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沙箱模型相关的资讯

  • 生物3D打印应用 | 构建体外肝毒性模型
    受伦理和费用影响,使用动物来进行毒理实验变得越来越困难。同时,动物所得到的结果很有可能与实际临床试验有差别,因而给临床试验带来了潜在的风险。于是,科研工作者开始尝试在体外构建三维细胞培养物——类器官。类器官通常具有相应器官的关键特征,以此科研工作者就可以使用它们来进行相应器官的药物毒理学试验,常见的如使用肝脏类器官检测药源性肝损伤(Drug Induced Liver Injury,DILI)。一些较为简单的模型构建事实上已经使用了较长时间,但这些模型缺乏长效性(Longevity)和组织复杂度(Tissue-level Complexity),得出的结论往往不具有充分的可靠性。 在此背景下,Deborah G. Nguyen等人使用病人来源的肝脏细胞和非薄壁细胞以3D打印的形式构建了无支架类器官。相较于传统的偏二维模型或简单三维模型,该类器官在4周后仍然能够维持一定程度的ATP、白蛋白甚至是药物介导的活性细胞色素P450s酶。为评估该类器官的功能性,作者选用曲伐沙星——一种因肝毒性较强而无法用标准临床前模型评估肝毒性的药物——与无明显肝毒性药物左氧氟沙星进行对比。发现曲伐沙星在临床浓度下(≤4 μM)的肝脏毒性与浓度呈显著性正比关系。图1 置于24孔板中的肝脏类器官此外,尽管有很多相关的文献,但对于准备进入这一领域的科学工作者而言,面对各种各样的细胞模型、种类繁多的模型构建方法,可能会耗费许多时间理清头绪。面对这种情况,Xihui等人在综述Three-dimensional liver models: state of the art and their application for hepatotoxicity evaluation一文中,详细阐述了构建体外三维肝脏模型的相关内容。分为模型建立方法、细胞种类、在药源性肝损伤(DILI)中的重要性及相关商业化情况,主要内容如下: l 模型构建:根据辅助材料的使用与否分为有支架(主要为水凝胶、琼脂糖等遇水形成一定支撑力的材料,其中便提到在regenHU技术和产品的推动下,利用细胞外基质(extracellular matrix,ECM)作为支架材料进行肝脏3D打印成为了非常重要的模型构建方法)和无支架模型两种,分别介绍了建立方法和优缺点。 l 细胞种类:原代人类肝脏细胞(Primary Human hepatocytes)、干细胞分化的类肝脏细胞(stem cell derived hepatocyte like cells)、永生化肝细胞系(immortalized hepatic cell lines)等三种不同类型的肝脏细胞。 l 肝毒性研究应用:肝毒性主要有两个来源——药物本身或经由药物代谢产生的产物。因而在本章节对直接毒性和慢性毒性均进行了介绍。同时,作者也总结了纳米药物的肝脏毒性。 l 商业化情况:因生物3D打印的速率尚不足以满足批量生产,因而作者认为该项应用仍以定制为主。通过使用病人来源的细胞,科研工作者可构建类器官进行个性化药物筛选和个体化药效评价,随着商业医疗的逐步完善,这一市场将极具发展前景。 该综述全面的内容为正要和即将进行类似实验的科研工作者提供了便利。但正如作者所言,类器官仍在多个国家遭受不同程度的文化、法规障碍,在努力争取科研许可的同时,也应牢记科学底线,为社会带来正能量。 参考文献:[1] Zhang X, Jiang T, Chen D, et al. Three-dimensional liver models: state of the art and their application for hepatotoxicity evaluation[J]. Critical Reviews in Toxicology, 2020(11):1-31.[2] Nguyen D G, Funk J, Robbins J B, et al. Bioprinted 3D Primary Liver Tissues Allow Assessment of Organ-Level Response to Clinical Drug Induced Toxicity In Vitro[J]. Plos One, 2016, 11(7):e0158674.目前,regenHU产品可经由我司购买。regenHU生物3D打印机具有高精度、高稳定性、打印方式广泛、应用面广等特点,欢迎大家咨询!联系电话021-37827858 或 13818273779(微信同号)。点击以下链接,查看往期回顾生物3D器官打印——人工角膜生物3D器官打印——肠道体外模型生物3D器官打印——喉部软骨
  • 我国首个渔业大模型“范蠡大模型1.0”发布
    6月15日,我国首个渔业大模型“范蠡大模型1.0”在中国农业大学发布,据悉,该模型可以实现渔业多模态数据采集、清洗、萃取和整合等,将为渔业养殖工人、管理经营者和政府决策部门提供全面、精准的智能化支持。“范蠡大模型1.0”发布现场(中国农业大学供图)渔业大国,面临转型的需求我国是水产养殖大国,数据显示,2023年,我国水产养殖产量达5812万吨,约占世界水产养殖总产量的60%以上,为城乡居民提供了1/3优质动物蛋白。但同时,我国不是养殖强国,水产养殖资源利用率、劳动生产率低,水产养殖产业发展面临多种转型需求。范蠡大模型设计者、发起者、国家数字渔业创新中心主任、中国农业大学信息与电气工程学院教授李道亮介绍,“我国水产养殖品种繁多,包括鱼、虾、蟹、贝、参、藻等,养殖模式多样,建立完整养殖品种的生产模型是极其困难的;同时,劳动力出现了普遍老龄化现象,有调查数据显示,我国水产养殖中,劳动力成本占70%左右,劳动者平均年龄达到55岁。新一代缺乏养殖经验,也不愿意从事传统的养殖生产,需要人工智能技术的支持。”范蠡大模型设计者、发起者、国家数字渔业创新中心主任、中国农业大学信息与电气工程学院教授李道亮(中国农业大学供图)随着现代技术的发展,水产养殖已经从1.0时代发展到4.0时代。李道亮介绍,“渔业1.0时代主要以小农生产为主,特征是依靠人力、手工工具、经验等养殖。2.0时代,水产养殖逐渐实现机械化、装备化,主要依靠机械动力和电力进行生产。3.0时代,自动化和计算机技术成为核心,生产装备出现数字化、网络化、自动化特征。到4.0时代,物联网、大数据、人工智能、机器人等技术普遍应用在生产中,无人化生产逐渐实现。”随着人工智能、机器人学习等技术的逐渐出现和成熟,越来越多的农业场景开始应用这些技术,但作为水产养殖大国,我国当前的水产养殖中,相关技术的应用还较为缺乏。渔业模型,从小到大的升级如何在水产养殖中应用现代技术,甚至打造未来的无人渔场?李道亮介绍,我国水产养殖品种繁多,养殖环境差异较大,而机理模型的构建,需考虑鱼类品种、饵料、病害、环境变化等一系列因素,面对众多的品种和养殖模式以及地区气候差异,逐个养殖品种建立像发达国家的养殖机理模型是不现实的。所谓大模型,是指具有大规模参数和复杂计算结构的机器学习模型,参数数量动辄数十亿甚至数千亿。在渔业中,大模型可以利用深度学习和数据驱动的方法,能够分析海量的养殖数据,揭示其中的规律和关联性。“它们不仅能够模拟和预测水质、饵料、疾病等因素对养殖效果的影响,还能够优化养殖方案,提高生产效率和经济效益。”李道亮说。智能池塘养鱼场景(中国农业大学供图)随着社会发展和水产养殖业转型,渔业大模型越来越成为产业发展的重要助力,为此,李道亮带领团队联合中国联通、中国电信、中国移动三家运营商、全国主要水产院校和科研机构,以鱼、虾、蟹、贝等27种我国主养品种水产文本语料为主,辅以文本、图像、视频、音频等多模态数据,形成大规模渔业专业知识语料库,通过深度学习架构,通过预训练和微调、参数共享与注意力机制、提示工程等技术,实现渔业多模态数据采集、清洗、萃取和整合等。“这一模型,不仅实现了丰富的渔业养殖知识生成,还包括水、饵、病、管等多方面多元化的预测、分析和决策。”李道亮说。范蠡为名,改变未来的渔业大模型构建成功后,命名为“范蠡大模型1.0”。李道亮介绍,范蠡是春秋末期越国大夫,众所周知的是,他是著名的政治家、军事家,也是商家鼻祖,但他同时也是我国最早的水产养殖专家,早在2500年前的春秋时期,他就写了一部《养鱼经》,并流传至今,“所以我们以范蠡为名,希望它能够在新时代中,为我国水产养殖带来的新的气象。”据介绍,范蠡大模型1.0分为请问我、请听我、请看我、请决策四个模块,分别代表文本、语音、视频、物联网决策四大场景,用户可以查询渔业的不同应用。而针对准确监测和评估鱼类的健康状况和体重异常耗时费力,且可能对鱼类造成伤害的问题,国家数字渔业创新中心开发了基于计算机视觉技术的鱼类体重估计模型,基于机器视觉实时捕捉水下鱼类图像和优化构建的深度神经网络算法,自动完成图像中鱼类目标的检测和定位,通过提取形状、颜色、纹理等多维度特征,以非接触方式实现对鱼类体重的实时、准确估算,同步完成生长及健康状态监测和计算,为投饵决策、水环境、能耗优化控制提供数据支撑。范蠡大模型利用了多种现代技术,以此实现水产养殖的数字化、无人化。图为鱼的种类识别模型(中国农业大学供图)“当前,范蠡大模型还是1.0,未来还会不断进化,人工智能在智慧渔业中的应用,是多元化且深远的、长期的,不可能一蹴而就。未来,范蠡大模型还有很长的路要走,必须充分发挥通信、科研、水产养殖企业、养殖户等各种不同领域的优势力量,以产学研用协同推进大模型的开发与应用,人工智能才能真正落地。”李道亮说。
  • 三维表面模型可视化软件Vayu 1.0发布
    包括古生物学在内,众多科研领域已经在前所未有的精度和广度上大规模应用X射线计算机断层扫描以及三维重建技术,随之对生成的三维表面模型的可视化效果方面也提出了更高的需求。目前大部分三维重建处理软件在处理三维表面模型方面能力较弱,已有的三维表面模型软件通常未对生物学三维表面模型数据作相应的优化,且在使用上往往存在上手困难,操作复杂,无法处理大数据文件等问题。 Vayu 主界面与部分案例展示针对以上问题,为了提升化石和现代生物成像数据的可视化效果,中国科学院古脊椎动物与古人类研究所卢静研究员团队自主研发了专门用于处理三维表面模型的新的免费软件Vayu 1.0,并在《古脊椎动物学报》上详细介绍了该软件的基本功能、操作流程以及相关案例展示。Vayu 1.0主要针对化石及现代生物成像数据可视化需求进行优化,可以广泛应用于古生物、生命科学、医学、考古等多学科领域三维表面模型的可视化乃至虚拟空间交互等方向。Vayu 1.0软件提供了一整套针对三维表面模型的编辑、渲染、标注、分析等可视化工具,同时自带VR模式以及快捷的动画制作方法,让使用者能在最短时间内掌握对三维表面模型进行快速渲染和动画制作,为三维表面模型的可视化提供了新工具。Vayu 1.0还包含虚拟现实(VR)模式和一站式动画制作平台等多种可视化工具,为各领域的三维表面模型渲染与可视化提供了新发展方向和思路。除此以外,Vayu 1.0在博物馆科普教育与学校教育等领域也可以提供广泛的应用场景。 Vayu 三维可视化渲染动画展示Vayu 现代鲨鱼身体内部三维结构VR动画该研究得到了中国科学院院战略性先导科技专项(B类)、国家自然科学基金优秀青年基金等项目的资助。论文链接:http://www.vertpala.ac.cn/CN/10.19615/j.cnki.2096-9899.221020软件下载链接: http://admorph.ivpp.ac.cn/download.html
  • 器官芯片模型在神经免疫系统研究中的新进展
    帕金森病(PD)和阿尔茨海默病(AD)是由基因、环境和家族因素相互作用引起的神经退行性疾病。值得注意的是免疫系统对疾病发展的影响,脑部驻留的小胶质细胞的功能障碍,会导致神经元的丧失和症状加剧。研究人员通过神经免疫系统模型来更深入地了解这些神经退行性疾病的生理和生物学方面以及它们的发展过程。不列颠哥伦比亚大学的Stephanie M. Willerth教授团队和英国诺丁汉特伦特大学的Yvonne Reinwald教授团队于2024 年 1 月 23 日在《Journal of Neuroinflammation》(影响因子:9.3)杂志上发表了题为“Modeling the neuroimmune system in Alzheimer’s and Parkinson’s diseases”的综述,介绍了神经免疫系统在三维模型和器官芯片系统方面取得的进展,以及模型在准确模拟复杂的体内环境方面的巨大潜力。 研究背景阿尔茨海默病(AD)是老年人中最常见的痴呆类型,与淀粉样斑块和磷酸化Tau蛋白的异常积累有关,虽具体原因尚不完全清楚,但与遗传和环境因素相关,诊断及早干预至关重要。帕金森病(PD)是一种神经系统疾病,主要表现为运动障碍,与聚集的α-突触核蛋白(α-syn)沉积物Lewy小体有关,相关基因变体也与其发病风险增加有关。尽管PD的确切原因尚不清楚,但其发病机制可能涉及多巴胺能神经元功能障碍以及氧化应激、线粒体功能受损、蛋白质代谢异常和神经炎症等多种因素。图1:阿尔茨海默病和帕金森病的病理生理学。 中枢神经系统(CNS)过度炎症的特征包括多种因素共同促进疾病进展,其中包括各种抗炎与促炎细胞因子的失调、CNS内小胶质细胞等免疫细胞的表型转化,以及外周细胞的巨噬细胞和淋巴细胞的招募,这些因素均导致突触丧失,成为随后认知功能障碍的最常见病理相关因素。图2:健康与病理神经免疫系统的比较:在健康的神经免疫系统中(1)小胶质细胞处于稳态和监视状态,(2)外周免疫细胞向中枢神经系统的浸润有限。在病理性神经免疫系统中:(3)小胶质细胞反应性增强,形态改变,(4)吞噬作用增加,(5)炎症标志物增加,(6)外周免疫细胞浸润增加。 研究进展1、目前阿尔茨海默病和帕金森病的治疗和临床试验针对AD,乙酰胆碱酯酶是一个常见的药物靶点,近期研究专注于开发单克隆抗体等药物以减少Aβ负荷,如lecanemab和aducanumab。此外,针对AD的临床试验正在进行中,旨在测试药物、设备和行为以改善患者认知和减缓疾病进展,而对于PD,则主要以药物和深部脑刺激为主要治疗手段,同时也在研究新的免疫调节治疗方法。 2、阿尔茨海默病、帕金森病和免疫系统的体外免疫系统模型癌症免疫系统的研究已经取得了许多成果,其中包括对3D模型的发展,这对于疾病建模和药物筛选至关重要,尤其是针对新的化疗药物和人工组织的开发。一种体外建模方案是使用细胞系,最常用的是SH-SY5Y人类神经母细胞瘤细胞系,模拟未成熟的儿茶酚胺能神经元,并可通过暴露于神经毒素或基因修饰来模拟AD或PD。然而,SH-SY5Y存在缺乏确立的培养维持程序、实验结果不一致和细胞生长的可变性等缺点,且不表现出成熟神经元的电生理和电化学特征。利用诱导多能干细胞(iPSC)创建基因准确的AD和PD模型,成为一个快速发展的研究领域,这些模型可以通过体细胞来源的iPSC诱导后,生成神经元与免疫细胞,用来构建AD和PD模型。图3:神经免疫系统的体内和体外模型的优缺点。 3、器官芯片模型在神经免疫系统研究中的新进展器官芯片平台的出现为建立体外模型提供了增强的设计和控制能力,能够模拟生物、生化、生理和机械现象,在活体器官系统中的发生。从血液-脑脊液屏障微流控模型到脑芯片模型,研究者们不断探索着复杂的生理学建模,为深入分析神经免疫相互作用提供了新的可能。这些模型不仅揭示了神经炎症在神经退行性疾病中的重要性,还为治疗干预提供了潜在途径,为了解AD和PD的潜在机制提供了宝贵的见解。同时,脑芯片模型被广泛应用于研究神经血管相互作用和神经退行性的不同方面。通过模拟神经-胶质-血管相互作用,研究人员发现了柴油排放颗粒等外源因素对AD类疾病病理特征的影响。这些研究不仅强调了神经免疫特异性行为的重要性,还突显了人类细胞模型在理解神经退行性疾病方面的关键作用。然而,尽管研究对细胞间相互作用和人类细胞模型的依赖日益增加,但对于AD和PD潜在机制的理解仍然相对有限。图4:芯片上器官的发展:示意图显示了开发和制造微流控芯片所需的步骤 先进的免疫细胞相互作用在AD和PD病理中至关重要,调节其功能可能为更有效的治疗提供希望;器官芯片模型具有模拟复杂细胞相互作用的优势,有助于深入了解AD和PD疾病机制并发现新的治疗策略。 文献索引:Balestri W, Sharma R, da Silva VA, Bobotis BC, Curle AJ, Kothakota V, Kalantarnia F, Hangad MV, Hoorfar M, Jones JL, Tremblay MÈ , El-Jawhari JJ, Willerth SM, Reinwald Y. Modeling the neuroimmune system in Alzheimer's and Parkinson's diseases. J Neuroinflammation. 2024 Jan 23 21(1):32. doi: 10.1186/s12974-024-03024-8. PMID: 38263227 PMCID: PMC10807115. 关于艾玮得生物作为一家专注于人体器官芯片及生命科学设备研发与生产的创新科技公司,艾玮得器官芯片应用全场景解决方案已能够全面覆盖新药研发评价、临床药敏检测、基础科学研究等应用领域,为科研、临床、药企等客户提供一站式解决方案。
  • 大气监测各路精英云集北大 从观测和模型全方位解读源解析技术
    仪器信息网讯 2016年4月15日,由北京大学环境科学与工程学院主办,美国Sunset公司和美国CES公司协办,河北先河环保科技股份有限公司赞助的“大气细颗粒物多组分在线监测及在线源解析研讨会”在北京大学顺利举行。研讨会吸引了来自环境监测站、科研院所等的相关专家学者约330人。北京大学环境科学与工程学院院长朱彤、河北先河环保科技股份有限公司董事长李玉国、中国环境监测总站副站长李国刚  嘉宾致辞上,北京大学环境科学与工程学院院长朱彤、河北先河环保科技股份有限公司董事长李玉国、中国环境监测总站副站长李国刚纷纷表示对如此多的学者参加此次研讨会表示热烈欢迎。李国刚副站长表示此次研讨是及时且有现实需要的,源解析的需求主要体现在时间、空间和物种三个维度上。时间维度上有突发事件的源解析、重污染天气的源解析和一定时间尺度上的源解析 空间维度上有区域内重点排放源的源解析和区域间传输的源解析 物种维度上有细颗粒物、臭氧等不同污染物的源解析。各研究单位和业务部门应充分利用已有的技术装备、方式方法和专家队伍,协同合作,最大程度上满足现实的需求。捐赠仪式—先河环保向北京大学郑玫教授捐赠两台仪器北京大学郑玫教授  此次研讨会由北京大学郑玫教授组织并主持。郑老师从观测和模型两方面邀请各个领域的专家为大家做有关源解析技术的介绍。郑老师首先介绍了目前的源解析框架,并为我们展示了其团队从事的多项源解析的工作。  多种观测手段 多维度了解污染特性  监测仪器是我们了解污染状况对污染进行分析的基础。本次研讨会邀请了中国科学院遥感所陈良富、美国CES公司John Cooper、美国Sunset公司Bob Cary、澳大利亚Ecotech公司曾鸣、先河环保崔厚欣,为大家分别介绍了卫星遥感、在线重金属分析仪、EC/OC分析仪、浊度仪和网格化监测系统等观测手段。中国科学院遥感所陈良富、美国CES公司John Cooper、美国Sunset公司Bob Cary、澳大利亚Ecotech公司曾鸣、先河环保崔厚欣(自左向右,自上向下)  不同的观测手段可以从不同的角度来解释大气污染的情况,如卫星遥感可以在大尺度上观测大气气溶胶光学厚度以及PM10和PM2.5浓度分布 在线重金属分析仪可以通过特定金属元素浓度变化来识别交通源、典型工业源等重要的污染源 EC/OC分析仪可以很好的指示高温燃烧,如烧烤、森林大火等产生的污染物的来源 浊度仪在沙尘暴观测中有很好的应用。网格化监测系统是以维护量少的传感器为主要监测手段,通过高空间密度和高时间密度来大量采集污染源数据,从而较精准、及时地捕捉污染源,如建筑工地、烧烤摊等。  多种预测模型 满足不同解析与预测需求  数据不代表信息,只有经过数学分析形成具有一定规律的结果才能用来支持决策。中国气象科学研究院龚山陵、清华大学张强和邢佳、北京大学蔡旭辉、宋宇和张霖六位专家为我们介绍了多种模型及其应用实例。中国气象科学研究院龚山陵、清华大学张强和邢佳、北京大学蔡旭辉、宋宇和张霖(自左向右,自上向下)  龚山陵介绍了CUACE雾霾预报系统及其在环境气象模拟预报中的应用 张强介绍了由清华大学开发和维护的中国多尺度排放清单模型,并展示了其应用实例-以2013年为基础通过设置不同的治理措施情景来评估京津冀地区在2030年是否能达成其空气目标 邢佳介绍了排放与环境效应之间的响应曲面模型,用来模拟不同排放水平下的各污染物浓度响应 蔡旭辉介绍了源解析中的印痕分析方法,印痕分析偏重于污染来源的物理和几何空间意义,揭示直观的潜在源区 宋宇介绍了常用源解析模型的优缺点并介绍了如何综合利用多种不同的源解析模型来寻找合理的源解析结果 张霖介绍了大气化学模式在细颗粒物源解析领域中的应用。  实战演练 多地区源解析工作大展示  源解析工作在我国已开展了一段时间,各地区和科研结构也做了很多工作。中国环境科学研究院高健、上海市环境监测中心伏晴艳、北京市环境保护监测中心张大伟、南京大学聂玮向大家展示了他们团队的工作。中国环境科学研究院高健、上海市环境监测中心伏晴艳、北京市环境保护监测中心张大伟、南京大学聂玮(自左向右,自上向下)  高健以“颗粒物动态源解析研究进展与应用实例”为题介绍了其团队基于在线观测和模拟的颗粒物动态源解析工作开展过程,并认为实时源解析技术的发展趋势是发挥不同源解析技术方法的各自优势,融合多种源解析方法分析颗粒物污染源类贡献。伏晴艳和张大伟分别以“上海超级站细颗粒物在线监测与在线源解析方法研究”和“基于多维观测的大气污染成因综合分析”为题为大家介绍了上海和北京的源解析设备、技术路线和现有成果。聂玮以“南京大学SORPES站点细颗粒相关的在线监测”为题为大家介绍了南京大学仙林中心站的建设情况、测量参数和已有的研究成果。研讨会现场
  • 速来!活体成像小动物模型开发+数据分析干货分享,锁定iSAI2024
    动物模型在临床前抗肿瘤药物评价体系中发挥着重要的作用。肿瘤动物模型的建立为研究肿瘤发生与转移的机制、筛选和评价抗肿瘤药物的药效提供了有力的工具。一般啮齿类动物小鼠,因为其具有繁育速度快,成本低,可进行基因修饰等诸多优点,基于其构建的各类肿瘤模型构成了临床前治疗性药物筛选的主要工具,而小动物活体成像数据分析被称为连接医学影像与生物医学的重要桥梁。仪器信息网将于2024年6月6日举办“第一届小动物活体成像技术与前沿应用”主题网络研讨会(iSAI2024),全日程现已公布(点击查看)。精彩报告提前知晓!本文为【动物模型开发/数据分析篇】,大会当天将由上海南方模式生物科技股份有限公司经理/副研究员慈磊博士与中国科学院高能物理研究所高级工程师聂彬彬博士两位嘉宾分别就活体成像小动物模型的开发、动物脑成像数据分析及应用展开报告,欢迎踊跃报名参加在线直播!参会报名链接二维码:https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/sai240606.html ——03 动物模型开发/数据分析篇——关键词:基因工程小鼠、脑影像数据分析慈磊 经理/副研究员上海南方模式生物科技股份有限公司个人简介:南模生物工业客户部经理,副研究员,同济大学生物学博士,已授权发明专利5项,发表SCI论文10余篇。主要从事小鼠疾病模型构建以及药效评价研究,具有多年肿瘤以及自免类药效模型构建及CRO服务经验,目前负责主持南模生物各类抗肿瘤以及炎症类药物临床前研究项目。大会报告:活体成像小动物模型的开发与应用通过构建报告基因小鼠模型,利用小鼠特异性启动子调控荧光素酶报告基因的表达,结合光学成像系统实时采集小鼠发出的荧光信号,进而追踪活体小鼠中该内源基因的表达。该基因工程小鼠不仅有助于建立针对治疗药物的临床前筛选平台,还可以明确这些基因表达的细胞类型,具有基础科研和临床应用的双重价值。聂彬彬 高级工程师中国科学院高能物理研究所个人简介:中国科学院高能物理研究所,高级工程师,课题组长。中国图学会医学图像与设备专业委员会秘书长;中华医学会核医学分会神经学组委员;中国生物医学工程学会放射学会青年委员会委员。多年来主要从事医学影像数据分析方法的研究及应用工作,作为课题负责人承担了国家自然科学基金四项,中国科学院青年项目一项;作为主要参与人参与了中国科学院先导专项一项,973课题两项,发表SCI论文百余篇。其建立的动物脑成像数据分析平台能够对多种成像模态的猕猴,树鼩,大鼠,小鼠的脑成像数据进行不同的数据处理,该软件平台于2014年起通过邮件注册的方式对外发布,截至目前,已经有150余家国内外单位注册使用。大会报告:动物脑成像数据分析及应用磁共振成像技术和正电子发射断层成像技术能够对动物进行在体成像,能够在正常的生理状态下观察动物的脑结构形态、脑功能活动、脑白质纤维束形态及走向等等,在重大脑疾病的发病机理、药物评估中具有不可替代的作用。脑影像的数据分析是连接医学影像与生物医学的重要桥梁,该报告主要介绍了动物脑成像研究中常用的数据分析方法及应用示例。点击获取稿件提纲为帮助广大实验室用户及时了解小动物活体成像前沿技术、创新产品与解决方案,增强业内专家与仪器企业之间的交流学习,仪器信息网特别组织策划“小动物活体成像技术” 主题约稿活动。欢迎投稿,投稿文章一经采纳,将收录至【小动物成像技术】专题并在仪器信息网相关渠道推广。投稿邮箱:刘编辑liuld@instrument.com.cn电话联系:13683372576(同微信)。
  • 首批《海洋数据开放共享目录》和“海洋云”平台正式发布
    6月8日,在第16个世界海洋日暨第17个全国海洋宣传日上,自然资源部面向全社会公开发布首批《海洋数据开放共享目录》和全国首个国家海洋大数据服务平台(海洋云)。该目录和平台由国家海洋信息中心研发。本次发布的《海洋数据开放共享目录》,是对我国自主获取海洋数据、自主研发海洋信息产品和全球海洋环境数据的整编集成。目录的内容包括海洋7大学科、83类要素,一是中国海洋站、浮标、岸基雷达、志愿船、断面观测和近海海洋综合调查标准数据集。二是中国近海环境统计分析产品,中国海平面变化和气候变化专题产品,全球和西北太平洋区域海洋实况分析、海洋再分析和海洋环境图集等产品。三是基于全球Argo等多源数据,通过排重整合、融合分析和精细化质量控制等处理形成的全球海洋温盐、水位、气象、生物、化学、水深地形、底质和地球物理等整合数据集。总体上,国内来源数据时间范围从1942年至今,国际数据从1662年至今,空间覆盖我国近岸近海、太平洋、大西洋和印度洋等全球海域。《海洋数据开放共享目录》具有数据类型丰富、时空范围广、时效性强、成谱系化等特点。所有数据都经过精细化处理和深加工,更新频率最高达到分钟级,涵盖标准数据集、整合数据集和统计分析、实况分析、再分析产品,以及图集图件和专题报告等多层级,可以面向海洋经济发展、海洋防灾减灾、海洋生态环境保护、海洋资源开发利用、海洋教育和科学研究等领域,为涉海部委、沿海地方、科研院校、涉海企业和社会公众等用户,提供多样化和个性化的服务。海洋云是国家级海洋数据和信息产品在线服务平台,构建了国家全球海洋立体观测网数据在线汇聚、涉海部门海洋信息互联互通、公益数据产品集成服务、国际海洋信息资料交换合作的一站式平台。海洋云以国家海洋观测调查的海洋大数据资源为基础,保证上云数据科学可靠、时空连续;充分利用大数据、云计算、区块链、互联网等先进信息技术,实现数据和模型方法上链服务;通过平台共建、资源共享、产品整合、平台挂载、资源链接等方式,保持云上数据资源的动态更新和生命力;打造数据安全防护体系,全力保障海洋云数据和系统的安全。海洋云提供海洋数据免费下载、依申请使用、在线计算分析和数据产品特色定制等服务,极大地提升用户享受数据服务的便利度和权威性,满足各类用户的多样化和个性化需求。《海洋数据开放共享目录》和海洋云的上线运行,将为全社会提供科学权威的海洋数据服务,有力推进海洋数字化转型,创新海洋信息互联互通、深度融合、智慧应用的新思路新模式。下一步,自然资源部将进一步聚焦新形势下海洋数据要素保障的新要求,完善海洋数据分类分级、海洋数据要素流通等规章制度与标准规范,加强安全沙箱、智能合约等新技术应用,动态更新海洋数据共享目录和海洋云系统功能,持续推动和加强海洋数据开放共享,为海洋新质生产力赋能海洋经济高质量发展和海洋强国建设提供更大助力。仪器人眼中的“赛龙舟”:
  • 安捷伦《类器官模型构建与高通量筛选方案》亮相慕尼黑生化展
    2023 年 7 月 13 日,第十一届慕尼黑上海分析生化展在国家会展中心(上海)圆满落幕,作为亚洲具有影响力的分析、实验室技术、诊断和生化技术领域的专业博览会,本次大会吸引了 1200 + 参展企业,超过 5 万人参会。在此次盛会上,安捷伦细胞分析事业部携《类器官模型构建与高通量筛选方案》亮相 2.2 H 分析与质量控制展馆。并受邀参加了生物谷举办的“类器官前沿技术开发与应用创新论坛”,安捷伦细胞分析事业部产品应用专家杨菁喆女士向与会者介绍了安捷伦 BioTek Cytation 及 CBM 智能化细胞成像分析系统在类器官建模优化、以类器官为模型进行高通量筛选的解决方案,在现场引起热烈反响,吸引了众多参会者到展台参观。《类器官模型构建与高通量筛选方案》吸引了众多与会展聆听与参观生物谷类器官前沿技术开发与应用创新论坛活动上,安捷伦细胞分析产品应用专家杨菁喆女士做报告随后,仪器学习网的记者就类器官研究进展和未来展望采访了杨菁喆女士。杨菁喆表示自 2009 年小肠类器官首次建立至今,类器官研究已经延伸到多个组织系统,并成为当下生命科学领域最活跃的技术之一。我们非常荣幸安捷伦细胞分析技术和平台能够参与其中,与研究者们一起探索,为人类健康的可持续发展贡献我们的力量。近年来类器官成就与发展大记事2013 年Science:年度十大突破2018 年Nature Methods:2017 年度方法2019 年The New England Journal of Medicine:优良的人类临床前疾病模型2021 年类器官被列入中国“十四五”重点研发计划专项 2022 年我国陆续刊发多篇类器官和器官芯片相关规范、共识和标准,《中国癌症防治杂志》刊发了我国第一个基于类器官指导肿瘤精准药物治疗的专家共识——《类器官药物敏感性检测指导肿瘤精准治疗临床应用专家共识( 2022 年版)》 2022 年美国 FDA 批准新药研制不再强制动物实验,类器官和器官芯片有望引领新时代浪潮安捷伦类器官模型构建与高通量筛选解决方案优势:1Cytation 成像与分析解决方案:❖ 全自动倒置荧光显微成像/转盘共聚焦显微成像为类器官成像提供优异的图像分辨率❖ 支持明场、多色荧光、彩色明场成像,一站式为类器官建模和筛选提供多维度研究方式❖ 优异的环境控制支持任意成像模式下的类器官活细胞动力学监测,为类器官形态学变化、分化验证和免疫杀伤提供动态变化过程❖ 明场及荧光场均支持 Z-轴层切成像与叠加,满足类器官成像对光学层切的需求❖ 支持实验室常规 6-1536 孔板,培养皿等常规耗材及耗材自定义,满足类器官培养条件优化以及高通量筛选对通量的不同要求❖ 高内涵软件支持从仪器控制—类器官培养条件设置—图像捕获—图像处理—数据分析—实验数据输出全流程操作2自动化解决方案:❖ Cytation 与 BioSpa 自动化培养箱及 Multiflo FX 分液器对接,组成 CBM 智能化活细胞成像与分析系统,实现从细胞铺种、培养基更换、自动培养、动力学成像全自动流程,更将实验通量提升到 8 块孔板,大大提高实验效率,在类器官研究多个实验环节发挥作用。❖ Cytation 与其他第三方工作站或抓扳手整合,实现更加集成化的类器官自动化整合方案。安捷伦细胞分析为类器官培养及检测提供丰富应用方案Cytation 和CBM 系统结合安捷伦细胞分析事业部的多功能微孔板检测仪、流式细胞仪和细胞能量代谢分析仪为类器官培养及检测提供丰富的应用方案。如果您对我们的技术和方案感兴趣,欢迎扫描下方二维码留下您的联系方式。
  • 广电计量牵头《数字孪生模型评估规范》等3项团体标准研制
    2023年1月5日,中国信息协会《数字孪生模型评估规范》等4项团体标准启动会暨首次研讨会在北京成功召开。其中3项团标由广电计量牵头主编,广电计量将以标准为抓手,持续完善软件测评、信息安全、数字化等业务布局,助力“数字中国”建设提质增速。本次启动的《数字孪生模型评估规范》《科学数据安全能力成熟度评估规范》《科学数据存储安全管理规范》《数据从业人员能力评估规范》4项团体标准,将填补国家在数字孪生模型评估、科学数据安全能力成熟度评估、科学数据存储安全管理、数据从业人员能力评估等方面的标准空白。中国信息协会领导李红在致辞中表示,标准研制组将利用各自在产业链上的专业优势,为标准建言献策,助力标准高质量发布。全体参编单位在保证标准质量、遵守协会标准制修订程序的前提下,要快速推进项目,争取标准早日发布实施,助力团体标准“最后一公里”的落地实施。中国标准化专家委专家(机械科学研究总院研究员)强毅作为特邀嘉宾,从标准化角度提出这几项团体标准的必要性和重要性,并呼吁更多的企业能够参与到团体标准中来,真正的为我国标准化事业做出贡献。来自70余家企事业单位、高校、科研院所的代表通过线上线下方式参加会议,围绕团体标准研制及推广发布等展开深入探讨,为高质量建设“数字中国”注入“标准力量”。主编单位广州广电计量检测股份有限公司总经理助理、信息化事业部总经理于莉莉博士在发言中表示,广电计量构建了软件全生命周期业务生态体系,成为国内为数不多具备“一站式”信息化服务能力的专业第三方检测机构。未来,公司将瞄准新一代信息产业发展机遇,聚焦政府和企业数字化转型,成为提升信息安全自主可控能力的综合性解决方案提供者,守护信息质量安全,助力数字经济发展。中国科学院计算机网络信息中心大数据部副主任(国家基础学科公共科学数据中心主任)胡良霖,江苏省科技资源统筹服务中心、南开大学、江苏南高智能装备创新中心有限公司、上海闪马智能科技有限公司的与会代表分别发言,为标准研制及应用建言献策。随后,来自中国科学院计算机网络信息中心、广州广电计量检测股份有限公司两家主编单位的3名专家代表起草组介绍标准草案和意见处理情况,各参编单位参与研讨。党的二十大报告提出,要“加快建设制造强国、质量强国、航天强国、交通强国、网络强国、数字中国”,对信息行业具有重大指导意义。国家“十四五”规划和2035年远景目标纲要中多处强调各领域的数字化发展。中国信息协会标准化项目负责人、北京蓝象标准咨询服务有限公司总裁段小莉表示,中国信息协会不仅要制定出更多高质量的标准,还要通过标准制定与实施的过程,有效提升产业竞争力和服务于市场主体,充分发挥团体标准价值链的作用,通过标准这个有力抓手,进行全产业链资源构建与整合,促进技术创新、产品创新以及多方战略合作,共同助力产业发展,推动中国经济创新发展。于莉莉表示,此次标准启动会,高质量开展标准研制探讨与交流,为后续推进团标广泛应用开好新局。未来,广电计量将发挥技术服务优势,深入推进数字孪生模型评估等标准落地,加强数据从业人员规范管理,全面促进“科学数据”共享开放,加快科技创新成果转化,赋能千行百业数字化转型,助力数字经济高质量发展!
  • 高校建筑模型打印:清华大学&华中科技大学
    各位朋友,新一批摩方超高精度3D打印的高校建筑模型出来啦!本轮高校建筑模型有2个,分别来自清华大学和华中科技大学,以下为实拍图分享~ 同时,欢迎感兴趣的朋友抓住机会参与“高校建筑模型征集活动”,免费获取超高精度3D打印母校建筑模型! 模型一:清华大学-大礼堂前日晷模型二:华中科技大学-新光电信息大楼活动主题:征集高校建筑模型图免费超高精度3D打印第一轮征集时间:2021年6-8月征集方式:请将您所提供的高校代表性建筑三维模型图(仅限stl格式文件)通过邮件的方式,发送至bmf@bmftec.cn即可。(请留下您的姓名、单位、联系方式)模型要求:模型整体的最大尺寸和内部最小细节,相差在500倍以内。活动流程:①在模型征集期间,对于您所提供的模型图,摩方精密技术团队将在7个工作日内进行内部技术评审;②通过评审的模型,将由技术团队安排在3周内通过摩方精密3D打印设备打印出来,免费赠送给您,同时,所打印高校建筑模型将在摩方精密的公众号进行阶段性公示;③截至8月31日,本轮模型征集结束后,摩方精密团队将针对所有经过评审打印出来的高校建筑模型,通过公众号或合作媒体进行全国投票活动,最终参考实际票数情况,评选出本轮高校建筑模型征集活动的优胜奖一/二/三等奖。活动奖项:一等奖:华为WATCH GT2 智能手表,价值1400元二等奖:Kindle电子书阅读器,价值658元三等奖:华为FreeLace Pro蓝牙耳机,价值500元 注:①摩方精密技术团队将秉承公平公正公开原则认真对待每一个模型的评审;②高校建筑模型图的版权归提供者所有,摩方精密享有对所打印建筑模型进行宣传推广的权力。感兴趣的也欢迎加小编微信,小编会拉您进群哦!
  • 美国研发高精度气候模型精确预测气候状况
    GEOS-5气候模型所形成的模拟图片,模型精确地预测了主体云层系统的位置与形状     地球同步轨道环境卫星所拍摄的卫星图片   北京时间6月16日消息,据美国宇航局官网报道,美国宇航局地球系统科学家近期研制了迄今精度最高的地球气候模型GEOS-5气候模型,并通过该模型绘制了全球气候模拟图片。模拟图片与卫星图片对比显示,GEOS-5气候模型可以精确地预测气候状况。   科学是一个过程。科学家首先需要实地观测,然后提出假设用于解释观测数据,最后再通过系统验证和推理,找到支持或辩驳其假设的证据,从而得出一个科学的结论。许多人或许认为,科学家们在进行假设和验证的过程,所有工作都是在实验室中进行的。但是,对于研究地球如何运行的地球系统科学家来说,他们的实验室就是整个星球。面对庞大的星球,科学家们很难将全球各地不同的气温或云雨真正地集中到狭小的实验室中系统地研究。相反,他们只有将实地观测数据结合起来,形成复杂的电脑模型进行模拟研究。通过这类模型,科学家们可以对不同的假设进行测试和验证,并利用真实的观测数据进行检测,从而科学家们可以真正地理解地球大气、陆地和海洋等各个方面是如何协同工作的。   本文中的两幅图片分别为地球气候模型模拟图片(上图)和地球同步轨道环境卫星图片,上图显示的是分别通过两种方式所获得的同一时刻地球气候状况。该地球气候模型被称为“戈达德地球观测系统模型-第五版”(GEOS-5),也是迄今精度最高的地球气候模型。下图则是由美国宇航局和美国国家海洋和大气局的地球同步轨道环境卫星所拍摄的卫星图片。通过图片对比发现,GEOS-5模型精确地预测了2010年2月6日时的云层特点。当天,一股强烈的寒流为华盛顿特区带来了一场数英尺厚的暴雪。   2010年2月6日,GEOS-5模型和地球同步轨道环境卫星传感器分别对地球上空的云层进行了红外测量。两幅图片显示,陆地上空覆盖着厚厚的云层,模拟图片与卫星图片所描绘的情况极其吻合。模型精确地预测了主体云层系统的位置与形状,如北大西洋东部上空的卷曲云带以及美国海岸附近的强烈冬季风暴。高精度的GEOS-5气候模型甚至还可以详细预测云层形状的细节。在2月6日的模拟图片中,气候模型预测了一些小型云层的边线、云街现象以及冬季风暴的东部细节。在一幅全球模拟图片中,气候模型还精确地预测了热带地区的大量雷暴现象。   GEOS-5气候模型的精度通常为每像素5公里,尽管它的精度最高可达每像素3.5公里,因此它也是目前世界上最精确的全球气候模型。普通气候模型在模拟云层情况时,精度大约为每像素28公里。这就意味着,由普通气候模型所产生的全球平面地图包含了77.7万个网格单元(像素),而5公里精度的GEOS-5气候模型所产生的地图(上图)则包含了2400万个网格单元。因此,科学家可以根据GEOS-5气候模型获得关于地球的更详细的信息。   和所有的气候模型一样,GEOS-5气候模型也是利用数学方程式来计算气候变化情况。地球气候的一些物理属性,如温度和能量等,则需要实地测量。实时数据被输入模型,从而保证模型与真实世界尽可能一致。当然,在建造模型过程中,数百万次的计算则需要数千台计算机处理器。GEOS-5气候模型运行于美国宇航局戈达德太空飞行中心新成立的气候模拟中心的“发现”超级计算机之上。“发现”超级计算机拥有近1.5万个处理器。   气候科学家将利用GEOS-5气候模型预测未来数十年的气候变化情况。2010年6月2日,美国宇航局气候模拟中心以新名称开始运作。
  • Nature :Stewart获得PDX模型
    p   Stewart等人报道了许多类型的儿科癌症的小鼠模型的建立方法和分析结果。研究者们将患者肿瘤活检得到的细胞移植到免疫缺陷小鼠中,从而获得PDX模型。他们使用几种技术来表征这些模型,这些技术包括显微镜和DNA序列分析,同时他们还在一些PDX模型小鼠上进行药物测试。研究人员将PDX肿瘤细胞冻存起来,之后将这些细胞解冻,并移植到其它小鼠中,以用于将来的分析。其他团队还创建了不同类型人类肿瘤的PDX模型。该领域关键的下一步是建立集中的开放存取库,以管理和共享来自不同团队的PDX研究数据。通过这种方法,我们可以促进识别临床试验中可测试的治疗方法的进展。 /p p style=" text-align: center " span style=" color: rgb(153, 153, 153) " img width=" 600" height=" 178" title=" " style=" width: 600px height: 178px " alt=" " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201709/uepic/071cf1e3-494a-444b-b094-4dbd24d0c9ed.jpg" border=" 0" vspace=" 0" hspace=" 0" / /span /p p   现在科学家们将患者的肿瘤细胞接种到小鼠体内,进而建立肿瘤模型,以用于分析和开展药物测试。目前研究人员已鉴定了一系列小儿实体肿瘤模型,同时相关数据的允许免费获取。 /p p   罕见癌症的研究面临着两方面的挑战:可用的肿瘤样本少 缺乏相应的小鼠模型。最近科学家们非常成功地开发了将人类肿瘤细胞高效移植到免疫缺陷小鼠中的癌症建模技术。在《自然》(Nature)杂志上,Stewart等人对成功接种和生长的小鼠实体瘤进行了全面的分析,并展示了这些模型如何用于筛选罕见癌症患者的潜在靶向治疗。 /p p   得益于高效的化疗药物组合,美国仅有不到20%的癌症儿童死于癌症。这些组合方案是通过高度实证和渐进的临床试验而建立起来的。然而,我们和其他癌症生物学家坚信,只有基本的科学发现才能产生变革性的进步。我们承认,儿童癌症的治疗比成年人的要有效得多,但仍然需要更好的治疗来减轻化疗药物造成的长期副作用。据美国国家癌症研究所(US National Cancer Institute)统计,每年年龄在20岁以下的癌症患者的死亡率比65岁以上癌症患者的死亡率低300-500倍。 /p p   另一个被广泛接受的信念是癌症研究需要更多的模型系统,这些模型要便宜、易于操作,并且真实反映人类肿瘤的特征,以改善癌症靶向。在这方面,缺乏T、B和自然杀伤细胞,因而对人类肿瘤细胞排斥能力较弱的免疫缺陷小鼠(裸鼠)成为了接受患者来源肿瘤异种移植物(patient-derived tumour xenograft, PDX)的理想动物模型。利用裸鼠制造PDX模型非常简便,并且可以将裸鼠的肿瘤细胞冻存,解冻后还可以移植到其它小鼠身上。肿瘤细胞也可以用于原位生长,这意味着细胞生长在与人类肿瘤来源的器官对应的小鼠组织中(即肺癌细胞接种到裸鼠肺里)。这些肿瘤细胞可以进行遗传工程,携带便于体内追踪的标记分子(如GFP),并且可以模拟人类肿瘤微环境的特征。 /p p   大多数原始PDX都会死亡。随着时间的推移,科学家们逐渐了解到,虽然PDX比体外生长的细胞系和常规小鼠肿瘤模型更贴近人类肿瘤特征,但它们也具有一些实质性限制。例如,当不同的小鼠被注射同一肿瘤标本的等分试样时,得到的PDX可以具有非常不同的突变、细胞表面标记和转录谱。用于异种移植的小鼠品系也对PDX生物学有很大的影响。因此,不同试验条件下得到的PDX小鼠模型都是不一样的。PDX专家们经常被问到这个问题:“这些模型是否与原始肿瘤相同?”其实两者之间差异很大。 /p p   至少到目前为止,PDX的最大优点是其造模非常简单。我们现在可以使用PDX研究几种没有对应的转基因小鼠或细胞株的罕见癌症模型。由于PDX源于人类肿瘤,因而对特定药物存在抵抗。这可能有助于模拟早期临床试验中难治性癌症的药物筛选。现已有20多种PDX被用于2期临床试验。这些研究可以表征多个模型的药物响应的异质性、用于开发预测药物响应的检测方法,或可用于筛选肿瘤中存在的少数耐药细胞。 /p p   现在有几个PDX存储库,含有数百个甚至数千个来源于接受过化疗或靶向治疗患者的肿瘤。这些库中的一些是开源的(可免费提供模型),包含400多个成人实质肿瘤PDX和300个儿科和成人血液肿瘤PDX,以及其他研究团队创造的大量数据。在儿童实质瘤网络计划(Childhood Solid Tumour Network)中,Stewart等人建立了60多种儿科实质肿瘤的PDX模型。 /p p   Stewart等人贡献了非常多的数据。他们通过原位生长获得了15种肿瘤的148个标本,并报告了1173个细胞涂片的免疫组织化学分析结果,102个PDX的全基因组序列结果和转录谱。他们还报告了目标基因组区域的广泛靶向DNA测序 分析了结合DNA的组蛋白的9种不同的修饰情况 对PDX进行了电子显微镜扫描 并生成了5种PDX的肿瘤细胞系。他们的药物筛选测试产生了50万个以上的数据点。他们进行的体内研究包括:多个PDX细胞系的基因工程标记细胞,进行成像 一项小鼠研究药物治疗剂量 以及两个小鼠研究调查多个药物联用的剂量及疗效。这样一个内容丰富的数据集为该领域的研究人员进一步调查Stewar等人发现的突变、转录特征和药物敏感性奠立了基础。 /p p   最大程度地发挥PDX在科学发现上的潜力需要非凡的透明度、标准化和开放获取模式。作为研究经费的使用者、癌症患者的保护者,我们责无旁贷。儿童实质瘤网络已经对多种儿童实质肿瘤建模,其中包括Stewart等人建立的模型,并免费提供,并已经将它们分发给了11个国家的120多名研究者。其他研究中心也可以学习Stewart等人的研究方法。儿童实质瘤领域的下一步将是建立一个更大的PDX库联盟、统一战线、合作表征PDX模型,建立数据库基础设施(图1)。 /p p   Stewart等人对一般肿瘤,特别是儿童实质瘤模型的建立做出了突出贡献。迄今为止,他们提供了最全面的PDX存储库之一。 他们贡献的大量数据集将为世界各地的调查人员提供参考,并推动学界的分享文化,使所有人受益。 /p
  • 基于光线模型的成像系统标定与三维测量进展
    一、背景介绍:机器视觉可称为人工智能的“慧眼”,成像系统的标定又是机器视觉处理的重要环节之一,其标定精度与稳定性直接影响系统工作效率。在传统机器视觉与摄像测量标定领域,小孔透视模型仍存在高阶透镜畸变无法完备表征和多类复杂特殊成像系统不适用的问题。而基于光线的模型以成像系统聚焦状态下每个像素点均对应空间一条虚拟主光线为前提假设,通过确定所有像素点所对应光线方程的参数即可实现标定与成像表征,可避免对复杂成像系统的结构分析与建模。基于该光线模型,研究院相关课题组发展了各类特殊条纹结构光三维测量方法与系统,实验证明光线模型可通用于多类复杂成像系统的高精度测量,是校准非针孔透视成像系统的有效模型,可作为透视模型的补充。二、光线模型Baker等人最早提出了一种可表征任意成像系统的光线模型[1],认为图像是像素的离散集合,并以一组虚拟的感光元件“光素”表示每个像素与某像素相关联的空间虚拟光线间的完整几何特性、辐射特性和光学特性,如图1所示。因此,光线模型的标定即确定出所有像素点对应的光线方程,无需严格分析和构建成像系统的复杂光学成像模型,具备一定的便携性和通用性,从一定程度上也可避免镜头畸变的多项式近似表征引入的测量误差,为非小孔透视投影模型成像系统的表征提供了一种新的思路。图1 成像系统的光线模型示意图三、基于光线模型的条纹结构光三维测量在条纹结构光投影三维测量领域,光线模型一方面可作为三维重建的光线方案,用于表征大畸变镜头、光场相机、DMD投影机、MEMS投影机等多类特殊结构的成像与投影装置,可发展新的基于光线模型的条纹结构光三维测量方法与系统;另一方面,发掘光线模型在结构光测量中的优势,光线模型对克服投影与相机的非线性响应、大畸变镜头成像下提升三维重建精度具有优异的效果。3.1 Scheimpflug小视场远心结构光测量系统光线模型与三维测量课题组开发了小视场远心结构光测量系统,采用Scheimpflug结构设计确保公共景深覆盖,如图2所示。考虑到远心镜头属平行正交投影、Scheimpflug倾斜结构造成畸变模型非中心对称,因此,提出一种基于光线模型的非参数化广义标定方法[2]。系统中相机与投影机成像过程均采用光线模型表征,标定其像素与空间光线对应关系,计算光线交汇点坐标,实现三维重建。图3展示了系统实物图与五角硬币局部小区域的三维测量结果,测量精度为2 μm。图2 Scheimpflug小视场远心结构光测量系统图3 测量系统实物图与五角硬币局部的三维测量结果3.2光场相机的光线模型标定与主动光场三维测量课题组发展了基于主动条纹结构光照明的光场三维测量方法与系统。光场相机通过在传感平面前放置微透镜阵列,实现光线强度和方向的同时记录,由于存在微透镜加工误差、畸变像差、装配误差等复杂因素影响,光场相机完备表征与精密标定是个难题。课题组提出光线模型表征光场成像过程[3],即将光场相机内部看作黑盒,直接建立像素m与所对应的物空间光线方程l的参数,如图4所示。并通过标定光场所有光线与投影条纹相位的映射关系实现被测为物体的高精度三维测量,考虑光场多角度记录特点,构建基于条纹调制度的数据筛选机制,实现了场景的高动态三维测量,如图5所示,黑色面板与反光金属可同时重建。图4 光场成像模型图5 主动光场高动态三维测量3.3 DMD投影机与双轴MEMS激光扫描投影机的光线模型标定与三维测量基于微机电系统(MEMS)激光扫描的投影机以小型化、大景深的优势被应用于条纹投影测量系统,如图6(a)所示。但由于其依赖激光点的双轴MEMS扫描投影图案,不依赖镜头成像,透视投影模型表征会存在一定误差。此外, DMD等依赖镜头成像的投影机,大光圈设计也会影响小孔透视投影模型的表征精度。对此,课题组采用光线模型表征投影机[4],并提出了一种基于投影机光线模型的条纹投影三维测量系统标定方法,该方法根据双轴MEMS投影的正交相位对光线进行识别追踪,利用投影光线与相机构建的三角测量实现了三维重建。进一步发现:由于投影光线的相位一致性特性,光线模型可显著抑制系统非线性响应引起的测量误差,图6(b)展示了单目系统在3步相移条件下(未额外矫正非线性响应),分别使用透视投影模型与光线模型对石膏雕塑的三维重建结果,可见光线模型对非线性响应影响具有免疫性。图6 双轴MEMS激光扫描投影原理和石膏雕塑三维重建结果(3步相移,左图为透视投影模型,右图为光线模型)3.4单轴MEMS激光扫描投影机光线模型标定与三维测量单轴MEMS投影机将激光点扫描拓展为面扫描大幅提升了投影速率,可应用于动态测量。针对单轴MEMS投影机无透镜结构使得针孔模型不适用、单向投影无法提供正交相位特征点的问题,课题组提出一种基于等相位面模型的系统标定方法[5],推导出了相机反向投影射线与该等相位面交点处的三维坐标值与相位值间新的映射函数,实现了快速三维重建。图7展示了使用高速相机搭建的单目测量系统和重建场景,投影采集速率为1000 frame/s,采用4步相移与雷码图相位展开,三维重建速率为90 frame/s。后续为适应更高速率测量应用,可将单目扩展为双目或多目系统,采用单帧解调相位和多极线约束相位展开等方法减少投影图像数量,提升三维测量速率。图7三维测量系统与动态重建场景3.5大畸变镜头成像的光线模型标定与三维测量针对传统低阶多项式不能完备表征大畸变镜头的问题,课题组采用光线模型表征大畸变镜头相机成像,并提出一种完全脱离对相机和投影机内参依赖(透视模型依赖相机与投影机内参)的光线与条纹相位映射的三维重建方法。通过直接标定相机光线与条纹相位的倒数多项式映射系数,避免了繁琐耗时的对应点搜索与光线插值操作。图8为装配4 mm广角镜头的光线标定结果与标准球三维测量结果,可见由于广角镜头畸变较大,光线模型较透视模型重建质量有所提升。图8 广角镜头光线标定与标准球三维测量数据的拟合误差分布(a)透视投影模型,(b)光线映射模型四、总结光线模型通过确定所有像素点所对应光线方程的参数实现标定与成像表征,从而避免了对复杂成像(投影)系统的结构分析与建模,解决了特殊条纹投影三维测量系统的标定与重建问题,同时在条纹投影三维测量的系统非线性相位误差抑制和精度提升上展示出优异性能。在结构光三维测量的未来发展中,可进一步扩展光线模型三维测量的方法与应用,提升测量精度、效率与通用性,解决各类特殊复杂场景中的应用测量问题。参考文献[1] Baker S, Nayar S K. A theory of catadioptric image formation[C]//Sixth International Conference on Computer Vision (IEEE Cat. No.98CH36271), January 7, 1998, Bombay, India. New York: IEEE Press, 1998: 35-42.[2] Yin Y K, Wang M, Gao B Z, et al. Fringe projection 3D microscopy with the general imaging model[J]. Optics Express, 2015, 23(5): 6846-6857.[3] Cai Z W, Liu X L, Peng X, et al. Ray calibration and phase mapping for structured-light-field 3D reconstruction[J]. Optics Express, 2018, 26(6): 7598-7613.[4] Yang Y, Miao Y P, Cai Z W, et al. A novel projector ray-model for 3D measurement in fringe projection profilometry[J]. Optics and Lasers in Engineering, 2022, 149: 106818.[5] Miao Y P, Yang Y, Hou Q Y, et al. High-efficiency 3D reconstruction with a uniaxial MEMS-based fringe projection profilometry[J]. Optics Express, 2021, 29(21): 34243-34257.课题组简介:本文作者:刘晓利 ,杨洋 ,喻菁 ,缪裕培 ,张小杰 ,彭翔 ,于起峰 ;深圳大学物理与光电工程学院深圳市智能光测与感知重点实验室。以于起峰院士领衔的深圳大学智能光测图像研究院主要研究方向包括大型结构变形与大尺度运动测量、超常光学测量与智能图像分析、计算成像与三维测量以及多传感器融合感知与控制等。
  • 干细胞模型再现人类胚胎早期发育
    据英国《自然》杂志2日发表的一项研究,科学家用人多能干细胞建立了一个模型,可用来研究人类胚胎植入子宫的过程。人胚状体(blastoid)是模拟早期人类胚胎的结构,在研究中能准确再现人类胚胎早期发育的关键阶段,包括黏附在体外子宫细胞上。该模型或有助于推进我们对人类发育早期阶段的认识,以及开发不孕不育的治疗方法或避孕药。  在受精后的一周内,人类胚胎会形成名为胚泡的细胞团,胚泡会植入子宫壁。准确模拟这一发育阶段的模型能支持对胚胎植入和早期发育的研究。利用干细胞构建胚泡的类似物是一种很有前景的方法,但此前的尝试遇到了瓶颈,比如会形成与胚泡不匹配的细胞。  此次,奥地利科学院分子生物技术研究所研究人员尼古拉斯利弗隆及其同事,利用人多能干细胞构建了人胚泡样结构(胚状体)。研究团队鉴定出3个信号通路,抑制它们就能得到有效模拟正常胚泡发育(成功率70%)和能形成正确细胞(成功率97%)的胚状体。  研究报告称,这种人胚状体能在体外特异性地黏附受激素刺激的子宫内膜细胞,让团队能重现直到第13天的围植入期发育过程。  由于该模型效率高、可扩展潜力大。研究人员认为,这种方法能为人类胚胎植入和发育研究提供重要帮助。  干细胞可揭示器官的形成机理,但此前这方面的研究,一直难以帮助我们更深入理解发育胚胎。通常来说,科学家试图培养本身没有干细胞的类器官时,都会用到多能干细胞这种更基本的干细胞类型。科学家既可以从人体胚胎中获得多能干细胞,也可将皮肤细胞或血细胞进行重编程进而培养出干细胞,然后诱导它们模仿特定器官的形成。  不过,这些结构或者说微型器官,通常只复制了真实器官的某些结构和功能而非全部。
  • “奇趣蛋”模型和“鱼塘养鱼”论到底在说什么?
    4月21日晚7点,由康宁反应器技术和惠和化德生物科技联合主办的“助力农药产业升级、安全高质发展—农药行业连续自动化生产技术应用分享会” 顺利结束了。 两位嘉宾老师的分享可谓干货与诚意齐飞,经验共观点一色!有前沿的理论和概念、客观的实例分析与总结以及真诚的忠告与建议。他们形象生动的分享,再一次刷新了人们对于微通道反应器、危化工艺研究思路和工业化实施方式的认知。您想知道连续流工艺设计时的“五维”评估是什么;连续流工艺开发的“三步”法包括哪些方面;项目实施的“奇趣蛋”模型怎么解释;还有连续流工艺的“鱼塘养鱼”论到底在说什么吗?欢迎您关注”康宁反应器技术“公众号点击文末阅读原文,观看限时直播回放!让我们一起来回顾两位老师的精彩内容。嘉宾分享来自惠和化德的马兵博士,首先基于自身多年微通道连续流技术推广经验和深刻理解,分享了如何“精准”理解微通道反应器及其应用的。马博士又通过多个案例分享了农药行业如何应用微通道反应器,在工艺开发、工艺放大过程中解决反应的问题、通量的问题并促进项目顺利落地的。“五维”评估工艺开发“三步”走项目实施“奇趣蛋”模型马博士有关项目实施的“奇趣蛋”模型受到了广泛的关注,相关视频请关注“康宁反应器技术”公众号查看。康宁分享来自康宁反应器技术的周太炎老师,分享了客户连续流技术“鱼塘养鱼”论。他从农药产品涉及的反应出发,分享了在内卷时代,企业如何在自身产品系列的基础上,选择合适的产品线或者反应阶段进行连续工艺开发储备,在恰当的时机获得发展先机的。周老师还从硝化工艺的连续流应用起,分享了康宁AFR在加氢、重氮化、氧化、酰化、酯化以及多步连续反应的工艺开发和工业化实例,通过这些案例的分享不仅向参会者展示了应用微通道反应器不仅可以提高反应的安全性、选择性和收率,而且在资产投入、产出经济性方面依然具有优势。可以达到马博士说的“工艺做的好,客户用得起”!衷心感谢各方支持本次直播得到了中国国际贸易促进委员会化工行业分会,CAC农药展组委会、化工园区管委会、客户、高校科研机构以及合作伙伴的大力支持和参与。在此向所有支持和参与的朋友们表示最诚挚的感谢直播回放,请关注“康宁反应器技术”公众号查看
  • 生物打印肝脏模型评价药物的肝脏毒性研究
    背景介绍 药物性肝损伤(DILI)会影响肝脏代谢和解毒能力,但其根本机制仍有很多未知。为了准确和可再现地预测人的DILI,非常需要体外肝脏模型来替代昂贵和低通量的2D细胞培养系统、动物研究和芯片实验室模型。我们提出了一种新的“droplet in droplet”(DID)生物打印方法,该方法可以产生用于肝毒性研究的生理相关肝脏模型。这些模型,或称微型肝脏,是用BIO X微滴打印包裹在ⅰ型胶原中的肝(HepG2和LX2 肝星状细胞)和非肝(HUVEC 人脐静脉血管内皮细胞)细胞制成的。培养7天后,将微型肝脏暴露于急性和高剂量的对乙酰氨基酚或氟他胺,然后评估细胞活力、白蛋白分泌、丙氨酸氨基转移酶(ALT)活性和脂质积累的变化。微型肝脏ALT活性增加,白蛋白和脂质生成减少,表面这两种药物均有细胞毒性反应。这项研究的结果进一步验证了3D生物打印是一种可行的、可用于模拟肝组织和筛选特异性药物反应的中到高通量的解决方案。 材料和方法 细胞准备根据建议的方案培养两种肝细胞(HepG2和LX2)和一种非肝细胞(HUVEC)细胞系,并每3-4天传代一次。HepG2在含有谷氨酰胺的MEMα中生长,并补充1%丙酮酸钠(Gibco,Cat#11360070)和1%MEM非必需氨基酸溶液(Gibco,Cat-#11140050)。LX2细胞在IMDM(Gibco,Cat#12440053)中生长,HUVEC在EGM-2生长培养基(Lonza,Cat#CC-3156)中培养,并添加单体补充剂(Lonza,Cat#CC-4176)。所有培养基均添加10%的FBS(Gibco,16000044类)和1%的青霉素链霉素(Gibco,参考文献1509-70-063)。.生物墨水的制备和DID生物打印中和并制备3mg/mL浓度的Coll I bioink(CELLINK,SKU#IK4000002001)用于生物打印。以1:1:2(LX2:HUVEC:HepG2)的比例将5x106个细胞/毫升装入冷冻墨盒。在未经处理的96孔板(Thermo Fisher Scientific)中,使用BIO X(CELLINK,SKU#0000000 2222)上的液滴打印功能对微型肝脏进行生物打印。使用设置为8°C的温控打印头(TCPH,SKU#0000000 20346)将胶原液滴分配到设置为8°C–10°C的冷却打印床上。在第一轮液滴打印后,样品在37°C下培养3分钟,然后返回BIO X,使用相同参数进行第二轮液滴打印。在37°C条件下,将得到的封装液滴热交联20分钟,并为每个孔提供200微升混合培养基(25%IMDM+25%DMEM+50%MEM)。培养液每2-3天更新一次。药物处理和分析培养7天后,用不同浓度的APAP[0.1,0.5,1,5,10,25,50 mM](Abcam)或FLU[10,25,50,75,100,150,200µM](Selleckchem)处理微型肝脏72小时。采用比色溴甲酚绿(BCG)测定法(Sigma-Aldrich)、ALT活性测定法(BioVision)和活/死染色试剂盒(Invitrogen)分别检测白蛋白产生、肝损伤和细胞活力。所有分析均按照制造商的说明进行。 结论 胶原I中的细胞生长和球体形成胶原I中的细胞生长和球体形成在这项研究中,我们评估了Coll I bioink中的细胞生长、球体形成和迁移模式。到第2天,HepG2和LX2已紧密组装成小簇,HUVEC已拉长,形成同心网络(图1)。使用胶原蛋白作为支架可以在整个培养过程中进行细胞重组、球体极化和细胞增殖(数据未显示)。此外,根据图1,很明显,细胞在整个培养过程中渗透DILI模型,并可能在内部和外部液滴层之间迁移。生物打印微型肝脏的药物治疗和细胞毒性第10天的毒性评估结果表明,生物打印微型肝脏对APAP(图2A)和FLU(图2B)具有细胞毒性和剂量依赖性反应。这种肝功能下降表现为白蛋白分泌和脂质生成减少,ALT活性上调。同样明显的是,基于ALT活性的增加,两种药物的毒性剂量都会对细胞活力产生破坏性影响。后者在图3中尤为明显,其中活/死图像表明,在较高浓度的APAP或流感病毒下,细胞活力显著降低。药物治疗的动态细胞内反应研究了APAP和FLU如何调节细胞内脂肪含量。肝组织的ORO染色通常用于识别脂肪酸或药物引起的不同阶段纤维化或脂肪变性(Pingitore,2019)。在我们的研究中,经处理的微型肝脏的ORO染色显示,在高剂量药物处理的样本中,脂肪积累最小,而在未经处理或低剂量药物治疗的样本中,脂肪积累显著(图4A)。一种解释是APAP和FLU与脂质过氧化有关,其中毒性药物水平引起的氧化应激可能引发脂质降解和膜损伤(Behrends,2019)。图4B中未处理样品的详细观察提供了液滴模型中液滴的横截面图。这张图片显示了大量细胞向液滴外壳迁移并产生脂肪,可能表明存在营养和氧气梯度,并验证了细胞重组模式和胶原内的球体极化。▶ 作为2D细胞培养系统、动物研究和芯片实验室原型的可靠替代品,BIO X可作为中高通量工具,用于制作功能性3D生物打印肝脏模型,实现药物筛选和分析,并减轻药物消耗的成本。▶ CELLINK Coll I作为DID模型的支架,为模型提供了一个稳定、可调和高度相容的环境,且具有丰富的肝细胞重排和球体形成的结合位点。▶ 基于脂质过氧化、白蛋白分泌减少和ALT活性上调的证据,我们的研究结果表明,DID微型肝脏具有功能性,并且对APAP和FLU具有剂量依赖性和细胞毒性反应。▶ DID模型允许组织层之间的细胞间相互作用,并为研究不同硬度层之间的迁移模式提供了独特的机会。未来的毒性研究可以采用该模型复制纤维化的各个阶段,或研究药物治疗后肝脏组织的再生能力。参考文献:1.Behrends, V., Giskeødegård, G. F., Bravo-Santano, N., Letek, M., & Keun, H. C. Acetaminophen cytotoxicity in HepG2 cells isassociated with a decoupling of glycolysis from the TCA cycle, loss of NADPH production, and suppression of anabolism. Archivesof Toxicology. 2019 93(2): 341–353. DOI: 10.1007/s00204-018-2371-0.2.Chen, M., Suzuki, A., Borlak, J., Andrade, R. J., & Lucena, M. I. Drug-induced liver injury: Interactions between drug properties andhost factors. Journal of Hepatology. 2015 63: 503–514. DOI: 10.1016/j.jhep.2015.04.016.3.Pingitore, P., Sasidharan, K., Ekstrand, M., Prill, S., Lindén, D., & Romeo, S. Human multilineage 3D spheroids as a model of liversteatosis and fibrosis. International Journal of Molecular Sciences. 2019 20(7): 1629.
  • 高校建筑模型打印——南京大学&安庆师范大学
    各位朋友,新一批摩方超高精度3D打印的高校建筑模型出来啦!本轮高校建筑模型有2个,分别来自南京大学和安庆师范大学,以下为实拍图分享~ 同时,欢迎感兴趣的朋友抓住机会参与“免费超高精度3D打印高校建筑模型”活动,免费获取超高精度3D打印母校建筑模型! 模型一:南京大学-现代工程与应用科学学院院楼模型二:安庆师范大学-红楼活动主题:免费超高精度3D打印高校建筑模型第一轮征集时间:2021年6-8月征集方式:请将您所提供的高校代表性建筑三维模型图(仅限stl格式文件)通过邮件的方式,发送至bmf@bmftec.cn即可。(请留下您的姓名、单位、联系方式)模型要求:模型整体的最大尺寸和内部最小细节,相差在500倍以内。活动流程:①在模型征集期间,对于您所提供的模型图,摩方精密技术团队将在7个工作日内进行内部技术评审;②通过评审的模型,将由技术团队安排在3周内通过摩方精密3D打印设备打印出来,免费赠送给您,同时,所打印高校建筑模型将在摩方精密的公众号进行阶段性公示;③截至8月31日,本轮模型征集结束后,摩方精密团队将针对所有经过评审打印出来的高校建筑模型,通过公众号或合作媒体进行全国投票活动,最终参考实际票数情况,评选出本轮高校建筑模型征集活动的优胜奖一/二/三等奖。活动奖项:一等奖:华为WATCH GT2 智能手表,价值1400元二等奖:Kindle电子书阅读器,价值658元三等奖:华为FreeLace Pro蓝牙耳机,价值500元注:①摩方精密技术团队将秉承公平公正公开原则认真对待每一个模型的评审;②高校建筑模型图的版权归提供者所有,摩方精密享有对所打印建筑模型进行宣传推广的权力。
  • 最后一周丨超高精度高校建筑模型免费打印
    各位朋友,摩方最新超高精度3D打印的高校建筑模型出炉啦!本轮高校建筑模型有1个,来自中南大学,以下为实拍图分享~ 本轮“免费超高精度3D打印高校建筑模型”活动即将到8月底截止,欢迎感兴趣的朋友抓住最后一周机会参与,免费获取超高精度3D打印母校建筑模型! 中南大学门牌坊活动主题:免费超高精度3D打印高校建筑模型第一轮征集时间:2021年6-8月征集方式:请将您所提供的高校代表性建筑三维模型图(仅限stl格式文件)通过邮件的方式,发送至bmf@bmftec.cn即可。(请留下您的姓名、单位、联系方式)模型要求:模型整体的最大尺寸和内部最小细节,相差在500倍以内。活动流程:①在模型征集期间,对于您所提供的模型图,摩方精密技术团队将在7个工作日内进行内部技术评审;②通过评审的模型,将由技术团队安排在3周内通过摩方精密3D打印设备打印出来,免费赠送给您,同时,所打印高校建筑模型将在摩方精密的公众号进行阶段性公示;③截至8月31日,本轮模型征集结束后,摩方精密团队将针对所有经过评审打印出来的高校建筑模型,通过公众号或合作媒体进行全国投票活动,最终参考实际票数情况,评选出本轮高校建筑模型征集活动的优胜奖一/二/三等奖。活动奖项:一等奖:华为WATCH GT2 智能手表,价值1400元二等奖:Kindle电子书阅读器,价值658元三等奖:华为FreeLace Pro蓝牙耳机,价值500元 注:①摩方精密技术团队将秉承公平公正公开原则认真对待每一个模型的评审;②高校建筑模型图的版权归提供者所有,摩方精密享有对所打印建筑模型进行宣传推广的权力。
  • 使用原代细胞3D生物打印皮肤组织模型
    导读皮肤是我们与外部环境的第一个主要接口,是一个非常有吸引力的再生器官,在过去40年里,科学家们对它进行了大量的探索(Loai, 2019 Tarassoli, 2017)。皮肤组织模型的广泛应用领域,从药物筛选到化妆品测试和伤口愈合研究,部分原因是因为皮肤组织的组成相对简单,可以描述为两个主要层,每层都具有一种主要细胞类型。在过去已经建立了2D模型和培养系统。然而,这些模型并不能完全重述原生皮肤,也缺乏3D模型提供的空间组织(Loai,2019 Singh,2020 Vijayavenkataraman,2016)。为了增加物理相关性,提高体外结果与体内条件的可译性,迫切需要3D皮肤组织模型。仪器:CELLINK BIOX墨水:GelXA Skin生物墨水和Col MA生物墨水细胞:人真皮成纤维细胞、表皮角质形成细胞过程:❶设计皮肤模型❷打印真皮层和表皮层❸3D生物打印皮肤组织模型转移到transwell板中,皮肤组织模型从液体培养到气液界面培养。结果:该皮肤组织模型的构建方法创建了一个完整且坚固的结构,可保持它在整个实验过程中的形状。样品横切面的H&E染色初步表明,6天时真皮和表皮这两个隔室之间的连接很弱。但在第14天,两层已经合并(图4)。在第14天,可以看到表皮平滑地跟随真皮的轮廓,真皮和角质形成细胞开始重组。进一步观察表皮发育,免疫荧光图像显示角蛋白14的表达在整个培养过程中保持不变,而角蛋白10和聚丝蛋白的表达在第14天增加。角蛋白10作为分化角质细胞的标记物,位于表皮的中间部分,而角化层的标记物聚丝蛋白应位于表皮的最外层。角蛋白10和聚丝蛋白表达的明显增加表明角质细胞已经开始分化。在第14天,聚丝蛋白的表达向结构的顶部,朝向气-液界面,显示了细胞在生物打印模型内的重组能力。总结:这项研究举例说明了如何使用原代细胞培养系统和CELLINK的3D生物打印平台进行全厚度皮肤组织模型的3D生物打印。★ GelXA SKIN生物墨水为皮肤发育提供了良好的环境,ColMA表皮生物墨水支持皮肤组织模型内表皮的形成。★ 该皮肤模型设计为表皮和真皮的发育形成了一个稳定的平台,在14天的培养期间保持稳定,但它可以培养更长时间,以允许其他真皮和表皮标记物进一步成熟。
  • 泽泉科技应邀参加作物生长模型高级研讨会2016
    2016年10月27日-29日,上海泽泉科技股份有限公司应邀赴南京参加了“作物生长模型高级研讨会2016”。此次研讨会由江苏省农业科学院农业经济与信息研究所/数字农业工程技术研究中心、中国农业大学资源与环境学院/系统模拟与软件技术实验室、西北农林科技大学水利与建筑工程学院共同主办。会议以作物模型与智慧农业为主题,特邀国内外知名作物模型专家作学术报告,旨在交流和讨论国内外模型建立与发展的经验。 来自南京农业大学、中国农业科学院、中国科学院地理科学与资源研究所、扬州大学、西北农林科技大学等40多家高校和科研单位的百余位专家学者参加了此次研讨会。与会专家围绕水稻、棉花、小麦、玉米、油菜等我国主要的粮食作物和经济作物模型构建及应用进行了深入讨论。模型对作物产量和品质的预测一直是建模工作讨论的热点,近几年来,模型在气候变化对作物的影响等方面的应用备受关注。 会议期间,泽泉科技展示的样机吸引了广大参会人员的眼球,技术人员演示了CI-110数字植物冠层图像分析仪、CI-203手持式激光叶面积仪、CI-690 ROOTSNAP根系分析系统等科研仪器设备的使用操作过程,并与我们的老用户和感兴趣的科研工作者交流了最新研究技术及相关设备的使用技巧和心得等。科研人员现场分享了高通量植物表型-基因型-育种平台AgriPheno的建设及科研服务内容和流程,与会人员反响热烈。泽泉科技的样机、海报以及工作人员的专业素养得到与会人员的一致好评,会议期间收到多位客户的详细咨询和留言。 本次参会得到了会议主办方和与会专家的鼎力支持,上海泽泉科技股份有限公司在此表示衷心的感谢。
  • 聚光污水智能运行监管模型顺利通过专家评审
    2014年9月11日,杭州市环境监察支队在杭州组织专家对聚光科技(杭州)股份有限公司承担的污染源排放(过程)工况监控污水智能运行监管模型进行评审,肯定了该污水智能运行监管模型的合理性和功能的完整性,并提出进一步完善意见。参加此次评审的专家组成员有中国环保产业协会马立学主任、浙江大学 尧一骏教授、浙江工业大学 童少平教授、上海市政工程设计研究总院 谭学军总工及萧山水务集团 方卫国总工。 为提升监测设备在环境执法中的作用,确保监测数据真实性,提高环境执法精准性,9月11日,杭州市环境监察支队在杭州组织专家对聚光科技(杭州)股份有限公司承担的污染源排放过程(工况)监控污水智能运行监管模型进行了论证。各专家组成员经过现场实地考察,对污水智能运行监管模型进行了详细审核,形成如下意见:1、 该模型符合《城镇污水处理厂污染源排放过程(工况)监控技术指南》要求;2、 该模型具有运行诊断、数据判定、物耗能耗核算等智能分析功能,满足合同要求;3、 该模型构架合理,监测参数齐全,满足对污染治理设施运行状态的判断要求;4、 建议进一步改进各子模型之间的相互验证功能,完善监测参数和取值范围,加强模型判断的实效性。 专家评审会现场
  • 英科学家研发新模型更精确检测外星生命
    这个行星上存在甲烷吗?   伦敦大学学院和澳大利亚悉尼新南威尔士大学的研究人员为&ldquo 炙热&rdquo 甲烷描绘了一个新光谱,可以用于检测温度高于地球分子水平的分子,温度上限高达1220摄氏度,这在之前是无法实现的。   为了查明环绕其它恒星的遥远行星的组成成分,天文学家分析了行星大气层吸收不同颜色的恒星光的方式,并将它与模型,或者称&ldquo 光谱&rdquo 相对比,从而鉴别不同的分子。研究合作作者、伦敦大学学院物理和天文系教授乔纳森· 坦尼森(Jonathan Tennyson)表示:&ldquo 目前的甲烷模型是不完备的,导致科学家们严重低估了行星的甲烷水平。我们预期我们研发的新模型将对未来的行星以及 寒冷 恒星的研究产生巨大的影响,潜在的帮助科学家们鉴别外星生命的迹象。&rdquo   这项发表在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上的研究描述了研究人员如何利用英国最先进的超级计算机&mdash &mdash 由英国剑桥大学进行的利用高级计算的分布式研究(DiRAC)项目所提供&mdash &mdash 以计算近100亿根光谱线,每一根光谱线都具有独特的颜色,且这一颜色的光能够被甲烷吸收。最新光谱线的名单比之前的任何研究都至少要庞大2000倍,这意味着它能够在更宽广的温度范围内提供更精确的信息。   研究首席作者、伦敦大学学院物理和天文系的谢尔盖· 尤尔琴科(Sergei Yurchenko)博士表示:&ldquo 我们创造的综合光谱只可能通过强大的超级计算机的来实现,我们将温度范围限制在1500k以与现有的能力相匹配,未来可以进行更多研究以拓展这个模型,从而将温度上限提升到更高。我们的计算要求300万个CPU小时。我们非常激动能够利用这一技术极大地推动光谱模型的发展,以帮助研究天体上存在潜在生命的研究人员,我们迫不及待想要看到这个新光谱将帮助他们获得什么新发现。&rdquo   这一最新模型已经被测试和证实了,它成功的细节复制了失败恒星,也被称为褐矮星(brown dwarfs)上的甲烷吸收光的方式。
  • 重磅!Nature封面:“中国天眼”挑战星际磁场标准模型
    1月6日,《自然》杂志以封面文章形式发表了被誉为“中国天眼”的500米口径球面射电望远镜(FAST)的最新成果。在该成果中,中国科学院国家天文台研究员李菂等领导的国际合作团队,通过FAST平台,采用原创的中性氢窄线自吸收方法,首次获得原恒星核包层中的高置信度的塞曼效应测量结果。研究发现,星际介质具有连贯性的磁场结构,异于标准模型预测,为解决恒星形成三大经典问题之一的“磁通量问题”提供了重要的观测证据。《中国科学报》了解到,这是FAST产出的系列重大成果之一。自2020年1月11日通过国家验收至今,FAST已运行近两周年。基于超高灵敏度的明显优势,它已成为中低频射电天文领域的观天利器。《自然》杂志封面 中国科学院国家天文台供图又一重磅,挑战星际磁场标准模型磁场在恒星、行星和生命的产生中发挥着重要作用,过程复杂。“磁通量问题”是恒星形成经典三大问题之一,分子云的星际磁场强度测量是全球天文界的共同挑战。恒星诞生于分子云中,分子云中的致密区域发生塌缩,最终形成恒星。恒星磁场的标准模型认为,在恒星形成过程中,磁场和重力是相互抗衡的力量,在分子云密度高的地方,重力越大,磁场也越强。按照这一模型,重力和磁场不断拉扯,以至于恒星形成需要上千万年。测量分子云的星际磁场强度并不是件容易的事。目前,可用于测量磁场强度的唯一手段就是“塞曼效应”。1896年,荷兰物理学家塞曼发现,把产生光谱的光源置于足够强的磁场中,磁场作用于发光体使光谱发生变化,一条谱线会分裂成几条偏振化的谱线。根据光谱的变化,科学家就可以反推出磁场的强度。但是,探测分子云的塞曼效应难度很大。“分子和磁场的作用普遍非常弱,塞曼效应也非常弱。”李菂说。为更好地测量出星际磁场,李菂团队另辟蹊径,原创出一种通过测量氢原子的谱线来测量星际磁场的方法——中性氢窄线自吸收方法。“原子对磁场的响应会比分子强。氢原子是宇宙中丰度最高的元素,广泛存在于宇宙的不同时期,也是不同尺度物质分布的最佳示踪物之一。”李菂说。FAST为李菂等人提出的新方法创造了应用的机会。“FAST是探测暗弱中性氢源的利器。”李菂说。通过FAST,研究人员测量了L1544分子云包层的磁场强度,首次实现了原创的中性氢窄线自吸收方法塞曼效应的探测,也实现了利用原子辐射手段来探测分子云磁场的“从0到1”的突破。研究人员发现,与标准模型的预测结果不同,星际介质从恒星外围的冷中性气体到原恒星核,具有基本一致、连贯性的磁场结构。“由此,我们将恒星形成的时间从上千万年减少到百万年。”李菂说。这一研究成果引起了国际学者的关注。未参与此项研究的美国伊利诺伊大学教授理查德克鲁切尔评价:“通过观测中性氢窄线自吸收的塞曼效应,FAST首次揭示了在恒星形成的早期阶段,磁压不足以阻止引力收缩,这与恒星形成的标准理论不一致。这一发现对于理解恒星形成的天体物理过程至关重要,并显示了FAST在解决重大天体物理问题方面的潜力。”运行两年,FAST产出一系列大成果从2020年1月11日通过国家验收至今,两年来,FAST好消息频传。仅2021年,FAST就产出了不少重要成果。2021年10月14日,《自然》发表了FAST获得迄今最大快速射电暴爆发事件样本的成果。快速射电暴(FRB)是宇宙中最明亮射电爆发现象,由于起源未知,它成为天文学研究的热点。国家天文台科研人员领导的国际合作团队,利用FAST对快速射电暴FRB121102进行观测,在约50天内探测到1652次爆发事件,获得迄今为止最大的快速射电暴爆发事件样本,超过此前本领域所有文章发表的爆发事件总和。这一成果还首次揭示出快速射电暴爆发率的完整能谱及其双峰结构。“FAST多科学目标巡天已经发现至少6例新快速射电暴,为揭示这一宇宙中神秘现象的机制、推进这一天文学全新领域的发展作出独特的贡献。”国家天文台副研究员王培说。面向未来,观天利器正摩拳擦掌5
  • 岛津应用:模型毛发样本中的药物成像
    -面向药物摄取履历的观察- 成像质谱分析法越来越广泛地应用于各领域中。由于毛发增长时会极微量地吸收当时所摄取的药物,因此,毛发作为记录药物使用履历的“磁带”式的样本备受关注。实际应用中经常使用 LCMS 等对从毛发中提取的药物进行分析。但是因提取操作的原因导致毛发中药物分布信息损失。如果能进行毛发纵轴方向截面的成像质谱分析,则可实现观察伴随毛发生长药物分布的变化情况、即实现药物使用履历的可视化。这项技术有望在法医学、临床医学、用药管理以及科学搜查等领域进行应用。 本次使用甲氧那明添加的毛发样品,进行了高空间分辨率的成像质谱分析,获得详细显示毛发中药物分布的成像结果。毛发在生长过程中,一边在根部吸收血液中的药物等,一边以每个月约 1cm 的速度生长。因此,毛发也被比喻为记录药物使用履历的磁带,在法医学和科学搜查中得到了应用,今后有望在用药管理、兴奋剂检查等更广泛的领域中应用。本应用报告中记载的添加毛发样本的制作过程与洗发香波、头发营养产品、头发定型产品和染发剂等头发护理用品的使用情况有很多共通点,因此,上述分析技术可以用于这些产品的开发和评价工作、进一步为头发的美容、健康作出贡献。iMScope TRIO (左)和 iMLayer(右) 了解详情,敬请点击《模型毛发样本中的药物成像-面向药物摄取履历的观察-》关于岛津 岛津企业管理(中国)有限公司是(株)岛津制作所于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司,在中国全境拥有13个分公司,事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心,并拥有覆盖全国30个省的销售代理商网络以及60多个技术服务站,已构筑起为广大用户提供良好服务的完整体系。本公司以“为了人类和地球的健康”为经营理念,始终致力于为用户提供更加先进的产品和更加满意的服务,为中国社会的进步贡献力量。
  • 不用动物实验依据毒性模型 基于细胞新方法可测化学品毒性
    p   一项研究发现可以通过基于细胞的方法预测化学物质对人的毒性,而不需要开展动物实验。这项研究展示了基于细胞的毒性模型,或有助于开发出代替传统动物实验测量化合物毒性的方法。相关成果近日发表于《自然—通讯》。 /p p   作为由美国政府主导的21世纪毒理学计划的一部分,美国国立卫生研究院的Ruili Huang 和同事测试了超过1万种化学物质,尝试开发出更好的测试诸如农药、工业化学品、食品添加剂和药品等化合物毒性的方法。他们测试了化学物质在15种不同浓度下和30个靶点(包括人体细胞核受体或者细胞通路)的反应活性,由此获得了超过5000万条数据。他们将数据和化学结构结合起来,创造了一些毒性模型,这些模型可以用于预测化学物质对动物或者人的影响。 /p p   当把这些结果与从动物试验中获得的、或已知从人身上获得的接触毒性物质的数据进行比较后,研究人员发现,相关模型既能预测对人的毒性,也能预测对动物的毒性。虽然这些结论需要用额外的细胞通路和靶点进行更多的试验,但研究人员提出,基于细胞的方法能用于毒理试验,而且能帮助优先选择出用于毒理试验的化合物。 /p
  • 苏州医工所等构建非小细胞肺癌化疗/靶向治疗疗效精准预测模型
    化疗/靶向治疗是中晚期非小细胞肺癌患者首选的治疗方案,然而化疗/靶向治疗并非适用于所有患者。部分患者对化疗/靶向治疗没有响应,而该情况对治疗没有益处,甚至造成无法逆转的身体损伤。目前,尚无临床指南指导医生在治疗前评估化疗/靶向治疗效果,导致中晚期非小细胞肺癌患者总体治疗效果不理想。因此,基于治疗前预测手段缺失的情况,开展非小细胞肺癌化疗/靶向治疗疗效预测对个性化医疗具有临床意义。  中国科学院苏州生物医学工程技术研究所研究员高欣团队与山东省肿瘤医院合作,探究治疗前医学影像信息对非小细胞肺癌化疗/靶向治疗疗效的预测价值。该研究入组了322例接受一线化疗、靶向治疗或二者联合的非小细胞肺癌患者,其中,肿瘤响应组152人,肿瘤无响应组170人,收集了患者的肺部CT影像数据及临床资料(年龄,血清标记物等)。科研人员利用肿瘤原发灶CT影像,借助影像组学方法及机器学习算法构建预测模型。研究表明,非小细胞肺癌肿瘤区域的影像学特征具有独立预测化疗/靶向治疗效果的能力,并且融合上述特征构建的模型预测精度达到0.746(如图所示),实现了目前已报道的精度最高的非小细胞肺癌化疗/靶向治疗疗效预测。  该研究探索并验证了肿瘤区域影像信息(CT)对非小细胞肺癌化疗/靶向治疗效果的预测能力,构建了非小细胞肺癌化疗/靶向治疗疗效预测模型,为临床制定个性化治疗方案提供了新的理论依据和方法。  相关研究成果发表在European Radiology上。  论文链接
  • 准确率突破90%|梁廷波团队利用质谱流式开发胰腺癌和肝癌早筛模型
    消化系统恶性肿瘤发病率及死亡率都居高不下,尤其是肝癌和胰腺癌,有着起病隐匿和进展迅速的特点,而进展期肝癌和胰腺癌大多数已丧失手术机会,导致患者预后极差[1]。因此,早筛对于肝癌和胰腺癌至关重要。目前临床上使用的肝癌和胰腺癌血清标志物分别为甲胎蛋白(AFP)和癌抗原19-9(CA19-9),但这两个指标的敏感性和特异性,都不满足早筛的需求[2,3]。近年来,基于外周血中循环肿瘤DNA和外泌体等指标的液体活检技术成功被用于癌症检测,但仍没有一项指标可应用于临床早筛[4]。于是科学界想到了检测肿瘤患者的免疫系统反应,已经有大量研究表明,肿瘤发生和进展的过程中会出现免疫细胞数量和组成的变化,而这种变化则体现为全身免疫紊乱和外周血免疫细胞亚群改变[4,5]。因此,通过外周血检测免疫细胞的组成和数量,或许可成为新的癌症早筛方法。近日,浙江大学医学院附属第一医院梁廷波教授领衔的研究团队在国际消化病顶级期刊Gut上,发表了一项重要研究成果。该研究通过质谱流式细胞术(CyTOF)检测了肝癌、胰腺癌患者及健康人的外周血免疫细胞组成和数量,确定肝癌和胰腺癌中特定的免疫细胞亚群改变,并基于此构建了肝癌和胰腺癌的早期诊断模型,灵敏度和特异度都高达90%以上,具有很高的诊断效能[7],从而为肝癌及胰腺癌的早期诊断和筛查提供了全新的策略。为获得精确且具有普遍性的结论,研究人员收集了来自了15个中心的2348个受试者的样本,其中健康人对照633例,肝病患者1131例(良性肝病341例,肝癌790例),胰腺病患者584例(良性胰腺疾病208例,胰腺癌376例),在完成样本质控后,对所有样本进行了CyTOF检测,对32种主要的免疫细胞进行鉴定(见图1),并分析癌症患者与健康人或良性疾病患者这些免疫细胞组成和数量的区别。图1.外周血中免疫细胞的鉴定研究人员发现,相比于健康人和良性疾病患者,肝癌和胰腺癌患者的外周血免疫细胞亚群有着明显区别:肝癌患者的幼稚CD4 T细胞、幼稚CD8 T细胞和效应CD8 T细胞等比例降低,而浆细胞、中央记忆性CD4 T细胞单核细胞等比例升高,且以NK细胞为代表的一些亚群会出现随着肿瘤分期的进展而比例增加的现象,在胰腺癌患者样本中这些现象同样存在。也就是说,恶性肿瘤患者的外周血中,确实存在着与健康人和良性疾病患者不同的免疫细胞亚群。为合理构建预测模型,研究人员将受试者分为模型构建组和内部验证组和外部验证组3组,通过随机森林算法鉴定出诊断肝癌的7个标志物和16个细胞亚群,以及诊断胰腺癌的8个标志物和11个细胞亚群,并以此为依据构建模型,得到了外周血免疫评分(PBIScore)这个诊断指标。PBIScore反应了人外周血中与肿瘤相关的免疫细胞亚群比例的改变,且与临床常用的肿瘤标志物AFP和CA19-9类似,PBIScore同样属于血液无创检测。那么与“前浪”相比,PBIScore这个“后浪”能否堪当大任呢?研究人员发现,PBIScore在肝癌诊断模型组、内部验证组和外部验证组中的AUC值(反应诊断效能)分别达到了0.98、0.91和0.85;在胰腺癌诊断模型组、内部验证组和外部验证组AUC值分别为0.98、0.89、0.89。也就是说,PBIScore的AUC值高于AFP和CA19-9这两个传统指标,但优势还不是十分显著。为了进一步增强PBIScore的诊断效能,研究者们将它与AFP或CA19-9联合,构建了新的评分模型——iPBIscore,使其诊断效能进一步增强:iPBIscore在肝癌诊断模型组、内部验证组和外部验证组的AUC值分别高达0.99、0.97、0.96,胰腺癌诊断的AUC值更是达到了0.99、0.98及0.97,均明显高于PBIScore或AFP/CA19-9单独使用(图2)。图2.基于PBIScore构建的肝癌和胰腺癌诊断模型的效能大多数标志物在进展期或晚期肿瘤诊断时都能发挥出不俗的作用,但是一到早期肿瘤诊断往往会“折戟”,而对于癌症筛查来说,早期诊断才是重中之重。因此,研究人员检测了这种基于PBIScore的模型对早期肝癌和胰腺癌的诊断效果。结果表明,AFP/CA19-9、PBIScore模型和iPBIScore模型诊断早期肝癌的AUC值分别为0.81、0.90和0.96,诊断早期胰腺癌的AUC值分别为0.88、0.89和0.95(图3)。由此可见,PBIScore模型对早期胰腺癌和肝癌具有很强的诊断能力,而且对于传统肿瘤标志物有着很好的补充作用,两者结合之后可大幅度提高肝癌和胰腺癌的早期诊断率。图3. 基于PBIScore的模型对早期肝癌和胰腺癌的诊断效果基于PBIScore模型良好的诊断效果,研究人员推测,模型中纳入的免疫细胞亚群和肿瘤标志物、分化程度及分期等病理特征有潜在相关性。经验证,肝癌患者中,AFP阳性患者的外周血单核细胞和中央记忆性CD8 T细胞显著低于AFP阴性患者,中分化和高分化肝癌患者的中央记忆性CD8 T细胞比例远高于低分化患者(图4A)。此外,外周血免疫细胞亚群和胰腺癌肿瘤位置、疾病分期也具有显著相关性(图4B)。因此,这些外周免疫细胞亚群的失衡对于肿瘤发生、进展都有重要影响。图4.PBIScore模型中免疫细胞亚群和胰腺癌肝癌病理特征的相关性总之,这项研究通过多中心、大样本的外周血免疫细胞亚群检测揭示了外周血免疫细胞亚群紊乱对于肿瘤发生发展的影响,开发了一种可早期高效诊断肝癌和胰腺癌的早筛模型,为癌症早筛提出了一个新策略和新方向。参考文献:[1] Sharma P, Hassan C. Artificial Intelligence andDeep Learning for Upper Gastrointestinal Neoplasia. Gastroenterology. 2022 Apr 162(4):1056-1066. doi: 10.1053/j.gastro.2021.11.040.[2] Melbye M, Wohlfahrt J, Lei U, et al. Alpha-Fetoprotein levels in maternal serum during pregnancy and maternal breast cancer incidence. J Natl Cancer Inst 2000 92:1001–5.doi:10.1093/jnci/92.12.1001 [3] Ballehaninna UK, Chamberlain RS. The clinical utility of serum CA 19-9 in the diagnosis, prognosis and management of pancreatic adenocarcinoma: An evidence based appraisal. J Gastrointest Oncol. 2012 Jun 3(2):105-19. doi: 10.3978/j.issn.2078-6891.2011.021.[6] Zhang Q, Mao Y, Lin C, et al. Mass cytometry-based peripheral blood analysis as a novel tool for early detection of solid tumours: a multicentre study. Gut. 2022 Sep 16:gutjnl-2022-327496. doi: 10.1136/gutjnl-2022-327496.
  • 福斯发布大豆加工工业中生榨豆粕近红外定标模型
    福斯专注于农产品和食品领域,其技术中凝聚了众多专家的智慧与行业经验。与福斯合作过的用户都知道,购买的福斯仪器不仅仅是一台硬件设备,而是一整套解决方案。近期,福斯应用专家们经过长期多个样品的测试,并通过化学计量学工具,开发出了生榨豆粕的近红外定标模型。 该定标模型建立在福斯近红外品质分析仪DA1650和DS2500上使用,所提供的参数包括水分,脂肪和蛋白。豆粕是大豆提取豆油后得到的一种副产品,因蛋白含量高,是作为饲料的主要原料,另外还用于制作食品、化妆品原料等。豆粕中的蛋白含量直接关系到豆粕的质量和使用,水分含量也会影响豆粕存储期。因此监控这些参数对于原料质量把控,按质论价,产品质量控制都有重要作用。 如需了解该定标的详细信息,请致电福斯。联系方式:鄂经理电话:18612999506邮箱:May.E@foss.com.cn 关于福斯 福斯是全球顶尖的食品业及农业产业分析解决方案供应商,帮助生产者实现其生产价值最大化。无论实验室分析还是在线解决方案,福斯采用各种技术从传统的实验室湿化学参照法到先进的近红外(NIR)和X射线等分析技术,满足客户需求。福斯一直处于创新前沿。 超过50000个福斯分析仪器正在全球各地实验室中运行,世界100强食品和农业产业公司中有90多家正在使用福斯的方案。 福斯是一家私有企业,拥有来自世界各地的1200多名员工。福斯在丹麦、瑞典、美国和中国均有制造及研发基地。福斯在25个国家设有销售服务公司及超过70家专业经销商销售福斯方案并提供服务。 福斯公司联系方式 北京:010-6846 7239上海:021-51695953广州:020-3828 8492邮箱:china@foss.com.cn
  • 转化医学系列网络讲座 | 类器官时代的疾病模型
    本期webinar邀请到的是香港大学微生物系研究助理教授周婕博士,周婕博士是西安医科大学医学学士,香港大学PhD,前 UCSF博士后研究员。她的研究方向是病毒感染的致病机理及病毒和宿主的相互作用。近年来,她将全新的类器官技术用于病毒学的研究,她的创新性的研究发表在Science Advances和 PNAS 上。与荷兰 Hubrecht 研究所Hans Clevers 教授合作,周婕博士和她的团队建立了首个成体干细胞来源的人气道类器官,气道类器官在形态和功能上忠实地模拟人的气道上皮,为呼吸道生理和病理的提供了一个功能强大的用途广泛的模型。讲座题目:类器官时代的疾病模型讲座时间:2019年6月20日14:00-15:00主讲人:周婕 博士(香港大学)讲座形式:网络讲座,手机或PC即可参与(会议链接和如下报名链接相同)内容简介:Brief introduction of organoids, esp. adult stem cell derived organoids.类器官简介,尤其是成体干细胞来源的类器官Virus infections in human intestinal organoids.人类小肠类器官中的病毒感染Establishment and characterization of human lung organoids and influenza virus infection.人类肺类器官的建立和分析,以及流感病毒的感染Cancer organoids and applications.肿瘤类器官及应用即刻报名扫描下方二维码,或点击“阅读原文”,即刻报名吧!更多转化医学系列网络讲座安排,具体时间以珀金埃尔默微信推送时间为准。敬请关注!关于珀金埃尔默:珀金埃尔默致力于为创建更健康的世界而持续创新。我们为诊断、生命科学、食品及应用市场推出独特的解决方案,助力科学家、研究人员和临床医生解决最棘手的科学和医疗难题。凭借深厚的市场了解和技术专长,我们助力客户更早地获得更准确的洞见。在全球,我们拥有12500名专业技术人员,服务于150多个国家,时刻专注于帮助客户打造更健康的家庭,改善人类生活质量。2018年,珀金埃尔默年营收达到约28亿美元,为标准普尔500指数中的一员,纽交所上市代号1-877-PKI-NYSE。了解更多有关珀金埃尔默的信息,请访问www.perkinelmer.com.cn
  • 贝叶斯模型分析“鸟枪法”鉴定蛋白质组数据
    北京蛋白质组研究中心/蛋白质组学国家重点实验室朱云平研究员课题组张纪阳博士等通过建立贝叶斯模型分析“鸟枪法”鉴定蛋白质组数据,大幅提升蛋白质组质谱数据的利用率。相关论文发表在最新一期国际蛋白质组学权威杂志:《分子与细胞蛋白质组学》(Molecular & Cellular Proteomics, MCP)上面,同期杂志还发表了该所姜颖副研究员课题组、钱小红研究员课题组的两篇研究论文,创该刊单期同一单位发文数之最。   大规模、高通量的蛋白质组研究产生了海量的数据,其中包含了大量的噪声,而高可靠的数据是进一步生物学分析的基础,故目前的分析方法均采用了过严的标准,但在降低假阳性的同时也人为地造成了数据较高的假阴性及较低的利用率。因此,"在保证高可信度的前提下,最大限度地利用实验数据"一直是蛋白质组学界的追求。"鸟枪法"是目前蛋白质组鉴定中地位最重要、应用最广泛的技术策略。他们基于随机数据库策略、非参概率密度模型和贝叶斯公式,建立了串联质谱数据过滤的多元贝叶斯非参模型。通过标准蛋白和复杂样品的严格考核,表明该模型具有良好的灵敏性和普适性,可将质谱数据的利用率提高10~40%,创本领域最好水平。   原始出处:   Molecular & Cellular Proteomics 8:547-557, 2009.doi:10.1074/mcp.M700558-MCP200
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