基于Orbitrap Fusion Lumos质谱进行血浆蛋白质组高通量深度解析

2019/06/14   下载量： 13 次

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应用领域 医疗/卫生
检测样本 全血/血清/血浆
检测项目 生化检验>蛋白
参考标准 国家标准

血液是最重要的临床检验样品来源。精准医学研究中的大队列生物标志物研究对于分析方法提出了高通量和高稳定性的要求，利用Orbitrap Fusion Lumos质谱极佳的灵敏度和稳定性，我们发展了一种快速、稳定的高通量血浆蛋白质组研究策略。简化的前处理步骤通量高、稳定性好，仅用1小时梯度即可定量700种蛋白，2.5小时梯度可定量超过1000种蛋白。基于高通量的深度血浆蛋白质组解析，我们可从大规模临床队列中发现潜在的生物标志物，助力精准医学研究。

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血液是最重要的临床检验样品来源。基于质谱的蛋白质组学可在几小时内定量几百个血浆蛋白，是研究血液生物标志物的主要方法之一。但由于血浆蛋白的动态范围极高，从血浆中鉴定蛋白的数量通常比较有限（200-300种），进行深度蛋白解析（>500种蛋白）往往还需进行繁琐的分级，影响了研究的通量和重现性。因此，我们利用Orbitrap Fusion Lumos质谱极佳的灵敏度和稳定性，发展了一种快速、稳定的高通量血浆蛋白质组研究策略。去除血浆中的高丰度蛋白后，进行Lys-C和trypsin串联酶解，再采用96孔固相萃取板进行高通量固相萃取。通过单针DIA数据采集，仅用1小时梯度即可定量700种蛋白，2.5小时梯度可定量超过1000种蛋白。

血液是最重要的临床检验样品来源。精准医学研究中的大队列生物标志物研究对于分析方法提出了高通量和高稳定性的要求，利用Orbitrap Fusion Lumos质谱极佳的灵敏度和稳定性，我们发展了一种快速、稳定的高通量血浆蛋白质组研究策略。简化的前处理步骤通量高、稳定性好，仅用1小时梯度即可定量700种蛋白，2.5小时梯度可定量超过1000种蛋白。基于高通量的深度血浆蛋白质组解析，我们可从大规模临床队列中发现潜在的生物标志物，助力精准医学研究。


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文献贡献者

赛默飞色谱与质谱
钻石会员 丨 第23年
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