CYTO2022直击|流式新冠应用、光谱流式、人工智能成焦点

意义非凡的CYTO2022——张千君

CYTO2022举办地：美国历史名城费城

费城是美国最具历史意义的城市，有非常重要的地位。1776在此发布《独立宣言》；1787年在此举行制宪会议，诞生了第一部美国联邦宪法。此次CYTO会议更是在经历3年的疫情后，第一次的现场会议，也是意义非凡。

ISAC 作为国际流式协会，是最具影响力的全球性协会，是所有流式人的家，对技术创新，行业标准化等作出了很大的贡献。

每年的年会CYTO更是一场流式行业的峰会，所有流式使用者，开发者，创新者，流式仪器，试剂，软件还有服务提供商云集一堂，共同学习了解行业最新的进展。CYTO2022 一共有1500人现场参会，300人在线参会。规模几乎回到了疫情前。

【Robert Hook talk & Keynote篇】

流式在COVID中的应用

Keynote speaker, 请的是Dr. E. John Wherry,也是宾大的。 他是T细胞衰竭领域的先锋。他帮助发现了PD-1 checkpoint在癌症里面的作用，这些发现对癌症的免疫治疗研究开始了新的篇章。过去两年他在研究COVID 病人及打过mRNA疫苗后人体的免疫反应从而更好的进行新的治疗方法。其中他提到的一个很有趣的方向就是人体的免疫图谱, 类似于基因图谱，创建个体的immune fingerprint, 从而对疾病的治疗及预后提供更好的指导。譬如他提到的一个例子就是一个经过化疗的淋巴瘤病人(新冠高危人群），他想去参加孙女的毕业典礼（人群聚集高危场所），如果他去医生那里寻求意见，医生应该怎么提供专业意见呢？医生可以给他测一个新冠抗体，然后再测一个T 细胞新冠抗原特异性反应检测，如果两个都是阳性的话，说明他是受免疫保护的，去毕业典礼相对是安全的，如果他两个都是阴性的话，就给注射预防性的新冠抗体。

恰好，这两天读到一篇在Nature Technology上发表的文章就是讲用PCR检测T细胞对冠病毒特异性反应（PCR比单细胞分析更易量化，更快速），从而评估个体对新冠的保护程度。这项技术已经在欧洲通过使用，在美国，FDA之前也紧急通过了另外一款针对新冠的T细胞免疫检测T-Detect。目前仅仅根据体内的抗体浓度无法准确评估对新冠病毒的保护程度，抗体的浓度和保护力并不成正比。现在再加上一个T细胞的免疫反应程度， 就可以相对准确的评估个体对病毒的免疫保护程度从而作出医疗决策. 根据个体的免疫指纹，帮助作出对应的医疗决策，这在新冠方向是一个应用，对其它疾病也将是一个发展的方向。这次会议上还有很多有关流式在COVID中的应用，就不一一详述了。

【技术热点篇】

光谱流式是一大热点，包括光谱流式仪，光谱成像，光谱分选

光谱流式分选仪

赛默飞公司的Bigfoot 全光谱超高速流式细胞分选仪. 配置高达9个激光器和60个检测器，既可以选择传统补偿模式进行数据分析，也可以切换成全光谱分析模式，以进行更精细的细胞亚群鉴定. 分析和分选的速度也很快。分析速率高达每秒100,000个事件，分选速率超过每秒70,000个事件，因此系统可以在8秒内完成96孔板分选，11秒内完成384孔板分选。

Cytek公司的光谱分选仪Aurora CS,秉承了Aurora的全光谱优越性及高敏感度，最多可以五激光，64个荧光参数轴，可以做到同时六路分选：

这次会议的一大技术亮点非 BD FACSDiscover™ S8 Cell Sorter with BD CellView™ Image Technology 莫属。 世界上第一台能够实时查看单个细胞图像的细胞分选仪, 同时进行高参数流式分析，然后使用传统的流式细胞术信号和每个细胞的显微图像对它们进行高速分选。非常期待它在现实实验中的表现及应用。

人工智能及机器学习应用

人工智能及机器学习（Artificial intelligence/machine learning)的应用是我很关心的一个领域. 这次会议上也大量的涉及了高纬流式的应用及数据分析。流式细胞术的高通量性能，以及最近传统流式，光谱流式及质谱流式的技术进展，而增加的多参数能力，能够生成大量高维数据， 如果同时考虑日益增加的数量具多的样本数及采集越来越多的细胞数，我们正式进入了流式大数据及计算流式细胞术时代。大家的共识是AI/ML将是基础科研，临床实验和临床诊断发展的一个大方向。这次CYTO会议专门有一个环节 Novel Clinical Trial Designs for Advanced Therapies, 先进疗法的新型临床试验设计。里面提到流式技术在药物开发的各个环节都起到了重要的作用，AI/ML更将被广泛应用。

Cytometry plays a critical role in all phases of drug development. 

很多临床实验设计将由生物标记驱动。而接下来的5年内，超过50%的生物医药公司将使用人工智能和机器学习(AI/ML)来加快药物开发的进程和成功率。

Biomarker driven clinical trial design

Estimated over 50% of pharma/biotech will implement AI/ML strategies in the next 5-years to accelerate development timeline and success rates. 

在这次会议上还有另外一个workshop是讨论人工智能和机器学习（AI/ML）在临床应用的最大的障碍. 提到的一些现有问题，包括现在已经有非常成熟的诊断手段和标准操作，没有AI解决方案的空间和需求等。但是AI 及机器学习自动化过程，有很多手动分析不能企及的优点，包括用标准化流程来减少手动的差异性，减少专业人士的工作量，并用自动化机器学习标准流程加快工作进程，进行快速的筛查，发现新的生物标记或预测性生物标记等。我们现在看到的AI在流式技术的应用只是冰山一角，未来的趋势正在向多组学平台/AI 方向发展，更智能化的神经网络深度学习更会大有用途。

关于中国流式小组【The Cytometry Society, China】

中国流式小组是国际流式学会（ISAC）协助组织；致力于凝聚中国流式人，构建交流沟通的学术平台，成为 中国和国际流式学术组织之间的连接窗口；开展流式学术会议及培训；宗旨是人人参与，人人受益，让它成为我们所有中国流式人自己的家。

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