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植物细胞壁

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植物细胞壁相关的资讯

  • 北京林业大学植物细胞壁拉曼光谱大数据分析取得新突破
    近期,北京林业大学材料学院许凤教授团队在植物细胞壁拉曼光谱大数据处理技术上取得新突破。该技术成果构建了基于主成分分析的植物细胞壁拉曼光谱聚类分析方法,相关研究成果“Method for Automatically Identifying Spectra of Different Wood Cell Wall Layers in Raman Imaging Data Set”发表在《Analytical Chemistry》上。该期刊为美国化学会旗下国际分析化学领域顶级期刊,最新影响因子5.636,五年影响因子5.966。  拉曼光谱成像技术具有信息丰富、制样简单、对样品无损伤等特点,近年来已成为研究植物细胞壁局部化学的重要工具。然而,拉曼光谱分类技术落后,严重制约了光谱数据的深入挖掘及科学运用。传统的分类技术通过导出实验数据进行手动分析,不但费时费力,人为因素干扰严重,更会造成数据浪费,甚至丢失重要信息。针对这一问题,许凤教授团队经过探索创新,基于细胞壁超微结构特点,率先采用数学统计学结合自主研发的计算机程序分析处理植物细胞壁拉曼光谱数据,建立了快速分辨细胞壁不同形态学区域拉曼光谱的新方法。该方法能够根据植物拉曼光谱的自身特点,对所获海量拉曼光谱数据进行自动、准确、快速分类,将为植物细胞壁化学组分拉曼光谱定量研究提供理论依据。论文投稿期间,审稿人一致评价该方法创新性突出,对生物质相关领域的研究具有重要意义。  发表在《Analytical Chemistry》上的论文第一作者为北京林业大学材料学院林产化学加工工程学科2014级博士研究生张逊,论文发表获得国家杰出青年科学基金的资助。目前,在许凤教授的指导下,张逊正开展基于该技术的相关研究,希望在植物细胞壁拉曼光谱的定量分析上能有新的突破。
  • NEPA21高效电转化未去除细胞壁的衣藻
    2013年最新发表的一篇文章报到了,使用电转方法(NEPA21高效基因转染系统)成功高效转化了未去除细胞壁的衣藻,为人们进行植物细胞的转化提供了新思路。 衣藻作为单细胞藻类,常被用于基础生命活动的研究,如光合作用,细胞周期调控以及细胞运动等。植物细胞转化前通常要去除细胞壁(或使用无细胞壁的突变株),比较费时,而突变株细胞往往比较脆弱,且不适于某些实验,如光合作用的测定等。 FIG. 2. (A) Colonies of hygromycin-resistant transformants plated on TAP agar medium containing 30 mg/mL hygromycin B. (B) Fluorescent signal of LCIBeGFP derived from transformants with the pTT1-LciB-GFP plasmid using NEPA21. Obvious ring fluorescence signals are present around the pyrenoid structure, as previously shown (12).Bar: 5 mm. Rapid transformation of Chlamydomonas reinhardtii without cell-wall removal http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1389172312005348
  • 透射电镜在植物科学中的应用
    近年来,透射电镜在植物研究中应用广泛,但由于植物细胞的生物学特征的特殊性,使植物样品的制备难度增大,针对植物细胞壁坚硬等问题,经过1000多个植物样品的制样和观察,其中包括植物的花粉、茎、叶、根、果实等组织细胞结构,对植物样品的制备技术进行改良,植物样品采用定制化方案,使植物的超微结构形态得到清晰的呈现。应用1:观察植物叶肉细胞的叶绿体和淀粉粒本图主要展示水稻叶片一个完整的叶肉细胞(前,X4000),单个叶绿体和叶绿体中的淀粉粒(后,X20000)本图主要展示拟南芥的叶绿体(前,X6000),单个叶绿体(后,X15000)本图主要展示的叶绿体类囊体(前,X30000),放大图,片层和垛叠(后,X100000)应用2:观察植物细胞的胞间连丝高等植物细胞之间通过胞间连丝相互连接,完成植物细胞间的通讯连接,是细胞间物质运输与信息传递的重要通道;胞间连丝见于所有的高等植物、某些低等植物如有些藻类以及真菌。胞间连丝的主要功能是:①细胞间物质包括小泡的运输和转移;②信息、刺激的传导;③影响细胞的生长、发育和分化。本图主要展示竹子叶片的胞间连丝(前,X5000),放大图(后,X10000)应用3:观察植物下胚轴下胚轴即子叶着生部位(子叶节)与根之间的轴状部分。它与根之间的界限不易区分,但有的植物下胚轴与根之间有轴环存在。通常为根茎之间维管组织发生变化的过渡区段,其内部的维管组织结构复杂,形态多种多样。本图主要展示拟南芥胚轴(前,X6000),放大图(后,X12000)应用4:观察花粉花粉是典型的制备难度较大的透射电镜样品,很难观察到样品的超微结构。本图主要展示一个完整的花药(前,X6000),放大图(后,X25000)应用5:观察植物根、茎、叶本图主要展示玉米束鞘细胞围成的一个完整的花环结构(前,X2500),玉米束鞘细胞和叶肉细胞(后,X6000)。
  • 植物重金属创新科研平台成果:曼陀罗镉胁迫研究
    2005年~2020年,NMT已扎根中国15年。2020年,中国NMT销往瑞士苏黎世大学,正式打开欧洲市场。国内科研人员基于自主底层核心技术——NMT非损伤微测技术,建立的“植物重金属独有创新科研平台”,已经取得了近百项研究成果,联盟将持续为您展示此平台成果案例。联盟已开始提供“植物重金属独有创新科研平台”的建立服务,咨询请联系中关村NMT联盟期刊:农业资源与环境学报标题:曼陀罗对镉的吸收及其亚细胞分布研究样品:曼陀罗检测指标:Cd2+作者:河南农业大学资源与环境学院杨素勤、张彪摘 要为研究曼陀罗对重金属镉的耐性机制,以前期筛选的曼陀罗(Datura stramonium L.)为试验材料,通过水培方式探究镉(Cd)胁迫下曼陀罗对Cd的吸收累积特性及其在植株体内的亚细胞分布特征。结果表明:介质中Cd无论低浓度还是高浓度,曼陀罗各部位的Cd含量都表现为根茎叶,但迁移系数差异不显著。曼陀罗根系Cd2+ 流速在不同位置具有显著差异,其中分生区和伸长区的Cd2+ 流速显著大于根冠区和成熟区。当介质中Cd浓度由0.1 mgL-1增至2.5 mgL-1时,细胞壁和细胞液中Cd含量之和所占比例显著增大。研究表明,曼陀罗根系对Cd2+ 的吸收主要集中在分生区和伸长区,当介质中Cd浓度较低时,根系中细胞壁对Cd向上运输的限制及茎叶中细胞液对Cd的区室化起重要的作用 当Cd浓度较高时,根部细胞各组分中细胞液所占比重增加,Cd由根系向上迁移,此时茎叶中细胞壁对Cd的固定作用增强,其可能是曼陀罗耐受高Cd胁迫的机制之一。
  • 五洲东方参加中国植物学会植物细胞生物学专业委员会2010年学术年会
    2010年10月29-31日,由中国植物学会细胞生物学专业委员会主办的中国植物学会细胞生物学专业委员会2010年学术年会在风景秀丽的中国南京紫金山山麓的国际会议大酒店召开。 来自包括清华、北大、上海交大、武大、浙大、南大、中国农大、南京农大,以及中科院系统等在植物学领域的院士既学者教授超过300位参与了这次会议。五洲东方作为特邀赞助商也参加了本次会议,并在大会上由产品经理刘凯敏做了《全自动梯度准备与分离系统》的专题报告。 两天的主题会议中,各位知名学者教授从多个方面阐述了植物在发育遗传中的信号转导既调控机制。需要特别注意的是植物在不同光合作用条件下,或在高光强、低温、干旱、高盐等逆境胁迫下的调控机理正在成为新的研究热点,而此类研究往往需要良好的植物培养条件。比如可以调控不同光谱(红、蓝、远红等)条件下的培养箱(三色光培养箱),可以调控不同湿度、温度(零下15℃到60℃)、光强(最高1200umol/m2/s)并可根据各种培养条件进行温/湿/光编程的培养箱。同时,对植物细胞组分的精确分离也成为研究后期的重要步骤。 基于上述热点,众多老师对我公司的美国PERCIVAL植物培养箱以及加拿大BIOCOMP全自动密度梯度制备和分离系统表现出了浓厚的兴趣。
  • 安捷伦科技大力支持“第一届植物次生代谢国际会议”
    由中国植物生理学会、中国科学院上海生命科学研究院和中国科学院昆明植物研究所联合主办的&ldquo 第一届植物次生代谢国际会议&rdquo 于2008年6月9日至10日在云南省昆明市召开。 300余位来自世界各地的相关科研工作者参加此次会议,共享植物次生代谢及代谢组学研究领域中的最新知识和进展。会议研讨内容涉及天然产物和细胞壁的生物合成与调控、代谢网络、代谢组学和代谢工程。 安捷伦科技有限公司作全程参与该次会议,并特邀世界著名Scripps质谱研究中心的Williams Wikoff博士作了题为&ldquo Navigating a Path from Metabolomics Methods to Biology&rdquo 的大会报告。报告以深入浅出的方式向与会者介绍了代谢组学的概念、研究对象、研究方法及从代谢组学到系统生物学研究路径,并展示了以安捷伦最新的四极杆-飞行时间串联质谱系统(Q-TOF)及专用代谢组学软件为技术平台的研究实例,引起了与会者的热烈讨论。
  • 遗传发育所在植物磷酸化蛋白质组学技术研发方面获进展
    蛋白质磷酸化是在激酶催化下将磷酸基团转移到底物蛋白质上的可逆过程,是能够调控蛋白质结构与功能且参与细胞内信号转导的重要翻译后修饰,在植物的生长、发育、环境适应以及作物的产量和品质调控中发挥着重要作用。深度解析磷酸化蛋白质组,是探讨磷酸化如何参与这些生物学过程以及筛选与作物重要农艺性状相关的关键磷酸化靶点的有效手段。然而,与动物相比,植物磷酸化蛋白质组的深度解析在技术上更具挑战性。这是由于植物细胞具有致密的细胞壁和大量的色素以及其他次生代谢物。前者增加了蛋白质提取的难度,而后者干扰了磷酸肽富集的效率和特异性。 中国科学院遗传与发育生物学研究所汪迎春研究组通过探索一系列的实验条件,研发出高效的植物磷酸化蛋白质组学新技术。该技术的主要特点是利用脱氧胆酸钠高效抽提植物蛋白,同时消除常规方法中导致样品损失和灵敏度降低的两个步骤,即在蛋白酶消化前的样品净化和在磷酸肽富集前的脱盐处理,在色素与其他干扰分子共存的情况下进行高特异性、高灵敏度地磷酸肽富集。 科研人员应用这一方法,在拟南芥、水稻、番茄和衣藻等绿色生物的组织中高效纯化磷酸化蛋白质组(单针质谱可鉴定约11,000个磷酸位点)。由于该技术主要面向高等植物及其他绿色生物(如衣藻),且操作简便,降低了实验所需的人力和试剂费用,因此命名为GreenPhos。GreenPhos可定量分析不同植物的磷酸化蛋白组,分析深度深、定量重复性高,有望成为植物磷酸化蛋白组学的通用技术。研究人员应用该技术,深度解析了拟南芥响应不同时长盐胁迫的差异磷酸化蛋白质组,发现了包括剪接体蛋白和一些激酶响应盐胁迫的磷酸化事件。 11月27日,相关研究成果在线发表在《分子植物》(Molecular Plant,DOI:10.1016/j.molp.2023.11.010)上。研究工作得到国家重点研发计划与中国科学院战略性先导科技专项的支持。中国科学院植物研究所的科研人员参与研究。GreenPhos工作流程及多种绿色生物磷酸化蛋白质组鉴定结果
  • iCEM 2017特邀报告:植物样品电镜技术
    p style=" text-align: center " strong 第三届电镜网络会议(iCEM 2017)特邀报告 /strong /p p style=" text-align: center " strong 植物样品电镜技术 /strong /p p style=" text-align: center " strong img width=" 250" height=" 291" title=" 洪健标准照.jpg" style=" width: 250px height: 291px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201705/insimg/f32c0971-5ce3-4ac3-8def-168a2f430fa4.jpg" border=" 0" vspace=" 0" hspace=" 0" / /strong /p p style=" text-align: center " & nbsp /p p style=" text-align: center " strong 洪健 教授 /strong /p p style=" text-align: center " strong 浙江大学 /strong /p p    strong 报告摘要: /strong /p p   用电子显微镜研究植物细胞,其实验方法大都借鉴于动物细胞研究方法。由于植物细胞具有细胞壁、液泡、质体和低浓度蛋白等诸多特点,要求其制样方法与现有的动物组织制样方法有所不同。一些特殊的植物样品如种子、花粉、水生植物、藻类、感病植物等,需要进行各种条件的摸索,如固定剂种类及浓度、渗透压、pH值、固定时间、固定方法等。在本次网络讲课中,将主要针对植物细胞的特殊性,介绍电镜制样方法以及研究应用的实例。 /p p   1.植物组织电镜样品制备的特殊性 /p p   2.植物样品透射电镜常规制备方法 /p p   3.一些特殊植物样品的制备方法 /p p   4. 植物细胞化学和元素分析技术 /p p   5. 植物样品的扫描电镜研究方法 /p p    strong 报告人简介: /strong /p p   洪健,浙江大学农生环测试中心副主任,电镜中心主任,浙江大学技术系列“求是”特聘教授。长期从事生物电子显微学、植物细胞超微结构、植物病毒学的科研教学工作,所在实验室为浙江省电镜中心(生命科学)、教育部CERS系统生物电镜示范机组,拥有Hitachi SU8010, Hitachi H-7650, Hitachi TM-1000, JEOL JEM-1230, JEOL JEM-1010, JEOL JEM-1200EX, FEI XL-30, KYKY-EM3200等多台透射电镜和扫描电镜。 /p p   近年来承担国家、省市科研项目20余项,其中主持国家自然科学基金面上项目5项、农业部公益性行业科研专项子课题1项,杭州市重大科技创新项目1项。在国内外学术刊物发表学术论文260多篇,出版《植物病毒分类图谱》等专著6本,起草透射电镜和扫描电镜相关国家标准3个。任中国电镜学会常务理事,农林电镜专业委员会主任;全国微束分析标准化技术委员会委员;中国微生物学会病毒专业委员会委员;浙江省分析测试协会副理事长,电镜与X衍射专业委员会副主任;浙江细胞生物学学会常务理事。 /p p    strong 报告时间:2017年6月23日上午 /strong /p p   strong  立即免费报名: a title=" " href=" http://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/iCEM2017/" target=" _blank" http://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/iCEM2017/ /a /strong br/ /p p style=" text-align: center " & nbsp a title=" " href=" http://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/iCEM2017/" target=" _self" img title=" 点击免费报名参会.jpg" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201705/insimg/c9793b9d-a3ec-4cb2-a453-330b3d0cbf03.jpg" / /a /p
  • 安捷伦公司金牌赞助第二届植物代谢国际会议
    安捷伦公司金牌赞助第二届植物代谢国际会议 2011年6月30日,第二届植物代谢国际会议在美丽的海滨之城青岛隆重拉开帷幕。大会以&ldquo 植物代谢与现代农业&rdquo 为主题,邀请到近400位国际植物代谢领域著名科学家分享和讨论了萜类、维生素、酚类、色素和细胞壁的生物合成,碳和氮的代谢,代谢组学和代谢工程等诸多研究方向的最新进展和发展趋势。 作为生命科学领域重要的解决方案供应商,安捷伦公司此次重点以植物代谢组学为主题参与了相关的学术及展示活动。近年来,安捷伦在代谢组学领域经过不断的积累与发展,目前可提供业内最为完备的代谢组学解决方案。从代谢组学应用领域上,安捷伦可全面提供包括疾病、健康、临床、药物开发、植物、营养、食品、中药代谢组学、系统生物学等解决方案;从产品平台上,安捷伦是目前全球唯一能够同时提供一流的液相色谱仪,液质联用仪、气相色谱仪、气质联用仪、毛细管电泳仪、毛细管电泳质谱联用仪及迄今最全面的适用于气质、液质系统的内源性代谢物数据库和谱库,以及当今最强大的生物信息学软件的方案供应商。 于7月1日晚进行的大会学术交流活动上,来自安捷伦公司的液质联用应用工程师冉晓蓉博士为大家带来了题为《Agilent New Bioinformatics Tools and Its Application on Metabolic Biomarkers Discovery》(安捷伦最新生物信息学软件及在植物代谢组学中应用)的精彩报告。报告主要围绕以下安捷伦独特的代谢组学方案进行了探讨和阐释:植物代谢物在生物系统中扮演着重要的角色,其在体内的变化可以为生物化学研究提供非常有价值的信息。通过代谢组学手段寻找的代谢标记物与基因、蛋白所构建的相互作用网络可以有效的研究植物的代谢及调控。安捷伦提供行业内植物代谢组学研究功能最全面的软件解决方案- Mass Profiler Professional(MPP)。MPP覆盖化学计量学分析、潜在生物标记物鉴定及代谢通路分析,其最新配套的样本类别预测功能可有效的对植物产地进行溯源,MPP强大的功能无疑可以为植物及中药代谢组学的研究提供最全面的软件支持。 上述讲座内容引发在场听众的高度关注与热烈讨论,冉晓蓉博士就大家所普遍关心的问题逐一给予详细解答。MPP软件除支持路径与数据库的用户自定义扩充外,还可兼容多种数据格式,因此能够灵活有效地进行第三方数据分析,方便用户在已有工作基础上,进行组学乃至系统生物学全面、系统的深入研究。   有关安捷伦代谢组学更多信息及材料索取,请登录网站:   http://www.antpedia.com/special/118-collection.html   http://www.metabolomics-lab.com/ 关于安捷伦科技 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,同时也是通信、电子、生命科学和化学分析领域的技术领导者。公司的18500 名员工为100 多个国家的客户提供服务。在2010 财政年度,安捷伦的业务净收入为54 亿美元。要了解更多安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn。
  • 农科院建立植物细胞无机磷可视化高效检测技术
    近日,中国农业科学院农业资源与农业区划研究所土壤植物互作创新团队建立了植物细胞无机磷可视化高效检测技术,并揭示了植物细胞无机磷分布调控新机制,相关研究成果发表在《自然—植物》(Nature Plants)上。研究提出了一种快速比色无机正磷酸盐(PI)成像方法--无机正磷酸盐染色法(IOSA),该方法可以对细胞内PI进行高分辨率的半定量成像。水稻根系伸长区细胞无机磷分布模式。中国农科院供图磷是植物生长发育必需的营养元素。植物根系主要吸收无机正磷酸盐,其也是植物体内磷循环利用的最主要形态。当磷素充足时,植物体内无机磷含量能占到总磷的80%左右。因此,明确植物无机磷的细胞分布模式是研究植物磷素高效利用调控机制的关键。然而,目前对植物组织细胞间无机磷的分布和储存模式仍不清楚,主要原因是缺乏高效的植物细胞无机磷可视化检测技术。研究团队建立了植物细胞无机磷可视化高效检测技术。与现有检测技术相比,该技术具有费用低、耗时短、操作简单、不受植物种类及组织部位限制等诸多优势。利用该技术,研究人员明确了水稻和拟南芥组织细胞无机磷主要的分布模式;发现了已知磷素核心调控因子的新功能,并筛选克隆到了新的水稻叶片细胞磷再利用调控因子。该研究为磷养分分子调控机制研究提供了技术支撑,也为作物磷高效遗传改良提供了新基因资源。该研究得到国家自然科学基金重点项目、优青项目、面上项目,以及中国农科院科技创新工程等项目资助。
  • 天津大学MFCM微流控流式细胞技术进展|针对原生质体样品的分析
    要更好地了解原生质体的表型异质性,需要对许多单个细胞的形态和代谢特征进行全面分析。在单细胞表型分析方面,流式细胞仪已证明其具有高通量定量分析和分离目标生物样品的能力。然而,传统的流式细胞仪体积庞大、复杂且需要高技能的人员。随着微流控技术的发展,微流控已与流式细胞仪相结合(MFCM),实现了强大的单细胞聚焦、检测和分选,已在各种生物应用中得到证明 ,包括单细胞 RT-PCR、干细胞筛选、蛋白质分析等。虽然 MFCM 已被证明是医学诊断和动物细胞研究中单细胞操作和分析的强大工具,但在植物细胞特性方面的类似工作仍然远远落后。天津大学环境科学与工程学院的Xingda Dai等人开发了一种带有荧光传感器的微流控流式细胞仪,为原生质体样品的分析提供了一种简单、直接且具有成本效益的解决方案。原生质体是植物细胞,其中细胞壁已被酶促或机械去除,是生物技术应用(如体细胞杂交和遗传转化)的非常有效的实验模型。原生质体提供了悬浮培养中的多细胞组织和细胞组装体所没有的许多细胞学优势,因此是研究细胞过程(如信号转导、细胞壁再生、压力和激素的作用等)的宝贵实验系统。然而,在细胞壁消化后,产生的原生质体是渗透敏感的、脆弱的结构,需要格外小心以保持其完整性。此外,原生质体的直径通常比哺乳动物细胞大,并且不像动物细胞那样粘附,因此使用流式细胞仪分析原生质体群体需要对仪器配置进行重大更改,并且极难实现稳定的流动。下图就是文章中所用的微流体流式细胞仪。(A) 开发平台示意图;(B) 已开发平台的照片;(C) 单个植物细胞通过通道的延时图像;(D) 单个植物细胞双通道荧光检测的实时响应。首先,基于用二氯二氢荧光素二乙酸酯 (DCFH-DA)染料检测拟南芥叶肉原生质体细胞内活性氧 (ROS) 的变化,研究了 H2O2、温度、紫外线 (UV) 和镉离子等各种外部应激因素对细胞内 ROS 积累的影响。下图显示的是外源 H2O2 介导的拟南芥原生质体 ROS 含量的变化。(A) 原生质体的荧光图像,比例尺为 25 µm;(B-D) 分别在 3、6 和 9 小时后由原生质体中的 H2O2 浓度诱导的荧光强度梯度;(E) H2O2 处理时间对原生质体荧光强度的影响。下图显示的是环境压力下拟南芥原生质体的氧化还原状态。(A) 原生质体在不同温度下的荧光图像,比例尺为 25 µm;(B) 原生质体在不同温度胁迫下的荧光强度;(C) Cd2+处理的原生质体荧光图像,比例尺为25 µm;(D) Cd2+下原生质体的荧光强度;(E) 紫外处理下原生质体的荧光图像, 比例尺为 25 µm (F) 紫外线下原生质体的荧光强度其次,从白色花瓣中分离出的矮牵牛原生质体比从紫色花瓣中分离出的原生质体中观察到更快和更强的氧化爆发,证明了花青素的光保护作用。第三,使用具有不同内源性生长素的突变体,证明了生长素在原代细胞壁再生过程中的有益作用。此外,UV-B 照射通过增加细胞内生长素水平具有类似的加速作用。该研究揭示了以前未被充分认识的原生质体群体中的表型变异性,并证明了微流体流式细胞术在评估单细胞水平的植物代谢和生理指标的体内动态方面的优势。
  • 我国著名植物细胞工程专家陈惠民教授逝世
    著名植物细胞工程专家、山东大学生命科学学院陈惠民教授于2010年9月14日辞世,享年89岁。  1980年,陈惠民教授最先将小麦叶片通过组织培养再生植株,成为我国小麦组织培养的奠基人。陈惠民教授科研团队在国际上率先创立了小麦体细胞杂交转移异源染色体小片段的新技术(获国家发明专利),选育了国际首例高产、耐盐/耐旱的小麦渐渗系新品种山融3号和多个新种质;在小麦基因工程育种方面,获得世界上首例抗大麦黄矮病毒的转基因小麦新种质,该成果被国家科委评为“1995年全国十大科技成就”之一。陈惠民教授治学严谨,淡泊名利,追求真理,成就斐然,以渊博的知识精心培育了很多优秀学生,以大仁大爱无私帮助过许多同事和学生,以自己独特的人格魅力影响和教育着他的学生,曾被评为山东大学先进工作者、山东大学优秀教师和驻济高校十大杰出教工,并荣获“山东大学特殊贡献奖”、“全国老教授科教兴国贡献奖”和“全国民主同盟先进个人”称号等。 (http://www.shunstar.com.cn)
  • 1300万!中国科学院分子植物科学卓越创新中心单细胞原位空间蛋白组表型分析系统采购项目
    一、项目基本情况项目编号:OITC-G230302470项目名称:中国科学院分子植物科学卓越创新中心单细胞原位空间蛋白组表型分析系统采购项目预算金额:1300.000000 万元(人民币)最高限价(如有):1300.000000 万元(人民币)采购需求:包号货物名称数量(台/套)是否允许采购进口产品采购预算(人民币)1单细胞原位空间蛋白组表型分析系统1套是 1300万元合同履行期限:详见采购需求本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间:2023年12月01日 至 2023年12月08日,每天上午9:00至11:00,下午13:00至17:00。(北京时间,法定节假日除外)地点:www.oitccas.com方式:登录“东方招标”平台www.oitccas.com注册并购买售价:¥600.0 元,本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名 称:中国科学院分子植物科学卓越创新中心     地址:上海市枫林路300号        联系方式:021-64318161/010-68290551      2.采购代理机构信息名 称:东方国际招标有限责任公司            地 址:北京市海淀区丹棱街1号互联网金融中心20层            联系方式:杨帆 陈小舫 赵倩,021-64318161/010-68290551            3.项目联系方式项目联系人:杨帆 陈小舫 赵倩电 话:  021-64318161/010-68290551
  • 中科院昆明植物研究所预算96万元采购流式细胞仪,需NMPA和SFDA认证
    7月5日,中国科学院昆明植物研究所流式细胞分析仪采购项目在线公开招标,预算金额为96万元人民币。用于植物倍性鉴定,用于遗传进化、开展倍性育种和杂交育种等相关工作。招标项目的潜在投标人应在www.oitccas.com;北京市海淀区丹棱街1号互联网金融中心20层获取招标文件,并于2024年07月26日 09点30分(北京时间)前递交投标文件。包号货物名称数量交货期指定到货港项目现场(交货地点)1流式细胞分析仪1套30天昆明机场中国科学院昆明植物研究所指定地点总则1、工作条件除非在技术规格中另有说明,所有仪器、设备和系统都应符合下列要求:1.1 适于在气温为摄氏-40℃~+50℃和相对湿度为90%的环境条件下运输和贮存。1.2 适于在电源220V(±10%)/50Hz、气温摄氏+15℃~+30℃和相对湿度小于80%的环境条件下运行。能够连续正常工作。1.3 配置符合中国有关标准要求的插头,如果没有这样的插头,则需提供适当的转换插座。1.4 如产品达不到上述要求,投标人应注明其偏差。如仪器设备需要特殊工作条件(如水、电源、磁场强度、温度、湿度、动强度等)投标人应在投标书中加以说明。2、验收标准除非在技术规格中另有说明,所有仪器、设备和系统按下列要求进行验收:2.1 仪器设备运抵安装现场后,买方将与卖方共同开箱验收, 如卖方届时不派人来, 则验收结果应以买方的验收报告为最终验收结果。验收时发现短缺、破损, 买方有权要求卖方负责更换。2.2 验收标准以中标人提供的投标文件中所列的指标为准(该指标应不低于招标文件所要求的指标)。任何虚假指标响应一经发现即作废标,卖方必须承担由此给买方带来的一切经济损失和其它相关责任。2.3 验收由采购人、中标人及相关人员依国家有关标准、合同及有关附件要求进行,验收完毕由采购人及中标人在验收报告上签名。3、如在具体技术规格中有本总则不一致之处,以具体技术规格中的要求为准。具体技术规格1、用途:用于植物倍性鉴定,用于遗传进化、开展倍性育种和杂交育种等相关工作。2、主机配置:2.1、激光器及检测通道:配置3根激光器,波长分别为485nm±3nm、 630nm±3nm、400nm±5nm;8个荧光检测通道,包含FSC、SSC等10个检测参数。2.2、光激发及收集系统:固定的光激发系统和光收集系统、无需操作人员调整;光纤信号导入检测系统,散射光和荧光信号通过连续反射信号收集系统。2.3、检测系统:仪器能检测前向散射光、侧向散射光、8色荧光,配置≥8个检测器;检测器采用独立(非共线)主流的高灵敏度全数字化光电倍增管(PMT)。2.4、荧光检测灵敏度:荧光灵敏度: FITC≤ 3MESF,PE≤ 5 MESF(需提供国内权威机构检测报告)。2.5、荧光补偿:数字化矩阵补偿,可实现实时补偿、脱机补偿和自动补偿。2.6、液流系统:采用不间断正压压力泵(非注射泵或蠕动泵)上样方式。2.7、分析速度:细胞获取速度需≥10000细胞/秒。2.8、最小样本量:≤30ul,适合微量样本和稀有样本的检测,以便节省珍贵样本及后续染色抗体的使用量,节约实验成本。2.9、脉冲处理信号:≥3参数(同时分析脉冲高度、宽度、面积)。2.10、有动态反馈的压力控制系统,可以控制压力变化在±0.005 psi范围内。2.11、交叉污染率:≤0.1%2.12、CV值:≤2%(全峰宽)。2.13、仪器性能质控:能够提供质控软件和质控品在内全套的质控体系,自动检测仪器性能,以保证检测结果的可靠性。2.14. 具有国内NMPA认证及SFDA认证,符合国际标准;2.15 生产厂家需获得ISO13485质量管理体系认证。3、配置要求:3.1软件配置:操作系统、数据获取分析软件、临床自动报告软件;3.2硬件配置:流式细胞分析仪主机一套、显示器一套、打印机一套、3KVA稳压电源一套、鞘液清洗液一套、计算机工作站一套。
  • 细胞体外培养实验的成功要从用水的选择开始!
    细胞体外培养用水中水的质量要求提起细胞体外培养实验,每个经历过的实验者都会有这样的领悟吧,细胞虐我千百遍,我待细胞如初恋。明明小心翼翼的操作,细胞总会莫名其妙的被污染了!莫名其妙的挂掉啦!到底怎么回事呢?其实造成细胞污染的因素不单单是微生物,培养环境中所掺杂的物质也可能会影响细胞的生长。水是细胞赖以生存的主要环境,营养物质和代谢产物都必须溶解在水中,才能为细胞吸收和排泄。对于体外培养的细胞来说,水是细胞培养液和试剂中简单而重要的组分。所以,细胞培养对水的质量要求较高,培养用水中如果含有一些杂质,即使含量极微,有时也会影响细胞的存活和生长,甚至导致细胞死亡。水中的杂质对水质有不同影响:1.离子——平衡渗透压;一些重金属 (Cadmium)对细胞毒害大,即便剂量很低 (衡量实验室用水导电性能的指标,单位为MΩ• cm,随着水内无机离子的减少电阻数值逐渐变大。2. 异体菌落数(Heterotrophic bacteria count,HBC)衡量实验室用水微生物的指标,单位为cfu/mL。3. 有机物(Total Organic Carbon ,TOC)水中碳的浓度,反映水中可氧化的有机化合物的含量,可间接反映出水中细菌和内毒素含量的高低。单位为ug/L或ppb。4. 内毒素(Endotoxin)革兰氏阴性细菌的脂多糖细胞壁碎片,又称之为“热原”,单位EU/mL。参考国际标准化组织的实验室纯水规范ISO3696,美国CLSI和ASTM D1193的试剂纯水规范,我国GBT6682和GBT 30301的试验用水指导,《实验细胞资源的描述标准与管理规范》用水指导,结合多年的实验操作经验,总结出细胞培养用水对水质的要求。细胞培养对水质的要求:1.一定要无菌:HBC 3.阻碍细胞生长的有机物含量要低:TOC等纯化后达到二级纯水,储存于水箱中以满足日常的清洗应用;水箱中的水再经过U Pack超纯化柱去离子,紫外灯照射杀菌并降低有机物含量,最后经终端滤器RephiBio过滤,以获得无菌、无热源、无核酸酶的超纯水。Genie G 水路图要想达到细胞培养用水的水质要求,纯水机的配置非常关键,带有消毒模块的纯水水箱、终端过滤器、取水水质的实时监测等配置都关系着产水水质是否达标。纯水的储存对保持纯水的质量是至关重要的,由于周围环境和空气中的二氧化碳更容易使水污染改变其pH,所以储存水的容器要尽量密封,避免和外界过多接触,抑制微生物生长。如Genie纯水设备可以提供的纯水水箱带有紫外消毒模块和去除二氧化碳的过滤器,能够尽量的保证水箱内的纯水水质。水箱空气过滤器(含CO2吸附剂)200/350L 水箱空气过滤器主控屏显示水箱水循环状态终端滤器可用于去除纯水中特定类型的污染物,满足不同实验的应用需求。对于细胞体外培养可以选用RephiBio Filter 纯水终端过滤器,安装在乐枫超纯水系统的出水口,可有效去除水中的热原(内毒素)、核酸酶、细菌等杂质,制备符合细胞培养用水要求的超纯水(无热原、无DNase、无RNase、无菌)。对于超纯水而言需要格外注意终端水质的TOC、电阻率、细菌和内毒素的含量,必须做到即取即用,因此取水的远程监控和水质实时监测就显得尤为重要。目前已有厂家可以提供与手柄通过无线连接的实验室纯水机(如上面提到的Genie),将水机和取水手柄分别放在洁净间的内外,通过无线控制取水手柄达到超纯水的取用和实时检测水的电阻率和TOC数值,非常适合无菌环境下的操作,尽量减少污染。无线 自由局域网无线通信技术 各单元摆脱信号线羁绊主机,主控屏,手柄摆放可自由组合 手柄触屏信息? 系统运行状态:待机,泄压,循环,产水? 水箱液位:0%或者L? 纯水(超纯水)水质参数:电阻率、TOC、温度 终 端 水 质 实 时 监 测结合上述用水要求,为大家推荐两款制备超纯水的水机,Genie G一体化纯水仪和Genie PURIST 超纯水仪。 Genie G一体化纯水仪以自来水为进水制备超纯水和 EDI 二级纯水性能指标Genie PURIST 超纯水仪以纯水(EDI 纯水,RO 水或蒸馏水等)为进水,制备实验室超纯水。性能指标【注意事项】1.超纯水应当注意使用时间,应该“即取即用”。防止超纯水吸收外界的杂质导致水质下降。2.在合适的环境使用超纯水。环境中的VOC(挥发性有机物),细菌等都会影响细胞培养。3.培养细胞的容器应当洁净无污染。 4.配制离散细胞用的消化液和细胞洗涤液时,宜采用钙、镁离子含量低的缓冲液,缓冲液用水可以选用装配乐枫低镁型纯化柱的纯水机,避免钙、镁离子促使细胞凝聚作用的产生。不同细胞体外培养用水选择指南细胞培养(cell culture)是指在体外模拟体内环境(无菌、适宜温度、酸碱度和一定营养条件等),使之生存、生长、繁殖并维持主要结构和功能的一种方法。细胞培养的整个流程中实验用水贯穿每一个环节:1.取材:组织的清洗和灌注试剂用水,如PBS缓冲液、Hanks液的配制;2.原代培养:1640、DMEM等培养基用水,明胶等支持物的配制,添加药物、检测试剂的配制;3.传代培养:胰酶等消化液的配制;4.冻存:细胞冻存液DMSO的配制。细胞体外培养的细胞类型一般分为动物细胞培养、植物细胞培养和微生物培养,其中极难的是动物细胞的培养。动物细胞的培养除了需要无菌、温度、气体、渗透压、pH等基本条件,它还需要血清、支持物等特殊物质,其中原代细胞的培养是很难的。植物细胞的培养需要光照和激素,而且培养条件和培养技术比较成熟。微生物培养多为单细胞生物,微生物人工培养的条件比动植物细胞简单得多,蛋白胨、麦芽汁、酵母膏等培养基即可满足微生物的营养要求,其中厌氧微生物培养比好氧微生物复杂,需要维持CO2等非氧惰性气体的浓度。由于细胞的种类和培养条件不同,对培养环境中杂质的含量要求也不同,那么配制培养基或试剂用水的选择大有讲究,不同细胞体外培养用水的指标如下:细胞体外培养用水选择细胞类型纯水等级电阻率(MΩcm)TOC(ppb)微生物(cfu/mL)内毒素(Eu/mL)核酸酶(pg/mL)动物细胞超纯水181810各种细胞培养用水的比较细胞培养用水制备方法优点缺点商品化细胞培养用水纯水或超纯水进行多效蒸馏制成,严格控制热源、无菌、内毒素、pH、渗透压等指标水质标准程度化高,可保证实验结果的重复性价格昂贵DEPC水DEPC处理过并经高温高压灭菌的MiliQ纯水,无RNase、DNAase和proteinase。完全去除核酸酶价格昂贵,未去除内毒素终端滤器过滤超纯水采用0.22μm的过滤膜,可有效去除水中的热原(内毒素)、核酸酶、细菌等杂质。性价比高,供水量大对取水环境要求高乐枫 RephiBio 终端过滤器采用0.22μm带正电荷的双层尼龙66过滤膜,可制备符合生物领域应用要求的超纯水(无热原、无DNase、无RNase、无菌),纯水中内毒素含量低于0.001 Eu/mL,核酸酶的含量低于可检测范围,微生物的含量低于0.1 cfu/mL,可以满足动物细胞和植物细胞的需求。Tips: 通常情况下乐枫RephiBio 终端过滤器的更换周期为3 个月,以达到好的使用效果。
  • CytoSense在线型浮游植物流式细胞仪首次国内应用
    多年来,CytoSense流式细胞分析仪结合EasyClus软件 (TR Project)为位于默兹河的荷兰Eijsden水质监测站提供了诸多有价值的监测数据(见www.fytoplankton.nl),该监测站由荷兰水司(Rijkswaterstaat)水生生物分析实验室直接管理。随着中荷两国间的水利合作关系的密切推进,CytoBuoy 公司藻类监测设备和技术将用于荷兰基础设施与环境部公共工程与水管理总司(Rijkswaterstaat)和中国太湖流域管理局(TBA)之间的联合监测项目。类似的操作系统将被安装在太湖水质野外监测站。 荷兰Eijsden水质监测站的Cytosense 本次项目的主要目标之一是建立有害藻华藻铜绿微囊藻动态变化自动评估机制。CytoSense专为浮游植物监测设计,可直接分析大尺寸范围的浮游藻类、团体结构,特殊的流体工艺设计同时可以避免脆弱的藻类结构遭到破坏,其出色的技术设计可实现藻类动态变化的实时监控。该技术可在完整的藻类粒径谱范围内对生物量进行线性评估。同时Easyclus软件(TR Project)用于支持藻类的快速分类与定量,同时可实现数据的批量化处理。 太湖局专家在野外调查船上操作CytoSense 太湖局专家赴荷兰参加技术培训 为促进本次国际合作项目的成功,2016年5月2日-6日,UNESCO-IHE 、荷兰水司(Rijkswaterstaat)水生生物分析分析实验室、CytoBuoy 公司及TP Project 公司在荷兰代尔伏特对太湖流域管理局的专家做了为期一周的CytoSense流式细胞仪培训课程。5月21日,泽泉科技作为CytoBuoy 公司在中国唯一的代理商,陪同CytoBuoy 公司CEO Mr. George Dubelaar 一起参观了无锡太湖流域管理局实验室,并就后期合作的技术及商务细节进行了探讨。 CytoSense 发明人回访太湖局流式细胞使用情况 在线系统合作项目会议 8月18日,Cytosense 在线监测系统在太湖望虞河口水质自动监测站安装试运行。CytoBuoy公司及泽泉科技工程师太湖局专家共同参与了设备的安装测试。目前设备运行正常,CytoBuoy应用科学家Lucyna将在中国协助TBA与荷兰水司的水质专家完成为期一个月的数据测试交流及优化设置工作。 在线系统安装试运行 现场安装培训 在线系统的成功运行首次实现流式细胞技术与在线监测技术真正结合,在此基础上,我们将不断努力,旨为科研工作者在藻类监测、研究工作提供更多新的方法和思路。
  • Orbitrap闪耀椰城 ---为植物蛋白质组学提供全流程解决方案
    随着人类基因组计划的完成,生物学研究时代进入蛋白质研究时代。功能蛋白的深入研究,是后基因组时代的重要研究方向。由中国植物学会主办,中国细胞学会染色质与蛋白质组专业委员会协办,海南大学、中国热带农业科学院、海南师范大学共同承办的“第六届全国植物蛋白质研究大会暨第二届植物蛋白质组最新研究技术培训班”于2016年12月18日-20日在海南省海口市召开。整合各种生物学研究技术,深入解析蛋白质的结构和功能,植物组学研究得到了越来越多的业界关注,多种植物全基因组测序的完成,为各种植物蛋白质组展开提供了条件。 朱玉贤院士做大会报告匡廷云院士做大会报告 赛默飞积极参与此次全国植物蛋白研究大会,在大会上披露了最新的Orbitrap 植物蛋白质组学全流程解决方案。赛默飞色谱质谱应用工程师蒋好在此次大会分会场环节,为与会者带来了题为“基于交联质谱技术的完整分析流程用于功能蛋白质组学研究”的精彩报告。随着蛋白质组学研究的不断深入,传统的蛋白质组学研究已经转向对蛋白质功能的研究,即在前期蛋白质及其翻译后修饰的鉴定基础上,去研究不同蛋白的表达、结构和相互作用网络,来解析蛋白质行使其功能的途径。采用基于化学交联的方法(DSS和DSSO),将存在相互作用的位点或者蛋白进行共价键合,结合不同碎裂模式的质谱技术进行大规模的交联肽段分析,实现对生物体内目标功能体系的蛋白相互作用网络绘制,显著提高整个分析流程的速度和鉴定结果的可靠性。他为与会者介绍了相较于传统的结构生物学研究方法,如X-ray、NMR和CryoEM,对样品的要求和分析流程的难度大大降低,并能够结合不同的结构生物学方法提供全面的蛋白结构与相互作用信息。赛默飞应用工程师蒋好做分会场报告基于Orbitrap 植物蛋白质组学全流程解决方案 赛默飞色谱质谱应用工程师孙佳楠在会后的培训班上作了“基于TMT的定量蛋白质组学完整分析流程”的报告。她介绍了在目前非靶向相对定量蛋白质组学技术日趋成熟的阶段,然而随着质谱技术的不断发展,为了定量的更加准确通量更高,相对标记定量方法也在不断的被开发,SPS-MS3质谱方法使定量结果更加接近于真实比例。质谱是高通量靶向蛋白质定量必不可少的技术手段,TOMAHAQ靶向标记定量方法,具有高的灵敏度、重现性、定量准确等特点,其最大的优势是通量得到非常大的提高,缩短我们实验的周期。赛默飞应用工程师孙佳楠在培训 赛默飞Orbitrap Fusion Lumos三合一高分辨质谱仪在会场外的展台展示时,引起了与会者的兴趣。优异的性能,以及最新的Orbitrap 植物蛋白质组学全流程解决方案,吸引了不少的目光。参会代表纷纷走进赛默飞展台,与工作人员咨询与交流。 参会代表在赛默飞展台咨询相关应用技术
  • 【会议通知】中国细胞生物学学会2021年全国学术大会•重庆 第三轮通知
    为促进我国细胞生物学领域研究人员的交流与合作,推动中国细胞生物学学科的发展,“中国细胞生物学学会2021年全国学术大会• 重庆”将于2021年4月12-16日在重庆举行。一、会议时间和地点:时间:2021年4月12-16日(4月12日于温德姆酒店一楼报到;4月13日会议中心)地点:重庆悦来国际会议中心二、会议规模:约1000-1200人。三、会议日程本次大会主要分为学术交流(大会特邀报告、分会场报告、卫星会议、墙报交流等)、工作会议和特色活动三种形式。其中分会场交流共分为17个主题开展学术交流。每个分会场由2位召集人负责,安排9-10个口头报告,其中5-6个为邀请报告,3-4个从投送的摘要中遴选。主题分别为:WLLA论坛:细胞器召集人:葛亮,田烨,杨爱民S01 胚胎早期发育调控与干细胞多能性召集人:颉伟,谭韬S02 发育和疾病的信号机制召集人:冯新华,刘峰S03 免疫细胞治疗和干细胞治疗召集人:朱剑虹,赵简S04 细胞工程与肿瘤召集人:边惠洁,刘强S05 肿瘤干细胞与微环境召集人:陈策实,柳素玲S06 非编码RNA与细胞功能召集人:骞爱荣,李斌S07 细胞极性与可塑性召集人:陈正军,周军S08 染色质稳态与人类疾病召集人:高绍荣,许兴智S09 中心体、纤毛与疾病召集人:潘俊敏,傅静雁S10 感染免疫与疫苗研发召集人:李斌,叶丽林S11 单细胞组学数据与人工智能召集人:李霞,王秀杰S12 细胞代谢与疾病召集人:李丰,丁春明S13 植物细胞骨架与细胞壁召集人:傅缨,孔照胜S14 细胞运动与力学感应召集人:符传孩,欧光朔S15 代谢与衰老召集人:刘光慧,韩敬东S16 植物受体激酶信号召集人:黎家,焦雨铃每个分会场的简介请见:https://www.cscb.org.cn/2021/venue.html四、会议注册本次大会实行在线注册,会议网站https://www.cscb.org.cn/2021/,在线注册截止日期为2021年3月31日。论文摘要纸质版:120元/本(会员100元/本)说明:1、以上收费标准以实际付款时间为准。2、本次会议提供电子版会议论文摘要集,大会APP上提供口头报告论文摘要,如需要纸质版摘要集,请额外支付120元资料费(会员支付100元)。3、未缴纳会费者,可在注册同时勾选缴纳会费选项,享受会员价。未交会费的会员不能享受会员价。4、缴费方式:在线支付(推荐)、银行汇款、现场缴费。通过银行汇款的参会代表请缴费后及时将汇款凭证、缴费人信息发送邮件至大会秘书处meeting@cscb.org.cn,以便核对查询。5、开具发票抬头为企业或个人的参会代表(含学会会员)一律按照企业代表进行注册缴费。6、凡已缴费的参会代表因故不能参会者,于2021年2月10日之前向大会提出申请,将扣除200元手续费后退还余款。2021年2月10日之后将不再退款。7、发票发放及领取:缴费确认成功,电子发票两周内发送至注册邮箱,索要注册费纸质发票将在会议现场领取。2021年3月31日之后确认的,在报到注册时根据本人身份证(学生代表还需携带学生证)以及汇款凭证,领取发票。8、团体注册特殊优惠政策:团体6人及以上,支付总金额享9折优惠。 9、汇款信息:(1)在线支付(支付宝/微信): https://www.cscb.org.cn/2021/login.html(2)银行转账:   单位:中国细胞生物学学会    账号:03392400040009251    开户行:农行徐汇区枫林支行五、口头交流与墙报交流1.口头交流本次大会口头交流除了分会场邀请的报告人以外,将从提交的论文摘要中遴选口头报告人。提交申请口头报告的参会代表可通过附件中的详细日程查询或者查阅网站https://www.cscb.org.cn/2021/program01.html。2.墙报交流为了鼓励会员积极参加墙报交流,本届大会将参照国际惯例,要求每篇论文摘要(除口头报告外)必须以墙报的形式展示。墙报格式:120cm×90cm(高×宽)。(1)墙报交流时间:4月14日和15日下午15:00-16:30(2)墙报制作:为减少参会代表携带不便,大会组委会将统一为大家制作墙报。(3)大会设立了优秀墙报奖,并组织评审委员会对投稿墙报进行评选,将在闭幕式上颁发证书和奖金(1000元/人)。六、特色活动大会为广大参会代表搭建了各类交流平台,包括就业宣讲会、基金申请、Meeting the Editors、教学分会场、WLLA论坛、女性科学家论坛等。具体详情可浏览网站:https://www.cscb.org.cn/2021/activity.html七、住宿预订本次会议食宿自理,授权上海得韬会展服务有限公司代为预订酒店住宿。住宿费委托上海得韬会展服务有限公司代收,发票由实际入住酒店开具。参会代表可以通过会议指定网站登录预订,或自行预订周边住宿。酒店信息请浏览会议网站https://www.cscb.org.cn/2021/accommodation.html。住宿预订联系人:王斌 13381695656, annualmeeting@163.com八、大会秘书处联系方式:中国细胞生物学学会秘书处E-mail:meeting@cscb.org.cn注册:021-64221728招商:021-64220263财务:021-64220196住宿:13381695656地址:上海市徐汇区肇嘉浜路789号均瑶国际广场11F3,200032中国细胞生物学学会2021年3月15日
  • ACS Editors’ Choice:单细胞质谱分析
    近日,清华大学欧阳证教授课题组在analytical chemistry上发表了single-cell mass spectrometry analysis of metabolites facilitated by cell electro-migration and electroporation,且以acs editors' choice形式亮点报道。 文章介绍了基于细胞电迁移-电穿孔的单细胞质谱分析方法,该方法无需细胞高精度操控平台,仅通过对单细胞施加一定序列的电压,即可实现对单个酵母等具有细胞壁的细胞内代谢物的可控释放与质谱分析。 acs美国化学会报道: acs 编辑良择 | 基于细胞电迁移-电穿孔的单细胞质谱分析方法通讯作者:欧阳证,清华大学作者:zishuai li (李自帅),zhengmao wang (王正茂),junmin pan (潘俊敏),xiaoxiao ma (马潇潇),wenpeng zhang (张文鹏),zheng ouyang (欧阳证) 单细胞分析对研究细胞在转录组学、蛋白组学以及代谢组学等方面的异质性有着重要的意义。目前,科学家们开发了大量的单细胞分析方法和技术,例如荧光分析法、微流控芯片、流式细胞仪、单细胞测序等。质谱分析,因其低样品消耗量、高灵敏度、高定量准确性等优势,已经被广泛应用于单细胞蛋白组学、脂质组学和代谢组学分析中。然而,目前大部分的单细胞质谱分析方法,都需要依托于高精度操作平台,这给单细胞分析技术的应用带来了一定的挑战。 清华大学欧阳证教授课题组报道了一种基于细胞电迁移-电穿孔的单细胞质谱分析方法。该方法无需细胞高精度操控平台,仅通过对单细胞施加一定序列的电压,即可实现对单个酵母等具有细胞壁的细胞内代谢物的可控释放与质谱分析。如图1所示,在硼玻璃纳喷管中加入适当体积(约0.5 μl)的细胞悬浮液(约104细胞/ml),该溶液内平均只含有单个细胞。由于细胞表面通常带负电,通过非接触式电极对溶液施加直流负电压,使细胞迁移到纳喷管尖端,并在针尖处封闭一段超小体积(约1.5 pl)的液体。之后施加高压脉冲电压,在细胞膜表面形成电穿孔,细胞内代谢物即释放到前端的超小体积液体中,从而避免了细胞内代谢物的过度稀释。最后,采用非接触式电极加压,由纳升电喷雾离子化将该部分溶液离子化并进行质谱分析。图1. 基于细胞电迁移-电穿孔的单细胞质谱分析方法 该研究中,首先用酵母细胞进行了方法验证。如图2所示,从离子流热图中可以看出,施加脉冲电压后,在质荷比m/z 50到800的范围内出现了大量的代谢物离子信号。图2b-c中比较了施加脉冲电压前后的单细胞分析质谱图。通过精确质量对比、串级质谱分析等方法,该课题组在单个酵母细胞内检测到了71种代谢物。图3a-f展示了几种典型代谢物的串级质谱谱图。 图2. (a)质谱离子流热图。在5 s时刻施加了高压脉冲电压。(b)负离子模式。(c)正离子模式。 图3. 负离子模式下单酵母菌代谢产物典型的串级质谱谱图 (a) glu, (b) gsh, (c) amp, (d) adp, (e)atp, (f) udp-hex. 除了酵母细胞,该方法还可用于其他种类的具有细胞壁结构的单细胞菌类的高灵敏度质谱分析。图4展示了莱茵衣藻(chlamydomonas reinhardtti)、杜氏盐藻(dunaliella salina)、斜生栅藻(scenedesmus obliquus)、绿眼虫(euglena viridis)的单细胞分析质谱图。图4. 不同种类细胞的单细胞质谱谱图。从内向外依次为:莱茵衣藻,杜氏盐藻,斜生栅藻,绿眼虫。 此外,该课题组还研究了不同培养环境下,单个细胞内代谢物相对含量的变化情况。将两组莱茵衣藻细胞,分别在有/无光照条件下培养24小时,之后采用本方法进行单细胞内代谢物的质谱分析。单细胞质谱分析表明,在黑暗条件下,衣藻细胞内的卡尔文循环内的碳固定被终止,细胞内有氧呼吸强度下降,糖酵解代谢增强。此时,细胞的光合作用停止,细胞通过糖酵解分解糖类以提供基本的代谢需求,同时降低有氧呼吸强度以维持生存。图5. 黑暗条件下的莱茵衣藻单细胞内部分代谢物强度比值变化。 本研究的相关结果已发表在analytical chemistry,并以acs editors' choice形式亮点报道。该论文得到了国家自然科学基金项目的支持。 文章链接:https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.analchem.0c02147
  • 超声波细胞破碎机的工作原理【莱恩德新品】
    超声波细胞破碎机,也称为超声细胞破碎仪,其工作原理主要基于超声波在液体中的空化效应。以下是其工作原理的详细解释:    1.电能转换:首先,超声波细胞破碎机将电能通过换能器转换为声能。换能器作为核心部件,能够将电能高效地转换为超声波能量。    2.空化效应:当超声波在液体中传播时,它会在液体中产生空化作用。这种空化作用表现为液体中的微小气泡迅速形成并随后炸裂。这些炸裂的气泡会产生类似小炸弹的能量,形成高强度的剪切力和高频交变水压。    3.细胞破碎:这些高强度的剪切力和高频交变水压作用于细胞壁,使细胞壁受到压力变化而破碎。同时,由于超声波在液体中的剧烈扰动,粒子会产生大的加速度,使它们相互碰撞或与装置壁碰撞而破碎。    4.主要应用:超声波细胞破碎机广泛应用于中药提取、细胞、细菌、病毒组织的破碎等领域。其高效的破碎能力使得这些生物样本的处理更加快速和有效。    此外,超声波细胞破碎仪还有一些其他的特性和功能,例如:   结构特点:超声探头通常采用进口钛合金材质,具有高能效换能器和振幅自动调节功能。这些特性保证了设备的高效性和稳定性。    技术参数:工作频率范围通常为20~25KHz,具有频率自动跟踪功能。设备可储存多套常规程序数据和一套组合程序,工作方式有定时和计数两种。这些参数和功能使得设备更加灵活和易用。    综上所述,超声波细胞破碎机的工作原理主要基于超声波在液体中的空化效应,通过电能转换、空化效应和细胞破碎等步骤实现对生物样本的高效处理。点击此处可了解更多产品详情:超声波细胞破碎机
  • 植物也要“摘口罩”:Nature主刊揭示植物气孔如何重新打开
    人们面对病毒入侵,会通过佩戴口罩进行有效抵御。同样,植物也会通过调节气孔的开放和关闭来抵抗病原入侵。气孔关闭可减少水分流失并限制病原体进入,然而长时间关闭气孔,会导致植物光合作用以及蒸腾作用的减弱,水分的过度积累甚至会促进植物体内病原体的定殖。所以,植物其实也是需要在合适的时间“摘掉口罩”。那么,植物是如何动态调节气孔关闭和开放的?其背后的分子机理仍不清楚。今年5月,美国德州农工大学何平教授、单立波教授与山东建筑大学侯书国教授在Nature主刊合作发表了相关研究,发现了一类新的调控免疫和水分流失的分泌小肽SCREWs,阐明了SCREWs参与植物重新打开气孔的分子机制。这也是山东建筑大学首篇Nature主刊文章。植物基因里编码数以千计的小肽,而其中多数小肽的功能仍是未知的。一些小肽是植物免疫的细胞因子,被驻扎在细胞表面的受体激酶所感知。作者首先分析了拟南芥小肽合成基因的转录组学,发现受细菌鞭毛蛋白刺激时,一些小肽的合成会明显提高,并且这些小肽具有保守的C端(图1)。用这些小肽处理种苗后,发现小肽诱导激活了MAPKs(mitogen-activated protein kinases),及包括WRKY30,WRKY333,WRKY353和FRK1在内的多种PTI(pattern-triggered immunity)标志物的表达,并且证明了C端保守的两个半胱氨酸(CC)对诱导免疫反应十分重要。体内实验发现这些小肽直接决定了拟南芥是否易感染Pst DC3000(Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000)。由此作者鉴定这些小肽为一类新的植物细胞因子,被命名为SCREWs(SMALL PHYTOCYTOKINES REGULATING DEFENSE AND WATER LOSS)。图1 细胞因子SCREWs的序列比对作者的下一步是找到SCREWs的受体。受体激酶,特别是LRR-RKs(leucine-rich repeat receptor kinases)是很多内源肽的受体。作者筛选了拟南芥的受体激酶,发现NUT(AT5G25930)介导了SCREWs诱导的免疫反应。为了确定NUT是不是SCREWs的直接受体,作者使用Biacore T200,通过把NUT胞外域固定在CM5芯片上,SCREWs作为分析物流过芯片,检测得到SCREW1与NUT的亲和力达到12.95μM,SCREW2与NUT的亲和力达到6.23μM(图2)。图2 Biacore鉴定SCREWs的受体NUT(pH 7.5)为了更加接近体内的环境,作者同样使用Biacore方法检测了pH5.7条件下SCREWs与NUT的亲和力,发现在非原质体的pH条件下,SCREWs与NUT的亲和力基本一致(图3)。图3 Biacore检测非原质体酸碱条件(pH 5.7)下SCREWs与NUT亲和力前面提到,SCERWs羧基端的保守半胱氨酸对诱导免疫十分重要,这里作者同样用Biacore做了体外实验的验证,结果发现保守区域半胱氨酸的突变会使SCREWs与NUT的亲和力显著降低(图4)。由此,藉由Biacore完整、可靠的实验结果,作者确定了NUT就是SCREWs的受体。图4 关键氨基酸的突变使SCREWs与NUT的亲和力显著降低很多LRR-PKs的受体都是BAK1和相关的SERKs,利用免疫沉淀实验发现SCREW会刺激NUT-BAK1复合物的产生后,作者同样使用Biacore检测SCREW2-NUT-BAK1三元的结合(图5)。同样把NUT胞外域固定在CM5芯片上,分析物则设置固定浓度的BAK1预混多浓度的SCREW2,并且检测NUT与单独BAK1的结合试验作为对照。结果发现,BAK1的存在显著提高了NUT和SCREW2的亲和力,达到了0.38μM。图5 Biacore检测SCREW2-NUT-BAK1三组分的结合除了调控免疫,作者还发现SCREW-NUT可以调控植物的水分流失。植物缺水时,ABA会促进气孔的关闭,调控植物的水分利用和耐旱性。作者发现,SCREW-NUT通过调控ABI(ABA INSENSITIVE)的磷酸化,导致ABI磷酸酶对OST1(OPEN STOMATA 1,一种介导ABA和MAMP诱导的气孔关闭的关键激酶)的活性增加,降低S型阴离子通道的活性,最终抑制气孔关闭。总结图6 文章整体研究思路综上所述,团队首次发现了植物应对病原体侵染或水分缺失时,会通过SCREWs-NUT来控制气孔的重新开放。SCREW-NUT系统广泛分布于双子叶和单子叶植物中,说明本研究在优化植物对非生物和生物胁迫的适应性方面有重要作用。Biacore作为分子互作的金标准,轻松应对信号通路的二元,三元体系研究,在研究植物生长发育和抗逆的信号通路,转录调控等方面,深受广大农业和植物科学家的信赖。Biacore可靠的实验数据,加上科学家创新又严谨的研究思路,定会加速我国科学家们在农业和植物领域的科研进展,巩固我们在此领域的领军地位。Biacore,for a better life参考文章:Liu, Z., Hou, S., Rodrigues, O. et al. Phytocytokine signalling reopens stomata in plant immunity and water loss. Nature 605, 332–339 (2022).
  • 分子植物卓越中心等发现新型植物RNA低温感受器
    低温胁迫是限制植物分布的主要环境因素之一,感知低温信号是植物适应寒冷环境的基础。植物在低温中呈现出生长减缓、开花延迟等表型以适应低温环境。鉴定植物的冷感受器是解析植物低温感知分子机制的关键。   10月20日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心/CAS-JIC植物和微生物科学联合研究中心研究员杨小飞研究组、东北师范大学教授张铧坤研究组,以及英国约翰英纳斯中心(John Innes Centre,JIC) 研究员丁一倞研究组合作,在《自然-通讯》(Nature Communications)上,发表了题为RNA G-quadruplex structure contributes to cold adaptation in plants的论文。   温度依赖的大分子结构变化决定生物大分子发挥细胞温度计的功能,如蛋白质、核糖核酸等。为寻找与温度感知有关的RNA结构域特征,科研团队对1000种植物转录组项目(1KP)的RNA序列开展研究。该研究对其中的906种陆生植物与环境因素的相关性分析表明,生长在低温地区的植物RNA中普遍富含鸟嘌呤(Guanine)。鸟嘌呤(G-rich)序列在体外可以折叠为特殊的鸟嘌呤四链体(RNA G-quadruplex,RG4)结构,耐寒植物中具有更多的RG4结构,暗示富含G-rich序列与植物的耐寒性有关。   为探究RG4折叠与冷响应间的关系,科研人员对模式植物拟南芥进行低温处理,并利用此前开发的RG4检测方法SHALiPE-seq对体内RG4折叠进行定量检测。结果表明,低温处理显著诱导植物体内RG4结构的折叠,证明植物RG4具有感知低温的能力。研究系统分析了拟南芥的mRNA降解组数据,发现包含有冷诱导RG4的mRNA降解速率明显降低,暗示RG4或抑制了mRNA的降解。为验证RG4结构在mRNA降解中的作用,科研团队挑选了一个受低温显著诱导的RG4基因,命名为CORG1。通过碱基替换将G突变为A,可将包含RG4结构的野生型wtRG4-CORG1突变为不能形成RG4结构mutRG4-CORG1基因。进一步研究发现,mutRG4-CORG1在冷胁迫中的降解速率显著高于wtRG4-CORG1的降解速率,证明低温诱导的RG4结构形成抑制mRNA的降解。同时,低温对mutRG4-CORG1的转基因植物的生长抑制也明显弱于wtRG4-CORG1的拟南芥,表明RG4结构突变降低植物对低温响应的敏感性。   综上所述,冷处理诱导植物mRNA的RG4折叠,进一步选择性抑制mRNA的降解从而减缓植物在低温环境下的生长速度。转录组中RG4结构的选择性富集帮助陆生植物感知低温信号,促进植物对寒冷环境的适应性进化。该研究迄今为止首次发现RG4结构抑制mRNA的降解,阐明了RG4结构的全新分子调节功能,且RG4结构是植物中发现的第一个RNA低温感受器。美国哈佛大学和耶鲁大学研究人员对动物细胞的同期研究工作表明,多种胁迫因素(如低温、饥饿)促进3’UTR的RNA结构折叠,并提高mRNA的稳定性(https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.03.03.482884v1)。这些研究暗示环境依赖的RNA结构折叠作为胁迫感受器,在自然界广泛存在。   研究工作得到国家自然科学基金、英国生物技术与生物科学研究委员会基金和欧洲研究委员会基金等的支持。耐寒植物中的RG4富集提高了植物对寒冷环境的感知能力
  • 精选案例汇总 | MST在植物抗逆机制研究上的应用
    MST案例汇总 植物生长会受到各种复杂多变的逆境条件胁迫,包括干旱、盐碱和低温等。在长期的系统发育过程中,植物也逐渐形成适应、抵抗和忍耐的抗逆性,植物抗逆性机制为当前研究的热点,今天小编带大家来了解一下,微量热泳动(MicroScale Thermophoresis, MST)互作技术在植物适应逆境的机制研究的应用。01高温胁迫_蛋白&蛋白互作Chen, Si‐Ting, et al. "Identification of core subunits of photosystem II as action sites of HSP 21, which is activated by the GUN 5‐mediated retrograde pathway in Arabidopsis." The Plant Journal 89.6 (2017): 1106-1118.前人研究发现位于叶绿体的热休克蛋白21(HSP21)能够保护光系统II复合体 (PSII),使其免受细胞内热和氧化应激,但其作用的分子机制尚不清楚。中科院植物生理生态研究所郭房庆研究团队发现,热应激下拟南芥HSP21被GUN5依赖的逆向信号通路激活,并直接结合其核心亚基D1和D2蛋白来稳定PSII。 组成性表达HSP21可以恢复热胁迫下PSII 的热敏稳定性和gun5突变体的功能缺失,表明HSP21是热胁迫条件下维持类囊体膜系统完整性的关键伴侣蛋白。研究人员借助MST技术直接在接近天然状态下的裂解液中检测了HSP21蛋白与PS II核心亚基D1和D2蛋白之间的亲和力。图注:MST技术检测HSP21和植物裂解液中D1/D2结合植物内某些蛋白较难纯化或者纯化后活性受影响,利用MST技术,可直接在植物裂解液内进行亲和力检测,无需纯化。在本次实验中,作者裂解表达35S::D1-eYFP或35S::D2-eYFP的转基因植物,直接向裂解液中加入梯度稀释的纯化HSP21蛋白,检测得到HSP21与D1/D2的亲和力Kd分别为0.67μM和1.32μM.02低温胁迫_蛋白&离子Ding, Yanglin, et al. "CPK28-NLP7 module integrates cold-induced Ca2+ signal and transcriptional reprogramming in Arabidopsis." Science Advances 8.26 (2022): eabn7901.寒冷的环境中会触发植物细胞质Ca2+的激增,导致植物的转录重编程。然而,Ca2+信号是如何被感知和传递到下游的低温信号通路仍然是未知的。中国农业大学杨淑华课题组研究发现,钙依赖性蛋白激酶28 (CPK28)启动了一个磷酸化级联,从而作用于低温诱导Ca2+信号下游的转录重编程。这项研究阐明了一种先前未知的机制,揭示了植物从质膜到细胞核的快速感知和转导低温信号的关键策略。研究中,作者通过MST实验检测到CPK28可直接与Ca2+结合。CPK28 EF-hand位点突变蛋白CPK28EFm与Ca2+亲和力降低了6倍,证明了EF-hand对结合Ca2+非常重要。图示:MST技术检测CPK28/CPK28EFm与Ca2+的亲和力03淹水胁迫_蛋白&离子Lehmann, Julian, et al. "Acidosis-induced activation of anion channel SLAH3 in the flooding-related stress response of Arabidopsis." Current Biology 31.16 (2021): 3575-3585.淹水胁迫导致厌氧菌引发的胞质酸中毒,使植物细胞感知酸性并通过膜去极化传递这种信号的分子机制尚不清晰。德国维尔茨堡大学研究表明,拟南芥根中酸中毒诱导的阴离子流出依赖于阴离子通道AtSLAH3,细胞质子浓度的增加使SLAH3从无功能二聚体转变为活性单体形式,激活了阴离子通道。研究发现硝酸盐对于pH依赖的通道激活至关重要,并通过MST技术研究SLAH3与NO3-的结合。图示:(左) 淹水相关胁迫响应中酸中毒诱导的阴离子通道SLAH3的激活(右) MST技术检测不同PH下SLAH3与NO3-亲和力作者表达SLAH3-GFP融合蛋白作为荧光信号源,无需其他标记。在pH6.5下检测到SLAH3与NO3-相互作用的Kd为120±50 mM。在pH为7.3时,SLAH3仍与NO3-结合,但亲和力降低了60%,表明SLAH3与阴离子的结合依赖于pH。04干旱胁迫_蛋白和磷脂分子Yang, Yongqing, et al. "Phosphatidylinositol 3-phosphate regulates SCAB1-mediated F-actin reorganization during stomatal closure in Arabidopsis."The Plant Cell 34.1 (2022): 477-494.为了应对干旱胁迫,植物关闭气孔以减少叶片蒸腾水分的损失。气孔运动受信号分子磷脂酰肌醇三磷酸(PI3P)的调控。然而,这一过程的分子机制尚不清楚。中国农业大学郭岩研究组研究表明,拟南芥气孔关闭过程中,PI3P通过与植物特异性肌动蛋白结合蛋白 (SCAB1) 结合,抑制其寡聚,从而调节气孔关闭期间保卫细胞中F-肌动蛋白稳定性和重排。为了检测SCAB1蛋白是否可与PI3P结合,作者进行MST实验,结果显示二者具有非常强的亲和力,解离常数Kd为4.5±0.09 pmol。为了确定具体结合位点,作者将PI3P motifs RXLR-dEER进行突变,MST结果显示,三重突变蛋白不能与PI3P结合。综合其他实验,最终证明,SCAB1的4个RXLR motifs均具有PI3P结合能力,且至少需要2个RXLR才能与PI3P结合。图示:MST检测SCAB1与PI3P的亲和力
  • 文献解读 | NanoTemper助力结核分枝杆菌细胞壁通路靶标膜蛋白研究
    01研究背景膜蛋白生命活动中具有重要作用,也是重要的药物靶点,而膜蛋白在进行互作研究过程中会有许多难点:1. 膜蛋白一般需要去垢剂来模拟脂质生物环境。对于基于固定的互作技术,去垢剂会增加背景信号,或者存在参比通道和样品通道背景不同的可能。2. 膜蛋白结构复杂,且与配体结合后可能发生变构。因此研究互作时,膜蛋白的正确构象至关重要。基于固定的技术可能阻碍变构过程,或者在固定和再生过程中破坏膜蛋白的构象。3. 膜蛋白的表达量低、纯化难,因此需要消耗量少的方法进行检测。本期文献解读,讲述如何利用MST及nanoDSF的手段来进行膜蛋白互作研究的故事。02研究内容2024年3月15日,上海科技大学张璐研究员/饶子和院士团队在Nature Microbiology发表题为“Structural analysis of phosphoribosyltransferase-mediated cell wall precursor synthesis in Mycobacterium tuberculosis”的研究,解析结核分枝杆菌全新药物靶标——膜蛋白磷酸核糖转移酶Rv3806c与其受体底物DP和供体底物PRPP结合复合物的精细三维结构,为研究Rv3806c作为新靶点的靶向性药物研发提供了重要的理论基础。https://doi.org/10.1038/s41564-024-01643-8IF: 28.3 Q1通过对Rv3806c与供体底物PRPP复合物结构分析,推测可能影响Rv3806c结合和酶活的位点,并通过MST进行大量突变Rv3806c亲和力检测进行验证。Rv3806c为膜蛋白,并且在脂质环境中以三聚体形式组装。实验种共有10种突变体需进行Kd检测,每次实验均进行了5次重复。MST进行一次亲和力检测时,仅需32pmol、1μg的膜蛋白Rv3806c,大大节约蛋白消耗量。此外,MST技术是在溶液条件下进行,无需固定,且兼容去垢剂,使膜蛋白能保持正确的构象,甚至可以完成nanodisc或者膜提取物形式的膜蛋白亲和力检测,从而可以轻松表征膜蛋白Rv3806c多种突变体与底物PRPP的亲和力。图示:MST测定PRPP与WT-Rv3806c及突变体的结合亲和力此外,研究发现,供体底物PRPP通过一个Mg2+结合在TM螺旋束-1的空腔。为了研究Mg2+对Rv3806c结合供体底物PRPP的作用,作者使用MST和nanoDSF技术检测存在或不存在Mg2+时,Rv3806c与底物PRPP的结合。NanoDSF技术通过监测蛋白内源荧光的变化来表征蛋白结构,无需加入外源荧光染料,兼容去垢剂。使用GDN纯化的Rv3806c完成MST亲和力实验和nanoDSF的热迁移实验,结果显示Mg2+对于PRPP的结合至关重要。图示:MST分析在Mg2+存在或不存在的情况下,PRPP与Rv3806c的结合亲和力。在没有Mg2+的情况下,结合亲和力急剧下降,而在金属螯合剂EDTA的存在下,没有检测到结合。图示:在Mg2+、PRPP和EDTA存在或不存在的情况下,纯化后的Rv3806c的nanoDSF热稳定性分析。PRPP-Mg2+存在时Rv3806c表现出最高的热稳定性。03技术优势在这篇工作中,通过MST技术及nanoDSF技术,确定了膜蛋白Rv3806c与PRPP结合的关键残基,以及Mg2+在互作过程中的关键作用。对于分子互作亲和力的检测,Monolith系列仪器无需固定样品,且不限制缓冲条件,蛋白用量少,可以在溶液中表征膜蛋白与小分子的亲和力。Promethus系列仪器,以nanoDSF技术为核心,通过检测蛋白内源荧光监测蛋白的稳定性,无需外源荧光染料,兼容去垢剂,低浓度也可轻松表征,在膜蛋白稳定性分析和TSA互作定性研究上具有显著优势。-Monolith分子互作检测仪--PR Panta蛋白稳定性分析仪-
  • 量子显微镜可详细观察活细胞细节
    显微镜技术取得重大突破!据最新发表在《自然》杂志上的文章,来自澳大利亚昆士兰大学的研究人员发明了一种量子显微镜,可使研究人员在的情况下检查活细胞,看到其他方式无法揭示的生物结构细节。这为生物技术的应用铺平了道路,且有望应用于导航、医学成像等领域。  显微镜由量子纠缠提供动力,爱因斯坦将这种效应描述为“远距离幽灵般的相互作用”。  来自昆士兰大学量子光学实验室和ARC工程量子系统卓越中心(EQUS)的沃里克鲍恩教授说:“这是第一个性能超过现有最佳技术的基于量子纠缠的传感器。”这台量子显微镜的成功首次证明,量子纠缠改变传感范式的潜力。  量子显微镜的一个主要成功之处在于,它能够跨越传统光基显微镜的“硬障碍”。通常,传统的光学显微镜会在被观察的生物样本上聚焦照明光线,更强大的光源使研究人员能够更细致地看到细胞。但这种方法的精确度存在一个根本性限制:在某一时刻,足够明亮的光线会破坏活细胞。  鲍恩和他的同事们已经找到了克服该问题的方法。他们使用了一种带有两个激光光源的显微镜,但通过一种特殊设计的晶体“挤压”了其中一束光线。它通过在光子(激光束中的光粒子)中引入量子纠缠来做到这一点。  光子被耦合成相互关联的对,其中任何具有不同于其他光子能量的光子都被丢弃,而不是被配对。这一过程降低了光束的强度,同时降低了其噪声,从而可以进行更精确的成像。  大约10纳米厚的酵母细胞的细胞壁及其细胞液,即使用最好的非量子显微镜,这两者的成像都是微弱的,用标准显微镜则是完全看不见的,而用量子显微镜则可以看到它们的结构细节,从而帮助我们在最小的尺度上理解生命的基本知识。  英国埃克塞特大学的弗兰克沃尔默表示:“这是光学显微镜领域的一项非常令人兴奋的进展,它为改进最先进的显微镜的工作方式打开了大门,其光强度正好不会破坏生物样本。”  鲍恩说,量子显微镜也将有实际应用。例如,光学显微镜经常被用来确定细胞是否癌变或诊断其他疾病,而量子显微镜可以显著提高这些测试的灵敏度,并加快测试速度。
  • 好物助研 | 想要养好细胞,你需要@biocomma®细胞培养基!
    细胞培养在科研界的地位举足轻重,很多成果可谓是成也细胞培养,败也细胞培养。影响细胞培养的因素有很多。其中很重要的一步就是为细胞选择适合的生长环境,为其选择成分适合又营养丰富的细胞培养基。以下介绍两款常用的细胞培养基,可满足多种细胞贴壁及悬浮培养需求,超强品质,久经考验,值得信赖!好物助研/推荐两款常用培养基DMEM(高糖)培养基DMEM是由Dulbecco改良的Eagle培养基,由MEM培养基改良而来,起初是为小鼠成纤维biocomma® DMEM培养基是MEM培养基的改良版,包含高糖型和低糖型2种。DMEM高糖培养基可促进细胞贴壁,适用于生长快、高密度、粘附性低的细胞,如原代成纤维细胞、神经元、胶质细胞、平滑肌细胞、HUVEC,以及 HeLa、293、Cos-7 和 PC-12 等细胞系,是细胞培养中常用的培养基。RPMI 1640培养基biocomma® RPMI 1640培养基是McCoy's 5A培养基的改良版,最初是为淋巴细胞培养专门设计的。现已广泛应用于各种哺乳动物细胞尤其是悬浮细胞的培养,如 HeLa 细胞、Jurkat 细胞、 MCF-7 细胞、PC12 细胞、PBMC 细胞、星形胶质细胞和肿瘤细胞等,是细胞培养中使用非常广泛的培养基。产品特点方便即用型,经过滤除菌,高效便捷专业专业生产工艺,ISO9001认证,GMP 标准,全程可溯源化优质出色的培养效果,质量有保证稳定优选的原材料,保证批间一致性为何选择biocomma® /全产业链生产能力原材料筛选通过LC/MS、GC/MS做严格原料筛选,确保产品间批次间的稳定性与一致性。无菌生物工艺包材瓶子为无菌/无酶/无热原医药包材,由ASB和青木固一步法加工而成,无二次污染。四种无菌工艺采用环氧乙烷+湿热+超滤+辐照4道无菌工艺。自动化无菌灌装注射级用水,全程自动化无菌灌装。选择高品质的培养基,对于细胞培养而言,不仅可以确保您实验数据的稳定性和可重复性,更能节约宝贵的实验时间和精力。逗点生物biocomma® 细胞培养基,GMP标准生产车间,搭配超强的全产业链生产能力,完美把控出品,可为客户提供各类细胞培养的定制化产品及品牌一体化服务!如感兴趣,可通过400-860-5168转3309官方客服热线联系我们!
  • 植物愈伤组织能再生器官研究获进展
    组织培养是重要的植物营养繁殖技术,也是基因编辑等现代农业分子育种技术得以应用的基础。20世纪50年代,由Skoog、Miller奠定的组织培养技术沿用至今(Symposia of the Society for Experimental Biology,11:118–130, 1957)。在两步法组织培养技术中,第一步是获取多能性(pluripotency acquisition),即利用高浓度生长素诱导外植体产生具有再生多种器官能力的愈伤组织;第二步是器官发生(organogenesis),即通过高浓度细胞分裂素诱导愈伤组织再生为芽,或通过低浓度生长素诱导愈伤组织再生为根。2010年,Meyerowitz实验室提出愈伤组织类似于根尖分生组织,开启了关于愈伤组织在细胞和分子层面的新认识(Developmental Cell,18: 463-471, 2010)。  愈伤组织的器官再生能力是植物再生领域的核心科学问题之一,而尚未在分子机制方面得到合理解释。为什么愈伤组织能够在不同的激素诱导下再生为不同的器官,而普通体细胞却没有这样的能力?11月15日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心徐麟研究组的研究成果(Pluripotency acquisition in the middle cell layer of callus is required for organ regeneration)作为封面文章,发表在Nature Plants上,从单细胞和分子层面揭示了愈伤组织具有器官再生能力的机制。  研究对拟南芥下胚轴产生的愈伤组织展开单细胞测序,确认了愈伤组织类似于根原基或根尖分生组织,大致分为三层:外层细胞类似于根尖的表皮和根冠;中层细胞具有根尖静止中心(quiescent center,QC)的特征;内层细胞类似于根尖的维管初始细胞。研究运用转录组比较分析、特征基因表达模式观察和细胞谱系追踪等方法,发现愈伤组织中层细胞与根尖静止中心QC有高度类似的转录组特征,也是根和芽再生的源头干细胞。在遗传表型方面,根尖静止中心QC的特征转录因子基因WOX5及其同源基因WOX7突变后,愈伤组织的器官再生能力下降;而WOX5/7过量表达可以使愈伤组织在低浓度细胞分裂素的情况下也具有芽再生的能力。分子层面的研究发现,WOX5/7至少通过三条通路促进愈伤组织中层细胞获取多能性:WOX5/7维持愈伤组织中层的干细胞属性;WOX5/7-PLT蛋白复合体能够激活内源生长素合成基因TAA1的表达,促进高浓度生长素的积累;WOX5/7-ARR12复合体能够抑制ARR5基因的表达,从而解除细胞分裂素的负反馈信号通路,达到细胞分裂素超敏感状态。  根据上述结果,研究推测愈伤组织具有器官再生能力的原理。愈伤组织中层细胞具有干细胞特征,处于未分化状态。愈伤组织的中层细胞具有双激素信号高峰的特征,即同时具备高浓度生长素积累和细胞分裂素超敏感的双重特性。这两个特征使愈伤组织具有既能再生根又能再生芽的能力:当培养基中只含有低浓度生长素而不含有细胞分裂素时,愈伤组织由于积累了高浓度生长素而分化为根;当培养基中含有高浓度细胞分裂素时,愈伤组织的细胞分裂素超敏感状态使细胞分裂素能快速有效的激活芽基因的表达,从而发育为芽。而在已分化的体细胞中,生长素途径和细胞分裂素途径相互抑制,无法达到两种激素信号的双高峰状态,因而不具备器官再生的能力。  研究工作得到国家自然科学基金、中科院、植物分子遗传国家重点实验室的支持。愈伤组织转录组数据和单细胞转录组数据可通过线上工具查询(http://xulinlab.cemps.ac.cn/)。  论文链接
  • 比朗最新发布 超声波细胞粉碎机BILON96-II
    原标题:比朗最新发布 超声波细胞粉碎机BILON96-II   继超声波细胞粉碎机新一代BILON96-II 在实验室研究成功之后,现已经可以投入使用,新产品已经在火爆销售中。   超声波细胞粉碎机是一种利用超声波在液体中产生空化效应的多功能、多用途仪器。它能用于多种动植物、病毒、细胞、细 菌及组织的破碎,同时可用来乳化、分立、匀化、提取、消泡、清晰、纳米材料的制备、分散及加速化学反应等。   超声波细胞粉碎机BILON96-II主要特征:   超声探头为进口钛合金材质,经久耐用,高能效换能器,确保功效强劲,振幅自动调节,在不同的负载状况时振幅保持一致,工作时间,超声间歇均可设置,微机控制,超声功率连续可调,集成温度控制防止样品过热,隔音箱均采用特殊隔音材料,隔音效果好。   仪器被广泛应用于生物学、微生物学、物理学、动 物学、农学、制药、化工、污水处理、纳米材料等领域。   技术参数:超声波细胞粉碎机BILON96-II 型号 工作频率 (KHz) 超声波功率 (W) 随机变幅杆 破碎容量 (ml) 可选配变幅杆 占空比 BILON96-II 20-25 10-150 &Phi 6 0.2-150 &Phi 2、&Phi 3,&Phi 8,&Phi 10 1-99.9% BILON88-II 20-25 10-250 &Phi 6 0.2-250 &Phi 2、&Phi 3,&Phi 8,&Phi 10 BILON92-II 20-25 20-650 &Phi 6或&Phi 10 0.2-500 &Phi 2、&Phi 3,&Phi 10,&Phi 12,&Phi 15 BILON98-III 19-23 200-1200 &Phi 20 50-1000 &Phi 15、&Phi 22、&Phi 25、&Phi 28 温控型(★:以下三款均带有温度控制功能) 型号 工作频率 (KHz) 超声波功率 (W) 随机变幅杆 破碎容量 (ml) 温度保护 BILON92-IID 20-25 20-900 &Phi 6或&Phi 10 0.2-600 样品温度至90℃ BILON98-IIID 19-23 200-1200 &Phi 20 50-1000 BILON99-IID 19-23 400-1800 &Phi 20或&Phi 22 250-1200 超声波细胞粉碎机http://www.bilon99.com/html/106-145.html
  • Nature重磅:离人造生命又近一步?首个具有主动运输能力的“人造细胞”问世!
    长期以来,人造生命一直是生物医学界的前沿话题, 2020年美国科学家克雷格文特尔团队向世界宣布,首例人造生命——完全由人造基因控制的单细胞细菌诞生,开启了“人造细胞”的新时代。但遗憾的是,研究发现这些细胞“复制品”往往缺乏执行复杂细胞过程的能力,如主动运输。  近日,这一难题终于取得了重大突破。美国纽约大学和芝加哥大学的科研团队联合在顶级期刊《Nature》上发表了一篇题为“Transmembrane transport in inorganic colloidal cell-mimics”的研究,他们利用人工合成材料设计了一种具有单个微孔的“无机中空微胶囊”,它可作为一种“人造细胞”,重现活细胞的基本功能,实现主动运输。  众所周知,细胞是生物体基本的结构和功能单位,是生长、发育的基础,解析其结构和功能对于科学家理解生命与基因的奥秘具有重要意义。然而,尽管目前细胞生物学研究已经取得重大进展,但人造细胞仍有诸多问题有待解决,如活细胞的一个基本功能“主动运输”,它可以帮助活细胞从环境中吸收必要的营养物质、储存能量、并排除代谢废物,但人造细胞却缺乏这种能力。为此,在这项最新的研究中,科学家们将重点放在人造细胞的主动运输能力上。(图注:具有主动运输功能的“人造细胞”)  那么何为主动运输呢?主动运输就是物质逆浓度梯度,在载体蛋白和能量的作用下将物质运进或运出细胞膜的过程。这个过程不仅要借助于镶嵌在细胞膜上特异性传递蛋白质分子作为载体,而且还须消耗细胞代谢所产生的能量来完成。因此,细胞膜对活细胞完成各项生命活动有重要作用。  在这项最新的试验中,为了设计人造细胞,研究人员使用一种聚合物制作出了细胞膜替代物“红细胞大小的球形膜”,以便于控制物质进出细胞,然后他们为了模拟细胞中可进行物质交换的蛋白质通道,在球形膜上钻了一个微型孔,形成了一个纳米通道。(图注:纳米通道)  随后,在构建“人造细胞”的前期工作准备就绪后,研究人员开始着手考虑如何为这种细胞复制品的“主动运输”过程提供动力来源。  他们在人造细胞的纳米通道内添加了一种固体光催化剂,当被光激活时,这种催化剂会作为内部泳动泵发挥作用,通过化学反应形成一个微小的真空环境,并将周围的物质拉入细胞膜中。当停止光照时,物质被捕获,并在细胞膜内进行反应。同时这一化学反应还可以逆转,用于排泄废物。  最后,研究人员在不同的环境中测试了这些人造细胞,将它们置于悬浮液中,同时用光激活,令人震惊的事情发生了,这些细胞可以从周围环境中捕获固体颗粒、杂质、乳液液滴和细菌。此外,还可以收集具有不同几何形状和成分的颗粒,然后将其融合在一起形成复合混合物。更重要的是,一维大于微孔直径的棒状颗粒也能有效地在细胞内运输。这个现象为我们提供了一个人造细胞用途的新思路,即可用于清理液体中的微观污染物,如净化水资源。此外,还可以给细胞装上药物,根据指令释放药物。(图注:主动运输过程)  该研究的通讯作者、纽约大学化学副教授StefanoSacanna表示:“我们可以把这些人造细胞吃污染物的过程想象成吃豆人(PAC-MAN)视频游戏。其技术理念是将迄今为止仅限于活细胞的主动运输功能添加到人造细胞中,技术核心是在细胞内部安装可提供动力的活性元件,使其与细胞壁施加的物理限制发生协同作用,以便摄入、处理和排出异物”。  总而言之,这项研究为构建“细胞模拟物(cellmimics)”提供了一个蓝图,其未来的潜在应用范围可从药物递送到环境科学,下一步,科研人员将探索出人造细胞的其他功能,并找到人造细胞相互“交流”的方法。但人造生命究竟是科幻还是现实?它会给我们的生活带来怎样的改变?它给人类带来的到底是福音、还是灾难还需时间去证明。
  • 为了样品破壁处理差点长住实验室,与隔壁师妹相比到底输在哪
    对于多数微生物及藻类,无论是通过提取目的基因组 dna 进行下游测序、鉴定、克隆等分子实验,或者进行胞内物质如蛋白质、生物活性分子的研究,都需要首先对样本进行破壁前处理。现有的细胞破壁方式有很多种,有优势也存在不足之处。常见破壁方法特点酶法反应温和,但不具有通用性,不同菌种需选择不同的酶,效果各异,且溶酶易造成产物抑制,同时溶酶价格高,限制了使用。化学法选择性高,但效率较差,且化学试剂的添加会形成新的污染,给进一步的分离纯化增添麻烦。超声波法适合处理少量样品,但超声过程中容易产热,导致蛋白质变性,破坏分子活性。液氮研磨单个样本操作,要求操作快速,比较费时费力,且操作不慎容易冻伤。反复冻融法对于细胞壁较脆弱的菌体可采用此法,但耗时较长,冻融时间及次数需多次优化。高压匀浆法适用于大量样本,对设备要求高,且较小的革兰氏阳性菌、真菌菌丝容易对仪器造成堵塞及损伤,且费用较高。对于实验室操作人员来讲,方法越简单高效越好。那有没有适合少量样本的通用性强、可同时处理多个样本又不影响下游实验的简单的操作方法呢?当然有啦!那就是今天小编要给大家介绍的利用细胞破碎仪破壁的涡旋破壁法。细胞破碎仪细胞破碎仪的破壁作用原理是使细胞悬浮液与微珠在快速振荡的作用下充分混合,微珠之间及微珠与细胞之间相互剪切、碰撞,促使细胞壁破碎,释放内含物,破壁效果达80%以上,非常适用于普通实验室的研究工作。使用过程中只需要用到占地面积12cm2的小型细胞破碎仪mx-c、2ml ep管及破壁微珠。细胞破碎仪可以有效解决不同细胞由于其结构、数量等原因给细胞破碎带来的困难:革兰氏阳性菌细胞壁主要由肽聚糖和酸性多糖构成,各类酵母菌、真菌细胞壁主要由多糖和蛋白质构成,其致密的网状结构均不易破碎;部分样本取样困难,数量有限;不恰当的破壁方式可能会导致基因组断裂,影响后续试验。应用——酵母菌破壁01镜检验证酵母菌液 300ul,使用细胞破碎仪最大转速破壁 5min,破壁前后分别镜检计数。02qpcr 验证01取 106 个酵母细胞,破壁前和破壁后分别提取基因组后进行 qpcr 验证。未破壁 ct 值为 33.08,破壁后 ct 值为 22.83,破壁后基因组模板浓度提高 103 倍。02106 个酵母细胞 10 倍系列稀释至 105、104、103 破壁后分别提取基因组后进行 qpcr 验证。标准曲线 r2=0.99,说明细胞在 103-106 范围时,破壁效率基本一致,在低浓度时破壁效率依然达到 80% 以上,说明细胞破碎仪非常适用于少量稀有样本的破碎。如果童鞋们对它感兴趣,可以详询各地区负责人哦~http://www.dlabsci.cn/plus/list.php?tid=198
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