野外高通量植物表型分析平台

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野外高通量植物表型分析平台相关的厂商

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    上海泽泉科技股份有限公司(Zealquest Scientific Technology Co., Ltd.)成立于2000年,是一家专注于高端科研设备研发、系统集成、技术推广、咨询、销售和科研服务的科技型技术企业。公司注册资金3500万元人民币,具有进出口贸易权。公司总部位于上海浦西,在北京设有分公司,在广州、成都、武汉分别设有代表处。公司全体员工均具有高等教育背景,其中80%的技术研发、技术支持和销售人员具有硕士和博士学位,参加过很多国家和省部级重大科研项目,具有丰富的科研工作经验。公司曾获得上海市高新技术企业、上海市普陀区科技小巨人企业、上海市科技型企业中华全国工商联合会/上海市工商联合会/上海市商会会员单位,曾是上海市专业技术服务平台——生理生态测量与分析平台的依托单位和上海市高新技术成果转化项目承担单位。2012年公司通过了ISO9001质量管理体系认证,获得AAA级信用资质等级认定,获得普陀区科技小巨人企业认定,成为上海市研发公共服务平台加盟单位和“上海市工商联合会”/“上海市商会”会员单位 。2015年获得“专精特新”中小企业认定。2016年成为“上海市生态学学会常务理事单位”和“上海种子行业协会”会员单位,2017年成为“上海市农业工程学会理事单位”。上海泽泉科技股份有限公司非常注重自主知识产权的申报和保护,截止2021年底已获得发明专利6项、实用新型53项及软件著作9项,国内外科研期刊发表科研论文20多篇。公司还参与承担了国家自然科学基金重点项目(41030529)和水利部948项目(200907)。公司秉承推进中国生态环境改善、农业兴国的理念,服务涉及植物表型组学和基因组学、植物生理生态、土壤、环境气象、水文水利、氢农业等领域的科研和技术支持,服务对象主要为各级科研单位、高校和政府机构。公司先后为科技部“973”项目和“863”项目、国家科技重大专项、国家科技支撑计划、国家“211”工程和“985”工程、中科院知识创新工程、农业部“948”项目、水利部“948”项目等提供技术咨询、仪器设备、系统解决方案和系统集成服务,为项目的顺利完成提供了有力支持。多年来,公司积极参与相关领域的学术会议,并定期举办相关仪器设备的技术讲座和培训班,在科研和监测领域产生了积极的反响,获得了良好的口碑。截止2021年底,泽泉科技举办公开技术讲座200多场,参会人员超过10000人次;同时在国内外应邀参加学术会议和展会200多次,与相关领域的客户有非常密切的交流合作。2014年2月,上海泽泉科技股份有限公司在上海浦东孙桥现代农业园区投资成立了上海乾菲诺农业科技有限公司,建设了AgriPhenoTM “高通量植物基因型-表型-育种服务平台”,为植物科研和育种单位提供全面的样品收集和栽培,实验设计和项目合作,以及表型数据与生物信息学分析综合服务。平台成功主持了上海张江国家自主创新示范区专项发展资金重点项目“泽泉科技高通量植物基因型-表型-育种服务平台”。作为主持单位或合作单位参与了上海市农委和科委的30多项政府科研服务项目以及商业服务项目,如科技兴农种业发展项目“农作物分子育种的技术创新研究”和“青菜高通量表型图谱标准的建立及主要性状分析”、科技兴农重点攻关项目“基于图像分析及三维建模技术的黄瓜长势快速评价方法研究”、 “兰科观赏花卉分子育种技术研究与产业化应用”等。为了紧追世界科技发展水平,开启院企合作建立研究型平台的创新尝试,上海泽泉科技股份有限公司与上海市农业科学院,结合双方各自的优势,于2021年5月在上海农业科学院庄行试验站联合成立“上海市农业科学院庄行综合试验站泽泉科技植物表型技术研究平台”,AgriPhenoTM平台从上海浦东孙桥现代农业园区整体迁出,并入新建的植物表型技术研究平台。目前平台除拥有无人机表型平台、温室型和实验室型高通量表型分析系统外,还拥有现代化温室、生物学实验室、植物生理生态测量设备、农业气象测量系统和专业的数据库平台,已经具备了对植物、动物基因测序与植物表型研究的各类条件。可以承担高通量DNA提取、基因测序服务、分子辅助育种、植物生理生态研究等科研实验任务。同时可以为植物功能基因组、农业育种家提供高通量植物基因型测试、高通量植物表型测试和植物基因型-表型生物信息学数据分析等开放式服务。公司积极响应上海市政府“崇明世界级生态岛建设”的发展方向,2016年12月泽泉科技在崇明城桥镇投资成立了子公司—上海金盏农业发展有限公司,扩展建设田间智能化育种服务平台,以及智能化农业物联网“农业云平台”,以生态乡村、能源乡村的发展模式,展示并实施公司自主研发的先进的农业楼宇基础设施、温室与田间的智能化“多因子”调控的栽培管理模式;拟建成拥有田间型高通量表型分析系统的“AgriPheno智能化育种服务平台”,提高上海种业商业化育种的进程,并服务于全国和国外相关育种科研单位。展望未来,上海泽泉科技股份有限公司希望在社会多方资源的支持和关怀下,不断提升自己,为社会提供更多、更优秀的产品和一流的服务!
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  • 400-860-5168转4713
    北京博普特科技有限公司成立于2008年,公司主要为植物、食品、生态、土壤、环境、气象、遥感行业提供科研仪器以及系统解决方案。涵盖田间表型成像系统、室内表型成像系统、种子表型成像系统、根系表型成像系统、显微表型成像系统等各个领域。公司主营产品有:WIWAM植物表型成像系统(RGB成像模块、多光谱激光雷达模块、叶绿素荧光成像模块、高光谱成像模块、近红外成像模块、计算机断层扫描模块、红外成像模块、3D激光雷达模块等);Videometer植物、种子多光谱表型成像系统、根系多光谱表型成像系统、VideometerLiq液体稳定多光谱成像系统、VideometerMic显微多光谱成像系统、Videometer Minilab 便携式多光谱成像系统、Videometer LabUV紫外光多光谱成像系统、VideometerLab XY高通量种子表型成像系统;Plant-Ditech公司的Plantarray高通量植物生理表型研究平台、植物逆境生物学生理研究平台、植物种质资源精准评价与鉴定平台以及SPAC分析系统;Fraunhofer研究院的便携式植物种子断层扫描系统、台式计算机断层扫描系统、全自动种子断层扫描系统、大型落地式根系表型成像系统;Hiphen 公司Airphen多光谱表型成像系统、Hiphen LITERAL手持植物表型冠层成像系统、Hiphen推车多光谱成像系统、Phenomobile全自动全植株智能表型成像车;HAIP 公司的BlackBird科研级高光谱成像系统、Blackbullet科研级高光谱成像系统、Blackbox科研级高光谱成像系统、BlackIndustry 工业级高光谱成像系统、Black mobile便携式高光谱成像系统;SeQso高通量种子表型与播种一体化系统、CF叶绿素种子成熟度测量仪、自动种子分拣系统(X光、多光谱、高光谱、叶绿素荧光);STEPS公司的植物生理生态监测系统、在线光合生理监测系统、土壤养分测量系统、植物养分测量系统、土壤5合1多参数测量仪、土壤直测PH计、盐度/活度检测仪;Pessl公司的植物生态环境智能传感器平台、植物物候远程监测系统;Inno-concept公司的植物活力胁迫测量系统、植物抗逆研究测量系统、气相离子迁移谱仪;Aquation水陆两用叶绿素荧光检测系统、经典和手持叶绿素荧光仪、Aquation公司的水下光合呼吸测量系统;EMS公司的便携式物联网乙烯气体分析仪、温室气体物联网监测系统;Cleangrow多参数离子测定仪、植物工厂自动8离子测定仪;Schaller全谷物湿度仪;EGC植物生长培养箱和生长室等等。
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  • 400-860-5168转1895
    北京易科泰生态技术有限公司成立于2002年,为中关村高新技术企业,致力于生态-农业-健康研究监测技术推广、研发与服务,特别是在光谱成像技术(高光谱成像技术、叶绿素荧光成像技术、红外热成像技术、无人机遥感等)、植物表型分析技术、呼吸与能量代谢测量技术等方面,与国际领先企业PSI、Specim、Sable等合作,致力于植物科学、土壤与地球科学、动物能量代谢、水体与藻类及生态环境领域先进仪器技术的引进推广和技术研发集成,为植物/作物表型分析、生态修复及生态保护、能量代谢测量等提供规划设计、技术方案与系统集成、技术咨询与科技服务。公司技术团队80%以上具备硕士或硕士以上学位,并与中国科学院研究生院、中科院植物研究所、中科院动物所、中科院地理科学与资源研究所、中国农科院、中国林科院、中国环科院、中国水科院、清华大学、中国农业大学、北京林业大学、北京大学、中国海洋大学、陕西师范大学、内蒙古大学等建立了长期的技术合作交流关系。 公司下设有叶绿素荧光技术与植物表型业务部、EcoTech实验室、光谱成像与无人机遥感事业部及无人机遥感研究中心(与陕西师范大学合作建立)、动物能量代谢实验室、内蒙古阿拉善蒙古牛生态牧业研究院及青岛分公司。实验室拥有叶绿素荧光成像、叶绿素荧光仪、水体藻类荧光仪、SPECIM高光谱仪、WORKSWELL红外热成像仪、EasyChem全自动化学分析仪、MicroMac1000水质在线监测系统、ACE土壤呼吸自动监测系统、SoilBox便携式土壤气体通量测量系统、动物呼吸测量系统、LCpro+光合作用测量仪、Hood土壤入渗仪、年轮分析仪等各种仪器设备,可以进行实验研究分析、实验培训等,欢迎与易科泰生态研究室开展合作研究。 易科泰公司与欧洲PSI公司(叶绿素荧光技术与表型分析技术)、美国SABLE公司(动物能量代谢技术)、欧洲SPECIM公司(高光谱成像技术)、欧洲WORKSWELL公司(红外热成像技术)、欧洲ATOMTRACE公司(LIBS元素分析技术)、欧洲BCN无人机遥感中心、欧洲ITRAX公司(样芯密度扫描与元素分析)、美国VERIS公司、英国ADC公司、德国UGT公司、欧洲SYSTEA公司等国际著名生态仪器技术领域的研发机构和厂商建立了密切的合作关系,在FluorCam叶绿素荧光成像与荧光测量技术、PlantScreen植物表型分析技术、高光谱成像技术、红外热成像技术、光合作用与植物生理生态研究监测、土壤呼吸与碳通量研究监测、动物呼吸代谢测量、水质分析与藻类研究监测、CoreScanner样芯密度CT与元素分析技术、LIBS元素分析技术、无人机生态遥感技术等生态仪器技术及其系统方案集成有着丰富的经验,成为我国农业、林业、地球科学、生态环境研究等领域科技进步的重要研究技术支持力量。由公司研制生产的EcoDrone无人机遥感平台、SoilTron多功能小型蒸渗仪技术、SoilBox土壤呼吸测量技术、PhenoPlot轻便型作物表型分析系统、SCG-N土壤剖面CO2/O2梯度监测系统、植物生理生态监测技术、动物能量代谢测量技术等,在中科院修购项目、农业部学科群项目、CERN网络(生态系统监测网络)等项目中发挥重要作用。 “工欲善其事,必先利其器”,易科泰公司将秉承“利其器,善其事”的经营理念,为国内生态-农业-健康研究与发展提供最优的技术方案和服务。欢迎关注易科泰公众号:
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野外高通量植物表型分析平台相关的仪器

  • PlantScreen野外高通量植物表型分析平台——Field-based High-throughput Phenotyping PlatForm 建立对野外生长植物迅速、准确、高通量非损伤多性状表型分析能力,是21世纪作物遗传育种面临的最 大挑战(Andrade-Sanchez et al.2014, Furbank and Tester 2011, Houle et al. 2010)。野外高通量植物表型分析平台对遗传学、生物技术、作物育种,及作物对气候变化、土壤、耕作管理的响应研究监测等,特别是现代农业、智慧农业都具有无比重要的意义。 PlantScreen野外高通量植物表型分析平台集成了自动化控制系统、叶绿素荧光成像测量分析、植物热成像分析、植物高光谱分析、RGB彩色成像分析及互联网+表型大数据平台等现代先进技术,以最 优化的方式实现野外植物原位高通量表型分析测量、植物胁迫响应与作物抗性成像分析测量筛选、植物生长分析测量、性状识别及植物生理生态分析研究等。作为全球第 一家研制生产植物叶绿素荧光成像系统的厂家,PSI公司在植物表型成像分析领域处于全球的技术前列,大面积叶绿素荧光成像分析等成像分析平台使PlantScreen成为植物表型分析与功能成像分析的最为先进的仪器设备。 功能特点:1) 大型多功能成像平台(Multi-functional sensor platform),集成了叶绿素荧光成像、RGB成像、红外热成像、LiDAR、高光谱成像等各种先进高端传感设备,全面分析:a) 结构性状表型分析(RGB成像及LiDAR)b) 功能表型分析(叶绿素荧光成像)c) 形状与生长评估(RGB成像及LiDAR)d) 光合作用表现(叶绿素荧光成像)e) 生物胁迫与非生物胁迫响应(叶绿素荧光成像、高光谱成像、红外热成像)f) 生理生态表现包括光合生理、气孔动态、生化代谢指标等等(叶绿素荧光成像、高光谱成像、红外热成像)2) 全球领 先的FluorCam叶绿素荧光成像技术,是作物生理生态功能性状的必备分析技术,智能LED光源提供调制测量光可以在白天自动成像测量光适应条件下的叶绿素荧光及光合效率;配备独有的高灵敏度叶绿素荧光成像镜头,成像面积达35cm x 35cm(可客户定制80cm x 80cm),是世界上单幅叶绿素荧光成像面积最 大的技术设备3) 可安装在拖拉机上进行移动式自动成像分析,也可安装在专用自动运行平台上沿样带轨道自动运行的同时进行样带全覆盖自动扫描成像和在线分析4) 表型分析大数据平台,包括系统控制、数据采集、数据处理分析与可视化在线显示、数据库等5) PSI表型研究中心专家团队技术支持,每年在美国和欧洲分别组织举办一次世界植物表型研讨会6) 可选配基于无人机技术(UAV-based)的PhenoUAS无人机高通量表型分析平台,使基于地面的表型分析scalling-up到空中大区域快速表型分析7) 可选配土壤气象监测站,全面分析环境条件与表型性状的关系8) 可选配植物生理生态监测系统,同步监测植物光合作用及果实生长等信息9) 可选配自动称重数字化培养盆,进行精确称重、土壤水分监测、自动浇灌等主要技术指标:1. 一体式多功能自动成像分析平台,集成了智能LED光源及叶绿素荧光成像模块、RGB成像分析模块及其它如红外热成像、LiDAR激光扫描、高光谱等选配成像模块,通过操作系统自动运行、自动分类存储、自动在线分析等2. 叶绿素荧光成像分析(标配): a) 3色智能LED激发光源,620nm脉冲测量光、白色光化学光和最 大饱和光闪、735nm红外光用于测量Fo’等b) 可选配蓝色光源与7位滤波轮用于多光谱多波段荧光测量如GFP成像测量c) 独有高灵敏度CCD叶绿素荧光成像传感器,帧频达50fps,有效捕捉叶绿素荧光瞬变,分辨率720x560像素,A/D 12比特,具备视频模式和快照模式;可选配高分辨率CCD,分辨率1360x1024,帧频20fps,A/D 16比特d) 单幅成像面积35x35cme) 成像测量参数:可进行黑夜暗适应测量及白昼光适应测量,测量参数包括Fo, Fm, Fv, Fo’, Fm’, Fv’, Ft, Fv/Fm, Fv’/Fm’, Phi_PSII, NPQ, qN, qP, Rfd等叶绿素荧光参数,用于分析植物光合效率、适合度、生物与非生物胁迫及作物抗性、恢复力等f) Fv/Fm、Kautsky诱导效应、荧光淬灭分析等完备自动化测量程序(protocols)与测量参数,如Fv/Fm程序测量时间仅需10sg) 叶绿素荧光数据在线分析,包括柱状图、测量参数图、数据表格等,具备自定义图像分割等功能,可进行不同时间尺度(如日、月、整个生长季节等)的多参数动态分析h) 是真正的二维同步成像,所得叶绿素荧光参数是真正的基于像素点的二维分布参数,避免简单化的“激光诱导成像”(优点是轻便、省电)仅仅是一维成像(点或线)、不能同步化二维成像、易受环境因素影响(如风吹草动即产生严重误差)、成像参数只是模拟参数(根据激光扫描快慢得到的快速测量荧光与慢速测量荧光不是真正的最小荧光和最 大荧光,所得参数“光量子产量”只是模拟光量子产量需要用进行校准后参数才能使用)、测量参数单一(只能得到快速测量荧光和慢速测量荧光及由此计算出的模拟光量子产量或称光量子效率)、技术不成熟(找不到参考文献)等问题i) 是世界上用于植物高通量表型分析应用最广、发表论文最多的技术手段3. RGB成像分析(标配):可对植物的形状、颜色绿度等进行成像分析,分辨率5Mpx,并可自动对植物花朵数量、水稻分蘖等进行统计分析,主要分析测量参数包括:1) 叶面积(Leaf Area: Useful for monitoring growth rate) 及其动态变化2) 植物紧实度/紧密度(Solidity/Compactness. Ratio between the area covered by the plant’s convex hull and the area covered by the actual plant)3) 叶片周长(Leaf Perimeter: Particularly useful for the basic leaf shape and width evaluation (combined with leaf area))4) 偏心率(Eccentricity: Plant shape estimation, scalar number, eccentricity of the ellipse with same second moments as the plant (0...circle, 1...line segment))5) 叶圆度(Roundness: Based on evaluating the ratio between leaf area and perimeter. Gives information about leaf roundness)6) 叶宽指数(Medium Leaf Width Index: Leaf area proportional to the plant skeleton (i.e. reduction of the leaf to line segment))7) 叶片细长度SOL (Slenderness of Leaves)8) 植物圆直径(Circle Diameter. Diameter of a circle with the same area as the plant)9) 凸包面积(Convex Hull Area. Useful for compactness evaluation)10) 植物质心(Centroid. Center of the plant mass position (particularly useful for the eccentricity evaluation))11) 扁平指数(Flattening index)12) 相对生长速率(Relative growth rate)13) 绿度指数与分级分析(暗绿、健康绿、浅绿等)14) 颜色分级与分区分析(Color segmentation for plant fitness evaluation)15) 其它性状与颜色分级动态分析4. 3D激光扫描分析(选配):用于植物结构表型分析,通过点云模型自动分析计算植物结构、生物量、叶片数量、叶面积、叶片倾斜角度、植物高度等各种形态结构参数5. 红外热成像分析(选配):焦平面阵列微测热辐射计,分辨率 640×480 像素,波段7.5-13μm,温度范围 -20 – 120℃,分辨率0.05℃@30℃/50mK,成像面积35x35cm,用于成像植物在光辐射情况下的冠层温度分布,并分析植物的气孔导度动态、干旱胁迫及抗干旱能力评估等,良好的散热可以使植物耐受较长时间的高光辐射或低水条件(干旱)6. 高光谱成像分析(选配):波长范围380-1000nm,光谱带数(波段数)675个波段,可成像并分析归一化指数(Normalized Difference Vegetation Index (NDVI))简单比值指数(Simple Ratio Index, Equation: SR = RNIR / RRED)、改进的叶绿素吸收反射指数(Modified Chlorophyll Absorption in Reflectance Index (MCARI1), ?Equation: MCARI1 = 1.2 * [2.5 * (R790- R670) - 1.3 * (R790- R550)])、优化土壤调整植被指数(Optimized Soil-Adjusted Vegetation Index (OSAVI)?, Equation: OSAVI = (1 + 0.16) * (R790- R670) / (R790- R670 + 0.16))、光化学植被反射指数(Photochemical Reflectance Index (PRI), Equation: PRI = (R531- R570) / (R531+ R570))等7. 野外移动平台:平台臂12m跨度,多功能成像平台可在移动平台上左右自动扫描成像分析,可自动扫描宽度达10m的样带,每一次扫描成像面积可达10x0.35m(3.5m2),完成一次扫描时间从不足1分钟到几分钟(根据实验测量程序Protocol而定),移动平台可沿轨道自动运行,运行距离原则上不受限制(受轨道长度限制);移动平台高度2.5m,多功能成像平台高度可调节,以适应不同高度作物成像分析;移动平台4个橡胶轮既可在轨道上通过控制系统自动运行并自动扫描成像,还便于在一般地面上移动、拐弯等,对于75x20m的样方,移动平台可以载荷多功能成像平台一次完成75x10m的样带,然后手动拐弯后再自动完成另一半75x10m的成像分析;配备GPS系统精度达2cm,通过软件自动记录测量数据、位置、时间等,可由柴油发电机提供动力驱动整个平台移动8. 可选配环境测量传感器网络,自动监测记录PAR、环境CO2浓度、空气温湿度、降雨量及土壤水分等。9. 系统控制与数据采集分析系统(表型大数据平台):1) 用户友好的图形界面2) GPS定位功能可进行空间分布信息及时空分布格局分析3) 已内置各种成熟的Protocols,具备用户定义、可编辑自动测量程序(protocols),根据用户设定程序自动完成全部实验。数据结果自动存储并分析,分析的数据结果可自动以动态曲线的形式显示4) MySQL数据库管理系统,可以处理拥有上千万条记录的大型数据库,支持多种存储引擎,相关数据自动存储于数据库中的不同表中5) 可用默认程序进行所有测量,也可通过开发工具创建自定义的工作过程,或者手动操作LED光源开启或关闭、RGB扫面成像、叶绿素荧光成像等6) 实验程序(Protocols)具备起始键、终止键、暂停键7) 系统可通过互联网无线远程控制,允许用户通过互联网远程访问,进行数据处理、下载及更改实验设计,具备用户权限分级功能,防止其他人员误操作影响实验产地:欧洲PSI应用案例: 应用FluorCam叶绿素荧光技术,对野外植物进行原位不同季节长期监测,同时监测植物光合作用(CO2同化)A,结果参见下图。FluorCam叶绿素荧光技术采用激发光脉冲调制技术、高灵敏度CCD传感器(采样频率达每秒50次)技术及智能LED光源,可以大面积(标配每帧成像面积35x35cm)植物/作物成像分析,在野外既可在夜间进行暗适应条件下的叶绿素荧光成像分析,还可在环境光适应条件下进行叶绿素荧光成像分析,比简单的激光诱导叶绿素荧光测量(通过一束点状或线型单色激发光源激发叶绿素荧光并进行测量,优点是省电且可以更轻便)相比有诸多功能优势,不仅测量参数多、可以进行各种叶绿素荧光实验程序成像测量分析,而且一次二维成像(真正的成像分析)避免了点状或线型激发光扫描造成的叶绿素荧光测量不同步、野外风吹草动分辨率严重降低等问题。 附:其它野外表型成像分析系统:1) PhenoUAS无人机高通量大田作物表型分析平台2) FluorCam野外移动式叶绿素荧光与RGB成像分析系统3) FluorCam样带扫描式叶绿素荧光与RGB成像分析系统(可选配红外热成像)
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  • 温室型高通量植物表型采集分析平台介绍:温室型高通量植物表型采集分析平台是一套针对大中型温室条件下集植物表型图像采集与参数分析功能于一体的高通量平台。平台采用流水线传送形式,将植物传送至成像暗室进行成像和解析,通过植物-传感器-解析的工作模式高效实现了对盆栽植株进行表型采集与解析。该产品可搭载可见光二维、可见光三维、高光谱等多个成像单元,可对突变体进行筛选与鉴定,对植物生长状态进行记录,同时也可以对高温、高盐、病害、虫害等逆境条件下植物的形态、颜色、纹理、长势、组分含量变化进行研究。温室型高通量植物表型采集分析平台适用于遗传育种、分子生物学、植物生理学、植物病理学、生态学、环境科学、植物保护等研究领域。温室型高通量植物表型采集分析平台产品组成:自动化传送单元+多维传感融合图像成像单元+边缘计算与解析单元+数据管理单元温室型高通量植物表型采集分析平台产品特点:1.多场景应用:适用于多种室内场景下的植物高通量的采集与应用;可应用于对温室控制条件下,对实验应用中的植株长势、逆境响应、病害等级分析等多种场景;2.高度集成:系统可集成可见光二维、可见光三维与高光谱成像单元,可全自动、高通量对植物样品进行可见光成像和高光谱成像;3.自动传送系统:系统采用全自动传送装置,配备智能化图像采集模块,系统运行全程自动化,减少人工操作误差;4.数据自动采集:系统支持配套植物样本自动识别码,植株移动到目标位置时自动进行关联,并自动记录对应设备的采集数据;5.样品称重及生物量计算:可选配称重模块,样品传送过程中高精度传感器实现对重量的测定;6.自动化参数解析:系统自动内置作物解析模型算法,根据可见光二维、可见光三维、高光谱等模块直接自动解析多项植株株型、颜色、纹理等参数;全角度多机位图像自动采集,无需手动标定,自动根据植物构建高精度三维模型;7.数据传输与存储管理:系统支持在本地搭建局域网络/公网,实现数据采集端PC端到数据中心服务器的自动化上传、自动化数据存储管理、自动化高效解析。8.数据安全:数据采用安全传输模式,储存空间无限扩容,保障用户需求的同时保障数据安全。温室型高通量植物表型采集分析平台-2维温室型高通量植物表型采集分析平台-3维温室型高通量植物表型采集分析平台-高光谱-玉米叶高光谱图_大豆冠层动图-高光谱图_水稻冠层各成像单元测量参数及应用领域:成像单元测量参数应用领域/场景可见光二维成像单元1、获取轮廓面积(顶视、侧视)、凸包面积(顶视、侧视)、冠层高度、冠幅、卷叶程度、叶顶点数、持绿程度、衰老程度、紧实度、偏心率、体积、生物量等2、高清测量植物颜色与真实纹理1、可分析植物基本形态,可用于突变体筛选/品种差异对比等场景2、可测量持绿程度、衰老程度等颜色信息,可应用于分析逆境胁迫响应、植物健康状态,植物病虫害分析等可见光三维成像单元1、基于可见光图像进行三维建模,生成高精度植物三维模型2、分析植物整体形态,基于三维模型准确获取植物冠层高度、冠幅、冠高比等形态参数3、整体分析植物的颜色分布4、整体分析植物的体积、表面积、生物量变化1、对植物株型进行三维结构分析,可应用于株型对产量影响分析、株型与植物健康状态相关性分析、株型突变体筛选等多个方向的研究2、可对植物生物量进行计算,用于分析植物生长状态变化,建立长势模型,记录植物生长与生物量变化过程,用于分析环境对植物生物量影响高光谱成像单元1、植物各部分光谱反射曲线2、叶绿素等成分反射峰值3、主要光谱指数(NDVI、RVI、GVI等)4、冠层叶绿素含量、冠层氮含量等生物学参数1、可通过高光谱成像单元实现对植物基本植被指数的计算,植被指数可以反应植物生长状态、色素含量、营养状态等情况,适用于其产量、育种、胁迫等多种研究工作2、可以获取植物组织的光谱反射率,生成光谱反射曲线。光谱反射曲线趋势可以反映植株不同部位或者不同植株的生长状态差异程度3、内置模型计算植物冠层叶绿素含量和冠层氮含量,可直接反映植物营养状态和健康状态4、可应用于病害研究。病斑部分和健康部分光谱反射曲线发生改变,通过对变化趋势的研究可以对病害发生部分和严重程度进行分析温室型高通量植物表型采集分析平台技术参数:(1)传送系统①传送速度:13m/min,可根据需求调节②定位精度:≤±2mm③电子识别:RFID,用于对每盆植物进行识别定位(2)可见光成像模块成像传感器高分辨率RGB镜头分辨率5120×5120像元尺寸2.5μm×2.5μm成像平台360度旋转平台成像高度支持多段成像,自定义高度照明光源侧面LED均一光源数据传输万兆以太网二维单株分析时间<5s三维单株重构与解析时间<7min (3)高光谱成像模块:成像波长范围400-1000nm照明光源低频闪高光质卤素灯光源像素大小5.86μm×5.86μm光谱分辨率2.5nm光谱带数(波段数)1200个波段图像分辨率1920×1920入射狭缝宽度25μm动态范围12bit成像高度支持自定义高度数据传输USB3.0/千兆以太网(可选)高光谱单株分析时间<5s
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  • 用途:凭借数十年植物科学研究的经验而设计出的PlantScreen植物表型成像分析系统,可用于高通量植物表型监测、植物构架量化以及在自然环境、温室和野外条件下高精度控制测量。 PlantScreen植物表型成像分析系统整合了叶绿素荧光动力学成像、植物形态学和RGB真彩3D成像、植物热成像、植物高光谱成像、植物近红外成像、自动条形码识别管理、植物图像控制软件和植物表型数据分析等系统,通过外接传感器和软件系统可测量光合有效辐射、空气温湿度、CO2、风速等环境因子,用于植物高通量表型成像分析测量、植物胁迫响应分析测量、植物生长分析测量、植物生态毒理学研究、性状识别及植物生理生态分析研究等。 特点:专业定制,根据用户实验需求量身定制;测量参数多样,有热成像、RGB成像、叶绿素荧光成像、高光谱成像、近红外成像等全方位测量参数;适用于多种类型的研究对象,拟南芥、水稻、小麦、玉米等;成像面积大,单幅成像达40cm x40cm;成像分析平台尺寸大,宽10m,高度可调至2.5m,样带轨迹长度100m;可外接环境气象因子传感器,综合分析环境因素的影响;用户可编辑测量程序(protocols),满足特殊实验需求。 技术规格:系统主体成像分析平台宽10m,高度可调,最大2.5m,可沿10m宽样带移动成像,样带轨迹长度100m外接传感器外接传感器和软件可采集PAR、CO2、空气温湿度、风速GPS带GPS精准定位系统实验程序预设常用实验程序(Protocols),用户可自定义、编辑实验程序叶绿素荧光成像系统测量和计算的参数Fo, Fm, Fv, Fo’, Fm’, Fv’, Ft, Fv/Fm, Fv’/Fm’, Phi_PSII, NPQ, qN, qP, Rfd等几十个叶绿素荧光参数成像面积40cm x 40cm测量光橙色620nm光化学橙色和白色双色光饱和光白色或蓝色,最大光强3600μmol.m-2 .s-1镜头分辨率1024 x 768像素,7位滤波轮RGB成像测量参数叶面积、植物紧实度、叶片周长、偏心率、叶圆度、叶宽指数、叶片细长度SOL、植物圆直径、凸包面积、植物质心、节间距、生长高度、植物三维最大高度和宽度、相对生长速率、叶倾角、节叶片数量、其他用于植物适合度估算的颜色定量分级、绿度指数成像位置顶部及侧面全方位成像分辨率500万像素高光谱成像测量参数归一化指数、简单比值指数、改进的叶绿素吸收反射指数、最优化土壤调整植被指数、绿度指数、改进的叶绿素吸收反射指数、转换类胡萝卜素指数、三角植被指数、ZMI指数、简单比值色素指数、归一化脱镁作用指数、光化学植被反射指数、归一化叶绿素指数、Carter指数、Lichtenthaler指数、SIPI指数、Gitelson-Merzlyak指数光谱范围380-1000nm光源LED,光强50-1000μmol/m2s热成像分辨率640x480nm温度范围20-120°C灵敏度NETD0.05°C@30°C/50mK成像面积35x35cm近红外成像波长范围1450-1600nm RGB成像 叶绿素荧光成像 高光谱成像 近红外成像 热成像 控制软件 产地:捷克
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野外高通量植物表型分析平台相关的资讯

  • 托普云农高通量植物表型采集分析平台全新上线!
    随着智慧农业发展,植物表型研究成为农业科技创新的前沿阵地。深耕智慧农业十余年,托普云农基于在植物表型领域的深厚积累,隆重推出高通量植物表型采集分析平台,实现植物表型测量的高通量、高精度、无损化、可复现。01 重磅上线盆栽植物数字表型采集分析系统左:盆栽植物二维/三维数字表型采集分析系统右:高光谱植物数字表型采集分析系统温室型植物表型采集分析平台左:逆境模拟及植物生长监测平台右:温室型高通量植物表型采集分析平台田间植物表型采集分析平台左:田间无人机式高通量植物表型采集分析平台右:田间轨道式高通量表型采集分析平台左:田间无人车式高通量植物表型采集分析平台右:田间固定式植物表型监测系统02 核心优势高通量可进行植物单器官、单株到群体的表型分析实现自动化传送、自动化采集自动解析识别,一次可获得上百种参数单器官表型分析单株表型分析群体表型分析高精度在可见光、高光谱成像基础上通过自研算法与计算机技术实现植物快速、高精度测量提升株高、冠幅、生物量等参数的测量准确性可见光二维成像可见光三维成像高光谱成像高效率二维单株分析时间小于5秒三维单株解析时间小于2分钟高光谱单株分析时间小于5秒三维单株动态展示无损化采用无接触测量法能够全程监测作物从出苗到成熟的每一个生长阶段实现精准的重复对比分析辣椒缺水状态的重复对比实验多维度对植物的器官-单株-群体从二维图像解析/三维高精度重构/高光谱曲线交互分析等维度解析植物的形态结构和生理功能满足多维度综合型实验数据需要让结果更全面、更精准三维、高光谱成像下植物病害识别展示高光谱成像下30个植被指数可视化动态展示应用广托普云农高通量植物表型采集分析平台,能够测量不同生境下,植物器官-单株-群体等表型数据,并提供智能分析、数据挖掘等功能。广泛适用于遗传育种、分子生物学植物生理学、植物病理学生态学、环境科学、植物保护等研究领域多年深耕精研,托普云农以科研端、产业端真实需求为导向,运用先进的光谱成像、图像识别、深度学习等技术,精心打造多元化植物表型仪器,并与多家科研机构携手,推动表型产品快速落地应用。托普云农期待与更多伙伴携手,以科技力量洞察生命之秘!
  • 托普云农“高通量植物表型采集分析平台”荣获CISILE 2024 “自主创新金奖”
    5月29-31日,第二十一届中国国际科学仪器及实验室装备展览会(CISILE 2024)在北京盛大开幕。展会同期,CISILE 2024“自主创新金奖”正式揭晓,托普云农自主研发制造的“高通量植物表型采集分析平台”凭借表型指标覆盖广、解析精度高、效率高等创新优势一举摘得此荣誉。CISILE“自主创新金奖”由中国仪器仪表行业协会于2006年设立,旨在鼓励弘扬自主创新精神,推动我国科学仪器及实验室装备制造领域高质量发展。托普云农“高通量植物表型采集分析平台”此次荣获CISILE 2024“自主创新金奖”,评选过程历时数月,由业内重点科研院所科研人员、企业研发人员和行业管理专家组成评审团队,经协会初审、专家会审、专家现场评审及名单公示等严谨流程,最终从数以千计的科学仪器设备中脱颖而出,可谓含金量十足。国产化替代,填补国内相关领域短板随着智慧农业快速发展,智能育种、种质资源高效鉴定已成为国内外众多农业高校、科研机构加速布局的前沿科研领域之一。而其中,对种质资源的表型特征进行高精准、高效率、高通量鉴定是提升科研效率的关键。过去,植物表型研究领域的关键装备、核心算法被欧美日澳等发达国家垄断,托普云农自主研发制造的“高通量植物表型采集分析平台”从各类传感器、成像单元等硬件到AI模型算法、操作系统等软件,均实现了100%国产化,并且在表型指标覆盖量、表型解析精度、解析效率等方面优势明显,有力填补了国内植物表型研究领域关键装备空白。经科技成果鉴定,该成果总体达到了国内领先水平,逐步向国际前沿技术水平迈进。高通量植物表型采集分析平台采用单箱体-多成像单元集成融合模式,通过自动化传送单元将植物传送到箱体内部,并依靠多维传感融合图像成像单元、边缘计算与解析单元、数据管理单元对植物形态、生理等表型指标进行高通量、高精度、无损化数据采集和多维度数据解析,广泛用于精准育种、抗逆种质筛选、植物生长与营养分析、病虫害抗性分析等场景。120+表型指标,覆盖植物全生育期高通量植物表型采集分析平台集成了可见光二维、可见光三维、高光谱等成像模块,整合多种传感器,能够获取植物全生育期高通量表型信息,覆盖不同生境下植物器官、单株、群体的形态、生理等120多种表型指标,超越国外主流同类型装备。基于托普云农专业的AI算法服务团队,高通量植物表型采集分析平台能够为用户提供指标参数定制化服务,可根据个性化分析需求构建相应的分析模型,满足更多科研场景应用。同时,平台设计具有良好的可扩展性,可以根据科研需求进行功能扩展和升级,如定制箱体尺寸、新增成像单元等。高精度三维重构,表型解析更精准在二维、高光谱成像基础上,高通量植物表型采集分析平台增设三维重构与分析单元,通过创新的图像采集方式结合全自研算法,实现对植物快速、准确的高精度三维重构,大大提升了植株株高、冠幅、生物量、卷叶程度等表型参数的解析精度。例如,反映植物长势的生物量指标,国外产品往往采用二维成像投影面积来表征,高通量植物表型采集分析平台则通过三维体积来表征,在精准度方面更上一层楼。采集分析同步完成,解析效率显著提升在生物育种、种质资源鉴定等场景中,研究人员经常需要快速鉴定大量不同品种植株的表型差异,这就对植物表型解析效率提出了较高要求。托普云农率先打造出集表型数据采集与解析于一体的植物表型智能解析平台TP-AIPheno,创新性地将数据采集与解析流程集成在同一软件中实现,显著提升了平台的表型解析效率。目前,高通量植物表型采集分析平台的可见光二维、高光谱模块的单株植物解析用时小于5秒,可见光三维重构模块的单株植物重构和解析共计用时小于7分钟,助力科研人员显著提升科研分析效率。兼顾便捷与安全,营造优质操作体验以往,我国科研人员使用国外的植物表型分析设备,不仅操作界面复杂,而且部分功能需要用户自主编程才能实现。而托普云农自主研发的高通量植物表型采集分析平台通过智能化、自动化设计,营造了一个高度便捷化的操作体验:植物传送、图像采集、数据分析全流程自动化,大大简化人工操作;用户界面简洁友好,快速呈现分析结果,支持一键导出和历史图像调阅,进一步降低使用门槛;平台配备必要的安全装置和数据保护措施,确保了操作安全性和数据安全性。当前,托普云农“高通量植物表型采集分析平台”已拥有9项国家专利,其中6项为发明专利。同时,基于托普云农自主研发及100%国产化优势,该平台较之同类型进口产品成本降低50%以上。科技创新是企业发展的不竭动力。作为国内先行的智慧农业综合服务商、全国专精特新重点“小巨人”企业,托普云农始终坚持“信息技术与农业专业深度融合,硬件与软件双向协同”的双轮驱动战略,积极引进行业尖端人才,推动农业智能装备国产化替代。当前,托普云农已自主研发气象环境、土壤、植物生理等多领域农业传感器30余种,创新升级技术,研发、迭代智能硬件装备200余种,赋能农业科研、种业、生产、管理、服务等全产业链应用场景。同时,托普云农成立智能实验室,开展智能识别、农业行业预测等一系列农业AI算法深度研究,推动科研成果向产业生产力落地转化。未来,托普云农会持续聚焦科技创新,围绕新一代农业传感器、AI模型算法、植物表型解析平台、小型智能农业机器人等关键技术领域展开科研攻关,不断打破国外产品技术垄断,为农业强国建设贡献托普力量。
  • Resonon | WinRoots:用于土壤胁迫下植物表型研究的高通量栽培和表型分析系统
    土壤是重要的自然资源,地球上95%的食物来源于土壤,土壤保存了至少四分之一的全球生物多样性,不仅是粮食安全、水安全和更广泛的生态系统安全的基础,更是为人类提供多种服务、帮助抵御和适应气候变化的重要因素。由土壤组成造成的胁迫,例如盐、重金属和养分亏缺是作物减产的主要原因。作物土壤耐逆性是一种复杂性状,涉及植物形态、代谢和基因调控网络等多种遗传和非遗传因素的调控。传统的作物表型研究通常在田间进行,费事费力、劳动密集、低通量、且受研究人员无法控制的自然环境因素的影响。在此情形下,难以获得高精度的表型数据以满足表型组学的研究需求。在过去几十年,已经开发了几种HTP(高通量表型)平台在现场或可控条件下使用,但其运维成本极高。此外,作物表型相关研究通常只关注植物地上部分,而对根系形态数据的获取有限。然而,根系是植物吸收水分和养分的主要途径,也是碳水化合物的储存器官和土壤胁迫的直接感知器官。因此,根系表型是土壤胁迫条件下植物表型研究的重要组成部分。就通量、环境可控性和根系表型获取而言,现有的植物表型平台无法完全满足植物对土壤胁迫响应的表型组学研究的特定需求。基于此,在本文中,来自山东大学生命科学学院和潍坊农科院的一组研究团队描述了其最近开发的高通量植物栽培和表型系统—WinRoots平台。以大豆植物为研究对象,将其暴露在盐胁迫中,证明了土壤盐胁迫条件的一致性和可控性以及WinRoots系统的高通量。他们开发了优化的盐胁迫条件,以及适用于大豆耐盐性的高通量表型指数。此外,高通量多表型分析表明,子叶特征可作为大豆全苗耐盐性的非破坏性指标。在本研究中,Canon EOS 700D数码相机和Resonon Pika L高光谱成像仪分别用于获取RGB和高光谱图像。相机位于植物材料上方1.5 m的可滑动水平导轨上。每天收集大豆冠层和整株幼苗的图像。栽培第九天,获取离体叶片图像,每个品种重复3次。WinRoots系统:高通量根系和整株植物表型平台。系统使用示意图。【结果】盐胁迫相关性状之间的相关分析。(A)盐胁迫相关性状之间的相关矩阵。(B)预测值和观测值之间的回归曲线。大豆盐胁迫相关性状的合成聚类。(A)大豆盐胁迫相关性状的合成聚类剖面图。(B)聚类1和聚类2代表性栽培品种表型。(C)聚类1和聚类2指标比较。【结论】WinRoots系统为幼苗生长提供了均一可控的土壤胁迫条件,可用于土壤胁迫下高通量栽培和表型分析,有助于提供准确多样的土壤胁迫相关的表型数据。因此,WinRoots提供了一种分析诸如土壤胁迫之类的复杂性状的改进方法。HPPA(Hyperimager Plant Phenomics Analysis)高光谱植物表型成像系统由北京依锐思遥感技术有限公司与美国RESONON公司联合研制生产,整合了高光谱成像测量分析、RGB真彩色图像、无线自动化控制系统、线性均匀光源系统等多项先进技术;最优化方式实现大量植物样品的数据采集工作,可用于高通量植物表型成像分析测量、植物胁迫响应成像分析测量、植物生长分析测量、遗传组学与表型组学、遗传育种、生态毒理学研究、性状识别及植物生理生态分析研究等。请点击以下链接,阅读原文:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MjM5NjE1ODg2NA==&mid=2650311205&idx=3&sn=ffe393bdf01d664cab05b92572691916&chksm=bee1a6da89962fccef8eae610681ac22d2239e59d016db96cd911d103186c3459c4061ca30bf&token=1489736406&lang=zh_CN#rd

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  • 【全球首发仪式】星赛高通量流式拉曼分选仪,12月30日盛大开启!听报告!赏新品!拿奖品!

    【全球首发仪式】星赛高通量流式拉曼分选仪,12月30日盛大开启!听报告!赏新品!拿奖品!

    [url=https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/FlowRACS/][img=,690,350]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2021/12/202112281152512795_9049_2507958_3.jpg!w690x350.jpg[/img][/url] 世间生灵,均由单个细胞组合而成或者发育而来,因此,单个细胞,是生命的功能单元和进化单位。显然,在单个细胞精度的分析与操作,能够在最“深”的水平来理解、设计和改造各种生命体系。但是,面对瀚如星海的细胞世界,如何快速探测细胞的功能呢? 拉曼光谱是一种散射光谱,是化合物中分子键被激发到虚能态却尚未恢复到原始态所引起的、入射光被散射后频率发生变化的现象。我们提出,“拉曼组”(Ramanome)作为一种信息极为丰富的分子光谱,能够在单细胞精度,定量检测细胞代谢各种底物的速率、各种拉曼敏感产物之多样性及其含量、细胞的环境应激性、细胞之间的代谢互作、细胞内代谢物相互转化网络等广阔的细胞代谢表型,还可区分不同的物种。 因此,拉曼组是一种直接刻画“代谢功能”的单细胞表型组。而且,拉曼组手段具有广谱适用、活体、无损、非标记、全景式表型、可分辨复杂功能、快速、高通量、低成本、能耦合下游测序、质谱或培养等重要优势,与现有的单细胞基因组、转录组、蛋白组和代谢物组等手段具有互补性,共同形成一个完整的单细胞多组学方法学体系。 在[b]基金委国家重大科学仪器研制项目、科技部合成生物学重点研发计划[/b]等的支持下,我们研制成功基于拉曼组概念和拉曼分选(RACS)技术的“单细胞分析仪器系列”,包括临床单细胞拉曼药敏快检仪(CAST-R)、高通量流式拉曼分选仪(FlowRACS)、单细胞拉曼分选-测序耦合系统(RACS-Seq)、单细胞微液滴分选系统(EasySort Lego / Compact)等。利用这些原创仪器,我们打通了从单细胞代谢表型组表征到相对应高质量单细胞基因组测定的全流程,为单细胞多组学体系提供了一个全新的维度。 青岛星赛生物科技有限公司(www.singlecellbiotech.com),专注于单细胞维度医疗器械与科学仪器的研发、生产、销售及相关技术服务,基于上述单细胞分析仪器系列,竭诚为客户提供原创、定制化、一体化、全方位的“单细胞代谢表型组表征-分选-测序-培养”解决方案。[b][size=18px][color=#ff0000] 2021年12月30日[/color][/size][/b][size=18px],星赛生物将携年度重磅创新单品——[b]全球首台高通量流式拉曼分选仪FlowRACS[/b]来袭![/size] 立足拉曼组/元拉曼组,依赖于微流控与AI技术,FlowRACS将为合成生物学、精准医学等领域带来重大突破。[b]产品真容、技术细节、精彩报告、有奖竞答[/b]……惊喜多多,不容错过。[size=24px][color=#ff0000][b][url=https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/FlowRACS/][img]https://simg.instrument.com.cn/bbs/images/brow/em17.gif[/img]点击参会![/url][/b][/color][/size]

  • 药物高通量筛选技术

    简单介绍一下关于药物高通量筛选技术的知识一.概念高通量筛选(High throughput screening,HTS)技术是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机对实验数据进行分析处理,同一时间对数以千万样品检测,并以相应的数据库支持整个体系运转的技术体系。二. 高通量筛选技术体系的组成1. 化合物样品库化合物样品主要有人工合成和从天然产物中分离纯化两个来源。其中,人工合成又可分为常规化学合成和组合化学合成两种方法。2.自动化的操作系统自动化操作系统利用计算机通过操作软件控制整个实验过程。操作软件采用实物图像代表实验用具,简洁明了的图示代表机器的动作。自动化操作系统的工作能力取决于系统的组分,根据需要可配置加样、冲洗、温解、离心等设备以进行相应的工作。3.高灵敏度的检测系统检测系统一般采用液闪计数器、化学发光检测计数器、宽谱带分光光度仪、荧光光度仪等。4.数据库管理系统数据库管理系统承担4个方面的功能: 样品库的管理功能;生物活性信息的管理功能; 对高通量药物筛选的服务功能; 药物设计与药物发现功能。三. 高通量筛选模型常用的筛选模型都在分子水平和细胞水平,观察的是药物与分子靶点的相互作用,能够直接认识药物的基本作用机制。1. 分子水平的药物筛选模型:受体筛选模型;酶筛选模型;离子通道筛选模型1.1受体筛选模型:指受体与放射性配体结合模型。以受体为作用靶的筛选方法,包括检测功能反应、第二信使生成和标记配体与受体相互作用等不同类型。1.2酶筛选模型:观察药物对酶活性的影响。根据酶的特点,酶的反应底物,产物都可以作为检测指标,并由此确定反应速度。典型的酶筛选包括1) 适当缓冲液中孵化;(2)控制反应速度,如:温度,缓冲液的pH值和酶的浓度等;(3)单时间点数器, 需测量产物的增加和底物的减少。1.3离子通道筛选模型: (1)贝类动物毒素的高通量筛选,其作用靶为Na+通道上的蛤蚌毒素结合位点,用放射性配体进行竞争性结合试验考察受试样品。(2)用酵母双杂交的方法高通量筛选干扰N型钙通道β3亚单位与α1β亚单位相互作用的小分子,寻找新型钙通道拮抗剂。2.细胞水平药物筛选模型观察被筛样品对细胞的作用,但不能反映药物作用的具体途径和靶标,仅反映药物对细胞生长等过程的综合作用。包括: 内皮细胞激活; 细胞凋亡; 抗肿瘤活性; 转录调控检测; 信号转导通路; 细菌蛋白分泌; 细菌生长。四.问题及展望高通量筛选技术与传统的药物筛选方法相比有以下几个优点:反应体积小;自动化;灵敏快速检测;高度特异性。但是,高通量筛选作为药物筛选的一种方法,并不是一种万能的手段,特别是在中药研究方面,其局限性也是十分明显的。首先,高通量筛选所采用的主要是分子、细胞水平的体外实验模型,因此任何模型都不可能充分反映药物的全面药理作用;其次,用于高通量筛选的模型是有限的和不断发展的,要建立反映机体全部生理机能或药物对整个机体作用的理想模型,也是不现实的。但我们应该相信,随着对高通量筛选研究的不断深入,随着对筛选模型的评价标准、新的药物作用靶点的发现以及筛选模型的新颖性和实用性的统一,高通量筛选技术必将在未来的药物研究中发挥越来越重要的作用。

  • 人血清中多种农兽药及其代谢物的高分辨、高通量检测技术与方法学研究

    [align=center][size=16px]人血清中[/size][size=16px]多[/size][size=16px]种农兽药及其代谢物的高分辨、高通量检测技术与方法学研究[/size][/align][size=16px]通过制备具有[/size][size=16px]多功能化超大比表面积[/size][size=16px]的[/size][size=16px]CMPs[/size][size=16px]和桥连硅烷化试剂修饰磁性纳米富集净化材料,并将其制备成萃取分离装置,构建集样品富集浓缩、高效净化的集成化前处理平台。进一步利用[/size][size=16px]LC-QTOF-MS[/size][size=16px]和[/size][size=16px]LC-Q Exactive Orbitrap-MS/MS[/size][size=16px]高分辨质谱,建立[/size][size=16px]300[/size][size=16px]种以上农兽药及其主要代谢物的标准质谱匹配信息库和保留时间数据库,并初步用于京津冀地区人血清样本中农兽药及代谢物的全面筛查,构建不同检测技术下农兽药化学污染物在人体内蓄积水平数据库,实现农兽药残留数据获取、污染等级判定、多维度表达及分析的自动化,为后续规模化样品分析和农兽药残留与疾病的关联性分析提供技术支撑。[/size][size=16px]2.1 [/size][size=16px]研究内容[/size][size=16px]([/size][size=16px]1[/size][size=16px])人血清中农兽药及代谢物高效净化技术研究[/size][size=16px]针对[/size][size=16px]人血清中农兽药及代谢物[/size][size=16px]残留水平低、结构特性多样等特征[/size][size=16px],以多粒径磁性纳米粒子为基质,制备具有超大比表面积的[/size][size=16px]桥连硅烷化试剂修饰材料和[/size][size=16px]共轭微孔聚合物材料,提高农兽药及[/size][size=16px]其代谢物的富集效率;通过修饰引入多羟基、磺酸基、卤代烃等多功能化基团,实现[/size][size=16px]不同结构特征[/size][size=16px]农兽药及其代谢物的高通量富集;将研制的富集净化材料进一步制备成萃取分离装置,构建集样品富集浓缩、高效净化的集成化前处理平台,实现人血清中农兽药及代谢物的高通量靶向[/size][size=16px]/[/size][size=16px]非靶向富集净化。[/size][size=16px]([/size][size=16px]2[/size][size=16px])人[/size][size=16px]血清中农兽药及代谢物的高通量筛查与定量分析方法研究[/size][size=16px]针对人血清中农兽药代谢复杂、残留水平较低的特点,利用[/size][size=16px]LC-QTOF-MS[/size][size=16px]和[/size][size=16px]LC-Q Exactive Orbitrap-MS/MS[/size][size=16px]高分辨质谱,建立[/size][size=16px]300[/size][size=16px]种以上农兽药及主要代谢物的标准质谱匹配信息库和保留时间数据库;结合课题开发的高通量农兽药残留分离富集前处理技术,建立覆盖[/size][size=16px]300[/size][size=16px]种以上农兽药及代谢物的血清样品高通量非靶向高分辨质谱检测技术,实现人血清农兽药残留由靶向检测向非靶向筛查的跨跃式发展;对所建立的方法进行方法学验证评价,形成方法标准操作规程。[/size][size=16px]([/size][size=16px]3[/size][size=16px])人血清样本中农兽药及代谢物全面筛查与数据库构建[/size][size=16px]基于所研发的人血清中[/size][size=16px]300[/size][size=16px]种农兽药及代谢物高通量非靶向高分辨质谱检测技术,开展京津冀地区人血清样本中农兽药及代谢物的初步筛查,构建不同检测技术下农兽药化学污染物在人体内蓄积的数据库,实现农兽药残留数据获取、污染等级判定、多维度表达及分析的自动化[/size][size=16px],[/size][size=16px]为后续规模化样品分析和农兽药残留与疾病的关联性分析提供技术支撑。[/size][size=16px]2.2 [/size][size=16px]研究目标[/size][size=16px]([/size][size=16px]1[/size][size=16px])针对人血清基质复杂,农兽药及代谢物残留浓度低、形态多样化等特点,筛选并制备出[/size][size=16px]多功能化超大比表面积磁性纳米材料[/size][size=16px],[/size][size=16px]实现不同结构特征的农兽药及其代谢物的[/size][size=16px]高效、[/size][size=16px]高通量富集[/size][size=16px]。[/size][size=16px]([/size][size=16px]2[/size][size=16px])[/size][size=16px]建立人血清中农兽药及其代谢物的高通量非靶向高分辨质谱检测技术,实现农兽药及其代谢物的快速筛查与精准定量分析。[/size][size=16px]([/size][size=16px]3[/size][size=16px])通过结合开发的高通量非靶向检测技术,初步用于京津冀地区人血清[/size][size=16px]中[/size][size=16px]农兽药的高通量非靶向高分辨质谱检测,构建人血清中农兽药残留蓄积形态数据库,筛查出高残留的农兽药及其代谢物。[/size][size=16px]([/size][size=16px]1[/size][size=16px])[/size][size=16px]通过设计开发[/size][size=16px]多功能化超大比表面积磁性纳米材料[/size][size=16px],实现[/size][size=16px]复杂[/size][size=16px]的人[/size][size=16px]血清[/size][size=16px]样本中[/size][size=16px]结构特征[/size][size=16px]多样[/size][size=16px]的农兽药及其代谢物[/size][size=16px]高效富集和净化。[/size][size=16px]([/size][size=16px]2[/size][size=16px])针对农兽药及代谢物种类繁多、性质各异限制其高通量非靶向筛查的问题,通过建立[/size][size=16px]300[/size][size=16px]种以上农兽药及代谢物的标准质谱匹配信息库和保留时间数据库,为农兽药高通量非靶向筛查方法的研发奠定基础。[/size]

野外高通量植物表型分析平台相关的耗材

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    MagPure纯化技术介绍MagPure(磁珠法)纯化技术是专门为自动化核核酸提取设计的。该技术采用超顺磁性粒子为基质, 在其表面包被硅醇基或羧基基团,使得微粒与核酸发生特异性的吸附作用,从而达到纯化核酸的目的。 MagPure技术配合自动化核酸提取工作站,可将核酸分离纯化,从手工变成机械自动化操作,可大大 提高实验的准确度和通量,并减少操作人员接触危险样品的机会。MagPure Plant/Seed/Food DNA Kit (自动化植物/种子/食品DNA纯化系统)从植物、种子或深加工食品样品中提取高纯度的总DNA(此系列产品在多个CIQ应用于转基因检测项目)该系列试剂盒采用磁珠法纯化技术,适合从植物样品/种子样品/深加工样品中提取高纯度的总DNA。得到的DNA可直接用于PCR、荧光 定量PCR、酶切、Southern杂交等实验。该产品可成功在VERSA 10,VERSA 1100,VERSA HT等设备上运用。Aurora为许多样品提供了优化方案, 我们可以根据用户的需求提供 优化 的流程。 优化的流程包括了样本预 处理、提高得率和产量、优化操作时 间,为不同平台提供的 设计方案。可兼容液体处理系统VERSA 10 PCR/NAP 自动化核酸提取-PCR建立工作站VERSA HT 高通量自动化液体处理工作站VERSA 1100 NGLP 下一代测序工作组VERSA 1100 4ch Independent 独立四通道液体处理工作站VERSA 1100 PCR/NAP 自动化核酸提取-PCR建立工作站Aurora在核酸分离纯化领域拥有完整和先进的技术,MagPure试 剂盒为不同样品提供不同粒径或不同官能基团的磁性粒子,以达到 最佳的纯化效果。在满足产品精确性及可重现性的要求,实现高通 量自动化核酸纯化的同时 保证产品绝对的兼容性。
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