采用GC/Q-TOF 进行蓝藻固碳突变体代谢组学研究

2018/06/15   下载量: 2

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应用领域 农/林/牧/渔
检测样本 渔业
检测项目 植物生理>代谢产物
参考标准 采用Agilent 7890B 气相色谱系统与Agilent 7200 GC/Q-TOF系统联用进行研究

气相色谱条件 色谱柱Agilent J&W DB-5MS 超高惰性色谱柱, 30 m × 0.25 mm,0.25 μm(部件号122-5532UI) 进样量1 μL 分流比10:1 分流/不分流进样口温度250 °C 柱温箱升温程序60 °C 保持1 min,以10 °C/min 的速率升至325 °C, 保持3.5 min 载气氦气,1 mL/min,恒流 传输线温度290 °C 质谱条件 电离模式EI 离子源温度230 °C 四极杆温度150 °C 质量数范围50 m/z 至800 m/z 谱图采集速率5 Hz,以棒状图和轮廓图两种模式采集

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摘要
使用非靶向代谢组学评估蓝藻细长聚球蓝细菌模型的突变体,从而对可实现蓝藻更高效生长的可能表型变化进行鉴定。采用Agilent 7200 系列GC/Q-TOF 分析突变体,通过Mass Profiler Professional 中的安捷伦通路结构软件分析代谢物谱的变化。本方法鉴定了多个代谢途径以及能够解释突变体改良表型的可能目标物。
前言
由于可用的化石燃料有限,而且排放的CO2 积累十分有害,因此人们对于工程菌生产可持续性替代燃料极为关注。蓝藻是一种光合二氧化碳固定微生物,因其具有以温室气体为碳源、以光为能源的功能而颇受青睐。然而蓝藻的产量很低,限制了大规模工业生产,因此为了使以蓝藻为基础的生物燃料经济可行,必须提高细胞生长速率[1]。之前的研究发现,碳固定是蓝藻生长的关键限制因素[2]。过去,人们试图通过定向改变来提高固碳速率,但收效甚微。因此,定向进化方法可能有助于鉴定之前未考虑过的有益代谢变化。

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