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蛋白组学数据分析

液质联用(LCMS)



  • 1.蛋白组学下机数据,请问q.value有些是0,代表什么意思。

    2.该组数据得出的是Abundance Ratio: (Medium, F2) / (Heavy, F2)这样的一个蛋白在中标和轻标样本里面表达丰度的比值,这种情况下还需要做P值校正吗?还是直接卡表达量的变化倍数就可以说明它是表达上升还是下降了
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  • hujiangtao

    第1楼2019/11/27

    应助达人

    0应该是未检出吧

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  • p3311681

    第2楼2019/11/27

    但是它后面有对应的在三次重复里面的丰富比值啊

    hujiangtao(hujiangtao)发表:0应该是未检出吧

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  • welewolf

    第3楼2019/11/27

    应助达人

    个人的理解是exp. q value代表经验Q值,其是对统计学P值的再统计。Q值越小越好。0的话应该是非常显著

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  • p3311681

    第4楼2019/11/27

    0的那些代表exp.q-value:combined,框出来的是蛋白丰度比值。软件用的proteome discover2.2

    p3311681(p3311681)发表:但是它后面有对应的在三次重复里面的丰富比值啊

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  • 歪果仁zZ

    第5楼2019/11/28

    应助达人

    学习一下,请教

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