究所Richard A. Young教授，美国国立卫生研究院Shiv Grewal教授，美国霍华德休斯医学研究院Zhang Yi教授，Nature 资深编辑Alex Eccleston博士，Science资深编辑Guy Hiddihough博士，法国植物分子生物学研究所Shen Wenhui教授等一行七人访问蛋白质组学国家重点实验室。会议由蛋白质组学国家重点实验室主任贺福初院士主持，军事医学科学院科技部张永祥副部长出席会议。会议在北京蛋白质组研究中心1201会议室举行。 　　会议伊始，贺福初院士代表实验室致欢迎辞，随后，实验室副主任兼中心技术总监钱小红教授介绍了重点实验室的发展历程，现有课题组设置及分工、人员情况及实验室近年取得的成绩。为使来宾更深入了解实验室，实验室的张学敏、杨晓、周钢桥、张令强、郝运伟、王建、应万涛等7位博士简要的介绍了所在课题组的代表性工作。而后，几位外宾介绍了各自实验室的工作，Alex Eccleston博士、Guy Hiddihough博士介绍了Nature、Science杂志相关情况，并对蛋白质组学国家重点实验室几年来所作的科研工作给与了肯定。期间，与会专家不时就感兴趣的问题及相关情况进行交流讨论，并对各课题组的研究发表评论和指导。研讨会结束后，来访学者兴致勃勃地参观了实验室，多位专家表达了合作的浓厚兴趣。 　　此次来访，不仅增加了蛋白质组学与表观遗传学等相关领域的交流与互动，也为前沿学科之间的交叉与合作提供了可能和途径。相信，随着此类交流与合作机会的增多，蛋白质组学国家重点实验室的国际影响力与地位会得到不断提升。

2008年12月12日上午，蛋白质组学国家重点实验室(筹)第一届学术委员会第二次会议在北京蛋白质组研究中心召开，会议由实验室常务副主任杨晓明研究员主持。国家科技部基础研究司基地建设处周文能处长，实验室学委会主任强伯勤院士、副主任张玉奎院士、钱小红研究员，学委会委员贺福初院士、陈惠鹏研究员、程京教授、刘斯奇教授、吴家睿研究员、杨芃原教授、杨晓明研究员、张学敏研究员，实验室依托单位军事医学科学院科技部徐天昊副部长、军事医学科学院放射与辐射医学研究所胡向军副所长、科技处王东根处长、甄蓓副处长，实验室PI和学术骨干等出席了会议。 　　会议伊始，徐天昊副部长致欢迎辞，对各位委员在百忙之中出席此次会议表示衷心感谢，对国家科技部和总后勤部卫生部的大力支持表示诚挚的谢意，并预祝此次会议圆满成功。 　　随后，学术委员会主任强伯勤院士主持讨论并通过实验室管理办法和高级人员聘用管理办法，对实验室拟设置的自主研究重点课题进行了评审 最后学委会在认真听取实验室常务副主任杨晓明研究员关于实验室建设期工作汇报的基础上，进行了重点讨论，一致认为实验室建设期工作完成扎实，成绩显著，各方面准备工作已相当完善，应该抓紧申请验收，并做好各项准备工作，同时，就评审答辩相关注意事项提出了宝贵意见和建议。 　　实验室主任贺福初院士对各位委员一直以来的指导和帮助表示衷心的感谢，并简要介绍了实验室下一步的工作重心，同时指出在高水平文章方面，实验室这两年非常重视，已经有一些起色。但在高层次人才引进方面受军队体制限制，不太理想，目前正在利用国家科技部对重点实验室的一些人才政策予以加强。 　　国家科技部基础研究司基地建设处周文能处长专程前来出席会议作了重要讲话，指出目前国家科技部对国家实验室和国家重点实验室给予了高度重视，并加大了投入。周处长对蛋白质组学国家重点实验室的建设工作给予了高度评价，对实验室在建设期内所取得的成绩予以了充分肯定，对学术委员会的悉心指导给予了高度赞扬。同时周处长强调实验室应该有更高的要求，要产出更多具有重要价值和国际影响的原始性创新成果，要形成一支在国际上占据一席之地的优秀团队，要成为国内乃至国际合作开放的示范平台，为我国蛋白质组学发展作出更大贡献。

俗话说：文无第一，如果非要整出个蛋白质质谱与蛋白质组学领域世界第一牛人，显然并不是一件容易的事，也注定是一件有争议的事。作为一个半路出家的准业内人，我就本着无知者无畏的革命精神，说一下我自己心目中的第一牛人：Ruedi Aebersold。 　　考虑到科学网的大多数网友对蛋白质组学并不了解，先简单科普一下，根据百度百科的定义：“蛋白质组学(Proteomics)一词，源于蛋白质(protein)与 基因组学(genomics)两个词的组合，意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。” 1995年(也有1994，1996年之说)Marc Wikins首次提出蛋白质组(Proteome)的概念1，1997年, Peter James(就职于有欧洲MIT之称的瑞士联邦工学院(ETH))又在此基础上率先提出蛋白质组学的概念2。基因组学和蛋白质组学的概念又进一步催生了N多的各种各样的组学(omics)，两者的诞生的发展，也使系统生物学成为可能，本文的主人公Ruedi Aebersold与Leroy Hood一起于2000年在美国西雅图创办了系统生物学研究所(ISB),该所的建立不但标志着系统生物学作为一门独立的学科的诞生(此句话貌似不靠谱，参见文后14楼的评论)，也带动了包括蛋白质组学在内的多种组学的发展，当然各种组学的发展也同时促进了系统生物学的发展。尽管日本也于2000年在东京建立了系统生物学研究所，但是同为第一个吃螃蟹的，东京的这个所，无论是学术水平还是世界影响都无法和西雅图的那个系统生物学领域的麦加相提并论。闲话少叙，我之所以认为Ruedi Aebersold是蛋白质质谱与蛋白质组学领域世界第一牛人，是基于如下原因： 　　Ruedi Aebersold对蛋白质组学的最大贡献可谓是同位素代码标记技术(ICAT)，现在这一蛋白组定量技术自从1999年在Nature上发表以来，该技术已世界广泛应用，该论文迄今(截至2013年1月11日)已被引用了近3000次。Web of Science的检索结果显示，蛋白组学领域迄今已经至少有超过10万篇论文发表，按照被引用次数排名，该论文位居第三位。有意思的是，被引用次数排第四位的是Ruedi Aebersold和另外一位牛人Mathias Mann(下面会介绍)于2003年发表在Nature上的有关蛋白质质谱与蛋白质组学的综述论文，迄今也已被引用近2800次。而引用次数排第一和第二的两篇论文的通讯作者并算不上是蛋白质质谱与蛋白质组学领域的，蛋白质组学仅仅是他们使用的工具，他们的影响也在这个领域之外。蛋白质组学领域，最重要的专业协会应该算是HUPO (国际人类蛋白质组组织), 最重要的专业会议也当属HUPO世界大会，Ruedi Aebersold曾获HUPO含金量最高的成就奖，他本人也经常是HUPO世界大会的分会主席或大会特邀报告人。当然Aebersold还获得了包括美国质谱协会(ASMS)大奖在内的许多专业大奖。可能有人会列出另外的自己心中的第一牛人(如上述的Mathias Mann)，但Ruedi Aebersold无疑至少是领域内公认的前几位的世界级牛人。另外，顺便说一下德国马普所的Mathias Mann(其在丹麦首都也有实验室)，Mann和Aebersold可谓是蛋白质组学领域的双子星座，都是该领域的顶级牛人，Mann发表的论文有多篇都在蛋白质组学领域被引用次数前10位，不少被引用次数都上千次。上述的Mann和Aebersold两人能在Nature发表综述论文也说明了他们的江湖地位。Aebersold和Mann所发表的论文总被引次数分别超过了5万和3万次，这个数字在世界所有领域都是惊人的。另外，Mathias Mann在蛋白质组学最大的贡献可以说是发明了蛋白质组体内标记技术SILAC3,这种技术与Ruedi Aebersold发明的ICAT已及另外一种标记iTRAQ是公认的应用最为广泛的蛋白质组学定量标记技术。 　　今年年近花甲的Ruedi Aebersold是世界蛋白质组学的开拓者之一，现在在上述的ETH的工作，和最早提出蛋白质组学Peter James在同一个大学。作为土生土长的瑞士人，Ruedi Aebersold是在2004年底、2005年初才开始在ETH全职工作的，可谓是瑞士的大海龟。Ruedi Aebersold此前在西雅图的ISB和华盛顿大学工作，作为ISB的元老和共同创办人，Ruedi Aebersold现在还是ISB的兼职教授，发表论文时也还署ISB地址。Mann和Aebersold都是欧洲人，现在又都致力于将蛋白质质谱与蛋白质组学应用到临床，尽管蛋白质组学已有十多年发展历史，现在最大的一个瓶颈可以说在基本无法应用到临床，现有的技术，对于临床应用而言，时间和经济成本都太高(无法高通量、检测成本太贵)。这一块硬骨头显然不是一般人能够啃得动的，需要从临床样品制备、质谱技术到数据分析都要有突破甚至革命性的创新，我很期待，也相信Mann和Aebersold有能力最终使蛋白质组学(尤其是基于此的生物标志物鉴定技术)应用到临床。 　　我国在蛋白质质谱与蛋白质组学领域在世界上最出名的无疑非贺福初莫属，贺福初的名字在国内搞蛋白质组学应该都知道他的名字，他的头衔很多(如将军、院士)，我就不一一列举了，新年伊始他又多了一个牛头衔：万人计划中的科技领军人才。贺的工作和学术水平，我不熟悉，不敢评头论足。他的文章被引用次数最高的是发表在Cancer Research一篇论文，迄今已有126次，但并非是蛋白质组学领域。在蛋白质组学领域，他的被引次数(含自引)最高的论文是2007年发表在蛋白质组学顶级期刊MCP的文章4，迄今已有105次引用。蛋白质质谱领域，我国在世界上最出名的学者估计要数复旦大学的杨芃原了，他的被引用次数最高的一篇论文，是2005年发表在化学顶级期刊德国应用化学的文章5，迄今已被引用70次，杨芃原为该论文的共同通讯作者。我国在蛋白质组学目前被引用次数最高的是南开大学王磊(澳大利亚海归、长江学者)2007年发表在美国科学院院刊(PNAS)的论文6，迄今被引次数已经超过500次。 　　蛋白质质谱仪主要生产商Thermo Fisher(即原来的Finnegan), 最近新出了本挂历，这本特别的挂历上列了13位在蛋白质质谱与蛋白质组学领域的牛人，上述的Ruedi Aebersold和Mathias Mann都在之列，其余11位简单介绍、列表如下。 姓 名 工作单位 主要贡献 Richard D. Smith 美国太平洋西北国家实验室 1990年首次用三重四级杆质谱Top-down（自上而下）分析完整蛋白 John Yates III 美国Scripps研究所 SEQUEST MS/MS数据库搜索程序 Joshua Coon 美国威斯康星大学麦迪逊分校 发明了电子转移解离技术(ETD) Neil Kelleher 美国西北大学 Top-down蛋白质组学 Kathryn Lilley 英国剑桥大学 蛋白质组学定量技术 Pierre Thibault 加拿大蒙特利尔大学 应用生物质谱和蛋白质组学到细胞生物学 Michael MacCoss 美国华盛顿大学（西雅图） 稳定同位素标记技术 Albert Heck 荷兰Utrecht大学 基于质谱的结构生物学 Catherine Costello 美国波士顿大学 HUPO前任主席，质谱技术发展及应用 Alexander Makarov 德国Thermo Fisher Scientific 生物质谱全球研发总监 领导研发Orbitrap质谱仪 Donald Hunt 美国弗吉尼亚大学 FT-MS and ETD 　　简单的说，上述13位世界级牛人都来自欧美，没有一位来自亚洲，也没有一位华人。我不知道以Ruedi Aebersold代表的上述牛人是如何炼成的，但可以肯定的是：他们不是欧美版的“百人”计划，也不是“千人”计划，更不是“万人”计划而“计划”出来的。网上的公开信息表明：Ruedi Aebersold除了在国际专业协会和期刊有学术兼职外，没有任何行政职务，就是一普通教授，但是这不妨碍他成为蛋白质质谱与蛋白质组学领域世界第一牛人。

美国科学家主导的国际科研团队在最新一期《科学》杂志撰文指出，他们利用人工智能和进化分析，绘制出了真核生物的蛋白质之间相互作用的3D模型，首次确定了100多个可能的蛋白质复合物，并为700多个蛋白质复合物提供了结构模型，深入研究蛋白质相互作用有望催生新的药物。　　研究负责人之一、美国西南大学人类发育与发展中心助理教授丛前（音译）称，研究结果代表了结构生物学新时代的重大进步。　　丛前解释说，蛋白质通常成对或成组工作，形成复合物，以完成生物体存活所需的任务。虽然科学家已经对其中一些相互作用开展了深入研究，但许多仍是未解之谜。了解蛋白质之间所有的相互作用将揭示生物学的许多基本方面，并为新药研发提供参考。　　但半个世纪以来，鉴于许多蛋白质结构的不确定性，科学家们很难了解这些相互作用。2020年和2021年，深度思维公司和华盛顿大学戴维贝克实验室独立发布了两种人工智能技术“阿尔法折叠”和RoseTTAFold，它们使用不同的策略预测蛋白质结构。　　在最新研究中，丛前等人通过对许多酵母蛋白复合物建模，扩展了人工智能结构预测工具箱。为了找到可能相互作用的蛋白质，科学家们首先搜索相关真菌的基因组，寻找发生突变的基因，然后使用上述两种人工智能技术来确定这些蛋白质是否可以3D结构结合在一起。　　他们确定了1505种可能的蛋白质复合物，其中699个结构已被表征，验证了其方法的实用性；另外700个复合物目前获得的数据有限，剩下106个从未被研究过。为更好地理解这些很少被描述或未知的复合物，团队研究了类似的蛋白质，并根据新发现的蛋白质与此前已知蛋白质的相互作用，确定了新发现蛋白质的作用。

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状态：公告 更新时间： 2023-06-21 招标文件: 附件1 北京昌平实验室蛋白纯化仪采购项目公开招标公告 2023年06月21日 15:40 公告概要： 公告信息： 采购项目名称 北京昌平实验室蛋白纯化仪采购项目 品目 货物/通用设备/仪器仪表/光学仪器/激光仪器 采购单位 北京昌平实验室 行政区域北京市 公告时间 2023年06月21日 15:40 获取招标文件时间 2023年06月21日至2023年06月29日每日上午:9:30 至 11:30 下午:13:30 至 16:30（北京时间，法定节假日除外） 招标文件售价 ￥500 获取招标文件的地点 北京市海淀区文慧园北路10号，北京中教仪国际招标代理有限公司办公楼511室（中国教育报刊社院内）。 开标时间 2023年07月12日 09:30 开标地点 博达大厦二层中央会议室（北京市昌平区中关村生命科学园科学园路28号） 预算金额 ￥392.000000万元（人民币） 联系人及联系方式： 项目联系人 陈杏媛、王磊、孙亚欣、韩寿国、蒋旭、谢杰、杨硕 项目联系电话 010-59893120、59893123、59893116、59893125 采购单位 北京昌平实验室 采购单位地址 北京市昌平区中关村生命科学园科学园路7号 采购单位联系方式 刘老师15810908562@163.com 代理机构名称 北京中教仪国际招标代理有限公司 代理机构地址 北京市海淀区文慧园北路10号，北京中教仪国际招标代理有限公司511室（中国教育报刊社院内） 代理机构联系方式 陈杏媛、王磊、孙亚欣、韩寿国、蒋旭、谢杰、杨硕010-59893120、59893123、59893116、59893125 附件： 附件1 购买标书登记表-单位名称.doc 项目概况 北京昌平实验室蛋白纯化仪采购项目 招标项目的潜在投标人应在北京市海淀区文慧园北路10号，北京中教仪国际招标代理有限公司办公楼511室（中国教育报刊社院内）。获取招标文件，并于2023年07月12日 09点30分（北京时间）前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号：0873-2301HW4L0198 项目名称：北京昌平实验室蛋白纯化仪采购项目 预算金额：392.0000000 万元（人民币） 采购需求： 1.本次招标共分1个包 序号 名称 数量/单位 是否接受进口产品 简要技术参数及规格描述 1 蛋白纯化仪 4套 是 详见第三章采购需求。 （1）本次招标、投标、评标均以包为单位，投标人须以包为单位进行投标，如有多包，可投一包或多包，但不得拆包，不完整的投标将被拒绝。 （2）进口产品是指通过中国海关报关验放进入中国境内且产自关境外的产品。 （3）本项目采购标的对应的中小企业划分标准所属行业为：工业。 （4）本项目为非专门面向中小企业采购的项目。 （5）本项目为科研仪器设备采购。 2.招标用途：用于 科研。 以上货物的供应、运输、安装调试、培训及售后服务具体招标内容和要求，以本招标文件中商务、技术和服务的相应规定为准。 合同履行期限：签订合同后 6个月内。 本项目( 不接受 )联合体投标。 二、申请人的资格要求： 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定； 2.落实政府采购政策需满足的资格要求： 本项目落实节约能源、保护环境、促进中小企业发展、支持监狱企业发展、促进残疾人就业等政府采购政策。 本项目为非专门面向中小企业采购的项目。 3.本项目的特定资格要求：(1)投标人按照招标公告的要求购买招标文件并登记备案。(2)在中华人民共和国境内注册登记，有生产或供应能力的本国供应商，包括法人、其他组织和个人。(3)为本项目提供整体设计、规范编制或者项目管理、监理、检测等服务的供应商，不得再参加本项目采购活动。(4)单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商，不得参加同一包投标或者在未分包的同一招标项目中投标。(5)本项目不接受联合体投标申请，不允许分包和转包。(6)投标人不得为“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）中列入失信被执行人和重大税收违法案件当事人名单的供应商，不得为中国政府采购网（www.ccgp.gov.cn）政府采购严重违法失信行为记录名单中被财政部门禁止参加政府采购活动的供应商（处罚决定规定的时间和地域范围内）。(7) 本项目不接受联合体投标。 三、获取招标文件 时间：2023年06月21日 至 2023年06月29日，每天上午9:30至11:30，下午13:30至16:30。（北京时间，法定节假日除外） 地点：北京市海淀区文慧园北路10号，北京中教仪国际招标代理有限公司办公楼511室（中国教育报刊社院内）。 方式：工作日9：30-11：30；13：30-16：30（法定节假日除外）,每包人民币500元，标书售后不退。建议以非现场方式获取招标文件，按本公告其他要求所述我公司账户信息汇款，并填写购买标书登记表（见附件），随后将汇款底单、购买标书登记表(word版)、法人授权书等材料e-mail至我公司（chenxingyuan@china-didac.com），并联系我公司确认信息，我公司在收到汇款后会及时将招标文件发送给贵方。 售价：￥500.0 元，本公告包含的招标文件售价总和 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 提交投标文件截止时间：2023年07月12日 09点30分（北京时间） 开标时间：2023年07月12日 09点30分（北京时间） 地点：博达大厦二层中央会议室（北京市昌平区中关村生命科学园科学园路28号） 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 1.购买招标文件时须携带法人授权委托书原件（法定代表人、被授权人签字，加盖投标人公章)、被授权人身份证复印件（加盖投标人公章）。 2.北京中教仪国际招标代理有限公司账户信息（本项目接收标书款和投标保证金的专用账户） 开 户 名：北京中教仪国际招标代理有限公司 开户银行：广发银行股份有限公司北京自贸试验区国际商务服务片区支行 帐 号：6232593799007549895 注：请投标人在汇款时务必注明所投标项目的项目编号及用途，否则，因款项用途不明导致投标无效等后果由投标人自行承担；不接受个人帐户汇款。 3.邮箱：chenxingyuan@china-didac.com 4.评标方法和标准：综合评分法。 七、对本次招标提出询问，请按以下方式联系。 1.采购人信息 名 称：北京昌平实验室 地址：北京市昌平区中关村生命科学园科学园路7号 联系方式：刘老师15810908562@163.com 2.采购代理机构信息 名 称：北京中教仪国际招标代理有限公司 地 址：北京市海淀区文慧园北路10号，北京中教仪国际招标代理有限公司511室（中国教育报刊社院内） 联系方式：陈杏媛、王磊、孙亚欣、韩寿国、蒋旭、谢杰、杨硕010-59893120、59893123、59893116、59893125 3.项目联系方式 项目联系人：陈杏媛、王磊、孙亚欣、韩寿国、蒋旭、谢杰、杨硕 电 话： 010-59893120、59893123、59893116、59893125 × 扫码打开掌上仪信通App 查看联系方式 $('.clickModel').click(function () { $('.modelDiv').show() }) $('.closeModel').click(function () { $('.modelDiv').hide() }) 基本信息 关键内容：蛋白质纯化 开标时间：2023-07-12 09:30 预算金额：392.00万元 采购单位：北京昌平实验室 采购联系人：点击查看 采购联系方式：点击查看 招标代理机构：北京中教仪国际招标代理有限公司 代理联系人：点击查看 代理联系方式：点击查看 详细信息 北京昌平实验室蛋白纯化仪采购项目公开招标公告 北京市-昌平区 状态：公告 更新时间： 2023-06-21 招标文件: 附件1 北京昌平实验室蛋白纯化仪采购项目公开招标公告 2023年06月21日 15:40 公告概要： 公告信息： 采购项目名称 北京昌平实验室蛋白纯化仪采购项目 品目 货物/通用设备/仪器仪表/光学仪器/激光仪器 采购单位 北京昌平实验室 行政区域 北京市 公告时间 2023年06月21日 15:40 获取招标文件时间 2023年06月21日至2023年06月29日每日上午:9:30 至 11:30 下午:13:30 至 16:30（北京时间，法定节假日除外） 招标文件售价 ￥500 获取招标文件的地点 北京市海淀区文慧园北路10号，北京中教仪国际招标代理有限公司办公楼511室（中国教育报刊社院内）。 开标时间 2023年07月12日 09:30 开标地点 博达大厦二层中央会议室（北京市昌平区中关村生命科学园科学园路28号） 预算金额￥392.000000万元（人民币） 联系人及联系方式： 项目联系人 陈杏媛、王磊、孙亚欣、韩寿国、蒋旭、谢杰、杨硕 项目联系电话 010-59893120、59893123、59893116、59893125 采购单位 北京昌平实验室 采购单位地址 北京市昌平区中关村生命科学园科学园路7号 采购单位联系方式 刘老师15810908562@163.com 代理机构名称 北京中教仪国际招标代理有限公司 代理机构地址 北京市海淀区文慧园北路10号，北京中教仪国际招标代理有限公司511室（中国教育报刊社院内） 代理机构联系方式 陈杏媛、王磊、孙亚欣、韩寿国、蒋旭、谢杰、杨硕010-59893120、59893123、59893116、59893125 附件： 附件1 购买标书登记表-单位名称.doc 项目概况 北京昌平实验室蛋白纯化仪采购项目 招标项目的潜在投标人应在北京市海淀区文慧园北路10号，北京中教仪国际招标代理有限公司办公楼511室（中国教育报刊社院内）。获取招标文件，并于2023年07月12日 09点30分（北京时间）前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号：0873-2301HW4L0198 项目名称：北京昌平实验室蛋白纯化仪采购项目 预算金额：392.0000000 万元（人民币） 采购需求： 1.本次招标共分1个包 序号 名称 数量/单位 是否接受进口产品 简要技术参数及规格描述 1 蛋白纯化仪 4套 是 详见第三章采购需求。 （1）本次招标、投标、评标均以包为单位，投标人须以包为单位进行投标，如有多包，可投一包或多包，但不得拆包，不完整的投标将被拒绝。 （2）进口产品是指通过中国海关报关验放进入中国境内且产自关境外的产品。 （3）本项目采购标的对应的中小企业划分标准所属行业为：工业。 （4）本项目为非专门面向中小企业采购的项目。 （5）本项目为科研仪器设备采购。 2.招标用途：用于 科研。 以上货物的供应、运输、安装调试、培训及售后服务具体招标内容和要求，以本招标文件中商务、技术和服务的相应规定为准。 合同履行期限：签订合同后 6个月内。 本项目( 不接受 )联合体投标。 二、申请人的资格要求： 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定； 2.落实政府采购政策需满足的资格要求： 本项目落实节约能源、保护环境、促进中小企业发展、支持监狱企业发展、促进残疾人就业等政府采购政策。 本项目为非专门面向中小企业采购的项目。 3.本项目的特定资格要求：(1)投标人按照招标公告的要求购买招标文件并登记备案。(2)在中华人民共和国境内注册登记，有生产或供应能力的本国供应商，包括法人、其他组织和个人。(3)为本项目提供整体设计、规范编制或者项目管理、监理、检测等服务的供应商，不得再参加本项目采购活动。(4)单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商，不得参加同一包投标或者在未分包的同一招标项目中投标。(5)本项目不接受联合体投标申请，不允许分包和转包。(6)投标人不得为“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）中列入失信被执行人和重大税收违法案件当事人名单的供应商，不得为中国政府采购网（www.ccgp.gov.cn）政府采购严重违法失信行为记录名单中被财政部门禁止参加政府采购活动的供应商（处罚决定规定的时间和地域范围内）。(7) 本项目不接受联合体投标。 三、获取招标文件 时间：2023年06月21日 至 2023年06月29日，每天上午9:30至11:30，下午13:30至16:30。（北京时间，法定节假日除外） 地点：北京市海淀区文慧园北路10号，北京中教仪国际招标代理有限公司办公楼511室（中国教育报刊社院内）。 方式：工作日9：30-11：30；13：30-16：30（法定节假日除外）,每包人民币500元，标书售后不退。建议以非现场方式获取招标文件，按本公告其他要求所述我公司账户信息汇款，并填写购买标书登记表（见附件），随后将汇款底单、购买标书登记表(word版)、法人授权书等材料e-mail至我公司（chenxingyuan@china-didac.com），并联系我公司确认信息，我公司在收到汇款后会及时将招标文件发送给贵方。 售价：￥500.0 元，本公告包含的招标文件售价总和 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 提交投标文件截止时间：2023年07月12日 09点30分（北京时间） 开标时间：2023年07月12日 09点30分（北京时间） 地点：博达大厦二层中央会议室（北京市昌平区中关村生命科学园科学园路28号） 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 1.购买招标文件时须携带法人授权委托书原件（法定代表人、被授权人签字，加盖投标人公章)、被授权人身份证复印件（加盖投标人公章）。 2.北京中教仪国际招标代理有限公司账户信息（本项目接收标书款和投标保证金的专用账户） 开 户 名：北京中教仪国际招标代理有限公司 开户银行：广发银行股份有限公司北京自贸试验区国际商务服务片区支行 帐 号：6232593799007549895 注：请投标人在汇款时务必注明所投标项目的项目编号及用途，否则，因款项用途不明导致投标无效等后果由投标人自行承担；不接受个人帐户汇款。 3.邮箱：chenxingyuan@china-didac.com 4.评标方法和标准：综合评分法。 七、对本次招标提出询问，请按以下方式联系。 1.采购人信息 名 称：北京昌平实验室 地址：北京市昌平区中关村生命科学园科学园路7号 联系方式：刘老师15810908562@163.com 2.采购代理机构信息 名 称：北京中教仪国际招标代理有限公司 地 址：北京市海淀区文慧园北路10号，北京中教仪国际招标代理有限公司511室（中国教育报刊社院内） 联系方式：陈杏媛、王磊、孙亚欣、韩寿国、蒋旭、谢杰、杨硕010-59893120、59893123、59893116、59893125 3.项目联系方式 项目联系人：陈杏媛、王磊、孙亚欣、韩寿国、蒋旭、谢杰、杨硕 电 话： 010-59893120、59893123、59893116、59893125

蛋白质印迹实验具体操作步骤 蛋白质印迹免疫分析的过程包括蛋白质经凝胶电泳分离后，在电场作用下将凝胶上的蛋白质条带转移到硝酸纤维素膜上，经封闭后再用抗待检蛋白质的抗体 作为探针与之结合，经洗涤后，再将滤膜与二级试剂-放射性标记的或辣根过氧化物酶或碱性磷酸酶 偶联抗免疫球蛋白抗体 结合，进一步洗涤后，通过放射自显影或原位酶反应来确定抗原-抗体-抗抗体复合物在滤膜上的位置和丰度。 【蛋白质印迹实验所需试剂】 1.IgG 标准品 2.羊抗人辣根过氧化物酶（HRP）标记的IgG 抗体 3.转移buffer:Tris 3.03g,Gly14.4g,甲醇200ml,加三蒸水至 1000ml充分溶解，4℃冰箱贮存。 4.Tris buffer（TBS）：Tris 2.42g,NaCl 29.2g,溶于600ml三蒸水，再用1N HCl调至pH7.5,然后补加三蒸水至1000ml. 5.漂洗液（TTBS）：TBS液500ml,加 Tween20 250ul. 6.封闭液：5%脱脂奶粉。 7.抗体buffer:1.5g BSA溶于50ml TTBS. 8.显色液DAB（3.3-diaminobenzidine,3.3-二氨基联苯胺）配制：5mg DAB溶于10ml 柠檬酸buffer（0.01mol/L 柠檬酸2.6ml,0.02 mol/L Na2HPO4 17.39ml），加30% H2O2 10 &mu l（临用时现配）。 9.脱色液：甲醇250ml,冰醋酸100ml,加蒸馏 水至1000ml. 10.氨基黑染色液（0.1%氨基黑 -10B）：0.2g 氨基黑-10B 溶于200ml 脱色液中，充分搅拌溶解，滤纸 过滤。 【蛋白质印迹实验操作步骤】 一、样品的SDS -聚丙烯酰胺凝胶电泳 按实验四操作步骤进行。加样时，注意在同一块胶上按顺序做一份重复点样，以备电泳结束时，一份用于免疫鉴定，一份用于蛋白染色显带，以利相互对比，分析实验结果。 二、转移印迹 1.转移前准备：将滤纸，硝酸纤维素膜（NC）剪成与胶同样大小，NC膜浸入蒸馏 水中 10-20min 后浸入转移buffer中平衡30min . 2.凝胶平衡：将电泳后的SDS -PAGE胶板置于转移buffer 中平衡 30-60min. 3.按图操作：逐层铺平，各层之间勿留有气泡和皱折。 4.开始转移，连接正负极，盖好盖子，接上电源，恒流 0.8mA/cm,室温下转移1h,转移后的凝胶再用氨基黑10B染色液染色20min ,然后脱色检测转移效果。 三、免疫染色 1.转移后的NC膜于5%脱脂奶粉中封闭，4℃过夜。 2.TBS洗膜1-2次，10min/次。 3.加HRP标记的抗体，室温1h . 4.TBS 洗3次，10min/次。 5.NC膜再转入DAB显色液中，置暗处反应，待显色反应达到最佳程度时，立即用三蒸水洗涤终止反应。

大家好，本周为大家分享一篇发表在Analytical Chemistry上的文章Quantitative Structural Proteomics Unveils the Conformational Changes of Proteins under the Endoplasmic Reticulum Stress1，文章的通讯作者是来自美国佐治亚理工学院的Ronghu Wu助理教授。在真核细胞中，内质网(endoplasmic reticulum，ER)负责蛋白质组中40%蛋白质的合成和成熟。蛋白质合成或折叠过程中的变化都将影响内质网的稳态，进而导致未折叠蛋白的积累和蛋白分泌效率的降低。在过去几十年的研究中，内质网应激反应被广泛研究，但是内质网应激反应后蛋白质折叠状态的变化却没有被深入研究。基于丰度的蛋白质组学方法不能直接用于分析蛋白质状态的变化，在这篇文章中，作者整合了半胱氨酸(cysteine，Cys)共价标记、选择性富集和定量蛋白质组学，称为半胱氨酸靶向共价蛋白绘制(cysteine targeted covalent protein painting，Cys-CPP)，用于研究蛋白质组范围内的蛋白质结构和变化(图1A)。　　使用CPP分析蛋白质结构，需要一种具有高反应活性的探针。作者设计了一种针对半胱氨酸的探针，其中包含半胱氨酸反应基团、用于富集的生物素部分和用于生成半胱氨酸特异性识别位点标签的可裂解连接部分(图1B)。以变性处理后的蛋白样品作为蛋白质展开形式的参考，计算肽段在原始样本和变性样本中的比例从而获得宝贵的蛋白质结构信息。　　图1.利用半胱氨酸反应探针定量分析人细胞蛋白质组中半胱氨酸暴露率的原理。(A)Cys-CPP的一般工作流程。(B)半胱氨酸残基与探针之间的反应。富集后，进行紫外裂解，在修饰的半胱氨酸上留下一个小标记，用质谱进行位点特异性分析。　　半胱氨酸暴露率Rexpo通过每条肽段在原始样本和变性样本中的比值进行计算。结果显示：(1)半胱氨酸的暴露率和溶剂可及性呈现正相关(图2C) (2)在丝氨酸和苏氨酸等极性氨基酸残基旁边的半胱氨酸具有相对较高的暴露率，这与人们普遍认为亲水残基更有可能暴露在蛋白质表面的观点一致 (3)甘氨酸和脯氨酸附近的半胱氨酸具有更高的暴露率，这是因为这两种氨基酸通常出现在蛋白质的转角和环结构中，对半胱氨酸的空间位阻较小 (4)半胱氨酸暴露率与其有/无序区(图2D)或所处二级结构(图2E)的相关性分析均表明，较低的暴露率与更稳定和结构化的局部环境有很好的相关性。这些数据结果共同证明目前的方法可以准确地测得半胱氨酸暴露率，并为蛋白质结构提供有价值的信息。　　图2.HEK293T细胞中半胱氨酸暴露率的分析。(A) VAHALAEGLGVIAC#IGEK(#代表标记位点)的串联质谱样本。报告离子的强度使我们可以准确定量一个半胱氨酸的暴露率(左框为报告离子强度的放大视图)。(B)蛋白CCT3中被定量半胱氨酸的定位和暴露率演示(PDB代码：6qb8)。(C−E)比较不同的溶剂可及性(C)、预测无序区(D)和二级结构(E)的半胱氨酸暴露率。　　衣霉素(Tunicamycin，Tm)可抑制 N-糖基化并阻断 GlcNAc 磷酸转移酶 (GPT)。由于蛋白质的N-糖基化经常发生在共翻译过程中，在蛋白质折叠的调节中起着至关重要的作用，所以衣霉素会引起细胞内质网中未折叠蛋白的积累并诱导内质网应激。基于此，作者用衣霉素对细胞进行处理，计算并对比了衣霉素处理样本和正常样本中的半胱氨酸暴露率。正如预期的那样，Tm处理样本中许多半胱氨酸的暴露率升高，且Tm对于蛋白质不稳定区域的作用尤为显著。根据Tm处理样本和正常样本之间半胱氨酸暴露率的差值，作者将所有位点划分为5个部分，在Tm处理下，近三分之一的半胱氨酸定位区域没有明显的结构变化(差值在-0.05~0.05之间)，而28%的位点则高度暴露(差值0.15)(图3B)。对这两种蛋白质进行基因本体(GeneOntology，GO)功能富集分析(图3C)，结果显示：差值在-0.05~0.05之间的蛋白通常是糖异生或折叠过后具有良好结构区域的蛋白，而差值0.15的蛋白则是与囊泡转运相关的蛋白。这表明抑制N-糖基化主要影响经典分泌途径中的蛋白质，与预期相符。　　图3.利用Tm抑制蛋白质N-糖基化对蛋白质折叠影响的系统研究。(A)Tm处理和对照样品之间半胱氨酸暴露率的比较。(B) 不同暴露率变化范围内的蛋白质数量。(C)在具有高度展开或稳定区域半胱氨酸的蛋白之间进行GO功能富集分析。　　由于Tm对于预先存在的、折叠良好的蛋白质所产生的影响可能远小于对新合成蛋白的影响，分别研究Tm对这两种蛋白的影响是必要的。作者通过将目前的方法Cys-CPP与细胞培养中氨基酸的稳定同位素标记(pSILAC)结合(图4A)，探究了细胞中已存在蛋白和新合成蛋白在内质网应激作用下的不同变化。结果显示：(1)抑制N-糖基化对新合成蛋白的去折叠影响比对已存在蛋白的影响更显著(图4C) (2)N-糖基化除了调节蛋白质的二级结构外，在蛋白质三级或四级结构的形成中起着更重要的作用(图4D)。　　图4. 抑制N-糖基化对新合成蛋白和已存在蛋白折叠状态影响的研究。(A)量化新合成蛋白和已存在蛋白折叠状态变化的实验设置。(B) 经Tm处理和未经处理的细胞中新合成和已存在蛋白质的重叠。括号内为每组蛋白质数。(C)不同蛋白质组中暴露率的分布。(D) 在有或没有Tm处理的细胞中、在不同的二级结构下，新合成和已存在蛋白之间半胱氨酸暴露率的差值分布。　　本文通过设计一种半胱氨酸靶向探针，定量半胱氨酸残基的暴露率，系统地研究了蛋白质的结构以及结构的变化。结果表明，半胱氨酸暴露率与蛋白质局部结构的相关性非常好。利用该方法，作者研究了Tm引起的内质网应激反应下细胞中蛋白质的结构变化。此外，通过将Cys-CPP与pSILAC结合，研究了在内质网应激反应下原有蛋白和新合成蛋白的结构变化差异，并详细分析了内质网应激对蛋白质去折叠的影响，深入和准确地了解内质网应激下的蛋白质结构变化，有助于深入了解蛋白质的功能和细胞活性。　　参考文献：[1] Yin K, Tong M, Sun F, et al. Quantitative Structural Proteomics Unveil the Conformational Changes of Proteins under the Endoplasmic Reticulum Stress[J]. Analytical Chemistry, 2022,

p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　詹显全，中南大学教授、博士研究生导师、博士后合作导师，英国皇家医学会会士(FRSM)、美国科学促进会(AAAS)会员、欧洲预测预防个体化医学协会(EPMA)的会士和国家代表、美国肿瘤学会(ASCO会士、欧洲科技合作组织(e-COST)的海外评审专家，中国抗癌药物国家地方联合工程实验室技术委员会委员、技术带头人和副主任，临床蛋白质组学与结构生物学学科学术带头人和学科负责人，国家临床重点专科建设项目重点实验室建设项目学科带头人，湖南省百人计划专家、湖南省高层次卫生人才“225”工程医学学的学科带头人、中南大学“531”人才工程专家。目前正致力于从多参数系统策略角度阐述肿瘤的分子机理、发现肿瘤分子标志物，研究并整合基因组、转录组、蛋白质组和代谢组的变异来实现肿瘤的预测、预防与个体化治疗及精准医学。已发表学术论文130 余篇，主编国际学术专著3 本，参编国际学术专著16 本，获得美国发明专利2 个。受邀在中科院1 区影响因子9.068 MassSpectrometry Reviews 和中科院2 区影响因子3.65 Frontiers in Endocrinology 的国际期刊上客座主编了3 个专刊。 /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em " 本篇文章仪器信息网获得授权转载，来源中国科技成果杂志。 /p p style=" text-align: center line-height: 1.75em " 　　 span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 深入剖析蛋白质组学技术最新进展与应用 /strong /span /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　詹显全：人类结构基因组测序接近尾声，人们就从结构基因组学研究转向功能基因组学研究，即对转录组和蛋白质组进行研究。1995 年正式提出了”蛋白质组”和”蛋白质组学”的概念，距今已有25 年历史了。 /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em " 蛋白质组学的主要技术包括蛋白质组的分离技术、鉴定技术和蛋白质组信息学技术。 span style=" text-indent: 2em " 蛋白质组的分离技术主要有双向凝胶电泳(2DE)和多维液相色谱(2DLC)。蛋白质组的鉴定技术主要是基于质谱(MS)的技术，主要分为肽质指纹(PMF)和串联质谱(MS/MS)分析技术，其用于蛋白质大分子分析的两大离子源主要有MALDI 和ESI。质谱技术发展很快，主要朝向高灵敏度、高通量和高精度方向发展。 /span /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　蛋白质组信息学技术主要是用来构建蛋白质相互用网络的相关技术。蛋白质组的分离技术和质谱技术的不同联合就形成了各种类型的蛋白质组学分析技术：如2DE-MS和2DLC-MS。2DE-MS 又有2DE-MALDI-PMF 和2DE-ESI-LC-MS/MS, 该技术在蛋白质组学研究的头10-15 年是其主要技术，然而常规概念认为2DE 的通量不高，即一个2D 胶点中一般仅含有1 ～ 2 个蛋白质，通常一次实验其通量仅能鉴定几十到一千个蛋白质，这样其在蛋白质组学中的地位逐渐被淡化。 /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em " 2DLC-MS 主要有iTRAQ or TMT-based SCX-LC-MS/MS and labelfree LC-LC-MS/MS, 这就是人们通常说的“Bottomup”蛋白质组学，该技术在最近10 ～ 15 年在蛋白质组学中起着核心技术的作用，因为其通量明显增加，一次实验其通量可达到几千到一万的蛋白质能被鉴定，但该法鉴定的结果是一个protein group, 实质上鉴定的是编码蛋白质的基因, 而并没有鉴定到真正意义上的蛋白质，即蛋白质存在形式(Proteoforms 或Protein species)。蛋白质存在形式(Proteoforms)是蛋白质组的基本单元。人类基因大约2 万个，人类转录本至少10 万个，每个转录本指导核糖体按三联密码子决定一个氨基酸残基来合成氨基酸序列，刚合成出来的蛋白质氨基酸序列是没有功能的，它必须到达其指定的位置如胞内、胞外，和不同的亚细胞器等，形成特定的三位空间结构，并与其周围的相关分子相互作用，形成一个复合物(complex)才能发挥其功能作用。从核糖体刚合成出来到其指定的位置过程中有很多的蛋白质翻译后修饰(PTMs 据估计人体有400 ～ 600 种PTMs)。我们最近对蛋白质存在形式的概念给出了最新最完整的定义：蛋白质的氨基酸序列+ 翻译后修饰+ 空间构型+ 辅助因子+ 结合伴侣分子+ 空间位置+ 特定的功能。而蛋白质的概念被定义为：由同一个基因编码的所有蛋白质存在形式的集合体。这样，人类蛋白质组中的蛋白质存在形式(Proteoforms)至少有100 万或甚至达10 亿 (图1)。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 427px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202008/uepic/1d18fad3-b010-4ea5-a812-432853ad4ec6.jpg" title=" 1111111.png" alt=" 1111111.png" width=" 600" height=" 427" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center line-height: 1.75em " 　　图1 ：Proteoforms 的概念及形成模式 (Zhan et al,Med One, 2018 Zhan et al., Proteomes, 2019) /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　如此庞大数量的Proteoforms/Protein species, 如何对其进行大规模的探测、鉴定和定量，是一个至关重要的事情。目前关于Proteoforms 的研究有两套策略一是“Top-down”MS 技术， 二是“Top-down” 和“Bottom-up”相结合的技术即2DE-LC/MS 技术(图2)。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 415px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202008/uepic/94f48c94-fd0b-4959-90fb-dd399cebf074.jpg" title=" 2.png" alt=" 2.png" width=" 600" height=" 415" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center line-height: 1.75em " 　　图2 ：Proteoforms 研究技术比较(Zhan et al., Med One, 2018 Zhan et al., Proteomes, 2019) /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　“Top-down”MS 技术能探测、鉴定和定量Proteoforms，获得蛋白质的氨基酸序列和PTMs 信息，然而该技术的通量较低，目前最大通量鉴定到5700 个Proteoforms, 对应到860 蛋白质。 /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　最近，詹显全教授团队发现2DE-LC/MS 技术是一超高通量的技术平台，在探测、鉴定和定量Proteoforms方面, 可以鉴定达几十万至上100 万的Proteoforms。随着质谱灵敏度的显著提高，自2015 年以来，詹显全教授团队就发现每个2D 胶点包含了平均至少50 个甚至达几百个Proteoforms，并且大多数是低丰度的 并在近1 ～ 2 年来发表了相关论文来全面阐述2DE-LC/MS 的新理念和实践，完全打破了40 多年来人们对双向电泳的传统认识 (即一个2D 胶点中一般仅含有1 ～ 2 蛋白质)，为大规模的Proteoforms 研究提供了技术基础。Proteoforms/Protein species 概念的发展极大的丰富了蛋白质组的内涵，是蛋白质组学研究的更高层次，是国际科学发展的前沿，必将影响着整个生命科学和医学科学的研究和实践，有助于发现可靠而有效的疾病标志物，用于深度理解疾病分子机制和决定药物靶点，或者用于有效的预测、诊断、预后评估。另外，蛋白质组是表型组的重要成分，是基因组功能的最终执行者，是基因组和转录组研究所不能替代的，要实现真正的个性化医学和精准医学，蛋白质组学研究是不能绕过去的。 /p p style=" text-align: center line-height: 1.75em " 　　 span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 基于整合组学发现疾病标志物才是精准发展之重 /strong /span /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　1. 您一直专注于肿瘤蛋白质组学的研究，例如垂体瘤、卵巢癌等相关恶性肿瘤结合组学的研究，请谈谈在这方面的最新的研究成果，以及过程中的主要挑战和解决方案 /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　詹显全： 垂体瘤是颅内常见肿瘤，绝大多数是良性的，只有少数具有侵袭性和恶性，并能引起激素分泌紊乱和颅内压迫症状，出现严重的临床症状，危害人体健康。临床上分为功能性垂体瘤和非功能性垂体瘤，并且非功能性垂体瘤不表现血中激素水平增加，不易早期诊断，经常是当肿瘤体积增加到压迫周围组织器官产生压迫综合征时才被诊断，这时已经是中晚期了，且其分子 /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　机制并不清楚，缺乏早期诊断标志物和药物治疗靶标。因此，非功能性垂体瘤被选为主要研究对象。虽然垂体瘤是在颅内，但我们认为垂体瘤是一种多病因、多过程、多结果的全身性的慢性疾病，并且还具有肿瘤的异质性 它涉及到一系列的分子改变，包括发生在基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和相互作用组水平上的改变，而这些不同水平改变的分子和信号通路又不是孤零零的起作用，而是相互间具有千丝万缕的联系。因此，我们很难用一种单一因素来解决其预测、预防、诊断、治疗和预后评估 而必须从单因素模式转向多参数系统思维模式。垂体瘤的多病因、多过程、多结果、全身性、慢性、分子网络系统性给其“同病同治”提出了严峻挑战，同时为实现其个性化的精准预测、精准预防、精准诊断和精准治疗提供了机遇和条件。多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、影像组学)和系统生物学技术的发展驱动了这一多参数系统思维模式的转变、推进了其个性化医学和精准医学的研究和实践。因此，我们认为多参数系统策略观和多组学是进行垂体瘤个性化医学和精准医学的研究和实践的重要理念和技术方案。 /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　我们从2001 开始进行垂体瘤的蛋白质组学及其翻译后修饰组学研究，从2008 年开始进行多组学和分子网络研究，及预测预防个体化医学(PPPM)和精准医学(PM)研究。经过过去近20 年未间断的研究，我们在垂体瘤的蛋白质组学、翻译后修饰组学、多组学、分子网络和系统生物学研究方面在国际上处于了主导地位。 /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　在我们研究过程中，我深深体会到一个重大思转变就是从以前的单参数模式转向了多参数系统思维模式，这符合肿瘤的真实情况。另外，就是多组学技术促进了这一模式的转变，并是其主要的解决方案。 /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　2. 从您的研究方向及重点出发，您认为多组学研究在精准医学中接下来的研究应当侧重于哪些方面，以及如何才能比较好的实现从研究到临床的转化落地? /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　詹显全：我的研究对象是肿瘤(垂体瘤、卵巢癌、肺癌、胶质瘤)，研究理念是肿瘤的多参数系统策略观，技术手段是多组学和系统生物学，研究的目标是要解决肿瘤的预测预防个体化医学(PPPM)和精准医学(PM)。 /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　我们认为多组学中的不同组学对PPPM/PM 的贡献是不平衡的，即个性化的表型组是基因组通向PPPM/PM 应用实践的桥梁，而蛋白质组和代谢组是表型组中两重要成分。蛋白质组的内涵包括蛋白质的拷贝数变化、剪切变化、翻译后修饰、转位、再分布、空间构型、与周围分子相互作用、及信号通路网络问题。代谢组的内涵涉及到体内所有物质(包括糖、脂、蛋白质、核酸)的代谢产物及其代谢网络问题。要真正实现PPPM 和PM，蛋白质组和代谢组的贡献是基因组所不能替代的是不能绕过去的。人们应从以基因组为中心的研究和实践转向以表型组为中心的研究和实践。其中蛋白质组的研究又应以翻译后修饰和蛋白质存在形式(Proteoforms)作为今后的研究方向。Proteoforms 的研究必将影响着整个生命科学和医学科学。从临床转化研究来看，基于多组学的整合生物标志物是发展方向。对于这里的生物标志物，我们将其分为两类：一类是解决疾病分子机制和药物靶点的生物标志物，这类生物标志物一定要有因果关系 一类是解决预测、诊断、预后评估的生物标志物，这类标志物不一定要求有因果关系，但必要要有量的变化。 /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　3. 作为EPMA(欧洲预测预防个体化医学协会)的中国代表，想请您分享下国际上对于组学研究在精准医疗中的应用现状、趋势以及发展规划 /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　詹显全：欧洲预测预防个体化医学协会(EPMA)是国际个体化医学领域领头的学术协会，由来自全球55 个国家和地区的专家学者组成，其创办的官方杂志EPMA Journal( 中科院2 区，ESI IF5.661) 涵盖了24 个专题内容，较全面地反映了预测预防个体化医学(PPPM)和精准医学(PM)的研究、实践与最新动态，还涉及到PPPM 和PM 的政策、伦理、卫生经济和社会保障等许多方面，为PPPM 和PM 的科研、实践提供了一个很好的交流平台。 /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em " 我本人作为EPMA 的中方代表(National Representative of EPMA in China) 和其官方杂志EPMA Journal 的副主编，参与了其经历的重要活动。我从2008 开始起在EPMA 中主要负责多组学和创新技术方面，在EPMA 白皮书中的“肿瘤预测预防个体化医学的多参数系统策略观”这部分最早就是我写的，之后我们写了一系列文章来论述基于多组学的多参数系统策略的研究和实践。因此，在EPMA，我们的基于多组学的多参数系统策略观还是比较早的，近五六年来多组学研究在EPMA 圈内(55 个国家和地区)发展得很快，已经深入到PPPM 的各个领域。 /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　另外，我认为，精准医学在理念上没错，严格意义上的精准医学是个理想化的概念，人们只能无限去逐步接近它。现阶段搞精准医学还是要回归到人类健康的保护过程，即预测、预防、诊断、治疗和预后评估，这里应该是针对个人来说而不是针对群体，严格说来应该是个性化的精准预测、精准预防、精准诊断、精准治疗和精准预后评估。对于人类健康保护过程来说，预测、预防还是上策，其次就是早诊断、早治疗。多组学研究已渗入到人类健康保护过程的每个环节，主要用来寻找基于多组学的生物标志物，当然这里的生物标志物应泛指前面说的两类：一类是解决疾病机制和治疗靶点的标志物，一类是解决预测、诊断、预后评估的标志物。 /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em " 因此，基于多组学的PPPM/PM 的研究和实践一定是今后发展的一个长远趋势。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 802px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202008/uepic/581ff7cf-5c3e-4fd6-8f5f-805989791ee5.jpg" title=" 詹.jpg" alt=" 詹.jpg" width=" 600" height=" 802" border=" 0" vspace=" 0" / /p p br/ /p

赛默飞与蛋白设施达成战略合作，助力蛋白质科学创新发展赛默飞色谱与质谱中国 // 近日，科学服务领域的世界领导者赛默飞世尔科技（以下简称：赛默飞）携手中国科学院上海高等研究院国家蛋白质科学研究（上海）设施（以下简称：蛋白设施）在上海举办蛋白质动态分析联合实验室签约仪式。双方在蛋白质动态分析研究领域，及通过蛋白设施联合上海临床研究中心开展的临床应用等领域，基于良好的合作意向，同意共建实验室及建立战略合作伙伴关系，并在2024年上海市产业技术创新大会得到会议举办方及与会代表众多领导、专家和学者的见证。本次战略合作基于赛默飞全球领先的高分辨质谱、电镜等平台及蛋白组学解决方案基础上，结合了蛋白设施在蛋白组学领域领先的科研能力、研发成果和强大的技术团队。双方围绕蛋白组学解决方案合作、技术培训交流、人才培养等方面达成了共识，旨在整合双方优势资源，共同提升蛋白组学研究、临床样本队列研究和生物医药领域产业的发展，共创技术新生态，为科研的新质生产力注入活力。高分辨质谱+冷冻电镜打造蛋白质科学创新平台赛默飞高级副总裁、亚太和拉美地区总裁Mark Smedley先生，赛默飞分析仪器事业部中国区商务副总裁周晓斌先生，蛋白设施主任吴家睿教授等出席了本次签约座谈仪式。双方领导共同讨论了高分辨质谱结合冷冻电镜技术，电镜技术结合AI，以及高分辨质谱、电镜技术与Olink方案的整合在蛋白组学领域的创新应用，并探讨了未来共同建立临床质谱标准数据库的落地化方案。滑动查看更多强强携手 加深合作全面推动蛋白质科学创新发展在报告环节，吴家睿主任介绍了蛋白设施成立的背景、技术系统、平台设备、重点方向以及近年来取得的成果。赛默飞材料与分析业务生命科学市场销售发展总监陈昉和色谱与质谱业务科学研究市场高级商务总监周昕分别对之前的技术及培训合作进行了回顾，并对未来计划进行了展望。蛋白组学领域自问世以来，取得了令人瞩目的进展。基于质谱和电镜平台，已经诞生了许多重要的发现。这些发现不仅深化了我们对蛋白质结构、功能和相互作用的理解，还为疾病诊断、药物研发和个体化治疗等提供了重要的指导。 此次合作，将共同推动Orbitrap质谱技术和Cryo-EM冷冻电镜在蛋白组学领域的应用，为蛋白质科学研究和生物医药相关领域产业的发展贡献更多华丽的成果。在未来的合作中，双方将共同努力，充分发挥赛默飞的全球领先技术和蛋白设施的科研实力，为蛋白质科学的创新突破和应用推广开辟更加辉煌的前景。关于中国科学院上海高等研究院国家蛋白质科学研究（上海）设施 蛋白质设施是国家“十一五”规划建设的国家重大科技基础设施项目，是全球生命科学领域首个综合性的大科学装置。蛋白质设施主体位于上海市张江科学城，于2008年经国家发改委批复，2014年建成并开放试运行，2015年通过国家验收正式开放运行。蛋白质设施的目标是建设国际一流的蛋白质科学研究体系和成为我国蛋白质科学及技术发展的重要创新基地。主要任务包括：开展蛋白质科学相关研究；研究蛋白质的多尺度时空结构；分析蛋白质修饰和相互作用；阐释蛋白质与化学小分子之间的相互作用；研究蛋白质相关的计算生物学与系统生物学；发展蛋白质研究的新方法和新技术学；结合创新药物的发展，研究蛋白质药物靶标的功能活动的结构特征等。蛋白质设施将聚焦世界科技前沿领域，在不断创新中实现跨越和发展，充分发挥大科学设施平台效能，全面支撑我国蛋白质科学研究和生物医药相关领域产业的发展。如需合作转载本文，请文末留言。

蛋白质是细胞功能的执行者，是一切生命的物质基础。然而人们对蛋白质和蛋白质组的了解还远远不够，蛋白质分析被认为是一项复杂而艰巨的任务。2015年是蛋白质领域的关键一年，有可能决定着蛋白质分析的未来走向。 　　1.人类蛋白互作图谱取得更大的成果。最近Cell杂志上发表了一项大规模的蛋白质研究，科学家们鉴定了一万四千个蛋白相互作用，获得了迄今为止最大规模的人类蛋白互作图谱。他们计划将在未来六年中逐步完成人类基因组的全部互作图谱。这种图谱可以帮助人们更全面的了解人类互作组，进一步理解疾病的发生和发展。对新发现的蛋白互作进行研究，能够揭示基因型和表型之间的真实关系。我们期待在2015年看到这类研究结出更多硕果。 　　2.人造环境为蛋白质分析提供便利。今年八月Roy Bar-Ziv及其同事在Science杂志上发表文章，展示了以微流体DNA隔室为基础的人造细胞。这些二维的人造细胞可以实现预编程的蛋白合成、代谢和通讯，是一种非常灵活的蛋白合成系统。研究显示，人造细胞能够更好的模拟蛋白表达的动态模式，维持蛋白信号的梯度。人们可以利用这一系统来评估蛋白质的活性和相互作用，这种方法将对蛋白质功能研究产生重要的影响。 　　3. 一个时代的终结&mdash &mdash 蛋白质结构计划PSI收官。PSI项目在运行了十五年后，正逐步走向自己的终点。PSI项目已经确定了六千三百多个蛋白结构，为蛋白质分析做出了重要的贡献。那些为PSI而建的高通量蛋白生产中心可能会继续维持下去，给其他结构生物学实验室使用。结构生物学家们也可能启动与数据处理有关的中、大型项目，作为PSI的延续。 　　不管怎样，对于蛋白质领域来说明年都是特别的一年，研究者们需要决定PSI之后的前进方向。我们希望未来能有更多类似人类互作组图谱的大型项目，增进我们对蛋白质结构和功能的理解。

2003年12月15日，由中国科学院院士贺福初牵头的“人类肝脏蛋白质计划”（HLPP）启动，这是我国领导的第一项重大国际合作计划，也是第一个人类组织/器官的蛋白质组计划。 北京蛋白质组研究中心主任、蛋白质组学国家重点实验室副主任秦钧告诉《中国科学报》记者，十余年来，HLPP经历了三代更迭，从第一代版本的肝脏总蛋白质组，到第二代的肝脏细胞器蛋白质组，以及到刚刚完成的第三代肝脏不同细胞亚群的蛋白质组解析。HLPP的肝脏蛋白质组研究正在并将继续作为“中国人类蛋白质组计划”（CNHPP）的先导，为CNHPP的发展探明道路。 事实上，通过HLPP研究十余年的努力，中国蛋白质组研究团队已向世界交上了一份漂亮的答卷。 据记者了解，中国科学家成功构建了迄今国际上质量最高、规模最大的人类第一个器官蛋白质组的表达谱、修饰谱、连锁图及其综合数据库；首次实现人类组织与器官转录组和蛋白质组的全面对接；在炎症诱发肿瘤等方面，发现一批针对肝脏疾病、恶性肿瘤等重大疾病的潜在药靶、蛋白质药物和生物标志物。 2008年，张学敏课题组首次发现炎症和免疫的新型调控分子CUEDC2，可作为肿瘤耐药的新标志物，从而为克服癌细胞耐药提供了原创性的药物新靶点和治疗新思路。2010年，周钢桥课题组“逮到”肝癌的易感基因，为肝癌的风险预测和早期预警提供了重要理论依据和生物标记̷̷上述几项成果均发表于国际顶级的《科学》《自然》系列杂志。 秦钧认为，蛋白质组学研究是我国生命科学中几个能够始终跻身世界前沿的科学领域之一。 而现在，世界蛋白质组学领域内的新一轮科技竞赛已开始。中国科学院院士、中国科学院大连化学物理研究所研究员张玉奎表示，虽然中国在蛋白质组学领域走在了世界前列，但国外有些团队如今正快马加鞭，中国科学家必须加快步伐，不能丧失已经取得的优势。 这也是我国开展CNHPP研究的一个重要原因。“这是真正的原始创新，是中国能够引领世界科技发展的重要领域之一。”贺福初说。

p 　　作为一名生长在齐鲁大地、深受儒家文化熏陶的青年学者，即便在海外求学多年，孙士生始终心系国家、情牵母校。伴随着时代的召唤，入选国家“千人计划”青年项目的孙士生毅然回到母校西北大学，希冀将他在美国掌握与研发的先进技术应用到西北这片广袤的大地上，以期为母校、为西北地区乃至为整个中国的科研水平真正实现与世界一流接轨尽一份力。 br/ /p p 　　“在我看来，在西部地区开展工作有一定的好处及空间，这里受到的外界诱惑和干扰应该会相对少一些，这份安静其实对于基础科学研究颇有助益。”对于未来，“我将继续在自己擅长的方向——糖蛋白质组学和生物标志物发现研究领域开展前沿研究”，为破译人类癌症的密码贡献力量。在接受《中国科学报》记者采访时，孙士生这样表示到。 /p p 　　和糖蛋白的缘分 /p p 　　2005年本科毕业后，孙士生进入西北大学攻读研究生，并在那里获得了硕士和博士学位。 /p p 　　“还在读大学的时候，我就对糖蛋白比较感兴趣。这个领域研究的人还比较少，但其实相当重要。当时教科书上关于糖蛋白的介绍还非常有限，从那时起我就开始注意搜集这方面的资料，没想到有一天还真的从事了这方面的研究。”孙士生回忆说。 /p p 　　糖蛋白是被聚糖共价修饰的一类蛋白质，糖蛋白上的寡糖链与肽链中的特定氨基酸残基侧链以糖苷键共价连接.糖蛋白普遍存在于动物、植物，真核微生物和各种病毒表面，种类繁多，功能广泛。其中N-连接的糖链合成起始于内质网，完成于高尔基体。其整个合成和分解过程受到各种酶类的特异催化和精确调控。其主要生物学功能为细胞或分子的生物识别，如人类ABO血型和精卵结合过程 另外，受体蛋白、肿瘤细胞表面抗原等亦均属糖蛋白。 /p p 　　近年来，科学界逐渐认识到，糖蛋白与很多疾病如感染、肿瘤、心血管病、肝病、肾病、糖尿病以及某些遗传性疾病等的发生、发展有关。再者，细胞表面的糖蛋白及糖脂可“脱落”到周围环境或进入血循环，它们可以作为相关组织或细胞异常的标志为临床诊断提供信息 患某些疾病时体液中的糖蛋白亦常有特异性或强或弱的改变,这些糖蛋白的发现和应用将有助于疾病诊断或预后的判断。 /p p 　　读研伊始，孙士生从事的是生物芯片方面的研究，“后来因为参与一个糖芯片检测流感病毒宿主范围的项目，我有幸进入了糖蛋白的研究领域，或许这就是缘分吧”，孙士生说。 /p p 　　2011年，从西北大学毕业后，孙士生选择前往美国约翰· 霍普金斯大学Dr. Hui Zhang实验室做博士后，继续从事糖蛋白质组的方法学和生物标志物发现研究。 /p p 　　Dr. Zhang建立了经典分析糖蛋白方法，这在世界上属于蛋白质组学领域的权威。他所领导的实验室，有着很多国际前沿的技术和研究。有幸在这样的实验室工作，孙士生深觉受益匪浅。 /p p 　　“在国外，感触比较深的一点是，国外做科研，比较强调原创性。在美国，张老师会说，这个领域已经有人在做，而且做得不错，我们应该选择一些新的领域去探索。很多学者认为别人没做过的研究会更困难，其实不然，正是因为没人做过，发挥的空间才会更大”。 /p p 　　糖蛋白组学意义重大 /p p 　　在美多年，孙士生所做的诸多研究也产生了不小的国际影响力。 /p p 　　孙士生介绍说，随着蛋白质组学研究的日益成熟和规模化，蛋白翻译后修饰谱成为了新的研究焦点。蛋白糖基化修饰作为最重要、最普遍的蛋白质翻译后修饰之一，主要参与细胞间识别、调控、信号传导、免疫应答、细胞转化和疾病的发生发展。而系统高通量的糖蛋白质组研究方法是蛋白糖基化分析的基础。在美期间，他在Dr. Zhang建立的经典分析糖蛋白方法基础上，通过改变分析策略，创建了一种全面系统分析N-糖蛋白质组的新方法。该方法可广泛应用于肿瘤标记物筛查，蛋白抗体、病毒以及其他各种生物样品中的蛋白糖基化分析。同时，孙士生还建立了一些其他基于质谱分析的糖蛋白质组学新方法。 /p p 　　在蛋白质组/糖蛋白质组学在疾病生物标记物和致病机理研究中的应用方面，孙士生也取得了一定的进展。他与合作者将蛋白质组/糖蛋白质组相关方法学成功应用于各种临床样本分析中。其应用范围包括：人流感病毒、艾滋病病毒(HIV)及其感染的细胞和宿主，不同年龄和性别的人唾液，肝癌细胞系和HCC病人血清，前列腺癌细胞系、组织和血清，卵巢癌细胞系和组织、肺癌细胞系模型和肾衰竭动物模型。 /p p 　　“其中值得一提的是，我在博士后期间作为样本制备主要负责人之一参与了美国临床蛋白质组肿瘤分析(CPTAC)项目。我所在的实验室是全美参与此项目的五个核心实验室之一。在此项目中,我一直负责实验室内样品分析方法的建立，标准流程的制定，样品制备，质量监控和问题解决。目前已顺利完成本轮所有临床样本的蛋白质组和糖蛋白质组图谱的解析,其中蛋白质组的研究成果已在Cell杂志发表”，孙士生说。 /p p 　　回国的“青年千人” /p p 　　梁园虽好，终非故土。在美国学习和工作多年后，孙士生最终选择回到西北大学，并在2017年顺利获得了中组部 “千人计划”青年项目的资助。 /p p 　　“我选择回西北大学，很大程度上是出于对母校的热爱。这儿有我老师、同学和朋友的帮助和支持。有着悠久历史的西北大学近年来综合实力也在蒸蒸日上”，孙士生指出，西北大学学术氛围相对自由，对青年学者没有设置太多限制，“选择西北大学，也有这方面的考量。” /p p 　　回到母校后，孙士生希望能将本人所学，特别是他在糖蛋白质组学及新的肿瘤标志物发现等领域所积累的研究经验及学术成果服务于祖国，同时将母校建设的更好。 /p p 　　展望未来，孙士生表示，他将继续致力于糖蛋白质组学新技术的开发并将其应用于新的生物标志物发现、致病机制研究和蛋白糖基化调控机制研究中。他已针对这些设想制定了详细的工作计划。 /p p 　　孙士生表示，蛋白质组研究技术在癌症、早老性痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治疗方面具有诱人的应用前景。糖类作为重要的生物大分子之一，参与各种重要的生物学过程。然而系统糖生物学研究包括系统的糖链解析、高通量的糖蛋白和糖脂分析等才刚刚起步：“在中国从事这方面的研究，必然会大有可为。” /p p br/ /p

时间：2014年5月20-23日 　　地点：北京蛋白质组研究中心(北京市昌平区科学园路33号，中关村生命科学园内) 　　主办单位： 　　北京蛋白质组研究中心(BPRC) 　　蛋白质组学国家重点实验室(SKLP) 　　中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO) 　　北京蛋白质组研究中心是蛋白质组学国家重点实验室，国际联合研究中心，国际人类肝脏蛋白质组计划(HLPP)执行总部。建立了世界上最大的人类蛋白质组数据库及数据管理平台，和国际领先的蛋白质相互作用网络构建和分析平台。对人类肝脏蛋白质组进行了系统的生物信息研究，包括蛋白质鉴定、修饰、定位、相互作用网络、代谢通路及肿瘤标志物发现等研究。讲师团队长期致力于蛋白质组数据分析及相关知识发现，为国际人类肝脏蛋白质组计划提供了全方位的生物信息支持。2012年，集体获中国电子学会电子信息科学技术奖一等奖：蛋白质组学计算方法的研究及其支撑平台的构建和应用 2007年，集体获北京市科学技术一等奖：蛋白质组支撑技术及其在人类重要疾病与生理过程研究中的应用。 　　前言 　　本课程为生命科学研究人员介绍如何合理利用和开发蛋白质生物信息学资源。课程着眼于实际数据库搜索、工具使用、大型数据库分析、生物学网络构建、可视化和数据分析等。采取小班授课，专人指导 理论课与实践课相结合，讲师与学员研讨的方式进行 精心挑选相应的上机软件，提供充足的实际操作机会 让每位学员学有所成。 　　培训对象 　　从事生命科学、农学、医学等领域科研工作者和高校教师及研究生 　　迫切希望提升生物信息分析能力的学者 　　培训内容 　　质谱数据深度分析、蛋白质注释及功能分析、蛋白质相互作用网络构建及分析、蛋白质组研究主题信息服务和专业数据库研发。 　　课程安排 时间 培训内容 2014年5月20日 9:00-10:00 蛋白质组信息学概论 10:00-12:00 质谱数据处理－搜库与质控 13:00-15:00 蛋白质组定量分析（以无标定量为主） 15:00-16:00 蛋白质翻译后修饰分析 16:00-17:00 蛋白质鉴定上机实习 2014年5月21日 9:00-11:00 质谱数据深度挖掘 11:00-12:00 蛋白质定量上机实习 13:00-15:00 蛋白质组数据分析/生物标志物发现 15:00-17:00 蛋白质组数据分析上机实习 2014年5月22日 9:00-10:30 蛋白质组数据库/数据提交 10:30-12:00 数据库及数据提交实习 13:00-15:00 蛋白质组软件包的使用（TPP等） 15:00-17:00 TPP安装及使用实习 2014年5月23日 9: 00-10:30 蛋白质相互作用网络和蛋白质组学知识挖掘的基础知识 10:30-12:00 蛋白质相互作用的生物信息学资源介绍 13:00-14:00 Cytoscape软件使用介绍 14:00-17:00 蛋白质相互作用数据分析上机 　　培训费 　　4月18日前注册：每人4200元，学生3900元。 　　4月19日至5月20日之间注册：每人4500元，学生4200元。 　　其他优惠：同一单位2人以上参加，每人优惠200元。 　　提前注册截止日期：2014年4月18日，以银行汇款凭证为准。 　　网上注册地址： http://61.50.138.116/training/cn/ 　　培训费用包含：培训资料、培训期间的午、晚餐。 　　可协助安排住宿，住宿费用自理。需住宿的学员请在网上注册时填写住宿信息。 　　报到时间和地点 　　报到：5月19日全天，北京扬子江药业海诺康会馆(北京市昌平区生命园路16号，中关村生命科学园内) 20日8:30-10:00，北京蛋白质组研究中心。 　　住宿：北京扬子江药业海诺康会馆，标准间298元/天(含早餐)。 　　学生报到时须持学生证。 　　学员自备笔记本电脑(具有WiFi无线网络功能)用以操作练习。 　　注意事项 　　培训结束后颁发北京蛋白质组研究中心和蛋白质组学国家重点实验室培训证书，需要中国生物化学与分子生物学会继续教育证书的学员报到时需要另交1张2寸免冠照片及20元工本费。 　　中心通过了ISO/IEC 17025实验室认可，为社会各界提供科研技术服务。参加本期培训班的学员可以享受中心提供的技术服务优惠政策。技术服务项目请看网站： http://www.bprc.ac.cn/guidance/list.php?catid=27 　　汇款信息 　　帐 号：0200004909200041055 　　账户名称：北京蛋白质组研究中心 　　开户银行：工商银行北京市永定路支行 　　注：汇款时请务必注明&ldquo 信息学培训班&rdquo 和学员姓名。汇款后将汇款凭据传真至中心，或将扫描电子版发送至邮箱bprctrain@163.com，以确保汇款安全到账。 　　如需发票请注明发票抬头，培训结束后统一开具发票(培训费、注册费、会议费、技术服务费等)，有其他特殊要求请声明。 　　联系方式 　　联系电话： 注册：周建平(010)80705277 　　咨询：史冬梅(010)80705888 　　传 真：(010)80705155 　　电子邮件：bprctrain@163.com 　　通信地址：北京市昌平区科学园路33号(102206)

11月18日凌晨，神舟八号飞船搭载的生物培养箱在神八落地后几乎是刻不容缓地被送回北京。据介绍，培养箱中装载样品33种，开展了17项空间生命科学实验。如今实验有了什么进展?我们就从中选取几项实验，介绍给您—— 　　神八实验揭秘 　　线虫的太空之旅 　　我是一条线虫,但不是你想象中的寄生虫，你可以叫我的英文名字：C.elegans。我坐着神八飞船，在太空进行了长达十六天半的旅行。 　　自然状态下，我生活在泥土中，以细菌为食。成年后身长约1毫米，人类在显微镜下才能看清。我通体透明，长得不好看。可大连海事大学环境系统生物学研究所孙野青教授和同事们，却常夸我是“可爱美丽的小天使”，还给我起了个好听的名字：秀丽隐杆线虫。 　　不是吹牛，我是天生的“航天员”。在空间生命科学领域，我的家族可谓声名远播。从1975年开始，我的同类就先后搭载美国国家航空航天局的航天飞机邀游太空。 　　为什么选择我们呢?一是因为我们在-80℃长期冻存后仍能恢复活力，是目前已知的唯一能低温冻存的多细胞真核动物。我在逆境时进入休眠期，像熊冬眠一样，不发育、不吃东西，时间可以长达2个月左右。二是我们基因组很小，仅为人类基因组的3%，但有约40%的基因与人类同源。据科学家们说，我们身上很多调控发育的基因和人类很相似，一旦研究清楚在空间辐射环境或空间辐射和微重力同时存在的环境下，我们的这些基因是如何变化的，将给航天医学及空间辐射损伤预警做出巨大贡献。 　　因此，我们在太空中要接受辐射，再把这些辐射损伤的印记带回来。所以我们在地面不能有任何损伤，坐飞机时都不能过安检，临上太空前还要在航天城“集训”两周，看我们能否顺利登舱。 　　这次上太空，我的“房子”是德国航空航天中心DLR研制的SIMBOX(生物支持系统实验盒)内的38个小盒子之一，大约18ml。这么小的空间，却住了十万伙伴。SIMBOX可不简单，它的里面安装了1g的离心装置，模拟地球的引力。我们分成两组，分别被装入在1g的离心机上和附近固定的房子里，有些伙伴只接受空间辐射，有的既接受空间辐射又感受微重力的。当返回地球后，我们就可以被比较分析变化的差别。我们屏住呼吸，停止发育，把空间环境影响的印记尽量留在身上。 　　接下来我们将继续配合孙教授课题组，给人类带来更多惊喜，大家拭目以待吧! 　　放线菌勇闯无重力空间 　　放线菌是“神八”的另一位旅客，它们比缝衣针尖还要小100倍，却是中科院微生物所黄英教授的心肝宝贝们。 　　别小瞧了放线菌!知道抗生素吧?70%是放线菌产生的。它们还是环境保卫者——难降解的塑料、化学除草剂、杀虫剂，可能都是放线菌的“美餐”，只要很短的时间，它们就能消灭这些顽固有机物。 　　黄英说，这次送上太空的有三种微生物，第一种是放线菌里的经典“美人”，它产生的色素像天空般蔚蓝，因此叫天蓝色链霉菌，正是出于颜色易于观察的原因，它是这次上太空的首选“模特” 第二种是放线菌里的“新人类”，它生命力旺盛，产生抗生素的能力又强又稳定，它有个暂定的名字叫卷须链霉菌C 第三种不是放线菌，叫枯草芽孢杆菌，有些洗衣粉里的酶，就是从它的分泌物中提取的。这次，它的命运是被两个同伴杀死，从而测试它们在太空环境下的抑菌能力。 　　放线菌被小心翼翼地放进通用生物培养箱，箱子保持23℃恒温和恒定的湿度，连空气成分都是照搬地球的，并且准备了充分的营养物。 　　送上太空，为什么又模拟地球环境呢?这叫微重力效应实验。地球引力对生物的影响，经常被人们忽视，但确实存在。比如，树木之所以能将根深深扎进土地里，就是因为地球引力的影响。对于放线菌而言，没有了地球引力，又会发生什么样的变化?这就是送放线菌上太空的原因所在。 　　此前科研人员曾在地面模拟微重力效应实验，结果发现它们产生抗生素的周期从1周缩短到4—5天，抗生素的产量也有所增加。 　　将它们送入太空，就是要看看在真实的微重力环境中，它们会发生什么变化。事实证明，在太空的微重力环境下，放线菌的生长和模拟微重力效应环境下相似，甚至效果更好一些。天蓝色链霉菌和卷须链霉菌C在太空中肆无忌惮的生长，杀死了更多的枯草芽孢杆菌，这说明它们释放出的抗生素浓度高于地球上的同类。 　　中科院微生物所接下来的工作，是进一步比对这些从太空中回来的“贵客”们的细微模样和抑菌能力，分析它们的基因性状，抓紧让它们“传宗接代”，看看下一代中会不会出现更美更壮的“佼佼者”。 　　太空中长出蛋白质 　　大约10厘米长、4厘米宽、5厘米厚——这个小黑盒就是由神八携带的、用于蛋白质晶体生长研究的“秘密武器”。打开这个“秘密武器”，可以看到120个排列整齐、大小一致的“小抽屉”，中科院生物物理所研究员仓怀兴解释说，每个“小抽屉”都装满了实验溶液，实验溶液中“漂浮”着一根内径1毫米、长12毫米的玻璃毛细管，毛细管里装着蛋白质溶液。“我们这个实验的主要目的，就是要在太空环境中让蛋白质溶液与实验溶液发生反应，看看能不能生长出质量更好的蛋白质晶体。” 　　蛋白质是生命的物质基础，没有蛋白质就没有生命。蛋白质分子是由氨基酸构成的，氨基酸的不同排列方式、也就是蛋白质分子的不同结构导致其产生不同的功能。 　　“要想知道哪种蛋白质有何功能，必须先了解它的结构。”仓怀兴说：“研究蛋白质分子的结构有两种方法，一是让其长出晶体，再用X射线照射 二是用核磁共振。”但当蛋白质分子比较大时，“比如一些病毒的蛋白质结构，核磁共振就看不到了。” 　　研究蛋白质分子结构是国际学界的热点。“近些年比较热门的应用是生物制药领域，因为很多病毒的外壳都是蛋白质。”仓怀兴介绍说，美、日、欧盟等发达国家早就将蛋白质分子送入太空，以便获得质量更好的蛋白质晶体，从而更加精细地了解蛋白质的结构。“据我了解，到目前为止，大概有25种蛋白质分子的高分辨率结构，是利用在空间实验中获得的蛋白质晶体取得的。我相信还有更多，不过很多制药公司都将其视为机密，在新药研制成功之前不会对外宣布。” 　　虽然有120个“小抽屉”，但此次实验只携带了14种蛋白质溶液。仓怀兴解释说：“蛋白质是种很奇怪的物质，不是说两种溶液相反应就必然能得到晶体，因此我们都做了充分的‘后备’。”仓怀兴说，得到的晶体已经被研究人员带到上海同步辐射光源进一步研究，“很快就会有结果了!” 空间微重力样品 　　神八里的绿色植物 　　“我们利用神八搭载水稻种子，进行高等植物在空间的代谢生物学研究。”中科院植物所的温晓刚说。水稻是空间生命支持系统中重要的食物来源，也是高等植物研究的模式植物，这是“神八”选择水稻种子的原因。 　　这些水稻种子被放置在植物生长容器中，以透光、透气、不透水的生物膜覆盖。“这些水稻种子在太空中萌发，生长成水稻幼苗。”温晓刚说，这些情况与地面上同一温度、湿度情况下生长的水稻种子进行对比，中科院植物所的研究人员就能够分析水稻幼苗在空间环境下的生长发育情况，考察空间飞行对植物代谢过程的影响。 　　温晓刚说：“经过空间飞行，水稻幼苗生长状态良好，发芽率达到91%以上，与地面实验一致。初步的光合生理实验结果显示，水稻幼苗在微重力等空间环境下，其光合系统的活性受到一定程度的影响，其中对光系统Ⅰ的影响大于对光系统Ⅱ的影响。”温晓刚解释，空间微重力会造成高等植物光合机构叶绿体中的类囊体膜结构发生改变，比如类囊体膜垛叠的基粒组分减少等，这种变化可能对植物光合系统的功能造成一定的影响。“实验结果正在进行进一步研究分析中。”接下来科学家们将深入分析得到的光合生理数据，并进行水稻幼苗叶片和根尖的亚显微结构分析，以及水稻叶片的蛋白质组学研究，同时研究空间飞行对水稻幼苗蛋白质组学的影响，特别是与光合作用相关的代谢过程以及与光合能量传递相关的蛋白的影响，分析空间环境下植物光合系统的变化规律。 　　神八中的“生物圈” 　　如果能在飞船密闭的空间里，建立这样一个“生物圈”：让食物产生、氧气供给、二氧化碳去除和废物再循环都变成现实，那宇航员们长期居住太空将不再是梦想。神八里就有一项空间简单密闭生态系统探索研究，我国科学家迈出了在太空自主建立受控生态生命保障系统(简称CELSS)的重要一步。 　　CELSS是生命科学、空间科学、环境科学、自动化和遥感科学诸多高新技术的集成。首先要在空间飞行器上进行模型实验，积累基本数据。神八飞船上，中科院水生生物研究所的科学家们构建了一个简单水生态系统，以纤细裸藻和小球藻作为主要生产者，澳洲水泡螺作为主要消费者，同时以自组织形式共培养细菌作为分解者。在硬件设计上，除了提供藻类生长与产氧所需的光源外，还增加了藻类生长密度检测装置，即时传送生长状态数据进行监控 并以特定的技术进行系统内的气体传质分布，增进气体在不同腔室的传递，以期在系统中实现气体、食物与废物处理的良性循环。中科院水生生物研究所的李小燕介绍，从目前得到的数据来看，藻与螺的生长都符合预期目标和已知规律，系统中的各要素基本实现自循环、自组织的功能。同时从神舟八号返回的样品中，可以在生物的空间飞行效应、空间共培养系统的物种相互关系，空间封闭生态系统的结构与功能三个方面剖析出重要的科学信息。

几种不同折叠模式的蛋白质模型(图片来源Protein Data Bank Japan ) 　　上个世纪初，科学家们认为蛋白质是生命体的遗传物质，而具有独特的作用。随着这个理论被证伪，真正的遗传物质DNA的结构被给予了很大关注。然而，蛋白质作为生命体的重要大分子，其重要性也从未被忽视，而且在1950年代开始，科学家一直在探寻DNA序列和蛋白质序列的相关性。与此同时，蛋白质测序和结构解析蛋白质结构的努力开始慢慢获得回报。更多的生化研究揭示了蛋白质的功能重要性，因此蛋白质的三维结构的解析对于深入理解蛋白质功能和生理现象起着决定性作用。 　　本文简要回顾了蛋白质结构解析的重大历史事件，并总结了蛋白质结构解析的常用方法和结构分析方向。通过了解蛋白质结构，能够让我们更好地理解生物体的蛋白的理化特性，以及其相关联的化学反应途径及其机制，对于我们认识生物世界和研发治疗方法和药物都起着关键作用。在即将召开的2015高分辨率成像与生物医学应用研讨会上，各位专家学者将会进一步讨论相关议题。 　　蛋白质结构解析六十年来大事件 　　在1958年，英国科学家John Kendrew和Max Perutz首先发表了用X射线衍射得到的高分辨率的肌红蛋白Myoglobin的三维结构，然后是更加复杂的血红蛋白Hemoglobin。因此，这两个科学家分享了1962年的诺贝尔化学奖。事实上，这项工作在早在1937年就开始了。 　　然后在1960年代，蛋白质结构解析方法不断进步，获得了更高的解析精度。这个时期，蛋白质序列和DNA序列间关系也被发现，中心法则被Francis Crick提出，然后科学界见证了分子生物学的崛起。分子生物学(Molecular Biology)的名称在1962年开始被广泛接受和使用，并逐渐演变出一些支派，如结构生物学。然后在1964年，Aaron Klug提出了一种基于X射线衍射原理发展而来的全新的方法电子晶体学显微镜(crystallographic electron microscopy )，可以解析更大蛋白质或者蛋白质核酸复合体结构。因为这项研究，他获得了1982诺贝尔化学奖。1969年，Benno P. Schoenborn 提出可以用中子散射和原子核散射来确定大分子中固定位置的氢原子坐标。 　　进入1970年代，很多新的方法开始发展。存储蛋白质三维结构的Protein Data Bank(1971年) 开始出现，这对于规范化和积累蛋白质数据有着重要意义。1975年新的一种仪器叫做多丝区域检测器，让X-ray的检测和数据收集更加快速高效。次年，Robert Langride将X-ray衍射数据可视化，并在加州大学圣地亚哥分校成立了一个计算机图形实验室。同年，KeithHodgson和同事首次证明了可以使用同步加速器获得的X射线并对单个晶体进行照射，并取得了很好的实验效果。然后在1978年，核磁共振NMR首次被用于蛋白质结构的解析 同年首个高精度病毒(西红柿丛矮病毒)衣壳蛋白结构被解析。 　　在1980年代，更多蛋白质结构被解析，蛋白质三维结构的描述越来越成熟，而且蛋白质结构解析也被公认成为药物研发的关键步骤。在1983年，冷冻蚀刻的烟草花叶病毒结构在电子显微镜结构下得到描述。两年后德国科学家John Deisenhofer等解析出了细菌光合反应中心，因此他们共享了1988年的诺贝尔化学奖。次年，两个课题组解析了HIV与复制相关的蛋白酶结构，对针对HIV的药物研发提供了理论基础。 　　下一个十年，因为大量同步加速器辅助的X射线衍射的使用，数千个蛋白质结构得到解析，迎来了蛋白质结构组的曙光。1990年多波长反常散射方法(MAD)方法用于X射线衍射晶体成像，与同步辐射加速器一起，成为了近二十多年来的最常用的的方法。Rod MacKinnon在199年发表了第一个高精度的钾离子通道蛋白结构，对加深神经科学的理解起了重要作用，因此他分享了2003年的诺贝尔化学奖。Ada Yonath等领导的课题组在1999年首次解析了核糖体结构(一种巨大的RNA蛋白质复合体)。　　进入新千年，更多的技术细节被加入到蛋白质解析研究领域。2001年，Roger Kornberg和同事们描述了第一个高精度的RNA聚合酶三维结构，正因此五年后他们共享了诺贝尔化学奖。2007年，首个G蛋白偶联受体结构的解析更是对药物研究带了新的希望。近些年来，越来越多的大的蛋白质结构得到解析。Cryo-EM超低温电子显微镜成像用于超大蛋白质结构成像的研究日益成熟，并开始广泛用于蛋白质结构的解析。 　　蛋白质结构解析的常用实验方法 　　1.X-ray衍射晶体学成像 　　X射线衍射晶体学是最早用于结构解析的实验方法之一。X射线是一种高能短波长的电磁波(本质上属于光子束)，被德国科学家伦琴发现，故又被称为伦琴射线。理论和实验都证明了，当X射线打击在分子晶体颗粒上的时候，X射线会发生衍射效应，通过探测器收集这些衍射信号，可以了解晶体中电子密度的分布，再据此析获得粒子的位置信息。利用这种特点，布拉格父子研制出了X射线分光计并测定了一些盐晶体的结构和金刚石结构。首个DNA结构的解析便是利用X射线衍射晶体学获得的。 　　后来，获得X射线来源的技术得到了改进，如今更多地使用同步辐射的X射线源。来自同步辐射的X射线源可以调节射线的波长和很高的亮度，结合多波长反常散射技术，可以获得更高精度的晶体结构数据，也成为了当今主流的X射线晶体成像学方法。由X射线衍射晶体学解析的结构在RCSB Protein Data Bank中占到了88%。 　　X射线衍射成像虽然得到了长足的发展，仍然有着一定的缺点。X射线对晶体样本有着很大的损伤，因此常用低温液氮环境来保护生物大分子晶体，但是这种情况下的晶体周围环境非常恶劣，可能会对晶体产生不良影响。而且，X射线衍射方法不能用来解析较大的蛋白质。 　　上海同步辐射加速器外景(图片来源 上海同步辐射光源网站) 　　2.NMR核磁共振成像 　　核磁共振成像NMR全称Nuclear magnetic resonance，最早在1938被Isidor Rabi (1946年诺贝尔奖)描述，在上世纪的后半叶得到了长足发展。其基本理论是，带有孤对电子的原子核(自选量子数为1)在外界磁场影响下，会导致原子核的能级发生塞曼分裂，吸收并释放电磁辐射，即产生共振频谱。这种共振电磁辐射的频率与所处磁场强度成一定比例。利用这种特性，通过分析特定原子释放的电磁辐射结合外加磁场分别，可以用于生物大分子的成像或者其他领域的成像。有些时候，NMR也可以结合其他的实验方法，比如液相色谱或者质谱等。 　　RCSB Protein Data Bank数据库中存在大约11000个用NMR解析的生物大分子结构，占到总数大约10%的结构。NMR结构解析多是在溶液状态下的蛋白质结构，一般认为比起晶体结构能够描述生物大分子在细胞内真实结构。而且，NMR结构解析能够获得氢原子的结构位置。然而，NMR也并非万能，有时候也会因为蛋白质在溶液中结构不稳定能难得获取稳定的信号，因此，往往借助计算机建模或者其他方法完善结构解析流程。 　　使用NMR解析的血红蛋白结构建模(图片来源RCSB PDB) 　　3.Cryo-EM超低温电子显微镜成像 　　电子显微镜最早出现在1931年，从设计之初就是为了试图获得高分辨率的病毒图像。通过电子束打击样本获得电子的反射而获取样本的图像。而图像的分辨率与电子束的速度和入射角度相关。通过加速的电子束照射特殊处理过的样品表明，电子束反射，并被探测器接收，并成像从而获得图像信息。具体做法是，将样品迅速至于超低温(液氮环境)下并固定在很薄的乙烷(或者水中)，并置于样品池，在电子显微镜下成像。图像获得后，通过分析图像中数量众多的同一种蛋白质在不同角度的形状，进行多次的计算机建模从而可以获得近原子级别的精度(最低可以到2.0埃)。 　　Cyro-EM解析TRPV1离子通道蛋白(图片来源Structure of the TRPV1 ion channel ) 　　将电子显微镜和计算机建模成像结合在一起的大量实践还是在新世纪之后开始流行的。随着捕捉电子的探测器技术(CCD技术，以及后来的高精度电子捕捉、电子计数electron counting设备)的提升，更多的信息和更低的噪音保证了高分辨率的图像。 　　近些年来，Cryo-EM被用来解析很多结构非常大(无法用X-ray解析)的蛋白质(或者蛋白质复合体)，取得了非常好的结果。同时，单电子捕捉技术取代之前的光电转换成像的CCD摄像设备，减少了图像中的噪音和信号衰减，同时并增强了信号。计算机成像技术的成熟和进步，也赋予了Cryo-EM更多的进步空间。然而，Cyro-EM与X-ray不同，该方法不需要蛋白质成为晶体，相同的是都需要低温环境来减少粒子束对样品的损害。 　　除去介绍的这三种方法以外，计算机建模技术也越来越多地被用在了蛋白质结构解析中。而且新解析的结构也会提高计算机建模的精确度。未来，我们或许能够用计算机构建原子级别的细胞模型，构建在芯片上的细胞。 　　蛋白质结构对了解生命体的生化反应、有针对性的药物研发有着重要意义。从1958到如今已经接近60年，蛋白质结构解析得到了较快的发展。然而，在如今DNA测序如此高效廉价的时代，蛋白质和DNA结构解析并没有进入真正高速发展阶段，这也导致了在如此多的DNA序列数据非常的今天，结构数据却相对少的可怜。大数据时代的基因组、蛋白质组、代谢组、脂类组等飞速发展的时候，蛋白质结构组也得到了更加广泛的重视。发展高精度、高效的结构解析技术也一直都有着重要意义。未来，蛋白质结构解析，对针对蛋白质的药物筛选，和计算机辅助的药物研究研究不应被低估。未来说不定在蛋白质结构领域有着更多惊喜，让我们拭目以待。 第一届电镜网络会议部分视频回放

中国，苏州，2013年3月25日- 2013年3月21-23日，全球近400生物医药领域专家和行业从业者汇聚苏城，参加了2013第六届国际蛋白质和多肽大会。本次大会由中国国家外国专家局国外人才信息研究中心、苏州市人才工作领导小组办公室、苏州人力资源和社会保障局、中国医药生物技术协会联合主办。本次大会主题为&ldquo 发展、转变与产业化&rdquo ，为期三天，就蛋白质组学、蛋白质科学、蛋白分析与分离技术、蛋白质设计与蛋白质工程、蛋白质与疾病、多肽技术与商务合作、分析技术等40个科技议题展开。 大会开幕式 瑞士Tecan集团作为实验室自动化引领者，在蛋白质纯化、自动化胶内酶解与MALDI TOF MS样本制备、蛋白结晶、蛋白表达等领域积累了丰富的经验和知识。Tecan集团Guy Burssens博士应主办方邀请在&ldquo 生物医学和生命科学中质谱（MS）应用&rdquo 的分会场为大家介绍了Tecan 自动化样本制备技术在小分子质谱分析中的应用优势。近年来，小分子质谱分析的样本通量大幅增加，具有高灵敏度和快速高效的质谱分析技术，与目前具有良好选择性和可靠性的液相色谱系统一起，使得实验处理时间大大缩短。但是由于手工制备样本既耗时耗力，又容易出现错误影响实验再现性，因此样本制备环节越来越成为整个实验流程的瓶颈。 使用自动化液体处理技术进行LC-MS/MS样本制备，既可以提高实验可重复性、省时省力，又能极大地保证样本和试剂的可溯源性，因此变得越来越流行。自动化技术良好的成本效益提高了日样本处理通量。另一方面，自动化项目的上马需要综合考虑预算、实验室场地、建设周期等多方面的因素，Guy Burssens博士通过介绍LC-MS/MS中进行自动化样本制备的几组案例，与参会代表们分享了如何有效开展自动化技术，使其能够极大简化现有的实验流程。 Guy Burssens博士介绍自动化样本制备在MS、LC/MS-MS中的应用优势 欲了解更多Tecan蛋白类应用解决方案，请点击www.tecan.cn/protein。 更多详情，欢迎您联系： 帝肯（上海）贸易有限公司 Libby Zhu Tel: 021 2206 3206 / 010 8511 7823 Fax:021 2206 5260 / 010 8511 8461 infotecancn@tecan.com www.tecan.com 关于帝肯 瑞士Tecan是全球领先的生命科学与生物制药、法医和临床诊断领域自动化及解决方案供应商。公司成立于1980年，总部设在瑞士Mä nnedorf，分别在瑞士、北美和奥地利设有自己的研发和生产基地，目前公司主要经营的产品有三大类：全自动化液体处理平台( Liquid Handling & Robotics )、多功能酶标仪(Multimode Reader)和OEM组件。销售服务网络遍布世界52个国家，客户覆盖制药企业、生物技术公司、科研院所、法医、医院、血站系统和疾病控制中心(CDC)等。其液体处理技术已拥有行业经验32年，在全球处于领先地位，备受世界领先生命科学实验室的青睐。作为原始设备制造商(OEM)，Tecan同样在OEM设备和组件开发和生产方面占有世界领先地位。2011年，Tecan创造了3.77亿瑞士法郎（即4.24亿美元；或3.06亿欧元）的销售业绩。Tecan集团的注册股票在瑞士证券交易所交易(TK: TECN/Reuters: TECZn.S/ ISIN: 12100191)。欲了解更多信息，请浏览公司网站：www.tecan.com。 关于帝肯中国 瑞士Tecan于2004年在北京开设代表处，正式进驻中国市场。2008年4月在上海浦东成立帝肯（上海）贸易有限公司，作为Tecan集团在亚太地区（日本及韩国除外）总部，全面负责Tecan集团在中国的所有商业活动，包括销售、市场活动与合作、以及客户支持。帝肯（上海）目前拥有一支专业的售前和售后服务团队，在科研、制药、公安刑侦、医院、血站、CDC和CIQ领域构建了良好的经销和售后服务网络，并以&ldquo 力求比客户期望做的更好&rdquo 的服务理念，给广大的终端用户提供专业的服务。我们致力于成为包括客户在内的所有合作方的首选合作伙伴(Partner of Choice)。 欲了解更多信息，请浏览公司网站：www.tecan.cn。