组蛋白脱乙酰酶抑制剂

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  • 组蛋白乙酰化

    组蛋白乙酰化组蛋白修饰通过改变组蛋白与DNA的亲和性使染色质结构发生改变,进而影响转录因子与DNA序列的结合和基因表达,包括乙酰化、甲基化、磷酸化等,其中乙酰化是最重要的修饰方式之一,其主要发生在组蛋白H3赖氨酸(Lysine, Lys)的位点上,在癌症进展中发挥双重作用,既参与肿瘤抑制基因的沉默,又增强癌基因的表达[11],它受组蛋白乙酰转移酶(Histone acetyl transferase,HAT)和组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylase,HDAC)调控。HDAC可移去Lys残基上的乙酰基,增强组蛋白的正电性,DNA(本身带有负电荷)与组蛋白结合紧密,转录因子不易于DNA结合,抑制抑癌基因的转录,HAT作用则相反,二者动态平衡才能使组蛋白乙酰化维持在正常水平。表观遗传学改变通过调控基因转录平衡组蛋白乙酰化和去乙酰化,从而影响细胞周期、凋亡和分化相关蛋白的表达水平[12]。2.1 组蛋白乙酰化水平与SCLC发生发展密切相关 一项实验研究表明,乙酰化组蛋白H3在SCLC和NSCLC细胞中的表达有显著性差异,以前者表达较高。Notch信号通路是SCLC发生发展和化疗耐药的主要调节通路之一[13],具有肿瘤抑制作用。此研究中,Notch1在SCLC细胞系(除H69AR、SBC-3)中失活,其表达水平与组蛋白H3乙酰化有关。Notch1阳性表达的细胞系中乙酰化组蛋白H3富集在Notch1启动子区域,表达水平较高,Notch1阴性表达的细胞系中Notch1启动子周围的乙酰化组蛋白H3水平较低。这说明组蛋白去乙酰化是Notch1基因在SCLC中表观失活的原因[14]915-918。此外,组蛋白H3赖氨酸23(histone 3 lysine 23, H3K23)乙酰转移酶KAT6B在SCLC中失活,若其活性恢复可对SCLC产生抑制作用,它的乙酰化水平降低是SCLC发生的重要标志[15]。由此可见,组蛋白去乙酰化可以调控相关基因的表达从而促进SCLC发生发展。2.2 组蛋白去乙酰化酶抑制剂 HDAC在许多癌症中过表达,干扰其活性、抑制其功能是有效的治疗手段。组蛋白去乙酰化酶抑制剂(Histone deacetylase inhibitor, HDACI)是重要的表观调控药物,高效低毒,通过靶向阻断HDAC去乙酰化、促进组蛋白乙酰化发挥抗肿瘤作用。根据化学结构的不同,HDACIs分为异羟肟酸(异羟肟酸酯)、短链脂肪(脂肪族)酸、环状四肽、苯甲酰胺和Sirt抑制剂5类[16]。在单药和/或与传统化疗药物联合使用时,HDACI可阻滞细胞周期,抑制迁移和侵袭[17],诱导癌细胞分化、自噬[18]、凋亡,抗血管生成。当前,伏立诺他(Vorinostat ,SAHA)、罗米地辛(Romidepsin)、帕比司他(Panobinostat)等被批准用于血液系统恶性肿瘤的治疗[19]。丙戊酸(valproic acid ,VPA)作为HDACI可抑制SCLC细胞生长,诱导细胞凋亡,阻滞SCLC细胞周期于G1期。以上抑制作用是通过降低HDAC4表达,增加组蛋白H4乙酰化实现的。同时发现,VPA激活了SCLC中Notch1、Notch靶基因HES1和P21的Notch信号通路。此外,它还可以上调生长抑素受体II(somatostatinreceptor2,SSTR2)并增强受体靶向细胞毒素的抑制作用[20]。在经曲古抑菌素A (Trichostatin A ,TSA)处理后的SCLC细胞系中, Notch1启动子区域H3乙酰化水平增加,从而导致Notch1蛋白表达。此外,经TSA处理后,SCLC细胞黏附增加,上皮间质转化标志物表达减少,细胞增殖减少,细胞凋亡激活,可能与TSA诱导Notch1表达有关[14]916-918。这些研究成果为HDACI在 SCLC治疗中的应用提供了依据。为了达到最好治疗效果,药物用量、联合用药及使用顺序仍需深入研究。

  • 【原创大赛】组蛋白乙酰化

    [size=20px] [/size][size=20px]组蛋白乙酰化[/size][size=16px]组蛋白修饰通过改变组蛋白与[/size][size=16px]DNA[/size][size=16px]的亲和性使染色质结构发生改变,进而影响转录因子与[/size][size=16px]DNA[/size][size=16px]序列的结合和基因表达[/size][size=16px],[/size][size=16px]包括乙酰化、甲基化、磷酸化等,其中乙酰化是最重要的修饰方式之一,其主要发生在组蛋白[/size][size=16px]H3[/size][size=16px]赖氨酸([/size][size=16px]Lysine, Lys[/size][size=16px])的位点上,在癌症进展中发挥双重作用,既参与肿瘤抑制基因的沉默,又增强癌基因的表达[/size][font='times new roman'][size=16px][11][/size][/font][size=16px],它受组蛋白乙酰转移酶([/size][size=16px]Histone acetyl transferase[/size][size=16px],[/size][size=16px]HAT[/size][size=16px])和组蛋白去乙酰化酶[/size][size=16px](Histone deacetylase[/size][size=16px],[/size][size=16px]HDAC)[/size][size=16px]调控。[/size][size=16px]HDAC[/size][size=16px]可移去[/size][size=16px]Lys[/size][size=16px]残基上的乙酰基,增强组蛋白的正电性,[/size][size=16px]DNA[/size][size=16px](本身带有负电荷)与组蛋白结合紧密,转录因子不易于[/size][size=16px]DNA[/size][size=16px]结合,抑制抑癌基因的转录,[/size][size=16px]HAT[/size][size=16px]作用则相反,二者动态平衡才能使组蛋白乙酰化维持在正常水平。表观遗传学改变通过调控基因转录平衡组蛋白乙酰化和去乙酰化,从而影响细胞周期、凋亡和分化相关蛋白的表达水平[/size][font='times new roman'][size=16px][12][/size][/font][size=16px]。[/size][size=20px]1[/size][size=20px] [/size][size=20px]组蛋白乙酰化水平与[/size][size=20px]SCLC[/size][size=20px]发生发展密切相关[/size][font='黑体'][size=14px] [/size][/font][font='黑体'][size=14px] [/size][/font][size=14px] [/size][size=16px]一项实验研究表明,乙酰化组蛋白[/size][size=16px]H3[/size][size=16px]在[/size][size=16px]SCLC[/size][size=16px]和[/size][size=16px]NSCLC[/size][size=16px]细胞中的表达有显著性差异,以前者表达较高。[/size][size=16px]Notch[/size][size=16px]信号通路是[/size][size=16px]SCLC[/size][size=16px]发生发展和化疗耐药的主要调节通路之一[/size][font='times new 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H3K23)[/size][size=16px]乙酰转移酶[/size][size=16px]KAT6B[/size][size=16px]在[/size][size=16px]SCLC[/size][size=16px]中失活,若其活性恢复可对[/size][size=16px]SCLC[/size][size=16px]产生抑制作用,它的乙酰化水平降低是[/size][size=16px]SCLC[/size][size=16px]发生的重要标志[/size][font='times new roman'][size=16px][15][/size][/font][size=16px]。由此可见,组蛋白去乙酰化可以调控相关基因的表达从而促进[/size][size=16px]SCLC[/size][size=16px]发生发展。[/size][size=20px]2 [/size][size=20px]组蛋白去乙酰化酶抑制剂[/size][font='黑体'][size=14px] [/size][/font][font='黑体'][size=14px] [/size][/font][size=16px]HDAC[/size][size=16px]在许多癌症中过表达,干扰其活性、抑制其功能是有效的治疗手段。组蛋白去乙酰化酶抑制剂([/size][size=16px]Histone deacetylase inhibitor, HDACI[/size][size=16px])是重要的表观调控药物,高效低毒,通过靶向阻断[/size][size=16px]HDAC[/size][size=16px]去乙酰化、促进组蛋白乙[/size][size=16px]酰化发挥抗肿瘤作用。根据化学结构的不同,[/size][size=16px]HDACIs[/size][size=16px]分为异羟肟酸(异羟肟酸酯)、短链脂肪(脂肪族)酸、环状四肽、苯甲酰胺和[/size][size=16px]Sirt[/size][size=16px]抑制剂[/size][size=16px]5[/size][size=16px]类[/size][font='times new 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,VPA)[/size][size=16px]作为[/size][size=16px]HDACI[/size][size=16px]可抑制[/size][size=16px]SCLC[/size][size=16px]细胞生长,诱导细胞凋亡,阻滞[/size][size=16px]SCLC[/size][size=16px]细胞周期于[/size][size=16px]G1[/size][size=16px]期。以上抑制作用是通过降低[/size][size=16px]HDAC4[/size][size=16px]表达,增加组蛋白[/size][size=16px]H4[/size][size=16px]乙酰化实现的。同时发现,[/size][size=16px]VPA[/size][size=16px]激活了[/size][size=16px]SCLC[/size][size=16px]中[/size][size=16px]Notch1[/size][size=16px]、[/size][size=16px]Notch[/size][size=16px]靶基因[/size][size=16px]HES1[/size][size=16px]和[/size][size=16px]P21[/size][size=16px]的[/size][size=16px]Notch[/size][size=16px]信号通路。此外,它还可以上调生长抑素受体[/size][size=16px]II[/size][size=16px]([/size][size=16px]somatostatinreceptor2[/size][size=16px],[/size][size=16px]SSTR2[/size][size=16px])并增强受体靶向细胞毒素的抑制作用[/size][font='times new roman'][size=16px][20][/size][/font][size=16px]。在经曲古抑菌素[/size][size=16px]A (Trichostatin A ,TSA)[/size][size=16px]处理后的[/size][size=16px]SCLC[/size][size=16px]细胞系中,[/size][size=16px] Notch1[/size][size=16px]启动子区域[/size][size=16px]H3[/size][size=16px]乙酰化水平增加,从而导致[/size][size=16px]Notch1[/size][size=16px]蛋白表达。此外,经[/size][size=16px]TSA[/size][size=16px]处理后,[/size][size=16px]SCLC[/size][size=16px]细胞黏附增加,上皮间质转化标志物表达减少,细胞增殖减少,细胞凋亡激活,可能与[/size][size=16px]TSA[/size][size=16px]诱导[/size][size=16px]Notch1[/size][size=16px]表达有关[/size][font='times new roman'][size=16px][14]916-918[/size][/font][size=16px]。这些研究成果为[/size][size=16px]HDACI[/size][size=16px]在[/size][size=16px] SCLC[/size][size=16px]治疗中的应用提供了依据。为了达到最好治疗效果,药物用量、联合用药及使用顺序仍需深入研究。[/size]

  • 我国“替尼类”(酪氨酸激酶抑制剂)抗肿瘤药的市场现状

    我国“替尼类”(酪氨酸激酶抑制剂)抗肿瘤药的市场现状2012年1月FDA批准辉瑞公司小分子酪氨酸激酶抑制剂阿西替尼上市,开始了又一轮抗肿瘤靶向药物研究的新高潮。酪氨酸激酶在肿瘤的发生、发展过程中起着非常重要的作用,以酪氨酸激酶为靶点进行药物研发已成为国际上抗肿瘤药物研究的热点。酪氨酸酶抑制剂在临床上通过抑制肿瘤细胞的损伤修复、使细胞分裂阻滞在G1期、诱导和维持细胞凋亡、抗新生血管形成等多途径实现抗肿瘤效果;其抗癌谱广,已经成为治疗各种癌症疾病的一线用药。伊马替尼是基于癌细胞分子作用机理而开发的第一个抗癌新药,开创了肿瘤分子靶向治疗的时代。目前我国已有8个酪氨酸激酶抑制剂上市,包括伊马替尼、厄洛替尼、舒尼替尼等,此类药物的市场情况如下表,其中只有埃克替尼一个为国产产品,其它均为进口产品。表1:酪氨酸激酶抑制剂靶向抗肿瘤药在中国上市情况通用名 商品名 中国上市年份 在中国上市的首家公司 伊马替尼 格列卫 2002 诺华 吉非替尼 易瑞莎 2004 阿斯利康 厄洛替尼 特罗凯 2006 罗氏 索拉非尼 多吉美 2006 拜耳 舒尼替尼 索坦 2007 辉瑞 尼洛替尼 达希纳 2009 诺华 达沙替尼 施达赛 2011 百时美施贵宝 埃克替尼 凯美纳 2011 浙江贝达药业有限公司 靶向治疗,是在细胞分子水平上,针对已经明确的致癌位点(该位点可以是肿瘤细胞内部的一个蛋白分子,也可以是一个基因片段),来设计相应的治疗药物,药物进入体内会特异地选择致癌位点来相结合发生作用,使肿瘤细胞特异性死亡,而不会波及肿瘤周围的正常组织细胞。由于靶向制剂可以提高药效、降低毒性,从而增强了药品的安全性、有效性和病人用药的顺应性,所以日益受到国内外医药界的广泛重视。从2011年各大公司年报数据了解到,诺华的伊马替尼销售额最大,超过46亿美元,罗氏的厄洛替尼和辉瑞的舒尼替尼销售额都超过10亿美元。表2:2011年各大药企的酪氨酸激酶抑制剂产品全球销售额通用名 企业 2011年销售额 伊马替尼 诺华 46.59亿美元 厄洛替尼 罗氏 12.51亿瑞士法郎 舒尼替尼 辉瑞 11.87亿美元 索拉非尼 拜耳 7.25亿欧元 达沙替尼 达沙替尼 8.03亿美元 尼洛替尼 诺华 7.16亿美元 吉非替尼 阿斯利康 5.54亿美元 拉帕替尼 葛兰素史克 2.31亿英镑

组蛋白脱乙酰酶抑制剂相关的方案

  • 多酸类组蛋白去乙酰化酶抑制剂的筛选及抗肿瘤活性研究
    多金属氧酸盐(polyoxometallates,POMs)由于结构的多样性以及其在分子尺寸、表面电荷分布、氧化还原电位、极性、酸性、溶解性及热稳定性等方面高度可调的分子特性,在材料,磁学,催化,尤其是医药科学等领域都有着广泛而重要的应用。肿瘤一直是威胁人类健康的一大顽疾。研究表明,组蛋白去乙酰化酶抑制剂(histone deacetylaseinhibitors,HDACi)可以通过改变组蛋白或转录因子的乙酰化状态诱导肿瘤细胞生长、分化或凋亡,具有明显的抗肿瘤活性。本论文首次将多酸类药物用于HDACi的筛选,从近400种POMs化合物中筛选出了五类13种与已知HDACi具有相同作用效果的多金属氧酸盐化合物。这五类POMs化合物分别是:1.夹心型钨锗酸盐化合物PA-304 PA-312 PA-313 PA-315 PA-317;2.三有机锡取代的钨锗酸盐化合物PA-320;3.过渡金属连接二钛取代的Keggin型钨磷酸盐形成的化合物PA-324 PA-331 PA-332PA-330;4.临床有机药物与Anderson型多阴离子形成的超分子化合物PA-301 PA-303;5.含Ti的三聚杂多钨锗酸盐化合物PA-334。实验中以PA-320为代表化合物,对其抗肿瘤活性做了初步的验证。绿色荧光蛋白质粒报告基因的荧光照片显示PA-320可以诱导绿色荧光蛋白发光增强,且发光的强度要强于已知临床组蛋白去乙酰化酶抑制剂TSA的作用效果。直观的说明PA-320可以刺激p21基因表达增加。逆转录PCR(RT-PCR)和DNA电泳的结果证实,不同浓度的PA-320处理的细胞,其细胞中p21基因的表达量与用临床组蛋白去乙酰化酶抑制剂BUA处理细胞后的作用效果相同。说明PA-320有和临床HDACi相同的作用功效,可以刺激p21基因的表达增加。据文献报道HDAC1对p21WAF1/CIP1基因的抑制作用最为显著。PA-320对瞬时转染的HDAC1-7的实验结果证实,在转染了HDAC1的同时加入一定浓度PA-320刺激后,p21WAF1/CIP1基因启动子报告基因的活性明显增强,HDAC1的活性明显受到抑制。瞬时转染HDAC实验证明多金属氧酸盐化合物PA-320可以很好的抑制HDAC的活性。MTT实验结果证实PA-320对Hela细胞,LNCaP细胞,293T细胞,SW620细胞四种癌细胞均有抑制作用。实验测得对四种癌细胞的IC50值分别为38.8679μg/ml,45.1477μg/ml,44.4783μg/ml和9.2771μg/ml。说明PA-320可以在相对较低的浓度下(100μg/ml),PA-320的抑制浓度也是比较低的。说明PA-320对肿瘤细胞有很好的抑制效果。
  • 人半胱氨酸蛋白酶抑制剂B(CSTB)检测试剂盒
    人半胱氨酸蛋白酶抑制剂B(CSTB)检测试剂盒人半胱氨酸蛋白酶抑制剂B(CSTB)检测试剂盒使用说明书本试剂盒仅供研究使用。检测范围: 规格:96T/48T使用目的:本试剂盒用于测定人血清,血浆及相关液体样本中人半胱氨酸蛋白酶抑制剂B(CSTB)含量。实 验 原 理 本试剂盒应用双抗体夹心酶标免疫分析法测定标本中人半胱氨酸蛋白酶抑制剂B(CSTB)水平。用纯化的抗体包被微孔板,制成固相抗体,往包被单抗的微孔中依次加入人半胱氨酸蛋白酶抑制剂B(CSTB)抗原、生物素化的人半胱氨酸蛋白酶抑制剂B(CSTB)抗体、HRP标记的亲和素,经过彻底洗涤后用底物TMB显色。TMB在过氧化物酶的催化下转化成蓝色,并在酸的作用下转化成最终的黄色。颜色的深浅和样品中的人半胱氨酸蛋白酶抑制剂B(CSTB)呈正相关。 使用酶标仪在450nm波长下测定吸光度(OD值),计算样品浓度。
  • 人半胱氨酸蛋白酶抑制剂/胱抑素C(Cys-C)检测试剂盒
    人半胱氨酸蛋白酶抑制剂/胱抑素C(Cys-C)检测试剂盒人半胱氨酸蛋白酶抑制剂/胱抑素C(Cys-C)检测试剂盒使用说明书本试剂盒仅供研究使用。检测范围: 规格:96T/48T使用目的:本试剂盒用于测定人血清,血浆及相关液体样本中人半胱氨酸蛋白酶抑制剂/胱抑素C(Cys-C)含量。实 验 原 理 本试剂盒应用双抗体夹心酶标免疫分析法测定标本中人半胱氨酸蛋白酶抑制剂/胱抑素C(Cys-C)水平。用纯化的抗体包被微孔板,制成固相抗体,往包被单抗的微孔中依次加入人半胱氨酸蛋白酶抑制剂/胱抑素C(Cys-C)抗原、生物素化的人半胱氨酸蛋白酶抑制剂/胱抑素C(Cys-C)抗体、HRP标记的亲和素,经过彻底洗涤后用底物TMB显色。TMB在过氧化物酶的催化下转化成蓝色,并在酸的作用下转化成最终的黄色。颜色的深浅和样品中的人半胱氨酸蛋白酶抑制剂/胱抑素C(Cys-C)呈正相关。 使用酶标仪在450nm波长下测定吸光度(OD值),计算样品浓度

组蛋白脱乙酰酶抑制剂相关的资讯

  • Namocell在CRISPR中的最新应用---微管蛋白聚合抑制剂与癌症研究
    当CRISPR 遇见Namocell---微管蛋白聚合抑制剂与癌症研究最新进展微管蛋白是一种在维持细胞结构和促进细胞分裂中起着关键作用的蛋白质。抑制微管蛋白聚合已被证明是抑制癌细胞增殖的有效策略。在以往的研究中,识别能够抑制微管蛋白聚合的化合物需要利用纯化的微管蛋白或固定细胞的免疫荧光分析进行体外实验。2023年1月29日,美国Harutyun Khachatryan研究团队在Biomolecules杂志发表了文章Identifification of Inhibitors of Tubulin Polymerization Using a CRISPR-Edited Cell Line with Endogenous Fluorescent Tagging of β-Tubulin and Histone H1,提出了一种新的方法来识别微管蛋白聚合抑制剂,利用内源性荧光标记β-微管蛋白和组蛋白H1的CRISPR - Hela细胞系来鉴定微管蛋白聚合抑制剂。该方法有助于研究活细胞内源性蛋白,而不使用细胞固定、免疫染色或重组蛋白过表达。本研究使用β-微管蛋白(mCTover3)、组蛋白H1(mTagBFP2)和p62-SQSTM1(mRuby3)荧光蛋白, 用CRISPR和FAST-HDR载体系统开发HeLa细胞,采用Hana单细胞分离仪(Namocell)进行单细胞分选,使用绿色荧光通道,并分选到96孔板中进行单细胞克隆培养,然后选择一个具有均匀明亮β-微管蛋白荧光的细胞克隆大量扩增得到实验细胞。后续实验通过高内涵成像分析来动态观察微管蛋白聚合情况。用已知的微管蛋白聚合抑制剂、秋水仙碱和长春新碱处理此细胞,并证实了由此产生的微管蛋白聚合抑制的表型变化。此外,作者筛选了429个激酶抑制剂文库,鉴定出三种抑制微管蛋白聚合的化合物(ON-01910、HMN-214和KX2-391)。值得注意的是,研究中采用Namocell 单细胞分离仪帮助作者快速、轻柔、高效地获得活性高的CRISPR - Hela单细胞,利于单克隆培养及扩增,为后续更多实验提供足够的细胞工具。Namocell单细胞分离仪 l 轻 柔 - 压力小于2psi,保护细胞活性l 快 速 - 分选快(1min),初始化快(2min),样本切换快(1min)l 精 准 - 配备2-11色荧光通道,精准捕获目的细胞l 无 菌 - 一次性无菌芯片,隔绝样本污染l 轻 松 - 无需调校,开机即用l 轻 巧 - 体积小巧,方便搬动Namocell 是一家成立于美国硅谷的专注于世界领先的单细胞分选技术的生物仪器公司,2022年7月加入Bio-Techne。公司自主研发的微流控单细胞分选平台,使复杂的单细胞分选变得极其简单快速,极大地推动了单细胞分析在基础研究和临床上的应用。我们的单细胞分选仪已在细胞株的构建,单克隆抗体的筛选,细胞基因编辑,基因及细胞治疗,癌症液体活检,癌症免疫治疗,产前基因筛查,噬菌体展示,单细胞基因组学等多方面得到广泛的应用。目前Namocell微流控单细胞分选仪已经被世界各大顶尖研究机构及生物制药公司广泛应用于生命科学研究的各个领域,例如美国国立卫生研究院(NIH),美国食品药品监督管理局 (FDA),美国疾病控制与预防中心(CDC),哈佛大学,斯坦福大学,麻省理工大学,Genentech,Merck,Biogen,BMS,Janssen,Boehringer-Ingelheim等。
  • 固定化酶技术在中药酶抑制剂筛选中的研究现状
    中药资源丰富,历史悠久,在预防与治疗疾病中扮演着重要的角色。然而,中药的化学成分多种多样,作用机制更是复杂多样,如何从中药中筛选疾病相关药效物质是当前亟待解决的关键问题。大量研究表明,人体许多疾病过程都与体内生物酶调节作用相关,如痛风[1]、阿尔茨海默症[2]、糖尿病[3-5]等。而且,中药在治疗各种疾病中也扮演着重要角色,如白芷提取物能促进新生血管形成与成熟,从而提高自发2型糖尿病小鼠创面愈合速率和质量[6];绞股蓝叶水提物能够降低链脲佐菌素诱导的糖尿病大鼠的血糖,其作用机制可能与增加骨骼肌肌膜葡萄糖转运体4蛋白表达和抑制骨骼肌炎症有关[7]。因此,基于酶在疾病发生发展的重要性,以酶为靶点从中药中筛选新药是一有力途径,而且开发一种快速、高效的酶抑制剂筛选方法是当前首要任务。固定化酶技术是20世纪60年代发展起来的,该技术利用物理或化学方法将游离酶固定在相应的载体上用于筛选酶抑制剂。固定化酶技术可以有效提高酶的催化性能和操作稳定性,并降低成本,是目前广泛使用的技术[8]。此外,相比于游离酶,固定酶更有利于酶-配合物的分离纯化,在pH耐受性,底物选择性,热稳定性和可回收性等方面表现出优越的性能[9-10]。不同的酶发挥催化作用的活性部位不同,将酶进行固定时,要使载体材料与酶的非活性部位结合,才可以保留酶的活性,因此载体材料的选择是固定化酶技术发挥作用的关键。本文以固定载体材料(表1)为分类综述了近10年固定化酶技术在中药酶抑制剂[α-葡萄糖苷酶(α-glucosidase,α-Glu)、脂肪酶等] 筛选中的研究现状,希望可以为后续的相关研究提供一定的参考依据。1 磁性载体磁性载体材料是利用铁、锰、钴及其氧化物等化合物制备的一类具有磁性的材料[11],通过改变磁力大小和外部磁场的方向来改变粒子的运动轨迹,从而使酶与载体的结合与分离可以在可控条件下完成,便于固定化酶的分离和收集,并用于酶抑制剂的筛选[12]。以磁性载体为材料的固定化酶技术的最大优点在于利用磁力吸引可使固定化酶快速从反应体系中分离,且固定化方法简单,能有效减少筛选时间及实验试剂的消耗。因此,通过不同方法对磁性载体材料进行功能化修饰,在充分发挥磁性材料优势的基础上改善其表面性质,提高对不同类型目标物的特异性,从而在各类复杂样品的前处理过程中有着良好的应用潜力[13]。目前,磁珠是近年来发展起来的一种常用的磁性载体材料,也叫做磁性纳米粒子,包括氧化铁(Fe3O4和γFe2O3)、合金(CoPt3和FePt)等。其中,Fe3O4纳米粒子具有生物相容性和无毒性等优点,被广泛应用于酶的固定化。中药酶抑制剂筛选中的常用磁珠其磁核以Fe3O4纳米粒子为主,壳层为二氧化硅、琼脂糖、葡聚糖等,是具有超顺磁性的小球形磁性粒子[14-15],可借助外部磁场从生物催化体系中分离酶抑制剂。该方法机械稳定性高、孔隙率低,利于降低反应中的传质阻力,提高了固定化酶的重复使用性。由于其具有操作稳定性高、磁响应强、磁分离速度快等优点,在生物和药物研究中得到了广泛的应用[16]。在进行酶抑制剂筛选时,磁珠的修饰位置不同,所固定的位点也不同。因此,在实验中,往往要根据靶蛋白的分子结构选择合适的磁珠或将某一磁珠进行修饰后作为固定载体。将酶固定在合适的磁珠上会增强酶与待筛选酶抑制剂的亲和力,利用磁力将固定化酶及其抑制剂从提取液中分离,然后洗去与酶不相互作用的化合物,随后可得到酶固定化磁珠配体配合物,最后通过洗脱溶剂使配体释放进而通过质谱表征[17]。在这种方法中,潜在的配体与酶相互作用,生成酶配体配合物,这有利于利用磁性[18-23]从复杂混合物中分离活性化合物。在酶抑制剂的筛选中,磁性载体材料是最常用的固定化载体材料[24-30]。1.1 无机载体材料二氧化硅是磁性纳米粒子表面修饰最常用的无机材料[23,31-34],此外还有二氧化钛[35]、介孔二氧化硅[16]等。Li等[23]首先将Fe3O4分散在水中加入聚乙烯吡咯烷酮(polyvinylpyrrolidone,PVP)室温搅拌得到产物。然后在超声作用下将产物分散在含有异丙醇和氨水的混合溶剂中,室温搅拌下缓慢加入正硅酸乙酯(tetraethylorthosilicate,TEOS)溶液得到SiO2@Fe3O4磁性微球,并加入3-氨丙基三甲氧基硅烷(3-aminopropyltrimethoxysilane,ATPES)对其表面进行改性。最后将α-淀粉酶固定在表面改性的SiO2@Fe3O4磁性微球上。将制得的酶固定化磁性微球用于黄花草中α-淀粉酶抑制剂的筛选,最终得到3种黄酮类化合物对α-淀粉酶具有较好抑制作用。Liu等[35]采用溶剂热法(也称水热法或水热合成法)制备了Fe3O4@TiO2纳米粒子,并通过静电相互作用固定脂肪酶。采用透射电镜、傅里叶变换红外光谱和X射线衍射等方法对磁性纳米粒子进行表征,以确定脂肪酶是否已经被固定。研究中应用脂肪酶固定化Fe3O4@TiO2纳米粒子从6种具有脂肪酶抑制活性的藏药中筛选出脂肪酶抑制剂,获得5种具有与临床常用减肥药物奥利司他活性类似的化合物,其中1种化合物(山柰酚)的抑制活性优于奥利司他。Yi等[16]将谷胱甘肽S-转移酶固定在介孔二氧化硅磁性微球表面筛选紫苏中的酶抑制剂,利用高效液相色谱和四极飞行时间质谱法进行鉴定,筛选出6种具有谷胱甘肽S-转移酶抑制作用的物质,其中,迷迭香酸、(−)表没食子儿茶素-3-没食子酸酯和 (−)-表儿茶素-3-没食子酸酯具有较好的抑制活性。最后利用分子对接技术确定潜在抑制剂与谷胱甘肽S-转移酶的结合方式。首先,用FeCl3与柠檬酸三钠和乙酸钠合成Fe3O4,然后将其分散在含有乙醇、去离子水和氨水的混合溶液中,搅拌均匀后加入TEOS制得SiO2@Fe3O4磁性微球。为进一步合成介孔二氧化硅磁性微球(mSiO2@SiO2@Fe3O4),将SiO2@Fe3O4磁性微球分散在十六烷基三甲基氯化铵、去离子水和三乙醇胺中并滴加TEOS,产物用磁铁分离并清洗除杂后得mSiO2@SiO2@Fe3O4磁性微球。最后用PDA对mSiO2@SiO2@Fe3O4磁性微球进行表面改性并将谷胱甘肽S-转移酶固定在其表面。1.2 有机载体材料在酶抑制剂的筛选中,有机载体材料相比于无机载体材料应用较少。目前,用于磁性纳米粒子表面修饰的有机载体材料有聚酰胺(polyamidoamine,PAMAM)[36]、共轭-有机骨架[37]和金属-有机骨架[38]等。Jiang等[36]以PAMAM包覆磁性微球为基础,建立了一种筛选和鉴定赤芍提取物中α-Glu抑制剂的方法。首先,采用微修饰法合成了Fe3O4-COOH微球。然后,通过Fe3O4-COOH微球表面羧基与PAMAM氨基的偶联反应,制备了Fe3O4@PAMAM微球。最后,通过GA的交联,成功地将α-Glu连接到其表面。结果表明,没食子酸和(+)-儿茶素对α-Glu均具有较好抑制作用。Zhao等[37]将乙酰胆碱酯酶(acetylcholinesterase,AchE)固定在适配体功能化磁性纳米颗粒共轭有机骨架上构建固定化酶反应器,并将该方法用于酒石酸、(−)-石杉碱A、多奈哌齐和小檗碱4种AchE抑制剂抑制活性的测定,发现酒石酸的IC50与已报道的结果相当,证明了该固定化酶反应器的可行性。Wu等[38]将α-Glu固定在磁性纳米材料Fe3O4@ZIF-67上,构建了快速筛选α-Glu抑制剂的生物微反应器。然后,将酶生物微反应器通过外加磁场固定在连接高效液相色谱仪(high performance liquid chromatography,HPLC)和微注射泵2端的管中,形成一个磁性在线筛选系统。以信阳毛尖粗茶提取物为实验对象,对该在线筛选方法进行验证,利用该在线筛选系统筛选出3种抑制剂(儿茶素、表没食子儿茶素没食子酸酯和表没食子酸酯)。与传统方法相比,该方法可将筛选、洗脱和分析结合起来,可以简单、高效、直接地从天然来源筛选和鉴定潜在的α-Glu抑制剂。磁珠分散性好,磁分离速度快,酶结合量大,酶活性高,是固定化酶的理想载体,现已广泛应用于酶抑制剂的筛选中。将酶固定在特定的磁珠上,可实现酶抑制剂的分离。此方法操作较稳定,非特异性结合率低。因此,酶固定化磁珠技术因其快速的生物分析、导向性分离和从复杂混合物中直接捕获配体而受到越来越多的关注。2 非磁性载体2.1 无机载体材料2.1.1 石英毛细管 毛细管电泳(capillary electrophoresis
  • 中科院上海药物所研究揭示HDAC抑制剂实体瘤治疗失败机制
    中科院上海药物所研究揭示HDAC抑制剂实体瘤治疗失败机制中国科学报讯 中科院上海药物所耿美玉课题组和丁健院士课题组合作,研究揭示了组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂对乳腺癌治疗不敏感的机制。相关研究已在线发表于《癌症细胞》。HDAC抑制剂是靶向肿瘤表观遗传修饰的分子靶向药物,但其治疗实体肿瘤效果不佳,且因机制不明,尚无合理的用药策略,极大限制其在临床上的广泛使用,成为领域内亟待解决的科学问题。该研究以乳腺癌/三阴乳腺癌为切入点,首次揭示细胞因子受体家族成员白血病抑制因子受体(LIFR)的反馈激活,是介导HDAC抑制剂治疗实体瘤不敏感的重要原因。研究发现,HDAC抑制剂通过上调LIFR基因启动子区的乙酰化修饰水平,招募组蛋白乙酰化修饰识别蛋白BRD4,进而转录上调肿瘤组织中LIFR表达水平,激活下游JAK-STAT3经典信号通路,致使临床治疗失败。尤为重要的是,联合BRD4或JAK抑制剂能够明显增敏HDAC抑制剂在乳腺癌,特别是三阴性乳腺癌的治疗效果。专家表示,该项研究成果对指导HDAC抑制剂治疗其他实体瘤具有普遍的指导意义,而LIFR-STAT3的激活则是HDAC抑制剂联合用药的重要标志物,其基于机制的联合用药策略将具有重要的临床转化价值。

组蛋白脱乙酰酶抑制剂相关的仪器

  • 过氧乙酰基硝酸脂PAN:是光化学烟雾产生危害的重要二次污染物。PAN没有天然源,只有人为源,其前体物是大气中氮氧化物和乙醛。在光的参与下,乙醛与OH自由基通过O2生成过氧乙酰基,再与NO2反应而得,因此,大气中测得 PAN即可作为发生光化学烟雾的依据。  PAN不仅是造成光化学烟雾中刺激眼的主要有害物,还是植物的毒剂,造成皮肤癌 的可能致变剂。由于它在雨水中解离成硝酸根和有机物,而参与降水的酸化。
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  • CHOZN GS-/-是采用Sigma独有的CompoZr锌指核酸酶(ZFN)技术建立的细胞株。ZFNs是一类工程DNA结合蛋白,它通过结合用户指定的位点并造成双链断裂(DSB),从而实现靶向基因的编辑。其后,细胞可采用内源性DNA修复过程,非同源性末端接合(NHEJ),或同源介导的双链修复来修复目标双链断裂处。这些修复过程可以被引导以产生精确的靶向基因编辑,从而形成特定基因缺陷(敲除),整合或修饰的生物体或细胞株。谷氨酰胺合成酶(GS)是生物制药行业中最常用的筛选标签之一。通过将重组蛋白的编码基因的表达与外源GS基因的表达偶联,生产重组蛋白的细胞株可以被筛选出来。在GS缺陷宿主细胞之中,只有那些成功转染外源GS基因的细胞在缺乏谷氨酰胺条件下培养才能存活。在具有内源性GS基因的宿主细胞中,可以使用MSX(甲硫氨酸砜亚胺)来抑制内源GS活性,使得这些细胞系可以使用GS筛选。然而在生物制药行业中,无MSX工艺更具优势。为了实现无MSX GS筛选,我们需要一种GS敲除的宿主细胞株。利用ZFN技术,SAFC设计了一种新的CHO K1 GS-/-细胞株。这种CHOZN GS-/-细胞株适合在化学成分限定EX-CELL CD CHO Fusion培养基中悬浮培养,并保持了野生型CHO K1的稳健特性。特点与优点:- 首个商业化的GS-/-CHO细胞株- CHOZN GS-/-是使用ZFN技术靶向突变开发的细胞株- 适合在化学限定,无动物源成分的培养基中悬浮培养的细胞系- 细胞源自于ECACC CHO K1- cGMP标准生产,完善的病毒检测,完整的可追溯资料- 全面的实验方案,为您详细说明筛选策略- 技术专家随时为您排除问题了解更多,可参见本页面核心参数 – 样本下载中的资料手册。
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  • SpectraMax M4 是 Molecular Devices 公司推出的专利双套"滤片+光栅“连续光谱、多功能读板机,并且拥有与单功能测读仪媲美的优异表现。它的测读模式包括:光吸收(紫外-可见光)、荧光强度(FI)、时间分辨荧光(TRF)和化学发光(Lum)。同时该读板机还内置比色皿插槽,可分别测读光吸收、荧光强度和化学发光。可调波长单色器与高质量的测读能力使得 SpectraMax M4 多功能读板机不仅适用于实验开发和科学研究,还适用于中低通量的药物筛选。主要特点 ● 专利双套"滤片+光栅“光路设计 ● 专利的 PATHCHECK 光径传感器技术 ● 专利自动增益调节 Auto-PMT 功能 ● 三功能比色皿检测(紫外-可见吸收光、荧光、化学发光)应用领域SpectraMax M4 多功能微孔板读板机支持蛋白检测领域中的ELISA、荧光蛋白的FRET;核酸检测领域中 DNA/RNA 定量;酶学检测应用领域中的磷酸酶活性、激酶活性和蛋白酶;细胞功能检测中的细胞迁移和细胞粘附;报告基因;其他分析包括脂肪酸摄取、神经递质摄取、ADME Tox、膜通透性、微生物生长、内毒素检测等。实验举例表观遗传学涉及在细胞分化或后代遗传过程中基因表达水平的改变,但是这种改变与传统遗传学中通过基因序列的改变方式有所不同,它无需改变基因序列本身,组蛋白赖氨酸残基乙酰化对基因转录的表观遗传学调控至关重要,组蛋白乙酰化过程被认为是特定蛋白与已知蛋白特定结构域结合所至,我们利用 BRD4 结构域1的 TR-FRET 试剂盒和具有时间分辨荧光共振能量转移技术的 SpectraMax M4 微孔板读板机,可以针对正常分裂和 DNA 复制的细胞检测,获得更加灵敏、更加可靠的结构域与乙酰化多肽结合抑制剂的高通量筛选的方案。
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组蛋白脱乙酰酶抑制剂相关的试剂

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