蝙蝠冠状病毒

今年的春节，我们要从一只蝙蝠，哦不，是从一种病毒说起～（一）要理解冠状病毒，首先要说说病毒病毒是一种个体微小，结构简单，只含一种核酸（DNA或RNA），必须在活细胞内寄生并以复制方式增殖的非细胞型生物。我们常听说的病毒有鼻病毒（主要引起人的感冒）、HIV病毒（艾滋病的元凶）、埃博拉病毒（致死率超高）、狂犬病毒（致死率近乎100%的牛X病毒）… … 到现在为止，谁都不知道在地球上到底有多少种病毒，可能有几百万种，可能有几亿种，反正就是在任何地方、任何生物体中都存在数量不一的病毒，但其中只有约5000种已经被详细描述。（二）病毒的分类病毒那么多，想要正确认识和研究病毒就需要根据不同的依据对病毒进行分类。从遗传物质分类：DNA病毒、RNA病毒、蛋白质病毒（如：朊病毒，疯牛病就属于软病毒感染的病）从病毒结构分类：真病毒（Euvirus，简称病毒）和亚病毒（Subvirus，包括类病毒、拟病毒、朊病毒）从寄主类型分类：噬菌体（细菌病毒）、植物病毒（如烟草花叶病毒）、动物病毒（如禽流感病毒、天花病毒、HⅣ等）从性质来分：温和病毒（例如HⅣ）、烈性病毒（例如狂犬病毒）。病毒的形态：⑴球状病毒（脊髓灰质炎病毒）⑵杆状病毒（烟草花叶病毒）⑶砖形病毒（天花病毒）⑷冠状病毒（SARS病毒）⑸丝状病毒（埃博拉病毒）… … OK，知道了病毒的分类，我们可以将这次发现的新型冠状病毒理解为主要感染动物的冠状RNA病毒（注：非生物学严谨描述，仅为简单理解）（三）冠状病毒1937年，冠状病毒（Coronaviruses）首先从鸡身上分离出来。1965年，分离出第一株人的冠状病毒。由于在电子显微镜下可观察到其外膜上有明显的棒状粒子突起，使其形态看上去像中世纪欧洲帝王的皇冠，因此命名为“冠状病毒”。到目前为止，大约有15种不同冠状病毒株被发现，能够感染多种哺乳动物和鸟类，到本次新型冠状病毒爆发前，已知的仅有6种可以感染人。其中4种在人群中较为普遍，仅引起普通感冒和一些轻微的呼吸道疾病。另外2种是我们熟知的SARS冠状病毒（引起非典）和MERS冠状病毒（引起中东呼吸综合征）。虽然都叫做冠状病毒，但2019年新发现的新型冠状病毒与SARS和MERS还是有很大的不同。从感染的速度和人群来看，受各种因素影响，新型冠状病毒的传染性比较强，但致死率较低，只要做好防护，可以有效避免感染，大家不用过度担心。（四）传播方式1.直接传播：指患者咳嗽、喷嚏、说话的飞沫、呼出的气体近距离直接吸入导致的感染2. 接触传播：指飞沫沉积在物品表面接触污染手后，再接触口腔、鼻腔、眼睛等粘膜导致的感染3.气溶胶传播（有待论证）：指飞沫混合在空气中，形成气沫核（气溶胶）吸入后导致的感染（五）新冠病毒入侵机理这里我们分享一篇通俗易懂的文章分享给大家，即使没有相关的生物学知识也可以快速了解。《武汉不明原因肺炎初步判定… … 》（六）如何识别病毒结合世界卫生组织于2020年1月12日发布的针对疑似新型冠状病毒感染造成严重急性呼吸道感染的临床处置指南（通过RT-PCR进行nCoV检测）。1月25日，上海市科学技术委员会公布中国首款法定检验机构检定合格的新型冠状病毒检测产品；在获得国家药监局批文后，被发往各地医院、疾控中心和出入境检验检疫局，用于测定疑似患者的样本中是否有新型冠状病毒，可望加快识别疑似病例。此次研发出来的试剂盒的科学原理名为“荧光PCR（聚合酶链式反应）法”，是一种用于放大扩增特定遗传片段的分子生物学技术，能利用聚合酶链式反应将微量的基因片段大幅扩增，从而检测出带有特定基因片段的病毒。荧光PCR（聚合酶链式反应）法是目前灵敏度和准确度最高的检测手段，也是现用的新型冠状病毒的确诊手段它通过聚合酶链式反应，即PCR，检测病人样品的核酸提取物中是否含有该病毒所独有的基因。这种检测方法的前提是必须知晓病毒完整基因序列。在这一点上，我们十分幸运，因为此次“新型冠状病毒感染性肺炎”的罪魁祸首新型冠状病毒的基因序列已被科学家们破译，找到了它所独有的基因片段，因此核酸检测成为可能。划重点！要对病毒进行核酸检测，首先必须从各种医疗样本中提纯出核酸样本。截止2020年2月5日，湖北省全省累计检测样本89600多份，这接近90000的样本有咽拭子，血液等，不同的样本必须经过处理才能得到病毒核酸。如此大的样本量，在医疗资源极度匮乏的当下，自动化的仪器设备成了解决此次疫情检测难题的急先锋。新芝生物NP-2032全自动核酸提取仪可解放检测人员双手，是病毒核酸提取的必备神器！NP-2032全自动核酸提取仪 性能特点 快速高效纯化后的核酸纯度可满足各类下游实验需求核酸回收率95%，磁珠回收率95%合计约20-40min可完成32个样本提取（依试剂而定）安全可靠全自动操作搭配一次性耗材，减少人员接触内置可定时紫外消毒，高效清洁排气风扇，有效避免气溶胶污染运行中防开门报警并自动停止运动结构，保障操作安全通用性强多速度多模块供选择，且可储存100个程序，满足不同客户要求自定义裂解、洗脱温度适合于不同样本，如动植物组织、血清、血浆等操控灵活大屏幕全彩显示，触控式操作，简单易用可自定义快捷程序，一键启动人性化的观察窗、显示屏设计，方便操作▼End

p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 近期，在我国湖北省武汉市等多个地区发生的新型冠状病毒感染的肺炎疫情引起举国关注。在国家卫健委、中国科学院的统一部署和湖北省武汉市有关部门的指导下，中国科学院武汉病毒研究所坚决贯彻落实党中央决策，加紧科研攻关，全力支持、全程参与相关防控工作，充分发挥依托我所建设的武汉国家生物安全实验室和国家病毒资源库的核心支撑作用，着力进行病原鉴定、病毒溯源、病原检测、抗病毒药物及疫苗等研究，努力为一线防控治疗提供重要资源储备和科技支撑。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " strong 提供资源支撑，牵头联合攻关 /strong /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 2019年12月30日，在疫情爆发初期，武汉病毒所积极响应武汉市政府、湖北省卫健委和武汉市卫健委的防控联动机制，开展新型冠状病毒样本的收集和标准化入库工作。研究所于2020年1月2日确定了新型冠状病毒（以下称2019新型冠状病毒）全基因组序列，于1月5日成功分离到了病毒毒株。1月9日该毒株资源已按标准完成国家病毒资源库入库，并进行了标准化保藏（保藏编号：IVCAS 6.7512），可依法依规提供给有关机构，将为当前2019新型冠状病毒的科学研究、疫苗开发、生物医药筛选等提供重要资源支撑。1月11日，武汉病毒所作为国家卫健委的指定机构之一，向世界卫生组织提交了2019新型冠状病毒基因组序列信息，在全球流感共享数据库（GISAID，Global Initiative on Sharing All Influenza Data）发布，实现全球共享。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 2020年1月23日，湖北省新型肺炎应急科研攻关专家组召开第一次工作会议。会议正式宣布成立由武汉病毒所牵头，石正丽研究员任组长，与来自华中农业大学、华中科技大学、武汉大学、湖北省中医院、武汉金银潭医院等单位的13位专家共同组成科研攻关专家组，着重在快速检测技术产品研发、疾病发生、发展和传播规律及临床诊治、抗病毒应急药物和抗体类药物等8个方面开展联合攻关，协同全省优势科研力量，全力打好科技防控攻关战。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " strong 积极主动参与，助力检测诊断 /strong /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 当前，武汉市作为此次疫情的重点区域，疑似病例不断出现，病毒检验检测任务十分艰巨。1月26日，武汉市确定了省疾控中心等2家疾病预防控制机构、同济医院等9家医疗机构、以及武汉病毒所等2家专业机构开展2019新型冠状病毒肺炎病原学检测。目前，武汉病毒所以疫情防控为中心，凭借自身的硬件条件和科技支撑队伍，已开展了部分2019新型冠状病毒临床样本检测，助力武汉市缓解防疫压力，并进一步提升新冠肺炎的检测及诊治能力。同时，由研究所开发的病毒检测试剂和方法，已应用于本次病原检测工作中，为后续诊断试剂盒的开发和推广使用奠定了坚实基础。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 此外，武汉病毒所实现了2019新型冠状病毒相关抗原蛋白的原核和真核表达。通过与珠海丽珠试剂股份有限公司合作，在短时间内完成了2019新型冠状病毒IgG、IgM血清学诊断试剂盒（酶联免疫法），可作为除咽拭子病原核酸检测以外的重要辅助诊断手段。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " strong 突破科学难题，取得重要进展 /strong /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 1月23日，武汉病毒所石正丽团队在bioRxiv预印版平台上发表文章《一种新型冠状病毒的发现及其可能的蝙蝠起源》（“Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin”），提出新型肺炎病毒或来源于蝙蝠。文章首次证实了该新型冠状病毒使用与SARS冠状病毒相同的细胞进入受体（ACE2），并发现新型冠状病毒与一种蝙蝠的冠状病毒的序列一致性高达96%，为后续病毒致病机理、病毒溯源等研究提供了重要依据。同时武汉病毒所正积极开展新型冠状病毒感染的抗病毒药物筛选、动物模型建立、疫苗研发等工作。目前已筛选出了几种有潜在临床应用价值的药物, 筛选结果已向国家和湖北省新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控指挥部科技攻关组报告，供综合研判后指导医疗救治。在动物模型方面，已基本完成小鼠和非人灵长类动物模型的建立，将为后续研究提供关键支撑。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 疫情当前，使命在肩。早在2003年SARS爆发时期，国家从战略高度部署了武汉病毒所承担的武汉国家生物安全实验室建设任务。经过十多年的积累，实验室作为我国生物安全防护等级最高的综合性技术平台，一直将应对突发公共卫生事件的能力建设作为其核心责任。在本次疫情发生并完成病原鉴定后，实验室已获国家卫健委批复，可开展新型冠状病毒相关实验活动。未来，武汉病毒所将进一步响应国家号召，依托高等级生物安全实验室和国家病毒资源库等关键科学设施，全面动员、加强科研攻关，继续为新型冠状病毒肺炎相关的科研攻关贡献力量。 /p

p style=" text-indent: 2em " 截至1月20日18时，中国境内累计报告新型冠状病毒感染的肺炎病例224例，其中确诊病例217例（武汉198例，北京5例，广东14例）。疑似病例7例（四川2例，云南1例，上海2例，广西壮族自治区1例，山东1例）。日本通报确诊病例1例，泰国通报确诊病例2例，韩国通报确诊病例1例。 /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 550px height: 338px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/5987ab17-e1d0-42be-bf99-a93d5e88e80b.jpg" title=" 1.jpg" alt=" 1.jpg" width=" 550" height=" 338" border=" 0" vspace=" 0" / /p p br/ /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " 图片来源：央视新闻 /p p style=" text-indent: 2em " 新型冠状病毒是什么？从哪来？我们该如何预防？ /p p style=" text-indent: 2em " 首先我们先来捋一捋新型冠状病毒的发现过程。 /p p style=" text-indent: 2em " 疫情最早通报时间为12月31日，第二天，与肺炎病例出现可能有关的华南海鲜城被关闭，并进行卫生消毒处置。 /p p style=" text-indent: 2em " 从第一次公告截至1月20日22时，武汉市累计报告新型冠状病毒感染的肺炎病例为198例，死亡3例。同时北京和广州分别确诊2例和1例。1月13日和15日，泰国和日本也先后确诊3例武汉新型冠状病毒肺炎病例，1月19日，韩国确诊首例新型冠状病毒肺炎病例。 /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 550px height: 342px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/d6f6349e-90eb-4829-a604-7f2034867cde.jpg" title=" 2.jpg" alt=" 2.jpg" width=" 550" height=" 342" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-indent: 0em " 武汉肺炎相关病例数（数据来自武汉市卫生健康委，更新至1月20日） /p p style=" text-indent: 2em " strong 1、什么是冠状病毒？ /strong /p p style=" text-indent: 2em " 众所周知，中东呼吸综合症（MERS）和严重急性呼吸综合症（SARS）都是由冠状病毒引起的。冠状病毒是一大类病毒，可感染人、鼠、猪、猫、犬、牛、貂、蝙蝠、骆驼、刺猬等哺乳动物以及多种鸟类，在20世纪60年代被首次发现。由于病毒外壳带有棘突（spike），看起来像& quot 皇冠& quot ，因此1975年被正式命名为冠状病毒。 /p p style=" text-align: center text-indent: 2em " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 550px height: 367px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/e2959ae9-990c-4ad5-adec-3d7b6ee08ae7.jpg" title=" 3.jpg" alt=" 3.jpg" width=" 550" height=" 367" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center text-indent: 2em " 冠状病毒 （图片来源：Veer图库） /p p style=" text-indent: 2em " 冠状病毒直径约80—120纳米，是目前已知最大的RNA病毒。冠状病毒分为：α、β、γ、δ四个属，其中引起重症，能广泛传播引起流行的SARS和MERS冠状病毒均属于β属冠状病毒，这次的新型冠状病毒也是β属。 /p p style=" text-indent: 2em " 人类冠状病毒是引起上呼吸道感染的常见病原体之一。从症状上来看，人类感染一般冠状病毒潜伏期为2—5天，引起的症状类似普通感冒，如发热、咳嗽、咽痛和鼻炎等轻微上呼吸道症状，少数病例可有神经系统等并发症。并且在冬季、春季高发，各年龄组人群普遍易感，在儿童、老人及免疫力低下等特定人群中危害严重，并可发生重复感染以及多种呼吸道病毒的共感染。 /p p style=" text-indent: 2em " 而此次新发现的型冠状病毒目前发现的潜伏期为2—12天，初期会引起发热、乏力、干咳等呼吸道症状。疾病进展较快，7天内即会出现呼吸困难，严重者会出现急性呼吸窘迫综合征、休克等较为严重的肺炎症状。 /p p style=" text-indent: 2em " strong 2、研究者是如何破解新型冠状病毒身份的？ /strong /p p style=" text-indent: 2em " 1月7日，实验室从1例阳性病人样本中分离出病毒样株，并在电镜下观察到病毒颗粒形态。1月10日，实验室人员获得病毒全基因组序列。通过对病毒基因组序列分析，科学家发现，引起此次武汉肺炎的病原体与蝙蝠中发现的一种SARS样冠状病毒亲缘关系最近，其次则是与SARS冠状病毒最为接近。但是它在进化关系上已形成新的分支，因此被认为是一种新型的冠状病毒。 /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/d9bb29f4-c1f6-4877-9597-37edddffb629.jpg" title=" 4.jpg" alt=" 4.jpg" / /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " 电镜下的2019新型冠状病毒 （图片来源：China CDC） /p p style=" text-indent: 2em " strong 3、新型冠状病毒从哪里来？ /strong /p p style=" text-indent: 2em " 根据序列分析结果显示，此次病毒由蝙蝠冠状病毒变异而来的可能性极大。最初发现此次疫情的武汉华南海鲜市场，除了售卖海鲜外，还是华中地区最大的& quot 野味& quot 交易市场，售卖各类野生动物。因此，病毒到底是由蝙蝠传染给野生动物，在野生动物体内发生变异并传染给人，还是由于蝙蝠病毒直接变异传染给野生动物从而传染给人，则需要科学家和实验室人员从相关场所进行采样，确定传染源及对传播路径等进行综合判断分析，而这需要时间和严谨的证据链。 /p p style=" text-indent: 2em " 关于病毒的传播方式，目前已经确定有人传人的现象。国家卫健委高级别专家组组长、中国工程院院士、国家呼吸系统疾病临床研究专家钟南山表示:& quot 根据目前的资料，新型冠状病毒肺炎是肯定的人传人，在广东有2个病例，没去过武汉，但家人去了武汉后染上了新型冠状病毒肺炎，现在可以说，肯定的，有人传人现象。& quot /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 550px height: 611px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/b120cee1-c9fb-4db5-8524-2768d0686096.jpg" title=" 5.jpg" alt=" 5.jpg" width=" 550" height=" 611" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " 图片来源：央视新闻 /p p style=" text-indent: 2em " 由于新型冠状病毒传染来源尚未找到，疫情传播途径尚未完全掌握，可以预见的是：情况仍会不断变化，对于疫情及病毒的变异情况仍需严密监控。 /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/ff8c9c21-2679-4c99-8404-a9b679d9e10e.jpg" title=" 6.jpg" alt=" 6.jpg" / /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " 冠状病毒可能的跨种传播形式（图片来源：参考资料3，有改动） /p p style=" text-indent: 2em " strong 4、新型冠状病毒肺炎如何防治？ /strong /p p style=" text-indent: 2em " 目前针对冠状病毒感染无特效药物及疫苗，对于人体内病毒的杀灭主要依赖人类自身免疫系统，因此治疗主要为对症和支持疗法，包括根据病情监测生命体征，血常规、尿常规等各项生化指标，以及胸部影像学复查。建议被感染患者卧床休息，同时注意维持体内水、电解质等内环境的平衡。 /p p style=" text-indent: 2em " 因此，预防是关键，关于新型冠状病毒预防可以借鉴防控SARS与MERS的经验： /p p style=" text-indent: 2em " 1) 尽量少接触一切未知来源的动物； /p p style=" text-indent: 2em " 2) 避免与类似患者近距离接触； /p p style=" text-indent: 2em " 3) 加强室内通风，保持室内环境清洁； /p p style=" text-indent: 2em " 4) 勤洗手、保持清洁，不共用洗漱用品； /p p style=" text-indent: 2em " 5) 平常多饮水，多吃蔬菜水果，注意锻炼身体； /p p style=" text-indent: 2em " 6) 打喷嚏、咳嗽要避开他人，用纸巾、手肘等部位遮挡。 /p p style=" text-indent: 2em " 7) 尤其是儿童、老人及免疫力低下者少去人员密集场所，外出时戴口罩以防感染； /p p style=" text-indent: 2em " 8) 一旦发生可疑症状，包括发热、乏力，出现干咳等呼吸道症状，或者近期有接触相关野生动物，应该及时就医。 /p p style=" text-indent: 2em " 参考资料： /p p style=" text-indent: 2em " 1. 武汉市卫生健康委官网. http://wjw.wuhan.gov.cn /p p style=" text-indent: 2em " 2. 中国疾病预防控制中心官网. http://www.chinacdc.cn /p p style=" text-indent: 2em " 3. Origin and evolution of pathogenic coronaviruses. /p

p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " strong 仪器信息网讯& nbsp /strong span style=" text-indent: 2em " 冠状病毒是一类严重危害人类和动物健康的病原微生物，属于具有大量天然宿主的一类RNA病毒。该病毒极易发生基因重组和变异，具有遗传多样性，迄今为止，已不断有新亚型或新的冠状病毒出现。冠状病毒上的S蛋白、PLpro和3CLpro是药物开发的良好靶点，本文整理并总结了基于靶标发现的潜在药物。 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" text-indent: 2em " /span /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202003/uepic/38dd544f-4905-4c6c-899f-7d2e0b1a4099.jpg" title=" 截屏2020-03-30上午11.54.47.png" alt=" 截屏2020-03-30上午11.54.47.png" / /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 冠状病毒是一种有包膜的、非节段的单股正链RNA病毒，属于巢病毒目（nidovirales）冠状病毒科（Coronaviridae）正冠状病毒亚科（ortho-coronavirinae）。由于病毒包膜上有向四周伸出的突起，形如花冠而得名。冠状病毒亚科进一步细分为四类，即α、β、γ 和 δ 冠状病毒。冠状病毒在自然界中广泛存在，其自然宿主包括人类和其他哺乳动物如牛、猪、犬、猫、鼠和蝙蝠等。 strong 目前，已经鉴定出六种人类冠状病毒，其中包括α属的HCoV-29E和HCoV-NL63；β属的HCoV-OC43、HCoV-HKU1、严重急性呼吸综合征相关冠状病毒（SARS-CoV）和中东呼吸综合征相关冠状病毒（MERS-CoV）。 /strong /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 另外，近期从武汉市不明原因肺炎患者下呼吸道分离出的冠状病毒，世界卫生组织初步命名为2019-nCoV。2020年2月12日，国际病毒分类委员会宣布新型冠状病毒（2019-nCoV）的正式分类名为 span style=" color: rgb(192, 0, 0) " 严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV-2） /span 。研究者将来源于武汉的新型冠状病毒序列与已知的“SARS冠状病毒”“MERS冠状病毒”进行了比较，发现 strong 6个新型冠状病毒序列几乎一致，其与SARS的同源性更高，相似性约为70%，与MERS相似性约为40%。 /strong strong 序列差异主要在ORF1a和编码S-蛋白的spike基因上，这是冠状病毒与宿主细胞作用的关键蛋白。 /strong /p p style=" text-align: center text-indent: 2em line-height: 1.75em " strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 冠状病毒蛋白靶点结构研究进展 /span /strong /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 冠状病毒是最大的一种核糖核酸病毒（26～32kb），其基因组为单股、正链RNA。编码非结构蛋白（Nps）的复制酶基因占据了基因组的三分之二，而结构蛋白和辅助蛋白仅占病毒基因组的三分之一。目前已经解析出了许多冠状病毒相关的蛋白质结构，如SARS-CoV S糖蛋白（PDB ID：5WRG）（图1A）、MERS-CoV N蛋白的C末端结构域（PDB ID：6G13）（图1B）、MERS-CoV N蛋白的N末端结构域（PDB ID： 4UD1）（图1C）。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202003/uepic/fd7a83a8-25f3-48a0-989e-958bb95bc364.jpg" title=" 截屏2020-03-30上午10.38.54.png" alt=" 截屏2020-03-30上午10.38.54.png" / /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 病毒体与宿主细胞的初始附着是通过S蛋白与其受体之间的相互作用而开始的。根据研究报道，S蛋白具有受体结合活性和膜融合活性，是冠状病毒感染细胞的关键蛋白。研究发现在大多数冠状病毒中，S蛋白被宿主细胞弗林蛋白酶（Furin）样蛋白酶切割成S1和S2两种单独的多肽。S1的主要功能是与宿主细胞表面受体结合，而S2亚基则负责介导病毒-细胞以及细胞-细胞膜的融合。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 在对近期的SARS-CoV-2 S蛋白进行研究时发现，虽然SARS-CoV-2 S蛋白中与ACE2蛋白结合的5个关键氨基酸中有4个发生了变化，但变化后的氨基酸，却没有影响SARS-CoV S蛋白与ACE2 蛋白互作的构象。与SARS-CoV S蛋白相比，突变体后的SARS-CoV-2 S蛋白结构与ACE2 蛋白相互作用能力，由于丢失的少数氢键有所下降，但仍然达到很强的结合自由能，说明SARS-CoV-2 是通过S蛋白与人ACE2相互作用感染人的呼吸道上皮细胞。 /p p style=" text-align: center text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 疫苗和治疗药物研究进展 /strong /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 为了控制病毒的爆发，研究者们开发了针对 SARS¯ CoV 和 MERS¯ CoV 的疫苗。不同的疫苗有不同的制备方法下表中列出了这些方法的发展和优缺点。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202003/uepic/446bbee2-3399-4764-a3f5-0339be331bc9.jpg" title=" 截屏2020-03-30上午10.59.39.png" alt=" 截屏2020-03-30上午10.59.39.png" / /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 迄今为止，大多数研究只集中在SARS疫苗的开发上，研究过程中使用了动物模型，但是这些模型并不能概括人类发生的严重临床疾病。 strong 综合SARS 和 MERS 疫苗的研究经验。发现冠状病毒疫苗的研究主要靶标是冠状病毒的S蛋白。疫苗不仅需要诱导体液和细胞免疫应答，还需要诱导黏膜免疫应答并借助佐剂来诱导 Th1 和 Th2 途径的平衡。也就是说成功的疫苗必须在不引起过度免疫激活的情况下达到保护的平衡。 未来还需加强对 SARS-CoV 和 MERS-CoV 等疫苗的研发。 /strong /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 对于目前的 SARS-CoV-2，据新华社报道，美国医学专家正与中国同行合作研发针对新型冠状病毒的疫苗，美国休斯敦贝勒医学院彼得霍特兹教授通过电子邮件表示，贝勒医学院正在与美国得克萨斯大学、美国纽约血液中心以及中国上海复旦大学合作开发疫苗。目前，尚无针对 SARS-CoV、MERS-CoV、 & nbsp SARS-CoV-2 和其他 HCoV 感染的特异性疗法，患者主要接受支持性治疗，并辅以多种药物组合，包括使用抗体、干扰素以及病毒和宿主蛋白酶的抑制剂。& nbsp /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 此外，除了针对SARS外，有研究报道了一种针对MERS-CoV S蛋白N端结构域的新型中和单克隆抗体。该研究表明N末端结构域在病毒感染过程中可能很重要，这项发现对于进一步的疫苗设计和针对MERS-CoV感染的预防和治疗性单克隆免疫法的开发具有重要意义。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 理想情况下，疫苗接种和抗病毒治疗都应具有各自明确的作用机制，以避免产生逃逸突变病毒菌株，并提高对不同病毒菌株的活性。 strong 迄今为止，利巴韦林和利巴韦林加各种类型的干扰素已成为SARS和MERS患者最常用的治疗手段。 /strong SARS-CoV-2爆发以来，全国各个攻关团队筛选出一系列具有治疗潜力的药物。 strong 中国科学院上海药物研究所和上海科技大学免疫化学研究所的抗SARS-CoV-2病毒感染联合应急攻关团队报道了综合利用虚拟筛选和酶学测试相结合的策略进行药物筛选，发现了30种可能对SARS-CoV-2有治疗作用的药物、活性天然产物和中药。 /strong /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " strong span style=" text-indent: 2em " 沈阳药科大学、华中科技大学和军事医学研究院国家应急防控药物工程技术研究中心组成的联合攻关小组发现SARS-CoV-2蛋白序列中SARS-CoV-2-PLP序列与SARS-CoV-PLP具有82%的氨基酸同源性。 /span /strong /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " & nbsp 2020 年 1 月 21 日，中国科学院上海巴斯德研究所郝沛研究员等使用计算机模拟的方法发现了& nbsp SARS-CoV-2的S-蛋白的受体结合结构域(RBD)和人血管紧张素转化酶 ACE2 的结合作用较强。& nbsp SARS-CoV-2通过 S 蛋白 - ACE2 结合途径对人 类传播构成了重大的公共卫生风险。因此ACE2 也可能用于& nbsp SARS-CoV-2的治疗研究。 黄朝林等根据过往洛匹那韦利托那韦片对& nbsp SARS-CoV感染的患者有“ 实质性的临床益处” 的结果 推测这种疗法可能对& nbsp SARS-CoV-2感染的患者有效。此外，武汉病毒研究所与军事医学科学院毒物药物研究所联合发现了在细胞层面上对& nbsp SARS-CoV-2有较好抑 制作用的雷米迪维或瑞德西韦(RemdesivirGS-5734)、氯喹(ChloroquineSigma-C6628)、利托那 韦(Ritonavir)等三种“老药物”。& nbsp /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 瑞德西韦属于核苷类似物能够抑制 RNA 依赖的 RNA 聚合酶 (RdRp)，由美国知名药企吉利德科学公司研发原本用于对抗埃博拉病毒在体外和动物模型中瑞德西韦证实了对 SARS 和 MERS 的病毒病原体均有活性它们与新型冠状病毒结构相似，从理论预测瑞德西韦对新型冠状病毒可能有效。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 目 strong 前瑞德西韦已进入 III 期临床试验该临床试验项目将在武汉市金银潭医院等多家医院同时进行两部分组成均采用随机、双盲、安慰剂对照形式开展。 /strong 据吉利德对外披露，在武汉进行的临床实验有两项，一是研究评估瑞德西韦用于未表现出显著临床症状患者的治疗效果，也就是轻、重症患者。另一项则是评估其用于重症确诊病患的疗效。值得一提的是，来自中国科学院武汉病毒研究所等机构的中国学者已经在细胞水平上验证了瑞德西韦在2019 新型冠状病毒上有较好的活性。 span style=" text-indent: 2em " 研究结果显示在 Vero E6 细胞上瑞德西韦对 SARS-CoV-2的半数有效浓度EC50 =0.77μmol/L,选择指数 SI 大于 129,表明该药物在细胞水平上能效抑制& nbsp SARS-CoV-2 的感染，但其在人体上的作用还有待临床验证。 /span /p p br/ /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 参考文献： /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 1.XU X T,CHEN P,WANG J F,et al. Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission[J]. Science China-Life Sciences,2020.& nbsp /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 2.FOUCHIER R A,HARTWIG N G,BESTEBROER T M,et al. A previously undescribed coronavirus associated with respiratory disease in humans [J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,2004,101(16):6212 - 6216.& nbsp /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 3.VANDER HOEK L,PYRC K,JEBBINK M F,et al. Identification of a new human coronavirus [ J] . Nature Medicine,2004,10(4):368 -373.& nbsp /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 4.WANG M,CAO R,ZHANG L,et al. Remdesivir and chloroquine effectively inhibit the recently emerged novel coronavirus (2019¯ nCoV) in vitro [J]. Cell Research,2020 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 5.HUANG C,WANG Y,LI X,et al. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan,China [J]. Lancet,2020.& nbsp /p p br/ /p p br/ /p

p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " span style=" color: rgb(79, 129, 189) " strong 介绍 /strong /span br/ /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　急性呼吸道疾病(ARD)在全世界所有急性发病率和死亡率中占很大比例，其中急性病毒性呼吸道感染是主要原因(约80%)。主要病毒病原体包括流感病毒，呼吸道疾病合胞病毒(RSV)，冠状病毒，腺病毒和鼻病毒。在5岁以下的儿童中，仅流感和RSV的全球总死亡率每年就达到300,000例死亡。其他呼吸道病毒(如腺病毒和鼻病毒)的死亡率较低，但发病率很高，造成了巨大的经济负担。 可能引起流行病或大流行的高致病性新兴和复发性冠状病毒，例如严重的急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)和中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)，已对全球公共卫生构成了巨大威胁。最近，一种新颖的冠状病毒2019-nCoV(https://www.who.int)导致严重的公共卫生事件。该冠状病毒的完整基因组序列已于2020年1月10日发布，与SARS-CoV和蝙蝠型SARS冠状病毒(SL-CoV)超过82%序列相似性。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　对致病性病毒病原进行准确，快速的诊断对于选择适当的治疗方法，挽救人们的生命，制止流行病并减少不必要的抗生素使用非常重要。上述所有病毒均可引起上呼吸道感染和下呼吸道感染，以及重叠的临床表现，如果没有扎实的实验室分析，医生很难区分病原体。常规的诊断方法，例如病毒培养和直接/间接免疫荧光测定(IFA)，既费时又费力，而且灵敏度有限。快速，准确地诊断呼吸道病毒可以帮助进行流行病学监测，以及采取有效的预防措施和实施适当的抗病毒治疗。在过去的几十年中，从常规方法到快速抗原检测，病毒诊断测试一直在发展。最近，已经开发出高灵敏度的核酸扩增试验(NAAT)和即时检验(POCT)。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　在这篇综述中，研究人员描述了目前可用于诊断人类呼吸道病毒感染的各种方法。 预计这些数据将有助于临床实验室快速准确地诊断呼吸道病毒，从而为医生提供及时和适当治疗患者的基本信息。该综述总结了常用的流感病毒，RSV，冠状病毒，腺病毒和鼻病毒的诊断方法，并在下面的评论中进行了详细描述。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " span style=" color: rgb(79, 129, 189) " strong 　　流感病毒及其诊断方法 /strong /span /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　流感病毒属于正粘病毒科。 该家族由五个属(甲型流感病毒，乙型流感病毒，丙型流感病毒，Thogotovirus和Isavirus)组成，它们根据内部核蛋白(NP)和基质(M)蛋白进行分类。 在这些属中，仅甲型和乙型流感病毒引起临床疾病。 乙型流感病毒感染通常引起局部性暴发，而甲型流感病毒是人类感染的主要病原体，因此是大流行性流感的主要原因。基于糖蛋白血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)， 甲型流感病毒位于病毒表面，分为多种亚型。 到目前为止，已鉴定出18种HA(H1-H18)和11种NA(N1-N11)亚型。已使用许多诊断方法，包括病毒分离以及一些新兴的基于分子的方法来检测发生流感的病毒种类。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　 span style=" color: rgb(79, 129, 189) " strong 人类呼吸道合胞病毒及其诊断方法 /strong /span /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　人RSV是副粘病毒科的无节段，负义和单链RNA病毒。RSV的基因组包括十个编码11种蛋白质的基因。根据基因组序列和单克隆抗体(mAb)对表面糖蛋白(G)和融合蛋白(F)的反应性，RSV可以分为A和B组。RSV是导致严重呼吸道疾病的主要原因。免疫功能低下的人群，例如婴儿和老年人群，在全球范围内具有很高的发病率和死亡率。早期和准确的RSV诊断对于适当的治疗至关重要。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　 span style=" color: rgb(79, 129, 189) " strong 冠状病毒及其诊断方法 /strong /span /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　冠状病毒属于冠状病毒科。蝙蝠已被公认是各种冠状病毒的天然宿主和载体，并且该病毒已经越过物种壁垒感染人类和许多其他种类的动物，包括鸟类，啮齿动物等。冠状病毒可能引起呼吸系统疾病和神经系统疾病。到目前为止，已鉴定出六种人类冠状病毒(HCoV)，包括HCoV-229E，HCoV-HKU1，HCoV-OC43，HCoV-NL63，严重急性呼吸综合症冠状病毒(SARS-CoV)和中东呼吸综合症冠状病毒( MERS-CoV)【注：新型冠状病毒2019-nCoV没有统计在内】。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　MERS-CoV是一种人类冠状病毒，于2012年6月首次报道，可引起人类呼吸系统疾病，它被归类为Cβ-冠状病毒谱系，其结构包含约30 kb的正向链，人类MERS-CoV与MERS-CoV来源于骆驼具有超过99.5%的核苷酸同一性，这表明人和骆驼分离物属于同一冠状病毒物种。截至2019年9月30日，实验室确认的2468例MERS-CoV感染病例，包括851例死亡。由于目前尚无用于MERS的商业疫苗或治疗方法，因此快速准确地诊断MERS-CoV对于预防其传播和暴发非常重要。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　当前对冠状病毒的诊断测试包括RT-PCR，实时逆转录PCR(rRT-PCR)，逆转录环介导的等温扩增(RT-LAMP)以及实时RT-LAMP。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　基于靶向SARS-CoV和MERS-CoV保守的S2基因的引物和探针，开发了一种RT-PCR方法。通过使用pUC57SARS-pS2作为SARS-CoV的模板和pGEM-MERSS2作为MERS-CoV的模板，可以实现50-100拷贝/ mL的足够检出限。设计了单重RT-iiPCR检测MERS-CoV包膜基因(upE)和开放阅读框1a(ORF1a)基因分开。与参考单重RT-qPCR检测相比，单重MERS-CoV ORF1a和upE RT-iiPCR检测的灵敏度分别为99.03%和100%。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　有六种基于rRT-PCR的市售MERS-CoV RNA检测试剂盒，包括AccuPower(韩国Bioneer)，Anyplex(韩国Seegene)，DiaPlexQ(韩国Solgenent)，LightMix(瑞士罗氏分子诊断公司)，UltraFast试剂盒(韩国Nanobiosys)和PowerChek(韩国Kogene Biotech)。 因此，上述六种rRT-PCR试剂盒的整体灵敏度和特异性足以诊断MERS-CoV感染。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　在RT-LAMP分析中，构建了两套引物，其中一套针对N基因，一套针对ORF1a基因。两组都显示了高效扩增来自不同MERS-CoV株的靶序列的效果，并且与其他呼吸道病毒没有交叉反应。Huang的研究小组已经建立了一种将RT-LAMP技术和垂直流相结合的核酸可视化技术。可视化条(RT-LAMP-VF)检测MERS-CoV的N基因。RT-LAMP-VF检测方法与多个SARS相关CoV(包括HKU1，HKU4，OC43和229E)无交叉反应的RNA，因此具有很高的特异性。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　上面提到的RT-LAMP和RT-LAMP-VF是用于快速准确检测MERS-CoV感染的检测方法。 Bonhan Kooa的团队设计了一种拱形多目标传感器，该传感器能够通过在临床样品中直接扩增来快速鉴定病原体。该方法能够以高灵敏度和特异性检测包括MERS-CoV在内的多种病毒，并且能够在20分钟内将临床样品中的MERS-CoV与HCoV区分出来。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　& nbsp & nbsp span style=" color: rgb(79, 129, 189) " strong 人腺病毒及其诊断方法 /strong /span /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　腺病毒(AdV)感染现在被视为人类或动物发病率和死亡率的重要来源。人腺病毒(hAdV)感染很容易传播，可感染所有年龄段的人群，尤其是婴儿和老年人，以及具有免疫缺陷和器官移植的人群。HAdV具有直径70至100nm的无包膜球形结构。外壳由252个帽壳组成，包括240个六邻体和12个Penton，由二十面体病毒衣壳组成。帽体排列在20个三角形表面上，使壳形成30个边和12个顶点。hAdV的基因组以线性双链DNA的形式存在于衣壳中，大小从34到37 kb以上不等。HAdV属于腺病毒科，已经被分类。根据六邻体和纤维蛋白特性，相对核酸同源性，免疫化学反应，生物学特性和系统发育关系分为7种(A至G)，具有50种以上血清型。该细分具有一定的临床意义，主要是因为不同的hAdV在组织方向和疾病类型上有所不同。HAdV可引起多种疾病，例如呼吸系统疾病(hAdV-B，-C和-E)，肠胃炎(hAdV-F和-G)，角膜结膜炎(hAdV-B和-D)和脑膜脑炎(hAdV-A， -B和-D)。因此，在hAdV进展之前对其进行有效，快速的诊断将提供对hAdV感染的有效监测，并确保及时有效地治疗与hAdV相关的疾病。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　 span style=" color: rgb(79, 129, 189) " strong 鼻病毒及其诊断方法 /strong /span /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　鼻病毒(RVs)是属于Picornaviridae肠病毒科的RNA病毒，已被分类为3种(A至C)，具有超过160种血清型。RVs是具有二十面体对称的小型单链RNA病毒。RVs是儿童和成人中最常见的呼吸道感染原因。RV-A和RV-C是常见的RV种类，可引起下呼吸道疾病，喘息和急性哮喘，与儿童相比，它们可能导致比RV-B更严重的症状。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　病毒的培养分离和酸稳定试验相结合是RV诊断的经典方法。但是，该测定费时且费力，从而限制了其在临床治疗中的价值。可以通过免疫学方法检测人RV抗体。但是，由于缺乏合适的交叉反应抗原来覆盖大量RV血清型，这些方法的应用受到很大限制。相比之下，一步式实时PCR分析通过使用序列检测RV。该测定法改善了工作流程，减少了准备时间，并消除了从逆转录反应步骤中cDNA可能引入的交叉污染。半嵌套式RT-PCR测定法基于一种极其灵敏的PCR方法，可检测空气传播的RVs的检出限(LOD)约为0.8。随着全基因组测序(WGS)技术的迅速发展，越来越多的实验室可能在临床上对人RV分离株进行WGS 。随着hRV-C的发现，全基因组hRV测序的数据量已大大增加和改善。这将有助于研究人员和临床医生了解RV的进化和重组，可以改善诊断。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　 span style=" color: rgb(79, 129, 189) " strong 多重呼吸道病毒检测 /strong /span /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　尽管可以在有症状的患者中检测到单个呼吸道病毒，但其他呼吸道病毒也可能同时存在。儿童，尤其是五岁以下的儿童，发生共感染的频率更高。在单个试管中包含多个病毒基因靶标的多重测定法具有快速检测几种潜在病毒病原体的优势。同时。多重实时PCR已允许在短时间内同时检测多种呼吸道病毒。与单重方法相比，多重诊断方法具有更高的样品通量(每次运行96个样品)，更短的周转时间(5h)和更少的样品需求量。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　 span style=" color: rgb(79, 129, 189) " strong 结论 /strong /span /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　在全世界所有年龄组中，呼吸道病毒都是症状性呼吸道感染的主要原因。对这些病毒的及时，准确的诊断可以对感染进行适当的治疗。总结了几种常见的呼吸道病毒(如流感病毒，人RSV，冠状病毒，hAdV和鼻病毒)的传统和现代分子诊断方法，以及它们的优点，缺点和原理。但是，这些呼吸道病毒容易因病毒基因中的点突变而引起抗原漂移，基因重排可能导致具有大流行潜力的新菌株。所有这些继续对快速准确地检测人类呼吸道病毒感染提出了新的挑战。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　因此，鉴定病毒基因组内的突变是非常必要的。但是，为查明人类呼吸道病毒的基因突变所做的努力依赖于使用Sanger测序对单个基因或基因家族进行高通量测序。尽管这种方法取得了丰硕的成果，但Sanger测序的成本和通量通常禁止构成外显子组的?22,000个基因的系统测序。 NGS技术的最新发展通过提供以相对较低的成本快速测序外显子组，转录组和基因组的能力，改变了这种范例。 NGS在呼吸道病原体的诊断和鉴定中的应用，特别是对于重症肺炎或不明原因感染的患者，越来越受欢迎。与传统方法相比，NGS具有检测重症肺炎患者中合并感染的能力，并且在诊断重症肺炎中表现良好。作为一种不经常循环的基因型，病毒株整个基因组的表征将促进对其流行病学和致病性的进一步研究，并有助于诊断新出现的呼吸道病毒。 WGS可以更好地识别传播事件和爆发，这在亚基因组序列中并不总是可能的。 /p

自 2019 新型冠状病毒（2019-nCoV）肺炎疫情爆发以来，相关科研单位便紧锣密鼓地开展病毒研究工作，并取得了一系列重要的研究成果。2 月 3 日，Nature 在线发布了复旦大学张永振教授团队的一项重要研究成果，该团队对患者支气管肺泡灌洗液进行了宏基因组二代测序（mNGS），鉴定出了一种新型冠状病毒，并发现该病毒基因组与蝙蝠体内发现的 SARS 样冠状病毒基因组有 89.1% 的相似性[1]。张永振教授团队发表的文章截图 | 图源：Nature2 月 20 日，bioRxiv 预印本平台发布了华南农业大学沈永义教授、肖立华教授团队关于新冠病毒中间宿主的研究成果。通过对穿山甲样品进行宏基因组分析，该团队发现穿山甲为新型冠状病毒潜在中间宿主[2]。沈永义教授、肖立华教授团队发表的文章截图 | 图源：bioRxiv可以说，宏基因组测序在新病原体的诊断、监测、跟踪，以及溯源方面具有关键作用，更是新冠病毒研究的一大助力。宏基因组测序：病原体检测的新风口1998 年，威斯康辛大学的 Jo Handelsman 提出宏基因组学（Metagenomics）的概念，并将其定义为：一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象，以功能基因筛选和测序分析为研究手段，以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系、以及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法[3]。包括宏基因组学在内的各类组学研究（右）相较传统遗传学与生物化学方法（左）在全基因水平的研究上效率更高 | 图源：Science2014 年，新英格兰医学杂志发表宏基因组二代测序（mNGS）确诊钩体病的首例临床应用案例[4]，打响了病原体 mNGS 的第一枪。新英格兰医学杂志发表宏基因组二代测序（mNGS）确诊钩体病的文章截图 | 图源：NEJM短短 5 年来，mNGS 在新发病原体鉴定、罕见重要病原体诊断和临床大数据研究等方面取得诸多进展。例如在 2018 年，Clinical and Research in Hepatology and Gastroenterology 发布了上海华山医院感染科张文宏教授团队使用 mNGS 协助临床诊断肝结核的案例，mNGS 的适时使用，准确快速地帮助临床明确了患者的发热病因，推动了临床的精准诊断[5]。张文宏教授团队发表文章截图 | 图源：ScienceDirect2019 年，中国临床专家也达成共识，认可了宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染领域的临床应用[6]。临床专家共识文章截图 | 图源：万方宏基因组二代测序的流程及原理宏基因组二代测序的检测流程可以大致分为5个步骤：核酸提取、文库构建、上机测序、生物信息学分析与报告解读[7]。具体来看，对于不同的临床样本，核酸提取前需要进行不同的前处理，比如痰液液化、破壁、去宿主等以提高病原体检出率。RNA 病毒需要在文库构建前进行逆转录，生成 cDNA。文库构建的目的在于给未知序列的核酸片段两端加上已知序列信息的接头以便于测序，单样本文库构建完成后需要经历 PCR 扩增、再将多个文库样本混合后进行测序。测序完成后，数据会自动进入搭建好的病原体自动分析流程，该流程包括去除人源宿主序列和低质量序列、以及微生物数据库比对注释等步骤。最后，解读专家根据自动化系统产生的初步结果，再结合部分临床指标、样本类型、病原体种类等因素进行综合分析解读。宏基因组工作流程示意图 | 图源：Nature Biotechnology样本文库质量是宏基因组测序的关键由于环境中的微生物种类五花八门，相对复杂，构建一个高质量的宏基因组文库在整个检测流程中便显得十分重要。故而在取样时，我们要严格遵循取样规则，在取样中应尽量避免对样本的干扰，缩短保存和运输的时间，使样品尽可能代表自然状态下的微生物原貌。并且要采用合适的方法，既要尽可能地完全抽提出环境样品中的 DNA/RNA，又要保持较大的片段以获得完整的目的基因或基因簇。在构建 RNA 文库之前需要对 RNA 样本进行完整性评估[8]，只有达标的样本才能进入下一阶段反转录及文库构建。宏基因组文库的质量直接关系到测序的数据量，在影响成本的同时也影响了测序时间，因此，为了提高测序准确性、减少测序过程中的风险，测序前需要测定文库样品的浓度和片段大小分布，确定合适的上机 pooling 方案和测序深度。可见样本的质量控制对于宏基因组测序的重要性。安捷伦自动化样本质控解决方案安捷伦在核酸蛋白质量控制领域拥有愈二十年的经验，针对不同来源样本，分析靶标和通量需求提供全套的自动化解决方案。安捷伦的 2100 生物分析仪是目前最为普遍使用的二代测序质控设备。安捷伦在 2100 生物分析仪上最早开发出了 RNA 完整性参数（RIN），它已成为全世界公认的 RNA 质控指标，它以 0-10 的数值直观反应 RNA 样本的完整性程度，为标准化的实验操作提供了样本质量评估的参考标准。在本次新冠病毒（RNA 病毒）的序列确定中，安捷伦 2100 生物分析仪发挥了重要作用。随着测序样本量的增加，特别是随着后续病毒变异监测以及病毒溯源工作的逐步展开，安捷伦中-高-超高通量自动化核酸质控平台（4200 tapestation 和 AATI FA）将发挥它们的优势。参考文献[1] Yong-Zhen Zhang , Edward C. Holmes,Lin Xu,et al. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China[J].nature,2020.[2] Xiao K, Zhai J, Feng Y, et al. Isolation and Characterization of 2019-nCoV-like Coronavirus from Malayan Pangolins[J]. bioRxiv, 2020.[3] Handelsman J, Rondon M R, Brady S F, et al. Molecular biological access to the chemistry of unknown soil microbes: a new frontier for natural products[J]. Chemistry & biology, 1998, 5(10): R245-R249.[4] Wilson M R, Naccache S N, Samayoa E, et al. Actionable diagnosis of neuroleptospirosis by next-generation sequencing[J]. New England Journal of Medicine, 2014, 370(25): 2408-2417.[5] Jing-Wen A , Yang L , Qi C , et al. Diagnosis of local hepatic tuberculosis through next-generation sequencing: Smarter, faster and better[J]. Clinics and Research in Hepatology and Gastroenterology, 2018, 42(3):178-181.[6] 宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用专家共识组. 宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用的专家共识[J]. 中华急诊医学杂志, 2019, 28(2):151-155.[7] Quince C, Walker A W, Simpson J T, et al. Shotgun metagenomics, from sampling to analysis[J]. Nature biotechnology, 2017, 35(9): 833.[8] Fan W, Su Z, Bin Yu, et al. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China[J]. Nature. 2020 Feb 3. [Epub ahead of print]推荐阅读：1. 抗击新型冠状病毒，安捷伦核酸/蛋白质质量控制产品从这些方面入手！https://www.instrument.com.cn/netshow/SH100320/news_521879.htm2. Agilent 2100 生物分析仪https://www.agilent.com/zh-cn/product/automated-electrophoresis/bioanalyzer-systems/bioanalyzer-instrument/2100-bioanalyzer-instrument-228250关注“安捷伦视界”公众号，获取更多资讯。

近日，由新型冠状病毒引起的肺炎疾病在武汉地区形成了一定规模的爆发，全国各地都已经引起了高度的重视。那么这个冠状病毒到底是什么以及为什么称它为新型？冠状病毒在系统分类上属冠状病毒科（Coronaviridae）冠状病毒属（Coronavirus）。冠状病毒属的病毒是具外套膜（envelope）的正链单股RNA病毒，直径约80～120nm，其遗传物质是所有RNA病毒中最大的，只感染人、鼠、猪、猫、犬、禽类脊椎动物。冠状病毒的一个变种是引起非典型肺炎的病原体，属于RNA病毒。冠状病毒最先是1937年从鸡身上分离出来，病毒颗粒的直径60～200nm，平均直径为100nm，呈球形或椭圆形，具有多形性。病毒有包膜，包膜上存在棘突，整个病毒像日冕，不同的冠状病毒的棘突有明显的差异。在冠状病毒感染细胞内有时可以见到管状的包涵体。冠状病毒的伪彩色结构图那么要想了解此次病毒的真面目就需要用电镜进行观察。近日国家病原微生物资源库发布了由中国疾病预防控制中心病毒预防控制所成功分离的我国第一株病毒（新型冠状病毒武汉株01）的电镜照片。图中黑色箭头所示的位置就是所说的病毒，可以看出，病毒的大小约为100纳米，同时可以看出，病毒形态成圆形，在病毒的表面围绕着一圈突刺蛋白（Spike protein），像一个皇冠。正因为有此形态，此类病毒被划分为冠状病毒（目前病毒的分类经常是根据病毒的型态进行分类的）。新型冠状病毒武汉株01的电镜照片那么得到以上的病毒的电镜照片需要经过那些操作呢？首先因为这个是一张透射电镜（TEM）的照片，拍摄此类透射电镜照片的步骤是：（1）从感染新型冠状病毒的病人的人气道上皮细胞培养液中离心，取上清液得到含有病毒的液体；（2）用2%多聚甲醛灭活；（3）用2.5%戊二醛固定在支持膜上（类似于载玻片），用一系列乙醇脱水处理；（3）包埋在超薄树脂中，制作成切片；（4）透射电镜进行观察。那么为什么称这次的病毒为新型冠状病毒呢？这是因为此次发现的病毒与之前发现的冠状病毒在RNA序列上有一些不同（此次武汉发现的新型冠状病毒已经被命名为 2019-nCoV）。目前发现该病毒有30473个碱基对。 这些碱基对的确定可以帮助开发快速分子检测方法，如PCR（polymerase chain reaction）方法。我们知道新型冠状病毒是RNA病毒，它的蛋白结构还没有确定出来，确定它的蛋白结构需要用到冷冻电镜技术，这种技术需要将生物样品冷冻在-180℃左右的液氮环境中，在毫秒时间内把样品内部的水分冷冻成玻璃态，从而保存了样品的天然形貌，使得科研人员能够观测到蛋白质的细微结构。随着技术的突破，现在的分辨率已经达到了原子级别，通过冷冻电镜从各个方向上照射样品，获取其三维结构。例如下图，为2019年10月18日饶子和灯研究团队发表在Science期刊的非洲猪瘟病毒的三维蛋白结构。非洲猪瘟病毒的三维蛋白结构[1]虽然现在还没有完全解析出新型冠状病毒的三维蛋白结构。但是，饶子和等团队已经发布了新型冠状病毒3CL水解酶高分辨晶体结构。希望能够为科技工作者、特别是从事药物研发的科技人员提供有用的支持，尽快研制出更好的抗新型肺炎的药物。新型冠状病毒3CL水解酶高分辨晶体结构最后，在全国预防新型冠状病毒的攻坚战期间，建议民众保持良好的卫生习惯，勤洗手、注意饮食休息，保持室内清洁与通风，避免去人多聚集的公共场所，如果必须外出，请佩戴N95口罩或者外科医用口罩进行防护。祝愿各位能够早日战胜此次新型冠状病毒引起的肺炎疾病的战役。[1] Architecture of African Swine Fever Virus and implications for viral assembly

p （原标题：追踪14年从结果到过程全搞明白了 武汉科学家确证SARS主犯是蝙蝠） /p p 6日，记者联系上有此发现的中科院武汉病毒研究所石正丽与崔杰课题组。据介绍，他们在单一菊头蝠种群中已找到SARS的全部基因组组分。这意味着，背上嫌疑近14年的“菊头蝠”，卷宗终于完备，遭致全球8000余人感染和近800人死亡的罪名，终告成立。 /p p strong 2004年：武汉科学家就“盯”上了菊头蝠 /strong /p p 早在近14年前，武汉的女科学家石正丽就独树一帜地盯上了菊头蝠。2002年到2003年，我国部分地区暴发了SARS。在武汉病毒所的整体部署下，石正丽联合中外科学家开展深入研究，将SARS病毒溯源集中在蝙蝠身上。 /p p 2004年初，广东省疾病防控中心举行新闻发布会宣布，在广州、深圳市售的果子狸等动物采集的样本中发现含有大量SARS样冠状病毒，认为果子狸为SARS冠状病毒的主要载体。此后，广东共扑杀果子狸、獾、貉等野生动物近万只，仅广州市就处理了2000多只果子狸。 /p p 可之后几个月，石正丽带领的研究小组就在菊头蝠属的4个种里发现SARS病毒抗体和基因。中国科学院武汉病毒研究所和澳大利亚吉朗的动物健康研究室同时对这些样本进行了SARS病毒抗体和基因的检测，基因序列分析表明，蝙蝠SARS样病毒与人SARS病毒基因组序列同源性达92%。蝙蝠携带有类SARS的病毒——该结果发表在2005年的《科学》上。 /p p strong 2013年：认定菊头蝠是SARS病毒的自然宿主 /strong /p p 由中国科学院武汉病毒研究所石正丽研究员领导的一支国际研究团队，成功分离到一株与SARS病毒高度同源的SARS样冠状病毒。通过遗传信息分析和对病毒进行功能测试，进一步证实了“中华菊头蝠是SARS病毒的自然宿主”。国际著名学术期刊《自然》于2013年10月31日在线发表了这一研究成果。 /p p 在这期间，石正丽以“研究蝙蝠”出名，课题组也曾研究蝙蝠在尼帕、埃博拉等病毒传播中的影响，SARS病毒一直是主线，石正丽仍惦记着许多未解之谜，她带着硕博士生去野外采集蝙蝠样本，和年轻人一起爬山、进山洞。 /p p strong 2017年：从结果到过程全搞明白了 /strong /p p 从最初认为“同源”，花了9年时间去证实是“源头”，又花了4年时间去溯源，有关SARS如何在蝙蝠中进化产生、从哪里的蝙蝠种群中出现的遗留之谜，在2017年年底全部解开。 /p p 本月初，石正丽团队宣布，在我国云南省发现了一处蝙蝠SARS样冠状病毒的天然基因库，揭示了SARS冠状病毒可能的重组起源。12月1日，Nature news对新发表的论文进行了报道，指出该发现回答了关于SARS病毒起源遗留的问题。 /p p 石正丽说，包括蝙蝠在内的野生动物携带各种病毒是自然进化的结果，是正常现象。包括菊头蝠在内的食虫蝙蝠是很多农林业害虫的重要天敌，对维护生态系统平衡发挥着重要作用，切不可对蝙蝠开杀戒。 /p p 相关科学家认为，人类须减少对蝙蝠等野生动物栖息地的侵扰。不管是果子狸还是菊头蝠，人类要杜绝野生动物市场交易，这对于防止新发传染病的发生至关重要。 /p p strong 武汉生物企业助力SARS揭秘 /strong /p p 6日，记者从中国科学院武汉病毒研究所石正丽与崔杰课题组获悉，武汉科学家的世界级发现，借助了本土的生物力量。 /p p 石正丽和崔杰团队在我国云南省发现了一处蝙蝠SARS样冠状病毒的天然基因库，揭示了SARS冠状病毒可能的重组起源，病毒基因组扩增与序列鉴定，须依靠引物合成、基因测序等手段，在汉的武汉擎科创新生物科技有限公司和昆泰锐（武汉）生物技术有限公司承担了这一工作。 /p p 记者了解到，擎科已建立北京、上海、南京、武汉等多个城市的本地化实验室，而武汉昆泰锐，是2005年创立于美国旧金山湾区的昆泰锐，在中国的分公司，2014年入驻东湖高新区武汉生物技术研究院。美国加州大学伯克利分校博士后、原加州大学伯克利中国公派学者联合会主席谢洪学是现任昆泰锐（武汉）生物技术有限公司董事长。 /p p 引物合成和基础测序，十年前还须到武汉之外的地方进行，而如今，仅光谷生物城就聚集了五十多家基因测序企业。据该团队研究人员介绍，SARS“追凶”14年，后程加速，得益于武汉生物产业链条的日益完善。以前引物需要在外地合成，测序也要把样本寄到外地测序企业，而近些年来在武汉本土就能做，“晚上送样，第二天早上就能出结果，马上能进行下一步科研，大大提高科研效率”。 /p

展鹏教授团队分享了聚焦冠状病毒生命周期中的药物靶点，综述了现有广谱冠状病毒抑制剂的研究进展，以期为研发抗冠状病毒药物提供参考，更好地应对当下及未来的冠状病毒疫情。人冠状病毒广谱抑制剂的研究进展（一）（点击查看）人冠状病毒广谱抑制剂的研究进展（二）（点击查看）4.3靶向冠状病毒多聚蛋白裂解过程的抑制剂SARS-CoV-2进入细胞后完成生命周期并制 造出子代病毒的关键步骤是多聚蛋白的裂解，这个过程依赖的是病毒自身产生的蛋白酶Mpro和 PLpro[84]。测序结果表明，编码SARS-CoV-2和 SARS-CoV蛋白酶的RNA序列显示出高度的一 致性[85]。因此针对上述蛋白酶的抑制剂是阻断各种冠状病毒在宿主细胞内增殖的有效手段。在抗病毒药物治疗中已经有多种蛋白酶抑制剂在临床上用于治疗HIV等病毒感染。随着对 NT。活性催化位点及其周边结构的认识不断深入（图10）,基于靶标的合理药物设计也促进了此类 药物的发现与发展。在针对SARS-CoV-2的治疗 中，大多数蛋白酶抑制剂仅处于计算机模拟（in silico）研究阶段，急需进一步的体外与临床研究数据。4.3. 1 主蛋白酶(Mpro)抑制剂洛匹那韦(lopinavir,20,图11)是已经上市的 拟肽类HIV蛋白酶抑制剂[86]。利托那韦 (ritronavir,21,图11)可抑制药物代谢酶,常与洛匹那韦联合应用以起到增效作用[87]，二者组成的复方制剂Kaletra相对于单一的洛匹那韦作用时 间更长[88]。2004年一项非盲临床试验显示，在 SARS-CoV感染者中，服用洛匹那韦-利托那韦 (400 mg：100 mg)的试验组产生负面临床结果的风险以及病毒载量明显降低[89]。洛匹那韦针对 MERS-CoV也有抑制作用師如，但仍需进一步的 临床试验确认。洛匹那韦在体外细胞中抑制 SARS-CoV-2 的 EC50值为 26.1μmol• L-1,但单 一的利托那韦无抗病毒活性。洛匹那韦-利托那 韦复方疗法在新冠治疗中受到普遍关注[92-94]。N3(22,图12)是含有迈克尔加成受体的拟 肽类冠状病毒抑制剂[95]。作为共价抑制剂，N3 分子的乙烯基与SARS-CoV-2的Mpro催化中心的 Cysl45共价结合,并通过3个侧链分别结合于催化中心周边的各个口袋，形成额外的作用力。此外，α-酮酰胺片段被看作高效的共价结合基团，可增强分子柔性、提高稳定性和透膜性，常用于病毒蛋白酶抑制剂的设计[96]。基于此,Zhang等[97]设计了一系列以α-酮酰胺为“共价弹头”的广谱主 蛋白酶抑制剂，针对α属、β属冠状病毒与肠病毒Mpro 均有良好的抑制活性。其中代表化合物为 23(图12)，其抑制 SARS-CoV 与 HCoV-NL63 主 蛋白酶的IC50值分别为0.71μmol• L-1和12.27μmol• L-1,在 Huh-7 细胞系中针对MERS- CoV的EC50值达到0. 0004 μmol• L-1。为进一步提高酮酰胺类抑制剂针对SARS-CoV-2的抑制作 用,Zhang等[98]对化合物23的结构进行修饰，将疏水性过强的肉桂酰基替换为具有一定亲水性的基团从而得到一系列化合物，其中化合物24(图 12)抑制 SARS-CoV-2、SARS-CoV与MERS-CoV 主蛋白酶的IC50值分别为(0.67±0.18)、(0.90 ±0.29)、(0.58 ±0.22) μmol• L-1。Rupintrivir ( AG7088,25,图12)对肠道病毒 EV71与鼻病毒有突出的抑制作用，但对冠状病毒活性不佳[99]。Dai等[100]通过解析AG7088与EV71 3Cpro的共晶结构，以醛基共价弹头取代了易水解失活的α,伊不饱和酯基，并结合数个蛋白 酶抑制剂的优势结构,设计了 一类靶向肠道病毒 EV71 3C蛋白酶的共价抑制剂。高亲电性的醛 基作为共价弹头，与主蛋白酶Cysl45的疏基结合稳定，广泛用于设计高活性的蛋白酶抑制剂。其中代表化合物26（图12）对各种肠道病毒、鼻病毒有广谱抑制作用。与先导化合物及同时合成的其他修饰物相比，化合物26具有更好的药代动力学特性与广谱抗冠状病毒作用，对SARS-CoV-2 Mpro。及病毒复制均有较好的抑制作用（IC50 = 0.034μmol• L-1 ,EC50 =0. 29 μmol• L-1）。四川大学杨胜勇团队基于SARS-CoV-2的 Mpro催化中心周边结构，结合已上市蛋白酶抑制剂的优势片段，设计了以双环脯氨酸为核心骨架的拟肽分子，部分化合物为27~32（图13）[101]门， 并首次在动物模型中测定了所合成化合物对Mpro 的抑制作用。该类化合物以环状γ-丁内酰胺基团（P1）靶向S1区域,脂肪稠环结构（P2）靶向S2 区域，并以结构多样的取代芳环（P3）靶向S4区域（图14）。在P2提高分子刚性与疏水性、增强 靶标结合力的同时,P3大小合适的疏水芳基有助 于进一步增强分子的活性与代谢稳定性。抑酶活性结果显示，化合物29、30、31的IC50值分别为7.6 ,7.6,9. 2 nmol• L-1。在 Vero E6 细胞中，化合物28,31,32抑制SARS-CoV-2复制的 EC50值分别为 0. 53,0.67,0.54μmol• L-1（表 2）。在体内活性测试中，化合物32的药代动力学性质较好,在鼠体内有效抑制了SARS-CoV-2的增殖，显著降低了病理损伤，经治疗的感染小鼠 未出现任何体重损失与异常状况。4.3.2 PLpro抑制剂PLpro在不同的冠状病毒中具有类似的氨基 酸序列与空间构象，显示出高度相似性（图15）。因此，针对特定冠状病毒PLpro抑制剂也具有开发 为广谱PLpro抑制剂的潜力。Figure 15 The conformation and amnio acid sequence of SARS-CoV PLpro ( PDB：2FE8 ) and SARS-CoV-2 PLpro(PDB：7CMD)Ratia等[102]建立了基于荧光的高通量筛选方法，在包含上万种类药分子的化合物库中发现了先导化合物33（图16）,其R型异构体抑制SARS- CoV PLpro的 IC50值为（8.7±0.7）μmol• L-1 此类分子结构按药效团可分为“头部-链接基团-尾 部”三部分，其中，“头部基团”一般是1-萘基或2-萘基，而“链接基团”中的亚氨基作为氢键供体对分子活性至关重要,N-甲基化修饰的化合物34（图 16）活性则明显减弱（IC50=22.6μmol• L-1）。为进一步提高药效,Bdez-Santos[103]结合此 类分子中的先导化合物35（图17-A）与SARS- CoV PL。，。的共晶结构以及构效关系，设计了尾部 含有不同取代苯基的新一代SARS-CoV PL。”抑 制剂36 -39（图17-A）。共晶结构显示，此类分 子结合于Tyr269与活性中心围绕而成的狭长空 腔内（图17-B、C），活性与代谢稳定性均有提高， 活性数据如表3所示。双硫仑(disulfiram, 40,图18)是乙醛脱氢酶抑制剂，用于辅助矫正酒精成瘾[104]。2018年， Lin等[105]发现双硫仑针对SARS-CoV主蛋白酶 具有竞争性抑制作用，针对MERS-CoV PLpro。则具 有变构抑制作用。证据表明，双硫仑通过分子中 的硫原子与金属离子配位,或与蛋白质疏基相互作用,因此可以靶向PLpro和NT。中具有催化作用 的半胱氨酸[106]。在以往的临床实践中，双硫仑 表现出毒副作用小、作用机理明确、成本低的独特优势。但其针对包括SARS-CoV-2在内的多种冠 状病毒的体外实验及临床试验尚待完成。疏瞟吟即6-疏基瞟吟(6-MP,41,图18)早已 广泛用于治疗急性淋巴细胞白血病和急性髓细胞白血病。2008年，Chou[107]等首先报道了疏嚓吟作为SARS-CoV PLpro小分子可逆抑制剂的活性。 在MERS-CoV与SARS-CoV的蛋白酶的相似性 被确证之后，Cheng等[109]质旳又发现了疏瞟吟针对 MERS-CoV PLpro的竞争性抑制作用。但不可忽视的是,PLpro抑制剂的设计与研发 相对存在一定难度。候选分子中的游离疏基可能 与人体内各种蛋白质的半胱氨酸残基发生作用，导致专一性较差以及毒副作用增强[108]。此外， 宿主细胞的去泛素酶与PLpro 的相似性还会带来 抑制剂脱靶的风险。Figure 18 The structures of disiilfiram (40) and6-MP(41)5 结语与展望本文作者总结了靶向冠状病毒刺突蛋白、RdRp、蛋白酶及宿主靶标的一系列冠状病毒广谱抑制剂，对抗击新冠肺炎疫情、预防未来的冠状病 毒传播具有重要意义。针对冠状病毒的高效广谱抑制剂，是疫情爆发初期迅速响应危机、并在第一时间治疗患者的法宝[109]。对冠状病毒广谱抑制剂的发现、评估和修饰，是人类对抗未来的公共卫生危机的重要 战略举措。对于具有“老药新用”潜力的已上市药物,要尽快开展科学严谨的大规模双盲临床实 验,为大范围推广提供最真实可靠的依据,最大程 度保护患者的生命健康。长远看来，从头研发出一款针对新型冠状病 毒的“魔弹”药物需要进行漫长的设计、开发及疗效验证。一方面，不同的冠状病毒生命周期中发 挥关键作用的生物大分子有明显的种间同源性，为基于靶标结构寻找广谱抑制剂提供了重要信息；另一方面,从治疗新型冠状病毒的中药方剂中寻找天然来源的先导化合物，也是开发抗冠状病 毒药物的重要源泉。参考文献见 中国药物化学杂志 第31卷 第9期，2021年9月总173期

目前，临床上针对新型冠状病毒的实验室检测主要是SARS-CoV-2病毒核酸和血清特异性抗体检测。核酸检测，是指通过特殊的技术手段检测临床样本中是否存在特定的病原体核酸，从而诊断患者的感染原因。此次新冠病毒是单链RNA病毒，根据《新冠病毒感染的肺炎诊疗方案（试行第七版）》（下文简称诊疗方案）建议，针对疑似病例的确诊，需要具备以下病原学证据之一者，即为确诊病例：1. 实时荧光RT-PCR检测新型冠状病毒核酸阳性；2. 病毒基因测序，与已知的新型冠状病毒高度同源；3. 血清新型冠状病毒特异性IgM抗体和IgG抗体阳性；血 清新型冠状毒特异性IgG抗体由阴性转为阳性或恢复期较急性期4倍及以上升高。诊疗方案中提到了三种检测方式，其中实时荧光RT-PCR和基因测序都属于核酸检测，需要进行核酸提取。新冠病毒核酸检测是临床诊断的“金标准”， 患者鼻咽拭子、痰、纤维支气管镜灌洗液、血液、肛门拭子、粪便等标本核酸检测阳性，说明其感染了新冠病毒，而且具有传染性。目前新冠病毒检测中核酸提取一般通常使用两种方式：手工提取和仪器提取。病毒核酸提取试剂盒采用具有独特分离作用的磁珠和缓冲液系统，专为快速、高度敏感,有效的从血清、鼻咽拭子样本中提取病毒DNA、RNA而研制，磁珠在一定条件下对核酸具有很强的亲和力，并且在条件改变时，磁珠与其吸附的核酸分离，能够达到快速分离纯化核酸的目的，产品提取出的核酸能够满足下游各种分子生物学实验检测，例如PCR扩增等。荧光定量PCR是临床分子检测中常用的检测方法，病毒核酸提取方法的选择对于最终的检测结果的影响非常重要。在以往采用RT-PCR对病毒核酸进行的检测中，磁珠法是较为常用的核酸提取方法，普遍认为其对病原体的核酸提取具有简便、高效、提取浓度及纯度较高等优势。此外因各实验室条件不同及针对的病毒的试剂盒不同，离心柱法、煮沸裂解法等也在临床大量应用。不同的病毒核酸提取方法因其提取产物浓度、纯度的差别以及对RNA的保护程度不同，将在一定程度上影响病毒核酸尤其是临界阳性样本的核酸检出。磁珠法手工提取病毒核酸主要设备有：冰箱、超低温冰箱、高速冷冻离心机、混匀器、微量加样器(0.2-1000ul)、磁力架、无菌无酶吸头、移动紫外灯、水浴锅或金属浴、生物安全柜等。无菌无酶吸头系列磁力架（货号DTCLJ-20）核酸提取仪病毒核酸医院检验科在进行新冠病毒检测时通常面临着大量的待检测样本需要短时间出来完成报告结果，因此自动化、高通量的核酸提取仪已经变得极为迫切。LunAmple全自动核酸提取纯化仪高通量提取 ---- 每次提取可根据需要选择1-72个样本人性化界面 ---- 触屏加按键式直接操作，无需连接电脑简单易用自由编辑 ---- 可自行编辑所需程序或预设保存，快速便捷结果稳定 ---- 提取灵敏度高，重复性好，核酸质量高安全可靠 ---- 配备紫外灭菌功能，减少与有害试剂的接触防止污染 ----内置独家去除核酸气溶胶装置，保护样本不被污染核酸提取制备的整体步骤

p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 由新型冠状病毒引起的肺炎疫情持续严峻，正牵动着亿万人的心，并受到了全世界的高度关注。2020年1月12日，世界卫生组织正式将该病毒命名为2019-nCoV, 成为继229E、NL63、OC43、HKU1、SARS-CoV、MERS-CoV后，迄今为止发现的第七种可感染人类的冠状病毒。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 在这场没有硝烟的疫情反击战中，施行“早发现，早隔离”，是阻断疫情传播的关键。由于全球还没有针对此病毒的特效救治方法，加强溯源和病原学检测分析，加快疫苗的研发，已成当务之急。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/73245441-82ed-48b5-99b5-ae913ece4ca9.jpg" title=" image003.jpg" alt=" image003.jpg" / /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 1月24日，中国疾控中心成功分离我国首株新型冠状病毒毒种。国家病原微生物资源库发布了这一株病毒毒种信息和电镜照片，也公布了新型冠状病毒核酸检测引物和探针序列等重要权威信息，为疫苗的研发奠定了基础。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 1月28日，新型冠状病毒mRNA疫苗研发正式在上海立项。研发团队将在40天内完成大规模预防性疫苗样品的生产和制备，疫苗样品制作完成后，可以送国家指定机构开展抗新型冠状病毒活性测试，完成必要的审批后，尽快推向临床； /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 1月31日，浙江省新型冠状病毒疫苗研发工作取得阶段性成果。由中国工程院院士李兰娟领衔的浙江大学传染病诊治国家重点实验室分离到8株新型冠状病毒毒株，浙江省疾控中心课题组成功分离到2株新型冠状病毒毒株。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 此外，在中国提供新型冠状病毒的DNA序列后，美国、澳大利亚、西班牙、俄罗斯、泰国等多国药企和研究机构也纷纷参与到新型冠状病毒疫苗研发中来。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 疫苗的开发是一个复杂的过程，需要经历临床前研究，筛选出 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/12902832-b763-402a-96f0-6c936cc444a4.jpg" title=" image002.jpg" alt=" image002.jpg" / /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 合适的毒株，通过工艺和质量检定研究，药理毒理研究确定安全，然后进入临床研究，进一步确保其安全有效后才可获批上市。首先要确认疫苗的靶点，抗原的选择。无论是灭活疫苗还是基因工程疫苗，都要先在实验室验证其有效性。可以同时进行动物安全性评价，确认抗原可能的毒性。长毒研究至少要几个月时间。最理想的状态，是一旦确定动物评价有效，GMP材料也完成，那么马上就可以启动临床实验了。临床材料生产和疫苗的有效性和安全性评价都会是疫苗开发的瓶颈。 br/ /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 尽管疫苗研发之路漫长，但基于早前对SARS冠状病毒和MERS冠状病毒的研发，以及疫苗技术的快速发展，相信针对新型冠状病毒疫苗的研发效率将大幅提升。2003年，SARS冠状病毒爆发，当时，从对病毒基因组测序到潜在疫苗的人体试验，科学家花了20个月的时间。2015年，寨卡病毒疫情爆发，研究人员将这一研发过程缩短至6个月。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " span style=" text-indent: 2em " 作为生命科学研究和生物制药行业合作伙伴，奥豪斯的产品和解决方案应用于疫苗的研发和生产中。《奥豪斯助力HPV疫苗生产，加速中国宫颈癌疫苗国产化进程》。奥豪斯将从专业视角持续关注疫情的进展和疫苗的开发，全力支持疫情防控阻击战, 为战胜疫情尽我们的绵薄之力。& nbsp /span br/ /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " span style=" font-size: 14px " 参考资料： /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " span style=" font-size: 14px " 《疫苗行业的发展逻辑 》 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " span style=" font-size: 14px " How Long Will It Take to Develop Vaccine For Coronavirus /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " span style=" font-size: 14px " From SARS to MERS, Thrusting Coronaviruses into the Spotlight /span /p p style=" text-align: right text-indent: 2em " span style=" font-size: 14px " （ /span span style=" font-size: 14px " 文源：奥豪斯 /span span style=" font-size: 14px text-indent: 2em " ） /span /p

人冠状病毒广谱抑制剂的研究进展（一）宋乐天，程玉森，高升华，姜向毅，展鹏＊，刘新泳＊（山东大学药学院药物化学研究所化学生物学教育重点实验室，山东济南250012）摘要：冠状病毒在全球范围内的三次流行对人类生命健康造成了极大威胁，特别是目前针对新冠疫情仍然缺乏有效的抗病毒药物。冠状病毒广谱抑制剂通过作用于病毒生命周期中的关键靶标或宿主关键因子来抑制病毒感染。本文作者聚焦冠状病毒生命周期中的药物靶点，综述了现有广谱冠状病毒抑制剂的研究进展，以期为研发抗冠状病毒药物提供参考，更好地应对当下及未来的冠状病毒疫情。关键词:冠状病毒 广谱抑制剂 老药新用 药物发现冠状病毒(coronaviruses, CoVs)在自然界中 广泛分布,1947年首次由啮齿类动物体内分离得到，其常在多个宿主间传播，对多种家畜、野生动 物及人类具有潜在威胁[1]。冠状病毒在动物间传播至人类，即形成人冠状病毒HCoV。至今已出现7种对人类具有传染性的冠状病毒，分别为HCoV-229E、HCoV-NL63、HCoV-OC43、HCoV-HKU1、MERS-CoV、SARS-CoV和SARS-CoV-2[2]。常见的人冠状病毒如HCoV-229E和 HCoV-OC43可导致上呼吸道感染、消化道及神经系统症状，不严重且能自愈[3-4]，因此在较长时间内未受到重视。2003年暴发的重症急性呼吸综合征(severe acute respiratory syndrome, SARS)疫情造成全球范围内8000多人感染，死亡率为10%左右 2012年暴发的中东呼吸综合征(middle east respiratory syndrome, MERS)死亡率高达39%；而2019年底暴发的新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease- 2019, COVID-19)疫情已经导致全球超过1.6亿人感染，350多万人死亡[5]，造成了全球公共卫生危机，这促使人类加快对冠状病毒抑制剂的研究，但至今仍缺乏特异性药物或疗法。相比较，广谱抗病毒药物可作用于某一类病毒或某种病毒不同的变异株，具有独特的优势。本文作者聚焦冠状病毒生命周期中的关键靶标，探讨了开发广谱抗冠状病毒药物的思路。1.冠状病毒的基本结构冠状病毒的遗传物质为单正链RNA,可以作为病毒增殖时的遗传物质及复制模板，也能以mRNA的形式参与合成相应的蛋白质，或直接组装入子代病毒颗粒。冠状病毒基因组从5,端开始，前三分之二序列由两个重合的开放阅读框组 成,编码多聚蛋白pplab,其最终转化为16种非 结构蛋白(non-structural protein, nsp)，与病毒基 因组转录与复制有关。3,端附近的序列编码冠状 病毒所共有的4种结构蛋白，包括核衣壳蛋白 (nucleocapsid protein, N 蛋白)、刺突糖蛋白 (spike glycoprotein, S 蛋白)、膜蛋白(membrane protein,M蛋白)和高度疏水的包膜蛋白(envelope protein, E 蛋白)(图1)[6] 。2.冠状病毒的生命周期冠状病毒的生命周期包括侵入宿主细胞、基因组复制和结构蛋白合成、子代病毒组装和释放 等基本步骤(图2)。S蛋白介导病毒入侵时，由宿主半胱氨酸组织蛋白酶和跨膜丝氨酸蛋白酶 (transmembrane protease serines 2, TMPRSS2)催化，裂解为S1、S2两个亚单位[7]。S1和S2分别负责病毒与细胞受体结合以及与细胞膜融合，二者协同介导病毒与细胞表面血管紧张素转化酶2 (ACE2)结合，引起S蛋白进一步的空间结构改变,使病毒以脱壳或膜融合方式纳入细胞[8]。相比于SARS-CoV, SARS-CoV-2和宿主细胞膜融合也可有成对碱性氨基酸蛋白酶(PACE,也称 Furin蛋白酶)的参与。其通过选择性水解刺突蛋 白中的氨基酸片段,预活化刺突蛋白以增强其与ACE2的结合力，提高对宿主细胞的侵染能力[9]。病毒侵入后,RNA复制产生子代RNA,并以之为模板合成多聚蛋白，后者在胞浆中受到主蛋白酶(main protease, Mpro或3CLpro)与木瓜样蛋白酶(papain-like protease, PLpro)协同作用，裂解生成功能性蛋白[10]。PLpro除此之外还具有去泛素活性,能在宿主细胞内将蛋白质脱除泛素和类泛素蛋白ISG15 ,以抑制宿主的抗病毒免疫反应[11]。最终,在功能性蛋白的作用下合成子代病毒颗粒的各个组分，装配并释放出胞。Figure 1 The structure of coronaviruses, represented by SARS-CoV-2Figure 2 The life cycle of coronaviruses, represented by SARS-CoV-23.抗冠状病毒药物的主要靶点通过将SARS-CoV-2的基因测序结果与不同的人冠状病毒基因序列对照，可以辨识出一系列 高度保守的序列。这些序列编码各种关键酶或蛋白质,包括S蛋白、主蛋白酶、木瓜样蛋白酶及依 赖RNA的RNA聚合酶(RdRp)等[12]。进一步研究表明，以上酶的活性位点在SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV乃至其他冠状病毒中保持高度相似[13],因此这些酶都是广谱抗病毒药物研发的重要靶点。同时，病毒增殖的过程中高度依赖宿主细胞的物质、能量与酶，因此靶向宿主细胞中与病毒生命周期密切相关的靶点，也是广谱抗病毒药物开发的重要策略[14]。靶向宿主的广谱冠状病毒抑制剂可充分克服病毒耐药性、突变性与种间差异性,具有较大的发展空间[15]。4.广谱冠状病毒抑制剂本文讨论的冠状病毒广谱抑制剂是针对冠状病毒与宿主的关键靶点开发的抗病毒化合物。现阶段，根据这类化合物靶向的生理过程不同，分别靶向冠状病毒的侵入过程、RNA复制过程、多聚蛋白裂解过程以及宿主靶标… … 下一期将分享靶向冠状病毒刺突蛋白、RdRp、蛋白酶及宿主靶标的一系列冠状病毒广谱抑制剂，以及其对抗击新冠肺炎疫情、预防未来的冠状病毒传播具有的重要意义。 参考文献：[1] BAILEY O T.PAPPENHEIMER A M.CHEEVER F S ,et al. A murine virus (JHM) causing disseminated encephalomyeliti s with extensive destruction of myelin: L Isolation and biological properties of the vinis[J]. J Exp Med, 1949,90(3) ：195 -212.[2] YEZ W, YUAN S, YUEN K S, et al. Zoonotic origins of human coronaviruses [ J ]. Int J Biol Sci, 2020,16(10) ： 1896 -1897.[3] WEISS S R, NAVAS-MARTIN S. Coronavirus pathogenesis and the emerging pathogen severe acute respiratory syndrome coronavirus[ J]. Microbiol Mol Biol Rev,2005,69(4) ：635 -664.[4] DE WIT E, VAN DOREMALEN N,FALZARANO D, et al. SARS and MERS: recent insights into emerging coronaviruses [ J ]. Nat Rev Microbiol, 2016,14(Suppl. 1) ：523 -524.[5] World Health Organization WHO Coronavirus Disease (COVID-19) Dashboard[EB/OLJ. [2021 -08 -23]. https://covid!9. who. int/.[6] YANG D, LEIBOWITZ J L. The structure and functions of coronavirus genomic 3' and 5' ends[ J]. Virus Res,2015,206：120 -133. [7] LAN J,GE J, YU J, et al. 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上期，展鹏教授团队分享并阐述了冠状病毒的基本结构、冠状病毒的生命周期、抗冠状病毒药物的主要靶点等内容，本期将分享靶向冠状病毒刺突蛋白、RdRp、蛋白酶及宿主靶标的一系列冠状病毒广谱抑制剂，以及其对抗击新冠肺炎疫情、预防未来的冠状病毒传播具有的重要意义。本文讨论的冠状病毒广谱抑制剂是针对冠状 病毒与宿主的关键靶点开发的抗病毒化合物。现 阶段,根据这类化合物靶向的生理过程不同，分别靶向冠状病毒的侵入过程、RNA复制过程、多聚 蛋白裂解过程以及宿主靶标。4.1靶向冠状病毒侵入过程的抑制剂在抗病毒药物中，侵入抑制剂可以使病毒的生命周期停止在第一步，使其对宿主的危害最小化。SARS-CoV和SARS-CoV-2是通过刺突蛋白与人类呼吸道上皮细胞的ACE2结合而侵入[16]， 而MERS侵入所利用的胞外受体是CD26,也称 作二肽基肽酶(DPP4)。刺突蛋白是一种I型跨膜蛋白(图3),分子 表面高度糖基化，它组装成三聚体后，分布在病毒颗粒的最外层，形成了冠状病毒独特的外观。所有冠状病毒刺突蛋白的胞外部分都是由两个相同的结构域结合而成:氨基端的S1亚单位与受体结 合相关，含有受体结合域(receptor binding domain,RBD)；羧基端的S2亚单位含有融合肽 (fusion peptide)，与病毒融合相关。在S1完成结合后,S2被细胞表面的TMPRSS2蛋白酶裂解，该过程是病毒与宿主细胞膜融合所必需的[17]。因此，靶向S蛋白或TMPRSS2的分子可成为有效的冠状病毒侵入抑制剂。Figure 3 (A-B ) Structure of S protein trimer, from different angles of view ( PDB code ：6XM5) ； ( C) Structure of S protein monomer and location of NTD and RBD； (D) Binding mode of S protein with ACE2 ( PDB code： 7KNY)4.1.1 靶向S蛋白的侵入抑制剂在S蛋白抑制剂中，肽类具有高效、低毒的优势[18]。基于ACE2胞外序列设计的水溶性肽 作为潜在的侵入抑制剂曾受到重视，但其体内半衰期短，难以转运到肺泡[19]。为提高成药性, Lei[20]将ACE2片段与人免疫球蛋白IgGl的Fc结构域结合，提高了血浆中稳定性并增强了结合力。目前,已设计并合成了一系列模拟ACE2的N端螺旋结构域的肽类化合物，如Barh[21]通过扫 描现有的抗菌、抗病毒肽类数据库，得到了10个可能有效阻断S蛋白RBD区域与人ACE2作用 的肽类，但其体内外活性有待进一步研究。在此 基础上,Larue[22]设计了一系列针对刺突蛋白的 ACE2多肽类似物(SAP1 ~SAP6,表1),并在编码荧光素酶并负载SARS-CoV-2刺突蛋白的慢病毒侵染HEK293T-ACE2细胞体系中测定各个多 肽对病毒侵入的抑制作用,各物质活性以半数抑 制浓度(IC50)计量，活性最好为SAP6[(1.90 ± 0. 14) mmol • L-1 ]。同时，上述多肽对SARS- CoV-2刺突蛋白RBD区域的亲和力(Kd)最高为 (0.53 ±0.01) mmol-L-1(SAPl)。Table 1 Amino acid sequence of ACE2 derivatives targeting S proteinCompd.SequenceLocationSAP127-TFLDKFNHEAEDLFYQ42Helix-1SAP237-EDLFYQSSLS5Helix-1SAP379-LAQMYPL-85Helix-3SAP4352-GKGDFRYL-359Helix-11SAP524-QAKTFLDKFNHEA-36Helix-1SAP637-EDLFYQ42Helix-1Curreli等[23]基于ACE2蛋白结合区中30个 氨基酸残基长度的螺旋结构，以8 ~11碳的不饱 和炷链连接肽链上一定跨度的邻近氨基酸，设计了 4个高度螺旋化的装订肽(stapled peptide) NYBSP-1~NYBSP-4，并在 HT1080/ACE2 细胞 与人肺A549/ACE2细胞系中使用基于假病毒的 单循环方法测定了上述多肽分子的EC50值。其中3 个多肽分子显示出了潜在的抗病毒活性:HT1080/ ACE2 中的 EC50值为(1. 9 ~ 4. 1 )μmol• L-1 , A549/ACE2 中 EC50值为(2. 2 ~ 2. 8) μmol • L-1，且在最高测试剂量时，未显示出任何细胞毒性。使用SARS-CoV-2病毒侵染Vero E6细胞时， NYBSP-1显示出了最高的抑制活性，在 17.2 μmol• L-1的浓度完全阻止了细胞病理效应。NYBSP-2和NYBSP-4活性稍低,EC100值为 33 μmol • L-1,NYBSP-4在血浆中的半衰期为289 min,代谢稳定性好。Glasgow 采用“受体陷阱”，(receptor trap)策略，合成出高亲和性、高溶解性的ACE2胞外部分结构域，阻止病毒刺突蛋白与人体细胞表面的 ACE2的结合与入侵[24]。基于此策略设计的肽类分子使冠状病毒难以产生抗药性，并可以抑制几乎所有通过ACE2侵入细胞的冠状病毒[25]。在进一步研究中,Glasgow[24]利用计算机/实验组合的蛋白质工程方法，重新设计了能与SARS- CoV-2刺突蛋白结合的ACE2胞外可溶性区域 (氨基酸18-614) 。最终得到的ACE2变体对于单体刺突蛋白RBD区域的KD app ( apparent binding affinity)值已接近100 pmol• L-1。同时，最理想的 “受体陷阱”分子抑制SARS-CoV-2假病毒和真正 SARS-CoV-2 病毒的 IC50值已达到(10~100) ng-mL-1的范围。这类多肽分子有望真正实现针对利用ACE2入侵宿主细胞的冠状病毒的广谱抑制。由于S蛋白分子高度糖基化，可与多糖衍生物产生多种相互作用，引导人们去探索针对S蛋 白的多糖类抑制物。早在2013年,Milewska就证实了N-(2-羟丙基)-3-三甲氨基甲壳素氯化物 (HTCC,1,图4)及其疏水性修饰的同系物(HM- HTCC)是HCOV-NL63的潜在抑制剂[26]，并制备 了不同比例的氨基被甲壳素取代的HTCC衍生物, 各自具有对不同种类人冠状病毒的抑制作用[27]。近期，文献报道了在人呼吸道上皮细胞中，HTCC 具有抑制 SARS-CoV-2 和 MERS-CoV 的 活性。尽管HTCC中单个正电基团对于靶标的作用较弱，但冠状病毒连环化的特性和多聚物分 子中的多个位点协同作用使得HTCC可以稳定 结合S蛋白。目前，虽然HTCC仍未被批准用于 临床,但实验已经证明其在肺部局部给药的可行 性，且毒副作用极低口旳。综合考虑，上述各种甲 壳素衍生物联合使用，有望成为广谱抗人冠状病 毒感染的防治药物。Griffithsin（2,图4）是由海藻中分离得到的天 然血凝素，可利用糖基结构域结合病毒包膜糖蛋白中特定的寡糖[29]。已有研究表明,griffithsin可以与多种病毒表面的糖蛋白相互作用，包括HIV gpl20 以及 SARS-CoV 的 S 蛋白[30-31]。2016 年，Millet 等[32]报道了 griffithsin 对于 MERS-CoV 的抑制作用。在2μg • mL-1 浓度下,griffithsin抑制了 MERS 病毒对 Huh-7、MRC-5 和 Vero-81 细 胞系90%以上的感染性。针对迅速爆发的新冠 肺炎疫情，一系列针对griffithsin抗新冠病毒活性 的研究正在展开。Xia等[33]首先发现griffithsin 对SARS-CoV-2假病毒侵染呈现剂量依赖性地抑 制作用,EC50值为293 nmol• L-1 Cai等[34]网进一 步在体外试验中测定了 griffithsin对SARS-CoV- 2的抑制活性，结果表明,griffithsin对SARS-CoV- 2活病毒的EC50值达63 nmol• L-1，同时对S蛋白 介导的细胞间融合的EC50 值为323 nmol-L-1值得注意的是,该研究团队还报道了 griffithsin与肽 类冠状病毒侵入抑制剂EK1的协同作用。未来, griffithsin可以单独或与EK1联合制成鼻喷剂、吸入剂或凝胶，以预防或治疗新冠肺炎。4. 1.2 TMPRSS2 抑制剂在SARS-CoV或 MERS-CoV的刺突S蛋白 发挥作用之前，要依赖宿主细胞的跨膜蛋白酶 TMPRSS2将其裂解为S1和S2亚单位[35]。针对 这类蛋白酶的抑制剂也可用于阻断各种冠状病毒 的入侵过程。蔡莫司他（nafamostat,3,图5 ）最初用于治疗胰腺炎，后发现也是TMPRSS2抑制剂，对MERS- CoV具有拮抗活性[36]。进一步研究发现,蔡莫司 他甲磺酸盐对SARS-CoV-2的EC50值达到了纳摩尔级[37]。同时，在日本批准用于治疗胰腺炎的 药物甲磺酸卡莫司他（camostat mesilate,4,图5） 同样具有抑制TMPRSS2的活性[17]，在微摩尔浓度即可有效抑制MERS-CoV感染中合胞体的形成[38]，EC50值达到 0.11 μmol• L-1[39]:对 SARS- CoV-2的EC50值为87 nmol• L-1[37]o现阶段仍无 法确定该化合物能否在肺部达到抑制病毒的有效浓度[40]，但已有临床研究正在评估其对新冠肺炎的治疗作用。4. 1. 3 宿主细胞激酶抑制剂病毒在生命周期中利用了宿主细胞的若干信 号通路。冠状病毒以内吞方式入侵宿主细胞的过 程中，除S蛋白与ACE2的作用外,还需要Abel- son激酶（Abl）的介导。Abl是细胞中重要的管 家蛋白，参与正常细胞的多个生理过程，同时也与 病毒的入侵与复制密切联系，是开发广谱冠状病 毒抑制剂的有效靶点[41]。伊马替尼（imatinib ,5, 图5）是Abl的抑制剂，已被批准用于治疗慢性粒 细胞白血病。已有研究证实，伊马替尼通过阻断病毒颗粒与胞内体膜融合，从而抑制病毒以内吞 路径入胞，并在感染早期抑制SARS-CoV和 MERS-CoV的增殖關。据报道，伊马替尼抑制 SARS-CoV-2 增殖的 EC50值达到130 nmol-L-1 , 同时对SARS-CoV-2 S蛋白的RBD区域结合活 性高达2. 32 pimol-L-1,可通过双靶点作用有效 抑制SARS-CoV-2的侵入關。但在细胞实验中， 其毒性较为明显，用于治疗新冠肺炎或其他冠状 病毒感染前还要经过充分评估。目前，世界范围 内已有多项伊马替尼针对新冠肺炎的临床试验正 在进行(NCT04394416、EudraCT2020-001236-10、 NCT04357613)。4. 1. 4 组织蛋白酶L与Furin蛋白酶抑制剂组织蛋白酶L位于宿主细胞的胞内体，在无 TMPRSS2表达的细胞中，组织蛋白酶L发挥裂 解活性，介导病毒粒子与胞内体膜融合，从而完成侵入过程[44]。2003年,SARS-CoV疫情引起了人 们对组织蛋白酶L抑制剂研发的重视。随后的十几年内，已发现数种具有抗冠状病毒活性的组 织蛋白酶L抑制剂。其中，K11777(6,图5)是通 过筛选2 000余个人组织蛋白酶抑制剂发现的［45］，其对人体或某些寄生虫的半胱氨酸蛋白酶具 有显著抑制作用。K11777抑制SARS-CoV和 MERS-CoV感染的EC50值分别达到0.68 nmol• L-1与46 nmol• L-1，但其不可逆的共价结合机制可能导致较强的毒副作用。目前,K11777仅作为锥虫 病治疗药物进行临床试验M ,其针对SARS- CoV-2的抑制作用有待于进一步确证。SARS-CoV-2 S蛋白的裂解过程也可依赖 Furin蛋白酶进行。Cheng［47］研究了以蔡基荧光 素(naphthofluorescein, 7,图5 )为代表 的数个 Furin蛋白酶抑制剂，证实了此类分子可抑制SARS-CoV-2的感染进程及细胞病理效应。但冠状病毒侵入细胞的不同路径中的关键酶具有互补作用，因此单一种类的蛋白酶抑制剂难以起效［48］，而多种抑制剂联用的毒性可能大幅度增加。针对冠状病毒生命周期中宿主蛋白酶的药物应用尚存在一定的风险与挑战。4.2靶向冠状病毒RNA复制过程的抑制剂针对冠状病毒另一类极为重要的治疗靶标是 RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)，由非结构蛋白 nspl2、nsp7与nsp8结合构成。其活性位点高度保守，包括在一个β转角中突出的两个连续的天 冬氨酸残基样［49］,在不同的正链RNA病毒如冠状病毒和HCV中结构相似［50］。RdRp作为RNA复 制的工具，在病毒的复制中具有重要作用［51］。同 时该酶结构高度特异化,人体无同源酶，是药物开 发的优良靶点。4. 2. 1 RNA依赖的RNA聚合酶抑制剂瑞德西韦(remdesivir ,8,图6-A)是一种腺昔 酸类似物，作为RNA聚合酶的广谱抑制剂，能够抑制人与鼠冠状病毒［52］。更为重要的是，研究证明瑞德西韦在体外针对SARS-CoV-2具有抑制活性, 其抑制 SARS-CoV-2 的 EC50值为 0.77μmol• L-1， 且CC50值大于100 μmol• L-1[53]。基于“老药新用”的原则,2020年10月23日，瑞德西韦获得美 国FDA的正式使用批准，用于治疗12岁以上的新冠肺炎患者[54]。作为一种核昔类似物，瑞德西韦可以与 SARS-CoV、MERS-CoV 和 SARS-CoV-2 RdRp 的 NTP结合位点相互作用。其代谢后以核昔母体9 (GS-441524，图6-A)的形式掺入新生的子代 RNA链中，但允许子链RNA的进一步延长。瑞 德西韦在新生链中移动到-4位时,分子中1，-氰基 与RdRp侧链的Ser861残基发生空间上的碰撞，阻碍了 RdRp在RNA链上的进一步移动,进而导致RNA复制终止(图6-B)。由于终止作用是在瑞德西韦结合RdRp后发生的，该过程称为延迟链终止[54]。延迟链终止机制的RdRp抑制剂针对冠状病 毒具有一定的抗耐药性。包括SARS-CoV-2在内 的冠状病毒会编码具有核酸外切酶活性的nspl4,该酶可以在3,端切除掺入RNA链的异常 碱基,并重启正确的RNA合成[56]。在此机制下, 导致RNA合成即时终止的分子，如去除3,羟基 的核甘类似物，在插入后会被nspl4切除。相对地，在一定延迟后使RNA链合成终止的RdRp抑制剂可有效逃脱nspl4的校对。但研究证实，核酸外切酶仍会识别并切除部分含有瑞德西韦的子 链RNA,并重启RNA复制[57]。同时，病毒体外 传代实验中发现了针对瑞德西韦的耐药现象。与 SARS-CoV-2相似的鼠肝炎病毒(MHV)传代培 养至23代后，其RdRp中出现了不利于瑞德西韦 结合的氨基酸突变[58]。一系列瑞德西韦的临床试验也引起了研究人 员对其临床疗效的争议。2020年5月，原研公司 吉利德发布了适应性试验的“最终报告” (NCT04280705)[59]，称瑞德西韦在临床中可缩短住院时间，改善呼吸系统症状。但WHO在2020 年12月2日发表的“团结实验” (NCT04315948) 结果显示,瑞德西韦无法显著改善总体死亡率、通气时间与住院时间，疗效仍待改进[60]。Spin-ner[61]在为期11天的周期内研究了瑞德西韦针 对新冠肺炎轻中症患者的疗效(NCT04292730), 结果表明，在治疗期间，虽然患者的某些临床数 据出现显著改变，但并不表示任何程度的病情改善。近H,Li[62]在一系列细胞实验中比较了瑞德 西韦与核昔母体GS-441524在体外细胞中的抗病毒能力。结果显示,GS-441524在Vero E6细胞 系中对SARS-CoV-2的抑制能力略强于瑞德西韦，但在Calu-3和Caco-2细胞系中活性稍弱。GS-441524亦可显著提高感染鼠肝炎病毒 (MHV)小鼠的生存率，初步展示出广谱抗病毒作用。由于GS-441524合成方便、成本低、可口服， 同样有望成为治疗SARS-CoV-2的候选药物。法匹拉韦(favipiravir, 10,图7)最早在日本上 市,用于治疗流感，其通过与RdRp活性位点结合 发挥抑制活性[63]，对所有种类及亚型的流感病毒均有拮抗作用，具有治疗多种RNA病毒感染的 潜力。此外,法匹拉韦在抑制病毒RdRp的同时, 不对哺乳动物机体的RNA及DNA合成路径产生影响[64-65]。虽然法匹拉韦在体外试验中对 SARS-CoV-2的抗病毒活性较低(EC50 = 62μmol• L-1),但在两次临床试验中均显示出良 好的效果3项7]。利巴韦林(ribavirin, 11,图7)是已上市的广谱抗病毒药物，已被批准用于治疗丙型肝炎与呼吸道合胞病毒感染。其作用机制是通过靶向病毒 RdRp而使病毒基因组RNA中出现多位点突变， 最终导致病毒mRNA加帽终止，进而抑制病毒 RNA合成[68]。利巴韦林的疗效已经在SARS- CoV和MERS感染者中得到了证实，但严重的不 良反应限制了其临床应用[69]。且在体内外实验中，利巴韦林对SARS-CoV-2感染的疗效约为瑞德西韦的1 /100[53]。综合考虑，利巴韦林治疗 SARS-CoV-2感染的药效、安全性及潜在的毒性 作用有待在临床试验中进一步研究。Galidesivir( BCX4430,12,图 7 )也是腺昔酸 类似物，最初为病毒RNA聚合酶抑制剂，曾被用 来治疗丙型肝炎，且对多种RNA病毒如SARS- CoV,MERS-CoV, Ebola 病毒和 Marburg 病毒具 有广谱抑制活性。在生物体内,galidesivir首先被 转化成相应的三磷酸核昔,再以此形式插入病毒 新合成的RNA链中，导致RNA转录或复制的提 前终止[70]。因此，其有望成为治疗新冠肺炎的候 选药物[71]。阿兹夫定(azvudine,FNC,13,图7)是首个核 首类双靶点HIV抑制剂，针对多种HIV耐药毒株有良好的抑制活性[72]。新冠肺炎疫情爆发后，在我国进行的一项临床试验(CTR2000029853)显 示，阿兹夫定可以显著缩短新冠肺炎轻中症状患 者的核酸转阴时间，对重症患者也具有潜在的治 疗作用。同时临床上未观察到任何与药物有关的 不良反应,安全性有充分保障。目前针对阿兹μmol• L-1。特别是 S416的选择指数达到10 000以上,且无激酶抑制 活性,在治疗浓度下对宿主细胞毒性极小,基本克 服了脱靶效应，作为广谱抗冠状病毒抑制剂具有 极大的开发潜力。此外，DHODH抑制剂有望在 新冠肺炎的治疗中发挥免疫抑制作用，降低“细 胞因子风暴”产生的炎症损伤。参考文献见 中国药物化学杂志 第31卷 第9期，2021年9月总173期

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SARS-CoV-2变异株的出现，使全球面临第二波冠状病毒疾病大流行的危机 目前，已知可以感染人的冠状病毒共有7种，分别为20世纪60年代发现的人冠状病毒HCoV-229E和HCoV-OC43，2003年新出现的SARS冠状病毒SARS-CoV，2004年发现的人冠状病毒HCoV-NL63，2005年新发现的人冠状病毒HCoV-HKU1，2012年7月在中东地区出现的MERS冠状病毒MERS-CoV以及2019年12月下旬爆发的严重性呼吸系统综合征冠状病毒（Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2，SARS-CoV-2）。其中，2019冠状病毒病（Coronavirus disease 2019，COVID-19）引起了全球持续地大流行。尽管全球采取了许多干预和控制措施，截至2022年1月4日，已有200多个国家受到该病毒的影响，实验室确诊的COVID-19病例人数已超过2.9亿，死亡人数超过540万。 本次研究基于岛津AXIMA Performance MALDI-TOF质谱检测平台，旨在提供一种特异性强、灵敏度高的用于检测7种人冠状病毒（人冠状病毒229E、NL63、HKU1、OC43、SARS-CoV、MERS-CoV、SARS-CoV-2），及新型冠状病毒（SARS-CoV-2）分子分型与重要变异株的检测方法。 岛津应对策略及解决方案通过合理选择设计位点、适当添加修饰碱基，可以将延伸探针的质量加以区分，均匀分布于检测范围之内，从而达到多重检测的目的。整个检测反应流程分为五步（图1）：图1 岛津AXIMA Performance MALDI-TOF用于7种人冠状病毒及新型冠状病毒分型与重要突变位点的检测流程示意图 第一步是一步法多重PCR反应，根据待检测位点两端的侧翼序列来设计引物与探针，在一个反应体系中实现逆转录PCR与多重PCR扩增反应，从而达到扩增待测位点的目的。第二步应用虾碱性磷酸酶（Shrimp alkaline phosphatase，SAP）对上一步PCR的反应产物进行处理，消化掉剩余的脱氧核酸核苷三磷酸（Deoxy-ribonucleoside triphosphate，dNTP）。第三步是单碱基延伸反应。事先针对每个检测位点设计一条短探针，探针可以结合到第一步PCR的扩增子上，同时令探针结合之后，延伸的第一个碱基就是要检测的多态性位点。向第二步的产物中加入这些探针，使用经修饰的双脱氧三磷酸核苷（ddNTP）作为反应底物，再配合专用的扩增酶进行反应。第四步是树脂纯化。第五步是质谱检测。将第四步的反应产物转移到包被基质的点样靶板上，待样本结晶之后，使用飞行时间质谱仪检测延伸的单碱基质量大小，来判定检测靶基因的有无，从而进一步判定样本中目标病原体的有无。 本方法经特异度评估、灵敏度评估以及稳定性评估，结果如下：l 使用28种常见呼吸道病原进行本方法特异度检测，测试结果显示，该方法与常见呼吸道病原均无交叉反应，说明该方法具有良好的特异度；l 梯度稀释核酸样本，测试本方法的灵敏度，测试结果显示本方法检出限为250copies/mL；l 使用多个样本检测本方法的稳定性，检测结果显示，不同检测样本的检测结果一致，该方法表现出良好的稳定性。 方法 特点创新性地使用一步法多重PCR技术与核酸质谱检测分析方法联用，实现从临床样本核酸提取后直接进行检测和分型，不需要额外进行RNA的逆转录，很大程度上缩短检测时间和减小试剂的消耗； 与高通量测序技术相比，该方法一次性可处理和分析96或384份样本，且可在一天内获得7种人冠状病毒的检测结果，及SARS-CoV-2基因组中重要的突变信息，并对其进行分型，特别适用于大规模的流行病学研究和重要型别的监测； 该方法具有灵活易用的特点，随着SARS-CoV-2病毒的不断地进化和基因组新突变的产生，新出现的重要突变位点可以被纳入用来设计更全面的检测方法。 结论岛津中国创新中心与中国医学科学院病原生物学研究所合作开发了一种基于MALDI—TOF平台检测7种人冠状病毒及新型冠状病毒分型与重要突变位点的检测方法。利用一步法多重PCR与MOLDI-TOF质谱技术联用来鉴定7种人冠状病毒与新型冠状病毒的重要突变位点。我们通过对包含新型冠状病毒在内的7种人冠状病毒的每一种目标病原体，选择种间特异且种内保守的基因作为检测靶基因，同时根据GISAID公布的用于新型冠状病毒分型与重要突变位点检测的重要突变位点作为靶点。针对上述检测靶点，设计相应检测试剂，旨在开发和评估一种可直接用于7种人冠状病毒检测和新型冠状病毒分型的快速、简便、无须测序的方法。该方法的建立为动态监测SARS-CoV-2病毒的感染和主要型别的全球流行情况提供强有力的手段。 *文中推荐技术方法方案仅用于医学及科研人员技术交流，不作为临床诊断依据。*本研究的相关成果已申请国家专利（申请号：202111084113.0）。

据世界卫生组织统计，目前新冠肺炎全球确诊病例已超过12万例，具备大流行特征。除了呼吸道标本，哪些标本也可能携带新型冠状病毒（SARS-CoV-2），这是大家都关心的。中国疾病预防控制中心、北京地坛医院和青岛市疾病预防控制中心的研究人员本周在《美国医学会杂志》（JAMA）上发文称，在感染者的肺泡灌洗液、鼻腔、痰液、粪便和血液样本中可检测到SARS-CoV-2病毒，但在尿液中检测不到。研究人员从205名新冠肺炎确诊患者中采集了1,070个样本，并利用RNA提取和实时定量PCR（RT-qPCR）来寻找新型冠状病毒的序列。如果通过40个或以下的RT-qPCR循环可检测到病毒RNA，则样本被视为阳性。而且，RT-qPCR的循环阈值越低，病毒拷贝数就越高。利用这种方法，研究人员从72个痰液样本（72/104）、5个鼻拭子样本（5/8）和126个咽拭子样本（126/398）中检测到SARS-CoV-2 RNA。尽管在72个尿液样本中未检测到病毒，但他们却从29%的粪便样本中检测到病毒（总共153个粪便样本）。于是，研究人员尝试对4个粪便样本进行后续培养和电子显微镜分析，以寻找活病毒。他们认为这相当重要，因为一旦在粪便中发现活病毒，就意味着SARS-CoV-2可能通过粪便途径传播。阳性率最明显的是支气管肺泡灌洗样本，这些样本是通过向支气管肺泡内注入生理盐水随后吸出而收集的。以这种方式收集的15个样本中，14个（93%）检测结果呈阳性。相比之下，利用纤维支气管镜刷获得的13个活检样本中，只有6个（46%）通过RT-qPCR检测出阳性。根据研究人员的分析结果，在血液中很少发现这种病毒。对于307份血液样本，他们仅从1%的样本中检测到SARS-CoV-2病毒，也就是说，只有3份血液样本呈阳性。他们怀疑这些患者是全身感染。研究人员指出，这项研究中患者的年龄从5岁到67岁不等，并于1月初到2月中旬在北京、湖北省和山东省的三家医院接受治疗。“在整个治疗期间都采集了血液、痰液、粪便、尿液和鼻腔样本，”他们解释说。在这些患者中，大约19%患有严重疾病，而大多数被诊断出病毒感染的患者也出现了明显的症状，如发烧、疲劳和干咳。不过，作者告诫称，目前的结果并不能说明不同类型的阳性样本与患者症状或疾病严重程度之间的潜在关联，因为他们无法获得所有患者的详细临床数据。研究人员总结道，“有必要对具有详细的时间和症状数据的患者以及从不同部位连续采集的样本进行进一步的调查”。

2020年4月17日本周五上午10:00，鉴知技术司星宇博士将在仪器信息网网络讲堂做题为“新型冠状病毒主流检测技术介绍”的主题报告，为大家详细介绍当前各类新型冠状病毒（2019-nCoV）的主流检测技术和产品。 精彩预告 目前病毒检测的主要技术有：基因测序，实时荧光RT-PCR以及胶体金。其中，依据《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案（试行第五版）》，RT-PCR和基因测序为检测2019-nCoV的金标准。那么，不同技术分别是什么原理？检测性能有何差异？分别适用什么场景？利用光谱技术检测病毒的前景又如何？本次讲座，将会针对这些问题一一阐述。 诚挚邀请 2020年4月17日本周五上午10:00，司星宇博士将在仪器信息网网络讲堂做题为“新型冠状病毒主流检测技术介绍”的主题报告，报告中将对各类2019-nCoV的主流检测技术和产品做详细介绍，同时浅谈新一代检测技术的研究进展，欢迎各界朋友报名参与，共同讨论、交流、进步！报名链接：https://www.instrument.com.cn/webinar/meeting_13133.html 鉴知技术简介 北京鉴知技术有限公司，简称“鉴知技术”，是一家以光谱检测技术为核心的专业公司，产品已广泛应用于安检、食品、药品、毒品、医疗等诸多领域，公司致力于为客户提供更先进的产品和更快捷的物质识别方案。鉴知技术公司源自同方威视技术股份有限公司与清华大学共建的“清华大学安全检测技术研究院”，历经10余年的孵育，公司的核心关键技术达到国际领先水平，专利累计申请数达140余件。公司所拥有的技术获得了国家科学技术委员会科技成果鉴定证书及中国专利优秀奖，相关产品获得了国际发明展览会金奖、北京市新技术新产品证书、中国科学仪器年度优秀新品奖、朱良漪分析仪器创新奖之“创新成果奖”等。【延伸阅读】酒精消毒防新冠？做不好这一点就没用！“鉴知”首次亮相——访北京鉴知技术有限公司总经理王红球从威视到鉴知 150余项专利技术铺就拉曼发展之路

p span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " 　　作者：中国科学技术大学 罗昭锋 /span /p p span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " 　　罗昭锋，中科大生命科学实验中心高级实验师，也是中国科学技术大学图书馆的高级顾问。 /span /p p span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " 　　研究方向： /span /p p span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " 　　1.与中心仪器相关的技术开发和应用研究：如基于表面等离子共振(SPR)、等温滴定微量热(ITC)和毛细管电泳(CE)等技术相关的应用研究 /span /p p span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " 　　2.与学院发展方向相关的公共技术平台建设：如适配体筛选平台建设。 /span /p p 　　 strong 【摘要】 /strong ：新冠状病毒(2019-nCoV)检测目前只有荧光定量PCR方法和测序方法两种被认可的方法。测序不具备快速筛查潜力，这里不做讨论。目前国家药监局审批通过的都是荧光定量PCR的试剂盒。等温扩增的检测试剂盒，至少已有两个单位开发成功，有望近几天上市。等温扩增的试剂盒上市后，检测速度会大幅提升，检测过程只需要15分钟左右。基本可以满足当下疫情控制要求。 /p p 　　 strong 【说明】 /strong ：鉴于当前技术进步非常快速，这里的信息随时可能会发生变化，请谨慎参考。 /p p 　　对抗当前的疫情，快速检测方法的可以快速确诊病人，快速隔离，快速采取措施。因此，各家科研机构以及相关的企业，特别是体外诊断企业、测序公司、大学、研究所以及疾控系统等，在这次新冠状病毒的检测产品开发中，扮演了重要的角色。这里简要介绍一下新冠状病毒的检测技术以及检测产品的开发情况。最后，也会给出个人的一点建议，希望对产品开发，以及基金申请选题有所帮助。 /p p 　　 strong 一、新冠状病毒相关检测技术 /strong /p p 　　世界卫生组织及国家推荐的检测方法是检测病毒的基因，通过荧光定量RT-qPCR的方法或者是基因测序的方法(1)。其它的方法很难达到实际检测所要求的灵敏度，这里基本不予考虑。测序方法由于比较慢，价格也比较昂贵，适合从事研究但不适合作为筛查手段。检测核酸的方法中，由于这次的新冠状病毒是RNA病毒，所以需要加入一步反转录的过程，再进行PCR扩增。目前的检测方法有荧光定量PCR方法和等温扩增的方法，还有数字PCR技术以及基于试纸检测的方法。还有一些研究的目标是加快样品前处理，提升检测通量，提升检测自动化水平，以及降低对设备的要求，对检测人员的要求和降低成本。目前试剂盒检测的标本主要是咽拭子、痰液、肺泡灌洗液、血清及血浆等。 /p p 　　 strong 1、 常规荧光定量PCR方法。 /strong 目前上市的试剂盒都是基于核酸检测的。最早上市的华大基因的方法，采用单基因检测，前后大约需要3小时。后来，有些公司的产品有了一些改进，如多基因检测，或者使用适合快速扩增的酶，都在一定程度上可以提升检测速度。2020年1月28日，第二批获得药监局批准的试剂盒中，圣湘生物采用了独创的RNA一步法技术，灵敏度为200copies/mL，样本处理与扩增检测在一个PCR反应管中即可完成，最大程度减少生物安全风险和交叉污染，可以在30分钟给出结果，这应该是这种方法的极限。而且应该没计算样品处理的时间(2)。 /p p 　　 strong 2、 等温扩增法： /strong 从原理上讲，等温扩增是较快且灵敏的方法。该方法也是检测病毒的核酸，只是信号放大的策略不同，只需要一个温度就可以了，不需要像常规PCR那样，需要在2~3个不同的温度之间进行循环。等温扩增减少了升降温，反应时间要比常规的PCR快很多，只需要十几分钟。但是，基于这种技术的试剂盒开发要比常规Q-PCR试剂盒复杂一些，涉及多对引物，所以截至今天还没有正式上市的产品。但至少有两个团队已经完成产品开发。 /p p 　　 strong 3、 试纸条法(胶体金免疫层析法)： /strong 该方法快速方便，优点适合快速筛选，便宜，不依赖仪器。在病毒浓度低的时候，会导致漏检，获得国家药监局批准的可能性较小。 /p p 　　 strong 4、 样品前处理及检测自动化： /strong 除了在检测环节提升检测效率之外，缩短样品前处理时间，提升检测通量，提升检测自动化也是一个重要研究方向。 /p p 　　 strong 5、 辅助技术开发： /strong 如开发能降低检测对环境要求的仪器或试剂。这次所有的检测都必须在P2(二级生物安全实验室)进行。这是一大限制因素，这种实验室建设周期长，审批慢。不可能短时间建成，只能利用现有资源。这也是湖北省每天检测能力受限的重要原因。因此，开发不依赖于P2实验室的检测试剂和方法，也是当前的一个重要方向。 /p p 　　 strong 二、相关产品介绍 /strong /p p 　　 strong 1、 荧光定量PCR检测试剂盒 /strong ，目前共有6家公司的产品获得国家药监局审批通过。 /p p 　　从1月10日公布新冠状病毒的基因序列，到今天为止恰好经历了三周。这三周也是疫情快速发展变化的三周，也是各相关科研人员与时间赛跑的三周。已经有6家获得国家药监局的批准上市。 /p p 　　1月26日，国家药监局仅用4天时间应急审批通过上海之江生物、上海捷诺生物、华大基因、华大智造4家企业的4个新型冠状病毒检测试剂，创造了中国审评审批速度1月28日，批准获批的2个企业分别是达安基因和圣湘生物。至此，已有6家企业的产品正式获批。还有多家企业等待审批，如辉睿生物、伯杰医疗等近20家企业。有些企业直接选择在省内审批，在省内使用的方法。后面详细附上相关公司及产品介绍。 /p p 　 strong 　2、 等温扩增检测试剂盒 尚未获批 /strong /p p 　　1月27日，徐涛院士团队告诉记者，他们开发的等温扩增试剂盒可以在30min内给出结果。目前未见进一步报告(3)。 /p p 　　1月29日，中国疾病预防中心病毒病预防控制所联合奇天基因成功研制新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸等温扩增快速检测试剂盒，可在8-15分钟内出结果(4)。 /p p 　　 strong 3、 试纸条法： /strong /p p 　　1月29日， SBC生物芯片上海国家工程研究中心旗下上海芯超生物科技有限公司宣布，其已成功研制出了新型冠状病毒(2019-nCoV)抗体检测试剂盒(胶体金免疫层析法)，加样后15分钟内就可以观察结果。该技术产品将可方便快速地用于社区卫生服务中心、基层医院的早筛早诊，不但增加检测和诊疗的时效性，而且可以有效防止广大群众在大型医院密集检查而导致的交叉感染(5)。 /p p 　　同一天，绍兴同创医疗器械有限公司宣布研制出可以快速筛查冠状病毒的筛查检测试纸(胶体金法)，该试纸可十分钟出结果(6)。 /p p 　　热景生物也在不久前推出新型冠状病毒IgM抗体检测试剂(胶体金免疫层析法)，具有敏感性高、诊断时间早等优点(26)。 /p p 　　 strong 4、 数字PCR法 /strong ：绍兴同创医疗器械有限公司与李兰娟院士的感染性疾病诊治协同创新中心开发出三款产品，其中之一就是基于数字PCR方法(7)。依据个人对数字PCR技术的了解，该技术对于临床检测的意义不大。通量低，价格高，速度慢，仪器少。 /p p 　　永诺医疗研发团队针对新型冠状病毒开发了数字PCR检测试剂盒。该试剂盒采用创新的一步法逆转录数字PCR技术，将 2019-nCoV的RNA逆转录及数字PCR扩增整合到一个反应体系，单管双检同时测定2019-nCoV两个独立基因，消除由于病毒变异带来的漏检风险(21)。 /p p 　　锐讯推出的病毒检测试剂盒也是市面上唯一一款兼容数字PCR仪和荧光PCR仪的试剂盒，大大降低了用户应用门槛。同时从技术原理上来说，数字PCR的检测灵敏度较荧光定量PCR高1-2个数量级，更适合检测微量痕量病毒，此次冠状病毒感染也出现了早期症状不明显，但是核酸检测呈阳性的的“潜在感染者”和“隐藏患者”(22)。 /p p 　　1月28日的报道，新羿生物在国家CDC的指导下与清华大学生物医学工程系等单位协力合作，正在开发数字PCR法2019-nCoV核酸检测试剂盒(23)。 /p p 　 strong 　三、其它尚未批准的产品 /strong /p p 　　1、 绍兴同创医疗器械有限公司与李兰娟院士的感染性疾病诊治协同创新中心,迅速成功研制了三类冠状病毒检测系列产品，分别为： 新型冠状病毒核酸检测试剂盒(荧光PCR法，免提取，45分钟快速检测)、新型冠状病毒核酸低拷贝检测试剂盒(数字PCR法，2小时常规检测)、 用于初期筛查的检测试纸(胶体金法，10分钟快速检测)(8)。 /p p 　　2、 山东艾克韦生物技术有限公司开发的试剂盒：1月26日下午，山东省药监局接到山东艾克韦生物技术有限公司研发的2019新型冠状病毒核酸检测试剂盒，省器械检验中心立即组织检验，并于27日上午9点完成所有项目检验，产品符合技术要求，成为山东省法定检验机构检定合格的首个新型k状病毒检测产品(9)。 /p p 　　3、 中拓生物有限公司开发的系列产品 2019新型冠状病毒核酸检测试剂盒(多重荧光PCR法)、2019新型冠状病毒(N基因)核酸检测试剂盒(荧光PCR法)、2019新型冠状病毒(ORF1ab基因)核酸检测试剂盒(荧光PCR法)三种试剂盒均已成功通过国家食品药品监督管理局济南医疗器械质量管理监督检验中心的注册检验，产品将用于新型冠状病毒的鉴别诊断，为疾病防控贡献力量(10)。 /p p 　　4、 江苏硕世生物股份有限公司开发的试剂盒。1月10日新型冠状病毒正式公布后，江苏硕世生物股份有限公司仅耗时3天，就完成了对新型冠状病毒核酸检测试剂盒的开发与生产，并快速向全国各省市提供诊断试剂与服务(11)。 /p p 　　5、 广州多家机构开发出了诊断试剂盒产品。包括达安基因、万孚倍特、华银医药、和信健康、微远基因等企业研发出新型冠状病毒检测试剂盒后，广纳信捷医疗(以下简称“广纳信捷”)与中科院国家纳米科学中心联合攻关的新型冠状病毒等温快速检测试剂盒研发接近完成，各项指标均满足临床应用要求，最快可实现30分钟出检测结果(12)。 /p p 　　6、 苏州海苗生物科技有限公司研发的超敏2019-nCov检测试剂盒于1月25日下线，该试剂盒可以快速检测人传人的二代、三代、四代新型冠状病毒。它的成功研发，可为新型冠状病毒感染肺炎的确诊起到重要作(13)。 /p p 　　7、 世和基因生物技术有限公司研发的新型冠状病毒检测试剂盒于1月27日推出，并正在申请进入国家药监局为此次疫情开辟的应急审批通道(14)。 /p p 　　8、 厦门大学专家团队与致善公司联合研制的新型冠状病毒(2019-nCoV)现场检测一体机已完成内部测试，即将开展临床评估。该型仪器可用于新型冠状病毒的现场检测，无需严格实验室条件，无需专门培训，仅需一步加样，仪器便可自动完成检测并出具报告(15)。 /p p 　　9、 奥然生物全自动qPCR一体机，助力新型冠状病毒的精准快速检测(16)。 /p p 　　10、 成都高新区企业迈克生物与1月29日成功研发出西南首个新型冠状病毒检测试剂盒，将为西部地区乃至全国有效筛查和防控新型冠状病毒提供有力保障(17)。 /p p 　　11、 陕西佰美医学检验实验室开发的检测试剂盒，已于1月27日，向西安市临检中心报备，服务社会(18)。 /p p 　　12、 广东凯普生物科技股份有限公司于1月29日完成两款新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒产品研制工作(19)。 /p p 　　13、 福州大学生物科学与工程学院自主研发出新型冠状病毒检测试剂盒，并与泰普生物科学(中国)有限公司合作，迅速实现产学研转化(20)。 /p p 　　14、据体外诊断网报道，新冠病毒检测试剂可先用后申报，1月28日，已有81家企业已可提供(21)。 /p p 　　15.迅敏康1月21日迅敏康就已完成了“2019-nCoV新型冠状病毒检测试剂盒(PCR-荧光探针法)”及配套IngeniFast& reg ?迅敏全自动PCR前处理系统的研发，并于(1月26日)正式推出(25)。 /p p 　 strong 　三、小结 /strong /p p 　　1月30日晚，湖北省委书记蒋超良在新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控工作新闻发布会上表示，湖北省共有28家医院能够做样本检测，单日的样本检测能力已提高到约4000份。可见，检测试剂和检测能力短缺的情况有所缓解。 /p p 　　如果现在才开始开发RT-qPCR检测试剂盒，需要仔细权衡一下。因为现在太多家企业在做相关产品，乐观估计，等几天之后开发完成，再等获得认证通过，估计疫情差不多结束了。早期大量企业一起研究，一起竞争，提升效率，我认为是很有必要的。但在今天，近二十家产品已经上市的情况下，潜在产能也许远远超出实际需求的情况下，再投入精力，研发重复性的检测试剂盒，未免有些浪费。 /p p 　　但是，如果检测方法有革命性的改进，依然值得探索。譬如能做到“省时、省钱、爽”，在检测时间上能够大大缩短，在检测步骤上更为简单，对环境对仪器对人员的要求更低 检测成本更低 更加方便，更加安全，更加准确等到你。这样的话还是值得继续去探索的。 /p p 　　我觉得当前的研究方向，可以转向治疗，以及更基础的研究方向。比如防控，治疗，以及致病机理研究等方面。 /p

中美两个独立的研究团队 28 日报告说，他们发现了多株可以抑制新型冠状病毒（中东呼吸系统综合征冠状病毒）感染的中和抗体。这是国际上首次报告发现抗新型冠状病毒的中和抗体。中和抗体是免疫细胞分泌的一类蛋白，能在某些病毒侵入细胞之前与该病毒结合，阻止其黏附、感染细胞，相当于把病毒“中和”掉。清华大学张林琦教授和王新泉教授带领的团队在美国《科学-转化医学》上报告说，他们首先从分子水平上分析了新型冠状病毒与其人类受体蛋白 DPP4 之间的相互作用，然后利用正常人的非免疫抗体库，像“钓鱼”一样筛选出两株中和抗体 MERS-4 和 MERS-27 。这两株中和抗体经过验证，可以有效阻断新型冠状病毒与其细胞受体 DPP4 的相互结合。美国戴纳-法伯癌症研究所研究团队利用类似方法，鉴别出7株中和抗体，其中一株抗体 3B11 表现出了最高的中和活性，被认为最有医学应用潜力。这一成果发表在美国《国家科学院学报》（PNAS）上。对比两项研究，张林琦表示，他们发现的两个抗体具有明显的相互协同作用，即联合使用可以大大加强抗病毒效果，从而提高抗病毒的活性和广谱性，对可能变异的病毒保持高效抑制活性。而另一项研究还没有开展这方面的研究，联合使用的效果不详。张林琦表示，他们将尽快展开动物和人体试验，现已开始与中国医学科学院和香港大学的科学家讨论相应的试验方案。新型冠状病毒 2012 年 9 月在沙特被发现，它与非典病毒（SARS）同属冠状病毒。其感染者多会出现严重的呼吸系统问题并伴有急性肾衰竭。新型冠状病毒致死率目前超过 50%，远高于 10 年前 SARS 流行期间大约 10% 的致死率。人们对这种病毒仍知之甚少。

新型冠状病毒肺炎是指新型冠状病毒感染导致的肺炎。2019年12月以来，湖北省武汉市部分医院陆续发现了多例有华南海鲜市场暴露史的不明原因肺炎病例，现已证实为一种新型冠状病毒感染引起的急性呼吸道传染病。新型冠状病毒感染的肺炎患者的临床表现为：以发热、乏力、干咳为主要表现。鼻塞、流涕等上呼吸道症状少见。约半数患者多在一周后出现呼吸困难，严重者快速进展为急性呼吸窘迫综合征、脓毒症休克、难以纠正的代谢性酸中毒和出凝血功能障碍。值得注意的是，重症、危重症患者病程中可为中低热，甚至无明显发热。部分患者起病症状轻微，可无发热，多在1周后恢复。多数患者预后良好，少数患者病情危重，甚至死亡。国家为指导各级疾控部门和其他相关机构开展新型冠状病毒感染的肺炎实验室检测工作，特制定本技术指南。本指南主要介绍目前已经比较成熟、易于实施的核酸检测方法。《新型冠状病毒感染的肺炎实验室检测技术指南》（第二版）其中提及到以下内容：（三）标本采集种类每个病例必须采集急性期呼吸道标本和急性期血液标本；重症病例优先采集下呼吸道标本（如支气管或肺泡灌洗液等），可根据临床表现与采样时间间隔进行采集。3．血液标本：尽量釆集发病后7天内的急性期抗凝血。采集量5ml，以空腹血为佳，建议使用含有抗凝剂的真空釆血管采集血液。4．血清标本：尽量釆集急性期、恢复期双份血清。*份血清应尽早（最好在发病后7天内）釆集，第二份血清应在发病后第3～4周釆集。采集量5ml，以空腹血为佳，建议使用真空釆血管。（四）标本采集方法7．血液标本：建议使用含有抗凝剂的真空釆血管采集血液标本5ml，室温静置30分钟，1500～2000rpm离心10分钟，分别收集血浆和血液中细胞于无菌螺口塑料管中。8．血清标本：用真空负压采血管采集血液标本5ml，室温静置30分钟，1500～2000rpm离心10分钟，收集血清于无菌螺口塑料管中。Hettich 离心机产品线齐全，从微量管离心机至台式离心机，有众多型号可供客户选择！例如：eba 280S离心机配上1148的8位水平转子，可以同时进行8个5ml采血管的离心实验，最高转速可达5000rpm，而且重量约12kg，轻巧方便，为新型冠状病毒肺炎检测保驾护航！

中国微生物菌种查询网：目前，有关新型冠状病毒的新闻铺天盖地，然而大多数的图片或摄影作品都是与人和社会有关的：戴着口罩的旅客、穿着防护服的医护人员，还有各种戒备森严的小区等等......但这组照片则揭露了新冠状病毒的真是面目。 这些图像是由位于蒙大拿州汉密尔顿市的美国国家过敏和传染病研究所（NIAID）落基山实验室（RML）的扫描和透射电子显微镜拍摄的。NIAID分子病机部门的负责人Emmie de Wit提供了病毒样本。显微镜专家伊丽莎白费希尔（Elizabeth Fischer）制作了这些图像，RML的视觉医学艺术办公室对图像进行了数字着色。 这些图像与MERS-CoV（2012年出现的中东呼吸综合征冠状病毒）或最初的SARS-CoV（2002年出现的严重急性呼吸综合征冠状病毒）没有太大区别。这并不奇怪。冠状病毒表面的棘突给这种病毒家族起了个名字——冠状病毒，在拉丁语中是“王冠”的意思。大多数冠状病毒都有皇冠一样的外观。 此外，在新冠肺炎疫情的影响之下，各行各业都遭到了一定程度的波及。在艺术行业里，影响是明显的，许多美术馆和画廊均用闭馆进行回应，或是延期举办展览，其中包括2020年的香港巴塞尔艺术展、北京画廊周、设计上海等多个大型艺术活动，甚至包括全球各大器材展览，比如日本的2020 CP+器材展和移动通信展会MWC 2020等等。

重磅|美格基因首推新型冠状病毒创新检测系统2019新型冠状病毒疫情发生后，病原体快速精准检测成为当务之急。作为专注于微生物组技术的国家高新技术企业，美格基因在国家应急部门公布2019-nCoV的全基因组序列之后，第一时间组织研发骨干力量，并和华南师范大学生命科学学院紧密合作，仅用5天时间即研制成功“新型冠状病毒（2019-nCoV）核酸检测试剂盒（基于Q-PCR法）”。结合美格基因前期的系列技术与产品储备，建立了基于快速检测试剂到检测配套的设备、仪器和物联网的荧光定量检测新型冠状病毒的整体解决方案。 美格基因的新型冠状病毒检测系统具有以下多方面优势：（1）一步法核酸提取试剂盒，样品前处理时间进一步优化；优化试剂配方和分装体系，简化配试剂流程（图1），仅需40分钟即可完成检测，同时兼具高特异性和高灵敏度的优势；自主研发生产仪器，大幅度降低仪器价格；简化仪器UI界面，统一程序设定，做到一键检测（图2）；开发客户端，手机端APP，实现检测结果多端口推送，查看简便（图3）。解决检测系统下基层困难问题，可将检测服务覆盖到社区、村落。 （2）将qPCR仪采集的数据信息，通过互联网技术及时上传至服务器，通过建立的监管系统可实现以下目的：①随时随地查看检测结果；②通过设置预警阈值，系统会自动提醒阳性的检测结果，便于及早发现危害；③系统实现多层级权限管理，可建立省市县镇多层级监管系统，实现检测结果的实时监管和数据的自动上报，便于疫病防控的便捷化管理；④系统自动生成系列报表，充分发挥大数据在疫病防控监管中作用，实现疫病检测的数字化管理（图四）。 （3）易用：全自动化检测，只需人工加入样品，一键式全程自动化检测及判读结果。 图一. 新型冠状病毒（2019-nCoV）核酸检测试剂盒（Q-PCR法）图二. 新型冠状病毒（2019-nCoV）核酸检测设备图三. 新型冠状病毒（2019-nCoV）核酸检测手机监测端 图四. 新型冠状病毒（2019-nCoV）核酸检测物联网监测平台（示意图）

2019年12月以来，湖北省武汉市陆续发现多例新型冠状病毒感染的肺炎患者，根据国家卫健委发布的《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案（试行版第五版）》，实验室检查在鼻咽拭子、痰液、下呼吸道分泌物、血液等标本种可检测出病毒核酸，确诊依据之一为呼吸道标本或血液标本实时荧光定量RT-PVR检测SARS-CoV-2核酸阳性，检测流程如下： 由于新冠病毒传染性极强，因此在核酸检测过程中安全性问题尤为重要，已有报道检验人员疑因实验过程中气溶胶感染SARS-CoV-2，海尔生物医疗提供可完全在生物安全柜内使用的核酸提取仪，最大程度保护环境及医技人员，比手工试剂盒更快更便捷。 目前核酸检测一度受到质疑，怀疑其有假阴性出现，假阴性的出现与病毒拷贝数有直接关系，对于同一份样本来说，与试剂及仪器的灵敏度准确度有极大关系，从核酸提取环节来说，就要求可以从样本中提取微量的优质RNA，海尔生物医疗提供得率高、纯度高的低压加压膜法自动核酸提取仪，快速简单易上手。l 仪器设备及试剂盒搭配方案：类型自动化方案手工辅助型方案产品名称QuickGene-AutoS RNA Tissue Kit QuickGene RNA tissue kit S II 型号AS-RTRT-S2规格48prep96prep方法学膜法膜法配套仪器QuickGene-Auto12S/24sQuickGene-Mini80/Mini480仪器性能无需离心，减少气溶胶，样本空气暴漏时间短，膜法提取快速质优无需离心，减少气溶胶，可放安全柜内，更安全，比普通手工试剂盒更快速便捷另有更多32、96通量核酸提取方案、荧光定量（四通道以上）PCR检测方案，以及SARS-CoV-2感染样本运、检、存、生物安全的全场景方案。

p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 截至1月22日11时，累计报告新型冠状病毒感染的肺炎确诊病例440例，疑似病例163例，治愈25例，死亡9例。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 北京、广东、上海、浙江相继出现确诊病例，目前湖北省确诊病例已达270例，全国20省市已出现确诊病例或疑似病例。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 383px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/b2f428c0-bfa2-45eb-9fbf-ff7d8eb66952.jpg" title=" 冠状病毒地图.jpg" alt=" 冠状病毒地图.jpg" width=" 600" height=" 383" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 目前，病毒传染源尚不明确，传播途径尚未完全掌握，但已确认存在人传人现象，部分医务人员感染。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 通过研究发现在武汉发现的新冠状病毒2019-nCoV为单链正链RNA病毒。在分类学上，2019-nCoV属于网巢病毒目（Nidovirales）、冠状病毒科（Coronaviridae）、正冠状病毒亚科（Orthocoronaviridae）的Beta冠状病毒属（Betacoronavirus），同属中还包括SARSr CoV、MERSr CoV等其它可感染人类的冠状病毒。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 中国科学院院士、中国疾病预防控制中心主任高福22日在国新办发布会上表示，新型冠状病毒的来源是武汉一家海鲜市场非法销售的野生动物。根据目前的流行病学认知，新型冠状病毒对于儿童等年纪小的人不易感。 /p

新型冠状病毒肺炎(Coronavirusdisease2019,COVID-2019)是由严重急性呼吸系统综合征冠状病毒（SARS-CoV-2）所引起的高传染性病毒疾病，对世界人口造成了灾难性影响，导致全球380多万人死亡，成为继1918年流感大流行以来影响最大的全球卫生危机。 新冠病毒不断变异的RNA病毒 作为单链结构的RNA病毒，新型冠状病毒的一大特点就是极其容易变异。随着感染人数的增加和疫情的持续，新型冠状病毒不断进化和变异，陆续产生多种新冠病毒变异株。世界卫生组织（WHO）根据新冠病毒变异株的传播力、致病力等将其分为VOCs(Variant of concern)和VOIs(Variant of interest)。新冠病毒VOCs的分类 新冠病毒VOIs的分类 目前市场对新冠病毒筛查主要采用荧光 PCR 方法，该方法检测灵敏度高，但成本也相对较高，并且单机通量小，容易被污染，制约了大规模病毒检测速度，对当前不同变异毒株区分荧光PCR方法存在一定难度。随着病毒感染多元化和疫情防控常态化的推进，市场急需一种更快速、准确、高通量的检测方法，用于满足大样本量的检测、基层的日常防控筛查，以及不同变异株的区分。 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）主要用于分析包括蛋白质及核酸在内的生物大分子，该技术应用于核酸检测具有高通量、高灵敏、高准确率的特点。其主要工作原理是结合延伸分析法和碱基特异裂解分析法，将扩增后的核酸产物通过离子源使样品离子化，产生不同质荷比的离子，再经过质量分析器测定该样品中不同种类离子的分子量，按照从小到大的顺序依次排列从而得到一幅质量图谱，并根据检测项目不同给出相应的检测报告。该技术在遗传病筛查、肿瘤变异检测、甲基化检测、用药指导、病原体检测及功能医学健康管理等多个领域的应用日益深入，已经成为精准医学不可或缺的分子诊断技术。MALDI-TOF MS检测新型冠状病毒方法为通过特定引物扩增目标基因片段，再通过靶向位点探针特异性单碱基延伸，然后通过质谱技术检测延伸位点的碱基，判断病毒种类和变异类型。该方法灵敏度高、操作简单、成本低廉、人员需求低、通量高，可实现6小时384样本出报告，以后每1小时出384份样品报告。新冠病毒流行初期，Autof ms1000系统建立了完成病毒检测检测体系，对病毒毒株进行了精准检测（图3）。随着研究深入，Autof ms1000检测核酸的体系也日渐成熟，针对当前多变异毒株情况，研究人员通过合理设计扩增引物和探针，可实现单个样品，单芯片位点检测，一次区分当前所有可认知的新冠病毒变异株。随着疫情斗争的持续进行，病毒变异也不断发生，后续可能出现更多更复杂的病毒变异株，MALDI-TOF MS技术基于其检测原理，在大样本多病毒变异株检测方面的优势将日渐突出。随着人们对该技术的认知度的日渐加深，未来该技术在核酸检测方向的应用将出现更多的思路和方法，MALDI-TOF MS在临床应用领域中将会发挥更大的作用。

p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 中国科学院武汉病毒研究所在新型冠状病毒研究方面取得突破，已筛选出几种能在细胞层面较好抑制这一病毒的药物，具有潜在临床应用价值。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　这是记者29日从中科院武汉病毒所获得的消息。据该所相关负责人介绍，筛选结果已向国家和湖北省新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控指挥部科技攻关组报告，供综合研判后指导医疗救治。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　新型冠状病毒感染的肺炎疫情发生后，中科院武汉病毒所依托该所建设的武汉国家生物安全实验室和国家病毒资源库的核心支撑作用，着力进行病原鉴定、病毒溯源、病原检测、抗病毒药物及疫苗等研究，努力为一线防控治疗提供重要资源储备和科技支撑。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　该所实现了新型冠状病毒相关抗原蛋白的原核和真核表达。通过与珠海丽珠试剂股份有限公司合作，在短时间内完成了新型冠状病毒IgG、IgM血清学诊断试剂盒，可作为除咽拭子病原核酸检测以外的重要辅助诊断手段。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　在新型冠状病毒感染的动物模型方面，该所已基本完成小鼠和非人灵长类动物模型的建立，将为后续研究提供关键支撑。同时，该所正积极开展新型冠状病毒疫苗研发工作。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " 　　据悉，在本次疫情发生并完成病原鉴定后，武汉国家生物安全实验室已获国家卫健委批复，可开展新型冠状病毒相关实验活动。 /p

目的 提高疫苗犹豫认识度,为进一步制定新冠病毒疫苗犹豫应对措施提供依据。方法 通过文献检索,对疫苗犹豫现象、新冠病毒疫苗研制和上市现状、新冠病毒疫苗犹豫现状、影响因素和应对措施进行综述。结果各国新冠病毒疫苗研制竞赛如火如荼,国内外均有不同类型疫苗上市使用 各国新冠病毒疫苗犹豫差异较大,与调查时机、国家地域、人群选择等均有关系 新冠病毒疫苗犹豫受疫苗、个人、认知等方面因素影响。结论 为减少新冠病毒疫苗犹豫,建议采取的措施有:政府主导,各级有效发挥监管作用 渠道畅通,保证疫苗信息透明准确 专业培训,全面提升疫苗接种信心。 新型冠状病毒疫苗犹豫研究进展_刘春梓.pdf

简智仪器国家标准起草单位航天级产品供应商拉曼光谱技术变革推动者拉曼快检领军企业权威官方（国家卫健委）的诊疗方案中明确说“新冠状病毒对紫外线和热敏感，56℃30分钟、乙醚、75%乙醇、含氯消毒剂、过氧乙酸和氯仿等脂溶剂均可有效灭活病毒，氯己定不能有效灭活病毒”。 是不是只要名字含“氯”的消毒剂、洗手液就能杀灭冠状病毒？食用级乙醇能不能用来消毒？过氧乙酸在家用安全么？这些疑问最近一直在微信群中被亲朋好友询问，下面让我们为大家进行简单的答疑解惑。一、明确有效的消毒品1、含氯消毒剂不是名字里面有“氯”字，就是含氯消毒剂！含氯消毒剂到底指的是什么呢？含氯消毒剂其实是指溶于水产生次氯酸的消毒剂，可杀灭各种微生物，包括细菌繁殖体、病毒、真菌、结核杆菌和抗力最强的细菌芽胞。科学家研究认为其能迅速氧化、破坏病毒衣壳上蛋白质的酪氨酸，抑制病毒的特异性吸附，阻止其对宿主细胞的感染。怎样选购才是对的？看成分！只要产品成分主要为次氯酸或写明了有效氯含量就可以。常见的市售产品名为84消毒液、漂白水等，在各大电商平台输入“次氯酸”或“含氯消毒剂”，可能搜索到的有效消毒剂比输入“84消毒液”得到的信息更多，然后再确认下产品成分是否正确，就可以放心购买啦。注意事项：1.有一定刺激性和腐蚀性，必须稀释后才能使用，使用时戴手套；2.不要与其他洗涤剂或消毒液混合使用，因为会产生氯气引起中毒；3.对金属有腐蚀作用，对织物有漂白作用；4.宜现配现用，一次性使用，不要用超过50度以上的热水稀释。2、75%乙醇为什么要用75%这个浓度 ？酒精能够吸收细菌和病毒蛋白的水分，使其脱水变性凝固，从而达到杀菌灭活的目的。如果使用高浓度酒精，会对蛋白脱水过于迅速，使细菌表面和病毒外壳蛋白质首先变性凝固，形成了一层坚固的包膜，酒精反而不能很好地渗入内部，以致影响其杀菌消毒能力。酒精浓度低于75%时，由于渗透性降低，也会影响杀菌能力。也就是说，酒精杀菌消毒能力的强弱与其浓度大小有直接的关系，过高或过低都不行，效果最好的是75%。疫情以来，大家都知道要购买75%的酒精，这时候，大家又被各种食用级、医用级、工业级酒精所困惑，到底食用级、粮食酿造的、工业级的75%乙醇能用么？其实，只要乙醇浓度达到了75%，这几个级别的都是可以用的。此外，70~75%浓度的酒精棉片也可以杀死病毒，但普通的湿巾是没有消毒作用的。乙醇易燃，使用时需远离明火。但乙醇易挥发，少量喷洒在身上或物品上是不会轻易引起燃烧的，只要喷洒时远离火源，都可以放心使用。3、过氧乙酸过氧乙酸是无色透明液体，具有酸性，有强烈的刺激性酸味，易挥发。消毒效果：可杀灭细菌繁殖体、真菌、病毒、分枝杆菌、细菌芽孢等，主要是由于其本身具有的强氧化性以及过氧化氢和乙酸的协同作用。适用于环境、非金属物体表面、餐饮具、果蔬、室内空气、医疗器械等的消毒和灭菌，也可用于消毒皮肤。消毒方法：根据产品说明进行稀释后，物品可浸泡、擦拭，皮肤擦拭后再用清水洗净。室内可采用喷雾或加热熏蒸消毒方法，服装与大件物品表面的消毒也可用这种方法，熏蒸后开窗通风15分钟后进入。毒性：过氧乙酸分解后产生醋酸、氧气和水，没有残留毒性。但高浓度的原液具有较强的腐蚀性和刺激性。注意事项：1.原液腐蚀性强，不可直接用手接触。配制溶液时应佩戴橡胶手套，防止药液溅到皮肤上。对金属有腐蚀性，不可用于金属器械的消毒。2.在做喷雾时，操作者应佩戴防护面罩或口罩、帽子及游泳镜替代，不可直接对人喷洒。3.原液贮存放置可以分解，故应注意有效期。原液应贮存于塑料桶内，在阴暗处保存，并远离可燃性物质。其稀释液更易分解，宜随配随用。二、无效的消毒品1、酚类和季铵盐类消毒剂市面上常见的消毒剂还有这两大类，主要是对氯间二甲苯酚（PCMX）、苯扎氯铵（BZK）。这类消毒剂只对细菌及部分病毒有效，苯扎氯铵对此次新型冠状病毒无效，对氯间二甲苯酚暂时没有明确证据表明其对新冠病毒是否有效。因此，此类消毒剂作为日常的家用消毒可用，但对此次疫情消毒无效。因此，在选购消毒剂时一定要看清成分，千万不能依靠“消毒液”三个字去购买！2、含碘消毒剂常见含碘消毒剂有碘伏、碘酊、可杀灭除细菌芽孢以外的各种细菌繁殖体、真菌、部分病毒和分枝杆菌，属中效消毒剂。多用于皮肤和黏膜的消毒，不适用于家具消毒，对新型冠状病毒也没有明确效果。参考文献：【1】王咏龙，卢先娥；含氯消毒剂应用研究进展.预防医学情报杂志,2002,18(6)【2】沈伟，朱仁义；过氧乙酸与过氧化氢消毒液及其研究进展.中国消毒学杂质,2010,27

由新型冠状病毒引起的新冠肺炎疫情仍在继续，严重威胁着全球公众健康，截至2021年12月，全球新冠肺炎确诊患者已累计超过2.8亿人次。目前广泛使用的基于聚合链式反应（PCR）和免疫分析的检测方法存在假阴性和诊断延迟的问题。因此，迫切需要高准确度、快速高通量的新冠肺炎检测方法用于大规模人群筛查。河北师范大学、军事医学科学院、融智生物的研究团队合作发展了一种基于基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）的检测方法。该方法使用融智生物QuanNUA核酸质谱系统，可同时完成7种冠状病毒联检，且具备灵敏度高（只需1μL样品）、通量高（可在30min内快速处理384个样品）、成本低、样本消耗量少的特点，同时不需要苛刻、洁净的检测环境，操作也相对简便。因此，该方法在大规模人群筛查、常规检测和诊断应用方面具有巨大潜力。相关论文已经发表在COVID期刊上。文章摘要翻译：人类冠状病毒（HCoV）与一系列呼吸道症状有关。严重急性呼吸综合征（SARS）-CoV、中东呼吸综合征和SARS-CoV-2的出现对人类健康构成重大威胁。本研究开发了一种将多重PCR与基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）相结合的方法（HCoV-MS），以同时检测和区分7种人类冠状病毒（HCoV）。HCoV-MS方法具有较高的特异性和灵敏度，检测限为1-5拷贝/反应。为了验证该方法，在研究中对163份临床样本进行了检测，结果与实时PCR结果一致。研究结果表明：HCoV-MS和实时PCR的检测灵敏度相当；HCoV-MS法是一种灵敏的分析方法，只需1μL样品；HCoV-MS是一种高通量方法，可以在30分钟内快速处理384个样品。在本研究的最后，作者建议使用这种方法来补充大规模筛选研究中的实时PCR。

在新型冠状病毒肺炎（Novel coronavirus pneumonia, NCP）的各个诊疗方案中，我们仍然能够发现与流式细胞术相关的检测得到了不少认可与建议，那么，究竟流式细胞术在新型冠状病毒感染的诊断与治疗中，有哪些用途呢？这些基于流式的检测又是否对临床具有实际意义的帮助呢？我们从现有的已经官方发布的新型冠状病毒肺炎的诊疗方案中，寻到了建议进行流式相关检测的依据。即，对于新型冠状病毒感染，在有条件的情况下，建议进行淋巴细胞亚群和细胞因子的检测。针对已确诊的2019-nCoV病人建议留观后第3、5、7天及出院时依据病情可，若有条件可检查血细胞，肝肾功能，肌酶+肌红蛋白，凝血、CRP；第5-7天若有条件可复查PCT及TB淋巴细胞亚群11项。而进行淋巴细胞亚群和细胞因子的检测，最常用的检测方法即流式细胞术。由于对2019-nCov的机制尚在研究中，我们参考了与之相似性很高的SARS的诊治方案和研究结果，来共同探讨一下这些检测的临床意义。其他研究显示，在SARS治疗过程中，糖皮质激素的应用会使T淋巴细胞及亚群发生不同程度减低，因此，外周血T淋巴细胞亚群的动态监测，有助于SARS-Cov致病机制的研究和诊断，并对于指导治疗（尤其糖皮质激素应用的试剂、剂量等）以及提示预后具有重要价值。3还有很多研究揭示了细胞因子在冠状病毒感染中扮演的重要角色。Chen J等人在2010年发表的，利用BALB/c小鼠模式，对SARS-CoV感染的细胞免疫反应进行的研究显示，细胞因子在病毒感染后的早期（如TNF-α, IL-6, 趋化因子CXCL10, CCL2, CCL3, CCL5等）和疾病进程中（如 TNF-α, IFN-γ, IL-2, IL-5, IL- 6, 趋化因子CXCL9, CXCL10, CCL2, CCL3和CCL5等）均有增高，这些细胞因子的增高，要么与早期炎症细胞的募集相关，要么与病毒清除，肺部损伤肺部炎症产生相关。5另有研究认为，SARS感染后，机体会因为受到较强的外界刺激而产生过度免疫，出现细胞因子风暴。而细胞因子风暴会造成的肺毛细血管内皮细胞以及肺泡上皮细胞的弥漫性损伤，引发急性呼吸急性呼吸窘迫综合征（acute respiratory distress syndrome, ARDS）。6最新发表在Lancet上的针对2019-nCoV 感染的研究揭示，感染2019-nCoV的患者有大量的IL1B、IFNγ、IP10和MCP1增高，可能与激活Th1细胞免疫反应有关。然而，2019-nCoV感染也启动了抑制炎症的Th2细胞因子（如IL4和IL10）分泌的增加，这与SARS-CoV感染还是不同的。进一步比较ICU患者与非ICU患者，发现ICU患者血浆IL2、IL7、IL10、GCSF、IP10、MCP1、MIP1A、TNFα的浓度均高于非ICU患者，提示细胞因子风暴与疾病严重程度相关（图2）。7由此可见，检测病毒感染者的细胞因子的情况，有助于了解机体在冠状病毒感染后的一系列免疫应答状态，为疾病治疗和预后判断提供重要依据，同时也为探索新型冠状病毒的致病机制提供更多的线索。当然，对于新型冠状病毒的研究仍在继续，流式细胞术能贡献的检测指标也远不止淋巴细胞亚群和细胞因子，在条件允许的情况下，纳入更多有潜在意义的检测指标，也很有可能为探索新型冠状病毒感染的更优诊疗方案，以及致病机制研究带来新的助益和指引。参考文献1. 新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案（试行第四版）2. 北京协和医院关于 “新型冠状病毒感染的肺炎”诊疗建议方案（V2.0）3. 传染性非典型肺炎(SARS)诊疗方案[J].现代实用医学,2004(02):119-126.4. He Z, ZhaoC, Dong Q, et al. Effects of severe acute respiratory syndrome (SARS) coronavirus infection on peripheral blood lymphocytes and their subsets[J]. International Journal of Infectious Diseases, 2005, 9(6): 323-330.5. Chen J, Lau Y F, Lamirande E W, et al. Cellular Immune Responses to Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus (SARS-CoV) Infection in Senescent BALB/c Mice: CD4+ T Cells Are Important in Control of SARS-CoV Infection[J]. Journal of Virology, 2010, 84(3): 1289-1301.6. 张艳丽, 蒋澄宇. 细胞因子风暴:急性呼吸窘迫综合征中的主宰生命之手[J].生命科学,2015,27(05):554-557.7. Huang C, Wang Y, Li X, et al. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China[J]. The Lancet, 2020.