新冠肺炎疫情牵动着每一个人的心。全力做好肺炎疫情防控工作,是华大智造和社会各界的共同目标。面对这场没有硝烟的战争,华大智造DNBSEQ系列高通量基因测序仪被用于基因组序列组装,疑似患者检测,变异检测等肺炎防控关键时刻。
MGISEQ-2000成为最早发布新型冠状病毒基因组测序仪之一
MGISEQ-2000作为中高通量测序仪,在临床和科研上都广泛使用,在全国各地本地化数据测序、助力分析新冠病毒基因组序列等发挥了重要作用。
MGISEQ-2000
12月30日,在最早一批提交至全球共享流感病毒数据库GISAID发布的13例新型冠状病毒基因组序列数据中,有5例数据来自华大智造高通量测序仪——MGISEQ-2000,这为研究分析武汉新型冠状病毒的进化来源、致病病理机制提供了第一手资料。
基于MGISEQ-2000技术平台提交的序列数据
1月23日,MGISEQ-2000在北京紧急检测任务中发挥了至关重要的作用,接到任务后,快速进行建库、上机,在1月25日凌晨3点成功下机。同一时间,在全球共享流感病毒数据库GISAID数据库中,已公开发布的新型冠状病毒基因组序列已增加至26例【1】。
新型冠状病毒2019-nCoV基因组结构示意图
(来源:Nextstrain)
1月25日,在深圳某医院MGISEQ-2000配合临床诊疗过程需要,参与溯源分析和研究。
1月27日,位于北京的MGISEQ-2000再次发挥了其全面灵活、质量稳定、测序速度快等优势。作为核酸检测试剂盒(PCR方法)的补充,对于部分病毒含量较低的样本,基于MGISEQ-2000高通量测序仪进行测序,可以提高阳性检出率,避免漏检和错检;对于疑似感染、多重感染或继发感染病原样本,而基于DNBSEQ高通量测序仪进行测序,可以进行并发检测,提供更多可能感染的病原信息。
华大智造高通量测序仪MGISEQ-2000在路上
超高通量测序仪DNBSEQ-T7成为规模化检测重器
年末岁初,武汉,在中国科学院微生物研究所、山东第一医科大学和华大基因的通力合作下,来自华大智造的DNBSEQ-T7出色完成基因组测序任务,快速完成该新型冠状病毒组测序。【2】
基于DNBSEQ-T7的4个样本组装文件
1月21日,紧急新增的DNBSEQ-T7测序仪连夜部署,最快可在20小时内对128个病例实现从样本到下机报告的输出,且每个样本经高通量测序获得的总Reads数超过100 Million reads,能有效提高病原微生物的检测灵敏度。
领域应用专家在DNBSEQ-T7前进行上机操作
除此之外,1月22日,位于上海、广州等地的DNBSEQ高通量测序仪——MGISEQ-200也完成数据更新,更新后的数据库包含引新型冠状病毒序列。
华大智造成立应急专项小组,开通技术支持专线
为了更好支持各地区测序仪的运作,华大智造成立应急专项小组、开通应急技术支持专线,24小时待命,共同助力疫情防控。在全国配备精锐力量,24小时待命,提供基于高通量测序方法的新型冠状病毒应急方案,支持临床鉴别提供诊断依据包括新型冠状病毒在内的其他冠状病毒和呼吸道病原感染,实现病毒序列快速检测,并为监测可能存在的病毒变异提供支持。
华大智造也开通了应急技术支持专线(4000-966-988,按语音提示输入5,即可实现呼叫),全力协助疫情防控。
华大智造2019-nCoV高通量测序解决方案总联系人
江博士,15972014336
华大智造2019-nCoV全国各区应急小组组长
华北区:杜先生,18911279162
华东区:赵先生,17621034555
华南区:曾先生,18718924024
华中区:蒋先生,13681802511
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