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华大基因登陆创业板

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  • 【讨论】华测检测登陆创业版,再聚华测!(奖励结束)

    [size=4][color=#DC143C]华测检测登陆创业版 拟募集资金2.75亿元[/color][/size]http://www.instrument.com.cn/news/20090922/034605.shtml“从业绩来看,对我们影响不大。”谈到2008年金融危机时,华测技术(300012.SZ)投资发展部的人士对记者表示。这段时间,华测技术公司董事长万峰与投资部的同事都非常忙碌,创业板上市成为这家公司的头等大事。  虽然在金融危机中保持了正增长,但华测的增速明显放缓,不过相比其他行业检测技术更能抵御经济的波动。去年全球前三大检测机构收入仍保持稳步增长,华测也不例外,2008年其营收和净利分别为2.03亿元、0.45亿元,同比分别保持了70%和13%左右的增长速度;不过相比于2007年净利同比增长100%以上而言,已显示出经济波动对公司业绩影响明显。  据了解,华测的客户主要分布在华南、华东,且以外向型经济的国内厂商为最大客户群体。去年国内制造商的外贸困境,给公司业绩增长带来冲击。不过,公司的业绩2009年重拾增长速度,今年上半年营收和净利已分别达1.21亿元、0.27亿元,以此数据推算,今年的净利同比增速有望达到20%以上,盈利重回快速增长通道。

  • 【讨论】创业板啊~~创业板

    [em09504]创业板昨天开了~~疯了啊~~28只新股遭爆炒均曾被停牌 诞生2只百元股[em09512]昨天厂里有个人居然中了一签,发了大财[em09508]咱没那运气[em09508]都没敢去开户[em09501]

  • 【转帖】创业板第二批8家公司

    创业板第二批8家公司今日在深交所挂牌交易,全日走势平稳,多数呈现高开低走态势,首日涨幅均未超过70%,平均涨幅不足5成,与首批28家创业板首日被爆炒的局面形成鲜明反差,显示市场趋于理性。  个股方面,超图软件(32.200,12.60,64.29%)涨幅最大,全日涨64.29%报32.20元,同花顺(70.380,17.58,33.30%)涨幅最小,收涨33.3%报70.38元。  首批28家创业板公司表现低迷,仅神州泰岳(109.600,0.00,0.00%)勉强平收,网宿科技(44.820,-3.17,-6.61%)大跌超6%,新宁物流(32.720,-1.82,-5.27%)、银江股份(38.000,-2.08,-5.19%)等4股跌幅逾5%。

  • 【转帖】刘召贵畅谈天瑞仪器创业板上市——访江苏天瑞仪器股份有限公司董事长刘召贵博士

    2011年1月25日,天瑞仪器正式在深交所挂牌上市。当日天瑞仪器董事长刘召贵博士及其高层出席了在深交所举行的隆重的敲钟仪式。此次,天瑞仪器登陆创业板,共发行股票1850万股,募集资金总额120,250.00万元人民币。  作为国内第一家创业板上市的分析仪器公司,天瑞仪器的上市对于分析仪器行业具有特殊的意义。那么天瑞仪器上市后有哪些发展计划?将面临哪些机遇与挑战?天瑞仪器的上市对于分析仪器行业又将产生哪些影响?  为此,仪器信息网(以下简称:Instrument)第一时间采访了江苏天瑞仪器股份有限公司董事长刘召贵博士及天瑞仪器普通员工。http://www.instrument.com.cn/news/20110126/055560.shtml

  • 【新闻转载】聚光科技闯关创业板 过半利润来自补贴和应收款

    21世纪经济报道 潘沩 上海报道(本文转载于 21世纪经济报道)  12月21日,聚光科技(杭州)股份有限公司(以下简称“聚光科技”)上会。  招股书显示,公司2007年至2009年三年累计实现净利润22395.98万元,预计2010年全年经审计的归属于母公司所有者的净利润将为14659.97万元。比较起创业板企业普遍在几百万到几千万的年净利润而言,聚光科技堪称是创业板的“巨无霸”公司。  但数据显示,聚光科技2007年主营业务为亏损,靠财政补贴和增值税退税,才得以盈利;其后两年半,财政补贴和税收优惠几乎撑起了聚光科技利润的半壁江山。  上海一位保荐人指出,“巨无霸”聚光科技有可能是因为2007年主营业务的亏损,而选择创业板上市。  而另一方面,由于应收账款过高,聚光科技的经营性净现金流也非常不理想,过去“三年一期”的数据中有两个数据为负。一位会计师事务所合伙人指出,即便有企业扩大规模的因素影响,但如此不稳定的现金流仍存不小风险。  过半利润来自  税收优惠和补贴  在上述一位保荐人看来,聚光科技选择上创业板,放弃主板,有可能是不得已为之。他告诉记者:“上主板要求企业连续三年盈利;创业板有两套标准:两年盈利一千万,持续增长;或最近一年盈利五百万,营业收入五千万,最近两年营业收入增长率超过30%。”  而数据显示,聚光科技2007年的营业利润为-547万。虽然在加上营业外收入1600万后,聚光科技2007年的利润总额仍只有1000万。  上述保荐人表示,聚光科技主营业务无法连续三年盈利,如果上中小板,“2007年的营业利润为负算一个瑕疵,上创业板则稳妥一些。”  招股说明书显示,这1600万的营业外收入,其中800万是增值税退税,其原因是“公司及部分子公司作为增值税一般纳税人,销售自行开发生产的软件产品增值税实际税负超过3%的部分实行即征即退”;681万是因为承担国家或杭州高新技术创新项目而获得的政府补助。  税收优惠和补贴,随后一直成为聚光科技的重要利润来源。  2008年,公司的利润总额为8700万,其中3700万是营业外收入,其构成为2700万增值税退税和1000万政府补助;2009年,公司的利润总额为1.5亿,其中有4400万营业外收入,主要构成为2900万增值税退税和900万政府补助;2010年上半年,公司利润总额为3500万元,1600万元是营业外收入,主要构成仍然是增值税退税和政府补贴。  聚光科技董秘田昆仑对记者解释,虽然公司是仪器仪表行业,但产品本身含公司自己设计生产的软件,所以可以获得增值税退税。  除此之外,聚光科技子公司因外资身份,又得以减免相当部分的所得税。数据显示,2007年、2008年、2009年和2010年上半年,分别减免所得税500万、1200万、1400万和320万元。  应收账款高企  另外,招股书显示,聚光科技应收账款高企。  公司2007年、2008年、2009年和2010年上半年,应收账款分别为4200万、1.62亿、3.12亿和3.64亿,占当年资产总额的比例分别为14.55%、32.99%、36.83%和42.34%。  在应收账款高企的情况下,其经营性净现金流也非常不好看。过去三年一期,聚光科技的这一数据分别为-4000万、72万、2000万和-5400万。  虽然公司在招股书中称,2010年上半年的应收账款过高,是因为行业使然,公司的收款集中在第四季度;应收账款比较高的另一原因是,随着公司扩大生产和销售,应收账款中的20%是属于放在客户中的质保金。不过有会计师向记者表示,如此不稳定的现金流,可以反映企业的资金链仍存在一定风险。  招股书中,聚光科技将自己的应收账款周转率,与同行业10个上市公司做出比较。从2008年开始,聚光科技的应收账款周转率就远远慢于同行。2008年,时代科技(7.14,-0.04,-0.56%)(000611.SZ)和大族激光(21.08,-0.01,-0.05%)(002008.SZ)等上市公司的周转率为一年4.12次,聚光科技为3.47次;2009年,分别为一年3.79次和2.22次;2010年上半年,分别为1.93次和0.72次。

  • 南华仪器将上市创业板

    [size=16px] 证监会近日公布了一系列拟上市企业名单及各企业IPO申报稿。在这上百家公司中,有一家是[/size][size=16px]来自广东佛山[/size][size=16px]的南华仪器股份有限公司,该公司的上市选择地点是深交所创业板。[/size][size=16px] 招股说明书上显示,南华仪器创办于1996年,主营业务是汽车环保和安全检测用分析,主要生产产品包括检测汽车废气数值的机动车排放物检测仪器、机动车排放物检测系统以及机动车安全检测系统。此次南华仪器的发行计划是拟向社会公众发行股票总量不超过1020万股。此次发行股票募集的资金,将用于年产600套机动车环保安全检测系统生产项目,年产310台红外烟气分析仪器及系统生产项目以及企业研发中心建设项目,三大项目总投资金额为1.50亿元。[/size]

  • 海归博士艾滋病基因疗法获千万元创业金

    海归博士艾滋病基因疗法获千万元创业金 作者: 来源:中国企业家 发布者: 吴林寰 类别:新闻扫描 杭州滨江区出大手笔。40位高层次“海归”入选“5050计划”,获得区政府6800万元的创业启动资金资助。其中拿到资助金额最高的是吴劲梓博士,他领衔的抗艾滋病新药研发项目,获得了1000万元创业启动资金。这也是迄今为止,全省受资助额最高的海外留学人才创业项目。 他,凭什么拿走1000万元? 吴劲梓是美籍华人,1988年从南京大学硕士毕业后就前往美国。1996年,他获得美国亚利桑那大学癌症生物学博士学位。去年回国前,他曾任葛兰素史克公司(世界第三大制药公司,全球500强企业)的副总裁,负责全球艾滋病新药开发。此前,他先后在法国安万特和瑞士诺华等国际顶级制药公司工作过。 去年,吴劲梓决定回国创业,并带领着一个六七位海外留学人才的团队来到杭州滨江。考虑到目前国内还没有自主研发并得到国际认可的抗HIV新药,吴劲梓的团队,决定以基因疗法对艾滋病病毒携带者的CCR5基因进行修饰,达到根治艾滋病的目的。 吴劲梓回国后,将自己的创业想法与滨江集团沟通,两者一拍即合,双方共同注册资本1000万美金,一期投资2000万美金,总投资将达1亿美金。去年底,吴劲梓开始与滨江区政府接触,区政府将他的项目提交专家组。专家认为,“若公司发展顺利,有机会带领本土公司实现我国在该领域零的突破,具有重大的示范效应。” 一个领军人才,不仅可以带领一个企业成长壮大,还可以带动一个行业、甚至一个产业快速发展。所以,吴劲梓的项目成为杭州高新区(滨江)“5050计划”首个给予“一事一议、上不封顶”政策的项目,获得区管委会、区政府1000万元创业启动资金及相关扶持政策。这个创业项目,或将带动和引领杭州高新区(滨江)甚至杭州市生物医药产业迈入新的发展阶段。

  • 【求助】论坛登陆是否有问题

    每次登陆后进入VIP页面,然后进入论坛首页,在点击就会出现窗口自动关闭的情况,如果用右键打开其他链接就没有问题。是不是有什么问题请斑竹查一下原因。

  • 利用MGI平台对大豆进行全基因组重测序分析

    [align=center][b][font=宋体]利用[/font][font='Times New Roman']MGI[/font][font=宋体]平台对大豆进行全基因组重测序分析[/font][/b][/align][b][font=宋体]摘要[/font][/b][font=宋体][font=宋体]:本研究建立了[/font][font=Times New Roman]MGI[/font][font=宋体]平台全基因重测序的方法。[/font][font=Times New Roman]MGI[/font][font=宋体]平台对大豆的全基因进行重测序结果显示,测序数据质量良好,且与参考基因组比对率较高,符合后续分析要求,对其进行[/font][font=Times New Roman]SNP[/font][font=宋体]和[/font][font=Times New Roman]Indel[/font][font=宋体]的变异检测和注释,此结果说明今后可利用[/font][font=Times New Roman]MGI[/font][font=宋体]平台对其它样品进行全基因重测序分析。[/font][/font][b][font=宋体]关键词[/font][/b][font=宋体][font=宋体]:[/font][font=Times New Roman]MGI[/font][font=宋体]平台;全基因重测序[/font][/font][align=center][font='Times New Roman']Whole genome resequencing analysis of soybeans using the MGI platform[/font][/align][b][font='Times New Roman']Abstract:[/font][font=宋体] [/font][/b][font=宋体][font=Times New Roman]In this study, a method for whole gene resequencing on the MGI platform was established. The results of resequencing the whole genes of soybean by MGI platform showed that the sequencing data was of good quality and had a high comparison rate with the reference genome, which met the requirements of subsequent analysis, and the variation detection and annotation of SNP and Indel were carried out, which indicated that the MGI platform could be used to perform whole gene resequencing analysis on other samples in the future.[/font][/font][b][font='Times New Roman']Keywords:[/font][font=宋体] [/font][/b][font=宋体][font=Times New Roman]MGI platform Whole gene resequencing[/font][/font][font='Times New Roman'] [/font][b][font='Times New Roman']1 [font=宋体]研究背景[/font][/font][/b][font='Times New Roman'][font=宋体]大豆是重要的粮食作物和油料作物,也是人类最主要的植物蛋白来源[/font][/font][font=宋体][font=Times New Roman][1][/font][/font][font=宋体][font=宋体]。我国是野生大豆的发源地,有着极其丰富的大豆种质资源基础,但是育种和产量较其他大豆主产国显得略有不足,究其原因是我国对大豆的研究和发掘力度存在不足,因此,对大豆育成品种的改良势在必行。自[/font][font=Times New Roman]2010[/font][font=宋体]年起,大豆群体水平的重测序也全面开展,在大豆的全基因组变异图谱上也得到了一定的研究进展[/font][/font][font=宋体][font=Times New Roman][2][/font][/font][font=宋体][font=宋体]。本研究利用[/font][font=Times New Roman]MGI[/font][font=宋体]平台对大豆全基因组进行重测序分析,挖掘全基因组水平上的突变。[/font][/font][b][font=宋体][font=Times New Roman]2 [/font][font=宋体]实验仪器[/font][/font][/b][font=宋体]主要实验仪器:[/font][font=宋体][font=Times New Roman]MGISP-960[/font][font=宋体]、[/font][font=Times New Roman]MGIDL-T7[/font][font=宋体]、[/font][font=Times New Roman]DNBSEQ-T7[/font][/font][b][font=宋体][font=Times New Roman]3 [/font][font=宋体]实验结果[/font][/font][font=宋体][font=Times New Roman]3.1 [/font][font=宋体]测序数据质量[/font][/font][/b][font=宋体][font=宋体]根据[/font][font=Times New Roman]MGI[/font][font=宋体]平台的测序特点,使用双端测序的数据,要求[/font][font=Times New Roman]Q30[/font][font=宋体]平均比例在[/font][font=Times New Roman]85%[/font][font=宋体]以上,可以看出大豆重测序数据[/font][font=Times New Roman]Q30[/font][font=宋体]平均比例在[/font][font=Times New Roman]94.72%[/font][font=宋体]以上,说明大豆测序数据质量良好,满足分析要求。[/font][/font][font='Times New Roman'] [/font][font='Times New Roman'] [/font][b][font=黑体][font=黑体]表[/font][font=Times New Roman]1 [/font][font=黑体]测序数据统计表[/font][/font][/b][table][tr][td][align=center][font='Times New Roman']Samples[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']ID[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']Clean reads[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']Clean bases[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']GC Content[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']%[/font][font=等线]≥[/font][font='Times New Roman']Q20[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']%[/font][font=等线]≥[/font][font='Times New Roman']Q30[/font][/align][/td][/tr][tr][td][align=center][font='Times New Roman']P117[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']P117[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']169494922[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']25424238300[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']36.18%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']98.49%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']95.27%[/font][/align][/td][/tr][tr][td][align=center][font='Times New Roman']P118[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']P118[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']166483906[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']24972585900[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']36.47%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']98.61%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']95.70%[/font][/align][/td][/tr][tr][td][align=center][font='Times New Roman']P119[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']P119[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']186127112[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']27919066800[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']35.89%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']98.57%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']95.61%[/font][/align][/td][/tr][tr][td][align=center][font='Times New Roman']P120[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']P120[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']192397276[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']28859591400[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']36.46%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']98.22%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']94.72%[/font][/align][/td][/tr][tr][td][align=center][font='Times New Roman']P198[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']P198[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']141636468[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']21245470200[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']37.11%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']98.67%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']95.84%[/font][/align][/td][/tr][tr][td][align=center][font='Times New Roman']P199[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']P199[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']169468714[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']25420307100[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']36.55%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']98.60%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']95.66%[/font][/align][/td][/tr][tr][td][align=center][font='Times New Roman']P200[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']P200[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']155078286[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']23261742900[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']37.90%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']98.77%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']96.14%[/font][/align][/td][/tr][/table][font=Calibri] [/font][font=宋体][font=宋体]样品原始数据碱基质量值可由图[/font][font=Times New Roman]1[/font][font=宋体]看出不存在异常碱基,[/font][font=Times New Roman]6[/font][font=宋体]个大豆碱基测序错误率分布均如图[/font][font=Times New Roman]1[/font][font=宋体]。[/font][/font][align=center][img=,321,]file:///C:/Users/xuxu/AppData/Local/Temp/ksohtml9716/wps1.jpg[/img][font=Calibri] [/font][/align][align=center][b][font=黑体][font=黑体]图[/font] [font=Times New Roman]1 [/font][font=黑体]碱基测序错误率分布图[/font][/font][/b][/align][font=宋体][font=宋体]碱基类型分布检查可用于检测有无[/font][font=Times New Roman]AT[/font][font=宋体]、[/font][font=Times New Roman]GC[/font][font=宋体]分离现象,若有碱基分离现象可能是测序或建库所带来的,并会影响后续分析。高通量所测序为基因组随即打断后的[/font][font=Times New Roman]DNA[/font][font=宋体]片段,由于位点在基因组上的分布是近似均匀的,同时,[/font][font=Times New Roman]G/C[/font][font=宋体]、[/font][font=Times New Roman]A/T[/font][font=宋体]含量也是近似均匀的。因此,根据大数定理,在每个测序循环上,[/font][font=Times New Roman]GC[/font][font=宋体]、[/font][font=Times New Roman]AT[/font][font=宋体]含量应当分别相等,且等于基因组的[/font][font=Times New Roman]GC[/font][font=宋体]、[/font][font=Times New Roman]AT[/font][font=宋体]含量。同样因为重叠等的关系会导致样品前几个碱基[/font][font=Times New Roman]AT[/font][font=宋体]、[/font][font=Times New Roman]GC[/font][font=宋体]不等波动较大,高于其他测序区段,而其它区段的[/font][font=Times New Roman]GC[/font][font=宋体]、[/font][font=Times New Roman]AT[/font][font=宋体]含量相等,且分布均匀无分离现象,如图[/font][font=Times New Roman]2[/font][font=宋体]所示。[/font][/font][align=center][img=,321,]file:///C:/Users/xuxu/AppData/Local/Temp/ksohtml9716/wps2.jpg[/img][font=Calibri] [/font][/align][b][font=黑体][font=黑体]图[/font][font=Times New Roman]2 ATGC[/font][font=黑体]含量分布图[/font][/font][font=宋体][font=Times New Roman]3.2 [/font][font=宋体]与参考基因组的序列比对[/font][/font][font='Times New Roman']3.2.1 [font=宋体]比对结果[/font][/font][/b][font=宋体][font=宋体]将测序得到的大豆样品与参考基因进行序列比对,[/font][font=Times New Roman]bwa[/font][font=宋体]软件主要用于二代高通量测序得到的短序列与参考基因组进行比对,比对结果见表[/font][font=Times New Roman]2[/font][font=宋体],根据比对结果可评估测序数据是否满足后续分析。[/font][/font][align=center][b][font=黑体][font=黑体]表[/font][font=Times New Roman]2 [/font][font=黑体]比对效率统计表[/font][/font][/b][/align][table][tr][td][align=center][font='Times New Roman']Sample_ID[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']Mapped(%)[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']Properly_mapped(%)[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']Averge_depth[/font][/align][/td][/tr][tr][td][align=center][font='Times New Roman']P117[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']99.99%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']98.53%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']25.44[/font][/align][/td][/tr][tr][td][align=center][font='Times New Roman']P118[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']99.99%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']98.55%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']24.9[/font][/align][/td][/tr][tr][td][align=center][font='Times New Roman']P119[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']99.99%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']98.63%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']27.75[/font][/align][/td][/tr][tr][td][align=center][font='Times New Roman']P120[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']99.98%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']98.28%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']28.58[/font][/align][/td][/tr][tr][td][align=center][font='Times New Roman']P198[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']99.99%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']98.58%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']21.26[/font][/align][/td][/tr][tr][td][align=center][font='Times New Roman']P199[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']99.98%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']98.50%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']25[/font][/align][/td][/tr][tr][td][align=center][font='Times New Roman']P200[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']99.99%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']98.13%[/font][/align][/td][td][align=center][font='Times New Roman']23.13[/font][/align][/td][/tr][/table][font=宋体][font=宋体]将比对到不同染色体的[/font][font=Times New Roman]Reads[/font][font=宋体]进行位置分布统计,绘制[/font][font=Times New Roman]Mapped Reads[/font][font=宋体]在参考基因组上的覆盖深度分布图,见图[/font][font=Times New Roman]3[/font][font=宋体]。[/font][/font][align=center][img=,321,]file:///C:/Users/xuxu/AppData/Local/Temp/ksohtml9716/wps3.jpg[/img][font=Calibri] [/font][/align][align=center][b][font=黑体][font=黑体]图[/font][font=Times New Roman]3 Mapped Reads[/font][font=黑体]在参考基因组上的位置及覆盖深度分布图[/font][/font][/b][/align][font=宋体][font=宋体]统计[/font][font=Times New Roman]Mapped Reads[/font][font=宋体]在指定的参考基因组不同区域的数目,绘制基因组不同区域样品[/font][font=Times New Roman]Mapped Reads[/font][font=宋体]的分布图,见图[/font][font=Times New Roman]4[/font][/font][align=center][img=,321,]file:///C:/Users/xuxu/AppData/Local/Temp/ksohtml9716/wps4.jpg[/img][font=Calibri] [/font][/align][b][font=黑体][font=黑体]图[/font][font=Times New Roman]4 [/font][font=黑体]基因组不同区域[/font][font=Times New Roman]Reads[/font][font=黑体]分布图[/font][/font][font=宋体][font=Times New Roman]3.2.2 [/font][font=宋体]插入片段长度检验[/font][/font][/b][font=宋体][font=宋体]通过检测双端序列在参考基因组上的起止位置,可以得到样品[/font][font=Times New Roman]DNA[/font][font=宋体]打断后得到的测序片段的实际大小,即插入片段大小([/font][font=Times New Roman]Insert Size[/font][font=宋体]),它是信息分析时的一个重要参数。插入片段大小的分布一般符合正态分布,且只有一个单峰,[/font][font=Times New Roman]Insert Size[/font][font=宋体]分布图可以展示各个样品的插入片段的长度分布情况。各样品的插入片段长度模拟分布图见图[/font][font=Times New Roman]5[/font][font=宋体]。[/font][/font][align=center][img=,321,]file:///C:/Users/xuxu/AppData/Local/Temp/ksohtml9716/wps5.jpg[/img][font=Calibri] [/font][/align][align=center][b][font=黑体][font=黑体]图[/font][font=Times New Roman]5 [/font][font=黑体]插入片段长度模拟图[/font][/font][/b][/align][b][font=宋体][font=Times New Roman]3.2.3[/font][/font][font='Times New Roman'][font=宋体]深度分布统计图[/font][/font][/b][font='Times New Roman']Reads[font=宋体]定位到参考基因组后,可以统计参考基因组上碱基的覆盖情况。参考基因组上被[/font][font=Times New Roman]reads[/font][font=宋体]覆盖到的碱基数占基因组的百分比称为基因组覆盖度;碱基上覆盖的[/font][font=Times New Roman]reads[/font][font=宋体]数为覆盖深度。基因组覆盖度可以反映参考基因组上变异检测的完整性,覆盖到的区域越多,可以检测到的变异位点也越多。[/font][/font][font='Times New Roman'][font=宋体]覆盖度主要受测序深度以及样品与参考基因组亲缘关系远近的影响。基因组的覆盖深度会影响变异检测的准确性,在覆盖深度较高的区域(非重复序列区),变异检测的准确性也越高。[/font][/font][font='Times New Roman'][font=宋体]另外,若基因组上碱基的覆盖深度分布较均匀,也说明测序随机性较好。样品的碱基覆盖深度分布曲线和覆盖度分布曲线见图[/font][/font][font=宋体][font=Times New Roman]6[/font][font=宋体]。[/font][/font][align=center][img=,321,]file:///C:/Users/xuxu/AppData/Local/Temp/ksohtml9716/wps6.jpg[/img][font=Calibri] [/font][/align][align=center][b][font=黑体][font=黑体]图[/font] [font=Times New Roman]6 [/font][font=黑体]深度分布统计图[/font][/font][/b][/align][b][font=宋体][font=Times New Roman]3.3 [/font][font=宋体]变异检测[/font][/font][font=宋体][font=Times New Roman]3.3.1 SNP[/font][font=宋体]检测与注释[/font][/font][/b][font='Times New Roman'][font=宋体]根据变异位点在参考基因组上的位置以及参考基因组上的基因位置信息,可以得到变异位点在基因组发生的区域(基因间区、基因区或[/font]CDS[font=宋体]区等),以及变异产生的影响(同义非同义突变等)。软件可以使用[/font][font=Times New Roman]vcf[/font][font=宋体]格式文件作为输入和输[/font][/font][font=宋体][font=宋体]出,见图[/font][font=Times New Roman]7[/font][font=宋体]和图[/font][font=Times New Roman]8[/font][font=宋体]。[/font][/font][align=center][img=,321,]file:///C:/Users/xuxu/AppData/Local/Temp/ksohtml9716/wps7.jpg[/img][font=Calibri] [/font][/align][align=center][b][font=黑体][font=黑体]图[/font][font=Times New Roman]7 SNP[/font][font=黑体]突变类型分布图[/font][/font][/b][/align][align=center][img=,344,]file:///C:/Users/xuxu/AppData/Local/Temp/ksohtml9716/wps8.jpg[/img][font=Calibri] [/font][/align][b][font=黑体][font=黑体]图[/font][font=Times New Roman]8 SNP[/font][font=黑体]注释分类图[/font][/font][font=宋体][font=Times New Roman]3.3.2 Indel[/font][font=宋体]检测与注释[/font][/font][/b][font=宋体][font=宋体]根据所有样品在[/font][font=Times New Roman]CDS[/font][font=宋体]区和全基因范围的[/font][font=Times New Roman]Indel[/font][font=宋体]长度进行统计,其长度分布如图[/font][font=Times New Roman]9[/font][font=宋体]。[/font][/font][align=center][img=,355,]file:///C:/Users/xuxu/AppData/Local/Temp/ksohtml9716/wps9.jpg[/img][font=Calibri] [/font][/align][align=center][b][font=黑体][font=黑体]图[/font][font=Times New Roman]9 [/font][font=黑体]全基因和编码区[/font][font=Times New Roman]Indel[/font][font=黑体]长度分布图[/font][/font][/b][/align][font='Times New Roman'][font=宋体]根据样品检测得到的[/font]Ind[/font][font=宋体][font=Times New Roman]el[/font][/font][font='Times New Roman'][font=宋体]位点在参考基因组上的位置信息,对比参考基因组的基因、[/font]CDS[font=宋体]位置等信息,可以注释[/font][font=Times New Roman]Indel[/font][font=宋体]位点是否发生在基因间区、基因区或[/font][font=Times New Roman]CDS[/font][font=宋体]区、是否为移码突变等。发生移码突变的[/font][font=Times New Roman]Indel[/font][font=宋体]可能会导致基因功能的改变,具体注释结果见[/font][/font][font=宋体][font=宋体]图[/font][font=Times New Roman]10[/font][font=宋体]。[/font][/font][align=center][img=,344,]file:///C:/Users/xuxu/AppData/Local/Temp/ksohtml9716/wps10.jpg[/img][font=Calibri] [/font][/align][align=center][b][font=黑体][font=黑体]图[/font] [font=Times New Roman]10 Indel [/font][font=黑体]注释分类图[/font][/font][/b][/align][b][font=宋体][font=Times New Roman]4 [/font][font=宋体]结论[/font][/font][/b][font=宋体][font=宋体]本文基于[/font][font=Times New Roman]MGI[/font][font=宋体]对大豆进行重基因测序,实验结果可看出,大豆样品测序产出数据良好,与参考基因组序列比对率较高,符合后续分析,对其进行变异检测可得到[/font][font=Times New Roman]SNP[/font][font=宋体]和[/font][font=Times New Roman]Indel[/font][font=宋体]的结果。其它研究表明[/font][/font][font=宋体][font=Times New Roman]MGISEQ-2000[/font][font=宋体]全基因组重测序表现性能稳定、质量可靠,在实际应用上有明显的优势和应用价值[/font][font=Times New Roman][3][/font][font=宋体]。对[/font][/font][font=宋体][font=宋体]本次实验说明[/font][font=Times New Roman]MGI[/font][font=宋体]平台对样品进行重测序效果良好,后续可对其它植物进行重测序。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体] [/font][font=宋体]参考文献:[/font][font=宋体][font=Calibri][1] [/font][/font][font='Times New Roman'][font=宋体]张永芳[/font],[font=宋体]钱肖娜[/font][font=Times New Roman],[/font][font=宋体]王润梅[/font][/font][font=宋体][font=Times New Roman],[/font][font=宋体]等[/font][font=Times New Roman]. [/font][font=宋体]不同大豆材料的抗旱性鉴定及耐旱品种筛选[/font][font=Times New Roman][J].[/font][font=宋体]作物杂志[/font][font=Times New Roman],2019(5): 41-45.[/font][/font][font=宋体][font=Calibri][2] [/font][font=宋体]邬启帆[/font][font=Calibri]. [/font][font=宋体]基于基因组重测序黄淮海大豆育成品种遗传结构及重要家族遗传基础研究[/font][font=Calibri][D]. [/font][font=宋体]南昌[/font][/font][font=宋体][font=宋体]大学[/font][font=Times New Roman], 2023.[/font][/font][font=宋体][font=Calibri][3] [/font][/font][font=宋体][font=宋体]李伟宁[/font][font=Times New Roman],[/font][font=宋体]刘刚[/font][font=Times New Roman],[/font][font=宋体]周荣等[/font][font=Times New Roman]. MGISEQ-2000[/font][font=宋体]、[/font][font=Times New Roman]HiSeq 2000[/font][font=宋体]与[/font][font=Times New Roman]NovaSeq 6000[/font][font=宋体]平台全基因组重测序数据的比较分析[/font][font=Times New Roman][J]. [/font][font=宋体]中国畜牧杂志[/font][font=Times New Roman],2021,57(11):156-162.[/font][/font]

  • 【原创】关于会员登陆的问题

    最近一段时间登陆论坛时刚登陆还没一分钟点论坛或者帖子时就会出现“对不起,系统校验失败,请您重新登陆!!“搞得我现在每过几分钟就要重新登陆一次这是什么原因?http://simg.instrument.com.cn/bbs/images/brow/emyc1010.gif是我的电脑问题还是?

  • 验证码登陆后不能翻页

    验证码登陆后不能翻页

    http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/09/201109091758_315383_1609375_3.jpg左边是验证码登陆,右边是登陆后死在那个位置不能翻页。从新上网却又是登陆成功的页面。别的网不这样。

  • 【讨论】登陆后浏览显示个人积分信息

    我是新手,浏览信息时没看见个人登陆信息和积分情况,如果可以我希望能显示这两项,这样可以明确自己登陆状态,也可以知道自己能不能下载文件(积分够不够),免得要去个人信息窗口查询,太麻烦。如果有这两个功能,请指教,谢过。

  • 手机无法登录!

    前段时间一般用电脑上论坛,基本上没用手机登录过。今天想登录一下,结果竟然登录不了,提示“请不要跨站登录”!个人中心和首页两处登录都试了,提示一样如上;帖子里面的登录框无法登录,也不出提示,输入信息点“登录”之后页面右上角还是没有用户信息,而是显示“注册”和“登录”这两个按钮。这是不是前段时间防止恶意攻击的招啊……手机操作系统:Blackberry OS v4.2 浏览器:Opera mini v4.2还有一个小疑问,为什么现在页面比以前耗流量一些了。个人中心登录页面加载图片现在有36K左右,以前只有16K左右;首页加载图片现在168K左右,以前103K。为什么强调“加载图片”,因为现在登录要输入验证码,不加载图片不行。以前没有验证码的时候,我全部不加载图片,个人中心页面只有6K,帖子页面18K(通常,文字和图片较多的除外),首页34K。这些数据都是浏览器实时显示的,连接的时候就会显示页面大小和加载进度,原来不用电脑上的时候用手机上得比较多,所以记得很清楚。记得原来有一帖,【有奖调查】用户使用手机上网行为调查,疯子哥说过今年一定会出手机版论坛,不知道能不能实现啊~干脆把问题都说了,原来能登录的时候,只能在用快速回复框回帖,“回复本帖”、“高级回复”、“发主题帖”和“编辑”功能都不能用(四者原理是一样的),“举报”和“管理”下面的功能都可以用,只是弹flash反应会比较慢。希望早日出手机版论坛,至少能实现“登录”、“打卡签到”、“领取时长奖励”、“领取周全勤奖”、“发主题帖”、“回复本帖”、“高级回复”和“编辑”等基本功能!

  • 恭喜:上海安谱成功登陆新三板

    上海安谱成功登陆新三板仪器信息网2015/03/04 15:51:11 点击 96 次仪器信息网讯 2015年2月11日,上海安谱实验科技股份有限公司在全国中小企业股份转让系统顺利挂牌(证券简称:安谱实验,证券代码:832021),所属行业为批发业,法定代表人为夏敏勇,总股本为3000.00万股,无流通股。其前身为上海安谱科学仪器有限公司。  上海安谱实验科技股份有限公司,于1997年组建成立,为上海市高新技术企业,主要产品包括色谱产品、化学试剂、标准品、实验室用品、分析仪器配件及耗材等;总部位于上海,目前拥有200多位员工,年销售额连续五年过亿元,处于中国色谱消耗品行业的前列。  长江证券股份有限公司在推荐上海安谱实验科技股份有限公司股票进入全国中小企业股份转让系统挂牌的推荐报告中提到:  2014年6月5日,安谱有限股东会决议同意公司整体变更为股份有限公司,安谱有限全体 27位股东作为发起人签署了《发起人协议》。 2014年 6月 25日,安谱实验全体发起人召开创立大会暨第一次股东大会, 一致同意将安谱有限以截至 2014 年 3 月 31 日经审计的净资产 91,235,649.80元为基础,扣除人民币 14,632,681.68 元用于派现,剩余净资产人民币 76,602,968.12 元按 1: 0.3916297 的折股比例折合为公司发起人股份 30,000,000 股,每股面值人民币 1 元,余额人民币 46,602,968.12 元计入资本公积,整体变更为上海安谱实验科技股份有限公司,变更后各股东持股比例保持不变。  2012年、2013年和2014年1-6月公司向国外供应商采购的金额分别为4,993.61万元、4,596.68万元和2,539.76万元。 上述海外采购均采用外币计价。  截至2014 年6月30日,公司应收账款净额为2,291.67万元,占流动资产和总资产的比例 分别为 19.36%和 17.51%。

  • 建议减少登陆麻烦

    不知道是不是我不熟悉还是网站本身如此设置的,每次从仪器网首页登陆,再进入仪器论坛,还得用用户名登陆,其实两个的就是一样的,能把它简化吗?在一个网站内所有需要登陆的地方只要登陆一次就能通用,这对用户来说很方便。好像本论坛还不能保存cookie,每次登陆都得输入,感觉没有色谱网那些方便。

  • 【原创】关于领取登陆积分的建议

    登陆论坛时会跳出领取登陆积分的提示,但进入的步骤很烦复,是否可以更人性化一点?例如:把提示上的“确定”改为“领取”与“退出”供版友选择,不想要的可点“退出”,想领取的点“领取”直接到“做任务得积分”里,然后就可点击“完成任务”了。供参考。

  • 关于登陆人数不多

    能否可以把论坛改为其他方式,可能对于论坛版面是个大大的手术,仅供参考。具体办法:斑竹可以自行设定发贴or回帖,需要一定积分或声望才可以打开。或者只有通过登陆才可以打开。大家被动登陆,把潜水员都赶出来。另外我们的特邀论坛什么时候开始?先从[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/3p][color=#3333ff]离子色谱[/color][/url]开始吧。

  • 原账号无法登陆网站

    管理员好!我是数据处理板块居民whuisvfg ,很长时间用原原账号和密码无法登陆网站了,不知何因?也不知道何处申告。现在重新注册,功能有许多限制。不知能否恢复原来账号网名。谢谢!

  • 【讨论】晒一下我这个星期的登陆次数,看一下我的登陆记录

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  • 美中特别委员会提议禁止华大智造等多家中国生物公司

    美国与中国共产党战略竞争众议院特别委员会主席迈克加拉格尔(R-WI)和高级成员拉贾克里希纳莫蒂(D-IL)今天提出了一项法案,以确保外国生物技术公司无法获得美国纳税人的资金。一旦颁布,该立法将限制联邦资助的医疗服务提供者使用外国对手生物技术公司,包括华大基因集团及其子公司华大智造和Complete Genomics,以及另一家中国-公司药明康德。罗姆尼参议员表示: “中国的生物技术公司正在通过医疗诊断测试收集世界各地数百万人的基因和敏感健康数据,以使中国占据上风。” “我们的两党立法禁止与中国有联系的公司签订联邦合同和融资机制,这有助于确保美国纳税人的钱不能被用来补贴威胁我们国家安全的生物技术公司。”“每天,美国人都会抽血或接受其他医学检查以保护他们的健康。但是,很少有人确切知道谁有权访问这些样本中包含的 DNA 信息,或者他们会如何使用这些信息。从 DNA 检测试剂盒到医疗诊断,随着生物技术领域在日常生活中变得越来越重要,外国对手控制的生物技术公司构成的威胁持续增长。”?“这项法案将保护美国人的个人健康和遗传信息免受外国对手的侵害,这些对手有能力和动机利用这些信息来破坏我们的国家安全。美国Complete Genomics (CG) 公司成立于2005年,是全球首家提供人类基因组测序服务的生命科学公司。CG公司独有DNA纳米球(DNA nanoball,DNB) 芯片及组合探针错定连接 (combinatorialprobe anchor ligetion,cPAL) 这两种测序相关技术,2013年被华大基因收购,并成立华大智造公司单独发展基因测序仪,依托于相关技术,华大智造目前已经是国际主流基因测序仪供应商之一。[来源:仪器信息网] 未经授权不得转载[align=right][/align]

  • 【讨论】关于论坛登陆设置

    大家好,最近身体不好,所以人很懒散,上论坛的时候,我想能否在登陆的旁边设置一个记住密码,这样省事点,每次打开网页,自动登陆就好了,大家认为呢?

  • 帖子列表新登录界面无法登录

    帖子列表新登录界面无法登录

    http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2012/11/201211031501_401062_2193245_3.jpg未登录状态打开帖子列表页,会自动弹出如上图所示的登录页,输入账号密码(论坛的,非第三方)后无法登录,仍然是未登录状态。IE8.0.7600

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