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蛋白质细胞

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蛋白质细胞相关的论坛

  • 蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

    基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的蛋白质称为蛋白质组(proteome)。同理,不同细胞在不同生理或病理状态下所表达的蛋白质的种类也不尽相同。蛋白质是基因功能的实施者,因此对蛋白质结构,定位和蛋白质-蛋白质相互作用的研究将为阐明生命现象的本质提供直接的基础。生命科学是实验科学,因此生命科学的发展极大地依赖于实验技术的发展。以DNA序列分析技术为核心的基因组研究技术推动了基因组研究的日新月异,而以基因芯片技术为代表的基因表达研究技术为科学家了解基因表达规律立下汗马功劳。在蛋白质组研究中,二维电泳和质谱技术的黄金组合又为科学家掌握蛋白质表达规律再铸辉煌。蛋白质组学(proteomics)就是指研究蛋白质组的技术及这些研究得到的结果。蛋白质组学的研究试图比较细胞在不同生理或病理条件下蛋白质表达的异同,对相关蛋白质进行分类和鉴定。更重要的是蛋白质组学的研究要分析蛋白质间相互作用和蛋白质的功能。蛋白质组学的研究内容包括:1.蛋白质鉴定:可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术,利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。2.翻译后修饰:很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如磷酸化,糖基化,酶原激活等。翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式,因此对蛋白质翻译后修饰的研究对阐明蛋白质的功能具有重要作用。3.蛋白质功能确定:如分析酶活性和确定酶底物,细胞因子的生物分析/配基-受体结合分析。可以利用基因敲除和反义技术分析基因表达产物-蛋白质的功能。另外对蛋白质表达出来后在细胞内的定位研究也在一定程度上有助于蛋白质功能的了解。Clontech的荧光蛋白表达系统就是研究蛋白质在细胞内定位的一个很好的工具。4.对人类而言,蛋白质组学的研究最终要服务于人类的健康,主要指促进分子医学的发展。如寻找药物的靶分子。很多药物本身就是蛋白质,而很多药物的靶分子也是蛋白质。药物也可以干预蛋白质-蛋白质相互作用。在基础医学和疾病机理研究中,了解人不同发育、生长期和不同生理、病理条件下及不同细胞类型的基因表达的特点具有特别重要的意义。这些研究可能找到直接与特定生理或病理状态相关的分子,进一步为设计作用于特定靶分子的药物奠定基础。不同发育、生长期和不同生理、病理条件下不同的细胞类型的基因表达是不一致的,因此对蛋白质表达的研究应该精确到细胞甚至亚细胞水平。可以利用免疫组织化学技术达到这个目的,但该技术的致命缺点是通量低。LCM技术可以精确地从组织切片中取出研究者感兴趣的细胞类型,因此LCM技术实际上是一种原位技术。取出的细胞用于蛋白质样品的制备,结合抗体芯片或二维电泳-质谱的技术路线,可以对蛋白质的表达进行原位的高通量的研究。很多研究采用匀浆组织制备蛋白质样品的技术路线,其研究结论值得怀疑,因为组织匀浆后不同细胞类型的蛋白质混杂在一起,最后得到的研究数据根本无法解释蛋白质在每类细胞中的表达情况。虽然培养细胞可以得到单一类型细胞,但体外培养的细胞很难模拟体内细胞的环境,因此这样研究得出的结论也很难用于解释在体实际情况。因此在研究中首先应该将不同细胞类型分离,分离出来的不同类型细胞可以用于基因表达研究,包括mRNA和蛋白质的表达。LCM技术获得的细胞可以用于蛋白质样品的制备。可以根据需要制备总蛋白,或膜蛋白,或核蛋白等,也可以富集糖蛋白,或通过去除白蛋白来减少蛋白质类型的复杂程度。相关试剂盒均有厂商提供。蛋白质样品中的不同类型的蛋白质可以通过二维电泳进行分离。二维电泳可以将不同种类的蛋白质按照等电点和分子量差异进行高分辨率的分离。成功的二维电泳可以将2000到3000种蛋白质进行分离。电泳后对胶进行高灵敏度的染色如银染和荧光染色。如果是比较两种样品之间蛋白质表达的异同,可以在同样条件下分别制备二者的蛋白质样品,然后在同样条件下进行二维电泳,染色后比较两块胶。也可以将二者的蛋白质样品分别用不同的荧光染料标记,然后两种蛋白质样品在一块胶上进行二维电泳的分离,最后通过荧光扫描技术分析结果。胶染色后可以利用凝胶图象分析系统成像,然后通过分析软件对蛋白质点进行定量分析,并且对感兴趣的蛋白质点进行定位。通过专门的蛋白质点切割系统,可以将蛋白质点所在的胶区域进行精确切割。接着对胶中蛋白质进行酶切消化,酶切后的消化物经脱盐/浓缩处理后就可以通过点样系统将蛋白质点样到特定的材料的表面(MALDI-TOF)。最后这些蛋白质就可以在质谱系统中进行分析,从而得到蛋白质的定性数据;这些数据可以用于构建数据库或和已有的数据库进行比较分析。实际上像人类的血浆,尿液,脑脊液,乳腺,心脏,膀胱癌和磷状细胞癌及多种病原微生物的蛋白质样品的二维电泳数据库已经建立起来,研究者可以登录www.expasy.ch/www/tools.html等网站进行查询,并和自己的同类研究进行对比分析。Genomic Solution可以为研究者提供除质谱外的所有蛋白质组学研究工具,包括二维电泳系统,成像系统及分析软件,胶切割系统,蛋白质消化浓缩工作站,点样工作站等;同时还可以提供相关试剂和消耗品。LCM-二维电泳-质谱的技术路线是典型的一条蛋白质组学研究的技术路线,除此以外,LCM-抗体芯片也是一条重要的蛋白质组学研究的技术路线。即通过LCM技术获得感兴趣的细胞类型,制备细胞蛋白质样品,蛋白质经荧光染料标记后和抗体芯片杂交,从而可以比较两种样品蛋白质表达的异同。Clontech最近开发了一张抗体芯片,可以对378种膜蛋白和胞浆蛋白进行分析。该芯片同时配合了抗体芯片的全部操作过程的重要试剂,包括蛋白质制备试剂,蛋白质的荧光染料标记试剂,标记体系的纯化试剂,杂交试剂等。对于蛋白质相互作用的研究,酵母双杂交和噬菌体展示技术无疑是很好的研究方法。Clontech开发的酵母双杂交系统和NEB公司开发的噬菌体展示技术可供研究者选用。关于蛋白质组的研究,也可以将蛋白质组的部分或全部种类的蛋白质制作成蛋白质芯片,这样的蛋白质芯片可以用于蛋白质相互作用研究,蛋白表达研究和小分子蛋白结合研究。Science,Vol.293,Issue 5537,2101-2105,September 14,2001发表了一篇关于酵母蛋白质组芯片的论文。该文主要研究内容为:将酵母的5800个ORF表达成蛋白质并进行纯化点样制作芯片,然后用该芯片筛选钙调素和磷脂分子的相互作用分子。最后有必要指出的是,传统的蛋白质研究注重研究单一蛋白质,而蛋白质组学注重研究参与特定生理或病理状态的所有的蛋白质种类及其与周围环境(分子)的关系。因此蛋白质组学的研究通常是高通量的。适应这个要求,蛋白质组学相关研究工具通常都是高度自动化的系统,通量高而速度快,配合相应分析软件和数据库,研究者可以在最短的时间内处理最多的数据。

  • Nature Communications |PiSPA平台:单细胞蛋白质组分析新工具

    近日,[b]科创中心生物与分子智造研究院分子智造研究所所长方群教授团队[/b]再出新成果!团队[b]开发了“点取式”单细胞蛋白质组分析(PiSPA)工作流程和基于纳升级微流控液滴操控机器人,实现了单细胞的精准捕获、前处理以及自动进样,并首次在单个哺乳动物细胞中实现了高达3000种蛋白质的超高定量深度[/b]。目前,相关研究成果以“ Pick-up single-cell proteomic analysis for quantifying up to 3000 proteins in a Mammalian cell ”为题在国际权威期刊《自然通讯》上发表。[b]这项成果也再次向我们证明了单细胞蛋白质组学在诊疗和预防、药物开发、癌症基因组学等精准医学研究中的应用潜力。[/b][align=center][img=,700,444]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/a2bc5a12-447c-42f5-901c-d7cd2ada8821.jpg[/img][/align][align=center]团队自研的探针式微流控液滴操纵机器人系统[/align][color=#0070c0][b]更强大的单细胞蛋白质组分析工具:PiSPA工作流程[/b][/color]单细胞蛋白质组学技术是近年来生命科学领域研究的热点。因单个细胞中的蛋白质含量极微(仅约0.2 ng)且无法扩增,单细胞蛋白质组分析极具挑战性。目前传统蛋白质组分析技术仅能在每个细胞中鉴定1000种左右的蛋白质,而这在单细胞分析领域显得有些“力不从心”。此外,传统的样本前处理操作大多在微升级反应器中进行,在样品处理和转移的过程中会出现明显的样品损失,这会限制单细胞蛋白质组学的鉴定深度,难以满足生命科学研究的迫切需求。“想要突破单细胞蛋白质组学鉴定深度的障碍,有两种策略。一是在足够小的微反应器中进行样品前处理,利用微尺度效应提高反应效率;二是将所有操作整合在一起,降低样品损失,但这两种策略对技术与设备的要求都很高”,本项成果第一完成人王宇博士解释道,“我们利用微流控技术将商品化的内插管改造为阵列化的纳升级微反应器,解决了纳升级样品反应与自动进样的问题。PiSPA平台可自动完成细胞捕获、样品前处理、色谱分离、质谱检测、数据处理等操作,进一步降低了样品损失。”[align=center][img=,700,303]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/63b80008-6467-4583-b1b7-147e9680c481.jpg[/img][/align][align=center]“点取式”单细胞蛋白质组分析流程示意图[/align][b]PiSPA工作流程使得高精度的液体操控、单细胞的精确处理以及先进的LC-TIMS-QTOF MS技术融为一体,重新定义了单细胞蛋白质组学分析。[/b]“在研究中,我们将该平台应用于三种哺乳动物细胞(HeLa、A549和U2OS细胞)的单细胞蛋白质组分析,以及HeLa细胞迁移过程中的细胞异质性研究中,均实现了超高深度定量分析”,王宇博士说。同时,迁移细胞的单细胞蛋白质组分析也证实了PiSPA平台具有识别细胞迁移关键分子以及有价值靶点的应用潜力。[align=center][img=,700,394]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/b4d136ba-e078-4fc6-b59d-911f8f0abfcc.jpg[/img][/align][align=center]哺乳动物细胞的单细胞蛋白质组分析结果[/align][color=#0070c0][b]单细胞的定量深度:从3000+走向全蛋白质组测序[/b][/color]PiSPA平台集成了基于序控液滴(SODA)技术的自动化液滴操纵机器人,能够在“点取式”操作模式下实现纳升级的细胞分选、多步样品前处理和自动进样操作。相比于其他单细胞分析方法,[b]PiSPA平台的优势主要体现在与成像技术结合,能够灵活地选择任意单个细胞进行分析,目标细胞的捕获指向性强,具有很高的捕获准确性和成功率,并可保留目标细胞的表观和空间信息,显著增加了单细胞分析的信息维度[/b]。其次,PiSPA平台采用针对单细胞样品的“定制化”分析条件,实现了蛋白质鉴定深度的大幅提升,能够为生物医学研究提供更多有效的基础数据。这些优势对推动单细胞蛋白质组分析的实际推广应用具有重要意义。“目前的单细胞定量深度只是一个起点”,方群教授分享道,在该项研究中,可从单个哺乳动物细胞中可定量多达3000种蛋白质,约占人类基因编码蛋白质总数(约20,000种)的15%,其鉴定深度已经达到10年前单细胞转录组测序技术的相近水平。类比单细胞转录组测序技术的发展历史,可以预见当前已处于单细胞蛋白质组分析技术的爆发阶段,随着技术的快速革新,单细胞的定量鉴定深度还将得到史无前例的提升。“这意味着单细胞蛋白质组学技术已进入在广泛的生物医学研究领域中实际应用的阶段。”[align=center][img=,700,315]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/0ff9f496-19a8-4d58-a0de-a5d54a37ad74.jpg[/img][/align][b]团队表示,未来,他们将进一步提高单细胞蛋白质组分析的鉴定深度和通量,以持续推进该技术实用化和应用拓展的水平[/b]。此外,在上述成果基础上,目前团队还在利用iChemFoundry平台的自动化机器人技术和机器视觉技术构建能够完成单细胞蛋白质组分析全部流程操作自动化的分析平台,很快会有新的成果发布,这些都将为人们了解生命活动中细胞异质性的变化带来更有力工具。[来源:浙大杭州科创中心][align=right][/align]

  • 蛋白修饰与蛋白质鉴定

    现在,在实验研究基础上,借助多方面的生物信息学方法,可以快速高通量的预测和进行蛋白质鉴定蛋白翻译后修饰。分泌蛋白和膜相关蛋白附着于细胞膜上的或将被排泄出去的蛋白质是由细胞内质网膜上附着的核糖体合成。附着有核糖体的内质网被称为糙面型内质网。这类蛋白质都含有一个N-末端(或氨基端),我们称之为信号序列或信号肽。这个信号肽通常情况下含有13-36个主要疏水性残基,同时它含有多蛋白复合物,我们称之为信号识别粒子(SRP)。这种信号肽在通过内质网膜之后会被去除。信号肽的去除过程是在信号肽酶催化作用下完成的。含有一个信号肽的蛋白质被称为前蛋白,有别于原蛋白。然而,某些用于分泌的蛋白在分泌之后会进一步被蛋白水解,因此包含有原蛋白的序列。这类蛋白质被称为前原蛋白。蛋白水解性裂解许多蛋白质在翻译之后会经历水解性裂解过程。其中最为简单的形式是去除起始蛋氨酸。许多蛋白质合成了不活跃的前体细胞,这些细胞只能在合适的生理条件下通过限制性蛋白水解过程产生活性。在凝血过程中使用到的胰腺酶和酶类就是后者的例证。多肽去除时产生活性的不活跃的前体蛋白,我们称之为原蛋白。前原蛋白的翻译后加工过程的一个复杂的例子就是脑垂体分泌合成的前阿黑皮素原的裂解过程(有关前阿黑皮素原的讨论,见肽类激素页)。这类前原蛋白经过复杂的裂解,根据合成的前阿黑皮素原的细胞定位而不同,其路径也有所不同。另一个前原蛋白的例子就是胰岛素。由于胰岛素是由胰腺分泌的,因此它有一个前肽。随着含24个氨基酸的信号肽的裂解,这类蛋白也折叠成了胰岛素原。胰岛素原进一步分裂,产生活跃的胰岛素,它包含两个肽链,由二硫键进行连接。但仍有其他的蛋白(酶类)被合成为非活跃的前体细胞,被称为酶原。酶原在蛋白水解性裂解时会产生活性,在凝血串联蛋白质链的若干蛋白质中都会发生这种现象。甲基化作用蛋白翻译后的甲基化过程主要发生在氮原子和氧原子上。活性甲基供体是活性腺苷甲硫胺酸(SAM)。最常见的甲基化作用发生在赖氨酸残基的ε-amine上。脱氧核糖核酸组蛋白中赖氨酸残基的甲基化作用可调节核染色质结构,因此可调节其转录活性。赖氨酸原本被认为是一种常设共价标记,可提供长期信号,甚至包括转录记忆时的组蛋白依赖机制。然而,最近的临床研究表明赖氨酸甲基化作用与其他共价修饰体相似,作用时间短,并能通过反脱甲基化活动进行动态调节。最近的组学研究发现表明,赖氨酸残基的甲基化作用不仅发生在核染色质层面,而且还通过修订转录因子影响基因表达。组氨酸的咪唑环,精氨酸的胍基部分以及谷氨酸盐和天冬氨酸盐的R组酰胺(R-group amides )上,都发现了额外的氮甲基化作用。谷氨酸盐和天冬氨酸盐的R组羧化物也会发生氧甲基化作用并形成甲基酯。蛋白可能在半胱氨酸的R[

  • 【原创】蛋白质提取与纯化技术

    纤维素),当被分离的蛋白质溶液流经离子交换层析柱时,带有与离子交换剂相反电荷的蛋白质被吸附在离子交换剂上,随后用改变pH或离子强度办法将吸附的蛋白质洗脱下来。(详见层析技术章)(四)根据配体特异性的分离方法-亲和色谱法   亲和层析法(aflinity chromatography)是分离蛋白质的一种极为有效的方法,它经常只需经过一步处理即可使某种待提纯的蛋白质从很复杂的蛋白质混合物中分离出来,而且纯度很高。这种方法是根据某些蛋白质与另一种称为配体(Ligand)的分子能特异而非共价地结合。其基本原理:蛋白质在组织或细胞中是以复杂的混合物形式存在,每种类型的细胞都含有上千种不同的蛋白质,因此蛋白质的分离(Separation),提纯(Purification)和鉴定(Characterization)是生物化学中的重要的一部分,至今还没的单独或一套现成的方法能移把任何一种蛋白质从复杂的混合蛋白质中提取出来,因此往往采取几种方法联合使用。细胞的破碎1、高速组织捣碎:将材料配成稀糊状液,放置于筒内约1/3体积,盖紧筒盖,将调速器先拨至最慢处,开动开关后,逐步加速至所需速度。此法适用于动物内脏组织、植物肉质种子等。2、玻璃匀浆器匀浆:先将剪碎的组织置于管中,再套入研杆来回研磨,上下移动,即可将细胞研碎,此法细胞破碎程度比高速组织捣碎机为高,适用于量少和动物脏器组织。3、超声波处理法:用一定功率的超声波处理细胞悬液,使细胞急剧震荡破裂,此法多适用于微生物材料,用大肠杆菌制备各种酶,常选用50-100毫克菌体/毫升浓度,在1KG至10KG频率下处理10-15分钟,此法的缺点是在处理过程会产生大量的热,应采取相应降温措施。对超声波敏感和核酸应慎用。4、反复冻融法:将细胞在-20度以下冰冻,室温融解,反复几次,由于细胞内冰粒形成和剩余细胞液的盐浓度增高引起溶胀,使细胞结构破碎。5、化学处理法:有些动物细胞,例如肿瘤细胞可采用十二烷基磺酸钠(SDS

  • 蛋白质检测仪有什么作用

    云唐蛋白质检测仪是一种用于测定食品、生物样品等中蛋白质含量的仪器设备。它在食品科学、生物学、医学和生化等领域具有重要作用,以下是其主要作用:  食品质量控制: 在食品工业中,蛋白质是食品的主要组分之一,其含量影响着食品的口感、质地、营养价值等。蛋白质检测仪可以用于监测食品样品中的蛋白质含量,确保产品的质量稳定性和一致性。  生物学研究: 在生物学研究中,蛋白质是细胞功能和结构的重要组成部分。蛋白质检测仪可以帮助研究人员测定生物样品(如细胞提取物、血清等)中蛋白质含量,从而深入了解细胞的生物学特性和疾病机制。  医学诊断: 在临床医学中,某些疾病的发展可能会导致血清蛋白质含量的改变。蛋白质检测仪可以用于测定血液和尿液中的蛋白质含量,帮助医生进行疾病诊断和监测。  药物研发: 药物研发过程中,蛋白质的定量分析是评估药物效果的重要环节。蛋白质检测仪可以用于分析药物与蛋白质的相互作用,评估药物对蛋白质的影响。  生化实验: 在生化实验室中,蛋白质检测仪常用于定量测定蛋白质样品,用于分析实验数据和评估实验结果的可靠性。  环境监测: 在环境科学领域,蛋白质检测仪可以用于监测水体、土壤等环境中蛋白质的含量,从而评估环境质量。

  • 【热点】蛋白质组学研究

    人类基因组计划的顺利实施,使生命科学研究的重心正逐渐转到生物功能的整体研究。基因组学由于自身的局限性,它不能回答诸如:蛋白质的表达水平和表达时间,翻译后修饰以及蛋白质与蛋白质或与其他生物分子的相互作用等问题。作为基因研究的重要补充,蛋白质组学在蛋白质的水平上定量的、动态的、整体的研究生物体。蛋白质组(Proteome)概念是最早是由澳大利亚学者Wilkins和Williams于1994年提出的,即基因所能表达的全部蛋白质,更为清楚的表达是细胞或组织或机体在特定时间和空间上表达的所有蛋白质。具体说它是对不同时间和空间上发挥功能的特定的蛋白质组群进行研究,进而在蛋白质的水平上探索其作模式、功能机理、调节调控以及蛋白质组群内的相互作用,从而为临床诊断、病理研究、药物筛选、新药开发、新陈代谢途径研究等提供理论依据和基础。 详情请见:[url=http://www.instrument.com.cn/hot/HA_56.htm]热点应用:蛋白质组学研究[/url]

  • 【讨论】蛋白质折叠病

    蛋白质折叠病 ▲许多疾病,如阿兹海默症(Alzheimer's),疯牛病(Mad Cow, BSE),可传播性海绵状脑病(CJD),肌萎缩性脊髓侧索硬化症(ALS),还有帕金森氏症(Parkinson's)等正是由于一些细胞内的重要蛋白发生突变,导致蛋白质聚沉或错误折叠而造成的。因此,深入了解蛋白质折叠与错误折叠的关系对于这些疾病的致病机制的阐明以及治疗方法的寻找将大有帮助。 ▲基因组序列的发展使我们得到了大量的蛋白质序列,结构信息的获得对于揭示它们的生物学功能是十分重要的。依靠现有手段(X-ray晶体衍射、NMR及电镜)测定蛋白质的结构需要较长的时间,因此结构解析的步伐已落后于发现新蛋白的步伐。而结构预测的方法虽然速度较快,但可靠性并不高,只有当我们对于维持蛋白质结构,驱动蛋白质折叠的理化因素更为了解,这一方法才可能有根本的改进。另外,我们对于蛋白质相互作用、配体与蛋白质的作用等结构与功能关系的研究也有赖于蛋白质折叠机制的阐明。【蛋白质折叠与“折叠病” 】 人们对由于基因突变造成蛋白质分子中仅仅一个氨基酸残基的变化就引起疾病的情况已有所了解,即所谓“分子病”,如地中海镰刀状红血球贫血症就是因为血红蛋白分子中第六位的谷氨酸突变成了颉氨酸。现在则发现蛋白质分子的氨基酸序列没有改变,只是其结构或者说构象有所改变也能引起疾病,那就是所谓“构象病”,或称“折叠病”。 大家都知道的疯牛病,它是由一种称为Prion的蛋白质的感染引起的,这种蛋白质也可以感染人而引起神经系统疾病。在正常机体中,Prion是正常神经活动所需要的蛋白质,而致病Prion与正常Prion的一级结构完全相同,只是空间结构不同。这一疾病的研究涉及到许多生物学的基本问题。一级结构完全相同的蛋白质为什么会有不同的空间结构,这与Anfinsen原理是否矛盾?显然这里有蛋白质的能量和稳定性问题。 从来认为蛋白结构的变化来自于序列的变化,而序列的变化来自于基因的变化,生命信息从核酸传递到蛋白。而致病Prion的信息已被诺贝尔奖获得者普鲁辛纳证明不是来自基因的变化,致病蛋白Prion导致正常蛋白Prion转变为致病的折叠状态是通过蛋白分子间的作用而感染!这种相互作用的本质和机制是什么?仅仅改变了折叠状态的分子又如何导致严重的疾病?这些问题都不能用传统的概念给予满意的解释,因此在科学界引起激烈的争论,有关研究的强度和竞争性也随之大大增强。 由于蛋白质折叠异常而造成分子聚集甚至沉淀或不能正常转运到位所引起的疾病还有老年性痴呆症、囊性纤维病变、家族性高胆固醇症、家族性淀粉样蛋白症、某些肿瘤等等。由于分子伴侣在蛋白质折叠中至关重要的作用,分子伴侣本身的突变显然会引起蛋白质折叠异常而引起折叠病。随着蛋白质折叠研究的深入,人们会发现更多疾病的真正病因和更针对性的治疗方法,设计更有效的药物。现在发现有些小分子可以穿越细胞作为配体与突变蛋白结合,从而使原已失去作战能力的突变蛋白逃逸“蛋白质质量控制系统”而“带伤作战”。这种小分子被称为“药物分子伴侣”,有希望成为治疗“折叠病”的新药。 新生肽的折叠问题或蛋白质折叠问题不仅具有重大的科学意义,除了上面提到的在医学上的应用价值外,在生物工程上具有极大的应用价值。基因工程和蛋白工程已经逐渐发展成为产值以数十亿美元计的大产业,进入21世纪后,还将会有更大的发展。但是当前经常遇到的困难,是在简单的微生物细胞内引入异体DNA后所合成的多肽链往往不能正确折叠成为有生物活性的蛋白质而形成不溶解的包含体或被降解。这一“瓶颈”问题的彻底解决有待于对新生肽链折叠更多的认识。

  • 【热点】蛋白质组学研究

    人类基因组计划的顺利实施,使生命科学研究的重心正逐渐转到生物功能的整体研究。基因组学由于自身的局限性,它不能回答诸如:蛋白质的表达水平和表达时间,翻译后修饰以及蛋白质与蛋白质或与其他生物分子的相互作用等问题。作为基因研究的重要补充,蛋白质组学在蛋白质的水平上定量的、动态的、整体的研究生物体。蛋白质组(Proteome)概念是最早是由澳大利亚学者Wilkins和Williams于1994年提出的,即基因所能表达的全部蛋白质,更为清楚的表达是细胞或组织或机体在特定时间和空间上表达的所有蛋白质。具体说它是对不同时间和空间上发挥功能的特定的蛋白质组群进行研究,进而在蛋白质的水平上探索其作模式、功能机理、调节调控以及蛋白质组群内的相互作用,从而为临床诊断、病理研究、药物筛选、新药开发、新陈代谢途径研究等提供理论依据和基础。 详情请见:[url=http://www.instrument.com.cn/hot/HA_56.htm]热点应用:蛋白质组学研究[/url]

  • 蛋白质纯化及复性

    蛋白质纯化及复性 重组蛋白在大肠杆菌(E. coli)高效表达时,往往以不溶的、无活性的蛋白聚集体,即包涵体(inclusion body)的形式存在于细胞内。必须从细胞内分离出包涵体,采用高浓度变性剂(如7.0mol/L盐酸胍、8.0mol/L脲)溶解包涵体,然后除去变性剂或降低变性剂的浓度,使包涵体蛋白得以复性,最后再用色谱法使目标蛋白质得到纯化。其中包涵体蛋白的复性和纯化是整个过程中的核心。 目前重组蛋白生产中普遍存在的问题是:(1)复性效率低。传统的复性方法稀释法和透析法。稀释复性法对样品几十倍,甚至上百倍的稀释会使样品的体积急剧增大,给后续的分离纯化带来很大的困难,而且复性过程中需要较大的复性容器。透析法耗时较长,而且要多次更换透析溶液。这两种方法的共同缺点是蛋白质在复性过程中会发生聚集而产生大量沉淀,复性效率低,通常蛋白质的活性回收率只有5~20%,而且复性后的蛋白质溶液中含有大量的杂蛋白,需要进行进一步的分离纯化。(2)工艺路线烦琐,生产周期长。在传统的重组蛋白质分离纯化工艺中,大多采用经典的软凝胶分离介质,由于这种介质的颗粒较大,分离效率较差,因此常常需要采用多种不同模式的色谱操作联用对目标蛋白质进行纯化,才能得到纯度符合一定标准的目标蛋白质。另外,这种色谱介质的耐压性很差,只能在流速较低的情况下进行操作,分离纯化时间较长。分离纯化步骤多和分离时间长使得蛋白质的质量回收率和活性回收率很低。而且在传统的重组蛋白质生产工艺中,蛋白质的复性和纯化是生产过程中两个独立的单元操作,也在很大程度上制约着生产效率。(3)生产成本高,设备投资大。由于复性和分离纯化分别单独进行,而且分离纯化步骤多,每一步都需要有与之配套的设备,致使设备投资大,生产成本高。随着生产规模的增加,这种弊端会愈来愈严重。 1991年耿信笃教授首先将高效疏水相互作用色谱(HPHIC)用于变性蛋白的复性,很好的解决了上述问题,现已成功用于重组人干扰素-g(rhIFN-g)、重组人干扰素-a(rhIFN-a)、人粒细胞集落刺激因子(rhG-CSF)、重组人胰岛素原(proinsulin)、重组牛朊病毒(prion)等重组蛋白以及溶菌酶和核搪核酸酶等标准模型蛋白的复性与同时纯化中。目前,排阻色谱法、离子交换色谱法和亲合色谱法也已用于蛋白质的复性和同时纯化中。与传统的稀释法及透析法比较,用色谱法进行蛋白复性的优点是:①在进样后可很快除去变性剂;②由于色谱固定相对变性蛋白质的吸附,可明显地减少、甚至完全消除复性过程中蛋白质聚集体和沉淀的产生,从而提高蛋白质复性的质量和活性回收率;③在蛋白质复性的同时可使目标蛋白质与杂蛋白分离以达到纯化的目的,使复性和纯化同时进行;④便于回收变性剂,以降低废水处理成本。简言之,色谱法复性可以提高蛋白质的活性和质量回收率,将蛋白复性和纯化集成在一步操作完成,缩短了操作步骤和生产时间,减少了设备投资,使生产成本大大降低,已经引起了全世界范围内许多生化研究者和重组蛋白药物生产厂家的关注。由于高效液相色谱(HPLC)分离效率高,往往在一步操作中便可得到纯度符合要求的蛋白质,而且分离速度快,在应用方面具有更大的优势。

  • 蛋白质泛素化:基本概念、蛋白大小与泛素化蛋白组学的应用

    [font=宋体][font=宋体]泛素化是一种细胞内的蛋白质标记系统,蛋白质泛素化是指将小的蛋白质泛素共价地连接到其他蛋白质分子上的过程。泛素([/font][font=Calibri]ubiquitin[/font][font=宋体])是一种高度保守的蛋白质,其结构由[/font][font=Calibri]76[/font][font=宋体]个氨基酸残基组成。泛素连接到目标蛋白质上的过程,经历了泛素激活、泛素转移和靶蛋白接受三个主要步骤。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体]蛋白质泛素化具有多种特点,例如它是高度选择性的,不同蛋白质泛素化的位置和数量可以影响其功能;它是可逆的,通过去泛素化反应可以调控蛋白质的泛素化状态;它还是动态调控的,受到多种因素的调控,如细胞信号通路和环境刺激。[/font][b][font=宋体]泛素化蛋白大小:[/font][/b][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]蛋白泛素化是指将小蛋白颗粒泛素([/font][font=Calibri]Ubiquitin[/font][font=宋体])与其他蛋白质共价结合的修饰过程。 泛素化修饰通常会导致泛素共价连接在蛋白质的赖氨酸残基上形成多重泛素链。 这种蛋白质泛素化增加了蛋白质的分子量,因为每个泛素分子的质量大约为[/font][b][font=Calibri]8.5[/font][font=宋体]千达尔顿([/font][font=Calibri]kDa[/font][/b][font=宋体][b])[/b]。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体] [/font][b][font=宋体]泛素化蛋白质组学在许多领域有重要的应用,主要包括:[/font][/b][font=宋体] [/font][font=宋体]①疾病机制研究:泛素化是一种广泛存在于细胞中的蛋白质修饰方式,参与了细胞的生长、分化、修复和调控等多个生命活动。泛素化蛋白质组学的研究可以帮助我们了解泛素化修饰的生物学功能和调控机制,为疾病发生机制和治疗策略的研究提供重要线索。例如,在癌症、代谢综合征、神经退行性疾病等疾病中,则会出现异常泛素化。[/font][font=宋体]②药物研发:通过分析药物对泛素化蛋白质的影响,可以评估药物的效力和选择性,为药物研发提供指导。[/font][font=宋体]③临床诊断:泛素化蛋白质组学鉴定与定量分析技术可以揭示细胞调控的机制,通过分析泛素化蛋白质的组学数据,可以确定泛素化修饰在细胞信号转导、蛋白质降解和细胞周期调控等过程中的重要作用。此外,通过比较病态和正常样品中泛素化蛋白质的差异,可以鉴定与疾病发生发展相关的泛素化修饰靶点,并进一步理解疾病的分子机制。因此,这些技术也可用于临床诊断。[/font][font=宋体]④蛋白质降解调控:在癌症、神经退行性疾病和免疫相关疾病等病症中,蛋白质降解调控出现异常。而泛素化蛋白组在调控蛋白质降解中发挥重要作用。通过与泛素连接,目标蛋白质被送入蛋白酶体或蛋白酶体样体中进行降解。这个过程是细胞清除异常、老化或受损蛋白质的重要途径。[/font][font=宋体]⑤高通量技术应用:高通量泛素化蛋白质组学鉴定与定量分析技术的发展包括质谱鉴定和抗体鉴定两种方法。质谱鉴定技术利用质谱仪的高灵敏度和分辨率,能够鉴定泛素化修饰的蛋白质及其泛素化位点。抗体鉴定技术则通过特异性抗体的使用,可以富集和鉴定泛素化修饰的蛋白质。这些技术为全面了解泛素化在细胞中的作用机制和调控网络提供了可能。[/font][font=宋体]总的来说,泛素化蛋白质组学在多个领域都有重要的应用价值,推动了我们对生命过程的深入理解以及疾病治疗的创新发展。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体]更多详情关于[url=https://cn.sinobiological.com/resource/protein-review][b]蛋白资源[/b][/url]详情可以参看:[/font][url=https://cn.sinobiological.com/resource/protein-review][u][font=宋体][color=#0000ff][font=Calibri]https://cn.sinobiological.com/resource/protein-review[/font][/color][/font][/u][/url][b][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]义翘神州:蛋白与抗体的专业引领者,欢迎通过百度搜索[/font][font=宋体]“义翘神州”与我们取得联系。[/font][/font][/b]

  • 蛋白质组学研究的一般工具与方法【含质谱】

    蛋白质组学研究的一般工具与方法随着人类基因组计划取得巨大的成功和许多物种基因组测序的完成,仅仅靠基因组的序列来试图阐明生命现象是远远不够的,因此,研究重心已经开始从揭示生命的所有遗传信息转移到在分子整体水平对功能的研究上,生命科学已实质性地跨入了后基因组时代。   尽管现在已经有多个物种的基因组被测序,但这些基因组中通常有一半以上基因的功能是未知的。目前功能基因组研究中所采用的策略,如微阵列法(microarray)(Wodicka et al., 1997)、基因芯片(gene chips)(Ramsay et al., 1998)、基因表达序列分析(SAGE)(Velculescu et al., 1995)等,都是从细胞中mRNA的角度来考虑的。但事实上,从DNA、mRNA到蛋白质存在三个层次的调控,mRNA自身也存在着贮存、转运和降解等问题,从mRNA角度考虑,实际上仅包括了转录水平调控,并不能全面代表蛋白质表达水平。实验也证明,组织中mRNA丰度与蛋白质丰度的相关性并不好,尤其对于低丰度蛋白质来说,相关性更差。蛋白质复杂的翻译后修饰,蛋白质的亚细胞定位或迁移,蛋白质-蛋白质相互作用则几乎无法从mRNA水平来判断(曾嵘,夏其昌,2002)。新生肽链合成后存在多种加工、修饰过程,蛋白质间也存在类似于mRNA分子内的剪切、拼接,研究证明基本元件“intein”广泛存在于蛋白质中(Perler et al., 1997)。基因与其编码产物蛋白的线性对应关系只存在于新生肽链而不是最终的功能蛋白质中。   蛋白质是生理功能的执行者和生命现象的直接体现者,对蛋白质结构和功能的研究将直接阐明生命在生理或病理条件下的变化机制;蛋白质本身的存在形式和活动规律,如翻译后修饰、蛋白质间相互作用及蛋白质构象等问题,仍依赖于直接对蛋白质的研究来解决。因此要对生命的复杂活动有全面和深入的认识,必然要在整体、动态、网络的水平上对蛋白质进行研究(钱小红,贺福初,2003)。      蛋白质组学研究中常用的技术体系   方法学上,二维凝胶电泳-质谱仍然是目前最流行和可靠的技术平台(Rabilloud et al., 2000)。其一般过程是:细胞或组织样品——样品制备——二维凝胶电泳(2D-PAGE)分离蛋白质——计算机辅助分析2D-PAGE图象——对感兴趣的蛋白质进行酶解——质谱分析——数据库检索——蛋白质鉴定——分析蛋白质在细胞与组织中的表达情况。   2-D PAGE   样品制备   2D-PAGE 的操作流程基本上实现了程序化。但是,样品制备是一个非常关键与复杂的过程。成功的2D-PAGE取决于对样品中蛋白质有效的抽提和它的溶解性。与核酸不同,目前没有一种通用的方法适用于所有的蛋白质,来源不同的蛋白质都受到自身蛋白质制备方法的挑战。   正确的样品制备方法从收集样品开始时就要防止样品的裂解和被蛋白水解酶降解(Rabilloud et al., 2000)。要尽可能溶解更多的蛋白,并且在2D-PAGE过程中保持它的溶解性,阻止蛋白质的人为修饰。在样品制备过程中,各个实验室也通过实验建立了更为可行的方法。目前通过建立分步提取方法可以有效地提取出更多的蛋白质(兰彦等,2001)。另一种对蛋白质采用预分离的方法称为“多间隔电解法(multi-compartment-electrolyser)”,采用这种方法后,分辨率和胶的质量均明显改善(Herbert et al., 2000)。   但是,由于生物样品的多样性和复杂性,目前所采用的样品制备方法具有局限性。其它物质对蛋白质样品制备存在干扰。核酸通过与蛋白质结合,增加样品黏度而干扰等点聚焦(IEF)分离的效果。当然,通过实验探索,采取一些措施可以减轻它的干扰。例如,在样品制备过程中加入非特异性的核酸酶或RNase与DNase的混合物,在等电聚焦时将每个胶条的电流限制在50mA以内通常可以消除其影响。脂类物质的影响可以通过利用有机溶剂的方法将其去除,但是这常常会导致蛋白质的不可逆沉淀。除了蛋白质的降解之外,糖基化是蛋白质的最重要的人工修饰,样品中的尿素在这一过程中起着非常重要的作用。样品中的尿素在降解的过程中会形成能够与蛋白质的氨基反应的氰酸盐,这种结果会导致蛋白质带有更多的正电荷。所以,在2D-PAGE中要用新鲜的尿素溶液,在等电聚焦过程中要控制温度不能太高(Beranova-Giorgianni, 2003)。但是,目前还没有一种简单有效的方法来去除样品中的多糖。   样品分离和分析   样品制备完成后运用IEF和SDS-PAGE电泳对它进行分离,常采用银染和考马斯亮兰染色即可观察到具有许多蛋白质斑点的凝胶图像。等电聚焦电泳与SDS-PAGE的具体操作步骤已经实现了程序化,均有详细操作流程参考,但是由于样品的不同,不同样品的具体条件还需要试验探索。第二相SDS-PAGE运行结束,染色完毕后,利用计算机软件对凝胶图像进行分析,如PD-QUEST软件,LIPS,HERMES,GEMINI等,对凝胶图像上的蛋白质斑点进行匹配,对图像进行数字化处理等分析(贾宇峰等,2001),对感兴趣的蛋白质采用质谱分析。   低丰度蛋白质的检测   低丰度蛋白在蛋白质组学研究中常常是人们非常感兴趣的,因为细胞或组织中的一些生物活性物质,如细胞分泌的一些活性物质,受体等表达量都非常低。按照一般电泳的上样量,这些小分子是根本看不到的,但如果单纯地增加上样量,细胞或组织中的大量表达的蛋白就会将其覆盖,而且上样量过大也会影响电泳结果。所以对这些低丰度的样品可以进行富集,富集的方法可以通过层析,如亲和层析,离子交换层析等方法,还可以通过利用样品等电点性质等方法将pH范围相近的蛋白质富集(Santoni et al., 2000; Beranova-Giorgianni, 2003)。

  • 【原创大赛】分子伴侣与蛋白质折叠

    【原创大赛】分子伴侣与蛋白质折叠

    摘要:本文介绍了分子伴侣的基本概念,以及分子伴侣的几种主要类型;简要说明了蛋白质折叠的概念及特点;在此基础上,进一步阐述了分子伴侣的功能,并以GroEL和GroES为例简述了分子伴侣在蛋白质折叠过程中的作用机理。最后介绍了分子伴侣概念的延伸,及其研究意义和展望。关键词:分子伴侣 蛋白质折叠 折叠病 20世纪60年代,人们就发现了由于组成蛋白质的氨基酸错误可以导致分子病,后来人们发现,即使一级结构正常,蛋白质的二级结构乃至立体结构异常也可导致疾病,即蛋白质折叠病,如疯牛病、老年性痴呆、囊性纤维性炎等。蛋白质折叠病的发现激励人们去寻找蛋白质折叠的分子机理,近年来研究中发现,分子伴侣在在蛋白质折叠中起重要作用。1分子伴侣简介1.1分子伴侣的基本概念分子伴侣(Molecular Chaperone),也有人翻译为“分子伴娘”。1978年,Laskey等首先用“分子伴侣”描述核质素(nucleoplasmin)在核小体组装过程中的作用。1987年,Ellis将凡能促进蛋白质折叠和组装的蛋白质统称为分子伴侣。随后,Ellis等又提出了分子伴侣的基本概念:在蛋白质折叠和组装过程中,分子伴侣防止多肽链内或链间因疏水键等相互作用表面瞬间暴露而形成错误结构,并且还可以破坏已经形成的错误结构。分子伴侣本身不是折叠或组装产物的一部分。1.2分子伴侣的几个例子Nucleoplasmins:体内的一系列过程,如DNA复制,RNA转录与剪接,核小体或核糖体的装配,都涉及到带正电的蛋白质与带负电的核酸之间较强的离子键的相互作用。实验发现,这些过程都与Nucleoplasmin相类似的蛋白质的参与。Charperonin(Cpn):是指在细菌、线粒体、质体中发现的一类序列同源的Charperonins,该家族具有独特的双层7-9元环状结构的寡聚蛋白(Hemminngwen;cheng 1998),它们的作用是促进体内正常条件以及应急反应下的蛋白质折叠,这一过程需要ATP提供能量。Cpns包括细菌的GroEL、叶绿体的Rubisco亚基结合蛋白(RuSBP)与线粒体的热休克蛋白Hsp60。Stress-70家族:该家族首先在热休克反应中发现,并研究多年,近些年来,发现Stress-70也在蛋白质的折叠与装配过程中起作用,因而受到广泛关注。参与这些作用的Stress-70的成员有:E. coli的DnaK、酵母细胞质的Ssa1p和Ssa2p、内质网的Kar2p和线粒体的Ssc1p。哺乳动物细胞质的Hsp70蛋白和Prp73多肽识别蛋白、内质网的Bip。这些蛋白可被细胞内未折叠蛋白质的增多而诱导并识别靶分子,在其他热休克蛋白或细胞因子的参与下,水解ATP调节蛋白的构象或折叠状态。Stress-90家族:分子量在90ku左右,包括大肠杆菌胞

  • 购买蛋白质样品

    我用安捷伦6520分析蛋白质样品,现在急需购买胰岛素和细胞色素C,哪位大侠知道哪里可以买到么?

  • 【转帖】蛋白质组学的标准化

    【转帖】蛋白质组学的标准化

    由于人类基因序列的建立已经接近完成,人们认识到生物科学届的下一项任务将是表征基因组的产物——其中绝大部分是蛋白质。作为正在兴起的研究领域,蛋白质组学将其研究目标定位于:鉴定和测量在一个细胞或组织中的所有蛋白质,这样做的预期是,将能发现那些能够成为疾病生物标志物(biomarker)或药物靶标的候选蛋白质。经证明,这是一项令人望而生畏的工作,难度之一在于,25,000个基因中的每一个都会产生拼接、翻译后修饰,最后表达的蛋白质数量将会大大增加。另一个增加难度的因素是蛋白质的浓度范围太广——通常为许多个数量级——并且很可能大多数人们感兴趣的都是那些低丰度的蛋白。  目前,已有大量的技术和实验方法用于解决蛋白质组学的问题。其中应用最广泛的是“自下而上”的方法。用蛋白质水解酶(典型的为胰蛋白酶)将细胞提取液或溶胞产物中的所有蛋白质酶解,接着用反相液相色谱(LC)分离,然后在线引入电喷雾源的质谱。一种参考的液相色谱-串联质谱([url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Yp][color=#3333ff]LC-MS[/color][/url]-MS)流程通常为:多肽离子在母离子扫描中被分离,其中几个最强的离子将被自动碎裂,将母离子质量和子离子/碎片质量都输入搜索引擎,和数据库中的蛋白按照多肽和碎片质量去匹配,匹配的结果将生成记录、即完成了蛋白质的鉴定。获得一个、几个或所有蛋白质的定量信息,可以有几种做法:比如通过谱图计数和峰强度测量的非标记方法(Label free) 通过引入稳定同位素标记标签 或用重同位素标记蛋白中的一个或几个肽(“蛋白典型多肽”) [1]对于复杂样品,如人体液或胞溶产物,潜在需要分析的蛋白质数量将非常庞大。在一个特定状态下一个细胞典型地会表达几千种蛋白质,每个蛋白质将产生多达几十个多肽,而每一个多肽在质谱中又以多种带电状态存在。因此,单个蛋白质组学样本就包含500, 000多种类别或者更多。为了减少分析问题的复杂性,通常在进行[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Yp][color=#3333ff]LC-MS[/color][/url]分析前利用一维或二维凝胶电泳[2]、溶液中的等电聚焦[3]或多维高效液相色谱(HPLC)[4]技术,将样本预分离成多馏分(prefractionation)。[img]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2009/12/200912311320_193276_1615922_3.jpg[/img]

  • 国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心(上海)(筹)公开招聘机械电气工程师

    国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心(上海)(筹)公开招聘机械电气工程师国家蛋白质科学研究上海设施是国家重大科技基础设施,是国家级蛋白质科学研究平台;在设施建设基础上,依托中国科学院上海生命科学研究院,委托生物化学与细胞生物学研究所(简称SIBCB)负责筹建成立并管理国家蛋白质科学中心(上海)(筹), 负责设施的运行管理。中心在筹建期间,办公地点设于生化与细胞所(上海市岳阳路320号);中心在建成运行期间,办公地点设于浦东新区张江高科技园区中区西部(上海市海科路333号)。中心定位于:支撑国家蛋白质上海设施建设的建设,衔接该设施的运行;聚集培养生命科学与生物技术特别 是蛋白质研究的人才,提升国家蛋白质研究能力;进而促进我国蛋白质基础研究的飞跃发展。中心将立足于国家生命科学与生物技术及相关研究领域雄厚的研究基础和创新实力,成为兼具蛋白质科学研究、技术及成果的转化、集成和应用平台的国家级的重要科学研究单元。国家蛋白质科学中心(上海)(筹)现因工作扩展的需要,公开招聘机械电气工程师两名。一、岗位职责:参与蛋白质科学研究中心(上海)(筹)在上海同步辐射光源5线6站的建设;参与5线6站建成后的运行和管理工作,辅助线站管理人员完成线站上机械设备,真空系统以及水,电,气等设备的巡查和维护;参与5线6站相关的科学研究工作。二、任职条件:1、具有机械或电气专业本科以上学历。2、爱好机械设计,动手能力强。具有大型机、电设备安装、维修工作经验者优先;3、有一定的机械制图或电子电路设计经验,至少熟悉autocad,protel或power pcb软件中的一种,能读懂相关的设计图纸。4、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。5、有同步辐射线站相关工作经验者优先。6、身体健康,能长期稳定工作。 三、招聘方式及程序 1、应聘材料:(1)《[color

  • 国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心(上海)(筹)公开招聘自动化控制系统工程师

    国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心(上海)(筹)公开招聘自动化控制系统工程师国家蛋白质科学研究上海设施是国家重大科技基础设施,是国家级蛋白质科学研究平台;在设施建设基础上,依托中国科学院上海生命科学研究院,委托生物化学与细胞生物学研究所(简称SIBCB)负责筹建成立并管理国家蛋白质科学中心(上海)(筹), 负责设施的运行管理。中心在筹建期间,办公地点设于生化与细胞所(上海市岳阳路320号);中心在建成运行期间,办公地点设于浦东新区张江高科技园区中区西部(上海市海科路333号)。中心定位于:支撑国家蛋白质上海设施建设的建设,衔接该设施的运行;聚集培养生命科学与生物技术特别 是蛋白质研究的人才,提升国家蛋白质研究能力;进而促进我国蛋白质基础研究的飞跃发展。中心将立足于国家生命科学与生物技术及相关研究领域雄厚的研究基础和创新实力,成为兼具蛋白质科学研究、技术及成果的转化、集成和应用平台的国家级的重要科学研究单元。国家蛋白质科学中心(上海)(筹)现因工作扩展的需要,公开招聘自动化控制系统工程师一名。一、岗位职责:参与国家蛋白质科学中心(上海)(筹)在上海同步辐射光源5线6站的建设、运行和管理,充分理解同步辐射光束线站的工作内容和线站用户的实际需求,完成线站自动化控制程序的设计、开发和维护。二、任职条件:1、本科以上学历,有丰富的 Unix/Linux 平台下的工作经验,熟悉 Unix/Linux 工作环境,习惯于在 Unix/Linux 平台下工作。有大量的源代码的阅读经验。2、有丰富的 C/C++ 开发经验。熟悉 Socket 编程和多线程编程。3、良好的英文表达能力。能独立完成项目调研,设计和开发工作。4、有以下背景或经验者优先考虑:有大型系统开发经验者和硬件开发经验者;有软件界面开发经验者;有网络程序开发经验者;熟悉 Tcl/Tk 语言者;有 Unix/Linux 系统管理经验者。5、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。6、身体健康,能长期稳定工作。 三、招聘方式及程序 1、应聘材料:([back=whi

  • 蛋白质分离纯化的详细步骤

    [font=宋体]蛋白质的分离纯化是生物科学领域中的一项关键技术,它涉及到从复杂的混合物中分离并纯化出特定的蛋白质。这个过程通常包括多个步骤,每个步骤都需要精确的操作和优化,以确保最终得到的蛋白质具有高纯度和活性。下面我们将详细介绍蛋白质的分离纯化步骤。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][b]分离纯化某一特定蛋白质的一般程序可以分为前处理、粗分离、精细分离三个步骤。[/b][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][b]①前处理[/b][/font][font=宋体] [/font][font=宋体]分离纯化某种蛋白质,首先要把蛋白质从原来的组织或细胞中以溶解的状态释放出来并保持原来的天然状态,不丢失生物活性。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体]为此,动物材料应先剔除结缔组织和脂肪组织,种子材料应先去壳甚至去种皮以免受单宁等物质的污染,油料种子最好先用低沸点的有机溶剂如乙醚等脱脂。然后根据不同的情况,选择适当的方法,将组织和细胞破碎。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体]动物组织和细胞可用电动捣碎机或匀浆机破碎或用超声波处理破碎。植物组织和细胞一般需要用石英砂或玻璃粉和适当的提取液一起研磨的方法或用纤维素酶处理也能达到目的。细菌细胞的破碎比较麻烦,破碎细菌细胞壁的常用方法有超声波破碎,与砂研磨、高压挤压或溶菌酶处理等。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体]组织和细胞破碎后,选择适当的缓冲液把所要的蛋白提取出来。细胞碎片等不溶物用离心或过滤的方法除去。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体]如果所要的蛋白主要集中在某一细胞组分,如细胞核、染色体、核糖体或可溶性细胞质等,则可利用差速离心的方法将它们分开,收集该细胞组分作为下步纯化的材料。如果碰上所要蛋白是与细胞膜或膜质细胞器结合的,则必须利用超声波或去污剂使膜结构解聚,然后用适当介质提取。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][b]②粗分离[/b][/font][font=宋体] [/font][font=宋体]当蛋白质提取液(有时还杂有核酸、多糖之类)获得后,选用一套适当的方法,将所要的蛋白与其他杂蛋白分离开来。一般这一步的分离用超滤、盐析、等电点沉淀和有机溶剂分级分离等方法。这些方法的特点是简便、处理量大,既能除去大量杂质,又能浓缩蛋白溶液。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][b]③精细分离[/b][/font][font=宋体] [/font][font=宋体]样品经粗分级分离以后,一般体积较小,杂蛋白大部分已被除去。进一步纯化,一般使用层析法包括离子交换层析、亲和层析、疏水层析以及分子筛等。必要时还可选择电泳法,包括区带电泳、等电点聚焦等作为最后的纯化步骤。用于细分级分离的方法一般规模较小,但分辨率很高。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体]结晶是[url=https://cn.sinobiological.com/resource/protein-review/protein-purification][b]蛋白质分离纯化[/b][/url]的最后步骤。尽管结晶过程并不能保证蛋白一定是均一的,但是只有某种蛋白在溶液中数量上占有优势时才能形成结晶。结晶过程本身也伴随着一定程度的纯化,而重结晶又可除去少量夹杂的蛋白。由于结晶过程中从未发现过变性蛋白,因此蛋白的结晶不仅是纯度的一个标志,也是断定制品处于天然状态的有力指标。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]义翘神州提供[url=https://cn.sinobiological.com/services/recombinant-protein-expression-service][b]重组蛋白表达服务[/b][/url][/font][font=宋体],可以根据客户需求,选用不同表达[/font][font=Calibri]/[/font][font=宋体]纯化标签、表达宿主等,真正为客户实现深度私人定制。[/font][/font][font=宋体][font=宋体]蛋白纯化详情:[/font][font=Calibri]https://cn.sinobiological.com/resource/protein-review/protein-purification[/font][/font]

  • 【金秋计划】常见的蛋白质修饰总结

    [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333](1)磷酸化修饰。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333]蛋白质磷酸化是由蛋白激酶催化的磷酸基转移反应,是最常见、最重要的蛋白质修饰方式之一。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333]蛋白质磷酸化修饰的具体生物效应包括:改变被修饰蛋白质的活性、改变蛋白的亚细胞内定位、改变蛋白与其他蛋白或其他生物分子的相互作用。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333]①催化蛋白质磷酸化的蛋白激酶,根据底物的磷酸化位点可分为三大类,蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶、蛋白质酪氨酸激酶、双专一性蛋白激酶。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333]②催化蛋白质去磷酸化的蛋白磷酸酶,根据磷酸化的氨基酸残基不同可分为两类,蛋白质丝氨酸/苏氨酸磷酸酶和蛋白质酪氨酸磷酸酶。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333](2)甲基化修饰。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333]蛋白质甲基化是指在甲基转移酶催化下,甲基基团由S-腺苷甲硫氨酸转移至相应蛋白质的过程。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333]蛋白质甲基化修饰可产生多种不同的生物效应,包括影响蛋白质间的相互作用、蛋白质和RNA间的相互作用、蛋白质的定位、RNA加工、细胞信号转导等。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333]催化蛋白质甲基化的酶:甲基转移酶。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333](3)乙酰化修饰。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333]蛋白质乙酰化是指在乙酰基转移酶的催化下,在蛋白质特定的位置添加乙酰基的过程。蛋白质乙酰化修饰所产生的生物效应,主要包括促进基因转录、诱导细胞自噬、调节代谢酶的活性及代谢通路。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333]催化蛋白质乙酰化的酶:组蛋白乙酰基转移酶。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333](4)类泛素化修饰。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333]小泛素相关修饰物(SUMO)是类泛素蛋白家族的重要成员之一,可与多种蛋白结合发挥相应的功能。SUMO化修饰可参与转录调节、核转运、维持基因组完整性及信号转导等多种细胞内活动。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333]①SUMO的分类:SUMO蛋白分布广泛,人类基因组编码了4种不同SUMO蛋白,分别为:SUMO1、SUMO2、SUMO3和SUMO4。其中,SUMO1-3在各种组织中均有表达,而SUMO4则主要在肾脏、淋巴结和脾脏中表达。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333]②催化蛋白质SUMO化修饰的酶。SUMO化修饰需要一系列酶的参与,包括E1活化酶,E2结合酶以及E3连接酶。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333](5)巴豆酰化修饰。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333]作为一种新型组蛋白翻译后修饰方式,蛋白质巴豆酰化是一种进化上高度保守,且在细胞生物学功能上完全不同于组蛋白赖氨酸乙酰化的蛋白质修饰方式。[/color][/size][/font] [font=system-ui, -apple-system, &][size=16px][color=#333333]蛋白质巴豆酰化是指在巴豆酰基转移酶的催化下,在蛋白质特定的位置添加巴豆酰基的过程。组蛋白赖氨酸巴豆酰化修饰与基因的活化密切相关。此外,催化蛋白质巴豆酰化的酶是巴豆酰基转移酶。[/color][/size][/font]

  • 蛋白质相互作用组学分析技术

    为探究生物进程的分子机制,需要确定介导这个过程的蛋白质-蛋白质间的相互作用。研究蛋白质间相互作用的主要技术总结如下:一、酵母双杂交系统酵母双杂交系统是当前广泛用于蛋白质相互作用组学研究的一种重要方法。其原理是当靶蛋白和诱饵蛋白特异结合后,诱饵蛋白结合于报道基因的启动子,启动报道基因在酵母细胞内的表达,如果检测到报道基因的表达产物,则说明两者之间有相互作用,反之则两者之间没有相互作用。将这种技术微量化、阵列化后则可用于大规模蛋白质之间相互作用的研究。在实际工作中,人们根据需要发展了单杂交系统、三杂交系统和反向杂交系统等。Angermayr等设计了一个SOS蛋白介导的双杂交系统。可以研究膜蛋白的功能,丰富了酵母双杂交系统的功能。此外,酵母双杂交系统的作用也已扩展至对蛋白质的鉴定。二、噬茵体展示技术在编码噬菌体外壳蛋白基因上连接一单克隆抗体的DNA序列,当噬菌体生长时,表面就表达出相应的单抗,再将噬菌体过柱,柱上若含目的蛋白,就会与相应抗体特异性结合,这被称为噬菌体展示技术。此技术也主要用于研究蛋白质之间的相互作用,不仅有高通量及简便的特点,还具有直接得到基因、高选择性的筛选复杂混合物、在筛选过程中通过适当改变条件可以直接评价相互结合的特异性等优点。目前,用优化的噬菌体展示技术,已经展示了人和鼠的两种特殊细胞系的cDNA文库,并分离出了人上皮生长因子信号传导途径中的信号分子。三、等离子共振技术表面等离子共振技术(SurfacePlasmonResonance,SPR)已成为蛋白质相互作用研究中的新手段。它的原理是利用一种纳米级的薄膜吸附上“诱饵蛋白”,当待测蛋白与诱饵蛋白结合后,薄膜的共振性质会发生改变,通过检测便可知这两种蛋白的结合情况。SPR技术的优点是不需标记物或染料,反应过程可实时监控。测定快速且安全,还可用于检测蛋白一核酸及其它生物大分子之间的相互作用。四、荧光能量转移技术荧光共振能量转移(FRET)广泛用于研究分子间的距离及其相互作用;与荧光显微镜结合,可定量获取有关生物活体内蛋白质、脂类、DNA和RNA的时空信息。随着绿色荧光蛋白(GFP)的发展,FRET荧光显微镜有可能实时测量活体细胞内分子的动态性质。提出了一种定量测量FRET效率以及供体与受体间距离的简单方法,仅需使用一组滤光片和测量一个比值,利用供体和受体的发射谱消除光谱间的串扰。该方法简单快速,可实时定量测量FRET的效率和供体与受体间的距离,尤其适用于基于GFP的供体受体对。五、抗体与蛋白质阵列技术蛋白芯片技术的出现给蛋白质组学研究带来新的思路。蛋白质组学研究中一个主要的内容就是研究在不同生理状态下蛋白水平的量变,微型化,集成化,高通量化的抗体芯片就是一个非常好的研究工具,他也是芯片中发展最快的芯片,而且在技术上已经日益成熟。这些抗体芯片有的已经在向临床应用上发展,比如肿瘤标志物抗体芯片等,还有很多已经应用再眼就的各个领域里。六、免疫共沉淀技术免疫共沉淀主要是用来研究蛋白质与蛋白质相互作用的一种技术,其基本原理是,在细胞裂解液中加入抗兴趣蛋白的抗体,孵育后再加入与抗体特异结合的结合于Pansobin珠上的金黄色葡萄球菌蛋白A(SPA),若细胞中有正与兴趣蛋白结合的目的蛋白,就可以形成这样一种复合物:“目的蛋白—兴趣蛋白—抗兴趣蛋白抗体—SPA\|Pansobin”,因为SPA\|Pansobin比较大,这样复合物在离心时就被分离出来。经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,复合物四组分又被分开。然后经Westernblotting法,用抗体检测目的蛋白是什么,是否为预测蛋白。这种方法得到的目的蛋白是在细胞内天然与兴趣蛋白结合的,符合体内实际情况,得到的蛋白可信度高。但这种方法有两个缺陷:一是两种蛋白质的结合可能不是直接结合,而可能有第三者在中间起桥梁作用;二是必须在实验前预测目的蛋白是什么,以选择最后检测的抗体,所以,若预测不正确,实验就得不到结果,方法本身具有冒险性。七、pull-down技术蛋白质相互作用的类型有牢固型相互作用和暂时型相互作用两种。牢固型相互作用以多亚基蛋白复合体常见,最好通过免疫共沉淀(Co-IP)、Pull-down技术或Far-western法研究。Pull-down技术用固相化的、已标记的饵蛋白或标签蛋白(生物素-、PolyHis-或GST-),从细胞裂解液中钓出与之相互作用的蛋白。通过Pull-down技术可以确定已知的蛋白与钓出蛋白或已纯化的相关蛋白间的相互作用关系,从体外传路或翻译体系中检测出蛋白相互作用关系。

  • 最广泛应用的蛋白质定量技术:4重和8重iTRAQ试剂

    一次可以同时标记4组/8组样品,4次/8次实验变成一次实验,大大提高了通量一个蛋白质有多个肽段被鉴定,提高了定量的准确性可以进行多个时间点蛋白质组动态变化的监测可以分析详细分期/型的临床疾病样本,并可设计样本重复甚至可以进行个体样本的研究细胞周期、细胞信号传导整个过程的蛋白质组动态学二级图谱质量更好,产生很好的y、b离子系列,蛋白序列覆盖率提高,鉴定结果更可靠操作简便,不需要更多的额外操作

  • 【转帖】蛋白质提取与纯化技术

    [size=3]选择材料及预处理   以蛋白质和结构与功能为基础,从分子水平上认识生命现象,已经成为现代生物学发展的主要方向,研究蛋白质,首先要得到高度纯化并具有生物活性的目的物质。蛋白质的制备工作涉及物理、化学和生物等各方面知识,但基本原理不外乎两方面。一是得用混合物中几个组分分配率的差别,把它们分配到可用机械方法分离的两个或几个物相中,如盐析,有机溶剂提取,层析和结晶等;二是将混合物置于单一物相中,通过物理力场的作用使各组分分配于来同区域而达到分离目的,如电泳,超速离心,超滤等。在所有这些方法的应用中必须注意保存生物大分子的完整性,防止酸、硷、高温,剧烈机械作用而导致所提物质生物活性的丧失。蛋白质的制备一般分为以下四个阶段:选择材料和预处理,细胞的破碎及细胞器的分离,提取和纯化,浓细、干燥和保存。   微生物、植物和动物都可做为制备蛋白质的原材料,所选用的材料主要依据实验目的来确定。对于微生物,应注意它的生长期,在微生物的对数生长期,酶和核酸的含量较高,可以获得高产量,以微生物为材料时有两种情况:(1)得用微生物菌体分泌到培养基中的代谢产物和胞外酶等;(2)利用菌体含有的生化物质,如蛋白质、核酸和胞内酶等。植物材料必须经过去壳,脱脂并注意植物品种和生长发育状况不同,其中所含生物大分子的量变化很大,另外与季节性关系密切。对动物组织,必须选择有效成份含量丰富的脏器组织为原材料,先进行绞碎、脱脂等处理。另外,对预处理好的材料,若不立即进行实验,应冷冻保存,对于易分解的生物大分子应选用新鲜材料制备。 蛋白质的分离纯化 一,蛋白质(包括酶)的提取   大部分蛋白质都可溶于水、稀盐、稀酸或碱溶液,少数与脂类结合的蛋白质则溶于乙醇、丙酮、丁醇等有机溶剂中,因些,可采用不同溶剂提取分离和纯化蛋白质及酶。 (一)水溶液提取法   稀盐和缓冲系统的水溶液对蛋白质稳定性好、溶解度大、是提取蛋白质最常用的溶剂,通常用量是原材料体积的1-5倍,提取时需要均匀的搅拌,以利于蛋白质的溶解。提取的温度要视有效成份性质而定。一方面,多数蛋白质的溶解度随着温度的升高而增大,因此,温度高利于溶解,缩短提取时间。但另一方面,温度升高会使蛋白质变性失活,因此,基于这一点考虑提取蛋白质和酶时一般采用低温(5度以下)操作。为了避免蛋白质提以过程中的降解,可加入蛋白水解酶抑制剂(如二异丙基氟磷酸,碘乙酸等)。下面着重讨论提取液的pH值和盐浓度的选择。[/size]

  • 【转帖】质谱与蛋白质组学

    质谱与蛋白质组学蛋白质组学对一个细胞或组织所表达的蛋白质进行的系统分析,而质谱是它的关键性分析工具。在过去的两年中,标准蛋白质组技术中的进展增进了更高水平自动化和敏感性的蛋白质识别技术。另外,新的技术促成了鉴定蛋白质功能相关特性的里程碑性的进展,包括它们的定量和在蛋白质复合物中复杂情况。缩写2DE two-dimensional gel electrophoresis双向凝胶电泳CID collision-induced dissociation碰撞诱导的解离ESI electrospray ionization电喷雾离子化FT-ICR Fourier-transform ion cyclotron resonance傅里叶-变换离子回旋加速器共振ICAT isotope-coded affinity tagsIEF isoelectric focusing等电聚焦MALDI matrix-assisted laser desorption ionization基质辅助的激光解析离子化Q-TOF quadrupole-TOFRP reversed phase反向TOF time-of-flight飞行时间简介蛋白质组学的核心组成是系统识别一个细胞或组织中表达的每一个蛋白质,以及确定每个蛋白质的突出特征(比如,丰度、修饰状态以及在多蛋白质复合体中的复杂状态)。这些分析的技术包括分离蛋白质和肽的分离科学、识别和定量分析物的分析科学和数据管理和分析的生物信息学。它的初步工具包括使用IEF(等电点聚焦)/SDS-PAGE凝胶的高分辨率的双向凝胶电泳(2DE),结合质谱和数据库搜索来分离、识别和定量在一个复合样本中存在的个体蛋白质,最终识别被分离的蛋白质。一个常用的方法用在Fig1中用图解说明。此技术以及由此而来的变化(综述见[1])已经被用来识别和分类在复杂样本中存在的大量蛋白质,并在蛋白质组数据库中呈现它们,该过程我们这里称之为"描述蛋白质组学"比如,Shevchenko等[2]从2D凝胶上系统地鉴定了150个蛋白质。数目庞大的这样的数据库现在可以找到。同样的技术现在已经被作为普遍的发现工具来动态检测一个细胞或组织对外来或内部干扰反应而在蛋白质组中的改变。因为检测动态改变需要精确定量每个被检测成分,我们使用"定量蛋白质组学"来定义。在此报告中,我们总结了自1999年1月至2000年4月来报道的与蛋白质组学和质谱相关的最重要的进展。在核心质谱技术中的进展已经导致2DE为基础的蛋白质组学技术的进一步改进。它们同时又促进了传统凝胶为基础的方法的替代方法,诸如引入以同位素稀释理论为基础的精确蛋白质定量技术和蛋白质复合物的系统分析。蛋白质组分析的MS技术进展在此部分,我们总结了在MS设备、它们的控制和操作中的进展,以及比较质谱数据和序列数据库识别蛋白质所用的搜索工具的进展。随着新型质谱仪的引入,蛋白质组学研究现存类型的质谱仪性能已经显著改进了。在此综述期间最普遍使用的仪器是可以分为两类:单一阶段的质谱仪和串联质谱为基础的系统。单一阶段的质谱仪,最显著的是基质辅助的激光解吸电离(MALDI)飞行时间(TOF)仪器,被用于无数通过肽质谱图谱技术大规模蛋白质识别的项目中。此方法在鉴别表达自小一些的和完全测序的基因组的蛋白质特别成功[3,4]。串联质谱仪器诸如triple quadrpole、离子捕获(ion-trap)和近来引进的混合quadrupole飞行时间(Q-TOF)被常规应用于[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Yp][color=#3333ff]LC-MS[/color][/url]/MS或用电喷雾电离(ESI)来生成肽片段离子谱,以便通过搜寻序列数据库进行蛋白质鉴定。使用仪器控制程序来自动选择肽离子进行碰撞诱导的解离(CID)(数据依赖CID)的不断增多是这些MS/MS仪器的一个明显的趋势。一些新的构造的具有高潜能的质谱仪被引入到蛋白质组学研究中产生深刻影响。两个研究组近来一个MALDI离子源和一个混合Q-TOF耦联了起来[5,6]。Q-TOF提供的质量准确性和敏感性提升了数据库搜寻结果并同时使它成为MS/MS从头测序的当然仪器选择。MALDI Q-TOF构造提供了激动人心的机会进行自动化和高通量应用以及在一个样品盘上存档样品进行日后研究的可能。Medzihradszky等[7]描述了一个不同的混合仪器称之为MALDI TOF TOF。此设备享有许多MALDI Q-TOF的优点,另外能够进行高能量CID和非常快速的扫描速率。傅里叶-变换离子回旋加速器共振(FT-ICR)质谱对于蛋白质组学来说相对陌生。这些设备具有非常高的敏感性和分辨率,质量精确性可以达到1ppm。这些特征被用来在一次分析中测量和定量几百种蛋白质的完整的分子质量[8]。Goodlett等[9]表明FT-MS测量的一个肽的准确质量以及可以容易获得的限制因素能够通过序列数据库搜索被用来识别蛋白质。蛋白质组学如果没有软件工具来进行质谱数据和序列数据库的关联将变得几无可能。现存的数据库搜索程序已经变得越来越成熟和可以(从网络)可获得。另外,引入了新的算法。主要相关程序是Sequest[10],MASCOT[11],PeptedeSearch[12],PROWL[13]和Protein Prospector[14]。在它们中间,Sequest使用CID谱设置了蛋白质识别的实验室标准(benchmark),因为它与边界MS/MS数据工作得最好,并高度可信,可以从整个[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Yp][color=#3333ff]LC-MS[/color][/url]/MS实验中自动分析数据,并不需要任何使用者的破译工作。在所提的程序中,然而,只有Sequest不能在网络上搜索。MASCOT是一个新的、快速、网络可进入和多功能的程序,具有进行肽指纹分析、用部分破译或未破译的CID谱进行数据库搜索的功能。

  • 【转帖】细胞间存传递致癌蛋白“木马”

    据美国物理学家组织网报道,北卡罗莱纳大学科学家的一项最新发现显示,细胞感染人类疱疹病毒(EBV)后,会产生小泡或被称为外体的液囊,从而改变细胞中所含的蛋白质和RNA(核糖核酸)。这种变质的外体一旦进入健康细胞,就能转变细胞的良性生长方式,使之变成不可控的致癌生长。这一发现刊登于美国《国家科学院院刊》网络版。EBV可能是世界上最成功的病毒,它无法被免疫系统彻底清除,几乎每个人终生都被它感染。它们不断进入唾液,在这里进行有效地传播。感染这种病毒很少致病,然而在几种主要的癌症中都发现了它的踪迹,包括淋巴瘤和鼻咽癌,它的蛋白质劫持了细胞生长调控机制,引发不可控的细胞生长,从而导致癌变。研究认为一种名为潜伏膜蛋白质1的蛋白质是EBV的致癌基因。通过外体,它们被传递给未受感染的细胞。研究人员还指出,EBV也彻底改变了外体的内含物,在细胞之间传递能激活癌症的蛋白质,这是值得注意的地方。这些发现表明,通过这种方式,病毒感染细胞能广泛影响并潜在控制全身其他细胞,引发它们的不可测生长。免疫系统不断地监视着外来病毒蛋白质,然而经外体携带的这些蛋白质可以不向免疫系统“报告”感染,并刺激癌细胞生长,由此容许了一种不可测的生长。该研究还显示,细胞能产生血管,这一被称为血管新生的过程很容易接受变质外体并引发潜在生长。北卡罗莱纳大学莱恩伯格综合癌症研究中心微生物与免疫学教授南希·瑞玻-特拉玻说:“外体就像特洛伊木马,EBV通过木马甚至能控制那些还没有感染的细胞。但重要的是,外体的产生可能为我们提供了一种新的治疗标靶,封锁它们就能控制癌症蔓延。”论文第一作者、瑞玻-特拉玻实验室博士后戴维·麦克表示,下一步研究是测定哪些蛋白质被选中进入外体,病毒如何控制了这些蛋白质,以及怎样才能遏制这一过程。

  • 无细胞蛋白表达:优势及应用详解

    [font=宋体][font=宋体]无细胞蛋白表达是一种体外重组蛋白质表达技术也称为无细胞蛋白质合成技术([/font][font=Calibri]CFPS[/font][font=宋体]:[/font][font=Calibri]Cell-free protein synthesis[/font][font=宋体]),是指用含有蛋白合成必需的组分(核糖体,转运[/font][font=Calibri]RNA[/font][font=宋体],氨酰合成酶,启动[/font][font=Calibri]/[/font][font=宋体]延伸[/font][font=Calibri]/[/font][font=宋体]终止因子,三磷酸鸟苷,[/font][font=Calibri]ATP[/font][font=宋体],[/font][font=Calibri]Mg2+[/font][font=宋体]和[/font][font=Calibri]K+[/font][font=宋体])的细胞裂解物在体外进行蛋白合成。无细胞蛋白表达技术适用于制备各种类型的蛋白质,包括难表达蛋白质、毒性蛋白质、复杂蛋白质等。在药物研究、生物制造和生命科学等领域中得到广泛关注和应用,无论是研究、开发还是商业化应用过程。目前无细胞蛋白表达主要应用于药物研发领域,例如抗体制备和生物药物生产等。随着人工智能技术的不断发展,无细胞蛋白表达技术可以与人工智能算法结合,构建计算机辅助的高通量生产系统,实现个性化、精准的生物医学治疗。除此之外,还能够应用于其他领域,例如基因工程、环境保护和农业生产等。随着无细胞蛋白表达技术的不断发展和人工智能技术的不断进步,我们可以看到更多的新领域和新应用出现,给生物科技行业带来更多的机遇和挑战。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体] [/font][b][font=宋体]相较于传统的活细胞蛋白表达技术,无细胞蛋白表达技术具有以下几个显著的优势:[/font][/b][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]1. [/font][font=宋体]更高的蛋白质表达量:传统的活细胞蛋白表达技术受限于细胞本身的多方面因素,其表达的蛋白质数量往往受到限制。而无细胞蛋白表达技术通过在体外底物浓度高的环境中进行合成反应,不但避免了传统活细胞表达所面临的方方面面的限制,还能够很好地控制反应体系,从而获得表达量更高的蛋白质。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]2. [/font][font=宋体]更快的表达速度:传统活细胞蛋白表达需要细胞生长并达到最佳密度才能进行蛋白质表达,这个过程往往需要数天时间。而无细胞蛋白表达技术通常只需要数小时就能够完成蛋白质的表达,这个速度明显快于传统活细胞表达技术。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]3. [/font][font=宋体]更精准的蛋白质合成:无细胞蛋白表达技术在体外进行蛋白质合成,能够精确控制底物浓度、反应温度、反应剂比例等参数,因此可以更加精准地合成定制的蛋白质,这对于研究和应用来讲具有重要意义。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]4. [/font][font=宋体]更灵活控制:在无细胞蛋白表达技术中,可以使用分离的组分体系进行蛋白质的合成,可以控制底物和反应剂的比例,也可以在适当的反应条件下进行自定义的修饰,如蛋白质标记、药效分析等。这些优点使得无细胞蛋白表达技术更加灵活、可控,适用于更广泛的应用领域。[/font][/font][font=宋体] [/font][b][font=宋体] [/font][font=宋体]无细胞蛋白表达应用[/font][/b][font=宋体] [/font][font=宋体]无细胞蛋白表达技术是一种飞速发展的新型生物技术,具有广阔的应用前景和潜力。该技术可以快速、高效、经济地合成蛋白质,可广泛应用于医疗、制药、农业、生物材料等多个领域。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]1. [/font][font=宋体]医疗领域:无细胞蛋白表达技术在医疗领域应用广泛,可以用于生产多种蛋白质药品,如单克隆抗体等。其中,单克隆抗体是一种重要的治疗药物,具有高度特异性和亲和力,可用于肿瘤、心血管疾病、自身免疫性疾病等疾病的治疗。传统单克隆抗体生产方法需要花费大量时间和成本,而无细胞蛋白表达技术则可以在短时间内大规模合成单克隆抗体,从而大大缩短生产周期,并且可以降低成本。此外,无细胞蛋白表达技术也可以用于疫苗研发。比如疟疾疫苗研究开发昂贵又耗时,目前利用[/font][font=Calibri]WGE[/font][font=宋体]系统可加速疫苗研发,并建立高通量疟原虫抗体筛查系统。[/font][font=Calibri]Stark[/font][font=宋体]等利用大肠杆菌的便携式冻干裂解物再水化,[/font][font=Calibri]1h[/font][font=宋体]内合成高致病性病原体土拉弗朗西斯菌亚种的生物偶联疫苗,与工程菌生产的疫苗相比,其可引发更高水平的病原体特异性抗体。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]2. [/font][font=宋体]制药领域:是无细胞蛋白表达技术的一个重要应用领域。药物开发的成功率取决于药物分子对目标蛋白的亲和力,而目标蛋白对于专一的细胞表达系统和分类的组织或器官非常敏感。通过无细胞蛋白表达技术,研究人员可以在不依赖于细胞的情况下直接生产大量需要的蛋白质,为药物研发提供了更快更便捷的方法。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]3. [/font][font=宋体]基础研究领域:利用无细胞蛋白质合成系统可以直接对表达产物进行核磁共振分析,目前已确定了数千个蛋白质的结构。可以通过合成蛋白质建立蛋白质阵列,解开基因产物的功能;应用核糖体展示和 [/font][font=Calibri]mRNA [/font][font=宋体]展示技术,更有利于实现高通量筛选,全面深入研究基因特征和功能。通过无细胞蛋白表达技术可以实现对大型蛋白质的生产和分析,同时也为基础研究打开了新的研究领域。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]目前义翘神州无细胞合成服务正在活动中,活动时间[/font][font=Calibri]2023[/font][font=宋体]年[/font][font=Calibri]10[/font][font=宋体]月[/font][font=Calibri]23[/font][font=宋体]日[/font][font=Calibri]-12[/font][font=宋体]月[/font][font=Calibri]31[/font][font=宋体]日。有需求的可以咨询或者进入义翘神州网进行查看。更多详情可以关注[/font][font=Calibri]https://cn.sinobiological.com/services/cell-free-protein-synthesis-service[/font][/font]

  • 国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)诚聘生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、流式细胞分选等岗位工作人员

    国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员等岗位招聘启事国家蛋白质科学研究上海设施是国家重大科技基础设施,是国家级蛋白质科学研究平台;在设施建设基础上,依托中国科学院上海生命科学研究院,委托生物化学与细胞生物学研究所(简称SIBCB)负责筹建成立并管理国家蛋白质科学中心•上海(筹), 负责设施的运行管理。中心位于浦东新区张江高科技园区中区西部(上海市浦东新区海科路333号),临近上海科技大学、中国科学院药物研究所、上海高等研究院等科研机构。中心定位于:支撑国家蛋白质上海设施建设的建设,衔接该设施的运行;聚集培养生命科学与生物技术特别是蛋白质研究的人才,提升国家蛋白质研究能力;进而促进我国蛋白质基础研究的飞跃发展。中心将立足于国家生命科学与生物技术及相关研究领域雄厚的研究基础 和创新实力,成为兼具蛋白质科学研究、技术及成果的转化、集成和应用平台的国家级的重要科学研究单元。国家蛋白质科学中心•上海(筹)现因工作需要,公开招聘生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、自动化控制工程师、软件工程师、流式细胞分选技术员等岗位。一、岗位详情:岗位一: 生物大分子晶体学线站工作人员 4名。(一) 岗位职责:参与蛋白质科学研究中心•上海(筹)在上海同步辐射光源参与生物大分子晶体学线站的运行、维护和管理工作,参与线站的用户服务和技术支持工作;参与5线6站相关的科学研究工作。(二) 任职条件:1、物理、光学、光学工程、结构生物学等专业背景,硕士或以上学历。2、具备基本的生物大分子晶体结构衍射数据收集和数据处理的基本知识;有同步辐射光源生物大分子晶体学线站衍射数据收集经验,束线设计和建造经验者,以及同步辐射线站其他相关工作经验者优先。3、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。4、身体健康,能长期稳定工作。岗位二:自动化控制系统工程师 1名(一) 岗位职责:参与国家蛋白质科学中心(上海)(筹)在上海同步辐射光源5线6站的建设、运行和管理,充分理解同步辐射光束线站的工作内容和线站用户的实际需求,完成线站自动化控制程序的设计、开发和维护。(二) 任职条件:1、本科以上学历,有 Unix/Linux 平台下的工作经验,熟悉Unix/Linux 工作环境,习惯于在 Unix/Linux 平台下工作。有大量的源代码的阅读经验。2、有丰富的 C/C++ 开发经验.熟悉 Socket 编程和多线程编程。3、良好的英文表达能力。能独立完成项目调研,设计和开发工作。4、有以下背景或经验者优先考虑:有大型系统开发经验者和硬件开发经验者;有软件界面开发经验者;有网络程序开发经验者;熟悉 Tcl/Tk 语言者;有 Unix/Linux 系统管理经验者。5、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。6、身体健康,能长期稳定工作。岗位三:冷冻电镜系统管理员 A 1名(一) 岗位职责:负责电镜负染及冷冻样品制样,样品检测、用户服务。参与中心电镜(包括200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1. 具有生物、医学或物理等相关专业的本科或以上学位,有电镜操作或生物电镜样品制样经验者优先考虑;2.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;3.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力、服务精神和团队协作精神;4. 具有良好的中英文口头表达和写作能力;5. 身体健康,能长期稳定工作。岗位四:冷冻电镜系统管理员 B 1名(一) 岗位职责:负责用户项目的合作及服务研究。可以独立应用TITAN Krios及TF20电镜,进行cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析,或可独立开展高压冷冻、超薄切片服务等。参与中心电镜(包括300 kV TITAN Krios,200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1.应聘者有3年或以上冷冻透射电镜使用经验,具有独立完成cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析的能力和经验;或者可以独立开展高压冷冻、超薄切片服务等;2. 具有生物物理学或相关专业的硕士或以上学位,有SCI第一作者论文;具有良好的中英文口头表达和写作能力;3.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;4.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力和团队协作精神;5. 身体健康,能长期稳定工作。 岗位五: 软件工程师 1名(一) 工作职责:1、 编写或依据设计说明书,落实代码的实现工作,确保系统设计的合理性、可扩充性和代码编写的规范性。2、 对接受的开发任务进行评估,细化分配任务,制定软件开发阶段的具体技术实施计划。解决项目中的关键问题和技术难题。3、 根据要求协助进行需求分析及确认工作。执行单元测试、集成测试及回归测试,查出并解决软件在存的缺陷并保证其质量可靠。4、 进行项目相关技术文档的编写工作。5、 辅助保障项目的质量监控和进度管理。6、 完成上级交办的其他工作。(二) 任职条件:1、 计算机相关专业,本科以上学历。2、 熟练掌握Java语言,掌握SQL语言和数据库应用开发。3、 熟练使用JavaScript、Ajax、Jquery客户端脚本技术,有高通量数据开发经历者优先,有Android及IOS开发经验者优先。4、 善于分析项目要求,对系统框架设计有独立解决方案;能独立进行需求需求分析、设计及代码编写工作,具有较强的逻辑思维能力,问题缺陷分析处理能力。5、 责任心、事业心强,能承受工作压力,具备良好的沟通协调能力,良好的合作意识和团队协作精神,愿意分担其它工程项目职责。岗位六: 流式细胞分选技术员 1名(一) 岗位职责:1. 主要负责荧光激发细胞分选仪的操作、管理服务及样品制备;2. 负责流式细胞仪的操作,用户培训和技术支持;3. 负责普通荧光显微镜的操作、管理服务及技术支持,保证设备正常运行及日常维护;4. 参与并协调系统公共行政事务(如预算、采购、预约系统等),与中心相关职能部门对接;收集整合系统宣传信息,与中心宣传对接。(二) 任职条件:1. 生物学相关专业,硕士或以上学历;2. 掌握流式细胞分选技术,有流式、显微镜理论及操作基础,能熟练操作显微镜相关的中小型仪器;3. 具有良好的独立工作能力、创新工作精神;工作积极主动,具有团结奉献精神,乐于学习和接受新事物;4. 为人诚实

  • 国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、流式细胞分选工作人员等岗位招聘

    国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、流式细胞分选工作人员等岗位招聘启事国家蛋白质科学研究上海设施是国家重大科技基础设施,是国家级蛋白质科学研究平台;在设施建设基础上,依托中国科学院上海生命科学研究院,委托生物化学与细胞生物学研究所(简称SIBCB)负责筹建成立并管理国家蛋白质科学中心•上海(筹), 负责设施的运行管理。中心位于浦东新区张江高科技园区中区西部(上海市浦东新区海科路333号),临近上海科技大学、中国科学院药物研究所、上海高等研究院等科研机构。中心定位于:支撑国家蛋白质上海设施建设的建设,衔接该设施的运行;聚集培养生命科学与生物技术特别是蛋白质研究的人才,提升国家蛋白质研究能力;进而促进我国蛋白质基础研究的飞跃发展。中心将立足于国家生命科学与生物技术及相关研究领域雄厚的研究基础 和创新实力,成为兼具蛋白质科学研究、技术及成果的转化、集成和应用平台的国家级的重要科学研究单元。国家蛋白质科学中心•上海(筹)现因工作需要,公开招聘生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、自动化控制工程师、软件工程师、流式细胞分选技术员等岗位。一、岗位详情:岗位一: 生物大分子晶体学线站工作人员 4名。(一) 岗位职责:参与蛋白质科学研究中心•上海(筹)在上海同步辐射光源参与生物大分子晶体学线站的运行、维护和管理工作,参与线站的用户服务和技术支持工作;参与5线6站相关的科学研究工作。(二) 任职条件:1、物理、光学、光学工程、结构生物学等专业背景,硕士或以上学历。2、具备基本的生物大分子晶体结构衍射数据收集和数据处理的基本知识;有同步辐射光源生物大分子晶体学线站衍射数据收集经验,束线设计和建造经验者,以及同步辐射线站其他相关工作经验者优先。3、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。4、身体健康,能长期稳定工作。岗位二:自动化控制系统工程师 1名(一) 岗位职责:参与国家蛋白质科学中心(上海)(筹)在上海同步辐射光源5线6站的建设、运行和管理,充分理解同步辐射光束线站的工作内容和线站用户的实际需求,完成线站自动化控制程序的设计、开发和维护。(二) 任职条件:1、本科以上学历,有 Unix/Linux 平台下的工作经验,熟悉Unix/Linux 工作环境,习惯于在 Unix/Linux 平台下工作。有大量的源代码的阅读经验。2、有丰富的 C/C++ 开发经验.熟悉 Socket 编程和多线程编程。3、良好的英文表达能力。能独立完成项目调研,设计和开发工作。4、有以下背景或经验者优先考虑:有大型系统开发经验者和硬件开发经验者;有软件界面开发经验者;有网络程序开发经验者;熟悉 Tcl/Tk 语言者;有 Unix/Linux 系统管理经验者。5、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。6、身体健康,能长期稳定工作。岗位三:冷冻电镜系统管理员 A 1名(一) 岗位职责:负责电镜负染及冷冻样品制样,样品检测、用户服务。参与中心电镜(包括200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1. 具有生物、医学或物理等相关专业的本科或以上学位,有电镜操作或生物电镜样品制样经验者优先考虑;2.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;3.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力、服务精神和团队协作精神;4. 具有良好的中英文口头表达和写作能力;5. 身体健康,能长期稳定工作。岗位四:冷冻电镜系统管理员 B 1名(一) 岗位职责:负责用户项目的合作及服务研究。可以独立应用TITAN Krios及TF20电镜,进行cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析,或可独立开展高压冷冻、超薄切片服务等。参与中心电镜(包括300 kV TITAN Krios,200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1.应聘者有3年或以上冷冻透射电镜使用经验,具有独立完成cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析的能力和经验;或者可以独立开展高压冷冻、超薄切片服务等;2. 具有生物物理学或相关专业的硕士或以上学位,有SCI第一作者论文;具有良好的中英文口头表达和写作能力;3.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;4.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力和团队协作精神;5. 身体健康,能长期稳定工作。 岗位五: 软件工程师 1名(一) 工作职责:1、 编写或依据设计说明书,落实代码的实现工作,确保系统设计的合理性、可扩充性和代码编写的规范性。2、 对接受的开发任务进行评估,细化分配任务,制定软件开发阶段的具体技术实施计划。解决项目中的关键问题和技术难题。3、 根据要求协助进行需求分析及确认工作。执行单元测试、集成测试及回归测试,查出并解决软件在存的缺陷并保证其质量可靠。4、 进行项目相关技术文档的编写工作。5、 辅助保障项目的质量监控和进度管理。6、 完成上级交办的其他工作。(二) 任职条件:1、 计算机相关专业,本科以上学历。2、 熟练掌握Java语言,掌握SQL语言和数据库应用开发。3、 熟练使用JavaScript、Ajax、Jquery客户端脚本技术,有高通量数据开发经历者优先,有Android及IOS开发经验者优先。4、 善于分析项目要求,对系统框架设计有独立解决方案;能独立进行需求需求分析、设计及代码编写工作,具有较强的逻辑思维能力,问题缺陷分析处理能力。5、 责任心、事业心强,能承受工作压力,具备良好的沟通协调能力,良好的合作意识和团队协作精神,愿意分担其它工程项目职责。岗位六: 流式细胞分选技术员 1名(一) 岗位职责:1. 主要负责荧光激发细胞分选仪的操作、管理服务及样品制备;2. 负责流式细胞仪的操作,用户培训和技术支持;3. 负责普通荧光显微镜的操作、管理服务及技术支持,保证设备正常运行及日常维护;4. 参与并协调系统公共行政事务(如预算、采购、预约系统等),与中心相关职能部门对接;收集整合系统宣传信息,与中心宣传对接。(二) 任职条件:1. 生物学相关专业,硕士或以上学历;2. 掌握流式细胞分选技术,有流式、显微镜理论及操作基础,能熟练操作显微镜相关的中小型仪器;3. 具有良好的独立工作能力、创新工作精神;工作积极主动,具有团结奉献精神,乐于学习和接受新事物;4. 为人诚实,工作认真踏实、积极主动,责任心强,善于团队合作;5. 良好的英文文献阅读和理解能力;6. 身体健康,能长期稳定工作。二、薪酬福利:我

  • ESI源安捷伦6520Q-TOF分析蛋白质

    最近,用6520Q-TOF分析细胞色素C,牛血清蛋白。样品从计量院取得。每次进样得出的峰都不是想要的,最大m/z才800多,明显不是蛋白质的质谱峰。而且细胞色素C和牛血清蛋白测出来的m/z居然差不多(最困惑的现象)。自己思考:样品保存问题、实验条件问题因为第一次接触质谱分析蛋白质,很困惑。望各位大侠指导一番。

  • 国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)诚聘生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、流式细胞分选等岗位工作人员

    国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员等岗位招聘启事国家蛋白质科学研究上海设施是国家重大科技基础设施,是国家级蛋白质科学研究平台;在设施建设基础上,依托中国科学院上海生命科学研究院,委托生物化学与细胞生物学研究所(简称SIBCB)负责筹建成立并管理国家蛋白质科学中心•上海(筹), 负责设施的运行管理。中心位于浦东新区张江高科技园区中区西部(上海市浦东新区海科路333号),临近上海科技大学、中国科学院药物研究所、上海高等研究院等科研机构。中心定位于:支撑国家蛋白质上海设施建设的建设,衔接该设施的运行;聚集培养生命科学与生物技术特别是蛋白质研究的人才,提升国家蛋白质研究能力;进而促进我国蛋白质基础研究的飞跃发展。中心将立足于国家生命科学与生物技术及相关研究领域雄厚的研究基础 和创新实力,成为兼具蛋白质科学研究、技术及成果的转化、集成和应用平台的国家级的重要科学研究单元。国家蛋白质科学中心•上海(筹)现因工作需要,公开招聘生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、自动化控制工程师、软件工程师、流式细胞分选技术员等岗位。一、岗位详情:岗位一: 生物大分子晶体学线站工作人员 4名。(一) 岗位职责:参与蛋白质科学研究中心•上海(筹)在上海同步辐射光源参与生物大分子晶体学线站的运行、维护和管理工作,参与线站的用户服务和技术支持工作;参与5线6站相关的科学研究工作。(二) 任职条件:1、物理、光学、光学工程、结构生物学等专业背景,硕士或以上学历。2、具备基本的生物大分子晶体结构衍射数据收集和数据处理的基本知识;有同步辐射光源生物大分子晶体学线站衍射数据收集经验,束线设计和建造经验者,以及同步辐射线站其他相关工作经验者优先。3、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。4、身体健康,能长期稳定工作。岗位二:自动化控制系统工程师 1名(一) 岗位职责:参与国家蛋白质科学中心(上海)(筹)在上海同步辐射光源5线6站的建设、运行和管理,充分理解同步辐射光束线站的工作内容和线站用户的实际需求,完成线站自动化控制程序的设计、开发和维护。(二) 任职条件:1、本科以上学历,有 Unix/Linux 平台下的工作经验,熟悉Unix/Linux 工作环境,习惯于在 Unix/Linux 平台下工作。有大量的源代码的阅读经验。2、有丰富的 C/C++ 开发经验.熟悉 Socket 编程和多线程编程。3、良好的英文表达能力。能独立完成项目调研,设计和开发工作。4、有以下背景或经验者优先考虑:有大型系统开发经验者和硬件开发经验者;有软件界面开发经验者;有网络程序开发经验者;熟悉 Tcl/Tk 语言者;有 Unix/Linux 系统管理经验者。5、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。6、身体健康,能长期稳定工作。岗位三:冷冻电镜系统管理员 A 1名(一) 岗位职责:负责电镜负染及冷冻样品制样,样品检测、用户服务。参与中心电镜(包括200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1. 具有生物、医学或物理等相关专业的本科或以上学位,有电镜操作或生物电镜样品制样经验者优先考虑;2.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;3.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力、服务精神和团队协作精神;4. 具有良好的中英文口头表达和写作能力;5. 身体健康,能长期稳定工作。岗位四:冷冻电镜系统管理员 B 1名(一) 岗位职责:负责用户项目的合作及服务研究。可以独立应用TITAN Krios及TF20电镜,进行cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析,或可独立开展高压冷冻、超薄切片服务等。参与中心电镜(包括300 kV TITAN Krios,200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1.应聘者有3年或以上冷冻透射电镜使用经验,具有独立完成cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析的能力和经验;或者可以独立开展高压冷冻、超薄切片服务等;2. 具有生物物理学或相关专业的硕士或以上学位,有SCI第一作者论文;具有良好的中英文口头表达和写作能力;3.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;4.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力和团队协作精神;5. 身体健康,能长期稳定工作。 岗位五: 软件工程师 1名(一) 工作职责:1、 编写或依据设计说明书,落实代码的实现工作,确保系统设计的合理性、可扩充性和代码编写的规范性。2、 对接受的开发任务进行评估,细化分配任务,制定软件开发阶段的具体技术实施计划。解决项目中的关键问题和技术难题。3、 根据要求协助进行需求分析及确认工作。执行单元测试、集成测试及回归测试,查出并解决软件在存的缺陷并保证其质量可靠。4、 进行项目相关技术文档的编写工作。5、 辅助保障项目的质量监控和进度管理。6、 完成上级交办的其他工作。(二) 任职条件:1、 计算机相关专业,本科以上学历。2、 熟练掌握Java语言,掌握SQL语言和数据库应用开发。3、 熟练使用JavaScript、Ajax、Jquery客户端脚本技术,有高通量数据开发经历者优先,有Android及IOS开发经验者优先。4、 善于分析项目要求,对系统框架设计有独立解决方案;能独立进行需求需求分析、设计及代码编写工作,具有较强的逻辑思维能力,问题缺陷分析处理能力。5、 责任心、事业心强,能承受工作压力,具备良好的沟通协调能力,良好的合作意识和团队协作精神,愿意分担其它工程项目职责。岗位六: 流式细胞分选技术员 1名(一) 岗位职责:1. 主要负责荧光激发细胞分选仪的操作、管理服务及样品制备;2. 负责流式细胞仪的操作,用户培训和技术支持;3. 负责普通荧光显微镜的操作、管理服务及技术支持,保证设备正常运行及日常维护;4. 参与并协调系统公共行政事务(如预算、采购、预约系统等),与中心相关职能部门对接;收集整合系统宣传信息,与中心宣传对接。(二) 任职条件:1. 生物学相关专业,硕士或以上学历;2. 掌握流式细胞分选技术,有流式、显微镜理论及操作基础,能熟练操作显微镜相关的中小型仪器;3. 具有良好的独立工作能力、创新工作精神;工作积极主动,具有团结奉献精神,乐于学习和接受新事物;4. 为人诚实,工作认真踏实、积极主动,责任心强,善于团队合作;5. 良好的英文文献阅读和理解能力;6. 身体健康,能长期稳定工作。二、薪酬福利:我单位将为入职员工提供有

  • 【“仪”起享奥运】生物质谱技术用于中药治疗的蛋白质组学研究

    [font=Arial, 'Microsoft Yahei'][size=16px] 蛋白质组学是近年医药和生命科学领域研究的热点之一。蛋白质组学的含义是一个基因组、一种生物或一种细胞/组织所表达的全套蛋白。蛋白质组学的核心在于大规模地对蛋白质进行综合分析,通过对某种物种、个体、器官、组织或细胞的全部蛋白质性质(包括表达水平、结构、翻译后修饰、细胞内定位、蛋白质相互作用等)的研究,对蛋白质所执行的生理性、病理性生命活动做出最精细、最准确、最本质的阐述。 中药治疗的蛋白质组学研究的基本研究思路是,首先造模,确定造模成功后提取总蛋白质,2-DE 电泳技术分离总蛋白建立蛋白质组图谱,用图像分析软件寻找模型组、对照组及中药治疗组各组间差异蛋白点,MALDI-TOF/MS 分析差异蛋白点,并结合蛋白质生物信息库,初步鉴定差异蛋白质。在此方面国内学者进行了一些探索,有学者研究了单体人参皂苷对人肺巨细胞癌高转移细胞株蛋白质组的表达的影响,还有报道研究松果菊苷对小鼠帕金森病模型黑质纹状体组织蛋白表达的影响,再如研究中药复方强骨宝1号对去卵巢骨质疏松大鼠皮质骨蛋白质组表达的影响等。以上研究结果找到一些差异蛋白,为中药作用机制的研究提供了依据。[/size] [/font]

  • 国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)诚聘生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、流式细胞分选等工作人员

    国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员等岗位招聘启事国家蛋白质科学研究上海设施是国家重大科技基础设施,是国家级蛋白质科学研究平台;在设施建设基础上,依托中国科学院上海生命科学研究院,委托生物化学与细胞生物学研究所(简称SIBCB)负责筹建成立并管理国家蛋白质科学中心•上海(筹), 负责设施的运行管理。中心位于浦东新区张江高科技园区中区西部(上海市浦东新区海科路333号),临近上海科技大学、中国科学院药物研究所、上海高等研究院等科研机构。中心定位于:支撑国家蛋白质上海设施建设的建设,衔接该设施的运行;聚集培养生命科学与生物技术特别是蛋白质研究的人才,提升国家蛋白质研究能力;进而促进我国蛋白质基础研究的飞跃发展。中心将立足于国家生命科学与生物技术及相关研究领域雄厚的研究基础 和创新实力,成为兼具蛋白质科学研究、技术及成果的转化、集成和应用平台的国家级的重要科学研究单元。国家蛋白质科学中心•上海(筹)现因工作需要,公开招聘生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、自动化控制工程师、软件工程师、流式细胞分选技术员等岗位。一、岗位详情:岗位一: 生物大分子晶体学线站工作人员 4名。(一) 岗位职责:参与蛋白质科学研究中心•上海(筹)在上海同步辐射光源参与生物大分子晶体学线站的运行、维护和管理工作,参与线站的用户服务和技术支持工作;参与5线6站相关的科学研究工作。(二) 任职条件:1、物理、光学、光学工程、结构生物学等专业背景,硕士或以上学历。2、具备基本的生物大分子晶体结构衍射数据收集和数据处理的基本知识;有同步辐射光源生物大分子晶体学线站衍射数据收集经验,束线设计和建造经验者,以及同步辐射线站其他相关工作经验者优先。3、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。4、身体健康,能长期稳定工作。岗位二:自动化控制系统工程师 1名(一) 岗位职责:参与国家蛋白质科学中心(上海)(筹)在上海同步辐射光源5线6站的建设、运行和管理,充分理解同步辐射光束线站的工作内容和线站用户的实际需求,完成线站自动化控制程序的设计、开发和维护。(二) 任职条件:1、本科以上学历,有 Unix/Linux 平台下的工作经验,熟悉Unix/Linux 工作环境,习惯于在 Unix/Linux 平台下工作。有大量的源代码的阅读经验。2、有丰富的 C/C++ 开发经验.熟悉 Socket 编程和多线程编程。3、良好的英文表达能力。能独立完成项目调研,设计和开发工作。4、有以下背景或经验者优先考虑:有大型系统开发经验者和硬件开发经验者;有软件界面开发经验者;有网络程序开发经验者;熟悉 Tcl/Tk 语言者;有 Unix/Linux 系统管理经验者。5、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。6、身体健康,能长期稳定工作。岗位三:冷冻电镜系统管理员 A 1名(一) 岗位职责:负责电镜负染及冷冻样品制样,样品检测、用户服务。参与中心电镜(包括200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1. 具有生物、医学或物理等相关专业的本科或以上学位,有电镜操作或生物电镜样品制样经验者优先考虑;2.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;3.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力、服务精神和团队协作精神;4. 具有良好的中英文口头表达和写作能力;5. 身体健康,能长期稳定工作。岗位四:冷冻电镜系统管理员 B 1名(一) 岗位职责:负责用户项目的合作及服务研究。可以独立应用TITAN Krios及TF20电镜,进行cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析,或可独立开展高压冷冻、超薄切片服务等。参与中心电镜(包括300 kV TITAN Krios,200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1.应聘者有3年或以上冷冻透射电镜使用经验,具有独立完成cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析的能力和经验;或者可以独立开展高压冷冻、超薄切片服务等;2. 具有生物物理学或相关专业的硕士或以上学位,有SCI第一作者论文;具有良好的中英文口头表达和写作能力;3.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;4.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力和团队协作精神;5. 身体健康,能长期稳定工作。 岗位五: 软件工程师 1名(一) 工作职责:1、 编写或依据设计说明书,落实代码的实现工作,确保系统设计的合理性、可扩充性和代码编写的规范性。2、 对接受的开发任务进行评估,细化分配任务,制定软件开发阶段的具体技术实施计划。解决项目中的关键问题和技术难题。3、 根据要求协助进行需求分析及确认工作。执行单元测试、集成测试及回归测试,查出并解决软件在存的缺陷并保证其质量可靠。4、 进行项目相关技术文档的编写工作。5、 辅助保障项目的质量监控和进度管理。6、 完成上级交办的其他工作。(二) 任职条件:1、 计算机相关专业,本科以上学历。2、 熟练掌握Java语言,掌握SQL语言和数据库应用开发。3、 熟练使用JavaScript、Ajax、Jquery客户端脚本技术,有高通量数据开发经历者优先,有Android及IOS开发经验者优先。4、 善于分析项目要求,对系统框架设计有独立解决方案;能独立进行需求需求分析、设计及代码编写工作,具有较强的逻辑思维能力,问题缺陷分析处理能力。5、 责任心、事业心强,能承受工作压力,具备良好的沟通协调能力,良好的合作意识和团队协作精神,愿意分担其它工程项目职责。岗位六: 流式细胞分选技术员 1名(一) 岗位职责:1. 主要负责荧光激发细胞分选仪的操作、管理服务及样品制备;2. 负责流式细胞仪的操作,用户培训和技术支持;3. 负责普通荧光显微镜的操作、管理服务及技术支持,保证设备正常运行及日常维护;4. 参与并协调系统公共行政事务(如预算、采购、预约系统等),与中心相关职能部门对接;收集整合系统宣传信息,与中心宣传对接。(二) 任职条件:1. 生物学相关专业,硕士或以上学历;2. 掌握流式细胞分选技术,有流式、显微镜理论及操作基础,能熟练操作显微镜相关的中小型仪器;3. 具有良好的独立工作能力、创新工作精神;工作积极主动,具有团结奉献精神,乐于学习和接受新事物;4. 为人诚实

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