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  • 【分享】美科学家首次测序癌症患者基因组

    科学家首次测序癌症患者基因组美国科学家近日首次成功测序了一个癌症患者的基因组,这一开创性工作为利用新方法揭开癌症的遗传学基础创造了条件。相关论文发表在11月6日的《自然》(Nature)杂志上。测序的基因组来自于一位女性,50多岁死于急性骨髓性白血病(AML)。美国华盛顿大学的研究人员利用来自皮肤样本的遗传材料,测序了她2套染色体的DNA,同时根据骨髓样本检测了其肿瘤细胞中的遗传突变。所有样本均采自患者接受癌症治疗前,以防DNA受到进一步损伤。随后,研究人员将患者的肿瘤基因组与其正常基因组进行了比较,以期发现遗传差异。在患者肿瘤基因组中接近270万个单核苷变异中,将近98%同样也在患者皮肤样本的DNA中检测到,这就大大缩小了进一步筛选的范围。研究人员最终在患者的肿瘤DNA中仅发现了10个可能与AML有关的遗传突变,其中8个很罕见,它们所处基因之前从未被认为与AML有关。研究人员还显示,肿瘤样本中的每个细胞拥有9个突变,而且较少发生的那个突变可能是最后形成的。研究人员怀疑,所有这些突变对于患者的癌症都很重要。美国国立人类基因组研究所前任主管Francis Collins说:“首次确定人类癌症基因组的完全DNA序列,并与同一个体的正常组织相比较,这在癌症研究中是一个真正的里程碑。”美国俄勒冈健康与科学大学癌症研究所的Brian Druker说:“虽然这一研究尚不能告诉我们怎样治疗癌症患者,但它是这条路上关键的第一步。它为大规模癌症基因组测序和揭示癌症秘密打下了基础。”目前,研究小组正在测序其他AML患者的基因组,同时他们还计划将这种全基因组方法扩展到乳腺癌和肺癌。

  • 中科院自主研发基因测序技术将实现产业化

    来源:中国科技网-科技日报 作者:王怡 2013年10月31日 原标题:我自主研发基因测序技术将实现产业化 科技日报讯(记者王怡)2013年国际基因组学大会10月29日在青岛举行。在开幕现场,中国科学院北京基因组研究所与吉林紫鑫药业股份有限公司就合作开发第二代高通量测序系统项目签订投资意向协议,这标志着由中科院自主研发的第二代测序仪项目即将进入市场转化和产业转化阶段。 基因测序技术,自人类基因组计划实施以来长期占据着国际生命科学技术研究的制高点,随着第二代基因测序技术的发展日趋成熟和成本急剧降低,该项技术被越来越多的科研和实践领域所应用,形成庞大市场。目前我国市场上所有高通量测序设备和试剂均来源于进口,据估计仅2013年我国在仪器和试剂上的投入就超过20亿元。 “我们的基因组学研究一直处于世界前列,源于我们最早参与人类基因组测序的工程,但是我们使用的设备一直都依靠国外的进口设备,中国科学院作为国立科研机构,我们有义务自主研制开发基因测序仪打破国外垄断。”中科院北京基因组研究所党委书记杨卫平说。 在中科院资助下,历时两年半时间完成第二代测序仪研发项目,于2011年实现原理样机和性能验收,部分性能指标超越同类进口产品。其后中科院北京基因组研究所自主投入完成该项目的工程化和产品化开发,并形成其自主知识产权群,目前已有9个专利获得授权。 “第二代高通量测序仪的产业化发展是我们的第一步,后面我们希望能有更多的进展,比如在试剂、数据库和后台都能实现国产化。”杨卫平说。

  • 纳米孔测序仪开放试用 公布部分参数

    MinION试用计划于本周一(11月25日)启动,将延续到2014年初,具体截止日期未定。根据这项试用计划,参与者须支付1,000美元的押金以及运费,而后将收到一台MinION测序仪,包括测序USB装置、流动槽和软件。在上个月的美国人类遗传学协会年会上,英国Oxford Nanopore Technologies公司宣布将启动MinION测序仪的试用计划。这次,它果然没有食言。MinION试用计划于本周一(11月25日)启动,将延续到2014年初,具体截止日期未定。根据这项试用计划,参与者须支付1,000美元的押金以及运费,而后将收到一台MinION测序仪,包括测序USB装置、流动槽和软件。除了MinION测序仪,Oxford Nanopore还在开发GridION测序仪。之前,该公司一直没有公布这两款测序仪的具体性能参数,但鉴于许多客户有意了解,它最近在网站上回答了一些常见问题。GridION和MinION系统的通量如何?据介绍,GridION系统是可以扩展的。它既可以单独作为一台仪器工作,又可以多台连接,带来更快的结果。至于仪器的通量,它会受到各种因素的影响,包括DNA的处理速度以及芯片上同时开展的实验数量。第一代商业化的仪器每天可产生几十Gb。目前的cartridge每次可开展2000个纳米孔实验,而更高配置(每次开展8000个实验)正在开发中。MinION系统是个一次性的设备,每次可开展数百个纳米孔实验,运行时间为数小时。运行时间如何?Oxford Nanopore表示没有固定的运行时间,这要取决于实验需求。由于全长的读取数据是实时流出的,故也能实时分析。初步分析可在每台仪器(节点)上本地开展,而二次分析可在用户的网络上并行开展。因此,MinION和GridION节点可持续运行,直到收集了足够的数据来回答实验问题。系统的读长是多少?据介绍,纳米孔测序仪是处理提交给它的DNA,而不是“产生”读长。它能够处理非常长的读长,大约几十kb。GridION和MinION系统的费用如何?相信这也是大家最关心的问题。Oxford Nanopore表示,GridION技术的定价不同于传统的系统。它是一个套餐,包括节点和cartridge耗材。这些套餐可满足不同需求及不同预算的客户。例如,有些客户可能有比较多的经费,而另一些则在耗材花费上更为自由;定价将让这两种类型的客户都能使用。此外,GridION系统的定价将比目前市场上的其他系统都要低。此系统是模块化的,用户可不断添加。无需服务器,因为每个节点都包含了所需的计算硬件。而且,定价透明,可在线下单。大的套餐也会有透明的折扣。对于MinION系统,零售价预计在900美元以下。不过,目前还未开始接受订单。

  • 【数亿美元收购】之:生命科技公司完成对测序公司Ion Torrent的收购

    2010年10月4日,Life Technologies宣布,公司以3.75亿美元现金和股票完成对测序公司Ion Torrent的收购。此外,如Ion Torrent在2012年之前实现了某些具有里程碑意义的技术,Life Technologies将追加3.5亿美元的投资额。链接:http://www.instrument.com.cn/news/20101009/048724.shtmlIon Torren是新一代测序仪制造商,其核心技术是使用半导体技术在化学和数字信息之间建立直接的联系。与其他测序技术相比,使用该项技术的测序系统更简单、更快速、更便宜及更易升级。第一款使用该技术的产品将于今年第四季度推出,命名为PGM测序仪。生命科技公司(Life Technologies)是一家致力于改善人类环境的全球生物技术公司。我们的仪器、耗材和服务可协助研究者加速科学探索与开发,从而让生命变得更加美好。我们的客户遍及生物学各个领域,努力加速推进个性化药物、再生科学、分子诊断、农业和环境的研究以及21世纪的法医鉴定。生命科技公司2009年的销售额33亿美元,全球雇员接近9000人,遍及160多个国家,并拥有3900多项知识产权专利及专有许可证。生命科技公司由Invitrogen公司和Applied Biosystems公司合并而成。讨论:1.仪器公司间的收购动辄就是数亿美元,难道如此大的投入会有更高的回报吗?2.收购对两者是互赢还是单赢呢?3.仅对以上例子来看,你看好收购后的公司前景吗?

  • 硅谷聚集基因测序技术新产业

    美国加州的山景城是“硅谷”的重要组成部分。现在,一个与硅芯片相关的潜力大产业正在这里兴起,那就是基因组测序技术产业。这个产业的发展是随着多家大公司的激烈竞争开始的。不过,一家名为“整合基因”(Complete Genomics,CG)的公司不像别的公司一样研发和销售测序仪器,而是为科学家提供外包的测序服务,更绝的是,在这家公司里做测序的,并不是研究人员,而是一排排的机器人。近日,《新科学家》杂志探秘了这家充满科幻意味的公司。前台都是“机器人”走进CG公司,连前台都由计算机终端出任。它会主动向来客问好,询问姓名、身份和来访意图。旁边连接的一台打印机则自动打出访客挂牌。与此同时,一份电子邮件已经发送到内部接应人员的电脑上。这家公司的生产线更像科幻电影里的实验室,昏暗蓝色的房间里到处都是高级仪器,室内温度保持在28℃和相对较高的湿度,几名穿着实验服,带着发罩的工作人员在监视着电脑屏幕,查看着机器人的运作状态。这儿已经成为了世界上最大的人类基因组测序工厂。只是在这里工作的不是人类,而是机器人。在一个大约只有半个网球场大的房间里,“坐着”16台机器人,不间断地进行着人类基因组测序的工作。去年,它们完成800个人的DNA测序工作其中三分之一是后半年做出来的。到了今年,它们已经可以每个月生产出400个人的基因了。CG公司只是目前迅速形成产业的诸多基因组测序公司中的一家,但是它十分独特。公司市场总监图柯特(Jennifer Turcotte)对《新科学家》杂志解释说,通常而言,DNA测序是在一个密封的机器里进行的,但在这家公司的实验室里,机器人却是在一个开放暴露的环境下做基因组测序,这是为了便于维修。实验室特定的温度和湿度是为了符合测序中出现的生化反应,微弱的蓝光是为了避免荧光探测剂在探测基因代码符号时受到其他频率光波的破坏。这儿所进行的基因组测序,已是目前最新的第三代基因组测序技术,称为“DNA纳米球测序技术”。这种新方法是将DNA链放置在一小块硅芯片上进行调节,自我组装成所谓的“纳米球”。这样的测序所需要的试剂更少,得到的数据则更多。技术人员都穿着无尘室服装,因为任何一点灰尘都会干扰测序,除非哪儿出问题了,一般而言这些技术人员不会干预机器人的工作。机器人则会自动添加试剂,操作样本,每个DNA纳米球上携带着70个核苷酸,其排列顺序会通过光信号被拍摄记录下来。费用正在逐步降低这些机器人正在做的工作,是一个浩大庞杂的工程蓝图中的第一步,所有的人类基因组中有着30亿对碱基对,而CG计划将其全部组装出来。这需要非常大的计算量,公司为此也建了一个自动数据中心。不过,这个数据中心设在距离公司大约有20分钟车程的地方那儿的电费更便宜。目前CG公司只针对研究者和制药公司开放,个人还没法购买他们的服务。在这里,每对基因组测序要价9500美元,如果购买1000对以上,则每对价格降为5000美元。这个价格是随着基因组测序技术突飞猛进而急剧下降的,要知道,十年前,第一对人类基因组序列完成时,其价格是以十几亿美元计量的。而科学家现在已经预计几年后,基因组测序的价格可能会降到一般人都可能支付得起的程度。基因组测序的流水线完全是由机器人来做的,而职员做什么呢?公司共有185名职员,部分是科研人员,忙于改善公司的测序技术,另一部分则是做市场和联络,与各类客户打交道。基因组测序工程是一项既有非常光明的前途但又异常庞大的科学工程,而自动化则可能成为处理这项工作的最佳工具。基因学家们认为,通过一些基因扫描,是可以找到导致人类易感疾病的一些基因变异,人类基因谱上,有一些常见明显变异,但是就整个遗传问题来看,还有大量的混乱的遗传变异隐藏在DNA双螺旋体中,这些也导致了世界上千奇百怪的遗传疾病。如何去捕猎这些神秘莫测的错误基因代码呢?只剩下一个方法,那就是将整个人类基因谱测序,来捕捉一些可能和疾病有关的基因变异。这个方法虽然听上去如同“大海捞针”一样不靠谱,但目前一些迹象表明,今后或许基因组序列会成为医疗记录的一部分,或者科学家可以通过家庭的基因组测序来纠正基因错误。比如,去年西雅图系统生物学研究所的胡德(Leroy Hood)及其小组与CG公司进行了合作,在《科学》杂志上刊登了一篇论文。他们对一家四口的基因组进行了测序。这是个特殊的家庭,两个孩子都患有两种隐性遗传病米勒综合征和纤毛运动障碍,而父母则完全正常,在分别测出这家人的基因序列后,研究者将父母和子女基因组序列进行比较,验证了米勒综合征这种非常罕见遗传病的致病突变。提供测序外包的服务目前,站在基因组测序产业化起跑线上的企业包括了同样位于加州的生物科学公司Pacific Bio。这个公司创立了首次可以对单个DNA进行测序的仪器。和CG公司一样,目前,这家公司也只向研究者提供服务。有一些大型的、从事基因组测序产业的公司已经将基因组测序做到医院和个人普及的地步了,如研发制造大型测序分析仪器的Illumina公司。这个公司在2008年美国成长最快的科技公司评选中,风头甚至盖过了Google。它们提供的产品甚至可以直接给病人使用。而另一位基因创业企业家罗斯伯格(Jonathan Rothberg)甚至发明了可以放在桌子上的基因解码器,可以在2小时之内以很高的精度解读出1000万个基因代码符号。大部分的基因组测序企业都站在一个竞争线上,尽力提高DNA测序的速度,降低费用。而CG公司其实并非和它们是严格意义上的竞争对手他们计划组装出所有的人类基因序列,研发也是为此目的而进行。此外,他们并不如其他公司一样开发更高级更小巧的基因组测序仪,而是为科学家提供基因组测序的外包服务,也就是说,研究人员无需购买、安装、培训、运行和维修仪器,而只要将样品交给这家公司,等待结果到来就可以。虽然很多人不理解他们的做法,但这家公司始终坚持自己的观点,认为这样的服务最能让科学家将时间从捣腾仪器设备的工作中解放出来,专心放在生物学和假说验证上。从这几年CG公司取得的成绩来看,这种做法确实是有效的。2009年,CG公司宣布其测出了第一个人类基因序列,并移交给美国生物科技信息中心数据库。同一年,他们在《科学》上刊文,发布了三个完整人类基因组序列分析的结果,当时文章还宣布,测序的成本已经可以降到1726美元。这在生物界引起了轰动。到了那一年结束,他们已经做出了50个人的基因序列。此外,他们的名字也随着来自各地的科学家一起多次登上了权威学术杂志。除了去年帮助科学家解开了米勒综合征突变难题给科学界留下难忘的印象之外,美国的罗氏公司还曾经借助CG的基因组测序技术,完成了人类科学史上第一例肺癌患者的全基因组比较。相关研究结果刊登在《自然》杂志上。而美国癌症学会也开始和CG公司联手,希望通过其服务比较正常人和癌细胞基因组序列的差异。或许在不久的将来,解开癌症之谜的第一个贡献就属于这些蓝光照耀下的机器人。

  • DNA测序问题大汇总

    以下问题是我摘抄的,当时记在我的记录本上,所以没有记下名字,很是抱歉。但是我想拿出来这是对大家的一种共享,所以祈求大家原谅。Q:我将PCR产物纯化后送测,结果说是双模板,测序峰重叠,请问是模板不纯吗?A:应该指的是模板不纯。可能是割胶纯化时,范围偏大,非目的基因片断亦混入其中。该非目的片断的大小与目的片断也类似。如果片断长度大的话,可以先连一下克隆载体,这样测序应该没有问题。 测序峰重叠不知道你讲的时双峰类型的还是指比较杂乱的而且无序的重叠: 如果是双峰(TP),有可能是标本来源是杂合子的缘故,如果是后者,原因很多,一般看打印出的测许结果大致可以判断。原因:1。有时候PCR产物可能就是失败的产物或者浓度很低。2.提纯不好,非目的片段保留。3.测序时Matrix等条件的错误。Q:测序结果不好,测序峰比较乱,基线不平,测许公司说含有复杂结构,现急需要该序列,请问高手这种情况该怎么办?有什么测许方法?A;我自己曾经亲自做过测序,对于这种情况,一般是有解决的方法的。不过公司不愿意为了你自己的一个样品去专门摸索条件。1. 最大可能是提取的质粒不纯,可以将质粒再次转化后挑单克隆重做(很奏效)。2. 直接在测序前的模板热变性使用86度,5分钟而不是大多数的96度3分钟3. 实在不行切后分别放到T载体上,一般都可以保证顺利读出序列。最后值得一提的是如果能自己根据理论序列给设计几个比较合理的测序引物可能一切就OK了。Q:上星期将我的PCR纯化产物拿到TAKARA测序,结果今天公司打电话来说测了100多个bp就读不下去了,建议我克隆后再测,我的PCR产物纯化只有很亮的一条带,不知道为什么测不出来。答:测不下去的原因主要是序列里面有困难序列,二级结构或短序列重复,比如发卡结构和AT长重复等,甲基化的影响不大清楚,本人认为不会影响测序。所以,PCR产物测不下去的话,克隆后也很难保证测过去。其实就测序来说,PCR产物还是质粒都无所谓,只要样品纯可以了。正向测不通反向再测也可能会测通,因为DNA中正链和反链二级结构不是完全一样的,正链中遇到困难序列在反链中可能相对简单,测序酶可能可以急需合成DNA。另外,还可以改一下测序PCR的反映条件等等,也可以测通。

  • 里程碑!新一代测序(NGS)首获FDA批准

    近日,美国 FDA 审批通过 Illumina 公司的 MiSeqDx 台式新一代测序仪及配套试剂盒,成为全球首个而且是目前唯一一个获得 FDA 临床认证的新一代测序(NGS)平台。通过认证的试剂盒除了针对囊性纤维化的检测之外,还包括通用试剂盒,让临床实验室能够开发他们自己的诊断检测。美国 FDA 医疗器械与辐射健康中心的官员 Alberto Gutierrez 博士认为:“NGS 正在改变我们了解基因组学的方式。在这之前,测序与特定疾病相关的基因是个漫长而昂贵的过程。今天,我们能够在单个检测中非常快速地读取和解释大的 DNA 片段,而这一信息丰富的技术日渐普及,能够被医生用于患者护理。”此次通过 FDA 认证的两项分析分别是 MiSeqDx Cystic Fibrosis 139-Variant Assay 和 MiSeqDx Cystic Fibrosis Clinical Sequencing Assay,它们可用于囊性纤维化的筛查和诊断。囊性纤维化是一种常见且致命的遗传疾病,在欧美人群中较为常见。在美国约有 1000 万名携带者,而患病人数超过 3 万名。此疾病由囊性纤维化跨膜传导调节因子(CFTR)基因的突变引起,有着广泛的临床表现,这取决于哪些CFTR基因突变存在。大部分CFTR突变是罕见的,其分布和频率随群体而异。MiSeqDx Cystic Fibrosis 139-Variant Assay 旨在同时检测CFTR基因中的 139 个临床相关的致病突变及变异,包括 ACMG 和 ACOG 建议筛查的那些。MiSeqDx Cystic Fibrosis Clinical Sequencing Assay 则凭借 Illumina 的靶向重测序技术,为 CFTR 基因的蛋白编码区域和内含子/外显子边界提供高度准确的数据。美国国立卫生研究院(NIH)的院长 Francis Collins 也是一名囊性纤维化的研究人员。他在一份声明中指出,这一具有里程碑意义的举措,将有助于实现个性化医疗的承诺。他认为,高通量 DNA 测序仪的出现让医生能够全面查看患者的基因组,以便搜索各种变异或突变,它们可能增加疾病风险,推动疾病进程,和/或影响药物反应。这些信息有可能在很多方面让患者受益。不过激动归激动,他认为目前还有很多工作要做。Francis Collins 博士和 FDA 局长 Margaret Hamburg 在《新英格兰医学杂志》上联名发文,称测序平台在临床应用中的批准将为医生在患者护理中更广泛地采用遗传信息铺平道路。不过,他们也指出,尽管目前已取得一些进展,但仍存在政策、法律和监管问题,而新发现也必须得到验证。此外,医生、医疗保健工作人员和患者仍需要支持和帮助,才能了解基因组数据。他们谈道:“新一代测序到达这一监管里程碑仅仅是个开始。我们需要共同努力,以确保研究进展和基因组信息的临床应用是基于严谨的证据。”原文检索:Francis S. Collins, and Margaret A. Hamburg. First FDA Authorization for Next-Generation Sequencer. NEJM, November 19, 2013; DOI: 10.1056/NEJMp1314561

  • 【分享】我国启动“兰花基因组计划”

    7月20日,我国科学家宣布“兰花基因组计划”正式启动。两岸科学家将联手对被喻为“植物界大熊猫”的兰科植物进行全基因组测序和生物信息分析,同时对10种最具代表性的兰科植物进行基因表达的转录组测序和分析。 国家兰科植物种质资源保护中心刘仲键教授介绍,对兰科植物的科学研究历史悠久,其成果为达尔文进化论提供了强有力的支持。兰花研究为进化生物学乃至整个生命科学的发展贡献巨大,至今仍是研究生命与进化的理想模式,占有特殊地位。同时,兰花也是世界性濒危物种,是国际公约保护物种的重中之重。兜兰与国宝大熊猫同列为一级保护,其余兰花全部被列入二级以上保护。 清华大学黄来强教授称,兰花全基因组及转录组测序分析,将为人类提供用现代生物学的新技术和理念从分子生物学的层面审视达尔文的研究,为进化生物学和进化论注入新鲜血液。在基因组和转录组的研究基础上进一步结合生物信息、分子生物、蛋白质组、代谢组、生化、生物物理等多学科和研究手段的融合,对加深其基因组结构及功能的了解,揭示兰科的进化,对生命科学研究具有普遍的重要意义。“兰花基因组计划”涉及的不仅是植物学,还将为世界上相关研究提供全新的起点和平台,是对全球基因组科学的又一重大贡献。 “兰花基因组计划”项目,由深圳兰科植物保护研究中心(国家兰科植物种质资源保护中心)、清华大学、深圳华大基因研究院、中国科学院植物所、台湾成功大学等单位科学家共同承担。

  • JPM2024:Illumina测序仪全球装机量超2.5万台,NovaSeq X业绩表现超预期

    2024年1月8-11日,作为业内最富盛名、规模最大、最具信息量的医疗健康投资盛会,第42届摩根大通医疗健康年会(42nd J.P. Morgan Healthcare Conference)正在美国加利福尼亚州旧金山隆重举行。[color=#000000][b]Illumina CEO Jacob Thaysen[/b][/color]在JPM会上表示:[b]“我非常高兴地宣布,Illumina第四季度业绩的初步评估中超出了华尔街的预期,这主要是由NovaSeq X仪器和消耗品销售推动的”。[/b][align=center][img=,600,338]https://img1.17img.cn/17img/images/202401/uepic/bab5261a-f40b-41ad-aebc-9d31e4ebd82c.jpg[/img][/align]NovaSeq X的业绩表现超出预期,Illumina称其推出了有史以来最成功的高通量DNA测序仪。自2022年底首次亮相后,公司已经收到了900个订单,在2023年第四季度完成了79台NovaSeq X仪器的交付,而在2023年内共交付了352台仪器。其中约三分之一流向临床单位,而20%则交付给首次进入高通量DNA测序的用户。[align=center][img=,600,335]https://img1.17img.cn/17img/images/202401/uepic/3610dbe1-81a2-4b4d-a797-92cd668d66e7.jpg[/img][/align]“但我们的重点不只是NovaSeq X,”[b][color=#000000]Jacob Thaysen[/color][/b]表示,[b]“实际上,我们现在已经有超过[color=#ff0000]25000台[/color]仪器安置在全球各地的实验室里面。今年我们又成功交付超过[color=#ff0000]2200台[/color]仪器。总设备基础(其中大部分包括的Illumina小型测序仪的低通量生产线)也转化为来自耗材供应的约[color=#ff0000]28亿[/color]美元收入。”[/b][align=center][img=,600,337]https://img1.17img.cn/17img/images/202401/uepic/e3aab9ea-bd31-4682-8feb-269f12b4e19a.jpg[/img][/align]对于2024年重点工作安排,Jacob Thaysen与Illumina管理团队设定了三个主要优先事项。首先,扩大NovaSeq X等产品装机量,赢得更多市场份额;其次是专注商业运营,进一步提高利润率;最后是尽快出售或拆分Grail。Illumina表示计划在6月底之前敲定战略:要么将Grail出售,要么将其作为独立公司上市。“所有选择都已摆在桌面上,”[b][color=#000000]Illumina CFO Joydeep Goswami[/color][/b]在JPM会议上表示,“目前我们谈论潜在估值还为时过早——我们将让市场推动这一过程。”在本次大会期间,Illumina同时也公布了2023年第四季度和财年初步财务业绩(未经审计)。[align=center][img=,600,318]https://img1.17img.cn/17img/images/202401/uepic/62a7f559-bbae-4ac6-b206-c3128a911543.jpg[/img][/align][b]2023年第四季度合并收入约为[color=#ff0000]11.15亿[/color]美元,较2022年第四季度[color=#ff0000]增长3%[/color];2023财年合并收入约为[color=#ff0000]44.97亿[/color]美元,较2022财年[color=#ff0000]下降2%[/color][/b]Core Illumina 2023年第四季度收入约为10.9亿美元,较2022年第四季度增长2%,2023财年收入约为44.31亿美元,较2022财年下降3%2023年第四季度的综合公认会计准则营业利润率约为(15.5%),2023财年约为(24.0%)2023年第四季度的综合非公认会计原则营业利润率约为 3.8%,2023财年约为5.3%2023年第四季度 Core Illumina GAAP 营业利润率约为 2.4%,2023财年约为12.3%Core Illumina 2023年第四季度非GAAP营业利润率约为18.0%,2023财年约为19.8%[size=14px](注:Illumina预计将在2024年2月8日星期四收市后公布其第四季度和2023财年的完整业绩。上述提及业绩为未经审计的初步结果,需待会计和年度审计完成后确定程序,因此可能会有所调整。)[/size][来源:仪器信息网] 未经授权不得转载[align=right][/align]

  • 质谱技术也可以用来做基因测序,你听说过吗?

    不过短短数十年,基因测序的价格从近30亿美元步入千元时代,这让你有没有恍如隔世的感觉?如果全基因组测序的价格降到非常低,你会选择测自己的基因序列吗?商家说做基因测序可以预知孩子有哪些天赋,你相信吗?Illumina、Life Tech、罗氏、华大基因,基因测序仪器市场谁主沉浮?中科院北京基因组研究所、中科院半导体所、北京大学、东南大学,学院派能否挑起测序仪器国产化的大梁?质谱技术也可以用来做基因测序,你听说过吗?虽然基因测序越来越容易,但我们得到的却是一本生命天书,要完全读懂它我们还需要多少时间?更多关于基因测序的信息,请访问:http://www.instrument.com.cn/news/subject/s325/

  • 低价转让基因测序仪

    公司现有1台ABI3100 测序仪,成色较新,价格优惠,质量保证,可预约试机。电话:13717963569自动化程度高:提供连续,无监控的操作,自动灌胶,上样,电泳分离,检测及数据分析,可连续运行24小时无需人工干预。样品分析量大:可同时对16个样品进行全自动分析,一天可完成数百个样品的测序或片段分析工作先进的荧光检测系统:采光栅分光,CCD摄像机成像技术,实现多色荧光同时检测应用广泛:除了新基因测序或比较测序工作外,可进行多种片段分析,包括微卫星DNA分析,比较基因型分析,单核苷酸多态性(SNP)研究

  • 微生物基因组测序的应用

    基因组测序和序列的组装,为快速研究该致病菌株的致病机理创造了条件。与此同时华大基因与德国汉堡-Eppendorf医疗中心合作,也宣布完成了对致病菌株的测序工作。Guenther说:"在有限的时间里完成了对微生物的全基因组测序,极大的方便了研究者从一个整体的水平上去研究微生物,进而揭示在这些目标微生物的基因组究竟发生了哪些改变。"事实上也的确如此,科学家根据从基因组测序的数据所获得的证据,将本次的致病型大肠杆菌鉴定为致病型大肠杆菌的一个新杂交品种,并且携带了一些抗性基因。"从宏观的基因组水平上来研究这类细菌,将在很大程度上革新我们对传染病暴发的认识,3-4天内完成对某种微生物的全基因组测序及基因标注,将会开启一个新的研究领域。"在新奥尔良召开的美国微生物学会年度会议上,一些研究者指出,分子鉴定的方法正被用来打造基因组传染病学这一领域,基因组传染病学致力于重构传染病暴发的过程,以求在将来能够对传染病能进行实时有效的监控和快速反应。

  • 【转帖】第三张“基因变异图谱”与第二代基因组测序技术

    第三张“基因变异图谱”与第二代基因组测序技术——评“千人基因组计划”首期研究成果的医学意义世界上任意两个人的基因99%都是相同的,而恰是那1%不同,负责着个体间的表型差异。《自然》杂志近期披露,当人体内携带有250到300基因变异位点的时候,相关基因就就会“沉默”。甚至,一个人只携带了 50到100基因变异位点,就可能患上某种疾病。10年前,“人类基因组计划”这一耗资30亿美元、历时10余年的伟大科学工程完成之际,人们以为得到了揭开自身生命奥秘的天书,生命科学也划时代地进入了“后基因组时代”。如今看来,当时得到的仅仅是人类基因组的“参考图谱”,对于人群里个体间的基因差异,或是更具医学意义的“基因变异图谱”来说,人们知之甚少。第三张“基因变异图谱”为了探寻个体间的基因差异,科学界在2002年启动了HapMap(人类基因组单体型图谱)计划。Hapmap在2005年完成的“第一张基因变异图谱”含有一百万个“单核苷酸多态性”(SNPs)位点;HapMap在2008年完成的“第二张基因变异图谱”含有三百一十万个SNPs位点。而此次“千人基因组”所公布的一期结果——“第三张基因变异图谱”,已经包含了一千五百万个SNPs位点。今年10月28日,《自然》杂志为此刊出的文章题目为“基于群体规模的基因变异图谱”,鲜明的指出,“千人基因组计划”首期研究成果,其最大优势在于:“第三张基因变异图谱”所采用的样本,针对了“大规模人群”。 远超过此前两张“基因变异图谱”所测定的样本数。绘制“第三张基因变异图谱”的所有数据,是基于两个核心家庭,6个个体的精确基因组测序,179个个体的低覆盖率基因组测序,以及七百多人的蛋白编码区的基因测序。检测人群数目庞大,人种涉及中国人、日本人、西欧人等。因此,第三张“人类基因变异图谱”的问世,可以从更深的层次上了解,种族之间、个体之间的基因差异。更具医学意义的是,对于人群中发生频率在1%以上的基因变异,本次研究的覆盖率达到95%以上。这就意味着:此前Hapmap计划所绘制的两张“基因变异图谱”中,没能涉及的“罕见病”致病基因,可能在“第三张基因变异图谱”中已经被标出。“基因变异图谱”的医学应用随着,“人类基因变异图谱”绘制的日臻完善,和商业化全基因组SNP 分型芯片成本的不断降低,以及新的统计方法和软件的出现, “全基因组关联分析”( Genome-Wide Associat ion Study , GWAS) 越来越多的应用于复杂疾病“易感基因”的确定。今年6月6日,安徽医科大学的张学军教授领衔的团队,通过对中国汉族和维吾尔族人群近2万份样本进行分析,在人类基因组的3个区域内发现与白癜风发病密切相关的4个易感基因。今年8月2日,中***事医学院贺福初院士领衔的蛋白质组学国家重点实验室,通过对大陆5个肝癌高发区的4500多名肝癌病例和对照的研究,发现了肝癌易感基因新区域(1p36.22)今年8月23日,新乡医学院的王立东教授联合国内18家医院,建立了数十万份的食管癌标本资料库,并首次在人类第10号和20号染色体上,发现两个食管癌易感基因(PLCE1和C20orf54)。基因变异有着很强的人种差异,相比国外此领域的研究成果,以上研究成果的临床意义,在于其是针对我国的特有人群。也就是说,以上研究成果在我国的临床上更具医学价值。更为可喜的是,以上研究成果均发表在此领域最为权威的《自然 遗传学》杂志上。我国在利用GWAS需找复杂疾病易感基因领域的研究,已经得到了世界的公认。

  • 【分享】共生体基因组计划启动

    近日,深圳华大基因研究院和美国科学家共同发起“共生体基因组计划”。该计划将对海蛤蝓(又称绿叶海蜗牛)及藻类饵料进行基因组测序。有科学家认为,海蛤蝓可能是“生命之树”中动植物界的交叉点。海蛤蝓的细胞能够从藻类获取叶绿素,进行光合作用,从而为其所有生命活动提供足够的能量,包括繁殖。迄今为止,科学家在海蛤蝓基因组里发现了大约十多种藻类基因,这些基因使这种生物在叶绿素合成通道和碳固定循环中具有集光蛋白质和酶类的功能。随着研究的深入,不断有新的藻类基因在海蛤蝓基因组中被发现。海蛤蝓通过自身内被转移的藻类基因合成叶绿素,进行光合作用。这种神奇的共生现象第一次证明了一套完整的生物合成途径可以从一种多细胞生物传递到另一种多细胞生物。华大基因有关专家表示,通过对藻类和海蛤蝓的基因组进行比较,不仅将在宿主细胞中发现一组能够进行持续光合作用的基因,而且能够找到转移的特性,包括转移基因片段的大小、数量;更重要的是了解这种转移的运行机制。这些发现将对基因组的人工调控和基因治疗新技术的开发产生重大现实意义。此外,这两类生物的基因组测序将有利于比较基因组研究、进化规则、发展生物学及分类学的发展。据悉,这次联合研究是华大基因“千种动植物参考基因组计划”的一部分。该计划将在未来两年内建立1000种动植物的参考基因组序列。在“共生体基因组计划”中,华大基因主要负责测序和生物信息分析工作。《科学时报》 (2010-3-23 A1 要闻)

  • 新一代测序仪前景广阔

    2010年2月,罗森伯格的Ion Torrent公司推出了世界上第一台半导体测序仪——PGM,这也是首台“桌面型”(benchtop)测序仪。PGM的测序原理不同于此前的测序技术。随着2011年三款新的测序平台的发布,此领域的变革步伐不断加快。这三款新平台分别为:Ion Torrent的PGM、Pacific Biosciences的RS和Illumina的MiSeq。研究人员发现,Ion Torrent、MiSeq和PacBio RS技术所产生的数据对富含GC、中性和富含AT的基因组都表现出近乎完美的覆盖,只是在利用PGM对富含AT的恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)基因组进行测序时,有大约30%的基因组无覆盖。这三台快速周转的测序仪都能够产生有用的序列。然而,就数据质量和应用而言,还存在很大差异。产量有限且每个碱基的费用高阻碍了大规模测序项目在PacBio仪器上的开展。从实用性和流程方便性来看,PGM和MiSeq相当接近。决定购买哪一台将取决于可利用的资源、现有设施和人员的经验,当然,资金和应用也要考虑.虽然目前个人化基因测序仪更多地还是用于科研,但对它在临床上的应用,是Life公司和IIIumina公司当下都在积极推进的最重要的方向。 Life在2011年7月就PGM的临床应用,向FDA提交了申请。IIIumina公司也紧随其后:“我们正在申请FDA对MiSeq的审批。MiSeq在设计过程中就考虑到了特定的临床应用环境,我们相信这个系统的许多特征会有助于它获得FDA的批准。

  • 【分享】PNAS:新技术实现纳米孔内快速测序DNA

    据《每日科学》近日报道,由美国华盛顿大学物理学家领导的研究小组设计了一种新技术,可在纳米孔内对DNA进行快速测序,而且价格比较便宜。新方法可为癌症、糖尿病或某些成瘾患者量身绘制个性化基因测序蓝图,提供更加高效的个体医疗。相关论文发表于美国《国家科学院院刊》(PNAS)。 论文主要作者、华盛顿大学物理教授简斯·冈德拉克表示,他们结合了生物和纳米技术,研制出这种DNA阅读器,阅读器内纳米微孔使用了一种取自耻垢分支杆菌的细胞外膜孔道蛋白A。这种纳米微孔只有1个纳米大小,仅够用来测量一个DNA的单分子链。 研究人员把微孔放在一层浸泡在氯化钾溶液中的膜上,并施加一个小的电压,让电流通过微孔。不同的核苷酸通过纳米微孔时,回路中的电流就会随之改变,这些电流称为特征信号。胞核嘧啶、鸟嘌呤、腺嘌呤和胸腺嘧啶这些DNA的基本组成要素,会生成不同的特征信号。 研究小组解决了两个主要问题,一是生成仅容一条DNA单链通过的纳米微孔,且每次只能通过一个DNA分子。伯明翰亚拉巴马州立大学的迈克尔·涅德维斯改良了细菌,生成了合适的微孔。第二个问题是让核苷酸以每秒100万个的速率通过纳米微孔,冈德拉克说,这实在太快了,阅读器还无法在这种速度下对每个DNA分子信号分类整理。为了解决这一点,研究人员在每个要测量的核苷酸之间附带了一段双链DNA,双链DNA在微孔中流动不那么顺畅,磕磕绊绊地通过微孔,便可将下一个通过微孔的单链延迟几毫秒。这种延迟尽管只有千分之几秒,电信号却有了充足时间来识别目标核苷酸,从而从示波器轨迹上准确读出这些DNA序列。 这项研究由美国国家卫生研究院和美国人类基因研究院资助,旨在降低成本,使人类基因组完整测序成本降到1000美元或更少。该研究始于2004年,当时完整测序一个人的基因要花费1000万美元,而新的测序技术使人们向1000美元测序的目标迈进了一大步。

  • 【分享】Science:家蚕基因组测序成功

    据8月28日的《科学》杂志报道说,蚕虫驯养已经有1万多年历史了。蚕为人类提供了宝贵的丝绸和蛋白。但是,现在对蚕基因进行序列测试还为人们提供了一张有关这些随时会为我们提供如此多宝贵物质的昆虫的基因变异图。由西南大学、深圳华大基因带领的国际研究团队为29种家蚕和11种野蚕世系的基因组成功地进行了测序并找到了这些世系之间的差别。共获得了40个家蚕突变品系和中国野桑蚕的全基因组序列,共测632.5亿对碱基序列,覆盖了99.8%的基因组区域,是多细胞真核生物大规模重测序研究的首次报道;绘制完成了世界上第一张基因组水平上的蚕类单碱基遗传变异图谱,这是世界上首次报道的昆虫基因组变异图。科学家还发现了驯化对家蚕生物学影响的基因组印记,从全基因组水平上揭示了家蚕的起源进化。 研究发现,家蚕很明显地在基因上与其野生对应物不同,但即使在各家蚕世系之间,它们仍然维持着大量的变异性。这提示,家蚕只经历了一次牵涉有大量个体的单一且短暂的驯养过程,并在此后在家蚕与野蚕种群之间很少有基因流动。研究人员还能够识别出特别的能够增进丝的生产、蚕虫的繁殖和生长的基因(这些基因很可能是被人类挑选出的)。他们甚至还寻找到了在驯养过程中由蚕虫所获取的行为特征,例如极端的拥挤和容忍人的靠近和操作,以及它们在驯养过程中所丧失的如逃逸及躲避掠食者和疾病等的特征。(

  • 【讨论】液相对全球碳减排计划有何益处?

    【讨论】液相对全球碳减排计划有何益处?

    [B][center]液相有没有可能运用到有机碳的检测?[/center][/B] 哥本哈根气候峰会正在举行,“低碳经济”已然是大势所趋,碳交易也将成为一种潜力巨大的国际贸易形式。这看不见、摸不着的“碳”该如何测量?谁说了算?此前一切都听欧洲、日本等碳购买国的,但很快,中国将发出自己的声音。昨天,北京环境交易所董事长熊焰透露,北京环境交易所主导制定的“熊猫标准”即将公布,这是中国参与制定的首个自愿减排标准,它标志着中国开始在全球碳交易中发出自己的声音。  在此前的国际碳交易中,项目认定、减排流程、核算方法等标准都由买家制定,卖家只能被牵着鼻子走。值得注意的是,买家是清一色的发达国家,卖家则是清一色的发展中国家,一个由买家单方面制定的游戏规则,能否带来对买卖双方都公平的碳交易?答案显而易见。事实上,正是由于不掌握话语权,中国、印度等一级碳交易市场达成的每一笔交易,价格都比在欧洲的二级交易低一半以上,以至于到中、印发现及“倒卖”碳减排项目已成为一种新兴行业,大批碳交易中介应运而生。  熊焰表示,北京环境交易所发起制定“熊猫标准”,尽管只是一个自愿减排标准,但它将是中国在全球碳交易领域中争夺话语权、继而争夺定价权的开始。据介绍,“熊猫标准”的发起人除了北京环境交易所外,还有美国纽约证券交易所和法国BlueNext交易所,参与该标准制定的有买方、卖方、中介、咨询开发公司等利益相关实体以及能源环保类非政府组织,广泛的代表性使这一标准更为公平、客观。  据透露,“熊猫标准”将确立自愿减排量的检测标准和原则,并规定自愿减排流程、评定机构、规则限定等内容,从而完善中国的碳排放交易市场机制。该标准将借鉴美国杜克法则,大力推动农、林、牧、副、渔业的生态补偿类项目,促进市场向工业补偿农业、城市补偿农村、东部补偿西部、高排放者补偿低排放者的方向发展。引用:http://www.instrument.com.cn/news/20091216/036775.shtml[U][B]液相对全球碳减排计划有何益处?可以利用液相制定碳的排放标准或检测吗?[/B][/U][B]相关资料:[/B]1、我国火力发电量占总发量的80%左右。许多大中型企业都有自备电厂和大型锅炉,企业为了降低能耗,提高效率,减少环境污染,需要对煤的燃烧效率进行检测和控制。目前,电厂和企业都是根据中华人民共和国水利电力部《火力发电厂燃料试验方法》,对煤渣粉尘进行取样,烘干,碾磨,然后放在马弗炉中,从低温(100℃)到高温(815℃)灼烧若干小时,最后用称重量差的办法来计算含碳量。整个过程烦琐,且时间长,不适宜实时检测和控制。而美国田纳西州水利工程局的技术人员在八十年代末就研制了微波粉尘含碳量检测装置。 煤渣粉灰含碳量微波检测仪由微波发射机,微波接收机,信号处理单元,数字显示单元,电源单元,远程信号输出单元等部分组成。该仪器采用了先进的集成电路技术和微波电子电路技术,集测量,显示,传送为一体,该仪器尚属国内首创,具有相当的实用性。 2、TOC测定仪3、[img]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2009/12/200912171009_190463_1600062_3.jpg[/img]

  • 【分享】加拿大首次完成甲型H1N1流感病毒基因测序

    加拿大卫生官员5月6日在渥太华举行的新闻发布会上宣布,加科学家已经完成对3个甲型H1N1流感病毒样本的基因测序工作,这是世界上首次完成对这种新病毒的基因测序,将为研制疫苗打下基础。 加拿大国家微生物学实验室科学家在新闻发布会上介绍说,完成基因测序可以使科学家掌握甲型H1N1流感病毒的运行机制以及反应方式,从而有助于疫苗研制工作,预计疫苗最早可于今年11月问世。 加科学家说,他们研究的3个病毒样本中有两个来自加拿大,1个来自墨西哥。基因测序发现,墨西哥与加拿大的病毒样本在基因层面上并无二致,这就排除了该病毒已发生变异的可能。 墨西哥有一些甲型H1N1流感患者死亡,而加拿大的患者症状迄今都比较温和,一些科学家曾认为这是因为病毒已发生变异所致。(新华网)

  • 赛纳生物基因测序仪S100获批国家药监局医疗器械注册证

    2024年2月21日,赛纳生物基因测序仪S100获批国家药品监督管理局(NMPA)医疗器械注册证(国械注准20243220383),标志着国产全自主知识产权基因测序仪S100在中国获准临床应用。[align=center][img=,600,280]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/0e5f95d7-ce9a-480b-b0a2-6fddc6d11d8d.jpg[/img][/align][align=center]图片来源:国家药品监督管理局官网[/align]基因测序仪S100依托荧光发生(Fluorogenic)测序化学和纠错编码(ECC)测序策略两项核心技术,将发光基团修饰在磷酸键上,使用聚合酶及磷酸酶合成天然DNA,一步完成DNA聚合、标记切除、荧光转化,避免了分子疤痕和测序偏差,实现了长读长,速度更快。同时结合ECC纠错编码技术发现并矫正测序错误,通过奇偶校验和动态规划算法进行解码,实现错误信息的自校正,测序准确度实现了几何式提高,在靶向基因检测等应用方向具备独特优势。[align=center][img=,600,338]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/6fd2204c-c2f2-42a6-9671-93e1d5b25593.jpg[/img][/align][align=center]图:赛纳生物基因测序仪S100[/align]对于基因测序仪公司,临床市场是必争之地,“获证”则是这些公司这真正能够进入临床的标志。据了解,一款基因测序仪申报获得国家药监局医疗器械注册证并非易事,通常要长达数年时间。虽然近几年国产创新基因测序仪产品涌现,但真正获得医疗器械注册证的仪器却寥寥无几。此次赛纳生物全自主知识产权基因测序仪S100获得批准,也进一步证明了中国在基因测序领域的技术实力和创新能力。[来源:仪器信息网] 未经授权不得转载[align=right][/align]

  • 数字PCR、新一代测序仪将点燃生命科学仪器市场,规模达458亿美元

    “在未来五年,全球基因组学生命科学研究工具市场预计每年增长6%,而新一代测序仪市场预计每年增长16%,”一家生命科学市场研究公司DeciBio在2012年4月12日发表的一份报告中说。  在这份报告中,位于洛杉矶基的DeciBio估计生命科学研究工具的市场规模将从2011年的374亿美元增长至到458亿美元,年复合增长率为4%。DeciBio说,在新一代测序仪持续被采用的推动下,2016年基因组学市场规模预计增长到89亿美元,而2011年是68亿美元。  DeciBio的合作伙伴Stéphane Budel,在一封给GenomeWeb的电子邮件中说,基因组学“有望成为生命科学研究工具市场增长最快的部分,”并且补充说,新一代测序技术“正在真正改变这次比赛。”更多内容:http://www.instrument.com.cn/news/20120413/076792.shtml

  • DNA测序仪原理和方法

    DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括Sanger双脱氧链终止法和Maxam-Gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今DNA序列分析的主流。美国PE ABI公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等DNA测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最多的一种型号。本实验介绍的是ABI PRISM 310型DNA测序仪的测序原理和操作规程。【原理】ABI PRISM 310型基因分析仪(即DNA测序仪),采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司专利的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法),因此通过单引物PCR测序反应,生成的PCR产物则是相差1个碱基的3'''端为4种不同荧光染料的单链DNA混合物,使得四种荧光染料的测序PCR产物可在一根毛细管内电泳,从而避免了泳道间迁移率差异的影响,大大提高了测序的精确度。由于分子大小不同,在毛细管电泳中的迁移率也不同,当其通过毛细管读数窗口段时,激光检测器窗口中的CCD(charge-coupled device)摄影机检测器就可对荧光分子逐个进行检测,激发的荧光经光栅分光,以区分代表不同碱基信息的不同颜色的荧光,并在CCD摄影机上同步成像,分析软件可自动将不同荧光转变为DNA序列,从而达到DNA测序的目的。分析结果能以凝胶电泳图谱、荧光吸收峰图或碱基排列顺序等多种形式输出。它是一台能自动灌胶、自动进样、自动数据收集分析等全自动电脑控制的测定DNA片段的碱基顺序或大小和定量的高档精密仪器。PE公司还提供凝胶高分子聚合物,包括DNA测序胶(POP 6)和GeneScan胶(POP 4)。这些凝胶颗粒孔径均一,避免了配胶条件不一致对测序精度的影响。它主要由毛细管电泳装置、Macintosh电脑、彩色打印机和电泳等附件组成。电脑中则包括资料收集,分析和仪器运行等软件。它使用最新的CCD摄影机检测器,使DNA测序缩短至2.5h,PCR片段大小分析和定量分析为10~40min。由于该仪器具有DNA测序,PCR片段大小分析和定量分析等功能,因此可进行DNA测序、杂合子分析、单链构象多态性分析(SSCP)、微卫星序列分析、长片段PCR、RT-PCR(定量PCR)等分析,临床上可除进行常规DNA测序外,还可进行单核苷酸多态性(SNP)分析、基因突变检测、HLA配型、法医学上的亲子和个体鉴定、微生物与病毒的分型与鉴定等。【试剂与器材】1.BigDye测序反应试剂盒 主要试剂是BigDye Mix,内含PE专利四色荧光标记的ddNTP和普通dNTP,AmpliTaq DNA polymerase FS,反应缓冲液等。  2.pGEM-3Zf(+)双链DNA对照模板0.2g/L,试剂盒配套试剂。  3.M13(-21)引物TGTAAAACGACGGCCAGT,3.2μmol/L,即3.2pmol/μl,试剂盒配套试剂。  4.DNA测序模板 可以是PCR产物、单链DNA和质粒DNA等。模板浓度应调整在PCR反应时取量1μl为宜。本实验测定的质粒DNA,浓度为0.2g/L,即200ng/μl。  5.引物 需根据所要测定的DNA片段设计正向或反向引物,配制成3.2μmol/L,即3.2pmol/μl。如重组质粒中含通用引物序列也可用通用引物,如M13(-21)引物,T7引物等。  6.灭菌去离子水或三蒸水。  7.0.2ml或和0.5ml的PCR管,盖体分离,PE公司产品。  8.3mol/L 醋酸钠(pH5.2)称取40.8g NaAc·3H2O溶于70ml蒸馏水中,冰醋酸调pH至5.2,定容至100ml,高压灭菌后分装。  9.70%乙醇和无水乙醇。  10.NaAc/乙醇混合液 取37.5ml无水乙醇和2.5ml 3mol/L NaAc混匀,室温可保存1年。  11.POP 6测序胶 ABI产品。  12.模板抑制试剂(TSR)ABI产品。  13.10×电泳缓冲液 ABI产品。  14.ABI PRISM 310型全自动DNA测序仪。  15.2400型或9600型PCR仪。  16.台式冷冻高速离心机。  17.台式高速离心机或袖珍离心机。

  • 关于测序电泳槽???

    各位大神: 最近有个朋友跟我提到了一个测序电泳槽,想问问各位大神什么事测序电泳槽啊?它的工作原理是怎么样的,电泳基本知识我知道,但测序电泳它是如何实现测序和微卫星分析等等功能的?

  • 全球首发仪式|新星NOVA—MobiNova-100高通量单细胞测序建库系统,4月15日14:00等你来!

    全球首发仪式|新星NOVA—MobiNova-100高通量单细胞测序建库系统,4月15日14:00等你来!

    近年来,单细胞测序技术成为生命健康领域追逐的热点,可应用于肿瘤异质性研究、干细胞分化以及组织器官发育研究、神经系统发育研究、免疫方向研究、疾病分型和药物机制以及用药指导等方向。随着研究的深入和技术的不断发展进步,市场对单细胞产品提出了新的要求:从单组学到多组学、从基本到高通量、从哺乳动物到微生物。墨卓生物即将推出MobiNova-100高通量单细胞测序建库系统助力科学研究,MobiNova-100是墨卓团队过去数年磨一剑的结晶,是一个真正稳定、精准、可信赖的技术平台,在关键的性能指标上接近甚至部分超越了国际一流水平。一次可探索最多数十万单细胞,实现极高的细胞捕获率,精准捕获细胞信息;单次运行仅需十分钟,最大程度保证数据质量,给用户提供可信赖的解决方案。 “新星”升越 ,创新不止,创新是墨卓生物不断向前发展的内在引擎,新星NOVA—MobiNova-100高通量单细胞建库系统全球首发仪式将正式进行线上发布! [b] [color=#ff0000]2022年4月15日14:00[/color][/b]诚邀各位莅临MobiNova的世界,一同解锁细胞的无限可能! [img=,442,348]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2022/04/202204141904574225_9730_2507958_3.png!w442x348.jpg[/img][img]file:///C:/Users/wangqy/AppData/Local/Temp/企业微信截图_16499342329421.png[/img] [b][size=18px] [img]https://simg.instrument.com.cn/bbs/images/brow/em20.gif[/img] 直达会场:[/size][/b][url=https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/mobinova20220415/][b][size=18px]https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/mobinova20220415/[/size][/b][/url][img=,480,1600]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2022/04/202204141901011128_219_2507958_3.jpg!w480x1600.jpg[/img][font=&][size=16px][color=#333333]14:08--14:45[/color][/size][/font][font=&][size=16px][color=#333333]新星NOVA—MobiNova-100高通量单细胞测序建库系统 全球首发仪式[/color][/size][/font][font=&][size=16px][color=#333333]裴颢[/color][/size][/font][font=&][size=16px][color=#333333]墨卓生物 CEO[/color][/size][/font]

  • 【转帖】中美英等国发起千人基因组计划获重大成果

    由中美英等国科研机构发起的大型国际科研合作项目“千人基因组计划”10月28日在英国《自然》杂志上,以封面文章形式发布了迄今最详尽的人类基因多态性图谱,同时也在美国《科学》杂志上报告了在基因研究技术手段上的收获,相关成果标志着人类基因研究进入了一个划时代的新阶段。“千人基因组计划”由中国深圳华大基因研究院、美国国立人类基因组研究所、英国桑格研究所等机构于2008年启动,旨在绘制迄今最详尽、最有医学应用价值的人类基因多态性图谱。现在报告的是该计划第一阶段的分析成果。“千人基因组计划”共同主席、英国桑格研究所基因专家、《自然》封面文章主要作者之一理查德·德宾在接受记者采访时说:“这一计划现在取得了两个重要成果,第一是获得了迄今最详尽的人类基因多态性图谱,第二是探索出了研究基因多态性的新技术手段。”基因多态性是指人与人之间的基因差异。人的基因组总体上差不多,但在有些位置上你我他都不一样,存在各种基因变种,它们最终导致了人与人之间的差异。德宾说,在第一个成果方面,研究人员找出了1000多万个大大小小的基因变种,其中约800万个都是前所未知的。对于人群携带率在1%以上的基因变种,本次研究的覆盖率达到95%以上,得出了迄今最详尽的基因多态性图谱。这一成果在医学等领域有很高的应用价值,比如通过参照图谱,可以方便地找出致病的基因变种。在第二个成果方面,研究人员验证了在大型基因研究中综合使用多种基因测序手段的可行性。由于基因测序成本目前仍很高昂,如果能在“精测”一些基因序列的同时,对另一些基因序列只需“粗测”就能保证最终结果的准确性,将可以大幅降低基因测序研究的成本。《科学》杂志上的文章便侧重描述了技术手段方面的进展。德宾告诉记者,自十年前“人类基因组计划”完成以来,因为难以同时对许多人进行基因测序,基因研究一直只在较小的层面上进行。本次研究不仅使大规模测序成为可能,还绘制了一个详尽的基因图谱以供比对,这标志着人类基因研究进入了一个划时代的新阶段。他说,本次报告还只是基于“千人基因组计划”第一阶段中搜集的数百人的基因数据,而该计划的最终目标是获得欧、亚、美、非各洲不同人群中2500人的基因数据,预计在2012年发布的最终结果将可以覆盖99%以上的基因变种。据报道,“千人基因组计划”所获数据存放在公共数据库中,公众可免费查询。 (新华网)

  • 美国应用生物系统公司appliedbiosystems(ABI)DNA测序仪-377

    性能介绍:  377型全自动遗传分析仪采用经典的聚丙烯酰胺凝胶的电泳方式,结合PE公司专利的四色荧光标记,激光检测的方法,具有测序精确度高,每个样品判读序列长(800-1200bp),一次电泳可测定样品数多(96个),快速方便,不需要同位素,测序方法灵活多样等特点,已成为全球应用最多最广的全自动DNA测序仪,尤其在人类基因组测序cDNA文库测序及比较基因组测序研究中应用极其广泛,此外377型全自动DNA测序仪在各种应用软件的辅助下,还可以进行DNA片段大小分析和定量分析,应用于基因突变分析SSCP,DNA指纹图谱分析(AFLP、RAPD、VNTR、STR),基因连锁图谱分析以及基因表达水平的研究,在临床遗传病、传染性病和癌症基因诊断、农业畜牧业的动植物育种、法医鉴定等领域有极其广泛的应用前景。 377型全自动遗传分析仪特点:   专利设计:  采用PE公司专利四色荧光标记,一个泳道测序的方法,避免单一标记(如:同位素标记)四个泳道测序因泳道间迁移率不同对精确度的影响,同时一个样品只占用一个泳道,使一次测定样品数目大大增加(至96个),因而具有精确度高,一次测定样品数多的特点。  测序能力强:  377型全自动遗传分析仪的荧光检测器采用激光激发、CCD摄像机同步成像技术,代表不同碱基信息的不同颜色荧光先经光栅分光,再经CCD摄像机成像,具有一次扫描可检测多种荧光的特点,测序速度高达200bp/小时,此外一个样品一次可测定800-1200个碱基,而同位素测序一次只能测定200-300个碱基。  电脑单点控制整个DNA测序仪的功能:  包括电泳参数设置,数据收集和分析以及结果输出。此外电脑可在电泳过程中对仪器运行状态进行同步监测,电泳结果也可以凝胶电泳图谱、荧光吸收峰图或碱基排列顺序等多种形式输出。新增加的用户界面卡功能强且简便易学,无论进行DNA序列分析还是DNA片段大小和定量分析,都可在各种软件辅助下方便地进行。  电泳的精确控温:  采用上下缓冲液环泵和温度检测器,使电泳温度恒定在51℃,这样可提高测序精度,调节温度,还可进行特殊应用研究,如:SSCP。此外采用恒定电压,而非恒定功率,可减少迁移率的变化,进一步提高电泳结果的重复性。  新改变的电泳胶板设计和电泳胶配方:  简化了灌胶操作,使灌胶更方便快捷,此外电泳胶的聚合可在最短的时间内完成。  测序方法灵活多样:  采用两种荧光染料标记方法(标记终止物ddNTP法和标记引物5'端法),两种DNA聚合酶(Sequenase和AmpliTaq),提供20钟测序试剂盒,可满足各种DNA模板(单链DNA,双链DNA,PCR产物)和测序策略(鸟枪法、缺失法、基因行走法)的要求。  丰富的应用软件:  有GeneScanTM、GenotyperTM、AutoAssemblerTM、Sequence NavigatorTM等软件,可进行DNA片段大小和定量分析,遗传基因的组型分析,DNA亚克隆序列拼接,DNA和蛋白序列比较。  多功能:  提供三种不同长度的凝胶电泳板,可根据对电泳时间和样品分辨率的不同要求选择,进行DNA序列分析,DNA片段大小分析(碱基分辨率可达1bp)和DNA片段定量分析(可检测从单一分子扩增的产物)。

  • 赛纳生物基因测序仪S100获批国家药监局医疗器械注册证

    2024年2月21日,赛纳生物基因测序仪S100获批国家药品监督管理局(NMPA)医疗器械注册证(国械注准20243220383),标志着国产全自主知识产权基因测序仪S100在中国获准临床应用。[align=center][img=,600,280]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/0e5f95d7-ce9a-480b-b0a2-6fddc6d11d8d.jpg[/img][/align][align=center]图片来源:国家药品监督管理局官网[/align]基因测序仪S100依托荧光发生(Fluorogenic)测序化学和纠错编码(ECC)测序策略两项核心技术,将发光基团修饰在磷酸键上,使用聚合酶及磷酸酶合成天然DNA,一步完成DNA聚合、标记切除、荧光转化,避免了分子疤痕和测序偏差,实现了长读长,速度更快。同时结合ECC纠错编码技术发现并矫正测序错误,通过奇偶校验和动态规划算法进行解码,实现错误信息的自校正,测序准确度实现了几何式提高,在靶向基因检测等应用方向具备独特优势。[align=center][img=,600,338]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/6fd2204c-c2f2-42a6-9671-93e1d5b25593.jpg[/img][/align][align=center]图:赛纳生物基因测序仪S100[/align]对于基因测序仪公司,临床市场是必争之地,“获证”则是这些公司这真正能够进入临床的标志。据了解,一款基因测序仪申报获得国家药监局医疗器械注册证并非易事,通常要长达数年时间。虽然近几年国产创新基因测序仪产品涌现,但真正获得医疗器械注册证的仪器却寥寥无几。此次赛纳生物全自主知识产权基因测序仪S100获得批准,也进一步证明了中国在基因测序领域的技术实力和创新能力。[来源:仪器信息网] 未经授权不得转载[align=right][/align]

  • 2012年测序市场,Life Tech能否撼动Illumina王者地位

    2011年《福布斯》杂志刊登了一篇名为“下一个千亿科技产业”的文章如是说:DNA测序是一种破解基因密码(即碱基序列)的技术,它将构成一个千亿产值市场的基础。多么让人心潮澎湃啊,呵呵! 刚过去的1月,测序市场的领头羊Illumina公司宣布推出一款新的测序仪——HiSeq 2500系统。能够在大约24小时内完成整个基因组的测序,即“一天一个基因组”。同一天,Life Technologis公司也宣布推出了Ion Proton测序仪,旨在一天内完成人类基因组的测序,耗资约为1000美元。业内人士认为,此前三家测序巨头的竞争,自此,来到两大巨头的升级版测序竞赛! 同样是一天一个基因组,HiSeq 2500在SBS测序原理上继续提升,而Ion Proton则运用半导体技术,不管怎么说,相信二者在数据质量、测序速度上差别不会太大,本次一个很大竞争点在价格方面。据Illumina公司介绍,HiSeq 2500的价格将是74万美元(美国报价),也可从现有的HiSeq 2000升级,费用是5万美元。Life Tech网站上介绍Ion Proton只需要15万美元(2012年1月Life Tech网站新闻公布, 美国报价。另有网友补充,15万美金是主机不带附属设备的,全部买齐大概要40万美金。)。不知在高端测序市场占尽先机的Illumina公司,本次如何面对Ion Proton的强势出击呢!Life Tech将从Illumina手中到底夺取多少市场份额,咱们拭目以待吧。————————————————————内容分割线——————————————————型号时间价格测序原理HiSeq 2500一天 74万美元(美国报价)SBSIon Proton一天 15—40万美金(美国报价)半导体————————————————————内容分割线—————————————————— 以上消息从Life Tech、Illumina网站、福布斯中文网等处整理总结,抛砖引玉,大家来讨论讨论2012年测序市场会不会有什么不一样吧,坐等回复! 没人回复呀!

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