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【原创】晶体学数据库简介
悠悠王
2009/04/21
私聊
X射线衍射仪(XRD)
国际上有几个著名的晶体学数据中心。这些数据中心的主要作用之一是收集、储存和提供已知化合物的晶体结构数据。因此,越来越多的科学杂志在发表论文前,把论文有关的晶体学参数、化合物分子式、晶胞参数、空间群、原子坐标及其原子位移参数、精修结果参数等,以电子版的形式存放到这些著名的国际晶体学数据中心。其中两个十分重要的数据库为:剑桥结构数据库(Cambridge Structural Database, 简称 CSD)和无机晶体结构数据库(The Inorganic Crystal Structure Database,简称ICSD)。
1. 剑桥结构数据库(CSD)
剑桥结构数据库位于剑桥晶体学数据中心(Cambridge Crystallographic Data Centre,简称CCDC),它只收集并提供具有C–H键的所有晶体结构,包括有机化合物、金属有机化合物、配位化合物的晶体结构数据。提供给CSD的晶体学数据必须以国际通用的CIF格式[1],可以用电子邮件提供。CSD在收到每个晶体结构的CIF数据之后,在3个工作日内给每套数据规定一个储存编号(deposition number),即CCDC number。CSD接受晶体学信息文件的电子邮件地址为:
deposit@ccdc.cam.ac.uk
剑桥晶体学数据中心的网址为:
http://www.ccdc.cam.ac.uk
CCDC可以为研究人员免费提供数据库中CIF格式的晶体结构数据。一般CCDC会在3个工作日内回复。索要晶体结构数据必须想提供以下内容:
1)化合物的储存编号,例如CCDC 146058, CCDC 182/1520。
2)发表该结构的论文出处(The full journal citation)
3)如果上述内容不十分清楚,进一步提供作者名字、化合物的名称、分子式、晶胞参数等。
更详细的情况可以在以下网址了解:
http://www.ccdc.cam.ac.uk/conts/index.html#retr
如果CCDC查到有关数据,将以CIF的形式提供给申请人。有关索要晶体结构数据的申请用电子邮件,发至:
data_request@ccdc.cam.ac.uk
2. 无机晶体结构数据库
无机晶体结构数据库(The Inorganic Crystal Structure Database,简称ICSD)由德国的The Gmelin Institute (Frankfurt)和FIZ(Fachinformationszentrum Karlsruhe)合办。它只收集并提供除了金属和合金以外、不含C–H键的所有无机化合物晶体结构信息。详细情况可以通过ICSD的网址了解:
http://www.fiz-informationsdienste.de/en/DB/icsd/index.html
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