当Vayu Maini Rekdal一次使用微生物时,他做出了一个不错的酵母面包,那时,年轻的Maini Rekdal和大多数厨房新手一样没有考虑过这些微生物背后的关键化学反应。
而且更重要的是,这些面团穿过消化系统时,生活在肠道中的数万亿微生物帮助身体分解面包,吸收营养。由于人体不能消化某些物质,例如所有重要的纤维,因此需要依靠微生物完成化学反应。
“但这种微生物代谢也可能是有害的,”Maini Rekdal说,他现在是加州大学旧金山分校Emily Balskus教授实验室的研究生,在他作为一作者的一篇Science论文中,他们发现肠道微生物也可以“吃”药物,这会产生危险的副作用。 “也许这种药物不会达到它在体内的靶标,也许它会突然变得有毒,也许它会有所帮助,”Maini Rekdal说。
在这项新研究中,研究人员一次发现了微生物组如何干扰药物:我们体内的细菌会对帕金森病的主要治疗方法:左旋多巴(L-dopa)产生干扰,而且他们也们确定了数万亿种细菌中的哪些细菌负责降解药物,以及如何阻止这种微生物的干扰。
L-dopa进入人脑
帕金森病会攻击大脑中产生多巴胺的神经细胞,如果没有这种神经细胞,身体会出现震颤,肌肉僵硬以及平衡和协调问题。左旋多巴向大脑输送多巴胺以缓解症状。但只有大约1%到5%的药物真正到达大脑。
这个数字,也就是药物的疗效因患者而异。自20世纪60年代末发现左旋多巴以来,研究人员就已经知道人体的酶可以分解肠道中的左旋多巴,防止药物进入大脑。因此,制药行业引入了一种新药carbidopa,用以阻止不必要的左旋多巴代谢。这种治疗似乎有效。
“尽管如此,有很多新陈代谢是无法解释的,人与人之间的差异变化很大,”Maini Rekdal说。这种差异是一个问题:不仅一些患者对药物的反应较差,而且当L-dopa转化为大脑外的多巴胺时,有可能会引起副作用,包括严重的胃肠道失调和心律失常。如果较少的药物到达大脑,患者通常会加用药物剂量,这可能会加剧这些副作用。
Maini Rekdal怀疑微生物可能是L-dopa消失的原因。由于先前的研究表明抗生素可以改善患者对左旋多巴的反应,科学家推测细菌可能是罪魁祸首。尽管如此,没有人确定哪些细菌可能是有影响的,毕竟患者吃药的方式也可能有关系。
因此,他们展开了调查。
吃掉L-dopa的细菌
研究人员以人体微生物组项目作为参考,通过细菌DNA寻找哪些肠道微生物具有编码类似酶的基因。结果他们发现一种细菌:粪肠球菌(Enterococcus faecalis)可以“吃掉”吃掉所有L-dopa。
由此研究人员提出了一个将粪肠球菌、细菌酶(PLP依赖性酪氨酸脱羧酶或TyrDC)与L-dopa代谢相关联的有力证据。
然而,人体酶能将L-dopa转化为肠道中的多巴胺,但是新药carbidopa能阻止这个反应,那么为什么粪肠球菌酶依然逃脱了呢?
即使人类和细菌酶发挥完全相同的化学反应,但是细菌也还是有所不同。 Maini Rekdal推测carbidopa可能无法穿透微生物细胞,或者轻微的结构差异可能阻止药物与细菌酶相互作用。如果是真的,其他针对宿主的治疗可能与新药carbidopa对类似的微生物作用一样无效。
但原因可能无关紧要了。 研究人员已经发现了一种能够抑制细菌酶的分子。
“这种能分子关闭这种不必要的细菌代谢,而不会杀死细菌,”Maini Rekdal说。
而且研究人员还进一步解析了L-dopa代谢的第二步。在粪肠球菌将药物转化为多巴胺后,第二种生物将多巴胺转化为另一种化合物:间甲胺。
“所有这些都表明肠道微生物可能导致不同患者服用L-dopa副作用和疗效观察到的剧烈变异”。
但这种微生物干扰可能不限于L-dopa和帕金森病。他们下一步将探索我们的肠道还有哪些其它的影响,这种影响是好是坏。
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