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关于同一个空间群,选择不同的坐标原点,Wyckoff位置如何转变!

X射线衍射仪(XRD)

  • 悬赏金额:20积分状态:已解决
  • 空间群227(Fd-3m)的坐标原点有两种选择,8a(-43m)或者16c(-3m)。
    不论哪种坐标原点,8a,8b,16c,16d的Wyckoff位置是明确的。
    问题是:
    原点在8a(-43m)和16c(-3m)的32e位置为(x,x,x)。但两个位置值肯定是不同的。

    如原点在8a时,32e位置为(0.808,0.808,0.808)。那么原点取在16c时,32e处的值为多少?
    为什么?
    直接减去0.125(1/8)好像是不对。因为输入到软件中,得到的结果不同,且有原子和相邻原子
    没有键连接,呈悬空状态!

    谢谢!急!!!

蓝莓口香糖 2011/08/19

我一直用这个,还不错。 http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20090126/1712695/

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  • iangie

    第1楼2011/08/16

    应助达人

    这个真不会~~哪位晶体学达人来讲解下.........

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  • dahua1981

    第2楼2011/08/17

    应助达人

    晶体解析直接不会啊

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  • 金水楼台先得月

    第3楼2011/08/17

    这类问题以前是怎么处理的呢

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  • wgjszx

    第4楼2011/08/17

    晶体数据库一半给出第一个原点的数据(origin choice 1),而一些软件需要输入的是第二个原点的数据(origin choice2)。简单的自己进行了转换,这个太复杂,有点晕。
    谢谢回复!
    继续等待高手!!!

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  • 洪星二锅头

    第5楼2011/08/18

    我觉得你选的原点有问题,选择的原点应该具备最高的对称性,其中的8a、8b的对称性都为-43m,可以通过原点直接得出空间群所有的等效点

    而当选择16c时,对称性仅仅为-3m,通过操作无法获得Fd-3m所有的等效点,所以就不存在你所32e位置的变动

    wgjszx(wgjszx) 发表:空间群227(Fd-3m)的坐标原点有两种选择,8a(-43m)或者16c(-3m)。
    不论哪种坐标原点,8a,8b,16c,16d的Wyckoff位置是明确的。
    问题是:
    原点在8a(-43m)和16c(-3m)的32e位置为(x,x,x)。但两个位置值肯定是不同的。

    如原点在8a时,32e位置为(0.808,0.808,0.808)。那么原点取在16c时,32e处的值为多少?
    为什么?
    直接减去0.125(1/8)好像是不对。因为输入到软件中,得到的结果不同,且有原子和相邻原子
    没有键连接,呈悬空状态!

    谢谢!急!!!

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  • 大陆

    第6楼2011/08/18

    原点在8a时,32e位置为(0.808,0.808,0.808),这个不妥,应该变换到最简单元空间里(Asymmetric unit),即x值应当在0-0.5之间。所以,你不妨试试:(0.192,0.192,0.192)。

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  • 蓝莓口香糖

    第7楼2011/08/18

    没觉得有什么不一样。

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  • wgjszx

    第8楼2011/08/19

    请参阅网址:http://www.cryst.ehu.es/cgi-bin/cryst/programs/nph-wp-list
    2
    27就是有两个原点选择。一个高对称,一个此对称。
    Find It中给出的是origin choice 1的,而有的软件就是要输入origin choice 2的。这是问题所在。
    谢谢你的回复!

    coime(coime) 发表:我觉得你选的原点有问题,选择的原点应该具备最高的对称性,其中的8a、8b的对称性都为-43m,可以通过原点直接得出空间群所有的等效点

    而当选择16c时,对称性仅仅为-3m,通过操作无法获得Fd-3m所有的等效点,所以就不存在你所32e位置的变动

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  • wgjszx

    第9楼2011/08/19

    有点意思,可以试一试!
    谢谢啊!

    大陆(handsomeland) 发表:原点在8a时,32e位置为(0.808,0.808,0.808),这个不妥,应该变换到最简单元空间里(Asymmetric unit),即x值应当在0-0.5之间。所以,你不妨试试:(0.192,0.192,0.192)。

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  • 大陆

    第10楼2011/08/19

    这取决于软件。
    对于智能的软件来说没什么不一样,但对于坐标的对称性变换这块做的蹩脚的程序来说,很不一样。
    智能软件可以自动识任意坐标并将其变换到该对称性关联的最简坐标形式;
    蹩脚软件则根据晶体学表中的公式(以最简坐标形式作为假定),计算出驴唇不对马嘴的对称点坐标。

    蓝莓口香糖(drizzlemiao) 发表:没觉得有什么不一样。

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