色谱是分离手段。而质谱是分离以后的检测手段之一，两者不好混谈

应助达人

实际还是看目标物含量控制要求吧，根据国家相关食品安全标准而定

色谱某些的检测器灵敏度很高，比如用ECD做666，那玩意检测6个氯，肯定不错，但是质谱多个定性作用，毕竟你可以通过特征离子，和他的比例关系来判断，而色谱只能通过保留时间。

加一句，通过特征例子的分离，GCMS可以一针做一百个农药，就算那两个峰重叠也还是可能独立计算的，GC差了点

食品安全什么的，我们实验室这台色谱做不了

质谱定性要纯物质，但现实情况下大部分样品不可能是纯物质，要想让质谱起作用还是要预先分离，众所周知分离最有效快速的方法还是色谱，不论是气相还是液相，所以色谱不但不会退出相反会起到跟重要的作用，最终结合在一起（气—质联用，液—质联用）。

质谱的价格不易普及

各有所长，不过感觉色谱覆盖面较广，能通吃，不过准确度方面有待商榷

气谱是基础，是分离的主要设备，质谱是检测定性，没有气谱的前端发展，就没有质谱的后端细分。

应助达人

随着食品安全要求的进一步提高，质谱的重要性越来越凸显出来，其实本质来说质谱只不过是更高一步的色谱技术，质谱与色谱的相结合，会更好的解决食品安全问题。