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【已解决】保留指数校正库建立出现的问题？

  • lovehome2008
    2010/04/15
    • 私聊

气质联用（GCMS）

  • 我用两个条件在GCMS上运行了正构烷烃标准化合物，c8-c40，获得MS数据文件。通过AMDIS建立保留指数校正文件！

    这是用记事本检查alkanes保留指数校正文件，比较成功的！
    4.929 1100.0 100 320 Undecane
    6.233 1200.0 100 320 Dodecane
    7.812 1300.0 100 292 Tridecane
    9.894 1400.0 98 262 Tetradecane
    12.597 1500.0 100 239 Pentadecane
    15.929 1600.0 100 221 Hexadecane
    19.780 1700.0 100 210 Heptadecane
    23.953 1800.0 100 199 Octadecane
    28.306 1900.0 100 193 Nonadecane
    32.700 2000.0 96 212 Eicosane
    35.388 2100.0 98 284 Heneicosane
    37.109 2200.0 98 320 Docosane
    38.437 2300.0 93 324 Tricosane

    这个是另一个保留指数校正文件（有20多种烷烃）
    3.222 900.0 100 292 Nonane
    5.694 1100.0 100 298 Undecane
    7.076 1200.0 100 307 Dodecane
    8.749 1300.0 100 270 Tridecane

    8min之后的呢？是不是这个的条件不合适？
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  • symmacros

    第1楼2010/04/15

    应助达人

    在工作站上粗略看看两个MS文件，似乎正常，但你的质谱扫描范围是从50开始，一部分低于50的离子无法匹配，另外后面的正构烷的分子离子一般相差0.5个单位，有点不准，不知为什么？是不是调谐不好（？），也会影响匹配。有时间我在Amdis上试试，看看是什么原因。

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  • 该帖子已被版主-新窦加8积分，加2经验;加分理由:应助
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  • lovehome2008

    第3楼2010/04/15

    很有可能是调谐不好导致有点偏差，但是两个MS文件第一个（5）在Amdis上只有8min之前的（10min之前的也很准确，之后的就有很大出入了？），第二个（6）在Amdis建立保留指数校正文件很正常，用来分析了以下感觉还可以。
    程序升温会有影响吗？我程序升温很快的10℃/min。
    C8-C40混标里面有混合物姣姥烷，植烷等！

    symmacros(jimzhu) 发表:在工作站上粗略看看两个MS文件，似乎正常，但你的质谱扫描范围是从50开始，一部分低于50的离子无法匹配，另外后面的正构烷的分子离子一般相差0.5个单位，有点不准，不知为什么？是不是调谐不好（？），也会影响匹配。有时间我在Amdis上试试，看看是什么原因。

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  • symmacros

    第4楼2010/04/15

    应助达人

    C8-C40混合5正常啊，参考：

    3.228 900.0 100 292 Nonane
    5.699 1100.0 100 298 Undecane
    7.081 1200.0 100 307 Dodecane
    8.755 1300.0 100 270 Tridecane
    11.249 1400.0 98 221 Tetradecane
    15.254 1500.0 100 173 Pentadecane
    21.877 1600.0 100 114 Hexadecane
    26.939 1700.0 100 246 Heptadecane
    29.163 1800.0 100 292 Octadecane
    30.751 1900.0 100 320 Nonadecane
    32.037 2000.0 98 339 Eicosane
    33.149 2100.0 98 347 Heneicosane
    34.152 2200.0 98 350 Docosane
    35.076 2300.0 93 353 Tricosane
    36.053 2400.0 100 323 Tetracosane
    37.202 2500.0 92 292 Pentacosane
    38.601 2600.0 93 262 Hexacosane
    40.352 2700.0 96 233 Heptacosane
    42.571 2800.0 86 193 Octacosane

0
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  • symmacros

    第5楼2010/04/15

    应助达人

    C8-C40混合6和你一样：

    4.935 1100.0 100 320 Undecane
    6.239 1200.0 100 320 Dodecane
    7.818 1300.0 100 292 Tridecane
    9.899 1400.0 98 262 Tetradecane
    12.603 1500.0 100 239 Pentadecane
    15.935 1600.0 100 221 Hexadecane
    19.786 1700.0 100 209 Heptadecane
    23.966 1800.0 100 201 Octadecane
    28.312 1900.0 100 193 Nonadecane
    32.706 2000.0 96 212 Eicosane
    35.394 2100.0 98 284 Heneicosane
    37.115 2200.0 98 320 Docosane
    38.442 2300.0 93 324 Tricosane

0
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  • symmacros

    第6楼2010/04/15

    应助达人

    程序升温没有影响。

    在C17和C18后面有两个非正构烷，Amdis是可以自动识别的。

    lovehome2008(lovehome2008) 发表:很有可能是调谐不好导致有点偏差，但是两个MS文件第一个（5）在Amdis上只有8min之前的（10min之前的也很准确，之后的就有很大出入了？），第二个（6）在Amdis建立保留指数校正文件很正常，用来分析了以下感觉还可以。
    程序升温会有影响吗？我程序升温很快的10℃/min。
    C8-C40混标里面有混合物姣姥烷，植烷等！

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  • symmacros

    第7楼2010/04/15

    应助达人

    不知道你的Amdis设置怎么样？

    我的设置共你参考：

    idenif.
    minimum match factor：60
    match factor penalties--level---average
    maximum penalty: 20, No RI in Library: 10

    instrument: threshold: off

0
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  • lovehome2008

    第8楼2010/04/15

    我的设置和你一样啊，我又试了，还是我那样子，不知道为什么！而且发现我后面的峰的时间和你做的保留指数时间不一致！混标5和6都是如此，且混标5只做出8min之前的！
    我的
    3.222 900.0 100 292 Nonane
    5.694 1100.0 100 298 Undecane
    7.076 1200.0 100 307 Dodecane
    8.749 1300.0 100 270 Tridecane
    你的
    3.228 900.0 100 292 Nonane
    5.699 1100.0 100 298 Undecane
    7.081 1200.0 100 307 Dodecane
    8.755 1300.0 100 270 Tridecane

    后来我终于发现 ，我用NIST05的amdis（2.64）做的保留指数时间与你不一样，用NIST02的amdis（2.1）的做的保留指数时间与你完全一样（混标6），但是混标5无论如何都不行！

    symmacros(jimzhu) 发表:不知道你的Amdis设置怎么样？

    我的设置共你参考：

    idenif.
    minimum match factor：60
    match factor penalties--level---average
    maximum penalty: 20, No RI in Library: 10

    instrument: threshold: off

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  • lovehome2008

    第9楼2010/04/16

    是不是我的ALKANES.CSL文件有问题，在附件里或者你邮箱里！
    能否把你的ALKANES.CSL,ALKANES.MSL,ALKANES.CID,发给我一份！

    symmacros(jimzhu) 发表:不知道你的Amdis设置怎么样？

    我的设置共你参考：

    idenif.
    minimum match factor：60
    match factor penalties--level---average
    maximum penalty: 20, No RI in Library: 10

    instrument: threshold: off

0
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  • lovehome2008

    第10楼2010/04/16



    在10.388min校正了一个杂峰，这个杂峰干扰了以后的保留指数的校正！那么这个杂峰怎么才能去掉？

0
    +关注 私聊

  • lovehome2008

    第11楼2010/04/16

    那个杂峰是己烷，我编辑了下ALKANES.CSL，把里面的己烷去掉了，结果就成功建立校正保留指数！
    amdis2.1(nist02)
    3.228 900.0 100 292 Nonane
    5.699 1100.0 100 298 Undecane
    7.081 1200.0 100 307 Dodecane
    8.755 1300.0 100 270 Tridecane
    11.249 1400.0 98 221 Tetradecane
    15.254 1500.0 100 173 Pentadecane
    21.859 1600.0 100 116 Hexadecane
    26.939 1700.0 100 246 Heptadecane
    29.164 1800.0 100 292 Octadecane
    30.751 1900.0 100 320 Nonadecane
    32.037 2000.0 98 339 Eicosane
    33.149 2100.0 98 347 Heneicosane
    34.152 2200.0 98 350 Docosane
    35.076 2300.0 92 353 Tricosane
    36.053 2400.0 100 323 Tetracosane
    37.202 2500.0 90 292 Pentacosane
    38.601 2600.0 93 262 Hexacosane
    40.352 2700.0 96 233 Heptacosane
    42.571 2800.0 86 193 Octacosane

    amdis2.64(nist05)
    3.222 900.0 100 292 Nonane
    5.694 1100.0 100 298 Undecane
    7.076 1200.0 100 307 Dodecane
    8.749 1300.0 100 270 Tridecane
    11.243 1400.0 98 221 Tetradecane
    15.249 1500.0 100 173 Pentadecane
    21.854 1600.0 100 116 Hexadecane
    26.933 1700.0 100 246 Heptadecane
    29.158 1800.0 100 292 Octadecane
    30.745 1900.0 100 320 Nonadecane
    32.031 2000.0 96 339 Eicosane
    33.143 2100.0 98 347 Heneicosane
    34.147 2200.0 99 350 Docosane
    35.070 2300.0 90 353 Tricosane
    36.047 2400.0 100 323 Tetracosane
    37.197 2500.0 88 292 Pentacosane
    38.595 2600.0 93 262 Hexacosane
    40.347 2700.0 96 233 Heptacosane
    42.565 2800.0 86 193 Octacosane

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