分子生物学软件简要功能介绍 二

18.化学应用

mmcalc.exe：分子量计算器

hxfc.zip：化学方程式配平软件

cmcalc10.exe：化学试剂制备计算器

alkne.exe：有机化学命名练习程序

chembl32.zip：Windows95下的免费化学方程式配平程序 periodic.zip：小巧的元素周期表

ptab32.zip：高级元素周期表

CAF：计算机辅助配方软件

CFT：化学式教师

元素屋：查询112种元素的各个信息的中文软件

化学反应方程式编辑器：制作化学反应方程式、离子方程式、分子式、离子式等

CRS：化学反应方程式配平器

Model ChemLabv：化学实验教育软件及其汉化版

periodic.exe：免费的元素周期表

化学品电子手册：一个综合性的化学品手册


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19.在线综合工具

Biology Workbench：基于WEB的生物学综合工具

sewer：网上常用在线工具集合，本地版


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20.在线蛋白工具

BCM Search Launcher：蛋白序列二级结构预测综合站点

DAS：蛋白跨膜预测服务器、输入蛋白序列，预测跨膜区域

TopPred：蛋白预测服务器提供的膜蛋白拓扑学预测在线工具

SOSUI：膜蛋白分类和二级结构预测在线工具

PSIpred-MEMSAT：进行二级结构预测与跨膜拓朴结构预测

HMMTOP：预测蛋白序列的跨膜螺旋与拓扑结构服务器

SMART：提供蛋白序列，在结构域数据库中查询/显示出其结构域及跨膜区等

TMpred：预测蛋白序列跨膜区

TMHMM：预测蛋白的跨膜螺旋

The PredictProtein server：提供蛋白数据库查询，预测蛋白各种结构的服务

SPLIT：膜蛋白二级结构预测服务器

PRED-TMR：提供基于SwissProt数据库统计分析的预测蛋白跨膜片段的服务

CoPreThi：基于INTERNET的JAVA程序，预测蛋白的跨膜区

TMAP：提供预测蛋白跨膜片段的服务


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21.RNA analysis

Pattern Search and Discovery：巴斯德研究所提供的常用RNA在线分析工具

DNA sequence analysis：巴斯德研究所提供的常用特征序列查询工具

Search Genes and Coding Regions：巴斯德研究所提供的常用DNA在线分析工具

Oligonucleotide Calculator：巴斯德研究所提供的基因与编码区查找工具

解链温度计算器：JAVA语言写的寡核苷酸计算器，给出核酸序列，计算GC百分比、解链温度、长度、分子量。
可以下载后使用，当小计算器

BCMgene-finder：核酸序列查找服务器，提交核酸序列，选择相应的数据库，进行序列查找


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22.在线引物设计

The Primer Generator：在线引物设计程序

Prime3：比较有名的在线引物设计程序