血基因组DNA提取实验

2019/08/09   下载量: 0

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应用领域 医疗/卫生
检测样本 全血/血清/血浆
检测项目
参考标准 采用特殊的细胞裂解和蛋白去除液(包括蛋白酶K 裂解)从抗凝全血中得到基因组DNA。

血基因组DNA提取可用于:(1)从冻全血、血浆、血清、骨髓、其他体液、淋巴细胞、培养细胞、病毒和线粒体中提取DNA;(2)用于后续测序、遗传信息学等研究。

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血基因组DNA提取可用于:(1)从冻全血、血浆、血清、骨髓、其他体液、淋巴细胞、培养细胞、病毒和线粒体中提取DNA;(2)用于后续测序、遗传信息学等研究。

 

实验方式: 采用特殊的细胞裂解和蛋白去除液(包括蛋白酶K 裂解)从抗凝全血中得到基因组DNA

 

实验材料: 抗凝全血

 

试剂试剂盒: 血基因组DNA 试剂盒

 

仪器耗材: 96孔深孔板   96圆孔板   96DNA制备板  96圆孔硅胶片 BF-400

 

实验步骤:     

一、试剂盒组成、贮存、稳定性

 

1.  说明书,耗材:96孔深孔板(1.6 ml),96圆孔板,96DNA制备板,96圆孔硅胶片,BF-400膜。

 

2.  Proteinase K:冻干的蛋白酶K 可室温贮存6 个月,长时间保存请置于4℃;溶解后,在2-8℃可贮存2 个月,长时间保存请勿置于室温中。

 

3.  Buffer PK :蛋白酶K 溶解液,室温密闭贮存。

 

4.  Buffer BL :细胞裂解液,室温密闭贮存。

 

5.  Buffer W1B concentrate :洗涤液。使用前,根据瓶上数量加入乙醇,混合均匀,室温密闭贮存。可用百分百乙醇或95%乙醇。

 

6.  Buffer W2 concentrate :去盐液。使用前,根据瓶上数量加入乙醇,混合均匀,室温密闭贮存。可用百分百乙醇或95%乙醇。

 

7.  10xBuffer W212x96 试剂盒):用于配制Buffer W2

 

8.  Eluent B7.5 mM Tris-HClpH 8.50.3 mM EDTA ,室温密闭贮存。

 

二、实验准备

 

1.  第一次使用时,在Buffer W2 concentrate Buffer W1B concentrate 中按试剂瓶上指定的体积加入无水乙醇。

 

2.  Buffer W212x96 试剂盒)配制:在提供的500 ml 空瓶中加入15 ml 10xBuffer W2135 ml 去离子水和350 ml 乙醇,可用100%无水乙醇或95%乙醇。

 

3. 根据瓶上标签将蛋白酶K 溶解于Buffer PK 中,请勿旋涡振荡。

 

4. 准备70℃温浴。

 

5. 使用前检查Buffer BL 是否有沉淀析出,若出现沉淀,请于70℃温浴加热至沉淀完全溶解后再使用。

 

三、操作步骤

 

1.  96 圆孔板的每孔中加入20 ul 蛋白酶K

 

2.  200 ul 抗凝全血到96 圆孔板中。

 

* 若全血样品体积少于200 ul,用PBS 补充到200 ul

* 若样品为鸟类血,样品用量须低于10 ul

* 若需得到RNA-free 的基因组DNA,在步骤3 加入Buffer BL 前加入DNase-free RNase A(20 mg/ ml)

 

3.  200 ul Buffer BL ,注意不要打湿每孔的边缘,用96 圆孔硅胶片密封各孔。

 

4.  用力混合30 s

 

5. 3000 rpm 简短离心使96 圆孔硅胶片上的溶液到96圆孔板内。启动离心机,当速度达到3000rpm后即停止。

 

6. 在培养箱或烘箱中70℃温浴至少10 min

 

7.  3 000 rpm 简短离心使96 圆孔硅胶片上的溶液到96圆孔板内。启动离心机,当速度达到3 000rpm后即停止。

 

8. 取下96 圆孔硅胶片,每孔加入200 ul 乙醇(96-100%)。

 

9.  96 圆孔硅胶片密封各孔,用力混匀混合15 s3 000 rpm 简短离心使96 圆孔硅胶片上的溶液到圆孔板内。启动离心机,当速度达到3 000 rpm 后即停止。

 

10.  96 DNA 板放到一洁净的96 1.6 ml 深孔板。取下圆孔板上的96 圆孔硅胶片,将每孔中的溶液转移至96 DNA 板 中,6 000 rpm 离心4 min

 

11.  丢弃96 1.6 ml 深孔板的滤液,将96 DNA 板放回到96 1.6 ml 深孔板上,每孔加入500 ul Buffer W1B,用一新的BF-400 膜密封96 DNA 板,6 000 rpm 离心4 min

 

* 确认在Buffer W1B concentrate 中已按试剂瓶上的指定体积加入无水乙醇。

 

12.  丢弃96 1.6 ml 深孔板的滤液,将96 DNA 板放回到96 1.6 ml 深孔板上,每孔加入850 ul Buffer W2,用另一新 的BF-400膜密封96DNA板,6 000 rpm 离心4 min

 

* 确认在Buffer W2 concentrate 中已按试剂瓶上的指定体积加入无水乙醇。

 

13.  弃滤液,将96DNA板放回到961.6 ml 深孔板上,每孔加入400 ul Buffer W2, 用另一新的BF-400 膜密封96 DNA 板,6 000 rpm 离心4 min

 

14.  96DNA板放在一洁净的96 1.6 ml 深孔板上,用BF-400膜密封96DNA板,6 000 rpm离心15 min

 

15.  96DNA板放在另一洁净的96 1.6 ml 深孔板上,每孔加入100-200 ul Eluent B 或去离子水,室温静置2 min,用另一新的BF-400膜密封96 DNA板,6 000 rpm 离心4min洗脱得到DNA

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