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  • Cell:让癌细胞“沉默”
    研究人员发现可以通过靶向一些分子,令癌细胞进入沉默状态 所有类型的癌症中一种最常见的突变基因就是 p53 基因。然而不幸的是这种基因很难用药物直接靶向。 近期一个由 Weill Cornell 医学院Lewis Cantley博士等人领导的多机构研究团队发现了一个酶家族,对于 p53 遗传突变的癌症发生至关重要。利用新型药物靶向这些酶,也许能阻止 p53 突变的癌症生长,从而惠及大量的肿瘤患者,包括乳腺癌,卵巢癌,肺癌,大肠癌和脑瘤患者。 这一研究成果公布在11月7日的Cell杂志上,研究人员指出当细胞丢失 p53 的时候,两种细胞内的酶:II型磷脂酰肌醇-5-磷酸- 4 -激酶 &alpha 和 &beta (II型 PIP激酶) 就成为了癌细胞生长所必不可少的元素,&ldquo 超过一半的癌症失去了 p53 这个基因,令这些癌症肆无忌惮的生长。&rdquo 研究人员发现, II型PIP激酶对于是正常细胞的生长并不重要,但是对于 p53 突变或丢失的细胞生长却必不可少。科学家在动物实验和人类癌细胞实验室研究中发现,靶向这些分子能有效地关闭 p53 突变癌症的增长。 虽然这项研究是在人类乳腺癌细胞中进行的,但研究人员相信II型PIP激酶抑制剂能阻断与 p53 基因突变或缺失有关癌症的生长。 &ldquo 在正常人体细胞或小鼠中剔除II型PIP激酶基本上不会影响细胞的存活,这表明这些酶抑制剂毒性并不大,&rdquo 文章通讯作者,Weill Cornell 医学院Cantley博士说。 Cantley博士等人正在努力开发能关闭这些激酶的药物,&ldquo 研发II型PIP激酶抑制剂也许能逆转 p53 突变的癌症, &rdquo 他说。 关键关联 Cantley博士是著名的细胞生物学家、生物化学家,他的主要贡献是对PI-3激酶的酶的发现和研究,这对了解癌症和糖尿病十分重要。2013年获生命科学突破奖。 PI 3 -激酶( PI3K )与多种细胞功能有关,比如细胞生长和增殖,大多数癌症是通过一个或多个机制激活 PI3K 。Cantley博士的发现有助于个性化癌症疗法的发展。 PI3K 的活性在某些情况下与II型PIP激酶有关,因此在这项研究中,Cantley博士希望能理解这些酶的功能。研究人员知道乳腺癌的一个亚型能表达这些分子,由此他们在更具侵袭性的肿瘤:HER2阳性乳腺癌中寻找这些酶的作用。 结果研究人员发现这种酶在具有健康 p53 的细胞中是沉默的, p53 的关键作用之一就是&ldquo 拯救&rdquo 产生过量活性氧(ROS)的细胞,ROS 是细胞增长过快的副产品。ROS 引起的氧化应激会破坏细胞结构,因此 p53 努力减少受影响细胞内的 ROS 。&ldquo 但是,如果ROS水平超过了 p53 的处理能力,那么 p53 就会启动第二个功能&mdash &mdash 杀死细胞, &rdquo Cantley博士说。 &ldquo 这就是为什么癌细胞需要剔除 p53 基因,如果 p53 基因突变或消失,那么细胞就能保持一个非常高的速度进行增长, &rdquo 他说,&ldquo 然后 ROS 开始损伤基因,令癌症更加具有侵袭性。 &rdquo II型PIP激酶是 p53 的备份救援系统,但它们只会在确保细胞不会死亡的基础上减少 ROS。 (过多的ROS也会杀死细胞)。 这也就是说癌细胞变得&ldquo 依赖于这些激酶才能生长, &rdquo Cantley说。
  • Nature重磅:“饿死”癌细胞,又添新线索
    近年来,随着国家工业化、城市化迅速发展,随之而来的环境污染以及人口老龄化加剧,导致我国癌症发病率持续上升。  2020 年全球最新癌症负担数据显示,2020 年全球新增癌症病例 1929 万例,其中中国新增癌症病例 457 万例,占到了全球的 23.7%。 同时,由于目前人们健康意识普遍较低,癌症筛查不到位,我国绝大多数癌症患者确诊时已处于晚期,治疗方案有限,预后较差。2020 年中国癌症死亡人数更是突破了 300 万。因此,亟需研发新的治疗,来改善癌症患者生存。  近日,美国麻省理工科赫综合癌症研究所 Matthew G. Vander Heiden 博士带领的研究团队和丹娜-法伯癌症研究中心的科研人员合作,在小鼠研究中发现,脂肪含量高、碳水化合物含量低的饮食,可以抑制小鼠肿瘤生长。  同时,研究人员还找到了其中的具体机制,癌细胞需要脂肪构建细胞膜,当组织中没有脂肪时,癌细胞可以通过 SCD 酶来将饱和脂肪酸转化为不饱和脂肪酸供癌细胞利用。而生酮饮食和热量限制饮食均可抑制 SCD 酶活性,但生酮饮食会同时提供大量的脂肪。相比之下,热量限制饮食既减少了脂肪含量,又抑制了 SCD 酶活性,从而会使得肿瘤生长显著减慢。  相关研究成果,发表在最新一期的顶级期刊 Nature 杂志上。  对此,本文主要作者麻省理工科赫综合癌症研究所 Evan C. Lien 博士表示,“热量限制不仅会使肿瘤缺少脂肪而饿死,还会抑制 SCD 酶,损害癌细胞对此的适应过程。这两个机制的结合可以显著抑制肿瘤生长。”  “不过,本研究的目的并不是推荐饮食,而是真正了解潜在的生物学机制。本研究揭示了热量限制饮食如何抑制癌细胞生长的机制,为未来新药的研发提供了方向。例如,改变癌症患者饮食中不饱和脂肪酸的比例,同时开发新药抑制 SCD 酶活性,或许是一个不错的方向。”  限制糖摄入“饿死”癌细胞,不太靠谱  众所周知,我们身体的其他正常细胞在分裂增殖到一定次数后,就会停止分裂增殖,体内的细胞逐渐衰老、减少,最终影响器官组织的功能,导致衰老和与衰老有关疾病。  而癌细胞是一种生长增殖非常快速,且可以无限分裂增殖的细胞,理论上只要有足够的营养和适合的环境,癌细胞可以无限制的生长。正是因为癌细胞生长速度快,消耗营养多,所以很多晚期癌症患者会出现消瘦现象。  因此,早在几十年前美国国家科学院院士、美国国家科学院医学研究中心院士、肿瘤血管新生理论之父 Folkman 教授就曾提出“饿死”癌细胞这一设想。简单来说,就是通过切断癌细胞血液和营养供应,来抑制癌细胞增殖。随后,众多科学家在这个方向上进行了大量的探索。  (来源:University of Missouri)  随后的研究发现,癌细胞在生长增殖过程中需要消耗大量的葡萄糖。因此,德国的生物学家约翰内斯• 科伊博士在《抗癌饮食》一书中表示,通过调整饮食,降低糖的摄入,长期依赖葡萄糖糖为营养的癌细胞,在持续的低糖饮食下会快速死亡。  那么,“饿死”癌细胞真的这么简单吗?  答案显然是否定的,约翰内斯• 科伊博士严重低估了癌细胞的能力。后续一系列的研究表明,葡萄糖并不是癌细胞唯一的能量来源。例如,2019 年的时候,来自加州大学洛杉矶分校的 Heather Christofk 和 Bill Lowry 等人就发现,癌细胞在葡萄糖缺乏的时候可以改变代谢方式利用谷氨酰胺提供能量。  不仅如此,对于中晚期,特别是晚期癌症患者,由于经过化疗、手术等一系列的治疗方案后,往往会处于一种营养不良状态,导致患者免疫能力下降。此时,限制患者葡萄糖摄入,不但患者无法忍受,相应的治疗无法完成,还会导致患者免疫力进一步下降,病情迅速恶化而死亡。所以临床上经常要求癌症患者吃高营养、高热量、易消化的食物,就是保证患者治疗过程中体质不过度下降。  因此,单纯从葡萄糖利用角度“饿死”癌细胞是不明智的。  限制脂肪摄入“饿死”癌细胞,或许可行  虽然大量研究表明,癌细胞在没有葡萄糖的情况下,可以改变代谢方式充分利用其他物质供能,仍旧可以快速生长,但是,近年来一系列的证据表明,饮食干预的确可以帮助减缓肿瘤生长。  生酮饮食和热量限制饮食是目前临床上癌症患者经常关心的两种饮食模式。  所谓生酮饮食就是少吃主食多吃脂肪和蛋白质的饮食模式,这种情况下人体会改变代谢利用酮体而不是葡萄糖供能,因此被称为生酮饮食。  (图注:生酮饮食(来源:Epilepsy Foundation))  同样地,所谓能量限制饮食,就是将每顿饭摄入的能量按正常标准减少 25%-50%。初步研究显示,在某些情况下,能量限制饮食或生酮饮食可能可以延长小鼠和其他多种生物的寿命。  那么,饮食干预是如何限制肿瘤生长的呢?为了弄清楚其中的原因,Vander Heiden 博士带领的研究团队在小鼠体内对生酮饮食以及热量限制饮食进行了研究,试图揭示饮食控制抑制癌细胞生长的奥秘。  通过胰腺癌小鼠模型的初步饮食干预,研究人员发现,相比于生酮饮食,热量限制饮食对肿瘤的抑制作用要大的多。  (图注:热量限制饮食(CR),而不是生酮饮食(KD),能够移植肿瘤的生长(来源:Nature)  随后,通过对小鼠胰腺肿瘤组织生长速度和各种营养物质浓度进行系统分析,研究人员发现,相比于正常饮食小时,热量限制饮食和生酮饮食小鼠中葡萄糖浓度均明显下降。不过热量限制饮食小鼠血脂水平也明显下降,但是生酮饮食小鼠血脂水平明显上升。)  这意味着,葡萄糖水平的降低对于癌细胞生长的抑制没有起到很明显的作用。相反,脂肪水平的变化或许是癌细胞生长抑制的关键。  由于癌细胞在增殖过程中需要脂肪来构建细胞膜,因此脂肪水平下降理论上是可以抑制癌细胞增殖的。不过,一般情况下,组织脂肪耗竭时,癌细胞可以通过硬脂酰辅酶 A 去饱和酶(SCD)将饱和脂肪酸转化为不饱和脂肪酸,从而加以利用。  在实验过程中,研究人员也发现,热量限制饮食和生酮饮食均可降低 SCD 酶活性,但是生酮饮食可以为小鼠提供脂肪,而热量限制饮食无法为小鼠提供足够的脂肪,因此肿瘤生长显著减慢。  最后,研究人员还对人类的数据进行了分析,以探索饮食模式和胰腺癌患者生存的关系,结果发现不同类型脂肪摄入似乎也会影响低糖饮食胰腺癌患者的生存。  总的来说,这一研究表明,热量限制饮食可以通过抑制 SCD 酶活性,降低肿瘤组织脂肪含量来抑制肿瘤生长,可能对癌症患者有利。  但是研究人员表示,他们不建议癌症患者使用热量限制饮食,以免产生不良反应。不过,针对 SCD 酶和肿瘤组织脂肪依耐性开发新的药物或许是一个更好的方向。
  • 可分离血液中癌细胞的生物芯片问世
    据澳大利亚广播公司日前报道,澳大利亚科研团队发明了一种可分离血液中癌细胞的生物芯片,能甄别出血液中的癌细胞并将其移除。该技术可大幅降低癌症治疗费用,有望延长患者生命。 澳大利亚新南威尔士大学的一个科研团队研发的这种生物芯片,在一个名为“癌症透析”的设备中过滤血液,甄别并移除癌细胞。该团队研发这种芯片的初衷,是想寻找一种较便宜且痛苦较少的癌症诊断方法。 团队负责人马吉德瓦尔基阿尼博士称,人类癌症中99%的癌症是实体瘤,而进入人体外周血(除骨髓之外的血液)循环的癌细胞会随着血液转移,扩散到身体其他部位。根据癌细胞比健康细胞大,代谢较旺盛的特点,医生将混有健康细胞和癌细胞的血液放入生物芯片中,在液体压力的影响下,较大的癌细胞和较小的健康细胞分别进入不同的出口,成功分离。 该芯片还能大幅降低与癌症相关的治疗成本。据了解,澳大利亚进行肿瘤检测的扫描费约700澳元(约合3229元人民币),而用这种芯片检测血液中癌细胞的成本仅为50到100澳元(约合230元至460元人民币)。 此外,该技术或能延长癌症患者的生命。有医生建议,如果能制作大型芯片,癌症患者的血液就如同接受肾透析一样得到“清洗”。将分离了癌细胞的血液重新输回患者体内,也避免了因输入他人血液造成的免疫反应。对于癌症早期患者,可通过这种技术降低癌症转移扩散的几率。

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  • 科学家发现癌细胞不死原因

    【西班牙《国家报》1 0月26日报道】巴塞罗那瓦尔德希伯伦大学附属医院的一个研究小组日前宣布,确认了癌细胞的一种基因物质能够使恶性肿瘤不老化并失控地增殖。   玛蒂尔德·列奥纳特医生领导的这项研究成果刊登在《医学研究评论》杂志上。研究报告指出,小核糖核酸(m icroARNs)对细胞不死发挥了突出的作用。  核糖核酸在蛋白质的生成过程中起到重要作用,但此前对小核糖核酸的功用实际上并不了解。最新研究表明,小核糖核酸与另一种遗传物质之间相互作用,阻断或激活细胞的增殖过程。瓦尔德希伯伦大学的研究小组已经确认了28种能使癌细胞继续增殖的小核糖核酸。研究人员认为,对这些小核糖核酸采取行动会为阻止甚至消除癌细胞的这种特性打开大门,是在抗击癌症方面的一大显著进步。癌细胞会不停地分裂和增殖,而健康细胞能够进行40-60次分裂,然后就停止分裂,最终死亡。  癌细胞的有害之处正是其不老化的能力,这种能力使其成为一种不死组织,因为它在不会自我消灭的同时还毫无控制地成倍增加。新研究成果确认了造成这种不死特性的小核糖核酸,便于今后研究出一种能够阻断这种能力,让癌细胞像健康细胞一样老化和自我毁灭的机制。 (来源: 新华国际)

  • 世界最快速相机可用于探测“流氓”癌细胞

    http://photocdn.sohu.com/20120710/Img347740451.jpg 加州大学洛杉矶分校的工程师们开发了一种全新的光学显微镜,显微镜上配备了世界上最快速的相机,可用于探测“流氓”癌细胞。  【搜狐科学消息】据国外媒体报道,美国加州大学洛杉矶分校(UCLA)的工程师们近日研制出了一款世界上最快速的相机,可用于探测难以捉摸的“流氓”癌细胞。这一科研成果的研究报告发表在了最新一期的《美国国家科学院院刊》上。  从大量各类正常细胞中识别和分离出一些罕见细胞对于某些疾病的早期发现、监测和治疗来说正在变得越来越重要。这些罕见细胞中,在体内自由移动的癌细胞就是一个很好的例子。通常情况下,在10亿个健康细胞中也只有一小撮癌细胞,然而它们会抢先转移,癌细胞扩散导致癌症患者的死亡率高达约90%。这样的“流氓”细胞除了癌细胞以外,还包括用于再生医学的干细胞及其它类型的细胞。不幸的是,检测这样的细胞是很困难的。要取得良好的统计准确性需要一台自动化、高通量的仪器,可以在相当短的时间内对数以百万计的细胞进行检测。配备了数码相机的显微镜是目前分析细胞的唯一设备,但是该设备对于这项研究来说速度显得太慢了。  现在,美国加州大学洛杉矶分校(UCLA)的工程师们开发了一种全新的光学显微镜,可以让这项艰巨的任务变得轻松许多。加州大学洛杉矶分校电气工程学院的工程师巴赫拉姆•贾拉利(Bahram Jalali)说:“为了抓拍到这些难以捉摸的细胞,相机必须具备在非常高的帧速率下持续捕获并对数百万张图像进行数字化处理的能力。传统的CCD和CMOS摄像头达不到这样的速度和灵敏度,因为从像素阵列读取数据需要时间,它们在速度极快的情况下对光变得不那么敏感。”  目前的流式细胞仪具有较高的通量,但是因为它依靠单点的光散射而不是拍照,在检测非常罕见的细胞类型时还不够灵敏,比如对于那些目前处于早期阶段或癌细胞转移前的癌症患者不适用。为了克服这些限制,巴赫拉姆•贾拉利和UCLA的的生物工程学副教授迪诺•迪•卡罗( Dino Di Carlo)领导的一个包括生物技术、光学、高速电子和微流体的跨学科研究团队开发出了高通量流式光学显微镜,这款显微镜非常灵敏,具备实时探测含量为百万分之一的罕见细胞的能力。  贾拉利的团队以他们在2009年创建的光子时间飞梭相机技术为基础,研制出了世界上最快的连续运行的相机。贾拉利、迪•卡罗和他们的同事在报告中描述了他们如何将这台相机与先进的微流体和实时图像处理技术进行整合,以对血液样本中的细胞进行分类。新的血液筛查技术每秒可筛查10万个细胞,比传统的基于成像的血液分析仪高出约100倍的通量。迪•卡罗说:“这项科研成果需要与一些尖端技术进行整合,通过生物工程部门、电气工程部门和加州纳米技术研究院的合作,并采用了UCLA细胞诊断学部门开发的重要的技术基础设施。”贾拉利和迪•卡罗均是加州大学洛杉矶分校的加州纳米技术研究院的成员。  他们的研究演示了如何实时辨别血液中罕见的乳腺癌癌细胞。初步结果表明,这种新技术有可能迅速地在大量血液中检测到极稀少的循环癌细胞,并将提高癌症早期检测、监测药物和放射治疗的效率。加州大学洛杉矶分校的电气工程和生物工程的项目经理本田惠介(Keisuke Goda)说:“这项技术可以大大减少错误,并将降低医疗诊断成本。”  研究人员通过将实验室生长的癌细胞与模拟现实生活中的病人的不同比例的血液进行混合得到了检测结果。加州纳米技术研究院的一名成员格达(Goda)说:“为了进一步验证该技术的临床应用效果,我们目前正在与临床医生合作进行临床试验。这项技术也将可能用于进行尿液分析、水质监测和相关的应用。”(尚力)

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  • 赛多利斯Incucyte 实时活细胞分析系统,可有效捕获培养箱中细胞的变化。系统支持高分辨率荧光和明场图像采集,能够实现数小时、数天或数周内数据的实时记录。系统使用灵活,从增殖分析到肿瘤球免疫杀伤检测,均可协助用户实时观察和定量复杂的生物变化。集成式软件可以简化数据分析,快速获得结果,并生成可供发表的图表和绘图。 Incucyte SX5 实时活细胞分析仪更多色彩,更多发现,更多可能 配备了专利光学组件的全新 Incucyte SX5可以更加深入地分析每个样本的信息。专为活细胞分析设计的颜色多达 5 种,功能更强大。该仪器具有更多通道,可以使用更多试剂。采用专门定制的软件,适用于更多应用领域。帮助您深入了解更多细胞生理学的相关信息。为活细胞分析赋能从每个样本获取更多信息,探索更多应用。支持多达五个不同的荧光通道( 同时可使用三个) 进行长时程活细胞实验。加速实现研究目标通过一个平台,即可完成复杂的免疫- 肿瘤细胞相互作用、神经元共培养突触活动、癌细胞代谢等研究。保护宝贵细胞样本三色光学模块正在申请专利,包括长波长、低光毒性NIR 通道,以及专为长期活细胞试验而设计的试剂。提高生产力最多可并行使用六个微孔板,自动获取并分析图像,为您提供远程控制便利。 关键功能 专为活细胞分析设计- 多达 5 个不同的荧光通道- 每次可同时使用 HD 相位和多达 3 个荧光通道 ( 绿色 /橙色/ 近红外)- 新三色光学模块包含一个长波长,低光毒性 NIR 通道和适用于完整应用的优化试剂- 自动式转台配备 4x、10x 和 20x 物镜支持多个用户- 配备支持 3 个可互换容器的托盘以及 600 多个容器- 最多可以同时放置 6 个微孔板- 通过远程网络访问和无使用限制的许可证,可无缝支持多用户使用 广泛应用 细胞健康与增殖增殖与细胞计数细胞周期细胞凋亡细胞毒作用细胞活性线粒体膜电位 新增!ATP 代谢 新增!细胞功能免疫细胞杀伤抗体内化免疫细胞化学吞噬作用神经突动力学神经元活动血管新生三维细胞建模肿瘤球生长与活性肿瘤球侵袭类器官QC 新增!细胞运动与形态趋化性迁移和侵袭划痕迁移和侵袭
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  • timsTOF SCP—— 拓展单细胞研究视野timsTOF SCP 专为无偏深度 4D-定量单细胞蛋白组学、免疫肽组学、表观蛋白质组学和翻译后修饰组学( PTM )设计,和 scRNA-seq 技术形成补充,从而拓展单细胞研究的视野。重新定义单细胞蛋白质组学 —— 发现真正的蛋白质组异质性拓展单细胞研究视野超高灵敏度:开创性的新的离子源几何设计,让离子传输效率提高 5 倍,并带来更高的稳定性。数据更完整:数据非依赖性采集 —— 平行累积连续碎列( dia-PASEF )超越定量重复性的极限,为大规模研究细胞异质性铺平道路。超快采集速度:高采集速度与 dia-PASEF 灵敏度相结合,可采用短色谱梯度进行样本分析,从而减少极低的样本量分析时的色谱稀释效应。更稳定:经过双正交反射后,离子再进入捕集离子淌度谱( TIMS )中,连续分析数千个样本也无需仪器的清洗。重新定义单细胞蛋白质组学先进的离子透镜和 PASEF 技术,可从单个细胞中发现细胞异质性和生物学特性基于质谱的蛋白质组学已成为现代研究理解生物功能和疾病机制的主要工具。健康或疾病组织看起来是同质的,但其蛋白质组是非常不同的。破解每个细胞中的蛋白组的差异( 细胞异质性 )是充分理解其功能的关键。timsTOF SCP 采用了一个全新改进的离子源概念,结合平行积累连续碎裂( PASEF )采集方法的优势,提供了极高的速度和灵敏度,以应对单细胞的蛋白组或后几个细胞的翻译后修饰的分析挑战。开创性的离子传输技术发现真正的蛋白质组异质性timsTOF SCP 采用经过改进的离子源几何设计,包括 1 毫米离子传输毛细管可将离子传输提升五倍,更高压力级的离子漏斗和八级真空系统。更大的离子传输毛细管带来超高灵敏度,额外的正交离子反射和高压离子漏斗,提供独立的、差分真空系统,依然维持了 timsTOF 仪器系列所固有的系统稳定性。蛋白质组学性能的显著提升timsTOF SCP 全新的设计提高了离子在离子源里的传输,更高的真空度维持了仪器的稳定性,这些改进让离子传输提升近 5 倍。当与以 100 nL/min 流速运行的 Evosep One Whisper 方法和 dia-PASEF 方法相结合时,Evosep One 的灵敏度比以前的高流速方法提高了约 100 倍,这使得单细胞水平的无偏蛋白质组学具有非常好的重现性和稳定性,并首次实现每个细胞覆盖约 1,500 种蛋白质。双 TIMS,CCS 支持的分析捕集离子淌度谱( TIMS )首先是前级的气相分离技术,在高性能液相色谱(HPLC)和质谱分离的基础上,离子淌度带来的额外的一个维度分离,降低了样品的复杂离,提高了峰容量和分析的可靠性。同样重要的是,TIMS 还对特定质量和淌度值的离子进行累积和聚焦,从而实现灵敏度和速度的独特提升。通过双 TIMS 技术,前部 TIMS 进行离子累积的同时,后部 TIMS 跟据离子淌度对离子进行释放,这样的设计可以实现近 100% 的离子利用率。这个过程也即为碰撞横截面( CCS )辅助的平行累积连续碎裂( PASEF )分析。支持 CCS 的分析为数据进一步的分析提供了很多的可能性,从更可靠的化合物鉴定到更可靠的数据库比对,以及的更大确定性到自信的库匹配,以及降低大型数据集中的误发现率( false discovery rates,FDRs )。免疫肽组学和其它富集工作流程的理想检测工具除了无偏真单细胞蛋白质组学应用外,timsTOF SCP 还提供了出色的灵敏度,可用于一些需要进行肽段富集的工作流程,比如免疫肽组学研究就需求从血浆或组织中纯化免疫肽开始。由于免疫多肽在这些样本中以相对较低的丰度存在,timsTOF SCP 是理想的免疫肽组学分析,在可用材料有限的情况下进行新生抗原发现,比如生物活检的样本。timsTOF SCP 突破性的灵敏度还可用于在癌症信号通路的研究中的磷酸化蛋白质组学研究。PASEF肽段离子通过捕集离子淌度谱( TIMS ) 分离,洗脱( ~ 100 ms ),并在四极杆飞行时间质谱( QTOF )上进行检测,生成 TIMS MS 热图。在 PASEF 方法中,相同的 TIMS 分离后的离子又通过四极杆对特定离子进行逐一隔离。母离子和碎片离子谱图按离子淌度值进行对齐。平行积累序列碎片( PASEF )技术实现了 120 Hz 的扫描速度, 使用 PASEF 通过多次选择低丰度肽来提高低丰度肽的 MS/MS 谱图质量。PASEF :鸟枪法蛋白质组学的完美选择由 PASEF 驱动的 timsTOF SCP 提供 120 Hz 的扫描速度,而不会牺牲灵敏度或分辨率,这是通过四极杆筛选离子和碰撞池中的离子碎裂与 TIMS 中肽段离子包释放保持同步而实现的。PaSER Run & Done —— 无偏单细胞分析数据的实时质量控制imsTOF SCP 可以以超过 120 Hz 的扫描速度,对数百个微量样本( 200 ng )进行分析。这改变了蛋白质组学的研究方式,但增加的数据量对数据分析提出了新的要求。数据分析已经成为许多工作流程中常见的瓶颈。现代分析方法经常需要在 timsTOF SCP上生成数百个数据,布鲁克已经推出的实时数据库搜索功能 —— 实时并行数据库搜索引擎( PaSER ),从而消除了这一障碍,使用 PaSER, LC-MS 运行一旦完成,结果就即使呈现 —— 也就是 “ Run & Done ”。MaxQuant/Perseus 和 PEAKS Studio 数据处理开放式数据格式允许研究人员直接使用原始数据,并使用自己选择的先进软件。MaxQuant 软件通过保留时间、离子淌度、质量和信号强度来提取 4 维( 4D )特征。这有利于肽、蛋白质和翻译后修饰的鉴定和定量。PEAKS Studio 将 de novo 测序与传统数据库搜索相结合,并对 timsTOF 原始数据的处理进行了优化。超高灵敏度的 dia-PASEF 加持的 4D-蛋白质组学CCS 支持的分析使鉴定更可靠timsControl 允许针对感兴趣的离子进行 dia-PASEF 窗口的自定义,并能调整质量隔离窗口,TIMS 的扫描范围,和循环时间,以使 dia-PASEF 方法适应不同的色谱方法有趣的离子。结合 Evosep One 系统的低流速方法与 timsTOF SCP 高灵敏度的 dia-PASEF 方法,可从 500pg 细胞消化液内鉴定出超过 2,000 个蛋白质,从 250pg 的细胞被鉴定出超过 1,500 个蛋白质。这展示了真正的单细胞蛋白质组学所需的灵敏度。从 250pg 中鉴定出的蛋白质的丰度范围约为 4 个数量级,可以在单细胞水平上进行蛋白质组定量分析。探索肿瘤微环境理解 TME 及其浸润性免疫细胞可被认为是影响疾病进展、治疗反应和患者生存的关键步骤。凭借其高灵敏度,timsTOF SCP 能够在 FFPE 组织样本的激光捕获显微切割( LMD )获得的细胞上获得足够的蛋白质组深度。典型的工作流如图所示。在 timsTOF SCP 仪器上,细胞标记物用于识别肿块中的黑色素瘤癌细胞和那些与基质密切相关的细胞,随后通过 LMD 对这两个群体分割,然后进行无偏 4D-蛋白质组学分析。关键发现:富集分析揭示了中枢和外周黑色素瘤细胞之间的差异调控蛋白,有可能进行疾病分型以指导临床决策。结果由 Matthias Mann 教授提供。
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  • Maestro Z/ZHT--细胞增殖、毒性与活性检测仪应用案例:FTH高表达可促进肝癌细胞增殖 肝细胞癌 (HCC) 是最常见的原发性肝癌类型,目前对于HCC晚期患者来说,有效的治疗方法很少。与其他类型癌症(如乳腺癌、非小细胞肺癌和胰腺癌)相似,HCC 细胞富含铁并且容易发生铁死亡——这是近期发现的一种由于铁过载引发脂质过氧化物的异常积累所致的程序性细胞死亡类型。一些证据表明,铁蛋白重链(下文简称为FTH)是一种由 FTH1 基因编码的亚铁氧化酶,起到了调控铁死亡的作用。但FTH在HCC的铁死亡抗性中的机制尚不清楚。 为了探索FTH是如何影响肝癌细胞生长的,来自浙江省人民医院的杜静团队使用 Axion Maestro Z细胞无损实时检测系统对过表达FTH的癌细胞进行活细胞分析,发现其相比对照组,展现出更快的增殖速度。 A, B分别为HCC-LM3, MHCC97H的对照组及FTH过表达组细胞增殖曲线 实时无标记的阻抗数据表明,无论HCC-LM3(人高转移肝癌细胞)还是MHCC97H(人肝癌细胞),在过表达FTH(图3A, B中OE-FTH组)后增殖速度都会变快。这说明在不同的肝癌细胞谱系中FTH的过表达均会促进细胞的增殖。◆ ◆ ◆ ◆实时无标记真阻抗细胞动态检测仪◆ ◆ ◆ ◆PART I 什么是真阻抗细胞检测 阻抗指贴附细胞对检测电流所起的阻碍作用。Maestro Z的真阻抗技术采用不同频率的交流电来检测细胞的阻抗变化。该技术不但可以检测因细胞数量变化导致的阻抗变化,还能实时检测因细胞形态、通透性变化而导致的细微阻抗变化。PART II Maestro Z的特点一体化设计 该仪器无需额外占用培养箱空间。专门设计的样本仓可以屏蔽外界电磁和机械噪音,避免培养箱开关门等额外操作导致检测结果偏差。真阻抗检测技术 该平台延续了Axion BioSystems公司成熟的高信噪比电生理检测技术,采用不同频率交流电,可用来检测细胞细微阻抗变化。友好易用的软件 操作软件提供实时数据记录,自动数据分析,自动数据报告生成。除此之外,还提供自动扣除本底,Nomalization等高阶数据分析,免除繁琐的手工计算。软件还符合FDA 21 CFR Part 11条款,兼容企业在GXP方面合规要求。数据安全性 自带数据储存,无惧电脑宕机,确保重要数据安全。PART III 应用方向简介 样本类型:悬浮细胞,贴壁细胞,3D培养细胞,类器官等 实时记录细胞增殖、凋亡过程,建立专属功能档案细胞毒性动态研究癌细胞浸润、迁移能力,划痕实验癌症免疫疗法,肿瘤免疫学,细胞治疗病毒学研究跨内皮/上皮细胞电阻(TEER)研究G蛋白偶联受体(GPCR),信号通路研究细胞愈合能力测试想要了解更详细特点,快来联系我们吧! Axion BioSystems ImagineExploreDiscover
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  • 人乳腺癌细胞(通过STR鉴定)
    人乳腺癌细胞(通过STR鉴定) 一、细胞简介平台编号:bio-73188拉丁属名:ZR-75-1细胞名称:人乳腺癌细胞种属:人 年龄(性别):女 组织来源:乳腺癌 生长特性:贴壁 细胞形态:上皮细胞样 背景描述:ZR-75-1细胞产生高水平的黏液素MUC-1 mRNA,低水平的MUC-2 mRNA,但不表达MUC-3基因;ZR-75-1细胞表达雌激素受体。 生长培养基:RPMI-1640(货号:PM150110)+10% FBS(货号:164210-500)+1% P/S(货号:PB180120) 培养条件:气相:空气,95%;CO2,5% 温度:37℃细胞用途:仅供科研使用。注意事项:仅用于科学研究或者工业应用等非医疗目的,不可用于人类或动物的临床诊断或治疗,非药用,非食用。 二、细胞接受后的处理方法1)收到细胞后,请检查是否漏液,如果漏液,请拍照片发给我们。2)请先在显微镜下确认细胞生长状态,去掉封口膜并将T25瓶置于37℃培养约2-3h。3)弃去T25瓶中的培养基,添加6ml新的完全培养基。4)如果细胞长满(80%-90%)请及时进行细胞传代。5)接到细胞次日,请检查细胞是否污染,若发现污染或疑似污染,请及时与我们取得联系。 三、ZR-75-1人乳腺癌细胞培养步骤1、培养基及培养冻存条件准备:1)准备RPMI-1640培养基;优质胎牛血清,10%;添加0.01mg/ml胰岛素;双抗,1%。2)培养条件: 气相:空气,95%;二氧化碳,5%。 温度:37摄氏度,培养箱湿度为70%-80%。3)冻存液:90%血清,10%DMSO,现用现配。 2、细胞处理:1)复苏细胞:将含有1mL细胞悬液的冻存管在37℃水浴中迅速摇晃解冻,加入4mL培养基混合均匀。在1000RPM条件下离心4分钟,弃去上清液,补加1-2mL培养基后吹匀。然后将所有细胞悬液加入培养瓶中培养过夜(或将细胞悬液加入250px皿中,加入约8ml培养基,培养过夜)。第二天换液并检查细胞密度。2)细胞传代:如果细胞密度达80%-90%,即可进行传代培养。 四、细胞的运输和保存可选择干冰运输及发送复苏存活细胞方式:(1)干冰运输,收到后立即转入液氮或者-80度冰箱冻存或直接复苏;(2)存活细胞,收到后应继续生长,传代达到细胞生长状态良好时,再进行冻存。具体操作见细胞培养步骤。(3)收到细胞后请拍照,3天内如果发现污染,请及时拍照与我们联系。 五、ZR-75-1人乳腺癌细胞实验要点及说明:1、本方法适用于贴壁细胞培养,而不适用于悬浮细胞培养,悬浮细胞可使用滴片法; 2、所使用的盖玻片应该为优质玻璃制造,并经过铬酸洗液处理; 3、盖玻片非常薄,易碎,取放盖玻片时动作要轻; 4、如果需要更多生长状态一致的细胞,可以使用较大的培养皿,但不宜过大,以避免培养液的浪费和增加污染机率; 5、如果细胞贴壁生长能力较差,可将盖玻片在0.5%多聚赖氨酸溶液中浸泡5-10分钟并自然晾干。 中国微生物菌种查询网自设细胞系板块,是细胞株提供中心,专业提供代次低、周期短、活性好的细胞株。与国内外多家研制单位,生物医药,第三方检测机构,科研院所有着良好稳定的长期合作关系!欢迎广大客户来询!
  • TU212(人喉癌细胞)的培养步骤及方法!
    TU212(人喉癌细胞)的培养步骤及方法! 一、细胞简介平台编号:bio-106163a规格:1*10 6拉丁属名:TU212(人喉癌细胞)型号:HTX2130细胞名称:TU212人喉癌细胞生长特性:贴壁组织来源:人喉癌细胞培养基:89%1640+10%FBS+1%双抗物种:人规格:2X10^6 cells培养温度:37℃引种来源:BioSample传代:1:2~1:4传代,两天左右换液。冻存液:92%完全培养基+8%DMSO(可以根据实验室条件自行选择)。包装:专业的无菌保温运输包装。细胞用途:仅供科研使用。注意事项:仅用于科学研究或者工业应用等非医疗目的,不可用于人类或动物的临床诊断或治疗,非药用,非食用。 二、细胞特性1)来源:头颈鳞癌2)形态:上皮细胞样,贴壁生长3)含量:1x1064)污染:支原体、细菌、酵母和真菌检测为阴性5)规格:T25瓶或者1mL冻存管包装 三、细胞接收后的处理方法1)收到细胞后,请检查发货培养瓶的状况,若发现培养瓶破损、有液溢出及细胞有污染,请拍照后及时联系我们。2)在显微镜下确认细胞生长状态时,最好在低倍镜(4或5X物镜)下进行,能准确判断细胞的传代密度。看细胞的形态请在10X和20×物镜下,同时给刚收到的细胞拍照,(10×,20×)各2-3张以及培养瓶外观照片一张留存,作为细胞需要售后时提供收到细胞时细胞状态的依据。3)观察好细胞状态后,75%酒精消毒瓶壁将T25瓶置于37℃培养箱放置约2-3h。4)贴壁细胞:在运输过程中贴壁细胞会有脱落的现象,如发现贴壁细胞有脱落或者脱落后抱团生长,可将T25瓶置于37℃培养箱放置约2-3h,然后抽出瓶中的培养基和未贴壁细胞1000rpm离心5分钟,弃去上清重悬后接种到加有按照说明书细胞培养条件新配制的完全培养基的原培养瓶中(或新的培养瓶中)。5)悬浮细胞:T25瓶置于37℃培养箱放置约2-3h,然后抽出瓶中的培养基和细胞1000rpm离心5分钟,弃去上清重悬后接种到新的培养瓶中(加入按照说明书细胞培养条件新配制的完全培养基)。6)备注:运输用的培养基(灌液培养基)不能再用来培养细胞,请换用按照说明书细胞培养条件新配制的完全培养基来培养细胞。收到细胞后第一次传代建议1:2传代。 四、细胞培养步骤1、培养基及培养冻存条件准备: 1)准备IMDM培养基;优质胎牛血清,10%;双抗,1%。2)培养条件: 气相:空气,95%;二氧化碳,5%。 温度:37摄氏度,培养箱湿度为70%-80%。3)冻存液:90%血清,10%DMSO,现用现配。2、细胞处理:1)复苏细胞:将含有1mL细胞悬液的冻存管在37℃水浴中迅速摇晃解冻,加入4mL培养基混合均匀。在1000RPM条件下离心4分钟,弃去上清液,补加1-2mL培养基后吹匀。然后将所有细胞悬液加入培养瓶中培养过夜(或将细胞悬液加入250px皿中,加入约8ml培养基,培养过夜)。第二天换液并检查细胞密度。2)细胞传代:如果细胞密度达80%-90%,即可进行传代培养。3)细胞冻存:待细胞生长状态良好时,可进行细胞冻存。 对于贴壁细胞,传代可参考以下方法:1、弃去培养上清,用不含钙、镁离子的PBS润洗细胞1-2次。2、加2ml消化液(0.25%Trypsin-0.53mM EDTA)于培养瓶中,置于37℃培养箱中消化1-2分钟,然后在显微镜下观察细胞消化情况,若细胞大部分变圆并脱落,迅速拿回操作台,轻敲几下培养瓶后加少量培养基终止消化。3、按6-8ml/瓶补加培养基,轻轻打匀后吸出,在1000RPM条件下离心4分钟,弃去上清液,补加1-2mL培养液后吹匀。4、将细胞悬液按1:2到1:5的比例分到新的含8ml培养基的新皿中或者瓶中。注:第一次传代推荐传代比例为1:2,以后传代比例可根据客户需要自己决定。 五、TU212(人喉癌细胞)的注意事项1、收到细胞后,若发现干冰已挥发干净、冻存管瓶盖脱落、破损及细胞有污染,请立即与我们联系。2、收到细胞先不开瓶盖,瓶身擦拭酒精后放在培养箱静置2-4小时(视细胞密度而定)稳定细胞状态。接着在倒置显微镜下观察细胞生长情况,并对细胞进行不同倍数拍照(建议收细胞时就整体外观拍一张照片,观察培养基的颜色和是否有漏液情况,随后在显微镜下拍下细胞状态,100*,200*各一张),观察记录细胞在运输过程中是否有污染情况。作为我方进行销售依据。3、由于细胞状态受环境、操作和运输等多方面因素影响,故本公司只保证客户收到细胞后一周内的细胞状态,故客户需要售后时需出示收到细胞的时间证明及客户提供收货时间和发现问题后客服人员沟通的时间证明,期间间隔时间不能大于7天。4、所有动物细胞均视为有潜在的生物危害性,必须在二级生物安全台内操作,并请注意防护,所有废液及接触过此细胞的器皿需要灭菌后方能丢弃。 六、TU212(人喉癌细胞)的运输和保存可选择干冰运输及发送复苏存活细胞方式(1)干冰运输,收到后立即转入液氮或者-80度冰箱冻存或直接复苏;(2)存活细胞,收到后应继续生长,传代达到细胞生长状态良好时,再进行冻存。具体操作见细胞培养步骤。(3)收到细胞后请拍照,3天内如果发现污染,请及时拍照与我们联系。 中国微生物菌种查询网自设细胞系板块,是细胞株提供中心,专业提供代次低、周期短、活性好的细胞株。与国内外多家研制单位,生物医药,第三方检测机构,科研院所有着良好稳定的长期合作关系!欢迎广大客户来询!
  • 百欧博伟生物 Capan-1 人胰腺癌细胞
    百欧博伟生物 Capan-1 人胰腺癌细胞 一、细胞简介平台编号:bio-106177拉丁属名:Capan-1(人胰腺癌细胞)规格:1ml/T25细胞名称:人胰腺癌细胞种属:人源细胞系/甲状腺、胰腺、垂体、肾上腺、扁桃体、胸腺到货周期:10-15个工作日细胞用途:仅供科研使用。注意事项:仅用于科学研究或者工业应用等非医疗目的,不可用于人类或动物的临床诊断或治疗,非药用,非食用。 二、细胞介绍该细胞来源于一位40岁白人男性患者的肝转移。细胞表达粘液素,Rh+, HLA A2,,A9,B13,B17。含有刺激素受体和乙二醇激素受体。 三、细胞特性1)来源:胰腺癌,肝转移2)形态:上皮细胞样,贴壁生长3)含量:1x106 个/mL4)污染:支原体、细菌、酵母和真菌检测为阴性5)规格:T25瓶或者1mL冻存管包装 四、细胞接受后的处理:1)收到细胞后,请检查是否漏液,如果漏液,请拍照片发给我们。2)请先在显微镜下确认细胞生长状态,去掉封口膜并将T25瓶置于37℃培养约2-3h。3)弃去T25瓶中的培养基,添加6ml本公司附带的完全培养基。4)如果细胞长满(90%以上)请及时进行细胞传代,传代培养用6ml本公司附带的完全培养基。5)接到细胞次日,请检查细胞是否污染,若发现污染或疑似污染,请及时与我们取得联系。 五、本公司的细胞培养操作规程,供参考1、培养基及培养冻存条件准备:1)准备IMDM培养基(IMDM,GIBCO,货号C12440500BT),80%;优质胎牛血清,20%。 。2)培养条件: 气相:空气,95%;二氧化碳,5%。 温度:37℃,培养箱湿度为70%-80%。3)冻存液:90%血清,10%DMSO,现用现配。液氮储存。2、细胞处理:1)复苏细胞:将含有1mL细胞悬液的冻存管迅速放入37℃水浴中(水面要低于冻存管盖部)摇晃解冻,移入事先准备好的含有4mL培养基的15ml离心管中混合均匀。在1000RPM条件下离心4分钟,弃去上清液,加入1mL培养基后吹匀。然后将所有细胞悬液移入含有5ml培养基的培养瓶中培养过夜。第二天换液并检查细胞密度。2)细胞传代:如果细胞密度达80%-90%,即可进行传代培养。 对于贴壁细胞,传代可参考以下方法:1、弃去培养上清,用不含钙、镁离子的PBS润洗细胞1-2次。2、加2ml消化液(0.25%Trypsin-0.53mM EDTA)于培养瓶中,置于37℃培养箱中消化1-2分钟,然后在显微镜下观察细胞消化情况,若细胞大部分变圆并脱落,迅速拿回操作台,轻敲几下培养瓶后加入3ml此细胞的培养基终止消化。3、轻轻吹打后吸出,移入15ml离心管中,在1000RPM条件下离心4分钟,弃去上清液,加入1mL培养液后吹匀。4、移入到事先准备好的含有5ml培养基的T-25培养瓶中或含有14ml培养基的T-75培养瓶中培养。3)细胞冻存:待细胞生长状态良好时,可进行细胞冻存。贴壁细胞冻存时,先要消化处理并进行细胞计数。消化方法按照细胞传代方法的1-3步骤进行,最后的重悬液使用血清。悬浮细胞直接计数后离心,用血清重悬浮,加DMSO至最终浓度为10%。加入DMSO后迅速混匀,按每1ml的数量分配到冻存管中。本公司按每个冻存管细胞数目大于1X106个细胞冻存。 六、运输和保存:可选择干冰运输及发送复苏存活细胞方式:(1)干冰运输,收到后立即转入液氮或者-80 度冰箱冻存或直接复苏;(2)存活细胞,收到后应继续生长,传代达到细胞生长状态良好时,再进行冻存。具体操作见细胞培养步骤。收到细胞后请拍照,3 天内如果发现污染,请及时拍照与我们联系。 七、注意事项:1、收到细胞后,若发现干冰已挥发干净、冻存管瓶盖脱落、破损及细胞有污染,请立即与我们联系。2、所有动物细胞均视为有潜在的生物危害性,必须在二级生物安全台内操作,并请注意防护,所有废液及接触过此细胞的器皿需要灭菌后方能丢弃。 中国微生物菌种查询网自设细胞系板块,是细胞株提供中心,专业提供代次低、周期短、活性好的细胞株。与国内外多家研制单位,生物医药,第三方检测机构,科研院所有着良好稳定的长期合作关系!欢迎广大客户来询!

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