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[align=center][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]上皮细胞[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]-[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]间充质转化[/color][/size][/font][/align][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]上皮细胞[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]-[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]间充质转化,是指上皮细胞转化为具有间质表型细胞的生物学过程,[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]在肿瘤的侵袭和转移等方面[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]具有[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]重要作用[/color][/size][/font][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#000000][31][/color][/size][/sup][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]。[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]经历[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]过程的细胞具有类似干细胞的特性,耐药性也随之增强[/color][/size][/font][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#000000][32][/color][/size][/sup][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]。研究发现,在乳腺癌的小鼠模型中,降低[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]snail[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]的表达,肺转移的发生显著减少[/color][/size][/font][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#000000][33][/color][/size][/sup][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]。胰腺癌、肺腺癌细胞在[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]过程后表现出更强的迁移和侵袭能力[/color][/size][/font][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#000000][34, 35][/color][/size][/sup][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]。[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]从[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]转录调控的角度看,[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]与非小细胞肺癌相比,人小细胞肺癌细胞系中[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]相关转录因子的表达量较高[/color][/size][/font][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#000000][36][/color][/size][/sup][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]。[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]Krohn[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]等人研究发现,[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]E[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]-cadherin[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]表达下调,[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]Vimentin[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]表达上调的贴壁的小细胞肺癌亚系[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]NCIH69V[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]具有更高的侵袭性[/color][/size][/font][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#000000][37][/color][/size][/sup][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]。在小细胞肺癌中,[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]与[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]PARP[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]抑制剂、顺铂、[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]Bcl-2[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]抑制剂等药物的耐药具有显著关联性。[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]E[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]-cadherin[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]表达量较高的小细胞肺癌对[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]Bcl-2[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]抑制剂具有更好的应答率[/color][/size][/font][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#000000][38][/color][/size][/sup][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]。[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]Contactin 1[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]通过诱导[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]过程调节小细胞肺癌聚乙二醇精氨酸酶的耐药性[/color][/size][/font][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#000000][39][/color][/size][/sup][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]。越来越多的研究证明,小细胞肺癌[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]过程受到多种通路的调节,促进小细胞肺癌细胞的增殖、侵袭和转移,并促进化疗的耐药性[/color][/size][/font][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#000000][40-44][/color][/size][/sup][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]。[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]指的是上皮细胞变成具备间质细胞形态和特性的细胞的[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]过程[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]。[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]在[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]的发生过程中[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000],[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]细胞丧失上皮表型[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000],[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]同时获得间质表型。[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]E-cadherin[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]水平下降可以导致细胞的粘附力降低[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000],[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]使细胞获得易于侵袭和转移的特性[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000],这[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]已经被认为是[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]最显著的特征。[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]在乳腺癌及宫颈癌中发现,[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]MSI1[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]促进肿瘤[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]过程[/color][/size][/font][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#000000][29][/color][/size][/sup][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]。通过[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]Western blot[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]技术检测[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]MSI1[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]低表达后[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]相关蛋白的表达情况。[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]如果[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]与对照相比,[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]H69[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]-sh[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]MSI1[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]组[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]N-cadherin[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]、[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]Vimentin[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]表达量下降,而[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]E-cadherin[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]表达量上升,表明[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]MSI1[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]低表达的[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]H69[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]细胞的[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]过程受到了抑制,减少了肿瘤转移的概率。[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]Wnt[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]信号通路能通过抑制[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]GSK3β[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000](糖原合成酶激酶[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]3β[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000],[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]glycogen synthase kinase -3β[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000])介导的磷酸化作用以及抑制胞质中的[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]β-catenin[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]降解等作用来诱发[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]转换[/color][/size][/font][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#000000][75][/color][/size][/sup][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]。[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]研究显示,抑制[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]Wnt[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]信号通路逆转非小细胞肺癌[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]过程[/color][/size][/font][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#000000][76][/color][/size][/sup][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000],而肿瘤干细胞[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]LGR5[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]通过活化[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]Wnt[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]通路促进神经胶质瘤[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]过程[/color][/size][/font][font='times new roman'][sup][size=16px][color=#000000][77][/color][/size][/sup][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]。参与[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]过程的信号通路还有:[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]TGF-β[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]、[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]Notch[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]、[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]SMAD[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]、[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]PI3K-AKT-MTOR[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]信号通路[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]等,其中涉及[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]MSI1[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]调节的信号通路。在人小细胞肺癌细胞系中,[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]MSI1[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]可能通过[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]Wnt[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]通路调节[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]EMT[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]过程,也可能通过其他通路协同作用,[/color][/size][/font][font='times new roman'][size=16px][color=#000000]具体机制仍需进一步关注与研究。[/color][/size][/font]
胆固醇稳态对机体正常的细胞和系统功能至关重要,胆固醇平衡失调是心血管疾病、神经退行性疾病和癌症等其他疾病的基础[1]。胆固醇代谢包括内源性胆固醇合成、吸收和排泄等环节。研究表明,胆固醇在体内不能被降解,有效排泄是维持其稳态的重要环节[2]。体内积累的胆固醇最终通过肠道以粪便消除胆固醇和胆汁酸的形式达到平衡,目前已知的胆固醇排泄途径包括了胆固醇逆转运(reverse cholesterol transport,RCT)途径和经肠胆固醇排泄(transintestinal cholesterol excretion,TICE)途径;前者是肝脏将胆固醇转化为胆汁酸后经肠排出,后者是由血直接经肠道分泌和排出血浆脂蛋白来源的胆固醇,二者交汇于肠道,因此,肠道在胆固醇稳态中发挥了重要作用[3-4]。调血脂治疗是防治体内高胆固醇含量诱导的相关疾病的有效方法,目前临床常用调血脂药物他汀类的作用是通过降低低密度脂蛋白胆固醇(low density lipoprotein cholesterol,LDL-C)以限制内源性胆固醇合成,从而防治心血管等疾病的发生发展,但其相关发病率和死亡率仅降低了30%[5]。这意味着需要更多策略来解决这个严重的公共卫生事件。 雷公藤红素(celastrol,CeT)是一种从传统中药雷公藤Tripterygium wilfordii Hook. f.中提取分离出的活性成分,具有抗炎、抗癌和抗动脉粥样硬化等多种药理活性[6],且具有良好的成药性,被《Cell》杂志列为最可能转化为现代药物的5种有潜力传统药物之一[7]。Zhang等[8]前期研究发现,体外有效成分为CeT的南蛇藤能够通过在促进RCT减少脂质蓄积方面具有积极作用,其机制主要是通过激活清除剂受体B类成员1(scavenger receptor class B member 1,SRB1)、ABC转运体和细胞色素P450家族7亚家族A成员1(cytochrome P450 family 7 subfamily A member 1,CYP7A1)途径促进胆固醇代谢。然而,有关CeT调控胆固醇代谢的作用机制探索尚不完善。此外,迄今为止,并无有关CeT通过调控肠道TICE途径介导胆固醇代谢的相关研究。因此,本研究采用网络药理学和系统生物学理论,通过构建“CeT-靶点-肠道胆固醇代谢”多层次网络,初步预测CeT调控肠上皮细胞胆固醇代谢的作用机制[9-10],并结合实验深入探讨和验证CeT调控肠上皮细胞胆固醇代谢的作用及机制,旨在为维持体内胆固醇稳态提供新的方向和理论依据。 1 材料 1.1 细胞 大鼠小肠隐窝上皮IEC-6细胞(批号ZQ0783)由中国科学院上海细胞库提供。 1.2 药品与试剂 CeT(批号C0869)购自美国Sigma公司;肝X受体α(liver X receptor α,LXRα)抑制剂GSK2033(批号HY-108688)、Bodipy荧光染色(批号HY-W090090)购自美国MCE公司;0.25%胰蛋白酶(批号PB180229)购自美国Hyclone公司;DMEM高糖完全培养基(批号ZQ-121)、DMEM基础培养基(批号09122)购自上海中乔新舟生物科技有限公司;磷酸酶抑制剂(批号CW2383S)、蛋白酶抑制剂(批号CW2200S)、BCA试剂盒(批号CW0014S)、SDS-PAGE试剂盒(批号CW0022S)、Loading buffer(批号CW0028S)液购自康为世纪生物科技股份有限公司;CCK-8试剂盒(批号C0037)、RIPA裂解液(批号P0013B)、ECL化学发光试剂盒(批号P0018S)购自碧云天生物技术股份有限公司;油红O染色试剂盒(批号G1262-4)购自北京索莱宝科技有限公司;PVDF膜(批号ISEQ00010)购自美国Millipore公司;兔抗三磷酸腺苷结合盒转运蛋白G5(adenosine triphosphate-binding cassette transporters G5,ABCG5)抗体(批号27722-1-AP)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)抗体(批号10494-1-AP)、山羊抗兔二抗(批号SA00001-2)购自美国Proteintech公司;兔抗ATP结合盒转运蛋白G8(ATP-binding cassette transporters G8,ABCG8)抗体(批号A01482-2)购自武汉博士德生物工程有限公司;兔抗NPC1样细胞内胆固醇转运蛋白1(NPC1 like intracellular cholesterol transporter 1,NPC1L1)抗体(批号PA5-116672)购自美国Thermo Fisher Scientific公司;兔抗LXRα抗体(批号ab41902)、DAPI染液(批号ab228549)购自英国Abcam公司。 1.3 仪器 ix 73型倒置荧光显微镜(日本Olympus公司);FC型酶标仪、Forma 3系列CO2培养箱、EVOS fl auto全自动荧光倒置荧光学显微镜(美国Thermo Fisher Scientific公司);ChemiDoc XRS+化学发光成像系统、Mini-PROTEAN Tetra蛋白电泳系统(美国Bio-Rad公司)。 2 方法 2.1 网络药理学研究 将PubChem(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)得到的CeT 3D结构导入PharmMapper(http://www. lilab-ecust.cn/pharmmapper/)进行药物靶点预测。通过NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)得到肠道和胆固醇代谢靶点。并与CeT靶点取交集得到共有靶点;通过STRING(https://STRING-db.org)进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络构建,并导入Cytoscape 3.9.1软件构建网络模型并分析;通过DAVID(https://david. ncifcrf.gov/)进行基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;利用PDB(https://www.rcsb.org/)筛选并下载分辨率小于0.25 nm的靶点的结晶复合式,结合上述得到的CeT 3D结构,采用Autodock进行分子对接,运用PyMol可视化处理。 2.2 实验验证 2.2.1 IEC-6细胞培养 IEC-6细胞用DMEM高糖完全培养基于37 ℃、5% CO2的恒温培养箱中常规培养。 2.2.2 CCK-8法检测细胞存活率 将对数生长期的IEC-6细胞接种于96孔板中,5×103个/孔。每孔加入100 μL含不同浓度(0.05、0.10、0.20、0.40、0.80 μmol/L)CeT的培养基,另设置加入无药物培养基的对照组,每组设置5个复孔,培养箱中培养24、48 h。每孔加入10 μL CCK-8试剂,于培养箱中孵育1~2 h后,采用酶标仪在450 nm处检测吸光度(A)值,计算细胞存活率。 细胞存活率=A给药/A对照 2.2.3 油红O染色评估CeT对肠上皮细胞胆固醇的影响 设置对照组、模型组和CeT(0.05、0.10、0.20 μmol/L)组,除对照组外,其余各组加入DMEM基本培养基配制的胆固醇胶束(cholesterol micelles, C-M,10 mmol/L)构建肠上皮细胞高胆固醇模型[11],给药组加入不同浓度的CeT溶液,对照组加入不含药物的培养基。干预24 h后,加入ORO Fixative固定液固定细胞;加入1 mL 60%异丙醇浸洗;加入油红O染液(ORO Stain A∶ORO Stain B=3∶2),洗涤至孔内无红色剩余;加入Mayer苏木素染色液,洗涤;加入油红O染液缓冲液;加入蒸馏水覆盖细胞并拍照,使用Image-Pro Plus软件以脂滴与整个图像的面积比进行定量。 2.2.4 Bodipy荧光标记法 按“2.2.3”项下方法进行分组和给药,干预24 h后,PBS洗涤,室温下多聚甲醛固定30 min;每孔加入2 μmol/L Bodipy染色液,于37 ℃细胞培养箱中孵育15 min;弃去染色液,PBS洗涤;DAPI复染核5 min,PBS洗涤;观察并拍照。使用Image-Pro Plus软件以荧光强度进行统计。 2.2.5 Western blotting检测TICE相关蛋白表达 按“2.2.3”项下方法进行分组和给药,干预24 h后,收集细胞;PBS洗涤后使用蛋白裂解液提取总蛋白质,BCA定量法测定蛋白质浓度。蛋白样品经十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳,转至PVDF膜,加入5%脱脂牛奶封闭3 h,用TBST洗涤后加入一抗,4 ℃孵育过夜;洗涤后加入二抗,室温孵育2 h;洗涤后进行显影,使用Image-Pro Plus软件分析条带灰度值。 2.2.6 免疫荧光检测LXRα/ABCG8和LXRα/ NPC1L1通路相关蛋白的影响 设置对照组、模型组、CeT(0.1 μmol/L)组、GSK2033(10 μmol/L)组和CeT+GSK2033组,除对照组外,其余各组加入DMEM基本培养基配制的胆固醇胶束(10 mmol/L)构建肠上皮细胞高胆固醇模型,各给药组加入相应药物,对照组加入不含药物的培养基。干预24 h后,PBS洗涤3次;4%多聚甲醛固定30 min,PBS洗涤3次后加入Trition X-100,室温下通透10 min;PBS洗涤3次后,加入免疫染色封闭液封闭60 min,吸去多余的牛血清白蛋白;分别滴加100 μL LXRα(1∶200)、ABCG8(1∶200)、NPC1L1(1∶200)一抗,4 ℃孵育过夜;回收一抗,PBS浸洗3次,滴加100 μL二抗(1∶300),室温避光孵育60 min;PBS洗涤3次,滴加DAPI复染核15 min,PBS洗涤3次;滴加抗淬灭剂10 μL,扣片,正面朝下盖在载玻片上,荧光显微镜下观察并拍照。使用Image-Pro Plus软件分析荧光强度。 2.2.7 统计学分析 采用GraphPad Prism 9.0和SPSS 26.0软件进行统计分析,数据以表示。两组间数据分布的正态性和方差齐性分别以Kolmogo? rov-Smirnov和Levene检验确定。组间均数比较采用t检验;多组间均数比较采用单因素方差分析,组间有差异进一步采用SNK-q检验进行两两比较。 3 结果 3.1 网络药理学研究 3.1.1 CeT-肠道胆固醇代谢靶点 通过TCMSP等数据库得到94个CeT相关靶点。通过NCBI Gene等数据库得到15 415个肠道相关靶点、14 177个胆固醇代谢相关靶点。并构建韦恩图预测CeT-肠道胆固醇代谢共有靶点,见图1。 图片 3.1.2 CeT-靶点-肠道胆固醇代谢网络构建 将PPI导入Cytoscape 3.8.1软件进行可视化,发现1个关键的子网络,见图2。 图片 3.1.3 CeT-肠道胆固醇代谢的GO功能富集分析 对CeT调控肠道胆固醇代谢的作用及机制进行GO富集分析,分别得到855个生物进程、17个细胞组成、53个分子功能,根据P<0.05,选出排名前10的条目,见图3。 图片 3.1.4 CeT-肠道胆固醇代谢的KEGG通路富集分析 CeT调控肠道胆固醇代谢的通路涉及34条,根据P<0.05,选出排名前10的通路,见图4。其中,主要涉及脂肪的消化和吸收、过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferators-activated receptor,PPAR)等信号通路。其中,肠道脂质代谢的关键通路(fat digestion and absorption)的靶点(ABCG5、ABCG8、NPC1L1)主要涉及CeT-靶点-肠道胆固醇代谢网络的关键网络之一(图5)。并且该网络主要涉及胆固醇排泄的关键途径——TICE途径。 图片 图片 3.2 分子对接分析 CeT与NR1H3(LXRα)结合能为?28.131 4 kJ/mol,可视化显示,匹配度良好,化合物与靶点结合的最优构象以氢键的方式呈现,结合活性良好,见图6。 图片 3.3 体外实验研究 3.3.1 CeT浓度筛选 不同浓度(0.05、0.1、0.2、0.4、0.8 μmol/L)的CeT分别干预IEC-6细胞24、48 h后,如图7所示,干预24 h时随着CeT浓度的增加细胞存活率降低,CeT的半数抑制浓度(half inhibitory concentration,IC50)为0.2 μmol/L。本研究在探索CeT安全浓度调控IEC-6细胞胆固醇代谢活性的同时,为了更进一步研究CeT在IC50时是否较安全浓度的效果更好,因此,选择0.05、0.10、0.20 μmol/L的CeT处理细胞24 h进行后续研究。 图片 3.3.2 CeT对IEC-6细胞内脂质的影响 如图8所示,油红O染色与Bodipy荧光标记结果均显示,与对照组比较,胆固醇胶束干预显著增加脂滴染色和荧光强度(P<0.001),表明造模成功;与模型组比较,各剂量CeT均显著抑制IEC-6细胞中脂质积累(P<0.05、0.01、0.001)。 图片 3.3.3 CeT对TICE途径关键蛋白的影响 NPC1L1是胆固醇吸收的重要蛋白,ABCG5/G8与胆固醇流出密切相关。如图9所示,与对照组比较,模型组NPC1L1蛋白表达水平显著升高(P<0.05),ABCG5和ABCG8蛋白表达水平显著降低(P<0.05、0.01);与模型组比较,CeT(0.2 μmol/L)组NPC1L1蛋白表达水平显著降低(P<0.05),CeT(0.1、0.2 μmol/L)组ABCG5和ABCG8蛋白表达水平显著升高(P<0.05、0.01)。因此,CeT可能通过抑制NPC1L1,促进ABCG5、ABCG8的表达,调控TICE途径介导的胆固醇摄取和流出。 图片 3.3.4 LXRα是CeT调控TICE途径的关键蛋白 如图10所示,与对照组比较,模型组LXRα、ABCG8表达显著降低(P<0.01),NPC1L1表达显著增加(P<0.001);与模型组比较,CeT组LXRα、ABCG8表达显著增加(P<0.001),NPC1L1表达显著降低(P<0.01),LXRα抑制剂GSK2033组ABCG8表达显著降低(P<0.01),NPC1L1表达显著增加(P<0.05);与CeT组比较,CeT+GSK2033组LXRα、ABCG8表达显著降低(P<0.01),NPC1L1表达显著增加(P<0.01)。因此,CeT可能通过促进LXRα的表达,调控TICE途径中的关键蛋白NPC1L1、ABCG8介导的胆固醇摄取和流出。 图片 4 讨论 胆固醇广泛存在于机体中,具有广泛的生理作用,是组织细胞中不可缺少的重要物质,它不仅参与细胞膜的形成,也是合成胆汁酸、维生素D及甾体激素的重要原料,但当其过量时便会导致高胆固醇血症,研究表明,心血管疾病、胆石症和肿瘤与高胆固醇血症密切相关[12-13]。胆固醇在体内不能被降解,机体有效排泄胆固醇是维持胆固醇稳态的重要环节[2]。因此,促进体内胆固醇排泄以维持体内胆固醇的动态平衡可能是治疗胆固醇失衡相关疾病的新策略。 基于此,本研究通过网络药理学方法,探讨CeT通过调控肠上皮细胞胆固醇代谢的潜在靶点及相关机制。PPI网络发现,CeT调控肠上皮细胞胆固醇代谢涉及1个核心子网络。其中,ABCG5/8与NPC1L1为胆固醇摄取与流出相关的核心靶点。本研究通过体外构建和模拟肠上皮细胞高胆固醇环境,探索CeT调控肠上皮细胞胆固醇代谢的机制,油红O和Bodipy结果均显示,CeT能够呈浓度相关性地降低胆固醇胶束干预的肠上皮细胞内的脂质积蓄。进一步通过结合KEGG通路分析发现,该子网络中的核心靶点与肠道脂质代谢的关键通路(fat digestion and absorption)相匹配,通过深度分析该通路发现,其主要涉及肠上皮细胞摄取与流出胆固醇中的TICE途径。已有研究表明,胆固醇从体内排出的唯一途径是通过粪便直接排出或转化为胆汁酸后排出,粪便排泄可通过2种独立途径进行,第1种途径是胆汁分泌,该途径已被广泛描述和研究。第2种途径是通过TICE途径[14]。在2009年Van团队初步研究估计,TICE对野生型小鼠体内排出的粪便中性固醇总量的贡献约为30%[15]。接下来,该团队在2010年通过实验得出在小鼠中TICE途径占粪便中性甾醇排泄的70%[16]。在人体生理情况下,TICE途径排泄的胆固醇占粪便胆固醇排泄总量的35%[2,17]。TICE指由血直接经肠道分泌和排出血浆脂蛋白来源的胆固醇。包括肝源性含载脂蛋白B的脂蛋白被基底膜侧低密度脂蛋白受体(low density lipoprotein receptor,LDLR)和其他可能受体吸收、内化,最终通过ABCG5/G8以及其他可能的转运体从顶端膜流出排泄到肠腔[18]。另有研究发现,利用Ezetimibe抑制NPC1L1介导的胆固醇摄取可显著增强TICE途径[2]。而本研究表明,CeT干预处于高胆固醇环境中的肠上皮细胞后,NPC1L1被抑制,而ABCG5、ABCG8被激活。提示,CeT主要通过抑制NPC1L1减少肠上皮细胞胆固醇摄取和促进ABCG5、ABCG8增加胆固醇流出。 LXRα由于其抗动脉粥样硬化、去除胆固醇和抗炎活性,在胆固醇稳态的转录调控中发挥极其关键作用[19]。研究发现,LXRα可调控NPC1L1在肠上皮细胞中的表达,降低肠道胆固醇的吸收[20]。此外,ABCG5和ABCG8是LXRα的直接靶基因,常形成异二聚体ABCG5/G8发挥作用,负责将细胞内胆固醇泵入肠腔并最终通过粪便排出体外[21]。PPI子网络表明,NPC1L1、ABCG5以及ABCG8主要由LXRα交联。因此,在上述研究的基础上,通过分子对接模拟了CeT与LXRα的对接模式,结合活性良好。采用LXRα抑制剂GSK2033处理,结果显示,NPC1L1和ABCG5/G8主要受LXRα调控。提示,CeT可能通过LXRα/ABCG5/ABCG8和LXRα/ NPC1L1途径分别介导IEC-6细胞胆固醇摄取和流出,进而促进TICE途径介导的胆固醇排泄。 本研究通过网络药理学和相关实验发现,CeT可能通过抑制肠上皮细胞胆固醇摄取和促进胆固醇流出维持机体胆固醇稳态,这一效应与核心靶点LXRα密切相关,本研究拓展了CeT调控体内胆固醇代谢的机制,为维持体内胆固醇稳态和胆固醇失衡相关疾病的新药研发提供了新思路。
糖尿病肾病(DN)是糖尿病(DM)最常见且严重的微血管病变之一,常伴有肾小球硬化和肾小管间质纤维化,最终可发展为终末期肾脏病(ESRD),严重危及生命。西医治疗DN主要以降糖、降压、调脂、抗感染为主,但这些手段仍难以阻止炎症反应与肾纤维化的发生,且存在一定的局限性及不良反应,因此,探寻行之有效的DN防治策略,提高治疗水平迫在眉睫[1-3]。中医药根据辨证分型对DN进行治疗已有上千年的历史,对其记载可追溯至《黄帝内经》之“消瘅”及“消渴病”继发的“虚劳、水肿、尿浊、关格、肾劳”等,可通过调节代谢、自噬、抗氧化、抗炎、抗纤维化等机制,对DN进行多靶点调控治疗。在改善DN客观指标、保护肾功能及远期疗效方面,中医药都显示出了独特的优势[4-5]。 黄芪六一汤始载于《太平惠民和剂局方》,由黄芪60 g、甘草10 g组成,具有大补肺气、滋益肾水、调和脾胃的功效[6]。课题组前期发现[7-11],由黄芪六一汤提取、分离出来的黄芪总皂苷、黄芪总黄酮、黄芪多糖、甘草酸所组成的黄芪六一汤组分(简称“HQD”)具有防治DN、显著改善肾功能的作用。并鉴定出HQD中6个主要原型入血成分(黄芪甲苷、毛蕊异黄酮葡萄糖苷、毛蕊异黄酮、芒柄花素、芒柄花苷、甘草酸)。然而,HQD作为中药复杂化学成分的混合体,其在体内发挥抗DN药效的分子作用机制尚不完全明确,制约了其深层次开发利用。 网络药理学能高效整合中药、成分和靶点之间关系,构建中药-成分-靶点网络,诠释药物与疾病之间的复杂关系,为中药及其复方作用机制研究提供了行之有效的新方法[12-13]。故本实验首先采用网络药理学技术对HQD抗DN的机制进行探索,发现HQD发挥药理作用可能与细胞自噬缺陷有关。据报道[14-15],自噬缺陷可导致肾小管上皮细胞的损伤,而激活自噬能够减轻这一损伤从而保护肾功能。根据药效学及网络药理学实验结果,推测HQD发挥抗糖尿病肾病的作用机制可能和肾小管上皮细胞自噬水平失调有关,为验证推测结果,本研究从细胞自噬角度出发,采用DN大鼠模型对筛选出的核心通路进行验证,以期为黄芪六一汤及中药复方的分子作用机制研究及深层次开发提供创新思路与借鉴。 1 材料 1.1 仪器 EnVision酶标仪(PerkinElmer);H1-16KR台式高速冷冻离心机(湖南可成仪器设备有限公司);Rayto全自动生化分析仪(Chemray 800);Tissuelyser-24L多样品组织研磨仪(上海净信实业发展有限公司);三诺血糖仪(长沙三诺生物传感技术有限公司);Multiskan FC酶标仪(Thermo Scientific);免染蛋白印迹系统(ChemiDooTM)、蛋白快速转印仪(Trans-Blot Turbo)、胶凝成像系统(GBOXChemiXL1.4)均购自美国Bio-rad公司;电泳仪(PowerPacBasic)、核酸蛋白紫外检测仪(Biomate 3S)、垂直电泳槽,均购自美国Thermo公司;纯水超纯水机(四川优普超纯科技有限公司);透射电子显微镜(日本电子JEOL)生物显微镜(麦克奥迪实业集团有限公司);台式高速微量离心机(大龙兴创实验仪器北京股份);超薄切片机(LEICA);组织脱水机(LEICA)。 1.2 试药 黄芪(批号220604、211104、220901,四川盛世锦荣药业有限公司)、甘草(批号201024、200306、220805,四川盛世锦荣药业有限公司),黄芪、甘草经贵州中医药大学谢军丽讲师鉴定分别为豆科植物膜荚黄芪 Astragalus membranaceus(Fisch.)Bge.的干燥根、豆科植物甘草Glycyrrhiza uralensis Fisch.干燥根和根茎。细胞凋亡检测试剂盒(货号E-CK-A322,Elabscience),DAPI(货号C1002,上海碧云天生物技术有限公司),抗荧光淬灭封片剂(货号0100-01,southernbiotech),苏木素(货号H9627,Sigma);二甲苯(货号10023418)、包埋石蜡(货号69019361)、伊红Y(水溶性,货号71014544)、中性树胶(货号10004160)均购于中国医药集团有限公司;肌酐(Scr,货号C074-d)、尿素氮(BUN,货号C010-a)、总胆固醇(TC,货号C048-a)、三酰甘油(TG,货号C019-a)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C,货号C047-a)检测试剂盒均购于长春汇力生物科技有限公司;尿蛋白测试试剂盒(货号C035-2,南京建成生物工程研究所),RIPA裂解液、PMSF、蛋白酶抑制剂、磷酸化蛋白酶抑制剂、BCA蛋白定量试剂盒、1xTBST 缓冲液、5x蛋白上样缓冲液、β-actin 兔多克隆抗体(货号AC230205001)均购于武汉塞维尔生物科技有限公司;mTOR(货号66888-1-lg)、Beclin 1(货号66665-1-lg)、p-mTOR(货号66882-1-lg)、HRP标记的羊抗鼠 IgG(货号SA00001-2)、HRP标记的羊抗兔 IgG(货号20000373)鼠单克隆抗体均购于武汉Proteintech有限公司;LC3α/β(货号R10241506)、PI3K(货号N09263380)、Akt(货号M04201652)兔多克隆抗体购于沈阳万类生物科技有限公司,链脲佐菌素(STZ,索莱宝生物有限公司,批号2230520002)。 根据本课题组前期确定的HQD制备工艺[10],按照原处方黄芪与甘草6∶1比例,取符合药典标准的黄芪饮片12 kg和甘草饮片2 kg,制备得质量分数为72.04%的黄芪总皂苷干浸膏76.02 g(含黄芪甲苷2.69%);质量分数为70.03 %的黄芪总黄酮干浸膏31.64 g(含毛蕊异黄酮葡萄糖苷1.72%、毛蕊异黄酮1.52%、芒柄花苷0.94%、芒柄花素0.31%);质量分数为67.12%的黄芪总多糖干浸膏185.04 g,质量分数为80.05%的甘草酸精制品22.01 g。将上述制备所得黄芪总皂苷、黄芪总黄酮、黄芪多糖干浸膏与甘草酸精制品全部混合均匀,即得本实验所需HQD样品。 1.3 实验动物 SPF级雄性SD大鼠35只,体质量(300.00±10.82)g,购自长沙市天勤生物技术有限公司,实验动物生产许可证号SCXK(湘)2022-0011,饲养于通风良好,室温18~25 ℃,相对湿度50%~70%,按常规定期消毒的动物房。按每笼4只分装,由专人饲养管理,自由饮水及饲料,实验操作和处理严格遵循国际准则。 2 方法 2.1 HQD抗DN的药效实验 2.1.1 DN模型大鼠的制备 大鼠适应性喂养1周后,选取8只作为对照组,对照组大鼠喂食普通饲料。其余大鼠高糖高脂饲料喂养2周,尾iv STZ(溶于pH 4.5,0.01 molL-1无菌柠檬酸钠缓冲液)33 mgkg-1,注射4周后测定空腹血糖(FBG)及24 h尿蛋白(24 h U-Alb)含量,以FBG≥11.1 mmolL-1[16-17],肾组织出现病变为造模成功。其中,24只大鼠造模成功,3只血糖低于11.1 mmolL-1,无死亡大鼠。 2.1.2 分组及给药 将造模成功大鼠随机分为模型组,HQD高、低剂量给药组,每组8只。以黄芪六一汤临床生药用量(黄芪60 g、甘草10 g)的4倍、1倍剂量,换算本实验的HQD高剂量(0.66 gkg-1)与低剂量(0.17 gkg-1)。按照给药剂量,每日固定时间ig 1次,对照组与模型组ig等量的0.9%氯化钠溶液,连续给药8周。 2.1.3 各组大鼠相关生化指标检测 实验期间观察各组大鼠活动情况、精神状态、毛色、进食、饮水量及排泄量状况等。末次给药后,代谢笼收集24 h尿液并记录尿量(禁食不禁水),1 400 rmin-1离心5 min,收集上清。尾静脉采血测FBG,于腹主动脉取血,4 ℃下3 000 rmin-1离心15 min,收集上清。取血后断颈处死各组大鼠,取肾脏,除去被膜,部分肾组织用于病理学、细胞凋亡等检测,其余组织于-20 ℃保存备用。采用全自动生化分析仪,检测血清Scr、BUN、TG、TC、LDL-C水平。按照尿蛋白定量测试盒说明书操作测定尿总蛋白。 2.1.4 肾脏组织病理学观察 取上述部分肾脏置于4%多聚甲醛中固定,蒸馏水冲洗,将组织包裹在石蜡块中,组织脱水,浸蜡、包埋、切片、烤片、切片脱蜡,HE染色、Masson染色,封片,光镜下观察肾脏组织病理学改变。 2.1.5 TUNEL检测细胞凋亡情况 取肾组织石蜡切片进行脱蜡、水化,以蛋白酶K工作液在25℃下消化组织15 min,PBS漂洗,按照说明书对切片进行TUNEL染色,荧光显微镜下观察采集图像,计算细胞凋亡率。 2.1.6 数据统计分析 所有数据以±s表示,统计分析采用SPSS 27单因素方差分析,P<0.05为差异有统计学意义。 2.2 网络药理学研究 2.2.1 活性成分靶点预测 以HQD中6个主要原型入血成分(黄芪甲苷、毛蕊异黄酮葡萄糖苷、毛蕊异黄酮、芒柄花素、芒柄花苷、甘草酸)为研究对象。采用PubChem数据库 (https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)下载活性成分的SDF格式,将其导入SwissTargetPrediction 数据库(http://swisstargetprediction.ch/)进行活性成分的靶点预测。剔除重复靶点,获取与6个活性成分相关的靶点。通过UniProt数据库 (https://www.uniprot.org/)将得到的活性成分靶点蛋白名称进行标准化。 2.2.2 DN的靶点预测 通过GeneCard(https://www.genecards.org/)、DisGeNET(https://www. disgenet.org/)和OMIM(https://omim.org/)数据库以“Diabetic nephropathy”为关键词进行检索,剔除重复得到疾病靶点,并用Venny工具将6个活性成分的作用靶点与DN靶点进行交集比对,得到其共同作用的靶点作为6个活性成分治疗DN的潜在靶点。 2.2.3 蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络的构建 为了进一步明确HQD治疗DN预测靶点之间的直接或间接调控关系,将潜在靶点导入STRING数据库(https://string-db.org/)中构建PPI网络,限定物种为“Homo sapiens”,为了具有高置信度,设置minimum required interaction score≥0.9,并隐藏游离蛋白,以TSV格式保存结果,将其导入可视化的Cytoscape 3.6.0软件进行拓扑分析,筛选得到核心靶点。 2.2.4 基因本体(GO)注释及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析 将交集靶点导入Metascape(http://metascape.org/gp/index.html),进行GO功能富集分析;将交集靶点导入KOBAS 3.0数据库(http://kobas.cbi. pku.edu. cn/ kobas3/genelist/),进行KEGG通路富集分析。下载分析结果,将其分别按P值和“Count”(每条通路中含有的潜在基因靶点的数量)值的大小进行排序。 2.3 实验验证网络药理学预测结果 2.3.1 透射电镜观察肾小管上皮细胞中自噬体及自噬溶酶体的形成 取“2.1.3项”下对照组、模型组、HQD高剂量给药组大鼠部分肾组织约1 cm3,经3%戊二醛预固定24 h左右,1%四氧化锇再固定2 h;依次加入30%、50%、70%、80%、95%、100%的丙酮溶液进行逐级脱水,每次20 min;脱水后,采用丙酮和Epon812包埋剂对其进行渗透和包埋;采用超薄切片机制备60~90 nm的超薄切片;并以醋酸铀避光染色10~15 min,再用柠檬酸铅避二氧化碳染色1~10 min,超纯水清洗3次,滤纸吸干、室温干燥过夜后,采用JEM-1400FLASH透射电镜对各组肾组织中的肾小管上皮细胞外形及其中的自噬体及自噬溶酶体进行观察。 2.3.2 Western blotting检测肾脏组织中自噬相关蛋白及磷脂酰肌醇-3-激酶/丝氨酸苏氨酸蛋白激酶/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(PI3K/Akt/mTOR)信号通路关键蛋白的表达 随机从对照组、模型组、HQD高剂量给药组选取3只大鼠的肾组织,加入含蛋白酶和磷酸化酶抑制剂的RIPA裂解液,冰上匀浆,裂解1 h后,12 000 rmin-1离心10 min,收集上清液;BCA法测定总蛋白浓度。每孔以20 μg蛋白上样,100 V电泳,100 V湿转;5%的脱脂牛奶封闭2 h,加入Beclin-1、LC3Ⅱ/Ⅰ一抗(1∶1 000),4 ℃孵育过夜,加入二抗(1∶10 000)室温孵育1 h,显色曝光。扫描胶片,分析胶片灰度值。考察HQD对肾组织中Beclin-1、LC3Ⅱ/Ⅰ、PI3K、Akt、mTOR及p-mTOR蛋白表达的影响。 3 结果 3.1 HQD抗DN的药效实验 3.1.1 各组大鼠相关生化指标检测 结果见图1。对照组大鼠精神状态良好,饮食、饮水与大小便正常,皮毛有光泽,体质量逐渐增加。模型组大鼠呈明显的多饮、多尿、多食、体质量下降等糖尿病“三多一少”症状,后期出现不同程度的体毛暗淡、稀疏、精神萎靡,反应迟钝症状。与对照组比较,模型组大鼠FBG、Scr、BUN、TG、TC、LDL-C、24 h U-Alb显著升高(P<0.01);与模型组比较,HQD高剂量组均能显著降低上述药效指标(P<0.05、0.01);低剂量组FBG、Scr、BUN、TG、24 h U-Alb显著降低(P<0.05、0.01)。 3.1.2 肾脏组织病理学观察 HE染色结果显示,细胞核呈蓝色,细胞浆、肌纤维、胶原纤维和红细胞呈不同程度的红色。对照组肾小球结构清晰,肾小球系膜区未见明显改变。模型组大鼠肾小球系膜基质增宽、增多,基底膜弥漫增厚,肾小囊腔狭窄,肾小球体积增大。HQD给药组大鼠肾小球系膜轻度增生,肾组织损伤情况较模型组明显减轻,见图2。 Masson染色结果显示,胶原纤维、黏液、软骨呈蓝色,肌肉、胞浆、纤维素、红细胞呈红色,胞核呈蓝黑色。主要用于区分肌纤维和胶原纤维。与模型组相比,HQD给药组大鼠的肾纤维化程度较轻,见图3。 3.1.3 TUNEL检测细胞凋亡情况 荧光显微镜下组织切片上凋亡的细胞呈红色荧光,细胞核呈蓝色荧光。每个样品选取3个高倍视野(400倍),每个高倍视野计数各视野总细胞数,同时计数各视野的凋亡阳性细胞。结果见图4。与对照组比较,模型组细胞凋亡率明显上升(P<0.01);而HQD高、低剂量组细胞凋亡率显著下降(P<0.05)。 3.2 网络药理学研究 3.2.1 潜在靶点 通过检索SwissTargetPrediction得到各个活性成分所对应的靶点基因共600个,去掉重复的244个,剩余356个靶点。通过GeneCard、DisGeNET和OMIM 数据库共获得1 480个与DN相关的靶点,通过制作韦恩图分析,得到114个药物-疾病共同靶点作为活性成分治疗DN的潜在靶点,见图5。 3.2.2 潜在靶点的PPI网络分析 为了获得有关潜在靶点交互作用的信息,将114个潜在靶点上传到STRING平台,进行PPI网络分析,结果见图6。并将结果的TSV文件导入Cytoscape 3.6.0 进行可视化和拓扑分析,PPI网络包括102个节点和451条边,选择“度”(degree)、“介数中心性”(betweenness centrality)和“接近中心性”(closeness centrality)高于中位数的靶点作为关键目标,首次筛选值为degree>6,betweenness centrality>0.003 836 8,closeness centrality>0.413 800 8,筛选后,获得了一个包含41个节点和258条边的新网络;随后筛选值为degree>10,betweenness centrality>0.007 837 44,closeness centrality>0.571 428 57,获得包含19个节点和107条边的中心网络;为了在PPI网络中找到最关键的目标,最后一次筛选值为degree>11,betweenness cenTrality>0.014 000 41,closeness centrality>0.72,筛选获得STAT3、EGFR、VEGFA、JUN、TNF、AKT1、CASP3、mTOR及IL2作为PPI网络中的核心靶点,见图7。其中,mTOR是调节自噬的关键激酶,抑制mTOR可促进自噬。 3.2.3 GO分析和KEGG分析 将114个交集靶点导入Metascape平台进行GO富集分析,共获得 1 581条结果,包含1 388条生物过程(BP)结果,122条分子功能(MF)结果,71条细胞组成(CC)结果,分别选取显著丰富的前15个结果进行可视化处理,见图8。BP主要对激素的反应、MAPK级联调节、细胞对氮化合物的反应、细胞对有机氮化合物的反应和蛋白质磷酸化的正调控等;CC主要涉及膜筏(membrane raft)、膜微区(membrane microdomain)、细胞外基质(extracellular matrix)、膜面(side of membrane)和囊泡腔(vesicle lumen)等;MF主要涉及激酶结合(kinase binding)、蛋白激酶结合(protein kinase binding)、激酶活性(kinase activity)、内肽酶活性(endopeptidase activity)和蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性(protein serine/threonine kinase activity)等。表明HQD治疗DN的机制涉及多种生物学过程,体现多重治疗作用。 使用KOBAS3.0共检索到235条富集通路,选取P<0.001的结果,获得147条显著富集通路,并按“Count” 值由高到低排列,选取前20条通路作为核心通路进行展示,见图9。显示6个成分治疗DN的靶点主要涉及癌症通路、癌症中的蛋白多糖、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路和糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路等信号通路,其中PI3K-Akt信号通路、MAPK通路均与自噬调控相关。与上述“3.2.2 ”项下PPI网络分析得出的“HQD核心作用靶点”进行联合分析后,选择对自噬经典通路PI3K/Akt/mTOR进行验证。 3.3 实验验证 3.3.1 透射电镜观察肾小管上皮细胞中自噬体及自噬溶酶体的形成 结果见图10。检测自噬的金标准是电镜下可观察到结构完整的自噬体及自噬溶媒体。采用透射电镜观察对照组、模型组、HQD高剂量组大鼠肾小管上皮细胞中自噬体及自噬溶酶体的数量。结果显示,对照组肾小管上皮细胞形态结构较正常;细胞核呈椭圆形或类圆形,核仁明显;线粒体呈圆形、椭圆形或长梭形,嵴排列较紧密,胞浆中可见大量溶酶体、自噬溶酶体和空泡。模型组肾小管上皮细胞形态结构出现明显异常。细胞核呈类圆形或椭圆形,核仁明显;线粒体发生肿胀,仅可见少量残留嵴结构,基质颗粒大量丢失;胞浆中自噬溶酶体数量较对照组明显降低。HQD高剂量组肾小管上皮细胞形态结构轻度异常。细胞核呈类椭圆形或类圆形,核仁明显;部分线粒体轻度肿胀,嵴溶解断裂,基质颗粒减少;胞浆中自噬溶酶体及自噬小体数量较模型组有所增加,溶酶体与自噬小体融合较好。 3.3.2 Western blotting检测肾脏组织中自噬相关蛋白Beclin-1、LC3Ⅱ/Ⅰ及PI3K/Akt/mTOR信号通路关键蛋白的表达 结果见图11。与对照组比,模型组PI3K、Akt、mTOR、p-mTOR蛋白表达水平显著升高;Beclin-1、LC3Ⅱ/Ⅰ蛋白表达水平显著降低(P<0.01)。与模型组比,HQD高剂量给药组PI3K、Akt、mTOR、p-mTOR蛋白表达水平显著降低;Beclin-1、LC3Ⅱ/Ⅰ蛋白表达水平显著升高(P<0.05、0.01)。 4 讨论 自噬是真核细胞的一种自我保护机制,也是细胞内蛋白质降解的主要途径之一。自噬活性正常时,细胞能够及时降解自噬小体内包裹的受损细胞器、侵入的病原体及衰老的蛋白质等,以维持细胞稳态、能量生成及细胞器的更新[19-20]。研究表明[21-23],DN发生时,肾脏存在显著的自噬失调。自噬缺陷可导致肾小管上皮细胞的损伤,激活自噬能够减轻这一损伤从而保护肾功能。恢复自噬活性可能成为保护肾脏免受高糖损伤的一种新的治疗选择,有望成为防治DN的新靶点。 课题组前期已鉴定出HQD中6个主要原型入血成分(黄芪甲苷、毛蕊异黄酮葡萄糖苷、毛蕊异黄酮、芒柄花素、芒柄花苷、甘草酸)。文献报道[24-28],黄芪甲苷可通过激活AMPK/eNOS信号通路,改善大鼠糖尿病肾损伤;毛蕊异黄酮葡萄糖苷具有保护血管内皮细胞的作用,能延缓DN患者的血管病变;毛蕊异黄酮能通过调节NF-κB/p65/NLRP3/TXNIP炎症小体信号通路延缓DN的发展;芒柄花素可通过调节Sirt1/PGC-1α通路减轻DN大鼠的肾小管及线粒体损伤;芒柄花苷能通过降低氧化应激和炎症标志物减轻链脲佐菌素诱导的DN大鼠模型的肾损伤;甘草酸能通过调节SNARK/AMPK信号通路保护高糖诱导的肾小球足细胞损伤。然而, HQD在体内发挥抗DN药效作用的分子机制尚不完全明确,限制了其深层次研究。网络药理学能基于中药多靶点效应,从生物信息学上整体分析在HQD治疗DN上所涉及的靶点及信号通路。故本实验以HQD中6个主要原型入血成分为研究对象,采用网络药理学方法对HQD作用靶点及信号通路进行预测,并将114个潜在靶点进行了PPI分析,发现HQD可能主要作用于STAT3、EGFR、VEGFA、JUN、TNF、AKT1、CASP3、mTOR及IL2等核心靶点。其中,mTOR是调控自噬的重要因子。mTOR是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白酶,是磷脂酰肌醇3激酶的相关激酶(PIKK),mTOR复合体是调节细胞自噬的关键分子之一,可作为多条信号通路的中间环节参与细胞自噬调节过程,并影响自噬标志性蛋白LC3的表达。mTOR可与其他调控蛋白相互作用至少形成两个不同的复合物,分别是mTOR复合物1(mTORC1)和复合物2(mTORC2)。虽然这两个复合物含有相同的催化亚基——TOR,但均可磷酸化不同的下游靶点,从而显示出不同的细胞功能。抑制mTOR可促进自噬,响胰岛素抵抗和炎性反应[29-30]。因此,调控mTOR不同的上游信号通路可能是治疗DN的一个新思路。 KEGG通路功能富集分析显示,HQD可能通过作用于癌症通路、癌症中的蛋白多糖、PI3K-Akt信号通路、MAPK等信号通路发挥药理作用。其中PI3K/Akt/mTOR通路为自噬调控的经典通路,通路活化后可激活mTORC1抑制细胞自噬过程[31]。据报道[32],Beclin-1、LC3蛋白参与自噬小体的形成与自噬溶酶体降解过程,是经典的自噬标志物。自噬小体的减少会导致Beclin-1和LC3Ⅱ/Ⅰ的表达水平降低,而激活Beclin-1和LC3Ⅱ/Ⅰ表达可诱导细胞发生自噬。故本项目选择对经典自噬调控通路PI3K/Akt/mTOR进行验证,并进一步考察HQD对自噬标志蛋白Beclin-1和LC3Ⅱ/Ⅰ的调节作用。Western blotting结果表明,HQD可以上调肾组织自噬相关蛋白Beclin-1、LC3Ⅱ/Ⅰ表达,抑制PI3K/Akt通路活化,抑制mTOR的激活;透射电镜观察显示,HQD可以增加肾小管上皮细胞自噬体及自噬溶酶体数量。研究结