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【原创】XRD数据库建设

X射线衍射仪(XRD)

  • 因为近来一直考虑实验室的数据管理,避免人员流动造成数据散失,对分析仪器数据库做了些调查。

    在红外版,看见有人上传谱图共享,并希望由此汇集更多的谱图。这个设想很好,但还是基于进口仪器配置的商品软件来管理,实际上要推广也不理想。

    我发现一个更适合XRD领域的做法。美国Indiana大学发起了一个Reciprocal Net,基于linux平台,通过对等的分布式MySQL数据库网格形成一个XRD共享网络数据库。每个网格点均对自己的数据库服务器有完全的控制权,自行决定哪些数据对网络开放。

    这个网络是学术性的,没有什么限制,或许国内有些XRD实验室可以考虑加入,并取得经验,为发展国内的中文环境做些储备。

    关于分析仪器数据库,国内的难点主要是在化学结构数据库基础软件上的薄弱,国外的商品化化学数据库管理软件价格难以承受。但是,现在,基于开源技术的化学数据库管理软件已经有不少了,是时候建立自己的实验数据管理系统,由此积累分析仪器数据,逐渐形成中国自己的数据库产品了。我们不能总是“满足”于“解密”国外的商品软件吧。

    在indiana大学,还有一个XPORT项目,实现了XRD仪器的远程观察。

    这些在技术都已经有现成技术,如何发挥我们的人力资源优势来实现,是我们面对的唯一难题。
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  • XRD

    第1楼2008/09/03

    这个事情在中国是个极大的困难。

    1 如果国家以科研经费支撑来开发相关的数据库,那么钱是用完了,最后可能由几个人关在一个小房子里弄出个没法用的东西来交差了事。以前不是没有过。搞得几回,国家也没那个心来弄了。以前在文献上就看到过一些人开发出来的数据库,论文是发表了,但就是没有看到有人真正用起来。可能程序还没写完,课题就已经结题了,成果已经申报成功了。

    2 如果由某个公司来开发。那么就是以赢利为目的了。如果没有政府的支持,根本就开发不出来或者开发出来也没有人买。如果有政府的支持,那么可能开发得出来,但会卖个开价。只会有那么几个有钱人(可能在政府的号召下)买上那么两个。其他人,买不起,但盗得起。用的人可能多了,公司也只有死了。看看现在的软件公司,他们主要的开发项目并非民用项目,在这些项目上赚不到钱。WPS其实也可以用来写论文,而且还有政府支持,结果呢?软件公司只有靠开发政府项目,比如马路上的摄象头,银行里面的存款机之类,才会有钱赚。

    如果楼主有雄心,我们倒可以响应您的号召。如果能开发出科研上用得着的一些数据库,我还是会劝我们领导来买上一套,至于以后还是不是更新就不知道了。 不过,千万不要开发出来的是那种“可以可以”级的东西。那是没有人感兴趣的。只有当电视机象卖废品一样地倾销国外的时候,国人才不会再进口电视机了。一个道理。

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  • musiguo_yechiu

    第2楼2008/09/03

    我觉得这个事情实施两种方式:
    1.由XRD设备仪器制造商组织,这样把学术和经济结合起来,有经济和质量保障;
    2.由政府支持来做,毕竟这些数据库的建立需要很长时间和很多投入.

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  • musiguo_yechiu

    第3楼2008/09/03

    公司开发也可以,主要看你怎么保护?
    比如计算相图热力学数据库\仿真一些数据库,他们和软件一起来卖,就很好呀.

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  • sigmax

    第4楼2008/09/09

    可能大家并没有去看Reciprocal Net,这已经是一个现成的XRD数据网络了,各位要做的只是申请加入(以实验室为单位),然后安装网个软件,开始使用。现在共有4000多个样品数据了。

    至于化学信息数据库,上网去查PCC、AMBIT和SMOL,这三个都是学术共享的桌面化学信息管理软件了。

    可惜,化学领域内商品软件的影响太大了,以至于我们想不到还有开源软件可供利用。使用这些软件,把衍射数据以CSV格式记录并保存就行。

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