疾病传播

法国Stilla Technologies公司的naica® 微滴芯片数字PCR系统用于评估有效再生数Re（effective reproduction number）。有效再生数Re（effective reproduction number）为一段时间内由单个感染者引起的新感染的平均数量，作为监测疾病动态、是区域和国家政策提供信息以及评估干预措施有效性的一个关键指标，在COVID-19大流行期间被广泛用于跟踪疾病动态。通常有效再生数Re根据临床病例数据进行评估（以下简称Rcc），如观察病例、住院和/或死亡，可能因检测和报告的变化而产生偏差。瑞士联邦理工学院科学家在medrxiv发布的跟踪研究表明，废水中SARS-CoV-2 RNA的动态可以用于近实时评估Re，不依赖于临床数据，也不存在来自临床测试和报告策略的相关偏差。文章中，使用数字PCR方法的定量检测废水和固沉积物病毒RNA载量，提供一个独立的数据集来估计Re(以下称为Rww)，能对原有Rcc评估补充，以提供一个更完整的图像式传染动力学。废水中SARS-CoV-2 RNA的纵向测量可用于评估不同地区的Re，并提供对COVID-19动态的独立评估。鉴于在此次大流行期间广泛进行废水取样，这些Re值可直接作为一种快速、低成本的方法，为公共卫生政策提供信息。该方法可适用于其他病原体，包括那些没有临床数据的病原体。图1:苏黎世(CHE)废水Rww 评估：A. 2020年9月1日至2021年1月20日期间测定的N1和N2标记(分别为绿色和黄色)的RNA载量。B. 同一时期确诊病例(紫色)。C. 根据病例报告得到的感染发生率时间序列(上)和根据N1和N2标记物的归一化RNA载量(下)，分别为绿色和黄色。归一化方法请见原文中方法描述，条形区域表示50次重复的平均值±标准偏差。D. Rww与Rcc 对比。彩色线表示原始数据点，带状区表示50次重复的的置信度95%的置信区间。图2:圣何塞(美国)污泥Rww 评估：A. 2020年11月15日至2021年3月19日期间测定的N、S和ORF1a基因(分别为蓝色、绿色和黄色)RNA载量。B. 同期确诊病例(紫色)。C. 根据病例报告的感染发生率时间序列(上)和归一化的RNA载量(下)。归一化方法请参考原文方法。条形图表示50次重复平均值±标准偏差。(D)Rww 与Rcc 对比。彩色线表示原始数据点，带状区表示50次重复置信度95%的置信区间。文章发现Rww 与Rcc结果一致，但两者时间上存在滞后，图2D。通常来说，Rww 或者Rcc 时间不准确的原因，推测是因为未能在最佳时间捕捉脱落，或者因为在观察期间临床病例的报告延迟改变。在这种情况下，Rcc可能由于漏报和增加测试延迟，导致存在偏差。根据测试调整的案例重新估计，结果更接近于Rww，尤其是11月/ 12月，图S1B。文章中作者调整了采样频率和易感性，通过建立噪声模型和对脱落负荷分布（SLD）进行反卷积，将废水中的RNA测量与原始感染发生率联系起来，准确描述脱落的时间动态和足够大的集水区，个体差异可能会趋于平均，随着前瞻性抽样研究报告结果，可以得出最优SLD ，从而提供更准确的废水和固体沉积物的Rww。从废水中获得Re为追踪疾病动态提供了一种独立的方法。基于废水的流行病学检测方法可在全球用于跟踪COVID-19大流行(https://www.covid19wbec.org/covidpoops19)，Rww 评估方法非常强大，不受测试和报告策略的影响，因此跨地理区域的评估更具可比性。通过估计Rww进行废水监测是一种低成本、快速并可对不同区域水质进行比较的方法，同时也能实现以接近实时的方式跟踪疾病传播动态。图片medRxiv是由美国冷泉港、BMJ和耶鲁大学联合运营的免费的、非营利性服务平台。2019年6月25日正式上线，专注于临床研究的科研人员可以在medRxiv平台上分享未经过同行评议的研究，从而有助于及时传播最新的发现，也有助于研究人员接收反馈进而完善研究内容。原文链接：https://doi.org/10.1101/2021.04.29.21255961针对于naica® 微滴芯片数字PCR系统，我们提供新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒，货号：AK900103。参考国家CDC与WHO指南方法，生信分析新型冠状病毒的开放读码框1ab（open reading frame, ORF1ab）、核壳蛋白（nucleoprotein，N）区域保守序列，优化引物探针，降低病毒变异的影响；利用三荧光通道的优势，加入人源管家基因作为内标进行监控，实现单孔多重三基因检测，结果更可靠。详情点击：https://mp.weixin.qq.com/s/uXv2JLTg1YJsQJFW9IGHzAnaica® 微滴芯片数字PCR系统法国Stilla Technologies公司的naica® 微滴芯片数字PCR系统在进行核酸检测时具有独特的优势。该系统利用cutting-edge微流体创新型芯片—Sapphire芯片（或高通量Opal芯片）作为数字PCR过程的耗材。样品通过毛细通道网格以30,000个微滴的形式进入2D芯片中。3色荧光检测仪器，整个流程只需要2.5小时，并可进行数据的质控和结果追溯分析，获得的数据真实可靠。naica® 六通道微滴芯片数字PCR系统法国Stilla Technologies公司naica® 六通道微滴芯片数字PCR系统，源于Crystal微滴芯片数字PCR技术，自动化微滴生成和扩增，每个样本孔可实现6荧光通道的检测，智能化识别微滴并进行质控，3小时内即可获得至少6个靶标基因的绝对拷贝数浓度。

12月1日上午，中国检验检疫科学研究院食源性疾病研究室在宁波大榭公共卫生与食品安全检测中心挂牌成立。中国检验检疫科学研究院院长李怀林、大榭开发区管委会主任蔡希良、宁波检验检疫局局长山巍出席仪式。 　　据悉，该研究室是中国检科院在全国范围内设立的第一个食源性疾病研究室，也是中国检科院继石油化工产品实验室、光电电气产品实验室之后设在宁波的第三个院外实验室。 　　因为受食品供应全球化、国际贸易加快、国际间人员流动频繁、微生物和病毒变异加速、易感人群增加等因素影响，食源性传染病已成为日益严重的国际性公共卫生问题，所以在宁波口岸成立食源性疾病研究室意义重大。 　　研究室的成立既是提升口岸公共卫生核心能力的需要，又是宁波市外向经济发展转型升级的客观需求。同时将为国家相关部门制定防控措施提供指导依据，对防止食源性传染病在口岸传播具有重要意义。 　　“十一五”期间，宁波检验检疫局大力实施“科技兴检”战略，共投入设备3507台套，资金2.7亿元，形成了由9个国家重点实验室、5个区域中心实验室、36个常规实验室组成的实验室检测体系。大榭公共卫生与食品安全检测中心作为体系的重要组成部分，近年来，在服务地方经济发展，严守国门安全方面取得突出成绩。这次双方将在有关口岸食源性疾病的检测技术与监测体系、病原体的流行病学研究、食物中毒事件应急体系建立与分析等领域开展科研合作，通过局院合作模式，双方将共享人才、设备、技术和研究资源，共同提高科研水平，防控食源性疾病在国境口岸传播。

日前，有消息爆料称，刚果(金)暴发未知疾病，已有14人死亡。3月2日，刚果民主共和国西部宽果省议员要求，国民议会议长针对该地区暴发的未知疾病采取紧急措施。刚果（金）议员帕西扎班巴称：“宽果省议员小组与议长克里斯托夫姆博索举行了会面，以讨论卡松戈－隆达地区所发之事。未知疾病正在夺取我们同胞的生命，已经有14人病逝。病因至今为止。”刚果（金）宽果省省长让-玛丽普吉普吉表示，未知疾病首例病例是一个月前发现的。到目前为止，病逝的都是60至80岁老年人。早在2020年 6月1日，刚果（金）卫生部长隆贡多对外透露称，除了新冠外又一致命病毒埃博拉来袭。目前已经在刚果（金）西北部爆发，随即世卫组织发声，表示将努力支持刚果（金）抗击埃博拉疫情。埃博拉病毒从发现到现在，已经过去几十年时间，但医学家们仍然没有发现埃博拉病毒的真实“身份”，没有人知道埃博拉病毒在每次大爆发后潜伏在何处，也没有人知道每一次埃博拉疫情大规模爆发时，埃博拉病毒是如何传播，这是有史以来最可怕的病毒之一。与此同时，刚果（金）还爆发了全世界最严重的麻疹疫情。可以说，现在的刚果（金）除了未知疾病，正面临3大公共卫生危机，即新冠肺炎、麻疹与埃博拉病毒，这将会给刚果（金）的医疗卫生系统造成巨大负担。世卫组织与联合国先后发出警告，非洲的新冠疫情形势不容乐观，如若不采取积极措施应对，将会出现大规模爆发的可能。相关研究预测，一旦失控，将会有超过2亿非洲人感染新冠病毒，一年内非洲将会有15万人死于新冠疫情。