丙氨酸氨基转移酶

合成生物学正在引领第三次生物技术革新，其作为底层技术将驱动多个领域的创新发展，包括医药、食品、农业、材料、环境甚至信息存储等。合成生物学是生物学工程化高度交叉的前沿学科研究域，包含几个不同的研究层次：认识生命、改造生命和创造生命；要想实现其终极目标，还需要在生命本质探索及相关技术的不断创新与应用上持续深入。我们将紧跟合成生物学领域的前沿研究进展，为大家系列解读该领域的最新科研成果。本期分享植物酶功能研究新方法，酶功能的深入认识将为下一步异源设计细胞工厂提供重要依据。研究成果来自中国科学院深圳先进技术研究院合成基因组学研究中心的赵乔研究员课题组在 Molecular Plant 上发表的题为“Glycosides-specific metabolomics combined with precursor isotopic labeling for characterizating plant glycosyltransferases”的研究论文[1]，为大家介绍一种特异针对糖基化合物的代谢组（glycosides-specific metabolomics，GSM）和同位素标记前体化合物示踪（precursor isotopic labeling，PIL）相结合的方法，可以高效、准确鉴定糖基转移酶（glycosyltransferases，GTs）在植物体内的产物，解析 GTs 在特定代谢通路中的作用。该方法极大缩小了目标化合物的范围，在糖基化合物定性、方法可靠性方面较传统生化手段或非靶向方法有较大提升，为植物糖基转移酶的功能解析提供了新手段。专家解读核心信息赵乔研究员中国科学院深圳先进技术研究院合成所合成基因组学研究中心主任。于美国俄亥俄州立大学植物系 Iris Meier 实验室取得博士学位后，在美国 Noble Foundation 美国科学院院士 Richard Dixon 实验室从事博士后研究。主要研究领域是植物天然产物的合成以及调控机制。已在该领域取得了一系列重要的成果，共发表 SCI 论文 30 余篇，累计他引 1500 次，其中第一或通讯作者的文章发表在包括 Molecular Plant、PNAS、Plant Cell 以及 Trends in Plant Science 等国际专业期刊上。“植物的次生代谢物种类繁多且修饰丰富，其中糖基化修饰在提供结构基础的同时也为其多样化的生物学功能发挥了重要作用。为了有效鉴定糖基化过程，需要使用高分辨质谱进行非靶向的特异性代谢组学研究，同时结合同位素标记来跟踪不同糖苷代谢物在突变体中的示踪结果以分析 UGTs 的功能，进而全面表征植物糖基化修饰的次级代谢物，为拓展天然化合物的高效生物合成提供依据。”酶功能研究及植物次级代谢产物鉴定的挑战植物中含有丰富的次级代谢产物，种类超过 40 万种。糖基化是一种常见的修饰方式，赋予化合物复杂且多样的结构，形成种类繁多的糖基化产物。糖基化修饰可以改变相应苷元的催化活性、溶解性、稳定性及其在细胞中的定位，在调节激素的稳态平衡，外源有害物质解毒，抵御生物和非生物胁迫中都发挥着重要的作用。同时，糖基化修饰可以改变天然产物的药理活性和生物利用率等性质，这些糖苷类化合物是天然药物的重要来源。植物 UGTs（UDP 糖基转移酶）以多基因家族的形式存在，它们能够利用不同的糖基供体，糖基化多种多样的植物小分子化合物。目前的研究多数集中在生化功能的确定上，UGTs 具有底物杂泛性和催化杂泛性，同一个 UGT 在体外可以催化结构不同的底物，且不同的 UGTs 可以识别同一种的底物。此外，由于植物体内的底物可得性和特殊且复杂多变的细胞环境，这些通过生化方法对 UGTs 活性、生理功能等的研究结果往往不能反映 UGTs 在植物体内的真实功能。GSM-PIL 方法实现对植物糖基化修饰次级代谢物的高效、准确鉴定非靶向特异性代谢组学（GSM）：基于内源碰撞诱导解离（ISCID）的中性质量丢失模式建立非靶向特异性代谢组学方法，以对糖基化修饰的次级代谢物进行针对性分析。该 GSM 方法可将受到 UDP 糖基转移酶（以 UGT72Es 为例）影响的代谢物范围从 1000 种缩小至 100 个。同位素标记前体化合物示踪（PIL，代谢流）：使用同位素标记的苯丙氨酸前体对 UGT72E 在特定的苯丙氨酸代谢通路中的作用进行示踪分析，可进一步将目标产物范围缩小到 22 个。图 1. GSM-PIL 方法解析 UGT72Es 在植物体内的功能GSM-PIL 方法的适用性及可靠性通过 GSM-PIL 方法，不但可以鉴定到已发表的两种木质素单体糖基化产物，还发现 UGT72E 家族参与植物苯丙烷通路中其他 15 种化合物的糖基修饰作用。进一步通过 UGT72Es 的体外酶活分析，植物内源基因过表达以及遗传互补等实验证实 UGT72Es 对这些化合物的糖基化作用，验证了 GSM-PIL 方法的可靠性。同时，该研究还发现了 UGT72Es 在植物体内对香豆素的糖基化作用，进而在植物碱性缺铁胁迫环境下发挥重要作用。最后，通过 UGT78D2 的功能解析，展示了 GSM-PIL 方法的普遍适用性。高分辨质谱结合数据高效提取软件协助 GSM-PIL 方法建立为了确保糖基化修饰的次级代谢物以及同位素示踪化合物的的高效检测，本研究采用安捷伦 6546 QTOF LCMS 系统进行数据采集；进一步结合 MassHunter、Profinder 数据处理软件对代谢组和同位素示踪数据进行有效提取和解析。图 2. 基于高分辨质谱的 GSM-PIL 方法建立 结 语 综上，基于液相-高分辨质谱的 GSM-PIL 方法可以高效解析 UGTs 在植物体内的功能。相对于传统一对一“钓鱼”式地探索 UGTs 功能，GSM-PIL 方法可以“捕鱼”式地一网打尽 UGTs 的产物，全面鉴定未知的底物或糖基化产物，解析 UGTs 在植物中未知的生理功能，揭示了植物中的糖基化网络比我们想象中更复杂。同时该方法可用于探索其他代谢途径，帮助人们进一步了解、进而利用植物合成途径，为拓展天然化合物的高效生物合成提供依据。参考文献：[1] Jie Wu, Wentao Zhu, Xiaotong Shan, Jinyue Liu, Lingling Zhao and Qiao Zhao. Glycosides-specific metabolomics combined with precursor isotopic labeling for characterizating plant glycosyltransferases. Molecular Plant 15, 1517-1532.

关于发布《血红蛋白测定参考方法》等13项推荐性卫生行业标准的通告(卫通〔2011〕16号) 　　现发布《血红蛋白测定参考方法》等13项推荐性卫生行业标准，其编号和名称如下： 　　WS/T 341-2011 血红蛋白测定参考方法 　　WS/T 342-2011 红细胞比容测定参考方法 　　WS/T 343-2011 红细胞沉降率测定参考方法 　　WS/T 344-2011 出血时间测定要求 　　WS/T 345-2011 血清尿素测定参考方法 　　WS/T 346-2011 网织红细胞计数的参考方法 　　WS/T 347-2011 血细胞分析的校准指南 　　WS/T 348-2011 尿液标本的收集及处理指南 　　WS/T 349-2011 α-淀粉酶催化活性浓度测定参考方法 　　WS/T 350-2011 血清葡萄糖测定参考方法 　　WS/T 351-2011 碱性磷酸酶(ALP)催化活性浓度测定参考方法 　　WS/T 352-2011 丙氨酸氨基转移酶催化活性浓度测定(无磷酸吡哆醛)参考方法 　　WS/T 353-2011 天门冬氨酸氨基转移酶催化活性浓度测定(无磷酸吡哆醛)参考方法 　　以上标准自2012年4月1日起施行。 　　特此通告。 二〇一一年九月三十日

国务院政策吹风会强化发热门诊建设，强化传染病检测能力2020年7月28日上午10时，国务院新闻办公室举行国务院政策例行吹风会。在谈及下一步将采取哪些措施补齐我国公共卫生防控和救治基础设施方面存在一些短板和漏洞时，国家发展和改革委员会社会司司长欧晓理表示：党中央、国务院高度重视，专门作出部署，国家发改委、国家卫健委和中医药局积极贯彻落实，我们在很短的时间里就研究制定了公共卫生防控救治能力建设方案。在未来一段时间，重点通过加强相关医疗卫生机构建设，强化七项能力，完善三个保障。在七项能力建设中，针对发热门诊及传染病检测，提出了以下重点：01　要强化发热门诊的接诊能力，所有二级以上综合医院要重点落实“三区两通道”要求，合理布局诊室、留观室、候诊区，扩大等候间距，配齐筛查所需的设施设备。 02 强化实验室的检测能力，新增一批达到P3水平的实验室，填补地市级P2实验室空白点，提升重大传染病检测一锤定音的能力。03 强化传染病的检测能力，所有承担收治任务的医院都要具备已知传染病的常规检测能力，同时也要充分发挥科研机构、企业等第三方实验室的作用。北京卫健委《通知》：加快发热门诊实验室及相关设备配置，发挥其在传染病防控中的探头作用7月3日，为了进一步完善传染病防控体系建设，提升传染病防控能力，切实发挥发热门诊在传染病防控中的探头作用，北京市卫健委印发了《关于加快推进我市医疗机构发热门诊建设改造有关工作的通知》。《通知》对发热门诊的功能需求，以及发热门诊实验室的建设标准和相关仪器设备的配置进行了明确的说明：功能需求：承担发热患者的筛查、诊断、治疗，对筛查出的传染病患者采取隔离救治措施，实现对传染病的早发现、早报告、早隔离、早治疗。推进建设工作：各级医疗机构需设置发热门诊的，应参照《北京市发热门诊设置指南（2020版）》和《医疗机构发展门诊临床实验室能力建设专家共识（2020版）》对发热门诊进行改造或建设，最大程度保证检查治疗在发热门诊内完成，避免与普通门诊动线、病区交叉。发热门诊临床试验开展的检验项目：1.临床血液/体液应开展项目：全血细胞计数、尿液干化学分析、粪便常规检查。建议开展项目：凝血酶原时间、活化部分凝血活酶时间、凝血酶时间、纤维蛋白原、纤维蛋白（原）降解产物、D-二聚体、抗凝血酶、ABD血型鉴定（正定型和反定型）、RhD血型鉴定、尿有形成分分析、粪便隐血试验、尿人绒毛膜促性腺激素试验等。2.临床生化应开展项目：钾、钠、氯、钙、碳酸氢盐/总二氧化碳、血糖、肌酐、尿素、尿酸、丙氨酸氨基转移酶、天门冬氨酸氨基转移酶、γ-谷氨酰基转移酶、总蛋白、白蛋白等。建议开展项目：乳酸、血气分析、胆碱酯酶、脂肪酶、淀粉酶、糖化白蛋白、糖化血红蛋白A、微量白蛋白测定等。3.临床免疫/血清学应开展项目：特定流行性传染病抗原和/或抗体、降钙素原、C-反应蛋白。建议开展项目：乙型肝炎病毒表面抗原、丙型肝炎病毒抗体、人免疫缺陷病毒抗体、梅毒螺旋体、人绒毛膜促性腺激素、孕酮、血清淀粉样蛋白A、白细胞介素-6、淋巴细胞亚群等。4.临床分子生物学应开展项目：特定流行性传染病病原体核酸检测。5.临床微生物学建议开展项目：直接涂片革兰染色镜检、无菌体液细菌培养、血液或相关体液培养、便培养等。检测仪器及辅助设备实验室应选择适用于发热门诊检验工作需求的检测设备。仪器的选型原则：小型化、检测速度快、一机多能。推荐使用闭盖穿刺的仪器设备和全自动检测设备。标准配置：1）血液分析仪（闭盖穿刺）；2）全自动尿液分析仪；3）全自动生化分析仪（湿式或干式）；4）全自动免疫分析仪；5）基因扩增仪；6）生物安全型离心机（如带有密闭盖或密封桶）；7）显微镜；8）医用冰箱（冷藏、冷冻）。建议配置：1）尿沉渣分析仪；2）全自动粪便分析仪；3）全自动血型分析仪；4）全自动血气分析仪；5）全自动凝血分析仪；6）自动核酸提取仪；7）流式细胞分析仪；8）全自动核酸分析仪；9）血培养仪；10）细菌鉴定仪等。物资储备清单常规检测试剂盒传染性病原体检测相关的试剂；耗材（病毒采样管、带滤芯的吸头等）；消毒用品（含氯消毒剂，75%乙醇，洗手液等）；个体防护装备（医用外科口罩，医用防护口罩，防护服，防水隔离衣，鞋套/靴套，手套，护目镜/面屏等）；意外事故处理箱，样本转运箱，急救箱，医疗废弃物转运箱等。助战发热门诊迪澳生物推出结核病核酸快速应急检测系统针对我国重大传染病结核病的防控，迪澳生物推出了针对发热门诊实验室应用的快速应急检测系统，该系统由结核分枝杆菌复合群核酸检测试剂和恒温核酸扩增荧光检测分析仪（Deaou-16P）组成，因其“安全、准确、快速、便携、联网”，被纳入国家结核病参比实验室的推荐检测方法。该技术从2015年国家卫计委疾控局推荐开展以来，已经服务于全国多个省市的结核病防控工作，并在疫情应急防控中也得到了很好的应用。其主要特点如下：01 安全：专用收集管全封闭提取痰液样本，降低气溶胶感染风险。02 准确：采用IMSA恒温扩增技术，灵敏度高；对结核分支杆菌复合群特异性的核酸片段设计了6条引物，覆盖7个区域，对靶区进行特异性扩增，对于结核诊断的特异性可达95%以上。03 快速：操作便捷、耗时短，1~16个样本/批，1个小时即可出报告。04 便携：仪器轻巧，携带方便，可用于结核病野外应急诊断。05 联网：自动上传数据，无缝接入医院的 LIS、HIS 系统。应急套装：设备展示：