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系统相似性达到多少才可以

食品常规理化分析

  • 各位老师,,有微生物鉴定系统,这个系统的相似性要达到多少才说明确定是某个菌种啊?还有相似性如何解释?
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  • wuyuzegang

    第1楼2022/05/23

    应助达人

    细菌的一般认为98%一下就可能是新种,97%就基本上可以判断,但要做一下生理生化特征来验证,还有就是细胞化学组分方面的东西。97以下不需要做杂交的。

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  • JOE HUI

    第2楼2022/05/23

    应助达人

    一般序列相似度在97%以上就可以认为是同种细菌(当然也有例外,DNA序列仅仅是一个参考指标)。

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  • 123

    第3楼2022/05/23

    应助达人

    相似性系数法是通过计算相似性系数SAB值来确定微生物之间的关系。

    如果SAB等于1,说明所比较的两菌株rRNA序列相同,两菌株亲缘关系相近,若SAB值小于0.1,则表明亲缘关系很远。

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  • 冰饼兵

    第4楼2022/05/24

    感谢老师的回复

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  • dong3626

    第5楼2022/05/25

    应助达人

    你看什么用途吧,其实中国药典2020版里面是有规定的。
    见2020版药典第四部,见P504页,
    合适的微生物鉴定系统中,试验菌
    株与参考微生物的一致性水平通常应大于9 0 % 。若可能,微生物鉴定方法确认所用的挑战微生物应包括非发酵型细菌、棒状杆菌和凝固酶阴性的葡萄球菌等,但其一致性水平可能比较低。

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