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GC-MS 和LC-MS前处理除了衍生化外，其他步骤一样吗？

Ins_e020ef66

2023/07/06

气质联用（GCMS）

做的非靶向代谢组学，对同一个物质同时使用LC-MS 和GC-MS检测，在不同的文献中分别找到了这个物质的LC-MS前处理和GC-MS 前处理，有一个问题就是两篇文献中对代谢物的提取方法除了GC-MS前处理需要衍生化以外，在衍生化之前的代谢物提取步骤也不同。这样的话我可以按照两个方法来做吗，还是说LC-MS和GC-MS的前处理一样，只是对GC-MS的前处理加一个衍生化？
两个方法步骤如下：

1、取样品30mg放入1.5mlEP管→加入两个4mm钢球→加入20μL内标→加入600μL甲醇：水（4:1）→-80℃，放置2min→60HZ超声2min→加入120μL氯仿→剧烈涡旋→环境温度下超声提取10min→4℃放置10min→4℃，13310g离心10min→取上清，冻干→衍生化

2、取样品60mg放入1.5mlEP管→加入200μL水，涡旋2min→加入800μL甲醇：乙腈（1:1，含内标）→涡旋2min→两次低温超声处理（30min）→-20℃放置1h→4℃，14000g离心20min→取上清，冻干

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xiaogumd11

第1楼2023/07/07

应助达人

两个方法步骤有差异，方法1用到了氯仿，做为提取液体，再冻干。方法1相当于直接冻干法。两个方法的效果是否相同，楼主可以做实验比较。

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Ins_e020ef66

第2楼2023/07/07

第2个方法做了，检测结果不好，目前打算试一下第一个方法，但是我有一个疑问，用到氯仿，是不是就是主要针对脂质的提取，检测结果会不会大部分都是脂质类，因为我想做的事非靶检测，用这个方法的话感觉是重点关注脂质类，这样处理合理吗？
xiaogumd11(v3247983) 发表:两个方法步骤有差异，方法1用到了氯仿，做为提取液体，再冻干。方法1相当于直接冻干法。两个方法的效果是否相同，楼主可以做实验比较。

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