在NGS检测实验中,DNA文库构建的第一步就是将DNA随机打断成符合各测序平台读长的片段。相信熟悉NGS文库构建的科研人员一定纠结过这个问题,是用酶解打断还是超声波打断?
目前DNA打断的最主要的方法超声法和酶解法。但是这两种方法在实际使用中各具优势,需要根据实验者自身的情况进行选择。
超声波打断法:
操作简单,耗时短,成本低;随机片段化,无GC序列偏好;剪切效果不受DNA浓度影响
片段化结果集中度高,目的长度片段得率高。
酶切法:
实验要求严格,针对不同样本合适的片段化条件摸索不易,成本较高;存在序列偏好性;需要根据样本浓度改变酶浓度,酶活性易受到溶液成分影响;目标长度片段集中度较低。
超声打断法的优势显而易见,而常用的超声波打断仪分为接触式和非接触式。相比传统的探头超声波破碎仪,探头与样品直接接触,一次只能处理一个样品,实验周期长。小美非接触超声波DNA打断仪Plus系列产品可在密闭容器下进行破碎,不产生感染性飞雾,超声探头与样品不接触,避免交叉污染。对于每天要处理多个样品或者贵重样品的实验室,此款仪器具有处理高通量,样本低损耗,无交叉污染等优势。逐渐成为ChIP(染色质免疫共沉淀)和DNA剪切研究平台不可缺少的标准化工具。
小美超声非接触超声波DNA打断仪Plus系列产品具有通量高、实验一致性好,实验重复性好、片段得率高等优点。专为二代测序DNA样本与染色质免疫共沉淀实验样本前处理量身订做的,应用领域包含:细菌细胞破碎、蛋白质抽提;二代测序样本DNA片段化;霉菌孢子破碎、乳化、均质、加速溶解、催化反应等。
采用等温、非接触的方式对样品进行打断、匀浆和混合;用于无菌、可超微量破碎,隔着离心管能打断染色体。深受各大基因公司、生物公司、测序公司的青睐!
血管生成实验必备指南|优化实验方案和关键参数
科研瓶颈怎么破?真空离心浓缩仪如何助我摆脱浓缩烦恼?
冷冻研磨仪步步都是陷阱,难怪我的样本提取总不成功!试用方知好用
实验难做,样品都是磨人的「小妖精」?现冷冻研磨仪申请出战……
相关产品
超高压均质机脂质体均质机高压均质机厂家
微孔板水平离心机
刀式研磨仪动植物组织刀式研磨仪
掌上迷你离心机 MINI-6K/7K/10K/10DFS拓赫
电热恒温鼓风干燥箱101-00S、101-00BS拓赫
恒温鼓风干燥箱101-0S/101-0BS拓赫烘箱
电热恒温鼓风干燥箱101-1S/101-1BS拓赫干燥箱
恒温鼓风干燥箱101-2S/101-2BS拓赫烘箱仪器
无油真空泵FCD-30拓赫便携式抽气泵
方形固相萃取仪FG-24拓赫玻璃萃取装置
固相萃取装置FG-12拓赫色谱前处理
固相萃取仪QSE-12 QSE-24拓赫12/24位固相萃取装置
单道可调移液器拓赫手动移液枪
高性能球磨仪TH-12L(不含罐)拓赫球磨机
高能行星式球磨仪/高能行星式球磨机厂家
关注
拨打电话
留言咨询