智能数据采集器

2015年5月份，我公司销售的美国Campbell公司生产的CR1000中标中国矿业大学，已经供货。 CR1000数据采集器是Campbell数据采集器里面性价比最高的一款。它提供传感器的测量、时间设置、数据压缩、数据和程序的储存以及控制功能，由一个测量控制模块和一个配线盘组成，具有强大的网络通讯能力。CR1000数据采集器的扫描速率能够达到100Hz，拥有模拟输入、脉冲计数、电压激发转换、数字等多个端口，外围接口有CS I/O、RS-232以及SDM等，采用12VDC外接可充电电池供电。对于低温的环境，用户还可以选择低温型的CR1000-XT数据采集器。CR1000所具有的高精度性、高适应性、高可靠性以及合理的价格等特点，使其成为科研、商业与工业系统应用的理想选择。目前，CR1000数据采集器已在气象观测、农业研究、土壤水分研究、风力观测、道路气象站、工业产品测试、通量观测、涡动协方差系统等众多领域得到了广泛应用标准的CR1000数据采集器包含4M的数据和程序存储空间，可通过外接存储模块和CF存储卡来实现大容量数据存储。数据和程序保存在非失意性闪存和内存里。锂电池装在内存和实时时钟上。当首选电池（BPALK，PS100）电压降至9.6V以下时，CR1000也能够延缓执行操作，从而减少不准确测量的可能性。CR1000可以通过外围设备扩展从而形成一个数据采集系统。很多CR1000系统可以构建一个网络从而形成当地或整个地区的监测网络。 数据存储为表格形式 l PakBus? 操作系统l 软件支持：LoggerNet3.4/4.0，PC4001.2,或者ShortCut2.2l 支持 CR1000KD手持式显示器（选配），读数方便l CSI/O和RS-232串行接口l 内部温度补偿，实时时钟，超时和温度变化实时校准l 当CR1000从主电源上分离后，使用内部锂电池支持SRAM存储和时钟以确保数据、程序和精确的时间l 具有强大的网络通讯功能，【主要性能】l 最大扫描速率：100Hzl 模拟输入：16个单端（或8个差分）通道l 脉冲通道：2个l 工作温度：标准为-25℃至+50℃，可扩展-55℃至+85℃l 内存：标准为4M内存，可扩展至2G，额外数据存储使用CFM100存储模块和一个CF存储卡。l 13-bit模拟数字转换l 16-bit H8S Hitachi微型控制器，32-bit内部CPU

data Taker，作为赛默飞旗下产品，是世界著名的工业级数据采集器品牌，来自澳大利亚，其广泛用于各种数据的采集，可连接多种不同类型的传感器，对温度、湿度、风速、风向、雨量、水位、流量、电压、电流、4-20mA电流回路、电阻、应力、应变、位移、裂缝、沉降、荷载、倾角、压力等各类数据进行采集，同时可对采集到的各种原始数据进行计算，并按所需要的工程单位或统计报告的形式将原始数据或计算结果返回到上位机。目前已在教育科研、自动气象站、水文、环境监测、生态农业、林业、石油化工、水利、桥梁与道路监测、建筑物自动化监测等各个领域得到广泛应用。众多世界知名的研究机构、高标准的重点实验室、高等院校等是我们的客户。 作为直接国外厂商，欢迎各位洽谈业务，联系方式：021-68654588-2295， Kevin Peng 多年来，我们凭借仪器杰出的性能和优质的服务深得世界范围内广大用户的信赖。基于产品的特点，data Taker数据采集器采取渠道销售的模式，由我方授权符合资质的代理商进行指定区域/行业内销售业务，每年签发一次正式授权书。目前，我们data Taker数据采集器产品已具有很强的客户信赖度和影响力，在全国有很好的声誉，现诚招气象、生态、环境（空气质量）监测、水文水质监测、能源监测、交通监测、工业自动化监测领域经销商，共同推进2014年业务发展和长远合作计划。赛默飞世尔科技公司的合作伙伴必须资质完善、诚实守信、共同遵守业务合作规则。我们也会提供最佳的产品培训、应用支持和技术服务。敬请广大经销商选择我公司data Taker数据采集器，确认经销渠道和网络。申请时限：从2014年2月到2014年9月底止联系人：彭先生 13816907295E-mail: kevin.peng@thermofisher.com 办公电话：021-68654588转2295产品及应用信息，请浏览：http://www.datataker.com 或来电来函索取。特此公告！赛默飞世尔科技2014年2月关于data Takerdata Taker品牌创建于1983年，是数据采集与数据记录设备的世界领导品牌之一。产品的设计、研发与制造全部在澳大利亚完成。data Taker数据采集器支持各种类型的传感器，并可稳定、高效地记录与储存数据，供客户进行数据分析。data Taker的数据采集产品被广泛应用于教育科研、自动气象站、水文、环境监测、生态农业、林业、石油化工、水利、桥梁与道路监测、建筑物自动化监测等各个领域，并得到客户一致认可。在全球40多个国家设有分销机构。欲获取更多信息，请浏览我们的网站：www.thermofisher.com.au www.datataker.com 关于赛默飞世尔科技赛默飞世尔科技（纽约证交所代码：TMO）是科学服务领域的世界领导者。公司年销售额170亿美元，在50个国家拥有员工约50,000人。我们的使命是帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。我们的产品和服务帮助客户加速生命科学领域的研究、解决在分析领域所遇到的复杂问题与挑战，促进医疗诊断发展、提高实验室生产力。借助于Thermo Scientific、 Life Technologies、 Fisher Scientific 和 Unity? Lab Services四个首要品牌，我们将创新技术、便捷采购方案和实验室运营管理的整体解决方案相结合，为客户、股东和员工创造价值。欲了解更多信息，请浏览公司网站：www.thermofisher.com 赛默飞世尔科技中国赛默飞世尔科技进入中国已超过30年，在中国的总部设于上海，并在北京、广州、香港、台湾、成都、沈阳、西安、南京、武汉等地设立了分公司，员工人数超过3800名。为了满足中国市场的需求，现有8家工厂分别在上海、北京和苏州运营。我们在北京和上海共设立了9个应用开发中心，将世界级的前沿技术和产品带给国内客户，并提供应用开发与培训等多项服务；位于上海的中国创新中心结合国内市场的需求和国外先进技术，研发适合中国的技术和产品；我们拥有遍布全国的维修服务网点和特别成立的中国技术培训团队，在全国有超过2000 名工程师提供售后服务。我们致力于帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。欲了解更多信息，请登录 www.thermofisher.cn

大家好，本周为大家分享一篇发表在Nature communications上的文章，FLASHIda enables intelligent data acquisition for top–down proteomics to boost proteoform identification counts [1]，文章的通讯作者是德国图宾根大学的Oliver Kohlbacher教授。自上而下蛋白质组学(TDP)能够对完整的proteoform进行全面和深入的分析，目前已广泛应用于生物医学研究领域。proteoform在不同的生物系统中具有高度异质性，proteoform水平的信息可以为了解生物生化功能或疾病表型提供重要的信息。近年来，随着TDP样品处理方法、分离技术、碎裂技术和生物信息学方法的进步，proteoform变得更容易被检测和表征。在复杂样本的大规模研究，如微生物或人类细胞裂解液中，proteoform的鉴定数量已达到4000-6000(对应500-1000个蛋白质)。在单次TDP实验中，在大肠杆菌裂解液中可以鉴定出约800种proteoform，在人脑样本中可以鉴定出约1800种proteoform。由于proteoform的多样性和复杂性，完整蛋白质的DDA采集是非常重要的。然而目前的仪器软件在DDA采集中实施的碎裂技术优化主要针对自下而上蛋白质组学(BUP)，而不是TDP。尽管这些方案在BUP研究中有效地捕获了各种高质量的肽段离子，但这些选择标准对于TDP中的proteoform离子选择并不是最优的。与BUP中的肽段离子相比，单个proteoform由于其高质量和高电荷会产生许多峰，Top-N采集往往会导致从一个丰度较高的proteoform中选择多个峰，而不是从多个不同的proteoform中进行选择，这会导致proteoform的覆盖率较低。此外，基于强度进行选择可能不会选到能产生多种独特片段的高质量前体。目前，大多数大规模TDP研究使用具有特定调优参数的DDA采集，例如，Top-N采用相对较低的N值(3-5)和相对较高的隔离窗口(1.2-15 Th，超宽隔离)。然而对所选前体离子的分析表明，对proteoform的选择依然不理想。因此，采用更智能的数据采集方式(Intelligent data acquisition，IDAs)是非常有必要的。本文中作者提出了一种用于TDP的基于机器学习的智能在线数据采集算法FLASHIda，该算法可以确保实时选择不同proteoform的高质量前体，最大化TDP中的proteoform覆盖。FLASHIda通过iAPI与tribrid Thermo Scientific质谱仪连接，允许对MS数据进行实时访问。在LC-MS运行期间，将实时去卷积算法和评估前体同位素质量的机器学习技术结合，非冗余选择高质量前体离子,从而提高蛋白质的覆盖率。FLASHIda流程如图1所示，该算法能在20毫秒内处理每个MS全扫描，并优化下一个采集周期，以最大限度地提高采集中的异型多样性。FLASHIda包括以下3个关键步骤，第一步是将输入的m/z-强度谱转换为mass-quality谱图，第二步是在转换谱图中选择前体离子，最大化唯一识别的proteoform离子数量，最后，动态确定每个选定质量的电荷态和隔离窗口大小，以尽量减少噪声或共洗脱的干扰。确定的隔离窗口m/z范围通过Thermo iAPI连接提供给仪器。　　图1.FLASHIda总览　　在对大肠杆菌裂解液的分析中，与标准DDA模式相比，FLASHIda在三分之一的仪器时间内将proteoform鉴定数量从800增加到1500，或产生几乎相同的鉴定数量。此外，FLASHIda能够灵敏地绘制翻译后修饰和检测化学加合物。作为仪器的软件扩展模块，FLASHIda可以方便地用于复杂样品的TDP研究，以提高proteoform的鉴定率。　　图2. Proteoform分析　　这项研究展示了IDA在TDP研究中的应用，目前作者依然在开发该算法的不同变体，用于靶向proteoform分析，深度表征，甚至从头测序。此外，由于FLASHIda能够选择无干扰的前体离子，因此它可以用于提高proteoform定量准确性。作者预计，未来在FLASHIda内开发的高级数据采集方法将有助于通过TDP探索proteoform的异质性。　　撰稿：张颖编辑：李惠琳　　原文：FLASHIda enables intelligent data acquisition for top–down proteomics to boost proteoform identification counts　　李惠琳课题组网址www.x-mol.com/groups/li_huilin 　　参考文献　　Jeong K, Babović M, Gorshkov V, Kim J, Jensen ON, Kohlbacher O. FLASHIda enables intelligent data acquisition for top-down proteomics to boost proteoform identification counts. Nat Commun. 2022 Jul 29 13(1):4407.