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thermo-Xcalibur使用姿势

液质联用(LCMS)

  • 今年也是刚刚接触themo - TSQ,慢慢跟大家分享一下thermo软件Xcalibur使用心得。

    之前一直主要使用安捷伦的CDS和岛津的Lab,其他用过时间不长的色谱软件国外的有变色龙、waters的那个配套软件也用过一下、国内的N2000、盛瀚的IC软件、还有其他的色谱软件,但是个总体感觉都还好,特别是岛津的Lab,是所有使用过的色谱软件里面感觉汉化最好的色谱软件了,此处点赞岛津!

    thermo色谱质谱配套软件挺多的,例如变色龙、Xcalibur、trancefinder等,给我感觉挺乱的,可能跟他 公司的发展历程有关吧,

    先整体说下Xcalibur的使用感受哈,不知道是有无先入为主的思维,总感觉Xcalibur用起来不是很爽,很多地方都是美国范,而且软件配套做的不好,出现多次软件失联情况。十分满分的话Xcalibur只能暂时给到6分。

    Xcalibur里面有很多模块,今天跟大家分享 proccessing setup模块的使用,这个模块其实主要功能就是做数据解析方法。



    这个是Xcalibur打开的主界面,各个功能模块都在主界面。一般常用的QUAN、QUAL、Proccessing setup、Sequence setup、instrument setup,这几个基本每天都会用到。



    这个大致是打开proccessing setup模块打开界面;



    做解析方法前先点击“空白页”图标选择新建方法或者”file“下选择”new";

    然后打开一个数据文件,最好是标曲最低点:单击”file“-”open raw file“ -选择要打开的数据文件-确定就好;



    再然后选择解析方法为内标法/外标法,操作过程是:单机“options”-“calibration options”-"internal standerd"/"external standard";



    此时开始制作方法(以外标法为例),"indentifiction"主要填写“name”-“filter”“expected”,填完之后单机“OK”,若有多个化合物单机“name"栏下拉菜单,选"new"就可以,这个类似岛津/安捷伦的化合物表;



    ”detection“主要设置一些积分参数例如斜率,平滑度、最小峰高等,设置完之后单击”OK“即可;



    ”calibration"主要设置线性拟合方式、浓度单位、内标法还会设置内标量,设置完之后单击”OK“即可;



    然后就到了“levels",其实就是主要设置一下个各浓度点的浓度,设置完之后单击”OK“即可;

    此时解析方法基本做完,切记多个化合物的单击每个化合物后都做一遍此流程,每次点击”OK“就可以(此操作不爽,感觉很花费时间)。



    此时之要保存方法就可以,点击”save"/save As"都可,在别人的方法基础上制作的方法一定要点击“save As”,否则掩盖之前方法,习惯点击“save As”保存。

    至此Xcalibur-meth proccessing setup分享完毕,后面有时间再跟大家分享交流,甚至建个thermo的软件使用交流群也是可以的。
  • 该帖子已被版主-hujiangtao加10积分,加2经验;加分理由:鼓励原创
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  • 123

    第2楼2021/11/10

    应助达人

    了解一下啊

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  • 支点

    第3楼2021/11/12

    应助达人

    xcalibur软件智能程度不够高,但该有的功能都能有可能需要耐心的寻找,比如:cal level栏填完一个组分后可以在栏内右键把这个组分的level设置复制到其他组分。
    再有,化合物的离子丰度比就在detection页面(问题是时隐时现),而且要手动计算丰度比填进去,这点变色龙和tracefinder都是自动的。
    可能主要因为xcalibur便宜吧。

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  • 歌名

    第4楼2021/11/12

    应助达人

    嘿嘿,不智能是确实,而且软件经常出问题,trancefinder,也有,还没时间去搞,Xcalibur好像现在不要钱吧,

    支点(zhx_fs_ln) 发表:xcalibur软件智能程度不够高,但该有的功能都能有可能需要耐心的寻找,比如:cal level栏填完一个组分后可以在栏内右键把这个组分的level设置复制到其他组分。
    再有,化合物的离子丰度比就在detection页面(问题是时隐时现),而且要手动计算丰度比填进去,这点变色龙和tracefinder都是自动的。
    可能主要因为xcalibur便宜吧。

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  • 歪果仁zZ

    第5楼2021/11/13

    应助达人

    很详细的分享!

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  • symmacros

    第6楼2021/11/14

    应助达人

    感谢分享详细的使用步骤,学习了。

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  • 支点

    第7楼2021/11/15

    应助达人

    trancefinder比Xcalibur强了一些,但各有各的毛病,xcalibur好在不要授权,办公电脑上就装xcalibur,分析气质液质的数据,这两个软件数据是通用的。

    歌名(Ins_eedcdc41) 发表: 嘿嘿,不智能是确实,而且软件经常出问题,trancefinder,也有,还没时间去搞,Xcalibur好像现在不要钱吧,

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