脂多糖的物理性状主要表现为集聚程度，集聚度的大小对于生物学活性有着非常显著的影响。对于某种特定的脂多糖其各种盐类的生物学活性强弱可不一。实验表明随着脂多糖盐类集聚度的增加(表现为沉淀系数的增加)，则脂多糖的抗补体作用亦相应地增加。高度集聚的脂多糖钠盐表达出极强的抗补体活性。其他低集聚度的脂多糖盐，则表现为弱抗补体活性。脂多糖的三乙胺盐(S =9.0)则完全缺失抗体活性。
除了抗补体活性外，其他生物学活性亦受到脂多糖物理性状的影响。实验结果表明:低集聚度的脂多糖分子能导致极强的家兔发热反应及小鼠致死毒性，而另--方面，高集聚状态的脂多糖分子易与细胞膜发生作用，可从血清中得到清除，并导致较强的大鼠致死毒性。而脂多糖的其他生物学活性，如致有丝分裂反应及鲨试剂凝集反应等活性，却不易受到分子集聚程度的影响。
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