淌度差分质谱

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  • 离子淌度差分质谱法直接进样快速定量千种脂质
    p style=" text-align: justify "    span style=" color: rgb(0, 32, 96) " strong 背景介绍 /strong /span /p p style=" text-align: justify "   健康的身体是人人都想一直保持的,但是伴随着人的衰老,一些疾病的得病率也在不断攀升,例如:糖尿病、心血管疾病、神经退行性疾病等。脂质作为人体需要的重要营养素之一,在许多生物过程中都扮演着重要的角色,是人体细胞组织的组成成分,为机体供给所需的能量,以及协助细胞信号传导等。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " & nbsp SCIEX公司于2011年美国质谱年会(American Society of Mass & nbsp Spectrometry,ASMS)会议上展示了最新的SelexIONTM & nbsp 技术。该技术是首个获得高重现性、耐用性及易用性的离子淌度差分质谱分离技术(Differential mobility & nbsp Spectrometry,DMS),同时还可为高灵敏度的定量与定性分析提供更多的选择性。 /p p style=" text-align: justify "   近年来,随着科研人员对脂质研究的深入,发现疾病的发生通常伴随着体内脂质水平的紊乱,因此,将脂质作为疾病的生物标志物的研究也越来越火热,而如何全面检测并定量分析人体内的脂质含量成为了研究重点。 /p p style=" text-align: justify "   span style=" color: rgb(0, 32, 96) " strong  那么如何全面检测并定量分析人体内的脂质? /strong /span /p p style=" text-align: justify "   在最新的一篇研究衰老的文献 “Cross-Platform Comparison of Untargeted and Targeted Lipidomics Approaches on Aging Mouse Plasma” 中,同时采用 strong 非靶向脂质组学与靶向脂质组学方法(LipidyzerTM) /strong 研究衰老老鼠血浆中脂质的差异变化。在该文章中,非靶向脂质组学与靶向脂质组学方法工作流程如图1所示,非靶向脂质组学方法采用LC-HRMS技术,利用反相色谱方法分离脂质,数据分析采用传统的分析方法,进行峰提取、峰对齐、峰鉴定、归一化、峰定量、手动确证。靶向脂质组方法采用SCIEX公司LipidyzerTM平台,相比非靶向脂质组方法,LipidyzerTM采用 strong 差向离子淌度分离技术(DMS) /strong 对脂质进行分离,因无需色谱分离,故采集时间更短 LipidyzerTM采用的是MRM 方法靶向分析脂质,故在数据分析过程中,仅需要3步(鉴定、归一化、定量)即可得到准确的定量结果。 /p p 引用文献: a href=" https://www.nature.com/articles/s41598-018-35807-4" https://www.nature.com/articles/s41598-018-35807-4 /a /p p style=" text-align: center " img title=" 640.webp.jpg" alt=" 640.webp.jpg" src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201901/uepic/036d08a3-9fa8-473f-b1f5-595ab3341d09.jpg" / /p p style=" line-height: 16px " img style=" margin-right: 2px vertical-align: middle " src=" /admincms/ueditor1/dialogs/attachment/fileTypeImages/icon_pdf.gif" / a title=" Cross-Platform Comparison.pdf" href=" https://img1.17img.cn/17img/files/201901/attachment/bbe0fd7c-0aa9-44d4-9532-98d0ce313dc2.pdf" target=" _blank" textvalue=" Cross-Platform Comparison of Untargeted and Targeted Lipidomics Approaches on Aging Mouse Plasma.pdf" Cross-Platform Comparison of Untargeted and Targeted Lipidomics Approaches on Aging Mouse Plasma.pdf /a /p p style=" text-align: center " img title=" 图1.webp.jpg" alt=" 图1.webp.jpg" src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201901/uepic/39c82326-fe5a-435a-8d92-c482ab684e96.jpg" / /p p style=" text-align: center "   图1. 靶向和非靶向工作流程 /p p style=" text-align: justify "   文章结果表明,LipidyzerTM方法在检测的脂质种类与数量上与传统非靶向脂质组学是相当的(图2),且都具有很好的定量准确度。研究者利用LipidyzerTM方法对衰老老鼠血浆的脂质差异性分析中发现 strong 甘油三脂TAG /strong 在衰老过程中变化差异最大,说明TAG代谢在衰老过程中最为敏感,为未来走向临床提供了可靠的生物标记物。 /p p style=" text-align: center " img title=" 图2.webp.jpg" alt=" 图2.webp.jpg" src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201901/uepic/8a2de8e9-45b3-4c4f-98dd-033dd963924f.jpg" / /p p style=" text-align: center "   图2. LipidyzerTM检测出衰老过程中变化的脂质 /p p style=" text-align: justify "    span style=" color: rgb(0, 32, 96) " strong LipidyzeTM提供高通量大规模脂质绝对定量“一站式”方案 /strong /span /p p style=" text-align: justify "   SCIEX对于脂质的检测分析也推出了相应的解决方案——LipidyzerTM,能够实现13大类,1000多种脂质的绝对定量分析。该平台(图3)提供了一套完整的靶向脂质组学解决方案,包含样品前处理,数据采集,以及数据分析。 /p p style=" text-align: center " img title=" 图3.webp.jpg" alt=" 图3.webp.jpg" src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201901/uepic/dcbbf113-2f59-435f-86ca-9ab372659d13.jpg" / /p p style=" text-align: center "   图3. LipidyzerTM平台 /p p style=" text-align: justify "    span style=" color: rgb(0, 32, 96) " strong 多重技术优势适用临床样本分析,助力精准脂质代谢与健康研究 /strong /span /p p style=" text-align: justify "   LipidyzerTM利用离子淌度技术(DMS)实现不同脂类的完全分离,具有极强的特异性 方法内包含 strong 13类脂质 /strong , strong 50多个同位素内标脂质 /strong ,覆盖了复杂的脂质代谢通路 通过内标的添加,实现每类脂质的绝对定量分析(图4)。该技术平台已在人血清和血浆分析中得到验证,成为临床脂质组分析的“即得”利器。 /p p style=" text-align: center " img title=" 图4.webp.jpg" alt=" 图4.webp.jpg" src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201901/uepic/ffc841ad-1c91-458d-b348-ef1b81e03916.jpg" / /p p style=" text-align: center "   图4. LipidyzerTM的优势 /p p & nbsp /p p br/ /p
  • 离子淌度质谱技术:质谱领域的新维度和新深度
    离子淌度质谱技术:质谱领域的新维度和新深度  距离质谱的上一个诺贝尔奖已经过去了20年,但目前的质谱技术并没有超越几十年前的模式,如傅里叶变换离子回旋共振质谱(FTICR-MS)依然具有最高的质量分辨率,飞行时间质谱(TOF-MS)依然具有最快的扫描速度等。质谱领域的革命性工作在于提高分析的精度、维度、广度和通量。近几十年来,离子淌度技术(ion mobility spectrometry,也称“离子迁移谱”)快速发展,离子淌度质谱的联用技术也得到了广泛应用,这使得质谱分析能力从相对简单的质荷比拓展到复杂的三维结构,从简单的异构体区分发展到复杂的构象解析。  近年来,国家自然科学基金委、科技部及相关部委对离子淌度质谱相关的技术开发和应用工作进行了资助,相应的成果在蛋白质组学、代谢组学、脂质组学、质谱成像分析、生物大分子结构分析、中医药分析、手性化合物分析等领域都得以广泛体现。然而,这些工作中使用的质谱仪器,尤其是同时拥有离子淌度功能的质谱仪器仍以国外企业产品为主,价格也十分昂贵。质谱等高精尖的科学仪器发展一直依赖于各行各业的齐心协力,不仅新的原理创造和技术开发需要重点资助和支持,新的应用场景和技术迭代同样需要各行各业的支持和响应。目前,现场爆炸物检测分析常用的离子淌度谱仪已经广泛实现了国产品牌替代,然而国产离子淌度质谱仪器的研究还基本处于空白。这些都极大地限制了自主性、原创性研究工作的开展,也对新一代质谱仪器的研发提出了更高的要求,特别需要引起国家部委和本土企业的极大关注和重视。  本专辑汇集了国内离子淌度质谱研究一线人员的工作,从多个方面展现了我国离子淌度质谱研究的现状,其中共收录了13篇论文,包括了新型离子迁移谱的理论技术,如基于离子阱技术和FTICR-MS的离子淌度分析、用于行波离子迁移谱的关键电源技术、基于离子淌度质谱技术的离子光谱研究等,还包括了离子淌度质谱技术的应用,如碰撞截面积的测量、小分子代谢物分析、糖类异构体分离、蛋白质的立体修饰、环境对蛋白结构的影响和糖基化蛋白分析等工作。专辑中的综述性工作和研究报告从不同的维度和角度反映了国内外离子淌度质谱研究的新进展,也提炼出了多个具有潜力的发展方向。  回首过去的几十年,国内质谱技术的发展一直在奋力追赶,在离子源、离子传输、分离、检测等各个领域都逐渐崭露头角。路漫漫其修远兮,时光流逝,希望下一个十年能看到高端国产离子淌度质谱技术在各个领域的身影。  本文内容源自《质谱学报》2022年第五期Vol.43,本期执行主编为中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心研究员朱正江、湖南大学教授博士生导师岳磊。 doi:10.7538/zpxb.2022.3000
  • 5000万!大连理工大学发布离子淌度质谱、高分辨质谱等采购意向
    近政策利好消息推动国内高校、科研院所纷纷启动仪器设备更新改造工作,我国科学仪器行业迎来一波仪器采购大潮。仪器信息网观察发现,高校拟采购的分析仪器中质谱仪器广受关注。  根据本网跟踪报道,大连理工大学11月4日发布了11月的仪器采购意向,预算近5000万元,拟采购离子淌度4D组学质谱、离子色谱-质谱联用仪、三合一轨道阱高分辨液质联用仪、轨道阱高分辨液质联用仪、全二维气相色谱高分辨质谱联用仪、辉光放电质谱仪、稳定同位素比质谱仪等7套质谱系统。仪器信息网特别梳理,以飨读者。序号项目名称预算金额(万元)采购单位发布时间预计采购时间查看1离子淌度4D组学质谱842大连理工大学2022/11/4 10:37Nov-22意向原文2离子色谱-质谱联用仪362大连理工大学2022/11/4 10:37Nov-22意向原文3三合一轨道阱高分辨液质联用仪1170大连理工大学2022/11/4 10:37Nov-22意向原文4轨道阱高分辨液质联用仪788大连理工大学2022/11/4 10:37Nov-22意向原文5全二维气相色谱高分辨质谱联用仪498大连理工大学2022/11/4 10:37Nov-22意向原文6辉光放电质谱仪700大连理工大学2022/11/4 10:37Nov-22意向原文7稳定同位素比质谱仪500大连理工大学2022/11/4 10:37Nov-22意向原文

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  • [转帖]:离子淌度质谱及其理论研究进展

    作者:王海龙,魏开华 来源:军事医学科学院院刊 [摘要] 离子淌度质谱是离子淌度分离与质谱联用的一种新型二维质谱分析技术,离子淌度分离原理是基于离子在飘移管中与缓冲气体碰撞时的碰撞截面不同,离子可按大小和形状进行分离。经过30多年的发展,离子淌度质谱已配有多种最新的离子源及质量分析器,理论研究也日渐成熟,并在蛋白质、多肽及复杂化合物异构体分析方面越发显示出独特的优势,正在发展成为一种新型的重要分析工具。[关键词] 离子淌度;质谱;碰撞截面;理论进展 2O世纪8O年代后,由于各种软电离技术相继问世,质谱(mass spectrometry,MS)的应用拓展到对高极性、难挥发和热不稳定的生物大分子的分析研究,发展成为生物质谱,并迅速成为现代分析化学最前沿的领域之一 。离子淌度质谱(ion mobility mass spectrometry,IMMS)是离子淌度光谱(ion mobility spectrometry,IMS)技术与质谱的联用。是一种新型的二维分离质谱技术。IMS技术出现于2O世纪7O年代,由于其具有多样性的分析能力、良好的检测限及实时的检测能力,在当时受到人们广泛关注,但由于IMS分辨率较低且不能给出离子质量信息,加之当时人们对离子组成的重要性缺乏理解,因此在1976年以后,有关离子淌度的研究逐渐减少。直到2O世纪8O年代末,特别是以MALDI和ESI 为代表的各种软电离方法应用以来,IMS在化合物异构体分离方面具有的独到优势才又引起了人们的关注,相继推出了配备各种新型离子源的IMS—MS联用技术,精确的离子几何形状和淌度计算方法得到飞速发展,IMMS技术有了实质性进展。目前,IMMS已经用来检测化学战剂、爆炸物 、环境污染 、麻醉剂 、半导体及生物大分子(如肽和蛋白质类),并显示出其强大的分析能力。1 原理与仪器组成1.1 IMMS基本原理 离子淌度(ion mobility,IM),又称离子迁移率,是指在电场强度为1 V/m或电场力为1N时正离子或负离子的运动速度,单位为m /V。在IMS中,离子受电场力加速的作用向前运动,运动中又与飘移区缓冲气体分子发生碰撞产生阻力使速度降低。碰撞过程中离子失去的动能可转化为内能使离子温度升高,再次的碰撞又可将升高的内能传递给气体分子,回复到系统温度 。因此,离子在运动过程中温度和速度并不保持恒定。离子之间、离子与缓冲气体之间也可能存在着静电引力与库仑斥力,决定了离子在飘移区的运动过程是极其复杂的,只能由其平均速度(即离子淌度 )或离子通过飘移区的时间td来计量。这种分离过程与色谱的分离过程类似,因此IMS在早期又被称为等离子体色谱(plasmachromatography,Pc)。为了使不同实验条件下的测量值能够相互比较,在实际应用中通常将离子淌度转换为折合离子淌度(reduced ionmobility, ),即在温度为273 K,压力为760 Tort的条件下的离子淌度,离子的大小和形状可用离子与缓冲气体发生碰撞时的平均可用截面即碰撞截面(collision Cross section,n)来衡量。由上述可知,离子淌度分离主要是基于离子的形状和大小。因此,对于用常规质谱方法不能区分的异构体或复合物等分析,这种分离手段具有独特优势。离子按淌度预分离后,再通过每一组分质荷比求得质量数,便可获得离子淌度质谱二维图谱或三维图谱(图1)。1.2 仪器组成 离子淌度质谱仪与常规质谱仪的主要区别在于前者在离子源和质量分析器之间增加了一个离子飘移管。离子飘移管通常由不导电的高纯度氧化铝制成,中间镶嵌若干不锈钢环,不锈钢环之间以高温电阻相连,两端不锈钢环之间施加驱动离子前进的电场。质量分析器可采用四极质量分析器或飞行时间质量分析器,由于四极分析器扫描离子费时较长,现在IMMS分析器多为飞行时间质谱(TOF—MS)。仪器中飘移管部分通以缓冲气体,质量分析器部分采用高真空,二者之间配以由锥体和离子透镜组成的接口。典型的离子淌度质谱的组成见图2。由于离子在飘移管中通过的时间为毫秒级,在飞行管中通过时间为微秒级,在下一组分到来前有充足的时间求得离子的质量数,因此对每一组分可在一次实验中同时求得淌度和质量数,整个实验可在1 min内完成。 有时为了获得更多的离子信息,可在飘移管前和(或)后串联使用几种质量分析器,如离子阱或四极滤质器等。2 离子淌度理论的研究进展2.1 缓冲气体对碰撞截面的影响 IMS区分离子是通过与缓冲气体分子碰撞过程而实现的,缓冲气体的种类直接影响分离过程。氮气和氦气是最常用的两种气体,氮气一般用于常规分析,氦气常用于结构分析。其他气体还有二氧化碳、六氟化硫、氨 和四氟化碳 。使用不同缓冲气体的理论研究在1975年之后便很少,即使是现在也还没有引起人们足够的重视,但在实际应用中,使用不同的气体对获得良好的分辨率和检测灵敏度相当重要。 离子的碰撞截面不仅与缓冲气体的质量数有关,而且取决于缓冲气体极化率的大小 。Matz等 研究6种苯丙胺(安非他明)衍生物在氦气、氩气、氮气与二氧化碳4种不同缓冲气体下的碰撞截面,结果显示碰撞截面随缓冲气体质量数的上升而上升,但并无严格的线性关系。而极化率与碰撞截面之间有良好的线性关系,碰撞截面随极化率的上升而上升,这也说明碰撞截面更依赖于缓冲气体的极化率而不是质量数。Els等 研究了不同浓度的氮气/二氧化碳混合气体作为缓冲气体在l0 水平分离5种氯代和溴代乙酸的情况,使用100% 氮气,2种组分淹没在其他峰中,若在缓冲气体中加入3%二氧化碳,则能达到完全分离,表明载气的组成明显影响峰形的检出。

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  • timsTOF Pro 2由平行累积连续碎裂技术( PASEF )驱动,使得 4D-蛋白质组学和 4D-脂质组学为无偏向性细胞和血浆蛋白质组学、液体活检多组生物标志物发现,以及整合基因组学、蛋白质组学和表观蛋白质组学拓宽了道路。4D-组学时代 —— 解锁第四维度的价值4D-组学的重大突破速度:PASEF 技术实现了在不影响分辨率情况下达到超过 120 Hz 扫描速度。深度:额外一维离子淌度提高了数据完整性。高通量:超快数据采集速度使其可以使用短梯度实现生物样本的高通量分析。耐用性:独特的仪器设计使得其可以连续分析数千个样品,仪器保持稳定的性能而无需清洁。4D-Proteomics&trade 的新标准:更快速度实现蛋白质组全覆盖基于质谱( MS )的蛋白质组学一次可实现样本里成千上万蛋白的定性和定量。然而,受到目前质谱仪的扫描速度、灵敏度和分辨率的影响,实现蛋白质组的全覆盖仍然具有挑战性。timsTOF Pro 2 使用平行累积连续碎列( PASEF )的技术可实现极高的扫描速度和灵敏度,只需要少量样本就可以达到蛋白质组学鉴定新深度。双 TIMS 和 CCS 的分析捕集离子淌度谱( TIMS )首先是一项重要的气相分离技术,它是在高效液相色谱( HPLC )和质谱分离的基础上,带来额外一个维度的分离,可大大降低样品分析复杂度,极大提高峰容量和分析物鉴定可靠性。同样重要的是,TIMS 离子淌度管能对离子实现时间和空间上的聚焦,从而独特地提高灵敏度和扫描速度。双 TIMS 技术可以实现近乎 100% 的离子利用率,离子在前一根淌度管内累积,在后一根淌度管内根据离子淌度值分批释放。这种平行累积连续碎裂( PASEF )的过程能够实现碰撞横截面( CCS )的分析。CCS 额外一个维度信息能够提供很多进一步的分析可能性,可以从复杂数据库实现化合物的高可信度库匹配以及更低的错误发现率( FDRs )。4D-Proteomics&trade 的新标准:更快速度实现蛋白质组全覆盖基于质谱( MS )的蛋白质组学一次可实现样本里成千上万蛋白的定性和定量。然而,受到目前质谱仪的扫描速度、灵敏度和分辨率的影响,实现蛋白质组的全覆盖仍然具有挑战性。timsTOF Pro 2 使用平行累积连续碎列( PASEF )的技术可实现极高的扫描速度和灵敏度,只需要少量样本就可以达到蛋白质组学鉴定新深度。双 TIMS 和 CCS 的分析捕集离子淌度谱( TIMS )首先是一项重要的气相分离技术,它是在高效液相色谱( HPLC )和质谱分离的基础上,带来额外一个维度的分离,可大大降低样品分析复杂度,极大提高峰容量和分析物鉴定可靠性。同样重要的是,TIMS 离子淌度管能对离子实现时间和空间上的聚焦,从而独特地提高灵敏度和扫描速度。双 TIMS 技术可以实现近乎 100% 的离子利用率,离子在前一根淌度管内累积,在后一根淌度管内根据离子淌度值分批释放。这种平行累积连续碎裂( PASEF )的过程能够实现碰撞横截面( CCS )的分析。CCS 额外一个维度信息能够提供很多进一步的分析可能性,可以从复杂数据库实现化合物的高可信度库匹配以及更低的错误发现率( FDRs )。极高的稳定性和通量无需清洗许多用于蛋白质组学应用的 MS 仪器需要每月清洁一次,在大样本组中每天 24 小时运行。仪器性能下降即使在较短的时间段内也是显而易见的。timsTOF Pro 2 卓越稳定性意味着仪器可以全天运行很多周,而没有明显的信号和其它性能下降。PaSER Run & Done —— 加快4D-蛋白质组学的鉴定速度PaSER( 实时平行搜索引擎 )是一个结合硬件和软件的解决方案,能够实现基于样本序列管理的实时数据库搜索引擎。PaSER 以很快的速度就能提供结果,包括 PTM 搜索。通过使用基于 GPU 的搜索,PaSER 在实时或离线模式下可以提供相同的结果,而无需使用简化的算法或中间步骤。PaSER 极快的搜索速度使得在数据采集结束后数秒就能同步拿到搜库结果,真正实现运行并完成! PaSER 有效地打破了大队列样本数据分析通量壁垒。此外,实时蛋白组学的非标记定量也可以跨越 PaSER 获得的数据结果集,使其瞬间能过渡到定量蛋白质组学。通过 TIMS Viz 使得淌度偏移质量对齐( MOMA )变得可视化 ,从而用户可以鉴定和识别只有 4D-Omics 才能看到的共洗脱多肽。 dia-PASEF 增加鉴定可信度dia-PASEF比传统的 DIA 方法有更高灵敏度和选择性,是因为它将 PASEF 原理也应用进来,结合了 DIA 的优点和 PASEF 离子利用率高的优势。TIMS 分离提高了选择性,而且可以将单电荷母离子排除掉,从而降低本底噪音干扰。利用分子量和碰撞横截面 CCS 值的相关性,dia-PASEF 能够实现高可信度化合物鉴定。在 LC-MS/MS分析中, dia-PASEF 能够采集包含 m/z,离子淌度值( CCS ),保留时间和离子强度的 4D 数据。前所未有的蛋白质覆盖深度凭借强大的 SRIG( 不锈钢堆叠环形离子向导 )装置和新优化的 dda-PASEF 方法 ,timsTOF Pro 2 单针能够达到前所未有的蛋白组学覆盖深度。使用自制 HEK 酶切样本, 上样 200 ng,使用 Aurora - 25cm 色谱柱,在 60 分钟梯度下能够鉴定 超过 7,000个 蛋白和 60,000 条多肽。因此 timsTOF Pro 2 可以通过数据库搜索和运行之间的匹配,无需任何谱图库,在一些日常细胞系蛋白组定量实验中实现很高的蛋白覆盖深度。超高灵敏度的高通量靶向蛋白质组学和常规的靶向蛋白组学分析技术( SRM 和 PRM )相比,prm-PASEF 在单针中可极大提高监测多肽数目,同时不影响仪器选择性或灵敏度。靶向质谱( MS )技术是蛋白质组学实验中一种强大的技术,用来验证大队列样本中的候选生物标志物。与数据依赖采集( DDA )和数据非依赖采集( DIA )相比,这可以增加检测灵敏度。可是该技术受到在单针中监测离子数目和液相分离出峰时长以及整体灵敏度间的折中限制。只有通过更长的色谱分离时长或降低质谱的灵敏度和选择性,才能获得大量目标肽的完整数据。prm-PASEF 可以极大地提高单针中靶向监测的多肽数目,这得益于布鲁克 timsTOF Pro 2 的第四维分离可以极大提高选择性和灵敏度, PASEF 技术带来的速度可以增加靶向分析离子数量。超高灵敏度应对最困难的分析挑战随着某些特定细胞、少量细胞群或生物穿刺样本的生物研究越来越重要,低样本量蛋白组定量变得至关重要。而如此低的样本量对于质谱灵敏度提出了很高要求。使用高灵敏度的质谱仪对如此低的样本量进行原型定量至关重要。timsTOF Pro 2 上样 200 ng HeLa 样本,使用 Aurora - 25cm 色谱柱,在 30 分钟梯度下使用 PaSER 能够鉴定超过 74,200 个蛋白和接近 30,000 条多肽。dia-PASEF —— 高通量定量蛋白质组学中实现无与伦比的数据完整性和分析深度使用标准 dia-PASEF 方法多针测试结果有着很高重复性。三种不同的 dia-PASEF 窗口设置下使用 Aurora-25cm 柱在 60 分钟梯度下可实现接近 8,000 个蛋白定量和超过 70,000 条多肽,而且有极高的定量准确性。高灵敏度磷酸化蛋白组学分析和同分异构体分离支持 CCS 的近邻位磷酸化位点定量dia-PASEF 在 timsTOF Pro 2 上的高灵敏度、扫描速度和重现性甚至可以实现低样本量的磷酸化蛋白质组学分析。例如可以实现小鼠脑样本起始总蛋白仅为 25 μg 的磷酸化蛋白质组的非标记定量。使用 Evosep 每天 30 个样本的分析方法,三次重复可鉴定出多达 4,473 个 unique 磷酸化多肽。这些结果为针刺活检的应用带来了希望,可以用信号转导的信息补充癌症蛋白质基因组学数据。这些结果为针刺活检的应用带来了希望。此研究结果由 Stefan Tenzer 教授提供。分析样本量有限时的细胞信号传导当肽段在色谱上发生共洗脱时,由于等重性和信号重合,不能测量 CCS 值的传统蛋白质组学是不能实现磷酸化肽异构体的定量的。PASEF 技术使得基于 TiO2 富集时,使用 150 ug 蛋白富集起始量就能够鉴定 27,768 个磷酸化肽,展现了淌度偏离质量对齐( MOMA )的优点。1,946 条鉴定的共洗脱异构体中,20% 的异构体可以被TIMS 完全分离,这可以使得我们可以更好地理解邻位蛋白磷酸化位点信息。
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  • 以超快扫描速度和超高分辨率持续引领蛋白质组学研究超高灵敏度:TIMS PASEF 扫描模式可以获得近乎 100% 的离子利用率,提供卓越灵敏度和 300 Hz 扫描速度下蛋白深度覆盖最大化离子传输效率:优化的 CaptiveSpray Ultra 2(CSI Ultra 2)离子源全新的涡流设计,无需手动调整,即可实现超高离子传输和稳定喷雾。增强专属性:MOMA( Mobility Offset, Mass Aligned )利用淌度实现同重共洗脱离子的鉴定与分离,增强鉴定结果的清晰度和可信度。提升置信度:通过 CCS 值加持的 TIMScore&trade 、TIMS DIA-NN 或者 Spectronaut 19 软件,极大提高低丰度肽段鉴定的置信度。仪器特点仪器设备升级,实现持续创新我们认识到科研投资固有的两面性:机遇与风险。持续拥抱创新,我们提出可升级的质谱研究平台。这一方式促进了可持续发展,并使研究人员有能力适应不断变化的科研环境。我们的可升级平台无缝集成了最新的技术,使您的研究始终处于探索的最前沿。可升级平台确保研究者有灵活的选择来升级成最新款仪器,最大限度地提升他们的工作并助力他们实现研究目标。无与伦比的灵敏度推动革新性组学研究新一代 timsTOF Ultra 质谱仪 timsTOF Ultra 2,与强大的 CaptiveSpray Ultra 2 离子源相结合,这一动态组合释放出无与伦比的灵敏度,使您能够征服具有挑战性的样本,检测低丰度肽段,为组学研究的突破性提供助力。深入探索:从微小样本到看不见的肽段timsTOF Ultra 2 和 CaptiveSpray Ultra 2 强强联手,揭示样本的全部潜力。即使是最小量的样本也能进行分析,发现全新肽段。PASEF 采集使您能够深入探索低丰度肽段,提取曾经无法检测到的重要信息。此外,捕集离子淌度技术无需借助化学标记,简化了新肽段的鉴定流程。随着这些进步,timsTOF Ultra 2 与 CaptiveSpray Ultra 2 重新定义了实验室的可能性,将您的研究提升到新的高度。timsTOF Ultra 2突破了传统限制,开启了新的科学可能性。无论是单细胞蛋白质组学、免疫肽组学还是血浆蛋白质组学,timsTOF Ultra 2 与 CaptiveSpray Ultra 2 都能提供研究人员所需的速度和灵敏度,打破边界,取得突破性成果。仪器优势Bruker ProteoScape&trade 助力实现更深层次的蛋白质鉴定通过 Bruker ProteoScape&trade 的新功能,最大限度地提高鉴定深度和通量。我们的 Run & Done 数据库搜索平台利用 TIMScore&trade 和 TIMS DIA-NN 发挥 CCS 的强大功能,实现更准确的实时蛋白质鉴定。此外,Bruker ProteoScape&trade 与 Spectronaut 19 无缝集成,提供 DirectDIA+ 访问权限,并支持强大 diagonal-PASEF 的工作流程。应用方向1)深度蛋白质组分析:timsTOF Ultra 2 无与伦比的性能第二代 timsTOF 专注于在不牺牲稳健性的前提下提高灵敏度。利用具有优化涡流设计的 CSI Ultra 2,以及 diagonal-PASEF 工作流程和第二代离子电荷控制 ( ion charge control, ICC 2 ) 的支持,timsTOF Ultra 2 将灵敏度提升到新的高度。体验 timsTOF Ultra 2 的强大能量稳定且高灵敏度的 timsTOF Ultra 2 质谱仪是您在异质细胞环境中表型研究不可或缺的工具,帮助您解锁癌症的秘密以及通过单细胞基因组学和转录组学的补充信息了解其他疾病,帮助您破译细胞异质性以加深对生命活动过程和细胞间通路的理解,增加治疗的选择。探索单细胞蛋白质组学的新纪元用 timsTOF Ultra 2 释放单细胞蛋白质组学强大探索能量。以前所未有的方式认识细胞复杂性,全面了解不同细胞群中的独特表型,并彻底改变对疾病及其潜在机制的认识。照亮科学研究的道路利用先进的质谱技术,驱动蛋白质组学的变革性突破,推动您的研究发展,timsTOF Ultra 2 将成为您的有力助手。解锁细胞的奥秘,超越传统认知,开创未来,使改进的疗法成为现实。以全新的视角解读细胞。彻底改变您的蛋白质组学方法,解开细胞复杂性的秘密。 2)分子医学的动力源泉:FFPE 组织中的单细胞分析想要提升您的单细胞分析水平吗?那就接受FFPE组织单细胞分析的挑战吧探索 timsTOF Ultra 在转化治疗领域的强大能力。即使样本量有限,timsTOF Ultra 卓越的性能依旧能够将 FFPE 组织中的蛋白精确定位到特定的癌症区域。timsTOF Ultra 中更高性能的 dia-PASEF 扫描模式将彻底改变低上样量组织蛋白质组学,为分子医学实验室提供重要的解决方案选择 timsTOF Ultra,释放分子医学的潜力,解决 FFPE 组织中单个细胞分析复杂的难题,踏上推进患者治疗的变革之旅。3)挖掘 TIMS 和 PASEF 在微生物研究中宏蛋白质组学的潜力微生物在地球可持续性发展中发挥着至关重要的作用,对人类、动物和植物生存发展具有重要影响,并能影响全球性的问题。随着微生物组广泛的研究和对立法、经济和社会行为的影响,必须超越分类学特征,深入研究微生物群落的功能动态和与环境的相互作用。宏蛋白质组学已成为该方面研究的有力方法。突出优势:出色的肽段和蛋白质鉴定:利用 TIMS 和 PASEF 的离子淌度维度,以极高的准确度( CV 20% )和无与伦比的深度,鉴定和定量小鼠肠道微生物和宿主中的肽段和蛋白质。全面的分类和功能分析:实现可与常规基因组方法相媲美或超过的分析深度,全面了解微生物群落的分类及其功能。灵敏度和效率:灵敏度的显著提升,允许以最少的样品量进行分析。同时 PASEF 令人难以置信的扫描速度使得通过短梯度来加速分析成为可能。4)更高的流速推动血浆蛋白质组学血浆蛋白质组学提供蛋白质组的全面认识,在疾病诊断和治疗中起着至关重要的作用。为了在大队列研究中可靠地识别和监测生物标志物,必须利用人群筛查技术。常规微升液相色谱,VIP-HESI 离子化技术和 timsTOF Ultra 2 质谱仪的结合,提供了无与伦比的稳定性、超快的扫描速度、超高的重现性、高灵敏度和高通量。主要特点:耐用的电喷雾离子化技术可实现多达 5000 次 LC/MS 运行,提供出色的使用寿命使用 50 μm 喷雾针、 50 μL/min 的流速,获得 3 倍的信号提升,确保最佳的灵敏度使用插入式喷雾针替换标准的 VIP-HESI 喷雾针,毫不费力地实现无缝衔接使用我们的 4D-蛋白质组方法,10 分钟内实现样品肽段的高效检测和定量更长的色谱柱寿命,更低的维护成本布鲁克先进的解决方案针对更高流速进行了优化,加快血浆蛋白质组学的研究。卓越的稳健性、高灵敏度和高通量帮助您解开血浆蛋白质组的复杂性难题,加速疾病诊断和治疗的发现。5)超高灵敏的细胞脂质组学,获得前所未有的视野脂质的诊断潜力及其在细胞过程中的关键作用推动了下一代脂质组学对高灵敏度的需求。在细胞水平上分析脂质可以深入了解细胞异质性,为单细胞生物学、癌症病理学和临床研究的突破性发现铺平道路。结合布鲁克 nanoElute 2 纳升液相和 CaptiveSpray Ultra 离子源,超高灵敏度的 timsTOF Ultra 可以实现无与伦比的鉴定深度,使研究人员能够深入研究细胞层面脂质组学的复杂世界,揭示脂质与细胞功能之间的复杂关系。发现:MS/MS 全覆盖:PASEF 扫描模式的单次进样可全面覆盖 MS/MS 谱图,深入探索脂质类型提高 MS/MS 谱图质量: 利用 MOMA 淌度分离获得高质量的 MS/MS 谱图,提高脂质注释的准确性和可靠性准确的 CCS 值提高置信度: TIMS 测试得到准确的 CCS 值,增强脂质鉴定的可靠性布鲁克超灵敏度解决方案释放细胞脂质组学的潜力,获得脂质组成和功能前所未有的见解,彻底改变您在单细胞生物学、癌症病理学和临床研究等不同领域的研究。 timsTOF Ultra 和 MetaboScape 分析软件将您的脂质组学研究的灵敏度和准确性提升至一个新的高度,为脂质相关研究的变革性发展铺平道路。
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  • 扩展高通量 4D-蛋白质组学的功能速度:timsTOF HT 使用的 PASEF 技术能够实现在不影响分辨率和灵敏度的情况下达到超过 150 Hz 的扫描速度;耐用性:独特的仪器设计使得其可以连续分析数千个样品,仪器保持稳定的性能而无需清洁;灵敏度:第四代 TIMS-XR 的超大离子容量极大提升了分析深度;选择性:在四极杆和飞行管之前提供额外一维淌度分离,大大提升了峰容量。捕集型离子淌度分离,支持 CCS 值分析全新的 timsTOF HT 质谱仪整合了第四代超高离子容量的 TIMS-XR 分析器和更先进的数字转换技术。新的设计为无与伦比的蛋白质组学分析深度和高通量定量分析提供了更宽的动态范围。timsTOF HT 提供全面的 CCS 值辅助分析,并支持所有基于平行累积连续碎裂技术( PASEF )的数据采集模式,PASEF、dia-PASEF 和 prm-PASEF 使得 4D-蛋白质组学分析拥有更高的灵活性,轻松实现蛋白质组的全覆盖。PaSERPaSER 是一款 “ 运行即完成 ”( run and done )的实时数据库搜索平台,能够最大限度的提升鉴定深度和分析通量。内嵌 TIMScore&trade 和 TIMS DIA-NN 模块使得其能充分利用 CCS 值辅助分析,使得蛋白质鉴定更可靠。dia-PASEF 实现更快速的组织样本蛋白质组学分析针对心脏组织样本的快速蛋白质组学分析示例。通过 dia-PASEF 和 30 分钟短梯度色谱分离,对不同样本量的小鼠心脏组织蛋白酶解液进行三次重复分析。在进样量为 800ng 时,能鉴定到 4700 个蛋白,蛋白相对丰度跨越 5 个数量级。原始数据使用 DIA-NN 的非建库模式进行数据检索,蛋白拷贝数通过 ‘proteomics ruler’ 方法进行估算。dia-PASEF 和 TIMS DIA-NN、PaSER 的强大组合使细胞系蛋白质组获得前所未有的深度覆盖加大蛋白酶解液的进样量能够提高鉴定量,获得更高的蛋白覆盖深度。如图为使用 Aurora-25 cm 色谱柱,在 250nL/min 的流速下,通过 60 分钟色谱梯度洗脱,结合 timsTOF HT 质谱仪的 dia-PASEF( 100 毫秒淌度分离 )数据采集模式对人类细胞系 K562 的胰酶消化液进行质谱分析结果。采集后的数据通过 TIMS DIA-NN 搜库分析,数据库为 uniprot 人源已注释蛋白。靶向血浆蛋白质组学:30 分钟梯度定量超过 550 个蛋白timsTOF HT 的 dia-PASEF 采集方式与 Biognosys 公司的 PQ500 稳定同位素标肽技术结合,对血浆蛋白质组进行靶向分析。在 30 分钟色谱梯度下,可以实现对 578 个蛋白( 对应 804 条多肽 )的准确定量,数据完整性超过 99%。该方法通过一个简单快捷的采集设置将传统 SMS/MRM 技术的选择性和灵敏度结合起来,并能够根据经验后续再进行新靶标的选择。适用于更高进样量的纳升流速液相色谱柱PepSep 25cm 系列色谱柱( 内径 150 um,粒径 1.5 um ),对于上样量达到 1600ng 的 K562 酶解肽段进行分析时,依然能够保持平均峰宽小于 5 秒。41 分钟的色谱梯度足够支持有效的肽段分离,即便是更高的上样量,也能够获得同源性多肽的分离。
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淌度差分质谱相关的耗材

  • 1200 系列液相色谱-芯片/质谱系统 G1379A
    产品特点:Agilent 1200 系列液相色谱-芯片/质谱系统完全的集成系统,具有卓越的色谱性能和使用方便性* 与常规 LC 相比,灵敏度最多提高了 3500 倍* 没有峰扩散,具有无与伦比的色谱性能* 在聚合物芯片上直接集成了样品制备、分离色谱柱、连接毛细管、接头和纳流喷雾针订购信息:质谱系统Agilent 1200 系列液相色谱-芯片/质谱系统说明部件号1200 系列微量真空脱气机G1379A1200 系列毛细液相泵G1376A1200 系列纳流泵G2225A1200 系列微量多孔板自动进样器G1377A1200 系列自动进样器温控装置G1330B1200 系列液相色谱-芯片/质谱接口包含 HPLC-Chip Cube、MS 安装工具包、带照相机和显示器的正交双电极纳流电喷雾离子源、用于在化学本底降低模式下操作的带刷的离子源顶部板、蛋白质鉴定芯片 #1和 MS 校准及诊断芯片G4240A HPLC 芯片MS 校准和诊断芯片用于 MS 调谐混合物的注入和芯片 Cube 微波校准G4240-61001 蛋白质鉴定芯片 #1用于多肽分离,低/中等复杂性的胰蛋白酶解混合物。100-400 ng 的柱上样品量。40 nL 富集柱,75 μm x 43 mm 分析柱。固定相:5 mm,C-18 SB- ZORBAX,300?。G4240-62001 蛋白质鉴定芯片 #2用于多肽分离,中等/高复杂性的胰蛋白酶解混合物。柱上样品量可达 1 μg。40 nL 富集柱,75 μm x 150 mm 分析柱。固定相:5 mm,C-18 SB-Zorbax,300?。G4240-62002 Agilent 1200 系列液相色谱-芯片/质谱系统说明部件号HPLC 芯片聚糖芯片用于聚糖(寡糖)分离。可用于强极性化合物和结构相关化合物,比如几何异构体和非对映异构体。40 nL 富集柱,75 μm x 43 mm 分析柱。固定相:5 mm,石墨化碳。G4240-62003小分子芯片用于 SB-C18 固定相上分离小的且结构明确的分子。40 nL 富集柱,75 μm x 43 mm 分析柱。固定相:5 mm,C-18 SB-ZORBAX 80?。G4240-65001 注入芯片将样品直接注入或自动流体注射到纳流条件下的 MS 中进行 MS 和 MS/MS数据采集。G4240-61002 定制芯片适用于需要非标准固定相材料和/或非标准形状和及功能的用户。最小定货量:5 个芯片。需特殊报价 (SPQ)。G4240-63001 预设计的定制 HPLC 芯片这些 HPLC-芯片没有现货,是根据订货制造的。供货时间是接受订单后 4 周。总蛋白质芯片用于分离高达 80 kDa 的完整蛋白质。40 nL 富集柱,75 μm x 43 mm 分析柱。固定相:5 mm,C-8 SB-ZORBAX,300?。G4240-63001SPQ105 直接进样芯片用于将未经富集的样品直接注入分离柱上。芯片上 16 nL 进样环,75 μm x150 mm 分析柱。固定相:5 mm,C-18 SB-ZORBAX,300?。G4240-63001SPQ100 蛋白质鉴定芯片 #3高容量富集柱。用于多肽分离,高复杂性的胰蛋白酶解混合物。柱上样品量可达 4 μg。160 nL 富集柱,75 μm x 150 mm 分析柱。固定相:5 mm,C-18SB-ZORBAX,300?。G4240-63001SPQ110 UHC 小分子芯片用于需要高容量和宽极性范围的小分子分离。500 nL 富集柱,75 μm x 150 mm分析柱。固定相:5 mm,C-18 SB-ZORBAX,80?。当使用这一芯片分析生物体液时,强烈推荐使用在线过滤器。G4240-63001SPQ115
  • 天骅自动化仪表附温糖度计附温糖度计糖液计
    糖液计 酒精计 Alcoholmeler.石油密度计.Oil hydrometer .一、概况及用途: 这三种比重计均属于专业用比重计,糖液比重计用以测定糖液中所含的干固物质糖的重量百分比。酒情比重计是专用于测定酒精水溶液中酒精含量百分比,广泛用于酿酒厂、专卖单位及化工厂对果酒、白酒、黄酒等食用酒与酒精溶液中所含酒精含量测定。石油密度计专用于石油产品的密度测量用。二、使用方法: 使用前先将比重计的压载物检查是否松动,刻度标尺是否有移位等缺陷,然后洗净、擦干,被测溶液置于长的筒中,用手拿比重计干管的顶端,轻轻的放入被测的溶液中,浮计与筒壁和筒家均不得接触,待比重计在溶液中稳定后,可以直接读取所求的百分含量,但要测定密度时需用公式进行换算。换算的公式见密度计使用。
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    糖液计 酒精计 Alcoholmeler.石油密度计.Oil hydrometer .一、概况及用途: 这三种比重计均属于专业用比重计,糖液比重计用以测定糖液中所含的干固物质糖的重量百分比。酒情比重计是专用于测定酒精水溶液中酒精含量百分比,广泛用于酿酒厂、专卖单位及化工厂对果酒、白酒、黄酒等食用酒与酒精溶液中所含酒精含量测定。石油密度计专用于石油产品的密度测量用。二、使用方法: 使用前先将比重计的压载物检查是否松动,刻度标尺是否有移位等缺陷,然后洗净、擦干,被测溶液置于长的筒中,用手拿比重计干管的顶端,轻轻的放入被测的溶液中,浮计与筒壁和筒家均不得接触,待比重计在溶液中稳定后,可以直接读取所求的百分含量,但要测定密度时需用公式进行换算。换算的公式见密度计使用。

淌度差分质谱相关的试剂

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