花粉蛋白

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  • 人β淀粉样蛋白 1-42 (Aβ1-42) 检测试剂盒
    β-淀粉样蛋白(1-42)聚集体的形成和Aβ1-42寡聚体的细胞毒性是阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)病理学的两个重要特征,在AD的发病机理中起着关键的作用,Aβ1-42可以作为 辅助性诊断AD的生物标志物之一。但是由于受到血脑屏障的限制,外周血中脑源性蛋白的浓度较低,且易受到血浆基质蛋白的干扰。彩科(苏州)生物科技有限公司开发的单分子免疫检测平台,使用彩科生物人β淀粉样蛋白1-42(Aβ1-42)检测试剂盒在彩科生物AXL/SXL 单分子阵列免疫分析仪上可以定量检测血浆中Aβ1-42的蛋白浓度。
  • PK02 蛋白酶K粉末
    可切割脂肪族氨基酸和芳香族氨基酸的羧基端肽键,是DNA提取的关键试剂,可酶解与核酸结合的组蛋白,使DNA游离出来,方便后续的抽提与纯化。
  • PK01 蛋白酶K粉末
    可切割脂肪族氨基酸和芳香族氨基酸的羧基端肽键,是DNA提取的关键试剂,可酶解与核酸结合的组蛋白,使DNA游离出来,方便后续的抽提与纯化。

花粉蛋白相关的仪器

  • 蛋白组学样本前处理工作站是一款具备高通量、高回收率、安全性能强、抗干扰能力强,适用范围广等优势,适用大队列样本的高通量处理设备,可实现质谱蛋白样本前处理的全自动化和标准化操作。蛋白组学样本前处理解决方案适用于血浆、血清、尿液、细胞、组织等类型样本从蛋白到多肽混合物的质谱检测前处理工作,试剂盒利用新型固相烷基化试剂SPA材料与蛋白的特异性共价反应,实现蛋白质的高效捕获,通过清洗磁珠表面,快速去除干扰物质,并进行原位固相酶解,获得蛋白酶解产物,仪器整合制冷模块、磁吸附模块、加热振荡模块、抓扳手,进而实现蛋白质组提取、还原、烷基化、酶解等流程自动化操作,提高蛋白质样品的处理效率和回收率。 优势特点高通量■96通道移液头,一次可处理最多96个样本,高效完成实验流程中吸废等步骤;■兼具8通道移液功能,可以实现试剂的精准分装;■ 全流程4-5小时可完成96个蛋白样本的前处理(具体时间根据具体实验流程);自动化程度高■ 整合抓板手,用于对标准SBS板子的转移;■ 整合蛋白前处理所需的试剂制冷模块、磁吸附模块、加热振荡模块等功能模块;■均一化操作,减少实验过程中的误差,提高准确性和稳定性;灵活性强■ 盘面包含18个SBS标准盘位,除功能模块外,有15个盘位放置试剂和耗材;■开放式平台,配有多样化适配器,可适配多种不同品牌试剂耗材;■软件界面人性化设计,拖拽式布局,操作简单,每个步骤可独立进行参数设置,实验流程可进行存储,按键式启动运行;安全性■可配置避光外罩,搭配紫外消毒灯;■可根据实验需求选配正、负压HEPA过滤系统,有效避免交叉污染; 数据测试样本批内测试数据材料:293T 细胞实验方法:手工操作3 组,仪器操作3 组Q Exactive质谱结果如下:表1:手工操作和仪器操作后蛋白数及零漏切率对比图1 Venn diagram(蓝色:手工;绿色:仪器)试验总结手工操作和仪器操作蛋白样本预处理后可检测到的蛋白数及零漏切率基本一致,达到预期要求;手工操作与仪器操作蛋白种类皮尔斯相关系数大于0.97,与预期一致;样本批间测试数据图2 96孔板检测示意图如图2所示共处理96个样品,分三组进行实验,随机选取36个样品进行Q Exactive质谱检测,结果如下:图3 36个样本检测蛋白数(个)图4 36个样本零漏切率(%)图5 随机样品日间比较实验总结36个随机样本检测蛋白数3074±89个,零漏切率78.32±2.66%,样本预处理的结果正常且稳定;36个样品的皮尔斯相关系数及日间随机样品皮尔斯相关系数均介于0.955-0.989之间,达到指标要求,具有较好的均一性。 应用领域临床诊断/用药指导/病理机制研究/疾病标志物的发现/药物机理研究特别说明,此页面中所有展示的图片和信息仅供参考。
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  • 岛津集团发布新型PPSQ-51A单反应器蛋白测序仪和PPSQ-53A三重反应蛋白测序仪。 新PPSQ-51A / 53A蛋白质测序仪采用岛津SPD-M30A光电二极管阵列检测器,配有新型毛细管流通池,灵敏度是原型号标准检测池的10倍,能进行较长序列的蛋白质研究。 主要特点:1、在等度洗脱模式下进行PTH-氨基酸的分析,等度序列分析提供更稳定的保留时间。这意味着可以使用色谱减法取消在以前的周期中检测到的峰,方便用户识别正确的氨基酸。在等度洗脱模式下进行PTH-氨基酸分析也使实验室通过流动相回收减少废液的浪费,降低运行成本。2、操作简单,专业的蛋白质测序仪将对反应单元和高效液相色谱分析单元提供控制功能,便于进行序列分析。3、新PPSQ软件可配置为满足实验室的各种需要,无论是监管、研究和开发,还是学术。该软件符合FDA 21 CFR Part 11指南对安全、用户管理和审计跟踪的要求。易于使用的数据分析功能,简化操作,数据处理和报告。这些功能允许色谱的后处理、多重色谱的叠加、色谱减法、和氨基酸序列的自动估计。此外,PPSQ-51A / 53A音序器提供定制的报告,并对数据进行快速、全面的的图形显示。拥有以前机型的客户(31A/33A/51B/53B)可以升级现有系统为相同灵敏度,并能拥有和PPSQ-51A / 53A一样的软件。升级包在有高层次的灵活性以及数据库的标准版和客户端服务器版本中都可以使FDA 21 CFR Part 11合规。
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  • 蛋白激酶活性实时检测分析系统 为了研究生物系统中的激酶,我们已经开发了一种独特的方法,使用具有代表已知磷酸位的肽的高灵敏度微阵列。在实验过程中,将阵列与细胞或组织的裂解液一起孵育。样品中的活性激酶会磷酸化其在阵列上的靶标。识别磷酸化残基的通用荧光标记抗体用于可视化磷酸化。智能分析工具可用于解释磷酸化模式,并生成关于条件之间激酶活性差异的假设。 蛋白激酶活性实时检测分析系统由pamchip和pamstation两部分组成,pamchip是微阵列芯片,每个pamchip有4个试验点,每个试验点有96个微阵列。pamstation是自动化分析pamchip的分析平台,可以同时分析3个pamchip。 激酶是研究最深入的蛋白质靶标,也是众多靶向疗法的基础。 但是,传统方法研究的是蛋白质的丰度而不是其活性。 这导致了关于细胞信号传导真正工作方式的知识鸿沟,并且仅对临床样品有部分了解。 蛋白激酶活性实时检测分析系统目前是世界上weiyi一个能做到实时检测激酶活性,进而分析信号通路、生物标记物发现、疾病模型表征、药物靶点发现和反应的设备。 产品应用? 途径阐明? 生物标志物发现? 疾病模型表征? 靶点发现与相互作用我们的技术为您的研究带来的好处:• 广泛的覆盖范围– 380种磷酸用于覆盖激酶组的大部分。• 基于激酶活性– 可以测量对激酶的直接抑制剂作用。• 灵敏– 仅需要少量蛋白质输入(每个阵列0.5至5μg),因此使该测定比其他方法更为灵敏。• 无特异性抗体– 数据质量不依赖于磷酸抗体的特异性,因为特异性源自380个磷酸位点。• 全长激酶– 我们可以从几种细胞系和组织的裂解物中测量全长蛋白的激酶活性,而其他基于重组的激酶活性测定法则无法提供这种活性。
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  • 酪蛋白在奶粉中的作用

    大多数婴儿都是吃奶粉长大的,因为奶粉里面的营养物质是非常多的,能够针对孩子的成长阶段,有不同的奶粉搭配,不同阶段的奶粉里面的营养成分不一样,酪蛋白是婴儿比较需要的一种物质,这种物质能够帮助婴儿分解身体内的蛋白质,促进蛋白质的吸收,那么酪蛋白在奶粉中都有什么作用呢? 一些婴儿的蛋白质分解能力很差,仅为成人的五分之一,因此牛奶中的大分子很难被儿童肠道吸收,这可能会导致蛋白质过敏。蛋白质奶粉的水解意味着首先处理奶粉中的蛋白质,并且通过水解来减少原来的蛋白质分子,这使得对蛋白质过敏的人更容易吸收,因为蛋白质分子减少了,所以身体中的免疫系统不会对它们起作用,也不会出现过敏症状。 酪蛋白具有防止矿物质流失、预防龋齿、预防骨质疏松和佝偻病、治疗缺铁性贫血和镁缺乏性神经炎等多种功能,特别是其促进主要元素(钙、镁)和微量元素(铁、锌、铜、铬、镍、钴、锰、硒)有效吸收的功能特性。一方面,它能有效防止钙在小肠的中性或微碱性环境中沉淀,另一方面,它能让钙在没有VD参与的情况下被肠壁细胞吸收,因此它是最有效的钙吸收促进剂之一。低蛋白膳食(植物蛋白)能抑制黄曲霉毒素诱发癌症,而且,即使癌症已经发生,低蛋白膳食也能显著地遏制癌症病情的恶化。而高蛋白膳食(动物蛋白)则能对黄曲霉毒素诱发癌症起到“推波助澜”的作用。事实上,膳食蛋白质对癌症的影响是非常显著的,只需要调整蛋白质的摄入量,就可以激活或者抑制癌症的发生和发展。

  • 蛋白胨和胰蛋白胨

    本文引用自cheney《蛋白胨和胰蛋白胨简介》蛋白胨是将肉、酪素或明胶用酸或蛋白酶水解后干燥而成的外观呈淡黄色的粉剂,具有肉香的特殊气息。蛋白质经酸、碱或蛋白酶分解后也可形成蛋白胨。蛋白胨富含有机氮化合物,也含有一些维生素和糖类。它可以作为微生物培养基的主要原料,在抗生素、医药工业、发酵工业、生化制品及微生物学科研等领域中的用量均很大。不同的生物体需要特定的氨基酸和多肽,因此存在着各种蛋白胨,一般来说,用于蛋白胨生产的蛋白包括动物蛋白(酪蛋白、肉类)和植物蛋白(豆类)等两种。能为微生物提供C源、N源、生长因子等营养物质。因此,蛋白胨从来源上可分为动物性蛋白胨和植物性蛋白胨。胰胨、肉胨、骨胨等都是动物性蛋白胨,而大豆蛋白胨等则是植物性蛋白胨。动物性来源的蛋白胨还有:蚕蛹蛋白胨、血液蛋白胨等。   不同来源的蛋白质和不同的水解条件,其水解物中组成可千差万别。所以胨往往是一个复杂的多肽混合物。可溶于水,过热不凝固,在饱和硫酸铵中不发生沉淀但可为蛋白质沉淀剂所沉淀。可用作微生物和动物细胞培养基、特种功能性食品和化妆品的配料,也有用作啤酒等产品的稳定剂。胰蛋白胨,又称胰酪蛋白胨(Casein Tryptone)、胰酶消化酪蛋白胨(Pancreatic digest of casein),是一种优质蛋白胨,是以新鲜牛肉和牛骨经胰酶消化,浓缩干燥而成的浅黄色粉末。具有色浅、易溶、透明、无沉淀等良好的物理性状。含有丰富的氮源、氨基酸等,可配制各种微生物培养基,用于细菌的培养、分离、增殖、鉴定,以及无菌试验培养基、厌氧菌培养基等细菌生化特性试验用培养基的配置。胰蛋白胨还广泛应用于高品质的抗生素、维生素、医药工业,氨基酸、有机酸、酶制剂、黄原胶等发酵工业,生化制品及微生物学科研等领域中的用量均很大,临床用于抗炎消肿,工业上用于皮革制造,生丝处理,食品加工。在国际市场上,胰蛋白胨也属于货紧价昂的短线品种之一。   胰酪蛋白胨质量标准及其检验标准:   常规各项理化指标:   1. 澄清度(磷酸盐、碱性沉淀):无沉淀、澄清   2. 2%水溶液:透明   3. 酸碱度:6-7   4. 氨基氮:≥3%   5. 色氨酸:≥0.8%   6. 胨含量:≥80%   7. 总氮:≥13%   8. 水份:≤5%   9. 灰份:≤6%   10. 氯化钠:≤0.2%胰蛋白胨特指用胰蛋白酶酶解酪蛋白生成的蛋白胨产物,与一般蛋白胨的区别在于酶解工艺处理上,属于水解度更高、胨分子量更小更均衡的蛋白胨。

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  • 435万!北京生命科学研究所计划采购多光谱激光成像仪及蛋白纯化分析系统
    项目概况北京生命科学研究所多光谱激光成像仪及蛋白纯化分析系统采购项目 招标项目的潜在投标人应在北京市西城区宣武门外大街10号庄胜广场中央办公楼北翼13A获取招标文件,并于2022年06月14日 13点30分(北京时间)前递交投标文件。一、项目基本情况项目编号:HCZB2022-094项目名称:北京生命科学研究所多光谱激光成像仪及蛋白纯化分析系统采购项目预算金额:435.0000000 万元(人民币)采购需求:名称、数量、简要技术需求如下:序号货物名称数量简要技术需求1▲多光谱激光成像仪1套… … 3.1检测模式:同位素磷屏成像、荧光成像和密度测定。… … (详见招标文件第六章)2▲蛋白纯化分析系统1套… … 2.1.1 精确的全自动微量柱塞泵,双泵四泵头。… … (详见招标文件第六章)注:1.标注“▲”的,允许提供进口产品;未标注允许采购进口产品的,如投标人所投货物为进口产品,其投标无效。2.本项目共1个包,投标人只可投完整包,不允许将一包中的内容拆开进行投标。合同履行期限:多光谱激光成像仪:合同签订后4个月内完成供货(免税的进口产品为签订外贸合同后);蛋白纯化分析系统:合同签订后6个月内完成供货(免税的进口产品为签订外贸合同后)。本项目( 不接受 )联合体投标。二、申请人的资格要求:1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定;2.落实政府采购政策需满足的资格要求:(1)投标人不为“信用中国”网站(www.creditchina.gov.cn)中列入失信被执行人和重大税收违法案件当事人名单的投标人,不为中国政府采购网(www.ccgp.gov.cn)政府采购严重违法失信行为记录名单中被财政部门禁止参加政府采购活动的投标人(以开标现场查询为准);(2)投标人单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商,不得参加同一合同项下的政府采购活动;(3)为采购项目提供整体设计、规范编制或者项目管理、监理、检测等服务的供应商,不得再参加本次采购活动;3.本项目的特定资格要求:/。三、获取招标文件时间:2022年05月24日 至 2022年05月31日,每天上午9:30至11:30,下午14:00至17:00。(北京时间,法定节假日除外)地点:北京市西城区宣武门外大街10号庄胜广场中央办公楼北翼13A方式:现场领购 获取招标文件需携带以下资料: 1.经办人员需携带法定代表人身份证明书(适用于法定代表人的,加盖投标人公章)或法定代表人授权委托书(适用于非法定代表人的,授权内容需包含其办理本项目购买招标文件等手续,加盖投标人公章、法定代表人签字或盖章),个人有效身份证明文件(居民身份证、护照、军人身份证件、驾驶证其中一项)原件及复印件或扫描件(加盖投标人公章)。 2.如自然人投标的,上述资料仅需签字或盖章即可。 3.经办人应严格遵守北京市政府及相关部门发布的现行关于新冠肺炎疫情防控的有关要求,需配合大厦物业工作人员出示北京健康宝、佩戴N95口罩、进行体温检测及人员信息登记等事宜,自觉做好个人防护。售价:¥200.0 元,本公告包含的招标文件售价总和四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点提交投标文件截止时间:2022年06月14日 13点30分(北京时间)开标时间:2022年06月14日 13点30分(北京时间)地点:北京市昌平区中关村生命科学园路七号二楼北会议室。五、公告期限自本公告发布之日起5个工作日。六、其他补充事宜1.评标方法和标准:采用综合评分法;满分为100分:投标报价部分30分,商务部分36分,技术部分34分。 2. 需要落实的政府采购政策:《中华人民共和国政府采购法》(主席令第68号)、《关于中国环境标志产品政府采购实施的意见》(财库[2006]90号)、《关于调整优化节能产品、环境标志产品政府采购执行机制的通知》(财库[2019]9号)、《国务院办公厅关于建立政府强制采购节能产品制度的通知》(国办发[2007]51号)、《关于开展政府采购信用担保试点工作的通知》(财库[2011]124号)、《关于印发〈政府采购促进中小企业发展管理办法〉的通知》(财库[2020]46号)、《财政部、司法部关于政府采购支持监狱企业发展有关问题的通知》(财库[2014]68号)、《关于促进残疾人就业政府采购政策的通知》(财库[2017]141号)、《北京市财政局关于进一步完善市级科研仪器设备政府采购管理有关事项的通知》(京财采购[2016]2862号)、《财政部关于在政府采购活动中查询及使用信用记录有关问题的通知》(财库[2016]125号)、《关于运用政府采购政策支持脱贫攻坚的通知》(财库[2019]27号)、《北京市财政局北京市生态环境局关于政府采购推广使用低挥发性有机化合物(VOCs)有关事项的通知》(京财采购[2020]2381号)等。3.本公告在中国政府采购网发布。4.由于系统原因,其他未尽事宜及公告显示内容与附件不同的,以附件为准。七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名 称:北京生命科学研究所     地址:北京市昌平区中关村生命科学园路七号        联系方式:李硕 80726688-8311      2.采购代理机构信息名 称:华诚博远工程咨询有限公司            地 址:北京市西城区宣武门外大街10号庄胜广场中央办公楼北翼13A            联系方式:刘天泽 18500706692            3.项目联系方式项目联系人:刘天泽电 话:  18500706692
  • 一种快速测定牛奶中乳清蛋白/酪蛋白比的方法
    21世纪,全球各个国家都处在一个经济、信息、科技多方面高速发展的时期。经济的发展提高了绝大多数人们的生活水平,信息科技的大爆炸拓展了人们的视野和见识,科技的进步为人类的持续发展和安全提供源动力。然而,事物通常都具有两面性,给我们带来便捷和效益的同时,也将衍生诸多问题。食品安全问题愈发严峻,便是当今经济、信息、科技发展的副产物。食品企业追求经济利益最大化时,往往利用一些不法的伪科学手段来降低企业生产成本,损害人们的身心健康安全。层出不穷的食品安全事件,尤其在乳制品行业年年都接连不断地爆发,如同挥之不去的梦魇,在这个信息大爆炸的时代,迅速传播,不断地刺痛着人们越来越越敏感脆弱的神经。 日前,香港商业调查机构CER公司公布报告称,某洋品牌配方奶粉远未达到国际标准甚至是中国所能接受的最低标准,被指最差洋奶粉。质量最差门主要是该品牌1段婴幼儿配方奶粉,乳清蛋白和酪蛋白比例不合格。说明称,乳清蛋白中含有高浓度、比例恰当的必需氨基酸,还含有为新生儿必需的半胱氨酸。乳清蛋白还含有包括免疫球蛋白和双歧因子等免疫因子。对于宝宝而言,乳清蛋白是一种优质蛋白,因为它容易被消化,蛋白质的生物利用度高,从而有效减轻肾脏负担。酪蛋白中含有丰富的必需氨基酸,还含有婴儿特别需求的蛋氨酸、苯丙氨酸及酪氨酸。酪蛋白中结合了重要的矿物元素,如钙、磷、铁、锌等。但是,酪蛋白是一种大型、坚硬、致密、极困难消化分解的凝乳。过量的酪蛋白会产生较高的肾溶质负荷,给宝宝肾脏带来较重的负担,对宝宝是不安全的。 乳清蛋白和酪蛋白各有好处,但合适的比例还是应该以母乳作为黄金标准。母乳中乳清蛋白和酪蛋白的比例为60 : 40(而普通牛奶中乳清蛋白和酪蛋白的比例为18 : 82)。而此次被检测出的该品牌奶粉,乳清蛋白和酪蛋白的比列为41 : 59。国际食品法典委员会(CAC)在&ldquo 婴儿配方食品及特殊医学用途婴儿配方食品&rdquo 标准中,没有对产品中乳清蛋白的比例提出要求,而推荐以必需和半必需氨基酸的含量是否接近母乳作为婴儿配方食品中蛋白质质量的判定依据。其他国家和地区(包括美国、欧盟和澳大利亚、新西兰等)均未规定乳清蛋白在蛋白质中所占比例。我国国家标准GB10765-2010《婴儿配方食品》中,要求&ldquo 乳基婴儿配方食品中乳清蛋白含量应&ge 60%&rdquo ,即以乳或乳蛋白制品为主要原料的婴儿配方食品中,乳清蛋白所占总蛋白质的比例应大于等于60%。该要求主要是参考了母乳中乳清蛋白和酪蛋白的比例,沿用了我国GB10766-1997《婴儿配方乳粉ⅡⅢ》中关于乳清蛋白比例的相关规定。 各种品牌的婴儿奶粉都在宣称"接近母乳",其中乳清蛋白和酪蛋白的比例是一个重要的指标,因为它能提供最接近母乳的氨基酸组合,更好地满足宝宝的成长需要。实际上,牛奶中酪蛋白含量的测定对于乳制品和奶酪制品生产商也都具有重大的经济意义。厂商通过测定酪蛋白含量,可以精确预测利用牛奶生产奶酪的产量。目前,市场上已经有一种快速测定乳清蛋白和酪蛋白比例的方法,是由美国CEM公司提出,在一些实验室应用推广。原理上是利用快速真蛋白测定仪,测得总蛋白含量后,沉淀及过滤酪蛋白,再测量乳清蛋白含量,能够快速精确得出酪蛋白含量,从而确定乳清蛋白和酪蛋白比例。整个过程仅需约15分钟,精确度和重复性相比其它凯氏定氮法和凝胶色谱法等更高,且没有污染性、腐蚀性试剂。这种高效而环保的方法值得推广,使用。 美国 CEM SPRINT 真蛋白质测试仪 更多详情,请联系培安公司: 电话:北京:010-65528800 上海:021-51086600 成都:028-85127107 广州:020-89609288 Email: sales@pynnco.com 网站:www.pynnco.com
  • 化学蛋白质组学揭示高铁血红素-蛋白互作谱
    大家好,本周为大家分享一篇最近发表在Journal of The American Chemical Society上的文章,A Chemical Proteomic Map of Heme−Protein Interactions1。该文章的通讯作者是美国斯克利普斯研究所的Christopher G. Parker研究员。高铁血红素(heme)是人体中许多蛋白质的辅助因子,也是血液中氧气的主要转运体。最近的研究也证实了高铁血红素可以作为一种信号分子,通过与伴侣蛋白质结合而不是通过其金属中心反应来发挥其作用。然而,目前关于血红素结合蛋白的注释还不够完整。因此,本文采用化学蛋白质组学的方法去揭示人体中与高铁血红素发生互作的蛋白质谱。化学蛋白质组学是揭示蛋白质功能和发现药物靶标的重要工具。其中,最常用的是基于活性的蛋白质分析(Activity-based protein profiling,ABPP),通过结合活性分子探针标记及串联质谱分析,实现对靶标蛋白的鉴定。如图1b,本文设计了一个“全功能”活性分子探针(HPAP),共包含3个部分:1. Hemin母核,用于与靶蛋白非共价结合;2.光活化基团-双吖丙啶,可在UV光照下生成卡宾,促使分子探针与蛋白发生共价交联;3. 炔基,可在铜催化下与含有叠氮的试剂(荧光标签,生物素)发生点击化学反应,后两者组成FF-control。具体实验流程如下图1a所示,用HPAP处理不同细胞(In Situ)或不同细胞来源的蛋白质组(In vitro),HPAP中的hemin母核可与靶蛋白发生非共价结合,经UV光照,HPAP-蛋白间形成共价交联,再利用点击化学可将HPAP-蛋白与荧光素(TAMRA)或者生物素标签相连,用于后续的荧光成像(In-gel fluorescence)或者链霉亲和素纯化、LC-MS鉴别定量(MS-based I.D. and quantitation)。 图1. (a)使用基于高铁血红素的光亲和探针(HPAP)识别血红素结合蛋白的流程示意图。(b) HPAP、hemin和FF-control的结构;(c) HEK293T裂解物中与HPAP结合的蛋白的荧光成像;(d) hemin加入对HPAP与蛋白结合的影响。作者首先使用了SDS-PAGE去评估了HPAP标记蛋白的能力。如图1c所示,随着HPAP浓度的提高,胶图上条带颜色也逐渐加深,说明HEK293T细胞裂解液中与HPAP结合的蛋白在逐渐增加。如图1d所示,在10 μM HPAP的条件下,逐渐加入hemin,可以看到胶图上条带颜色逐渐变浅,说明hemin与HPAP之间发生了竞争,HPAP模拟了hemin与蛋白的结合过程。随后,作者又使用已知的hemin结合蛋白来确认HPAP捕获目标蛋白的能力。如图2所示,这些已知蛋白被HPAP成功的标记上,但由于hemin的加入,条带的颜色在逐渐变浅(TAMRA)。Western blot的结果显示,蛋白的总量并无太大变化,但hemin的竞争结合,导致与HPAP结合的蛋白量在下降。以上实验均说明,HPAP具有较好的选择性标记能力,能够模拟hemin与靶蛋白的结合,并以共价交联的方式标记在蛋白上。 图2. 用已知的高铁血红素结合蛋白确认HPAP捕获目标蛋白的能力。验证了方法的可行性后,作者将HPAP与定量蛋白质组学结合用于绘制高铁血红素-蛋白质互作谱。考察了多种细胞系,包括:人胚胎肾细胞(HEK293T)、人慢性髓系白血病细胞(K562)以及人原代外周血单个核细胞(PBMCs)。每种细胞系设置了两种实验形式:1)特异性结合实验(Enrichment):通过将HPAP识别出蛋白与FF-Control识别出的蛋白进行对比,排除非特异结合的干扰(图1b),如果同一蛋白通过HPAP富集到的量是FF-control富集到的量4倍以上,则认为该蛋白是HPAP特异性结合蛋白。2)竞争性结合实验(Competition):观察HPAP富集的蛋白在hemin和HPAP同时存在时富集到的量的变化,变化大于3倍且具有显著性差异(p<0.05)的蛋白被认为是HPAP与hemin竞争性结合的蛋白。最终确定的高铁血红素结合蛋白应满足以上两种实验的筛选标准(图3a)。如图3b-d所示,总共鉴定出378个的高铁血红素结合蛋白,其中214个来自HEK293T, 182个来自K562, 107个来自PBMC。尽管三种细胞类型之间的结合蛋白有一些重叠,但大多数靶点蛋白只存在于一种或两种细胞类型中(图3b),这暗示血红素在不同细胞中可能发挥不同的功能。其中,19个靶点蛋白是在UniProt上已经注释为高铁血红素的结合蛋白,剩余都是未揭示的结合蛋白。这些结合蛋白按照功能可划分为:转运蛋白,转录因子,支架蛋白和酶(图3c),根据代谢通路又可进一步划分(图3d)。作者最后对几个新发现的结合蛋白进行了验证,并选择IRKA1进行进一步的作用机制研究。IRKA1在调节炎症信号通路中起着关键作用,IRAK1被IRAK4磷酸化,然后自磷酸化,产生NFkB介导的炎症反应。经实验确认(图4),hemin是IRKA1的一种变构活化配体,可增强其酶活性,促进IRAK1的自磷酸化。 图3. 基于蛋白质组学的HPAP-蛋白互作分析。 图4. Hemin对IRKA1的调节作用。总之,本文设计开发了一种基于高铁血红素的光亲和探针,它可以与化学蛋白质组工作流程结合,以识别不同蛋白质组中的高铁血红素结合蛋白。利用该方法也可拓展至其他分子配体靶标蛋白的识别。 撰稿:刘蕊洁编辑:李惠琳原文:A Chemical Proteomic Map of Heme-Protein Interactions参考文献1. Homan, R. A., Jadhav, A. M., Conway, L. P., & Parker, C. G. (2022). A Chemical Proteomic Map of Heme-Protein Interactions. Journal of the American Chemical Society, 144(33), 15013–15019.
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