型号: | Element AVITI™ 系统 |
产地: | 美国 |
品牌: | Element Biosciences |
评分: |
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Element AVITI™ 系统
特性
• 以更低的成本实现灵活性
介绍
新一代测序(NGS)已经推动了基因组学领域的,使研究人员能够通过不断发展的技术和工具组合来面对复杂的科学问题。尽管有这些创新,但台式测序的测序成本仍然很高,需要工厂规模的生产型测序仪才能实现各种节省成本。为了节省成本,往往是以牺牲质量和灵活性为代价的。
Element AVITI 系统重新构建了 NGS 的核心组件,以提供一个全面的台式平台,使得基因组学生态系统可以更广泛的采用这个平台(图 1)。 AVITI 是一台以极低的测序成本提供灵活通量测序的平台,它节省了时间和资源。 Avidity 碱基化学(Avidity base chemistry, ABC)组成了颠覆性设计的核心,它可以很容易地进行各种应用,提供了从扩增子到全基因组,从短读到长读的测序方法。
可扩展的实验设计
每次实验无论是需要 20 亿 reads 还是 1 亿 reads, AVITI 都能在任何通量下实现经济高效、高质量的测序。多种测序试剂盒配置,读取长度从 2 x 75 至 2 x 300,涵盖高、中、低通量的全范围,即使在低通量上也能实现精准基因组产出,而不会牺牲成本效益(表 1)。其成本接近于于生产规模的测序系统,且无需等待足够多的项目凑满一个流动槽的通量。
作为 AVITI 的另一个选项, Element AVITI LT 系统可运行低通量和中通量测序试剂盒,以提供低通量和经济实惠的 ABC 测序。如果未来业务成长或有更多的应用需要更广泛的通量范围,实验室可以轻松地将 AVITI LT 升级为全通量 AVITI。
新型ABC测序
ABC 技术的基本原理是利用 avidites(亲和子)的独特特性来执行高效的测序反应,并产生高度准确的数据。在高密度 polony 下保持强大信噪比的能力推动了这种精度。
对于每个循环,测序聚合酶和 avidite 与 polony 和引物的双链复合体相结合,并将碱基特异性 avidite 捕获到 polony 上。这形成了一个极其紧密的复合物,与边合成边测序(SBS)相比,试剂浓度可降低 100 倍。
应用优势
RCA 仅使用原始文库作为模板,从而避免了放大错误。该方法避免了游离引物与 polony 的结合,并最大限度地减少了流动槽上的index hopping。此外,由于光学重复率低, RCA 可提供更多可用reads,光学重复率小于 1 %。
订货信息
Element AVITI System | 880-00001 |
Element AVITI System LT | 880-00003 |
总结
AVITI 彻底改变了表面化学和数据分析,提供了一个灵活且具有高性价比的测序平台,具有卓越的准确性。与标准 NGS 文库的全面兼容性为实验室开展测序工作提供了方便的路径,并可适用于广泛的NGS 应用。多种试剂盒和丰富的软件功能促进了适应各种需求的运行设置和分析,以满足一系列实验需求。AVITI 支持您的基因组需求。
系统参数
参考文献
1. Arslan, Sinan, Francisco J. Garcia, Minghao Guo, et al., “Sequencing by avidity enables high accuracy with low reagent
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