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全球测序者计划
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全球测序者计划相关的方案
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化
重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最hou对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较,判断是否CpG位点的甲基化状态。
个体化用药微测序解决方案
基于特殊连接酶和荧光捕获探针的微测序技术原理,即连接酶测序法,应用天隆特有的微测序反应试剂及Fascan 48E多通道荧光定量分析仪,采集血液、胃粘膜组织等样本后可快速获取个体化用药相关基因信息,用于指华法林,氯此格雷、他汀类药物、硝酸甘油、降压药物、阿司匹林、精神类药物、叶酸等药物的个体化使用。
Namocell单细胞分离仪应用---单细胞测序
Namocell单细胞分离仪能够快速、准确、高效地将目的单细胞分离至孔板中,并且能够与后续的基因扩增及测序进行无缝对接。
Namocell单细胞分离仪应用---单细胞测序
Namocell单细胞分离仪能够快速、准确、高效地将目的单细胞分离至孔板中,并且能够与后续的基因扩增及测序进行无缝对接。
使用蛋白质测序仪检测半胱氨酸和胱氨酸
目前,在蛋白质的分析中,使用质谱仪及利用基因组数据库搜索引擎进行蛋白质鉴定的蛋白质组分析是主流的分析技术。体内表达的蛋白质经过翻译后修饰而具有各种功能,并且前体和成熟蛋白质之间可能具有不同的理论质量数。在不使用数据库的情况下,使用质谱仪鉴定氨基酸序列非常复杂和困难。另一方面,作为常规方法,使用埃德曼降解法的蛋白质测序仪所得到的氨基酸序列结果的可靠性高,即使在数据库不充分的情况下,也可以轻松地鉴定氨基酸序列。本次为您介绍使用蛋白质测序仪PPSQ™ -50A系统(等度系统和梯度系统)对含有半胱氨酸和胱氨酸的样本进行氨基酸序列分析的实例。
完整线粒体DNA提取神器—SageHLS在测序合成的应用
线粒体病是遗传缺陷引起线粒体异常,致使ATP合成障碍、能量来源不足等导致的一组异质性病变,又称为线粒体细胞病。为了确保低丰度mtDNA突变的检测不受核假基因的干扰,许多研究人员采用传统的氯化铯密度梯度离心法来富集mtDNA,或在NGS二代测序前通过PCR富集特异性的mtDNA序列,该方法虽然是mtDNA富集的金标准,但是整个富集流程所需试剂多,操作繁琐且耗时。SageHLS只需通过一个步骤,就可富集得到mtDNA。整个工作流程完全自动化,仅包含1.25小时的提取和片段分离电泳,以及1.5小时的洗脱。
快速深度单克隆抗体 De novo 测序
通过 Trypsin,LysC,Chymotrypsin,GluC 和 AspN 5 种酶进行多酶酶切,采用 HCD 和 ETD 两种互补碎裂方式,以及后续的软件分析和人工确认,建立了单抗药物简单、快速的 De novo 质谱测序分析流程,为未知氨基酸序列蛋白药物的分析和确认提供了质谱方法,有望大规模应用于生物制药企业的早期研发中。
PerkinElmer NGS整体解决方案助力新冠病毒的测序研究
通过高通量NGS测序可以协助病毒溯源,监控病毒变异,掌握病毒的发展方向,也可以为抗病毒药物研发提供科学依据。珀金埃尔默具有完整的NGS解决方案,产品涵盖样品收集、核酸提取、核酸质控、NGS自动化文库构建工作站及NGS建库试剂等几个方面。利用珀金埃尔默公司的NGS产品,可以实现从样品收集、提取、NGS建库及文库质控的全流程解决方案。
应用蛋白质测序仪PPSQ-53A测定多黏菌素B的氨基酸序列
本文应用岛津蛋白质测序仪PPSQ-53A,对经过无花果蛋白酶酶切处理解除N端封闭的多黏菌素B2组分进行氨基酸序列分析,测得N端氨基酸序列为Thr-DABA-X-DABA-Phe-Leu-DABA-DABA-Thr(X代表信号无检出),与理论一致。本方法操作简单、检测灵敏可靠,可作为多肽类抗生素氨基酸序列分析时的参考。
靶向序列捕获和新一代测序前对福尔马林固定石蜡包埋组织及新鲜冷冻组织进行 DNA 质量控制
本文将介绍利用 Agilent 2100 生物分析仪系统的微流控芯片电泳,在新一代测序工作流程的 SureSelect 靶向序列捕获之前或期间,对福尔马林固定石蜡包埋组织及新鲜冷冻组织的 DNA 样品进行质量控制。借助 2100 生物分析仪系统可靠的 DNA 电泳技术,可提供弥散条带谱及详细的文库统计信息,例如峰高、平均弥散条带分子量、分子量分布和 DNA 浓度。FFPE DNA 样品的结果与新鲜冷冻组织和对照 DNA 的 DNA 分析结果具有可比性。
电子舌联合微生物测序技术分析贮运温度对巴氏杀菌乳品质的影响
本文采用电子舌联合高通量测序两种快速现代检测技术,对5 个不同温度下贮藏不同时间的巴氏杀菌乳样品进行感官品质和细菌多样性测定,进一步利用统计学软件分别对各样品味感值及细菌种类作主成分和关联性分析,揭示贮运温度对巴氏杀菌乳感官品质和微生物的影响规律,以及主要残留微生物与巴氏杀菌乳贮运期间感官品质之间的关系,为今后的研究提供更加系统的评价依据。
利用 Agilent 2200 TapeStation 系统为新一代测序文库制备及 SureSelect 靶向 序列捕获进行全程样品质量控制
Agilent 2200 TapeStation 系统可对新一代测序 (NGS) 工作流程中的样品进行全程分析,从最初的起始材料一直到测序前的最终 DNA 文库质量控制 (QC)。本应用简报遵循 SureSelect 文库制备实验方案,展示了基因组 DNA ScreenTape、D1000 ScreenTape 及高灵敏度 D1000 ScreenTape 分析方法对该工作流程中样品的分析性能及适用性。数据证明了 2200 TapeStation 系统是可靠的文库分子量测定及定量分析 QC 平台。数据还证明了这些 DNA ScreenTape 分析方法与 Agilent 2100 生物分析仪的相应分析方法具有可比性,并在其性能指标内。
应用岛津蛋白质测序仪PPSQ-53A测定蛋白质药物注射用重组人促红素原液的N-末端氨基酸序列
通过自制脱盐装置对蛋白质药物注射用重组人促红素原液(CHO细胞)进行脱盐处理,应用蛋白质测序仪PPSQ-53A进行重组人促红素的N-末端氨基酸序列分析,避免了盐分干扰和对仪器的损害,成功测定了样品N-末端前15个氨基酸的序列,结果与理论一致,表明使用PPSQ可以检测蛋白质的N-末端序列,是生物技术药物研发和质控管理中具有重要作用的分析手段。
全球首款单细胞蛋白质组研究工具
全球首款单细胞蛋白质表达定量分析系统单细胞组学是精准医学研究计划的首要组成部分,在国家精准医疗计划申请指南,排在第一位。之前只有基因水平的手段,现在美国ProteinSimple率先提供蛋白质水平的检测方法。
利用PPSQ™ -51A/53A梯度系统分析 小鼠IgG的N末端氨基酸序列
本文介绍了利用微量IgG蛋白(来自小鼠血清)进行氨基酸测序的方法。。PPSQ-51A/53A梯度系统测序简便、可靠,是蛋白质分析不可缺少的工具。
NIPT二代测序基因检测自动化解决方案
IPT 的刚性需求不断上升,样本量的不断增加,消费者要求的时效性,给产前筛查中心、产前诊断中心、第三方检验所带来一些压力,而AMTK推出系列液体处理工作站,很好的服务于NIPT高通量检测需求,为NIPT项目提供全套成熟的、标准的自动化解决方案。针对不同通量不同试剂盒的NIPT检测,AMTK推出多种自动化解决方案,全面匹配不同客户的NIPT需求。
来自全球法规认证服务调查的见解:安捷伦 ― 法规认证的公认领导者
2019 年 4 月,市场调研公司 Cell Associates 面向分离科学领域权威杂志《LC/GC》的读者开展了一项独立调查。这项调查旨在收集有关实验室法规认证服务的市场调研信息,包括当前监管趋势、对分析仪器和软件验证法规认证服务的偏好性等主题。这项调查共计收到 450 多份回复,并对这些回复进行了分析。数据可靠性仍是重中之重。此外,由于缺乏对当前法规变化和各种确认方法的透彻了解,调查结果表现出对改进服务交付方法的极大关注。安捷伦法规认证服务名列第一:受访者十分认可安捷伦的仪器确认和计算机系统验证服务。
六种不同文库制备试剂盒用于 FFPE 样品外显子序列捕获应用的比较
外显子组测序和靶向基因组合测序是常用的新一代测序 (NGS) 方法,用于鉴定和表征科研与临床样品(如癌症样本)中的不同基因突变。基因组合靶标设计、实验室处理操作和生物信息学分析等许多因素都会影响变异/畸变检测的灵敏度和准确性。本文展示相同 FFPE 样品在多个供应商的六种不同文库制备试剂盒中得到的对比结果。在 100X 原始测序深度下,Agilent SureSelectXT HS 文库制备试剂盒在四个关键指标上表现出最佳性能,即在靶率、平均读出序列深度、20X 读出序列深度下的靶标碱基覆盖率以及捕获前文库产率。供应商 A 试剂盒在 20X 读出序列深度下的靶标碱基覆盖率和捕获前文库产率两个指标中排名第二;供应商 E 在在靶率和平均读出序列深度两个指标中排名第二。总体来说,Agilent SureSelectXT HS 试剂盒的性能优于评估的其他 5 种试剂盒。
【应用文章下载】QPix400系统在噬菌体展示中的应用
QPix 400 系列是目前全世界最专业的微生物克隆筛选系统,全球装机量超过800 套。早在上世纪 90 年代,大规模的测序工作迫切的需要一款性能可靠的自动化微生物克隆挑选系统。
使用岛津PPSQ对IgG抗体的N末端氨基酸进行序列分析
作为生物药品的N末端氨基酸序列分析的实例,这里介绍使用蛋白质测序仪PPSQ-50A系列分析小鼠抗体IgG的氨基酸序列分析。
添加甘蔗糖蜜对苜蓿青贮发酵品质、微生物群落及口感的影响
研究添加甘蔗糖蜜对紫花苜蓿青贮发酵品质和口感的影响。采用不添加添加剂(对照)、1%糖蜜(M1)、2%糖蜜(M2)和3%糖蜜(M3)的苜蓿青贮206 d。测定了紫花苜蓿青贮饲料的化学成分和发酵特性,采用16S rRNA测序法对微生物群落进行了描述,并采用电子舌感系统对其口味进行了评价
NGS自动化建库
随着测序成本的下降、测序通量不断提升,新一代测序技术发展迅速,应用范围也不断扩大。Auto-NGS系列全自动样本处理系统是一款高效紧凑、无人值守的自动化NGS文库制备设备。Auto-NGS系列产品有助于减少工作量,对更多样本进行并行处理,提高文库制备过程的重复性,大幅度解放实验室人力,并将可能的错误最小化,同时提高文库制备稳定性。
海能仪器:氧化还原电位(ORP、Eh)的测定(去极化法)
如果充分考虑了铂电极的表面性质和电极电位建立的动力学过程,对复杂的介质,如果采用了去极化法测定氧化还原电位,可以在较短时间2分钟内得到较为精确的结果,这个结果相当于传统测定方法平衡48小时的电位,通常两者小于10mV或更好。
2020年全国饲料质量安全监督抽查计划-液相色谱配置解决方案
为助力企业从容应对2020年全国饲料质量安全监督抽查,上海通微针对《2020年全国饲料质量安全监督抽查计划》项目,制定了行之有效的配置解决方案。
单细胞悬液制备仪实验分享 ▏肝组织单细胞悬液制备
单细胞技术已经广泛应用于肿瘤,免疫,发育生物学,神经科学,细胞治疗,药物研发及动植物研究中。但并不是所有的组织都适用于单细胞RNA测序,现阶段单细胞RNA测序研究的一个极大的挑战仍是如何获得高质量的单细胞悬浮液。科研者单细胞悬液仪具有起始组织量小,时间短,细胞得率高,细胞活性高的特点。带加热功能,对样品的消化处理过程始终处在恒温状态,细胞得率高达90%,方便了对真核生物进行单细胞核RNA测序。
全球食品生产商选择可靠性高、运行时间长的InnovOx分析仪
荷兰一家生产食物酵素、培养物、配料及其它产品的全球领先生产商,所用的在线型总有机碳(TOC)监测仪连续发生性能和维护方面的问题。监测仪采用高温氧化作为检测废水中有机物的方法。仪器由于堵塞,正常运行时间总是不足。多年之后,公司决定寻找其它更好的监测解决方案,新方案必须可靠性更强,正常运行时间更长。
去极化方法测定海水的氧化还原电位初探
采用去极化法测量氧化还原标准溶液——醌氢醌标准溶液,初步探讨了去极化法测定氧化还原电位的准确度,结果发现运用去极化方法测定氧化还原电位是一种快速、准确的方法,相对传统方法而言,具有测量时间短、测量精度高、数据重现性好的优点。进一步开展去极化方法测定海水氧化还原电位,为海洋氧化还原电位的快速测量提供依据。
一种无酚/无氯仿组织研磨从热带木本植物中提取核酸的方法,可用于基因表达和测序
木本植物传统核酸提取方式耗时长、需使用有毒化学品(例如苯酚和氯仿),且一次只能处理少量样品。为了克服这些问题,我们开发了一种不使用苯酚/氯仿、基于CTAB / PVP的新方法,用于RNA或DNA提取。该方法同样适用于96深孔板,使用SPEX高通量组织研磨仪,一次研磨6块深孔板,同时处理576个样品,大大加快了处理速度。
外泌体纯化检测解决方案
不同细胞分泌的外泌体具有不同的组成成分和功能,可作为疾病诊断的生物标志物,也可用于靶向药物的定向传输。贝克曼库尔特公司为此提供了专门针对 Exosome 的超离富集纯化,以及纳米颗粒 / 蛋白表达 /NGS 测序等检测的一系列配套解决方案。
PriboLab公司推出全球领先技术的分子印迹固相亲和柱
近期,Pribolab公司将先进的分子印迹技术应用于霉菌毒素高效液相色谱(HPLC)检测领域,面向全球推出基于分子印迹技术的展青霉素分子印迹固相亲和柱。Pribolab公司推出的PriboMIPTM Patulin 展青霉素分子印迹固相亲和柱,是运用分子印迹技术原理,模拟抗原抗体反应模式,配合HPLC液相方法在检测展青霉素前,将样品中的展青霉素进行特异性提纯处理和富集,完全除去其他杂质。
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