symmacros 2010/04/06
我的看法是PBM检索和NIST search给出的检索结果基本上是一致的。 因为两者使用相似的检索方式。NIST search提供正向检索(标准库的峰与未知谱对照,看看谱库中是否存在与未知谱相同的参考谱图)和反向检索(未知谱的峰与标准库对照,看看标准谱中的各质量峰是否出现在未知谱中。忽略在谱库不存在的未知谱上的峰。) PBM检索也属于反检索。 这样如果使用相同的谱库,例如NIST05,两者给出的结果应该一致。我检验过许多质谱图谱,如果同一数据库(library)结果是一样的。PBM检索相对简单。而NIST search可以给出更多的信息,更细致的图谱分析。例如正检索和反检索结果,保留时间对比及文献参考,图谱解释(spectrum interpreter),同位素分析等。利用这些数据更进一步分析处理图谱。 最终的结果也要参照保留时间或保留指数,挥发油的来源等因素确认。 两种结果可以同时应用到一篇文章中,您可以说明你用过了什么检索方式。分离较好的峰可以直接用PBM检索。分离度稍差的,共流出的或本底干扰大的峰用AMDIS处理后并在Amdis上检索。好像不能在Amdis处理后用NIST search进样检索(更正:可以的)。
symmacros
第1楼2010/04/06
我的看法是PBM检索和NIST search给出的检索结果基本上是一致的。
因为两者使用相似的检索方式。NIST search提供正向检索(标准库的峰与未知谱对照,看看谱库中是否存在与未知谱相同的参考谱图)和反向检索(未知谱的峰与标准库对照,看看标准谱中的各质量峰是否出现在未知谱中。忽略在谱库不存在的未知谱上的峰。)
PBM检索也属于反检索。
这样如果使用相同的谱库,例如NIST05,两者给出的结果应该一致。我检验过许多质谱图谱,如果同一数据库(library)结果是一样的。PBM检索相对简单。而NIST search可以给出更多的信息,更细致的图谱分析。例如正检索和反检索结果,保留时间对比及文献参考,图谱解释(spectrum interpreter),同位素分析等。利用这些数据更进一步分析处理图谱。
最终的结果也要参照保留时间或保留指数,挥发油的来源等因素确认。
两种结果可以同时应用到一篇文章中,您可以说明你用过了什么检索方式。分离较好的峰可以直接用PBM检索。分离度稍差的,共流出的或本底干扰大的峰用AMDIS处理后并在Amdis上检索。好像不能在Amdis处理后用NIST search进样检索(更正:可以的)。
symmacros
第5楼2010/04/07
大致看了一下操作过程。
不清楚C8-C40.MSL是不是用于正构烷的检索的?在分析处理挥发油样品时 选用这个数据库时,不合适。可能用NISTFF.MSL(一个小型香精香料Amdis检索谱库)稍好些。最好自建相应的谱库,或者从别的库转来MSL库来用。 Type of analysis如果选用RIcalibration/performance,你的MSL库中必须包含每个化合物的保留指数。如果没有保留指数,则只能选simple。
一般在Amdis上直接进行数据处理,给出结果。除非有什么更细致的检索需要,才会转入NIST search(go to NIST MS program)做进一步的处理。
实际上,你是在Amdis转了一下,并未使用其检索和保留指数校正,而进入NIST search。 有时间,我再看看你的PBM和NIST检索的结果。
有关Amdis的使用,请参考:
【第二届原创大赛参赛作品】AMDIS自动化质谱图解卷积和鉴定软件在GC/MS数据处理的初步应用
http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20091226/2294579/
和【第二届原创大赛参赛作品】AMDIS自动化质谱图解卷积和鉴定软件初步介绍(续)
http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20100117/2352775/
happyddm
第8楼2010/04/08
在鉴定过程中,对于检索结果,不一定匹配值最高的就是最后的结果,还要先比对分子量是否能对得上,是吗?
那以您的经验,在鉴定过程中,一般要依次经过哪些步骤的筛查和分析呢,才能高效准确进行鉴定呢?谢谢!