【分享】Rt-PCR经验总结

六、需购置的Rt-PCR材料：
（生工. Tel. 2236106.）
Taq酶（含MgCl2 Buffer） 200u 70.00
dNTP: 1支
oligo(dT)15: 1 OD 40.00 promega
M-MLV: 1支 250.00 promega (Buffer)
RNasin: 1支 110
—— -20℃

DEPC 5g 110.00
Trizol 100ml/1瓶 Invitrogen Life technologies
—— 4℃

Marker: 10μg 0.2μg/ml 150.00 科威
（1543. 994. 697. 515. 377. 231）
七、引物合成
1、内参照：
GAPDH
正义：5′—ACCACAGTCCATGCCATCAC—3′
反义：5′—TCCACCACCCTGTTGCTGTA—3′

β-actin
正义：5′—CACGATGGAGGGGCCGGACTCATC—3′
反义：5′—TAAAGACCTCTATGCCAACACAGT—3′

2、par-4:
正义：5′—GGGACCTCGGAACTCAAC—3′
反义：5′—TGTATCTGCCTGGGACTG—3′

3、退火温度计算
2（A+T）+4（G+C）
正反义平均数，再上下波动度（±4℃，或±5℃）

4、引物各合成5 OD，每OD一瓶分装好

5、引物稀释：
加DEPC水量为（μl）
= ? nmol / OD × 管上所标OD数×100
是为10p mol / μl 浓度的引物溶液

八、PCR产物电泳
先将1-10μl左右PCR产物，加已点在纸上的溴酸兰，反复吸打混匀后进行电泳，一般电流为10mA，电源100V，电泳30分钟，紫外灯下观察，满意的结果扫描打印。

九、几个注意点：
1、逆转录的关键步骤是立即冰水浴？
2、Rt时，先打开PCR预热30分钟。
3、RNA抽提前，打开离心机预冷。

在所有RNA实验中，最关键的因素是分离得到全长的RNA。而实验失败的主要原因是核糖核酸酶（RNA酶）的污染。由于RNA酶广泛存在而稳定，一般反应不需要辅助因子。因而RNA制剂中只要存在少量的RNA酶就会引起RNA在制备与分析过程中的降解，而所制备的RNA的纯度和完整性又可直接影响RNA分析的结果，所以RNA的制备与分析操作难度极大。
在实验中，一方面要严格控制外源性RNA酶的污染；另一方面要最大限度地抑制内源性的RNA酶。RNA酶可耐受多种处理而不被灭活，如煮沸、高压灭菌等。
外源性的RNA酶存在于操作人员的手汗、唾液等，也可存在于灰尘中。在其它分子生物学实验中使用的RNA酶也会造成污染。这些外源性的RNA酶可污染器械、玻璃制品、塑料制品、电泳槽、研究人员的手及各种试剂。而各种组织和细胞中则含有大量内源性的RNA酶。