扎伊尔型埃博拉病毒核酸检

埃博拉（Ebola virus）又译作伊波拉病毒，这种病毒来自“Filoviridae”族。“埃博拉”属于丝状病毒，这是一种十分罕见的病毒，1976年在苏丹南部和扎伊尔即现在的刚果（金）的埃博拉河地区发现它的存在后，引起医学界的广泛关注和重视，“埃博拉”由此而得名。 埃博拉病毒是引起人类和灵长类动物发生埃博拉出血热（EBHF）的烈性传染病病毒，其致死率高达50%至90%，[LD{1] 是当今世界上最致命的病毒性出血热，感染者症状与同为纤维病毒科的马尔堡病毒极为相似，人类感染埃博拉病毒几天后会出现发烧、头疼、关节和肌肉及喉咙疼痛、周身虚弱等症状，许多患者还会出现体内或体外出血；另有人打嗝、眼睛又红又痒。感染一周后病人会胸痛、休克，甚至死亡。 埃博拉病毒包含扎伊尔埃博拉病毒、苏丹埃博拉病毒、雷斯顿埃博拉病毒、塔伊森林埃博拉病毒、本迪布焦埃博拉病毒5种类型。近期爆发的是最厉害的扎伊尔埃博拉病毒。该病毒不会经由空气进行人与人的传播，但能通过汗液、血液、唾液以及性接触等途径进行传播。一旦感染，埃博拉病毒会迅速瓦解体内的免疫系统细胞，并进行快速繁殖，对身体内细胞进行攻击，最终导致多器官功能衰竭。美国范德比尔特大学感染病学专家 William Schaffner 博士认为，埃博拉病毒非常危险，即使防护做的再完美，也存在感染的风险。 根据WHO官方网站数据，截止2014年8月1日，西非埃博拉病毒出血热总共感染（含疑似）1,323人，其中729人死亡。疫情涉及4个西非国家：几内亚、利比里亚、塞拉利昂和尼日利亚，几内亚死亡人数最多（339人），塞拉利昂感染人数最多（533人）。 为了防止埃博拉病毒的进一步肆虐，我国的各口岸也都已经提高了戒备等级，保证病毒不能轻易传播入国内人群；各疾病预防控制中心也在积极准备，一些疾控中心已经具备了检测病毒的能力。[LD{2] 8月4日，国家质检总局、外交部、国家卫计委、国家旅游局联合发布关于防止非洲埃博拉出血热传入我国的公告。中国质检总局下发《关于加强口岸埃博拉出血热疫情防控工作的通知》，要求各检验检疫局切实做好口岸卫生检疫工作，严防埃博拉出血热疫情传入中国。 由于现阶段尚无有效疫苗，只能通过维持患者体内体液和电解质进行辅助治疗。因此，早期的迅速诊断和隔离就显得非常重要。使用实时荧光PCR检测方法是目前最快也是最准确的检测诊断方法。罗氏诊断生命科学部凭借其在生命科学领域的悠久研究历史及经验，针对目前正在迅速传播的扎伊尔埃博拉病毒（Zarie EBOV）及时研发并提供了全面的检测解决方案：从MagNA Pure全自动核酸提取系统或High Pure系列手动提取试剂盒上进行血清或血浆的核酸提取，使用成品化的扎伊尔埃博拉病毒检测试剂盒到结合罗氏诊断全线LightCycler家族荧光定量PCR仪进行病毒核酸定量，整个过程最快在2小时内即可完成。罗氏诊断最新的埃博拉病毒检测试剂盒中含有引物、探针、内对照以及临床检测最重要的阳性质控，符合澳大利亚职业安全和卫生管理局危险告知标准以及欧盟包装安全标准。 埃博拉来势汹汹，罗氏诊断将积极与中国政府与各研究单位紧密合作，配合有关部门在第一时间做好捍卫工作，将其危害降低到最低程度。

8月13日讯 记者今天从华大基因科技有限公司(以下简称华大基因)获悉，该公司联合军事医学科学院微生物流行病研究所，成功研制出埃博拉病毒核酸检测试剂，现已向国家食品药品监督管理总局申请应急审批，供防治埃博拉疫情使用。　　埃博拉出血热是由埃博拉病毒引起的一种急性出血性传染病，临床表现主要为突起发热、出血和多脏器损害。埃博拉病毒可分为扎伊尔型、苏丹型、本迪布焦型、塔伊森林型和莱斯顿型。除莱斯顿型对人不致病外，其他4种亚型感染后均可致人发病。今年，西非暴发了史上最严重的埃博拉疫情，并且有蔓延趋势。据世卫组织统计，截至8月11日，在几内亚、利比里亚、塞拉利昂、尼日利亚等国暴发的埃博拉疫情已致1013人死亡。　　虽然此次疫情还未波及我国，但我国与疫区国家人员交往、贸易往来活动频繁，要防止埃博拉病毒进入我国形成蔓延，第一时间提供准确、特异的检测试剂盒非常重要。　　据了解，华大基因此前多次参与国家突发公共卫生事件应急处理，与合作单位完成了中国第一例SARS病毒基因组序列、第一例感染人的高致病性禽流感病毒基因组序列、第一株感染人的猪链球菌基因组序列、新型布尼亚病毒致发热伴血小板减少综合征的发现与诊断，并研制出人感染H7N9禽流感诊断试剂。

当国内抗击新型冠状病毒已经取得阶段性胜利，各地方政府推出各种积极鼓励政策，普及全民免费接种新冠病毒疫苗的时候，当地时间2021年5月3日，刚果（金）卫生部宣布，该国第12轮埃博拉疫情结束......“国民男神”张文宏医生曾与樊登对话时指出：“如果今年新冠的死亡率、病死率，是像埃博拉一样的，其实这个病还是比较容易控制的。”埃博拉病毒，一个既熟悉又陌生的名字。埃博拉病毒（EBOV）是一种膜包被的负单链RNA病毒，属于Filoviridae家族，编码7种结构蛋白。该病毒在人类和非人类灵长类动物中可引起严重的出血性发热、腹泻、呕吐、肌痛、肝肾功能损伤等临床症状。迄今为止，已确定6种埃博拉病毒，包括扎伊尔型埃博拉病毒（ZEBOV），该病毒对人类的致死率最高，死亡率为60％ ~ 90％。2014年至2016年，西非国家利比亚、几内亚和塞拉利昂曾爆发了最大规模的埃博拉病毒，导致超过28000人感染，11000人死亡。这次史无前例的爆发主要是由扎伊尔型埃博拉病毒所引起，世界卫生组织（WHO）宣布进入国际关注的公共卫生紧急状态。2021年2月至5月，刚果（金）民主共和国北基伍省共发现确诊病例12例，其中死亡6例。埃博拉疫情能被一次又一次得到有效控制，死亡率降低，感染人数减少，不得不说，很大一部分原因是得益于埃博拉疫苗的普及。全球首个上市预防埃博拉病毒病的商品化疫苗ERVEBO，即rVSV∆G-ZEBOV-GP疫苗，2019年已获得欧盟EMEA和美国FDA批准使用。此疫苗由全球领先的Merck公司研发生产，采用多种创新性的技术。其疫苗分析研究进展与疫苗工艺开发和商业化部门于2020年8月发表题为Characterization of rVSV∆G-ZEBOV-GP glycoproteins using automated capillary western blotting的文章， 披露了利用全自动毛细管Western Blot技术平台表征rVSV∆G-ZEBOV-GP糖蛋白的详细技术细节。研究背景EBOV主要通过由病毒糖蛋白（GP）介导的相互作用来感染宿主细胞。EBOV基因组由于转录停顿可产生三种不同的包膜GP变体。未编辑的RNA转录编码一个非结构分泌型GP（sGP）蛋白。开放阅读框（ORF）的+1转变，可产生一个结构上重要的病毒膜结合型GP蛋白。最后，ORF的+2转变，可产生一个非结构小型分泌型GP（ssGP）。每种蛋白在致病机制方面的作用先前已经描述。EBOV GP合成为一个多肽，被一种类似呋喃的蛋白酶裂解，生成一个异质二聚体，由GP1和GP2亚基组成，通过一个二硫键连接在一起。ZEBOV包膜GP蛋白的表面含有17个N-连接糖和许多糖基化位点。GP1负责与细胞受体的结合，有三个结构域，包括一个受体结合域、一个糖帽和一个非结构性的重度O型糖基化区域（粘蛋白样结构域）。GP2有一个跨膜结构域，负责与病毒的融合。GP2∆，发现于脱落GP蛋白，是TNF-a转换酶（TACE）对GP2进行酶切的结果。EBOV的细胞进入机制，是由组织蛋白酶的半胱氨酸蛋白酶介导的，它裂解完整的EBOV GP1，去除糖帽和粘液蛋白结构域，暴露出增加受体结合和病毒感染性的氨基酸残基。该项研究阐述了在整个rVSV∆G-ZEBOV-GP疫苗生产过程中，使用全自动定量毛细管Western Blot检测平台，研究和表征ZEBOV糖蛋白。自动化Western Blot与传统手工Western Blot技术平台相比有诸多优点：线性范围增加更高的通量因自动化而增强的重复性由于该技术的高特异性，毛细管Western Blot技术已被应用于疫苗产品和治疗性蛋白质的表征。该项目中，研究人员还进行了方法学对比，对比了传统手动Western Blot技术与全自动毛细管Western Blot检测技术。研究结论我们已开发和应用基于全自动毛细管Western Blot检测方法，去开发及生产ERVEBO疫苗。使用该方法表征在疫苗生产的过程中，GP变体的类型和数量。毛细管Western Blot技术提供了与传统手动Western Blot系统相似的GP结果。但是，具有更好的重复性，更准确的定量，并更简单易用。该方法有助于表征疫苗生产中酶促反应步骤，评估下游纯化步骤中的变化，并确认多批次间的工艺稳定性。实验表明，使用VSV载体产生的GP、sGP和ssGP的相对数量与天然埃博拉病毒中观察到的不同。GP蛋白是在感染期间产生的，只有病毒粒子膜结合的GP包含在rVSVΔG-ZEBOV-GP疫苗最后的DP中。毛细管Westerns表明，ERVEBO生产过程中的每个步骤都有独特的电泳图，该方法可以作为一个有利的工具，去评估生产过程的不同阶段。方法学对比根据工序，rVSV∆G-ZEBOV-GP使用1x样品缓冲液中稀释至7倍。初步稀释后，将样品在2个混合物（含样品缓冲液、二硫苏糖醇和荧光标准品）中稀释2倍，在70℃下加热10分钟。随后，样品经短暂涡旋去除气泡后，加载到12-230 kDa的样品板上。一抗（兔抗ZEBOV-GP）母液被加载到样品板前，用抗体稀释液（终浓度为2μg/mL）稀释1000倍。毛细管Western Blot仪器采购于ProteinSimple公司（Santa Clara, CA, USA）。仪器设置定义如下：分离时间设置为30分钟，一抗体孵育时间为30至60分钟，二抗体孵育时间为30至60分钟。使用仪器的化学发光检测通道在不同的曝光长度下进行检测。除非另有规定，曝光时间为2s。所有未指定的设置均采用供应商的默认选项。Merck早在2012年就曾发表文章指出，对比传统手动WB （罗氏于2005年发表：CV 35%），ProteinSimple全自动Western Blot检测平台的数据CV值可以控制在10%以内。结果展示图1. 基于毛细管法获得的工艺步骤电泳图谱(A) 收获病毒液（HVF：Harvested virus fluid）为工艺流程中最早的步骤，即病毒转染后收获。包含：GP1（260 kDa）、未知（190 kDa）、可溶性GP（95 kDa）和GP2 + GP2∆（40 kDa）；(B) 澄清病毒液（CVH：Clarified viral harvest）为工艺流程中的第二步，过死端过滤以去除细胞碎片和样品。包含：GP1（260 kDa）、可溶性GP（95 kDa）和GP2 + GP2∆（40 kDa），未知的190 kDa峰被去除；(C) 反应后病毒收获（RVH：Reacted viral harvest ），在纯化过程的酶解步骤之后。包含：由胰蛋白酶处理的GP1、可溶性GP（95 kDa）、GP2 + GP2∆（40 kDa）和较低分子量的蛋白质（12 kDa）组成，可能是胰蛋白酶处理后产生的GP1片段；(D) 超滤产品（UFP：Ultrafiltration product），样品被超滤后。包含：GP1（95 kDa）和GP2（40 kDa），所有可溶性GP和脱落的GP被去除；(E) 药物产品（DP: Drug product），通过加入Tris和rHSA （recombinant Human Serum Albumin:重组人血清白蛋白）稀释DS（Drug substance：原药）至目标浓度。包含：GP1（95 kDa）和GP2（40 kDa），由于rHSA与一抗的交叉反应，DP中观察到一个约60 kDa的rHSA峰，DP浓度比UFP中低约2-logs。原药电泳图（补充信息图.1S）与UFP相似，因为其浓度与UFP相似，尽管含有rHSA作为稳定剂。图片中的峰高经过调整，以最好地呈现出每个样品。图2. 胰蛋白酶处理步骤的过程表征(A) 胰蛋白酶处理CVH样品时间过程电泳图，GP1峰在10分钟内从260 kDa转移到95 kDa，随着时间的推移，峰面积持续减少；(B) 加入胰蛋白酶抑制剂后结果，RVH样品在室温下进行Hold Time Study。在168小时内，GP1峰值持续缓慢下降。图3. 批间工艺一致性评价：通过峰面积评估四个不同批次的GP变体的百分比，以确保工艺一致性(A) 四个不同批次的CVH中GP和可溶性GP的峰面积百分比；(B) 其中一个批次的CVH的电泳图，显示峰值积分和分配；(C) 四个不同批次的UFP样品，显示峰面积分布；(D) UFP样品的电泳图，显示峰值积分整合和分配。四个批次CVH样品中，GP（包括GP1和GP2+GP2Δ）占总峰面积的78%，可溶性GP平均占22%。全自动毛细管Western Blot技术平台展望后疫情时代，我们依然需要居安思危，对科学与自然保持敬畏之心。潜心开发传统疫苗、亚单位疫苗、联合疫苗、核酸疫苗和治疗性疫苗，惠及人民。作为地球人，疾病无国界，先进技术无国界，爱与帮助也同样无国界。国外成熟的疫苗研发与生产技术路线，值得我们学习和借鉴。ProteinSimple全自动毛细管Western Blot技术平台，已被众多科研工作者使用，从事人用和兽用疫苗相关研发、生产和质控，包括埃博拉病毒疫苗，狂犬病病毒疫苗，肺结核病病毒疫苗，新型人乳头瘤病毒疫苗，SARS-CoV-2疫苗等等。正如ERVEBO生产整个过程中，全自动毛细管Western Blot技术平台可呈现出独特的电泳图，去评估疫苗生产过程的不同阶段。其高质量高重复性数据（CV 10%）、全自动高通量快速检测流程（25个样品仅需3h，最高通量为96个样品）、超微量样品（仅需3ul）、除分子量分离外，可兼容等电点分离的灵活应用，等等诸多优势，使得全自动毛细管Western Blot技术平台逐渐取代传统手工Western Blot检测技术，被广泛应用于疫苗领域。 代表文献 1. A single-dose live-attenuated YF17D-vectored SARS-CoV-2 vaccine candidate, L. Sanchez-Felipe, T. Vercruysse, S. Sharma, J. Ma, V. Lemmens, D. Van Looveren, M. Javarappa, R. Boudewijns, B. Malengier-Devlies, L. Liesenborghs, S. Kaptein, C. De Keyzer, L. Bervoets, S. Debaveye, M. Rasulova, et al., Nature, 2021 590: 320–325.2. OvHV-2 glycoprotein B delivered by a recombinant BoHV-4 is immunogenic and induces partial protection against sheepassociated malignant catarrhal fever in a rabbit model, S. Shringi, D. O’Toole, E. Cole, K. Baker, S. White, G. Donofrio, H. Li and C. Cunha, Vaccines, 2021 9:90.3. Analysis of the antigenic properties of membrane proteins of Mycobacterium tuberculosis, H. Li, L. Liu, W. Zhang, X. Zhang, J. Zheng, L. Li, X. Zhu, Q. Yang, M. Zhang, H. Liu, X. Chen and Q. Jin, Scientific Reports, 2019 9:3042.4. Inactivated rabies virus-vectored immunocontraceptive vaccine in a thermo-responsive hydrogel induces high and persistent antibodies against rabies, but insufficient antibodies against gonadotropin-releasing hormone for contraception, X. Wu, Y. Yang, C. Kling, L. Seigler, N. Gallardo-Romero, B. Martin, T. Smith and V. Olson, Vaccines, 2019 7: 73.5. Quantitation of CRM197 using imaged capillary isoelectric focusing with fluorescence detection and capillary Western, J. Loughney, S. Ha and R. Rustandi, Analytical Biochemistry, 2017 534:19–23.6. Neutralization of diverse human cytomegalovirus strains conferred by antibodies targeting viral gH/gL/pUL128-131 pentameric complex, S. Ha, F. Li, M. Troutman, D. Freed, A. Tang, J. Loughney, D. Wang, I. Wang, J. Vlasak, D. Nickle, R. Rustandi, M. Hamm, P. DePhillips, N. Zhang, J. McLellan, et al., Journal of Virology, 2017 91:e02033-16.7. Applications of an automated and quantitative CE-based size and charge western blot for therapeutic proteins and vaccines, R. Rustandi, M. Hamm, C. Lancaster and J. Loughney, Methods in Molecular Biology, 2016 1466:197–217. 参考文献 1. Characterization of rVSVΔG-ZEBOV-GP glycoproteins using automated capillary western blotting, K. Minsker, R. Rustandi, S. Ha and J. Loughney, Vaccine, 2020 38(45):7166–7174.2. Qualitative and quantitative evaluation of SimonTM, a new CE-based automated Western blot system as applied to vaccine development, R. Rustandi, J. Loughney, M. Hamm, C. Hamm, C. Lancaster, A. Mach and S. Ha, Electrophoresis, 2012 33:2790–2797.3. Precision and variance components in quantitative gel electrophoresis, Koller, A. and H. Watzig, Electrophoresis, 2005 26(12):2470-2475.