拉曼光谱
lh2000d
第1楼2008/03/12
做蛋白质定量分析,扣除侧链基团的影响?在蛋白质的Raman谱中,侧链基团谱带主要由芳香族氨基酸侧链引起,如酪氨酸的850/830双峰,苯丙氨酸1002处一锐峰,半胱氨酸、蛋氨酸的CS峰,另外还有色氨酸吲哚环引起的谱峰等。您是想扣除侧链基团的谱峰吗?不知您为何要这样做为何要扣除?您是想要哪些峰呢[多肽链骨架(酰胺I III,骨架CC)]?那不知您的定量分析是如何定量的,是通过峰强比呢还是峰面积比?还有,您使用的内标为何物(也就是您作比较的参考峰)?
shuiyunmengze
第2楼2008/03/13
因为想用蛋白的酰胺1和3键来做定量,怕会受到侧链的影响,所以想能不能扣除掉侧链的谱峰。我也是刚接触拉曼,而且本来现在做定量的就不多,所以也是在摸索阶段。想利用Bejort的方法做定量,他是用峰面积来做的,但是好像没有用内标。
第3楼2008/03/19
可能酰胺III较容易受影响,重叠较严重,可以考虑用酰胺I或其他峰。另外,可以选择亚甲基CH2在1448cm-1处的峰作为内标,此峰比较稳定;或者可以人为加入一种内标物质(其谱峰不与蛋白谱峰重叠)对于您所说的Bejort方法,不知您参考的是、、、 没有了解过,也没查到,不是很清楚。QQ55381948 可以进一步交流 探讨 相互学习
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