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去糖基化完整质量数

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去糖基化完整质量数相关的论坛

  • CE-SDS测高糖基化蛋白

    有没有同学用CE-SDS测高糖基化蛋白的?现有的方法多数是测单抗的,对我目前检测的蛋白不适用。想要改进方法又没有方向。希望有类似研究方向的同学交流一下,怎么能建立一个适用的方法。我用的仪器是贝克曼PA800plus

  • 抗体糖基化分析

    附件中是有关抗体IgG 的糖基化相关研究;希望对大家有用!祝新年好!

  • N-糖链/糖肽纯化与免疫球蛋白G Fc糖基化定量分析

    [b][font='微软雅黑',sans-serif][color=black][back=white]【序号】:4【作者】: 曹翠岩【题名】:N-糖链/糖肽纯化与免疫球蛋白G Fc糖基化定量分析[/back][/color][/font][/b][align=left][font='微软雅黑',sans-serif][color=black][back=white]【期刊】:大连理工大学 博士论文[/back][/color][/font][font='微软雅黑',sans-serif][color=black][/color][/font][font='微软雅黑',sans-serif][color=black][back=white]【年、卷、期、起止页码】:2022[/back][/color][/font][font='微软雅黑',sans-serif][color=black][/color][/font][font='微软雅黑',sans-serif][color=black][back=white]【全文链接】:[/back][/color][/font][url=https://kns.cnki.net/kcms2/article/abstract?v=3uoqIhG8C447WN1SO36whLpCgh0R0Z-ia63qwICAcC3-s4XdRlECrS5ECsmZMDd20ZXc0ZZUotUGtkXc-cNy_5YsXaID81b6&uniplatform=NZKPT]N-糖链/糖肽纯化与免疫球蛋白GFc糖基化定量分析研究 - 中国知网 (cnki.net)[/url][/align][align=left] [/align]

  • O-GlcNAc糖基化及其糖蛋白规模化的鉴定

    [align=center][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]基[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]化[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]及其[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖蛋白规模化的鉴定[/color][/size][/align]O- [size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖基化是一种发生在蛋白质丝氨酸或苏氨酸上的具有一个糖单元结构的翻译后修饰,广泛分布在细胞核和细胞质中,是一种重要的胞内修饰调控方式。它参与细胞的多种应激响应和细胞进程,如信号转导、转录、翻译、蛋白降解、基因调控与细胞周期调控等。目前,已发现的[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]1000[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]多种[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖蛋白中,主要有细胞骨架蛋白、核孔蛋白、转录因子、激素受体、磷酸酶、激酶等。[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖基化异常与一些疾病,如糖尿病、帕金森病、阿尔兹海默症等有紧密联系。因此,系统地对[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖基化蛋白质进行鉴定与分析[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d],[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]对于研究其生物学功能和在疾病发生发展中的作用都具有重要意义。[/color][/size][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#0d0d0d][1][/color][/size][/sup][/font][size=16px][color=#0d0d0d]与目前磷酸化蛋白的鉴定规模相比,[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]蛋白的鉴定尚处于初级水平。[/color][/size][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#0d0d0d][2-4][/color][/size][/sup][/font][size=16px][color=#0d0d0d]导致[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]难以鉴定的原因主要有:[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]1[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d])[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]修饰在胞内是动态变化的,并且在细胞裂解时糖苷键容易被破坏;[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]2[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d])[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]修饰蛋白表达丰度较低,[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]且糖基[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]化水平不一;[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]3[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d])[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]修饰蛋白在进行质谱检测时容易发生中性丢失,难以被完全检测。[/color][/size][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#0d0d0d][5][/color][/size][/sup][/font][size=16px][color=#0d0d0d]由于[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]修饰具有表达丰度低、高度动态变化、容易分解等特点,常规质谱鉴定手段难以对其实现高灵敏度、规模化的分析鉴定,因此对[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]的鉴定往往需要先对糖蛋白[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]/[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖肽进行分离富集后方能成功进行。[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]在近年来发展了多种针对[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖基化修饰蛋白质和[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]肽段[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]的分离与富集新策略,已有的[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖肽富集方法包括凝集素富集法、抗体富集法、代谢标签富集法、化学酶促反应标签富集法以及酰肼富集法等。[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]基于亲和作用的直接捕捉方法操作简便,但由于亲和力较弱,难以避免非特异性吸附,导致特异性差;而通过非天然糖基的代谢标记法或化学酶促标记法将生物兼容性的反应基团([/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]炔[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]基、叠氮基等)引入[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖肽,再由点击化学反应进行捕捉可以显著提高糖肽的富集特异性,但点击化学等反应不可逆,容易造成糖肽修饰基团的质量标签过大,影响糖肽的鉴定效率,而且操作复杂。[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]因此,应该开发特异性高、覆盖高度、操作简便,并且不会影响质谱鉴定的新方法实现[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖蛋白规模化的鉴定。[/color][/size]

  • 如何解析带有糖基化合物的NMR?

    带有糖基的化合物,一般在溶液中有异构体,比如果糖基,在重水中有开环式、闭环式,其中闭环式又有a-呋喃式、a-吡喃式、b-呋喃式、b-吡喃式,这样造成H谱和C谱比较复杂,如何解析这样的化合物?

  • 质谱技术在抗体药物分析中的应用

    质谱技术是抗体药物分析最重要的技术手段之一。本文简述了抗体药物的发展和质谱技术的原理。对于质谱技术在抗体药物的分析中应用进行了归类整理,主要分为在一级结构和高级结构分析中的应用。抗体类药物是指含有抗体片段的蛋白类药物,所以在恶性肿瘤、自身免疫性疾病、心血管疾病、感染和器官移植排斥等重大疾病上得到了快速的发展,是当前生物药物领域增长最快的一类药物.1.抗体药物发展新趋势在生物药物领域,抗体药物占据着越来越重要的地位,全球销售排名前10位的药物中有6个为抗体药物,抗体药物按来源分类可以分为:鼠源单克隆抗体、人鼠嵌合抗体、人源化抗体和全人源抗体。目前,批准的单克隆抗体药物中,人源化单抗和全人源单抗数量已占据大多数。1.1 抗体药物偶联物(ADC)抗体药物偶联物(ADC)由单克隆抗体和小分子化合物两部分组成。通过抗体的靶向作用,ADC 的抗体部分和肿瘤细胞表面抗原特异性识别并结合,通过细胞内吞作用,将抗体和小分子化合物一起带进肿瘤细胞内部,释放出小分子化合物。这样既可以降低小分子药物的毒性,同时具有靶向结合的作用。已经上市的两个ADC 是Kadyla 和Adcetris。1.2 双特异性抗体(BsAb)双特异性抗体(BsAb)是含有两种特异性抗原结合位点的人工抗体,能在靶细胞和功能分子(细胞)之间架起桥梁,由于基因工程的发展,目前双特异性抗体已经研发出多种类型,主要类型有三功能双特异性抗体、IgG-scFv、三价双特异性分子、串联单链抗体(串联scFv)、DVD-Ig 等多种形式。2.质谱技术近年来质谱仪性能的显著改进主要基于开发出的两种离子化技术:一种是介质辅助的激光解吸/离子化技术。另一种是电喷雾离子化技术。由于这两种电离技术的出现,使原本只能检测小分子的质谱技术,可以运用于检测生物大分子。在过去质谱技术主要运用于对一级结构和序列的表征,而现在质谱技术越来越多地运用于高级结构的分析,而高级结构对于抗体药物的生物活性至关重要。3.质谱技术在抗体药物一级结构分析中的应用3.1 完整抗体药物精确分子量测定当得到抗体药物时,可以直接通过高分辨率的MALDI-TOF或者ESI-MS进行分子量的检测。通过对于脱糖后分子量的检测,可以对于抗体药物进行初步定性分析,并将可以作为药物常规放行的分析方法。对于脱糖前的抗体药物进行分析,可以得到抗体药物的糖基化类型的信息及糖基化水平的分布,对于快速了解生产工艺与药物质量的关系具有十分重要的意义。3.2 药物抗体偶联比(DAR)对于赖氨酸链接的抗体偶联药物,采用C4色谱柱及联用的质谱对去糖基化样品进行分析,根据偶联不同数目药物分子的质量数增加判断偶联数目。对于质谱测定的结果,不仅可以给出确切的药物抗体偶联比值,更能够给出链接不同个小分子药物的分布情况,及反应过程副产物空链接头的分布情况。3.3 肽图谱分析蛋白被特异酶切后的蛋白酶水解后得到的肽片段质量图谱。由于不同的抗体药物具有不同的氨基酸序列,蛋白质被酶水解后,产生的肽片段也各不相同,肽混合物的质量数具有唯一特征。可以通过LC-ESI-MS进行肽片段的一级质量数的鉴定,也可以通过LC-ESI-MS/MS对于每个肽片段进行进一步确证,提高肽图谱的准确性。3.4 翻译后修饰研究蛋白质的翻译后修饰(PTM)对于抗体药物的生物学功能十分重要。常见的翻译后修饰有:磷酸化、脱酰胺、甲硫氨酸氧化、糖基化修饰、N端焦谷氨酸环化,C端赖氨酸切除等。质谱分析仪检测蛋白和肽片段的分子量偏差,可以实现高灵敏、高通量和高精确地鉴别蛋白质的翻译后修饰的种类。3.5 N端氨基酸序列检测常规N端氨基酸检测用Edman降解法进行检测,但是抗体药物有时候会出现N 端环化的现象,在这种情况下用Edman降解法需要先对抗体进行去封闭处理,而直接使用质谱可以直接测出N端的氨基酸序列,同时可以检测出N端环化的相对比例。4.质谱技术在抗体药物高级结构分析中的应用4.1 氢/氘交换质谱(HDX-MS)常规的质谱只能获得蛋白的一级结构信息。氢/氘交换质谱(HDX-MS)可以进行蛋白质构象,溶液动力学和表位映射进行分析。在能够调查的蛋白质的高阶结构和动态结构技术中,HDX-MS已经证明适合单克隆抗体和单克隆抗体-抗原复合物的构象分析。4.2 离子淌度质谱法(IM-MS)离子淌度是根据蛋白的电荷和形状选择性分离的方法,可以区分相同分子量的蛋白和肽段,可用于检测蛋白的简单高级结构。4.3 高分辨率傅立叶变换离子回旋共振质谱(FTICR-MS)高分辨率傅立叶变换离子回旋共振质谱(FTICR-MS)能够检测最高质量数的质谱仪器,并且有着很高的分辨率。FTICR-MS 是目前被公认为是蛋白质组学研究的有力工具,特别是和完整的蛋白质鉴定和上/下调翻译后修饰(PTM)蛋白质的鉴定。

  • 求一个表格,关于元素、质量数、干扰物的

    这几天在逛[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url]板块,前两天看到一个图,当时没保存,现在想找又找不到了。表格横着看每列是质量数,大概六七个?纵向每行是分析的元素,中间区域填写的是对应元素在对应质量数下的同质异位素或是同位素等。我记得发图的人说这个叫什么卡来着,还说仪器带的,但是我这没有找到,哪位大佬知道是什么的?能发给我看下最好。用标样扫描9个元素铬、镍、铜、锌、锗、铑、镉、铼、铅,用scanning模式,扫出10个峰,多出来的是质量数77的,想查一下这个是什么还有,扫描模式如何设置才能完整扫描出全质量数的谱图来,而不是选择性地跳着扫描?

  • O-GlcNAc糖基化修饰蛋白质和肽段的分离与富集新策略

    [align=center][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖基化修饰蛋白质和[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]肽段[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]的分离与富集新策略[/color][/size][/align][size=16px][color=#0d0d0d]作为[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]成功鉴定的前提,糖肽的分离富集一直是国内外研究的重点。近年来,针对[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖基化修饰丰度低,质谱响应性差,难以实现高灵敏度、规模化分析等难点,发展了凝集素法、抗体富集法、亲水富集法等多种针对[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖基化修饰蛋白质和[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]肽段[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]的分离与富集新策略。[/color][/size][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#0d0d0d][7-8][/color][/size][/sup][/font][size=16px][color=#0d0d0d]凝集素作为一类糖结合蛋白,能专一识别某种单糖或聚糖结构,并与之可逆的共价结合,因此被广泛[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]应用于糖基[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]化蛋白的分离富集中,其中,小麦胚芽凝集素([/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]WGA[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d])是富集[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖肽的常用策略。[/color][/size][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#0d0d0d][9][/color][/size][/sup][/font][size=16px][color=#0d0d0d]WGA[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]以二聚体形式作用,每个单体含有[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]4[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]个结合位点,识别专一性不高,对聚糖的亲和力高,对单糖亲和力比较低,[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]对糖链末端[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]的唾液酸([/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]sialic acid[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d])、[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]N-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]乙酰葡糖胺([/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d])[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]以及壳[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]二糖([/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]chitobiose[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d])等结构均有识别。由于[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]是单糖修饰,直接用[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]WGA[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]富集特异性比较差。针对存在问题,[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]Wosseller[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]等[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]人制[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]备了一种基于[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]WGA[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]的凝集素层析柱,发展了一种凝集素弱性亲和色谱法([/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]LWAC[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d])对[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖蛋白进行分离富集鉴定。利用装有[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]WGA[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]偶联珠的长柱,用低流速等压洗脱分离[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]肽,[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]肽[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]由于与材料的亲和作用[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]而被柱阻滞[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d],从而实现分离富集。除此以外,琥珀酰化后的小麦胚芽凝集素([/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]sWGA[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d])可以实现对末端[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖链的[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]特异的亲和性,专一性有所改善,但结和力减弱。因此,凝集素方法依然存在制备困难、成本高、稳定性差、亲和力和选择性不足等缺点,影响[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖肽的高效分离富集。[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]基于抗体的富集方法比凝集素[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]法拥有[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]更好的亲和力和特异性,是最简单的[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖肽富集方法之一,运用[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]泛特异性抗体,可以识别[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]连接的丝氨酸或者苏氨酸残基,目前用到的主要有两种[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]RL2[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]和[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]CTD110.6[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d],但是这些抗体往往具有位点依赖性,需要结合多个单糖才能表现出较强的亲和力,存在亲和力不够高的问题,多个抗体联合使用则会提高富集特异性。[/color][/size][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#0d0d0d][10][/color][/size][/sup][/font][size=16px][color=#0d0d0d]Wells[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]等人通过对抗体富集策略进行改进发展,开发了新前处理方式等手段,从小鼠的突触组织样本中鉴定到[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]1750[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]个[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]修饰位点,大大提高了[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖肽鉴定的准确度和广泛性。抗体较凝集素而言,特异性更强,结合力更大,但价格昂贵,易产生非特异性吸附导致假阳性结果,[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]且单抗[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]富集的[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖肽具一定的选择性,每种抗体富集到的[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖肽重合度不高,因此,普适性通用[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]性抗体的开发成为了基于抗体富集[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖肽研究的关键。[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]亲水富集方法利用糖肽中聚糖的羟基与固定相之间的亲水作用进行[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖肽的分离富集,[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]Qian[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]等人利用表面引发原子转移自由基聚合[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d](SIATRP)[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]合成了亲水聚合物改性二氧化硅微粒,微粒子表面密集填充聚乙二醇,具有高度亲水性,为[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]肽的保留提供强大的[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]HILIC[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]相互作用。利用该材料从人的尿液样本鉴定到[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]470[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]个[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]肽,[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]457[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]个[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]蛋白,大大提高了[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]O-[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]GlcNAc[/color][/size][size=16px][color=#0d0d0d]糖肽鉴定的覆盖度。但仍然存在假阳性较高的问题。[/color][/size][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#0d0d0d][11][/color][/size][/sup][/font]

  • 急求!重质量数信号偏低

    昨天停电,仪器重新启动,发现重质量数信号严重偏低,U等质量数几十的信号,扫描调节液也发现重质量数信号严重偏低,重质量数的信号的峰位也向右偏0.3aum,质量校正也校不过,动了四级杆RF发生器也不管用,空气湿度为50-60,那位高手请赐教!多谢!!!

  • 【分享】生物质谱在糖蛋白结构分析中的应用

    【分享】生物质谱在糖蛋白结构分析中的应用

    生物质谱在糖蛋白结构分析中的应用项目完成人:桑志红 蔡 耘项目完成单位:国家生物医学分析中心 随着人们对糖蛋白参与生命活动机理的日益深入了解,对天然糖蛋白及重组糖蛋白类药物的分析越来越受到重视。重组糖蛋白类药物的质量控制更是直接关系到药物的疗效及至人类的健康。九十年代以来,随着带有反射功能的基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)和纳升电喷雾串联质谱(nano-ESI-Q-TOF)等具有软电离方式的现代质谱 技术的发展,质谱以其高灵敏度和强有力的分析混合物的能力,提供了生物大分子的分子量、序列、一级结构信息以及结构转换、修饰等方面的信息,使糖基化分析有了重要的进展。 通常研究糖蛋白的方法是把蛋白链上的寡糖切下来,分别研究蛋白部分和寡糖部分的结构,因此无法研究与两部分共同相关的结构问题,也不能区分不同糖基化位点上切下来的寡糖。自90年代初,国外有人开始用质谱法研究糖蛋白的结构,同时描述了各个位点的不均一性。我们用建立的现代生物质谱技术研究糖蛋白一级结构的方法,将其应用与基因重组糖蛋白的结构分析。为糖蛋白结构分析及基因重组糖蛋白类药物的质量控制提供新的手段。一、 生物质谱研究糖蛋白结构方法的建立实验所用仪器为:1.德国BRUKER 公司的REFLEXIII型基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱仪,N2激光器,波长337nm,线性飞行距离150cm,加速电压2kv。2.英国Micromass 公司Q-TOF型电喷雾串联质谱仪。源温80°C,气体流速40L/h,枪头电压650V,检测频率2.4S,氩气碰撞池压力6*10-5mbar。1. 基质的选择,在MALDI-TOF-MS分析中,基质起着相当重要的作用。不同的基质对不同类的物质响应不同,a-氰基-4-羟基肉桂酸用于测定糖蛋白核糖核酸酶B效果相对较好。2. 糖蛋白分子量的测定,糖蛋白核糖核酸酶B由124个氨基酸组成,在34位Asn处连有一个高甘露糖型N-糖链。由于糖链的微不均一性,与普通蛋白质及核酸不同,其分子离子峰在MALDI-TOF-MS 质谱图上表现为一簇峰,各峰之间约相差一个糖基。正是由于这种微不均一性,使得其分子离子峰变宽,灵敏度降低。糖链分子量越大,峰越宽,灵敏度越低,所以一般只有糖链较短,蛋白的质量不太大的糖蛋白才能测定其平均分子量。用MALDI-TOF可直接测定糖蛋白核糖核酸酶B的平均分子量为 15208.6Da。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/03/201103211511_284179_1604317_3.jpg3. 糖含量的测定,采用O聚糖酶及内糖苷键酶F分别作用于核糖核酸酶 B,只有内糖苷键酶F能够是其分子量发生变化,表明核糖核酸酶B分子中不存在O-连接糖链存在着N-连接糖链。内糖苷键酶F切断N-糖链五糖核心最内侧的GlcNAc-GlcNAc糖苷键,得到含一个GlcNAc的肽链,减去GlcNAc,可以计算出准确的肽链分子量T=13695.6,与糖蛋白平均分子量之差为糖链的平均分子量G=1513.4,平均糖含量为:(糖链大小/糖蛋白分子量)×100%=9.95%。4. 糖基化位点的确定,研究糖基化类型及糖基化位点的策略:采用蛋白酶酶解与糖苷内切酶酶解相结合的方法,通过酶切前后含糖肽片的位移,结合网上数据库检索,可以确定糖基化类型和糖基化位点。以不同类型的糖苷内切酶作用于糖蛋白(N-糖苷键酶或O-糖苷键酶),在MALDITOF-MS 上观察其质量的变化,可以直接确定糖蛋白中是否含有响应类型的糖链,这是我们确定糖蛋白中糖苷键类型的基础。我们采用先将核糖核酸酶B还原烷基化,加Glu-C酶切,产物再用内糖苷肩酶F酶切,可观察到含糖肽段出现位移,将核糖核酸酶B的肽质量指纹图进行数据库检索,证实发生位移的肽段中含有N-糖链特异连接位点,由此确定34位Asn为糖基化位点。另外我们采用内糖苷键酶F及肽-N-聚糖酶F两种酶进行差位酶切法对含糖肽段进行验证,两种酶酶切后分子离子峰的差值除以GlcNAc的质量,结果就是N-糖基化位点的个数5. 质谱测定氨基酸序列, 我们对核糖核酸酶B肽质量指纹谱中的含糖肽段进行了串联质谱测定,首先在一级质谱图中选择离子4972.23,在串联质谱的碰撞活化室以氩气与其碰撞产生碎片,从碎片的质荷比推算出此肽片中的一段氨基酸序列,检索结果为核糖核酸酶B,从而判断其理论序列是否一致。6. 糖链结构的研究,凝集素对糖肽的亲和提取,进一步分析糖肽序列及糖链结构的关键是含糖肽段的提取。核糖核酸酶B中糖链为高甘露糖型,我们选用对其有特异性吸附的伴刀豆球蛋白对其进行提取利用这种简捷的亲和质谱的方法,对糖肽段进行了分析。建立了亲和质谱分析糖肽类物质的方法,为今后糖肽序列分析及糖链结构分析奠定了基础。二、基因重组糖蛋白人促红细胞生成素(rhEPO)的结构分析。 利用以上建立的方法,我们对样品重组人促红细胞生成素进行了分析,断定此样品为非完全糖基化,样品中只存在N-连接的糖链,无O-糖链。应用酶切法用肽-N-聚糖酶处理后,得到两个含糖肽段,进行数据库检索,测得38位及83位为N-糖基化位点,与文献报道相符,结果可靠。因此,该项课

  • 【第三届原创参赛】金属羰基化合物的红外光谱及应用

    【第三届原创参赛】金属羰基化合物的红外光谱及应用

    曾经在工作中接触过一点金属羰化物的红外分析,当时为了做好这项工作,我做了不少案头工作,现在我要离开分析行业了,整理了一下自己曾经做过的一些东西,真的还是有点留恋,就拿这些内容整理一下,作为原创大赛的最后一篇告别文。我这人其实挺烦为发表而作的八股文的,所以更喜欢比较自由的论坛帖子。好了,下面言归正传:一.基础知识 金属羰基化合物是指羰基和金属原子形成含σ-π配键的配位化合物,几乎全部的过渡金属可以和一氧化碳形成稳定的羰化物。这种配合物中金属离子的氧化态一般很低,有的甚至等于零,如4]、Na[Co(CO)[sub]4]、[Mn(CO)[sub]5Br]、Co[sub]2(CO)[sub]8]等。有些金属羰化物及其衍生物在一些有机合成中用作催化剂,有的已用于工业生产中,例如工业上常在高温高压下由合成气(CO+H[sub]2)与金属铑、钴或它们的盐合成羰化物作为催化剂。这里是别人列出的一些金属羰化物.[img]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2010/12/201012142027_267014_1640192_3.jpg[/img] 我接触到的是合成中用于均相催化剂的钴\铑\铱的羰基化合物.[/size]

  • 【求助】质量数偏高

    各位大虾,小弟在GC-MS的调谐评估是发现质量数70与质量数69之比大过1.6%,请问各位大神,是是什么原因引起的?谢谢!

  • 四极质量分析器测试用的刚超过2000质量数的质谱标样?

    我是质谱分析的初学者,想请教个问题。在质谱分析中,用四极杆作质量分析器,用液相进样系统,若想测量质量数超过2000的标准样品,但质量数超过不是太多,选用什么物质作为标准样品比较合适?若计算分辨率的话,相邻同位素峰选取那个峰比较合适?

  • 【金秋计划】消痰散结方通过调节GnT-V介导的E-cadherin糖基化抑制胃癌转移

    [b][size=15px][color=#595959]胃癌([/color][/size][size=15px][color=#595959]GC)[/color][/size][/b][size=15px][color=#595959]是世界范围内人类最常见的癌症死亡原因之一,手术切除是早期胃癌的主要治疗方法,化疗是晚期胃癌最常用的治疗方法。胃癌的一线标准化疗方案包括5-[/color][/size][b][size=15px][color=#595959]氟尿嘧啶[/color][/size][/b][size=15px][color=#595959]和铂类药物。[/color][/size] [size=15px][color=#595959]此外,[b]曲妥珠单抗和雷莫芦单抗[/b]两种[/color][/size][b][size=15px][color=#595959]靶向治疗[/color][/size][/b][size=15px][color=#595959]药物已被批准用于临床治疗GC,然而治疗效果仍然有限。因此,迫切需要研究新的治疗GC的方法。[/color][/size] [size=15px][color=#595959]中医药在恶性[/color][/size][b][size=15px][color=#595959]肿瘤[/color][/size][/b][size=15px][color=#595959]的治疗中具有独特的特点和优势。中药复方[b]消痰散结方[/b](XTSJ)可以用于治疗GC。前期研究证实XTSJ对GC有明显的抗转移作用。然而,[/color][/size][b][size=15px][color=#595959]XTSJ抗胃[/color][/size][size=15px][color=#595959]癌转移[/color][/size][size=15px][color=#595959]特性的机制尚不清楚。该研究探讨了XTSJ介导的抑制胃癌转移的机制[/color][/size][/b][size=15px][color=#595959]。[/color][/size] [size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959]采用GC细胞系(SGC-7901,HGC-27,MKN-28,MKN-45,MGC80-3,BGC-823,MKN-7,KAO-III),构建MGAT5过表达细胞系(BGC-823-OE-MGAT5)和MGAT5低表达细胞系(MGC-803-KD-MGAT5)干扰过表达MGC80-3和BGC-823稳定转基因株。构建荷瘤裸鼠模型,将裸鼠随机分为生理盐水[NS]、XTSJ、MGAT5 + NS和MGAT5 + XTSJ 4组,每组3只。NS组和XTSJ组裸鼠分别注射2 × 106个BGC-823细胞。MGAT5 + NS组和MGAT5 + XTSJ组裸鼠分别注射2 × 106个BGC-823 + OV-MGAT5细胞。XTSJ组和MGAT5 + XTSJ组大鼠每日灌胃XTSJ 1.5 g/[kgd]。NS组和MGAT5 + NS组每天只灌胃生理盐水。维持1周以上观察肝、肺转移情况。采用RT-[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url]、Western blot、[/color][/size][b][size=15px][color=#595959]免疫[/color][/size][/b][size=15px][color=#595959]沉淀反应、透射电子等检测方法,重点研究[b]Glc-N-Ac-转移酶V[/b]的表达(GnT-V MGAT5编码)。[/color][/size] [align=center] [/align][img=,650,427]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2024/09/202409051418560122_4620_6561489_3.png!w650x427.jpg[/img] [size=15px][color=#595959]XTSJ给药后胃[/color][/size][b][size=15px][color=#595959]癌细胞[/color][/size][/b][size=15px][color=#595959]的迁移和侵袭能力明显下降,证实了XTSJ对胃癌的体外治疗作用。XTSJ增加了GC细胞间连接处[b]E-cadherin[/b]的积累,这被MGAT5过表达逆转。XTSJ给药和MGAT5敲低可减轻细胞-细胞连接结构异常,而MGAT5过表达则有相反的作用。MGAT5敲除和XTSJ处理也显著增加了E-cadherin介导的粘附连接复合物相关蛋白的积累。[/color][/size] [size=15px][color=#595959]此外,MGAT5在BGC-823-MGAT5 + XTSJ小鼠肺中的表达明显低于BGC-823-MGAT5 +溶剂小鼠,说明XTSJ治疗后体内胃肿瘤向[b]肺转移[/b]的能力降低。[/color][/size] [align=center] [/align] [b][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959]XTSJ通过抑制GnT-V介导的E-cadherin糖基化和促进E-cadherin在细胞-细胞连接处的积累来阻止胃癌转移[/color][/size][/b][size=15px][color=#595959]。后续工作将寻求鉴定XTSJ的有效成分,这可能有助于开发治疗GC的新药。[/color][/size][b][size=15px][color=#595959][/color][/size][/b]

  • 质量数校准错误

    [color=#444444] 最近岛津QP2010最近调谐不过,显示质量数校准错误,实际质量数漂移不大低质量数0.05高质量数0.1排除了离子源脏了和标准样品的问题,69峰形明显分叉,仪器有10年了,请教各位大侠原因,最好能解释一下质谱峰形成过程。[/color]

  • 质量数小数对结果的影响

    质量数小数对结果的影响

    昨天一台仪器换了色谱柱,使用SIM测试的样品在测试方法中将选择离子的小数位修正,但是做标曲的时候是载前一天的曲线,化合物列表中的质量数没有改,结果把昨天的数据放上去之后就是这样的http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2014/01/201401231626_488706_2115574_3.png根本就是一条直线,没有峰,然后把质量数改过来后就是这样的http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2014/01/201401231626_488707_2115574_3.png其实无论是定性离子还是定量离子,小数点后只差了0.2不到,但是对结果却有很大的影响,这是为什么,使用SCAN模式或SCAN+SIM模式似乎就没有这样的问题。

  • 【求助】什么是离子的主要质量数

    在了解[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/bp][color=#3333ff]气质[/color][/url]校准规范时,看到有主要离子质量数的说法,请教大家在GCMS中如何得到离子质量数?

  • 色谱柱对质量数有影响吗?

    随着现在质谱灵敏度的越来也高,很多牌子的仪器在做SIM模式的时候都会要求质量数精确到小数点后1位甚至2位。之前我们每次更换色谱柱后都会根据规矩重新全扫描一次标液,然后根据全扫描的结果,重新设定SIM中的质量数,每次更换色谱柱后,虽然变化很小,单质量数都会随之更改。理论上来说色谱柱只起到分离的作用,对于质量数是没有任何影响的,但是为什么每次换色谱柱后质量数都会改变呢?

  • 液质 质量数的理解

    各位专家和同行的朋友们好: 我是个[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Yp][color=#3333ff]液质[/color][/url]新手 对质量数的概念有一点不太清楚 按我的理解质量数差1 可以被认为是不同的离子 那质量数差0.1或者0.2和0.3的离子 他们彼此差在哪里呢 是说同种离子之间也存在着实际质量上的差异吗

  • 【转帖】发现另类DNA修复机制

    发现另类DNA修复机制 被烷基化或脱氨基的DNA碱基,在一个保护基因组完整性、但同时又会干预癌症烷基化疗法的过程中被DNA糖基化酶(修复酶)清除。迄今所研究的DNA糖基化酶采用一个被修饰的碱基插入活性点的机制。现在,最近发现的DNA糖基化酶AlkD的结构已被确定,并且也显示了一个非常不同的机制。按这种机制,被修饰的碱基从一个“螺旋外”位置伸出,这个位置只使N3- 和N7-被烷基化的碱基发生解理。DNA与AlkD的串联HEAT重复段的相互作用使DNA 骨干发生扭曲,从而使“非Watson–Crick碱基对”能够被检测到。AlkD酶在细菌、古细菌、植物和真核生物中普遍存在,这便提出了一个有趣的问题:为什么消除基因组烷基化损伤会有另一种机制?

  • 母离子质量数差异求助

    做[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Yp][color=#3333ff]LCMS[/color][/url]的MS方法优化时母离子扫描显示的质量数比标品给定和文献写明质量数都低了2左右,MS质量轴一周前矫正过,有什么可能引起这种情况出现了的??欢迎给位大佬指点

  • 质量数校准错误

    在自动调谐卡着很久以后,突然出现“质量数校准错误”的提示,按其提示对离子源进行了清洗,并检查pftba没问题,但还是出现这种问题?_??

  • 请教一个比较奇葩的问题,求硝基呋喃四个代谢物的衍生物的精确质量数。

    Hi,各路大侠,跪求AOZ、AMOZ、AHD、SEM分子式以及四个物质衍生物的精确质量数(分子式也行),感激不尽!!!硝基呋喃一般是测定代谢物(AOZ、AMOZ、AHD、SEM)的衍生物,衍生试剂为邻硝基苯甲醛(2-NBA),目前检测也都是用三重四极杆,所以只需要知道母离子和子离子即可。而我现在要用高分辨(70000分辨率)仪器去测定这些化合物,用一级精确质量数(小数点后4位)定量,可是查了很多文献也没有找到衍生后的四个代谢物的精确质量数,甚至没有查到四个代谢物的分子式和精确质量数。请问哪位大侠有啊,或者相关的文献,哪怕是有衍生过程的也行,感激不尽!!!

  • 请教一个奇葩问题,硝基呋喃类代谢物衍生后的分子式或者精确质量数

    Hi,各路大侠,跪求AOZ、AMOZ、AHD、SEM分子式以及四个物质衍生物的精确质量数(分子式也行),感激不尽!!!硝基呋喃一般是测定代谢物(AOZ、AMOZ、AHD、SEM)的衍生物,衍生试剂为邻硝基苯甲醛(2-NBA),目前检测也都是用三重四极杆,所以只需要知道母离子和子离子即可。而我现在要用高分辨(70000分辨率)仪器去测定这些化合物,用一级精确质量数(小数点后4位)定量,可是查了很多文献也没有找到衍生后的四个代谢物的精确质量数,甚至没有查到四个代谢物的分子式和精确质量数。请问哪位大侠有啊,或者相关的文献,哪怕是有衍生过程的也行,感激不尽!!!

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