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常用蛋白质网站供大家参考运用

省部重点实验室

2011/10/17

生命科学仪器综合讨论

1）从氨基酸组成辨识蛋白质
ExPASy： http://www.expasy.ch/tools/

PROSEARCH： http://www.embl-heidelberg.de/prs.html

2）预测蛋白质的物理性质：等电点、分子量、酶切特性、疏水性、电荷分布等

ExPASy： http://www.expasy.ch/tools/ ，有较多的蛋白分析工具，包括分子量、亲疏水性、表面积、二级结构、极性、折射率等

FASTA： ftp://ftp.virginia.edu/pub/fasta/

SAPS： http://www.isrec.isb-sib.ch/software/SAPS_form.html

3）跨膜区预测： http://www.isrec.isb-sib.ch/software/tmpred_from.html

4）蛋白质二级结构预测

nnPredict： http://www.cmpharm.ucsf.edu/~nomi/nnpredict.html

PredictProtein： http://cubic.bioc.columbia.edu/predictprotein/

PredictProtein的国内镜像： http://www.cbi.pku.edu.cn/predictprotein/

SOPMA： http://pbil.ibcp.fr/

5）二级结构预测： www.cmpharm.ucsf.edu/~nomi/nnpredict-instrucs.html

6）卷曲螺旋预测
COILS： http://www.ch.embnet.org/software/COILS_form.html

7）跨膜区段和在膜上的取向预测
TMpred： http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html

8）信号肽的剪切位点

SignalP： http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/

9）蛋白质的三维结构

SWISS-MODEL： http://www.expasy.ch/swissmod/SWISS-MODEL.html

CPHmodels： http://www.cbs.dtu.dk/services/CPHmodels/

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ldgfive

第1楼2011/10/23

应助工程师

先收下了，很实用的网站

0

分
该帖子已被版主-zhang8826857加1积分，加2经验;加分理由:鼓励积极回帖^_^

symmacros

第2楼2011/10/23

应助达人

谢谢分享，只是有的网站较难进入，特别慢。

0

分
该帖子已被版主-zhang8826857加1积分，加2经验;加分理由:可能是国际网的原因吧？鼓励积极回帖

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